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Alignment Overview

Query: NF17962_low_39 (Length: 261)

Name: NF17962_low_39
Description: NF17962
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17962_low_39
NF17962_low_39
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (26-226)||(11860-12062)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (26-225)||(22132786-22132987)
chr4 (26-227)||(56030187-56030390)
chr4 (26-225)||(5100743-5100944)
chr4 (26-225)||(22135018-22135219)
chr4 (26-225)||(14787820-14788021)
chr4 (26-227)||(44600227-44600430)
chr4 (26-226)||(17662625-17662827)
chr4 (26-226)||(24347958-24348159)
chr4 (26-221)||(30136319-30136516)
chr4 (77-227)||(47211158-47211310)
chr4 (61-226)||(9022059-9022225)
chr4 (73-225)||(9863499-9863650)
chr4 (61-225)||(10112626-10112787)
chr4 (26-226)||(38890517-38890702)
chr4 (124-223)||(19322410-19322510)
chr4 (154-225)||(14789500-14789571)
chr4 (142-211)||(38209186-38209255)
chr4 (26-118)||(19322547-19322641)
chr4 (26-99)||(53404998-53405071)
chr4 (61-145)||(54929094-54929180)
chr4 (147-215)||(5516771-5516839)
chr4 (142-213)||(29609914-29609985)
chr4 (68-145)||(10979676-10979755)
chr4 (144-209)||(54929198-54929261)
chr4 (104-145)||(14647173-14647214)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (26-225)||(51943042-51943243)
chr3 (26-225)||(746422-746623)
chr3 (26-225)||(53915881-53916082)
chr3 (26-225)||(25533107-25533308)
chr3 (26-225)||(27636011-27636212)
chr3 (26-228)||(455570-455774)
chr3 (26-227)||(53918049-53918252)
chr3 (26-226)||(1313081-1313283)
chr3 (41-225)||(41848804-41848990)
chr3 (26-225)||(457950-458151)
chr3 (26-225)||(10621926-10622127)
chr3 (26-225)||(42991953-42992154)
chr3 (26-228)||(4104282-4104486)
chr3 (26-223)||(42989954-42990153)
chr3 (151-225)||(6561613-6561687)
chr3 (142-211)||(53974124-53974193)
chr3 (142-211)||(11072648-11072717)
chr3 (61-207)||(11066263-11066429)
chr3 (142-193)||(54287576-54287627)
chr3 (72-142)||(54287487-54287559)
chr3 (77-140)||(53974011-53974077)
chr3 (77-145)||(11072731-11072801)
chr3 (185-226)||(27000082-27000123)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (26-225)||(47905956-47906157)
chr1 (33-225)||(48664852-48665046)
chr1 (26-227)||(15295238-15295441)
chr1 (26-225)||(9459812-9460013)
chr1 (26-225)||(31735914-31736115)
chr1 (26-225)||(39931762-39931963)
chr1 (26-226)||(24325346-24325548)
chr1 (26-225)||(9463639-9463840)
chr1 (26-226)||(17325026-17325228)
chr1 (41-225)||(27337346-27337532)
chr1 (41-225)||(45693838-45694024)
chr1 (35-226)||(2949623-2949816)
chr1 (35-225)||(4131690-4131882)
chr1 (26-226)||(28998643-28998845)
chr1 (26-226)||(29004359-29004561)
chr1 (35-225)||(27339534-27339730)
chr1 (35-198)||(21948591-21948756)
chr1 (37-225)||(6115527-6115718)
chr1 (41-225)||(6997214-6997393)
chr1 (110-225)||(46432521-46432636)
chr1 (74-225)||(16561131-16561284)
chr1 (35-187)||(6996067-6996215)
chr1 (61-145)||(11693580-11693666)
chr1 (26-103)||(46432118-46432195)
chr1 (26-103)||(2510722-2510799)
chr1 (144-211)||(32260750-32260817)
chr1 (61-211)||(13785662-13785831)
chr1 (26-88)||(6115479-6115541)
chr1 (35-93)||(26520522-26520580)
chr1 (61-142)||(14352759-14352842)
chr1 (142-188)||(10115509-10115555)
chr1 (105-158)||(13112046-13112099)
chr1 (148-211)||(11693686-11693749)
chr1 (104-145)||(32260833-32260874)
chr1 (61-142)||(10115572-10115653)
chr1 (147-178)||(16855265-16855296)
chr1 (175-211)||(10115470-10115506)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (35-225)||(28485261-28485453)
chr7 (26-225)||(7472373-7472574)
chr7 (26-226)||(20625733-20625935)
chr7 (26-226)||(20629624-20629826)
chr7 (26-226)||(20642043-20642245)
chr7 (26-225)||(1606171-1606372)
chr7 (26-225)||(3035415-3035616)
chr7 (26-225)||(7092567-7092768)
chr7 (26-225)||(7470420-7470621)
chr7 (26-225)||(11756925-11757126)
chr7 (26-225)||(20299155-20299356)
chr7 (26-225)||(42331392-42331593)
chr7 (35-225)||(47865328-47865520)
chr7 (26-225)||(1849665-1849866)
chr7 (26-225)||(7094814-7095015)
chr7 (26-225)||(18345237-18345438)
chr7 (26-225)||(31156299-31156500)
chr7 (26-225)||(38395986-38396187)
chr7 (35-227)||(7352054-7352248)
chr7 (26-225)||(28487249-28487450)
chr7 (26-227)||(21989851-21990052)
chr7 (35-225)||(38393683-38393875)
chr7 (41-226)||(37412530-37412717)
chr7 (26-225)||(21470682-21470883)
