View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17967_low_6 (Length: 230)

Name: NF17967_low_6
Description: NF17967
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17967_low_6
NF17967_low_6
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-230)||(16105573-16105802)
chr5 (1-230)||(108929-109158)
chr5 (1-195)||(9730479-9730672)
chr5 (1-158)||(7528902-7529059)
chr5 (1-166)||(17909500-17909664)
chr5 (19-195)||(10778085-10778259)
chr5 (84-195)||(23514528-23514638)
chr5 (147-229)||(11583982-11584063)
chr5 (32-202)||(7728378-7728547)
chr5 (49-203)||(24084034-24084187)
chr5 (49-166)||(29917958-29918075)
chr5 (49-154)||(23493925-23494029)
chr5 (49-203)||(6456580-6456734)
chr5 (49-202)||(21616974-21617126)
chr5 (42-154)||(23981646-23981757)
chr5 (49-202)||(37983325-37983474)
chr5 (82-203)||(1168373-1168495)
chr5 (82-203)||(3673818-3673940)
chr5 (191-229)||(24225596-24225634)
chr5 (32-203)||(5450963-5451134)
chr5 (82-183)||(11337355-11337455)
chr5 (165-202)||(32966399-32966436)
chr5 (32-183)||(19862186-19862336)
chr5 (49-152)||(21109758-21109860)
chr5 (49-144)||(26559952-26560046)
chr5 (130-194)||(22882391-22882455)
chr5 (15-100)||(23328619-23328703)
chr5 (15-100)||(24616223-24616307)
chr5 (15-100)||(24712599-24712683)
chr5 (15-100)||(24745617-24745701)
chr5 (84-152)||(19873852-19873920)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-230)||(16522748-16522977)
chr4 (1-230)||(9295624-9295853)
chr4 (1-166)||(14996122-14996286)
chr4 (1-166)||(8044935-8045103)
chr4 (1-166)||(19697469-19697633)
chr4 (1-166)||(19708054-19708218)
chr4 (5-180)||(9795195-9795371)
chr4 (1-106)||(14500313-14500418)
chr4 (84-183)||(7132244-7132342)
chr4 (49-230)||(7185981-7186159)
chr4 (15-137)||(22738293-22738414)
chr4 (19-195)||(20000690-20000864)
chr4 (49-202)||(7964848-7965000)
chr4 (32-154)||(15044834-15044955)
chr4 (49-194)||(40905071-40905214)
chr4 (32-154)||(15109469-15109590)
chr4 (81-202)||(19821944-19822065)
chr4 (32-195)||(41166066-41166228)
chr4 (51-203)||(41256508-41256660)
chr4 (51-154)||(15013421-15013523)
chr4 (49-152)||(18238294-18238396)
chr4 (52-202)||(18276392-18276541)
chr4 (49-99)||(32460840-32460890)
chr4 (108-182)||(32460880-32460953)
chr4 (49-152)||(54398391-54398493)
chr4 (129-202)||(37957241-37957314)
chr4 (32-154)||(38764715-38764836)
chr4 (15-100)||(26339081-26339165)
chr4 (81-195)||(14901197-14901311)
chr4 (82-183)||(16732146-16732247)
chr4 (50-152)||(50220078-50220179)
chr4 (32-154)||(52265628-52265749)
chr4 (49-180)||(13442813-13442946)
chr4 (56-100)||(22352197-22352241)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (1-230)||(130486-130715)
scaffold0028 (22-180)||(79519-79677)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-230)||(4991002-4991231)
chr6 (1-230)||(18823484-18823712)
chr6 (1-230)||(18839339-18839567)
chr6 (1-166)||(32276860-32277024)
chr6 (1-158)||(16300077-16300234)
chr6 (1-178)||(19629314-19629489)
chr6 (84-195)||(16231859-16231969)
chr6 (84-195)||(18087002-18087112)
chr6 (109-230)||(18583264-18583384)
chr6 (84-195)||(13620973-13621083)
chr6 (108-230)||(17083373-17083496)
chr6 (19-195)||(23977736-23977910)
chr6 (81-195)||(18381851-18381965)
chr6 (32-202)||(22361885-22362054)
chr6 (32-203)||(18398895-18399065)
chr6 (49-180)||(19854135-19854265)
chr6 (49-202)||(25919571-25919723)
chr6 (32-195)||(21623133-21623295)
chr6 (49-191)||(33538506-33538647)
chr6 (49-155)||(25651242-25651347)
chr6 (31-203)||(34966823-34966995)
chr6 (49-203)||(29605406-29605560)
chr6 (15-100)||(29869886-29869970)
chr6 (81-180)||(33324673-33324772)
chr6 (81-180)||(35136180-35136279)
chr6 (22-65)||(15005024-15005067)
chr6 (22-65)||(22585664-22585707)
chr6 (22-65)||(22590495-22590538)
chr6 (49-152)||(29160440-29160542)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (1-230)||(9303196-9303425)
chr3 (2-182)||(11477288-11477467)
chr3 (1-195)||(16934070-16934263)
chr3 (1-230)||(19946629-19946857)
chr3 (1-166)||(8275941-8276105)
chr3 (1-166)||(8268841-8269005)
chr3 (1-158)||(14284963-14285120)
chr3 (81-230)||(47784915-47785064)
chr3 (127-230)||(7853913-7854015)
chr3 (84-195)||(18910960-18911070)
chr3 (127-230)||(33341812-33341914)
chr3 (147-230)||(54685543-54685625)
chr3 (49-203)||(12952920-12953074)
chr3 (81-202)||(38811176-38811297)
chr3 (49-203)||(1990759-1990913)
chr3 (49-203)||(6228762-6228916)
chr3 (32-182)||(17191519-17191668)
chr3 (32-154)||(12488846-12488967)
chr3 (52-193)||(17204667-17204807)
chr3 (85-202)||(34559857-34559974)
chr3 (49-154)||(4162342-4162446)
chr3 (49-152)||(41661573-41661675)
chr3 (81-194)||(9590922-9591035)
chr3 (22-64)||(18970016-18970058)
chr3 (30-152)||(31412451-31412572)
chr3 (32-180)||(3576558-3576705)
chr3 (165-202)||(17960565-17960602)
chr3 (82-183)||(14295415-14295516)
chr3 (81-154)||(11061174-11061247)
chr3 (82-182)||(11329130-11329230)
chr3 (82-182)||(17139486-17139586)
chr3 (81-180)||(14080489-14080588)
chr3 (49-203)||(33369045-33369199)
chr3 (49-152)||(43427653-43427753)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (1-230)||(25212977-25213207)
chr2 (1-230)||(24826815-24827044)
chr2 (1-182)||(17204309-17204490)
chr2 (3-182)||(28031337-28031516)
chr2 (3-166)||(15633208-15633370)
chr2 (32-230)||(19433452-19433649)
chr2 (1-138)||(33128067-33128203)
chr2 (81-202)||(3409-3529)
chr2 (84-195)||(12636047-12636157)
chr2 (84-195)||(42178148-42178258)
chr2 (19-195)||(12641757-12641931)
chr2 (84-195)||(8943813-8943923)
chr2 (19-195)||(3798718-3798892)
chr2 (32-230)||(43645824-43646020)
chr2 (49-203)||(24884643-24884796)
chr2 (26-180)||(19669222-19669376)
chr2 (81-182)||(25305423-25305524)
chr2 (32-199)||(67952-68119)
chr2 (15-100)||(5888740-5888824)
chr2 (81-203)||(25265573-25265695)
chr2 (49-152)||(6094724-6094826)
chr2 (49-152)||(9636753-9636855)
chr2 (82-183)||(28974026-28974127)
chr2 (15-100)||(23774198-23774282)
chr2 (81-154)||(23821773-23821846)
chr2 (81-154)||(23830852-23830925)
chr2 (49-154)||(24277767-24277871)
chr2 (81-154)||(24294691-24294764)
chr2 (127-202)||(722353-722428)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-166)||(6312-6477)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (1-195)||(21650136-21650329)
chr1 (1-137)||(20254336-20254472)
chr1 (84-195)||(17148534-17148644)
chr1 (32-195)||(20177140-20177302)
chr1 (51-194)||(21194980-21195122)
chr1 (127-202)||(27674755-27674829)
chr1 (81-154)||(36356461-36356534)
chr1 (127-201)||(22829638-22829712)
chr1 (127-202)||(38033888-38033962)
chr1 (81-195)||(41229107-41229221)
chr1 (82-195)||(13377009-13377122)
chr1 (49-202)||(17608886-17609038)
chr1 (81-202)||(37234028-37234149)
chr1 (15-100)||(7641044-7641128)
chr1 (49-154)||(8538047-8538151)
chr1 (49-154)||(8603286-8603390)
chr1 (165-202)||(19603055-19603092)
chr1 (49-180)||(49997418-49997548)
chr1 (49-116)||(52400675-52400741)
chr1 (15-100)||(22035509-22035593)
chr1 (82-194)||(51627833-51627945)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-195)||(3431377-3431570)
chr8 (1-182)||(22886305-22886485)
chr8 (1-166)||(18612401-18612565)
chr8 (1-166)||(18619306-18619470)
chr8 (3-166)||(2544944-2545103)
chr8 (1-166)||(22147433-22147597)
chr8 (49-182)||(21494593-21494725)
chr8 (84-195)||(13721107-13721217)
chr8 (49-203)||(33528383-33528535)
chr8 (49-202)||(5854572-5854724)
chr8 (32-195)||(21198272-21198434)
chr8 (49-202)||(38533607-38533759)
chr8 (19-195)||(16873166-16873340)
chr8 (32-195)||(23837163-23837325)
chr8 (49-202)||(26011452-26011604)
chr8 (49-194)||(27233204-27233348)
chr8 (49-203)||(18261608-18261762)
chr8 (81-202)||(22736006-22736127)
chr8 (49-202)||(15933256-15933408)
chr8 (49-194)||(33611190-33611334)
chr8 (49-203)||(18041669-18041823)
chr8 (52-194)||(37653756-37653895)
chr8 (49-143)||(38635785-38635878)
chr8 (49-180)||(45465263-45465393)
chr8 (49-152)||(45559074-45559176)
chr8 (49-203)||(22742717-22742874)
chr8 (82-182)||(39446935-39447034)
chr8 (22-62)||(23217974-23218014)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (1-195)||(371055-371248)
chr7 (84-195)||(18980200-18980310)
chr7 (84-195)||(14251077-14251187)
chr7 (84-195)||(15927535-15927645)
chr7 (82-230)||(7284229-7284376)
chr7 (19-195)||(13758337-13758511)
chr7 (81-230)||(14272054-14272203)
chr7 (32-195)||(17224058-17224220)
chr7 (49-202)||(48356602-48356754)
chr7 (32-203)||(13377485-13377656)
chr7 (81-202)||(16915096-16915217)
chr7 (49-202)||(34241325-34241477)
chr7 (49-154)||(15358803-15358907)
chr7 (49-203)||(4446168-4446322)
chr7 (15-100)||(10000480-10000564)
chr7 (22-67)||(13352044-13352089)
chr7 (49-154)||(20583691-20583795)
chr7 (49-152)||(17947729-17947831)
chr7 (49-143)||(31501190-31501283)
chr7 (15-100)||(16418559-16418643)
chr7 (49-180)||(13448964-13449094)
chr7 (49-180)||(28390292-28390422)
chr7 (49-203)||(38424175-38424329)
chr7 (52-154)||(4484733-4484834)
chr7 (86-183)||(11287394-11287491)
chr7 (127-203)||(14935319-14935396)
chr7 (127-203)||(15362912-15362989)
chr7 (82-182)||(13274765-13274865)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-182)||(49944-50124)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (1-199)||(5677-5875)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (3-166)||(11740-11901)
scaffold0162 (81-146)||(8360-8425)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (1-158)||(5224-5380)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-167)||(165062-165224)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-166)||(17695-17857)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (16-195)||(13395-13575)
scaffold0032 (81-202)||(93940-94061)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (32-230)||(28466-28663)
scaffold0150 (180-230)||(21637-21687)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (82-230)||(3230-3377)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (3-99)||(34511-34607)
scaffold0118 (118-182)||(34607-34670)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-140)||(61323-61461)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-98)||(17410-17506)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (86-230)||(21442-21586)
scaffold0120 (82-230)||(31141-31289)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (82-230)||(75-222)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (82-230)||(24890-25036)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (82-230)||(283-430)
scaffold0310 (153-230)||(6603-6679)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (49-202)||(43935-44087)
scaffold0080 (49-203)||(23809-23963)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (49-202)||(69415-69567)
scaffold0009 (22-61)||(244920-244959)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (32-195)||(76967-77129)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (49-203)||(6500-6654)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (49-202)||(2483-2635)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (81-202)||(103090-103211)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (49-154)||(4611-4715)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (32-199)||(270-436)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (84-203)||(107967-108086)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (32-195)||(35444-35605)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (84-123)||(1693-1732)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (170-227)||(12990-13048)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (81-202)||(30978-31099)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (81-154)||(11100-11173)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (19-195)||(4906-5081)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (87-195)||(116687-116795)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (52-203)||(27453-27604)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (49-203)||(7812-7966)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (53-203)||(7358-7508)
scaffold0253 (53-203)||(16783-16933)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (49-180)||(37538-37668)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (49-203)||(85489-85643)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (81-199)||(6622-6740)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (42-144)||(2471-2572)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (84-154)||(1117-1187)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (32-203)||(2436-2607)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (15-100)||(23859-23943)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (15-100)||(7271-7355)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (22-62)||(1619-1659)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (80-144)||(4579-4643)
scaffold0447 (80-144)||(9193-9257)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (190-230)||(12694-12734)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (49-152)||(3260-3361)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (49-100)||(22559-22609)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (195-230)||(3392-3427)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (49-202)||(197390-197545)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (82-183)||(745-846)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (82-183)||(109631-109732)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (108-203)||(1337-1433)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (82-183)||(11877-11977)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (15-100)||(6659-6743)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (82-182)||(33897-33996)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (24-65)||(44234-44275)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (22-62)||(203-243)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (81-180)||(10642-10741)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (82-154)||(33668-33740)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (82-154)||(40664-40736)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16105802 - 16105573
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105802 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16105703  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16105702 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttaggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggtt 16105603  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105602 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16105573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 108929 - 109158
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108929 tatgaaaatggattgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 109028  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  109029 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggtt 109128  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  109129 gatagagaagaagtttgattttgatgatgt 109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 9730479 - 9730672
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9730479 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttg 9730578  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  9730579 ctgagacatattgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgag-aaataagatgttgttggtggttttgtgaaat 9730672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7529059 - 7528902
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7529059 tatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 7528960  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttg 158  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7528959 ctgagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcatgattgttg 7528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17909664 - 17909500
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17909664 tatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgctg 17909565  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
     || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17909564 atgcgacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattggtggtgagaaa 17909500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 10778085 - 10778259
Alignment:
Q  19 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |  ||||| || | ||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778085 tgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt-aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 10778183  T
Q  119 tatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  10778184 tatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttggtggtggttttgtgaaat 10778259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23514638 - 23514528
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||| || |||||||||||    
