View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17924_low_10 (Length: 483)

Name: NF17924_low_10
Description: NF17924
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17924_low_10
NF17924_low_10
[»] chr8 (88 HSPs)
chr8 (231-471)||(1646719-1646959)
chr8 (237-471)||(1651784-1652018)
chr8 (237-471)||(1740160-1740394)
chr8 (234-471)||(15871833-15872071)
chr8 (233-471)||(27473283-27473522)
chr8 (247-471)||(38588600-38588825)
chr8 (231-471)||(45077415-45077656)
chr8 (232-471)||(33295896-33296136)
chr8 (233-471)||(45276808-45277047)
chr8 (246-471)||(7949424-7949650)
chr8 (234-471)||(15048399-15048637)
chr8 (239-468)||(27669421-27669651)
chr8 (239-471)||(1432136-1432369)
chr8 (247-471)||(44594813-44595038)
chr8 (233-471)||(7535045-7535284)
chr8 (246-464)||(5435119-5435338)
chr8 (239-459)||(11173858-11174079)
chr8 (247-464)||(5152753-5152971)
chr8 (234-471)||(1869934-1870173)
chr8 (236-392)||(15048690-15048847)
chr8 (233-395)||(33819784-33819947)
chr8 (234-395)||(15871621-15871783)
chr8 (234-395)||(45276597-45276759)
chr8 (231-395)||(5434897-5435062)
chr8 (231-395)||(37569311-37569476)
chr8 (232-372)||(1646499-1646639)
chr8 (238-372)||(1739952-1740086)
chr8 (233-394)||(1870224-1870386)
chr8 (234-395)||(34470832-34470994)
chr8 (235-395)||(5152536-5152696)
chr8 (236-395)||(38588875-38589035)
chr8 (234-393)||(40659983-40660143)
chr8 (232-395)||(11707748-11707912)
chr8 (247-470)||(37569527-37569752)
chr8 (237-372)||(40660198-40660333)
chr8 (234-395)||(27473072-27473233)
chr8 (234-471)||(40048067-40048293)
chr8 (237-395)||(40048342-40048501)
chr8 (232-346)||(22763271-22763385)
chr8 (253-395)||(27669709-27669851)
chr8 (302-424)||(18298488-18298611)
chr8 (234-320)||(45077221-45077307)
chr8 (231-356)||(24666006-24666131)
chr8 (231-360)||(33295733-33295862)
chr8 (232-320)||(11920136-11920224)
chr8 (237-395)||(7534845-7534995)
chr8 (237-372)||(44594604-44594739)
chr8 (232-316)||(24652821-24652905)
chr8 (246-335)||(22762525-22762614)
chr8 (386-471)||(11707962-11708047)
chr8 (234-350)||(15740613-15740729)
chr8 (234-309)||(12643891-12643966)
chr8 (234-309)||(15741607-15741682)
chr8 (236-322)||(33819975-33820062)
chr8 (233-293)||(11920075-11920135)
chr8 (400-471)||(24659408-24659479)
chr8 (403-471)||(34470714-34470782)
chr8 (339-395)||(45077307-45077364)
chr8 (233-307)||(29770376-29770450)
chr8 (233-298)||(31988513-31988578)
chr8 (234-298)||(14897390-14897454)
chr8 (234-298)||(45123609-45123673)
chr8 (233-309)||(45436473-45436549)
chr8 (231-298)||(31445666-31445733)
chr8 (235-298)||(40229091-40229154)
chr8 (231-286)||(43633120-43633175)
chr8 (232-298)||(7116470-7116536)
chr8 (232-298)||(9807274-9807340)
chr8 (232-298)||(11713198-11713264)
chr8 (232-298)||(33098964-33099030)
chr8 (233-298)||(2221593-2221658)
chr8 (245-298)||(9739287-9739340)
chr8 (233-298)||(11760909-11760974)
chr8 (232-297)||(18476067-18476132)
chr8 (117-198)||(21141836-21141917)
chr8 (233-298)||(22013461-22013526)
chr8 (233-298)||(26060105-26060170)
chr8 (233-298)||(41155008-41155073)
chr8 (233-298)||(45123219-45123284)
chr8 (234-298)||(761393-761457)
chr8 (234-298)||(9739779-9739843)
chr8 (247-287)||(18298612-18298652)
chr8 (234-298)||(27786479-27786543)
chr8 (239-315)||(29769368-29769444)
chr8 (234-298)||(31988894-31988958)
chr8 (258-298)||(33098611-33098651)
chr8 (234-298)||(41154617-41154681)
chr8 (234-298)||(42193779-42193843)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (233-471)||(21511-21749)
scaffold0115 (231-372)||(22465-22606)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (236-471)||(6137590-6137825)
chr6 (232-471)||(18052954-18053194)
chr6 (239-471)||(5938025-5938258)
chr6 (234-471)||(9046086-9046324)
chr6 (247-471)||(24744341-24744566)
chr6 (231-471)||(32993227-32993468)
chr6 (232-471)||(34890642-34890882)
chr6 (246-471)||(5310838-5311064)
chr6 (239-471)||(2517007-2517240)
chr6 (239-471)||(5639385-5639618)
chr6 (233-471)||(26600356-26600595)
chr6 (233-471)||(7269950-7270191)
chr6 (234-471)||(34994592-34994830)
chr6 (236-471)||(6236133-6236369)
chr6 (244-471)||(21540189-21540417)
chr6 (232-471)||(21856767-21857007)
chr6 (239-471)||(31237751-31237984)
chr6 (239-471)||(31247121-31247354)
chr6 (234-471)||(32753177-32753411)
chr6 (234-418)||(6532192-6532377)
chr6 (233-471)||(26956968-26957200)
chr6 (233-395)||(34890932-34891094)
chr6 (236-395)||(32753461-32753621)
chr6 (233-395)||(3423169-3423332)
chr6 (277-471)||(7270672-7270867)
chr6 (234-395)||(35167490-35167652)
chr6 (236-395)||(15932844-15933004)
chr6 (232-395)||(21856553-21856717)
chr6 (233-395)||(978414-978577)
chr6 (237-395)||(5937816-5937975)
chr6 (233-395)||(9046374-9046537)
chr6 (232-395)||(34994378-34994542)
chr6 (232-393)||(6137377-6137538)
chr6 (236-389)||(25176665-25176819)
chr6 (280-471)||(3423382-3423574)
chr6 (232-395)||(6235919-6236083)
chr6 (309-464)||(25176876-25177032)
chr6 (234-392)||(2517293-2517452)
chr6 (245-395)||(26600635-26600786)
chr6 (231-372)||(18053265-18053406)
chr6 (236-395)||(5311114-5311274)
chr6 (234-395)||(31238034-31238196)
chr6 (236-391)||(32993017-32993173)
chr6 (231-369)||(14276396-14276534)
chr6 (232-392)||(7270920-7271081)
chr6 (234-386)||(26957258-26957411)
chr6 (234-395)||(31247404-31247566)
chr6 (234-395)||(24744609-24744770)
chr6 (236-388)||(10412796-10412949)
chr6 (234-362)||(17244664-17244792)
chr6 (233-335)||(34517271-34517373)
chr6 (233-350)||(7438803-7438920)
chr6 (232-395)||(7270241-7270405)
chr6 (234-350)||(34518026-34518142)
chr6 (233-350)||(29261285-29261402)
chr6 (339-471)||(35167702-35167837)
chr6 (233-328)||(15932729-15932824)
chr6 (234-362)||(6228730-6228857)
chr6 (280-372)||(3035926-3036019)
chr6 (239-346)||(15286350-15286457)
chr6 (239-346)||(29260536-29260642)
chr6 (233-313)||(25180219-25180299)
chr6 (232-306)||(35167833-35167907)
chr6 (246-378)||(6229629-6229760)
chr6 (234-335)||(27829314-27829414)
chr6 (233-364)||(17245580-17245711)
chr6 (233-338)||(34251553-34251656)
chr6 (234-315)||(1158588-1158669)
chr6 (232-298)||(26392839-26392905)
chr6 (233-298)||(17383734-17383799)
chr6 (233-298)||(31739909-31739974)
chr6 (234-298)||(3618781-3618845)
chr6 (234-298)||(21271486-21271550)
chr6 (234-298)||(21272113-21272177)
chr6 (258-298)||(22498408-22498448)
chr6 (234-298)||(22498761-22498825)
[»] chr3 (114 HSPs)
chr3 (233-471)||(4773242-4773480)
chr3 (234-471)||(10506160-10506398)
chr3 (234-471)||(54108114-54108352)
chr3 (239-471)||(39241363-39241596)
chr3 (233-471)||(5900635-5900874)
chr3 (233-471)||(32633277-32633516)
chr3 (234-471)||(42591784-42592022)
chr3 (246-470)||(44893752-44893977)
chr3 (239-463)||(47669264-47669489)
chr3 (231-471)||(53716292-53716531)
chr3 (236-463)||(1994389-1994616)
chr3 (233-471)||(4757706-4757944)
chr3 (232-471)||(18464454-18464694)
chr3 (239-471)||(29818182-29818415)
chr3 (246-471)||(27801501-27801727)
chr3 (234-471)||(39664396-39664634)
chr3 (239-471)||(8474058-8474291)
chr3 (232-471)||(16931604-16931844)
chr3 (239-471)||(21969634-21969867)
chr3 (239-471)||(21992070-21992303)
chr3 (239-471)||(22201621-22201854)
chr3 (232-471)||(11256101-11256341)
chr3 (233-471)||(22151844-22152083)
chr3 (233-471)||(26318394-26318633)
chr3 (246-471)||(15986247-15986472)
chr3 (246-471)||(21568758-21568983)
chr3 (231-471)||(24428564-24428805)
chr3 (247-471)||(12203763-12203988)
chr3 (247-471)||(51509331-51509555)
chr3 (232-471)||(46152613-46152851)
chr3 (231-471)||(47303231-47303469)
chr3 (246-471)||(54752175-54752401)
chr3 (223-471)||(39951346-39951595)
chr3 (232-428)||(28986397-28986593)
chr3 (233-395)||(27801777-27801940)
chr3 (233-395)||(39664183-39664346)
chr3 (239-471)||(41835138-41835371)
chr3 (231-395)||(51509116-51509281)
chr3 (233-395)||(21569033-21569196)
chr3 (233-395)||(54107901-54108064)
chr3 (234-395)||(24428855-24429017)
chr3 (233-395)||(1994168-1994331)
chr3 (233-395)||(1999327-1999490)
chr3 (234-392)||(26318182-26318341)
chr3 (231-393)||(42592074-42592237)
chr3 (234-394)||(47669548-47669709)
chr3 (232-395)||(4757492-4757656)
chr3 (232-395)||(5900421-5900585)
chr3 (231-394)||(11256392-11256556)
chr3 (233-395)||(18464744-18464907)
chr3 (234-384)||(45306991-45307142)
chr3 (234-395)||(12203551-12203713)
chr3 (234-395)||(22201904-22202066)
chr3 (232-395)||(10505946-10506110)
chr3 (236-395)||(29818465-29818625)
chr3 (236-395)||(54752451-54752611)
chr3 (234-391)||(15986526-15986684)
chr3 (234-372)||(45306832-45306970)
chr3 (231-372)||(4773554-4773695)
chr3 (237-393)||(44894030-44894187)
chr3 (231-395)||(47303016-47303181)
chr3 (253-392)||(8473865-8474005)
chr3 (231-395)||(22152133-22152300)
chr3 (246-372)||(12791488-12791614)
chr3 (235-372)||(16931918-16932055)
chr3 (232-395)||(19883528-19883691)
chr3 (231-395)||(21969917-21970084)
chr3 (231-395)||(21992353-21992520)
chr3 (232-395)||(53716581-53716745)
chr3 (234-362)||(44317537-44317665)
chr3 (232-362)||(49528147-49528277)
chr3 (269-395)||(41834961-41835088)
chr3 (237-362)||(13866023-13866148)
chr3 (233-360)||(7681447-7681575)
chr3 (247-350)||(7163463-7163566)
chr3 (234-345)||(28985509-28985620)
chr3 (231-384)||(20963525-20963678)
chr3 (246-350)||(15790691-15790795)
chr3 (301-395)||(39241646-39241741)
chr3 (262-392)||(46152904-46153032)
chr3 (354-471)||(19883359-19883477)
chr3 (232-349)||(30681752-30681869)
chr3 (232-339)||(15791454-15791556)
chr3 (246-378)||(49529062-49529194)
chr3 (223-350)||(30681018-30681145)
chr3 (233-378)||(44316626-44316770)
chr3 (246-378)||(13866906-13867038)
chr3 (232-320)||(42853244-42853331)
chr3 (239-327)||(43844392-43844480)
chr3 (312-395)||(32633143-32633227)
chr3 (258-315)||(43839984-43840041)
chr3 (231-298)||(966977-967044)
chr3 (232-298)||(13355721-13355787)
chr3 (335-395)||(28986261-28986322)
chr3 (234-298)||(6098975-6099039)
chr3 (258-362)||(8327697-8327801)
chr3 (234-298)||(40503726-40503790)
chr3 (239-315)||(50259112-50259188)
chr3 (231-298)||(12739961-12740028)
chr3 (233-355)||(39951682-39951793)
chr3 (232-307)||(40639430-40639505)
chr3 (232-298)||(24242991-24243057)
chr3 (248-298)||(32309599-32309649)
chr3 (232-298)||(45940674-45940740)
chr3 (239-309)||(50394335-50394405)
chr3 (225-298)||(27688477-27688550)
chr3 (232-309)||(51311829-51311906)
chr3 (233-309)||(5348879-5348955)
chr3 (234-298)||(12739878-12739942)
chr3 (238-298)||(27990266-27990326)
chr3 (235-267)||(42853342-42853374)
chr3 (234-298)||(45940215-45940279)
chr3 (234-298)||(50531102-50531166)
chr3 (234-298)||(53246595-53246659)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (234-471)||(38958936-38959173)
chr5 (231-471)||(9989320-9989561)
chr5 (233-471)||(2182942-2183181)
chr5 (233-471)||(36440412-36440651)
chr5 (239-471)||(37424474-37424709)
chr5 (234-463)||(27185874-27186103)
chr5 (234-471)||(24040297-24040537)
chr5 (239-471)||(32288289-32288521)
chr5 (246-471)||(34264560-34264790)
chr5 (245-471)||(11315969-11316192)
chr5 (245-471)||(35569992-35570219)
chr5 (233-471)||(25567200-25567439)
chr5 (233-395)||(27186161-27186324)
chr5 (236-394)||(39325414-39325573)
chr5 (234-372)||(38958724-38958862)
chr5 (237-395)||(25182941-25183100)
chr5 (236-392)||(35569777-35569934)
chr5 (234-402)||(39325636-39325805)
chr5 (236-395)||(24040087-24040247)
chr5 (232-395)||(36440198-36440362)
chr5 (234-395)||(37424262-37424424)
chr5 (253-395)||(9989611-9989754)
chr5 (235-393)||(32288079-32288237)
chr5 (246-392)||(16860315-16860462)
chr5 (262-393)||(11316244-11316376)
chr5 (234-343)||(1140106-1140215)
chr5 (235-362)||(19184598-19184725)
chr5 (255-372)||(2183255-2183372)
chr5 (253-390)||(29198971-29199109)
chr5 (233-350)||(34264350-34264478)
chr5 (233-378)||(19185490-19185635)
chr5 (232-356)||(31756630-31756754)
chr5 (398-471)||(16860515-16860588)
chr5 (234-303)||(19128434-19128503)
chr5 (239-309)||(33817659-33817729)
chr5 (398-471)||(16860632-16860705)
chr5 (386-468)||(29199167-29199249)
chr5 (228-298)||(29961804-29961874)
chr5 (233-298)||(17339794-17339859)
chr5 (153-197)||(26522258-26522302)
chr5 (231-298)||(16670022-16670089)
chr5 (232-298)||(435552-435618)
chr5 (232-286)||(2596386-2596440)
chr5 (244-298)||(3722079-3722133)
chr5 (232-298)||(4077409-4077475)
chr5 (232-298)||(4959559-4959625)
chr5 (232-298)||(6157491-6157557)
chr5 (232-298)||(11079624-11079690)
chr5 (246-327)||(2597377-2597458)
chr5 (233-298)||(24100694-24100759)
chr5 (233-298)||(25333182-25333247)
chr5 (258-298)||(6157160-6157200)
chr5 (234-298)||(27851037-27851101)
chr5 (234-298)||(29962175-29962239)
chr5 (234-298)||(30012559-30012623)
chr5 (234-298)||(35000918-35000982)
chr5 (234-298)||(38312325-38312389)
chr5 (234-298)||(39547777-39547841)
[»] chr7 (99 HSPs)
chr7 (232-471)||(6356284-6356523)
chr7 (239-471)||(33716593-33716826)
chr7 (239-471)||(41191897-41192130)
chr7 (234-471)||(44332731-44332969)
chr7 (231-471)||(10526308-10526548)
chr7 (239-471)||(41453217-41453450)
chr7 (233-471)||(6356764-6357003)
chr7 (258-471)||(17359205-17359419)
chr7 (233-471)||(48626275-48626514)
chr7 (234-471)||(21391402-21391640)
chr7 (233-471)||(19681707-19681946)
chr7 (234-471)||(31638155-31638393)
chr7 (246-471)||(41751662-41751888)
chr7 (255-471)||(28297840-28298057)
chr7 (246-471)||(34037123-34037349)
chr7 (239-471)||(28286329-28286562)
chr7 (232-471)||(8542497-8542737)
chr7 (233-471)||(8937061-8937300)
chr7 (239-432)||(1114059-1114253)
chr7 (246-471)||(7579084-7579310)
chr7 (232-471)||(43247413-43247653)
chr7 (256-469)||(36423391-36423605)
chr7 (234-395)||(7578872-7579034)
chr7 (234-395)||(35146699-35146861)
chr7 (232-395)||(10526598-10526762)
chr7 (233-372)||(6356597-6356736)
chr7 (246-471)||(35146910-35147127)
chr7 (234-392)||(48626063-48626222)
chr7 (234-395)||(41453005-41453167)
chr7 (232-395)||(8936847-8937011)
chr7 (233-391)||(31075485-31075644)
chr7 (234-395)||(1114333-1114495)
chr7 (233-393)||(21391189-21391350)
chr7 (234-393)||(6357055-6357215)
chr7 (237-408)||(7909290-7909461)
chr7 (252-395)||(36423657-36423801)
chr7 (233-395)||(28286116-28286279)
chr7 (239-400)||(4931556-4931718)
chr7 (234-395)||(17749935-17750097)
chr7 (236-389)||(8542793-8542946)
chr7 (235-395)||(19681496-19681657)
chr7 (234-395)||(41191683-41191844)
chr7 (234-367)||(16867707-16867840)
chr7 (237-393)||(31637946-31638103)
chr7 (235-357)||(36673976-36674098)
chr7 (253-389)||(7909460-7909597)
chr7 (233-413)||(27738935-27739115)
chr7 (234-382)||(41891966-41892115)
chr7 (232-362)||(4155596-4155726)
chr7 (237-389)||(17363532-17363683)
chr7 (233-346)||(8416484-8416597)
chr7 (232-372)||(41751962-41752103)
chr7 (311-471)||(40673219-40673378)
chr7 (256-395)||(28298107-28298247)
chr7 (234-342)||(36282786-36282894)
chr7 (233-356)||(29277671-29277794)
chr7 (239-356)||(36283533-36283651)
chr7 (262-395)||(33716872-33717005)
chr7 (236-320)||(29276877-29276961)
chr7 (246-335)||(8417285-8417374)
chr7 (267-356)||(32946669-32946758)
chr7 (231-395)||(40673009-40673169)
chr7 (234-343)||(41893416-41893525)
chr7 (233-320)||(36674095-36674180)
chr7 (231-364)||(28263493-28263626)
chr7 (246-378)||(4156495-4156627)
chr7 (232-294)||(36423790-36423852)
chr7 (331-389)||(17359479-17359538)
chr7 (258-384)||(28264587-28264714)
chr7 (232-309)||(38677053-38677130)
chr7 (331-410)||(38447603-38447682)
chr7 (231-298)||(48095356-48095423)
chr7 (280-350)||(29276950-29277020)
chr7 (234-315)||(40263616-40263697)
chr7 (233-298)||(42287806-42287871)
chr7 (246-315)||(43050396-43050465)
chr7 (234-298)||(18458276-18458340)
chr7 (226-298)||(39143505-39143577)
chr7 (231-298)||(24733626-24733693)
chr7 (232-298)||(3217748-3217814)
chr7 (232-298)||(7776951-7777017)
chr7 (232-298)||(27284240-27284306)
chr7 (232-286)||(43704943-43704997)
chr7 (232-298)||(47987325-47987391)
chr7 (245-298)||(8090832-8090885)
chr7 (438-471)||(17363439-17363472)
chr7 (233-298)||(20493744-20493809)
chr7 (233-298)||(31852076-31852141)
chr7 (233-298)||(35918733-35918798)
chr7 (233-298)||(37374451-37374516)
chr7 (246-335)||(38676070-38676159)
chr7 (233-298)||(40852154-40852219)
chr7 (233-298)||(45456733-45456798)
chr7 (282-335)||(46540017-46540070)
chr7 (234-298)||(23911076-23911140)
chr7 (234-298)||(27284603-27284667)
chr7 (233-313)||(36507116-36507196)
chr7 (234-298)||(39143146-39143210)
chr7 (246-298)||(41691937-41691989)
[»] chr1 (103 HSPs)
chr1 (232-471)||(12481271-12481511)
chr1 (233-471)||(45052901-45053140)
chr1 (239-471)||(35612294-35612527)
chr1 (233-471)||(23476553-23476792)
chr1 (234-471)||(16023897-16024135)
chr1 (232-471)||(37304026-37304266)
chr1 (232-465)||(2064429-2064663)
chr1 (231-471)||(20305999-20306240)
chr1 (246-471)||(49140355-49140580)
chr1 (233-471)||(1762886-1763125)
chr1 (233-471)||(3089341-3089580)
chr1 (233-471)||(8762611-8762850)
chr1 (239-471)||(25995789-25996022)
chr1 (234-469)||(27547883-27548119)
chr1 (246-471)||(6798019-6798245)
chr1 (235-471)||(38127710-38127947)
chr1 (234-471)||(37576181-37576419)
chr1 (234-471)||(37284940-37285177)
chr1 (232-471)||(9006403-9006642)
chr1 (232-471)||(49643883-49644122)
chr1 (239-471)||(12127265-12127501)
chr1 (239-432)||(45843368-45843562)
chr1 (239-470)||(4330050-4330282)
chr1 (246-471)||(37585905-37586131)
chr1 (20-229)||(52873325-52873527)
chr1 (280-471)||(31703660-31703852)
chr1 (237-395)||(49643674-49643833)
chr1 (235-395)||(44322948-44323109)
chr1 (233-395)||(16024185-16024348)
chr1 (234-395)||(1762674-1762836)
chr1 (235-395)||(12481060-12481221)
chr1 (233-432)||(39486444-39486643)
chr1 (234-395)||(23476341-23476503)
chr1 (234-395)||(37576469-37576631)
chr1 (239-395)||(37304316-37304473)
chr1 (233-392)||(12127056-12127216)
chr1 (234-395)||(27547669-27547831)
chr1 (237-392)||(35612085-35612241)
chr1 (233-395)||(4696881-4697044)
chr1 (293-471)||(27400636-27400815)
chr1 (233-395)||(49140142-49140305)
chr1 (234-395)||(31703901-31704063)
chr1 (237-389)||(38000492-38000645)
chr1 (232-395)||(8760270-8760434)
chr1 (232-395)||(26707194-26707358)
chr1 (237-395)||(9006194-9006353)
chr1 (233-395)||(20306290-20306453)
chr1 (245-391)||(37284739-37284886)
chr1 (231-392)||(26723092-26723254)
chr1 (236-395)||(6797809-6797969)
chr1 (232-363)||(23598070-23598201)
chr1 (237-391)||(37585696-37585851)
chr1 (232-346)||(46593569-46593682)
chr1 (232-372)||(45052688-45052828)
chr1 (246-395)||(39486214-39486364)
chr1 (233-356)||(10831130-10831253)
chr1 (246-346)||(5537142-5537242)
chr1 (232-346)||(34967060-34967174)
chr1 (234-356)||(37467548-37467670)
chr1 (239-356)||(34966308-34966425)
chr1 (239-335)||(10831935-10832031)
chr1 (233-350)||(5536397-5536514)
chr1 (231-320)||(32047740-32047829)
chr1 (236-356)||(28884751-28884871)
chr1 (239-346)||(46592817-46592924)
chr1 (234-320)||(13109191-13109277)
chr1 (388-471)||(26707408-26707491)
chr1 (232-335)||(28884015-28884118)
chr1 (393-471)||(4697094-4697172)
chr1 (389-471)||(44322816-44322898)
chr1 (231-356)||(32048510-32048635)
chr1 (234-320)||(13183766-13183852)
chr1 (261-320)||(4697163-4697222)
chr1 (280-346)||(49837417-49837483)
chr1 (237-307)||(46289327-46289397)
chr1 (233-356)||(37466801-37466922)
chr1 (234-314)||(49838756-49838835)
chr1 (338-395)||(25996072-25996130)
chr1 (244-298)||(52179365-52179419)
chr1 (234-298)||(39851174-39851238)
chr1 (231-298)||(6328324-6328391)
chr1 (231-298)||(44114512-44114579)
chr1 (234-281)||(45843320-45843366)
chr1 (231-298)||(49548119-49548186)
chr1 (232-298)||(3798704-3798770)
chr1 (231-297)||(6327938-6328004)
chr1 (232-298)||(7334922-7334988)
chr1 (232-298)||(31488023-31488089)
chr1 (236-298)||(33784615-33784677)
chr1 (232-298)||(37483537-37483603)
chr1 (232-298)||(38980048-38980114)
chr1 (233-298)||(3798323-3798388)
chr1 (233-298)||(6714201-6714266)
chr1 (233-298)||(14244554-14244619)
chr1 (233-298)||(24370114-24370179)
chr1 (233-298)||(37483053-37483118)
chr1 (233-298)||(45678711-45678776)
chr1 (239-276)||(46289404-46289441)
chr1 (233-298)||(50227908-50227973)
chr1 (246-298)||(7334455-7334507)
chr1 (234-298)||(42616695-42616759)
chr1 (239-327)||(43727278-43727366)
chr1 (234-298)||(50138495-50138559)
[»] chr4 (103 HSPs)
chr4 (231-471)||(53995146-53995388)
chr4 (233-471)||(8591968-8592207)
chr4 (231-471)||(623891-624132)
chr4 (231-471)||(44991490-44991731)
chr4 (232-471)||(6711961-6712201)
chr4 (233-471)||(14985330-14985569)
chr4 (234-471)||(53751114-53751352)
chr4 (231-471)||(21763393-21763634)
chr4 (232-471)||(16038006-16038246)
chr4 (232-471)||(42855551-42855791)
chr4 (232-471)||(44957387-44957627)
chr4 (233-471)||(19088553-19088792)
chr4 (245-471)||(43734498-43734725)
chr4 (246-471)||(30683740-30683966)
chr4 (231-471)||(1433483-1433724)
chr4 (234-464)||(39448707-39448938)
chr4 (233-471)||(50768820-50769059)
chr4 (246-471)||(46849881-46850107)
chr4 (239-471)||(24898194-24898427)
chr4 (234-464)||(38339492-38339723)
chr4 (234-471)||(15477857-15478095)
chr4 (239-471)||(23756012-23756245)
chr4 (239-471)||(33091665-33091898)
chr4 (247-471)||(41752028-41752253)
chr4 (232-471)||(12817804-12818044)
chr4 (246-471)||(52557299-52557525)
chr4 (233-471)||(25182024-25182263)
chr4 (225-471)||(41878071-41878317)
chr4 (246-471)||(53259350-53259576)
chr4 (231-471)||(36122645-36122885)
chr4 (233-395)||(6505536-6505698)
chr4 (234-471)||(37206639-37206877)
chr4 (270-471)||(43566590-43566792)
chr4 (266-471)||(19508625-19508831)
chr4 (231-471)||(50508669-50508910)
chr4 (234-395)||(44991279-44991441)
chr4 (228-395)||(42855333-42855501)
chr4 (233-372)||(25269312-25269451)
chr4 (237-395)||(43734289-43734448)
chr4 (231-395)||(24898477-24898642)
chr4 (235-391)||(53750903-53751060)
chr4 (233-396)||(12818093-12818257)
chr4 (232-395)||(16037792-16037956)
chr4 (234-393)||(38339782-38339942)
chr4 (233-395)||(14985619-14985782)
chr4 (233-395)||(46849668-46849831)
chr4 (234-395)||(8592257-8592419)
chr4 (236-395)||(52557089-52557249)
chr4 (233-395)||(15477644-15477807)
chr4 (234-395)||(8398031-8398193)
chr4 (231-395)||(39448485-39448650)
chr4 (236-392)||(50769112-50769269)
chr4 (239-393)||(20888148-20888303)
chr4 (233-395)||(25181811-25181974)
chr4 (236-393)||(43566380-43566538)
chr4 (234-395)||(53994934-53995096)
chr4 (236-395)||(36122435-36122595)
chr4 (232-391)||(41877858-41878017)
chr4 (233-395)||(6712251-6712412)
chr4 (237-395)||(19088344-19088503)
chr4 (234-395)||(19508413-19508575)
chr4 (233-395)||(41751817-41751978)
chr4 (235-392)||(1433272-1433430)
chr4 (231-372)||(44125782-44125923)
chr4 (235-392)||(30683527-30683686)
chr4 (233-372)||(55022283-55022421)
chr4 (234-372)||(623679-623817)
chr4 (234-395)||(33091453-33091615)
chr4 (234-372)||(44957669-44957807)
chr4 (234-395)||(21763180-21763343)
chr4 (234-372)||(23755418-23755556)
chr4 (232-348)||(4513252-4513368)
chr4 (234-393)||(37206428-37206587)
chr4 (231-350)||(47602940-47603059)
chr4 (280-395)||(53259184-53259300)
chr4 (237-388)||(49135928-49136084)
chr4 (289-391)||(50508512-50508615)
chr4 (236-367)||(44125624-44125755)
chr4 (232-335)||(47603710-47603813)
chr4 (234-346)||(52692778-52692889)
chr4 (246-329)||(52692036-52692119)
chr4 (233-322)||(31214161-31214250)
chr4 (397-471)||(6505748-6505822)
chr4 (247-320)||(55022424-55022497)
chr4 (393-471)||(23755630-23755708)
chr4 (247-298)||(20614128-20614179)
chr4 (231-298)||(20614610-20614677)
chr4 (245-276)||(43734941-43734972)
chr4 (247-298)||(56270557-56270608)
chr4 (232-298)||(42369503-42369569)
chr4 (236-298)||(48091969-48092031)
chr4 (233-263)||(53259168-53259198)
chr4 (232-298)||(56271210-56271276)
chr4 (233-298)||(1098052-1098117)
chr4 (233-298)||(17475877-17475942)
chr4 (233-298)||(25618435-25618500)
chr4 (233-298)||(41610126-41610191)
chr4 (234-298)||(3503470-3503534)
chr4 (234-286)||(5904505-5904557)
chr4 (234-298)||(17475397-17475461)
chr4 (234-298)||(31487978-31488042)
chr4 (234-298)||(34237941-34238005)
chr4 (246-298)||(46579789-46579841)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (234-471)||(38332704-38332942)
chr2 (231-471)||(13192985-13193226)
chr2 (239-471)||(15744462-15744695)
chr2 (234-470)||(34735556-34735793)
chr2 (234-471)||(26181912-26182150)
chr2 (232-471)||(16305023-16305263)
chr2 (231-471)||(7496192-7496432)
chr2 (234-471)||(29472242-29472480)
chr2 (239-471)||(7469171-7469404)
chr2 (232-471)||(24372179-24372419)
chr2 (233-471)||(19847531-19847769)
chr2 (234-471)||(24138718-24138957)
chr2 (234-471)||(15405968-15406205)
chr2 (233-464)||(10991850-10992082)
chr2 (232-471)||(8174097-8174337)
chr2 (237-471)||(2148098-2148333)
chr2 (233-471)||(19815916-19816155)
chr2 (239-469)||(41474087-41474318)
chr2 (232-411)||(33470195-33470375)
chr2 (234-471)||(36713588-36713823)
chr2 (280-464)||(12860586-12860771)
chr2 (231-395)||(15405753-15405918)
chr2 (232-395)||(7495978-7496142)
chr2 (235-395)||(12860381-12860542)
chr2 (232-392)||(24138066-24138227)
chr2 (233-395)||(24371966-24372129)
chr2 (231-395)||(8173882-8174047)
chr2 (232-392)||(19815702-19815863)
chr2 (234-392)||(41474373-41474532)
chr2 (236-389)||(38332974-38333128)
chr2 (232-395)||(13193276-13193440)
chr2 (233-395)||(34735342-34735505)
chr2 (246-395)||(16305313-16305463)
chr2 (237-395)||(30898589-30898748)
chr2 (232-392)||(29472533-29472694)
chr2 (237-395)||(2147888-2148048)
chr2 (235-392)||(26181701-26181859)
chr2 (239-395)||(17052342-17052499)
chr2 (264-393)||(42834452-42834582)
chr2 (234-351)||(15744780-15744897)
chr2 (232-344)||(17032591-17032703)
chr2 (231-363)||(8444819-8444951)
chr2 (280-395)||(10992139-10992255)
chr2 (232-344)||(17050927-17051039)
chr2 (246-395)||(36713873-36714023)
chr2 (246-346)||(8962372-8962472)
chr2 (234-335)||(8963166-8963267)
chr2 (352-471)||(17052175-17052292)
chr2 (239-346)||(8445127-8445234)
chr2 (237-391)||(7469458-7469605)
chr2 (246-337)||(23992189-23992280)
chr2 (233-298)||(13479426-13479491)
chr2 (233-298)||(15044738-15044803)
chr2 (233-298)||(33200027-33200092)
chr2 (233-298)||(38807179-38807244)
chr2 (234-298)||(33200519-33200583)
chr2 (247-298)||(2804969-2805020)
chr2 (232-323)||(19847276-19847361)
chr2 (231-298)||(32194823-32194890)
chr2 (232-298)||(2822302-2822368)
chr2 (244-298)||(2822675-2822729)
chr2 (232-298)||(4602811-4602877)
chr2 (232-298)||(14848197-14848263)
chr2 (246-315)||(16655911-16655980)
chr2 (234-298)||(5382012-5382076)
chr2 (246-298)||(15136870-15136922)
chr2 (246-298)||(31557548-31557600)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (232-471)||(20749-20988)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (232-471)||(45754-45994)
scaffold0037 (253-395)||(56424-56567)
scaffold0037 (253-395)||(63549-63692)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (233-464)||(72761-72992)
scaffold0029 (232-395)||(73049-73213)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (234-471)||(50688-50927)
scaffold0019 (236-395)||(50478-50638)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (246-471)||(18285-18511)
scaffold0340 (234-395)||(18561-18723)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (232-464)||(14354-14587)
scaffold0134 (233-395)||(14134-14297)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (231-471)||(24159-24400)
scaffold0186 (234-389)||(24456-24612)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (239-471)||(19713-19946)
scaffold0182 (237-395)||(19996-20155)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (232-471)||(8427-8666)
scaffold0221 (238-395)||(8716-8874)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (228-471)||(349068-349311)
scaffold0003 (233-395)||(349361-349523)
scaffold0003 (234-395)||(113654-113816)
scaffold0003 (232-363)||(113391-113522)
scaffold0003 (386-471)||(113519-113604)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (239-471)||(15458-15686)
scaffold0072 (234-395)||(15736-15898)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (311-471)||(82070-82231)
scaffold0032 (232-395)||(81856-82020)
scaffold0032 (246-340)||(90782-90876)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (280-471)||(6044-6233)
scaffold0246 (252-395)||(6283-6426)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (273-392)||(14231-14350)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (232-384)||(9780-9932)
scaffold0225 (246-378)||(10862-10994)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (253-346)||(144039-144132)
scaffold0001 (246-390)||(147133-147277)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (233-298)||(230871-230936)
scaffold0014 (234-298)||(231252-231316)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (231-298)||(1472-1539)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (232-298)||(57020-57086)
scaffold0054 (233-298)||(57552-57617)
[»] scaffold0526 (1 HSPs)
scaffold0526 (234-267)||(4030-4063)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (233-298)||(83380-83445)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (234-298)||(125432-125496)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (234-298)||(283168-283232)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 88)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1646959 - 1646719
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646959 ataggcttaattacctttttcgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 1646860  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1646859 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 1646760  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646759 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 1646719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 237 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1652018 - 1651784
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1652018 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 1651919  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatct 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1651918 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatct 1651819  T
Q  437 cgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651818 cgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 1651784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 237 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1740394 - 1740160
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1740394 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 1740295  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatct 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1740294 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatct 1740195  T
Q  437 cgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740194 cgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 1740160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15872071 - 15871833
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15872071 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcctctaaataaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 15871972  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15871971 actacatttagtcttttttgttagttttattcaaataaacgttagagcttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 15871872  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15871871 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 15871833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27473522 - 27473283
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27473522 aggctaaattacctttttggtcctctaacaatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 27473423  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27473422 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta 27473323  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27473322 ttccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 27473283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Original strand, 38588600 - 38588825
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38588600 ttttcgtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtc 38588699  T
Q  347 ctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagat 445  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |    
T  38588700 atttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggt 38588799  T
Q  446 attatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38588800 attatgattaaatagtgactgatatt 38588825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45077656 - 45077415
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45077656 ataggctaaattacctttttggtcctctaactatttgattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcact 45077557  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45077556 gttactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtct 45077457  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45077456 tatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 45077415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 33296136 - 33295896
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33296136 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 33296037  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33296036 ttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcat 33295937  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33295936 attccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 33295896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45277047 - 45276808
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45277047 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 45276948  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45276947 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 45276848  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45276847 ttccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 45276808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 7949424 - 7949650
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7949424 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 7949523  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||     
T  7949524 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaagg 7949623  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7949624 tattatgattaaatagtgactgatatt 7949650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 15048399 - 15048637
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15048399 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgtt 15048498  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15048499 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 15048598  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
       | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15048599 tatttgttaaggtattatgattaaataatgattgatatt 15048637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 239 - 468
Target Start/End: Original strand, 27669421 - 27669651
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27669421 aattactttttcgatcatttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcactgttagtac 27669520  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  27669521 atttagtcctttctgttagttttattgaaataaacgttagggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatacctt 27669620  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgat 468  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27669621 gttaaattattatgattaaatagtgactgat 27669651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 1432136 - 1432369
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1432136 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 1432235  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||     
T  1432236 atttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatttgggtcctctaactttatttattaatatcattttgatcatatgcctt 1432335  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1432336 gttaatgtattatgtttaaatagtgactgatatt 1432369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 44595038 - 44594813
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44595038 tttttgtcctctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaaccgttactacatttagtc 44594939  T
Q  347 ctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagat 445  Q
     |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |    
T  44594938 atttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtattattttggttctatgtcttgttaaggt 44594839  T
Q  446 attatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44594838 attatgattaaatagtgactgatatt 44594813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 7535284 - 7535045
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7535284 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgt 7535185  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7535184 tactacatttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtgagtcctctagctttatttattagtatcattttggtctta 7535085  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7535084 ttcctcgttaacgtattatgattaaataatgactgatatt 7535045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 246 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 5435338 - 5435119
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5435338 tttttggtcctctaactatataattggtatcggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagt 5435239  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||     
T  5435238 cacttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcctagttaagg 5435139  T
Q  445 tattatgattaaatagtgac 464  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  5435138 tattataattaaataatgac 5435119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 239 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 11174079 - 11173858
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11174079 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 11173980  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |     
T  11173979 atttagtcttttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttagattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttgggttctatgcttt 11173880  T
Q  438 gttaagatattatgattaaata 459  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  11173879 gttaaggtattatgaataaata 11173858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 247 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 5152971 - 5152753
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  5152971 tttttgtcctctgactgtttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattacatttagtt 5152872  T
Q  347 ctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagat 445  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||  ||||| |    
T  5152871 ttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcatatgccttcttaaggt 5152772  T
Q  446 attatgattaaatagtgac 464  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5152771 attatgattaaatagtgac 5152753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 1869934 - 1870173
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1869934 ggctaaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttctcaccgtt 1870032  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1870033 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgaattgtgggtcccctaactttatttattagtatcattttggtcttat 1870132  T
Q  433 atctcgttaagatat--tatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      ||  ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1870133 gccttattaatgtattatatgattaaatagtgactgatatt 1870173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15048847 - 15048690
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15048847 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 15048748  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  15048747 tacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 15048690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 33819784 - 33819947
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33819784 aggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 33819883  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  33819884 tactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 33819947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 15871621 - 15871783
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15871621 ggcttaattacctttttggtcctttaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaaatttctcactgtt 15871720  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15871721 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 15871783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 45276597 - 45276759
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  45276597 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 45276696  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  45276697 actacatttagtcatttatattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 45276759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Original strand, 5434897 - 5435062
