View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1798_low_42 (Length: 256)

Name: NF1798_low_42
Description: NF1798
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1798_low_42
NF1798_low_42
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-234)||(33528667-33528900)
chr2 (1-234)||(20522038-20522271)
chr2 (1-234)||(17865021-17865254)
chr2 (1-236)||(10445488-10445725)
chr2 (8-224)||(16940265-16940481)
chr2 (8-224)||(17010930-17011146)
chr2 (24-236)||(31055883-31056097)
chr2 (20-236)||(34682378-34682595)
chr2 (8-236)||(8039884-8040113)
chr2 (25-237)||(33117978-33118190)
chr2 (10-224)||(34388686-34388899)
chr2 (1-224)||(21629769-21629985)
chr2 (10-236)||(13569155-13569381)
chr2 (8-236)||(8390194-8390425)
chr2 (10-224)||(23078526-23078742)
chr2 (1-235)||(39482753-39482983)
chr2 (10-224)||(36757818-36758031)
chr2 (10-236)||(42039713-42039939)
chr2 (25-224)||(10707308-10707508)
chr2 (17-237)||(14699050-14699261)
chr2 (28-236)||(28259221-28259429)
chr2 (28-236)||(3491597-3491803)
chr2 (28-236)||(25398339-25398548)
chr2 (28-204)||(35397357-35397532)
chr2 (31-224)||(40738688-40738884)
chr2 (35-217)||(2869756-2869943)
chr2 (28-236)||(25403477-25403686)
chr2 (1-142)||(40014746-40014886)
chr2 (28-145)||(27148999-27149118)
chr2 (171-234)||(1345587-1345652)
chr2 (171-224)||(723727-723781)
chr2 (171-224)||(11151574-11151628)
chr2 (171-224)||(34139753-34139807)
chr2 (28-99)||(11099109-11099182)
chr2 (186-234)||(2838076-2838124)
chr2 (33-102)||(16388297-16388367)
chr2 (170-224)||(17057351-17057406)
chr2 (170-224)||(17085334-17085389)
chr2 (171-224)||(11067436-11067490)
chr2 (171-224)||(14633808-14633862)
chr2 (187-237)||(35215586-35215636)
chr2 (187-237)||(35217963-35218013)
chr2 (187-237)||(36558864-36558914)
chr2 (187-237)||(36561141-36561191)
chr2 (171-224)||(36773693-36773747)
chr2 (187-237)||(45332181-45332231)
chr2 (8-49)||(32178419-32178460)
chr2 (183-224)||(39284967-39285008)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (1-237)||(10047197-10047433)
chr4 (1-233)||(25862069-25862301)
chr4 (1-237)||(54867000-54867237)
chr4 (1-237)||(39245811-39246048)
chr4 (21-237)||(5269234-5269453)
chr4 (1-224)||(42599630-42599856)
chr4 (10-224)||(5147504-5147718)
chr4 (1-234)||(3796565-3796801)
chr4 (20-236)||(5143096-5143312)
chr4 (10-236)||(38152483-38152710)
chr4 (8-236)||(24333635-24333862)
chr4 (10-223)||(16630737-16630950)
chr4 (28-236)||(5396715-5396926)
chr4 (46-221)||(3777413-3777587)
chr4 (1-237)||(6743458-6743699)
chr4 (23-236)||(36315273-36315469)
chr4 (23-236)||(36329482-36329678)
chr4 (10-224)||(8689539-8689748)
chr4 (10-142)||(16624147-16624279)
chr4 (28-224)||(31985689-31985885)
chr4 (28-236)||(28468573-28468779)
chr4 (28-146)||(1983432-1983551)
chr4 (148-236)||(16623337-16623426)
chr4 (28-237)||(34495866-34496075)
chr4 (28-155)||(18377216-18377344)
chr4 (170-224)||(12739532-12739587)
chr4 (170-224)||(26175618-26175673)
chr4 (170-231)||(29254618-29254680)
chr4 (37-217)||(37781716-37781897)
chr4 (171-224)||(48893621-48893675)
chr4 (125-221)||(21688383-21688478)
chr4 (28-99)||(24741782-24741855)
chr4 (173-224)||(5871951-5872003)
chr4 (170-224)||(9927440-9927495)
chr4 (170-224)||(12743907-12743962)
chr4 (170-224)||(12745296-12745351)
chr4 (171-221)||(52467337-52467388)
chr4 (187-237)||(9148535-9148585)
chr4 (187-237)||(16931789-16931839)
chr4 (187-237)||(16934143-16934193)
chr4 (187-237)||(22780373-22780423)
chr4 (187-237)||(44599838-44599888)
chr4 (171-224)||(46147374-46147428)
chr4 (28-65)||(5112085-5112122)
chr4 (183-224)||(36463385-36463426)
chr4 (71-99)||(7816397-7816425)
chr4 (187-235)||(18709164-18709212)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (1-236)||(9765863-9766099)
chr8 (1-237)||(4696639-4696882)
chr8 (1-236)||(26403274-26403510)
chr8 (7-234)||(5702529-5702756)
chr8 (8-236)||(6127043-6127274)
chr8 (28-236)||(19752438-19752646)
chr8 (35-237)||(23799620-23799823)
chr8 (10-236)||(4455855-4456081)
chr8 (10-234)||(19175800-19176027)
chr8 (28-236)||(31071273-31071481)
chr8 (28-236)||(7412182-7412394)
chr8 (28-236)||(26287747-26287954)
chr8 (28-236)||(26312998-26313205)
chr8 (1-217)||(6813496-6813717)
chr8 (1-155)||(5990685-5990836)
chr8 (1-236)||(9054881-9055113)
chr8 (28-236)||(1261998-1262204)
chr8 (28-99)||(26300992-26301064)
chr8 (28-236)||(28307401-28307614)
chr8 (170-224)||(15212917-15212972)
chr8 (170-223)||(43036555-43036609)
chr8 (28-99)||(36979219-36979292)
chr8 (170-224)||(4733837-4733892)
chr8 (1-114)||(7493233-7493345)
chr8 (174-224)||(27811409-27811460)
chr8 (28-97)||(30655482-30655553)
chr8 (170-224)||(33352281-33352336)
chr8 (171-224)||(1345354-1345408)
chr8 (187-237)||(15072996-15073046)
chr8 (187-237)||(15809503-15809553)
chr8 (187-236)||(17799424-17799474)
chr8 (187-237)||(22684653-22684703)
chr8 (171-224)||(40321211-40321265)
chr8 (187-237)||(43079887-43079937)
chr8 (187-237)||(43082258-43082308)
chr8 (171-217)||(19491681-19491729)
chr8 (28-94)||(33037994-33038062)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-237)||(48438032-48438268)
chr3 (8-236)||(3716036-3716265)
chr3 (20-237)||(40844489-40844705)
chr3 (7-234)||(1417526-1417752)
chr3 (28-222)||(40592830-40593025)
chr3 (10-237)||(30709823-30710051)
chr3 (10-236)||(8370520-8370747)
chr3 (8-221)||(24695213-24695425)
chr3 (8-237)||(26298807-26299042)
chr3 (1-236)||(6794747-6794981)
chr3 (25-236)||(21711068-21711276)
chr3 (1-237)||(37466109-37466345)
chr3 (8-236)||(16264174-16264403)
chr3 (10-231)||(39040031-39040251)
chr3 (10-224)||(36028932-36029134)
chr3 (28-225)||(35925327-35925525)
chr3 (68-237)||(3328389-3328558)
chr3 (28-236)||(33386700-33386909)
chr3 (28-236)||(27986480-27986687)
chr3 (28-236)||(32143167-32143374)
chr3 (20-164)||(8126538-8126682)
chr3 (94-237)||(18552916-18553059)
chr3 (10-164)||(27026772-27026925)
chr3 (28-236)||(27974986-27975191)
chr3 (107-236)||(25795704-25795834)
chr3 (7-150)||(1417090-1417232)
chr3 (10-164)||(27038117-27038270)
chr3 (11-135)||(47924007-47924128)
chr3 (128-237)||(1736338-1736447)
chr3 (28-236)||(4386961-4387173)
chr3 (8-97)||(47649565-47649655)
chr3 (28-201)||(1305795-1305967)
chr3 (28-201)||(1309700-1309872)
chr3 (125-223)||(34491344-34491443)
chr3 (8-81)||(3323752-3323825)
chr3 (1-92)||(18554465-18554556)
chr3 (28-100)||(27452803-27452876)
chr3 (168-237)||(47923939-47924008)
chr3 (81-224)||(25929488-25929633)
chr3 (114-234)||(26928637-26928756)
chr3 (28-236)||(8477206-8477415)
chr3 (131-236)||(27452906-27453011)
chr3 (163-224)||(29810999-29811061)
chr3 (171-224)||(32744419-32744473)
chr3 (28-64)||(4387239-4387275)
chr3 (170-224)||(5236439-5236494)
chr3 (170-224)||(29813194-29813249)
chr3 (170-224)||(51398945-51399000)
chr3 (171-224)||(9666449-9666503)
chr3 (171-224)||(23391892-23391946)
chr3 (171-224)||(29196369-29196423)
chr3 (182-224)||(44331676-44331718)
chr3 (187-237)||(50494208-50494258)
chr3 (187-237)||(53917662-53917712)
chr3 (1-58)||(25929635-25929692)
chr3 (183-236)||(28503908-28503960)
chr3 (187-235)||(746968-747016)
chr3 (184-224)||(40913424-40913464)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (1-237)||(42127453-42127688)
chr5 (7-237)||(28832084-28832313)
chr5 (1-236)||(17004004-17004239)
chr5 (1-237)||(19588564-19588800)
chr5 (38-238)||(24553548-24553748)
chr5 (10-221)||(14520056-14520268)
chr5 (8-217)||(11181896-11182106)
chr5 (8-236)||(3880127-3880352)
chr5 (28-236)||(15464377-15464585)
chr5 (10-236)||(11917016-11917245)
chr5 (28-236)||(9353376-9353582)
chr5 (46-222)||(31300654-31300829)
chr5 (28-236)||(36932394-36932602)
chr5 (80-236)||(12084219-12084376)
chr5 (122-224)||(6741790-6741893)
chr5 (31-236)||(33030984-33031196)
chr5 (28-236)||(38192017-38192226)
chr5 (28-236)||(38219242-38219451)
chr5 (28-106)||(35387508-35387587)
chr5 (161-236)||(10281728-10281804)
chr5 (125-223)||(28278448-28278547)
chr5 (125-222)||(38747138-38747235)
chr5 (1-62)||(42126625-42126686)
chr5 (171-224)||(8565930-8565983)
chr5 (31-236)||(24135696-24135901)
chr5 (33-136)||(34842454-34842557)
chr5 (187-237)||(10757405-10757455)
chr5 (187-237)||(23665272-23665322)
chr5 (187-237)||(23741859-23741909)
chr5 (187-237)||(23793265-23793315)
chr5 (171-224)||(32636955-32637009)
chr5 (170-224)||(19806494-19806549)
chr5 (7-49)||(10281686-10281728)
chr5 (187-237)||(10749929-10749979)
chr5 (187-237)||(15354575-15354625)
chr5 (187-237)||(15552474-15552524)
chr5 (187-237)||(21288990-21289040)
chr5 (187-237)||(31179371-31179421)
chr5 (187-237)||(31542963-31543013)
chr5 (187-237)||(31545309-31545359)
chr5 (187-236)||(4410252-4410301)
chr5 (187-236)||(27910680-27910729)
chr5 (1-49)||(6741672-6741719)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-237)||(20283907-20284143)
chr7 (1-237)||(33332493-33332729)
chr7 (1-201)||(9235634-9235836)
chr7 (8-236)||(29159627-29159856)
chr7 (8-234)||(49091487-49091712)
chr7 (1-222)||(23403071-23403292)
chr7 (1-237)||(46516353-46516590)
chr7 (1-237)||(4796710-4796949)
chr7 (9-236)||(9190052-9190279)
chr7 (28-237)||(2647739-2647949)
chr7 (10-237)||(35960641-35960870)
chr7 (28-224)||(9185221-9185415)
chr7 (34-223)||(21988757-21988948)
chr7 (28-236)||(2580232-2580443)
chr7 (8-237)||(55764-56001)
chr7 (28-221)||(2479184-2479375)
chr7 (10-236)||(21983109-21983337)
chr7 (28-224)||(47263525-47263719)
chr7 (28-236)||(44848728-44848937)
chr7 (28-224)||(18413487-18413681)
chr7 (8-224)||(5817325-5817545)
chr7 (28-236)||(18408610-18408816)
chr7 (28-236)||(21645852-21646059)
chr7 (28-236)||(28617269-28617480)
chr7 (28-236)||(21639654-21639861)
chr7 (119-223)||(22270105-22270210)
chr7 (1-216)||(3047070-3047287)
chr7 (157-224)||(30814567-30814634)
chr7 (170-224)||(27347948-27348003)
chr7 (171-224)||(41317417-41317471)
chr7 (28-234)||(1533490-1533696)
chr7 (1-45)||(2647962-2648006)
chr7 (170-224)||(48489562-48489617)
chr7 (174-231)||(2759183-2759241)
chr7 (187-237)||(2935507-2935557)
chr7 (187-236)||(7464519-7464569)
chr7 (187-237)||(9027194-9027244)
chr7 (171-224)||(12097850-12097904)
chr7 (172-221)||(14069817-14069867)
chr7 (172-221)||(14379845-14379895)
chr7 (187-237)||(22108305-22108355)
chr7 (187-237)||(22137316-22137366)
chr7 (187-237)||(31155911-31155961)
chr7 (187-237)||(40550065-40550115)
chr7 (187-237)||(40552343-40552393)
chr7 (171-224)||(41648994-41649048)
chr7 (170-231)||(43864368-43864430)
chr7 (170-224)||(26417446-26417502)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (1-237)||(10077208-10077444)
chr6 (1-237)||(31979331-31979567)
chr6 (8-234)||(18232670-18232896)
chr6 (25-234)||(5017515-5017727)
chr6 (34-237)||(22963550-22963753)
chr6 (34-237)||(23824640-23824843)
chr6 (10-236)||(31936414-31936640)
chr6 (28-236)||(5757522-5757728)
chr6 (2-236)||(4629780-4630007)
chr6 (1-224)||(21801400-21801627)
chr6 (8-234)||(31086519-31086734)
chr6 (28-236)||(21355883-21356089)
chr6 (1-139)||(5572737-5572875)
chr6 (28-236)||(22708863-22709071)
chr6 (139-237)||(5572284-5572382)
chr6 (1-237)||(24436014-24436245)
chr6 (28-98)||(26258181-26258252)
chr6 (28-236)||(5674814-5675023)
chr6 (26-96)||(27165545-27165616)
chr6 (171-223)||(16569154-16569207)
chr6 (149-236)||(33335974-33336063)
chr6 (187-237)||(12195515-12195565)
chr6 (187-237)||(29754709-29754759)
chr6 (187-237)||(33309120-33309170)
chr6 (172-223)||(9183015-9183067)
chr6 (135-217)||(27165635-27165717)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (1-224)||(775490-775713)
chr1 (7-237)||(16124559-16124790)
chr1 (1-236)||(19072744-19072981)
chr1 (1-236)||(19120634-19120871)
chr1 (6-237)||(13598219-13598452)
chr1 (10-236)||(29651637-29651864)
chr1 (20-237)||(47098867-47099083)
chr1 (10-236)||(47703980-47704208)
chr1 (9-236)||(27104416-27104640)
chr1 (20-237)||(47102884-47103100)
chr1 (11-236)||(26644941-26645166)
chr1 (8-236)||(9476087-9476314)
chr1 (10-236)||(21536613-21536839)
chr1 (20-168)||(40816844-40816993)
chr1 (28-234)||(37069613-37069821)
chr1 (10-236)||(3281537-3281761)
chr1 (28-224)||(32889283-32889480)
chr1 (1-216)||(50521165-50521382)
chr1 (1-155)||(9023957-9024109)
chr1 (28-224)||(17345574-17345771)
chr1 (28-236)||(13604667-13604876)
chr1 (28-236)||(19361476-19361688)
chr1 (28-236)||(19380116-19380328)
chr1 (28-236)||(19358887-19359098)
chr1 (28-102)||(22819270-22819344)
chr1 (28-236)||(24202813-24203020)
chr1 (171-224)||(28265537-28265591)
chr1 (171-231)||(3847104-3847165)
chr1 (172-224)||(28220210-28220263)
chr1 (170-224)||(3156996-3157051)
chr1 (171-217)||(13137959-13138006)
chr1 (170-224)||(44455291-44455346)
chr1 (171-224)||(834150-834204)
chr1 (187-237)||(9459419-9459469)
chr1 (187-237)||(9463246-9463296)
chr1 (187-237)||(12302507-12302557)
chr1 (187-237)||(15823775-15823825)
chr1 (187-237)||(16226396-16226446)
chr1 (187-237)||(23786068-23786118)
chr1 (171-224)||(45644337-45644391)
chr1 (172-224)||(28223405-28223458)
chr1 (174-222)||(31659371-31659420)
chr1 (171-217)||(41361052-41361100)
chr1 (171-222)||(4552620-4552672)
chr1 (170-205)||(30476428-30476464)
chr1 (170-221)||(37559849-37559901)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (25-237)||(2334-2546)
scaffold0006 (6-237)||(5504-5737)
scaffold0006 (28-236)||(133324-133533)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-234)||(17084-17314)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (8-236)||(10552-10782)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (10-233)||(85512-85733)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (28-236)||(36876-37084)
scaffold0087 (28-236)||(44005-44211)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (30-236)||(8463-8670)
scaffold0140 (187-237)||(22353-22403)
scaffold0140 (187-237)||(24628-24678)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (28-236)||(45100-45306)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (28-107)||(1253-1332)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (28-236)||(17996-18204)
scaffold0188 (28-98)||(24226-24297)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (10-100)||(29670-29760)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (10-100)||(43084-43174)
scaffold0078 (10-96)||(23357-23443)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (170-224)||(20397-20452)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (187-237)||(279-329)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33528900 - 33528667
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33528900 aattcggacaaaattccaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtccccaagcaacaacaacaaaaacag 33528801  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33528800 acctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 33528701  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33528700 cggtccaatatgacctaatatgggaaagagagca 33528667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20522038 - 20522271
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  20522038 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagaaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaacaaaaaaag 20522137  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20522138 acatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 20522237  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20522238 cggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 20522271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 17865021 - 17865254
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  17865021 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaaaatgtgtggagaaaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaaccaacaacaacaaaaacat 17865120  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17865121 acctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataatcaatgaaagaaaggaacaatcacaccaagattgttgacccagtt 17865220  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17865221 cagtcgaatatgacctaatctgggggagagagca 17865254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10445725 - 10445488
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-c 98  Q
    ||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10445725 aattcggacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaac 10445626  T
Q  99 aaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccag 198  Q
    | ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10445625 agacctaaatctaagtgtagagcaaaaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgatccag 10445526  T
Q  199 ttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10445525 ttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 10445488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16940481 - 16940265
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16940481 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaacaaaaacagacctaga 16940382  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| || ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16940381 tctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtcca 16940282  T
Q  208 atatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||| |||||||||    
T  16940281 atatgacataatctggg 16940265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17011146 - 17010930
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  17011146 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaacaaaaacagacctaga 17011047  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| || ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17011046 tctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtcca 17010947  T
Q  208 atatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||| |||||||||    
T  17010946 atatgacataatctggg 17010930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 31055883 - 31056097
Alignment:
Q  24 aaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  31055883 aaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaa 31055982  T
Q  124 caccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaag-aaatgaacaaacacacc-aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  31055983 caccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatct 31056082  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
     ||  ||||||||||    
T  31056083 aggggagagagcagc 31056097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34682595 - 34682378
Alignment:
Q  20 caataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaa-gtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtag 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  34682595 caatgaataacaaagatgtgtggagcaaaagaaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtag 34682496  T
Q  119 agtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaa 218  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  34682495 agcaacaccacaagcataatcaaacaaataaatataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacataa 34682396  T
Q  219 tctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  34682395 tctgggggagagagcagc 34682378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 8039884 - 8040113
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  8039884 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagacctaa 8039983  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||     
T  8039984 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaggagaggaaaaaatacatcaagattgttgacccagttcagtcc 8040083  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8040084 aatatgacctaatctgggggagagagcagc 8040113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 33117978 - 33118190
Alignment:
Q  25 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaac 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  33117978 aataacaaagatgtgtggatcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaaacatcaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaac 33118077  T
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33118078 accacaagcataatcaaagtaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttggg 33118177  T
Q  225 aaagagagcagcc 237  Q
      |||||||||||    
T  33118178 ggagagagcagcc 33118190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 34388686 - 34388899
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34388686 aaaatcacaccaataaataacgaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatatgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 34388785  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaat 209  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  34388786 taagtgtagagcaacaccacaagcaaaatcaaagc-acaaagataaacaaagaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccaattcggtccaat 34388884  T
Q  210 atgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||||    
T  34388885 atgacctaatctggg 34388899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 21629769 - 21629985
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  21629769 aattcggacaaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacag 21629866  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||     | ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21629867 acctagatctaagtgtagagcagcaccaca-----attcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 21629961  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    | ||| ||||||||||||||||||    
T  21629962 cagtccaatatgacctaatctggg 21629985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 13569155 - 13569381
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagat 108  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||    
T  13569155 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacaggcttagat 13569254  T
Q  109 ctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaa 208  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13569255 ctaagtatagagaaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataatcaatgaaagaaaggaataaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaa 13569353  T
Q  209 tatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13569354 tatgacctaatctgggggagagagcagc 13569381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8390425 - 8390194
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa----acc 103  Q
