View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17930_high_6 (Length: 360)

Name: NF17930_high_6
Description: NF17930
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17930_high_6
NF17930_high_6
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (119-345)||(8374620-8374851)
chr5 (1-113)||(4120942-4121054)
chr5 (1-113)||(8374429-8374541)
chr5 (1-113)||(9008148-9008260)
chr5 (1-113)||(24105762-24105874)
chr5 (1-113)||(33491287-33491399)
chr5 (1-113)||(35782735-35782847)
chr5 (1-113)||(19358531-19358643)
chr5 (1-113)||(27679260-27679372)
chr5 (1-113)||(1579041-1579153)
chr5 (1-113)||(1605662-1605774)
chr5 (1-113)||(16069358-16069470)
chr5 (1-112)||(3386577-3386688)
chr5 (1-111)||(1165692-1165802)
chr5 (1-115)||(16737538-16737652)
chr5 (1-113)||(5202977-5203089)
chr5 (1-113)||(27420863-27420975)
chr5 (1-112)||(38598541-38598652)
chr5 (1-113)||(31883149-31883261)
chr5 (1-112)||(20992372-20992487)
chr5 (1-113)||(3921586-3921698)
chr5 (1-113)||(33991145-33991257)
chr5 (1-79)||(26603033-26603111)
chr5 (4-113)||(20992240-20992349)
chr5 (1-110)||(33284666-33284775)
chr5 (1-113)||(31410481-31410593)
chr5 (1-73)||(27025001-27025073)
chr5 (5-106)||(31638157-31638258)
chr5 (36-113)||(25634587-25634664)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-117)||(30691851-30691967)
chr6 (1-113)||(3955857-3955969)
chr6 (4-113)||(34887386-34887495)
chr6 (1-113)||(6086690-6086802)
chr6 (1-113)||(26946967-26947079)
chr6 (2-113)||(2837549-2837660)
chr6 (1-113)||(21893459-21893571)
chr6 (1-107)||(1153603-1153709)
chr6 (1-113)||(52840-52952)
chr6 (1-113)||(3347614-3347726)
chr6 (1-113)||(17261164-17261276)
chr6 (1-113)||(26704430-26704542)
chr6 (1-113)||(20726795-20726903)
chr6 (1-113)||(9459567-9459679)
chr6 (1-113)||(18613542-18613654)
chr6 (1-113)||(11167244-11167356)
chr6 (1-113)||(16307099-16307211)
chr6 (1-113)||(35198288-35198399)
chr6 (1-113)||(28199598-28199712)
chr6 (39-113)||(33463705-33463779)
chr6 (1-114)||(30699020-30699133)
chr6 (1-47)||(33464399-33464445)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (1-112)||(21581042-21581153)
chr3 (1-113)||(37698220-37698332)
chr3 (4-113)||(29445487-29445596)
chr3 (1-113)||(15520219-15520331)
chr3 (1-113)||(20842425-20842537)
chr3 (1-113)||(25494362-25494474)
chr3 (1-113)||(25999387-25999499)
chr3 (1-113)||(42307982-42308094)
chr3 (1-113)||(8042606-8042718)
chr3 (1-113)||(32244119-32244231)
chr3 (1-113)||(38856092-38856204)
chr3 (1-113)||(54870251-54870363)
chr3 (1-112)||(26122814-26122925)
chr3 (1-112)||(50529850-50529961)
chr3 (1-111)||(2895186-2895296)
chr3 (1-118)||(35643211-35643328)
chr3 (1-113)||(15520635-15520747)
chr3 (1-113)||(22175067-22175179)
chr3 (1-113)||(38933945-38934056)
chr3 (1-113)||(50528928-50529040)
chr3 (1-113)||(20699148-20699260)
chr3 (1-113)||(34700340-34700452)
chr3 (1-113)||(54534404-54534515)
chr3 (1-113)||(12117735-12117847)
chr3 (1-113)||(46452239-46452351)
chr3 (1-113)||(49128048-49128160)
chr3 (1-112)||(35226447-35226558)
chr3 (1-112)||(44609410-44609521)
chr3 (1-91)||(44688782-44688872)
chr3 (1-113)||(32359258-32359370)
chr3 (1-108)||(42105048-42105155)
chr3 (2-79)||(16354379-16354456)
chr3 (1-113)||(24835776-24835888)
chr3 (4-112)||(48925083-48925189)
chr3 (140-259)||(7816219-7816338)
chr3 (1-61)||(12915957-12916017)
chr3 (62-111)||(24366093-24366142)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (1-111)||(12101259-12101369)
chr7 (1-113)||(1803029-1803141)
chr7 (1-113)||(30181105-30181217)
chr7 (1-113)||(33846605-33846717)
chr7 (1-111)||(42965077-42965187)
chr7 (1-118)||(20346486-20346603)
chr7 (4-117)||(43156712-43156825)
chr7 (1-113)||(3511326-3511438)
chr7 (1-113)||(4347276-4347388)
chr7 (1-113)||(33359171-33359283)
chr7 (5-113)||(43068058-43068166)
chr7 (1-113)||(42204157-42204270)
chr7 (1-113)||(4477402-4477514)
chr7 (1-113)||(7164187-7164299)
chr7 (1-113)||(22649775-22649887)
chr7 (1-113)||(24792413-24792525)
chr7 (4-113)||(9452593-9452702)
chr7 (1-113)||(5280863-5280975)
chr7 (1-113)||(25748490-25748602)
chr7 (1-113)||(32041545-32041657)
chr7 (4-115)||(38866545-38866656)
chr7 (1-119)||(8630663-8630781)
chr7 (1-113)||(6394754-6394866)
chr7 (1-113)||(15655915-15656027)
chr7 (1-113)||(36890911-36891022)
chr7 (1-113)||(37005892-37006004)
chr7 (1-112)||(933289-933400)
chr7 (1-111)||(43021657-43021767)
chr7 (8-113)||(19828273-19828378)
chr7 (4-113)||(46134388-46134497)
chr7 (1-113)||(42673468-42673576)
chr7 (5-111)||(12097675-12097781)
chr7 (21-113)||(37704983-37705075)
chr7 (1-113)||(17753603-17753715)
chr7 (1-79)||(16894588-16894666)
chr7 (7-113)||(43405023-43405129)
chr7 (1-113)||(46891420-46891533)
chr7 (1-79)||(48865667-48865748)
chr7 (21-113)||(30075330-30075421)
chr7 (27-79)||(27691433-27691485)
chr7 (139-182)||(2042433-2042476)
chr7 (8-113)||(36849625-36849730)
chr7 (1-113)||(15655493-15655605)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (1-113)||(18594541-18594653)
chr8 (1-113)||(29938065-29938177)
chr8 (1-113)||(39206590-39206702)
chr8 (1-113)||(40117943-40118055)
chr8 (1-118)||(34842456-34842573)
chr8 (1-113)||(14422707-14422819)
chr8 (1-117)||(26783824-26783940)
chr8 (1-113)||(35118122-35118234)
chr8 (1-114)||(42571597-42571709)
chr8 (1-113)||(2042615-2042727)
chr8 (1-113)||(5320568-5320680)
chr8 (1-117)||(7774764-7774880)
chr8 (1-113)||(7791415-7791527)
chr8 (1-117)||(10836846-10836962)
chr8 (1-113)||(13110408-13110520)
chr8 (1-113)||(8021723-8021835)
chr8 (1-113)||(24113257-24113369)
chr8 (1-113)||(33287116-33287228)
chr8 (1-113)||(144398-144510)
chr8 (1-113)||(6144364-6144476)
chr8 (1-113)||(22260721-22260833)
chr8 (1-109)||(34998987-34999095)
chr8 (1-113)||(39218781-39218893)
chr8 (1-113)||(41575517-41575629)
chr8 (1-117)||(44805035-44805151)
chr8 (1-112)||(34679548-34679659)
chr8 (1-113)||(7811999-7812111)
chr8 (1-113)||(4035851-4035963)
chr8 (8-111)||(36491163-36491266)
chr8 (1-112)||(38167246-38167357)
chr8 (1-113)||(28639282-28639398)
chr8 (1-113)||(66271-66383)
chr8 (1-113)||(33278404-33278516)
chr8 (21-112)||(5005171-5005262)
chr8 (30-113)||(9806877-9806960)
chr8 (1-113)||(2322103-2322215)
chr8 (2-113)||(39220260-39220371)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (1-113)||(23776538-23776650)
chr4 (1-113)||(53717543-53717655)
chr4 (1-118)||(40428799-40428916)
chr4 (1-117)||(15241107-15241223)
chr4 (1-113)||(20877049-20877161)
chr4 (1-113)||(38055159-38055271)
chr4 (1-113)||(54412630-54412742)
chr4 (1-112)||(48909849-48909960)
chr4 (1-113)||(1617086-1617198)
chr4 (1-113)||(14987794-14987906)
chr4 (1-113)||(16700783-16700895)
chr4 (1-113)||(19913709-19913821)
chr4 (1-113)||(30423643-30423755)
chr4 (1-117)||(33703839-33703955)
chr4 (1-113)||(50353803-50353915)
chr4 (1-113)||(53875659-53875771)
chr4 (1-113)||(54189547-54189659)
chr4 (1-112)||(28032791-28032902)
chr4 (4-113)||(6611442-6611551)
chr4 (1-113)||(1756843-1756955)
chr4 (1-113)||(27488727-27488839)
chr4 (1-113)||(43290039-43290151)
chr4 (1-113)||(50055180-50055292)
chr4 (1-112)||(28360433-28360544)
chr4 (12-113)||(6688711-6688812)
chr4 (1-118)||(11639657-11639774)
chr4 (1-113)||(19165050-19165163)
chr4 (1-113)||(2481487-2481599)
chr4 (1-113)||(15669185-15669297)
chr4 (1-113)||(44784996-44785108)
chr4 (1-113)||(45424613-45424725)
chr4 (1-113)||(50053445-50053557)
chr4 (1-113)||(52139205-52139317)
chr4 (1-112)||(23704288-23704399)
chr4 (1-100)||(37968836-37968935)
chr4 (1-111)||(27583711-27583821)
chr4 (1-106)||(38071399-38071504)
chr4 (1-101)||(8591171-8591271)
chr4 (1-113)||(8932257-8932369)
chr4 (1-113)||(31969683-31969795)
chr4 (1-113)||(37464723-37464835)
chr4 (1-113)||(30171582-30171694)
chr4 (1-113)||(35490852-35490964)
chr4 (17-113)||(55344920-55345016)
chr4 (1-113)||(53353057-53353173)
chr4 (1-111)||(40680117-40680227)
chr4 (1-113)||(47632036-47632149)
chr4 (1-112)||(44379266-44379377)
chr4 (1-113)||(44375847-44375959)
chr4 (30-113)||(23265865-23265948)
chr4 (1-74)||(27536183-27536256)
chr4 (1-92)||(16703844-16703935)
chr4 (19-103)||(44548238-44548322)
chr4 (1-78)||(17493370-17493447)
chr4 (1-34)||(23269125-23269158)
chr4 (1-49)||(51780797-51780845)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-113)||(4016041-4016153)
chr2 (1-117)||(3873335-3873451)
chr2 (1-113)||(30420258-30420370)
chr2 (1-112)||(33906138-33906249)
chr2 (1-113)||(6174919-6175031)
chr2 (1-113)||(18806975-18807087)
chr2 (1-113)||(28329928-28330040)
chr2 (1-113)||(31517306-31517418)
chr2 (1-113)||(42937721-42937833)
chr2 (1-113)||(39635454-39635566)
chr2 (1-101)||(1108293-1108393)
chr2 (1-113)||(4232233-4232345)
chr2 (1-113)||(30270770-30270882)
chr2 (1-100)||(5733414-5733513)
chr2 (1-113)||(19901229-19901340)
chr2 (1-113)||(26323277-26323389)
chr2 (1-113)||(2178860-2178972)
chr2 (1-113)||(429818-429930)
chr2 (1-113)||(850999-851111)
chr2 (1-113)||(1482994-1483105)
chr2 (1-111)||(16066385-16066495)
chr2 (1-111)||(44947633-44947743)
chr2 (1-113)||(16588867-16588979)
chr2 (7-101)||(19384032-19384126)
chr2 (1-79)||(42446660-42446738)
chr2 (1-81)||(22101238-22101318)
chr2 (1-113)||(3585292-3585404)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (1-113)||(42370886-42370998)
chr1 (1-112)||(29078519-29078630)
chr1 (1-112)||(52086270-52086381)
chr1 (1-113)||(1168505-1168617)
chr1 (1-113)||(25897376-25897488)
chr1 (1-113)||(29288151-29288263)
chr1 (4-113)||(15203114-15203223)
chr1 (4-113)||(26663260-26663369)
chr1 (5-113)||(8079804-8079912)
chr1 (1-113)||(20089473-20089585)
chr1 (1-113)||(26580361-26580473)
chr1 (5-113)||(32671581-32671689)
chr1 (1-113)||(39260437-39260549)
chr1 (1-113)||(43905656-43905768)
chr1 (5-113)||(52753242-52753350)
chr1 (1-112)||(12682823-12682934)
chr1 (1-112)||(38829072-38829183)
chr1 (1-112)||(40092494-40092605)
chr1 (7-113)||(1940844-1940950)
chr1 (1-113)||(1170535-1170647)
chr1 (1-113)||(5215387-5215499)
chr1 (1-113)||(16052098-16052210)
chr1 (1-113)||(46409437-46409549)
chr1 (1-113)||(970615-970729)
chr1 (1-113)||(8120871-8120983)
chr1 (1-113)||(19715252-19715364)
chr1 (1-113)||(33510486-33510598)
chr1 (1-113)||(41928586-41928698)
chr1 (1-113)||(52696793-52696905)
chr1 (1-113)||(2347658-2347770)
chr1 (1-113)||(2473724-2473836)
chr1 (1-113)||(46760968-46761080)
chr1 (1-113)||(49146174-49146286)
chr1 (1-112)||(13996814-13996925)
chr1 (1-113)||(7145209-7145321)
chr1 (1-113)||(17591693-17591802)
chr1 (1-112)||(23498463-23498574)
chr1 (1-79)||(40149499-40149577)
chr1 (1-112)||(29695678-29695790)
chr1 (1-113)||(51359308-51359419)
chr1 (1-99)||(17587596-17587694)
chr1 (1-113)||(6765461-6765573)
chr1 (27-113)||(15554261-15554347)
chr1 (1-115)||(15717785-15717898)
chr1 (1-113)||(38171834-38171946)
chr1 (141-264)||(3117426-3117549)
chr1 (1-101)||(23322931-23323031)
chr1 (44-113)||(5675107-5675176)
chr1 (21-117)||(5217895-5217990)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-113)||(36707-36819)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-113)||(386-498)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-113)||(23042-23154)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-113)||(10240-10352)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-113)||(145336-145448)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (1-118)||(3707-3824)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-79)||(97-175)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-113)||(96-210)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Original strand, 8374620 - 8374851
Alignment:
Q  119 gtacgacatagcccactctaccaactctttgtatttctttagcttttattgataaatttttgagaatgcttattagggatttctggttctaaggatgaca 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8374620 gtacggcatagcccactctaccaactctttgtatttctttagcttttattgataaatttttgaggatgcttattagggatttttggttctaaggatgata 8374719  T
Q  219 acctagttgggatctatattgtcactttgatgcaagt------tcatgctttatcaacaacaacaaaaaatgaaagggttaaaacaaattacattatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374720 acctagttgggatctatattgtcactttgatgcaggtccatactcttgctttatcaacaa-aaaaaaaaatgaaagggttaaaacaaattacattatgaa 8374818  T
Q  313 caaatcataaaagacaaggtagtggttagaact 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8374819 caaatcataaaagacaagttagtggttagaact 8374851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4121054 - 4120942
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4121054 aagcagcttatgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 4120955  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | || ||||||||    
T  4120954 gccattccaaacg 4120942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 8374429 - 8374541
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8374429 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataa 8374528  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    |||||||||||||    
T  8374529 ggcaatccaaacg 8374541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 9008148 - 9008260
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  9008148 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 9008247  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  9008248 gccaatccaaacg 9008260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 24105762 - 24105874