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  5434897 atagtcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctacctaaaatttgatttatttcggttttctaagtttctcacc 5434996  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5434997 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5435062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Original strand, 37569311 - 37569476
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37569311 ataggcttgattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 37569410  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  37569411 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcgaataaacgttatggtttttgttatgtgggt 37569476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 232 - 372
Target Start/End: Original strand, 1646499 - 1646639
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646499 taggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 1646598  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1646599 ttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaa 1646639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Original strand, 1739952 - 1740086
Alignment:
Q  238 taattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttacta 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1739952 taattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttatta 1740051  T
Q  338 catttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1740052 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 1740086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1870386 - 1870224
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1870386 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagatagatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaaagt 1870287  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtggg 394  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1870286 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 1870224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 34470994 - 34470832
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  34470994 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgtt 34470895  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  34470894 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 34470832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 235 - 395
Target Start/End: Original strand, 5152536 - 5152696
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5152536 gcttaattacctttttgatcctctaactgtttaattggtatcagattggtcctctgactaaaaattgatttattt-ggtcctctaagtttctcattgtta 5152634  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5152635 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5152696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 38589035 - 38588875
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38589035 cttaattatttttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 38588936  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  38588935 tagatttagtcctttatgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggt 38588875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 234 - 393
Target Start/End: Original strand, 40659983 - 40660143
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40659983 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcatctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgtt 40660082  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40660083 actacatttagtcttttctaatagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 40660143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 11707748 - 11707912
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11707748 taggcttaattatctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttgtttcgatcctctaagtttctcactg 11707847  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11707848 ttaatacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 11707912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37569752 - 37569527
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  37569752 ttttgatcttctaagtatttaattgatatcggattgatcatctaattaaaaatttatttattttggtcctctaaatttctcgttgttactatatttagtc 37569653  T
Q  347 ctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagat 445  Q
     |||  |||||||||||||||||||| |||||  ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |    
T  37569652 ttttcagttagttttattcaaataaacgttagagtttatgctacgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggt 37569553  T
Q  446 attatgatt-aaatagtgactgatat 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37569552 attatgattaaaatagtgactgatat 37569527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40660333 - 40660198
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40660333 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttgttatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 40660234  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  40660233 atatttagtcttttctgttagttttattcaaataaa 40660198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 27473072 - 27473233
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27473072 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac-gtt 27473170  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  27473171 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacattatgatttgtgttatgtgggt 27473233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 40048067 - 40048293
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||        |||||    
T  40048067 ggctaaattacttttttgataatctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattaatttattttgattctctaa--------ctgtt 40048158  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40048159 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgt----cctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 40048254  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
       | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40048255 tcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 40048293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40048501 - 40048342
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  40048501 ttaattacctttttgatcctctagttatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgttttattttgatcctctaagtttctcaccgttact 40048402  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  40048401 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 40048342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22763385 - 22763271
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  22763385 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccg 22763286  T
Q  332 ttactacatttagtc 346  Q
    |||||||||||||||    
T  22763285 ttactacatttagtc 22763271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 253 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27669851 - 27669709
Alignment:
Q  253 tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtccttttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  27669851 tcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcgat-ctttaagtttcacactgttactacatttagtcatttct 27669753  T
Q  353 gttagttttattcaaataa-agttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  27669752 gttagttttattcaaataatcattagggtttgtgttatgtgggt 27669709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 302 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18298611 - 18298488
Alignment:
Q  302 atttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctct 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  18298611 atttattttggtcctctaagtttctcacaattactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgagtcctct 18298512  T
Q  401 aactttatttattagtatcatttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18298511 aactttatttattagtatcatttt 18298488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 320
Target Start/End: Original strand, 45077221 - 45077307
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45077221 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 45077307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24666131 - 24666006
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||     
T  24666131 ataggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctttaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcacc 24666032  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgtta 356  Q
    ||||| | |||| ||||||| |||||    
T  24666031 gttaccatatttcgtcctttctgtta 24666006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 360
Target Start/End: Original strand, 33295733 - 33295862
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  33295733 ataggtttaatgacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtattctaagtttgtcacc 33295832  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttt 360  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  33295833 gttattacatttagtcatttctgttagttt 33295862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 232 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11920224 - 11920136
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11920224 taggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttgggtcctctaa 11920136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 7534845 - 7534995
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |         
T  7534845 ttaattacctttttggtcttctaattatttagttgatatcggattagtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccg----- 7534939  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7534940 ----ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 7534995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 237 - 372
Target Start/End: Original strand, 44594604 - 44594739
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    ||||||    
T  44594604 ttaattacatttttggtcctctaattatttaattgctattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttatattcgttact 44594703  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  44594704 acatttagttatttctgttagttttattcatataaa 44594739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 316
Target Start/End: Original strand, 24652821 - 24652905
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24652821 taggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcct 24652905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 335
Target Start/End: Original strand, 22762525 - 22762614
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  22762525 tttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcaccgttac 22762614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 386 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11708047 - 11707962
Alignment:
Q  386 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11708047 ttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgttttgttaaggtattatgattaaataatgactgatatt 11707962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Original strand, 15740613 - 15740729
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  | |||    
T  15740613 ggcttaattgcctttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttccgtt 15740712  T
Q  334 actacatttagtccttt 350  Q
    || || |||||||||||    
T  15740713 accacttttagtccttt 15740729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12643966 - 12643891
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 309  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12643966 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaatttgtatcgatttggtcctctaactaaatattgatttattt 12643891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15741682 - 15741607
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15741682 ggcttaattacctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaattttgatttattt 15741607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33820062 - 33819975
Alignment:
Q  236 cttaattac-ttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 322  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  33820062 cttaattacctttttttatcctctaactatttaattggtatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcagtcttctaagt 33819975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Original strand, 11920075 - 11920135
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaact 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  11920075 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttatttggttttggattggtcctctaact 11920135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24659479 - 24659408
Alignment:
Q  400 taactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24659479 taactttatttattagtatcattttggtcctctgccttattaaggtattctgattaaatagtgactgatatt 24659408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Original strand, 34470714 - 34470782
Alignment:
Q  403 ctttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34470714 ctttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacagatatt 34470782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 395
Target Start/End: Original strand, 45077307 - 45077364
Alignment:
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  45077307 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggt 45077364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29770450 - 29770376
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttat 307  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  29770450 aggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttat 29770376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 31988513 - 31988578
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  31988513 aggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 31988578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14897454 - 14897390
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  14897454 ggcttaaatgctcttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 14897390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 45123673 - 45123609
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  45123673 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcctttaactaaaaa 45123609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45436549 - 45436473
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 309  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  45436549 aggctaaattacattttttgtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattt 45436473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Original strand, 31445666 - 31445733
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  31445666 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 31445733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 298
Target Start/End: Original strand, 40229091 - 40229154
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  40229091 gcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 40229154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 286
Target Start/End: Original strand, 43633120 - 43633175
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcc 286  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43633120 ataggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcc 43633175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 7116470 - 7116536
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  7116470 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 7116536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9807340 - 9807274
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  9807340 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 9807274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 11713198 - 11713264
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  11713198 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 11713264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33099030 - 33098964
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  33099030 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgatttggtcccttaactaaaaa 33098964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 2221593 - 2221658
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  2221593 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 2221658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 9739287 - 9739340
Alignment:
Q  245 ttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  9739287 ttttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 9739340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11760974 - 11760909
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  11760974 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 11760909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18476132 - 18476067
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaa 297  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18476132 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaatttgtatcgctttggtcccctaactaaaa 18476067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Original strand, 21141836 - 21141917
Alignment:
Q  117 ttaaatatgttcttagtccttaaaattattttaacattttgttttagttccactaaagaatttctttggcttttagtccctc 198  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||  ||||||| || ||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  21141836 ttaaatatgtttttagtccttataaatatgttaacctttcattttagtccctctaaaaaatttcttcaacttttagtccctc 21141917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 22013461 - 22013526
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  22013461 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 22013526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 26060105 - 26060170
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  26060105 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 26060170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41155073 - 41155008
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  41155073 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 41155008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 45123219 - 45123284
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  45123219 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 45123284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 761393 - 761457
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  761393 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 761457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9739843 - 9739779
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  9739843 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 9739779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18298652 - 18298612
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcct 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18298652 ttttgatcctctaactatttaattgatattggattggtcct 18298612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27786543 - 27786479
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  27786543 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 27786479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 315
Target Start/End: Original strand, 29769368 - 29769444
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 315  Q
    |||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  29769368 aattacctttttggtctcttaactatttaattggtttcggtttggttccttaactaaattttgatttattttggtcc 29769444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31988958 - 31988894
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  31988958 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggccctttaactaaaaa 31988894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 298
Target Start/End: Original strand, 33098611 - 33098651
Alignment:
Q  258 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  33098611 taactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 33098651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 41154617 - 41154681
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  41154617 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 41154681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 42193779 - 42193843
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  42193779 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 42193843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 21511 - 21749
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21511 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 21610  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21611 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 21710  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711 atctcgttaaaatattatgattaaatagtgactgatatt 21749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22606 - 22465
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22606 ataggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 22507  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22506 attactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 22465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 236 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6137825 - 6137590
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6137825 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 6137726  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatc 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6137725 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttagattttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatc 6137626  T
Q  436 tcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6137625 tcgttaagatattatgattaaatagtgagtgatatt 6137590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 18052954 - 18053194
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18052954 taggctaaattacttttttgatcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 18053053  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18053054 ttactacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttct 18053153  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18053154 atgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 18053194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5938258 - 5938025
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5938258 aattacctttttggtcatctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaattactac 5938159  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||     
T  5938158 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgcctt 5938059  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5938058 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 5938025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 9046086 - 9046324
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  9046086 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttgtcaccgtt 9046185  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9046186 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaaatttatttattagtatcattttggtcttat 9046285  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9046286 gccttgttaagctattatgattaaatagtgactgatatt 9046324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Original strand, 24744341 - 24744566
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  24744341 tttttgtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaactttcacaccgttactgcatttagtc 24744440  T
Q  347 ctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagat 445  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  24744441 atttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggt 24744540  T
Q  446 attatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24744541 attatgattaaatagtgactgatatt 24744566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 32993468 - 32993227
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  32993468 ataggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcacc 32993369  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32993368 gtttctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtct 32993269  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  32993268 tatgccttgttaaggtgttatgattaaataatgactgatatt 32993227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 34890642 - 34890882
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34890642 taggctaaattacctttttgttcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctcaaagtttctcactg 34890741  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34890742 ttattacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 34890841  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34890842 atgccttgttaaagtattatgattaaataatgactgatatt 34890882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 5310838 - 5311064
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5310838 tttttggtcctctaactatttaattgatatcagagtagtcctataactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactacatttagt 5310937  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||     
T  5310938 cctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaagg 5311037  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5311038 tattatgattaaatagtgactgatatt 5311064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 2517007 - 2517240
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2517007 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgactgttactac 2517106  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||   |     
T  2517107 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctccaactttatttataagaatcattttggtcatattcttt 2517206  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2517207 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 2517240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5639618 - 5639385
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5639618 aattacatttttgatcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 5639519  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  5639518 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 5639419  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5639418 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 5639385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 26600356 - 26600595
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26600356 aggctaaattatctttttggtcctctaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttatcaccgt 26600455  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26600456 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 26600555  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26600556 ttccttattaaggtattatgattaaatagtgaccgatatt 26600595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 7269950 - 7270191
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7269950 aggctaaattacttttttaatcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcaccgt 7270049  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttag--ttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7270050 tactacatttagtcatttctgttagttttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 7270149  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7270150 tatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 7270191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34994830 - 34994592
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34994830 ggctaaattacctttttagtcatctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 34994731  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  34994730 actgcatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggtcctctaacttgatttattagtatcattttggtcttat 34994631  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34994630 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 34994592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 236 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6236369 - 6236133
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6236369 cttaattacttttttggtcccctaactatttaattgatatttgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaacagttac 6236270  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatat 434  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||      
T  6236269 taaatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgaatcctctaacttcatttattagtatcatcttggtcctatgc 6236170  T
Q  435 ctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6236169 cttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatatt 6236133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 244 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21540417 - 21540189
Alignment:
Q  244 cttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacattta 343  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21540417 cttttttggtcctttaactatttaattggtatcagattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttactacattta 21540318  T
Q  344 gtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaa 442  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  21540317 atcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaa 21540218  T
Q  443 gatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21540217 gatattatgattaaatagtgattgatatt 21540189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21857007 - 21856767
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21857007 taggctaaattacctttttggtcctctaagtatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccg 21856908  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21856907 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttttgttatatgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtctt 21856808  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21856807 attccttgttaaggtattatgattaaacagtgacggatatt 21856767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 31237751 - 31237984
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31237751 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 31237850  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |  ||     
T  31237851 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttgatcatgttcctt 31237950  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31237951 gttaaggtattatgattaaataatgacagatatt 31237984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 31247121 - 31247354
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31247121 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtgttctaagtttctcaccgttactac 31247220  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||     
T  31247221 atttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgttttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatattcctt 31247320  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31247321 gttaaggtattatgattaaataatgacagatatt 31247354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 32753177 - 32753411
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32753177 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 32753276  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||||||    
T  32753277 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactgtatttattagtataa----ggtcctat 32753372  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32753373 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 32753411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 234 - 418
Target Start/End: Original strand, 6532192 - 6532377
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  6532192 ggcttaattaccttttttgtcctctaactatttaatttgtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaaatttctcaccgtt 6532291  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 418  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6532292 actacatttagtgatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 6532377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 26956968 - 26957200
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26956968 aggctaaattacattttttgtcctccaactatttaattgatatcggtt-------ctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgt 26957060  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957061 tactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaaagtttatgttatgggggtcctctagctttatttattagtatcattttggtccta 26957160  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26957161 tgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 26957200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 34891094 - 34890932
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34891094 aggcttaattacttttt-ggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 34890996  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34890995 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 34890932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32753621 - 32753461
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32753621 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 32753522  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  32753521 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttatgtgggt 32753461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 3423169 - 3423332
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423169 aggcttaattaccattttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 3423268  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3423269 tactacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 3423332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 277 - 471
Target Start/End: Original strand, 7270672 - 7270867
Alignment:
Q  277 ggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gtt 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7270672 ggattggtcctctaattaaaaattgatttattttgatcttttaagtttcttaccgttactatatttagtcttttttgttagttttattcaaataaacgtt 7270771  T
Q  376 aggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7270772 agggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 7270867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 35167490 - 35167652
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35167490 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 35167589  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35167590 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 35167652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15933004 - 15932844
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15933004 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttac 15932905  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  15932904 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 15932844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 21856553 - 21856717
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21856553 taggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccg 21856652  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  21856653 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 21856717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 978414 - 978577
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  978414 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 978513  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  978514 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 978577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 5937816 - 5937975
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5937816 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgattctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 5937915  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5937916 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5937975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9046537 - 9046374
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  9046537 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccgctaagtttctcaccgc 9046438  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9046437 tactacatttagtcctttctgttagttctattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 9046374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 34994378 - 34994542
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34994378 taggtttaattacctttttggtcctttaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 34994477  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  34994478 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtgggt 34994542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 232 - 393
Target Start/End: Original strand, 6137377 - 6137538
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6137377 taggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaat-gatttatttcggtcctctaagtttctcactg 6137475  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  6137476 ttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgttatgtgg 6137538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 25176665 - 25176819
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  25176665 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattatggtcctctaagtttctcaccgttac 25176764  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttat 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25176765 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 25176819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 280 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 3423574 - 3423382
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagg 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  3423574 ttggtccgctaattaaaaattggtttatttcggtcctctaattttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaga 3423475  T
Q  379 ttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3423474 gtttgtgatatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattacgattaaatagtgaccgatatt 3423382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 6235919 - 6236083
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6235919 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctataattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 6236018  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6236019 ttactgcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 6236083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 309 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 25177032 - 25176876
Alignment:
Q  309 tcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaacttta 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25177032 tcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggggcctctaacttta 25176933  T
Q  408 tttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgac 464  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25176932 tttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgac 25176876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2517452 - 2517293
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2517452 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 2517353  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||    
T  2517352 actacatttaatcctttctgttagttttatttaaataaacgttatgatctgtgttatgtg 2517293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26600786 - 26600635
Alignment:
Q  245 ttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 344  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26600786 tttttttgtcctctaactatttagttggtattggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 26600687  T
Q  345 tcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26600686 tcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 26600635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18053406 - 18053265
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18053406 ataggcttagttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcacc 18053307  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18053306 gttactacatttagtcctttctattagttttattcaaataaa 18053265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5311274 - 5311114
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  5311274 cttagttacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttac 5311175  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  5311174 tacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 5311114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31238196 - 31238034
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctc-taagtttctcactgt 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  31238196 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggt-ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcttaagtttttcaccgt 31238098  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  31238097 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 31238034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 391
Target Start/End: Original strand, 32993017 - 32993173
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32993017 cttaattaccttcttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaagtaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattgttac 32993116  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgt 391  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32993117 tacatttggtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 32993173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 369
