View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17894_low_30 (Length: 250)

Name: NF17894_low_30
Description: NF17894
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17894_low_30
NF17894_low_30
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (1-240)||(8395508-8395747)
chr4 (1-240)||(8393299-8393538)
chr4 (1-240)||(7124804-7125046)
chr4 (1-240)||(5138193-5138434)
chr4 (1-240)||(7122585-7122827)
chr4 (1-240)||(5135967-5136209)
chr4 (1-213)||(31495340-31495556)
chr4 (1-226)||(13992317-13992544)
chr4 (1-226)||(29999830-30000063)
chr4 (1-213)||(56178661-56178882)
chr4 (4-145)||(52095389-52095530)
chr4 (1-145)||(41964415-41964560)
chr4 (1-145)||(46703500-46703645)
chr4 (1-145)||(9927482-9927626)
chr4 (1-141)||(2209717-2209858)
chr4 (1-145)||(48143042-48143187)
chr4 (1-145)||(8665408-8665552)
chr4 (1-145)||(12073392-12073536)
chr4 (1-145)||(26364236-26364380)
chr4 (1-126)||(5370107-5370232)
chr4 (1-142)||(379383-379524)
chr4 (1-145)||(12739574-12739718)
chr4 (13-145)||(40632445-40632577)
chr4 (1-145)||(41639426-41639570)
chr4 (1-145)||(37229745-37229890)
chr4 (3-145)||(34570440-34570582)
chr4 (15-145)||(36994524-36994654)
chr4 (1-145)||(47038435-47038577)
chr4 (1-127)||(6655975-6656100)
chr4 (1-138)||(5207866-5208003)
chr4 (1-145)||(8648139-8648283)
chr4 (1-126)||(12743949-12744073)
chr4 (1-126)||(12745338-12745462)
chr4 (1-145)||(26175660-26175804)
chr4 (1-145)||(36463413-36463557)
chr4 (9-145)||(37740625-37740761)
chr4 (1-91)||(50673871-50673960)
chr4 (1-145)||(54199930-54200074)
chr4 (9-145)||(54883020-54883156)
chr4 (15-145)||(4587958-4588089)
chr4 (1-143)||(12119540-12119683)
chr4 (15-145)||(12747794-12747924)
chr4 (11-145)||(45687216-45687351)
chr4 (1-143)||(46147415-46147557)
chr4 (17-126)||(12744087-12744195)
chr4 (17-145)||(12745476-12745604)
chr4 (1-145)||(27416989-27417133)
chr4 (1-145)||(48893662-48893810)
chr4 (3-145)||(5429679-5429821)
chr4 (1-145)||(6542203-6542349)
chr4 (1-130)||(26699466-26699596)
chr4 (1-91)||(35662496-35662585)
chr4 (1-145)||(5871820-5871964)
chr4 (5-145)||(31474150-31474291)
chr4 (1-91)||(50262725-50262814)
chr4 (27-145)||(24969112-24969230)
chr4 (35-145)||(52082715-52082825)
chr4 (1-142)||(52467378-52467519)
chr4 (1-91)||(33989899-33989989)
chr4 (1-71)||(13009468-13009536)
chr4 (59-140)||(44967910-44967992)
chr4 (15-60)||(3913534-3913578)
chr4 (3-91)||(33089933-33090021)
chr4 (73-141)||(48142473-48142542)
chr4 (15-145)||(51337064-51337194)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (1-240)||(2628-2868)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (1-240)||(18388784-18389024)
chr7 (1-240)||(18392220-18392460)
chr7 (1-240)||(6592364-6592604)
chr7 (1-240)||(6594582-6594822)
chr7 (1-229)||(20343811-20344041)
chr7 (1-240)||(32060346-32060590)
chr7 (1-229)||(24789755-24789985)
chr7 (75-240)||(1562103-1562268)
chr7 (1-229)||(39731283-39731513)
chr7 (1-229)||(43504178-43504409)
chr7 (1-226)||(35853825-35854058)
chr7 (1-229)||(25766984-25767215)
chr7 (1-226)||(29990965-29991197)
chr7 (1-229)||(48408709-48408948)
chr7 (1-68)||(1560690-1560757)
chr7 (1-213)||(25615785-25615997)
chr7 (1-145)||(34310740-34310884)
chr7 (1-145)||(23555039-23555184)
chr7 (1-145)||(14069857-14070001)
chr7 (1-145)||(14379885-14380029)
chr7 (1-145)||(22269973-22270117)
chr7 (1-145)||(41317458-41317602)
chr7 (1-145)||(8359340-8359485)
chr7 (1-226)||(19502088-19502322)
chr7 (1-145)||(29608737-29608881)
chr7 (1-145)||(30024756-30024900)
chr7 (1-145)||(48491579-48491723)
chr7 (1-226)||(4178685-4178917)
chr7 (15-213)||(47673981-47674189)
chr7 (1-145)||(27347817-27347961)
chr7 (1-145)||(2360996-2361140)
chr7 (1-145)||(3258995-3259139)
chr7 (1-145)||(6431971-6432115)
chr7 (1-145)||(8153342-8153486)
chr7 (1-145)||(18126644-18126788)
chr7 (1-91)||(32358078-32358167)
chr7 (1-142)||(41649035-41649175)
chr7 (1-145)||(4253552-4253697)
chr7 (15-145)||(4586161-4586291)
chr7 (1-127)||(2390301-2390426)
chr7 (8-145)||(48599365-48599502)
chr7 (3-145)||(4508732-4508874)
chr7 (15-145)||(26417316-26417446)
chr7 (1-126)||(23565085-23565210)
chr7 (1-145)||(31732993-31733137)
chr7 (1-145)||(36146432-36146576)
chr7 (1-145)||(47676160-47676304)
chr7 (1-145)||(48489431-48489575)
chr7 (27-226)||(38671272-38671480)
chr7 (1-142)||(496007-496148)
chr7 (1-145)||(43864244-43864388)
chr7 (73-145)||(23343975-23344048)
chr7 (74-145)||(24525992-24526065)
chr7 (1-142)||(1113660-1113801)
chr7 (1-140)||(22328414-22328556)
chr7 (5-142)||(31105421-31105558)
chr7 (1-120)||(2759221-2759339)
chr7 (1-91)||(4510572-4510661)
chr7 (1-91)||(4512414-4512503)
chr7 (17-91)||(6359992-6360065)
chr7 (1-80)||(18396384-18396462)
chr7 (1-60)||(24525526-24525584)
chr7 (73-145)||(12097954-12098027)
chr7 (1-60)||(31518988-31519047)
chr7 (27-145)||(36574565-36574683)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-240)||(12647410-12647650)
chr2 (1-229)||(6266605-6266835)
chr2 (1-166)||(13656056-13656221)
chr2 (1-229)||(32289479-32289708)
chr2 (1-229)||(4484354-4484592)
chr2 (1-229)||(30833252-30833490)
chr2 (1-226)||(45099665-45099898)
chr2 (3-226)||(5723282-5723512)
chr2 (1-226)||(4503157-4503390)
chr2 (1-226)||(36205689-36205921)
chr2 (1-145)||(2334442-2334586)
chr2 (1-145)||(45726929-45727073)
chr2 (1-145)||(29867869-29868013)
chr2 (1-213)||(34139794-34140017)
chr2 (1-226)||(36988100-36988333)
chr2 (1-226)||(42362262-42362496)
chr2 (1-145)||(6595030-6595175)
chr2 (1-142)||(14633849-14633991)
chr2 (1-140)||(33648176-33648316)
chr2 (9-216)||(38312159-38312376)
chr2 (1-127)||(723768-723893)
chr2 (1-145)||(1631756-1631900)
chr2 (1-145)||(35446908-35447052)
chr2 (1-145)||(24398055-24398202)
chr2 (11-145)||(13121769-13121901)
chr2 (9-145)||(36773562-36773698)
chr2 (1-145)||(26353184-26353328)
chr2 (27-145)||(7815323-7815441)
chr2 (1-145)||(11151615-11151759)
chr2 (1-145)||(17057393-17057537)
chr2 (1-145)||(17085376-17085520)
chr2 (1-145)||(36318033-36318177)
chr2 (27-142)||(11690504-11690619)
chr2 (1-145)||(11067305-11067449)
chr2 (1-91)||(17490172-17490261)
chr2 (1-145)||(33162474-33162618)
chr2 (1-87)||(28671989-28672075)
chr2 (1-145)||(42288135-42288278)
chr2 (1-91)||(7451173-7451262)
chr2 (1-45)||(39284936-39284980)
chr2 (1-45)||(42412118-42412161)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (1-240)||(44203536-44203776)
chr1 (1-240)||(9036320-9036560)
chr1 (1-229)||(40282291-40282521)
chr1 (1-229)||(9987116-9987345)
chr1 (1-229)||(21053872-21054102)
chr1 (1-229)||(20622261-20622492)
chr1 (4-229)||(51765302-51765538)
chr1 (1-146)||(13316376-13316521)
chr1 (1-145)||(37168297-37168442)
chr1 (1-142)||(8550811-8550952)
chr1 (1-226)||(20762582-20762816)
chr1 (1-145)||(13547113-13547257)
chr1 (1-145)||(47255364-47255508)
chr1 (1-145)||(3189330-3189474)
chr1 (1-145)||(3198147-3198291)
chr1 (1-145)||(3206986-3207130)
chr1 (1-145)||(11348698-11348842)
chr1 (1-145)||(13549024-13549168)
chr1 (1-145)||(28220250-28220394)
chr1 (1-145)||(44455160-44455304)
chr1 (1-145)||(7482254-7482399)
chr1 (1-142)||(834191-834332)
chr1 (1-145)||(3156865-3157009)
chr1 (1-145)||(28265578-28265722)
chr1 (1-145)||(29136247-29136391)
chr1 (1-145)||(31925731-31925875)
chr1 (9-145)||(37503589-37503722)
chr1 (1-145)||(42297999-42298143)
chr1 (1-145)||(49918350-49918494)
chr1 (1-145)||(47115171-47115316)
chr1 (1-145)||(1833522-1833666)
chr1 (1-145)||(4552661-4552805)
chr1 (1-145)||(23555290-23555433)
chr1 (1-145)||(19754494-19754639)
chr1 (1-145)||(34603576-34603721)
chr1 (1-145)||(37033096-37033241)
chr1 (1-145)||(28223445-28223589)
chr1 (1-145)||(45644378-45644523)
chr1 (1-145)||(50169234-50169378)
chr1 (1-140)||(22079322-22079461)
chr1 (3-213)||(13659362-13659582)
chr1 (1-145)||(193611-193755)
chr1 (1-145)||(31659238-31659382)
chr1 (9-145)||(50167207-50167343)
chr1 (1-213)||(3847145-3847367)
chr1 (27-226)||(196958-197166)
chr1 (1-60)||(28242391-28242448)
chr1 (1-142)||(46064921-46065062)
chr1 (15-145)||(37559906-37560037)
chr1 (1-145)||(41360914-41361058)
chr1 (1-127)||(15820326-15820451)
chr1 (16-145)||(19752685-19752815)
chr1 (3-91)||(6808507-6808595)
chr1 (45-140)||(12318589-12318685)
chr1 (16-91)||(16455676-16455750)
chr1 (27-124)||(928026-928123)
chr1 (1-91)||(13138000-13138089)
chr1 (17-145)||(30476486-30476614)
chr1 (1-60)||(36683766-36683824)
chr1 (72-145)||(37879005-37879079)
chr1 (5-91)||(5459961-5460046)
chr1 (73-142)||(8871143-8871213)
chr1 (6-60)||(37876795-37876848)
chr1 (59-123)||(48382441-48382505)
chr1 (65-131)||(3460710-3460778)
chr1 (64-127)||(32736952-32737015)
chr1 (64-127)||(35109493-35109556)
chr1 (1-131)||(37282715-37282846)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (1-240)||(6027151-6027391)
chr6 (1-240)||(25421208-25421450)
chr6 (1-248)||(16653007-16653256)
chr6 (1-240)||(16554772-16555013)
chr6 (1-240)||(16631328-16631569)
chr6 (1-240)||(33342129-33342370)
chr6 (5-229)||(27647777-27648000)
chr6 (1-240)||(16578542-16578783)
chr6 (1-240)||(16616597-16616838)
chr6 (1-240)||(34164761-34165002)
chr6 (1-240)||(34166983-34167224)
chr6 (1-172)||(13153886-13154059)
chr6 (1-229)||(412016-412246)
chr6 (1-229)||(3072783-3073014)
chr6 (1-229)||(2171556-2171792)
chr6 (1-229)||(6097475-6097695)
chr6 (4-226)||(31404702-31404932)
chr6 (1-226)||(5406224-5406456)
chr6 (1-226)||(5410549-5410781)
chr6 (1-226)||(30834560-30834794)
chr6 (1-145)||(5413418-5413561)
chr6 (1-222)||(16452353-16452583)
chr6 (1-145)||(21588931-21589075)
chr6 (1-145)||(21593664-21593808)
chr6 (1-145)||(2972963-2973107)
chr6 (1-145)||(3808732-3808877)
chr6 (6-145)||(33160381-33160521)
chr6 (1-145)||(22424850-22424995)
chr6 (9-145)||(9183063-9183199)
chr6 (1-145)||(28137432-28137576)
chr6 (1-143)||(26830147-26830289)
chr6 (5-142)||(17758026-17758163)
chr6 (5-145)||(17762990-17763130)
chr6 (1-226)||(16568953-16569166)
chr6 (1-142)||(5043630-5043771)
chr6 (1-145)||(3038927-3039071)
chr6 (1-142)||(26954310-26954450)
chr6 (1-91)||(26800642-26800731)
chr6 (1-74)||(5409093-5409164)
chr6 (1-145)||(33211209-33211353)
chr6 (27-145)||(4045423-4045542)
chr6 (1-91)||(603112-603201)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-240)||(25637331-25637571)
chr3 (1-240)||(3617352-3617594)
chr3 (1-240)||(4600768-4601009)
chr3 (1-229)||(45282897-45283130)
chr3 (1-229)||(6716414-6716643)
chr3 (1-229)||(54635039-54635268)
chr3 (1-240)||(4598547-4598788)
chr3 (1-240)||(10056122-10056363)
chr3 (1-240)||(10058344-10058585)
chr3 (1-240)||(10060566-10060807)
chr3 (1-240)||(10062788-10063029)
chr3 (1-240)||(10065010-10065251)
chr3 (1-240)||(10211298-10211539)
chr3 (1-240)||(10209078-10209319)
chr3 (43-240)||(10067232-10067431)
chr3 (1-229)||(801005-801236)
chr3 (1-180)||(7780028-7780208)
chr3 (111-229)||(6718598-6718718)
chr3 (1-229)||(23200162-23200398)
chr3 (1-226)||(45095075-45095307)
chr3 (1-229)||(23197963-23198199)
chr3 (1-226)||(5258168-5258402)
chr3 (1-226)||(9636150-9636385)
chr3 (1-226)||(5260347-5260581)
chr3 (1-145)||(37408458-37408602)
chr3 (1-142)||(19683913-19684054)
chr3 (1-145)||(7762265-7762409)
chr3 (1-134)||(7764476-7764608)
chr3 (1-145)||(34491212-34491356)
chr3 (1-142)||(39153385-39153526)
chr3 (1-145)||(29196410-29196555)
chr3 (1-226)||(9581193-9581426)
chr3 (1-145)||(41819547-41819691)
chr3 (3-145)||(4569952-4570094)
chr3 (1-141)||(30236129-30236269)
chr3 (1-145)||(49199493-49199638)
chr3 (1-142)||(760850-760991)
chr3 (1-142)||(22835026-22835167)
chr3 (1-145)||(6095623-6095767)
chr3 (1-145)||(40734498-40734642)
chr3 (1-145)||(44331545-44331689)
chr3 (1-145)||(46860474-46860618)
chr3 (1-145)||(43401825-43401970)
chr3 (15-145)||(44700516-44700646)
chr3 (1-145)||(40735383-40735527)
chr3 (1-141)||(51398818-51398958)
chr3 (1-145)||(54593704-54593848)
chr3 (15-226)||(29682269-29682489)
chr3 (1-143)||(31314447-31314589)
chr3 (1-145)||(5236481-5236624)
chr3 (1-145)||(29810868-29811012)
chr3 (9-145)||(29813063-29813199)
chr3 (5-145)||(53921531-53921671)
chr3 (1-143)||(32891105-32891248)
chr3 (1-145)||(43403768-43403913)
chr3 (1-126)||(46173377-46173501)
chr3 (3-213)||(16498952-16499171)
chr3 (1-85)||(55301996-55302079)
chr3 (16-145)||(51352150-51352278)
chr3 (1-226)||(32744460-32744684)
chr3 (10-145)||(36018852-36018987)
chr3 (73-145)||(5433971-5434046)
chr3 (1-87)||(40913352-40913437)
chr3 (27-140)||(4055813-4055926)
chr3 (1-44)||(27305734-27305777)
chr3 (74-133)||(28253363-28253423)
chr3 (1-57)||(47304340-47304395)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (1-240)||(25078023-25078265)
chr5 (1-240)||(25135992-25136234)
chr5 (1-240)||(10593161-10593402)
chr5 (1-240)||(16546534-16546775)
chr5 (1-233)||(22536314-22536545)
chr5 (1-240)||(40379995-40380235)
chr5 (1-240)||(40382206-40382446)
chr5 (1-240)||(16544312-16544553)
chr5 (1-229)||(29751184-29751414)
chr5 (1-229)||(29722438-29722668)
chr5 (1-229)||(29720278-29720508)
chr5 (1-229)||(9789248-9789478)
chr5 (1-229)||(16409389-16409619)
chr5 (1-229)||(18441672-18441902)
chr5 (1-229)||(26177797-26178026)
chr5 (1-226)||(25412672-25412904)
chr5 (1-229)||(26170688-26170906)
chr5 (1-226)||(13342971-13343204)
chr5 (1-226)||(30182499-30182732)
chr5 (1-213)||(13239674-13239895)
chr5 (1-226)||(36074067-36074302)
chr5 (1-145)||(40147261-40147405)
chr5 (1-145)||(213465-213609)
chr5 (1-145)||(32636824-32636968)
chr5 (1-126)||(37439161-37439285)
chr5 (1-145)||(28278316-28278460)
chr5 (1-145)||(13488203-13488347)
chr5 (1-145)||(42428454-42428598)
chr5 (1-145)||(13695714-13695859)
chr5 (1-145)||(27637637-27637781)
chr5 (15-142)||(39468587-39468714)
chr5 (1-145)||(5058047-5058189)
chr5 (1-145)||(28750679-28750823)
chr5 (1-226)||(30682946-30683178)
chr5 (1-226)||(33831590-33831824)
chr5 (1-145)||(42426259-42426403)
chr5 (1-213)||(8565970-8566192)
chr5 (1-226)||(31182883-31183115)
chr5 (1-145)||(533769-533913)
chr5 (1-131)||(16640964-16641091)
chr5 (3-142)||(9049368-9049506)
chr5 (1-142)||(538028-538169)
chr5 (1-213)||(16452003-16452224)
chr5 (15-141)||(38747009-38747135)
chr5 (1-139)||(316769-316907)
chr5 (1-42)||(4160702-4160743)
chr5 (5-91)||(42309963-42310048)
chr5 (1-142)||(3075682-3075823)
chr5 (28-91)||(10054867-10054929)
chr5 (1-45)||(19806463-19806507)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-240)||(3750-3990)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (1-233)||(25689865-25690098)
chr8 (1-240)||(15290427-15290668)
chr8 (1-240)||(15470796-15471037)
chr8 (1-240)||(42575348-42575589)
chr8 (1-229)||(3439418-3439647)
chr8 (1-229)||(2627649-2627880)
chr8 (1-226)||(34254355-34254586)
chr8 (1-226)||(44303764-44303999)
chr8 (1-226)||(17982563-17982797)
chr8 (1-226)||(31218167-31218401)
chr8 (1-226)||(34256531-34256762)
chr8 (1-145)||(19945383-19945529)
chr8 (1-145)||(42498193-42498338)
chr8 (1-131)||(1746243-1746371)
chr8 (1-145)||(15212786-15212930)
chr8 (1-145)||(42435015-42435159)
chr8 (3-142)||(40328782-40328922)
chr8 (1-145)||(4283524-4283668)
chr8 (1-145)||(33352150-33352294)
chr8 (1-145)||(43036423-43036567)
chr8 (1-145)||(18655400-18655544)
chr8 (1-145)||(27811278-27811422)
chr8 (27-145)||(9765745-9765863)
chr8 (9-139)||(30143346-30143476)
chr8 (15-145)||(30291606-30291737)
chr8 (1-143)||(40321082-40321224)
chr8 (1-131)||(12702658-12702787)
chr8 (1-145)||(18141821-18141964)
chr8 (1-145)||(3303694-3303838)
chr8 (1-145)||(40221745-40221889)
chr8 (15-142)||(44353796-44353923)
chr8 (9-145)||(4731658-4731794)
chr8 (15-91)||(41366652-41366727)
chr8 (1-142)||(1345395-1345536)
chr8 (1-142)||(6598975-6599116)
chr8 (1-142)||(6674428-6674569)
chr8 (1-145)||(1292488-1292631)
chr8 (9-91)||(5689326-5689407)
chr8 (1-145)||(19491723-19491867)
chr8 (1-145)||(8965715-8965859)
chr8 (1-70)||(4743238-4743306)
chr8 (1-143)||(10930223-10930365)
chr8 (3-141)||(11383989-11384127)
chr8 (1-127)||(4162516-4162640)
chr8 (1-91)||(7597669-7597759)
chr8 (65-132)||(41266982-41267051)
chr8 (73-140)||(1822297-1822365)
chr8 (73-140)||(1856742-1856810)
chr8 (1-91)||(10015136-10015223)
chr8 (1-91)||(18106105-18106191)
chr8 (69-140)||(29796413-29796485)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (3-240)||(6177-6415)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-226)||(434443-434677)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (1-229)||(11185-11423)
scaffold0491 (1-147)||(8759-8907)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (1-226)||(827-1059)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (1-145)||(11557-11701)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (3-145)||(114602-114744)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-145)||(18028-18171)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (3-145)||(7327-7469)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (1-145)||(20439-20583)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (3-213)||(149123-149343)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-89)||(10546-10633)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (1-91)||(27466-27556)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (46-141)||(80351-80447)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8395747 - 8395508
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8395747 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttc 8395648  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395647 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 8395548  T
Q  201 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395547 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 8395508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8393538 - 8393299
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8393538 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttc 8393439  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393438 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 8393339  T
Q  201 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8393338 ctctaatcaaagaaccataaaccctagagcttcccctttg 8393299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7125046 - 7124804
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7125046 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagtt 7124947  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124946 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 7124847  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124846 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7124804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5138434 - 5138193
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5138434 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 5138335  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5138334 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtatttcccatgttttcaacccaagaga 5138235  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138234 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5138193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7122827 - 7122585
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7122827 tgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagtt 7122728  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122727 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 7122628  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122627 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7122585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5136209 - 5135967
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5136209 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 5136110  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5136109 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtatttcccatgtttttcaacccaagag 5136010  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136009 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5135967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 31495340 - 31495556
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||    
T  31495340 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaag 31495438  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 194  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31495439 ttcacaatgaacaatcc-taatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaa 31495537  T
Q  195 gagatactctaatcaaaga 213  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  31495538 gagaagctctaatcaaaga 31495556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 13992317 - 13992544
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  13992317 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac--aagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagt 13992413  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaaccca 193  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||    
T  13992414 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 13992512  T
Q  194 agagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992513 agagagactctaatcaaag-accctaaacccta 13992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 29999830 - 30000063
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  29999830 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacatgt 29999928  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttc-a 188  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| | |||||| | |    
T  29999929 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccaa 30000027  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30000028 acccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 30000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 56178661 - 56178882
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  56178661 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagt 56178758  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  56178759 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccc 56178857  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178858 aacccaagaga-actctaatcaaaga 56178882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 52095389 - 52095530
Alignment:
Q  4 cctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttca 101  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52095389 cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttca 52095486  T
Q  102 ctatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52095487 caaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41964560 - 41964415
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||    
T  41964560 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggttacaataaattagcttaaacaag 41964463  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41964462 ctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 46703645 - 46703500
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  46703645 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 46703548  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46703547 ctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 9927482 - 9927626
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  9927482 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 9927579  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9927580 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2209858 - 2209717
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  2209858 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaag 2209761  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 141  Q
     |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209760 ctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48143187 - 48143042
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  48143187 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta-tgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagt 48143090  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  48143089 tcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8665552 - 8665408