chr7 (35-225)||(7349675-7349867)
chr7 (26-217)||(24258166-24258358)
chr7 (79-225)||(443326-443474)
chr7 (26-226)||(3676996-3677179)
chr7 (26-156)||(13099864-13099996)
chr7 (104-227)||(40281869-40281994)
chr7 (26-145)||(43253914-43254035)
chr7 (35-121)||(20297163-20297251)
chr7 (61-211)||(10690688-10690845)
chr7 (142-208)||(12310542-12310608)
chr7 (162-211)||(20297112-20297161)
chr7 (171-211)||(43254023-43254063)
chr7 (61-145)||(12310442-12310528)
chr7 (147-178)||(6628853-6628884)
chr7 (147-178)||(12657667-12657698)
chr7 (148-178)||(12485044-12485074)
chr7 (148-178)||(12506475-12506505)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (26-227)||(42452447-42452650)
chr2 (26-226)||(35218364-35218566)
chr2 (26-225)||(35215983-35216184)
chr2 (26-225)||(42923893-42924094)
chr2 (26-225)||(23452628-23452829)
chr2 (61-225)||(27583741-27583907)
chr2 (61-211)||(28568584-28568736)
chr2 (104-227)||(27136376-27136507)
chr2 (130-218)||(34575608-34575696)
chr2 (61-209)||(15693589-15693755)
chr2 (150-211)||(28568350-28568411)
chr2 (142-207)||(41303549-41303615)
chr2 (76-215)||(39286888-39287042)
chr2 (68-145)||(41304806-41304884)
chr2 (161-211)||(7502583-7502633)
chr2 (61-144)||(7502638-7502723)
chr2 (69-145)||(41303457-41303535)
chr2 (142-211)||(41304898-41304960)
chr2 (61-93)||(34575556-34575588)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (26-225)||(2629278-2629479)
chr6 (26-225)||(5275727-5275928)
chr6 (26-225)||(12195903-12196104)
chr6 (26-226)||(19704964-19705166)
chr6 (26-228)||(30034995-30035199)
chr6 (26-226)||(18317750-18317952)
chr6 (26-226)||(26932957-26933159)
chr6 (26-225)||(30966923-30967124)
chr6 (35-227)||(17852265-17852458)
chr6 (35-223)||(17011781-17011968)
chr6 (64-225)||(22858373-22858536)
chr6 (61-223)||(20526548-20526708)
chr6 (61-203)||(30445243-30445404)
chr6 (142-203)||(30443036-30443097)
chr6 (168-211)||(12158532-12158575)
chr6 (61-145)||(30443111-30443195)
chr6 (147-191)||(3833176-3833220)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (26-225)||(25803707-25803908)
chr5 (26-223)||(18511601-18511800)
chr5 (26-225)||(3373429-3373630)
chr5 (26-225)||(18468698-18468899)
chr5 (26-225)||(27912219-27912420)
chr5 (26-225)||(26098640-26098841)
chr5 (26-225)||(27910135-27910336)
chr5 (26-222)||(18509706-18509904)
chr5 (26-225)||(15551925-15552126)
chr5 (26-205)||(10586549-10586730)
chr5 (26-225)||(26097421-26097624)
chr5 (44-230)||(21288524-21288713)
chr5 (41-227)||(18596324-18596523)
chr5 (75-218)||(17415748-17415893)
chr5 (26-145)||(18466453-18466574)
chr5 (121-226)||(6661929-6662034)
chr5 (146-225)||(40221282-40221361)
chr5 (61-145)||(15143262-15143348)
chr5 (142-209)||(5779144-5779211)
chr5 (171-225)||(18466411-18466465)
chr5 (171-226)||(15143219-15143274)
chr5 (35-94)||(40221340-40221399)
chr5 (144-178)||(2532750-2532784)
chr5 (171-209)||(32520215-32520253)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (26-228)||(15808959-15809163)
chr8 (26-225)||(28283612-28283813)
chr8 (26-226)||(3873749-3873952)
chr8 (26-225)||(43529871-43530072)
chr8 (27-225)||(41384493-41384692)
chr8 (26-225)||(608470-608671)
chr8 (35-224)||(41382420-41382611)
chr8 (69-225)||(32339094-32339252)
chr8 (108-225)||(3265635-3265752)
chr8 (144-211)||(13986304-13986370)
chr8 (144-211)||(30679186-30679252)
chr8 (61-145)||(11701364-11701447)
chr8 (26-76)||(181434-181484)
chr8 (73-142)||(13986214-13986285)
chr8 (144-173)||(27820149-27820178)
chr8 (171-211)||(11701435-11701475)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (26-225)||(51709-51910)
scaffold0005 (154-225)||(50159-50230)
scaffold0005 (104-145)||(170076-170117)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (26-226)||(1734-1936)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (26-225)||(78883-79084)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (110-224)||(2070-2184)
scaffold0468 (26-84)||(2022-2080)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (79-225)||(4546-4694)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (131-225)||(1-95)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (74-142)||(57836-57905)
scaffold0008 (144-211)||(57926-57991)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (147-188)||(2232-2273)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (165-211)||(10447-10493)