Target Start/End: Original strand, 14276396 - 14276534
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  14276396 ataggtttaattacctttttggtcctctacctatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttacttcggtcctctaaatttctcacc 14276495  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaat 369  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14276496 gttactacatttagtcctttgtattagttttattcaaat 14276534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 232 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7271081 - 7270920
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  7271081 taggcttaattgcctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcatcg 7270982  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  7270981 ttactatatttagtcctttctattagttttatttaaataaacgttggggtttgtgttatgtg 7270920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 234 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26957411 - 26957258
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  26957411 ggcttaattatctttttggtcatctaactatttaattggtattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttttcaccgtt 26957312  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgt 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26957311 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 26957258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31247566 - 31247404
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctc-taagtttctcactgt 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  31247566 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcagtcctcttaagtttttcaccgt 31247467  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  31247466 tactaca-ttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgtgggt 31247404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24744770 - 24744609
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  24744770 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatta-attggtcctctaactaaaaattgatttatttccattctttaagtttctcactgtt 24744672  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24744671 attacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24744609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 10412949 - 10412796
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10412949 cttaattatctttttggtcttttaactatttagttggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 10412850  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgtta 388  Q
    || |||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10412849 tatatttagtcatttctattaattttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 10412796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 234 - 362
Target Start/End: Original strand, 17244664 - 17244792
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  17244664 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 17244763  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagtttta 362  Q
    | || |||| ||| ||| |||||||||||    
T  17244764 attatatttcgtcatttctgttagtttta 17244792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 335
Target Start/End: Original strand, 34517271 - 34517373
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34517271 aggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactgt 34517370  T
Q  333 tac 335  Q
    |||    
T  34517371 tac 34517373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 7438803 - 7438920
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  7438803 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgt 7438902  T
Q  333 tactacatttagtccttt 350  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  7438903 tactacatttagttcttt 7438920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7270405 - 7270241
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||  |    
T  7270405 taggcttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcgaattgatcctctaactaaaaattaattttttttggttctctaaatttctcatcg 7270306  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  7270305 ttactacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtggtatgtgggt 7270241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34518142 - 34518026
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||    
T  34518142 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctcaaactaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcatcgtt 34518043  T
Q  334 actacatttagtccttt 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  34518042 actacatttagtccttt 34518026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 29261402 - 29261285
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  29261402 aggctaaattatatttttagtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatgtcggtcccttaagtttctcactgt 29261303  T
Q  333 tactacatttagtccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29261302 tactacatttagtccttt 29261285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 339 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 35167837 - 35167702
Alignment:
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||     
T  35167837 atttaatcctttctgttagttttattcaagtaaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcctaatcctt 35167738  T
Q  438 gttaagatat--tatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35167737 gttaaggtattatatgattaaatagtgactgatatt 35167702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 328
Target Start/End: Original strand, 15932729 - 15932824
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 328  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15932729 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctca 15932824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 362
Target Start/End: Original strand, 6228730 - 6228857
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  6228730 ggcttaattacctttttagtcctctaattatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcc-ctaagtttatcaccgtt 6228828  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagtttta 362  Q
    |||| |||| ||| ||| |||| ||||||    
T  6228829 actatatttcgtcatttctgtttgtttta 6228857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 372
Target Start/End: Original strand, 3035926 - 3036019
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttt-tgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  3035926 ttggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactcttactacatttagtcattttctgttaattttattcaaataaa 3036019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 239 - 346
Target Start/End: Original strand, 15286350 - 15286457
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||| |    
T  15286350 aattacctttttgatcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctgactaaaaattgatttatttcaatcccttaagtttctcaccgttactgc 15286449  T
Q  339 atttagtc 346  Q
    ||||||||    
T  15286450 atttagtc 15286457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 239 - 346
Target Start/End: Original strand, 29260536 - 29260642
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  29260536 aattacctttctggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctcaaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctcac-attactac 29260634  T
Q  339 atttagtc 346  Q
    ||||||||    
T  29260635 atttagtc 29260642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25180299 - 25180219
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 313  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25180299 aggctaaattacctttctggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 25180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35167907 - 35167833
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattta 306  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35167907 taggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgattta 35167833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6229760 - 6229629
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  6229760 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcc-ctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttagt 6229662  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaagttagg 378  Q
    |||||  |||| ||||||| | | |||||||||    
T  6229661 cctttccgttaattttattaataaaaagttagg 6229629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27829414 - 27829314
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  27829414 ggcttaattacctttt-ggtcctccaactatttaattggtaacagtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgtt 27829316  T
Q  334 ac 335  Q
    ||    
T  27829315 ac 27829314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17245711 - 17245580
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||    
T  17245711 aggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgt 17245612  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttatt 364  Q
    |||||| ||||||| |||  |||| |||||||    
T  17245611 tactacttttagtcttttccgttaattttatt 17245580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 338
Target Start/End: Original strand, 34251553 - 34251656
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  34251553 aggctaaattacctttttaatcctctaattatttagttggtatcggattagtcctg--actaaaaattaatttatttcgatcctctaagtttctcatcgt 34251650  T
Q  333 tactac 338  Q
    ||||||    
T  34251651 tactac 34251656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 1158588 - 1158669
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  1158588 ggcttaattacatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcc 1158669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26392905 - 26392839
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  26392905 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 26392839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 17383734 - 17383799
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  17383734 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 17383799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31739974 - 31739909
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  31739974 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 31739909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 3618781 - 3618845
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  3618781 ggcttaaatgcttttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 3618845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 21271486 - 21271550
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  21271486 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 21271550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21272177 - 21272113
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  21272177 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 21272113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 298
Target Start/End: Original strand, 22498408 - 22498448
Alignment:
Q  258 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  22498408 taactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 22498448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22498825 - 22498761
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  22498825 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 22498761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 114)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 4773242 - 4773480
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4773242 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 4773341  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773342 tactatatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 4773441  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773442 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 4773480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10506398 - 10506160
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10506398 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 10506299  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10506298 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 10506199  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10506198 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 10506160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 54108352 - 54108114
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54108352 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcagtgtt 54108253  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54108252 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 54108153  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54108152 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 54108114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 39241363 - 39241596
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241363 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 39241462  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  39241463 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtctt 39241562  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39241563 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 39241596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5900874 - 5900635
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5900874 aggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 5900775  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5900774 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtccta 5900675  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5900674 ttccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 5900635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 32633516 - 32633277
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32633516 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattgttatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 32633417  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32633416 tactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 32633317  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32633316 tttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 32633277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 42591784 - 42592022
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42591784 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 42591883  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42591884 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 42591983  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42591984 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 42592022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 246 - 470
Target Start/End: Original strand, 44893752 - 44893977
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44893752 tttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 44893851  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  44893852 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaga 44893951  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatat 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44893952 tattatgatcaaatagtgactgatat 44893977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 239 - 463
Target Start/End: Original strand, 47669264 - 47669489
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47669264 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 47669363  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  47669364 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 47669463  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtga 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47669464 gttaagatattatgattaaatagtga 47669489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Original strand, 53716292 - 53716531
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53716292 ataggctaaattacttttttg-tcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 53716390  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53716391 gttactatatttggtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttacgtggg-cctctaactttatttattagtatcattttggtcc 53716489  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53716490 tatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 53716531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 236 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1994616 - 1994389
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994616 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 1994517  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatat 434  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  1994516 tacatttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattc 1994417  T
Q  435 ctcgttaagatattatgattaaatagtga 463  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1994416 cttgttaaga-attatgattaaatagtga 1994389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 4757944 - 4757706
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4757944 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 4757845  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4757844 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttcta 4757745  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  4757744 ttccttgataaga-attatgatcaaatagtgaccgatatt 4757706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 18464454 - 18464694
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464454 taggctaaattacatttttgctcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 18464553  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18464554 ttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctatagctttatttattagtatcattttggtcat 18464653  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||   | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18464654 atgcattgttaaggtattatggttaaatagtgactgatatt 18464694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 29818182 - 29818415
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29818182 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaaataaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttactac 29818281  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |     
T  29818282 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtttt 29818381  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29818382 attaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 29818415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 27801501 - 27801727
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27801501 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactagatttatt 27801600  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||      
T  27801601 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtggatcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaaag 27801700  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27801701 tattatgattaaatagtgactgatatt 27801727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 39664634 - 39664396
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39664634 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 39664535  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39664534 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctat 39664435  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39664434 gccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatatt 39664396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8474291 - 8474058
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  8474291 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatgaccgttactac 8474192  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |     
T  8474191 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcttt 8474092  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8474091 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 8474058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 16931604 - 16931844
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaa-ttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16931604 taggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttggta-cggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 16931702  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaata-aagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16931703 gttactacatttagtcctttctgttagttttatacaaatatacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 16931802  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16931803 tatgtcttgttaaggtattaagattaaatagttactgatatt 16931844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 21969634 - 21969867
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21969634 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 21969733  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||     
T  21969734 atttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattcctt 21969833  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21969834 gttaaggtattatgtttaaatagtgactgatatt 21969867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 21992070 - 21992303
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21992070 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 21992169  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||     
T  21992170 atttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattcctt 21992269  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21992270 gttaaggtattatgtttaaatagtgactgatatt 21992303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 22201621 - 22201854
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22201621 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaaataaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgttactac 22201720  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  22201721 atttagtcctttctgttaggtttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcctt 22201820  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22201821 gttaaggtattatgattaaatagtgactaatatt 22201854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 11256101 - 11256341
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  11256101 taggcttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaaataatttatttcgatcctttaagtttctcatcg 11256200  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11256201 ttactacatttagtcctttttgatagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 11256300  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11256301 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 11256341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 22151844 - 22152083
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  22151844 aggctaaattacatttttggtcctataactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttctcaccgt 22151943  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22151944 tactacatttagtcctttttgttaattttattcaaataaacgatagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 22152043  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22152044 ttcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 22152083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26318633 - 26318394
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26318633 aggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgt 26318534  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26318533 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 26318434  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |   | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26318433 ttctttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatatt 26318394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 15986247 - 15986472
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15986247 tttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcccctagctaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactgcatttagt 15986346  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||     
T  15986347 cctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcctat-tcgtgttaagg 15986445  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15986446 tattatgattaaatagtgactgatatt 15986472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 21568758 - 21568983
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21568758 tttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 21568857  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  21568858 catttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgt-ggtcctctaaccttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaga 21568956  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21568957 tattatgattaaatagtgactaatatt 21568983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Original strand, 24428564 - 24428805
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24428564 ataggctaaattatctttttggtcctctaactattcaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcact 24428663  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24428664 gttactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttgggatttgtgttatgtggatcctctaacttaatttattagtatcattttgctcc 24428763  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24428764 tatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 24428805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12203988 - 12203763
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12203988 ttttggtcccctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtc 12203889  T
Q  347 ctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagat 445  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||| |    
T  12203888 ctttctgatagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggacctctaactttatttattagtatcattttggtaatatgttttgttaaggt 12203789  T
Q  446 attatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  12203788 attatgattaaacagtgactgatatt 12203763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 51509555 - 51509331
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51509555 tttttgtcctccaactatttaattggtattggattagtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactacatttagtc 51509457  T
Q  347 ctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagat 445  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |    
T  51509456 ttttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggt 51509357  T
Q  446 attatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  51509356 attatgattaaatagtgactgatatt 51509331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 46152613 - 46152851
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  46152613 taggctaaattacatctttggtcctctaactatttaattggcatcgaattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacca 46152712  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46152713 tcactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatctgg--catctaactttatttattagtatcattttggtcat 46152810  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46152811 attccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 46152851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 47303469 - 47303231
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  47303469 ataggtttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaagtaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcacc 47303370  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  47303369 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt--tgttatgtgggtcctctaactttatttatta-tatcattttgatca 47303273  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47303272 tatgccttattaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 47303231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 54752175 - 54752401
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |    
T  54752175 tttttggtcctctaactatttaattggtataagattggtcctgtaactaaaaattgatttatttcggtcatataagtttctcaccgttactacatttgat 54752274  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||     
T  54752275 cctttctgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaagg 54752374  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  54752375 tattatgattaaatagtgactgatatt 54752401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 223 - 471
Target Start/End: Original strand, 39951346 - 39951595
Alignment:
Q  223 attagaacataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 322  Q
    |||| ||| |||||| ||||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39951346 attaaaacttaggctaaattacccttttgatcatctgactatttaattggtatcggattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctttaagt 39951445  T
Q  323 ttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcat 421  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39951446 ttctcatcgttactatatttagttctttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctttaactttatttattagtatcat 39951545  T
Q  422 tttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39951546 tttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 39951595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 232 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28986593 - 28986397
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986593 taggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 28986494  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 428  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986493 ttacta-atttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 28986397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27801940 - 27801777
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801940 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaattaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 27801841  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27801840 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 27801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 39664183 - 39664346
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39664183 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 39664282  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39664283 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 39664346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41835371 - 41835138
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41835371 aattacctttttggtcctctaactatttaattgatattgaattagttctttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 41835272  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  41835271 atttagtcctttctattagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttacatgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 41835172  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41835171 gttaatgtattttgattaaatagtgactgatatt 41835138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Original strand, 51509116 - 51509281
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  51509116 ataggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacc 51509215  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51509216 gttcctacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 51509281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21569196 - 21569033
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21569196 aggcttgattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgt 21569097  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21569096 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 21569033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 54107901 - 54108064
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54107901 aggctttattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 54108000  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  54108001 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 54108064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24429017 - 24428855
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24429017 ggcttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 24428918  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24428917 actacatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24428855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 1994168 - 1994331
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1994168 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgt 1994267  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  1994268 tgctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 1994331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 1999327 - 1999490
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1999327 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgt 1999426  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  1999427 tgctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 1999490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 234 - 392
Target Start/End: Original strand, 26318182 - 26318341
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26318182 ggcttaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 26318281  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  26318282 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 26318341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 231 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42592237 - 42592074
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  42592237 ataggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacc 42592138  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  42592137 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgg 42592074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 47669709 - 47669548
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47669709 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttatttggtatcggattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 47669610  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtggg 394  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  47669609 actacatttagtccttactgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 47669548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 4757492 - 4757656
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  4757492 taggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggaatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacca 4757591  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4757592 ttactacatttattcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 4757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 5900421 - 5900585
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5900421 taggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccg 5900520  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  5900521 ttactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 5900585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 231 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11256556 - 11256392
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  11256556 ataggcgtaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctttaagtttctcacc 11256457  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtggg 394  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  11256456 gttactaaatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtggg 11256392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18464907 - 18464744
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18464907 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgt 18464808  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18464807 tactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 18464744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45307142 - 45306991
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45307142 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 45307043  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgt 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45307042 actacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaatgttagggtttgt 45306991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 12203551 - 12203713
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12203551 ggcttaattaccttttttatcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattggtatatttcggtcctctaagtttctcactgtt 12203650  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12203651 actacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 12203713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22202066 - 22201904
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22202066 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggtt 22201967  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  22201966 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtgggt 22201904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 10505946 - 10506110
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10505946 taggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacca 10506045  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  10506046 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtcatatgggt 10506110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29818625 - 29818465
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29818625 cttaattacctttttgatcttctaattatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttac 29818526  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  29818525 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggt 29818465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 54752611 - 54752451
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  54752611 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttac 54752512  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  54752511 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 54752451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15986684 - 15986526
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15986684 ggcttaattaactttttggtcctctaattatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15986585  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgt 391  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15986584 actacatttagtcctttcaataagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 15986526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 372
Target Start/End: Original strand, 45306832 - 45306970
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45306832 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 45306931  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45306932 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 45306970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4773695 - 4773554
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4773695 ataggcttaatcatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcact 4773596  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4773595 gttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaa 4773554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 44894187 - 44894030
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44894187 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggacctctaagtttctcaccgttact 44894088  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  44894087 acatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacattagagtttgtgttatgtgg 44894030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Original strand, 47303016 - 47303181
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  47303016 ataggcttaattacttttttgatcatctaactatttaattggtattgaatcagtcctctaattaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacc 47303115  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47303116 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 47303181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 253 - 392
Target Start/End: Original strand, 8473865 - 8474005
Alignment:
Q  253 tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtccttttt 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8473865 tcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcactgttactacatttagtcatttct 8473964  T
Q  353 gttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  8473965 gttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 8474005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22152300 - 22152133
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactat--ttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22152300 ataggcttaattacctttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctgagtttctca 22152201  T