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  8665552 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 8665455  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || | | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8665454 tctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12073536 - 12073392
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||     
T  12073536 tgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaataaattagcttcaacaagc 12073439  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12073438 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26364380 - 26364236
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  26364380 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-taatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagt 26364283  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364282 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 5370107 - 5370232
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc--ttgacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  5370107 tgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaag 5370204  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacc 126  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  5370205 ttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 5370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 379524 - 379383
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  379524 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aattagttcttac-aaagcgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 379427  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  379426 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcac 379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12739574 - 12739718
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12739574 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcatac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagt 12739671  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12739672 tcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40632577 - 40632445
Alignment:
Q  13 gaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaaca 110  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||     
T  40632577 gaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac- 40632481  T
Q  111 aaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40632480 aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41639570 - 41639426
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||    
T  41639570 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagt 41639473  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639472 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 37229745 - 37229890
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||| |||| | ||||     
T  37229745 tgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaatttgctttaacaagc 37229843  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37229844 tcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 34570440 - 34570582
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaa-aaggttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34570440 acctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttc 34570537  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34570538 acaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36994654 - 36994524
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||    
T  36994654 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aa 36994558  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36994557 ccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 47038435 - 47038577
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |    
T  47038435 tgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtccttac-aaacagatacaaatgattacaagaaattagcttcaacaagct 47038532  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038533 cacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6656100 - 6655975
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  6656100 tgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagt 6656003  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc 127  Q
    |||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  6656002 tcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 5207866 - 5208003
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    |||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||| ||| |||||||||| | |||||    
T  5207866 tgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttcttacaaatagatatacaag-ggttgcaataaattagcttcaacaagt 5207963  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 138  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5207964 tcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8648283 - 8648139
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||      
T  8648283 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaaac 8648186  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8648185 tcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 12743949 - 12744073
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12743949 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagt 12744046  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc 126  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744047 tcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 12745338 - 12745462
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12745338 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagt 12745435  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc 126  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745436 tcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 26175660 - 26175804
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||     
T  26175660 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagc 26175757  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26175758 tcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 36463413 - 36463557
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  36463413 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 36463510  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36463511 tcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37740761 - 37740625
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |    
T  37740761 tctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag 37740664  T
Q  107 aacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  37740663 aac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 37740625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 50673871 - 50673960
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50673871 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 54199930 - 54200074
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||    
T  54199930 tgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 54200027  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54200028 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54883156 - 54883020
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |      
T  54883156 tctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaa 54883059  T
Q  107 aacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54883058 aac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4588089 - 4587958
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | || | |||||||    
T  4588089 ggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaa 4587992  T
Q  113 ccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
     | |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4587991 tcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaa 4587958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12119683 - 12119540
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||    
T  12119683 tgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagt 12119586  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc 143  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12119585 tcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacc 12119540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747924
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcatac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aa 12747890  T
Q  113 ccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12747891 ccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 45687216 - 45687351
Alignment:
Q  11 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaa 108  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||    
T  45687216 tggaggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaa 45687313  T
Q  109 caaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45687314 caaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 46147415 - 46147557
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  46147415 tgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 46147512  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 143  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46147513 tcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  17 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaacc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aacc 12744183  T
Q  115 ctaatttctacc 126  Q
    ||||||||||||    
T  12744184 ctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745604
Alignment:
Q  17 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaacc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aacc 12745572  T
Q  115 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  12745573 ctaatttctacccattttcctaatctcgccaa 12745604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 27416989 - 27417133
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  27416989 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 27417086  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27417087 tcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 48893662 - 48893810
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  48893662 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 48893759  T
Q  99 tc----actatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48893760 tcacaaacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 48893810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5429821 - 5429679
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  5429821 acctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 5429724  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || | |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5429723 acgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 5429679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 6542203 - 6542349
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||     
T  6542203 tgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagc 6542300  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  6542301 tcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaa 6542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 26699466 - 26699596
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  26699466 tgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagc 26699564  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttt 130  Q
    |||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  26699565 tcacaaagaacaaaccctaatctatacccttt 26699596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 35662585 - 35662496
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35662585 tgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 35662496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5871964 - 5871820
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||  |||||     
T  5871964 tgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttcttgc-aaagtgataaaaatgggttacaagaaatttgcttaaacaagc 5871867  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5871866 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 5871820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31474291 - 31474150
Alignment:
Q  5 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcac 102  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||     
T  31474291 ctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaa 31474194  T
Q  103 tatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     | ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31474193 aaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 31474150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 50262725 - 50262814
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50262725 tgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 50262814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969112
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatc-aattagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttcta 24969134  T
Q  125 ccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  24969133 cccatttttccaatctcaccaa 24969112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 52082715 - 52082825
Alignment:
Q  35 tccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-tttt 131  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  52082715 tccactatcaaa-gatttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaa-ccctagtttctacccatttt 52082811  T
Q  132 cccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||    
T  52082812 cccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 52467378 - 52467519
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||     
T  52467378 tgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-aagttattac-aaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagc 52467475  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52467476 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaacctcac 52467519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat-taacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 13009468 - 13009536
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa 71  Q
    ||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13009468 tgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaa 13009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Original strand, 44967910 - 44967992
Alignment:
Q  59 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 140  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| || | | || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44967910 aaagagatacaaatggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctaccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3913578 - 3913534
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 60  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3913578 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 3913534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089933
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||   | || ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagctt 33089933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Original strand, 48142473 - 48142542
Alignment:
Q  73 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 141  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  48142473 ggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctca 48142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 51337194 - 51337064
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaac 113  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| | ||| |||| | |||||||     
T  51337194 ggagagattgatctctctaatacactatcaa-tgagttctta-aaaagagatacaaaagggttataataaattatcttaa-aagctcacaaagaacaaat 51337098  T
Q  114 cc-taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51337097 ccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 51337064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 2628 - 2868
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2628 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 2727  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2728 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 2827  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2828 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 2868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18388784 - 18389024
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388784 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 18388883  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388884 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 18388983  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388984 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18389024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18392220 - 18392460
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392220 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 18392319  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392320 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 18392419  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392420 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18392460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 6592364 - 6592604
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592364 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 6592463  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592464 cactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 6592563  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592564 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 6594582 - 6594822
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594582 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 6594681  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594682 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 6594781  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594782 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6594822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20344041 - 20343811
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344041 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 20343942  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343941 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 20343842  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343841 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20343811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 32060346 - 32060590
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaa--gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32060346 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaag 32060445  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060446 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaag 32060545  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32060546 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttaccctttg 32060590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24789985 - 24789755
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24789985 tgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaa-gagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagtt 24789887  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789886 cacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 24789787  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789786 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 24789755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562268
Alignment:
Q  75 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgt 1562202  T
Q  175 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562203 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 1562268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39731513 - 39731283
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagct-tgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  39731513 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagt 39731415  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaag 195  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  39731414 tcacaaagaacaa-ccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 39731316  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39731315 agaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 39731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 43504178 - 43504409
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||    
T  43504178 tgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaag 43504276  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  43504277 ttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaa 43504375  T
Q  195 gagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  43504376 gagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 43504409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35854058 - 35853825
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35854058 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 35853961  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  35853960 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccc 35853862  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35853861 aacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaacccta 35853825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 25766984 - 25767215
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  25766984 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctt-caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaag 25767081  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttc-ccaatctcac----caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaac 190  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||    |    
T  25767082 ttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttt---cc 25767177  T
Q  191 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767178 caaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 25767215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29991197 - 29990965
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29991197 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatta-gaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 29991100  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  29991099 tcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca 29991001  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991000 acccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 29990965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48408948 - 48408709
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc-ttgacaag 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  48408948 tgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaag 48408850  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    || || | |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  48408849 tttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 48408751  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408750 caacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 48408709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 1560690 - 1560757
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560690 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25615997 - 25615785
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  25615997 tgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 25615900  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgtttt-caaccca 193  Q
     |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||    |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  25615899 gcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactcaatgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaaccca 25615804  T
