View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17955_low_1 (Length: 531)

Name: NF17955_low_1
Description: NF17955
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17955_low_1
NF17955_low_1
[»] chr6 (89 HSPs)
chr6 (21-515)||(26142671-26143165)
chr6 (19-515)||(25579523-25580021)
chr6 (20-515)||(26055732-26056227)
chr6 (20-515)||(26075702-26076197)
chr6 (21-515)||(25538346-25538840)
chr6 (81-515)||(26048651-26049085)
chr6 (81-515)||(26069820-26070254)
chr6 (20-515)||(25481548-25482043)
chr6 (23-430)||(26655880-26656287)
chr6 (23-430)||(26761851-26762258)
chr6 (19-426)||(27337950-27338357)
chr6 (19-426)||(27398690-27399097)
chr6 (23-423)||(26646377-26646777)
chr6 (23-423)||(26752345-26752745)
chr6 (49-430)||(27718294-27718675)
chr6 (49-430)||(27610917-27611298)
chr6 (133-430)||(27678837-27679134)
chr6 (137-430)||(27698497-27698790)
chr6 (101-430)||(27724812-27725141)
chr6 (65-430)||(26622867-26623232)
chr6 (65-430)||(26728845-26729210)
chr6 (206-430)||(27229123-27229347)
chr6 (131-430)||(27604702-27605001)
chr6 (49-430)||(27592935-27593316)
chr6 (133-430)||(27677613-27677910)
chr6 (170-430)||(27531233-27531493)
chr6 (175-430)||(26884054-26884311)
chr6 (133-430)||(26802333-26802630)
chr6 (23-430)||(26823731-26824138)
chr6 (133-430)||(28781030-28781327)
chr6 (65-430)||(31284179-31284544)
chr6 (175-430)||(27706443-27706698)
chr6 (176-430)||(28786169-28786423)
chr6 (176-430)||(28792290-28792544)
chr6 (187-423)||(26861514-26861750)
chr6 (133-279)||(27427605-27427751)
chr6 (119-426)||(28234459-28234765)
chr6 (103-423)||(28242702-28243022)
chr6 (119-282)||(28139580-28139743)
chr6 (145-339)||(28149920-28150113)
chr6 (23-384)||(26949598-26949959)
chr6 (186-388)||(28181047-28181249)
chr6 (21-381)||(26848600-26848960)
chr6 (64-291)||(28098299-28098526)
chr6 (186-426)||(28185261-28185501)
chr6 (119-350)||(28325452-28325683)
chr6 (101-305)||(26341898-26342105)
chr6 (102-426)||(26936989-26937313)
chr6 (186-354)||(28226917-28227085)
chr6 (186-354)||(28297765-28297933)
chr6 (186-354)||(28514140-28514308)
chr6 (438-509)||(27605048-27605119)
chr6 (203-337)||(25506978-25507112)
chr6 (434-507)||(27718712-27718785)
chr6 (203-388)||(29825960-29826145)
chr6 (192-240)||(2184369-2184417)
chr6 (191-239)||(26975134-26975182)
chr6 (434-509)||(26655768-26655843)
chr6 (434-509)||(26761739-26761814)
chr6 (438-505)||(27611339-27611406)
chr6 (189-239)||(25071741-25071791)
chr6 (438-507)||(28780920-28780989)
chr6 (434-507)||(28786059-28786132)
chr6 (23-111)||(25506873-25506961)
chr6 (440-508)||(26823626-26823694)
chr6 (21-240)||(27214498-27214720)
chr6 (21-240)||(27234508-27234730)
chr6 (192-239)||(2184980-2185027)
chr6 (434-509)||(27698827-27698901)
chr6 (434-504)||(27725178-27725248)
chr6 (434-503)||(28792184-28792253)
chr6 (186-240)||(27665169-27665223)
chr6 (436-498)||(31284078-31284140)
chr6 (21-85)||(26617858-26617922)
chr6 (21-85)||(26723786-26723850)
chr6 (186-237)||(26635774-26635825)
chr6 (186-237)||(26741740-26741791)
chr6 (434-508)||(27229014-27229086)
chr6 (337-384)||(27427806-27427853)
chr6 (191-237)||(26959250-26959296)
chr6 (298-384)||(27214354-27214440)
chr6 (298-384)||(27234788-27234874)
chr6 (296-384)||(26617263-26617351)
chr6 (296-384)||(26723191-26723279)
chr6 (440-509)||(26802217-26802290)
chr6 (296-384)||(26811446-26811534)
chr6 (434-486)||(27678748-27678800)
chr6 (434-486)||(27706735-27706787)
chr6 (103-155)||(29826193-29826245)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (23-377)||(268233-268587)
chr1 (23-430)||(28127555-28127963)
chr1 (23-430)||(28164239-28164645)
chr1 (435-480)||(28127995-28128040)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (23-430)||(18723961-18724368)
chr4 (23-430)||(18731380-18731787)
chr4 (31-430)||(18679451-18679850)
chr4 (23-430)||(18655353-18655760)
chr4 (31-430)||(18699284-18699683)
chr4 (133-279)||(18073804-18073950)
chr4 (182-279)||(17989088-17989185)
chr4 (101-417)||(5090921-5091237)
chr4 (434-501)||(18699720-18699787)
chr4 (434-501)||(18655797-18655864)
chr4 (434-501)||(18679887-18679954)
chr4 (434-501)||(18731824-18731891)
chr4 (337-384)||(17989240-17989287)
chr4 (341-384)||(18073702-18073745)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (23-377)||(29273659-29274013)
chr8 (262-426)||(31903746-31903910)
[»] scaffold0349 (5 HSPs)
scaffold0349 (133-430)||(3420-3718)
scaffold0349 (49-430)||(14271-14651)
scaffold0349 (434-507)||(8134-8207)
scaffold0349 (434-509)||(14688-14762)
scaffold0349 (434-504)||(3755-3825)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (23-430)||(4560-4967)
scaffold0277 (23-430)||(13521-13928)
scaffold0277 (438-507)||(13969-14038)
scaffold0277 (434-503)||(5004-5073)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (23-430)||(7416-7823)
scaffold0419 (434-486)||(7327-7379)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (133-279)||(59612-59758)
scaffold0003 (341-384)||(59510-59553)
[»] scaffold1254 (2 HSPs)
scaffold1254 (254-430)||(37-213)
scaffold1254 (434-486)||(250-302)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (186-426)||(34620-34860)
scaffold0038 (103-423)||(42864-43184)
scaffold0038 (119-350)||(116767-116998)
scaffold0038 (186-354)||(27415-27583)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (186-426)||(58334-58574)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (186-339)||(3279670-3279823)
chr2 (186-384)||(17993736-17993934)
chr2 (104-155)||(3279857-3279908)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (193-389)||(16688943-16689139)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 89)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26143165 - 26142671
Alignment:
Q  21 taagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctg 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26143165 taagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataaatcccactctg 26143066  T
Q  121 atgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaa 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143065 atttcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggaaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaa 26142966  T
Q  221 aatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26142965 aatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaa 26142866  T
Q  321 gatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgag 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26142865 gatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgag 26142766  T
Q  421 gaacacttgggacggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 515  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26142765 gaacactcgggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 26142671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25580021 - 25579523
Alignment:
Q  19 ggtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25580021 ggtaagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatactcaccataactcccactc 25579922  T
Q  119 tgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579921 tgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 25579822  T
Q  219 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  25579821 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttg 25579722  T
Q  319 aagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactg 418  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579721 aagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcactgcctctgaaactg 25579622  T
Q  419 aggaacacttgggacggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatga--aaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 515  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25579621 aggaacactcgggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaataaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatgtgtg 25579523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26056227 - 26055732
Alignment:
Q  20 gtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactct 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056227 gtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgctcaccataactcccactct 26056128  T
Q  120 gatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056127 gatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 26056028  T
Q  220 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |    
T  26056027 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttga 26055928  T
Q  320 agatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactga 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26055927 agatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaaatga 26055828  T
Q  420 ggaacacttgggacggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 515  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26055827 ggaacactcaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 26055732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26076197 - 26075702
Alignment:
Q  20 gtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactct 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26076197 gtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgctcaccataactcccactct 26076098  T
Q  120 gatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26076097 gatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 26075998  T
Q  220 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |    
T  26075997 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttga 26075898  T
Q  320 agatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactga 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26075897 agatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattga 26075798  T
Q  420 ggaacacttgggacggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 515  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075797 ggaacactctggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 26075702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25538840 - 25538346
Alignment:
Q  21 taagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctg 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25538840 taagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcattattttgaaacctctcttcatgcttagtaaaatgctcaccataactcccactctg 25538741  T
Q  121 atgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaa 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25538740 atgtcgtaactgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaa 25538641  T
Q  221 aatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25538640 aatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaa 25538541  T
Q  321 gatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgag 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25538540 gatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgag 25538441  T
Q  421 gaacacttgggacggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 515  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25538440 gaacactcgggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgattaatttgtg 25538346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 81 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26049085 - 26048651
Alignment:
Q  81 cttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26049085 cttcatgcttagtaagatgctcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgt 26048986  T