Q  329 ctgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  22152200 ctgttactacatttagtcgtttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 22152133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12791614 - 12791488
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12791614 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcaccgttactacatttagt 12791515  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12791514 cttttctgttagttttattcaaataaa 12791488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16932055 - 16931918
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16932055 gcttaattacctttttggtcctctaactttttaattggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgtta 16931956  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16931955 ctacatttagtcttttctgttagtcttattcaaataaa 16931918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19883691 - 19883528
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19883691 tagggttaattaccttttta-tcctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcacag 19883593  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19883592 ttactacatttaatcgtttttattaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19883528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21970084 - 21969917
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactat--ttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 328  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21970084 atagacttaattacatttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctca 21969985  T
Q  329 ctgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21969984 ctgttactacatttagtcatttctgttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 21969917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21992520 - 21992353
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactat--ttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 328  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21992520 atagacttaattacatttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctca 21992421  T
Q  329 ctgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21992420 ctgttactacatttagtcatttctgttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 21992353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 53716745 - 53716581
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||       
T  53716745 taggcttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcatca 53716646  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaa-taaagttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  53716645 ttactacatttagtcatttatgttagttttattcaaattaacgttagggtttgtgttatgtgggt 53716581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44317665 - 44317537
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  44317665 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 44317566  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagtttta 362  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  44317565 actatatttcgtcctttctgttagtttta 44317537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 232 - 362
Target Start/End: Original strand, 49528147 - 49528277
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  49528147 taggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctagctaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccg 49528246  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagtttta 362  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  49528247 ttactatatttcgtcctttctgttagtttta 49528277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Original strand, 41834961 - 41835088
Alignment:
Q  269 ttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaa 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||    
T  41834961 ttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttaatcctttctgttagttgtatttaaa 41835060  T
Q  369 taaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41835061 taaacgttagggtttgtgttatgtgggt 41835088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 237 - 362
Target Start/End: Original strand, 13866023 - 13866148
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  13866023 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgttact 13866122  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagtttta 362  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||    
T  13866123 atatttcgtcctttctgttagtttta 13866148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7681575 - 7681447
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7681575 aggctaaattacacttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 7681476  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttt 360  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7681475 ttactacattcagtcctttctgttagttt 7681447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 350
Target Start/End: Original strand, 7163463 - 7163566
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7163463 ttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacagttactacatttagtc 7163562  T
Q  347 cttt 350  Q
    ||||    
T  7163563 cttt 7163566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 234 - 345
Target Start/End: Original strand, 28985509 - 28985620
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28985509 ggcttaattacccttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctataagtttctcaccgtt 28985608  T
Q  334 actacatttagt 345  Q
    | ||||||||||    
T  28985609 attacatttagt 28985620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20963678 - 20963525
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  20963678 ataggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctctct 20963579  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgt 384  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  20963578 gttacttcttttagtcctttccgttagttttattaaaaaaaagttaggatttgt 20963525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 246 - 350
Target Start/End: Original strand, 15790691 - 15790795
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15790691 tttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttccatcccttaagtttctcaccgttactacatttagt 15790790  T
Q  346 ccttt 350  Q
    |||||    
T  15790791 ccttt 15790795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 39241741 - 39241646
Alignment:
Q  301 gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39241741 gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtgggt 39241646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 46153032 - 46152904
Alignment:
Q  262 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagtttt 361  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  46153032 tatttagttggtatcgaattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcac---tactacatttagtcatttatgttagtttt 46152936  T
Q  362 attcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  46152935 attcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtg 46152904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 354 - 471
Target Start/End: Original strand, 19883359 - 19883477
Alignment:
Q  354 ttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatga 452  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||    
T  19883359 ttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtaccttaactttatttattagtatcattttggttctaagtcttgttaaggtattatga 19883458  T
Q  453 ttaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19883459 ttaaatagtgactgatatt 19883477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30681869 - 30681752
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| |    
T  30681869 taggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtaacagtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccg 30681770  T
Q  332 ttactacatttagtcctt 349  Q
    |||| | |||| ||||||    
T  30681769 ttaccatatttcgtcctt 30681752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15791556 - 15791454
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  15791556 taggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggat-----ctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccg 15791462  T
Q  332 ttactaca 339  Q
    ||||||||    
T  15791461 ttactaca 15791454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49529194 - 49529062
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  49529194 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttagt 49529095  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaagttagg 378  Q
    |||||  |||| ||||||| | | |||||||||    
T  49529094 cctttccgttaattttattaataaaaagttagg 49529062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 223 - 350
Target Start/End: Original strand, 30681018 - 30681145
Alignment:
Q  223 attagaacataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 322  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| |    
T  30681018 attagaaaagaggcttaattacatttttggtcatctaactatttaattggtaacggtttggttctctaactaaaaaaatatttattttggtcctctaact 30681117  T
Q  323 ttctcactgttactacatttagtccttt 350  Q
    || |||| ||||| | |||| |||||||    
T  30681118 ttatcaccgttaccatatttcgtccttt 30681145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 378
Target Start/End: Original strand, 44316626 - 44316770
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||    
T  44316626 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttagtcccctaactaaaatttgatttattt-ggtcccttaaatttctctctgt 44316724  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttagg 378  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||||| | | |||||||||    
T  44316725 tactacttttagtcctttccgttaattttattaataaaaagttagg 44316770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13867038 - 13866906
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| | |||||||| |||| |    
T  13867038 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctcagttactacttttaat 13866939  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaagttagg 378  Q
    |||||  |||| ||||||| | | |||||||||    
T  13866938 cctttccgttaattttattaataaaaagttagg 13866906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 320
Target Start/End: Original strand, 42853244 - 42853331
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42853244 taggctaaattacctttttggtc-tctatctatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatgtgggtcctctaa 42853331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 239 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 43844480 - 43844392
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 327  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  43844480 aattatttttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaaatttctc 43844392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 395
Target Start/End: Original strand, 32633143 - 32633227
Alignment:
Q  312 gtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  32633143 gtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgatatgtgggt 32633227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 315
Target Start/End: Original strand, 43839984 - 43840041
Alignment:
Q  258 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 315  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43839984 taactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcc 43840041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Original strand, 966977 - 967044
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  966977 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 967044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13355787 - 13355721
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  13355787 taggcttaaatgctcttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 13355721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 395
Target Start/End: Original strand, 28986261 - 28986322
Alignment:
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  28986261 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 28986322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6099039 - 6098975
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  6099039 ggcttaaatgctcttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 6098975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8327801 - 8327697
Alignment:
Q  258 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttag 357  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |  ||||||||||| |||||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||  ||| | ||||    
T  8327801 taactatttatttggtatcggtttggtcccttaactatattttgatttattttggtcctttaaatttatctttgttaccacatttagttatttctattag 8327702  T
Q  358 tttta 362  Q
    |||||    
T  8327701 tttta 8327697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40503790 - 40503726
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  40503790 ggcttaattgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 40503726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 315
Target Start/End: Original strand, 50259112 - 50259188
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 315  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||  |||| |||||| |||||    
T  50259112 aattacatttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgaattattttggtcc 50259188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Original strand, 12739961 - 12740028
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  12739961 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 12740028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39951793 - 39951682
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  ||    
T  39951793 aggcttaattattttttttgtcct-taactatttaattggtatc----------tttaactaaaaattgatttatttcaattctctaagtttttcaacgt 39951705  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgtt 355  Q
    || ||||||||||| ||| ||||    
T  39951704 tattacatttagtcatttctgtt 39951682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40639505 - 40639430
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttat 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  40639505 taggctaaattatgtttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttat 40639430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24243057 - 24242991
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  24243057 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 24242991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32309649 - 32309599
Alignment:
Q  248 tttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  32309649 tttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 32309599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 45940740 - 45940674
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  45940740 taggcttaaatgctattttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 45940674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 50394405 - 50394335
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 309  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  50394405 aattacctttttggtcccttaactatttaattggttttggtttggtcccttaactaaattttgatttattt 50394335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 27688477 - 27688550
Alignment:
Q  225 tagaacataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||  |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  27688477 tagaaaataggcttaattgctattttagtcccttaactaattatttggtatcggtttggtcccataactaaaaa 27688550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 51311906 - 51311829
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 309  Q
    |||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  51311906 taggctaaattacatttttggtctgttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattt 51311829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5348955 - 5348879
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 309  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  5348955 aggctaaattatgttttttgtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccgtaattaaaatttgatttattt 5348879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 12739878 - 12739942
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  12739878 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 12739942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27990326 - 27990266
Alignment:
Q  238 taattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  27990326 taattgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 27990266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42853374 - 42853342
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactattta 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42853374 gcttaattacatttttggtcctctaactattta 42853342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 45940215 - 45940279
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  45940215 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 45940279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50531166 - 50531102
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50531166 ggcttaaatgctcttttggtcccttaaatatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 50531102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 53246659 - 53246595
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  53246659 ggcttaaatgcttttttgctcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 53246595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 38959173 - 38958936
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38959173 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38959074  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctata 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38959073 actacatttagtcctttttgttaattttattcaaataaagttagattttgtgttatgtgagtcctctaactttatttataagtatcattttggtcttata 38958974  T
Q  434 tctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958973 tctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 38958936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Original strand, 9989320 - 9989561
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9989320 ataggctaaattacttttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 9989419  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989420 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 9989519  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9989520 tatgtcttattaaggtattatgattaaacagtgactaatatt 9989561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 2182942 - 2183181
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  2182942 aggctaaattaattttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgtcgtctaagtttctcaccgt 2183041  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2183042 tactacatttagtcctttatgttagctttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 2183141  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2183142 tatcttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatatt 2183181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 36440651 - 36440412
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36440651 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactat 36440552  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36440551 aactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 36440452  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36440451 ttcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 36440412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37424709 - 37424474
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37424709 aattacctttttggtcctctaactatttaattg-tattggattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 37424611  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtggg---tcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatat 434  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  37424610 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctcctctaactttatttattaatatcattttggtcctattt 37424511  T
Q  435 ctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37424510 tttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 37424474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 234 - 463
Target Start/End: Original strand, 27185874 - 27186103
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27185874 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactttt 27185973  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27185974 actacatttagtccttcctg-tagttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggtcctctaattttattaattagtatcattttggtcttat 27186072  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtga 463  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||    
T  27186073 gccttgttaaggtattatgattaaatagtga 27186103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24040537 - 24040297
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  24040537 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattagtatcggattgatcctctaactaaaaattgacttatttcagtcctttaagtttctcaccgtt 24040438  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatc--attttggtcct 430  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  24040437 cctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcatattttggtcat 24040338  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24040337 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 24040297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 32288521 - 32288289
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32288521 aattacctttttgatcctctaactatttaattgatattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcactgttaatac 32288422  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcg 438  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |    
T  32288421 atttagtcatttctgttagttttattcaaataatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgccttg 32288322  T
Q  439 ttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  32288321 ttaaagtattatgattaaatagtgattgatatt 32288289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34264790 - 34264560
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattta----tttcggtcctctaagtttctcactgttactacatt 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34264790 tttttggtcctccaactatttaattggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttaattatttcggtcctctaagtttctcattgttattacatt 34264691  T
Q  342 tagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgtt 440  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||    
T  34264690 tagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgccttgtt 34264591  T
Q  441 aagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34264590 aagatattatgattaaatagtgactgatatt 34264560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 245 - 471
Target Start/End: Original strand, 11315969 - 11316192
Alignment:
Q  245 ttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 344  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11315969 tttttttgtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcttactattactacatttag 11316068  T
Q  345 tcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaag 443  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  11316069 tcatttctgttagttttattccaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtc---ttaac 11316165  T
Q  444 atattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  11316166 a-attatgattaaatattgacttatatt 11316192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 245 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 35570219 - 35569992
Alignment:
Q  245 ttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35570219 tttttttgtcctctaactatttaattggtatttgattactcctctaactaaaaattgatttattttagtcttctaagtttctcaccgttactacatttag 35570120  T
Q  345 tcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaag 443  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||    
T  35570119 tcacttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcatttcggtcttattccttgttaag 35570020  T
Q  444 atattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  35570019 ttattatgattaaatagtgactgatatt 35569992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 25567439 - 25567200
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||    
T  25567439 aggctaaattacttttttagtcctttaactatttaattggtatcggattggttctttaactaaaaattgatttattttgatcctttaagtttttcaccgt 25567340  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  25567339 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttttgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttagtcata 25567240  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25567239 tgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatatt 25567200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27186324 - 27186161
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27186324 aggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgt 27186225  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27186224 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 27186161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 394
Target Start/End: Original strand, 39325414 - 39325573
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39325414 cttaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 39325513  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtggg 394  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  39325514 tacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtggg 39325573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 234 - 372
Target Start/End: Original strand, 38958724 - 38958862
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958724 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 38958823  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38958824 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaa 38958862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25183100 - 25182941
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  25183100 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagcttctcaatgttgct 25183001  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25183000 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 25182941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Original strand, 35569777 - 35569934
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569777 cttaattacctttttggtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 35569876  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35569877 tacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35569934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 234 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39325805 - 39325636
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39325805 ggctaaattacatttttagtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 39325706  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaa 402  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39325705 attacatttagtactttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggctcctctaa 39325636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Original strand, 24040087 - 24040247
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24040087 cttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttac 24040186  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  24040187 tacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 24040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 36440198 - 36440362
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36440198 taggcttaattacctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 36440297  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  36440298 ttattacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36440362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 37424262 - 37424424
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37424262 ggcttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 37424361  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  37424362 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatttgggt 37424424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9989754 - 9989611
Alignment:
Q  253 tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtccttttt 352  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9989754 tcctctacctatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttct 9989655  T
Q  353 gttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  9989654 gttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 9989611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 235 - 393
Target Start/End: Original strand, 32288079 - 32288237
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32288079 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgtta 32288178  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32288179 ctacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagg-tttgtgttatgtgg 32288237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Original strand, 16860315 - 16860462
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16860315 tttttggtcctctaactatttaatcggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagt 16860414  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  16860415 cttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 16860462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11316376 - 11316244
Alignment:
Q  262 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagtttt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  11316376 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctattaatttt 11316277  T
Q  362 attcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11316276 attcgaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 11316244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1140215 - 1140106
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1140215 ggcttaattgcctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 1140116  T
Q  334 actacattta 343  Q
    ||||||||||    
T  1140115 actacattta 1140106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 235 - 362
Target Start/End: Original strand, 19184598 - 19184725
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  19184598 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgtta 19184697  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagtttta 362  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  19184698 ctatatttcgtcctttctgttagtttta 19184725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2183372 - 2183255
Alignment:
Q  255 ctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  2183372 ctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggttctgtaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctat 2183273  T
Q  355 tagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2183272 tagttttattcaaataaa 2183255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 253 - 390
Target Start/End: Original strand, 29198971 - 29199109
Alignment:
Q  253 tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtccttttt 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  29198971 tcctctaactatttaattgatattaaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgattctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttct 29199070  T
Q  353 gttagttttattcaaataaag-ttaggttttgtgttatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29199071 gttagttttattcaaataaagtttagggtttgtgttatg 29199109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 34264350 - 34264478
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggt-----------cctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag 321  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34264350 aggcttaattacctttttgatcctctaactatttaattggtgttggattggtgttggattggccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaag 34264449  T
Q  322 tttctcactgttactacatttagtccttt 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34264450 tttctcaccgttactacatttagtccttt 34264478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19185635 - 19185490
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||    
T  19185635 aggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgt 19185536  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttagg 378  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||||| | | |||||||||    
T  19185535 tactacttttagtcctttccgttaattttattaataaaaagttagg 19185490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 232 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31756754 - 31756630
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  31756754 taggtttaattacctttttggtctcctaactatttaattggtaacggtttagtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactg 31756655  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgtta 356  Q
    |||| | |||| ||| ||| |||||    
T  31756654 ttaccatattttgtcatttctgtta 31756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16860588 - 16860515
Alignment:
Q  398 tctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16860588 tctaactttatttattagtatcattttggttccatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 16860515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19128503 - 19128434
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgat 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19128503 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgat 19128434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33817729 - 33817659
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 309  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33817729 aattacctttttgattctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaatttatttattt 33817659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 398 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16860705 - 16860632
Alignment:
Q  398 tctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16860705 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaatgtattatgattaattagtgactgatatt 16860632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29199249 - 29199167
Alignment:
Q  386 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgat 468  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29199249 ttatgtggatcttctaacattatttattagtatcattttaattctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgat 29199167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Original strand, 29961804 - 29961874
Alignment:
Q  228 aacataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  29961804 aacataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtccattaactaaaaa 29961874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 17339794 - 17339859
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  17339794 aggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 17339859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26522302 - 26522258
Alignment:
Q  153 ttttgttttagttccactaaagaatttctttggcttttagtccct 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  26522302 ttttgttttagttccactaaaaaatttcttcagcttttagtccct 26522258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16670089 - 16670022
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  16670089 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 16670022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 435552 - 435618
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  435552 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 435618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 286
Target Start/End: Original strand, 2596386 - 2596440
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcc 286  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2596386 taggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcc 2596440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3722133 - 3722079
Alignment:
Q  244 cttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  3722133 cttttttggtcccttaaatatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 3722079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4077475 - 4077409
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  4077475 taggcttaaatgctcttttggtcccctaaatatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 4077409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 4959559 - 4959625
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  4959559 taggcttaaatgctattttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 4959625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6157557 - 6157491
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  6157557 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgatttggtcccttaactaaaaa 6157491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11079690 - 11079624
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  11079690 taggcttaaatgctattttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 11079624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2597458 - 2597377
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 327  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||   ||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  2597458 tttttggtcccttaactatttaattggttttggtttggtctcttaactaaattttgatttattttggtcctttaactttctc 2597377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24100759 - 24100694
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  24100759 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 24100694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25333247 - 25333182
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  25333247 aggcttaaatgctattttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaattaaaaa 25333182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 298
Target Start/End: Original strand, 6157160 - 6157200
Alignment:
Q  258 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  6157160 taactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 6157200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27851101 - 27851037
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  27851101 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 27851037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29962239 - 29962175
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  29962239 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 29962175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 30012559 - 30012623
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  30012559 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 30012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 35000918 - 35000982
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| |||| |||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  35000918 ggcttaaatactcttttggtcctttacctgtttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 35000982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 38312325 - 38312389
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  38312325 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 38312389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 39547777 - 39547841
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  39547777 ggcttaaatgcttttttggtcccttaaatatttatttggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 39547841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 99)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 6356284 - 6356523
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  6356284 taggtttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttaccg 6356383  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356384 ttactacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaagttagattttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 6356483  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356484 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 6356523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 33716593 - 33716826
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33716593 aattagttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 33716692  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33716693 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtctt 33716792  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33716793 gttaaggtattatgattaaataatgactgatatt 33716826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41192130 - 41191897
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41192130 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactac 41192031  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  41192030 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttctt 41191931  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41191930 attaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 41191897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 44332969 - 44332731