Q  194 agagatactctaatcaaaga 213  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  25615803 agaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 34310740 - 34310884
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |    
T  34310740 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaatt 34310837  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34310838 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23555184 - 23555039
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  23555184 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaggtacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagt 23555087  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  23555086 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 14069857 - 14070001
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14069857 tgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagt 14069954  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14069955 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 14379885 - 14380029
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14379885 tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagt 14379982  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14379983 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22270117 - 22269973
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  22270117 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 22270020  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270019 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 41317458 - 41317602
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  41317458 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagc 41317555  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41317556 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 8359340 - 8359485
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||    
T  8359340 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaag 8359437  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8359438 ctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19502322 - 19502088
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  19502322 tgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagc 19502225  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct--ctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| |  ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||  |||  |||||||||| | ||||||      
T  19502224 tcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 19502126  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19502125 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 19502088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29608881 - 29608737
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  29608881 tgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 29608784  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29608783 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 30024756 - 30024900
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  30024756 tgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 30024853  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30024854 tcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48491723 - 48491579
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  48491723 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 48491626  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48491625 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4178917 - 4178685
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  4178917 tgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagt 4178821  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  4178820 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccc 4178722  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4178721 aacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 4178685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 47673981 - 47674189
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  47673981 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aa 47674077  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagata 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |    
T  47674078 ccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-a 47674176  T
Q  201 ctctaatcaaaga 213  Q
    |||||||||||||    
T  47674177 ctctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27347961 - 27347817
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  27347961 tgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 27347864  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347863 tcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 2360996 - 2361140
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  2360996 tgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 2361093  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2361094 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3259139 - 3258995
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||     
T  3259139 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaatgagttacaataaattagcttaaacaagc 3259042  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3259041 tcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6432115 - 6431971
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  6432115 tgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 6432018  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6432017 tcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8153486 - 8153342
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||      
T  8153486 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaatc 8153389  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8153388 tcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18126788 - 18126644
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttg-acaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  18126788 tgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagt 18126691  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18126690 tcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 32358078 - 32358167
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32358078 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 41649035 - 41649175
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |    
T  41649035 tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagctaaacaagct 41649132  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 142  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  41649133 cacaaagaacaaa-cctaatttctaccaatttttccaatctcac 41649175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 4253552 - 4253697
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||| | |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||     
T  4253552 tgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttctttccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagc 4253650  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  4253651 tcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4586291 - 4586161
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  |||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  4586291 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aa 4586195  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4586194 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 2390426 - 2390301
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  2390426 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-atatgagttattac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 2390329  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc 127  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  2390328 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 48599365 - 48599502
Alignment:
Q  8 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactat 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |     
T  48599365 ctctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa 48599462  T
Q  106 gaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48599463 gaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 4508732 - 4508874
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||    
T  4508732 acctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataagctc 4508829  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4508830 acaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26417446 - 26417316
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||    
T  26417446 ggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aa 26417350  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26417349 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 23565085 - 23565210
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||     
T  23565085 tgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaagc 23565182  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc 126  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  23565183 tcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 31732993 - 31733137
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||     
T  31732993 tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaccaagc 31733090  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  31733091 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaa 31733137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 36146432 - 36146576
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||  |||||     
T  36146432 tgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac-agaaattagcttcaacaagc 36146528  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146529 tcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 47676160 - 47676304
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  |||| |    
T  47676160 tgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcat-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaat 47676257  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47676258 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47676304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48489575 - 48489431
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  48489575 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttattgc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 48489478  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |  | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48489477 tttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 226
Target Start/End: Original strand, 38671272 - 38671480
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  38671272 ctcttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttcta 38671368  T
Q  125 ccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaag 212  Q
    ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  38671369 cccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag 38671467  T
Q  213 aaccctaaacccta 226  Q
     ||||| |||||||    
T  38671468 -accctcaacccta 38671480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 496007 - 496148
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||     
T  496007 tgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta-taaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagc 496104  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  496105 tcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43864388 - 43864244
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  43864388 tgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaggaaattagcttcaacaagt 43864291  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  43864290 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23344048 - 23343975
Alignment:
Q  73 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344048 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 145
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  74 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1113801 - 1113660
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||     
T  1113801 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttcttac-aaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagc 1113704  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1113703 tcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttctcaatctcac 1113660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 22328414 - 22328556
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| || ||| ||| |   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  22328414 tgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaa-tgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagc 22328512  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctc 140  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22328513 tcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Original strand, 31105421 - 31105558
Alignment:
Q  5 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcac 102  Q
    ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  31105421 ctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaa-tgagttcttacaaaaag-atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac 31105518  T
Q  103 tatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
     | ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31105519 aaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcac 31105558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 2759221 - 2759339
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  2759221 tgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagt 2759318  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatt 120  Q
    |||| | |||| ||||||||||    
T  2759319 tcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 4510572 - 4510661
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    |||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4510572 tgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta-taaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 4510661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 4512414 - 4512503
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    |||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4512414 tgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta-taaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 4512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 6359992 - 6360065
Alignment:
Q  17 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  6359992 agagattgatctctccaatcaactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18396462 - 18396384
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||   |||| ||||||||| |||||||    
T  18396462 tgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatc-aatgaattctttataaagagatacaaaatgttacaa 18396384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 24525526 - 24525584
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 60  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24525526 tgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Original strand, 12097954 - 12098027
Alignment:
Q  73 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12097954 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 12098027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31519047 - 31518988
Alignment:
Q  1 tgacctactctggag-gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 60  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31519047 tgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtc-aatgagttcttacaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 36574565 - 36574683
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||   |||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||  |||| | ||||||| | |||||||||    
T  36574565 ctctccaaaccactatcaa-tgagttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta 36574663  T
Q  125 cccttttcccaatctcaccaa 145  Q
     ||||| ||||||||| ||||    
T  36574664 -cctttccccaatctctccaa 36574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12647410 - 12647650
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647410 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 12647509  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647510 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 12647609  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647610 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 12647650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6266835 - 6266605
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6266835 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagtt 6266737  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266736 cacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 6266637  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266636 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6266605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 13656056 - 13656221
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656056 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttc 13656155  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656156 actatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta 13656221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32289708 - 32289479
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  32289708 tgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagt 32289610  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaag 195  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  32289609 tcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttcc-aatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttccaaacccaag 32289512  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  32289511 agaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 32289479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4484354 - 4484592
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4484354 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 4484452  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||  | |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  4484453 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccc 4484551  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4484552 aacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 4484592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30833490 - 30833252
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  30833490 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagt 30833392  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||  | |||  ||| |||||| | ||||||  |    
T  30833391 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaagtgtttacaatgtttccc 30833293  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30833292 aacccaagataagctctaatcaaa-aaccctaaaccctagag 30833252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45099898 - 45099665
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  45099898 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagt 45099802  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  45099801 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 45099703  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099702 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Original strand, 5723282 - 5723512
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723282 acctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttc 5723379  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaac 190  Q
    || | |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||    
T  5723380 acaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaac 5723478  T
Q  191 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5723479 ccaagaga-actctaatcaaag-accccaaacccta 5723512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 4503157 - 4503390
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4503157 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagt 4503253  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctc-------accaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||       | |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  4503254 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 4503352  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503353 caacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaacccta 4503390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 36205689 - 36205921
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36205689 tgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagt 36205785  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||  |    
T  36205786 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttccc 36205884  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36205885 aacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 2334442 - 2334586
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  2334442 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagt 2334539  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2334540 tcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaa 2334586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45727073 - 45726929
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||     
T  45727073 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagc 45726976  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45726975 tcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29868013 - 29867869
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29868013 tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagt 29867916  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29867915 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34139794 - 34140017
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggataca-aaaggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||     
T  34139794 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 34139892  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||      
T  34139893 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 34139991  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34139992 caacccaagaga-actctaatcaaaga 34140017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 36988100 - 36988333
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||     
T  36988100 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagc 36988197  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  36988198 tcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttccc 36988296  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36988297 aacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 36988333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42362496 - 42362262
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  42362496 tgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 42362399  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||      
T  42362398 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 42362300  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42362299 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 42362262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 6595030 - 6595175
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  6595030 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagt 6595127  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  6595128 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaa 6595175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 14633849 - 14633991