T  23514638 aattgatgttgttgttcttgagagatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattattgatgag-aaataagatgttgttggtg 23514540  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  23514539 gttttgtgaaat 23514528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11584063 - 11583982
Alignment:
Q  147 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  11584063 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgttcgtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagtttgtttttgatgatg 11583982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728378
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | |||| ||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgc 7728449  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7728448 ttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgag-agatgaggtgttgttggtgactttgaaaaatgggttga 7728378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24084187 - 24084034
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | | || | ||||||||||||||  || |||    
T  24084187 atgttgttgttgaattgtgatgtgaatcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgaagattcatggcttgggtgttagtaaatc 24084089  T
Q  149 atgattgttgttga-gaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||||  ||| ||| |||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||||||    
T  24084088 atgat--ttgatgatgaaaataagttgttgtggttggttttgtaaaaatgggttgat 24084034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29918075 - 29917958
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| || |||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  29918075 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aactgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 29917977  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaa 166  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  29917976 atgatttgatgttgagaaa 29917958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493925
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattc 23493931  T
Q  149 atgatt 154  Q
    ||||||    
T  23493930 atgatt 23493925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6456734 - 6456580
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || | |||| | |||| | |||||||||||||||||  |||    
T  6456734 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatc 6456636  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgta-aaatgggttgat 203  Q
    |||| ||| || |||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  6456635 atgatttgatgatgag-aaataagttgttgttgttgtttttgtacaaacgggttgat 6456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21617126 - 21616974
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| |  ||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  21617126 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattc 21617028  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| ||| || |||| || |||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  21617027 atgatttgatgatgag-aagtgagctgttgtggttggttttgtaaaatgggttga 21616974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 154
Target Start/End: Original strand, 23981646 - 23981757
Alignment:
Q  42 ttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttc 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | || ||| || | |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||    
T  23981646 ttatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttc 23981744  T
Q  142 atatatcatgatt 154  Q
    |||  ||||||||    
T  23981745 ataactcatgatt 23981757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37983474 - 37983325
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| |||||||||||   || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  37983474 atgttattgttgaattgtaatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 37983376  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    | || ||| || ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37983375 aggatttgatgatga-aaaatgagttgttgttgg---ttttgtaaaatgggttga 37983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Original strand, 1168373 - 1168495
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1168373 tcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttg 1168471  T
Q  181 gtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    ||| |||  | |||||||||||||    
T  1168472 gtgttttgatgaaaatgggttgat 1168495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3673940 - 3673818
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | || |||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||| |||||||||||    
T  3673940 tcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcacgatttgatgatgag-aaataagttgttgttg 3673842  T
Q  181 gtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
     || ||| || |||||||||||||    
T  3673841 ttggtttggtgaaaatgggttgat 3673818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Original strand, 24225596 - 24225634
Alignment:
Q  191 aaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24225596 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 24225634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Original strand, 5450963 - 5451134
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |   | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |  ||||    
T  5450963 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgtt-caactgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcttggc 5451061  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  5451062 ttggatgatcataaatcatgatttgatgatgag-aaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 5451134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 11337355 - 11337455
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| || | | |||||||| || | |||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11337355 tcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatggcttgagtttacatgattcatgattgttgttgag-aaatgagatgttgttgg 11337453  T
Q  182 tg 183  Q
    ||    
T  11337454 tg 11337455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 32966399 - 32966436
Alignment:
Q  165 aaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32966399 aaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 32966436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19862336 - 19862186
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| | |  |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||  || || ||| | |||| | ||| |    
T  19862336 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtg-caattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgac 19862238  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  19862237 ttgggtgttcataattcatgatttgatgatgag-aaatgagttgttgttggtg 19862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21109860 - 21109758
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||  | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  21109860 atgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttattgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 21109762  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  21109761 atga 21109758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 26559952 - 26560046
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcata 144  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| |  |||||||||||||||||    
T  26559952 atgttgttgttgatttgtgatgagaattatgttt-aattgatgttgttgttgctaagagatattgttggtgatgattcttggcttgggtgttcata 26560046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22882455 - 22882391
Alignment:
Q  130 gcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaa 194  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  22882455 gcttgggtgttcataaatcatgaattgatgttgag-aaataagttgttgttgttggttttgtaaaa 22882391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23328703 - 23328619
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23328703 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 23328619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24616307 - 24616223
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24616307 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 24616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24712683 - 24712599
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24712683 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 24712599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24745701 - 24745617
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24745701 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 24745617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19873920 - 19873852
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga 152  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||||||    
T  19873920 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatga 19873852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16522977 - 16522748
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522977 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16522878  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16522877 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggtt 16522778  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522777 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16522748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9295853 - 9295624
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295853 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9295754  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  9295753 ctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttatgtaaaatgagtt 9295654  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295653 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9295624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14996286 - 14996122
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14996286 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 14996187  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14996186 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 14996122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8045103 - 8044935
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtg--aatcaagtttcaattgatgttgttgt 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||     
T  8045103 tatgagaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgtgaatcaagttccaattgatgttgttgc 8045004  T
Q  99 tgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8045003 tgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgaattgttgatgagaaa 8044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 19697469 - 19697633
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19697469 tatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 19697568  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19697569 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 19697633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 19708054 - 19708218
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19708054 tatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 19708153  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19708154 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 19708218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9795371 - 9795195
Alignment:
Q  5 aaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctg- 103  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9795371 aaaatgagtagttgtgaaattatgtttaattggtgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagtttcaattgatgttgttgttgttgt 9795272  T
Q  104 --agatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
      | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9795271 tgatacatgttgttgtttatga-ttatggcttgggtgttgatatatcatgattgttgttgag-aaatgaattgttgttg 9795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 14500313 - 14500418
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14500313 tatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 14500412  T
Q  101 ctgaga 106  Q
    ||||||    
T  14500413 ctgaga 14500418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 183
Target Start/End: Original strand, 7132244 - 7132342
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  7132244 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggtg 7132342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 7185981 - 7186159
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||| | |||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  7185981 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatc 7186079  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||| ||| || |||| | ||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7186080 atgatttgatgatgag-atatgagttgttgt---tgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7186159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22738414 - 22738293
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22738414 gttgtgaaattatgcttaattgatggtttatgatgagttgttattgaattgag-tgtgaatcaagttccaatggatgttgttgttgcttagacatgttgt 22738316  T
Q  115 tgattatgaattatggcttgggt 137  Q
    |||   ||||||||| |||||||    
T  22738315 tgagggtgaattatgacttgggt 22738293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20000864 - 20000690
Alignment:
Q  19 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| | |||||| || | ||| |||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20000864 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt-aatcgatgttgttgttgctgagatatgttgttgag 20000766  T
Q  119 tatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||| |||||| |||||| ||||    
T  20000765 tatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttattggtggttttgtgaaat 20000690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 7964848 - 7965000
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  7964848 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgattttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatc 7964946  T
Q  149 atgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7964947 atgatttgatgatgagaaa-tgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 7965000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15044955 - 15044834
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| | |||||    
T  15044955 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggc 15044857  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  15044856 ttgggtgttcataaatcatgatt 15044834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 40905071 - 40905214
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  40905071 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtt--aattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgactcgtggcttgggtgttcataaatc 40905168  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaa 194  Q
    |||| ||| || |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  40905169 atgatttgatgatgag-aaataagttgttgttgttggttttgtaaaa 40905214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Original strand, 15109469 - 15109590
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| | |||||    
T  15109469 aattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggc 15109567  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  15109568 ttgggtgttcataaatcatgatt 15109590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 19821944 - 19822065
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||    
T  19821944 ttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgag-aaatgagttgttttt 19822042  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    
T  19822043 ggtgactttgtaaaatgagttga 19822065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 41166066 - 41166228
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||   || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||| |||||    
T  41166066 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggc 41166164  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| ||||||  | |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  41166165 ttgggtattcataacttatgatttgttgatgag-aaatgagttgttgtgggtggttttgtgaaat 41166228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 203
Target Start/End: Original strand, 41256508 - 41256660
Alignment:
Q  51 gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcat 150  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | |||| ||||||||||||| |||||    
T  41256508 gttgttgttgaattgtgatgagaaccatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcat 41256606  T
Q  151 ga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    || ||| || |||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  41256607 gatttgatgatgag-aaatgagttgttgttgttggttttataaaaatgggttgat 41256660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 154