Q  181 gttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatg 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26048985 cttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatg 26048886  T
Q  281 gccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattac 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26048885 gccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattac 26048786  T
Q  381 cggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgggacggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26048785 cggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacactcgggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaaga 26048686  T
Q  481 ctttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26048685 ctttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 26048651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 81 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26070254 - 26069820
Alignment:
Q  81 cttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070254 cttcatgcttagtaagatgctcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgt 26070155  T
Q  181 gttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatg 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26070154 cttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatg 26070055  T
Q  281 gccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattac 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26070054 gccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattac 26069955  T
Q  381 cggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgggacggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26069954 cggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacactcgggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaaga 26069855  T
Q  481 ctttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069854 ctttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 26069820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25482043 - 25481548
Alignment:
Q  20 gtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactct 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |   | |    
T  25482043 gtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctcttcatgcttagtcagatattcaccataactacatgtat 25481944  T
Q  120 gatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 219  Q
    || |||| |  | |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25481943 gacgtcgaacatcagtaggatccacaccatagaaaacgggtaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 25481844  T
Q  220 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  25481843 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttga 25481744  T
Q  320 agatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactga 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25481743 agatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattga 25481644  T
Q  420 ggaacacttgggacggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 515  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25481643 ggaacactctggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaatttgtg 25481548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26656287 - 26655880
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    |||||||||||||||||   ||| | || |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  26656287 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgat 26656188  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656187 gtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 26656088  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||   ||||    
T  26656087 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaaga 26655988  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||| |||| || ||||||||||    
T  26655987 tcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgagga 26655888  T
Q  423 acacttgg 430  Q
    ||||||||    
T  26655887 acacttgg 26655880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26762258 - 26761851
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    |||||||||||||||||   ||| | || |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  26762258 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgat 26762159  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762158 gtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 26762059  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||   ||||    
T  26762058 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaaga 26761959  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||| |||| || ||||||||||    
T  26761958 tcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgagga 26761859  T
Q  423 acacttgg 430  Q
    ||||||||    
T  26761858 acacttgg 26761851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 426
Target Start/End: Original strand, 27337950 - 27338357
Alignment:
Q  19 ggtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactc 118  Q
    ||||||||||||||||||||    ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27337950 ggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaacttatcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccagtc 27338049  T
Q  119 tgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 218  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||  | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27338050 tgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagc 27338149  T
Q  219 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27338150 aaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttc 27338249  T
Q  319 aagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactg 418  Q
    |||||| || ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||   |||||||| || | || ||||||    
T  27338250 aagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactg 27338349  T
Q  419 aggaacac 426  Q
    ||||||||    
T  27338350 aggaacac 27338357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 426
Target Start/End: Original strand, 27398690 - 27399097
Alignment:
Q  19 ggtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactc 118  Q
    ||||||||||||||||||||    ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27398690 ggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaacttatcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccagtc 27398789  T
Q  119 tgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 218  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||  | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27398790 tgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagc 27398889  T
Q  219 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27398890 aaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttc 27398989  T
Q  319 aagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactg 418  Q
    |||||| || ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||   |||||||| || | || ||||||    
T  27398990 aagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactg 27399089  T
Q  419 aggaacac 426  Q
    ||||||||    
T  27399090 aggaacac 27399097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26646777 - 26646377
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26646777 agagccaacttccattgatgcaatcgttccttgtttttcttgttattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgat 26646678  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    | ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| || |  | || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646677 gccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 26646578  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    |  |||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26646577 tttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaaga 26646478  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||  ||  |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  26646477 tcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgagga 26646378  T
Q  423 a 423  Q
    |    
T  26646377 a 26646377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26752745 - 26752345
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26752745 agagccaacttccattgatgcaatcgttccttgtttttcttgttattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgat 26752646  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    | ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| || |  | || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752645 gccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 26752546  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    |  |||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26752545 tttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaaga 26752446  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||  ||  |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  26752445 tcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgagga 26752346  T
Q  423 a 423  Q
    |    
T  26752345 a 26752345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 430
Target Start/End: Original strand, 27718294 - 27718675
Alignment:
Q  49 ctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatc 147  Q
    ||||||||| ||||  | |||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||| ||  |||||||||| | || ||||||||||||  |    
T  27718294 ctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgcc 27718392  T
Q  148 atagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaa 247  Q
      ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  27718393 gaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaa 27718492  T
Q  248 aatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaa 347  Q
    || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  27718493 aacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 27718592  T
Q  348 ttcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  27718593 ttcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttgg 27718675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 430
Target Start/End: Original strand, 27610917 - 27611298
Alignment:
Q  49 ctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatc 147  Q
    ||||||||| ||||  | |||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |  | ||||||||||||  |    
T  27610917 ctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcactttagtaggttccacgcc 27611015  T
Q  148 atagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaa 247  Q
      ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  27611016 gaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaa 27611115  T
Q  248 aatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaa 347  Q
    || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  27611116 aacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 27611215  T
Q  348 ttcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  27611216 ttcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttgg 27611298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 133 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27679134 - 27678837
Alignment:
