View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17978_low_7 (Length: 532)

Name: NF17978_low_7
Description: NF17978
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17978_low_7
NF17978_low_7
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (13-504)||(29910170-29910662)
chr2 (13-501)||(14271802-14272291)
chr2 (13-515)||(18577511-18577978)
chr2 (44-515)||(35875838-35876286)
chr2 (44-515)||(35883327-35883775)
chr2 (44-515)||(36723040-36723488)
chr2 (13-122)||(33402963-33403072)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (13-515)||(9417955-9418457)
chr8 (13-515)||(24097214-24097721)
chr8 (13-500)||(7836492-7836980)
chr8 (13-505)||(7807067-7807562)
chr8 (13-497)||(24268408-24268895)
chr8 (60-515)||(31576412-31576871)
chr8 (18-515)||(12766000-12766483)
chr8 (13-247)||(997140-997374)
chr8 (353-500)||(988048-988195)
chr8 (18-515)||(20028519-20028993)
chr8 (44-515)||(42713709-42714161)
chr8 (18-515)||(20036280-20036754)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (13-515)||(11222002-11222496)
chr5 (13-515)||(42733566-42734060)
chr5 (13-402)||(26649161-26649546)
chr5 (13-402)||(26920746-26921131)
chr5 (13-379)||(2641036-2641403)
chr5 (263-422)||(26649558-26649718)
chr5 (263-422)||(26921143-26921303)
chr5 (416-511)||(26651730-26651825)
chr5 (416-511)||(26923315-26923410)
chr5 (423-497)||(22129373-22129448)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (13-450)||(15719-16157)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (13-515)||(9735574-9736068)
chr7 (87-515)||(4314162-4314591)
chr7 (14-515)||(32816669-32817167)
chr7 (18-515)||(2890405-2890900)
chr7 (113-515)||(48712612-48713008)
chr7 (13-380)||(8980592-8980959)
chr7 (13-65)||(4314588-4314640)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (13-500)||(25514725-25515212)
chr4 (13-500)||(50065845-50066331)
chr4 (13-500)||(28069467-28069951)
chr4 (13-380)||(11480916-11481286)
chr4 (21-500)||(50518196-50518678)
chr4 (44-380)||(9243794-9244131)
chr4 (44-380)||(7580473-7580810)
chr4 (44-242)||(34495225-34495423)
chr4 (16-215)||(28257581-28257779)
chr4 (87-324)||(9204009-9204249)
chr4 (87-324)||(9208228-9208468)
chr4 (416-497)||(25538495-25538576)
chr4 (315-503)||(28257302-28257489)
chr4 (23-128)||(9245624-9245729)
chr4 (188-324)||(9275520-9275655)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (13-471)||(7786503-7786952)
chr3 (13-500)||(36433803-36434291)
chr3 (13-453)||(9308183-9308624)
chr3 (238-500)||(46280066-46280329)
chr3 (18-515)||(13329446-13329922)
chr3 (155-478)||(23484855-23485171)
chr3 (13-211)||(13978313-13978512)
chr3 (302-451)||(13953305-13953456)
chr3 (414-500)||(37919710-37919796)
chr3 (13-103)||(9294433-9294523)
chr3 (18-127)||(23484740-23484850)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (13-500)||(35755785-35756273)
chr1 (13-486)||(5382612-5383079)
chr1 (14-391)||(26907713-26908091)
chr1 (13-282)||(23550192-23550458)
chr1 (339-500)||(23550488-23550649)
chr1 (54-102)||(10632920-10632969)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (13-380)||(14097429-14097790)
chr6 (13-451)||(2850189-2850628)
chr6 (18-202)||(17513876-17514061)
chr6 (384-514)||(14099909-14100040)
chr6 (287-515)||(17513616-17513841)
[»] scaffold0753 (2 HSPs)
scaffold0753 (52-380)||(2892-3221)
scaffold0753 (44-341)||(846-1147)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (23-380)||(2590-2951)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (13-224)||(11410-11620)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (18-515)||(449-923)
[»] scaffold0135 (7 HSPs)
scaffold0135 (87-324)||(2092-2332)
scaffold0135 (87-324)||(6307-6547)
scaffold0135 (87-324)||(10522-10762)
scaffold0135 (87-324)||(14737-14977)
scaffold0135 (87-324)||(18952-19192)
scaffold0135 (87-324)||(23167-23407)
scaffold0135 (87-324)||(27382-27622)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (302-451)||(5445-5596)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (240-331)||(3501-3592)
scaffold0186 (14-194)||(3320-3499)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 504
Target Start/End: Original strand, 29910170 - 29910662
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  29910170 aaaataattcaaggttaattaaccaagaatgtattgtcatcacatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttttctttatgaggatgcc 29910269  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29910270 tcttacactcaaaattattttcatcatttcatcaaaatgataaaaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 29910369  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29910370 aatgatattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttgaagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 29910469  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  29910470 ctattcaaaatatgatttgtagaatagaaataaatcacaggaattttgactttgagaaaagtttatcatgttcctaccaatatcattctggtcatacaaa 29910569  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgtt 504  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29910570 aagaagaaaatatcttcatttgatgatttaaaagataaaaaaaatattacaattattattttgttatccactaatttgttttgtgagaatgtt 29910662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 501
Target Start/End: Original strand, 14271802 - 14272291
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  14271802 aaaatagttcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacatcatcaactctgatgaaagaatgttctcaagatgaggatgca 14271901  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14271902 tattacactctaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaacaaattcatgaataaattatttattaagtcattcatt 14272001  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||| ||||| ||||||| ||||    
T  14272002 aatgatattgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcat-----------gatggtccaagaatcttcaatca 14272090  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttga-----------ctttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattct 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||           ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  14272091 ctattcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgaaattcctttgagaaaggtttatcatgttcctacaaatatcatttt 14272190  T
Q  401 ggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  14272191 ggtcatacaaagtgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctattgattcgttttgtgagaa 14272290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 515
Target Start/End: Original strand, 18577511 - 18577978
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||              
T  18577511 aaaataattcaaggttaattaattgagaatctattgtcatctcatatagaaaagaacattatcaactccgatgaaataatgttctcatga---------- 18577600  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
         |  | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18577601 -----cgtttaaaattattcccatcatttcatcaaaatgattagaatcaattttcaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtaattcatt 18577695  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||| ||| |||| |  |  ||||||||||||    
T  18577696 aataatattgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatca------tggagattatatcataaaagacttatgatggtataggaatcttccatca 18577789  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||               ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||   |||||||    
T  18577790 ctattaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaag---------------gaaacatttttcatgttcctacaaatatcattctgattatgcaaa 18577874  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtga 511  Q
    | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  18577875 gtgaagaaaacaccctcatttgatgttttaaaagataagaaaaatattacaattattattttgttatccgctaatgtgttttatgataatgtttcagtga 18577974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 515
Target Start/End: Original strand, 35875838 - 35876286
Alignment:
Q  44 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttc 142  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35875838 tattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttc 35875937  T
Q  143 atcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 242  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||                     ||| |||| |||||| |||    
T  35875938 atcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcattaa---------------------ttggagaattatcaaggaa 35876016  T
Q  243 gaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatt-tgaagaata-aa 340  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||  | |||||| ||    
T  35876017 gaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaa 35876116  T
Q  341 ataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgtttt 440  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| || |||| ||    
T  35876117 atcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaagaacattctggtcatacaaagtgaagagaacatcctcactttatgtgtt 35876216  T
Q  441 aaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaat 515  Q
          ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35876217 ----tttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaat 35876286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 515
Target Start/End: Original strand, 35883327 - 35883775
Alignment:
Q  44 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttc 142  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35883327 tattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttc 35883426  T
Q  143 atcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 242  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||                     ||| |||| |||||| |||    
T  35883427 atcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcattaa---------------------ttggagaattatcaaggaa 35883505  T
Q  243 gaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatt-tgaagaata-aa 340  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||  | |||||| ||    
T  35883506 gaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaa 35883605  T
Q  341 ataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgtttt 440  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| || |||| ||    
T  35883606 atcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaagaacattctggtcatacaaagtgaagagaacatcctcactttatgtgtt 35883705  T
Q  441 aaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaat 515  Q
          ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35883706 ----tttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaat 35883775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 515
Target Start/End: Original strand, 36723040 - 36723488
