View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17962_high_35 (Length: 261)

Name: NF17962_high_35
Description: NF17962
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17962_high_35
NF17962_high_35
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (26-226)||(11860-12062)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (26-225)||(22132786-22132987)
chr4 (26-227)||(56030187-56030390)
chr4 (26-225)||(5100743-5100944)
chr4 (26-225)||(22135018-22135219)
chr4 (26-225)||(14787820-14788021)
chr4 (26-227)||(44600227-44600430)
chr4 (26-226)||(17662625-17662827)
chr4 (26-226)||(24347958-24348159)
chr4 (26-221)||(30136319-30136516)
chr4 (77-227)||(47211158-47211310)
chr4 (61-226)||(9022059-9022225)
chr4 (73-225)||(9863499-9863650)
chr4 (61-225)||(10112626-10112787)
chr4 (26-226)||(38890517-38890702)
chr4 (124-223)||(19322410-19322510)
chr4 (154-225)||(14789500-14789571)
chr4 (142-211)||(38209186-38209255)
chr4 (26-118)||(19322547-19322641)
chr4 (26-99)||(53404998-53405071)
chr4 (61-145)||(54929094-54929180)
chr4 (147-215)||(5516771-5516839)
chr4 (142-213)||(29609914-29609985)
chr4 (68-145)||(10979676-10979755)
chr4 (144-209)||(54929198-54929261)
chr4 (104-145)||(14647173-14647214)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (26-225)||(51943042-51943243)
chr3 (26-225)||(746422-746623)
chr3 (26-225)||(53915881-53916082)
chr3 (26-225)||(25533107-25533308)
chr3 (26-225)||(27636011-27636212)
chr3 (26-228)||(455570-455774)
chr3 (26-227)||(53918049-53918252)
chr3 (26-226)||(1313081-1313283)
chr3 (41-225)||(41848804-41848990)
chr3 (26-225)||(457950-458151)
chr3 (26-225)||(10621926-10622127)
chr3 (26-225)||(42991953-42992154)
chr3 (26-228)||(4104282-4104486)
chr3 (26-223)||(42989954-42990153)
chr3 (151-225)||(6561613-6561687)
chr3 (142-211)||(53974124-53974193)
chr3 (142-211)||(11072648-11072717)
chr3 (61-207)||(11066263-11066429)
chr3 (142-193)||(54287576-54287627)
chr3 (72-142)||(54287487-54287559)
chr3 (77-140)||(53974011-53974077)
chr3 (77-145)||(11072731-11072801)
chr3 (185-226)||(27000082-27000123)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (26-225)||(47905956-47906157)
chr1 (33-225)||(48664852-48665046)
chr1 (26-227)||(15295238-15295441)
chr1 (26-225)||(9459812-9460013)
chr1 (26-225)||(31735914-31736115)
chr1 (26-225)||(39931762-39931963)
chr1 (26-226)||(24325346-24325548)
chr1 (26-225)||(9463639-9463840)
chr1 (26-226)||(17325026-17325228)
chr1 (41-225)||(27337346-27337532)
chr1 (41-225)||(45693838-45694024)
chr1 (35-226)||(2949623-2949816)
chr1 (35-225)||(4131690-4131882)
chr1 (26-226)||(28998643-28998845)
chr1 (26-226)||(29004359-29004561)
chr1 (35-225)||(27339534-27339730)
chr1 (35-198)||(21948591-21948756)
chr1 (37-225)||(6115527-6115718)
chr1 (41-225)||(6997214-6997393)
chr1 (110-225)||(46432521-46432636)
chr1 (74-225)||(16561131-16561284)
chr1 (35-187)||(6996067-6996215)
chr1 (61-145)||(11693580-11693666)
chr1 (26-103)||(46432118-46432195)
chr1 (26-103)||(2510722-2510799)
chr1 (144-211)||(32260750-32260817)
chr1 (61-211)||(13785662-13785831)
chr1 (26-88)||(6115479-6115541)
chr1 (35-93)||(26520522-26520580)
chr1 (61-142)||(14352759-14352842)
chr1 (142-188)||(10115509-10115555)
chr1 (105-158)||(13112046-13112099)
chr1 (148-211)||(11693686-11693749)
chr1 (104-145)||(32260833-32260874)
chr1 (61-142)||(10115572-10115653)
chr1 (147-178)||(16855265-16855296)
chr1 (175-211)||(10115470-10115506)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (35-225)||(28485261-28485453)
chr7 (26-225)||(7472373-7472574)
chr7 (26-226)||(20625733-20625935)
chr7 (26-226)||(20629624-20629826)
chr7 (26-226)||(20642043-20642245)
chr7 (26-225)||(1606171-1606372)
chr7 (26-225)||(3035415-3035616)
chr7 (26-225)||(7092567-7092768)
chr7 (26-225)||(7470420-7470621)
chr7 (26-225)||(11756925-11757126)
chr7 (26-225)||(20299155-20299356)
chr7 (26-225)||(42331392-42331593)
chr7 (35-225)||(47865328-47865520)
chr7 (26-225)||(1849665-1849866)
chr7 (26-225)||(7094814-7095015)
chr7 (26-225)||(18345237-18345438)
chr7 (26-225)||(31156299-31156500)
chr7 (26-225)||(38395986-38396187)
chr7 (35-227)||(7352054-7352248)
chr7 (26-225)||(28487249-28487450)
chr7 (26-227)||(21989851-21990052)
chr7 (35-225)||(38393683-38393875)
chr7 (41-226)||(37412530-37412717)
chr7 (26-225)||(21470682-21470883)
chr7 (35-225)||(7349675-7349867)
chr7 (26-217)||(24258166-24258358)
chr7 (79-225)||(443326-443474)
chr7 (26-226)||(3676996-3677179)
chr7 (26-156)||(13099864-13099996)
chr7 (104-227)||(40281869-40281994)
chr7 (26-145)||(43253914-43254035)
chr7 (35-121)||(20297163-20297251)
chr7 (61-211)||(10690688-10690845)
chr7 (142-208)||(12310542-12310608)
chr7 (162-211)||(20297112-20297161)
chr7 (171-211)||(43254023-43254063)
chr7 (61-145)||(12310442-12310528)
chr7 (147-178)||(6628853-6628884)
chr7 (147-178)||(12657667-12657698)
chr7 (148-178)||(12485044-12485074)
chr7 (148-178)||(12506475-12506505)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (26-227)||(42452447-42452650)
chr2 (26-226)||(35218364-35218566)
chr2 (26-225)||(35215983-35216184)
chr2 (26-225)||(42923893-42924094)
chr2 (26-225)||(23452628-23452829)
chr2 (61-225)||(27583741-27583907)
chr2 (61-211)||(28568584-28568736)
chr2 (104-227)||(27136376-27136507)
chr2 (130-218)||(34575608-34575696)
chr2 (61-209)||(15693589-15693755)
chr2 (150-211)||(28568350-28568411)
chr2 (142-207)||(41303549-41303615)
chr2 (76-215)||(39286888-39287042)
chr2 (68-145)||(41304806-41304884)
chr2 (161-211)||(7502583-7502633)
chr2 (61-144)||(7502638-7502723)
chr2 (69-145)||(41303457-41303535)
chr2 (142-211)||(41304898-41304960)
chr2 (61-93)||(34575556-34575588)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (26-225)||(2629278-2629479)
chr6 (26-225)||(5275727-5275928)
chr6 (26-225)||(12195903-12196104)
chr6 (26-226)||(19704964-19705166)
chr6 (26-228)||(30034995-30035199)
chr6 (26-226)||(18317750-18317952)
chr6 (26-226)||(26932957-26933159)
chr6 (26-225)||(30966923-30967124)
chr6 (35-227)||(17852265-17852458)
chr6 (35-223)||(17011781-17011968)
chr6 (64-225)||(22858373-22858536)
chr6 (61-223)||(20526548-20526708)
chr6 (61-203)||(30445243-30445404)
chr6 (142-203)||(30443036-30443097)
chr6 (168-211)||(12158532-12158575)
chr6 (61-145)||(30443111-30443195)
chr6 (147-191)||(3833176-3833220)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (26-225)||(25803707-25803908)
chr5 (26-223)||(18511601-18511800)
chr5 (26-225)||(3373429-3373630)
chr5 (26-225)||(18468698-18468899)
chr5 (26-225)||(27912219-27912420)
chr5 (26-225)||(26098640-26098841)
chr5 (26-225)||(27910135-27910336)
chr5 (26-222)||(18509706-18509904)
chr5 (26-225)||(15551925-15552126)
chr5 (26-205)||(10586549-10586730)
chr5 (26-225)||(26097421-26097624)
chr5 (44-230)||(21288524-21288713)
chr5 (41-227)||(18596324-18596523)
chr5 (75-218)||(17415748-17415893)
chr5 (26-145)||(18466453-18466574)
chr5 (121-226)||(6661929-6662034)
chr5 (146-225)||(40221282-40221361)
chr5 (61-145)||(15143262-15143348)
chr5 (142-209)||(5779144-5779211)
chr5 (171-225)||(18466411-18466465)
chr5 (171-226)||(15143219-15143274)
chr5 (35-94)||(40221340-40221399)
chr5 (144-178)||(2532750-2532784)
chr5 (171-209)||(32520215-32520253)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (26-228)||(15808959-15809163)
chr8 (26-225)||(28283612-28283813)
chr8 (26-226)||(3873749-3873952)
chr8 (26-225)||(43529871-43530072)
chr8 (27-225)||(41384493-41384692)
chr8 (26-225)||(608470-608671)
chr8 (35-224)||(41382420-41382611)
chr8 (69-225)||(32339094-32339252)
chr8 (108-225)||(3265635-3265752)
chr8 (144-211)||(13986304-13986370)
chr8 (144-211)||(30679186-30679252)
chr8 (61-145)||(11701364-11701447)
chr8 (26-76)||(181434-181484)
chr8 (73-142)||(13986214-13986285)
chr8 (144-173)||(27820149-27820178)
chr8 (171-211)||(11701435-11701475)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (26-225)||(51709-51910)
scaffold0005 (154-225)||(50159-50230)
scaffold0005 (104-145)||(170076-170117)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (26-226)||(1734-1936)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (26-225)||(78883-79084)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (110-224)||(2070-2184)
scaffold0468 (26-84)||(2022-2080)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (79-225)||(4546-4694)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (131-225)||(1-95)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (74-142)||(57836-57905)
scaffold0008 (144-211)||(57926-57991)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (147-188)||(2232-2273)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (165-211)||(10447-10493)


Alignment Details
Target: scaffold0154 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 11860 - 12062
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11860 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 11959  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11960 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatactacaa 12059  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  12060 caa 12062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 22132786 - 22132987
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22132786 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 22132885  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132886 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatactacaa 22132985  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  22132986 ca 22132987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 56030390 - 56030187
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  56030390 ctccttcagtgaaagaatatttgcaccaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 56030291  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56030290 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 56030191  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  56030190 caat 56030187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5100944 - 5100743
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  5100944 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttgtt 5100845  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5100844 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 5100745  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  5100744 ca 5100743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 22135018 - 22135219
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22135018 ctccttcagtgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 22135117  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22135118 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 22135217  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  22135218 ca 22135219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 14787820 - 14788021