Q  133 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 232  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||  || | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27679134 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 27679035  T
Q  233 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcat 332  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||    
T  27679034 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttat 27678935  T
Q  333 caatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||| ||    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27678934 caatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttgg 27678837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 137 - 430
Target Start/End: Original strand, 27698497 - 27698790
Alignment:
Q  137 ggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcat 236  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || | || || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698497 ggttccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcat 27698596  T
Q  237 agttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaat 336  Q
    |||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27698597 agttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaat 27698696  T
Q  337 gaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||    
T  27698697 gaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttgg 27698790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 101 - 430
Target Start/End: Original strand, 27724812 - 27725141
Alignment:
Q  101 tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgt 200  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| | || ||||||||||||  |  ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  27724812 tcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgt 27724911  T
Q  201 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||    
T  27724912 ggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgt 27725011  T
Q  301 gatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtg 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||    
T  27725012 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtg 27725111  T
Q  401 tcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  27725112 tcagtgcccctaaaactaaggaacacttgg 27725141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26623232 - 26622867
Alignment:
Q  65 ttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaat 163  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||| | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||     
T  26623232 ttattatggaacctctttgcatgcttagcaag-tgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaa 26623134  T
Q  164 actaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 263  Q
    || |  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  26623133 acgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaa 26623034  T
Q  264 tcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataag 363  Q
    ||||||| ||||| || || ||| |||||  |||| ||||||| || ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||    
T  26623033 tcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaag 26622934  T
Q  364 agccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    |||||| |||||||| || || |||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26622933 agccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttgg 26622867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26729210 - 26728845
Alignment:
Q  65 ttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaat 163  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||| | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||     
T  26729210 ttattatggaacctctttgcatgcttagcaag-tgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaa 26729112  T
Q  164 actaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 263  Q
    || |  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  26729111 acgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaa 26729012  T
Q  264 tcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataag 363  Q
    ||||||| ||||| || || ||| |||||  |||| ||||||| || ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||    
T  26729011 tcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaag 26728912  T
Q  364 agccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    |||||| |||||||| || || |||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26728911 agccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttgg 26728845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 206 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229123
Alignment:
Q  206 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgattt 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  306 catctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcact 405  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| |    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  406 gcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||    
T  27229147 gcccctaaaactaaggaacacttgg 27229123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 430
Target Start/End: Original strand, 27604702 - 27605001
Alignment:
Q  131 tgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 230  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||||| || | || || ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27604702 tgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaag 27604801  T
Q  231 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatc 330  Q
    | ||||| |||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  27604802 aggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttc 27604901  T
Q  331 atcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  27604902 atcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttgg 27605001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 430
Target Start/End: Original strand, 27592935 - 27593316
Alignment:
Q  49 ctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgc-tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatc 147  Q
    |||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| |||||| |    
T  27592935 ctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggatccacacc 27593033  T
Q  148 atagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaa 247  Q
    | ||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  27593034 aaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaa 27593133  T
Q  248 aatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaa 347  Q
    || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||    |    
T  27593134 aacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttga 27593233  T
Q  348 ttcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27593234 ttcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttgg 27593316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 133 - 430
Target Start/End: Original strand, 27677613 - 27677910
Alignment:
Q  133 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 232  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||  || | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27677613 agtaggttccacagcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 27677712  T
Q  233 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcat 332  Q
    |||||||||  |||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||  |    
T  27677713 gcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgt 27677812  T
Q  333 caatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  27677813 caatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttgg 27677910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 430
Target Start/End: Original strand, 27531233 - 27531493
Alignment:
Q  170 caactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctag 269  Q
    |||| |||||| | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27531233 caaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctag 27531332  T
Q  270 attcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagcctt 369  Q
    ||| ||||||||| ||    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||    
T  27531333 atttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagcctt 27531432  T
Q  370 atagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
     |||||||| |||||||||  || |||||||||   ||| || ||||||||||||||||||    
T  27531433 gtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttgg 27531493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26884311 - 26884054
Alignment:
Q  175 ctttgtgttgtagcagtgaatga--tgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagatt 272  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26884311 ctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagatt 26884212  T
Q  273 cttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttata 372  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| | |||||||||| ||    
T  26884211 cttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgta 26884112  T
Q  373 gagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    |||||| || || |||   |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26884111 gagatttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttgg 26884054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 133 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26802630 - 26802333
Alignment:
Q  133 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 232  Q
    |||||| |||||| || ||||||  ||||| || | || || |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26802630 agtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 26802531  T
Q  233 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcat 332  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26802530 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 26802431  T
Q  333 caatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  26802430 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttgg 26802333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26824138 - 26823731
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||   | |||||||||||| |||||    
T  26824138 agagccttcttccattgaagcaatttctccatgttttccttgttatttccgaacctcttttcatgcttagtgagatgtatagcataactcccacgctgat 26824039  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    ||||||||| |  ||| |||||| |||||||||| ||||| || | ||  | ||||   ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26824038 gtcgtatgtcaccaggatccacaccatagaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 26823939  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||  | ||  ||||| ||| ||||||| |||     
T  26823938 tgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagt 26823839  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    |||  ||||||||  || ||  | |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |  |  |||||||||  |||||| |||||||| |    
T  26823838 tcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaa 26823739  T
Q  423 acacttgg 430  Q
    ||||||||    
T  26823738 acacttgg 26823731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 133 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28781327 - 28781030
Alignment:
Q  133 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 232  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || ||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||      
T  28781327 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 28781228  T
Q  233 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcat 332  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28781227 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 28781128  T
Q  333 caatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||| ||    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  28781127 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttgg 28781030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31284544 - 31284179
Alignment:
Q  65 ttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaat 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||| || || |||||||| |  |||| ||| |||||  || |||||||||||||     
T  31284544 ttatgttggaacctctcttcatgcttagcca-atgcttctccataactacctctatgatgtcgcacatgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaa 31284446  T
Q  164 actaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 263  Q
    || | || ||  |||   || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  31284445 acgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaa 31284346  T
Q  264 tcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataag 363  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||    
T  31284345 tcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaag 31284246  T
Q  364 agccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||   |  ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  31284245 agccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttgg 31284179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 175 - 430
Target Start/End: Original strand, 27706443 - 27706698
Alignment:
Q  175 ctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  27706443 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactct 27706542  T
Q  275 tcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttataga 374  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||  |||||||| ||  | ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  27706543 tcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtaga 27706642  T
Q  375 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    |||| || || |||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  27706643 gattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttgg 27706698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 176 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28786423 - 28786169
Alignment:
Q  176 tttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattctt 275  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || |  || ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  28786423 tttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattctt 28786324  T
Q  276 caatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagag 375  Q
    | ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28786323 cgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagag 28786224  T
Q  376 attaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||| |||||||||  || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  28786223 atttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttgg 28786169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 176 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28792544 - 28792290
Alignment:
Q  176 tttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattctt 275  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || |  || ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  28792544 tttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattctt 28792445  T
Q  276 caatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagag 375  Q
    | ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28792444 cgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagag 28792345  T
Q  376 attaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||| |||||||||  || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  28792344 atttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttgg 28792290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26861750 - 26861514
Alignment:
Q  187 gcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttg 286  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  26861750 gcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattg 26861651  T
Q  287 acaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaa 386  Q
     | |||  |  | |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26861650 tcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaa 26861551  T
Q  387 aattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaa 423  Q
    ||   |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26861550 aaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 26861514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Original strand, 27427605 - 27427751
Alignment:
Q  133 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 232  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  27427605 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagat 27427704  T
Q  233 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27427705 gcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28234765 - 28234459
Alignment:
Q  119 tgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 218  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||  || |||   | | |||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  28234765 tgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtctattttcctcgaagca-taaatgatgtggacaagttcgtccaagc 28234667  T
Q  219 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttc 318  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||     
T  28234666 aaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttg 28234567  T
Q  319 aagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactg 418  Q
    ||| ||  | ||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||||||  ||||||||||  ||||||||   | |||||||||||| ||||| |||||     
T  28234566 aagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcgagtgtcactacctctaaaacta 28234467  T
Q  419 aggaacac 426  Q
    ||||||||    
T  28234466 aggaacac 28234459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28243022 - 28242702
Alignment:
Q  103 accataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtgg 202  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  | || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |  ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  28243022 accataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtgg 28242923  T
Q  203 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtga 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  28242922 acaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgtta 28242823  T
Q  303 tttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtc 402  Q
    |||  || |||| |  ||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||| | |  |||| | || |||||||| || ||||||   |  ||||||||    
T  28242822 ttttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtc 28242723  T
Q  403 actgcctctgaaactgaggaa 423  Q
    ||| ||||| ||||| |||||    
T  28242722 actacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28139743 - 28139580
Alignment:
Q  119 tgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 218  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| || || || | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28139743 tgatgtcgaatgtgagaaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagc 28139644  T
Q  219 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggc 282  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||| |  || || |||||||||||||||||||||||    
T  28139643 aaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggc 28139580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28150113 - 28149920
Alignment:
Q  145 atcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggca 244  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  28150113 atcatagaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgata 28150014  T
Q  245 gaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaa 339  Q
    || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| || |||| || ||| ||  |||||||||||||    
T  28150013 gagaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaa 28149920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26949959 - 26949598
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgc-tcaccataactcccactctga 121  Q
    ||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||   | |||||    
T  26949959 agagctatcttccatttcagcaaccgctccatgttttttttgctcttttggaacctctcttcatgcttagcaag-tgcttcaccataactataattctga 26949861  T
Q  122 tgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaa 221  Q
    ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  || | || ||  |||   ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26949860 tgtcgcacgtgagaaggttctacatcatagaaaactggcagaacaaggcgacctttttccttgaagtagtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaa 26949761  T
Q  222 atgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaag 321  Q
    |||||||||| ||||| |    |||||| | |  |||   ||| || |||||||||||   |||||  |||   ||||||||||| || ||| | | |||    
T  26949760 atgaagaagaagcatattccttagaaaagacgataatggcaattctcgattcttcaattctcttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaag 26949661  T
Q  322 atcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
     || |||||||||||||| || || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  26949660 ctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccggt 26949598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28181249 - 28181047
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28181249 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28181150  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggta 385  Q
    || ||||  || ||| ||||| || |||| || ||| ||  | ||||| ||||| || || ||||||||||||  ||||||  ||| |||||| || |||    
T  28181149 gaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagta 28181050  T
Q  386 aaa 388  Q
    |||    
T  28181049 aaa 28181047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26848960 - 26848600
Alignment:
Q  21 taagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactct 119  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||  |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | | |||    
T  26848960 taagagctttcttccatttacgcaaacgctccatgctttccttgttattttgaaacacctcttcatgcttagcaag-tgcttcaccataactactattct 26848862  T
Q  120 gatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 219  Q
    ||||||| |  |||| |||||| |   |||||||||| || |  || | || || ||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26848861 gatgtcgcacatgagaaggttctatgccatagaaaacaggaataaccatgctacccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 26848762  T
Q  220 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttca 319  Q
    ||| |||||||  ||||||||  |||| ||||   ||||  ||||||| || |||||||||  |||||  ||    |||||||| ||||| || || | |    