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  14633849 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttcttacaaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 14633947  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14633948 tcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttaccaatctcac 14633991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33648316 - 33648176
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||     
T  33648316 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaggaaattagcttcaacaagc 33648218  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 140  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33648217 tcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38312376 - 38312159
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |    
T  38312376 tctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaag 38312279  T
Q  107 aacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 194  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||||| | | ||||||  ||||||||    
T  38312278 aac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacacaaggtgtatacaatgtttcccaacccaa 38312180  T
Q  195 gagatactctaatcaaagaacc 216  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  38312179 gaga-actctaatcaaagaacc 38312159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 723768 - 723893
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  723768 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 723865  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc 127  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  723866 tcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 1631756 - 1631900
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||     
T  1631756 tgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagc 1631853  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1631854 tcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 35446908 - 35447052
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||     
T  35446908 tgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagattcaacaaga 35447005  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35447006 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaa 35447052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24398202 - 24398055
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  24398202 tgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagc 24398104  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24398103 tcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  11 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaac 109  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaa-tgagtttctacaaa-gagatacaaa-ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac 13121805  T
Q  110 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13121804 aaaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36773698 - 36773562
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |    
T  36773698 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag 36773601  T
Q  107 aacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  36773600 aac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26353328 - 26353184
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    |||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||      
T  26353328 tgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaa-tgagtacttacaaaaag-atacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaaac 26353231  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26353230 tcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |    | ||||||||||||||||| |    
T  7815323 ctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaa 7815420  T
Q  125 cccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  7815421 cctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 11151615 - 11151759
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  11151615 tgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaa-gagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 11151712  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11151713 tcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 11151759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 17057393 - 17057537
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||     
T  17057393 tgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagc 17057490  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |  | | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17057491 ttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17057537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 17085376 - 17085520
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||     
T  17085376 tgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagc 17085473  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |  | | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17085474 ttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17085520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 36318033 - 36318177
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||  |||||     
T  36318033 tgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagc 36318130  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36318131 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11690619 - 11690504
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  11690619 ctctccaatccactatcaac-gatttcttacaaa-gggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 11690523  T
Q  125 ccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  11690522 cccattttcccaatctcac 11690504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11067449 - 11067305
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  11067449 tgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagc 11067352  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | | || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  11067351 tcacaaagtac-aacactaatttctacccatttttccaatttcaccaa 11067305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 17490172 - 17490261
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17490172 tgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagttacaaaagagttacaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 33162474 - 33162618
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  33162474 tgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-agagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 33162571  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  33162572 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaa 33162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28672075 - 28671989
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  28672075 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtc-agtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 42288135 - 42288278
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||  |||||||  |||||||| ||||||||||  |||||     
T  42288135 tgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagctcttac-aaagaaatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagc 42288231  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42288232 tcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 42288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7451262 - 7451173
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  7451262 tgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 39284980 - 39284936
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 45  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39284980 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 42412161 - 42412118
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 45  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412161 tgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44203776 - 44203536
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203776 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 44203677  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203676 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 44203577  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203576 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 44203536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9036560 - 9036320
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036560 tgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 9036462  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036461 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 9036362  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9036361 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 9036320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40282521 - 40282291
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40282521 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagtt 40282423  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282422 cacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 40282323  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282322 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 40282291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9987345 - 9987116
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9987345 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa-tgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattagattagacaagtt 9987247  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987246 cacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 9987148  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987147 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21054102 - 21053872
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21054102 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattagatttgacaagtt 21054004  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattct--ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054003 cacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 21053904  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053903 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 21053872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 20622261 - 20622492
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa--gggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20622261 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaag 20622359  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc--tctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaag 195  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622360 ttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaag 20622458  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622459 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51765538 - 51765302
Alignment:
Q  4 cctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc-ttgacaagttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51765538 cctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttc 51765440  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaac 190  Q
    || | |    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||    
T  51765439 acaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaac 51765340  T
Q  191 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51765339 ccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 51765302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 13316376 - 13316521
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13316376 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 13316473  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaag 146  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13316474 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37168442 - 37168297
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  37168442 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 37168345  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168344 ctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 8550811 - 8550952
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  8550811 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagc 8550908  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8550909 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20762816 - 20762582
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20762816 tgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-gaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 20762719  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||| |||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  20762718 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 20762620  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20762619 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 20762582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13547113 - 13547257
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||     
T  13547113 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaaatagcttcaacaagc 13547210  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547211 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 47255364 - 47255508
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  47255364 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 47255461  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47255462 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3189474 - 3189330
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||    
T  3189474 tgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagt 3189377  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3189376 tcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3198291 - 3198147
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||    
T  3198291 tgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagt 3198194  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3198193 tcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3207130 - 3206986
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||    
T  3207130 tgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagt 3207033  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3207032 tcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11348842 - 11348698
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  11348842 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta-gaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 11348745  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11348744 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13549024 - 13549168
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta-gcttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||| | || |||||     
T  13549024 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacatgaaattaggtttaacaagc 13549121  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549122 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 28220250 - 28220394
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  28220250 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 28220347  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28220348 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44455304 - 44455160
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||    
T  44455304 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagt 44455207  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44455206 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 7482254 - 7482399
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  7482254 tgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 7482351  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482352 ctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 834191 - 834332
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  834191 tgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 834288  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  834289 tcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3157009 - 3156865
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  3157009 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 3156912  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3156911 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 3156865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 28265578 - 28265722
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  28265578 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 28265675  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  28265676 tcacaatgaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaa 28265722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29136391 - 29136247
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||  |||||     
T  29136391 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggttccaagaaattagcttcaacaagc 29136294  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29136293 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 31925731 - 31925875
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  31925731 tgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 31925828  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  31925829 tcacaatgaac-atccctaatttctacccatttttccactctcaccaa 31925875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Original strand, 37503589 - 37503722
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatga 107  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  37503589 tctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac--aaggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaga 37503684  T
Q  108 acaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37503685 ac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 42297999 - 42298143
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  42297999 tgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 42298096  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42298097 tcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 49918494 - 49918350
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  49918494 tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 49918397  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49918396 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47115316 - 47115171
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  47115316 tgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 47115219  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47115218 ctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1833666 - 1833522
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgacaag-t 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  || |    
T  1833666 tgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagat 1833569  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1833568 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 4552661 - 4552805
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  4552661 tgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagc 4552758  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4552759 tcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 23555290 - 23555433
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||| ||  ||||||    
T  23555290 tgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaagt 23555386  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23555387 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19754639 - 19754494
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  19754639 tgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagc 19754542  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19754541 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34603721 - 34603576
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  34603721 tgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 34603624  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34603623 ctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 34603576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 37033096 - 37033241
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||  | |||||||||||||||||  |||||    
T  37033096 tgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatgcaaaatggattacaagaaattagcttcaacaag 37033193  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37033194 ctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 28223445 - 28223589
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  28223445 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 28223542  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||  | || | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28223543 tcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28223589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 45644378 - 45644523
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||     
T  45644378 tgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttgcaagaaattagctttgacaagc 45644475  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45644476 tcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 50169234 - 50169378
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||     
T  50169234 tgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagtacttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagc 50169331  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50169332 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||     
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagc 22079363  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 140  Q
    |||| | ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22079362 tcacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 13659362 - 13659582
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| |     
T  13659362 acctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagctt 13659459  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcta---caaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    || |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |||   |||||||||| | |||||| |||    
T  13659460 acaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctca 13659558  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  13659559 acctaagaga-actctaatcaaaga 13659582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 193755 - 193611
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  193755 tgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 193658  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    | |  | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  193657 taataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 193611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31659382 - 31659238
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  31659382 tgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 31659285  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31659284 tcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 31659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Original strand, 50167207 - 50167343
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatg 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |      
T  50167207 tctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaat 50167304  T
Q  107 aacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  50167305 aac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 3847145 - 3847367
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||  ||||      
T  3847145 tgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaac 3847242  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||      