    |||||||| || |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||    |||    
T  8390425 acaaaatcacaccaatgaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtatccaaacaacaacaacaacaaaaaccagacc 8390326  T
Q  104 tagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgg 203  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8390325 tagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcgatgaaagaaatgaacaaacacaccaaaattgttgacccagttcgg 8390227  T
Q  204 tctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    || || |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  8390226 tccaaaatgacctaatttgggggagagagcagc 8390194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23078742 - 23078526
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca-aaaacaaacctagat 108  Q
    |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23078742 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacatacctagat 23078643  T
Q  109 ctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||     
T  23078642 ctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaatggaacaaacacaccaaaagaatgttgacccagttcgatcc 23078544  T
Q  207 aatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  23078543 aatatgacctaatatggg 23078526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 39482753 - 39482983
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-ca 99  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  39482753 aattcagacaaaatcacacaaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaa----taa-caatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaaca 39482847  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagt 199  Q
     ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39482848 gacctaaatctaagtgtagaacaacaccacaagcataaccaaagcaataaagataaacaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacctagt 39482947  T
Q  200 tcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcag 235  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  39482948 tcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 39482983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36758031 - 36757818
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  36758031 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaga-c 36757934  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |    
T  36757933 ttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccaattcggtcca 36757835  T
Q  208 atatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  36757834 atatgacctaatctggg 36757818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42039939 - 42039713
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  42039939 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacatacctagat- 42039841  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||| |    
T  42039840 taagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggagcaagcacaccaaaagattgttgatctagttcggtcca 42039742  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42039741 atatgacctaatctgtgggagagagcagc 42039713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10707508 - 10707308
Alignment:
Q  25 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca--aaaacaaacctagatctaaatgtagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||||| |    
T  10707508 aataacaaagatgtgtggagcaaaagaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaagaaaatatacctagatctaagtgtagagca 10707409  T
Q  123 acaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    ||||  |||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10707408 acactgcaagcataatcaaagc-acaaagataagcaaagaaagaaatgaataaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatg 10707310  T
Q  223 gg 224  Q
    ||    
T  10707309 gg 10707308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14699261 - 14699050
Alignment:
Q  17 catcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaac----aaaaacaaacctagatctaa 112  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||| || ||||| ||||||    
T  14699261 catcaatgaatatcaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaagcagacctaaatctaa 14699162  T
Q  113 atgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatg 212  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||             || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14699161 gtgtagagcaacaccacaagcataatca-------------aagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatg 14699075  T
Q  213 acctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  14699074 acctaatctgggggagagagcagcc 14699050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28259429 - 28259221
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa--caaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||  ||||||| ||||    
T  28259429 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtaataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaataacaaaaaaacagacctag-tctag-tgtagagcaaca 28259332  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||||||  ||||  || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28259331 ccacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaaga-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgg 28259234  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  28259233 gggagagagcagc 28259221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 3491597 - 3491803
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  3491597 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 3491694  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||| |   ||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  3491695 cacaagcaaatagaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg 3491791  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  3491792 ggagagagcagc 3491803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 25398339 - 25398548
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||| |||||    
T  25398339 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctaga-ct-agtgtagagcaacac 25398436  T
Q  127 caca-agcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    |||| |  | ||| |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  25398437 cacacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatct 25398533  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  25398534 gggggagagagcagc 25398548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Original strand, 35397357 - 35397532
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  | || || |  ||||||||||||||||||  | ||||| |||||  || |||| || |||    
T  35397357 aacaaagatgtgcggagcagaggaagtagtaatcaatgagtgaaatgacctcaagcaacaacaacaaaat-atacctaaatctatgtgcagagcaaaacc 35397455  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggt 204  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35397456 acaagcataatcaaagcaatcaatataagcaatgaaagaaggaaacaaacacaccaatattgtttacccagttcggt 35397532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 40738688 - 40738884
Alignment:
Q  31 aaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatcta----aatgtagagtaaca 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    | ||||||| ||||    
T  40738688 aaagatgtgtggagtaaaaggaagtggtaatctatatgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaaacc-agatctagtctagtgtagagcaaca 40738786  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||||||| | | ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  40738787 ccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcta-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctgg 40738883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2869943 - 2869756
Alignment:
Q  35 atgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa----cctagatctaaatgtagagtaacaccaca 130  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||  |  ||| |||||||||||| ||||||    |||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  2869943 atgtttggagcaaaggaagtagtgatcaatgagtaaagtagcatcaaacaacaacaacaacaacaaatagacctaaatctaagtgtagagcaacaccata 2869844  T
Q  131 agcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaat-gaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgaccta 217  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| |||  |||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2869843 agcatattcaaagcaacaaagataagcaaataaaggaagagaacaaacacaccaatattgtttacccagttcggtccaatatgaccta 2869756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 25403477 - 25403686
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||| |||||    
T  25403477 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctaga-ct-agtgtagagcaacac 25403574  T
Q  127 caca-agcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    |||| |  | ||| |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  25403575 cacacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcag-ccaatatgacctaatct 25403671  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  25403672 gggggagagagcagc 25403686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 40014746 - 40014886
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaaca 99  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  40014746 aattcggacaaaatcacaccaatgacaaacaaagatgtatggagcaaaggaagtagtaatcaatgg--aaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaaca 40014843  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaa 142  Q
      |||| | |||| |||| |  | |||||||||||||||||||    
T  40014844 gtcctaaaactaagtgtaaaacatcaccacaagcataatcaaa 40014886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27149118 - 27148999
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaac--aaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||  |  |||||||||||||||| |||  | | ||| |||||  |||| || ||||    
T  27149118 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtgataatcaatgagtaaagtagcatcaagcaacaacaacaataacatagatctaaatctatttgtaaagcaaca 27149019  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaaca 145  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  27149018 ccacaagcatattcaaaaca 27148999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1345652 - 1345587
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaaga--ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  1345652 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 1345587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 723727 - 723781
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  723727 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 723781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 11151574 - 11151628
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  11151574 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 11151628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 34139753 - 34139807
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  34139753 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 34139807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11099182 - 11099109
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatggataaagtg-tctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  11099182 aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaca 11099109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838076
Alignment:
Q  186 attgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 2838076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Original strand, 16388297 - 16388367
Alignment:
Q  33 agatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagt-gtctccaagcaacaacaacaa-aaacaaac 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  16388297 agatgtgtggagcaaagaaagtagtaatcaatgaataaagtagtct-caagcagcaacaacaacaaacaaac 16388367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 17057351 - 17057406
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  17057351 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctggg 17057406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 17085334 - 17085389
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  17085334 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctggg 17085389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11067490 - 11067436
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  11067490 aacaaacacaccaaagattgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctggg 11067436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 14633808 - 14633862
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  14633808 aacaaacacaccaaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctggg 14633862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215636
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 35215636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218013
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 35218013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558914
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 36558914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561191
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 36561191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36773747 - 36773693
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  36773747 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctggg 36773693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332231
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 45332231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 32178419 - 32178460
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaag 49  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32178419 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaag 32178460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39285008 - 39284967
Alignment:
Q  183 aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  39285008 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 39284967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 10047197 - 10047433
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  10047197 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaaaatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaataacaacaaaaatag 10047296  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10047297 acatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 10047396  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10047397 cggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 10047433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25862301 - 25862069
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25862301 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacag 25862202  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25862201 acctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaataaacacaccaagattgttgactcagtt 25862102  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagc 233  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25862101 cggtccaatatgacctaatatggggaagagagc 25862069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 54867000 - 54867237
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa--c 98  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  54867000 aattcagacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaac 54867099  T
Q  99 aaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccag 198  Q
    | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54867100 agacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagtaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccag 54867199  T
Q  199 ttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  54867200 ttcggtccaatatgacctagtctggg-gagagagcagcc 54867237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 39245811 - 39246048
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-ca 99  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  39245811 aattcggacaaaatcacaccaatgaataataaagatgtgtggagcgaatgaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaaca 39245910  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagt 199  Q
     ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245911 gacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaggcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagt 39246010  T
Q  200 tcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39246011 tcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 39246048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5269453 - 5269234
Alignment:
Q  21 aataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa---acctagatctaaatgta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||    
T  5269453 aataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaatatacctagatctaagtgta 5269354  T
Q  118 gagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgaccta 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5269353 gagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaatataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaacaagattgttgacctagttcggtccaatatgaccta 5269254  T
Q  218 atctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  5269253 atctgggggagagagcagcc 5269234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42599856 - 42599630
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa---a 97  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |    
T  42599856 aattcggacaaaatcacactaatgaataataaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgactccaagcaacaacaacaaaacaaa 42599757  T
Q  98 caaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgaccca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42599756 caaacctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaccca 42599657  T
Q  198 gttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
     ||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  42599656 attcagtccaatatgacataatatggg 42599630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 5147504 - 5147718
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||    
T  5147504 aaaatcacaccaatgaataacaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaataacagacctaaatc 5147603  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaat 209  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5147604 taagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaaacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaat 5147703  T
Q  210 atgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||| ||||    
T  5147704 atgacctaatttggg 5147718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3796801 - 3796565
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-c 98  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3796801 aattcatacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaatc 3796702  T
Q  99 aaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagattgttgaccca 197  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3796701 agacctaaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgaccca 3796602  T
Q  198 gttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  3796601 gttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagca 3796565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 5143096 - 5143312
Alignment:
Q  20 caataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtaga 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  5143096 caatgaataacaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtaga 5143195  T
Q  120 gtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaat 219  Q
      |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5143196 acaacaccacaaacataatcaaaacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactgagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaat 5143295  T
Q  220 ctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||  ||||||||||    
T  5143296 ctgggggagagagcagc 5143312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38152710 - 38152483
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacaaacctaga 107  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  38152710 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtagagcaaatgaagtggtaatcaatgtatgaagtgtttccaagcaacaacaacaataaaacagacctaga 38152611  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38152610 tctaagtgtatagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcca 38152512  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  38152511 atatgacataatctgggggagagagcagc 38152483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 24333635 - 24333862
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaaccta 105  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  24333635 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagaccta 24333734  T
Q  106 gatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtc 205  Q
    ||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24333735 gatctaagtgtagagcaacac---aagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaagaaacaaacacaccaagattgttaactcagttcggtc 24333831  T
Q  206 taatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
     ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  24333832 caatatgacctaatttgggggagagagcagc 24333862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16630950 - 16630737
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16630950 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaactggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcagcaacaacaaaaacaaacctagatc 16630851  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaag-aaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaa 208  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  16630850 taagtgtaaagcaacaccacaagcataatc-aaagaacaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaaggttgttgacctagttcggtccaa 16630752  T
Q  209 tatgacctaatctgg 223  Q
    |||||| ||||||||    
T  16630751 tatgacataatctgg 16630737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5396926 - 5396715
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatcta---aatgtagagtaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   | ||||||| |||    
T  5396926 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaga-ctaattagtgtagagcaac 5396828  T
