View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17904_low_5 (Length: 444)

Name: NF17904_low_5
Description: NF17904
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17904_low_5
NF17904_low_5
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (9-426)||(15019317-15019734)
chr2 (15-419)||(15012832-15013236)
chr2 (15-426)||(31968742-31969153)
chr2 (15-405)||(14528349-14528754)
chr2 (15-407)||(14542573-14542980)
chr2 (15-272)||(14512047-14512304)
chr2 (15-271)||(14533732-14533988)
chr2 (21-260)||(14519899-14520138)
chr2 (15-247)||(15004207-15004439)
chr2 (15-322)||(15007519-15007826)
chr2 (322-405)||(14519751-14519834)
chr2 (322-371)||(14533626-14533675)
chr2 (15-79)||(14547063-14547127)
chr2 (322-403)||(15004511-15004592)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (185-284)||(17357245-17357345)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15019734 - 15019317
Alignment:
Q  9 gcatcagatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||| |    
T  15019734 gcatcagatagaaagaattgaaactttggcaataacattttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcttttttgatgatgatgcgaatgttggagt 15019635  T
Q  109 ttgaaaagccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattc 208  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15019634 ttgaaaagccatagctttttaagaagttgatgactgagtcaggcctatctggggtattgaaacgaacgtgcctgaggttgaaagctttgagagctgattc 15019535  T
Q  209 agttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019534 agttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagt 15019435  T
Q  309 gggaatgagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacatgggtg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15019434 gggaatgagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttggacatgggtg 15019335  T
Q  409 attttgagagtacaatgt 426  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  15019334 attttgagagttcaatgt 15019317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15013236 - 15012832
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       || |||||||| ||||  || | |||||    
T  15013236 gatataaaaaattgaaacttaggcaataaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgcttttttgatgatgatgcgtatgtcagagtgtgaaa 15013137  T
Q  115 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 214  Q
    | ||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15013136 aaccatggttttgaaagaagttgatgactgagtcaggattatctggggtattgaaacgaacttgcctgaggttgaaagctttgagagctgattcagttga 15013037  T
Q  215 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagtgggaat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15013036 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgagaatgggaat 15012937  T
Q  315 gagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacatgggtgattttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  15012936 gagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgttatgacacctaaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttggacatggttgattctg 15012837  T
Q  415 agagt 419  Q
    |||||    
T  15012836 agagt 15012832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31969153 - 31968742
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       || | |||||| ||||  || |||||||    
T  31969153 gatataaaaaattgaaacttaggcaataaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgcttttttgatgaagatgcgtatgtcagagtttgaaa 31969054  T
Q  115 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 214  Q
    | ||||  ||||  |||||| |||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969053 aaccatggttttgaaagaaggtgataacagaatcaggattatctgaggtattgaaacgaacctgcttgaggttgaaagctttgagagctgattcagttga 31968954  T
Q  215 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagtgggaat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31968953 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaaatgggaat 31968854  T
Q  315 gagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacatgggtgattttg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31968853 gagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgacacctaaaacaagattatgggagaaaaacaatttgttggacatggttgattttg 31968754  T
Q  415 agagtacaatgt 426  Q
    ||||| ||||||    
T  31968753 agagttcaatgt 31968742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14528754 - 14528349
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||| ||||||   | |||||    
T  14528754 gatagaaaaaattgaaactttggcaaaaaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgctcttctgatcatgatgcgtatgttgtcgtgtgaaa 14528655  T
Q  115 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 214  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  14528654 agccatgattttgaaagaaggtgatgactgaatcaggtttatctgcggtattgaaacgaacttgcttgaggttgaaagctttgagagcagattcatgtga 14528555  T
Q  215 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagtgggaat 314  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |   | | ||||||||| |||||||    
T  14528554 gaacccaaaattgttgatgagataagatgcagcgaatggatgtgtgactgattcagattgagatgttgtggtgcagaatcttgtgagtgaaaatgggaat 14528455  T
Q  315 gagaagt---------------ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttga 399  Q
    |||||||               |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  14528454 gagaagtgttggttgaaaagagggttgttgaattttgaggttgttgtttttgttgtgatgagacctaaaacaacattctgggagagaaaccatttgttca 14528355  T
Q  400 acatgg 405  Q
    ||||||    
T  14528354 acatgg 14528349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14542980 - 14542573
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||| ||||||   | |||||    
T  14542980 gatagaaaaaattgaaactttggcaaaaaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgctcttctgatcatgatgcgtatgttgtcgtgtgaaa 14542881  T
Q  115 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 214  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  14542880 agccatgattttgaaagaaggtgatgactgaatcaggtttatctgcggtattgaaacgaacttgcttgaggttgaaagctttgagagcagattcatgtga 14542781  T
Q  215 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagtgggaat 314  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |   | | ||||||||| | |||||    
T  14542780 gaacccaaaattgttgatgagataagatgcagcgaatggatgtgtgactgattcagattgagatgttgtggtgcagaatcttgtgagtgaaatttggaat 14542681  T
Q  315 gagaagt---------------ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttga 399  Q