T  26848761 aaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctga 26848662  T
Q  320 agatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattacc 381  Q
    ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  26848661 agatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagattacc 26848600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 291
Target Start/End: Original strand, 28098299 - 28098526
Alignment:
Q  64 gttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| ||| | ||||  || ||    
T  28098299 gttattttggaacctctcttcatgcttagcta-atgcttcaccataactccccgtctgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcacaaaaaataggaaa 28098397  T
Q  163 tactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaa 262  Q
     || ||||||| ||||   | ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||   ||| || |  ||||| |||    
T  28098398 aacgaagcaacccttttcttcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaa 28098497  T
Q  263 atcctagattcttcaatggccttgacaag 291  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  28098498 atcctggactcttcgatggccttgacaag 28098526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28185501 - 28185261
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28185501 agcagttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28185402  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggta 385  Q
    || ||||  || ||| ||||| || |||| || ||| ||  | ||||| ||||| || || ||||||||||||  ||||||  ||| |||||| || |||    
T  28185401 gaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagta 28185302  T
Q  386 aaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacac 426  Q
    |||   |  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  28185301 aaacgataacgagtgtcactacctctaaagctaaggaacac 28185261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28325683 - 28325452
Alignment:
Q  119 tgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 218  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||  |  |||   ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28325683 tgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttgaagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagc 28325584  T
Q  219 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttc 318  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||| || |||| ||     
T  28325583 aaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttg 28325484  T
Q  319 aagatcattatcatcaatgaaagtacgaattc 350  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  28325483 aaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattc 28325452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 305
Target Start/End: Original strand, 26341898 - 26342105
Alignment:
Q  101 tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaac---tctttgtgttgtagcagtgaatga 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | |  || ||   ||||||  ||| |||| |||||||    
T  26341898 tcaccgtaactcccaatctgacgtcgtacatgagaaggttccatgtcatagaaaacaggcaaaattttgcgacccttctttgccttgaagcaatgaatga 26341997  T
Q  198 tgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttgg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   || || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||  | |    
T  26341998 tgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggctttgacaagtgattg 26342097  T
Q  298 tgtgattt 305  Q
    ||||||||    
T  26342098 tgtgattt 26342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26937313 - 26936989
Alignment:
Q  102 caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtg 201  Q
    |||||||||||||| | || ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| | ||    ||  ||||| ||| |||||| || ||||||    
T  26937313 caccataactcccagtttggtgtcgaacgtgagaaggatccacttcatagaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtg 26937214  T
Q  202 gacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||  || ||   |||||  || |||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26937213 gacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtg 26937114  T
Q  302 atttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgt 401  Q
    ||||| |||||||  |  || || || ||||||||||| || ||||||||    |||  |||||| || || |||| |||  |||||| |  ||||||||    
T  26937113 atttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggtgcgaattccacaatcacaaagagctttgtaaagatgaccaataaaatggaagcgagtgt 26937014  T
Q  402 cactgcctctgaaactgaggaacac 426  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  26937013 cggtgcctctgaaactgaggaacac 26936989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28227085 - 28226917
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28227085 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 28226986  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattccctt 354  Q
    || ||||  || ||| |||||||| |||| || ||| ||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  28226985 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattccctt 28226917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 354
Target Start/End: Original strand, 28297765 - 28297933
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| ||||||||||  |||||||||  |||    
T  28297765 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28297864  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattccctt 354  Q
    || ||||  |||||| ||||| || |||| || ||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||    
T  28297865 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattccctt 28297933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28514308 - 28514140
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| ||||||||||  |||||||||  |||    
T  28514308 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28514209  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattccctt 354  Q
    || ||||  |||||| ||||| || |||| || ||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||    
T  28514208 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattccctt 28514140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 438 - 509
Target Start/End: Original strand, 27605048 - 27605119
Alignment:
Q  438 attgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27605048 attgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 27605119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 337
Target Start/End: Original strand, 25506978 - 25507112
Alignment:
Q  203 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtga 302  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |  ||||||||    
T  25506978 acaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtga 25507077  T
Q  303 tttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatg 337  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  25507078 tttcatctcctcttttcagatcacaatcatcaatg 25507112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Original strand, 27718712 - 27718785
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagt 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  27718712 ggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagt 27718785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29826145 - 29825960
Alignment:
Q  203 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtga 302  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| || || |||||    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||   |||||||    
T  29826145 acaagttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtga 29826046  T
Q  303 tttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaa 388  Q
    |||| || ||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||  ||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||    
T  29826045 tttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaa 29825960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2184417 - 2184369
Alignment:
Q  192 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2184417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtt 2184369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26975182 - 26975134
Alignment:
Q  191 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26975182 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26655843 - 26655768
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26655843 ggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaa 26655768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26761814 - 26761739
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26761814 ggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaa 26761739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 438 - 505
Target Start/End: Original strand, 27611339 - 27611406
Alignment:
Q  438 attgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatga 505  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  27611339 attgcatagccatgaaaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 27611406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25071791 - 25071741
Alignment:
Q  189 agtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25071791 agtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28780989 - 28780920
Alignment:
Q  438 attgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagt 507  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  28780989 attgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagt 28780920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28786132 - 28786059
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagt 507  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  28786132 ggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagt 28786059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 25506873 - 25506961
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataact 111  Q
    ||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25506873 agagctattttccattgatgcgatctctccatgtttttcttattattttgaaacttctcttcatgcttagtcagatcttcaccataact 25506961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 26823694 - 26823626
Alignment:
Q  440 tgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagta 508  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26823694 tgcatagccatgagaattgagagaaattggacgaagaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagta 26823626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27214720 - 27214498
Alignment:
Q  21 taagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataac---tcccact 117  Q
    ||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||   |     |    
T  27214720 taagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctcttcatgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgtt 27214621  T
Q  118 ctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaa 217  Q
    | ||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||| || |  || | || ||  |||   ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27214620 cagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaa 27214521  T
Q  218 caaaatgaagaagatgcatagtt 240  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  27214520 caaaatgaagaagtagcatagtt 27214498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 27234508 - 27234730
Alignment:
Q  21 taagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataac---tcccact 117  Q