Alignment Details
Target: scaffold0154 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 11860 - 12062
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11860 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 11959  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11960 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatactacaa 12059  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  12060 caa 12062  T

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Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 22132786 - 22132987
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22132786 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 22132885  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132886 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatactacaa 22132985  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  22132986 ca 22132987  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 56030390 - 56030187
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  56030390 ctccttcagtgaaagaatatttgcaccaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 56030291  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56030290 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 56030191  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  56030190 caat 56030187  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5100944 - 5100743
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  5100944 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttgtt 5100845  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5100844 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 5100745  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  5100744 ca 5100743  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 22135018 - 22135219
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22135018 ctccttcagtgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 22135117  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22135118 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 22135217  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  22135218 ca 22135219  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 14787820 - 14788021
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  14787820 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatt 14787919  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14787920 gtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 14788019  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  14788020 ca 14788021  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 44600227 - 44600430
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  44600227 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 44600326  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44600327 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 44600426  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  44600427 caat 44600430  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 17662625 - 17662827
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17662625 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcgtacggtacaaaaatatatttatt 17662724  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17662725 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttgtagtcatactacaa 17662824  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  17662825 caa 17662827  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24348159 - 24347958
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  24348159 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 24348060  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24348059 gtccataaatatattttc-gcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 24347961  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  24347960 caa 24347958  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30136516 - 30136319
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30136516 ctccttcaatgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattctcttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttatt 30136417  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  30136416 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaattttaaatcattctac 30136319  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Original strand, 47211158 - 47211310
Alignment:
Q  77 atatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211158 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttgagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 47211257  T
Q  175 tttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47211258 tttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaacaat 47211310  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9022225 - 9022059
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9022225 aatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatctttcttcatacggtagaaaaatatatttattgtc-ataaatatattttcagcaaaaaatatatttg 9022127  T
Q  159 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9022126 aaacaaatcatttatattttcaacaacaatatttctcatccataaaattttgaatcatactacaacaa 9022059  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9863650 - 9863499
Alignment:
Q  73 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttta 172  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9863650 caaaatatatttgcatcaaatcttccttcatgc-acaaaaatatatttattgttcataaatatatttttagcacaaaatatgtttgaaacaaatcattta 9863552  T
Q  173 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  9863551 tatttttagtaacaatatatttcatccaacaaattttgagtcatattacaaca 9863499  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10112787 - 10112626
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10112787 aatattctctttcaaa-tatatttacatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatagtttcagcacaaaatatatttg 10112689  T
Q  159 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||    
T  10112688 aaac----cttttatatttttagcaacaatattcttcattcaacaaattttaagtcatactacaaca 10112626  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 38890517 - 38890702
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatatt-ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttat 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  38890517 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacaatacaaaaatatatttat 38890616  T
Q  123 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactaca 222  Q
    ||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38890617 tgtccata------------------aatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatgctaca 38890698  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19322510 - 19322410
Alignment:
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagc-aacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactaca 222  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19322510 gtccataaatatattttcagtataaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 19322411  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  19322410 a 19322410  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 14789500 - 14789571
Alignment:
Q  154 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14789500 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 14789571  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Original strand, 38209186 - 38209255
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38209186 agcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttaacaacaatatttttcatccatcaaattttga 38209255  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19322641 - 19322547
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatat 118  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  19322641 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcctttatacagtacaaaaatatat 19322547  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 53405071 - 53404998
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405071 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatttttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 53404998  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 54929094 - 54929180
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54929094 aatattcctattaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattttttgtccataaatatattttcagca 54929180  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Original strand, 5516771 - 5516839
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatca 215  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5516771 aaaatatatttgaaacaattcatttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaattttaaatca 5516839  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Original strand, 29609914 - 29609985
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaat 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29609914 agcacaaaatatatttgaaaaaaatcaagaatacttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaat 29609985  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10979755 - 10979676
Alignment:
Q  68 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10979755 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacagcacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagca 10979676  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 54929198 - 54929261
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  54929198 cacaaaatacatttaaatcaaatcttttatatttttagcaacaatattatt--tccatcaaatttt 54929261  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Original strand, 14647173 - 14647214
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647173 ggtacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 14647214  T

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Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51943243 - 51943042
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  51943243 ctccttcaatgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttatt 51943144  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51943143 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 51943044  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  51943043 ca 51943042  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 746623 - 746422
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  746623 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 746524  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  746523 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 746424  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  746423 ca 746422  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 53915881 - 53916082
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  53915881 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 53915980  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53915981 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccctcaaattttgagtcatactacaa 53916080  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  53916081 ca 53916082  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25533308 - 25533107
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25533308 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 25533209  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25533208 gtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 25533109  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  25533108 ca 25533107  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 27636011 - 27636212
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27636011 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 27636110  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27636111 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaactaatattttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaaatcatactacaa 27636210  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  27636211 ca 27636212  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 455774 - 455570
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  455774 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 455675  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  455674 gtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaattttgagtcatactacaa 455575  T
Q  224 caatt 228  Q
    |||||    
T  455574 caatt 455570  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 53918049 - 53918252
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  53918049 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaaaaaaatatatttatt 53918148  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  53918149 gtccataaatatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactataa 53918248  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  53918249 caat 53918252  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1313283 - 1313081
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  1313283 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacagaaatatatttatt 1313184  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1313183 gtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 1313084  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  1313083 caa 1313081  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41848990 - 41848804
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848990 aatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 41848891  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41848890 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 41848804  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 458151 - 457950
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  458151 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 458052  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  458051 gtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaattttgagtcatactacaa 457952  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  457951 ca 457950  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 10621926 - 10622127
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  10621926 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 10622025  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10622026 gtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 10622125  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  10622126 ca 10622127  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42992154 - 42991953
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  42992154 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 42992055  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42992054 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaaccttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 42991955  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  42991954 ca 42991953  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 4104282 - 4104486
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  4104282 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 4104381  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4104382 gtccataaatatattttcagcataaagtatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 4104481  T
Q  224 caatt 228  Q
    |||||    
T  4104482 caatt 4104486  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42990153 - 42989954
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  42990153 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 42990054  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42990053 gtccataaatatactttcagcaaaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 42989954  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6561687 - 6561613
Alignment:
Q  151 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6561687 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttcgagtcatactacaaca 6561613  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Original strand, 53974124 - 53974193
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53974124 agcacaaaatataattgaaacaaatcttttatatttttaacaacaacattcttcatccatcaaattttga 53974193  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11072717 - 11072648
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11072717 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatattttttgcaacaatcttcttcatccatcaaattttga 11072648  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11066429 - 11066263
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca---------------- 142  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||                    
T  11066429 aatattctctttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtaaaaaaatatatttattgtccataaatgtattttcaacaacaatcttccgaa 11066330  T
Q  143 -gcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttt-agcaacaatattcttcatccatcaaatt 207  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11066329 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatcttttttagcaacaatattcttcatccatcaaatt 11066263  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Original strand, 54287576 - 54287627
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54287576 agcacgaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatcttct 54287627  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 142
Target Start/End: Original strand, 54287487 - 54287559
Alignment:
Q  72 tcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54287487 tcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacagtacaaaaatgtatttattatccataaatatattttca 54287559  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 140
Target Start/End: Original strand, 53974011 - 53974077
Alignment:
Q  77 atatatttgcatcaaatcgttctt-cat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatttt 140  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974011 atatatttgcatcaaatcttcctttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatatttt 53974077  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11072801 - 11072731
Alignment:
Q  77 atatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11072801 atatatttgcatcaaatcttccgtaatacggtacaaaaatctatttgttgtccataaatgtattttcagca 11072731  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27000123 - 27000082
Alignment:
Q  185 caatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27000123 caatattctccatccatcaaattttcagtcatactacaacaa 27000082  T