Alignment:
Q  44 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttc 142  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36723040 tattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttc 36723139  T
Q  143 atcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 242  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||                     ||| |||| |||||| |||    
T  36723140 atcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcattaa---------------------ttggagaattatcaaggaa 36723218  T
Q  243 gaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatt-tgaagaata-aa 340  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||  | |||||| ||    
T  36723219 gaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaa 36723318  T
Q  341 ataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgtttt 440  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| || |||| ||    
T  36723319 atcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaagaacattctggtcatacaaagtgaagagaacatcctcactttatgtgtt 36723418  T
Q  441 aaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaat 515  Q
          ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36723419 ----tttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaat 36723488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 33402963 - 33403072
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  33402963 aaaatagttcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacatcatcaactccaatgaaagaatgttctcaagatgaggatgca 33403062  T
Q  113 tattacactc 122  Q
    | ||||||||    
T  33403063 tgttacactc 33403072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 515
Target Start/End: Original strand, 9417955 - 9418457
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  9417955 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatatcatatagaagagaaaattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaagatgca 9418054  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9418055 tattacactcgaaattattctaatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcataaatgaattatttattaagtcgttcatt 9418154  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  9418155 aatgatattgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaatatttatgatggtccaagaatcttccatca 9418254  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||  |||    
T  9418255 c-attcaagatataatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttaagaaaggtttatcatgttcctacaaatatcattctgctcatataaa 9418353  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtga 511  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  9418354 gtgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatccggtaatgtattttgtgagaatgtttcagtga 9418453  T
Q  512 gaat 515  Q
    ||||    
T  9418454 gaat 9418457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24097721 - 24097214
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24097721 aaaataatccaaggttcattaaccgagaaggtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctgatgaaagaattttctcatgataaggatggc 24097622  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24097621 tattacacttgaaattattctcatcatttcatcaaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaatccataaatgaattattcattaagtcattcatt 24097522  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  24097521 catgatgttgattggagaattatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcatacaagacttagcatgatccaagaatcatccatca 24097422  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaa----tcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatg 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    ||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| | ||||| |||     
T  24097421 ctattcaagatatgatttggagaatagaaatcaattactcaaatgaattttgactttgagaaaagtctttcatgttcctacaaatattaatctggtcata 24097322  T
Q  408 caaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgtttta 507  Q
     | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  24097321 tagagtgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatccactaatgtgttttgtaagaatgtttca 24097222  T
Q  508 gtgagaat 515  Q
    ||||||||    
T  24097221 gtgagaat 24097214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 500
Target Start/End: Original strand, 7836492 - 7836980
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7836492 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgca 7836591  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7836592 tattacactggaaattattatcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 7836691  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | | |||| ||||| |||| || ||||    
T  7836692 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaaaaaaaatcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatactcatgatggtccaagaatcctctatca 7836791  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaataa-aataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  7836792 ctattcaatatatgatttggagaacaacaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttccaacaaatatcattttggtcatacaaa 7836891  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
    | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||    
T  7836892 gtgaagaagacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctactggtgtgttttgtgagaa 7836980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 505
Target Start/End: Original strand, 7807067 - 7807562
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||     
T  7807067 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcctatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcacgatgagaatgca 7807166  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7807167 tattacactagaaattattctcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 7807266  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaag--aagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccat 310  Q
     ||| ||||||| | ||||  |||||||  || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | | |||| || || |||| || ||    
T  7807267 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaaaaaaaaaatcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatactcatgatggtctaagaatcctctat 7807366  T
Q  311 cactattcaagatatgatttgaagaataa-aataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  7807367 cactattcaatatatgatttggagaacaacaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttccaacaaatatcattttggtcataca 7807466  T
Q  410 aagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttt 505  Q
    ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||    
T  7807467 aagtgaagaagacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctactagtgtgttttgtgaaaatgttt 7807562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 497
Target Start/End: Original strand, 24268408 - 24268895
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || | |||||     
T  24268408 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatttattgtcatctcatatagaagcgaacattatcaactccgatgaaagaatgatctcataatgaagatgca 24268507  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24268508 tattacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattataatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 24268607  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24268608 aatgatattgattgaaaaaatataaaagaagaaaattcatgatcacatgcttgatgattctatcgtaaaagatttaggatgatcgaagaatcttccatca 24268707  T
Q  313 --ctattcaagatatgatt-tgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgc 408  Q
       | || |||||||||||  | |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||  |    
T  24268708 tttttttaaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaacgaatttttactttgagagaggtttctcatatccttacaaagaacattctggtcagac 24268807  T
Q  409 aaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtga 497  Q
    |||| ||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  24268808 aaagtgaagagaacatcctcacttgatgtttttaaagataacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtga 24268895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 60 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31576871 - 31576412
Alignment:
Q  60 agaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaat 159  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31576871 agaagcgaacattatcaactccgatgaaagaatgatctcataatgagtatgcatattacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaat 31576772  T
Q  160 caattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcata 259  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31576771 caactttgaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcaca 31576672  T
Q  260 tacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactatt---caagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaa 354  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||    
T  31576671 tgcttgaagattctatcataaaagatttaggatgattgaagaatcttccatcatttttttaaaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaa 31576572  T
Q  355 ttttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaa 454  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||| |     
T  31576571 tttttactttgagagaggtttctcatattcttacaaagaacattctggtcatacaaagtgaagagaacatcctcacttgatgtttttaaagataacacat 31576472  T
Q  455 atattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaat 515  Q
    || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31576471 at-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaat 31576412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Original strand, 12766000 - 12766483
Alignment:
Q  18 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  12766000 aattcaaggttaattaaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 12766099  T
Q  117 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 216  Q
    |||||| ||||||||||||||         |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  12766100 acactcgaaattattctcatcg--------aaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaataaattattcattaagtcattcattaat- 12766190  T
Q  217 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 316  Q
            || |||| |||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  12766191 --------tggagaactatcaaggaagacaaatcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagacttaggatgatccaagaatcttccatcatttt 12766282  T
Q  317 tcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaat-atcattctggccatgcaaaga 413  Q
    ||||||||| |||||  |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||  || |||  ||||     
T  12766283 tcaagatataatttgggagaatagaaatcaataaaaggaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaaagaacatttcggtcataaaaagt 12766382  T