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  24105762 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 24105861  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  24105862 gccaatccaaacg 24105874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 33491287 - 33491399
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33491287 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataa 33491386  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  33491387 gccaatccaaacg 33491399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 35782735 - 35782847
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  35782735 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa 35782834  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    |||||||||||||    
T  35782835 ggcaatccaaacg 35782847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19358643 - 19358531
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  19358643 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataa 19358544  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    |||||||||||||    
T  19358543 ggcaatccaaacg 19358531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 27679260 - 27679372
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  27679260 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 27679359  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  27679360 gccaatccaaacg 27679372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1579153 - 1579041
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  1579153 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 1579054  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  1579053 gccaatccaaacg 1579041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 1605662 - 1605774
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  1605662 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 1605761  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  1605762 gccaatccaaacg 1605774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16069470 - 16069358
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16069470 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataa 16069371  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  16069370 gtcaatccaaacg 16069358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 3386577 - 3386688
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  3386577 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataa 3386676  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  3386677 gccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 1165692 - 1165802
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  1165692 aagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataa 1165791  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||||||||    
T  1165792 gtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 16737538 - 16737652
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  16737538 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 16737637  T
Q  101 ggcaatccaaacgag 115  Q
    | |||| ||||||||    
T  16737638 gccaattcaaacgag 16737652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5203089 - 5202977
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  5203089 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataa 5202990  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  5202989 gtcaatccaaacg 5202977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27420975 - 27420863
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  27420975 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 27420876  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  27420875 gccaatccaaacg 27420863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 38598541 - 38598652
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||| |||    
T  38598541 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaa 38598640  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  38598641 gccaatccaaac 38598652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31883261 - 31883149
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  31883261 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataa 31883162  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  31883161 gtcaatccaaacg 31883149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 20992372 - 20992487
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacac----acataagcttaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    ||||||||| |||    
T  20992372 aagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatgtacataagctcaaa 20992471  T
Q  97 ataaggcaatccaaac 112  Q
    ||||| ||||||||||    
T  20992472 ataagccaatccaaac 20992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3921698 - 3921586
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||| || |||||||    
T  3921698 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataa 3921599  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  3921598 atcaatccaaacg 3921586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33991257 - 33991145
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| || |||||||    
T  33991257 aagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataa 33991158  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||| ||||||    
T  33991157 gtcaattcaaacg 33991145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 26603033 - 26603111
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 79  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603033 aagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 26603111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 20992240 - 20992349
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||| |    
T  20992240 cagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagcc 20992339  T
Q  104 aatccaaacg 113  Q
    ||| ||||||    
T  20992340 aattcaaacg 20992349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 33284666 - 33284775
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  33284666 aagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 33284765  T
Q  101 ggcaatccaa 110  Q
    | ||||||||    
T  33284766 gtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31410593 - 31410481
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||| || |||||||    
T  31410593 aagcagcttataaaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataa 31410494  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  31410493 atcaatccaaacg 31410481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27025073 - 27025001
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  27025073 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31638258 - 31638157
Alignment:
Q  5 agcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggca 104  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||| | ||||||| | ||||||||| ||    
T  31638258 agcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagctcacataaacataaaataagtca 31638159  T
Q  105 at 106  Q
    ||    
T  31638158 at 31638157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25634664 - 25634587
Alignment:
Q  36 ttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||||||||||||   ||| |||  |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25634664 ttatttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacg 25634587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30691967 - 30691851
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  30691967 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 30691868  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggc 117  Q
    | |||||||||||||||    
T  30691867 gccaatccaaacgaggc 30691851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 3955857 - 3955969
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3955857 aagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 3955956  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  3955957 gccaatccaaacg 3955969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 34887386 - 34887495
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  34887386 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtc 34887485  T
Q  104 aatccaaacg 113  Q
    ||||||||||    
T  34887486 aatccaaacg 34887495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 6086690 - 6086802
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  6086690 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 6086789  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  6086790 gccaatccaaacg 6086802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 26946967 - 26947079
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  26946967 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 26947066  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  26947067 gccaatccaaacg 26947079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2837660 - 2837549
Alignment:
Q  2 agcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataag 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  2837660 agcagctcatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 2837561  T
Q  102 gcaatccaaacg 113  Q
     |||||||||||    
T  2837560 ccaatccaaacg 2837549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21893571 - 21893459
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21893571 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 21893472  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      | |||||||||    
T  21893471 atcgatccaaacg 21893459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1153709 - 1153603
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  1153709 aagcagcttatgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataa 1153610  T
Q  101 ggcaatc 107  Q
    | |||||    
T  1153609 gccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 52952 - 52840
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  52952 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataa 52853  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  52852 gccaatccaaacg 52840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 3347614 - 3347726
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  3347614 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataa 3347713  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  3347714 gccaatccaaacg 3347726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 17261164 - 17261276
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  17261164 aagcagcttatgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 17261263  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  17261264 gccaatccaaacg 17261276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 26704430 - 26704542
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  26704430 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataa 26704529  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  26704530 accaatccaaacg 26704542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20726903 - 20726795
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  20726903 aagcagcttatgaaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 20726808  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  20726807 gccaatccaaacg 20726795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9459679 - 9459567
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| || |||||||    
T  9459679 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataa 9459580  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  9459579 gccaatccaaacg 9459567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18613654 - 18613542
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||    
T  18613654 aagcagcttatggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataa 18613555  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  18613554 gtcaatccaaacg 18613542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11167356 - 11167244
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || |||| |||||||||||| |||||||    
T  11167356 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataa 11167257  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  11167256 gccaatccaaacg 11167244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 16307099 - 16307211
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16307099 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataa 16307198  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  16307199 gtcaatccaaacg 16307211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35198399 - 35198288
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||    
T  35198399 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataa 35198301  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||| ||||||    
T  35198300 gccaattcaaacg 35198288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 28199598 - 28199712
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta---gataaacacacataagcttaaaa 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||   |||||||||| ||||    
T  28199598 aagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaa 28199696  T
Q  98 taaggcaatccaaacg 113  Q
    |||| |||||||||||    
T  28199697 taagtcaatccaaacg 28199712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463705