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44332969 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44332870  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44332869 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 44332770  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44332769 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 44332731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Original strand, 10526308 - 10526548
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10526308 ataggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 10526407  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10526408 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 10526507  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     ||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10526508 aatgcct-gttaaggtattatgattaaatattgactgatatt 10526548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41453450 - 41453217
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41453450 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 41453351  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||     
T  41453350 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattcctt 41453251  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41453250 gttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 41453217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 6356764 - 6357003
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6356764 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 6356863  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6356864 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttcta 6356963  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6356964 ttccttgttaaggtattatgattaaacagtgattgatatt 6357003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 258 - 471
Target Start/End: Original strand, 17359205 - 17359419
Alignment:
Q  258 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttag 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17359205 taactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttag 17359304  T
Q  358 ttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaa 456  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  17359305 ttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaa 17359404  T
Q  457 atagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||    
T  17359405 atagtgactgatatt 17359419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 48626514 - 48626275
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||    
T  48626514 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctgaccgt 48626415  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48626414 tgctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 48626315  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48626314 ttccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 48626275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21391640 - 21391402
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21391640 ggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcactctt 21391541  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21391540 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtggatcatctaactttatttattagtatcattttgatcttat 21391441  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21391440 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 21391402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19681946 - 19681707
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19681946 aggctaaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 19681847  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19681846 tactacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 19681747  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | ||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  19681746 tttcttgttaatgcattatgattaaatattgactgatatt 19681707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31638393 - 31638155
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  31638393 ggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttctcatcgtt 31638294  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31638293 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttatggtttgtgtcatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 31638194  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31638193 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 31638155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 41751662 - 41751888
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  41751662 tttttggtcctttaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgacttatttcggtcctctaagtttctaaccgttactacatttaat 41751761  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||     
T  41751762 cctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcttctaactttatttattagtattattttggtcctatgtcttgttaagt 41751861  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41751862 tattatgattaaatagtgactgatatt 41751888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 255 - 471
Target Start/End: Original strand, 28297840 - 28298057
Alignment:
Q  255 ctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgt 354  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||    
T  28297840 ctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagttctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttctgt 28297939  T
Q  355 tagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgat 453  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||    
T  28297940 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgactagttaaggtattatgat 28298039  T
Q  454 taaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28298040 taaatagtgactgatatt 28298057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34037349 - 34037123
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  34037349 tttttggtcctctaactatttaattggtatatgattagtcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatctccgttactgcatttagt 34037250  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||     
T  34037249 cctttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcatattttttgttaagg 34037150  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34037149 tattatgattaaatagtgactgatatt 34037123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28286562 - 28286329
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28286562 aattacatttttggtcctctaactttttaattggtatcggattagtcctttaactaaaaattgattgatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 28286463  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||     
T  28286462 atttagttctttatattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggaactattcctt 28286363  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28286362 cttaaggtattatgattaaatagtgaccgatatt 28286329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 8542497 - 8542737
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8542497 taggctaaattacctttttcgtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccg 8542596  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8542597 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttgtgtgggtcttctaactttatttattagcatcattttggtcat 8542696  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8542697 attccttgttaaggtattatgattaaatattgacggatatt 8542737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8937300 - 8937061
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8937300 aggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattagtatcagatttgtcctctaattaaaagttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 8937201  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  8937200 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattaatatcatgttggtcata 8937101  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  8937100 ttccttgttaaggtattgtgattaaatagtgattgatatt 8937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 239 - 432
Target Start/End: Original strand, 1114059 - 1114253
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  1114059 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacacagttactaa 1114158  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1114159 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattgtggtcctat 1114253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 7579310 - 7579084
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7579310 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcatctaattttctcaccgttactacatttagt 7579211  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||     
T  7579210 cctttattttagttatattcaaataaacgttatggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaagg 7579111  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7579110 tattatgattaaatagtgattgatatt 7579084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 43247413 - 43247653
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43247413 taggctgaattatattttttgtcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccg 43247512  T
Q  332 ttactacatttagt-cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43247513 ttactacatttactccctttctattagttttattcaaataaacattagg-tttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtct 43247611  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43247612 tatgcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 43247653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 256 - 469
Target Start/End: Original strand, 36423391 - 36423605
Alignment:
Q  256 tctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgtt 355  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| || |||| ||||    
T  36423391 tctaactatttaattggcattagattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcactgttgccacttttggttctttctgtt 36423490  T
Q  356 agttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgatt 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||     
T  36423491 agttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatacctggttaaggtattatgatc 36423590  T
Q  455 aaatagtgactgata 469  Q
    |||||||||||||||    
T  36423591 aaatagtgactgata 36423605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 7578872 - 7579034
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7578872 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaatgtt 7578971  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7578972 acttcatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 7579034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 35146699 - 35146861
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35146699 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 35146798  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35146799 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 35146861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10526762 - 10526598
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10526762 taggcttaattatcttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 10526663  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10526662 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaagttttgtgttatgtgggt 10526598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6356736 - 6356597
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356736 aggcttaattacctttttggtcctataactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 6356637  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6356636 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 6356597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 35147127 - 35146910
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35147127 tttttggtcctctaactatttaattggtattggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactacatttagt 35147028  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||         |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  || ||||||     
T  35147027 cctttctgttagttttattcaaataaatgttatggtttgtgtt---------ctctaactttatttatcaatatcattttggtcatattccttgttaagg 35146937  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35146936 tattatgattaaatagtgactgatatt 35146910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 392
Target Start/End: Original strand, 48626063 - 48626222
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626063 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 48626162  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  48626163 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 48626222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 41453005 - 41453167
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41453005 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 41453104  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  41453105 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatatgggt 41453167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 8936847 - 8937011
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8936847 taggcttaattatctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactt 8936946  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8936947 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 8937011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31075644 - 31075485
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31075644 aggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 31075545  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31075544 tactacatttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 31075485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1114495 - 1114333
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1114495 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 1114396  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  1114395 actacatttactcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 1114333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 393
Target Start/End: Original strand, 21391189 - 21391350
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21391189 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgc 21391288  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  21391289 tactacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgg 21391350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 234 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6357215 - 6357055
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6357215 ggcttaattacatttttgatcctctaattatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacagtt 6357116  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  6357115 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgctatgtgg 6357055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 237 - 408
Target Start/End: Original strand, 7909290 - 7909461
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7909290 ttaattacttttttg-tcctttaactatttaattggtatcagattggttttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 7909388  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttat 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7909389 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtggatcctctaactttat 7909461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36423801 - 36423657
Alignment:
Q  252 gtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  36423801 gtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattacatttagtcctttc 36423702  T
Q  352 tgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  36423701 tgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36423657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 28286116 - 28286279
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  28286116 aggcttaattatatttttggtcttctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcatcgt 28286215  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28286216 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 28286279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 239 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4931718 - 4931556
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4931718 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgaattatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 4931619  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctct 400  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||    
T  4931618 attcagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtaagtcctct 4931556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 17749935 - 17750097
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17749935 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 17750034  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  17750035 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatatgggt 17750097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8542946 - 8542793
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  8542946 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtgac 8542847  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttat 389  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8542846 tacatttaatcctttctg-tagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttat 8542793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 395
Target Start/End: Original strand, 19681496 - 19681657
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||    
T  19681496 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttgccgtta 19681595  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19681596 ctacatttattcctttctgttagttttagtcgaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19681657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 41191683 - 41191844
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  41191683 ggcttaattaccttttta-tcctctaactatttagttgatattggattggtcctctaactaaaaattggtttatttcagttctctaagtttctcaccgtt 41191781  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41191782 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 41191844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 234 - 367
Target Start/End: Original strand, 16867707 - 16867840
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16867707 ggctaaattacctttttggtcctctaactatataattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttcttactgtt 16867806  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaa 367  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16867807 actacatttagtcatttctgttagttttattcaa 16867840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 31637946 - 31638103
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  31637946 ttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgaaccactaagtttctcaccgttact 31638045  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  31638046 acatttagtcatttctgttagttttattcatataaacgttagggtttgtgttacgtgg 31638103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 235 - 357
Target Start/End: Original strand, 36673976 - 36674098
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36673976 gcttaattacctttatggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 36674075  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttag 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  36674076 ctacatttagtcctttctgttag 36674098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 253 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7909597 - 7909460
Alignment:
Q  253 tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtccttttt 352  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |    
T  7909597 tcctctaactatttaattgatattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttagtacatttagtcatttct 7909498  T
Q  353 gttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttat 389  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7909497 gttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 7909460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27739115 - 27738935
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  27739115 aggctaaattactttttctgttctttaactatttatttggtatcagattgatcccctaactaaaaattgatttatttcggtccttttagtttctcaccgt 27739016  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttatt 413  Q
    ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27739015 tactatatttaat-ctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttatt 27738935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 382
Target Start/End: Original strand, 41891966 - 41892115
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||    
T  41891966 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttctttcggtcccttaagtttcttaatgtt 41892065  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggtttt 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  41892066 actacatttagtcctttctgttaaatttatttaaaaaaacgttaggtttt 41892115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 232 - 362
Target Start/End: Original strand, 4155596 - 4155726
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  4155596 taggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccg 4155695  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagtttta 362  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  4155696 ttactatatttcgtcctttctgttagtttta 4155726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 17363683 - 17363532
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  17363683 ttaattatatttttggttctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtt--tcaatgttact 17363586  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttat 389  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17363585 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 17363532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 346
Target Start/End: Original strand, 8416484 - 8416597
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8416484 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactgt 8416583  T
Q  333 tactacatttagtc 346  Q
    ||||||||||||||    
T  8416584 tactacatttagtc 8416597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 232 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41752103 - 41751962
Alignment:
Q  232 taggcttaattact-tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  41752103 taggcttaattacaattttttatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctatct 41752004  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  41752003 gttaccatatttagttctttctgttagttttaatcaaataaa 41751962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 311 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 40673378 - 40673219
Alignment:
Q  311 ggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40673378 ggtcctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 40673279  T
Q  410 tattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||  || |||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  40673278 tattagta--attttagtcatatgccttgttaaagtattagaattaaatagtgactgatatt 40673219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 256 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28298247 - 28298107
Alignment:
Q  256 tctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgtt 355  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  28298247 tctaactatttaattggtatcagatttaccctctaattaaaaattgatttatttcgattctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgtt 28298148  T
Q  356 agttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  28298147 aattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 28298107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 342
Target Start/End: Original strand, 36282786 - 36282894
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  36282786 ggctaaattacatttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 36282885  T
Q  334 actacattt 342  Q
    |||||||||    
T  36282886 actacattt 36282894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29277794 - 29277671
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  29277794 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttatttggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgt 29277695  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgtta 356  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||    
T  29277694 taccatatttcgtcctttctgtta 29277671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 239 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36283651 - 36283533
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgg-tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttacta 337  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  36283651 aattacattttttgttctctaactatttaattggtatcggatttgatcctctaactaaaaattgatttatttccgtcccttaaatttctcactgttacta 36283552  T
Q  338 catttagtcctttttgtta 356  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  36283551 catttagtcatttttgtta 36283533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33717005 - 33716872
Alignment:
Q  262 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagtttt 361  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  33717005 tatttaattgatatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcggtcatttaagtttctcattgttactaca-ttagtcatttatgttaatttt 33716907  T
Q  362 attcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
     |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  33716906 gttcaaataaacgttagggttggtgttatgtgggt 33716872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 320
Target Start/End: Original strand, 29276877 - 29276961
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29276877 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaa 29276961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8417374 - 8417285
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||    
T  8417374 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcccttaagtttctcaccgttac 8417285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32946758 - 32946669
Alignment:
Q  267 aattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgtta 356  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32946758 aattggtatcagattggtactctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttttcactgttagtacatttagtcctttctgtta 32946669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Original strand, 40673009 - 40673169
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| || ||||||||  || || ||||||| ||| |    
T  40673009 atagacttaattacatttttg-tcctctatctatttaattggtatc---ttgatcctctaactaaaatttaatttatttgagttctgtaagtttttcatt 40673104  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa---gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  40673105 gttactacatttagtcctttctgttagtt---ttcaaataaacacgttaggatttgtgttatgtgggt 40673169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41893525 - 41893416
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||| |||| |||    
T  41893525 ggctaaattattttttttgtcctttaactatttaattaatatcggattggtcatctaactaaaaatttatttatttcgattccttaagtttttcaccgtt 41893426  T
Q  334 actacattta 343  Q
    ||||||||||    
T  41893425 actacattta 41893416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36674180 - 36674095
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674180 aggctaaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcgggttagtc--ttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 36674095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 28263493 - 28263626
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |  ||| |||||  |     
T  28263493 ataggctaaattacttttttgatcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtaccttaaatttcttccc 28263592  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttatt 364  Q
    ||||| || ||||||| |||  ||||||||||||    
T  28263593 gttaccacctttagtcgtttccgttagttttatt 28263626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4156627 - 4156495
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  4156627 tttttggtcccttaactatttaattagtatctgtttggtaccctaactaaaatttgatttattttggtctcttaaatttctctctgttactacttttagt 4156528  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaagttagg 378  Q
    | |||| |||| ||||||| | | |||||||||    
T  4156527 ctttttcgttaattttattaataaaaagttagg 4156495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36423852 - 36423790
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaacta 294  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36423852 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaacta 36423790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 17359538 - 17359479
Alignment:
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttat 389  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17359538 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 17359479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28264714 - 28264587
Alignment:
Q  258 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttag 357  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||   ||||    
T  28264714 taactatttaattagtatcaatttggtcttttaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctctatgttactacttttaatcctttccattag 28264615  T
Q  358 ttttattcaaataaa-gttaggttttgt 384  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  28264614 ttttatttaaaaaaacgttagggtttgt 28264587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38677130 - 38677053
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 309  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  38677130 taggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattt 38677053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 410
Target Start/End: Original strand, 38447603 - 38447682
Alignment:
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttattt 410  Q
    ||||||||||||| || ||| | | | |||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38447603 gttactacatttaatcatttctttaaattttattcaaataaatattgggtttgtgttatgtggatcctctaactttattt 38447682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48095423 - 48095356
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  48095423 ataggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 48095356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 350
Target Start/End: Original strand, 29276950 - 29277020
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtccttt 350  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||    
T  29276950 ttggtcctctaattaaaaaatgatttcttttggtcctctaactttatcactgttaccatatttcgtccttt 29277020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40263697 - 40263616
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  40263697 ggctaaattacctttttggtcccttaaatatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattttggtcc 40263616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42287871 - 42287806
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  42287871 aggcttaaatactcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 42287806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 315
Target Start/End: Original strand, 43050396 - 43050465
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 315  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43050396 tttttggtcccttaactatttaattaatattggtttggtcccctaattaaaaattgatttattttggtcc 43050465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 18458276 - 18458340
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  18458276 ggcttaaatactcttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 18458340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39143577 - 39143505
Alignment:
Q  226 agaacataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  39143577 agaaaataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 39143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Original strand, 24733626 - 24733693
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  24733626 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 24733693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3217814 - 3217748
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  3217814 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 3217748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7777017 - 7776951
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  7777017 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 7776951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 27284240 - 27284306
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  27284240 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 27284306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 286
Target Start/End: Original strand, 43704943 - 43704997
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcc 286  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43704943 taggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcc 43704997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 47987325 - 47987391
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  47987325 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 47987391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 8090832 - 8090885
Alignment:
Q  245 ttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  8090832 ttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 8090885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 471
Target Start/End: Original strand, 17363439 - 17363472
Alignment:
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17363439 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 17363472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 20493744 - 20493809
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  20493744 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 20493809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31852141 - 31852076
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  31852141 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 31852076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35918798 - 35918733
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||   ||||||||||    
T  35918798 aggcttaaatgcttttttggtcctttaactatttaattgatatcgctttggtctcttaactaaaaa 35918733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37374516 - 37374451
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  37374516 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 37374451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 335
Target Start/End: Original strand, 38676070 - 38676159
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||   ||| |||||| |||||||    
T  38676070 tttttggtcccttaactatttaattgatttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattttggtctcttaactttctctctgttac 38676159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40852219 - 40852154
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  40852219 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 40852154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 45456733 - 45456798
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  45456733 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 45456798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 46540070 - 46540017
Alignment:
Q  282 ggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||| |||||    
T  46540070 ggtcctctaactaaaaattgattcatttcaatcccttaagtttctcaccgttac 46540017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23911140 - 23911076
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||    
T  23911140 ggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaataggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 23911076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27284667 - 27284603
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  27284667 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 27284603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36507196 - 36507116
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 313  Q
    ||||| |||||  |||||||||   ||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  36507196 aggctaaattatgtttttggtctcttaactatttaattagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttatttcggt 36507116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 39143146 - 39143210
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  39143146 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 39143210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Original strand, 41691937 - 41691989
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  41691937 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 41691989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 103)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12481511 - 12481271
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481511 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 12481412  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12481411 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcct 12481312  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12481311 attccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 12481271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45053140 - 45052901
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  45053140 aggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcagtgt 45053041  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45053040 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 45052941  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45052940 tgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 45052901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 35612527 - 35612294
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35612527 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttatcactgttactac 35612428  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  35612427 atttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtctgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtctt 35612328  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35612327 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 35612294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23476792 - 23476553
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23476792 aggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgt 23476693  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23476692 tacttcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 23476593  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23476592 tgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatatt 23476553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 16023897 - 16024135
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16023897 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 16023996  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16023997 actacatttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 16024096  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || ||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16024097 gccttgttgaggtattatgattaaatagtgactaatatt 16024135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 37304026 - 37304266
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  37304026 taggctaaattacctttttggtcctctaaccatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccg 37304125  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37304126 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 37304225  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37304226 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatatt 37304266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 232 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2064663 - 2064429
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2064663 taggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactg 2064564  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2064563 ttactacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctt 2064464  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgact 465  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2064463 atgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgact 2064429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Original strand, 20305999 - 20306240
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  20305999 ataggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttcccacc 20306098  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20306099 gttattacatttagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 20306198  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20306199 tatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 20306240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 49140580 - 49140355