Target Start/End: Original strand, 15013421 - 15013523
Alignment:
Q  51 gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcat 150  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||| || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  15013421 gttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatattgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 15013519  T
Q  151 gatt 154  Q
    ||||    
T  15013520 gatt 15013523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Original strand, 18238294 - 18238396
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  18238294 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 18238392  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  18238393 atga 18238396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276392
Alignment:
Q  52 ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg 151  Q
    |||||||||||||| | || || ||| ||| |||||||||||||||||||  ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgtt-caattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatg 18276443  T
Q  152 a-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    | |||  | ||||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18276442 atttgacgatgag-tattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 18276392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 99
Target Start/End: Original strand, 32460840 - 32460890
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 99  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460840 atgttgttgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 32460890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 32460880 - 32460953
Alignment:
Q  108 atgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  32460880 atgttgttgtttatgatttatgacttgggtgtgcatatatcatgattgttggtgag-aattgagatgttgttggt 32460953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54398493 - 54398391
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  54398493 atgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatc 54398395  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  54398394 atga 54398391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Original strand, 37957241 - 37957314
Alignment:
Q  129 ggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37957241 ggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaa-tgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 37957314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38764836 - 38764715
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||| | |||||    
T  38764836 aattgttgaattatgcgatgttgttgttcaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggc 38764738  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  38764737 ttgggtgttcataaatcatgatt 38764715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26339165 - 26339081
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || ||| | ||||| ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26339165 gttgtgaaattttgcttaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggagagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 26339081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14901311 - 14901197
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| | |||| | ||| | ||||||| ||||  |||||| ||| || ||||||| || |||||||||    
T  14901311 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgctgttgttgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaa-tgggttgttgtt 14901213  T
Q  180 ggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||| |||||||||||    
T  14901212 ggtggttttgtaaaat 14901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16732247 - 16732146
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16732247 tcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttg 16732149  T
Q  181 gtg 183  Q
    |||    
T  16732148 gtg 16732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Original strand, 50220078 - 50220179
Alignment:
Q  50 tgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatca 149  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || | ||||||||||||| ||||    
T  50220078 tgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtgttcataaatca 50220176  T
Q  150 tga 152  Q
    |||    
T  50220177 tga 50220179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265749
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  || ||| || | |||| | |||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggc 52265726  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  52265727 ttgggtgttcataattcatgatt 52265749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 13442813 - 13442946
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctg---agatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatat 145  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||   ||| || |||||| | |||| | || |||||||||||||||     
T  13442813 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttgttaagagattttgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataa 13442911  T
Q  146 atcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    || ||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  13442912 attatgaattgatgatgag-aaatgagttgttgttg 13442946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 100
Target Start/End: Original strand, 22352197 - 22352241
Alignment:
Q  56 tgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22352197 tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 22352241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 130715 - 130486
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130715 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 130616  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  130615 ttgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggtt 130516  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  130515 aataaagaagaagtttgattttgatgatgt 130486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 79677 - 79519
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgat-gacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgatta 120  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||  | |||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  || || ||| | |    
T  79677 aattatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttga 79579  T
Q  121 tgaattatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  79578 tgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgag-aaatgagttgttgttg 79519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4991231 - 4991002
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991231 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggtgtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 4991132  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4991131 ctgagatatgttgttgatcatgaattttggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggtt 4991032  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991031 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 4991002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18823484 - 18823712
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823484 tatgaaaatgggttgttgtgaagttatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgcggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 18823583  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
     |  |  ||||||||||| || |   ||||||||||| | |||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  18823584 atatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggag-aaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatggctt 18823682  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823683 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 18823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18839339 - 18839567
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839339 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttattgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 18839438  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
     |  |  ||||||||||| || |   ||||||||||| | |||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  18839439 atatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggag-aaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgagtt 18839537  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18839538 gaaaaagaagaagtttgattttgatgatgt 18839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 32276860 - 32277024
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32276860 tatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttattgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 32276959  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32276960 ctgagatatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 32277024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 16300077 - 16300234
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16300077 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcctaattgataaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16300176  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttg 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16300177 ctgagatatgttgttgtatatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttg 16300234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19629489 - 19629314
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  19629489 tatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttg 19629390  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgt 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19629389 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgag-aaatgagttgttgt 19629314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16231969 - 16231859
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  16231969 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggtg 16231871  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  16231870 gttttgtgaaat 16231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 18087002 - 18087112
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| |||||    
T  18087002 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcataattgttgatgag-aaataagatgttggtggtg 18087100  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  18087101 gttttgtgaaat 18087112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18583384 - 18583264
Alignment:
Q  109 tgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaaga 208  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18583384 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatga 18583286  T
Q  209 agaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18583285 agaagtttgattttgatgatgt 18583264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 13620973 - 13621083
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||| || |||||||||||    
T  13620973 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatgacttgggtgttcatataccataattgttgatgag-caataagatgttgttggtg 13621071  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  13621072 gttttgtgaaat 13621083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 230
Target Start/End: Original strand, 17083373 - 17083496
Alignment:
Q  108 atgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgataa 205  Q
    ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  17083373 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaa-tgagttgttgttgttgtttttgtgaaaatgggttgataa 17083471  T
Q  206 agaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17083472 tgaagaagtttgattttgatgatgt 17083496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23977910 - 23977736
Alignment:
Q  19 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| | |||||| || | ||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23977910 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt-aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgag 23977812  T
Q  119 tatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||| |||||| |||||| ||||    
T  23977811 tatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttattggtggttttgtgaaat 23977736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Original strand, 18381851 - 18381965
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  18381851 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgag-aaatgagttgttgtt 18381949  T
Q  180 ggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||| |||||| ||||    
T  18381950 ggtggttttgtgaaat 18381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 202
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22362054
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||  | ||| | |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 22361983  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| || |||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  22361984 ttgggtgttcataattcatgaattgatgatgag-aattgagttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 22362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398895
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| | || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | |||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggc 18398967  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||||||| ||||  |||||| |  || | || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  18398966 ttgggtgtgcataattcatgaattgtgataag-aaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 18398895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19854265 - 19854135
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  19854265 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 19854167  T
Q  149 atg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  19854166 atgaattgatgatgag-aaatgagttgttgttg 19854135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25919723 - 25919571
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagat-atgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatat 147  Q
    ||||||||||||||||  | || ||| || | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||  |    
T  25919723 atgttgttgttgaattatgatgagaaccatg-ttcaattgatgttgttgttgct-atatgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataatt 25919626  T
Q  148 catga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25919625 catgatttgttgatga-aaaatgagttattgttggtgactttgtaaaatgagttga 25919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21623295 - 21623133
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||  |||||| || | |||| | |||||    
T  21623295 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgtt-ctattgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgttaatgagtcatggc 21623197  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  21623196 ttgggtattcataattcatgatttgtggatga-aaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaat 21623133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Original strand, 33538506 - 33538647
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  33538506 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttattgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatc 33538604  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgta 191  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  33538605 atgatttgatgatgag-aaatgagttgttgttgttggttttgta 33538647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25651347 - 25651242
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  25651347 atgttgttgttgaattatgatgagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 25651249  T
Q  149 atgattg 155  Q
    |||||||    
T  25651248 atgattg 25651242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34966995 - 34966823
Alignment:
Q  31 taattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatgg 130  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || |    
T  34966995 taattgttgaattatgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatag 34966897  T
Q  131 cttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  || || | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  34966896 cttgggtgttcataaatcatgagttcgtgatgtg-aaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggttgat 34966823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29605560 - 29605406
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| | |||| |||||||| |||| |||    
T  29605560 atgttgttgttgaattatgatgtgaatcatgctt-aattgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggtttgggtgtgcataaatc 29605462  T
Q  149 atg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    ||| |||| |  |||| |||| ||||||| ||| || |||||| |||||||||||||    