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Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47906157 - 47905956
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  47906157 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 47906058  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47906057 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 47905958  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  47905957 ca 47905956  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48665046 - 48664852
Alignment:
Q  33 aatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccata 130  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  48665046 aatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatgtgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccata 48664947  T
Q  131 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48664946 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 48664852  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 15295238 - 15295441
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15295238 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 15295337  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15295338 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 15295437  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  15295438 caat 15295441  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 9459812 - 9460013
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  9459812 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacggtataaaaatatatttatt 9459911  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9459912 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 9460011  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  9460012 ca 9460013  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 31735914 - 31736115
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31735914 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 31736013  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31736014 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccttccatcaaattttgagtcatactacaa 31736113  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  31736114 ca 31736115  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39931963 - 39931762
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39931963 ctccttcaataaaagaatatttgcatcaaaagtataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 39931864  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39931863 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 39931764  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  39931763 ca 39931762  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24325548 - 24325346
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  24325548 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 24325449  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24325448 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 24325349  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  24325348 caa 24325346  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 9463639 - 9463840
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || |||||||||||||||    
T  9463639 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacgatataaaaatatatttatt 9463738  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9463739 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 9463838  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  9463839 ca 9463840  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 17325026 - 17325228
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17325026 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcccttgcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacggtacaaaaatatatttatt 17325125  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17325126 gtccataaatatattttcaactcaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 17325225  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  17325226 caa 17325228  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 27337346 - 27337532
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337346 aatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 27337445  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27337446 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattccccatccatcaaatttggagtcatactacaaca 27337532  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 45693838 - 45694024
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693838 aatatttgcataaaaaatatattattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 45693937  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45693938 tttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatagtacaaca 45694024  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Original strand, 2949623 - 2949816
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2949623 tgaaagaatatttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaa 2949722  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2949723 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatgaaattttgagtcatactataacaa 2949816  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 4131690 - 4131882
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt-gtccataa 131  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4131690 tgaaagaatatttgcatc-aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatttgtccataa 4131788  T
Q  132 atatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4131789 atatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 4131882  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 28998643 - 28998845
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  28998643 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttatt 28998742  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28998743 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 28998842  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  28998843 caa 28998845  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 29004359 - 29004561
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  29004359 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttatt 29004458  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29004459 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 29004558  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  29004559 caa 29004561  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 27339534 - 27339730
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27339534 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 27339633  T
Q  133 tat----attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  27339634 tatatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccgtcaaatttggagtcatactacaaca 27339730  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 21948591 - 21948756
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21948591 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 21948690  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21948691 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatc 21948756  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 225
Target Start/End: Original strand, 6115527 - 6115718
Alignment:
Q  37 aaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaata 134  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115527 aaaatatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcattcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaata 6115626  T
Q  135 tattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaa-ttttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6115627 tattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttttgagtcatcctacaaca 6115718  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6997393 - 6997214
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6997393 aatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaa------tttgcatcaaatcgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataa-tatatt 6997301  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6997300 tttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactataaca 6997214  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Original strand, 46432521 - 46432636
Alignment:
Q  110 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46432521 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 46432620  T
Q  210 gaatcatactacaaca 225  Q
    || |||||||||||||    
T  46432621 gagtcatactacaaca 46432636  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16561284 - 16561131
Alignment:
Q  74 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 171  Q
    ||||||||||||  ||||||  | ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16561284 aaaatatatttgtttcaaatattccttcatacggtacaaaaagatatttattgtcaataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatatttt 16561185  T
Q  172 atatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16561184 atatttttagcaacaatattcttcatccaacaaattttgaatcatacaacaaca 16561131  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6996215 - 6996067
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6996215 tgaaagaatatttgcaacaaaaatataatattccctttcaa------tttacatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatgtattgtccataaa 6996122  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6996121 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaagtcttttatatttttagcaacaa 6996067  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 11693580 - 11693666
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11693580 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 11693666  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 46432118 - 46432195
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 103  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432118 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 46432195  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 2510722 - 2510799
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 103  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510722 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 2510799  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32260817 - 32260750
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32260817 cacaaaatatattttaaacaattcttttatatttttagcaacaatcttcttcatccatcaaattttga 32260750  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Original strand, 13785662 - 13785831
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca------------- 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||                 
T  13785662 aatattccttttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttactatctataaatatattttcagcaacaatattctaga 13785761  T
Q  146 ----caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13785762 aacacaaaatatatttgaaacaaatctttcatatttttagcgacaatattctccatccatcaatttttga 13785831  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 88
Target Start/End: Original strand, 6115479 - 6115541
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 88  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115479 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 6115541  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 93
Target Start/End: Original strand, 26520522 - 26520580
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 93  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520522 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 26520580  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14352842 - 14352759
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14352842 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactattcataaatatattttca 14352759  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10115555 - 10115509
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10115555 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaat 10115509  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Original strand, 13112046 - 13112099
Alignment:
Q  105 gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13112046 gtacaaaaatatatttattgtccatgaatatattttcagcataaaatacatttg 13112099  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Original strand, 11693686 - 11693749
Alignment:
Q  148 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11693686 aaatatatttaaaacaaaatttttataattttagcaataatcttcttcatccatcaaattttga 11693749  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32260874 - 32260833
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32260874 ggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 32260833  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10115653 - 10115572
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115653 aatattccgtttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacgggataaaaatatttattgtccataaatatattttca 10115572  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 178
Target Start/End: Original strand, 16855265 - 16855296
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855265 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 16855296  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10115506 - 10115470
Alignment:
Q  175 tttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10115506 ttttttgcaacaatattcttaatccatcaaattttga 10115470  T