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140580 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaa-ttgatttatttcggtcctataagtttctcactgttactacatttagt 49140482  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||     
T  49140481 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttatattccttgttaagg 49140382  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  49140381 tattatgattaaatagtgactgatatt 49140355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1763125 - 1762886
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1763125 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgt 1763026  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1763025 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 1762926  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  1762925 tgccttgttaaagtgttctgattaaatagtgactgatatt 1762886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 3089341 - 3089580
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3089341 aggctaaattaccttttgggtcctctaactatttaattggcatcggattggtactctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 3089440  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3089441 tattacatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctataactttatttattagtatcattttggtcata 3089540  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3089541 tgtcttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 3089580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8762850 - 8762611
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  8762850 aggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgg 8762751  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8762750 tactacatttagtcctttctgttagctttattcaaataaacgttaagagttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 8762651  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  8762650 tgtcttgttaaggtattatgaataaatagtaactgatatt 8762611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 25995789 - 25996022
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25995789 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgttactac 25995888  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  25995889 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttgagatttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgcctt 25995988  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  25995989 gttaaggtaatatgattaaatagtggctgatatt 25996022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 234 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27548119 - 27547883
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27548119 ggctaaattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27548020  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27548019 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatggtatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtactat 27547920  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgata 469  Q
       | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27547919 gctttgttaaagtattatgattaaatagtgactgata 27547883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6798245 - 6798019
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6798245 tttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttactacatttagt 6798146  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||     
T  6798145 cctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagg 6798046  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6798045 tattatgattaaatagtgactaatatt 6798019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 235 - 471
Target Start/End: Original strand, 38127710 - 38127947
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38127710 gcttaattacctttttggttctctaactatttaattggtttcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgtta 38127809  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctata 433  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38127810 ctatatttagtccttgctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatg 38127909  T
Q  434 tctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38127910 ccttattaaggtattatgattaaatagtgaatgatatt 38127947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 37576181 - 37576419
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  37576181 ggctaaattacctttttggtcctttaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttatcaaagtt 37576280  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37576281 actaaatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttataagtatcattttggtcctat 37576380  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37576381 tccttgttaaggtattaggattaaatagtgaccgatatt 37576419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37285177 - 37284940
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||    
T  37285177 ggctaaattacatttttggtcctttaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgattctctaaatttctcacaatt 37285078  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37285077 actacatttagtcc-ttatgttagttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 37284979  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37284978 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 37284940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 9006642 - 9006403
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||      
T  9006642 taggctaaattatctttttggtcttctaactatttaatcgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttggatcctccaagtttctcacc- 9006544  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9006543 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 9006444  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9006443 atgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatatt 9006403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 49644122 - 49643883
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   |      
T  49644122 taggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaattaaaaattgatttaattcggtcctctaagtttccatcca 49644023  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49644022 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg-tttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttgatcct 49643924  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  49643923 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgagtgatatt 49643883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12127501 - 12127265
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggt---cctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12127501 aattacattttttatcctctaactatttaattggtatcggattagttctcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgttac 12127402  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatat 434  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  12127401 tacatttagtcatttctgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattc 12127302  T
Q  435 ctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12127301 cttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatatt 12127265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 239 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45843562 - 45843368
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45843562 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 45843463  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45843462 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctagctttttttattagtatcattttggtcctat 45843368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 239 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4330282 - 4330050
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4330282 aattaccttttttgtcctctaattatttaattggtatcggattaaccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgttactac 4330183  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||     
T  4330182 atttagtcctttctcttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcattttaatcatattcctt 4330083  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatat 470  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  4330082 gttaaggtattatggttaaatagtggctgatat 4330050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37586131 - 37585905
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37586131 ttttttgtcatctaactacttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttttcaccgttactacatttagt 37586032  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  37586031 catttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttatattatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaaga 37585932  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  37585931 tattatgattaaatagtgactgatatt 37585905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52873527 - 52873325
Alignment:
Q  20 gtgataatgtagctttagttgtgtagtcgcagttaccacgaacacaaacagcaactgatccagataactgcagtgcgaaagaaagnnnnnnnnnngttta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||           | |||    
T  52873527 gtgataatgtagctttagttgtgtagtcgcagttaccacgaacacaaacagcaactgatccagataactgcagtgcaaaaaaaa-------aaggggtta 52873435  T
Q  120 aatatgttcttagtccttaaaattattttaacattttgttttagttccactaaagaatttctttggcttttagtccctcttaagttttccatcaccaatt 219  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873434 aatatgttcttagtccctaaaactattttaatattttgttttagttccactaaaaaatttctttggcttttagtccctcttaagttttccatcaccaatt 52873335  T
Q  220 ttgattagaa 229  Q
    ||| ||||||    
T  52873334 ttggttagaa 52873325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 280 - 471
Target Start/End: Original strand, 31703660 - 31703852
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31703660 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggg 31703759  T
Q  379 ttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31703760 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 31703852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 49643674 - 49643833
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49643674 ttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 49643773  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  49643774 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 49643833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 235 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 44323109 - 44322948
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44323109 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 44323010  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44323009 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 44322948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16024348 - 16024185
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16024348 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 16024249  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  16024248 tactacatttagtcctttctggtagttttattcaaataaacgttagggtttatgttatgtgggt 16024185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 1762674 - 1762836
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1762674 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 1762773  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  1762774 acaacatttaatcatttatgttagttttattcaaataaacattagggtttgtattatgtgggt 1762836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 395
Target Start/End: Original strand, 12481060 - 12481221
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12481060 gcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtta 12481159  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  12481160 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 12481221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39486643 - 39486444
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | || ||    
T  39486643 aggcataattacttttttaatcatctaactatttaattggtattgaattgttcctctaactaaaaattgatttatttccgttttctaagttttttaccgt 39486544  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486543 tactacatttagtcctttcagttagttttattcaaaaaacgttagggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 39486444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 23476341 - 23476503
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  23476341 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgtt 23476440  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  23476441 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatctgtgttatgtgggt 23476503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37576631 - 37576469
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37576631 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgtt 37576532  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  37576531 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 37576469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37304473 - 37304316
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37304473 aattatttttttggccctctaactatttaattggtatcggattgatcctataactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 37304374  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37304373 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 37304316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 392
Target Start/End: Original strand, 12127056 - 12127216
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12127056 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 12127155  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  12127156 ttctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 12127216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 27547669 - 27547831
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27547669 ggcttaattacctttttggtcttttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27547768  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  27547769 aatacatttagtcctttctgttggttttattcaaataaacgttagggtttgtgtcatgtgggt 27547831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 392
Target Start/End: Original strand, 35612085 - 35612241
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35612085 ttaattacctttttggtcctctaagtatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcactgttact 35612184  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35612185 acatttagtcctttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35612241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 4696881 - 4697044
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4696881 aggctaaattatctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctataactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgt 4696980  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  4696981 tactacatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 4697044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 293 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27400815 - 27400636
Alignment:
Q  293 taaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27400815 taaaaattgatttattttgttcctctaaatttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 27400716  T
Q  392 gggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27400715 gggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcttatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatatt 27400636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 49140142 - 49140305
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49140142 aggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 49140241  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  49140242 tactacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 49140305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31704063 - 31703901
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  31704063 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggacctataagtttctcactgtt 31703964  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  31703963 actacatttagtcctttctgttaattttattcaaataaacgttaggctttatgttatatgggt 31703901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 237 - 389
Target Start/End: Original strand, 38000492 - 38000645
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38000492 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttact 38000591  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttat 389  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  38000592 acatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 38000645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 8760270 - 8760434
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  8760270 taggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgaccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttttcagtg 8760369  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  8760370 ttactacatttagtcatttatgttagctttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 8760434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 26707194 - 26707358
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26707194 taggcttaaatacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagatcggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctccccg 26707293  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26707294 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttggagtttgtgttatgtgggt 26707358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 9006194 - 9006353
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |    
T  9006194 ttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttatcaccgttagt 9006293  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9006294 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 9006353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20306453 - 20306290
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20306453 aggcttaattacctctttggtcctctaactagttaattggtatcagattgatcctccaactaaagattgatttattttggtcctttaagtttctcactgt 20306354  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20306353 tactacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 20306290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Original strand, 37284739 - 37284886
Alignment:
Q  245 ttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37284739 ttttttggtcctctaactatttaattgatatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgttactacatttag 37284838  T
Q  345 tcctttttgttagttttattcaaataa-agttaggttttgtgttatgt 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37284839 tcttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgt 37284886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26723254 - 26723092
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26723254 ataggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacc 26723155  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  26723154 gttattacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtg 26723092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Original strand, 6797809 - 6797969
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6797809 cttaattacttttttggttctctaactatttaattgatatcagattgatcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 6797908  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  6797909 tccatttagtcatttctgttagttttgttcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 6797969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 232 - 363
Target Start/End: Original strand, 23598070 - 23598201
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  23598070 taggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaaatttctcaccg 23598169  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttat 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23598170 ttactacatttagtcatttttgttagttttat 23598201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 391
Target Start/End: Original strand, 37585696 - 37585851
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |    
T  37585696 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttatt 37585795  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgt 391  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  37585796 atatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgt 37585851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 232 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46593682 - 46593569
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46593682 taggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct-taagtttctcactg 46593584  T
Q  332 ttactacatttagtc 346  Q
    |||||| ||||||||    
T  46593583 ttactatatttagtc 46593569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 232 - 372
Target Start/End: Original strand, 45052688 - 45052828
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45052688 taggcttaattatctttttgatcttcaaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcactg 45052787  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  45052788 ttactacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaa 45052828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Original strand, 39486214 - 39486364
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  39486214 tttttggttctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcgtttaagtttctcacatttactgcatttggt 39486313  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39486314 cttttctgttagttctattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 39486364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 356
Target Start/End: Original strand, 10831130 - 10831253
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||    
T  10831130 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttccttaagtttttcaccgt 10831229  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgtta 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  10831230 tactacatttagtccttttcgtta 10831253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5537242 - 5537142
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5537242 tttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagattctcactgttactacatttagt 5537143  T
Q  346 c 346  Q
    |    
T  5537142 c 5537142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34967174 - 34967060
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  34967174 taggctaaattacatttttgattctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccattaagtttctcaccg 34967075  T
Q  332 ttactacatttagtc 346  Q
    |||||| ||||||||    
T  34967074 ttactatatttagtc 34967060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37467670 - 37467548
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  37467670 ggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttaggtcccttaagtttctcactgtt 37467571  T
Q  334 actacatttagtcctttttgtta 356  Q
    ||||||||  |||||||| ||||    
T  37467570 actacattcggtccttttcgtta 37467548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 356
Target Start/End: Original strand, 34966308 - 34966425
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |    
T  34966308 aattacctttttggacctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaacttgatttatttcagtcccttaagtttctcactgttactgc 34966407  T
Q  339 atttagtcctttttgtta 356  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  34966408 atttagtcttttatgtta 34966425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10832031 - 10831935
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  10832031 aattacttttttggtcctctaactatttaactggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttac 10831935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 5536397 - 5536514
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||  ||    
T  5536397 aggctaaattacatttttggccctctaactatttaattggtatcggattggtcctctacctaaaatttgatttatttgggtctcttaagtttctcatcgt 5536496  T
Q  333 tactacatttagtccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5536497 tactacatttagtccttt 5536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Original strand, 32047740 - 32047829
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32047740 ataggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaa 32047829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28884871 - 28884751
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  28884871 cttaattgcttttttggtcctctaactatttaattggttacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttagtcctctaactttatcactgttac 28884772  T
Q  336 tacatttagtcctttttgtta 356  Q
     | |||| ||||||| |||||    
T  28884771 catatttcgtcctttctgtta 28884751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 239 - 346
Target Start/End: Original strand, 46592817 - 46592924
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  46592817 aattacctttttggccctctaactatttaattgatatcagattgatcctctaactaaaaaatgatttatttcgatcccttaagtttctcactgttactgc 46592916  T
Q  339 atttagtc 346  Q
    ||||||||    
T  46592917 atttagtc 46592924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13109277 - 13109191
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13109277 ggctaaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatccgattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13109191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 388 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26707491 - 26707408
Alignment:
Q  388 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26707491 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 26707408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 335
Target Start/End: Original strand, 28884015 - 28884118
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  28884015 taggtttaattacctttttggtcctctaattatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatcactg 28884114  T
Q  332 ttac 335  Q
    ||||    
T  28884115 ttac 28884118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 4697172 - 4697094
Alignment:
Q  393 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4697172 ggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 4697094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 389 - 471
Target Start/End: Original strand, 44322816 - 44322898
Alignment:
Q  389 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44322816 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaattgtgactgatatt 44322898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32048635 - 32048510
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||     
T  32048635 atagacttaattacttttttggtcctctaactatttatttgataacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttatttttgtcctctaactttatcaca 32048536  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgtta 356  Q
    ||||| | ||||  |||||| |||||    
T  32048535 gttaccatatttcatcctttctgtta 32048510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 320
Target Start/End: Original strand, 13183766 - 13183852
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183766 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtattgaattagtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13183852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4697222 - 4697163
Alignment:
Q  261 ctatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697222 ctatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 4697163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 346
Target Start/End: Original strand, 49837417 - 49837483
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49837417 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactacatttagtc 49837483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 307
Target Start/End: Original strand, 46289327 - 46289397
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttat 307  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46289327 ttaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttat 46289397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 356
Target Start/End: Original strand, 37466801 - 37466922
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| |||||  | ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||| |||    
T  37466801 aggctaaattacattttttattctctaatcatttaattggtatcggattactgctctaactaaaaattgatttatttccgtc--ccaagtttttcattgt 37466898  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgtta 356  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    
T  37466899 tactacatttagtcttttctgtta 37466922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49838835 - 49838756
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtc 314  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49838835 ggctaaattacctttttgg-cctttaattatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtc 49838756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25996130 - 25996072
Alignment:
Q  338 catttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25996130 catttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 25996072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 52179419 - 52179365
Alignment:
Q  244 cttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  52179419 cttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 52179365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 39851174 - 39851238
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  39851174 ggcttaaatgctcttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 39851238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6328391 - 6328324
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  6328391 ataggcttaattgctcttttggtcccttaagtatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 6328324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44114579 - 44114512
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  44114579 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 44114512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 281
Target Start/End: Original strand, 45843320 - 45843366
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggatt 281  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45843320 ggcttaattacctttt-gatcctctaactatttaattggtatcggatt 45843366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Original strand, 49548119 - 49548186
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  49548119 ataggtttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 49548186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3798770 - 3798704
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  3798770 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 3798704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 6327938 - 6328004
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaa 297  Q
    |||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  6327938 ataggcttaattgctctttaggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 6328004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7334988 - 7334922
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  7334988 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 7334922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 31488023 - 31488089
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  31488023 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 31488089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33784677 - 33784615
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  33784677 cttaaatactcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 33784615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37483603 - 37483537
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  37483603 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 37483537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38980114 - 38980048
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  38980114 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 38980048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 3798323 - 3798388
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  3798323 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 3798388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 6714201 - 6714266
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  6714201 aggcttaaatgctcttttggtccgttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 6714266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14244619 - 14244554
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  14244619 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 14244554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 24370114 - 24370179
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  24370114 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 24370179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 37483053 - 37483118
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  37483053 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 37483118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 45678711 - 45678776
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  45678711 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 45678776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 46289441 - 46289404
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatc 276  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  46289441 aattacttttttgatcctttaactatttaattggtatc 46289404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50227973 - 50227908
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  50227973 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 50227908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Original strand, 7334455 - 7334507
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  7334455 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 7334507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 42616695 - 42616759
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  42616695 ggcttaaatgctcttttggtcctttaagtatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 42616759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 327
Target Start/End: Original strand, 43727278 - 43727366
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 327  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  43727278 aattacctttttagtcccttaactatttaattggtttcggtttgatcccttaactaaattttgatttattttgatcctttaactttctc 43727366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 50138495 - 50138559
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  50138495 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 50138559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 103)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 53995388 - 53995146
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53995388 ataggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgcattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 53995289  T
Q  331 gttactacatttagtcctttt--tgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 428  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53995288 gttactacatttagtcctttttatgttagttttattcaaataacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtc 53995189  T
Q  429 ctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53995188 ctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 53995146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 8591968 - 8592207
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8591968 aggctaaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 8592067  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8592068 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtccta 8592167  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8592168 ttccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 8592207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 624132 - 623891
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  624132 ataggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatt 624033  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  624032 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagcatcattttggtct 623933  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  623932 tattccttgttaagatattatgattaaatagtgacagatatt 623891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 44991731 - 44991490
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991731 ataggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactgaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 44991632  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44991631 gttattacatttagtcttttttgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtct 44991532  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44991531 tatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 44991490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 6711961 - 6712201
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6711961 taggctaaattatatttttggccctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 6712060  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6712061 ttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 6712160  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6712161 gtgccttattaagatattatgattaaatagtgactgatatt 6712201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 14985330 - 14985569
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14985330 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccat 14985429  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14985430 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 14985529  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14985530 tgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 14985569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 53751352 - 53751114
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53751352 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 53751253  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  53751252 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtataattttggtcttat 53751153  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  53751152 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatatt 53751114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21763634 - 21763393
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763634 ataggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 21763535  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  21763534 gttactacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgtttt 21763435  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21763434 tatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 21763393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16038246 - 16038006
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16038246 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 16038147  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16038146 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcct 16038047  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16038046 attccttgttaaggtattatgattaagtagtgacggatatt 16038006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 42855791 - 42855551
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42855791 taggctaaattacctttttagtcatttaactatttaattagtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 42855692  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855691 ttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 42855592  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  42855591 attcctcgttaaggtattatgattaaataatgactgatatt 42855551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 44957387 - 44957627
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957387 taggctaaattatatttttggtcctctaactattttattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 44957486  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44957487 ttactgcatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 44957586  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44957587 atgccttgataatgtattatgattaaatagtgactgatatt 44957627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19088792 - 19088553
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088792 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 19088693  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  19088692 tactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatctta 19088593  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19088592 ttccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 19088553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 245 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 43734725 - 43734498
Alignment:
Q  245 ttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  43734725 ttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgttattacatttag 43734626  T