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  14787820 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatt 14787919  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14787920 gtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 14788019  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  14788020 ca 14788021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 44600227 - 44600430
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  44600227 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 44600326  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44600327 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 44600426  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  44600427 caat 44600430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 17662625 - 17662827
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17662625 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcgtacggtacaaaaatatatttatt 17662724  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17662725 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttgtagtcatactacaa 17662824  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  17662825 caa 17662827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24348159 - 24347958
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  24348159 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 24348060  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24348059 gtccataaatatattttc-gcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 24347961  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  24347960 caa 24347958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30136516 - 30136319
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30136516 ctccttcaatgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattctcttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttatt 30136417  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  30136416 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaattttaaatcattctac 30136319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Original strand, 47211158 - 47211310
Alignment:
Q  77 atatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211158 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttgagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 47211257  T
Q  175 tttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47211258 tttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaacaat 47211310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9022225 - 9022059
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9022225 aatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatctttcttcatacggtagaaaaatatatttattgtc-ataaatatattttcagcaaaaaatatatttg 9022127  T
Q  159 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9022126 aaacaaatcatttatattttcaacaacaatatttctcatccataaaattttgaatcatactacaacaa 9022059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9863650 - 9863499
Alignment:
Q  73 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttta 172  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9863650 caaaatatatttgcatcaaatcttccttcatgc-acaaaaatatatttattgttcataaatatatttttagcacaaaatatgtttgaaacaaatcattta 9863552  T
Q  173 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  9863551 tatttttagtaacaatatatttcatccaacaaattttgagtcatattacaaca 9863499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10112787 - 10112626
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10112787 aatattctctttcaaa-tatatttacatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatagtttcagcacaaaatatatttg 10112689  T
Q  159 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||    
T  10112688 aaac----cttttatatttttagcaacaatattcttcattcaacaaattttaagtcatactacaaca 10112626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 38890517 - 38890702
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatatt-ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttat 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  38890517 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacaatacaaaaatatatttat 38890616  T
Q  123 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactaca 222  Q
    ||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38890617 tgtccata------------------aatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatgctaca 38890698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19322510 - 19322410
Alignment:
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagc-aacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactaca 222  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19322510 gtccataaatatattttcagtataaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 19322411  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  19322410 a 19322410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 14789500 - 14789571
Alignment:
Q  154 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14789500 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 14789571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Original strand, 38209186 - 38209255
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38209186 agcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttaacaacaatatttttcatccatcaaattttga 38209255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19322641 - 19322547
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatat 118  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  19322641 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcctttatacagtacaaaaatatat 19322547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 53405071 - 53404998
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405071 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatttttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 53404998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 54929094 - 54929180
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54929094 aatattcctattaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattttttgtccataaatatattttcagca 54929180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Original strand, 5516771 - 5516839
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatca 215  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5516771 aaaatatatttgaaacaattcatttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaattttaaatca 5516839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Original strand, 29609914 - 29609985
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaat 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29609914 agcacaaaatatatttgaaaaaaatcaagaatacttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaat 29609985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10979755 - 10979676
Alignment:
Q  68 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10979755 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacagcacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagca 10979676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 54929198 - 54929261
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  54929198 cacaaaatacatttaaatcaaatcttttatatttttagcaacaatattatt--tccatcaaatttt 54929261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Original strand, 14647173 - 14647214
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647173 ggtacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 14647214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51943243 - 51943042
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  51943243 ctccttcaatgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttatt 51943144  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51943143 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 51943044  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  51943043 ca 51943042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 746623 - 746422
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  746623 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 746524  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  746523 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 746424  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  746423 ca 746422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 53915881 - 53916082
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  53915881 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 53915980  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53915981 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccctcaaattttgagtcatactacaa 53916080  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  53916081 ca 53916082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25533308 - 25533107
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25533308 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 25533209  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25533208 gtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 25533109  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  25533108 ca 25533107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 27636011 - 27636212
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27636011 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 27636110  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27636111 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaactaatattttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaaatcatactacaa 27636210  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  27636211 ca 27636212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 455774 - 455570
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  455774 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 455675  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  455674 gtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaattttgagtcatactacaa 455575  T
Q  224 caatt 228  Q
    |||||    
T  455574 caatt 455570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 53918049 - 53918252
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  53918049 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaaaaaaatatatttatt 53918148  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  53918149 gtccataaatatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactataa 53918248  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  53918249 caat 53918252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1313283 - 1313081
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  1313283 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacagaaatatatttatt 1313184  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1313183 gtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 1313084  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  1313083 caa 1313081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41848990 - 41848804