T  29605461 atgaattgataatgag-aaataagttgttcttgttggttttgtaaaaatgggttgat 29605406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 29869886 - 29869970
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29869886 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 29869970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33324772 - 33324673
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||||||||    
T  33324772 ttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgag-aaatgagttgttgtt 33324674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Original strand, 35136180 - 35136279
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||||||||    
T  35136180 ttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgag-aaatgagttgttgtt 35136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Original strand, 15005024 - 15005067
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattg 65  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15005024 aattatgttcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 15005067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Original strand, 22585664 - 22585707
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattg 65  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22585664 aattatgctcaattgaagaattatgacatgttgttgttgaattg 22585707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Original strand, 22590495 - 22590538
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattg 65  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22590495 aattatgctcaattgaagaattatgacatgttgttgttgaattg 22590538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Original strand, 29160440 - 29160542
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || |||||||| |||||| |||    
T  29160440 atgttgttgttgatttgcgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcataaatc 29160538  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  29160539 atga 29160542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9303196 - 9303425
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303196 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgctgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9303295  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9303296 ctgagatatgttgttgactatgaattatggcttgggtgttcatataccatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaacgggtt 9303395  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303396 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 11477288 - 11477467
Alignment:
Q  2 atgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11477288 atgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgctgc 11477387  T
Q  102 tgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  11477388 tgagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgatga-aaaataagatgttgttggt 11477467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16934070 - 16934263
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934070 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16934169  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  16934170 ctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtattcataaatcatgattgtttgtgag-aaataagatgttgttggtggttttgtgaaat 16934263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19946857 - 19946629
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19946857 tatgaaaatgagtagttgtgaaattatgcttaattgatgatttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 19946758  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
     |  |  ||||||||||| || |   ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19946757 atatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggtt 19946659  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  19946658 gataatatagaagtttgattttgatgatgt 19946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 8275941 - 8276105
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8275941 tatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattgttg 8276040  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8276041 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 8276105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 8268841 - 8269005
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8268841 tatgaaaattggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattgttg 8268940  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8268941 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 8269005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14285120 - 14284963
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14285120 tatgaaaatgggtagttgtgaaaatatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 14285021  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttg 158  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14285020 ctcagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcatgaatgttg 14284963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Original strand, 47784915 - 47785064
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  47784915 ttcagttgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaa-tgagttgttgtt 47785013  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47785014 ggtgattctgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 47785064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7854015 - 7853913
Alignment:
Q  127 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatg 226  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7854015 atggcttgggtttgcatgaatcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 7853917  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  7853916 atgt 7853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18911070 - 18910960
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  18911070 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggtg 18910972  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  18910971 gttttgtgaaat 18910960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33341914 - 33341812
Alignment:
Q  127 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatg 226  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33341914 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatt 33341816  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  33341815 atgt 33341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 230
Target Start/End: Original strand, 54685543 - 54685625
Alignment:
Q  147 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54685543 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgctgttgctggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 54685625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12953074 - 12952920
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || || | | |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  12953074 atgttgttgttgaattgtgatgagatttatgttt-aattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 12952976  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  12952975 atgatttgatgatgag-aaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 12952920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 38811176 - 38811297
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||  |||||  ||| || | || |||||||||||||||    
T  38811176 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcag-aaatgagttgttgtt 38811274  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  38811275 ggtgactttgtaaaatgggttga 38811297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1990913 - 1990759
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggt-gttcatatat 147  Q
    |||||||||||||| || | || |||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | ||||||||| | ||||||| ||    
T  1990913 atgttgttgttgaactgtgatgagaatcatgtttaaat-gatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaat 1990815  T
Q  148 catgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgat 203  Q
    ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1990814 catgatttgatgatgagaaa-tgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgat 1990759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 6228762 - 6228916
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    |||||||||| |||||  | |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  6228762 atgttgttgtcgaattatgatgtggatcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 6228860  T
Q  149 atgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||||| | || ||||||  | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  6228861 atgatttgatgatgagaat-taagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 6228916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17191668 - 17191519
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| | |||| | |||||    
T  17191668 aattgatgaattatgttatgttgttgctgaattgtgataagaatcatgttt-aattgatgttgctgttgctaagtaatgttgttgttgatgattcatggc 17191570  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    ||| |||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  17191569 ttgagtgttcataattcatgatttgttgatgag-aaatgagttgttggtggt 17191519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Original strand, 12488846 - 12488967
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |  || ||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | |||||    
T  12488846 aattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgat-caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggc 12488944  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  12488945 ttgggtgttcataattcatgatt 12488967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17204807 - 17204667
Alignment:
Q  52 ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg 151  Q
    |||||||||||||| | |  |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||| |||  |||||    
T  17204807 ttgttgttgaattgtgataggaatcatgttt-aatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatg 17204709  T
Q  152 a-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaa 193  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17204708 atttgttgatgag-aaatgagttgttgttagtggttttgtaaa 17204667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34559974 - 34559857
Alignment:
Q  85 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||||  ||||||||||||| ||    
T  34559974 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatgagaat-tgagttgttgttgttg 34559876  T
Q  184 attttgtaaaatgggttga 202  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34559875 gttttgtaaaatgggttga 34559857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 4162342 - 4162446
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  4162342 atgttgttgttgaatgatgacgtgaatcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagaactattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 4162440  T
Q  149 atgatt 154  Q
    ||||||    
T  4162441 atgatt 4162446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41661675 - 41661573
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||| | || ||||| ||||||||| |||    
T  41661675 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttgagagatattgttgttgatgattcatagcttgagtgttcataaatc 41661577  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  41661576 atga 41661573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 194
Target Start/End: Original strand, 9590922 - 9591035
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||| | ||| ||||||||||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||||||||    
T  9590922 ttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgag-aaatgagttgttgtt 9591020  T
Q  180 ggtgattttgtaaaa 194  Q
    | || ||||||||||    
T  9591021 gttggttttgtaaaa 9591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18970058 - 18970016
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaatt 64  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18970058 aattatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaatt 18970016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 152
Target Start/End: Original strand, 31412451 - 31412572
Alignment:
Q  30 ttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatg 129  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||| | |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | ||     
T  31412451 ttaattgttgaattgtgatatgttgttgttgaattgtgatgagaattaggttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcata 31412549  T
Q  130 gcttgggtgttcatatatcatga 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  31412550 gcttgagtgttcataaatcatga 31412572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 180
Target Start/End: Original strand, 3576558 - 3576705
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||||||||||| | |  || ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  || |||| | | |||| | |||||    
T  3576558 aattgatggattatgctatgttgttgttgaattgtgataagagtcatgtttga-ttgatgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggc 3576656  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3576657 ttgggtgttcataattcatgatttgttgatgag-aaatgagttgttgttg 3576705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 17960565 - 17960602
Alignment:
Q  165 aaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17960565 aaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 17960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14295516 - 14295415
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14295516 tcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttg 14295418  T
Q  181 gtg 183  Q
    |||    
T  14295417 gtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 11061174 - 11061247
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11061174 ttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatt 11061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Original strand, 11329130 - 11329230
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  11329130 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgatgag-aaatgagatgttgttg 11329228  T
Q  181 gt 182  Q
    ||    
T  11329229 gt 11329230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17139586 - 17139486
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17139586 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgcg-aaatgagatgttgttg 17139488  T
Q  181 gt 182  Q
    ||    
T  17139487 gt 17139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14080588 - 14080489
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||||||||    
T  14080588 ttcaattgatgttgttattgcgaagtaatgttgttgttgatgatttacggcttgggtattcataattcatgatttggtgatgag-aaatgagttgttgtt 14080490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 33369045 - 33369199
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||||||| |||||| | ||  || |||||| | | || | ||| |||||||||||||| |||    
T  33369045 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgtttttgttgttaaggaatattgttgttgacgattcatgacttgggtgttcataaatc 33369143  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||| || |||| |||| | ||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  33369144 atgatttgatgatgag-aaataaattgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 33369199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Original strand, 43427653 - 43427753
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||| | || |||| |||||||||| |||    
T  43427653 atgttgttgttgagttgtgatgagaatcatgatt-aattgatgttgttgttgttgagata--ttgttgttgatgattcatagctttggtgttcataaatc 43427749  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  43427750 atga 43427753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25213207 - 25212977
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213207 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 25213108  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgag-aaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggt 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25213107 ctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggt 25213008  T
Q  200 tgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25213007 tgataaagaagaaatttgattttgatgatgt 25212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24826815 - 24827044
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826815 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 24826914  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24826915 ctgagatacgttgttgattatgaattatggcttgggtgctcatttatcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtggttttgtaaaatgggtt 24827014  T
Q  201 gataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24827015 gataaagaagaagtttgatattgatgatgt 24827044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17204490 - 17204309