    ||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||   |     |    
T  27234508 taagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctcttcatgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgtt 27234607  T
Q  118 ctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaa 217  Q
    | ||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||| || |  || | || ||  |||   ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27234608 cagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaa 27234707  T
Q  218 caaaatgaagaagatgcatagtt 240  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  27234708 caaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2185027 - 2184980
Alignment:
Q  192 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2185027 gaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 2184980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 27698827 - 27698901
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27698827 ggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 27698901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 504
Target Start/End: Original strand, 27725178 - 27725248
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatg 504  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  27725178 ggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg 27725248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28792253 - 28792184
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaat 503  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  28792253 ggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665223
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 31284140 - 31284078
Alignment:
Q  436 tgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaata 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  31284140 tgattgcatagccatgagatttgagagaatatggatgaagaaagaatttgagaatgcagaata 31284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26617922 - 26617858
Alignment:
Q  21 taagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttca 85  Q
    ||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  26617922 taagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttggaacctttcttca 26617858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26723850 - 26723786
Alignment:
Q  21 taagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttca 85  Q
    ||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  26723850 taagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttggaacctttcttca 26723786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635774
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26635774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741740
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26741740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 27229086 - 27229014
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagta 508  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  27229086 ggtgattgtatagccatgagacttgagagaaattggatg--aaaagagttttagaatgcagaatatgaatgagta 27229014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 384
Target Start/End: Original strand, 27427806 - 27427853
Alignment:
Q  337 gaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27427806 gaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggt 27427853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26959296 - 26959250
Alignment:
Q  191 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  26959296 tgaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcata 26959250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27214440 - 27214354
Alignment:
Q  298 tgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    ||||||||| || ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27214440 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggt 27214354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 384
Target Start/End: Original strand, 27234788 - 27234874
Alignment:
Q  298 tgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    ||||||||| || ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27234788 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggt 27234874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617263
Alignment:
Q  296 ggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || | ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgccggt 26617263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723191
Alignment:
Q  296 ggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || | ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgccggt 26723191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26802290 - 26802217
Alignment:
Q  440 tgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaa----gactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 509  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||    || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26802290 tgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 26802217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26811534 - 26811446
Alignment:
Q  296 ggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  26811534 ggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagatgaccggt 26811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 27678800 - 27678748
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttga 486  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| || |||||||||||| |||||    
T  27678800 ggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttga 27678748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 486
Target Start/End: Original strand, 27706735 - 27706787
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttga 486  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| || |||||||||||| |||||    
T  27706735 ggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttga 27706787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29826245 - 29826193
Alignment:
Q  103 accataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaa 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  29826245 accataactcccagtctgatgtcgcacatgagaaggatccacatcatagaaaa 29826193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 377
Target Start/End: Original strand, 268233 - 268587
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  268233 agagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgctattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgat 268332  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |  |  | || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268333 gtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 268432  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||| |||||||||| ||||||| |||     
T  268433 tgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagt 268532  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagat 377  Q
    |||  |||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  268533 tcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 268587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Original strand, 28127555 - 28127963
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||  | ||||    
T  28127555 agagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacctctctccatgcttagcaagctcttcaccataactccctgtatgat 28127654  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
     ||| |  | |||||| |||||  || ||||||| ||||| |||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28127655 atcgcacatcagtaggatccacgccaaagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaa 28127754  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtga-tttcatctcctctttcaag 321  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||   ||||||| |||  |||||||| |||||    
T  28127755 tgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaag 28127854  T
Q  322 atcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagg 421  Q
    || |  |||||||||||| ||  | ||||||||||||  ||| ||||| |||||||  || || |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28127855 attacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgagg 28127954  T
Q  422 aacacttgg 430  Q
    |||||||||    
T  28127955 aacacttgg 28127963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Original strand, 28164239 - 28164645
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |  |||||||||||  | ||||    
T  28164239 agagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacctctcaccatgcttagtaagatctttgccataactccctgtatgat 28164338  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    |||| |  | |||||| |||||  || ||||||| ||||| |||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164339 gtcgcacatcagtaggatccacgcca-agaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 28164437  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| || |  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | |   ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28164438 tgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaaga 28164537  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||   ||| |||||||||||||  || || |||  ||  |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28164538 tcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctaaaactgagga 28164637  T
Q  423 acacttgg 430  Q
    ||||||||    
T  28164638 acacttgg 28164645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 480
Target Start/End: Original strand, 28127995 - 28128040
Alignment:
Q  435 gtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||    
T  28127995 gtgattgcatagccatgagaattgacaaaaattggatgagaaaaga 28128040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Original strand, 18723961 - 18724368
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  18723961 agagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactcattttgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttggt 18724060  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||| || |  | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18724061 gtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaa 18724160  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||| |||||||||| |||||||  ||     
T  18724161 tgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcagg 18724260  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    |||   ||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18724261 tcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgagga 18724360  T
Q  423 acacttgg 430  Q
    ||||||||    
T  18724361 acacttgg 18724368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Original strand, 18731380 - 18731787
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18731380 agagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactctttttgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgat 18731479  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||| || |  | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731480 gtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 18731579  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||| |||||||||| |||||||  ||     
