View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1789_high_27 (Length: 249)

Name: NF1789_high_27
Description: NF1789
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1789_high_27
NF1789_high_27
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (1-239)||(21689369-21689607)
chr7 (4-233)||(21681612-21681841)
chr7 (4-236)||(21646702-21646934)
chr7 (4-239)||(21791967-21792202)
chr7 (23-239)||(15713579-15713795)
chr7 (43-213)||(21664080-21664250)
chr7 (30-216)||(21788208-21788394)
chr7 (34-222)||(21623160-21623354)
chr7 (34-202)||(21704636-21704804)
chr7 (45-213)||(21785388-21785556)
chr7 (43-223)||(21808161-21808341)
chr7 (43-216)||(21652048-21652221)
chr7 (30-202)||(21628118-21628290)
chr7 (37-193)||(21992175-21992340)
chr7 (34-169)||(21714209-21714344)
chr7 (45-195)||(21745532-21745682)
chr7 (4-194)||(21725897-21726087)
chr7 (34-129)||(21764128-21764223)
chr7 (43-194)||(21771962-21772113)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (33-129)||(25376-25472)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21689607 - 21689369
Alignment:
Q  1 atgtttttgtgtagatccctctgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21689607 atgtttttgtgtagatccctctgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagagatttattgc 21689508  T
Q  101 catgatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21689507 catgatggataggaccttttgacatcaacctcggggtctaatgcttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcaccctttgtatctttggtcg 21689408  T
Q  201 tgaactttcgggtgttggatttgtatctatgtacctttg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21689407 tgaactttcgggtgttggatttgtatctatgtacctttg 21689369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21681841 - 21681612
Alignment:
Q  4 tttttgtgtagatccctctgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccat 103  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21681841 tttttgtatagatccttttgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatctgtattgccat 21681742  T
Q  104 gatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtga 203  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||| || || |||||||  ||||||| ||| ||||  | |||||||| |||||||||| |||||    
T  21681741 gatggataggacctattgacacaaacttggggctgtaatgctccttaaattttgttctatttttgacataccgtggcaccctttgtatctttggtcgtga 21681642  T
Q  204 actttcgggtgttggatttgtatctatgta 233  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21681641 attttggggtgtttgatttgtatctatgta 21681612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21646934 - 21646702
Alignment:
Q  4 tttttgtgtagatccctctgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |  |||| |||    
T  21646934 tttttgtgtagatccttcttaattcttcccgtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtatttctctcctatcttcagctttggattgtcat 21646835  T
Q  104 gatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtga 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  21646834 gatggataggacctattgacaccaacttgggggtgtaatgctcctcaaattttgttctatttctgagatactgtggcaccctttgtatctttggtcgtga 21646735  T
Q  204 actttcgggtgttggatttgtatctatgtacct 236  Q
    | ||| ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  21646734 attttggggtgtttgatctatatctatgtacct 21646702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21792202 - 21791967
Alignment:
Q  4 tttttgtgtagatccctctgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccat 103  Q
    |||||||| |||||  || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||    
T  21792202 tttttgtgcagatctttcagaatgctttcagtttttttgatgtattctgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactccagatctgtactgccat 21792103  T
Q  104 gatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtga 203  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||   |||    
T  21792102 gatggatgggacctattgatacaaaccttgggatgtaatgcttctcaaaattttctctctttctgagatactctgccaccctttgtatctttggttttga 21792003  T
Q  204 actttcgggtgttggatttgtatctatgtacctttg 239  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21792002 acttgggggtgttggatttgtatctatgtacctttg 21791967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15713795 - 15713579
Alignment:
Q  23 gaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattga 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15713795 gaatgcttccagtgtttttgatgtattttgccgcccacataagcttgtacttctcccctgactttagatttgtattgtcatgatggatagggcctattga 15713696  T
Q  123 catcaacctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtgaactttcgggtgttggattt 222  Q
     | |||| | || | ||||| | ||||| | ||||  || |||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||    
T  15713695 aaccaacttaggtgcgtaatgcatctcataatttttactttttctgagatagcctggcaccctttgtatctttggtcgtgaactttggggtgtttgcttt 15713596  T
Q  223 gtatctatgtacctttg 239  Q
    |||| |||||| |||||    
T  15713595 gtatttatgtaactttg 15713579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21664250 - 21664080
Alignment:
Q  43 atgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || | |||||    
T  21664250 atgtattttgctgcccacataagcttgtacttccctcctaacttcagatctgtattgccatgatggataggacctattgacaggaacttgggtgagtaat 21664151  T
Q  143 acttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtgaactttcgggt 213  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||  | | |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  21664150 acttctcaaagttttttctgtttctgagattgtgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaactttggggt 21664080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21788394 - 21788208
Alignment:
Q  30 tccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaac 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  21788394 tccagtgttttcgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaacttcaaatttgtgttgtcatgatggataggacctaccgacaacaac 21788295  T
Q  130 ctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtgaactttcgggtgtt 216  Q
     | || | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| || || |||||| ||| |||||||    
T  21788294 ttgggcgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgagatactctgccaccctttgtattttcggtcgtgaattttggggtgtt 21788208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21623354 - 21623160
Alignment:
Q  34 gtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  21623354 gtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaacttcagatttgtattgccatgatggataggacctattgacaccaacttgg 21623255  T
Q  134 gggtgtaatacttctcaaatttttctctatt------tctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtgaactttcgggtgttggattt 222  Q
    | | ||||| |||  ||||    | ||||||      || || |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21623254 gtgagtaatgcttggcaaaaaaatttctatttccgaatccgacatactctgccaccctttgtatctttggtcgtgaactttcgggtgttggattt 21623160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21704804 - 21704636
Alignment:
Q  34 gtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcg 133  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| | |    
T  21704804 gtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaacttcagagttggattgtcatgatggataggacctatcgacactaacttgg 21704705  T
Q  134 gggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtg 202  Q
    | | ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21704704 gtgagtaatgctgctcaaagttttttctacttctgagatactcttgcaccctttgtatctttggtcgtg 21704636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21785556 - 21785388
Alignment:
Q  45 gtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaatac 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | || | ||||| |    
T  21785556 gtattttgcggcccacataagcttgtacttctctcctgtcttcagatttggattgtcatgatggataggacctattgacactaacttgggtgagtaatgc 21785457  T
Q  145 ttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtgaactttcgggt 213  Q
    |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  21785456 ttctcaaagtttttcctatttcttagatactcttgcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggt 21785388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Original strand, 21808161 - 21808341
Alignment:
Q  43 atgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaat 142  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | || | |||||    
T  21808161 atgtatttcgcagaccacataagcttgtacttctctcctaacttcagatttatatttccatgatggataggacctattgataccaacttgggtgagtaat 21808260  T
Q  143 acttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtgaactttcgggtgttggatttg 223  Q
     ||||||||  |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||    
T  21808261 gcttctcaagatttgttctatttctgagatactcagccaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtatttgatttg 21808341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21652221 - 21652048
Alignment:
Q  43 atgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   || | || | ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||    
T  21652221 atgtattttgctgcccacataagcttatactcctctcctggtttcatatttgtattgtcatgatggataggacctattgaaacaaacttgggggtgtaat 21652122  T
Q  143 acttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtgaactttcgggtgtt 216  Q
      |||||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  21652121 gtttctcaaaattgtttctatttctgagatactgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtgtt 21652048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21628290 - 21628118
Alignment:
Q  30 tccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaac 129  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21628290 tccaatgttttctatgtattttgatgcccacacaagcttgtacttctctcctatgttcagatttgtactgccatgatggataggacctattgacacaaac 21628191  T
Q  130 ctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctttggccgtg 202  Q
     | || | |||||||||| |||| | || | ||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||| ||||    
T  21628190 ttgggtgagtaatacttcccaaaatcttttttatttctgagatgatcggccaccctttgtatctttggtcgtg 21628118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21992340 - 21992175
Alignment:
Q  37 tttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagat---------gtttattgccatgatggataggacctattgacatca 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||          | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21992340 ttttcgatgtattttgctgcccacgtaagcttgtacttctctcctaacttcagatttgcattgcttgtattgccatgatggataggacctattgacacca 21992241  T
Q  128 acctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatct 193  Q
    |  | || | ||| | ||||||||| | || ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  21992240 atttgggtgagtagtgcttctcaaagtcttttctatttttgagatactctgccaccctttgtatct 21992175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21714344 - 21714209
Alignment:
Q  34 gtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcg 133  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||  ||| | |    
T  21714344 gtgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctcctttcttcagatttggattgtcatgatggataggacctaatgacacaaacttgg 21714245  T
Q  134 gggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctga 169  Q
    | | ||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  21714244 gtgagtaatgcttctcaaaatttgttctatttctga 21714209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21745682 - 21745532
Alignment:
Q  45 gtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaatac 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | || | ||||| |    
T  21745682 gtattttgctgcccacataagcttatactcttctcctgtctttagatttggattgtcatgatggataggacctaatgacaccaacttgggtgagtaatgc 21745583  T
Q  145 ttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatcttt 195  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  21745582 ttctcaaaatttgttctatttatgagatggtctaccaccctttgtatcttt 21745532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21726087 - 21725897
Alignment:
Q  4 tttttgtgtagatccctctg-aatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||| | | ||   |    
T  21726087 tttttgtgtagatcc-tctggaatgtgtccggtgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtactactctgctaatatcagatttgtgttctga 21725989  T
Q  103 tgatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaatacttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctt 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||   || | || | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  21725988 tgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgagagactttagcaccctttgtatctt 21725897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21764223 - 21764128
Alignment:
Q  34 gtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaac 129  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21764223 gtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacttcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaac 21764128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21772113 - 21771962
Alignment:
Q  43 atgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaacctcggggtgtaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||| | | ||   |||||| ||||||||||||||||   || | || | |||||    
T  21772113 atgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatatcagatttgtgttatgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaat 21772014  T
Q  143 acttctcaaatttttctctatttctgagatactcttgcacccttcgtatctt 194  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  21772013 gcttctcaaagttttttctatttctgagagactttagcaccctttgtatctt 21771962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25472 - 25376
Alignment:
Q  33 agtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatgtttattgccatgatggataggacctattgacatcaac 129  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25472 agtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacttcagatttttattgtcatgatggataggacctattgacaccaac 25376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University