Q  414 gaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgaga 513  Q
    ||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12766383 gaagagaacatcctcactttatgttttaaaagataacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgaga 12766481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 997140 - 997374
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  997140 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcgtcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgca 997239  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  997240 tattacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 997339  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaa 247  Q
     ||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  997340 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaa 997374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 353 - 500
Target Start/End: Original strand, 988048 - 988195
Alignment:
Q  353 aattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaa 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  988048 aattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattttggtcatacaaaatgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaa 988147  T
Q  453 aaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  988148 aaatattacaattattattttgttatctactagtgtgttttgtgagaa 988195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Original strand, 20028519 - 20028993
Alignment:
Q  18 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 116  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  20028519 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 20028618  T
Q  117 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 216  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                   
T  20028619 acactcgaaattattctcattacctcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta--------------- 20028703  T
Q  217 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 316  Q
          |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |   |||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  20028704 ------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacaaaggatggtccaagaatcttccatcatttt 20028797  T
Q  317 tcaagatatgatt-tgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagag 414  Q
    | |||||||||||  | | |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  20028798 ttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaatttttaccttgagaaaagtttctcatgttcttaaaaagaacattctggtcatacaaagtg 20028897  T
Q  415 aagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaa 514  Q
    |||| || ||| ||| || |||||||      ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20028898 aagagaacatcctcactttatgtttt----tttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaa 20028992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42714161 - 42713709
Alignment:
Q  44 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttc 142  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42714161 tattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttc 42714062  T
Q  143 atcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 242  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||                     |||| |||| |||||| |||    
T  42714061 atcgaaataattagaatcaactttgaggagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaa 42713983  T
Q  243 gaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataa-aagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatt-tgaagaata-a 339  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |  || |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||  | |||||| |    
T  42713982 gaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaaacataagatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaataga 42713883  T
Q  340 aataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttt 439  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||| |||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||    
T  42713882 aatcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaagaacatactggtcattcaaagtgaagagaacatcctcactttatgttt 42713783  T
Q  440 taaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaat 515  Q
    |      ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42713782 t-ttttttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaat 42713709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Original strand, 20036280 - 20036754
Alignment:
Q  18 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 116  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  20036280 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 20036379  T
Q  117 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 216  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||                   
T  20036380 acactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaatcaaccgatgaatgaattattcatta--------------- 20036464  T
Q  217 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 316  Q
          |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  ||||||| || || |||||||||||| | |    
T  20036465 ------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatggtcaaagaatcttccatcatttt 20036558  T
Q  317 tcaagatatgatt-tgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagag 414  Q
    | |||||||||||  | | |||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  20036559 ttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaaattttaccttgagaaaagtttctcatgttcttaaaaagaacattctggtcatacaaagtg 20036658  T
Q  415 aagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaa 514  Q
    |||| || ||| ||| || |||||||      ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20036659 aagagaacatcctcactttatgtttt----tttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaa 20036753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 515
Target Start/End: Original strand, 11222002 - 11222496
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||     
T  11222002 aaaataattcacggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgacgaaagaatggtctcatgataaggatgca 11222101  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11222102 tattacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcatt 11222201  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| |||||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||| |||||| |||||    
T  11222202 aatgatattgat---------atcaaaaaagaaaattcatgatcatatacttggagattatatcataaaagacttatgatagtccaagaatcttacatca 11222292  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  11222293 ctattcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgaaaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattcttgtcatacaaa 11222392  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtga 511  Q
    | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11222393 gtgaagaaagcatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtga 11222492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42734060 - 42733566
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  42734060 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatggtctcatgatgaggatgca 42733961  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42733960 tattacactcgaaattattatcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcatt 42733861  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| |||||||         ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||| |||||| |||||    
T  42733860 aatgatattgat---------atcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattatatcataaaagacttatgatagtccaataatcttacatca 42733770  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  42733769 ctattcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgaaaaaggtttatcatcttcctacaaatatcattcttgtcatacaaa 42733670  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtga 511  Q
    | |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42733669 gtgaagaaagcatcctcatatgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtga 42733570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 402
Target Start/End: Original strand, 26649161 - 26649546
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| | |||||     
T  26649161 aaaataattcaaggttaattaagcgagagtgtattgtcatctcatatagaagagaacattattaactccggtgaaagaatgttctcatgatgaagatgca 26649260  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||      ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26649261 tattacacttgaaattagtctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaacttt------aaatcaattcatgaatgaattacttattaagtcattcatt 26649354  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaa-tatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatc 311  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  26649355 aatgatattgattggagaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgtttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatc 26649454  T
Q  312 actattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctgg 402  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26649455 actattaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattctgg 26649546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 402
Target Start/End: Original strand, 26920746 - 26921131
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| | |||||     
T  26920746 aaaataattcaaggttaattaagcgagagtgtattgtcatctcatatagaagagaacattattaactccggtgaaagaatgttctcatgatgaagatgca 26920845  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||      ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26920846 tattacacttgaaattagtctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaacttt------aaatcaattcatgaatgaattacttattaagtcattcatt 26920939  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaa-tatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatc 311  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  26920940 aatgatattgattggagaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgtttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatc 26921039  T
Q  312 actattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctgg 402  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26921040 actattaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattctgg 26921131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 379
Target Start/End: Original strand, 2641036 - 2641403