Alignment:
Q  39 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacg 33463705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 30699020 - 30699133
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || |||| | ||||||| || | |||||    
T  30699020 aagcagctaataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataa 30699119  T
Q  101 ggcaatccaaacga 114  Q
    | ||||||||||||    
T  30699120 gtcaatccaaacga 30699133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 33464445 - 33464399
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaa 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33464445 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21581153 - 21581042
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  21581153 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 21581054  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  21581053 gtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 37698220 - 37698332
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  37698220 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 37698319  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  37698320 gccaatccaaacg 37698332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29445596 - 29445487
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  29445596 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagcc 29445497  T
Q  104 aatccaaacg 113  Q
    ||||||||||    
T  29445496 aatccaaacg 29445487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 15520219 - 15520331
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  15520219 aagcagtttatgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 15520318  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  15520319 gccaatccaaacg 15520331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 20842425 - 20842537
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  20842425 aagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataa 20842524  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  20842525 gccaatccaaacg 20842537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 25494362 - 25494474
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25494362 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataa 25494461  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  25494462 gtcaatccaaacg 25494474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25999499 - 25999387
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  25999499 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataa 25999400  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  25999399 gccaatccaaacg 25999387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 42307982 - 42308094
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  42307982 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 42308081  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  42308082 gccaatccaaacg 42308094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8042718 - 8042606
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  8042718 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataa 8042619  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | | |||||||||    
T  8042618 gcccatccaaacg 8042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32244231 - 32244119
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  32244231 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataa 32244132  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  32244131 gccaatccaaacg 32244119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38856204 - 38856092
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  38856204 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 38856105  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  38856104 gccaatccaaacg 38856092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 54870251 - 54870363
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  54870251 aagcagcttatgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataa 54870350  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  54870351 gccaatccaaacg 54870363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26122925 - 26122814
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26122925 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataa 26122826  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  26122825 gccaatccaaac 26122814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 50529850 - 50529961
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||    
T  50529850 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataa 50529949  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  50529950 gtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 2895296 - 2895186
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2895296 aagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataa 2895197  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||| ||||    
T  2895196 gtcaattcaaa 2895186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35643328 - 35643211
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||    
T  35643328 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaaggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataa 35643229  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggct 118  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  35643228 gtcaatccaaacggggct 35643211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15520747 - 15520635
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15520747 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataa 15520648  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  15520647 gccaatccaaacg 15520635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 22175067 - 22175179
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  22175067 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa 22175166  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  22175167 gccaatccaaacg 22175179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38934056 - 38933945
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  38934056 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagc-cacataagctcaaaataa 38933958  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  38933957 gccaatccaaacg 38933945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 50529040 - 50528928
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  50529040 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa 50528941  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  50528940 gccaatccaaacg 50528928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20699260 - 20699148
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  20699260 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa 20699161  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  20699160 gccaatccaaacg 20699148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34700452 - 34700340
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  34700452 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataa 34700353  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      ||||| |||||    
T  34700352 accaatctaaacg 34700340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 54534404 - 54534515
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  54534404 aagcagcttat-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 54534502  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  54534503 gccaatccaaacg 54534515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 12117735 - 12117847
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  12117735 aagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 12117834  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||| ||||||    
T  12117835 gccaattcaaacg 12117847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 46452239 - 46452351
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||  |||    
T  46452239 aagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaa 46452338  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  46452339 gccaatccaaacg 46452351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 49128160 - 49128048
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  49128160 aagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagcccacataagtttaaaataa 49128061  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  49128060 gtcaatccaaacg 49128048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 35226558 - 35226447
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||     
T  35226558 aagcagcttatgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaatag 35226459  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  35226458 gccaatccaaac 35226447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 44609410 - 44609521
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||   |||||||||| |||||||    
T  44609410 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataa 44609509  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  44609510 gccaatccaaac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 44688872 - 44688782
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagc 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44688872 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32359370 - 32359258
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  32359370 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataa 32359271  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  32359270 gccaatccaaacg 32359258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 42105048 - 42105155
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  42105048 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 42105147  T
Q  101 ggcaatcc 108  Q
    | ||||||    
T  42105148 gtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16354456 - 16354379
Alignment:
Q  2 agcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16354456 agcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 24835776 - 24835888
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | ||||||| |||||||    
T  24835776 aagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataa 24835875  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  24835876 atcaatccaaacg 24835888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 48925083 - 48925189
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||  ||||||| |    
T  48925083 cagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagcc 48925180  T
Q  104 aatccaaac 112  Q
    |||||||||    
T  48925181 aatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7816338 - 7816219
Alignment:
Q  140 caactctttgtatttctttagcttttattgataaatttttgagaatgcttattagggatttctggttctaaggatgacaacctagttgggatctatattg 239  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||    
T  7816338 caactctctgtatttctttctcttttattattaaatttttcagtatgcttgtaagggatttgtggttctagggataccaacctagtagggatgtctattg 7816239  T
Q  240 tcactttgatgcaagttcat 259  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  7816238 ccaccttgatgcaagttcat 7816219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 12916017 - 12915957
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaag 61  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12916017 aagcagtttatgaaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaag 12915957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366093
Alignment:
Q  62 gcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 24366093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 12101259 - 12101369
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12101259 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 12101358  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||||||||    
T  12101359 gccaatccaaa 12101369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1803141 - 1803029
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  1803141 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 1803042  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  1803041 gtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 30181105 - 30181217
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  30181105 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 30181204  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  30181205 gccaatccaaacg 30181217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 33846605 - 33846717
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  33846605 aagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 33846704  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  33846705 gccaatccaaacg 33846717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 42965077 - 42965187
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  42965077 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 42965176  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||||||||    
T  42965177 gccaatccaaa 42965187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20346603 - 20346486