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Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28485453 - 28485261
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28485453 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 28485354  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485353 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 28485261  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 7472373 - 7472574
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  7472373 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgatacaataatatatttatt 7472472  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7472473 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7472572  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  7472573 ca 7472574  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20625935 - 20625733
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20625935 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20625836  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20625835 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20625736  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  20625735 caa 20625733  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20629826 - 20629624
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20629826 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20629727  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20629726 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20629627  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  20629626 caa 20629624  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20642245 - 20642043
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20642245 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20642146  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20642145 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20642046  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  20642045 caa 20642043  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1606372 - 1606171
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1606372 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 1606273  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1606272 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 1606173  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  1606172 ca 1606171  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3035616 - 3035415
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3035616 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaaatatatttatt 3035517  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3035516 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 3035417  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  3035416 ca 3035415  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 7092567 - 7092768
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7092567 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7092666  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7092667 gtccataaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7092766  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  7092767 ca 7092768  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 7470420 - 7470621
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7470420 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7470519  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7470520 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatgttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7470619  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  7470620 ca 7470621  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11757126 - 11756925
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  11757126 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 11757027  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11757026 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 11756927  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  11756926 ca 11756925  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20299356 - 20299155
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20299356 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20299257  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20299256 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 20299157  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  20299156 ca 20299155  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 42331392 - 42331593
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  42331392 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatacttatt 42331491  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  42331492 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcattcatcaaattttaagtcatactacaa 42331591  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  42331592 ca 42331593  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47865520 - 47865328
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47865520 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 47865421  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47865420 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaaca 47865328  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1849866 - 1849665
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1849866 ctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 1849767  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1849766 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 1849667  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  1849666 ca 1849665  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 7094814 - 7095015
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7094814 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7094913  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7094914 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7095013  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  7095014 ca 7095015  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18345438 - 18345237
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18345438 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccatttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 18345339  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18345338 gtcaataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 18345239  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  18345238 ca 18345237  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 31156299 - 31156500
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31156299 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 31156398  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31156399 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 31156498  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  31156499 ca 31156500  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38396187 - 38395986
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  38396187 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 38396088  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  38396087 gtacataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaa 38395988  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  38395987 ca 38395986  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Original strand, 7352054 - 7352248
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  7352054 tgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaa 7352153  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7352154 tatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaacaat 7352248  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28487450 - 28487249
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  28487450 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaattatatttatt 28487351  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28487350 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaagcaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 28487251  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  28487250 ca 28487249  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21990052 - 21989851
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21990052 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 21989953  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21989952 gtccataaatatattttcaacacaa--tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgggtcatactacaa 21989855  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  21989854 caat 21989851  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38393875 - 38393683
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38393875 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataacattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 38393776  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38393775 taaattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttagaatcatactacaaca 38393683  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Original strand, 37412530 - 37412717
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37412530 aatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgttacataattatatttattgtccataaatatatt 37412629  T
Q  139 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37412630 ttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 37412717  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 21470682 - 21470883
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  21470682 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatattcgcatcaaatcgttcttcatacgatataaaaatatatttatt 21470781  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21470782 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcaaactacaa 21470881  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  21470882 ca 21470883  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 7349675 - 7349867
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  7349675 tgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaa 7349774  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7349775 tatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaaca 7349867  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24258358 - 24258166
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  24258358 ctccttcagtgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa-tcgtccttcatactgtacaaaaatatatttatt 24258260  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcata 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24258259 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcata 24258166  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 443474 - 443326
Alignment:
Q  79 atatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443474 atatttgcatcaaattgttcttcagacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 443375  T
Q  177 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  443374 tttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 443326  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3677179 - 3676996
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||          
T  3677179 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatata------ 3677086  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3677085 -------------ttttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatctatcaaattttgagtcatactacaa 3676999  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 156
Target Start/End: Original strand, 13099864 - 13099996
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13099864 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacggtacgaaaatatatttatt 13099963  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099964 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 13099996  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 40281869 - 40281994
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaa--tattcttcatccat 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  40281869 ggtacaaaaatatatttattttccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaaattcttcttcatccat 40281968  T
Q  202 caaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  40281969 caaattttgagtcatactacaccaat 40281994  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 43253914 - 43254035
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  43253914 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 43254013  T
Q  124 gtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  43254014 gtccataaatatatttttagca 43254035  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20297251 - 20297163
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatattta 121  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  20297251 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattta 20297163  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10690845 - 10690688
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctt---catggtacaaaaatatatttattgtccataa------atatattttcagcacaaaat 151  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||      || | ||   ||||||||||    
T  10690845 aatattccttttaaaaatatatttgcatcaaata-ttctgtcacatggtacaaaaatatatttattgtacataagcaacaattttttgaaagcacaaaat 10690747  T
Q  152 atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  10690746 atatttgaaacata-cttttatatttttagcaacaatcttctccctccatcaaattttga 10690688  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 12310542 - 12310608
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12310542 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatcagtagcaacaatcttcttcatccattaaattt 12310608  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20297161 - 20297112
Alignment:
Q  162 caaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297161 caaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 20297112  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 43254023 - 43254063
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43254023 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 43254063  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 12310442 - 12310528
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||    
T  12310442 aatattccttttaaaaatatatttacatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattaactgtccttaagtataatttcagca 12310528  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6628884 - 6628853
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628884 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 6628853  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 178
Target Start/End: Original strand, 12657667 - 12657698
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657667 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12657698  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 12485044 - 12485074
Alignment:
Q  148 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12485044 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12485074  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 12506475 - 12506505
Alignment:
Q  148 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506475 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12506505  T