T  3847243 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 3847341  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3847342 caacccaagaga-actctaatcaaaga 3847367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 226
Target Start/End: Original strand, 196958 - 197166
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  196958 ctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 197054  T
Q  125 cc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaag 212  Q
    ||  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  197055 ccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag 197153  T
Q  213 aaccctaaacccta 226  Q
     ||||| |||||||    
T  197154 -accctcaacccta 197166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 28242448 - 28242391
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28242448 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 46065062 - 46064921
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||||||  || ||     
T  46065062 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttcttac-aaagagatacacatgagttacaagaaattagcttcaacgagc 46064965  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  46064964 tcacaaagaacaaa-cctaatttttatccattttcccaatctcac 46064921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Original strand, 37559906 - 37560037
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt--gacaagttcactatgaacaa 111  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||| | |||| |    
T  37559906 ggagagattgatctctccaattcactatcaac-gagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-a 37560002  T
Q  112 accctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  37560003 actctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 37560037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41361058 - 41360914
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| || | ||||     
T  41361058 tgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaac-gagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagc 41360961  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41360960 tcacaaagaacaaacc-taatttctacccattttcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15820451 - 15820326
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  15820451 tgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatc-aatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagc 15820354  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc 127  Q
    |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  15820353 tcacaaagaacaaa-cctaatttttaccc 15820326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19752815 - 19752685
Alignment:
Q  16 gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaac 113  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| || | | |||| |||    
T  19752815 gagagattgatctctccaatcctctatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aac 19752719  T
Q  114 cctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  19752718 cctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808507
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Original strand, 12318589 - 12318685
Alignment:
Q  45 aatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 140  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12318589 aatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatctc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16455750 - 16455676
Alignment:
Q  16 gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455750 gagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-acagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 928026 - 928123
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928026 ctctctaatccactattaa-tgagtttttacaaa-gagatccaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 13138000 - 13138089
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13138000 tgacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatc-aatgtgttcttac-aaagagatgcaaatgggttacaagaaattagctt 13138089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 30476486 - 30476614
Alignment:
Q  17 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaacc 114  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||| ||| | ||||||||  | |||||| ||    
T  30476486 agagattgatctgtccaatccagtatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaa-cc 30476582  T
Q  115 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30476583 ctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36683824 - 36683766
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 60  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36683824 tgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatc-aatgagttcttacaaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879079
Alignment:
Q  72 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 37879079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  5 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||   ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttctttacaaagaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Original strand, 8871143 - 8871213
Alignment:
Q  73 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 142  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8871143 ggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcac 8871213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Original strand, 37876795 - 37876848
Alignment:
Q  6 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 60  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37876795 tactctggaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 48382505 - 48382441
Alignment:
Q  59 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttct 123  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  48382505 aaagtgatacaaataggttacaagaaattaactt-acaagttcacaaagatcaaaccctaatttct 48382441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3460778 - 3460710
Alignment:
Q  65 atacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 131  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  3460778 atacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaccctttt 3460710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 32737015 - 32736952
Alignment:
Q  64 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 127  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  32737015 gatacaaagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 35109556 - 35109493
Alignment:
Q  64 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  35109556 gatacaaataggttacaagaaattagctt-aaaagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccc 35109493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 37282715 - 37282846
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||   |||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| | ||||     
T  37282715 tgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccacta-ctaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaattagcttcaacaagc 37282813  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 131  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||| ||||    
T  37282814 tcacaaggaacaaaccctaatttataccatttt 37282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6027391 - 6027151
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027391 tgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 6027292  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027291 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 6027192  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027191 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6027151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25421450 - 25421208
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421450 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 25421351  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421350 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 25421251  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421250 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25421208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16653256 - 16653007
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653256 tgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 16653157  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653156 acaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 16653057  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttgcttctcca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  16653056 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttgattctcca 16653007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16555013 - 16554772
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555013 tgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 16554914  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554913 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 16554814  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16554813 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16554772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16631569 - 16631328
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631569 tgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 16631470  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631469 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 16631370  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16631369 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16631328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33342129 - 33342370
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33342129 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 33342228  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342229 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 33342328  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342329 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 33342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27648000 - 27647777
Alignment:
Q  5 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacta 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27648000 ctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaa 27647902  T
Q  105 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647901 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacatggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 27647802  T
Q  205 aatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27647801 aatcaaagaaccctaaaccctagag 27647777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16578542 - 16578783
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578542 tgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 16578641  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578642 acaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagaga 16578741  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16578742 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16578783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16616838 - 16616597
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616838 tgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 16616739  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616738 acaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagaga 16616639  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16616638 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16616597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34165002 - 34164761
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34165002 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 34164903  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34164902 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 34164803  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34164802 tactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34164761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34167224 - 34166983
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34167224 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 34167125  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34167124 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 34167025  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34167024 tactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13154059 - 13153886
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13154059 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 13153960  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153959 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggt 13153886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 412246 - 412016
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| || || |||    
T  412246 tgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgataag 412148  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaag 195  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  412147 ttcacaatgaacaa-ccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttttcaacccaag 412049  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  412048 agaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 412016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3072783 - 3073014
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||    
T  3072783 tgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaag 3072881  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3072882 ttcacaatgaacaa-ccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaa 3072980  T
Q  195 gagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  3072981 gagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 3073014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 2171556 - 2171792
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2171556 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaagggttacaagaaattagctttgacaagtt 2171653  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  2171654 cacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca 2171752  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2171753 acccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 2171792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 6097475 - 6097695
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |          |||||||||||||| || ||||||||    
T  6097475 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagag----------ttacaagaaattagatttgacaagtt 6097563  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta--caaggtgtttcccatgttttc-aacccaaga 196  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||||||||| |||||||| | |||| ||||    
T  6097564 cacaaagaacaatcc-taatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaaga 6097662  T
Q  197 gatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097663 gatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6097695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 31404702 - 31404932
Alignment:
Q  4 cctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttca 101  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31404702 cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttca 31404799  T
Q  102 ctatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgtttt-caacc 191  Q
    | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||| |||||    
T  31404800 caaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacc 31404898  T
Q  192 caagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31404899 caagaga-actctaatcaaaagaccctaaacccta 31404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 5406224 - 5406456
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5406224 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 5406321  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  5406322 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca 5406420  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406421 acccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5406456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 5410549 - 5410781
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5410549 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 5410646  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  5410647 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca 5410745  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410746 acccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 30834560 - 30834794
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30834560 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 30834657  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  | |||||||| | |||||| |    
T  30834658 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccgaggtgtttacaatgtttct 30834756  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30834757 caacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 30834794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 5413418 - 5413561
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5413418 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 5413515  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || | | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5413516 tcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 5413561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16452353 - 16452583
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggata-caaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16452353 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 16452450  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||| |    
T  16452451 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttct 16452549  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16452550 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaac 16452583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21589075 - 21588931
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  21589075 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 21588978  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21588977 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21593808 - 21593664
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  21593808 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 21593711  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593710 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 2972963 - 2973107
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  2972963 tgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 2973060  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2973061 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 3808732 - 3808877
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||    
T  3808732 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttcaacaag 3808829  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3808830 ctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 145
Target Start/End: Original strand, 33160381 - 33160521
Alignment:
Q  6 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcact 103  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33160381 tactctggaggagagattgatctctccaatccaccatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcaca 33160478  T
Q  104 atgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    | |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  33160479 aagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 22424850 - 22424995
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa---ggttacaagaaattagctt-gacaa 96  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||  ||||    
T  22424850 tgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaa 22424946  T
Q  97 gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    | |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22424947 gctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Original strand, 9183063 - 9183199
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |    
T  9183063 tctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaag 9183160  T
Q  107 aacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9183161 aac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 28137432 - 28137576
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  28137432 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 28137529  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28137530 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 26830147 - 26830289
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||     
T  26830147 tgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatggattacaagaaattagcttcaacaagc 26830244  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 143  Q
    |||| | |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26830245 tcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17758163 - 17758026
Alignment:
Q  5 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcac 102  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  17758163 ctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac 17758066  T
Q  103 tatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
     | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17758065 aaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17763130 - 17762990
Alignment:
Q  5 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcac 102  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  17763130 ctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcac 17763033  T
Q  103 tatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17763032 aaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16569166 - 16568953
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||            ||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  16569166 tgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac------------aaaggttacaagaaattagcttaaacaagct 16569080  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttttc-aacccaa 194  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||||| | |||||||    
T  16569079 cacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaa 16568983  T
Q  195 gagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16568982 gaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5043771 - 5043630
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  5043771 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 5043674  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  5043673 tcacaaagaacaaa-cctaatttctactcattttctcaatctcac 5043630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 3038927 - 3039071
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||     
T  3038927 tgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagc 3039024  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3039025 tcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 26954310 - 26954450
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||||||  |||||     
T  26954310 tgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacagatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 26954407  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954408 tcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26800731 - 26800642
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  26800731 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaattagttacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 5409093 - 5409164
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5409093 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagg 5409164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 33211209 - 33211353
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||| ||| | ||||     