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17204490 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 17204391  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17204390 ctgagatatattgttgattatgaattatggcttatatgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagatgttgttggt 17204309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Original strand, 28031337 - 28031516
Alignment:
Q  3 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28031337 tgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgatatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgtt 28031436  T
Q  103 gagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28031437 gagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgatgagaaaatgagatgttgttggt 28031516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15633370 - 15633208
Alignment:
Q  3 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15633370 tgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaattgatgttgttgttgct 15633271  T
Q  103 gagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15633270 gagatatgttgttg-ctatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttagtgagaaa 15633208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 19433452 - 19433649
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||  ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| | |||||    
T  19433452 aattgttgaattatgctatgttgttattgaattgttgtaagaatcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggc 19433550  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19433551 ttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaa-tgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 19433649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33128203 - 33128067
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  33128203 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatattgttgtgg 33128105  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtg 138  Q
     | ||| || |||||| | |||| | ||||||||||||    
T  33128104 ttaagagatattgttgttaatgattcatggcttgggtg 33128067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 3409 - 3529
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3409 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgtagatgag-aaatgagttgttgttg 3507  T
Q  181 gtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  3508 gtgactttgtaaaatgggttga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 12636047 - 12636157
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  12636047 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggattgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggtg 12636145  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  12636146 gttttgtgaaat 12636157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 42178148 - 42178258
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  42178148 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgacttatggcttgggtgttcatataccaaaattgttgatgag-aaataagatgttgttggtg 42178246  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  42178247 gttttgtgaaat 42178258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 12641757 - 12641931
Alignment:
Q  19 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| | |||||| || | ||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12641757 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt-aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgag 12641855  T
Q  119 tatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  12641856 tatgatttatggcttgggtgttcatataccataagtgttgatgag-aaataagatgttgttggtggttttgtgaaat 12641931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8943923 - 8943813
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| || |||||||||||    
T  8943923 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggattgggtgttcatataccataattgttaatgag-aaataagatgttgttggtg 8943825  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  8943824 gttttgtgaaat 8943813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 3798718 - 3798892
Alignment:
Q  19 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| | |||||| || | ||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3798718 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt-aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgag 3798816  T
Q  119 tatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||| |||||| |||||| ||||    
T  3798817 tatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttattggtggttttgtgaaat 3798892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43646020 - 43645824
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||| | ||| |    
T  43646020 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgatgattcatgac 43645922  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||  ||||||||  || ||  |   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43645921 ttgggtgttcataattcatgatttgtgatgtcatt-tgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttggtaatgaaaaagtttgattttgatgatgt 43645824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24884796 - 24884643
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| | || || ||| |||| ||||||||||||||||||| | | || |||||| | |||| | ||| |||||||||||||| |||    
T  24884796 atgttattgttgaattgtgatgagattcatgttt-aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatc 24884698  T
Q  149 atgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgat 203  Q
    |||||| | ||  |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24884697 atgatttgatgaggagaaa-tgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgat 24884643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 19669222 - 19669376
Alignment:
Q  26 atgcttaattgat-gacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaa 124  Q
    ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||  | |||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| | ||||     
T  19669222 atgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgat 19669320  T
Q  125 ttatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    | ||||||||||| ||||||  ||||| | || || ||| |||||||||||||||||    
T  19669321 tcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatga-aaaatgagttgttgttg 19669376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25305524 - 25305423
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| | |||| | ||||| ||||| ||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  25305524 ttcaattgatgttgttgtggctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgag-aaatgagttgttgtt 25305426  T
Q  180 ggt 182  Q
    |||    
T  25305425 ggt 25305423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| |  ||| | |||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggc 68021  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggt 199  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||| || |||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  68020 ttgcgtgttcataattcatgatttgatgatgag-aaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 5888740 - 5888824
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5888740 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 5888824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 203
Target Start/End: Original strand, 25265573 - 25265695
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||| | |   ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  25265573 ttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatat-tcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgtt 25265671  T
Q  180 ggtgattt-tgtaaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  25265672 ggtgttttatgt-aaatgggttgat 25265695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6094826 - 6094724
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || |||||||| |||||| |||    
T  6094826 atgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcataaatc 6094728  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  6094727 atga 6094724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9636855 - 9636753
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || | |||||| |||||| |||    
T  9636855 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcataaatc 9636757  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  9636756 atga 9636753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28974127 - 28974026
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  28974127 tcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgag-aaatgagatgttgttg 28974029  T
Q  181 gtg 183  Q
    |||    
T  28974028 gtg 28974026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23774282 - 23774198
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23774282 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 23774198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 23821773 - 23821846
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  23821773 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatt 23821846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 23830852 - 23830925
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  23830852 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatt 23830925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24277871 - 24277767
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||  ||||| |||    
T  24277871 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaaat-gatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtactcataaatc 24277773  T
Q  149 atgatt 154  Q
    ||||||    
T  24277772 atgatt 24277767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 24294691 - 24294764
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||| | |||||||| || ||||||  ||||||||    
T  24294691 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatt 24294764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 722428 - 722353
Alignment:
Q  127 atggcttgggtgttcatatatcatgattg-ttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  722428 atggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagata-tgagttgttgttggtgactttgtaaaattggttga 722353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 6312 - 6477
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6312 tatgaaaatgggttgttgtgaaattaagcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgatg 6411  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6412 ctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcataattgttgatgagaaa 6477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 21650136 - 21650329
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650136 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 21650235  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
     ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  21650236 ttgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgag-aaataagatgttgttggtggttttgtgaaat 21650329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20254472 - 20254336
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20254472 tatgaaaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 20254373  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggt 137  Q
    |||||| |||||||||    ||||||||| |||||||    
T  20254372 ctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 20254336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17148644 - 17148534
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| |||||    
T  17148644 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcataattgttgatgag-aaataagatgttggtggtg 17148546  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  17148545 gttttgtgaaat 17148534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20177302 - 20177140
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||   | ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| | |||||    
T  20177302 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaaagtcaagtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggc 20177204  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||| | ||||||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20177203 ttggatattcataattcatgatttgttgaagag-aaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 20177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21195122 - 21194980
Alignment:
Q  51 gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcat 150  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  21195122 gttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattaatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 21195024  T
Q  151 ga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaa 194  Q
    || ||| || |||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  21195023 gatttgatgatgag-aaatgagttgttgttgttggttttataaaa 21194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27674829 - 27674755
Alignment:
Q  127 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27674829 atggcttgggtgtgcataattcatgatttttgatgagaaa-tgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 27674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 36356461 - 36356534
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36356461 ttcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgatgatttatggcttgggtgttcataattcatgatt 36356534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 22829638 - 22829712
Alignment:
Q  127 atggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttg 201  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22829638 atggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaa-tgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttg 22829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Original strand, 38033888 - 38033962
Alignment:
Q  127 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38033888 atggcttgggtgtgcatagttcacgattgttgatgagaaa-taagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38033962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Original strand, 41229107 - 41229221
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||||  |||||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  41229107 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgag-aaatgagttgttgtt 41229205  T
Q  180 ggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||  ||| |||||||    
T  41229206 ggtagtttggtaaaat 41229221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Original strand, 13377009 - 13377122
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||  |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  13377009 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgag-aaatgaattgttgttg 13377107  T
Q  181 gtgattttgtaaaat 195  Q
    | | |||||| ||||    
T  13377108 gcggttttgtgaaat 13377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17609038 - 17608886
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || || ||| | |||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  17609038 atgttgttgttgaattatgatgagattcatg-ttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 17608940  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| ||| |  |||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  17608939 atgatttgattatgag-aattgagttgttgttgttggttttggaaaatgggttga 17608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 37234028 - 37234149
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| || ||| ||| |||||| ||||     
T  37234028 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttgatgatga-aaattgagtttttgtg 37234126  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  37234127 gttggttttgtaaaatgggttga 37234149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 7641044 - 7641128
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7641044 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 7641128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 8538047 - 8538151
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||     
T  8538047 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaata 8538145  T
Q  149 atgatt 154  Q
    ||||||    
T  8538146 atgatt 8538151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 8603286 - 8603390
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||     
T  8603286 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaata 8603384  T
Q  149 atgatt 154  Q
    ||||||    
T  8603385 atgatt 8603390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19603092 - 19603055
Alignment:
Q  165 aaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19603092 aaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 19603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 49997418 - 49997548
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgc-tgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatat 147  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| |||| || ||||||||||||||| | ||| || |||||| | || | | |||| || |||||||||| ||    