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848990 aatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 41848891  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41848890 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 41848804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 458151 - 457950
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  458151 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 458052  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  458051 gtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaattttgagtcatactacaa 457952  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  457951 ca 457950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 10621926 - 10622127
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  10621926 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 10622025  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10622026 gtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 10622125  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  10622126 ca 10622127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42992154 - 42991953
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  42992154 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 42992055  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42992054 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaaccttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 42991955  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  42991954 ca 42991953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 4104282 - 4104486
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  4104282 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 4104381  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4104382 gtccataaatatattttcagcataaagtatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 4104481  T
Q  224 caatt 228  Q
    |||||    
T  4104482 caatt 4104486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42990153 - 42989954
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  42990153 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 42990054  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42990053 gtccataaatatactttcagcaaaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 42989954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6561687 - 6561613
Alignment:
Q  151 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6561687 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttcgagtcatactacaaca 6561613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Original strand, 53974124 - 53974193
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53974124 agcacaaaatataattgaaacaaatcttttatatttttaacaacaacattcttcatccatcaaattttga 53974193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11072717 - 11072648
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11072717 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatattttttgcaacaatcttcttcatccatcaaattttga 11072648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11066429 - 11066263
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca---------------- 142  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||                    
T  11066429 aatattctctttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtaaaaaaatatatttattgtccataaatgtattttcaacaacaatcttccgaa 11066330  T
Q  143 -gcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttt-agcaacaatattcttcatccatcaaatt 207  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11066329 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatcttttttagcaacaatattcttcatccatcaaatt 11066263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Original strand, 54287576 - 54287627
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54287576 agcacgaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatcttct 54287627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 142
Target Start/End: Original strand, 54287487 - 54287559
Alignment:
Q  72 tcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54287487 tcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacagtacaaaaatgtatttattatccataaatatattttca 54287559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 140
Target Start/End: Original strand, 53974011 - 53974077
Alignment:
Q  77 atatatttgcatcaaatcgttctt-cat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatttt 140  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974011 atatatttgcatcaaatcttcctttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatatttt 53974077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11072801 - 11072731
Alignment:
Q  77 atatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11072801 atatatttgcatcaaatcttccgtaatacggtacaaaaatctatttgttgtccataaatgtattttcagca 11072731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27000123 - 27000082
Alignment:
Q  185 caatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27000123 caatattctccatccatcaaattttcagtcatactacaacaa 27000082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47906157 - 47905956
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  47906157 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 47906058  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47906057 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 47905958  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  47905957 ca 47905956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48665046 - 48664852
Alignment:
Q  33 aatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccata 130  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  48665046 aatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatgtgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccata 48664947  T
Q  131 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48664946 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 48664852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 15295238 - 15295441
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15295238 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 15295337  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15295338 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 15295437  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  15295438 caat 15295441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 9459812 - 9460013
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  9459812 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacggtataaaaatatatttatt 9459911  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9459912 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 9460011  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  9460012 ca 9460013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 31735914 - 31736115
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31735914 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 31736013  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31736014 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccttccatcaaattttgagtcatactacaa 31736113  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  31736114 ca 31736115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39931963 - 39931762
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39931963 ctccttcaataaaagaatatttgcatcaaaagtataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 39931864  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39931863 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 39931764  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  39931763 ca 39931762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24325548 - 24325346
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  24325548 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 24325449  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24325448 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 24325349  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  24325348 caa 24325346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 9463639 - 9463840
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || |||||||||||||||    
T  9463639 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacgatataaaaatatatttatt 9463738  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9463739 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 9463838  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  9463839 ca 9463840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 17325026 - 17325228
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17325026 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcccttgcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacggtacaaaaatatatttatt 17325125  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17325126 gtccataaatatattttcaactcaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 17325225  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  17325226 caa 17325228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 27337346 - 27337532
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337346 aatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 27337445  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27337446 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattccccatccatcaaatttggagtcatactacaaca 27337532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 45693838 - 45694024
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693838 aatatttgcataaaaaatatattattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 45693937  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45693938 tttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatagtacaaca 45694024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Original strand, 2949623 - 2949816
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2949623 tgaaagaatatttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaa 2949722  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2949723 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatgaaattttgagtcatactataacaa 2949816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 4131690 - 4131882
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt-gtccataa 131  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4131690 tgaaagaatatttgcatc-aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatttgtccataa 4131788  T
Q  132 atatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4131789 atatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 4131882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 28998643 - 28998845
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  28998643 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttatt 28998742  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28998743 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 28998842  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  28998843 caa 28998845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 29004359 - 29004561