T  33211209 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagctacaagaaattaacttcatcaagc 33211306  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33211307 tcacaaagaac-aaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaa 33211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   |||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaa-tgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttcta 4045444  T
Q  125 cccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  4045443 ccattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 603112 - 603201
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  603112 tgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 603201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25637571 - 25637331
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637571 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 25637472  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637471 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 25637372  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25637371 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagatacccctttg 25637331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3617594 - 3617352
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617594 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 3617495  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617494 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 3617395  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617394 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3617352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4600768 - 4601009
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4600768 tgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaatgt 4600867  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600868 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 4600967  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4600968 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4601009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45283130 - 45282897
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa---gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283130 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaag 45283031  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283030 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgtttcccatgttttcaacccaag 45282931  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282930 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 45282897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6716643 - 6716414
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716643 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 6716545  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716544 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 6716445  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716444 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6716414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54635268 - 54635039
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635268 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 54635170  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635169 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 54635070  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635069 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 54635039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4598547 - 4598788
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4598547 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 4598646  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598647 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacagggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 4598746  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598747 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4598788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10056363 - 10056122
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10056363 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 10056264  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10056263 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 10056164  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10056163 tactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10056122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10058585 - 10058344
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10058585 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 10058486  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10058485 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 10058386  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10058385 tactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10058344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10060807 - 10060566
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10060807 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 10060708  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10060707 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 10060608  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10060607 tactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10060566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10063029 - 10062788
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10063029 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 10062930  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10062929 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 10062830  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10062829 tactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10062788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10065251 - 10065010
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10065251 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 10065152  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10065151 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 10065052  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10065051 tactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10065010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10211539 - 10211298
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10211539 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 10211440  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10211439 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 10211340  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10211339 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10211298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10209319 - 10209078
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10209319 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 10209220  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10209219 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 10209120  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10209119 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10209078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067232
Alignment:
Q  43 caaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  141 accaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10067232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 801236 - 801005
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||    
T  801236 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaag 801138  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  801137 ttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaa 801039  T
Q  195 gagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  801038 gagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 801005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 7780028 - 7780208
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7780028 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagtt 7780126  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttccca 180  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  7780127 cacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718598
Alignment:
Q  111 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  209 aaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagag 6718598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23200162 - 23200398
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23200162 tgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 23200259  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    |||| | |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  23200260 tcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca 23200358  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200359 acccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23200398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45095307 - 45095075
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45095307 tgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 45095210  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  45095209 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca 45095111  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095110 acccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23197963 - 23198199
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23197963 tgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 23198060  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    |||| |  ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  23198061 tcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca 23198159  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23198160 acccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23198199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 5258168 - 5258402
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5258168 tgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 5258265  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  5258266 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 5258364  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5258365 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5258402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9636150 - 9636385
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  9636150 tgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagt 9636247  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctc-------accaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||       |||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | || |||      
T  9636248 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcc 9636346  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636347 caacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 9636385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 5260347 - 5260581
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5260347 tgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 5260444  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctc-------accaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||       |||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  5260445 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 5260543  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260544 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5260581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37408602 - 37408458
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37408602 tgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 37408505  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37408504 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 19683913 - 19684054
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19683913 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 19684010  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19684011 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7762409 - 7762265
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  7762409 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagt 7762312  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7762311 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7764608 - 7764476
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  7764608 tgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagt 7764511  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 134  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7764510 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34491356 - 34491212
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  34491356 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 34491259  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34491258 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 39153385 - 39153526
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  39153385 tgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttctta-taaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagc 39153482  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39153483 tcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 29196410 - 29196555
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||| ||||||     
T  29196410 tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagc 29196507  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196508 tcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9581426 - 9581193
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||     
T  9581426 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttaaaagaaattagcttaaacaagc 9581329  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |    
T  9581328 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccc 9581230  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9581229 aacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 9581193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 41819547 - 41819691
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41819547 tgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttagacaag 41819643  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41819644 ctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4570094 - 4569952
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  | ||| ||    
T  4570094 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctc 4569997  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4569996 acaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30236269 - 30236129
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||     
T  30236269 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagc 30236172  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 141  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30236171 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 49199493 - 49199638
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  49199493 tgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaag 49199590  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199591 ctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 760991 - 760850
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  760991 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 760894  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  760893 tcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcac 760850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 22835026 - 22835167
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  22835026 tgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 22835123  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22835124 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 6095623 - 6095767
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  | ||||    
T  6095623 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaagaagt 6095720  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    | || | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6095721 ttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40734642 - 40734498
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||     
T  40734642 tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgtgttacaagaaattaggttcaacaagc 40734545  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40734544 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44331689 - 44331545
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||     
T  44331689 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaatggcttacaagaaattagcttcaacaagc 44331592  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44331591 tcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 46860618 - 46860474
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  46860618 tgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 46860521  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46860520 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 43401825 - 43401970
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||   ||||||||||||||||||  |||||    
T  43401825 tgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaag 43401922  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43401923 ctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Original strand, 44700516 - 44700646
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||    
T  44700516 ggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aa 44700612  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44700613 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40735527 - 40735383
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||     
T  40735527 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagc 40735430  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40735429 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 40735383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 51398958 - 51398818
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  51398958 tgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagt 51398861  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 141  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51398860 tcactaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 51398818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54593848 - 54593704
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||     
T  54593848 tgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagc 54593751  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  54593750 tcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29682489 - 29682269
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||    
T  29682489 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa 29682392  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagata 200  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |    
T  29682391 -cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-a 29682294  T
Q  201 ctctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  29682293 ctctaatcaaag-acccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31314589 - 31314447
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  31314589 tgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaga 31314492  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 143  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31314491 tcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 5236481 - 5236624
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||    
T  5236481 tgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 5236577  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5236578 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29811012 - 29810868
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  29811012 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 29810915  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  29810914 tcacaaagaac-aactctaatttctacatattttcctaatctcaccaa 29810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29813199 - 29813063
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |    
T  29813199 tctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag 29813102  T
Q  107 aacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29813101 aac-aaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaa 29813063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 53921531 - 53921671
Alignment:
Q  5 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcac 102  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  53921531 ctactccgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaagaaattagctttaacaagctcac 53921628  T
Q  103 tatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  53921629 aaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32891248 - 32891105
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  32891248 tgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 32891151  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 143  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32891150 tcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 43403768 - 43403913
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |   |||||||||||| |||||  |||||    
T  43403768 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagataaaacatgagttacaagaaatgagcttcaacaag 43403865  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403866 ctcacaaagaac-aagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43403913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 46173501 - 46173377
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  46173501 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 46173404  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc 126  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  46173403 tcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16499171 - 16498952
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| |     
T  16499171 acctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagctt 16499074  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcta---caaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    || |  ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |||   |||||||||| | |||||| |||    
T  16499073 acaa--aaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctca 16498976  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16498975 acctaagaga-actctaatcaaaga 16498952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 55301996 - 55302079
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaat 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  55301996 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac-aaagagatacaaataggttacaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 145
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352278
Alignment:
Q  16 gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaacc 114  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||| | || | |||| |||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaa-tgagttattacaaa-gaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaacc 51352247  T
Q  115 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  51352248 ctaacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 32744460 - 32744684
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  32744460 tgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagc 32744557  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 194  Q
    |||| | |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | |||||||||  ||| |||  ||| |||||| | ||||||  ||||||||    
T  32744558 tcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactcaatgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaa 32744654  T