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5396827 accacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaagaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 5396729  T
Q  223 ggaaagagagcagc 236  Q
    |   ||||||||||    
T  5396728 gaggagagagcagc 5396715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 3777413 - 3777587
Alignment:
Q  46 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaaca 145  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |     
T  3777413 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatctaagtgtagaacaaaaccacaagcataatcaaagc- 3777511  T
Q  146 ataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3777512 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatataacctaatct 3777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6743699 - 6743458
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| |||||||||  | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6743699 aattcggacaaaatcatagcaatgaataacaaagaagtgtcgagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaa-caa 6743601  T
Q  101 acctagatctaaat------gtagagtaacaccacaagcataatcaaaaca-ataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttga 193  Q
    ||||| ||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6743600 acctaaatctaaatctgagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcatatagagataagaaatggaagaaaggaacaaacacaccaagat-gttga 6743502  T
Q  194 cccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  6743501 cccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagcc 6743458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36315469 - 36315273
Alignment:
Q  23 taaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaa--gtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagag 120  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||                    
T  36315469 taaataacaaaaatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggacaaaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctt--------------- 36315385  T
Q  121 taacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatc 220  Q
        |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36315384 ----accacaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatc 36315289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36329678 - 36329482
Alignment:
Q  23 taaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaa--gtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagag 120  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||                    
T  36329678 taaataacaaaaatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggacaaaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctt--------------- 36329594  T
Q  121 taacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatc 220  Q
        |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36329593 ----accacaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatc 36329498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8689748 - 8689539
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  8689748 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcg-----taaagtgtctccaagtaacaacaacaaaaacagacctaga-c 8689655  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  8689654 ttaatgcagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaagtaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtcca 8689556  T
Q  208 atatgacctaatctggg 224  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  8689555 atatgatctaatatggg 8689539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16624279 - 16624147
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16624279 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatt 16624180  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaa 142  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16624179 taagtgtagagcaacaccacaagaataatcaaa 16624147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31985885 - 31985689
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca-aaaacaaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||| |||     
T  31985885 aacaaagatgtgtggtgcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaact 31985788  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31985787 ccacaagcatatacaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg 31985690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28468779 - 28468573
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  28468779 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 28468682  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||| |  |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  28468681 cacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctgga 28468585  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  28468584 ggagagagcagc 28468573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1983551 - 1983432
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||  || || |||||| |||| || | |||    
T  1983551 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtaataatcaatggataaagtgggttcaagcaacaacaacaacaaactgacttaaatctaagtgtaaagcatcac 1983452  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaa 146  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  1983451 cacaaacataatcaaaacaa 1983432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16623426 - 16623337
Alignment:
Q  148 aaagataaacaatgaaagaaatg-aacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16623426 aaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagc 16623337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34496075 - 34495866
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||||||| |||||  || | | |||| |||| || | ||     
T  34496075 aacaaagatgtgtggagcaaaggtagcggtaatcaatggacaaaatagcctcaagcaacaacaacaacaaacagtcccaaaactaagtgtaaagcatcaa 34495976  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaa-tgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||   |||||||||||||||| || | ||| ||||||||| || ||||| || ||||||     
T  34495975 cacaagcataatcaaagcaataaa-acaagcaatgaaagaaagaaaacaaacacaccaaga-tggtaacctagttcggtccaacatgacttactctgggg 34495878  T
Q  226 aagagagcagcc 237  Q
     |||||||||||    
T  34495877 gagagagcagcc 34495866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Original strand, 18377216 - 18377344
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||| | |||| |||| || |  ||    
T  18377216 aacaaatatgtgtggagcaaagtttgtagtaatcaatggataaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaacagtcctaaaactaagtgtaaagcataac 18377315  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataa 155  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18377316 cacaagcataatcaaagcaacaaaaataa 18377344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 12739532 - 12739587
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  12739532 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 12739587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 26175618 - 26175673
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  26175618 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 26175673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29254680 - 29254618
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagaga 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||    
T  29254680 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggagagaga 29254618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Original strand, 37781716 - 37781897
Alignment:
Q  37 gtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcat 135  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||  |||||| ||  ||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  37781716 gtgtggagcaaaagaagtagtcattaatgagtaaagtatcatcaatcaacaacatcaacaaatagacctagatctaagtgtgaagcaacaccacaagcat 37781815  T
Q  136 aatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct-aatatgaccta 217  Q
    | ||||| ||| ||||||||  ||| | ||||   ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  37781816 attcaaagcaacaaagataagaaataatagaagaaaac-aacaaaccaatattgtttacccagttcggtttaaatatgaccta 37781897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 48893621 - 48893675
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  48893621 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 48893675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21688478 - 21688383
Alignment:
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaag--attgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||   ||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  21688478 accacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaagataaca---acaccaagaaattgttgactcaattcggtctaacttgacctaatct 21688383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 99
Target Start/End: Original strand, 24741782 - 24741855
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatggataaagtg-tctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  24741782 aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaca 24741855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871951
Alignment:
Q  173 caaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5872003 caaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctggg 5871951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 9927440 - 9927495
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  9927440 gaacaaacacaccaaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctggg 9927495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 12743907 - 12743962
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  12743907 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatggg 12743962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 12745296 - 12745351
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  12745296 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatggg 12745351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Original strand, 52467337 - 52467388
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  52467337 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatct 52467388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9148585 - 9148535
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9148585 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 9148535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931839
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16931839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934193
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16934193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780423
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 22780423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599888
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 44599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 46147374 - 46147428
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  46147374 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttggg 46147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Original strand, 5112085 - 5112122
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatg 65  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5112085 aacaaaaatgtgtggagcaaagggagtggtaatcaatg 5112122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 36463385 - 36463426
Alignment:
Q  183 aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  36463385 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 36463426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7816425 - 7816397
Alignment:
Q  71 agtgtctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7816425 agtgtctccaagcaacaacaacaaaaaca 7816397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709212
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcag 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcag 18709212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9766099 - 9765863
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9766099 aattcagacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 9766000  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa-gattgttgacccagt 199  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9765999 acctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaagggaacaaacacaccaatgattgttgacccagt 9765900  T
Q  200 tcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9765899 tcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4696882 - 4696639
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggata-------aagtgtctccaagcaacaacaaca 93  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  4696882 aattcggacaaaatcacatcaatgaataacaaagatgtgtggaacaaaggaagtggtaatcaatagatactagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 4696783  T
Q  94 aaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttga 193  Q
    |||||| || || |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4696782 aaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttga 4696683  T
Q  194 cccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4696682 cccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 4696639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26403510 - 26403274
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    ||||| ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26403510 aattcggacaaaaccacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataatgtgtctccaagcaataacaacaaaaaca 26403411  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagt 199  Q
     ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26403410 gacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaaacgaggaacaaacacaccaagattgttgacccagt 26403311  T
Q  200 tcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26403310 tcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 26403274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5702756 - 5702529
Alignment:
Q  7 gacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5702756 gacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgaataaagtgtctcctagcaacaacaacaaaaacagacctag 5702657  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5702656 atctaagtgtagagcatcaccacaagcataattaaagcaatagagataagctatgaaggaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcc 5702557  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  5702556 aatatgacctaatatgggggagagagca 5702529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 6127043 - 6127274
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaaccta 105  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  6127043 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagattaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagatata 6127142  T
Q  106 gatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacaca-ccaagattgttgacccagttcggt 204  Q
     || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||    
T  6127143 aatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcactaaagataagcaatgaaagagatgaacaaacacatcaaatattgttgactcagttcggt 6127242  T
Q  205 ctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6127243 ccaatatgacctaatttggggaagagagcagc 6127274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19752646 - 19752438
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | |||||    
T  19752646 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatatataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-cagacctaaatctaagtgtagtgcaacac 19752548  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||      
T  19752547 cacaagcataatcaaagcaatagagataagtaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctagggg 19752448  T
Q  227 agagagcagc 236  Q
    ||||||||||    
T  19752447 agagagcagc 19752438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23799823 - 23799620
Alignment:
Q  35 atgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa-acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |  ||||||| |    
T  23799823 atgtgtggagcaaagaaagtgttaatcaatagataaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaaatagacctagatctaagtgtagagaagtaccacaaac 23799724  T
Q  134 ataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagc 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||    
T  23799723 ataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagc 23799624  T
Q  234 agcc 237  Q
    ||||    
T  23799623 agcc 23799620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 4455855 - 4456081
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  4455855 aaaatcacaccaatgaatatcaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagcaaaaacagacctgga-c 4455953  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    | | ||||||| ||||| |||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |    
T  4455954 ttagtgtagagcaacacaacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgctgacccggttcggtcca 4456052  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4456053 atatggcctaatctgggggagagagcagc 4456081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19176027 - 19175800
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggat----aaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaaccta 105  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  19176027 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaattaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaag-cagaccta 19175929  T
Q  106 gatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgg 203  Q
    || || | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  19175928 ga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcgg 19175831  T
Q  204 tctaatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19175830 tccaatatgacctaatctgggggagagagca 19175800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31071481 - 31071273
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  31071481 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 31071384  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||| |  |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31071383 cacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgg 31071286  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  31071285 gggagagagcagc 31071273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 7412182 - 7412394
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatcta----aatgtagagtaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||| | ||| |||    | ||||||| ||    
T  7412182 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatgaatgtgtaaagtgtctccaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaac-agacctagtctagtgtagagcaa 7412280  T
Q  124 caccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaga---ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatc 220  Q
    |||||||||||||  ||||  || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  7412281 caccacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaata 7412378  T
Q  221 tgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||  ||||||||||    
T  7412379 tgggggagagagcagc 7412394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 26287747 - 26287954
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  26287747 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 26287844  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||| |  |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26287845 cacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg 26287941  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  26287942 gggagagagcagc 26287954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 26312998 - 26313205
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  26312998 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 26313095  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||| |  |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26313096 cacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg 26313192  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  26313193 gggagagagcagc 26313205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 6813496 - 6813717
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    ||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||| ||||    
T  6813496 aattcggacaaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgttgagcaaagtgagtggtaatcaatggacaaaatagtctc-aatcaacaacaacaacaaca 6813593  T
Q  100 aa-----cctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagattgttga 193  Q
    ||     | ||  ||| | ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |    
T  6813594 aaatagacttaagtcttagtgtagaacaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacataccaaagattgttaa 6813693  T
Q  194 cccagttcggtctaatatgaccta 217  Q
    |||||||||||| ||||| |||||    
T  6813694 cccagttcggtccaatataaccta 6813717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5990836 - 5990685
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||  ||| |     
T  5990836 aattccgacaaaatcacatcaataaa--acaaagatgtgcggagcaaaggaagtagtaatcaatggataaagtagcatcaagcaacaacaac--aaatag 5990741  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaa-caataaagataa 155  Q
    ||||| |||||| ||||||  || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  5990740 acctaaatctaagtgtagaacaaaaccacaagcatattcaaaagcaacaaagataa 5990685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9055113 - 9054881
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  |    
T  9055113 aattcaaacaaaatcacatcaatgaa--acaatgatgtgtggagtaaaggaagtactaatcaatggataaagtagtctcaaaa-aacaacaacaaaat-a 9055018  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagt 199  Q
     || ||  ||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||||   | |||||||||||| ||| || || | ||    
T  9055017 gacataagtcttagcgtagaataacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagtcatgaaagaagcaatcaaacacaccaatattatttactctgt 9054918  T
Q  200 tcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    || ||| ||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  9054917 tcagtccaatatgacctactctggaggagagagcagc 9054881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1262204 - 1261998