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  2641036 aaaataattaaaggttaatttaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattattaactccgatgaaagaatgttctcatgatggggatgca 2641135  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2641136 tattacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaaatcattcatt 2641235  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| || || |    
T  2641236 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcacgatcatatgctttgagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaatcctctatta 2641335  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctca 379  Q
    || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2641336 ctgttcaagatatgatttggagaacagaaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaagtttctca 2641403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Original strand, 26649558 - 26649718
Alignment:
Q  263 ttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgac 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26649558 ttggagattctatcataaaagatttatgatggtccaagaatcttccatcactattaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgac 26649657  T
Q  362 tttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaat 422  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  26649658 tttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattctggttatacaaagtgaagaaaat 26649718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Original strand, 26921143 - 26921303
Alignment:
Q  263 ttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgac 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26921143 ttggagattctatcataaaagatttatgatggtccaagaatcttccatcactattaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgac 26921242  T
Q  362 tttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaat 422  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  26921243 tttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattctggttatacaaagtgaagaaaat 26921303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 416 - 511
Target Start/End: Original strand, 26651730 - 26651825
Alignment:
Q  416 agaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtga 511  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26651730 agaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatccactaatgtgttttgtgagaatgttttagtga 26651825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 416 - 511
Target Start/End: Original strand, 26923315 - 26923410
Alignment:
Q  416 agaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtga 511  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26923315 agaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatccactaatgtgttttgtgagaatgttttagtga 26923410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22129448 - 22129373
Alignment:
Q  423 atcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattatt--attttgttattcactaatttgttttgtga 497  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22129448 atctttatttgatgttttaaa-gattacaaacatattaaatttatttaattttgttatctactaatttgttttgtga 22129373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16157 - 15719
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  16157 aaaataagtcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaaaagaacatcatcaactccgatgaaacaatgttctcaagatgaggatgca 16058  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16057 tattacactctaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaattaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattatgtcattcatt 15958  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  15957 aatgatattgattggagaaatatcaaagaagaaaatacatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatca 15858  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15857 ctattcaagatataatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattatggtcatacaaa 15758  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataac 450  Q
    | |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15757 gtgaagaaaacatccttatttgatgttttaaaagataac 15719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 515
Target Start/End: Original strand, 9735574 - 9736068
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  9735574 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatggtctcatgatgaggatgca 9735673  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9735674 tattacactcgaaactattctcatcatttcatcaaaacggttagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcatt 9735773  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| |||||||         |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  9735774 aatgatattgat---------atcaaagaagaaaatttatgatcatatgcttggagattatatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttacatca 9735864  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| ||||    
T  9735865 ctattcaagatatgaattggagaatagaaatcaatcaaatgaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaatatcattctcttcatacaaa 9735964  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtga 511  Q
    | |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9735965 gtgaagaaaccatcctcatttgatgttttaaaagagaacaaaaattttacaattattattttgtcattcactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtga 9736064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 87 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4314591 - 4314162
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4314591 aagaatgttctcttgatgaggatgcatattacactcgaaattattatcataatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatga 4314492  T
Q  187 atgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatt 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  4314491 atgaattatttatcaagtcattctttaatgatattgattggagaattatcaaagaagaaaattgatgatcatatgcttggagattatatcataaaagact 4314392  T
Q  287 taggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcc 385  Q
    || |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4314391 tatgatggtccaagaatcttatatcactattcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaagaatttttactttcagaaaggtttctcatattcc 4314292  T
Q  386 tacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaa 485  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  4314291 tacaaatatcactctggtcattcaaagtgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatatcataattattatcttgttattcactaa 4314192  T
Q  486 tttgttttgtgagaatgttttagtgagaat 515  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4314191 tgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaat 4314162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 515
Target Start/End: Original strand, 32816669 - 32817167
Alignment:
Q  14 aaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaa-tgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||| || |||||| ||||      
T  32816669 aaataattcaaggttaattaaccaagaagatggtgtcttctcatatagaagagaaccttatcaactttgatgaaaaaaatgttttcttgataaagatgat 32816768  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32816769 tgtcacactcgaaattattctcattacttcatcaaaataattagaatcaactctgaagaaaaaccaatccatgaatgaattatgaattaagtcattcatt 32816868  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaa--gaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccat 310  Q
    |||         || ||||  |||| |  || |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  32816869 aat---------tggagaatgatcatatggatgaaaattcatgatcatatgcacggaggttctatcataaaagagttaggaagatccaagaatcttccat 32816959  T
Q  311 cactattcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattct-ggccatg 407  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| || |||     
T  32816960 cattattcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaataaatttttaatttgagaaaggtttctcatgttcttacaaagaacattcttggtcata 32817059  T
Q  408 caaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgtttta 507  Q
    |||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  32817060 caaagtcaaaaaaacatcatcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatccactaatttattttatgagaatgtttca 32817159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Original strand, 2890405 - 2890900
Alignment:
Q  18 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaac---tctaatgaaag-aatgttctcatgataaggatgcct 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||   | | ||||||  ||||||||| |||||| |||   |    
T  2890405 aattcaaggttaattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacgttatcaacaactttgatgaaaataatgttctcgtgataaagattatt 2890504  T
Q  114 attacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatta 213  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2890505 gttacactcgaaattattctcattacttcatcaaaataattagaatcaactctgaagaaaaatcaatccatgaatgaattattcattaagtcattaatta 2890604  T
Q  214 atgttattgattgaagaaatatcaaa--gaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatc 311  Q
    ||         || ||||  |||| |  |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2890605 at---------tggagaatgatcatatggaagaaaattcatgatcatatgtacgaagattctatcataaaagacttaggaagatccaaaaatcttccatc 2890695  T
Q  312 actattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgca 409  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||    
T  2890696 attattcaagatatgatttaggagaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaagaacattctggtcataca 2890795  T
Q  410 aagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagt 509  Q
    ||| ||||| || ||| ||| || ||||||  |||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  2890796 aagtgaagagaacatcctcactttatgtttctaaagataacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtaagaatgtttcagt 2890894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 113 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 48713008 - 48712612
Alignment:
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48713008 tattacactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcattaagtcattcatt 48712909  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||         || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48712908 aat---------tggagaattatcaaggaagaaaattcataatcatatgcatgaagattctatcataataaacttaggatgatccaagaatctgccatca 48712818  T
Q  313 ctattcaagatatgat-ttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaa 410  Q
     ||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||  |  ||| |||    
T  48712817 ttattcaaaatatgatctgggagaatagaaatcaatcaaaggaatttttacttagagaaaggtttctcatgttcttacaaagaacattacgatcatacaa 48712718  T
Q  411 agagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaata-ttacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagt 509  Q
    || ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||  ||||||  |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  48712717 agtgaagagaacatcttcacttgatgtttttaaagataacaaacatatttatatttattatcctgttatctactaatgtattttgtgagaatgtttcagt 48712618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8980959 - 8980592
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||| | ||| | ||||      
T  8980959 aaaataattcaaagttaattgaccaagaaaatattgtcatctcatatagaagagaacataatta-ctcttatgaaagaatattctgaagatgaagatgtt 8980861  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    ||||||||   || |||||||||| | ||||| |||||| |   |||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  8980860 tattacacctgaatttattctcattatttcataaaaatggttgaaatcaactttgaaaagaaactaatttgtgaataaattattcattcagtcattcatt 8980761  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||  | |||||    
T  8980760 aatgatattgatcggagaattatcaaataa-aaaattcttgatcatatgcatggagattctatcaaaatggacttaggatgatccaataattgttcatca 8980662  T
Q  313 ctattcaagatat-gatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 380  Q
     |||||||| ||| | || |||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8980661 ttattcaagttatagcttggaagaatagaaatcaaacaaaacaattttgactttgagaaagatttctcat 8980592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 4314640 - 4314588
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaaga 65  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4314640 aaaacaattcaaggttagttaaccgagaatgtattatcatctcatatagaaga 4314588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 500
Target Start/End: Original strand, 25514725 - 25515212
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25514725 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatc-catatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgca 25514823  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    ||||||||   ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25514824 tattacacctgaaattattctcattattttatcaaaatgattagaatcaactttaaagagaaatcaattcattaatgaattatttattaagtcattcatt 25514923  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||| |  ||||    
T  25514924 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataatatacttatgatggtccaaaaatcctatatca 25515023  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  25515024 ctattcaagatatgatttggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattttggtcatacaaa 25515123  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
      |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  25515124 atgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctactagtgtgttttgtgagaa 25515212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 50066331 - 50065845
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  50066331 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactatgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgca 50066232  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50066231 tattacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaattattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 50066132  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| || | || ||||    
T  50066131 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgattatatgctttgagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaaccctctatca 50066032  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  50066031 ctattcaaggtatgatttggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctac-aatatcattttggtcatacaaa 50065933  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
      |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  50065932 atgaagaaaacatcctaatttgatgttttaaaatataac-aaaatattacaattattattttgttatctactagtgtgttttgtgagaa 50065845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 500
Target Start/End: Original strand, 28069467 - 28069951
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  28069467 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccaatgaaagaatgttctcatgat--ggatgca 28069564  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28069565 tattacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcataaatgaattatttattaagtcattcatt 28069664  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| ||||||| | ||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||| ||| | | | |||| ||||  |||| || ||||    
T  28069665 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaactcatgaacatatgctttgaaattctatcatgaaataatcatgatggtccaggaatcctcaatca 28069764  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  28069765 ctattcaa-ttatgatttggagaacagtaattaatcaaagaaattttgactttgagagaggtttctcatgttcctacaaatatcattttggtcatacaaa 28069863  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
      |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  28069864 atgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaacgat-acgaaaatattacaattattattttgttatctactagtgtgttttgtgagaa 28069951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Original strand, 11480916 - 11481286
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||     
T  11480916 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatatattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactccgatgaaataatgttctcatgatgaggatgca 11481015  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11481016 tattacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagataaactagttcatgaatgaattatttattaagccattcatt 11481115  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  11481116 aatgatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgtttgaagattctatcataaaagatttaggatgattgaagaatcttccatca 11481215  T
Q  313 -ctattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 380  Q
      | || |||||||||||| | |||| | |||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11481216 tttttttaagatatgatttaggagaaaagaaaacaatcaaatgaatttttactttgagagaggtttctcat 11481286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 50518678 - 50518196
Alignment:
Q  21 tcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaaga-gaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattaca 119  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||  ||||||| | |||||    
T  50518678 tcaaggttaattaatcaagaaggtattgtcatctcatataaaaaaagaacattatcaactccgatgaaagaacattctcatgaagaggatgcttcttaca 50518579  T
Q  120 ctcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgtta 219  Q
    ||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50518578 ctcaagattattctcatcatttgattaaaatgattagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgata 50518479  T
Q  220 ttgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca-ctattc 318  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||   |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||     
T  50518478 ttgatggaaaaaatatcaaaaaagaaaatttgggatcatatgcttgaagatactatcataaaagatttaggatgatcgaagaatcttccatcattttttt 50518379  T
Q  319 aagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaa 416  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| ||| || | |||| ||| ||| ||||  |||    
T  50518378 aagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaataaatttttattttgagagaggttcctcatgttcttacgaagaacattttggtcatacaaaatgaa 50518279  T
Q  417 gaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
    || || ||| ||| |||||||||| |||||||||| | || |||||  |||||| |||||||  |||||| | |||||||||||    
T  50518278 gagaacatcctcacttgatgtttttaaagataacacatat-ttacatgtattatcttgttatctactaatgtattttgtgagaa 50518196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Original strand, 9243794 - 9244131
Alignment:
Q  44 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttca 143  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||  |||| ||||| ||||||||||| | | ||||    
T  9243794 tattgtcatctcatatagaagataacattatcaactctggtgaaataatgttctcattatgaagatgtttatttcactcgaaattattctcgttatttca 9243893  T
Q  144 tcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaat---gaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaag 240  Q
     ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9243894 acaaaatgattaggattaattttgaagagaaaccaattcatgaatattgaattattcattgagttattcattaatgatattgattgaagaattatcaaag 9243993  T
Q  241 aagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgattt-gaagaata- 338  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||    |||||||| ||||||||| ||||||||     
T  9243994 atgaaaattcatgatcatatgcatggagattctatcataaaatacttaggatgatccaaaaaattgcc----ctattcaaaatatgatttggaagaatag 9244089  T
Q  339 aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 380  Q
    |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9244090 aaatcaaacaaagcaattttgacattgagaaaggtttctcat 9244131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Original strand, 7580473 - 7580810
Alignment:
Q  44 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttca 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||| | ||||  ||||||||   || |||||||||| | ||||    
T  7580473 tattgtcatctcatatagaagagaacattattaactcttatgaaagaatattctgaagatgaagatgtttattacacctgaatttattctcattatttca 7580572  T
Q  144 tcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaag 243  Q
    | |||||| |  ||||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||     
T  7580573 taaaaatggttggaatcaactttgaaaagaaactaatttgtgaataaattattcattgagtcattcattattgatattgatccaagaattatcaaataa- 7580671  T
Q  244 aaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatat-gatttgaagaata-aaa 341  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||    
T  7580672 aaaattcatgatcatatgcatggagattctatcaaaatggacttaggatgatccaataattgttcatcattattcaagttatagcttggaagaatagaaa 7580771  T
Q  342 taaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 380  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7580772 tcaaacaaagcaattttgactttgagaaaggtttctcat 7580810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34495423 - 34495225
Alignment:
Q  44 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttca 143  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  34495423 tattgtcttctcatatagatgagaacattatcaactttgatgaaagaatattctcatgatgaagatgattattacacttgaaattattctcattacttca 34495324  T
Q  144 tcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  34495323 tcaaaatgataagaatcaactttgaagagataccaatccaggaataaattattcattaagtcattcattaatgatattgattggagaattatcaaagaa 34495225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28257779 - 28257581
Alignment:
Q  16 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 115  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  28257779 ataatttaaggttaattgaccaagaagatattgttttctcgtatagaagagaacattatcaactttaatgaaagaatgttctcatgatgaagatgactat 28257680  T