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  29004359 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttatt 29004458  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29004459 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 29004558  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  29004559 caa 29004561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 27339534 - 27339730
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27339534 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 27339633  T
Q  133 tat----attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  27339634 tatatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccgtcaaatttggagtcatactacaaca 27339730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 21948591 - 21948756
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21948591 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 21948690  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21948691 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatc 21948756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 225
Target Start/End: Original strand, 6115527 - 6115718
Alignment:
Q  37 aaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaata 134  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115527 aaaatatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcattcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaata 6115626  T
Q  135 tattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaa-ttttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6115627 tattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttttgagtcatcctacaaca 6115718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6997393 - 6997214
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6997393 aatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaa------tttgcatcaaatcgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataa-tatatt 6997301  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6997300 tttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactataaca 6997214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Original strand, 46432521 - 46432636
Alignment:
Q  110 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46432521 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 46432620  T
Q  210 gaatcatactacaaca 225  Q
    || |||||||||||||    
T  46432621 gagtcatactacaaca 46432636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16561284 - 16561131
Alignment:
Q  74 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 171  Q
    ||||||||||||  ||||||  | ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16561284 aaaatatatttgtttcaaatattccttcatacggtacaaaaagatatttattgtcaataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatatttt 16561185  T
Q  172 atatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16561184 atatttttagcaacaatattcttcatccaacaaattttgaatcatacaacaaca 16561131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6996215 - 6996067
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6996215 tgaaagaatatttgcaacaaaaatataatattccctttcaa------tttacatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatgtattgtccataaa 6996122  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6996121 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaagtcttttatatttttagcaacaa 6996067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 11693580 - 11693666
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11693580 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 11693666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 46432118 - 46432195
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 103  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432118 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 46432195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 2510722 - 2510799
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 103  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510722 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 2510799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32260817 - 32260750
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32260817 cacaaaatatattttaaacaattcttttatatttttagcaacaatcttcttcatccatcaaattttga 32260750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Original strand, 13785662 - 13785831
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca------------- 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||                 
T  13785662 aatattccttttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttactatctataaatatattttcagcaacaatattctaga 13785761  T
Q  146 ----caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13785762 aacacaaaatatatttgaaacaaatctttcatatttttagcgacaatattctccatccatcaatttttga 13785831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 88
Target Start/End: Original strand, 6115479 - 6115541
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 88  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115479 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 6115541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 93
Target Start/End: Original strand, 26520522 - 26520580
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 93  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520522 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 26520580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14352842 - 14352759
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14352842 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactattcataaatatattttca 14352759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10115555 - 10115509
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10115555 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaat 10115509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Original strand, 13112046 - 13112099
Alignment:
Q  105 gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13112046 gtacaaaaatatatttattgtccatgaatatattttcagcataaaatacatttg 13112099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Original strand, 11693686 - 11693749
Alignment:
Q  148 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11693686 aaatatatttaaaacaaaatttttataattttagcaataatcttcttcatccatcaaattttga 11693749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32260874 - 32260833
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32260874 ggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 32260833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10115653 - 10115572
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115653 aatattccgtttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacgggataaaaatatttattgtccataaatatattttca 10115572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 178
Target Start/End: Original strand, 16855265 - 16855296
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855265 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 16855296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10115506 - 10115470
Alignment:
Q  175 tttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10115506 ttttttgcaacaatattcttaatccatcaaattttga 10115470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28485453 - 28485261
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28485453 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 28485354  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485353 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 28485261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 7472373 - 7472574
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  7472373 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgatacaataatatatttatt 7472472  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7472473 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7472572  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  7472573 ca 7472574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20625935 - 20625733
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20625935 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20625836  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20625835 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20625736  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  20625735 caa 20625733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20629826 - 20629624
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20629826 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20629727  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20629726 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20629627  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  20629626 caa 20629624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20642245 - 20642043
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20642245 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20642146  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20642145 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20642046  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  20642045 caa 20642043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1606372 - 1606171
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1606372 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 1606273  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1606272 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 1606173  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  1606172 ca 1606171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3035616 - 3035415
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3035616 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaaatatatttatt 3035517  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3035516 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 3035417  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  3035416 ca 3035415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 7092567 - 7092768
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7092567 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7092666  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7092667 gtccataaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7092766  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  7092767 ca 7092768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 7470420 - 7470621
