View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17998_high_1 (Length: 843)

Name: NF17998_high_1
Description: NF17998
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17998_high_1
NF17998_high_1
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (24-821)||(43270343-43271130)
chr8 (24-821)||(17699375-17700173)
chr8 (24-821)||(20824189-20824992)
chr8 (24-595)||(2170233-2170803)
chr8 (24-821)||(13878934-13879734)
chr8 (24-821)||(25090280-25091080)
chr8 (24-301)||(37434025-37434302)
chr8 (433-819)||(42177004-42177386)
chr8 (24-298)||(13200016-13200290)
chr8 (190-438)||(42177422-42177670)
chr8 (24-817)||(8299696-8300492)
chr8 (30-778)||(9922500-9923251)
chr8 (556-817)||(41664819-41665080)
chr8 (537-817)||(7924795-7925075)
chr8 (604-808)||(172499-172703)
chr8 (552-817)||(32266986-32267243)
chr8 (24-471)||(13396281-13396729)
chr8 (24-202)||(2529779-2529957)
chr8 (24-156)||(42177680-42177812)
chr8 (24-294)||(7924279-7924549)
chr8 (24-234)||(32266457-32266667)
chr8 (645-721)||(38046875-38046951)
chr8 (362-448)||(13200296-13200383)
chr8 (749-821)||(37434406-37434478)
chr8 (24-288)||(41665352-41665616)
chr8 (30-96)||(5181569-5181635)
chr8 (639-799)||(5585200-5585360)
chr8 (659-778)||(36492912-36493031)
chr8 (24-82)||(20496977-20497035)
chr8 (698-778)||(8902397-8902477)
chr8 (30-78)||(34137156-34137204)
chr8 (634-694)||(36157660-36157720)
chr8 (636-742)||(4310368-4310474)
chr8 (653-694)||(17659356-17659397)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (24-821)||(14439646-14440437)
chr2 (24-821)||(12645429-12646214)
chr2 (24-307)||(10999915-11000197)
chr2 (24-615)||(40176562-40177155)
chr2 (39-821)||(28252628-28253413)
chr2 (570-821)||(33515654-33515905)
chr2 (58-471)||(38604178-38604587)
chr2 (30-471)||(41206915-41207357)
chr2 (30-246)||(15917553-15917769)
chr2 (39-285)||(17764948-17765194)
chr2 (653-782)||(37445618-37445747)
chr2 (36-294)||(4552074-4552332)
chr2 (24-108)||(33515947-33516031)
chr2 (228-333)||(18154547-18154652)
chr2 (649-694)||(1380603-1380648)
chr2 (634-694)||(15018183-15018243)
chr2 (634-694)||(22725013-22725073)
chr2 (659-778)||(26146746-26146865)
chr2 (407-471)||(17764757-17764822)
chr2 (641-694)||(35488350-35488403)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (24-821)||(10576697-10577496)
chr6 (24-821)||(20882480-20883280)
chr6 (32-821)||(17605781-17606573)
chr6 (24-821)||(21629569-21630356)
chr6 (24-656)||(17573268-17573902)
chr6 (24-388)||(11462306-11462664)
chr6 (39-778)||(14372481-14373223)
chr6 (24-243)||(17579109-17579328)
chr6 (30-619)||(15958462-15959054)
chr6 (573-817)||(2554051-2554295)
chr6 (518-821)||(13938109-13938411)
chr6 (651-815)||(17577171-17577335)
chr6 (39-778)||(24766904-24767656)
chr6 (602-778)||(18682064-18682240)
chr6 (36-238)||(2553542-2553744)
chr6 (140-438)||(13937709-13938007)
chr6 (396-675)||(33185700-33185982)
chr6 (63-280)||(18651225-18651442)
chr6 (24-244)||(12734018-12734238)
chr6 (699-818)||(15956442-15956560)
chr6 (634-778)||(32186189-32186333)
chr6 (648-715)||(10922073-10922140)
chr6 (653-694)||(5085600-5085641)
chr6 (634-694)||(17078764-17078824)
chr6 (634-694)||(18051023-18051083)
chr6 (344-403)||(21168412-21168471)
chr6 (624-739)||(26514220-26514335)
chr6 (140-273)||(18682503-18682636)
chr6 (741-802)||(502998-503059)
chr6 (653-694)||(503106-503147)
chr6 (264-301)||(5041648-5041685)
chr6 (653-694)||(8264748-8264789)