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  1262204 aacaaagatgtgtggagtaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 1262107  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||| | |||  || |||  ||||| || |  ||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  1262106 cacaag-agaatacaagcaaacaagat-aagatagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttc-aaccaatatgacctaatctgg 1262011  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  1262010 gggagagagcagc 1261998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 99
Target Start/End: Original strand, 26300992 - 26301064
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26300992 aacaaagatgcgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcaacaagcaacaacaacaaaaaca 26301064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 28307401 - 28307614
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-----ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaacaaacctagatctaaatgtagagt 121  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||  | ||||  |  |||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |      
T  28307401 aacaaagatgtgtggagcaaattaaaggaagtagtaatcaatgagtcaagtagcctcaagtaacgacaacaacaaataaacctaaatctaagtgtataac 28307500  T
Q  122 aacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||  || | |||||   || |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||    
T  28307501 agcaccacaagcataaacaaagcaataaatataagaaa-gcaagaatgaaataaacacgccaagattggtaacccagttcggtccaaaatgacctactct 28307599  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    ||| | |||||||||    
T  28307600 ggggatgagagcagc 28307614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15212972 - 15212917
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  15212972 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 15212917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43036609 - 43036555
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  43036609 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgg 43036555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 99
Target Start/End: Original strand, 36979219 - 36979292
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatggataaagtg-tctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  36979219 aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaca 36979292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4733892 - 4733837
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  4733892 gaacaaacacaccaaagactgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 4733837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7493345 - 7493233
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagt-gtctcca--agcaacaacaacaaaaa 97  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||    
T  7493345 aattcggacaaaatcacaccaataaa--actatgatgtgtggagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtagtctcaagcagcagcaacaacaacaa 7493248  T
Q  98 caaacctagatctaaat 114  Q
    ||||  |||||||||||    
T  7493247 caaa--tagatctaaat 7493233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27811460 - 27811409
Alignment:
Q  174 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  27811460 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 27811409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Original strand, 30655482 - 30655553
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatggataaagtg-tctccaagcaacaacaacaaaaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  30655482 aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaaa 30655553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33352336 - 33352281
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  33352336 gaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 33352281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 1345354 - 1345408
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  1345354 aacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtctaacttgacctactctggg 1345408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15073046 - 15072996
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  15073046 ttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 15072996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15809553 - 15809503
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15809553 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagcc 15809503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Original strand, 17799424 - 17799474
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaat-atgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17799424 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggagagagagcagc 17799474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 22684653 - 22684703
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22684653 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagcc 22684703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40321265 - 40321211
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  40321265 aacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 40321211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079887
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 43079887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082258
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 43082258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 19491681 - 19491729
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaagat--tgttgacccagttcggtctaatatgaccta 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19491681 aacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatatgaccta 19491729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33038062 - 33037994
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaa-aggaagtggtaatcaatggataaagt-gtctccaagcaacaacaacaa 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||    
T  33038062 aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaa 33037994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 48438032 - 48438268
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  48438032 aattcggacaaaatcacatcaatgaataacaaggatgtgtggagcaaaggaaatggtaatcaatagataaagtatctccaagcaacaacaacaaaaacag 48438131  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48438132 acctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgacagaaaggaacaaacacaccaagattattgacctagtt 48438231  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  48438232 cggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 48438268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3716265 - 3716036
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||     
T  3716265 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctacaagcaacaacaacaaaaacagacataa 3716166  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3716165 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcacaacaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcc 3716066  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3716065 aatatgacctaatctaggagagagagcagc 3716036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Original strand, 40844489 - 40844705
Alignment:
Q  20 caataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtaga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40844489 caatgaataacaaagatgtgtggagtaaaagaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaaatctaagtgtaga 40844588  T
Q  120 gtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaat 219  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  40844589 gcaacactacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacgaacacaccaagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaat 40844688  T
Q  220 ctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||  |||||||||||    
T  40844689 ctggg-gagagagcagcc 40844705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1417752 - 1417526
Alignment:
Q  7 gacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||     
T  1417752 gacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaa-catacataa 1417654  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1417653 atctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcc 1417554  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1417553 aatatgacctaatctgggggagagagca 1417526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40593025 - 40592830
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40593025 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacacc 40592926  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaag-aaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40592925 acaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 40592830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30710051 - 30709823
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30710051 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 30709952  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  30709951 taagtttagagcaacaccataagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcca 30709853  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30709852 atatgacctaatctgggggagagagcagcc 30709823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8370747 - 8370520
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8370747 aaaatcacatcaatgaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 8370648  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  8370647 taagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcca 8370549  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8370548 atatgacctaatctgggggagagagcagc 8370520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24695425 - 24695213
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  24695425 acaaaatcacacaaatgaataataaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagagctaaa 24695326  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24695325 tctaagtatagagcaacac-acaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtcca 24695227  T
Q  208 atatgacctaatct 221  Q
    ||||||||||||||    
T  24695226 atatgacctaatct 24695213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 26298807 - 26299042
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaac------aacaacaaaaacaaa 101  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||| |    
T  26298807 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggatcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaaacaacaacaacaacaacaaaaacaga 26298906  T
Q  102 cctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttc 201  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26298907 cctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaacgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttc 26299006  T
Q  202 ggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||  |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  26299007 ggttcaatatgacataatctgggggagagagcagcc 26299042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6794981 - 6794747
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6794981 aattcggacaaaatcacaccaatgaaaaacaacgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagaaaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-cag 6794883  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6794882 acctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccggtt 6794783  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
     |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  6794782 aggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 6794747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Original strand, 21711068 - 21711276
Alignment:
Q  25 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |||    
T  21711068 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaa---atagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaaatcaccatgtagagcaac 21711164  T
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21711165 accataggcataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg 21711264  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  21711265 ggagagagcagc 21711276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 37466109 - 37466345
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || || || |||||||     
T  37466109 aattcggacaaaatcacaccaataaataacaaagatgtgaggagcaaaggaaatggtaatcaatggattaagtgtctccaaaaaaaaaaaaaaaaaacag 37466208  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    || |  |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37466209 acattaatctaagtgtagagcaacattacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacacagtt 37466308  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  37466309 cggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagcc 37466345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 16264174 - 16264403
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16264174 acaaaatcacaccaatgaataacaaagacgtgtggagcaacagaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaacaatcctaga 16264273  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacac--caagattgttgacccagttcggtc 205  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  16264274 tctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagc-acaaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtc 16264372  T
Q  206 taatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16264373 caatatgacctaatctgggggagagagcagc 16264403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39040251 - 39040031
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  39040251 aaaatcacaccaataaataataaagatgtgtggaacaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaga-c 39040154  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |    
T  39040153 ttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtcca 39040055  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagaga 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  39040054 atatgacctaatctggggaagaga 39040031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 36028932 - 36029134
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36028932 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 36029031  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaat 209  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||            |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  36029032 taagtatagagcaacaccacaagc------------ataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttctgtccaat 36029119  T
Q  210 atgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36029120 atgacctaatctggg 36029134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 35925327 - 35925525
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35925327 aacaaagatatgtggagcaaagcaggtggtaatcaatgtgtaaaatgtctccaagtaacaacaacaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacacc 35925426  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35925427 acaagcataatcaaaac-acaaagatgagcaatgaaagaaaagaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatttggga 35925525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3328558 - 3328389
Alignment:
Q  68 taaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaa 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3328558 taaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagag 3328459  T
Q  168 atgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  3328458 aggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcc 3328389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33386909 - 33386700
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca-aaaacaaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||| ||||    
T  33386909 aacaaagatgtgtggagtaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaaca 33386812  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33386811 ccacaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaag-aagaaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgg 33386713  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  33386712 gggagagagcagc 33386700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27986687 - 27986480
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||| |||||    
T  27986687 aacaaagatgtatggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaatagacctag-tctag-tgtagagcaacac 27986590  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27986589 cacaagcatatacaaagcaataaagataagcaa-gaaagaa-tgaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg 27986492  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  27986491 ggagagagcagc 27986480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 32143167 - 32143374
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||    
T  32143167 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaacac 32143264  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||| |  |||| |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32143265 cacaagcaaatacaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggg 32143362  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  32143363 ggagagagcagc 32143374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 8126538 - 8126682
Alignment:
Q  20 caataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtaga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  8126538 caataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtattcaatagatacaatgtctccaaccaacaacaacaaaaacatacctaaatctaagtgtaga 8126637  T
Q  120 gtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaa 164  Q
    | |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8126638 gcaacaccacactcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaa 8126682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18553059 - 18552916
Alignment:
Q  94 aaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttga 193  Q
    |||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18553059 aaaacagaactaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataatcaatgaaagaaaggaacaaatacaccaagattgttga 18552960  T
Q  194 cccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18552959 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 18552916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Original strand, 27026772 - 27026925
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27026772 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaagaaaaacagacctagatc 27026871  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaa 164  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  27026872 taagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaa 27026925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27975191 - 27974986
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  27975191 aacaaagatatgtggagtaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagc-aaaacagaccta-atct-agtgtagagcaacacc 27975095  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    ||||||||||   ||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27975094 acaagcataa-ataaagaacaaagataagcaatgaaag-aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 27974997  T
Q  226 aagagagcagc 236  Q
     ||||||||||    
T  27974996 gagagagcagc 27974986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Original strand, 25795704 - 25795834
Alignment:
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagattgttgacccagttcggtc 205  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25795704 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataataaaaacaataaaaataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtc 25795803  T
Q  206 taatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25795804 caatatgacctaatctgggggagagagcagc 25795834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Original strand, 1417090 - 1417232
Alignment:
Q  7 gacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  1417090 gacaaaatcacaccaatgaataataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaa 1417188  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaa 150  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  1417189 atctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagcaataaa 1417232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Original strand, 27038117 - 27038270
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27038117 aaaatcacaccaatgaataactaagatgtgtggagcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagatctagatc 27038216  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaa 164  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  27038217 taagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaa 27038270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 47924128 - 47924007
Alignment:
Q  11 aaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatct 110  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  47924128 aaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaca---acaaaaacagacctagatct 47924032  T
Q  111 aaatgtagagtaacaccacaagcat 135  Q
    || ||||||| ||||||||||||||    
T  47924031 aagtgtagagcaacaccacaagcat 47924007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1736447 - 1736338
Alignment:
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaa 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  1736447 acaagcataatcaaagcaataaacataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaatattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggga 1736348  T
Q  228 gagagcagcc 237  Q
    ||||||||||    
T  1736347 gagagcagcc 1736338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4387173 - 4386961
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa---cctagatctaaatgtagagtaac 124  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  |   |||||||||||||||||| |||   ||||  ||| ||||||||  |||    
T  4387173 aacaaaaatgtgtggagcaaagaaagtagtaatcaatgagtaaagtagccataagcaacaacaacaaaaaaaaaagacctaagtcttaatgtagaacaac 4387074  T
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacaca-ccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||  | ||||||||| |||||    