Q  116 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 215  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28257679 tacactcgaaaatattctcattacttcatcgaaatgatta-tatcaactttgaagagaaactaattcatgaatgagttattcattaagtcgttcattaat 28257581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 9204009 - 9204249
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9204009 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 9204108  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  9204109 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 9204208  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  9204209 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 9204249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 9208228 - 9208468
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9208228 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattagcatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 9208327  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  9208328 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 9208427  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  9208428 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 9208468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 416 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25538576 - 25538495
Alignment:
Q  416 agaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtga 497  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  25538576 agaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctactagtgtgttttgtga 25538495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28257489 - 28257302
Alignment:
Q  315 attcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaag 412  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||  || |||||    
T  28257489 attcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgact--gaaaaaagtttctcatgttcctacaaagaacattatggttatacaaag 28257392  T
Q  413 agaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgt 503  Q
     || || || ||| ||  ||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  28257391 tgaggagaacatcctctcttgatgtttcaat-gataacaaacgtattacaattattatcttgttatctactaacgtgttttgtgagaatgt 28257302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Original strand, 9245624 - 9245729
Alignment:
Q  23 aaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactc 122  Q
    |||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |  |||  ||||||||||    
T  9245624 aaggttaattgaccaataagatattgtcgtctcatatagaagagaaaattatcaactctgattgaagaatattctcatgatgaatatgtttattacactc 9245723  T
Q  123 aaaatt 128  Q
     |||||    
T  9245724 gaaatt 9245729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 324
Target Start/End: Original strand, 9275520 - 9275655
Alignment:
Q  188 tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagattt 287  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  ||||| | ||    
T  9275520 tgaattattcataaagttattcattaatga-attgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatactt 9275618  T
Q  288 aggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    |||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  9275619 aggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 9275655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 7786952 - 7786503
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||     
T  7786952 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcgtgatgaagatgca 7786860  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7786859 tattacactcgaaatttgtctcatcatttcattaaaaagattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaattcattcatt 7786760  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  7786759 aatgatattggttgaggaaatatcaa---agaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatca 7786663  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7786662 ctattcacgatatgatttgaaaaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttcttatgttcctacaaatatcattctggtcatacaaa 7786563  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattatt 471  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7786562 gtgaagaaaatatcatcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattatt 7786503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 36434291 - 36433803
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||     
T  36434291 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaatagaacattatcaactccggtgaaagaatgttctcattatgaggatgca 36434192  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36434191 tattacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaaaagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 36434092  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| | ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| |||| || ||||    
T  36434091 tatgatgttgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcgtaaaatacttatgatggtccaagaatcctctatca 36433992  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  36433991 ctattcaagatatgatttggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaattatcattttggtcatacaaa 36433892  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
      |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||    
T  36433891 atgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctacaagtgtgttttgtgagaa 36433803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 453
Target Start/End: Original strand, 9308183 - 9308624
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9308183 aaaataaataaagattaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgca 9308282  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9308283 tattacacaagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 9308382  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| || ||||    
T  9308383 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttaagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaatcctctatca 9308482  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  9308483 ctattcaaaatataatttggagaagagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttttcatgttcctacatatatcattttggtcatacaaa 9308582  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaa 453  Q
      |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9308583 atgaagaaaacatcctcatttaatgttttaaaagataacaaa 9308624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 238 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 46280329 - 46280066
Alignment:
Q  238 aagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttgaagaat 337  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46280329 aagaagaaaattcatgatcatatggtttgagactctatcataaaatacttatgatggtccaagaatcctctatcactattcaagatatgatttggagaac 46280230  T
Q  338 aaaa-taaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatg 436  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  46280229 aaaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaagtttctcatgttcctacaaatatcattttggtcatacaaagtgaagaaaacatcataatttgatg 46280130  T
Q  437 ttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  46280129 ttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctactagtgtgttttgtgagaa 46280066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13329922 - 13329446
Alignment:
Q  18 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 116  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | | ||||  ||||    
T  13329922 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttctatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaatgttctcatggtgaagatgattatt 13329823  T
Q  117 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 216  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                   
T  13329822 acactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattcgaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta--------------- 13329738  T
Q  217 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 316  Q
          |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  |||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  13329737 ------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgaaccaagaatcttccatcatttt 13329644  T
Q  317 tcaagatatgatttg-aagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagag 414  Q
    | ||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  13329643 ttaagatatgattcgcgagaatagaaatcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagattctcatgttcttacaaagaacattctggtcatacaaagtg 13329544  T
Q  415 aagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaa 514  Q
    |||| || ||| ||| || |||||||  |   ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13329543 aagagaacatcctcactttatgtttttta--ttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgataatgtttcagtgagaa 13329447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 478
Target Start/End: Original strand, 23484855 - 23485171
Alignment:
Q  155 agaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatga 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||         || |||| |||||| ||||| || ||||||    
T  23484855 agaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaataaattatttattaagtcattcattaat---------tggagaactatcaaggaagacaaatcatga 23484945  T
Q  255 tcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaagg 352  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| |||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  23484946 tcatatgcatgaagattctatcataaaagacttaggatgatccaagaatcttcaatcatttttcaagatataatttgggagaatagaaatcaataaaagg 23485045  T
Q  353 aattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctac-aaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataaca 451  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | |||| ||| |||  |||| ||||| || | ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  23485046 aatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaaagaacattatggtcataaaaagtgaagagaacaccttcactttatgtttttaaagataaca 23485145  T
Q  452 aaaatattacaattattattttgttat 478  Q
     | || ||||| ||||||| |||||||    
T  23485146 catat-ttacatttattatcttgttat 23485171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13978512 - 13978313
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||| |||| | ||||     
T  13978512 aaaataattcaaggttaattgaccaagaagatattgtcttctcatataaaagagaaccttatcaactttgatgaaaagaatggtctcgtgatgatgatga 13978413  T
Q  112 ctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcat 211  Q
     |||||||||  |||||||||| || ||||||   ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13978412 ttattacacttgaaattattcttattacttcacggaaatgattagaatcaactttgaagataaacaaatccatgaatgaactattcattaagtcattcat 13978313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13953456 - 13953305