T  49997418 atgttgttgttgaattaaggtgagaatcatgttt-aactgatgttgttgttgcttaagagatattgttgttgatcattcatggatttggtgttcataaat 49997516  T
Q  148 catgattgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    |||| |||||| |||| |||| |||||||||||    
T  49997517 catggttgttgatgag-aaataagttgttgttg 49997548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 52400741 - 52400675
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttg 116  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  52400741 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgacgttgttgttgctgagagatgttgttg 52400675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22035593 - 22035509
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22035593 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 22035509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 194
Target Start/End: Original strand, 51627833 - 51627945
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  51627833 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgctgttgag-aaatgagatgttgttg 51627931  T
Q  181 gtgattttgtaaaa 194  Q
    ||| ||| ||||||    
T  51627932 gtggtttggtaaaa 51627945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 3431377 - 3431570
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3431377 tatgaaaatgagttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttg 3431476  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  3431477 ctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgag-aaataagatgttgttggtggttttgtgaaat 3431570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22886485 - 22886305
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886485 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaactatgacatgttgttgt-gaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 22886387  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  22886386 ctgagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcatgattgttgatgagaaattaagatgttgttggt 22886305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18612565 - 18612401
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  18612565 tatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagatttaattgatgttgttgttg 18612466  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18612465 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgagtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 18612401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18619470 - 18619306
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  18619470 tatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagatttaattgatgttgttgttg 18619371  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18619370 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgagtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 18619306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2545103 - 2544944
Alignment:
Q  3 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 102  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |    
T  2545103 tgaaaatgggtagttgtaaaattatgcttaattgatgaattataacatgttgttgttgaattgaggtgggaatcaagtttcaattgatgttgttgt---t 2545007  T
Q  103 gagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2545006 gatacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttgatatatcatgattgttgttgagaaa 2544944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22147597 - 22147433
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22147597 tatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaaattttaattgatgttgttgttg 22147498  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| |||| ||||  |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22147497 ctgagacatgtcgttgtatat-tattatggcttaggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 22147433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 182
Target Start/End: Original strand, 21494593 - 21494725
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  21494593 atgttgttgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttataacttgggtgtgcatatatc 21494692  T
Q  149 atgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    |||||||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  21494693 atgattgttggtgag-aattgagatgttgttggt 21494725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 13721107 - 13721217
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  13721107 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggtg 13721205  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  13721206 gttttgtgaaat 13721217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33528535 - 33528383
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct--gagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatata 146  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||   | |||||||||||||||||| |    
T  33528535 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagagatattttgttgatgat---tcatggcttgggtgttcataaa 33528440  T
Q  147 tcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgat 203  Q
    |||||||| | || ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33528439 tcatgatttgatgatgagaaa-tgggttgttgttgttgattttgtaaaatgggttgat 33528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5854724 - 5854572
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  5854724 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 5854626  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| ||| || |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5854625 atgatttgatgatgag-aattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 5854572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 21198272 - 21198434
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| || | |||| | |||||    
T  21198272 aattgttgaattatgttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgctgttaatgattcatggc 21198370  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21198371 ttgggtgttcataattcatgatttgtggatgag-aaatgagttgttgttggtggtttggtaaaat 21198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38533759 - 38533607
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||| ||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||  ||    
T  38533759 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgtgcataattc 38533661  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38533660 atgatttgttgatgag-aaatgagatgttgttggagactttgtaaaatgggttga 38533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 16873166 - 16873340
Alignment:
Q  19 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| | |||||| || | ||| |||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16873166 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt-aatcgatgttgttgttgctgagatatgttgttgag 16873264  T
Q  119 tatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||| || |||| |||||| |||||| ||||    
T  16873265 tatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattattgatgag-aaataagatgttattggtggttttgtgaaat 16873340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837163
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| | |||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggc 23837227  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  23837226 ttgggtattcataattcatgatttgttgatgag-aaatgagttgttggtggtggttttgtgaaat 23837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26011604 - 26011452
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  26011604 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttg-aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 26011506  T
Q  149 atgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||| | || ||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26011505 atgatttgatgatgagaat-taagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 26011452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 27233204 - 27233348
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  27233204 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 27233302  T
Q  149 atgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaa 194  Q
    |||||| | |  ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  27233303 atgatttgataatgagaaa-taagttgttgttgttggttttgtaaaa 27233348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 18261608 - 18261762
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  18261608 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 18261706  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||| || |||| || | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  18261707 atgagttgatgatgag-aattaagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 18261762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 22736006 - 22736127
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaatt-atggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgt 178  Q
    |||||||||||||||| ||||| |   ||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  22736006 ttcaattgatgttgttcttgctaactgatgttgttg-ttgttaattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatga-aaaatgagttgttgt 22736103  T
Q  179 tggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  22736104 tggtgactttgtaaaatgggttga 22736127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15933408 - 15933256
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | ||||||||||||||  || |||    
T  15933408 atgttgttgttgaattatgatgagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatc 15933310  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| |||  | |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15933309 atgatttgaagatgag-aattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 15933256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 33611190 - 33611334
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| || |||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  33611190 atgttgttgttgaattgtgttgagaaccatgttt-aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgtgtgttcataaatc 33611288  T
Q  149 atgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaa 194  Q
    |||||| | || ||||| | | ||||||||||| || ||||||||||    
T  33611289 atgatttgatgatgagata-taagttgttgttgttggttttgtaaaa 33611334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 18041669 - 18041823
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||| | || |||| |||||||||| |||    
T  18041669 atgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttaggtgttcataaatc 18041767  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||  || || | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  18041768 atgagtttatgatgtg-aaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggttgat 18041823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Original strand, 37653756 - 37653895
Alignment:
Q  52 ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg 151  Q
    |||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  37653756 ttgttgttgaattctgttgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgatttatggcttgggtgttcatat--catg 37653852  T
Q  152 att-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaa 194  Q
    ||| | || ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  37653853 atttgatgatga-aaaataagttgttgttgttggttttgtaaaa 37653895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 38635785 - 38635878
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcat 143  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | |||||||||||||||||    
T  38635785 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcat 38635878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 45465263 - 45465393
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || | ||||||||||||| |||    
T  45465263 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtgttcataaatc 45465361  T
Q  149 atg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||| |||| || || | ||||||||||||||||    
T  45465362 atgaattgatgatg-ggaaatgagttgttgttg 45465393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Original strand, 45559074 - 45559176
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||| | || ||||||||| ||||| |||    
T  45559074 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatagcttgggtggtcataaatc 45559172  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  45559173 atga 45559176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22742874 - 22742717
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctg---agatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatat 145  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||   ||  || |||||| | |||| |  |||||||||||||||||     
T  22742874 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttgttgaggaatattgttgttgatgattcgtggcttgggtgttcataa 22742776  T
Q  146 atcat-gattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    ||| | | |||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  22742775 atcttggtttgttgatgag-aaataagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 22742717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Original strand, 39446935 - 39447034
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||  || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39446935 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggtatgcat-gattatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttg 39447032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23218014 - 23217974
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaa 62  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23218014 aattatgttcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 23217974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 371248 - 371055
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  371248 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttg 371149  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  371148 ccgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgag-aaataagatgttgttggtggttttgtgaaat 371055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 18980200 - 18980310
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| |||||    
T  18980200 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcataattgttgatgag-aaataagatgttggtggtg 18980298  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  18980299 gttttgtgaaat 18980310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 14251077 - 14251187
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  14251077 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgacttatggcttgggtgttcagataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggtg 14251175  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  14251176 gttttgtgaaat 14251187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15927645 - 15927535
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  15927645 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatctatggcttgggtgttcacataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggtg 15927547  T
Q  184 attttgtaaaat 195  Q
     |||||| ||||    
T  15927546 gttttgtgaaat 15927535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 7284229 - 7284376
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 181  Q
    ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || | | |||||||| || | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7284229 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataattcatggcttgagtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgttgg 7284327  T
Q  182 tgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    || |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  7284328 tggttttgttaaatgggttgataatggagaagtttgattttgacgatgt 7284376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13758511 - 13758337
Alignment:
Q  19 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| | |||||| || | ||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13758511 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt-aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgag 13758413  T
Q  119 tatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||| |||||| |||||| ||||    
T  13758412 tatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttattggtggttttgtgaaat 13758337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Original strand, 14272054 - 14272203
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |   || |||||| | |||| | |||||||| |||||||||  |||||||| | || ||||||| |||||||||| |    
T  14272054 ttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaa-tgagttgttggt 14272152  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  14272153 ggtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagttttattttaatgatgt 14272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 17224058 - 17224220