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7470420 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7470519  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7470520 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatgttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7470619  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  7470620 ca 7470621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11757126 - 11756925
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  11757126 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 11757027  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11757026 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 11756927  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  11756926 ca 11756925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20299356 - 20299155
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20299356 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20299257  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20299256 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 20299157  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  20299156 ca 20299155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 42331392 - 42331593
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  42331392 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatacttatt 42331491  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  42331492 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcattcatcaaattttaagtcatactacaa 42331591  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  42331592 ca 42331593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47865520 - 47865328
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47865520 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 47865421  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47865420 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaaca 47865328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1849866 - 1849665
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1849866 ctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 1849767  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1849766 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 1849667  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  1849666 ca 1849665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 7094814 - 7095015
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7094814 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7094913  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7094914 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7095013  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  7095014 ca 7095015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18345438 - 18345237
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18345438 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccatttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 18345339  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18345338 gtcaataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 18345239  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  18345238 ca 18345237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 31156299 - 31156500
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31156299 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 31156398  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31156399 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 31156498  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  31156499 ca 31156500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38396187 - 38395986
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  38396187 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 38396088  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  38396087 gtacataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaa 38395988  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  38395987 ca 38395986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Original strand, 7352054 - 7352248
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  7352054 tgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaa 7352153  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7352154 tatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaacaat 7352248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28487450 - 28487249
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  28487450 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaattatatttatt 28487351  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28487350 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaagcaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 28487251  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  28487250 ca 28487249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21990052 - 21989851
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21990052 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 21989953  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21989952 gtccataaatatattttcaacacaa--tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgggtcatactacaa 21989855  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  21989854 caat 21989851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38393875 - 38393683
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38393875 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataacattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 38393776  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38393775 taaattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttagaatcatactacaaca 38393683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Original strand, 37412530 - 37412717
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37412530 aatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgttacataattatatttattgtccataaatatatt 37412629  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37412630 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 37412717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 21470682 - 21470883
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  21470682 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatattcgcatcaaatcgttcttcatacgatataaaaatatatttatt 21470781  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21470782 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcaaactacaa 21470881  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  21470882 ca 21470883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 7349675 - 7349867
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  7349675 tgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaa 7349774  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7349775 tatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaaca 7349867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24258358 - 24258166
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  24258358 ctccttcagtgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa-tcgtccttcatactgtacaaaaatatatttatt 24258260  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcata 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24258259 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcata 24258166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 443474 - 443326
Alignment:
Q  79 atatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443474 atatttgcatcaaattgttcttcagacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 443375  T
Q  177 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  443374 tttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 443326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3677179 - 3676996
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||          
T  3677179 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatata------ 3677086  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3677085 -------------ttttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatctatcaaattttgagtcatactacaa 3676999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 156
Target Start/End: Original strand, 13099864 - 13099996
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13099864 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacggtacgaaaatatatttatt 13099963  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099964 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 13099996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 40281869 - 40281994
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaa--tattcttcatccat 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  40281869 ggtacaaaaatatatttattttccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaaattcttcttcatccat 40281968  T
Q  202 caaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  40281969 caaattttgagtcatactacaccaat 40281994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 43253914 - 43254035
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  43253914 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 43254013  T
Q  124 gtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  43254014 gtccataaatatatttttagca 43254035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20297251 - 20297163
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatattta 121  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  20297251 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattta 20297163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10690845 - 10690688
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctt---catggtacaaaaatatatttattgtccataa------atatattttcagcacaaaat 151  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||      || | ||   ||||||||||    
T  10690845 aatattccttttaaaaatatatttgcatcaaata-ttctgtcacatggtacaaaaatatatttattgtacataagcaacaattttttgaaagcacaaaat 10690747  T
Q  152 atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  10690746 atatttgaaacata-cttttatatttttagcaacaatcttctccctccatcaaattttga 10690688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 12310542 - 12310608
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12310542 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatcagtagcaacaatcttcttcatccattaaattt 12310608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20297161 - 20297112
Alignment:
Q  162 caaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297161 caaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 20297112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 43254023 - 43254063
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43254023 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 43254063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 12310442 - 12310528
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||    
T  12310442 aatattccttttaaaaatatatttacatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattaactgtccttaagtataatttcagca 12310528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6628884 - 6628853