Q  195 gagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32744655 gaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 32744684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018852
Alignment:
Q  10 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaag 36018891  T
Q  107 aacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36018890 aac-aaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaa 36018852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  73 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 40913437 - 40913352
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 87  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  40913437 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 140
Target Start/End: Original strand, 4055813 - 4055926
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagtt-cttacaaaagggatacaaaag--gttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttc 122  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||||  |||||||||    
T  4055813 ctcttcaatccactatcaa-tgagtttcttacaaa-gagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttc 4055908  T
Q  123 tacccttttcccaatctc 140  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  4055909 tacccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 27305734 - 27305777
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatca 44  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305734 tgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253423
Alignment:
Q  74 gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 133  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctaccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 47304395 - 47304340
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 57  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47304395 tgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 47304340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25078265 - 25078023
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078265 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 25078166  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078165 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 25078066  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078065 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25078023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25136234 - 25135992
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136234 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 25136135  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136134 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 25136035  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136034 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25135992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10593402 - 10593161
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593402 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 10593303  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10593302 actatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagaga 10593203  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10593202 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttccccctttg 10593161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16546775 - 16546534
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16546775 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 16546676  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546675 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 16546576  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546575 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16546534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 22536314 - 22536545
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536314 tgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 22536412  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536413 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctgcagggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 22536512  T
Q  201 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536513 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 22536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40380235 - 40379995
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40380235 tgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagtt 40380136  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40380135 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagat 40380036  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380035 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40379995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40382446 - 40382206
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382446 tgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagtt 40382347  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40382346 cactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagat 40382247  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382246 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40382206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16544553 - 16544312
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  16544553 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgt 16544454  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544453 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 16544354  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544353 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16544312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29751184 - 29751414
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29751184 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagtt 29751282  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751283 cacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 29751382  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751383 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29722668 - 29722438
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29722668 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagtt 29722570  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722569 cacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 29722470  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722469 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29722438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29720508 - 29720278
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29720508 tgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagtt 29720410  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 197  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720409 cacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagag 29720310  T
Q  198 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720309 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29720278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9789248 - 9789478
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  9789248 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagt 9789346  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaag 195  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9789347 tcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaag 9789445  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9789446 agaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 9789478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16409619 - 16409389
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  16409619 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagt 16409521  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaag 195  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  16409520 tcacaaagaacaa-ccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaag 16409422  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16409421 agaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 16409389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18441672 - 18441902
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  18441672 tgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagt 18441770  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaag 195  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18441771 tcacaaggaacaa-ccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaag 18441869  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18441870 agaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 18441902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26178026 - 26177797
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  26178026 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagt 26177928  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaag 195  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  26177927 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaag 26177830  T
Q  196 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26177829 agaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 26177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25412904 - 25412672
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25412904 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 25412807  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  25412806 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca 25412708  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412707 acccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26170906 - 26170688
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |          |||||||||||||| || ||||||||    
T  26170906 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagag----------ttacaagaaattagatttgacaagtt 26170818  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaaga 196  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  26170817 cacaaagaacaatcc-taatttctacccttttcc-aatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaaga 26170720  T
Q  197 gatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||  || ||||||||| || |||||||||||||    
T  26170719 gaagctgtaatcaaag-actctaaaccctagag 26170688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13343204 - 13342971
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13343204 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagt 13343108  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  13343107 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 13343009  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13343008 caacccaagaga-actctaatcagag-accctaaacccta 13342971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30182732 - 30182499
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30182732 tgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 30182635  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  30182634 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttgcaatgtttccc 30182536  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30182535 aacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatcccta 30182499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13239895 - 13239674
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  13239895 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagt 13239798  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  13239797 tcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccc 13239699  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239698 aacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 36074067 - 36074302
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36074067 tgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagt 36074163  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc----ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt 185  Q
    || | | |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||    
T  36074164 tcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttt 36074262  T
Q  186 -tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
      |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074263 cccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40147405 - 40147261
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  40147405 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 40147308  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147307 tcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 213609 - 213465
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||     
T  213609 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttaacaagc 213512  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  213511 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32636968 - 32636824
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32636968 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagt 32636871  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32636870 tcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 37439285 - 37439161
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  37439285 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagt 37439188  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc 126  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  37439187 tcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28278460 - 28278316
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  28278460 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 28278363  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28278362 tcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13488347 - 13488203
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  13488347 tgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 13488250  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13488249 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 42428454 - 42428598
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  42428454 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 42428551  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42428552 tcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13695714 - 13695859
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| || |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||     
T  13695714 tgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagc 13695812  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13695813 tcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 27637637 - 27637781
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||    
T  27637637 tgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaag 27637733  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||  | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27637734 ctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 142
Target Start/End: Original strand, 39468587 - 39468714
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  39468587 ggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aa 39468683  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39468684 ccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5058189 - 5058047
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||| ||||||  |||||     
T  5058189 tgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggatacaagaaaatagcttcaacaagc 5058092  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058091 tcac--agaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 28750679 - 28750823
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||| |||  |||| |    
T  28750679 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggttacaggaaattaacttcaacaatt 28750776  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28750777 tcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 28750823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 30682946 - 30683178
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag--ttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaa 96  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  30682946 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaa 30683043  T
Q  97 gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt- 185  Q
    ||||||    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||     
T  30683044 gttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttc 30683139  T
Q  186 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683140 gcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33831824 - 33831590
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  33831824 tgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 33831727  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgtttt- 186  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||        |||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||||||     
T  33831726 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttc 33831628  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33831627 caacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 33831590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 42426259 - 42426403
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||  |||| |    
T  42426259 tgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaatt 42426356  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42426357 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 42426403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 8565970 - 8566192
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  8565970 tgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-agagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 8566067  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgttttc 187  Q
    |||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||||| |    
T  8566068 tcacaaagaacaaa-cctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 8566166  T
Q  188 -aacccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8566167 gaacccaagaga-actctaatcaaaga 8566192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31183115 - 31182883
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||  |    
T  31183115 tgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaa-tgagttcttacaaa-gggatacaaatggttacaagaaattaacttaaacaaact 31183018  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ac--aaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    ||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || || ||  ||||||||| | ||||||  ||    
T  31183017 cacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaatgtttccca 31182919  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31182918 acccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 31182883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 533913 - 533769
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||     
T  533913 tgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagc 533816  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  533815 tcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 16640964 - 16641091
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||| |||||  |||||     
T  16640964 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca----agttcttac-aaagagatacaaaagagttatcagaaatcagcttcaacaagc 16641058  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 131  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16641059 tcacaaagaacaaacactaatttctaccatttt 16641091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 9049368 - 9049506
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  9049368 acctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctc 9049465  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 142  Q
    || |  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9049466 ac-aaaaacaaacactaatttctatcattttcccaaactcac 9049506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 538169 - 538028
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  |||||     
T  538169 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 538072  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  538071 tcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcac 538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16452224 - 16452003
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  16452224 tgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 16452127  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttc- 187  Q
    |||  | ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| |     
T  16452126 tcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcacttaccaaggtgtttacaatgtttccg 16452028  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16452027 aacccaagaga-actctaatcaaaga 16452003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 38747135 - 38747009
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| || |||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||    
T  38747135 ggagagattgatctctccaatcctctatcaa-tgagtttttccaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aa 38747039  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38747038 ccctaatttctacccattttcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 316907 - 316769
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||| |||||| |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||     
T  316907 tgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaa-tgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaagc 316809  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 139  Q
    || | | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  316808 tctccaagaacaaacc-taatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 4160743 - 4160702
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160743 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 42309963 - 42310048
Alignment:
Q  5 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42309963 ctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaa-taagttcttacaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctt 42310048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 3075682 - 3075823
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| || | ||||     
T  3075682 tgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaac-gaattcttacaaaaag-atacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagc 3075779  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  3075780 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttctcaatctcac 3075823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054929
Alignment:
Q  28 tctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 91  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10054867 tctccaatacactatcaa-tgagttcattacaaa-gagatacaaaaggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 19806507 - 19806463
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 45  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19806507 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 3750 - 3990
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3750 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgtt 3849  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3850 cactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 3949  T
Q  200 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25690098 - 25689865
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690098 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 25690000  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689999 acaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 25689900  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689899 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15290668 - 15290427