T  18731580 tgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcagg 18731679  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    |||   ||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||  | |||||||  || ||||||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18731680 tcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgagga 18731779  T
Q  423 acacttgg 430  Q
    ||||||||    
T  18731780 acacttgg 18731787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 430
Target Start/End: Original strand, 18679451 - 18679850
Alignment:
Q  31 cttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttca-tgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtat 129  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  18679451 cttccattgatgcaaccgctccatgtttttattgttattttggaaactct-ttcagtgattagtgagatgttcaccataactaccactttgatgtcatat 18679549  T
Q  130 gtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaa 229  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679550 gtgagtaggatccacgacatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaa 18679649  T
Q  230 gatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattat 329  Q
    || |||||||||  |||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||| |||||||||| |||||||  || |||   |    
T  18679650 gaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggt 18679749  T
Q  330 catcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttg 429  Q
    |||||||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18679750 catcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttg 18679849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Original strand, 18655353 - 18655760
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  18655353 agagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaattctttctgtgcttagtgagatgttcaccataacttccagtttgat 18655452  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| || || || |  | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18655453 gtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaa 18655552  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | |||  |||| |||||||||| || ||||  ||     
T  18655553 tgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagc 18655652  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagga 422  Q
    |||   ||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||| || |||||||  || ||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18655653 tcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgagga 18655752  T
Q  423 acacttgg 430  Q
    ||||||||    
T  18655753 acacttgg 18655760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 430
Target Start/End: Original strand, 18699284 - 18699683
Alignment:
Q  31 cttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatg 130  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18699284 cttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactctttccgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatg 18699383  T
Q  131 tgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 230  Q
    |||||||| || ||  |||||||||| ||||| || |  | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18699384 tgagtaggatctacgccatagaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 18699483  T
Q  231 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatc 330  Q
    | |||||||||  |||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||| |||||||||| || ||||  || |||   ||    
T  18699484 aggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtc 18699583  T
Q  331 atcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||| || |||||||  || ||||||  ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18699584 atcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttgg 18699683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18073950 - 18073804
Alignment:
Q  133 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 232  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  18073950 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagat 18073851  T
Q  233 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18073850 gcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 279
Target Start/End: Original strand, 17989088 - 17989185
Alignment:
Q  182 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17989088 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 417
Target Start/End: Original strand, 5090921 - 5091237
Alignment:
Q  101 tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgt 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||| |||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||  |||   ||| |||||||||| || |    
T  5090921 tcaccataacttccagtctgatatcgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttccttggagcagtgaataatat 5091020  T
Q  201 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgt 300  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |  ||| || | |  ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||    
T  5091021 ggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatggccttgagaagtgacggtgt 5091120  T
Q  301 gatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtg 400  Q
     ||||  |||||||  | ||| ||  | ||||||||||| ||  ||||||||||| ||   ||||| | ||||||||| || ||||||  ||  ||||||    
T  5091121 tatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtg 5091220  T
Q  401 tcactgcctctgaaact 417  Q
    ||  ||||||| |||||    
T  5091221 tcggtgcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 501
Target Start/End: Original strand, 18699720 - 18699787
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  18699720 ggtgattgcatagccatgagaattgagagaaactagatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18699787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 501
Target Start/End: Original strand, 18655797 - 18655864
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatga 501  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  18655797 ggtgattgcctagccatgaaaattgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18655864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 501
Target Start/End: Original strand, 18679887 - 18679954
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatga 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  18679887 ggtgattgcatagccatgaaaatagagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18679954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 501
Target Start/End: Original strand, 18731824 - 18731891
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatga 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  18731824 ggtgattgcatagccatgaaaatcgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18731891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 384
Target Start/End: Original strand, 17989240 - 17989287
Alignment:
Q  337 gaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17989240 gaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggt 17989287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18073745 - 18073702
Alignment:
Q  341 gtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18073745 gtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggt 18073702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 377
Target Start/End: Original strand, 29273659 - 29274013
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgat 122  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29273659 agagccaacttccattgatgcaaccgatccatgtttttcttgctattttggaaactctcttcgtacttagtgagatgttcaccataactcccactttgat 29273758  T
Q  123 gtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 222  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| |  |  | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29273759 gtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaa 29273858  T
Q  223 tgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaaga 322  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | |||  || | |||||||||| ||||||| |||     
T  29273859 tgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagt 29273958  T
Q  323 tcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagat 377  Q
    |||  |||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  29273959 tcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagat 29274013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31903910 - 31903746
Alignment:
Q  262 aatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaata 361  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  | ||||  |||||||||||||| |||||||| ||| || | ||| ||||| || ||  | |||||||| |||  |    
T  31903910 aatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataa 31903811  T
Q  362 agagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacac 426  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||   | |||||||||   |||||| || |||||||||||    
T  31903810 agagctttgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacac 31903746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 5)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 133 - 430
Target Start/End: Original strand, 3420 - 3718
Alignment:
Q  133 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 232  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||  || | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3420 agtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 3519  T
Q  233 gcatag-ttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatca 331  Q
    |||||| |||  |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3520 gcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtca 3619  T
Q  332 tcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  3620 tcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttgg 3718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 430
Target Start/End: Original strand, 14271 - 14651
Alignment:
Q  49 ctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgc-tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatc 147  Q
    |||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||  |||||||||| | || ||||||||||||  |    
T  14271 ctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgcc 14369  T
Q  148 atagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaa 247  Q
      ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||    
T  14370 gaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaa 14468  T
Q  248 aatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaa 347  Q
    || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  14469 aacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 14568  T
Q  348 ttcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||    
T  14569 ttcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttgg 14651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Original strand, 8134 - 8207
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagt 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  8134 ggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagt 8207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 14688 - 14762
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14688 ggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 14762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 504
Target Start/End: Original strand, 3755 - 3825