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628884 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 6628853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 178
Target Start/End: Original strand, 12657667 - 12657698
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657667 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12657698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 12485044 - 12485074
Alignment:
Q  148 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12485044 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12485074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 12506475 - 12506505
Alignment:
Q  148 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506475 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12506505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42452650 - 42452447
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  42452650 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 42452551  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42452550 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttaagtcatactacaa 42452451  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  42452450 caat 42452447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 35218364 - 35218566
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  35218364 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttatt 35218463  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35218464 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 35218563  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  35218564 caa 35218566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 35215983 - 35216184
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  35215983 ctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttatt 35216082  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35216083 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 35216182  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  35216183 ca 35216184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 42923893 - 42924094
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42923893 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 42923992  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42923993 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 42924092  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  42924093 ca 42924094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 23452628 - 23452829
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  23452628 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 23452727  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23452728 gtccataaatttattttcagcataaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 23452827  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  23452828 ca 23452829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 27583741 - 27583907
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27583741 aatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtataaaaatatatttattgttcataaatatatcttcagcacaaaatatatttg 27583840  T
Q  159 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27583841 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaaatttgagtcatactacaaca 27583907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Original strand, 28568584 - 28568736
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28568584 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcacacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaaaacaaaatatatttg 28568683  T
Q  159 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28568684 aaacaaatcttttatagttttagcaacaatattcttcatctatcaaattttga 28568736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 27136376 - 27136507
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatat--------attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttc 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27136376 ggtacaaaaatatatttattttccataaatatatttatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaccaatattcttc 27136475  T
Q  196 atccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27136476 atccatcaaattttgagtcatactacaacaat 27136507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Original strand, 34575608 - 34575696
Alignment:
Q  130 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34575608 aaatatattttcagcacaaaatatatttagaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 34575696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15693755 - 15693589
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca------------- 145  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||                 
T  15693755 aatatcccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgcccataaatatattttcagcaacaagtttttgga 15693656  T
Q  146 ----caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15693655 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttt-atatttttagcaacaatattattcatccatcaaatttt 15693589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28568411 - 28568350
Alignment:
Q  150 atatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568411 atatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattcttcatccatcaaattttga 28568350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 41303549 - 41303615
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata-tttttagcaacaatattcttcatccatcaaatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41303549 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttttagcaacaatcttcttcatccatcaaatt 41303615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39287042 - 39286888
Alignment:
Q  76 aatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcag-----------------cacaaaatatatt 156  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 || ||||||||||    
T  39287042 aatatatttgcatcaaatcttcattcatatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttaagcaacaatcttctggaatcataaaatatatt 39286943  T
Q  157 tgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatca 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  39286942 tgaaacaaatcatttatatttttagcaacaat----ctcatccatcaaattttgaatca 39286888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 41304806 - 41304884
Alignment:
Q  68 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg-gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  41304806 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatgtacaaaaatatatttactatccataaatatattgtcagca 41304884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7502633 - 7502583
Alignment:
Q  161 acaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7502633 acaaatcttttatactttgagcaacaatcttcttcatccatcaaattttga 7502583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7502723 - 7502638
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct-tcatgg--tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagc 144  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7502723 aatatttcctttaaaaatatatttgcatcaaatc-ttctgtcatacaatacaaaaatatttttattgttcataaatatattttcagc 7502638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Original strand, 41303457 - 41303535
Alignment:
Q  69 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || | |||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41303457 ctttaaaaatatatttgaatcaattcttccttcacacggtacaaaattatatttactgtccataaatatattttcagca 41303535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Original strand, 41304898 - 41304960
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41304898 agcacaaaatatatttga--caaatcttttatattttta-----aatcttcttcatccatcaaattttga 41304960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 93
Target Start/End: Original strand, 34575556 - 34575588
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575556 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 34575588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 2629278 - 2629479
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  2629278 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 2629377  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2629378 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 2629477  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  2629478 ca 2629479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 5275727 - 5275928
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5275727 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 5275826  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5275827 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 5275926  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  5275927 ca 5275928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 12195903 - 12196104
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12195903 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 12196002  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12196003 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 12196102  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  12196103 ca 12196104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 19704964 - 19705166
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19704964 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 19705063  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19705064 gtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 19705163  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  19705164 caa 19705166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 30034995 - 30035199
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  30034995 ctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 30035094  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30035095 gtctataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 30035194  T
Q  224 caatt 228  Q
    |||||    
T  30035195 caatt 30035199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18317952 - 18317750
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18317952 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttatt 18317853  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18317852 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatactacaa 18317753  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  18317752 caa 18317750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 26932957 - 26933159
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  26932957 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 26933056  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26933057 gtccataataatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 26933156  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  26933157 caa 26933159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30967124 - 30966923