Q  345 tcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaag 443  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||     
T  43734625 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttaagatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaa 43734526  T
Q  444 atattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734525 atattatgattaaatagtgactgatatt 43734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 30683966 - 30683740
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  30683966 tttttggtcctctaaatatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcgcaccgttattacatttagt 30683867  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||     
T  30683866 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagg 30683767  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30683766 tattatgattaaatagtgacttatatt 30683740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1433724 - 1433483
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1433724 ataggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaattttctcact 1433625  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1433624 gttactacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtct 1433525  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1433524 tatgccttgttatggtattatgattaaatagtgactgatatt 1433483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 234 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 39448938 - 39448707
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39448938 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 39448839  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  39448838 actacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttat 39448739  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgac 464  Q
      || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39448738 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 39448707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Original strand, 50768820 - 50769059
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50768820 aggcttaattacctttttgatcctttaactatttaattggtatcgaattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 50768919  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50768920 tactacatttagtactttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtctta 50769019  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50769020 tgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 50769059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 46850107 - 46849881
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  46850107 tttttggtcatctaactattaaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 46850008  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  46850007 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaga 46849908  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46849907 tattatgattaaatagtgaccgatatt 46849881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 24898194 - 24898427
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24898194 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 24898293  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||     
T  24898294 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgcgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcacatgtctt 24898393  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24898394 gttaatgtattatgattaaatagtgactaatatt 24898427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 234 - 464
Target Start/End: Original strand, 38339492 - 38339723
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38339492 ggctgaattacctttttggtcctctaactatttaactggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcctctaagtttctcaccgtt 38339591  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38339592 gctacatttagtcctttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 38339691  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgac 464  Q
      || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38339692 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 38339723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15478095 - 15477857
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15478095 ggctaaattacctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattaatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15477996  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15477995 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttacgtgggtcctctaactttgtttattagtatcattttggtcatat 15477896  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15477895 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactcatatt 15477857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23756245 - 23756012
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  23756245 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactat 23756146  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |     
T  23756145 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgcgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtttt 23756046  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23756045 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 23756012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 33091898 - 33091665
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33091898 aattacatttttagtcctctaactatttaattagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcatctaagtttctcaccgttactac 33091799  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  33091798 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgcttt 33091699  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33091698 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 33091665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41752253 - 41752028
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41752253 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattcatttattttggtcctctaagtttctcactgttactacatgtagtc 41752154  T
Q  347 ctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagat 445  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||  || | |||| |    
T  41752153 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattaatatcattttgatcatatgccttgctaaggt 41752054  T
Q  446 attatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41752053 attatgattaaatagtgactgatatt 41752028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 12817804 - 12818044
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12817804 taggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcactg 12817903  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12817904 ttactacatttagccctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctgtaactttatttatcagtatcattttggtcat 12818003  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12818004 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 12818044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 52557525 - 52557299
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52557525 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttactacatttagt 52557426  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||     
T  52557425 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaagg 52557326  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52557325 tattatgattaaatagtaactgatatt 52557299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 25182263 - 25182024
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25182263 aggctaaattatctttttggtcttctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 25182164  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25182163 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtttgagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtccta 25182064  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25182063 ttccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatatt 25182024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 225 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41878317 - 41878071
Alignment:
Q  225 tagaacataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 324  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41878317 tagaatataggctaaattacttttttggtcctctaactatataattggaatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattgcggtcctctaagttt 41878218  T
Q  325 ctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattt 423  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41878217 ctcactgttactaca-ttagtcctttctgctagttttattcaaataaatgttagggtttatgttatgtgggtcctccaactttatttattagtatcattt 41878119  T
Q  424 tggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||| |||   | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41878118 tggtcatattatttgttaaggtattatgattaaatattgactgatatt 41878071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 53259576 - 53259350
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53259576 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 53259477  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaata-aagttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||     
T  53259476 catttctgttagttttattcaaatacacgttagagtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaagg 53259377  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  53259376 tattatgattaaacaatgagtgatatt 53259350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 36122885 - 36122645
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36122885 ataggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattga-ttatttcggtcctctaagtttctcact 36122787  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36122786 gttattacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatataggtcctctaactatatttattagtatcattttggtca 36122687  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  36122686 tatgccttgttaaggtattatgactaaatagtgattgatatt 36122645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 6505536 - 6505698
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6505536 aggcttaattacatttttgatcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 6505635  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6505636 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaagttagggtttgtgttatgtgggt 6505698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37206877 - 37206639
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||    
T  37206877 ggctaaattaccttttttgttctctaactatttaattgatatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttttcatcgtt 37206778  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37206777 actacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 37206678  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
       | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37206677 tctttgttaaggtattatgattaaatagtggctgatatt 37206639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 270 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 43566792 - 43566590
Alignment:
Q  270 tggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  43566792 tggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcttttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttatttaaat 43566693  T
Q  370 aaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgat 468  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43566692 aaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctcaaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgat 43566593  T
Q  469 att 471  Q
    |||    
T  43566592 att 43566590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 266 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19508831 - 19508625
Alignment:
Q  266 taattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattc 365  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19508831 taattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctccaagtttctcacccttactacatttagtcctttctgttagttttattc 19508732  T
Q  366 aaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgac 464  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19508731 aaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatgattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaacagtgac 19508632  T
Q  465 tgatatt 471  Q
    |||||||    
T  19508631 tgatatt 19508625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 50508910 - 50508669
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  50508910 ataggctaaattatctttttggttttctaattatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcacc 50508811  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  50508810 gttactgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtca 50508711  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50508710 tatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatatt 50508669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 44991279 - 44991441
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44991279 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44991378  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44991379 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 44991441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Original strand, 42855333 - 42855501
Alignment:
Q  228 aacataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 327  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855333 aacataggcgtaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggagtggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 42855432  T
Q  328 actgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42855433 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaaggttagggtttgtgttatgtgggt 42855501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25269451 - 25269312
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25269451 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 25269352  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25269351 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 25269312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 43734289 - 43734448
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734289 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 43734388  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43734389 acatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 43734448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24898642 - 24898477
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  24898642 ataggcttaattactttttttgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcacc 24898543  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24898542 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24898477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 391
Target Start/End: Original strand, 53750903 - 53751060
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750903 gcttaattacctttttagtcctctaactattaaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 53751002  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgt 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  53751003 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 53751060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12818257 - 12818093
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12818257 aggcttacttatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtgctctaactaaaacttgatttatttcggtcctctaagtttctcattgt 12818158  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12818157 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtc 12818093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 16037792 - 16037956
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16037792 taggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactg 16037891  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  16037892 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 16037956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 234 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 38339942 - 38339782
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38339942 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcacactgtt 38339843  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38339842 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 38339782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14985782 - 14985619
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14985782 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcactgt 14985683  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14985682 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 14985619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 46849668 - 46849831
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46849668 aggcttaattacctttttcgtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgt 46849767  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46849768 tactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 46849831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8592419 - 8592257
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8592419 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 8592320  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  8592319 actacatttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 8592257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Original strand, 52557089 - 52557249
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52557089 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttcttactgttac 52557188  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  52557189 tacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 52557249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 15477644 - 15477807
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15477644 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaacattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgt 15477743  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  15477744 tactacatttagtccattctgttagttttattaaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 15477807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 8398031 - 8398193
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  8398031 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaactttctcattgtt 8398130  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8398131 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 8398193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Original strand, 39448485 - 39448650
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  39448485 atagacttaattatctgtttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcacc 39448584  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataa-agttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  39448585 gttactacatttagtcctttttgttagttttatttaaataagcgttagagtttgtgttatgtgggt 39448650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 50769269 - 50769112
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50769269 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttac 50769170  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  50769169 tacatttagtcatttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtg 50769112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 239 - 393
Target Start/End: Original strand, 20888148 - 20888303
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20888148 aattaccttttaggtactctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactgc 20888247  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaat-aaagttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  20888248 atttagtcatttctgttagttttattcaaatgaatgttagggtttgtgttatgtgg 20888303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 25181811 - 25181974
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25181811 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagtttgtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgt 25181910  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  25181911 tattacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatatgggt 25181974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 393
Target Start/End: Original strand, 43566380 - 43566538
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43566380 cttaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 43566479  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43566480 tacaattagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 43566538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 53994934 - 53995096
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  53994934 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 53995033  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  53995034 actacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 53995096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Original strand, 36122435 - 36122595
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  36122435 cttaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttttgtcatctaagtttttcactgttac 36122534  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  36122535 tacatttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36122595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 232 - 391
Target Start/End: Original strand, 41877858 - 41878017
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41877858 taggcttagttacctttttggtcatctaattatttagttggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-ttctcactg 41877956  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41877957 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgt 41878017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6712412 - 6712251
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6712412 aggcttaattacctttttggtc-tctaactatttaattggtaatggattgatcctctaactacaaattgatttatttcggtcctctaaattt-tcactgt 6712315  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6712314 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 6712251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 19088344 - 19088503
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||    
T  19088344 ttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggaatgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttaataccgttact 19088443  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19088444 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19088503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 19508413 - 19508575
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  19508413 ggcttaattacttttt-gatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaacaattgatttatgtcggccctctaagtttctcactgtg 19508511  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gtta-ggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  19508512 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggggtttgtgttatgtgggt 19508575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 41751817 - 41751978
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  41751817 aggcttaattacctttttg-tcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggt-ctttaagtttctcactgt 41751914  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41751915 tactacatttagtctttactgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 41751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 392
Target Start/End: Original strand, 1433272 - 1433430
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  1433272 gcttaattatctttttggtcctctaactatttcattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggttctctaagtttctcatcgtta 1433371  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1433372 ttacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 1433430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44125923 - 44125782
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44125923 ataggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtgtcggattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcact 44125824  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44125823 gttattacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaa 44125782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 392
Target Start/End: Original strand, 30683527 - 30683686
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30683527 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 30683626  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttag-ttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30683627 ctacatttagtcatttctgttagtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 30683686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 372
Target Start/End: Original strand, 55022283 - 55022421
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55022283 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgt 55022382  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  55022383 tactacattta-tcctttctgttagttttattaaaataaa 55022421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 372
Target Start/End: Original strand, 623679 - 623817
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||    
T  623679 ggcttaattatatttttggtcctttaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgttttattttggtcctataagtttcttaccgtt 623778  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  623779 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 623817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 33091453 - 33091615
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||    
T  33091453 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatcagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccatt 33091552  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  33091553 actgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 33091615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44957807 - 44957669
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  44957807 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcaaattggtcctttaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacattt 44957708  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44957707 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaa 44957669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 21763180 - 21763343
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||    
T  21763180 ggcttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctccaggtttttcaccgtt 21763279  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttag-ttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  21763280 actacatttagtcatttctgtttgtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 21763343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 234 - 372
Target Start/End: Original strand, 23755418 - 23755556
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||    
T  23755418 ggcttaattaacttattcgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttcttatcgtt 23755517  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23755518 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaa 23755556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 232 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4513368 - 4513252
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4513368 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 4513269  T
Q  332 ttactacatttagtcct 348  Q
    |||||||||||||||||    
T  4513268 ttactacatttagtcct 4513252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 234 - 393
Target Start/End: Original strand, 37206428 - 37206587
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37206428 ggcttaattacctttt-gatcctctaactattcagttgatatcagattaatcctctagttaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgtt 37206526  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37206527 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 37206587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 350
Target Start/End: Original strand, 47602940 - 47603059
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  47602940 ataggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcact 47603039  T
Q  331 gttactacatttagtccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47603040 gttactacatttagtccttt 47603059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 395
Target Start/End: Original strand, 53259184 - 53259300
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagg 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53259184 ttggtcctctaactaaaaattaattaatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagg 53259283  T
Q  379 ttttgtgttatgtgggt 395  Q
     ||||||||||||||||    
T  53259284 gtttgtgttatgtgggt 53259300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 49136084 - 49135928
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  49136084 ttaattactttttttatcgtctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 49135985  T
Q  337 acatttag----tcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgtta 388  Q
    ||||||||    | |||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  49135984 acatttagttatttctttatgtcaattttattcaaataaacgttaggatttgtgtta 49135928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 289 - 391
Target Start/End: Original strand, 50508512 - 50508615
Alignment:
Q  289 taactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgtt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50508512 taactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 50508611  T
Q  388 atgt 391  Q
    ||||    
T  50508612 atgt 50508615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 367
Target Start/End: Original strand, 44125624 - 44125755
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  44125624 cttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtattaaattggttctctaactaaaaattgatttttttcggttttctaagtttctcaccgttac 44125723  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaa 367  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  44125724 tacatttaatcatttctgttagttttattcaa 44125755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 232 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47603813 - 47603710
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  47603813 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctcaccg 47603714  T
Q  332 ttac 335  Q
    ||||    
T  47603713 ttac 47603710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 52692889 - 52692778
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||    
T  52692889 ggctaaattacctttttggtcctttagctatttaattgctatcg-attggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 52692791  T
Q  334 actacatttagtc 346  Q
    |||||||||||||    
T  52692790 actacatttagtc 52692778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 329
Target Start/End: Original strand, 52692036 - 52692119
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52692036 tttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcac 52692119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 322
Target Start/End: Original strand, 31214161 - 31214250
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 322  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31214161 aggctaaattacatttttgatcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctcaaagt 31214250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 397 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6505822 - 6505748
Alignment:
Q  397 ctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6505822 ctctaattttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 6505748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 55022497 - 55022424
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55022497 tttttgtcctctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctctaa 55022424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23755708 - 23755630
Alignment:
Q  393 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23755708 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatatt 23755630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 298
Target Start/End: Original strand, 20614128 - 20614179
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20614128 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 20614179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20614677 - 20614610
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  20614677 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 20614610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 43734972 - 43734941
Alignment:
Q  245 ttttttggtcctctaactatttaattggtatc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734972 ttttttggtcctctaactatttaattggtatc 43734941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 298
Target Start/End: Original strand, 56270557 - 56270608
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  56270557 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 56270608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42369569 - 42369503
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  42369569 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 42369503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48092031 - 48091969
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  48092031 cttaaatactattttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 48091969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 263
Target Start/End: Original strand, 53259168 - 53259198
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaacta 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53259168 aggcttaattacttttttggtcctctaacta 53259198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 56271276 - 56271210
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  56271276 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 56271210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 1098052 - 1098117
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  1098052 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 1098117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17475942 - 17475877
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  17475942 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 17475877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 25618435 - 25618500
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  25618435 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 25618500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 41610126 - 41610191
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  41610126 aggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 41610191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 3503470 - 3503534
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  3503470 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaatcggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 3503534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 286
Target Start/End: Original strand, 5904505 - 5904557
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcc 286  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5904505 ggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcc 5904557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 17475397 - 17475461
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  17475397 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 17475461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 31487978 - 31488042
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  31487978 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 31488042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34238005 - 34237941
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  34238005 ggcttaaatgctattttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 34237941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Original strand, 46579789 - 46579841
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  46579789 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactgaaaa 46579841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 38332704 - 38332942
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38332704 ggctaaattacatttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38332803  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332804 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 38332903  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332904 gccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 38332942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Original strand, 13192985 - 13193226
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13192985 ataggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 13193084  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13193085 gttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 13193184  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13193185 tatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactcatatt 13193226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 15744462 - 15744695
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15744462 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaactgttactac 15744561  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||     
T  15744562 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattcctt 15744661  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15744662 gttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 15744695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 234 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34735793 - 34735556
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34735793 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgtt 34735694  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34735693 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 34735594  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatat 470  Q
      || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34735593 tccttgttaaggtattaggattaaatagtgactgatat 34735556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26182150 - 26181912
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26182150 ggctaaattacatttttggtcctttaattatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggccctctaagtttctcactgtt 26182051  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26182050 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 26181951  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26181950 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 26181912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 16305023 - 16305263
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggatt-ggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16305023 taggctaaattacatttttg-tcctctaactatttaattggtatcggatttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaca 16305121  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16305122 attactacatttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtct 16305221  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16305222 tatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgattgatatt 16305263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 7496432 - 7496192
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7496432 ataggcttaattacatttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcacc 7496333  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7496332 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagcatcattttggtcc 7496233  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||  || ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7496232 tattccttgttaaga-attatgagtaaatagtgaccgatatt 7496192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 29472242 - 29472480
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29472242 ggctcaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 29472341  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29472342 cctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 29472441  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29472442 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 29472480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 7469171 - 7469404
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7469171 aattacctttttggccctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 7469270  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  7469271 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcctattcctt 7469370  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  7469371 gttaaggtattatgattaaatagttagtgatatt 7469404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24372419 - 24372179