T  4387073 gccacatgcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgg 4386974  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  4386973 gggagagagcagc 4386961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Original strand, 47649565 - 47649655
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa 97  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47649565 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggaacaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa 47649655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 1305795 - 1305967
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaag-gaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  1305795 aacaaagatgtgtggagcaaaaagaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 1305892  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttc 201  Q
    |||||||| |  |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1305893 cacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttc 1305967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 1309700 - 1309872
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  1309700 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 1309797  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttc 201  Q
    |||||||| |  |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1309798 cacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttc 1309872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34491443 - 34491344
Alignment:
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  34491443 accacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctgg 34491344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3323825 - 3323752
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaa 81  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3323825 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgcataaagtgtctccaa 3323752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18554556 - 18554465
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaac 92  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  18554556 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatagataaaatatctccaaacaacaacaac 18554465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 100
Target Start/End: Original strand, 27452803 - 27452876
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27452803 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaacaacaa 27452876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47924008 - 47923939
Alignment:
Q  168 atgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47924008 atgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcc 47923939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25929633 - 25929488
Alignment:
Q  81 agcaacaacaacaa--aaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagat---aaacaatgaaagaaatgaacaa 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||   |||  | ||||||||  |||||    
T  25929633 agcaacaacaacaacaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaacaaagataagaaagcaagaaagaaa--aacaa 25929536  T
Q  176 acacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  25929535 acacaccaaga-tggtaacccagttcggtccaatacgacctactctggg 25929488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26928756 - 26928637
Alignment:
Q  114 tgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatat 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||    
T  26928756 tgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcta-gaaagaaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatat 26928660  T
Q  212 gacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  26928659 gacctaatctgggggagagagca 26928637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 8477206 - 8477415
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatggataaagtgtct-ccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||  || | ||||||||||||||||||| ||  |||||| || | ||||||  ||||    
T  8477206 aacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaagtttcccaagcaacaacaacaaaaccagccctaga-ct-agtgtagaacaaca 8477303  T
Q  126 ccacaagcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||  ||||| |||| |||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  8477304 ccacaaagataatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaagaaa-gaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct 8477400  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  8477401 gggggagagagcagc 8477415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 236
Target Start/End: Original strand, 27452906 - 27453011
Alignment:
Q  131 agcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaag 228  Q
    ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||    
T  27452906 agcatatacaaagcaataaagataagcaa-gaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggag 27453003  T
Q  229 agagcagc 236  Q
    ||||||||    
T  27453004 agagcagc 27453011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29811061 - 29810999
Alignment:
Q  163 aagaaatgaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  29811061 aagagatgaacaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtttaacttgacctaatctggg 29810999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 32744419 - 32744473
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  32744419 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 32744473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4387275 - 4387239
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4387275 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtagtaatcaat 4387239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 5236439 - 5236494
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  5236439 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagtttggtccaaattgacctaatctggg 5236494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29813249 - 29813194
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  29813249 gaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacatgaccaaatctggg 29813194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51399000 - 51398945
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  51399000 gaacaaacacaccaaagattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggg 51398945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 9666449 - 9666503
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  9666449 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaactttacctaatctggg 9666503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 23391892 - 23391946
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  23391892 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttggg 23391946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 29196369 - 29196423
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  29196369 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttggg 29196423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44331718 - 44331676
Alignment:
Q  182 caagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44331718 caagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 44331676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494208
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 50494208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 53917662 - 53917712
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  53917662 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 53917712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 25929692 - 25929635
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggta 58  Q
    ||||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25929692 aattcggacaaaatcacaacaactaataacaaagatgtgtggaataaaggaagtggta 25929635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28503960 - 28503908
Alignment:
Q  183 aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28503960 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctggggaagagagcagc 28503908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 747016 - 746968
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcag 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  747016 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcag 746968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40913464 - 40913424
Alignment:
Q  184 agattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  40913464 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 40913424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42127688 - 42127453
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  42127688 aattcggacaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-cag 42127590  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    || || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42127589 acttaaatctaattgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 42127490  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42127489 cgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 42127453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Original strand, 28832084 - 28832313
Alignment:
Q  7 gacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  28832084 gacaaaatcataccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagaccta- 28832182  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28832183 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaatcaataaagataagcaatgaaagaaacaaacaaacacaccaagattgttgacccggttcggtcc 28832282  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28832283 aatatgacctaatctgggggagagagcagcc 28832313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17004239 - 17004004
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaca 99  Q
    ||||| ||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004239 aattcggacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagaggtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaca 17004140  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagt 199  Q
     ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004139 gacctaaatctaagtgta-agcaacaccacaagcataatcaaagcaaaaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagt 17004041  T
Q  200 tcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17004040 tcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 17004004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19588564 - 19588800
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  19588564 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagcgtctccaagcaacaacaacaaaaaaag 19588663  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19588664 acctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacactcaaagattgttgacccagtt 19588763  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||||    
T  19588764 cggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagcc 19588800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24553748 - 24553548
Alignment:
Q  38 tgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataa 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24553748 tgtggagcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagcaacatcaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagaaacaccacaagcataa 24553649  T
Q  138 tcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  24553648 tcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagcc 24553549  T
Q  238 t 238  Q
    |    
T  24553548 t 24553548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 14520056 - 14520268
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14520056 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 14520155  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  14520156 taagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcactgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcca 14520254  T
Q  208 atatgacctaatct 221  Q
    ||||||||||||||    
T  14520255 atatgacctaatct 14520268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11182106 - 11181896
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca--aaaacaaaccta 105  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||    
T  11182106 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagtaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagactta 11182007  T
Q  106 gatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtc 205  Q
     |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  11182006 aatctaagtgtagagcaataccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaga-tggtaacctagttcggtc 11181908  T
Q  206 taatatgaccta 217  Q
    ||||||||||||    
T  11181907 taatatgaccta 11181896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 3880127 - 3880352
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||   |||||||||| |||||     
T  3880127 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaatcaac---aacaaaaacagacctaa 3880223  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||     
T  3880224 atctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaac-aacacaccaagattgttgattcagttctgtcc 3880322  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  3880323 aatatgacctaatctgaggcagagagcagc 3880352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 15464377 - 15464585
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||    
T  15464377 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaacac 15464474  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15464475 cacaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaag-aagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctggg 15464573  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  15464574 ggagagagcagc 15464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11917245 - 11917016
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa---cctag 106  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || || ||||| |||   |||||    
T  11917245 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaagacctag 11917146  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11917145 atcttagtgtagagcaacaccacaagcataaacagtgcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtcc 11917046  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  11917045 aatatgacctaatatgggggagagagcagc 11917016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9353582 - 9353376
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  9353582 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaaacaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaacacc 9353485  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    |||||||| ||  ||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9353484 acaagcat-atacaaagaacaaagataagcaatgaaag-aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 9353387  T
Q  226 aagagagcagc 236  Q
     ||||||||||    
T  9353386 gagagagcagc 9353376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31300829 - 31300654
Alignment:
Q  46 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaaca 145  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  31300829 aaaggaactggtaatcaatagataaagtgttttcaagcaaaaacaacaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtgtaatcaaaaca 31300731  T
Q  146 ataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31300730 ataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctg 31300654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36932602 - 36932394
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||    
T  36932602 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctag-tctag-tgtagagcaaca 36932505  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36932504 ccacaagcataaacaaag-aacaaagataagcaatgaaa-aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg 36932407  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  36932406 gggagagagcagc 36932394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12084376 - 12084219
Alignment:
Q  80 aagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacac 179  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12084376 aagcaacaaaaacaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacac 12084278  T
Q  180 acc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  12084277 accaaaatattgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagc 12084219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 224
Target Start/End: Original strand, 6741790 - 6741893
Alignment:
Q  122 aacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatc 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||  |||||||| || ||    
T  6741790 aacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattattaacacagttcggttcaatatgacatactc 6741889  T
Q  221 tggg 224  Q
    ||||    
T  6741890 tggg 6741893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33031196 - 33030984
Alignment:
Q  31 aaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtg-tctccaagcaacaacaacaaaaacaaacc----tagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||      || |||||| ||||||| || |    
T  33031196 aaagatgtgtggagcaaaggaaatagtaattaatggataaagtgatcctcaagcaccaacaacaacaacaaataaatataaatctaagtgtagagcaata 33031097  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatg-aaagaaatgaacaaacaca-ccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||| |||||||| || |||||    
T  33031096 ccacgagaataatcaaagcaataaagataaccaatgaaaataaaggaacaaacacatcaaagattgttaattcagttcggtcaaatatgacatactctgg 33030997  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  33030996 gggagagagcagc 33030984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 38192017 - 38192226
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||| |||||    
T  38192017 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctaga-ct-agtgtagagcaacac 38192114  T
Q  127 caca-agcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    |||| |  | ||| |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  38192115 cacacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct 38192211  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  38192212 gggggagagagcagc 38192226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 38219242 - 38219451
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||| |||||    
T  38219242 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctaga-ct-agtgtagagcaacac 38219339  T
Q  127 caca-agcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    |||| |  | ||| |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  38219340 cacacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct 38219436  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  38219437 gggggagagagcagc 38219451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Original strand, 35387508 - 35387587
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35387508 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaccctag 35387587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Original strand, 10281728 - 10281804
Alignment:
Q  161 gaaagaaatgaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  10281728 gaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagc 10281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28278547 - 28278448
Alignment:
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaag-attgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  28278547 accacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaagaaagaaacacaccaagaattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctgg 28278448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38747235 - 38747138
Alignment:
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||    
T  38747235 accacaatcataatcaaagcaataaagataagcaattaaagaaaggaacaaatccaccaagattattgacccagtttggtccaacttgacctgatctg 38747138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 42126686 - 42126625
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatca 62  Q
    ||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42126686 aattcggataaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatca 42126625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 8565930 - 8565983
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  8565930 aacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctggg 8565983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 236
Target Start/End: Original strand, 24135696 - 24135901
Alignment:
Q  31 aaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagc-aacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacca 128  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| || | ||||||| |||||||    
T  24135696 aaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagagtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctaga-ct-agtgtagagcaacacca 24135792  T
Q  129 caagcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||| ||||| |||| |||  ||||||| | |  |||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  24135793 caag-ataatacaaagcaaacaagataagctagaaaaggaa-gaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg 24135889  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  24135890 ggagagagcagc 24135901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 34842454 - 34842557
Alignment:
Q  33 agatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaacaaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaa 131  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||  |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  34842454 agatgtgtggagtaaaggaagtagtaatcaagag-taaagtagcctcaagcagcaacaacaataaacaaacctagatctaagtgtgaagcaacaccacaa 34842552  T
Q  132 gcata 136  Q
    |||||    
T  34842553 gcata 34842557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10757455 - 10757405
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  10757455 ttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 10757405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23665322 - 23665272
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23665322 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagcc 23665272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 23741859 - 23741909