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  20346603 aagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 20346504  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggct 118  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  20346503 gccaatccaaacggggct 20346486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 43156825 - 43156712
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |    
T  43156825 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagcc 43156726  T
Q  104 aatccaaacgaggc 117  Q
    |||||||| |||||    
T  43156725 aatccaaatgaggc 43156712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3511438 - 3511326
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  3511438 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataa 3511339  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  3511338 gacaatccaaacg 3511326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4347388 - 4347276
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4347388 aagcagcttatgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataa 4347289  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  4347288 gtcaatccaaacg 4347276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 33359171 - 33359283
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  33359171 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataa 33359270  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  33359271 gccaatccaaacg 33359283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Original strand, 43068058 - 43068166
Alignment:
Q  5 agcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggca 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| ||    
T  43068058 agcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtca 43068157  T
Q  105 atccaaacg 113  Q
    |||||||||    
T  43068158 atccaaacg 43068166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 42204270 - 42204157
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacaccttta-aaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  42204270 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 42204171  T
Q  100 aggcaatccaaacg 113  Q
    || |||||||||||    
T  42204170 agccaatccaaacg 42204157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 4477402 - 4477514
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4477402 aagcagcttatgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 4477501  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  4477502 gccaatccaaacg 4477514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 7164299 - 7164187
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  7164299 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 7164200  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  7164199 gccaatccaaacg 7164187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 22649775 - 22649887
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  22649775 aagcagcttatgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 22649874  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||| ||||||    
T  22649875 gccaattcaaacg 22649887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 24792413 - 24792525
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||  |||    
T  24792413 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaa 24792512  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  24792513 gccaatccaaacg 24792525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9452702 - 9452593
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||| |||||||| |    
T  9452702 cagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtc 9452603  T
Q  104 aatccaaacg 113  Q
    ||||||||||    
T  9452602 aatccaaacg 9452593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5280975 - 5280863
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  5280975 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataa 5280876  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  5280875 gccaatccaaacg 5280863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25748602 - 25748490
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||    
T  25748602 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaa 25748503  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  25748502 gccaatccaaacg 25748490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32041657 - 32041545
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  32041657 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataa 32041558  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  32041557 gccaatccaaacg 32041545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 38866656 - 38866545
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  38866656 cagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtc 38866557  T
Q  104 aatccaaacgag 115  Q
     |||||||||||    
T  38866556 gatccaaacgag 38866545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8630781 - 8630663
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  8630781 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataa 8630682  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggctg 119  Q
       |||||||||| |||||    
T  8630681 acaaatccaaacggggctg 8630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6394866 - 6394754
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  6394866 aagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 6394767  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | ||||| |||||    
T  6394766 gccaatctaaacg 6394754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15656027 - 15655915
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  15656027 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataa 15655928  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  15655927 gccaatccaaacg 15655915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 36890911 - 36891022
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| | ||||||    
T  36890911 aagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagc-tcaaataa 36891009  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  36891010 gtcaatccaaacg 36891022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 37005892 - 37006004
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37005892 aagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaacttatagaagtagataaactcacataagcttaaaataa 37005991  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  37005992 gccaatccaaacg 37006004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 933400 - 933289
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||| |||||||    
T  933400 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataa 933301  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | |||| |||||    
T  933300 gccaattcaaac 933289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 43021657 - 43021767
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  43021657 aagcagcttatgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataa 43021756  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||||||||    
T  43021757 gccaatccaaa 43021767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19828378 - 19828273
Alignment:
Q  8 ttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatc 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||| ||||     
T  19828378 ttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagccaacataaactcaaaataagccaatt 19828279  T
Q  108 caaacg 113  Q
    ||||||    
T  19828278 caaacg 19828273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 46134388 - 46134497
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  46134388 cagcttatgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtc 46134487  T
Q  104 aatccaaacg 113  Q
    ||||||||||    
T  46134488 aatccaaacg 46134497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 42673576 - 42673468
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||    
T  42673576 aagcagcttatgaaactatgataagctgttttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataa 42673481  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  42673480 gtcaatccaaacg 42673468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Original strand, 12097675 - 12097781
Alignment:
Q  5 agcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggca 104  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||  |||| ||    
T  12097675 agcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagcca 12097774  T
Q  105 atccaaa 111  Q
    |||||||    
T  12097775 atccaaa 12097781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704983
Alignment:
Q  21 ataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacg 37704983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17753715 - 17753603
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    ||||||| |||||||    
T  17753715 aagcagcttatgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataa 17753616  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    |  ||||||||||    
T  17753615 gctaatccaaacg 17753603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 16894588 - 16894666
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16894588 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 16894666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43405129 - 43405023
Alignment:
Q  7 cttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaat 106  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||    
T  43405129 cttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaat 43405030  T
Q  107 ccaaacg 113  Q
     ||||||    
T  43405029 tcaaacg 43405023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 46891420 - 46891533
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaata 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||||| ||||||    
T  46891420 aagcagcttataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaata 46891519  T
Q  100 aggcaatccaaacg 113  Q
    || |||||||||||    
T  46891520 agccaatccaaacg 46891533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 48865748 - 48865667
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacaccttta---aaaaggcttatgggagtagataa 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  48865748 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataa 48865667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Original strand, 30075330 - 30075421
Alignment:
Q  21 ataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||   | | ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30075330 ataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggcttatgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacg 30075421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691485
Alignment:
Q  27 tatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataa 27691485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 182
Target Start/End: Original strand, 2042433 - 2042476
Alignment:
Q  139 ccaactctttgtatttctttagcttttattgataaatttttgag 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2042433 ccaactctttgtatttctttatcttttattaataaatttttgag 2042476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Original strand, 36849625 - 36849730
Alignment:
Q  8 ttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatc 107  Q
    |||||||| | ||||||| |  ||||| | ||||| |||||||||||||||||  | ||||  |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  36849625 ttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttagtagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatc 36849724  T
Q  108 caaacg 113  Q
    ||||||    
T  36849725 caaacg 36849730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 15655493 - 15655605
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||| ||| | || |||| |||||||| | ||||| ||||| |  ||||||||| ||||||  |||||| || | |||||||| ||| |||||    
T  15655493 aagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagacttatgttagtagacaagctcacataagtttagaataa 15655592  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  15655593 gccaatccaaacg 15655605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18594653 - 18594541
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  18594653 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 18594554  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  18594553 gccaatccaaacg 18594541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29938177 - 29938065
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  29938177 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataa 29938078  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  29938077 gccaatccaaacg 29938065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39206702 - 39206590
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  39206702 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 39206603  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  39206602 gccaatccaaacg 39206590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 40117943 - 40118055
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40117943 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 40118042  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  40118043 gccaatccaaacg 40118055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 34842456 - 34842573