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15290668 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 15290569  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15290568 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 15290469  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15290468 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15290427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15471037 - 15470796
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15471037 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 15470938  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15470937 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 15470838  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15470837 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15470796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 42575348 - 42575589
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42575348 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgt 42575447  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42575448 tcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagg 42575547  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42575548 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 42575589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3439647 - 3439418
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3439647 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgccaagttc 3439549  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439548 ataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 3439449  T
Q  199 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439448 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 3439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2627880 - 2627649
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  || ||||||||||| || ||||||    
T  2627880 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaag 2627782  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2627781 ttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaa 2627683  T
Q  195 gagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2627682 gagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 2627649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 34254355 - 34254586
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  34254355 tgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaa-taagttcttacaaa-gagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagt 34254452  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaa 189  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||| | |||    
T  34254453 tcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtctccaa 34254551  T
Q  190 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254552 cccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 34254586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44303999 - 44303764
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44303999 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta-aaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagt 44303902  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc---ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt- 185  Q
    |||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||     
T  44303901 tcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttc 44303803  T
Q  186 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303802 ccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 44303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17982797 - 17982563
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  17982797 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagt 17982700  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  17982699 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 17982601  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982600 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 17982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31218401 - 31218167
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31218401 tgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 31218304  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-t 186  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||      
T  31218303 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 31218205  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218204 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 31218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 34256531 - 34256762
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  34256531 tgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagt 34256628  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaa 189  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||||||||  ||| | |  |||||||||| | |||||| |||    
T  34256629 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacacaccaaggtgtttacaatgtttccaa 34256727  T
Q  190 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256728 cccaagata-actctaatcaaag-accctaaacccta 34256762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 19945383 - 19945529
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc-ttgacaag 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19945383 tgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaag 19945480  T
Q  98 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19945481 ttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaa 19945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42498338 - 42498193
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  42498338 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagt 42498241  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42498240 tcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 1746243 - 1746371
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1746243 tgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 1746339  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 131  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  1746340 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttt 1746371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15212930 - 15212786
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  15212930 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 15212833  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15212832 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 42435015 - 42435159
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  42435015 tgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 42435112  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42435113 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagct 40328825  T
Q  100 cactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40328824 cacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4283668 - 4283524
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  4283668 tgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 4283571  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283570 tcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33352294 - 33352150
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||    
T  33352294 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagt 33352197  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33352196 tcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43036567 - 43036423
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||| ||  ||||||    
T  43036567 tgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagt 43036470  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43036469 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18655544 - 18655400
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  18655544 tgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 18655447  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18655446 tcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27811422 - 27811278
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  27811422 tgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 27811325  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27811324 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765745
Alignment:
Q  27 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 9765767  T
Q  125 ccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  9765766 cccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 30143476 - 30143346
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |    
T  30143476 tctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag 30143379  T
Q  107 aacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatct 139  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30143378 aac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30291737 - 30291606
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||    
T  30291737 ggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gaattcttac-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa 30291640  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30291639 acctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40321224 - 40321082
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aaaaggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||  |||||     
T  40321224 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtttttac-aaagagatactaatgggttacaagaaattaacttcaacaagc 40321127  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 143  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40321126 tcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 12702658 - 12702787
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  12702658 tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttac-aaagagacacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagt 12702755  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 131  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12702756 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt 12702787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18141964 - 18141821
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  18141964 tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 18141867  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18141866 tcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 3303694 - 3303838
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||     
T  3303694 tgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagc 3303791  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3303792 tcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40221889 - 40221745
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||     
T  40221889 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagc 40221792  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40221791 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 112  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aa 44353827  T
Q  113 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44353826 ccctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4731794 - 4731658
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 106  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |    
T  4731794 tctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaag 4731697  T
Q  107 aacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4731696 agc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 41366652 - 41366727
Alignment:
Q  15 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41366652 ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagggatacaaataggttaaaagaaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 1345395 - 1345536
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggataca-aaaggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| |  |||||||||||||||||||  | ||      
T  1345395 tgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttctttc-aaagagatacatatgggttacaagaaattagcttcaataaac 1345492  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 142  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1345493 tcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttcccaatctcac 1345536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6599116 - 6598975
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  6599116 tgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-gtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 6599019  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    || | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6599018 tcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6598975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6674569 - 6674428
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||  |||||     
T  6674569 tgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-gtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 6674472  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 142  Q
    || | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6674471 tcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6674428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 1292488 - 1292631
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  1292488 tgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 1292584  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1292585 tcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5689407 - 5689326
Alignment:
Q  9 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5689407 tctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 5689326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 19491723 - 19491867
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| || | ||||     
T  19491723 tgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaac-gagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagc 19491820  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19491821 tcacaaagaacaaacc-taatttctacccattttcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 8965715 - 8965859
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 98  Q
    ||||||| | ||| |||||||||   |||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||| ||| | |||      
T  8965715 tgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatataaaagggttataagaaattaacttcaacaaac 8965812  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8965813 tcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 4743238 - 4743306
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaa 70  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  4743238 tgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaatgggttacaa 4743306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 10930223 - 10930365
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||  || ||     
T  10930223 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgtgttcttac-aaagagatataaatgggttacaagaaattagcttcaacgagc 10930320  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcacc 143  Q
    |||| | || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10930321 tcacaaagagc-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacc 10930365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11384127 - 11383989
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  11384127 acctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatc-aatgggttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactc 11384030  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 141  Q
    || | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11384029 acaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 11383989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4162640 - 4162516
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  4162640 tgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagt 4162544  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc 127  Q
    || | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162543 tctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7597759 - 7597669
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7597759 tgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagctt 7597669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41267051 - 41266982
Alignment:
Q  65 atacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttc 132  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41267051 atacaaaagagttacaagaaattagtctcaacaagttctctaagaacaaaacctaatttctaccattttc 41266982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1822365 - 1822297
Alignment:
Q  73 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 140  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1822365 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1822297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1856810 - 1856742
Alignment:
Q  73 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 140  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1856810 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1856742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 10015223 - 10015136
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10015223 tgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatc-aatgagttcct--aaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 18106105 - 18106191
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18106105 tgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaa-tgagttcttacaaaa--gatacaaatgagttacaagaaattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 140
Target Start/End: Original strand, 29796413 - 29796485
Alignment:
Q  69 aaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 140  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | ||||||| | | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  29796413 aaaatgttacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactcttttcccaatctc 29796485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6415 - 6177
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttca 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6415 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttacaagaaattagcttgacaagttca 6316  T
Q  102 ctatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6315 ctatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 6216  T
Q  202 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6215 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 6177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 434677 - 434443
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  434677 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 434580  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt--cccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgtttt- 186  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||||| ||| |||||||||     
T  434579 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtatttaccatgttttc 434481  T
Q  187 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  434480 caacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 434443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11185 - 11423
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||    
T  11185 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagt 11283  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||  | |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  11284 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccc 11382  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 229  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11383 aacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagag 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 8759 - 8907
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||    
T  8759 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagt 8857  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaaga 147  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8858 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1059 - 827
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1059 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgtt--caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagt 963  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac------caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 187  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |    
T  962 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccc 864  T
Q  188 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  863 aacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11701 - 11557
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11701 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagt 11604  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11603 tcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 114744 - 114602
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  114744 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagcgttacaagaaattagctttgacaagttc 114647  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  114646 acaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 18028 - 18171
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||     
T  18028 tgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 18124  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18125 tcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaa 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7469 - 7327
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  7469 acctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 7372  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 145  Q
    || | |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7371 acaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 20439 - 20583
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  20439 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagt 20536  T
Q  99 tcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 145  Q
    |||| |  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20537 tcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 149123 - 149343
Alignment:
Q  3 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| |     
T  149123 acctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagctt 149220  T
Q  101 actatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcta---caaggtgtttcccatgttt-tca 188  Q
    || |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |||   |||||||||| | |||||| |||    
T  149221 acaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctca 149319  T
Q  189 acccaagagatactctaatcaaaga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  149320 acctaagaga-actctaatcaaaga 149343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10633 - 10546
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10633 tgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaataaattagc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 27466 - 27556
Alignment:
Q  1 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 91  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||   |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27466 tgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 27556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 141
Target Start/End: Original strand, 80351 - 80447
Alignment:
Q  46 atgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 141  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  80351 atgagttcttacaaaaag-atacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctca 80447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University