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23741859 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagcc 23741909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 23793265 - 23793315
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23793265 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagcc 23793315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32637009 - 32636955
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  32637009 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 32636955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19806549 - 19806494
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19806549 gaacaaacaccccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 19806494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 49
Target Start/End: Original strand, 10281686 - 10281728
Alignment:
Q  7 gacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaag 49  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10281686 gacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaag 10281728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749929
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 10749929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354625
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 15354625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552474
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 15552474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21289040 - 21288990
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  21289040 ttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 21288990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179421
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 31179421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542963
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 31542963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545309
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 31545309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410252
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagc 4410252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910680
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagc 27910680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 6741672 - 6741719
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaag 49  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6741672 aattcagacaaaataacatcaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaag 6741719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 20283907 - 20284143
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20283907 aattcggacaaaatcacacctatgaataacaaagatgtgtggagcaaaagaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaacag 20284006  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284007 acctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 20284106  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20284107 cggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 20284143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33332729 - 33332493
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33332729 aattcggacaaaatcacaccaatgaataaccaagatgtgtggaccaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtatccaaacaacaacaacaaaaacaa 33332630  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332629 acctaaatctaagtgtagagcaacaccataagcataatcaaatcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 33332530  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33332529 cgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 33332493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9235836 - 9235634
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa--c 98  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9235836 aattcggacaaaatcacaccaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaac 9235737  T
Q  99 aaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccag 198  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9235736 agacctaaatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccag 9235637  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  9235636 ttc 9235634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 29159627 - 29159856
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaagg-aagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29159627 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaa 29159726  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29159727 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcc 29159826  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  29159827 aatatgacctaatctaggggagagagcagc 29159856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Original strand, 49091487 - 49091712
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49091487 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaga 49091586  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  49091587 tttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacgcaccaagattgttgacccagtttagtcca 49091685  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  49091686 atatgacctaatctggggaagagagca 49091712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23403292 - 23403071
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23403292 aattcggacaaaatcataccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtttccaagcaacaacaacaaaaacag 23403193  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23403192 acctaaatgtaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaatataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactaagattgttgacccaatt 23403093  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23403092 cggtctaatatgacctaatctg 23403071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46516590 - 46516353
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-ca 99  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  46516590 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaaca 46516491  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagt 199  Q
     || || |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46516490 gacttaaatctaagtgtaaagcaacaccaaaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagt 46516391  T
Q  200 tcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  46516390 tcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagcc 46516353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4796949 - 4796710
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4796949 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtttctccaagcaacaacaacaaaaaaaa 4796850  T
Q  101 ---acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgaccca 197  Q
       ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4796849 cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccaagattgttaaccca 4796750  T
Q  198 gttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  4796749 gttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagcc 4796710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9190279 - 9190052
Alignment:
Q  9 caaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9190279 caaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-caaacctaga 9190181  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9190180 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcca 9190081  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  9190080 atatgacctagtctgggggagagagcagc 9190052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2647949 - 2647739
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||    
T  2647949 aacaaagatgtgtggagcaaaggaaatggtaatcaatagataaaatatctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtttagagcaacac 2647850  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaa 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||      
T  2647849 cacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctggggg 2647750  T
Q  227 agagagcagcc 237  Q
    |||||||||||    
T  2647749 agagagcagcc 2647739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 35960641 - 35960870
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacaaacctaga 107  Q
    |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||| |    
T  35960641 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaacaggcctaaa 35960740  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  35960741 tctaagtgtagagaaacaccaccagcataaataaagcaataaagataagaaattaatgaaatgaacaaacacaccaagattgttgaccgagttcggttca 35960840  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35960841 atatgacctaatctgggggagagagcagcc 35960870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9185415 - 9185221
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  9185415 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-cagacctagatctaagtgtagagaaacac 9185317  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  9185316 cacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaa--acaccaagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctggg 9185221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Original strand, 21988757 - 21988948
Alignment:
Q  34 gatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa-acctagatctaaatgtagagtaacaccacaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||   ||||||| ||||||||||     
T  21988757 gatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcaccaagcaacaacaacaaactccagacctaaatctgggtgtagagcaacaccacaaa 21988856  T
Q  133 cataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatg-aacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21988857 cataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg 21988948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 2580232 - 2580443
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||  ||||    
T  2580232 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagatacac 2580330  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaa---atgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  2580331 cacaagtataaccaaagcaataaagataagcaatgaaaaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgg 2580430  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  2580431 gggagagagcagc 2580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 55764 - 56001
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa---------ac 98  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||         ||    
T  55764 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaataaaataaaaaaaaac 55863  T
Q  99 aaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaag-aaatgaacaaacacaccaagattgttgaccca 197  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55864 agacctagatctaagtatagagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatggaaggaaaggaacaaacacaccaagattattgaccca 55962  T
Q  198 gttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  55963 gttcggtccaatatgacctaatctggg-gagagagcagcc 56001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 2479184 - 2479375
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  2479184 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaacacc 2479281  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    |||||||| ||  ||| || |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2479282 acaagcat-atacaaagaacaaagataagcaatgaaag-aagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatct 2479375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 21983109 - 21983337
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa-acctagat 108  Q
    |||||| || |||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||||| ||    
T  21983109 aaaatcacaccaatgaaaaacaatgatgtatggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtatctccaagcaacaacaacaaactccagacctaaat 21983208  T
Q  109 ctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatg-aacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||   ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21983209 ctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaatagagataagcaacgaaagaaaaggaacaaatgcaccgagattgttgacccagttcggtcca 21983308  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21983309 atatgacctaatctgggggagagagcagc 21983337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 47263525 - 47263719
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  47263525 aacaaagatgcgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaaaacaaaaatagacctag-tct-agtgtagagcaacacc 47263622  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  47263623 acaagcataaac-aaagaataaagataagcaatgaaa-taagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatggg 47263719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44848937 - 44848728
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa---acctagatctaaatgtagagtaac 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||  ||||||| |||    
T  44848937 aacaaggatgtgtggagcaaaggtagtgctaatcaatgtgcaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaaacagacctag-tctag-tgtagagcaac 44848840  T
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    ||||||||||||  ||||  || |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  44848839 accacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaag-gaacatacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctg 44848742  T
Q  223 ggaaagagagcagc 236  Q
    ||  ||||||||||    
T  44848741 ggggagagagcagc 44848728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 18413487 - 18413681
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  18413487 aacaaagatgtgaggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 18413584  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||| |  |||| |||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  18413585 cacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaagaaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg 18413681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5817545 - 5817325
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa-----c 102  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |  ||| |||||||||||| ||||||     |    
T  5817545 acaaaatcacatcaataaa--acaaagatgtgtgaagcaaagtaagtattaatcaatggacaaagtagcatcaaacaacaacaacaacaacaaaatagac 5817448  T
Q  103 ctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagattgttgacccagttc 201  Q
     ||  ||  | ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  5817447 ataagtcctagtgtagaacaacaccacaagcataatcaacacaataatgataagcaatgtaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttaactcagttc 5817348  T
Q  202 ggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  5817347 ggtccaatatgacctactctggg 5817325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 18408610 - 18408816
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||| | ||||||| |||||    
T  18408610 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccacgcaacaacaacaaaaacagccgtag-tct-agtgtagagcaacac 18408707  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||| || |  |||| |||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  18408708 cacaaacaaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaagaaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg 18408804  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  18408805 ggagagagcagc 18408816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 21645852 - 21646059
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  21645852 aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 21645949  T
Q  127 cacaagcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    |||||| | ||| ||||||||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||     
T  21645950 cacaag-agaatacaaaacaaacaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatcta 21646045  T
Q  223 ggaaagagagcagc 236  Q
    || |||||||||||    
T  21646046 gggaagagagcagc 21646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28617480 - 28617269
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacaaacctagatctaaatgtaga-gtaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |  |||| ||||| |||||  ||| | |||||  ||| |  ||| | | |||    
T  28617480 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtagcctcaagaaacaagaacaacaaaatagacctaagtcttagagtaaaagcaac 28617381  T
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||  || |||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28617380 accacaagcatattcaaagcaacaaagataagcaagaaaggaagaaaacaaacacaccaatattgtttacccagttcggtccaatatgacctactctggg 28617281  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  28617280 ggagagagcagc 28617269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 21639654 - 21639861
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||    
T  21639654 aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagccctag-tct-agtgtagagcaacac 21639751  T
Q  127 cacaagcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    |||||| | ||| |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  21639752 cacaag-agaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg 21639847  T
Q  223 ggaaagagagcagc 236  Q
    ||  ||||||||||    
T  21639848 ggggagagagcagc 21639861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22270210 - 22270105
Alignment:
Q  119 agtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaga-ttgttgacccagttcggtctaatatgaccta 217  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  22270210 agtaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagagatgttcacccagttcggtccaacttgaccta 22270111  T
Q  218 atctgg 223  Q
     |||||    
T  22270110 ctctgg 22270105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 3047070 - 3047287
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  3047070 aattcggacaaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtgataatcaatgagtaaagtgtcctcaagcaacaacaacaataacaa 3047168  T
Q  101 acctagatctaaa------tgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaa-tgaacaaacacaccaagattgttga 193  Q
    |  ||| ||||||      |||| || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| || || | ||||||   ||||||||||||||||| | | |    
T  3047169 a-atagttctaaaactgtgtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaatcaa-caagat-aataaagcaagaaagaaaacaaacacaccaagatcg-taa 3047264  T
Q  194 cccagttcggtctaatatgacct 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  3047265 cccagttcggtccaatatgacct 3047287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30814634 - 30814567
Alignment:
Q  157 caatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  30814634 caatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatggg 30814567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27348003 - 27347948
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  27348003 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 27347948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 41317417 - 41317471
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  41317417 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 41317471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1533696 - 1533490
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   |||  || |||||||||||||||||||| ||  || || ||| | ||||||| |||||    
T  1533696 aacaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaagtttccaagcaacaacaacaaaaccagccccag-tct-agtgtagagcaacac 1533599  T
Q  127 cacaagcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    |||||  | ||| |||| |||  || |||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  1533598 cacaaagagaatacaaagcaaacaatataagcaa-gaaagaaa-gaacaaacacaccaataagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg 1533502  T
Q  223 ggaaagagagca 234  Q
    ||  ||||||||    
T  1533501 ggggagagagca 1533490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 2648006 - 2647962
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagc 45  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  2648006 aattcagacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagc 2647962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48489617 - 48489562
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  48489617 gaacaaacacaccaaagattgtttacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 48489562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 2759183 - 2759241
Alignment:
Q  174 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagaga 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  2759183 aaacacaccaatgattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagaga 2759241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935507
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 2935507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Original strand, 7464519 - 7464569
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaat-atgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  7464519 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggaagagagcagc 7464569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027244
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 9027244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 12097850 - 12097904
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  12097850 aacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctggg 12097904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 14069817 - 14069867
Alignment:
Q  172 acaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  14069817 acaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatct 14069867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 14379845 - 14379895
Alignment:
Q  172 acaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  14379845 acaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatct 14379895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108305
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 22108305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137316
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 22137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155961