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  34842456 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 34842555  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggct 118  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  34842556 gccaatccaaacggggct 34842573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14422819 - 14422707
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  14422819 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 14422720  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  14422719 accaatccaaacg 14422707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 26783824 - 26783940
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  26783824 aagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 26783923  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggc 117  Q
    | |||||||||||||||    
T  26783924 gccaatccaaacgaggc 26783940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 35118122 - 35118234
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  35118122 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 35118221  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  35118222 gccaatccaaacg 35118234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 42571709 - 42571597
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42571709 aagcagcttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataa 42571611  T
Q  101 ggcaatccaaacga 114  Q
    | ||||||||||||    
T  42571610 gccaatccaaacga 42571597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 2042615 - 2042727
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  2042615 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 2042714  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  2042715 gccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5320680 - 5320568
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5320680 aagcaacttatgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataa 5320581  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  5320580 gccaatccaaacg 5320568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7774880 - 7774764
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  7774880 aagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataa 7774781  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggc 117  Q
    | ||||| |||||||||    
T  7774780 gccaatctaaacgaggc 7774764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 7791527 - 7791415
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7791527 aagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataa 7791428  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  7791427 gccaatccaaacg 7791415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 10836846 - 10836962
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  10836846 aagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 10836945  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggc 117  Q
    | |||||||||||||||    
T  10836946 gccaatccaaacgaggc 10836962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13110520 - 13110408
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  13110520 aagcagcttattaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 13110421  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  13110420 gccaatccaaacg 13110408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8021835 - 8021723
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  8021835 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 8021736  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  8021735 gccaatccaaacg 8021723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 24113257 - 24113369
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  24113257 aagcagcttatgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 24113356  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  24113357 gtcaatccaaacg 24113369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 33287116 - 33287228
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33287116 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 33287215  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  33287216 gtcaatccaaacg 33287228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 144510 - 144398
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||    
T  144510 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataa 144411  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  144410 gtcaatccaaacg 144398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 6144364 - 6144476
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  6144364 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 6144463  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  6144464 gtcaatccaaacg 6144476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 22260721 - 22260833
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  22260721 aagcagcttatgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataa 22260820  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  22260821 gccaatccaaacg 22260833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 34998987 - 34999095
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  34998987 aagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataa 34999086  T
Q  101 ggcaatcca 109  Q
    | |||||||    
T  34999087 gccaatcca 34999095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39218893 - 39218781
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  39218893 aagcagcttatgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 39218794  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  39218793 gccaatccaaacg 39218781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 41575629 - 41575517
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||    
T  41575629 aagcagcttatgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataa 41575530  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  41575529 gccaatccaaacg 41575517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 44805035 - 44805151
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  44805035 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataa 44805134  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggc 117  Q
    | |||| |||| |||||    
T  44805135 gccaattcaaatgaggc 44805151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 34679548 - 34679659
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  34679548 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 34679647  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  34679648 gccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 7812111 - 7811999
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7812111 aagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataa 7812012  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | ||||| |||||    
T  7812011 gccaatcaaaacg 7811999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4035963 - 4035851
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  4035963 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataa 4035864  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  4035863 accaatccaaacg 4035851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 36491266 - 36491163
Alignment:
Q  8 ttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatc 107  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  36491266 ttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatc 36491167  T
Q  108 caaa 111  Q
    ||||    
T  36491166 caaa 36491163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 38167246 - 38167357
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||     
T  38167246 aagcagcttatgaaactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaatag 38167345  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  38167346 gccaatccaaac 38167357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28639398 - 28639282
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggct----tatgggagtagataaacacacataagcttaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28639398 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaa 28639299  T
Q  97 ataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  28639298 ataagccaattcaaacg 28639282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 66271 - 66383
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |  ||| || || |||||||    
T  66271 aagcagcttatgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataa 66370  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | ||||| |||||    
T  66371 gccaatctaaacg 66383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33278516 - 33278404
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||   || |||| || |||||||    
T  33278516 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataa 33278417  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  33278416 gccaatccaaacg 33278404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5005262 - 5005171
Alignment:
Q  21 ataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaac 112  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5005262 ataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataagcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806877
Alignment:
Q  30 ttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacg 9806877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 2322103 - 2322215
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  || |||||||   |||||    
T  2322103 aagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgttagtagataaatccatataagctccgaataa 2322202  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  2322203 gccaatccaaacg 2322215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39220371 - 39220260
Alignment:
Q  2 agcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataag 101  Q
    |||||||||||||| |   ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||   || ||||||| ||||||||    
T  39220371 agcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacatatggatgtagataagttcatataagctcaaaataag 39220272  T
Q  102 gcaatccaaacg 113  Q
     |||| ||||||    
T  39220271 tcaattcaaacg 39220260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 23776538 - 23776650
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  23776538 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 23776637  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  23776638 gccaatccaaacg 23776650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 53717543 - 53717655
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53717543 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataa 53717642  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  53717643 gccaatccaaacg 53717655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 40428799 - 40428916
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40428799 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 40428898  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggct 118  Q
    | |||| |||||| ||||    
T  40428899 gccaattcaaacggggct 40428916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 15241107 - 15241223
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15241107 aagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataa 15241206  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggc 117  Q
    | |||||||||||||||    
T  15241207 gccaatccaaacgaggc 15241223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20877161 - 20877049
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  20877161 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 20877062  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  20877061 gccaatccaaacg 20877049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38055271 - 38055159
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  38055271 aagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 38055172  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  38055171 gtcaatccaaacg 38055159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 54412742 - 54412630
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  54412742 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 54412643  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  54412642 gccaatccaaacg 54412630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 48909960 - 48909849
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48909960 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 48909861  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  48909860 gccaatccaaac 48909849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1617198 - 1617086
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  1617198 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataa 1617099  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  1617098 gccaatccaaacg 1617086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14987906 - 14987794
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  14987906 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataa 14987807  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  14987806 gccaatccaaacg 14987794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16700895 - 16700783