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  30967124 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 30967025  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  30967024 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaa 30966925  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  30966924 ca 30966923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17852458 - 17852265
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17852458 tgaaataatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcataaggtacaaaaatatatttattgtccataaa 17852359  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagca--acaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17852358 tatattttcagcataaa--atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacacaatattctccat-catcaaattttgagtcatatttcaacaat 17852265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17011968 - 17011781
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011968 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccatcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaa 17011869  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17011868 tatattttctacacaaa--atatttaaaacaaa-cttttatatttttagcaataatattcttcatccatcaaattttaagtcatactacaa 17011781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Original strand, 22858373 - 22858536
Alignment:
Q  64 attccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22858373 attccctttcaaaatatatttgcatctaatcttctttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaagtatatttaaaa 22858472  T
Q  162 caaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22858473 caaatcttttatatttttattaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 22858536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20526708 - 20526548
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaa-tatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattt 157  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20526708 aatattctctttcaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatgta-----cataaatatattttcagcataaaatatattt 20526614  T
Q  158 gaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20526613 gaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcacccatcaaattttgagtcatactacaa 20526548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30445404 - 30445243
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc----------------- 141  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                     
T  30445404 aatattcctttttaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagcaacaatattctgga 30445305  T
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30445304 agcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttctagcaacaatattcttcatccatca 30445243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30443097 - 30443036
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatca 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30443097 agcaaaaaatatatttgaaacaaatctcttatatttttaacaacaatattcttcatccatca 30443036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12158575 - 12158532
Alignment:
Q  168 ttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12158575 ttttatatttttagcaacaatcttcttcattcatcaaattttga 12158532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30443195 - 30443111
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30443195 aatatttcttttaaaaatacatttgcatcaaatcttcctttatacggtacaaacatatattt--tgtccataaatatattttcagca 30443111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3833220 - 3833176
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatatt 191  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  3833220 aaaatatatttaaaacaaatattttatgtttttagcaataatatt 3833176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25803908 - 25803707
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25803908 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 25803809  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25803808 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 25803709  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  25803708 ca 25803707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 18511601 - 18511800
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18511601 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 18511700  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18511701 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 18511800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 3373429 - 3373630
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3373429 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 3373528  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3373529 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattctgagtcatactacaa 3373628  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  3373629 ca 3373630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18468899 - 18468698
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18468899 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 18468800  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18468799 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 18468700  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  18468699 ca 18468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27912420 - 27912219
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  27912420 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacgatacaaaaatatatttatt 27912321  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27912320 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 27912221  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  27912220 ca 27912219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 26098640 - 26098841
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  26098640 ctccttcaatgaaagaatttttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatt 26098739  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26098740 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 26098839  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  26098840 ca 26098841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27910336 - 27910135
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  27910336 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 27910237  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27910236 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 27910137  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  27910136 ca 27910135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Original strand, 18509706 - 18509904
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18509706 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttatt 18509805  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactaca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18509806 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 18509904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15552126 - 15551925
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15552126 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatgtcatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 15552027  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552026 gtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 15551927  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  15551926 ca 15551925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10586730 - 10586549
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  10586730 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 10586631  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10586630 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaa 10586549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26097624 - 26097421
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctt--tcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatattta 121  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26097624 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacatttccttcttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattta 26097525  T
Q  122 ttgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26097524 ttgtccataaatatattttcagtacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactac 26097425  T
Q  222 aaca 225  Q
    ||||    
T  26097424 aaca 26097421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21288713 - 21288524
Alignment:
Q  44 atttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtaca-aaaatatatttattgtccataaatatatttt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288713 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcataaaatcgttcttcatacggtaccgaaaatatatttattgtccataaatatatttt 21288614  T
Q  141 cagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaattgt 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21288613 cagcacaaaatatattttaaacaaatcttttttatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagttatactacaacaattgt 21288524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18596523 - 18596324
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttat-----------tgtcc 127  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||           |||||    
T  18596523 aatatttgtatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatggtatatttattgtcc 18596424  T
Q  128 ataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18596423 ataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatagtacaacaat 18596324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Original strand, 17415748 - 17415893
Alignment:
Q  75 aaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttta 172  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17415748 aaatatatttgcatcaaattttccttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatctttta 17415847  T
Q  173 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17415848 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 17415893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18466574 - 18466453
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18466574 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 18466475  T
Q  124 gtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  18466474 gtccataaatatatttttagca 18466453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 6661929 - 6662034
Alignment:
Q  121 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatacta 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  6661929 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaagttttaagtcatacta 6662028  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  6662029 caacaa 6662034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40221361 - 40221282
Alignment:
Q  146 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  40221361 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatcaattaaattttgagtcatactacaaca 40221282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15143348 - 15143262
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15143348 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatatttttagca 15143262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 5779144 - 5779211
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  5779144 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatcttcttcatctatcaaatttt 5779211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18466465 - 18466411
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18466465 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 18466411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15143274 - 15143219
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15143274 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactataacaa 15143219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40221399 - 40221340
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 94  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40221399 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgaaacaaatc 40221340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 178
Target Start/End: Original strand, 2532750 - 2532784
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2532750 cacaagatatatttgaaacaaatcttttatatttt 2532784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32520253 - 32520215
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32520253 tatattttcagcaacaatcttcttcatccatcaaatttt 32520215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15809163 - 15808959
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15809163 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 15809064  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15809063 gtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaaaa 15808964  T
Q  224 caatt 228  Q
    |||||    
T  15808963 caatt 15808959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 28283612 - 28283813
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  28283612 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 28283711  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28283712 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 28283811  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  28283812 ca 28283813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3873952 - 3873749
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtt-cttcat--ggtacaaaaatatatttat 122  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  3873952 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttcttcatacgatacaaaaatatatttat 3873853  T
Q  123 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactaca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3873852 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 3873753  T
Q  223 acaa 226  Q
    ||||    
T  3873752 acaa 3873749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43530072 - 43529871
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  43530072 ctccttcagtgaaagaatattagcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 43529973  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43529972 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 43529873  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  43529872 ca 43529871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41384692 - 41384493
Alignment:
Q  27 tcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattg 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41384692 tccttcaatgaaagaatatttgcata-aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattg 41384594  T
Q  125 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaac 224  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41384593 tccataaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaac 41384494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 608671 - 608470
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  608671 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaatatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 608572  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  608571 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtgatactacaa 608472  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  608471 ca 608470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41382611 - 41382420
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382611 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttgttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaa 41382512  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaac 224  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41382511 tatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaac 41382420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32339252 - 32339094
Alignment:
Q  69 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339252 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 32339153  T
Q  167 cttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32339152 cttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 32339094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Original strand, 3265635 - 3265752
Alignment:
Q  108 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3265635 caaacatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatt 3265734  T
Q  208 ttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3265735 ttgagtcatactacaaca 3265752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 13986304 - 13986370
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13986304 cacaaaatatatttaaaacaaatcttt-atatttttagcaacaatcttcttcatccataaaattttga 13986370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 30679186 - 30679252
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30679186 cacaaaatatatctaaaacaaatcttttttatttttaccaac-atattcttcatccatcaaattttga 30679252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 11701364 - 11701447
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || | | | | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11701364 aatattccctttaaaaatatatttacatcaattcttccat-acggtacaaaaatatatttactgaccataaatatattttcagca 11701447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 181484 - 181434
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaa 76  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  181484 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaa 181434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Original strand, 13986214 - 13986285
Alignment:
Q  73 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  13986214 caaaatatatttgcatcaaatcttctttcatgcggtacaaaaatttattaactatccataaatatattttca 13986285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 173
Target Start/End: Original strand, 27820149 - 27820178
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820149 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 27820178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 11701435 - 11701475
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11701435 tatattttcagcaacaatcttcttcgtccatcaaattttga 11701475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51910 - 51709
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  51910 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatt 51811  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51810 gtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 51711  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  51710 ca 51709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50230 - 50159
Alignment:
Q  154 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50230 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 50159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 170117 - 170076
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170117 ggtacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 170076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1936 - 1734
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1936 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttatt 1837  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1836 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatactacaa 1737  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  1736 caa 1734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 79084 - 78883
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  79084 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttatt 78985  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  78984 atccataaatatatttttagcagaaaatatatttgagacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaa 78885  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  78884 ca 78883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2184
Alignment:
Q  110 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2070 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 2169  T
Q  210 gaatcatactacaac 224  Q
    || ||||||||||||    
T  2170 gagtcatactacaac 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Original strand, 2022 - 2080
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatattt 84  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2022 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatattt 2080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4694 - 4546
Alignment:
Q  79 atatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 176  Q
    ||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4694 atatttgcatcaaattgtccttcatacagtacaaaaatatatatattgtccataaatatattttcagcacgaaatatattcgaaacaaatcttttatatt 4595  T
Q  177 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  4594 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagttatactgcaaca 4546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 1 - 95
Alignment:
Q  131 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 142
Target Start/End: Original strand, 57836 - 57905
Alignment:
Q  74 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  57836 aaaatatatttgcatcaaatt-ttcttcatacggtacaaaaatatatttattgttcatacatatattttca 57905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 57926 - 57991
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  57926 cacaaaaaatatataaaacaaatcttttatacttttagaaaca--attcatcatccatcaaattttga 57991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Original strand, 2232 - 2273
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2232 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttctgcaacaat 2273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10493 - 10447
Alignment:
Q  165 atcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  10493 atcttttatatttttaacaacaatcttttttatccatcaaattttga 10447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University