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24372419 taggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccg 24372320  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24372319 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 24372220  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  ||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24372219 attcctttttaaagtattatgattaaattgtgactgatatt 24372179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19847769 - 19847531
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19847769 aggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttctcaccgt 19847670  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19847669 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcata 19847570  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19847569 ttccttgttaaga-attatgattaaatagtgaccgatatt 19847531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24138957 - 24138718
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24138957 ggcttaattacctttttggtattctaactatttaattggtatcaaattagtactttaattaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 24138858  T
Q  334 actacatttagtcctttt-tgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24138857 actacatttagtctttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 24138758  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24138757 tgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 24138718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15406205 - 15405968
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15406205 ggctaaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgtt 15406107  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15406106 actacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttggtcatat 15406007  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15406006 gtcttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatatt 15405968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Original strand, 10991850 - 10992082
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  10991850 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttttcaccgt 10991949  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10991950 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttacagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtccta 10992049  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgac 464  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10992050 tgtcttgctaagatattatgattaaatagtgac 10992082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8174337 - 8174097
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  8174337 taggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctttaaatttctcaccg 8174238  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  8174237 tttctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgttttt 8174138  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8174137 attccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 8174097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 237 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2148333 - 2148098
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||    
T  2148333 ttaaatacattttttgtcatttaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcatcgttact 2148234  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatc 435  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2148233 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 2148134  T
Q  436 tcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2148133 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 2148098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 233 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19816155 - 19815916
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  19816155 aggctaaattacctttttggtcctcaaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcagaccat 19816056  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  19816055 tactacatttagtcctttctgctagttttattcaaataaacgttagagtctgtgttatgtgggtcctctgactttatttattagtatcattttgctcata 19815956  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19815955 ttccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 19815916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 239 - 469
Target Start/End: Original strand, 41474087 - 41474318
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41474087 aattacatttttggtcttctaactatttaattggtatcggatcggtcctgtaattaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 41474186  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  41474187 atttagtcttttatgttagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcctatgcctt 41474286  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgata 469  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41474287 gttaaggtattataattaaatagtgactgata 41474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 232 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33470375 - 33470195
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33470375 taggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 33470276  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttattta 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33470275 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttattta 33470195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Original strand, 36713588 - 36713823
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  36713588 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttatgtcctctaaatttctcagtgtt 36713687  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  36713688 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattag--tcattttggttctat 36713785  T
Q  433 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
      || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36713786 gccttgttaaggtattatgatt-aatagtgactgatatt 36713823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 280 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 12860771 - 12860586
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12860771 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttacg 12860672  T
Q  379 ttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgac 464  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12860671 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 12860586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Original strand, 15405753 - 15405918
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15405753 ataggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcacc 15405852  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  15405853 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 15405918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 7495978 - 7496142
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7495978 taggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 7496077  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  7496078 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 7496142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 395
Target Start/End: Original strand, 12860381 - 12860542
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12860381 gcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtta 12860480  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  12860481 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 12860542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 232 - 392
Target Start/End: Original strand, 24138066 - 24138227
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24138066 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccg 24138165  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24138166 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 24138227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 24371966 - 24372129
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24371966 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 24372065  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  24372066 tactacatttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggt 24372129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 231 - 395
Target Start/End: Original strand, 8173882 - 8174047
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8173882 ataggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 8173981  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaat-aaagttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  8173982 gttactacatttagtcctttctgttaattttattcaaatgaacgttagggtttgtgttatgtgggt 8174047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 232 - 392
Target Start/End: Original strand, 19815702 - 19815863
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19815702 taggtttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 19815801  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  19815802 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 19815863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 234 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41474532 - 41474373
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41474532 ggcttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctgagtttctcactgtt 41474433  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  41474432 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 41474373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 38333128 - 38332974
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38333128 cttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 38333029  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttat 389  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38333028 tacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 38332974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13193440 - 13193276
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13193440 taggcttaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 13193341  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13193340 ttactacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 13193276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 34735342 - 34735505
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34735342 aggcttaataatctttttggtcctctaactatttagttggtatcgaattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 34735441  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34735442 tactacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 34735505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16305463 - 16305313
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16305463 tttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcaatcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 16305364  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataa-agttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  16305363 cttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgtgggt 16305313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 30898748 - 30898589
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  30898748 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcaccgttact 30898649  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  30898648 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 30898589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 232 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29472694 - 29472533
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  29472694 taggcttaaatacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattgatcctctaacaaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccg 29472595  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29472594 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 29472533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 2147888 - 2148048
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaat-tgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2147888 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaaaatgatttatttcgggcctctaagtttctcaccgttac 2147987  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  2147988 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 2148048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 392
Target Start/End: Original strand, 26181701 - 26181859
Alignment:
Q  235 gcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26181701 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggaattggattggtccactaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 26181800  T
Q  335 ctacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  26181801 ctacatatattcctttctgttagttttattcaaataaaccttaaggtttgtgttatgtg 26181859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17052499 - 17052342
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  17052499 aattacatgtttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccnttactac 17052400  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  17052399 atttagtcatttctgttagtttcattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 17052342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 264 - 393
Target Start/End: Original strand, 42834452 - 42834582
Alignment:
Q  264 tttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42834452 tttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactattactacatttagtcttttctgttagttttat 42834551  T
Q  364 tcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgg 393  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42834552 tcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 42834582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 234 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15744897 - 15744780
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15744897 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 15744798  T
Q  334 actacatttagtcctttt 351  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15744797 actacatttagtcgtttt 15744780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Original strand, 17032591 - 17032703
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17032591 taggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccg 17032690  T
Q  332 ttactacatttag 344  Q
    |||||||||||||    
T  17032691 ttactacatttag 17032703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 231 - 363
Target Start/End: Original strand, 8444819 - 8444951
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8444819 ataggtttaattacctttttggtcttctaactatttagttgatatcggattggttatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacc 8444918  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttat 363  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8444919 gttactacatttagtcatttctgttagttttat 8444951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10992255 - 10992139
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagg 378  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  10992255 ttggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaga 10992156  T
Q  379 ttttgtgttatgtgggt 395  Q
     ||||||||||||||||    
T  10992155 gtttgtgttatgtgggt 10992139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Original strand, 17050927 - 17051039
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17050927 taggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccg 17051026  T
Q  332 ttactacatttag 344  Q
    |||||||||||||    
T  17051027 ttactacatttag 17051039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36714023 - 36713873
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  36714023 tttttggttctctaactatttaattggtattgaattggtcctcaaactaaaaattgatttattttcgtcatctaggtttctcaccgttaccacacttagt 36713924  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  36713923 catttctgtttgttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36713873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 246 - 346
Target Start/End: Original strand, 8962372 - 8962472
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8962372 tttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccctcaagtttctcaccgttactacatttagt 8962471  T
Q  346 c 346  Q
    |    
T  8962472 c 8962472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8963267 - 8963166
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||    
T  8963267 ggctaaattacttttttggttctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 8963168  T
Q  334 ac 335  Q
    ||    
T  8963167 ac 8963166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 352 - 471
Target Start/End: Original strand, 17052175 - 17052292
Alignment:
Q  352 tgttagttttattcaaataaa--gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatatta 449  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||| |||||    
T  17052175 tgttagttttattcaaataaaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta----acgttaaggtatta 17052270  T
Q  450 tgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  17052271 tgattaaataatgactgatatt 17052292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8445234 - 8445127
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8445234 aattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattagcactctaattaaaaattgatttacttcggtcctctaagtttatcacagttactac 8445135  T
Q  339 atttagtc 346  Q
    ||||||||    
T  8445134 atttagtc 8445127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7469605 - 7469458
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||            
T  7469605 ttaattacctttttggttctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcagtcgtctaagtttctca-------- 7469514  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgt 391  Q
     | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  7469513 tcgtttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgt 7469458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23992280 - 23992189
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttacta 337  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||    
T  23992280 tttttggtccctgaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctttgttacta 23992189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13479491 - 13479426
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  13479491 aggcttaaatgctcttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 13479426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 15044738 - 15044803
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15044738 aggcttaagtgctattttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaaa 15044803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 33200027 - 33200092
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  33200027 aggcttaaatgctattttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 33200092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38807244 - 38807179
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  38807244 aggcttaaatgctcttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 38807179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33200583 - 33200519
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  33200583 ggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 33200519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2805020 - 2804969
Alignment:
Q  247 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  2805020 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttgatcctttaactaaaaa 2804969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Original strand, 19847276 - 19847361
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 323  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19847276 taggcttaattagttttt-ggtc-tctaactatttagttggta-cggattgg-cctcta-ctaaaaattgatttattttgg-cctctaagtt 19847361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32194890 - 32194823
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  32194890 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 32194823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 2822302 - 2822368
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  2822302 taggcttaaatgtttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 2822368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2822729 - 2822675
Alignment:
Q  244 cttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  2822729 cttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 2822675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4602877 - 4602811
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  4602877 taggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 4602811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14848263 - 14848197
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  14848263 taggcttaaatgcttttttggtcccttaagtatttaattggtatcactttggtcctttaactaaaaa 14848197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16655980 - 16655911
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 315  Q
    ||||||||||  ||||||||||  | ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16655980 tttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaatttgatttattttggtcc 16655911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5382076 - 5382012
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  5382076 ggcttaaatatttttttggtctcttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 5382012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15136922 - 15136870
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  15136922 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 15136870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31557600 - 31557548
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  31557600 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaaa 31557548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 20749 - 20988
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20749 taggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacactg 20848  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20849 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcct 20948  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20949 attccttgttaaga-attatgattaaatagtgaccgatatt 20988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 45754 - 45994
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45754 taggctaaattactattttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacgg 45853  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  45854 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttacttattagtttcattttggtcat 45953  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45954 attccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 45994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 253 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 56567 - 56424
Alignment:
Q  253 tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtccttttt 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  56567 tcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttct 56468  T
Q  353 gttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  56467 gttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgggt 56424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 253 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 63692 - 63549
Alignment:
Q  253 tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtccttttt 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  63692 tcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttct 63593  T
Q  353 gttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  63592 gttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgggt 63549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Original strand, 72761 - 72992
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  72761 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 72860  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  72861 tactacatttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtctta 72960  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgac 464  Q
    |  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  72961 ttccttgttaaga-attatgattaaatagtgac 72992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 73213 - 73049
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  73213 taggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccg 73114  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  73113 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 73049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 234 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 50927 - 50688
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactattt-aattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  50927 ggctaaattacatttttggtcctctaactattttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgt 50828  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 431  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50827 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 50728  T
Q  432 tatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50727 tgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 50688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Original strand, 50478 - 50638
Alignment:
Q  236 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 335  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50478 cttaattatctttttggtcctctacctatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttac 50577  T
Q  336 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  50578 tacatttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 50638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 18285 - 18511
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18285 tttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcttctaagtttctcaccgctactacatttagt 18384  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaga 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||     
T  18385 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaagg 18484  T
Q  445 tattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18485 tattatgattaaatagtgactgatatt 18511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18723 - 18561
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18723 ggcttaattacatttttggtcctttaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcactgtt 18624  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18623 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 18561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 232 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 14587 - 14354
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14587 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctatgtttctcaccg 14488  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14487 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcat 14388  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgac 464  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14387 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 14134 - 14297
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14134 aggcttaattacctgtttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgt 14233  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  14234 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 14297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Original strand, 24159 - 24400
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 330  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24159 ataggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacc 24258  T
Q  331 gttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 429  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24259 gttattacatttagtcatttctgttagtttttttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcc 24358  T
Q  430 tatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    | |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24359 tgttccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatatt 24400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24612 - 24456
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24612 ggcttaattacatttttggtactctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 24513  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttat 389  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24512 actacatttagtcatttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 19713 - 19946
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19713 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 19812  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||     
T  19813 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattcctt 19912  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  19913 gttaaggttttatgattaaatagtgacggatatt 19946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20155 - 19996
Alignment:
Q  237 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  20155 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattattttttgtcctctaagtttctcaccgttact 20056  T
Q  337 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  20055 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 19996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 232 - 471
Target Start/End: Original strand, 8427 - 8666
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8427 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatctt-taactaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcactg 8525  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 430  Q
    |||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8526 ttacaatatttagtattttctgttagttttattcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 8625  T
Q  431 atatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8626 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 8666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 238 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8874 - 8716
Alignment:
Q  238 taattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttacta 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  8874 taattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgttctctaagtttctcaccgttacta 8775  T
Q  338 catttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  8774 catttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggt 8716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 228 - 471
Target Start/End: Original strand, 349068 - 349311
Alignment:
Q  228 aacataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 327  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  349068 aacataggctatattatttttttg-tcctctaactatttaattagtattagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctc 349166  T
Q  328 actgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgg 426  Q
    || |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  349167 accgtttttacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgg 349266  T
Q  427 tcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    || |||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  349267 tcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgactgatatt 349311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 349523 - 349361
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 332  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  349523 aggcttagttacctttttggtcccctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-ttctcacttt 349425  T
Q  333 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  349424 tactacatttagtcctttctgttaattttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 349361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 113816 - 113654
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  113816 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaagtgctatcagattggtcctgtaactaaaaattgatttctttcggtcatctaaatttctcactgtt 113717  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||    
T  113716 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaggttagtgttatgtgggt 113654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 232 - 363
Target Start/End: Original strand, 113391 - 113522
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  113391 taggctaaataacatttttggtcctctaactgtttaattggtatccgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcatcg 113490  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttat 363  Q
    ||| || ||||| ||||||  |||||||||||    
T  113491 ttagtaaatttattcctttccgttagttttat 113522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 386 - 471
Target Start/End: Original strand, 113519 - 113604
Alignment:
Q  386 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  113519 ttatgtggctcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 113604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 239 - 471
Target Start/End: Original strand, 15458 - 15686
Alignment:
Q  239 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 338  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  15458 aattaccttttttatcctctaactattcaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttattttggtcatttaagtttctcactgttactac 15557  T
Q  339 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 437  Q
    |||||||| ||| |||||     ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  15558 atttagtcatttctgtta-----attcaaataaatgtttgagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttttgtcctatgcctt 15652  T
Q  438 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15653 gttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 15686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15736
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  15898 ggcttaattacttttttgatcctctaactatttaactggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatg 15799  T
Q  334 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15798 actacatttaatcccttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 15736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 311 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 82231 - 82070
Alignment:
Q  311 ggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82231 ggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 82132  T
Q  410 tattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82131 tattaatatcattttggtcctatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 82070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 232 - 395
Target Start/End: Original strand, 81856 - 82020
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81856 taggcttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 81955  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  81956 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtaatttgggt 82020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 246 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 90876 - 90782
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacat 340  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  90876 tttttcgtcctctaactatttagttggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacat 90782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 280 - 471
Target Start/End: Original strand, 6044 - 6233
Alignment:
Q  280 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||     
T  6044 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcattgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattaga 6143  T
Q  379 ttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 471  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6144 gtttgtgttatgtggatcctctaactttatttat---tatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 6233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6426 - 6283
Alignment:
Q  252 gtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttt 351  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  6426 gtcctttaactaattaattggtatcgtattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttc 6328  T
Q  352 tgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  6327 tgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 6283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Original strand, 14231 - 14350
Alignment:
Q  273 tatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14231 tatcggattggtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttgctatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaa 14329  T
Q  373 -gttaggttttgtgttatgtg 392  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  14330 cgttagagtttgtgttatgtg 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 232 - 384
Target Start/End: Original strand, 9780 - 9932
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 331  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  | |    
T  9780 taggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttgctcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctatccg 9879  T
Q  332 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaagttaggttttgt 384  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||    
T  9880 ttactacttttagtcctttccgttagttttattaaaaaaacgttagggtttgt 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10994 - 10862
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||| || ||||||    
T  10994 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttctgttaccacttttagt 10895  T
Q  346 cctttttgttagttttattcaaataaagttagg 378  Q
     ||||  |||| ||||||| ||| || ||||||    
T  10894 tctttccgttaattttattaaaaaaacgttagg 10862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 253 - 346
Target Start/End: Original strand, 144039 - 144132
Alignment:
Q  253 tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  144039 tcctctaactatttaattggtatcatattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaaatttctcaccgttactacttttagtc 144132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 147277 - 147133
Alignment:
Q  246 tttttggtcctctaactat--ttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacattta 343  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||   || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||    
T  147277 tttttggtcctctaactatatttaatt---attgaattggtcctcgaactaaaaattgatttatttcggtccgttaagtttctcatcgttactatattta 147181  T
Q  344 gtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatg 390  Q
    ||| |||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  147180 gtcatttccgttaattttattcgaataaacgttaggatttatgttatg 147133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 230871 - 230936
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  230871 aggcttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 230936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 231316 - 231252
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  231316 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggccctttaactaaaaa 231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Original strand, 1472 - 1539
Alignment:
Q  231 ataggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  1472 ataggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 1539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 57020 - 57086
Alignment:
Q  232 taggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  57020 taggcttaattgttcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 57086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 57617 - 57552
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  57617 aggcttaattgttcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 57552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0526 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0526
Description:

Target: scaffold0526; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 267
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4063
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactattta 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4030 ggcttaattacctttttggtcctctaactattta 4063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 83445 - 83380
Alignment:
Q  233 aggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  83445 aggcttaaatgctattttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 83380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 125496 - 125432
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||    
T  125496 ggcttaaatgctcttttggtccactaactatttaattggtatcgctttgatccattaactaaaaa 125432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 283232 - 283168
Alignment:
Q  234 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaa 298  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  283232 ggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaaa 283168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University