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Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42452650 - 42452447
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  42452650 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 42452551  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42452550 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttaagtcatactacaa 42452451  T
Q  224 caat 227  Q
    ||||    
T  42452450 caat 42452447  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 35218364 - 35218566
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  35218364 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttatt 35218463  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35218464 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 35218563  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  35218564 caa 35218566  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 35215983 - 35216184
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  35215983 ctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttatt 35216082  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35216083 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 35216182  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  35216183 ca 35216184  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 42923893 - 42924094
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42923893 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 42923992  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42923993 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 42924092  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  42924093 ca 42924094  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 23452628 - 23452829
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  23452628 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 23452727  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23452728 gtccataaatttattttcagcataaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 23452827  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  23452828 ca 23452829  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 27583741 - 27583907
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27583741 aatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtataaaaatatatttattgttcataaatatatcttcagcacaaaatatatttg 27583840  T
Q  159 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27583841 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaaatttgagtcatactacaaca 27583907  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Original strand, 28568584 - 28568736
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28568584 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcacacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaaaacaaaatatatttg 28568683  T
Q  159 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28568684 aaacaaatcttttatagttttagcaacaatattcttcatctatcaaattttga 28568736  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 27136376 - 27136507
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatat--------attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttc 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27136376 ggtacaaaaatatatttattttccataaatatatttatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaccaatattcttc 27136475  T
Q  196 atccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27136476 atccatcaaattttgagtcatactacaacaat 27136507  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Original strand, 34575608 - 34575696
Alignment:
Q  130 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34575608 aaatatattttcagcacaaaatatatttagaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 34575696  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15693755 - 15693589
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca------------- 145  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||                 
T  15693755 aatatcccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgcccataaatatattttcagcaacaagtttttgga 15693656  T
Q  146 ----caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15693655 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttt-atatttttagcaacaatattattcatccatcaaatttt 15693589  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28568411 - 28568350
Alignment:
Q  150 atatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568411 atatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattcttcatccatcaaattttga 28568350  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 41303549 - 41303615
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata-tttttagcaacaatattcttcatccatcaaatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41303549 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttttagcaacaatcttcttcatccatcaaatt 41303615  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39287042 - 39286888
Alignment:
Q  76 aatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcag-----------------cacaaaatatatt 156  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 || ||||||||||    
T  39287042 aatatatttgcatcaaatcttcattcatatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttaagcaacaatcttctggaatcataaaatatatt 39286943  T
Q  157 tgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatca 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  39286942 tgaaacaaatcatttatatttttagcaacaat----ctcatccatcaaattttgaatca 39286888  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 41304806 - 41304884
Alignment:
Q  68 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg-gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  41304806 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatgtacaaaaatatatttactatccataaatatattgtcagca 41304884  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7502633 - 7502583
Alignment:
Q  161 acaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7502633 acaaatcttttatactttgagcaacaatcttcttcatccatcaaattttga 7502583  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7502723 - 7502638
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct-tcatgg--tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagc 144  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7502723 aatatttcctttaaaaatatatttgcatcaaatc-ttctgtcatacaatacaaaaatatttttattgttcataaatatattttcagc 7502638  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Original strand, 41303457 - 41303535
Alignment:
Q  69 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || | |||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41303457 ctttaaaaatatatttgaatcaattcttccttcacacggtacaaaattatatttactgtccataaatatattttcagca 41303535  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Original strand, 41304898 - 41304960
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41304898 agcacaaaatatatttga--caaatcttttatattttta-----aatcttcttcatccatcaaattttga 41304960  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 93
Target Start/End: Original strand, 34575556 - 34575588
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575556 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 34575588  T