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatg 504  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  3755 ggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg 3825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Original strand, 4560 - 4967
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctga 121  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||  | |||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||| ||  || ||    
T  4560 agagccaacttccattgatgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttcaga 4658  T
Q  122 tgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaa 221  Q
    ||||| | || ||||||||||||  |  ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4659 tgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaa 4758  T
Q  222 atgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaag 321  Q
    | |||||| | ||||||  |  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4759 acgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaag 4858  T
Q  322 atcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagg 421  Q
    |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||| |||| || |||||||||    
T  4859 atcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgagg 4958  T
Q  422 aacacttgg 430  Q
    |||||||||    
T  4959 aacacttgg 4967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Original strand, 13521 - 13928
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctga 121  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||||   ||  | ||||| |||||||||  ||  | |||    
T  13521 agagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgtccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatga 13619  T
Q  122 tgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaa 221  Q
    ||||| |  | |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || ||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  13620 tgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaa 13719  T
Q  222 atgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaag 321  Q
    ||   ||||  || ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13720 attttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 13819  T
Q  322 atcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagg 421  Q
    |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||| |||| || |||||||||    
T  13820 atcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagg 13919  T
Q  422 aacacttgg 430  Q
    |||||||||    
T  13920 aacacttgg 13928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 507
Target Start/End: Original strand, 13969 - 14038
Alignment:
Q  438 attgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagt 507  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  13969 attgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagt 14038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 503
Target Start/End: Original strand, 5004 - 5073
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaat 503  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  5004 ggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7823 - 7416
Alignment:
Q  23 agagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctga 121  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||||   ||  | ||||| |||||||||  ||  | |||    
T  7823 agagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgtccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatga 7725  T
Q  122 tgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaa 221  Q
    ||||| |  | |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || ||  | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7724 tgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaa 7625  T
Q  222 atgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaag 321  Q
    ||   ||||  || ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7624 attttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 7525  T
Q  322 atcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgagg 421  Q
    |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||| |||| || ||||| |||    
T  7524 atcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaagg 7425  T
Q  422 aacacttgg 430  Q
    |||||||||    
T  7424 aacacttgg 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7327
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttga 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  7379 ggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttga 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 59758 - 59612
Alignment:
Q  133 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 232  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  59758 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagat 59659  T
Q  233 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  59658 gcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 59553 - 59510
Alignment:
Q  341 gtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  59553 gtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggt 59510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 430
Target Start/End: Original strand, 37 - 213
Alignment:
Q  254 ggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattccct 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    |||||||    
T  37 ggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattccct 136  T
Q  354 tgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacacttgg 430  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  137 tgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttgg 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 486
Target Start/End: Original strand, 250 - 302
Alignment:
Q  434 ggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttga 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  250 ggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttga 302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 34860 - 34620
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34860 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 34761  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggta 385  Q
    || ||||  |||||| ||||||||||||| || ||| ||  | ||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||||||  ||||||||||  |||||    
T  34760 gaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggta 34661  T
Q  386 aaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacac 426  Q
    |||   | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34660 aaaccatagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 34620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 43184 - 42864
Alignment:
Q  103 accataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtgg 202  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  | || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |  ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  43184 accataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtgg 43085  T
Q  203 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtga 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  43084 acaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgtta 42985  T
Q  303 tttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtc 402  Q
    |||  || |||| |  ||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||| | |  |||| | || |||||||| || ||||||   |  ||||||||    
T  42984 ttttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtc 42885  T
Q  403 actgcctctgaaactgaggaa 423  Q
    ||| ||||| ||||| |||||    
T  42884 actacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 116998 - 116767
Alignment:
Q  119 tgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 218  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||  |  |||   ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  116998 tgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttgaagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagc 116899  T
Q  219 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagttttggtgtgatttcatctcctctttc 318  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||| || |||| ||     
T  116898 aaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttg 116799  T
Q  319 aagatcattatcatcaatgaaagtacgaattc 350  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  116798 aaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattc 116767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27583 - 27415
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27583 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 27484  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattccctt 354  Q
    || ||||  || ||| |||||||| |||| || ||| ||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  27483 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattccctt 27415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 426
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58574
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggta 385  Q
    || ||||  |||||| ||||| || |||| || ||| ||  | ||||| ||||| || || ||||||||||||  ||||||  | |||||||| || |||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  386 aaattgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacac 426  Q
    |||   | |||||||||||  ||||| || || ||||||||    
T  58534 aaaccatagcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacac 58574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279670
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| || |  |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaa 339  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||||  | ||| ||  |||||||||||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaa 3279670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 384
Target Start/End: Original strand, 17993736 - 17993934
Alignment:
Q  186 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     || || | |  |||   ||| || || |||||||||  |||    
T  17993736 agcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaagacgataatcgcaattcttgagtcttcaatgctctt 17993835  T
Q  286 gacaagttttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggt 384  Q
    ||  ||    |||||||||||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17993836 gaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagattaccggt 17993934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3279908 - 3279857
Alignment:
Q  104 ccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaa 155  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  3279908 ccataactcccagtctgatgtcgcacgtgggaaggttccacatcatagaaaa 3279857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16688943
Alignment:
Q  193 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagt 292  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||   |||||| | ||| ||   |||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  16689139 aatgatgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagt 16689040  T
Q  293 tttggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaataagagccttatagagattaccggtaaaat 389  Q
      |||||||||||  || ||||| | ||| || || |||||||||||   ||| ||||||||||||   ||||| || || |||||||| |||||||    
T  16689039 gatggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtcacatagagctttgtacagattaccagtaaaat 16688943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University