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  16700895 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 16700796  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  16700795 gccaatccaaacg 16700783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 19913709 - 19913821
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  19913709 aagcagcttatgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 19913808  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  19913809 gccaatccaaacg 19913821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 30423643 - 30423755
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  30423643 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataa 30423742  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  30423743 gccaatccaaacg 30423755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33703955 - 33703839
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33703955 aagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataa 33703856  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggc 117  Q
    | ||||  |||||||||    
T  33703855 gtcaattaaaacgaggc 33703839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 50353915 - 50353803
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  50353915 aagcagcttatgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataa 50353816  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  50353815 gccaatccaaacg 50353803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 53875771 - 53875659
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  53875771 aagcagcttataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataa 53875672  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  53875671 gccaatccaaacg 53875659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 54189659 - 54189547
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  54189659 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataa 54189560  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  54189559 gccaatccaaacg 54189547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 28032791 - 28032902
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  28032791 aagcagcttatgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 28032890  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||| ||||    
T  28032891 gtcaatctaaac 28032902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 6611442 - 6611551
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||  |    
T  6611442 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaacc 6611541  T
Q  104 aatccaaacg 113  Q
    ||||||||||    
T  6611542 aatccaaacg 6611551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 1756843 - 1756955
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  1756843 aagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 1756942  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  1756943 gccaatccaaacg 1756955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 27488727 - 27488839
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||  |||    
T  27488727 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaa 27488826  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  27488827 gccaatccaaacg 27488839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 43290039 - 43290151
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  43290039 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataa 43290138  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  43290139 gccaatccaaacg 43290151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 50055180 - 50055292
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  50055180 aagcagcttatgaaaccatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 50055279  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  50055280 gccaatccaaacg 50055292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28360544 - 28360433
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  28360544 aagcagcttataaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataa 28360445  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  28360444 gtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 113
Target Start/End: Original strand, 6688711 - 6688812
Alignment:
Q  12 gaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6688711 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaa 6688810  T
Q  112 cg 113  Q
    ||    
T  6688811 cg 6688812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 11639657 - 11639774
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||    
T  11639657 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataa 11639756  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggct 118  Q
      ||||||||||| ||||    
T  11639757 accaatccaaacggggct 11639774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 19165050 - 19165163
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  19165050 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 19165149  T
Q  100 aggcaatccaaacg 113  Q
    || |||||||||||    
T  19165150 agccaatccaaacg 19165163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 2481487 - 2481599
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  2481487 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa 2481586  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  2481587 gccaatccaaacg 2481599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15669297 - 15669185
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  15669297 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataa 15669198  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  15669197 gccaatccaaacg 15669185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 44784996 - 44785108
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  44784996 aagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 44785095  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  44785096 gccaatccaaacg 44785108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 45424613 - 45424725
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  45424613 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataa 45424712  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  45424713 gtcaatccaaacg 45424725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 50053557 - 50053445
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||    
T  50053557 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataagtccatataagctcaaaataa 50053458  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  50053457 gccaatccaaacg 50053445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 52139317 - 52139205
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||||| | |||||||    
T  52139317 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataa 52139218  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  52139217 gccaatccaaacg 52139205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 23704288 - 23704399
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  23704288 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataa 23704387  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  23704388 gccaatccaaac 23704399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 37968836 - 37968935
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  37968836 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 37968935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 27583711 - 27583821
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  27583711 aagcagcttatgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataa 27583810  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||||||||    
T  27583811 gtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 38071399 - 38071504
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  38071399 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 38071498  T
Q  101 ggcaat 106  Q
    | ||||    
T  38071499 gtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 8591171 - 8591271
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  8591171 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataa 8591270  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  8591271 g 8591271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 8932257 - 8932369
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||    
T  8932257 aagcagcttatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataa 8932356  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  8932357 gccaatccaaacg 8932369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31969795 - 31969683
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  31969795 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 31969696  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||| ||||||    
T  31969695 atcaattcaaacg 31969683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37464835 - 37464723
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  37464835 aagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataa 37464736  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||| ||||||    
T  37464735 gccaattcaaacg 37464723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 30171694 - 30171582
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | |||||||||| |||||||    
T  30171694 aagcagcttatgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataa 30171595  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  30171594 gccaatccaaacg 30171582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 35490852 - 35490964
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | || ||||||| |||||||    
T  35490852 aagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataa 35490951  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  35490952 gccaatccaaacg 35490964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Original strand, 55344920 - 55345016
Alignment:
Q  17 tatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  55344920 tatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacg 55345016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 53353173 - 53353057
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacaca----taagcttaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || |    |||||| |||    
T  53353173 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaa 53353074  T
Q  97 ataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||| |||||||||||    
T  53353073 ataagccaatccaaacg 53353057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 40680117 - 40680227
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||  | |||||||    
T  40680117 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataa 40680216  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||||||||    
T  40680217 gtcaatccaaa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 47632149 - 47632036
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacc-tttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||    
T  47632149 aagcagcttatgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaata 47632050  T
Q  100 aggcaatccaaacg 113  Q
    || |||||||||||    
T  47632049 agccaatccaaacg 47632036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 44379266 - 44379377
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  | |||| || |||||||    
T  44379266 aagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataa 44379365  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  44379366 gtcaatccaaac 44379377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 44375959 - 44375847
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |  ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44375959 aagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataa 44375860  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  44375859 gccaatccaaacg 44375847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265948
Alignment:
Q  30 ttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 23265948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 27536183 - 27536256
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 74  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27536183 aagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggagta 27536256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16703935 - 16703844
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  16703935 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagct 16703844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Original strand, 44548238 - 44548322
Alignment:
Q  19 tgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    ||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  44548238 tgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctccaaataaggc 44548322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17493447 - 17493370
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 78  Q
    ||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  17493447 aagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgcttataggagtagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 23269125 - 23269158