    |||||||               |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  14542680 gagaagtgttggttgaaaagagggttgttgaattttgaggttgttgtttttgttgtgttgagacctaaaacaacattctgggagagaaaccatttgttca 14542581  T
Q  400 acatgggt 407  Q
    ||||||||    
T  14542580 acatgggt 14542573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14512304 - 14512047
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||| ||||||   | |||||    
T  14512304 gatagaaaaaattgaaactttggcaaaaaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgctcttctgatcatgatgcgtatgttgtcgtgtgaaa 14512205  T
Q  115 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 214  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||  ||     
T  14512204 agccatgattttgaaagaaggtgatgactgaatcaggtttatctgcggtattgaaacgaacatgcttgtagttgaaagatttgagagctgattcatgtgt 14512105  T
Q  215 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgat 272  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||| ||||||||||    
T  14512104 gaaaccaaaattgttgatgagataagatgcagcgaatggatgtgtgactgattctgat 14512047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14533988 - 14533732
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||| |||||||| |||| ||    
T  14533988 gatagaaaaaattgaaactttggcaataaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgccttttggatgatgatgcgtatgttggagtttggaa 14533889  T
Q  115 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 214  Q
    | ||||  ||||  |||||| |||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  14533888 aaccatggttttgaaagaaggtgataacagaatcagcattatctggggtattgaaacgaacctgcttgttgttgaaagctttgagagcagattcatgtga 14533789  T
Q  215 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctga 271  Q
    |||  ||||||||||||| || || |||||||  || || |||||| ||||||||||    
T  14533788 gaatccaaaattgttgatgaggtatgatacagagaatggatgtgtgtttgattctga 14533732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14520138 - 14519899
Alignment:
Q  21 aaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaaagccat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||       || |||||||| |||||    | |||||||||||    
T  14520138 aaaaattgaaactttggcaataccattttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgcttttgtgatgatgatgcgtatgttatcgtgtgaaaagccat 14520039  T
Q  121 aattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttgagaaatc 220  Q
      ||||  |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |    
T  14520038 ggttttgaaagaaggtgataacagaatcaggattatctggggtattgaaacgaacctgtctgttgttgaaagctttgagagccgattcatgtgagaaacc 14519939  T
Q  221 aaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtg 260  Q
    ||| |||||||  || || ||||||||||| |||||||||    
T  14519938 aaatttgttgacgaggtatgatacagcaaatggttgtgtg 14519899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 15004207 - 15004439
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||       || |||||||| |||||      |||||    
T  15004207 gatagaaaaaattgaaactttgacaataaacctttgtggggttgcgatgaaagtaaccaaggtgcttttgtgatgatgatgcgtatgttatcgagtgaaa 15004306  T
Q  115 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 214  Q
    | |||| |||||  |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15004307 aaccatgattttgaaagaaggtgataacagaatcaggattatctggggtattgaaacgaacctgcttgttgttgaaagctttgagagttgattcagttga 15004406  T
Q  215 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagc 247  Q
    |||| |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  15004407 gaaaccaaaattgttgacaaggtatgatacagc 15004439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15007826 - 15007519
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 114  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |       || |||||||| |||||    | |||||    
T  15007826 gatagaaaatattcaaactttggcaataacattttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggttcttttctaatgatgatgcgtatgttttcgtgtgaaa 15007727  T
Q  115 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 214  Q
    |||||| |||||  |||||| |||  ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||| ||||| |||| || |||    
T  15007726 agccatgattttgaaagaaggtgagaactgaattaggcttttcaagggtattgaaacgaacctgtttgttgttgaaagctttaagagcagattgaggtga 15007627  T
Q  215 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagtgggaat 314  Q
    |||| ||||||||| ||| || || ||| |||| || || || ||| | |||||||||   ||||||||| |||||   | | ||||||||| |||||||    
T  15007626 gaaaccaaaattgtcgatgaggtaggatgcagcgaatgggtgagtgttggattctgatgttgatgttgtggtgctgaatcttgtgagtgaaattgggaat 15007527  T
Q  315 gagaagtg 322  Q
    ||||||||    
T  15007526 gagaagtg 15007519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14519834 - 14519751
Alignment:
Q  322 ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacatgg 405  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  14519834 ggttgttgaattttggggttgttgattttgttgtgatgagacataaaacaacattctgggaaagaaacagtttcttcaacatgg 14519751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14533675 - 14533626
Alignment:
Q  322 ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaaca 371  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14533675 ggttgttgaattttggggttgttgattttgttgtgatgaaacataaaaca 14533626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14547127 - 14547063
Alignment:
Q  15 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgc 79  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14547127 gatagaaaaaattcaaacttgggcaaaattatattgtggggttgtaatgaaagtaaccatggtgc 14547063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 403
Target Start/End: Original strand, 15004511 - 15004592
Alignment:
Q  322 ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacat 403  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| || |||||||  ||| ||||||| |||| |||| || |||||    
T  15004511 ggttgttgaattttggggttgttgattttgtggtgatgatacctaaaacagcattgtgggagagaaaccatttcttcaacat 15004592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 284
Target Start/End: Original strand, 17357245 - 17357345
Alignment:
Q  185 gttgaaagctttgagagctgatt-cagttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgt 283  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||  | |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||| |  ||||||||    
T  17357245 gttgaaagctttgaaagcagatttcaggagtgaaaccaaaattgtcgatgagatacgatacagcaaatggtggtgtgactaattctgactctgatgttgt 17357344  T
Q  284 g 284  Q
    |    
T  17357345 g 17357345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University