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 31155961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550065
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 40550065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552343
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 40552343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 41648994 - 41649048
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  41648994 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttggg 41649048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43864430 - 43864368
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaag-attgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagaga 231  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||    
T  43864430 gaacaaacacaccatctattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggagagaga 43864368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26417502 - 26417446
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaaga--ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  26417502 gaacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaatttgacctaacctggg 26417446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10077444 - 10077208
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10077444 aattcggacaaaatcacactaatgaatagcgaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacag 10077345  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10077344 acctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccaatt 10077245  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10077244 cggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 10077208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 31979331 - 31979567
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31979331 aattcggacaaaatcacaccactaaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacag 31979430  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979431 acctaaatctaagtgtagagcaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaatagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 31979530  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  31979531 cggtccaatatgacataatctgggggagagagcagcc 31979567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Original strand, 18232670 - 18232896
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18232670 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 18232769  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |    
T  18232770 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcgatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgactcaaatcggtcca 18232869  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18232870 atatgacctaatctgggggagagagca 18232896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5017727 - 5017515
Alignment:
Q  25 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaac----aacaaaaacaaacctagatctaaatgtagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5017727 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaacagacctagatctaagtgtagag 5017628  T
Q  121 taacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatc 220  Q
     ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5017627 caacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatc 5017529  T
Q  221 tgggaaagagagca 234  Q
    | ||  ||||||||    
T  5017528 taggggagagagca 5017515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 22963550 - 22963753
Alignment:
Q  34 gatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaag 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22963550 gatgtgtggagctaaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaag 22963649  T
Q  133 cataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagag 232  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  22963650 cataatcaaagcaatagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggg-gagagag 22963748  T
Q  233 cagcc 237  Q
    |||||    
T  22963749 cagcc 22963753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23824843 - 23824640
Alignment:
Q  34 gatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaag 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23824843 gatgtgtggagctaaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaag 23824744  T
Q  133 cataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagag 232  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  23824743 cataatcaaagcaatagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggg-gagagag 23824645  T
Q  233 cagcc 237  Q
    |||||    
T  23824644 cagcc 23824640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 31936414 - 31936640
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagat 108  Q
    |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  31936414 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-cagaccttaat 31936512  T
Q  109 ctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaa 208  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31936513 caaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagataggaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaa 31936612  T
Q  209 tatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31936613 tatgacctagtctgggagagagagcagc 31936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5757728 - 5757522
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  5757728 aacaaagaagtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagaccta-atct-agtgtagagcaacacc 5757631  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5757630 acaagcataaac-aaagaacaaagataagcaatgaaag-aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 5757533  T
Q  226 aagagagcagc 236  Q
     ||||||||||    
T  5757532 gagagagcagc 5757522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 4629780 - 4630007
Alignment:
Q  2 attcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||         |||||||||     
T  4629780 attcggacaaaatcacaccaatgaataataaagatgtgtggagtaaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtctccaa---------acaaaaacag 4629870  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacaca-ccaagattgttgacccagt 199  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  4629871 acctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaagattgttgactcagt 4629970  T
Q  200 tcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4629971 tcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagc 4630007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21801627 - 21801400
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-ca 99  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21801627 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggag--aaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaatca 21801530  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagat-----tgttga 193  Q
     ||||| |||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||     ||||||    
T  21801529 gacctaaatctaagtgtagaacaataccacaatcataatcaaagcaataaagataagtaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagataaaagtgttga 21801430  T
Q  194 cccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21801429 -ccagttcagtccaatatgacctaatctggg 21801400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31086734 - 31086519
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    |||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |    
T  31086734 acaaaatcacaccaatgaagaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaacaaaaacagacataaa 31086635  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| ||||||| |||| |||           |||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31086634 tctaagtgtagagcaacatcac-----------aaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcagtcca 31086546  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  31086545 atatgatctaatctaggggagagagca 31086519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 21355883 - 21356089
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  21355883 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaacacc 21355980  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    |||||||| ||  ||| || |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  21355981 acaagcat-atacaaagaacaaagataagcaatgaaag-aagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag 21356078  T
Q  226 aagagagcagc 236  Q
     ||||||||||    
T  21356079 gagagagcagc 21356089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5572875 - 5572737
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  5572875 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacagcaaaaacag 5572776  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatc 139  Q
    || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5572775 acataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatc 5572737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 22708863 - 22709071
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  22708863 aacaaagatgtgtagtgcaaaggggagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatct-aatgtagagcaacac 22708961  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||  ||  |||| |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  22708962 cacaagtgtatccaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaaattgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctggg 22709059  T
Q  225 aaagagagcagc 236  Q
      ||||||||||    
T  22709060 ggagagagcagc 22709071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5572382 - 5572284
Alignment:
Q  139 caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  5572382 caaagcaataaatataagcagtgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagcc 5572284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24436245 - 24436014
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||| ||    
T  24436245 aattcggacaaaataacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaagggaaatggtaatcaatagataaagtgtctaca---aacaacaacaaaaataa 24436149  T
Q  101 -acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaa-tgaacaaacacaccaagattgttgacccag 198  Q
     | ||| |||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| ||| |||||| || || | ||||||   |||||||||||||||| || | ||||||    
T  24436148 gatctaaatctaagtgtagag--acacaacaagcataaacaaagcaacaaagat-aagaaagcaagaaagaaaacaaacacaccaaga-tggtaacccag 24436053  T
Q  199 ttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  24436052 ttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagcc 24436014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26258252 - 26258181
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaac 98  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26258252 aacaaagatgtatggagcaaaaggaagtggtaaccaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaac 26258181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5675023 - 5674814
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatggataaagtgtctcc-aagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||  || ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||| ||||    
T  5675023 aacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaagtttcccaagcaacaacaacaaaaccagccctag-tctag-tgtagagcaaca 5674926  T
Q  126 ccacaagcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa---gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||  | ||| |||| |||  || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  5674925 ccacaaagagaatacaaagcaaacaatataagcaa-gaaagaaa-gaacaaacacaccaaagagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatct 5674829  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  5674828 gggggagagagcagc 5674814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 27165545 - 27165616
Alignment:
Q  26 ataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatg-gataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27165545 ataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtcgtaatcaatgagcaaaagtagtct-caagcaacaacaacaaaa 27165616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16569207 - 16569154
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  16569207 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgg 16569154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33336063 - 33335974
Alignment:
Q  149 aagataaacaatgaaa-gaaatgaacaaacac--accaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33336063 aagataaaccatgaaaagaaaagaacaaacaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtgacctaatctgggggagagagcagc 33335974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195565
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 12195565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754759
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 29754759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309120
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 33309120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 9183015 - 9183067
Alignment:
Q  172 acaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  9183015 acaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgg 9183067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 27165635 - 27165717
Alignment:
Q  135 taatcaaaacaataaagataaacaatgaaag-aaatgaacaaacacacc-aagattgttgacccagttcggtctaatatgaccta 217  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  27165635 taatcaaagcaa-aaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaccacaccaaagattgtttacccag-tcggtccaatatgaccta 27165717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 775490 - 775713
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  775490 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaaccaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacag 775589  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  775590 acctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaagattgttgacccaatt 775689  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  775690 cggtccaatatgacctaatctggg 775713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16124790 - 16124559
Alignment:
Q  7 gacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16124790 gacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaaatgtgtccaagcaacaacaacaaaaacagacctag 16124691  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaag-aaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtc 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16124690 atctaaatgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagctatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttgactcagttcggtc 16124591  T
Q  206 taatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16124590 caatatgacctaatctgggggagagagcagcc 16124559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 19072744 - 19072981
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-ca 99  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19072744 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatatgtggaacaaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaacaaaaatca 19072843  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagattgttgacccag 198  Q
     ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19072844 gacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccag 19072943  T
Q  199 ttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19072944 ttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 19072981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 19120634 - 19120871
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-ca 99  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19120634 aattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatatgtggaacaaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaacaaaaatca 19120733  T
Q  100 aacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aagattgttgacccag 198  Q
     ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19120734 gacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccag 19120833  T
Q  199 ttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19120834 ttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 19120871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 13598219 - 13598452
Alignment:
Q  6 agacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaac---aacaacaaaaacaaac 102  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||   ||||||||||||| ||    
T  13598219 agacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatagttaa-gtgtctccaaacaacaacaacaacaaaaacagac 13598317  T
Q  103 ctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcg 202  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13598318 ctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcg 13598417  T
Q  203 gtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13598418 gtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 13598452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 29651637 - 29651864
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagat 108  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||    
T  29651637 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctataatcaacaacaacaaaaaacagacttagat 29651736  T
Q  109 ctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaa 208  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  29651737 ctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatttttgacccagttcggtccaa 29651836  T
Q  209 tatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29651837 tatgacctaatctgggggagagagcagc 29651864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47099083 - 47098867
Alignment:
Q  20 caataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtaga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  47099083 caatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagtaacaacaacaaaa-cagacctaaatctaagtgtaga 47098985  T
Q  120 gtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaat 219  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  47098984 gcaacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaat 47098885  T
Q  220 ctgggaaagagagcagcc 237  Q
    |||||  |||||||||||    
T  47098884 ctgggggagagagcagcc 47098867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47704208 - 47703980
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa-acctaga 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |    
T  47704208 aaaatcacatcaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcagcaacaacaaaaaatagacctaaa 47704109  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47704108 tctaagtgtagagcaacaccacaagtttaatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaaaaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcca 47704009  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47704008 atatgacctaatctgggggagagagcagc 47703980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27104640 - 27104416
Alignment:
Q  9 caaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||| |    
T  27104640 caaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa----aacagacctaaa 27104545  T
Q  108 tctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27104544 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaataaaggaacaaacacaccaagattgttgacacagttcggtcca 27104445  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  27104444 atataacctaatctgggggagagagcagc 27104416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47103100 - 47102884
Alignment:
Q  20 caataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtaga 119  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  47103100 caatgaataataaagacgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatagataaagtgtctcaaagcaacaacaacaaaa-cagacctaaatctaagtgtaga 47103002  T
Q  120 gtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaat 219  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47103001 gcaacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaat 47102902  T
Q  220 ctgggaaagagagcagcc 237  Q
    || ||  |||||||||||    
T  47102901 ctaggggagagagcagcc 47102884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26645166 - 26644941
Alignment:
Q  11 aaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatct 110  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  26645166 aaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctttaagcaacaacaacaaaagcagacctaga-ct 26645068  T
Q  111 aaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaa 208  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26645067 tagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 26644969  T
Q  209 tatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26644968 tatgacctaatctgggggagagagcagc 26644941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 9476087 - 9476314
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaag-gaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctag 106  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||     
T  9476087 acaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtagagcaaaatgaagtagtaattaatggataaagtgtctccaagcaacaataacaaaa-cagacataa 9476185  T
Q  107 atctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtct 206  Q
    || ||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9476186 atataagtgtagaa-aacatcacaagcataatcaaagcaaaaaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcc 9476284  T
Q  207 aatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9476285 aatatgacctaatctaggggagagagcagc 9476314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21536839 - 21536613
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |    
T  21536839 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaatcaacaacaacaaaaatagacctaga-c 21536741  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||  |||| | | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |    
T  21536740 ttactgtagagcaacaccacaagcatagacaaagc-acaaagataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtaaa 21536642  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||    
T  21536641 aaatgacctaatctgggggagagagcagc 21536613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40816993 - 40816844