Alignment:
Q  302 atcttccatcactattcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattc 399  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  13953456 atcttccatcatttttcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaagaacattc 13953357  T
Q  400 tggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataaca 451  Q
    |||  || ||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13953356 tggttatacaaagtgaagagaacatcttcacttgatgtttttaaagataaca 13953305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 500
Target Start/End: Original strand, 37919710 - 37919796
Alignment:
Q  414 gaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||    
T  37919710 gaagaacacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctattagtgtgttttgtgagaa 37919796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9294523 - 9294433
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgat 103  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  9294523 aaaataattaaaagttaattaaccaagaatgtattgtcatcctatatataatagaacattatcaactccgatgaaaaaatgttctcatgat 9294433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Original strand, 23484740 - 23484850
Alignment:
Q  18 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatg-aaagaatgttctcatgataaggatgcctatt 116  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  23484740 aattcaaggttaattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 23484839  T
Q  117 acactcaaaat 127  Q
    |||||| ||||    
T  23484840 acactcgaaat 23484850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 35756273 - 35755785
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  35756273 aaaataattaaaggttagttaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatgttttcatgatgaggatgca 35756174  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35756173 tattacactagaaattattctcatcatttcataaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 35756074  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
     ||| |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||| || ||||    
T  35756073 tatgatattgatctgagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatatttatgatggtctaagaatcctctatca 35755974  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  35755973 ctattcaagatatgatttggagaacataaatcaatcaaagaaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattttggtcatacaaa 35755874  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
      |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||    
T  35755873 atgaagaaaacatcctcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttatctacgagtgtgttttgtgagaa 35755785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 5383079 - 5382612
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5383079 aaaataattcaaggttaattaacgaagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgca 5382987  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  5382986 tattacactcgaaatcagtctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataagttatttattaattcactcatt 5382887  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  5382886 aatgatattgtttggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggaggttctatcataaaagacttatgatggtccaagaatctttcatca 5382787  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||| ||||    
T  5382786 ctattcaagatatgatttggagagtagaaatcaatcaaaggaattgtgattttgagaaaggtttctcacgttcctaaaaatatcattatggacatacaaa 5382687  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaat 486  Q
    || ||||||| |||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  5382686 gacaagaaaacatccccattggatgttttaaaatgtaacaaaaatattacgattatcatcttgttatttactaat 5382612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26908091 - 26907713
Alignment:
Q  14 aaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcct 113  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||| |    
T  26908091 aaataatttaatgttaatcaaccgagaatgtatcgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaaggttctcatgatgaagatgcat 26907992  T
Q  114 attacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatta 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26907991 attacactcaaaattat-ctcatcatttcatcaaaatgatcagaatcaactttgaagagaaaccaaatcatgaatgaattatttattaagtcattcatta 26907893  T
Q  214 atgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcac 313  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  || || |||||| ||||||    
T  26907892 atgatattgattggagaaatatcatagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatagtctaagaatctttcatcac 26907793  T
Q  314 tattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 391  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26907792 tattcaagatatgttttgggagaatataaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaatgtttctcatgttcctacaaa 26907713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Original strand, 23550192 - 23550458
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||     
T  23550192 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatggt---gatgca 23550288  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550289 tattacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagataaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 23550388  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaa 282  Q
     ||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23550389 tatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataaaa 23550458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 339 - 500
Target Start/End: Original strand, 23550488 - 23550649
Alignment:
Q  339 aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgtt 438  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  23550488 aaatcaatcaaagaaattttaactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattttggtcatacaaaatgaaggaaacatcctcatttgatgtt 23550587  T
Q  439 ttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  23550588 ttaaaagataacaaaaatattaagattattattttgttatctactagtgtgttttgtgagaa 23550649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10632969 - 10632920
Alignment:
Q  54 tcatatagaagagaa-cattatcaactctaatgaaagaatgttctcatga 102  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10632969 tcatataaaagagaaacattatcaactcttatgaaataatgttctcatga 10632920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Original strand, 14097429 - 14097790
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | || |||||||     
T  14097429 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatggtctcgtaatgaggatgca 14097521  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14097522 tattacactcgaaatcaatctcatcatttcatcaaaatgattagaattaactttgaagagaaaccaattcatgaacgaattatttattaagtcagtcatt 14097621  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  14097622 aatgatattggttggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatca 14097721  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14097722 ctattcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaagaaattttgactttccgaaaggtttctcat 14097790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 451
Target Start/End: Original strand, 2850189 - 2850628
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  2850189 aaaataattcaaggttaattaatcaagaaggtattatcatcttatatagaagagaacatcatcaactctgatgaaagaacgttctcataaagaggatgcc 2850288  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    | |||||||| | ||||||||||||| || || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2850289 tcttacactcgagattattctcatcatttgattaaaaggattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcactcatt 2850388  T
Q  213 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 312  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  2850389 aatgatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttgaagattctatcataaaagatttaagatgatcgaagaatcttccatca 2850488  T
Q  313 ctattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaa 411  Q
     | || |||||||| || | |||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||  || ||||    
T  2850489 ttttttaagatatggttgggagaatagaaatcaatcaaaggaatatttactttgagaaaggtttctcacgttcttacaaagaacattatggttatacaaa 2850588  T
Q  412 gagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataaca 451  Q
    | ||||| || |||  || | |||||||| ||||||||||    
T  2850589 gtgaagagaacatccccactcgatgtttttaaagataaca 2850628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17514061 - 17513876
Alignment:
Q  18 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 116  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  17514061 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatcaagatgattatt 17513962  T
Q  117 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaa 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  17513961 acactcaaaattattctcattacttcatcgaaataatttgaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcattaa 17513876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 514
Target Start/End: Original strand, 14099909 - 14100040
Alignment:
Q  384 cctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgtttt-aaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcac 482  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14099909 cctacaaatatcattatggtcatacaaagtgaagaaaacatcttcatttgatgttttcaaaagataacaaaaatattacaattattatatttttattcac 14100008  T
Q  483 taatttgttttgtgagaatgttttagtgagaa 514  Q
    |||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  14100009 taatgtcttttgtgagaatgtatcagtgagaa 14100040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 287 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17513841 - 17513616
Alignment:
Q  287 taggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttc 384  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  17513841 taggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaagaaatttttactttgagaaaggtttctcatgttc 17513742  T
Q  385 ctacaaatatcattctggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcacta 484  Q
     |||||| | |||||||| ||| ||||| |||||  | ||| ||| || |||||||      ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  ||||    
T  17513741 ttacaaagaacattctggtcatacaaagtgaagagtacatcctcactttatgtttt----tttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctacta 17513647  T
Q  485 atttgttttgtgagaatgttttagtgagaat 515  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  17513646 atttattttgtgagaatgtttcattgagaat 17513616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0753 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0753