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Target: chr6 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 2629278 - 2629479
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  2629278 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 2629377  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2629378 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 2629477  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  2629478 ca 2629479  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 5275727 - 5275928
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5275727 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 5275826  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5275827 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 5275926  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  5275927 ca 5275928  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 12195903 - 12196104
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12195903 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 12196002  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12196003 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 12196102  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  12196103 ca 12196104  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 19704964 - 19705166
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19704964 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 19705063  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19705064 gtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 19705163  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  19705164 caa 19705166  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 30034995 - 30035199
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  30034995 ctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 30035094  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30035095 gtctataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 30035194  T
Q  224 caatt 228  Q
    |||||    
T  30035195 caatt 30035199  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18317952 - 18317750
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18317952 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttatt 18317853  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18317852 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatactacaa 18317753  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  18317752 caa 18317750  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 26932957 - 26933159
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  26932957 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 26933056  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26933057 gtccataataatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 26933156  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  26933157 caa 26933159  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30967124 - 30966923
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  30967124 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 30967025  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  30967024 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaa 30966925  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  30966924 ca 30966923  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17852458 - 17852265
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17852458 tgaaataatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcataaggtacaaaaatatatttattgtccataaa 17852359  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagca--acaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17852358 tatattttcagcataaa--atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacacaatattctccat-catcaaattttgagtcatatttcaacaat 17852265  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17011968 - 17011781
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011968 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccatcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaa 17011869  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17011868 tatattttctacacaaa--atatttaaaacaaa-cttttatatttttagcaataatattcttcatccatcaaattttaagtcatactacaa 17011781  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Original strand, 22858373 - 22858536
Alignment:
Q  64 attccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22858373 attccctttcaaaatatatttgcatctaatcttctttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaagtatatttaaaa 22858472  T
Q  162 caaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22858473 caaatcttttatatttttattaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 22858536  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20526708 - 20526548
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaa-tatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattt 157  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20526708 aatattctctttcaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatgta-----cataaatatattttcagcataaaatatattt 20526614  T
Q  158 gaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20526613 gaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcacccatcaaattttgagtcatactacaa 20526548  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30445404 - 30445243
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc----------------- 141  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                     
T  30445404 aatattcctttttaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagcaacaatattctgga 30445305  T
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30445304 agcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttctagcaacaatattcttcatccatca 30445243  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30443097 - 30443036
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatca 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30443097 agcaaaaaatatatttgaaacaaatctcttatatttttaacaacaatattcttcatccatca 30443036  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12158575 - 12158532
Alignment:
Q  168 ttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12158575 ttttatatttttagcaacaatcttcttcattcatcaaattttga 12158532  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30443195 - 30443111
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30443195 aatatttcttttaaaaatacatttgcatcaaatcttcctttatacggtacaaacatatattt--tgtccataaatatattttcagca 30443111  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3833220 - 3833176
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatatt 191  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  3833220 aaaatatatttaaaacaaatattttatgtttttagcaataatatt 3833176  T

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Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25803908 - 25803707
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25803908 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 25803809  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25803808 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 25803709  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  25803708 ca 25803707  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 18511601 - 18511800
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18511601 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 18511700  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18511701 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 18511800  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 3373429 - 3373630
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3373429 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 3373528  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3373529 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattctgagtcatactacaa 3373628  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  3373629 ca 3373630  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18468899 - 18468698
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18468899 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 18468800  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18468799 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 18468700  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  18468699 ca 18468698  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27912420 - 27912219
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  27912420 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacgatacaaaaatatatttatt 27912321  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27912320 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 27912221  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  27912220 ca 27912219  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 26098640 - 26098841
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  26098640 ctccttcaatgaaagaatttttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatt 26098739  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26098740 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 26098839  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  26098840 ca 26098841  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27910336 - 27910135
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  27910336 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 27910237  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27910236 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 27910137  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  27910136 ca 27910135  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Original strand, 18509706 - 18509904
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18509706 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttatt 18509805  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactaca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18509806 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 18509904  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15552126 - 15551925
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15552126 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatgtcatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 15552027  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552026 gtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 15551927  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  15551926 ca 15551925  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10586730 - 10586549
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  10586730 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 10586631  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10586630 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaa 10586549  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26097624 - 26097421
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctt--tcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatattta 121  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26097624 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacatttccttcttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattta 26097525  T
Q  122 ttgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26097524 ttgtccataaatatattttcagtacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactac 26097425  T
Q  222 aaca 225  Q
    ||||    
T  26097424 aaca 26097421  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21288713 - 21288524
Alignment:
Q  44 atttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtaca-aaaatatatttattgtccataaatatatttt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288713 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcataaaatcgttcttcatacggtaccgaaaatatatttattgtccataaatatatttt 21288614  T
Q  141 cagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaattgt 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21288613 cagcacaaaatatattttaaacaaatcttttttatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagttatactacaacaattgt 21288524  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18596523 - 18596324
Alignment:
Q  41 aatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttat-----------tgtcc 127  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||           |||||    
T  18596523 aatatttgtatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatggtatatttattgtcc 18596424  T
Q  128 ataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18596423 ataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatagtacaacaat 18596324  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Original strand, 17415748 - 17415893
Alignment:
Q  75 aaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttta 172  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17415748 aaatatatttgcatcaaattttccttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatctttta 17415847  T
Q  173 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17415848 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 17415893  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18466574 - 18466453
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18466574 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 18466475  T
Q  124 gtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  18466474 gtccataaatatatttttagca 18466453  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 6661929 - 6662034
Alignment:
Q  121 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatacta 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  6661929 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaagttttaagtcatacta 6662028  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  6662029 caacaa 6662034  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40221361 - 40221282
Alignment:
Q  146 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  40221361 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatcaattaaattttgagtcatactacaaca 40221282  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15143348 - 15143262
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15143348 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatatttttagca 15143262  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 5779144 - 5779211
Alignment:
Q  142 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  5779144 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatcttcttcatctatcaaatttt 5779211  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18466465 - 18466411
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18466465 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 18466411  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15143274 - 15143219
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15143274 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactataacaa 15143219  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40221399 - 40221340
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 94  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40221399 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgaaacaaatc 40221340  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 178
Target Start/End: Original strand, 2532750 - 2532784
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2532750 cacaagatatatttgaaacaaatcttttatatttt 2532784  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32520253 - 32520215
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32520253 tatattttcagcaacaatcttcttcatccatcaaatttt 32520215  T