Alignment:
Q  20 caataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca-aaaacaaacctagatctaaatgtag 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  40816993 caatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtag 40816894  T
Q  119 agtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaa 168  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  40816893 agcaacaccacgagcataatcaaagcaataaagataagtaatgaaagaaa 40816844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Original strand, 37069613 - 37069821
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaac--aacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  || || ||||||| || |||| || ||||||||| ||||    
T  37069613 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaaaaaaaaaaaacagacttaga-cttaatgtagagcaaca 37069711  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
    |||||||||||| |||| | | |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37069712 ccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaacgaaataaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg 37069810  T
Q  224 gaaagagagca 234  Q
    |  ||||||||    
T  37069811 gggagagagca 37069821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 3281537 - 3281761
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |    
T  3281537 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtg--gagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaagacataga-c 3281633  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtcta 207  Q
    |   ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| |    
T  3281634 tttgtgtagagcaacaccacaagaataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaaagattattgacccagttcggtcca 3281732  T
Q  208 atatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3281733 atatgacctaatctgggggagagagcagc 3281761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 32889283 - 32889480
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaa-gtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||    
T  32889283 aacaaagatgtgtggagcaaaagaaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaaaa-cagatctaaatctaagtgtagagcaacac 32889381  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaa-gaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32889382 cacaagtataaccaaagcaataaagataagcaatgaaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctggg 32889480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50521382 - 50521165
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaa-gt-gtctccaagcaacaacaacaaaaac 98  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||||||||||      
T  50521382 aattcggacaaaatcacatcaataaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgagtaaaagtagtctcaaa-caacaacaacaaaat- 50521285  T
Q  99 aaacctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aaga-ttgttgaccc 196  Q
    | |||||  ||  | ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||    
T  50521284 agacctaagtcctagtgtagaacaacaccacaaacataatcaaagcaataaagagaaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagatttggtaaccc 50521185  T
Q  197 agttcggtctaatatgacct 216  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  50521184 agttcggttcaatatgacct 50521165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9024109 - 9023957
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    |||| |||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||  |||||     
T  9024109 aatttagacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagaagtgtggagcagagaaagtggtaatcaatggataaagtagccccaagcaataacaac--aaacat 9024012  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataa 155  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9024011 acctaaatctaagtgtatagcaacaccacaagcataatcaatgcaataaagataa 9023957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17345771 - 17345574
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaa-gtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||  |  |||||||||||||||||   || ||||   || | ||||||  |||||    
T  17345771 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtagtaatcaatgagtaaaagtagcctcaagcaacaacaacaaagt-aatcctaagacttagtgtagaacaacac 17345673  T
Q  127 cacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacaca-ccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17345672 cataagcataatcaaagccataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaaaacataaaagattattaacccagttcggtctaatatgacctactctggg 17345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13604876 - 13604667
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca-aaaacaaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||| || ||| ||||  | ||||| ||||    
T  13604876 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaaagcaaaacagacatag-tctag-tatagagcaaca 13604779  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
     ||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  13604778 tcacaagcatatacaaagcaataaagataagtaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgg 13604680  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  13604679 gggagagagcagc 13604667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19361688 - 19361476
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa-----cctagatctaaatgtagagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||     ||||| ||| | |||||||     
T  19361688 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaaacagccctag-tct-agtgtagagc 19361591  T
Q  122 aacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaat 219  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||  ||||||| |||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19361590 aacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagtc-aatatgacctaat 19361493  T
Q  220 ctgggaaagagagcagc 236  Q
     ||||  ||||||||||    
T  19361492 atgggggagagagcagc 19361476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19380328 - 19380116
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa-----cctagatctaaatgtagagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||     ||||| ||| | |||||||     
T  19380328 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaaacagccctag-tct-agtgtagagc 19380231  T
Q  122 aacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaat 219  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||  ||||||| |||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19380230 aacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagtc-aatatgacctaat 19380133  T
Q  220 ctgggaaagagagcagc 236  Q
     ||||  ||||||||||    
T  19380132 atgggggagagagcagc 19380116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19359098 - 19358887
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa----acaaacctagatctaaatgtagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    |||  ||||| ||| | ||||||| |    
T  19359098 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaatacagccctag-tct-agtgtagagca 19359001  T
Q  123 acaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatc 220  Q
    |||||||||||| |  |||| |||  ||||||| |||  |||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  19359000 acaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaacacatcaaaagattgttgacccagttcagtc-aatatgacctaata 19358903  T
Q  221 tgggaaagagagcagc 236  Q
    ||||  ||||||||||    
T  19358902 tgggggagagagcagc 19358887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 102
Target Start/End: Original strand, 22819270 - 22819344
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  22819270 aacaaagatgtgtggagcaaagaaaatggtaatcaatggataaagtgtccttaagcaacaacaacaacaacaaac 22819344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24203020 - 24202813
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagc-aacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| | || | ||||||| ||||    
T  24203020 aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-aact-agtgtagagcaaca 24202924  T
Q  126 ccacaagcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||| | ||| |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  24202923 ccacaag-agaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct 24202828  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  24202827 gggggagagagcagc 24202813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 28265537 - 28265591
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  28265537 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 28265591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 231
Target Start/End: Original strand, 3847104 - 3847165
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagaga 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  3847104 aacaaacacaccaaagattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagaga 3847165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 28220210 - 28220263
Alignment:
Q  172 acaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  28220210 acaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 28220263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3157051 - 3156996
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  3157051 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatggg 3156996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 13137959 - 13138006
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgaccta 217  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13137959 aacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaatatgaccta 13138006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44455346 - 44455291
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44455346 gaacaaacacaccaaagatcgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctggg 44455291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 834150 - 834204
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  834150 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctggg 834204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459469
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 9459469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463296
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 9463296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 12302507 - 12302557
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  12302507 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagcc 12302557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15823825 - 15823775
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  15823825 ttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 15823775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226396
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16226396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786068
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 23786068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 45644337 - 45644391
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  45644337 aacaagcacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 45644391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 28223405 - 28223458
Alignment:
Q  172 acaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  28223405 acaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatggg 28223458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31659420 - 31659371
Alignment:
Q  174 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  31659420 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctg 31659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41361100 - 41361052
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaagat--tgttgacccagttcggtctaatatgaccta 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41361100 aacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatatgaccta 41361052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 4552620 - 4552672
Alignment:
Q  171 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctg 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  4552620 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctg 4552672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 205
Target Start/End: Original strand, 30476428 - 30476464
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtc 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30476428 gaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtc 30476464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 37559849 - 37559901
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  37559849 gaacaaacacaccaaagattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatct 37559901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 2334 - 2546
Alignment:
Q  25 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||    
T  2334 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgttgatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatctaagtgtagaacaac 2433  T
Q  125 accacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2434 accacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctggg 2533  T
Q  225 aaagagagcagcc 237  Q
      ||| |||||||    
T  2534 ggagacagcagcc 2546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 5504 - 5737
Alignment:
Q  6 agacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaac---aacaacaaaaacaaac 102  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||   ||||||||||||| ||    
T  5504 agacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatagttaa-gtgtctccaaacaacaacaacaacaaaaacagac 5602  T
Q  103 ctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcg 202  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603 ctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcg 5702  T
Q  203 gtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5703 gtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 5737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 133533 - 133324
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca-aaaacaaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||| || ||| ||||  | ||||| ||||    
T  133533 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaaagcaaaacagacatag-tctag-tatagagcaaca 133436  T
Q  126 ccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgg 223  Q
     ||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  133435 tcacaagcatatacaaagcaataaagataagtaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgg 133337  T
Q  224 gaaagagagcagc 236  Q
    |  ||||||||||    
T  133336 gggagagagcagc 133324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 17084 - 17314
Alignment:
Q  1 aattcagacaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||     
T  17084 aattcggacaaaatcacatgaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtctccaa---acaacaacaaaaacat 17180  T
Q  101 acctagatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagtt 200  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17181 acctaaatctaagtatagagcaacaccacaagcataattaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggagcaaacacaccaaaattgttgacccagtt 17280  T
Q  201 cggtctaatatgacctaatctgggaaagagagca 234  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17281 cggttcaatatgacctaatatgggaaagagagca 17314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 10552 - 10782
Alignment:
Q  8 acaaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaag-gaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaaccta 105  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10552 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaagaagtggtaatcgatagataaagttactccaagcaacaacaacaaaaaacagaccta 10651  T
Q  106 gatctaaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtc 205  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10652 aatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattattgacccagttcggtc 10751  T
Q  206 taatatgacctaatctgggaaagagagcagc 236  Q
     ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10752 caatatgacctaatttgggggagagagcagc 10782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 85512 - 85733
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatc 109  Q
    |||||| || |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  85512 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtagagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa-taaaacagacctagatc 85610  T
Q  110 taaatgtagagtaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtctaat 209  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  85611 taagtgtagagcaacatcacaagcataaccaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaagaacaaacacatctagattgttgacccagttcagtccaat 85709  T
Q  210 atgacctaatctgggaaagagagc 233  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  85710 atgacctaatctgggggagagagc 85733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37084 - 36876
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||  ||||||    
T  37084 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaga-cttggtgtagaccaacacc 36986  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    ||||| |||| |||| | | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  36985 acaagtataaacaaagc-acaaagataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggg 36887  T
Q  226 aagagagcagc 236  Q
    |||||||||||    
T  36886 aagagagcagc 36876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44211 - 44005
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  44211 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagaccta-atct-agtgtagagcaacacc 44114  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||     
T  44113 acaagcataaac-aaagaacaaagataagcaatgaaag-aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggg 44016  T
Q  226 aagagagcagc 236  Q
     ||||||||||    
T  44015 gagagagcagc 44005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8670 - 8463
Alignment:
Q  30 caaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  8670 caaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaaaaaacagacctag-tctag-tgtagagcaacacc 8573  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  8572 acaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaagaaga-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 8474  T
Q  226 aagagagcagc 236  Q
     ||||||||||    
T  8473 gagagagcagc 8463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22353
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 22353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24628
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 24628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 45100 - 45306
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctagatctaaatgtagagtaacacc 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||    
T  45100 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagaccaag-tct-agtgtagagcaacacc 45197  T
Q  128 acaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggga 225  Q
    |||| ||| ||  ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  45198 acaaacat-atacaaagaacaaagataagcaatgaaag-aatgaacaaacacaccaaaagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggg 45295  T
Q  226 aagagagcagc 236  Q
     ||||||||||    
T  45296 gagagagcagc 45306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Original strand, 1253 - 1332
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaacctaga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1253 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaga 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18204 - 17996
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagatctaaatgtagagtaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || | ||||||| ||||    
T  18204 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaccagccctaga-ct-agtgtagagcaaca 18107  T
Q  126 ccacaagcataat-caaaacaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacacc---aagattgttgacccagttcggtctaatatgacctaatct 221  Q
    ||||||| | ||| |||| |||  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  18106 ccacaag-agaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct 18011  T
Q  222 gggaaagagagcagc 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  18010 gggggagagagcagc 17996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24297 - 24226
Alignment:
Q  28 aacaaagatgtgtggagcaaa-ggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaac 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24297 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaac 24226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 29760 - 29670
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    |||||| || |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||| |||||||||||| |||||    
T  29760 aaaatcacaccaatgaaaaacaaaaatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtatcctcaaccaacaacaacaacaacaa 29670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Original strand, 43084 - 43174
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaa 100  Q
    |||||| || |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||| |||||||||||| |||||    
T  43084 aaaatcacaccaatgaaaaacaaaaatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtatcctcaaccaacaacaacaacaacaa 43174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 96
Target Start/End: Original strand, 23357 - 23443
Alignment:
Q  10 aaaatcgcatcaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 96  Q
    |||||| || ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||  ||||||| ||||||||||    
T  23357 aaaatcacaccaataaaaagtaaagatgtgttgagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaaatatcctcaagcaataacaacaaaa 23443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 20397 - 20452
Alignment:
Q  170 gaacaaacacaccaaga-ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctggg 224  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  20397 gaacaaacacaccaaaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 20452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 279
Alignment:
Q  187 ttgttgacccagttcggtctaatatgacctaatctgggaaagagagcagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University