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttattttta 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23269125 aagcagcttatgaaactatgataagctattttta 23269158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 51780797 - 51780845
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaac 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  51780797 aagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4016153 - 4016041
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4016153 aagcagcttatgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataa 4016054  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  4016053 gccaatccaaacg 4016041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 3873335 - 3873451
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  3873335 aagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 3873434  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggc 117  Q
    | |||||||||||||||    
T  3873435 gccaatccaaacgaggc 3873451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 30420258 - 30420370
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  30420258 aagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 30420357  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  30420358 gccaatccaaacg 30420370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 33906138 - 33906249
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||    
T  33906138 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataa 33906237  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  33906238 gtcaatccaaac 33906249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 6174919 - 6175031
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  6174919 aagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataa 6175018  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  6175019 gccaatccaaacg 6175031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 18806975 - 18807087
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  18806975 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataa 18807074  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  18807075 gccaatccaaacg 18807087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 28329928 - 28330040
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  28329928 aagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataa 28330027  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  28330028 gtcaatccaaacg 28330040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 31517306 - 31517418
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  31517306 aagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataa 31517405  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  31517406 gccaatccaaacg 31517418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 42937833 - 42937721
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42937833 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataa 42937734  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  42937733 gccaatccaaacg 42937721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39635566 - 39635454
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  39635566 aagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataa 39635467  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    |  ||||||||||    
T  39635466 gctaatccaaacg 39635454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1108393 - 1108293
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  1108393 aagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 1108294  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  1108293 g 1108293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 4232233 - 4232345
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  4232233 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataa 4232332  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  4232333 gccaatccaaacg 4232345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 30270770 - 30270882
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30270770 aagcagcttatgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataa 30270869  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  30270870 gccaatccaaacg 30270882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 5733513 - 5733414
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  5733513 aagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 5733414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 19901229 - 19901340
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||||||    
T  19901229 aagcagtttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataa 19901327  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  19901328 gccaatccaaacg 19901340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 26323277 - 26323389
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  26323277 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataa 26323376  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  26323377 accaatccaaacg 26323389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 2178860 - 2178972
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||   ||||||| ||||||||||    
T  2178860 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataa 2178959  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  2178960 atcaatccaaacg 2178972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 429930 - 429818
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  | |||||||    
T  429930 aagcaacttatgaaattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataa 429831  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    || ||| ||||||    
T  429830 gggaattcaaacg 429818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 851111 - 850999
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  851111 aagcagcttataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataa 851012  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    |  ||||||||||    
T  851011 gcaaatccaaacg 850999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 1482994 - 1483105
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  1482994 aagcagcttatgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataa 1483092  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | ||||| |||||    
T  1483093 gccaatcaaaacg 1483105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 16066385 - 16066495
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||    
T  16066385 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataa 16066484  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||| ||||    
T  16066485 gccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 44947633 - 44947743
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||    
T  44947633 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataa 44947732  T
Q  101 ggcaatccaaa 111  Q
    | |||| ||||    
T  44947733 gccaatacaaa 44947743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 16588867 - 16588979
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||| |  |||||||    
T  16588867 aagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataa 16588966  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  16588967 gccaatccaaacg 16588979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 19384032 - 19384126
Alignment:
Q  7 cttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataag 101  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| | || |||| || ||||||||    
T  19384032 cttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 42446660 - 42446738
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 79  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42446660 aagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataa 42446738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 22101238 - 22101318
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaac 81  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22101238 aagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttagtagataaac 22101318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3585404 - 3585292
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || |||||| | ||||||| |||||| ||||| |||| |||||  ||| ||||||  |||||||||||  |||||    
T  3585404 aagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggtttatgttagtggataaatccacataagctttgaataa 3585305  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | | |||||||||    
T  3585304 gccgatccaaacg 3585292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 42370886 - 42370998
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  42370886 aagcagcttatgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataa 42370985  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  42370986 gtcaatccaaacg 42370998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29078630 - 29078519
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  29078630 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 29078531  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  29078530 gccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 52086381 - 52086270
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  52086381 aagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccacataagcttaaaataa 52086282  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  52086281 gtcaatccaaac 52086270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1168617 - 1168505
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  1168617 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 1168518  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  1168517 gccaatccaaacg 1168505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25897488 - 25897376
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  25897488 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataa 25897389  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  25897388 gtcaatccaaacg 25897376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29288263 - 29288151
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  29288263 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 29288164  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  29288163 gtcaatccaaacg 29288151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15203223 - 15203114
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  15203223 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtc 15203124  T
Q  104 aatccaaacg 113  Q
    ||| ||||||    
T  15203123 aattcaaacg 15203114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 26663369 - 26663260
Alignment:
Q  4 cagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |    
T  26663369 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc 26663270  T
Q  104 aatccaaacg 113  Q
    ||||||||||    
T  26663269 aatccaaacg 26663260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Original strand, 8079804 - 8079912
Alignment:
Q  5 agcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggca 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||    
T  8079804 agcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 8079903  T
Q  105 atccaaacg 113  Q
    |||||||||    
T  8079904 atccaaacg 8079912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20089585 - 20089473
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  20089585 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 20089486  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  20089485 gccaatccaaacg 20089473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 26580361 - 26580473
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  26580361 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 26580460  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  26580461 gccaatccaaacg 26580473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32671689 - 32671581
Alignment:
Q  5 agcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggca 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  32671689 agcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagcca 32671590  T
Q  105 atccaaacg 113  Q
    |||||||||    
T  32671589 atccaaacg 32671581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 39260437 - 39260549
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  39260437 aagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 39260536  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  39260537 gccaatccaaacg 39260549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43905768 - 43905656
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  43905768 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataa 43905669  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  43905668 gccaatccaaacg 43905656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Original strand, 52753242 - 52753350
Alignment:
Q  5 agcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggca 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||    
T  52753242 agcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 52753341  T
Q  105 atccaaacg 113  Q
    |||||||||    
T  52753342 atccaaacg 52753350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12682934 - 12682823