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||| | |||||    
T  17224058 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggc 17224156  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17224157 ttgggtattcataattcatgatttgttgatgag-aaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 17224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48356754 - 48356602
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  48356754 atgttgttgttgaattatgatgagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 48356656  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| ||| || |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  48356655 atgatttgatgatgag-aattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 48356602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13377656 - 13377485
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| | |||||    
T  13377656 aattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggc 13377558  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  13377557 ttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgag-aaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 13377485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 16915096 - 16915217
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||    
T  16915096 ttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgaagag-aattgagttgttgtt 16915194  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  16915195 gttggttttgtaaaatgggttga 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 34241325 - 34241477
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  |  |||||| | |||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  34241325 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgataagtgacattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatc 34241423  T
Q  149 atgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||||| | || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  34241424 atgatttgatgatga-aaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaagggttga 34241477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15358907 - 15358803
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  | |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15358907 atgttgttgttgaattgtgatgggaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagaagttttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatatatc 15358809  T
Q  149 atgatt 154  Q
    | ||||    
T  15358808 aagatt 15358803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4446322 - 4446168
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgatta-tgaattatggcttgggtgttcatatat 147  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||  ||||||||||||||||| | ||| ||| || || | | ||| | |||||||||||||||||| ||    
T  4446322 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtt--aattgatgttgttgttgataagagatgctgatgttgaatgattcatggcttgggtgttcataaat 4446225  T
Q  148 catga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    ||||| ||| || || |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  4446224 catgaattgatgatgtgaaa-tgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 4446168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 10000480 - 10000564
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  10000480 gttgtgaaattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgctgttg 10000564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13352089 - 13352044
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggg 67  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13352089 aattatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattggg 13352044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 20583691 - 20583795
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  20583691 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 20583789  T
Q  149 atgatt 154  Q
    ||||||    
T  20583790 atgatt 20583795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Original strand, 17947729 - 17947831
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  17947729 atgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 17947827  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  17947828 atga 17947831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31501283 - 31501190
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcat 143  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| |  || || |||||| | |||| | |||||||||||||||||    
T  31501283 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcat 31501190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16418643 - 16418559
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16418643 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 16418559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 13448964 - 13449094
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| |  | ||||||||||| ||| |||    
T  13448964 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcgtagcttgggtgttgataaatc 13449062  T
Q  149 atg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  13449063 atgaattgatgatgag-aaatgagttgttgttg 13449094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28390422 - 28390292
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || | ||||||||||||| |||    
T  28390422 atgttattgttgaattgtgatgataatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtgttcataaatc 28390324  T
Q  149 atg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  28390323 atgaattgatgatgag-aaatgagttgttgttg 28390292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38424329 - 38424175
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||| | |||| || |||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | ||| |||||||||||||| |||    
T  38424329 atgttgttgttgaattatgatgagaattatgttt-aagtgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatc 38424231  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||| || ||| ||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  38424230 atgatttgatggtga-aaaataagttgttgttgtgggttttgtaaaaatgggttgat 38424175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4484834 - 4484733
Alignment:
Q  52 ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg 151  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || |||||||| |||||  ||||||    
T  4484834 ttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatg 4484736  T
Q  152 att 154  Q
    |||    
T  4484735 att 4484733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11287491 - 11287394
Alignment:
Q  86 ttgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11287491 ttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttggtg 11287394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14935396 - 14935319
Alignment:
Q  127 atggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  14935396 atggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgag-aaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 14935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15362989 - 15362912
Alignment:
Q  127 atggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15362989 atggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgag-aaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 15362912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13274865 - 13274765
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| | ||||||| ||| | |||   |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13274865 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgag-aaatgagatgttgttg 13274767  T
Q  181 gt 182  Q
    ||    
T  13274766 gt 13274765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 49944 - 50124
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49944 tatgaaaatgggtagttgtgaaattatacttaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 50043  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  50044 ctgagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgatga-aaaataagatgttgttggt 50124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 5677 - 5875
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5677 tatgaaaatgggttgttttgaaattatgcttaattaatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 5776  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgta-aaatgggt 199  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5777 ctgagaaatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatgtcatgattgttggtgag-aaatgagatgttgttggttgttttgtataaatgggt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11901 - 11740
Alignment:
Q  3 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11901 tgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaatcatgacatgtt-ttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 11803  T
Q  103 gagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11802 gagacatgttgttg-ttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaa 11740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Original strand, 8360 - 8425
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatata 146  Q
    |||||||||||||||||||| | |   ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  8360 ttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatata 8425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5380 - 5224
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  5380 tatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttg 5281  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttg 158  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280 ctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttg 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 165062 - 165224
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  165062 tatgaaaatgggttcttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 165161  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaa 167  Q
    |||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  165162 ctgagacatgttgt---ttatg-attatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaaa 165224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17857 - 17695
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  17857 tatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgtt---gttg 17761  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 166  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17760 ctgagacaagttgttgtttatgatttatggcttgggtgctcatatatcatgattgttggtgagaaa 17695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 13395 - 13575
Alignment:
Q  16 ttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctg---agatatgtt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||   | | |||||    
T  13395 ttgtgaaattatgtttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagtttcaattgatgttgttgttgttgttgatacatgtt 13494  T
Q  113 gttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||| |||||| ||||    
T  13495 gttgtttatga-ttatggcttgggtgttgatatatcatgattcttgttgag-aaatggattgttgttagtggttttgtgaaat 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 93940 - 94061
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||| || | | |||  |||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  93940 ttcaattgatgttgttattaataagtgatgttgttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaa-tgagatgttgtt 94038  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  94039 ggtgactttgtaaaatgggttga 94061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28663 - 28466
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||  |||| | | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| | |||||    
T  28663 aattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggc 28565  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||  |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28564 ttgggtgttcataattcatgatttattggtgag-aaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21687 - 21637
Alignment:
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21687 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3377 - 3230
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 181  Q
    ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3377 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgttgg 3279  T
Q  182 tgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3278 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 34511 - 34607
Alignment:
Q  3 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34511 tgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgaaaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 34607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 34607 - 34670
Alignment:
Q  118 ttatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  34607 ttatgatttatgacttgggtgttcatataacatgattgttggtgag-aattgagatgttgttggt 34670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 61323 - 61461
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  61323 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgtgg 61421  T
Q  101 ctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgtt 140  Q
     | ||| || |||||| | |||| | |||||||| |||||    
T  61422 ttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgtgtgtt 61461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 17410 - 17506
Alignment:
Q  1 tatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||    
T  17410 tatgaaaatgggttgctgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgt 17506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21586 - 21442
Alignment:
Q  86 ttgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtga 184  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  21586 ttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaa-tgagttgttgttggtgg 21488  T
Q  185 ttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21487 ttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31289 - 31141
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31289 tcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaa-tgagttgttgttg 31191  T
Q  181 gtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31190 gtggttttgtaaaatgggttgataatgaaaaagtttgattttgatgatgt 31141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 222 - 75
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 181  Q
    ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  222 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgctgagaaa-tgagttgttgttgt 124  T
Q  182 tgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  123 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25036 - 24890
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 181  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25036 tcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatggcttgggt-tgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgttgg 24939  T
Q  182 tgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24938 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 24890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 283 - 430
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 181  Q
    ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || | | || |||||||| | |||   |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  283 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatagcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagcttttgttgg 381  T
Q  182 tgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  382 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6679
Alignment:
Q  153 ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6603 ttgttgttgagaat-tgagttgttcttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 6679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 43935 - 44087
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  43935 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 44033  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44034 atgatttgatgatgag-aaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 23809 - 23963
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||| |||||||||| | ||  || |||||| | |||| | |||||||| |||||| ||||||    
T  23809 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgacgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgtgtgttcgtatatc 23907  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    || | ||| || ||| ||||| | ||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23908 ataatttgatgatga-aaaataaattgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 23963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 69567 - 69415
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  69567 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 69469  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| ||| || |||| || |||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  69468 atgatttgatgatgag-aattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 69415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 61