Description:

Target: scaffold0753; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3221 - 2892
Alignment:
Q  52 tctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatg 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| ||    
T  3221 tctcatatagaagataacattatcaactctgatgtaagaatgctctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattg 3122  T
Q  152 ataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaa---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaat 248  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  3121 attaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaatattgaattattcattgagttattcattaatgatattgattgaataattatcaaagatgaaaat 3022  T
Q  249 tcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaat 346  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||    |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||     
T  3021 tcatgatcatatgcatggagattctatcataaaatacttaggacgatccaaaaaatttcc----ctattcaaaatatgatttggaagaatagaaatcaaa 2926  T
Q  347 caaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 380  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2925 caaaacaattttgacattgagaaaggtttctcat 2892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0753; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 846
Alignment:
Q  44 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttca 143  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  1147 tattgtcgtctcaaatagaagagaaaattatcaactctgatggaagaatgttctcatgatgaagatggttattacactcgaaattattctcattatttca 1048  T
Q  144 tcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaa---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaag 240  Q
    || | ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||   | ||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||    
T  1047 tctatatgattaggttcaatttttaagagaaaccaattcataaatattaaattattcataaagttattcattaataatattaattggagaattatcaaag 948  T
Q  241 aagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgattt-gaagaataa 339  Q
    | |||| ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| | | || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  947 atgaaacttcattatcatatgcatggatattctatcgtaaaatacttaggatgatccaagagttttacatcaccattcaatatatgatttggaagaataa 848  T
Q  340 aa 341  Q
    ||    
T  847 aa 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 380
Target Start/End: Original strand, 2590 - 2951
Alignment:
Q  23 aaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactc 122  Q
    |||||||||| ||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||   ||| ||||||    
T  2590 aaggttaattgaccaataagatattgtcgtctcatatagaagagaacattatcaactctgatggaagaatgttctcatgatgaagatttttatgacactc 2689  T
Q  123 aaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaa---tgaattatttattaagtcattcattaatgtta 219  Q
    ||| |||||||| | | ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||| |||||||||||  |    
T  2690 aaagttattctccttatttcatcacaatgattaggatcaattttaaagagaaaccaattcatgaatattgaattattcataaagt-attcattaatgaca 2788  T
Q  220 ttgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattca 319  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||| | |||||||||||||  |||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  2789 tttattgaagaattatcaaagatgaaacttccttatcatatgcatggagattctatcgaaaaatacttaggatgatccaagagttttccatcactattca 2888  T
Q  320 agatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 380  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| || ||||  ||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  2889 agatatgatttggaagaatacaaatcaaacaaaccaatttcgacattgaaaaaggtttttcat 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11620 - 11410
Alignment:
Q  13 aaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||     
T  11620 aaaataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcctatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcacgatgagaatgca 11521  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11520 tattacactagaaattattctcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaaatcattcatgaatgaattatttattaagtca-tcatt 11422  T
Q  213 aatgttattgat 224  Q
     ||| |||||||    
T  11421 tatgatattgat 11410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Original strand, 449 - 923
Alignment:
Q  18 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 116  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  449 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 548  T
Q  117 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 216  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                   
T  549 acactcgaaattattctcattacctcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta--------------- 633  T
Q  217 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 316  Q
          |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |   |||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  634 ------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacaaaggatggtccaagaatcttccatcatttt 727  T
Q  317 tcaagatatgatt-tgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattctggccatgcaaagag 414  Q
    | |||||||||||  | | |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  728 ttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaatttttaccttgagaaaagtttctcatgttcttaaaaagaacattctggtcatacaaagtg 827  T
Q  415 aagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataacaaaaatattacaattattattttgttattcactaatttgttttgtgagaatgttttagtgagaa 514  Q
    |||| || ||| ||| || |||||||      ||||| | || ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  828 aagagaacatcctcactttatgtttt----tttaacacatat-ttacatttattatcttgttatctactaatgtgttttgtgagaatgtttcagtgagaa 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 7)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 2092 - 2332
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2092 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 2191  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  2192 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 2291  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  2292 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 2332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 6307 - 6547
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6307 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 6406  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  6407 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 6506  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  6507 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 10522 - 10762
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10522 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 10621  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  10622 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 10721  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  10722 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 10762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14977
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14737 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 14836  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  14837 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 14936  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  14937 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 14977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 18952 - 19192
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18952 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 19051  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  19052 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 19151  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  19152 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 19192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 23167 - 23407
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23167 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 23266  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  23267 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 23366  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  23367 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 23407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 27382 - 27622
Alignment:
Q  87 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27382 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 27481  T
Q  187 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 283  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  27482 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 27581  T
Q  284 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 324  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  27582 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 27622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5596 - 5445
Alignment:
Q  302 atcttccatcactattcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatatcattc 399  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  5596 atcttccatcatttttcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaagaacattc 5497  T
Q  400 tggccatgcaaagagaagaaaatatcttcatttgatgttttaaaagataaca 451  Q
    |||  || ||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5496 tggttatacaaagtgaagagaacatcttcacttgatgtttttaaagataaca 5445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Original strand, 3501 - 3592
Alignment:
Q  240 gaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttg 331  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  3501 gaagaaaatccatgatcatatgctcgaagattctatcataaaagacttaggatgatcaaagaatctttcatcattactcaaaatatgatttg 3592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 3320 - 3499
Alignment:
Q  14 aaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatg-aaagaatgttctcatgataaggatgcc 112  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||   || |||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||| ||| || ||||||||| |||       
T  3320 aaataattcaaagttatttgaccaagaggatagtgtcttctcatatagaagacaacattatcaattttgatgaaaataatattatcatgataaagataat 3419  T
Q  113 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaatta 194  Q
    | |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||| || |||||||| | |||||| ||||  || |||||||||||||    
T  3420 tgttacactcgaaattattttcattacttcatcgaaataattagaatcaactctgaagaaaaac--atccatgaatgaatta 3499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University