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  12682934 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataa 12682835  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  12682834 gtcaatccaaac 12682823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38829183 - 38829072
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  38829183 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataa 38829084  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  38829083 gccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 40092605 - 40092494
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  40092605 aagcagcttatgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataa 40092506  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  40092505 gtcaatccaaac 40092494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 1940844 - 1940950
Alignment:
Q  7 cttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaat 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| ||||    
T  1940844 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaat 1940943  T
Q  107 ccaaacg 113  Q
    |||||||    
T  1940944 ccaaacg 1940950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 1170535 - 1170647
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  1170535 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataa 1170634  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  1170635 gccaatccaaacg 1170647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5215499 - 5215387
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  5215499 aagcaacttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataa 5215400  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  5215399 gccaatccaaacg 5215387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16052210 - 16052098
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  16052210 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataa 16052111  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  16052110 gccaatccaaacg 16052098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 46409549 - 46409437
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||| |||||||    
T  46409549 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataa 46409450  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  46409449 gtcaatccaaacg 46409437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 970615 - 970729
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactat--gataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaat 98  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  970615 aagcagcttatgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 970714  T
Q  99 aaggcaatccaaacg 113  Q
    ||| |||||||||||    
T  970715 aagtcaatccaaacg 970729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8120983 - 8120871
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  8120983 aagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataa 8120884  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  8120883 gccaatccaaacg 8120871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 19715252 - 19715364
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  19715252 aagcagcttatgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataa 19715351  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  19715352 accaatccaaacg 19715364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33510598 - 33510486
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  33510598 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataa 33510499  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  33510498 gccaatccaaacg 33510486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 41928586 - 41928698
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| | |||||||    
T  41928586 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataa 41928685  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  41928686 gccaatccaaacg 41928698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 52696905 - 52696793
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  52696905 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa 52696806  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  52696805 gccaatccaaacg 52696793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2347770 - 2347658
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||    
T  2347770 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataa 2347671  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
       ||||||||||    
T  2347670 acaaatccaaacg 2347658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2473836 - 2473724
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  2473836 aagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataa 2473737  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      | |||||||||    
T  2473736 accgatccaaacg 2473724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 46761080 - 46760968
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||| | |||||||    
T  46761080 aagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataa 46760981  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  46760980 gtcaatccaaacg 46760968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 49146286 - 49146174
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  49146286 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataa 49146187  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
      |||||||||||    
T  49146186 accaatccaaacg 49146174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 13996814 - 13996925
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||    
T  13996814 aagcagcttatgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataa 13996913  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | ||||||||||    
T  13996914 gccaatccaaac 13996925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 7145321 - 7145209
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagct-taaaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  7145321 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttgtttatttacccaa-cacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaata 7145223  T
Q  100 aggcaatccaaacg 113  Q
    || |||||||||||    
T  7145222 agtcaatccaaacg 7145209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17591802 - 17591693
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   |||||    
T  17591802 aagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagc-cacataagct--caataa 17591706  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  17591705 gccaatccaaacg 17591693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23498574 - 23498463
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23498574 aagcaacttatgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataa 23498475  T
Q  101 ggcaatccaaac 112  Q
    | |||| |||||    
T  23498474 gccaattcaaac 23498463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 40149577 - 40149499
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 79  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40149577 aagcagcttataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 40149499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29695790 - 29695678
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggc-ttatgggagtagataaacacacataagcttaaaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  29695790 aagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 29695691  T
Q  100 aggcaatccaaac 112  Q
    || ||||||||||    
T  29695690 agccaatccaaac 29695678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 51359308 - 51359419
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| | | |||||||| |||||||    
T  51359308 aagcaccttatgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataa 51359406  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  51359407 gccaatccaaacg 51359419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 17587596 - 17587694
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaata 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17587596 aagcagcttatgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6765573 - 6765461
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  6765573 aagcagctcatgaaaatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataa 6765474  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  6765473 gccaatccaaacg 6765461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Original strand, 15554261 - 15554347
Alignment:
Q  27 tatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  15554261 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacg 15554347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15717898 - 15717785
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |  |||||| || |||||||    
T  15717898 aagcagcttatgaaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataa 15717800  T
Q  101 ggcaatccaaacgag 115  Q
    | |||||||||||||    
T  15717799 gtcaatccaaacgag 15717785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38171946 - 38171834
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||  | |||||||    
T  38171946 aagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataa 38171847  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||| ||||||    
T  38171846 gtcaatgcaaacg 38171834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 264
Target Start/End: Original strand, 3117426 - 3117549
Alignment:
Q  141 aactctttgtatttctttagcttttattgataaatttttgagaatgcttattagggatttctggttctaaggatgacaacctagttgggatctatattgt 240  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||  | |||||| | |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  3117426 aactctttgtatttctttctcttttattaataatttttttagaatgctggtaagggatctgtggttctaggggtgtcaacctagttgagatgtctattgt 3117525  T
Q  241 cactttgatgcaagttcatgcttt 264  Q
    |||| | | |||||||||| ||||    
T  3117526 cactctaacgcaagttcatacttt 3117549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 23322931 - 23323031
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||    
T  23322931 aagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagtttatgggagtagataagcctatataagctcaaaataa 23323030  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  23323031 g 23323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675107
Alignment:
Q  44 ccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacg 113  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacg 5675107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Original strand, 5217895 - 5217990
Alignment:
Q  21 ataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataaggcaatccaaacgaggc 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    ||| |||  |||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5217895 ataagctattttta-ttatttacccaaatgtatttgaaagagcttatgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggc 5217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 36819 - 36707
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  36819 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 36720  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  36719 gccaatccaaacg 36707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 386 - 498
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  386 aagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataa 485  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  486 gccaatccaaacg 498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 23042 - 23154
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  23042 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataa 23141  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  23142 gccaatccaaacg 23154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10352 - 10240
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  10352 aagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataa 10253  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  10252 gtcaatccaaacg 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 145336 - 145448
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||    
T  145336 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataa 145435  T
Q  101 ggcaatccaaacg 113  Q
    | |||||||||||    
T  145436 gtcaatccaaacg 145448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3824 - 3707
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacacacataagcttaaaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||    
T  3824 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataa 3725  T
Q  101 ggcaatccaaacgaggct 118  Q
      ||||||||||| ||||    
T  3724 accaatccaaacggggct 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 97 - 175
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 96 - 210
Alignment:
Q  1 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta---gataaacacacataagcttaaaa 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||   |||||||||| ||||    
T  96 aagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaa 194  T
Q  98 taaggcaatccaaacg 113  Q
    |||| |||||||||||    
T  195 taagtcaatccaaacg 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University