Target Start/End: Original strand, 244920 - 244959
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttga 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  244920 aattatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttga 244959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77129
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||  | |||| | |||||    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggc 77065  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  77066 ttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaa-tgagttgttgttggtggttttgtgaaat 77129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6654 - 6500
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  6654 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgatgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttaggtgttcataaatc 6556  T
Q  149 atgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||||| | || ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  6555 atgatttgatgatgagaaa-taagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 6500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2635 - 2483
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||| ||||||||||||| |||    
T  2635 atgttgttgttgaattatgatgagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatc 2537  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||| ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  2536 atgatttgatgatgag-aaatgacttgttgttgttggttttctaaaatgggttga 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 103090 - 103211
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||| || | | |||| |||||||| ||||  |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  103090 ttcaattgatgttattgtttctaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaa-tgagttgttgtt 103188  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  103189 ggtgactttgtaaaatgggttga 103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4611
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  | |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4715 atgttgttgttgaattgtgatgggaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagaagttttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatatatc 4617  T
Q  149 atgatt 154  Q
    | ||||    
T  4616 aagatt 4611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 270
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| | || | | ||| |    
T  436 aattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgcc 338  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaatgggt 199  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  337 ttgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaa-tgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 108086 - 107967
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg 183  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||| ||    
T  108086 aattgatgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattttgatgag-aaataagttgttgttgttg 107988  T
Q  184 attttgt-aaaatgggttgat 203  Q
     |||| | |||||||||||||    
T  107987 gttttttaaaaatgggttgat 107967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35444
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||| || |||  || ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||| | |||||    
T  35605 aattgttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgtt-caattgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggc 35507  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35506 ttgggtattcataattcatgatttgttgatgag-aaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaat 35444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 123
Target Start/End: Original strand, 1693 - 1732
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1693 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatga 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13048
Alignment:
Q  170 agttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatga 227  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12990 agttgttgttgatggttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31099 - 30978
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||| | |||| | |||||||| ||||||||| |||| |||| | || ||||||  ||||||||||||    
T  31099 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatactgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcaagatttgatgatgagaat-tgagttgttgtt 31001  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggttga 202  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  31000 gttgcttttgtaaaatgggttga 30978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11173 - 11100
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11173 ttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgtttatgattcatggcttaggtgttcatagatcatgatt 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5081 - 4906
Alignment:
Q  19 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgat 118  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| | |  |  ||| | | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  5081 tgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat-caattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgat 4983  T
Q  119 tatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgtaaaat 195  Q
     || | | ||||||||| ||||||||  |||||| ||| || |||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  4982 gataattcatggcttggttgttcataattcatgatttgctgatgag-aaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 195
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116795
Alignment:
Q  87 tgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgat 185  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||  |||||||||||| |    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatga-aaaatggattgttgttggtggt 116785  T
Q  186 tttgtaaaat 195  Q
    ||||||||||    
T  116786 tttgtaaaat 116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27604 - 27453
Alignment:
Q  52 ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg 151  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||| |||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  27604 ttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgatgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatg 27506  T
Q  152 a-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    | ||| || || | ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  27505 agttgatgatgtg-aaatgagttgttgttgtcggttttgtaaaaatgggttgat 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 7812 - 7966
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  7812 atgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 7910  T
Q  149 atga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    |||| ||  || || | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  7911 atgagtttgtgatgtg-aaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggttgat 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7508 - 7358
Alignment:
Q  53 tgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga 152  Q
    ||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | |||| | |||||||||||  ||||| |||||||    
T  7508 tgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttggtgttgctaagagatattgttgctaatgattcatggcttgggtactcataaatcatga 7410  T
Q  153 -ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
     ||| || |||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  7409 tttgatgatgag-aaataagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 7358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16933 - 16783
Alignment:
Q  53 tgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga 152  Q
    ||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | |||| | |||||||||||  ||||| |||||||    
T  16933 tgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttggtgttgctaagagatattgttgctaatgattcatggcttgggtactcataaatcatga 16835  T
Q  153 -ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
     ||| || |||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  16834 tttgatgatgag-aaataagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 16783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37668 - 37538
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  37668 atgttattgttgaattgagacgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 37570  T
Q  149 atg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  37569 atgaattgatgatgag-aaatgagttgttgttg 37538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 85643 - 85489
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||| || |||| ||||||||||| ||| || |||||| | |||| | ||| |||||||||||||| |||    
T  85643 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aagtgatattgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatc 85545  T
Q  149 at-gattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    || | |||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  85544 atggtttgttgatga-aaaataggttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 85489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6740 - 6622
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    ||||||||||||||||  | || ||  ||||| ||| | |||| | |||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  6740 ttcaattgatgttgttactcctaagtgatgtttttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaa-tgagttgttgtt 6642  T
Q  180 ggtgattttgtaaaatgggt 199  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  6641 ggtggttttgtaaactgggt 6622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2572 - 2471
Alignment:
Q  42 ttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttc 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | || ||| || | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| | ||||||||||| |||    
T  2572 ttatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattc 2474  T
Q  142 ata 144  Q
    |||    
T  2473 ata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 154
Target Start/End: Original strand, 1117 - 1187
Alignment:
Q  84 aattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1117 aattgatgttgttgttgctaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatt 1187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Original strand, 2436 - 2607
Alignment:
Q  32 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 131  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  | |  || ||| ||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||| | |||||    
T  2436 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgtt-caattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggc 2534  T
Q  132 ttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    ||||| |||||||  |||||  ||| || |||| |||| ||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  2535 ttgggcgttcataattcatgttttgatgatgag-aaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 23859 - 23943
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23859 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 23943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 7355 - 7271
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7355 gttgtgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 7271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 1619 - 1659
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1619 aattatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4643 - 4579
Alignment:
Q  80 tttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||    
T  4643 tttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcata 4579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9257 - 9193
Alignment:
Q  80 tttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||    
T  9257 tttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcata 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12694
Alignment:
Q  190 taaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12734 taaaatgggttgatagtgaagaagtttgattttgatgatgt 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3361 - 3260
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  3361 atgttgttgttgaattgtgatga-aatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 3264  T
Q  149 atga 152  Q
    ||||    
T  3263 atga 3260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 100
Target Start/End: Original strand, 22559 - 22609
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22559 atgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgttt-aattgatgttgttgttg 22609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 230
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3427
Alignment:
Q  195 tgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3392 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197545
Alignment:
Q  49 atgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatc 148  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||| |||||| |||||| |||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtcttcataaatc 197488  T
Q  149 atg-attgttgttgagaaaatgagttgttgttggtg---attttgtaaaatgggttga 202  Q
    |||  ||| || |||| || ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  197489 atgctttgatgatgag-aattgagttgttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 197545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 745 - 846
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | |||||||||||   |||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  745 tcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttg 843  T
Q  181 gtg 183  Q
    |||    
T  844 gtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 109631 - 109732
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||  | |||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  109631 tcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggattgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttg 109729  T
Q  181 gtg 183  Q
    |||    
T  109730 gtg 109732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1433 - 1337
Alignment:
Q  108 atgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgattttgt-aaaatgggttgat 203  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  1433 atgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgat 1337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 11877 - 11977
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | |||||||| || | |||   ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  11877 tcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatggttcatgattggtgttgag-aaatgagatgtttttgg 11975  T
Q  182 tg 183  Q
    ||    
T  11976 tg 11977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6743 - 6659
Alignment:
Q  15 gttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || ||| | ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  6743 gttgtgaaattttgcttaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttattgttg 6659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Original strand, 33897 - 33996
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||  || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33897 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggtatgcat-gattatgatttgttgttgag-aaatgagatgttgttg 33994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 65
Target Start/End: Original strand, 44234 - 44275
Alignment:
Q  24 ttatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattg 65  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44234 ttatgctcaattgacgaattatgacatgttgttgttgaattg 44275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 243 - 203
Alignment:
Q  22 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaa 62  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  243 aattatgctcaattgttgaattatgacatgttgttgttgaa 203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10741 - 10642
Alignment:
Q  81 ttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatg-attgttgttgagaaaatgagttgttgtt 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| | || | | ||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  10741 ttcaattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatga-aaaatgaattgttgtt 10643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33740 - 33668
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  33740 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctagggtgttcataattcatgatt 33668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40736 - 40664
Alignment:
Q  82 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt 154  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40736 tcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University