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Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15809163 - 15808959
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15809163 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 15809064  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15809063 gtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaaaa 15808964  T
Q  224 caatt 228  Q
    |||||    
T  15808963 caatt 15808959  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 28283612 - 28283813
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  28283612 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 28283711  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28283712 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 28283811  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  28283812 ca 28283813  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3873952 - 3873749
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtt-cttcat--ggtacaaaaatatatttat 122  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  3873952 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttcttcatacgatacaaaaatatatttat 3873853  T
Q  123 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactaca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3873852 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 3873753  T
Q  223 acaa 226  Q
    ||||    
T  3873752 acaa 3873749  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43530072 - 43529871
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgg--tacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  43530072 ctccttcagtgaaagaatattagcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttatt 43529973  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43529972 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 43529873  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  43529872 ca 43529871  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41384692 - 41384493
Alignment:
Q  27 tcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattg 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41384692 tccttcaatgaaagaatatttgcata-aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattg 41384594  T
Q  125 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaac 224  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41384593 tccataaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaac 41384494  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 608671 - 608470
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  608671 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaatatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 608572  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  608571 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtgatactacaa 608472  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  608471 ca 608470  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41382611 - 41382420
Alignment:
Q  35 tgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaa 132  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382611 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttgttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaa 41382512  T
Q  133 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaac 224  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41382511 tatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaac 41382420  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32339252 - 32339094
Alignment:
Q  69 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339252 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 32339153  T
Q  167 cttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32339152 cttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 32339094  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Original strand, 3265635 - 3265752
Alignment:
Q  108 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3265635 caaacatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatt 3265734  T
Q  208 ttgaatcatactacaaca 225  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3265735 ttgagtcatactacaaca 3265752  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 13986304 - 13986370
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13986304 cacaaaatatatttaaaacaaatcttt-atatttttagcaacaatcttcttcatccataaaattttga 13986370  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 30679186 - 30679252
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30679186 cacaaaatatatctaaaacaaatcttttttatttttaccaac-atattcttcatccatcaaattttga 30679252  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 11701364 - 11701447
Alignment:
Q  61 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || | | | | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11701364 aatattccctttaaaaatatatttacatcaattcttccat-acggtacaaaaatatatttactgaccataaatatattttcagca 11701447  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 181484 - 181434
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaa 76  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  181484 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaa 181434  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Original strand, 13986214 - 13986285
Alignment:
Q  73 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  13986214 caaaatatatttgcatcaaatcttctttcatgcggtacaaaaatttattaactatccataaatatattttca 13986285  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 173
Target Start/End: Original strand, 27820149 - 27820178
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820149 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 27820178  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 11701435 - 11701475
Alignment:
Q  171 tatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11701435 tatattttcagcaacaatcttcttcgtccatcaaattttga 11701475  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51910 - 51709
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  51910 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatt 51811  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51810 gtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 51711  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  51710 ca 51709  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50230 - 50159
Alignment:
Q  154 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50230 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 50159  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 170117 - 170076
Alignment:
Q  104 ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170117 ggtacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 170076  T

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Target: scaffold0511 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1936 - 1734
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1936 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttatt 1837  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1836 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatactacaa 1737  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  1736 caa 1734  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 79084 - 78883
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttatt 123  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  79084 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttatt 78985  T
Q  124 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 223  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  78984 atccataaatatatttttagcagaaaatatatttgagacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaa 78885  T
Q  224 ca 225  Q
    ||    
T  78884 ca 78883  T

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Target: scaffold0468 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2184
Alignment:
Q  110 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2070 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 2169  T
Q  210 gaatcatactacaac 224  Q
    || ||||||||||||    
T  2170 gagtcatactacaac 2184  T

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Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Original strand, 2022 - 2080
Alignment:
Q  26 ctcctttaatgaaaaaatatttgcatccaaaatataatattccctttcaaaatatattt 84  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2022 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatattt 2080  T

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Target: scaffold0133 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4694 - 4546
Alignment:
Q  79 atatttgcatcaaatcgttcttcatg--gtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 176  Q
    ||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4694 atatttgcatcaaattgtccttcatacagtacaaaaatatatatattgtccataaatatattttcagcacgaaatatattcgaaacaaatcttttatatt 4595  T
Q  177 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  4594 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagttatactgcaaca 4546  T

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Target: scaffold1674 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 1 - 95
Alignment:
Q  131 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 95  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 142
Target Start/End: Original strand, 57836 - 57905
Alignment:
Q  74 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat--ggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 142  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  57836 aaaatatatttgcatcaaatt-ttcttcatacggtacaaaaatatatttattgttcatacatatattttca 57905  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 57926 - 57991
Alignment:
Q  144 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  57926 cacaaaaaatatataaaacaaatcttttatacttttagaaaca--attcatcatccatcaaattttga 57991  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Original strand, 2232 - 2273
Alignment:
Q  147 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2232 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttctgcaacaat 2273  T

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Target: scaffold0474 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10493 - 10447
Alignment:
Q  165 atcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  10493 atcttttatatttttaacaacaatcttttttatccatcaaattttga 10447  T

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