chr6 (653-694)||(11060436-11060477)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (24-783)||(37254651-37255413)
chr7 (290-821)||(31422763-31423295)
chr7 (28-624)||(25619356-25619961)
chr7 (71-330)||(18532568-18532827)
chr7 (24-817)||(4937579-4938375)
chr7 (30-817)||(17720534-17721324)
chr7 (554-817)||(11276699-11276962)
chr7 (36-808)||(47876888-47877662)
chr7 (552-817)||(29968398-29968663)
chr7 (582-817)||(234889-235124)
chr7 (24-471)||(11277051-11277499)
chr7 (648-817)||(39931047-39931216)
chr7 (24-294)||(235414-235686)
chr7 (24-75)||(18530403-18530454)
chr7 (648-817)||(36364036-36364205)
chr7 (24-280)||(29967868-29968124)
chr7 (24-294)||(37919437-37919707)
chr7 (653-778)||(17056054-17056179)
chr7 (24-136)||(31177440-31177552)
chr7 (750-817)||(18768030-18768097)
chr7 (344-462)||(29968187-29968306)
chr7 (344-465)||(37919757-37919879)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (29-821)||(8299629-8300424)
chr5 (24-821)||(25856886-25857671)
chr5 (29-670)||(10776662-10777326)
chr5 (24-821)||(27795376-27796177)
chr5 (29-384)||(27766940-27767295)
chr5 (24-349)||(33385296-33385621)
chr5 (25-302)||(18359061-18359337)
chr5 (39-821)||(42928039-42928824)
chr5 (140-821)||(33169667-33170351)
chr5 (36-817)||(30731765-30732549)
chr5 (156-778)||(31641537-31642161)
chr5 (24-724)||(12825092-12825795)
chr5 (552-817)||(23238807-23239072)
chr5 (537-817)||(42514129-42514409)
chr5 (520-783)||(28535160-28535423)
chr5 (667-821)||(10780740-10780894)
chr5 (24-778)||(35983281-35984038)
chr5 (552-817)||(27116624-27116889)
chr5 (582-821)||(27165412-27165636)
chr5 (24-294)||(23238277-23238547)
chr5 (198-438)||(24407995-24408235)
chr5 (24-329)||(18089703-18090008)
chr5 (24-280)||(28535666-28535922)
chr5 (24-238)||(8227919-8228133)
chr5 (24-294)||(42513613-42513883)
chr5 (152-298)||(26072913-26073059)
chr5 (24-185)||(12820035-12820196)
chr5 (31-292)||(27165931-27166192)
chr5 (39-112)||(19255282-19255355)
chr5 (653-802)||(22094716-22094865)
chr5 (24-238)||(27117194-27117408)
chr5 (24-82)||(3418676-3418734)
chr5 (750-817)||(38358089-38358156)
chr5 (659-778)||(41590627-41590746)
chr5 (634-739)||(15862206-15862311)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (24-821)||(19890571-19891370)
chr3 (24-821)||(48569486-48570286)
chr3 (401-821)||(12341702-12342124)
chr3 (24-438)||(29523578-29523992)
chr3 (24-371)||(33496440-33496787)
chr3 (24-372)||(11203712-11204061)
chr3 (24-354)||(12342143-12342472)
chr3 (24-312)||(35214334-35214618)
chr3 (24-817)||(34332266-34333062)
chr3 (24-817)||(2364170-2364966)
chr3 (140-821)||(962610-963294)
chr3 (32-657)||(17097488-17098115)
chr3 (405-697)||(15312855-15313151)
chr3 (24-240)||(36801106-36801322)
chr3 (228-821)||(3140949-3141544)
chr3 (537-807)||(10323032-10323302)
chr3 (24-233)||(7031055-7031264)
chr3 (537-817)||(19919680-19919960)
chr3 (500-817)||(16179317-16179636)
chr3 (433-610)||(29523379-29523558)
chr3 (30-292)||(26770968-26771230)
chr3 (536-804)||(20531515-20531782)
chr3 (24-294)||(40930505-40930775)
chr3 (36-294)||(7312681-7312939)
chr3 (140-333)||(2755851-2756044)
chr3 (24-294)||(19920206-19920476)
chr3 (24-289)||(10323553-10323818)
chr3 (24-84)||(11310382-11310442)
chr3 (152-288)||(15312604-15312740)
chr3 (639-799)||(22734192-22734352)
chr3 (659-781)||(52250612-52250733)
chr3 (767-814)||(19652211-19652258)
chr3 (141-292)||(20532028-20532179)
chr3 (653-694)||(5342786-5342827)
chr3 (653-742)||(8130476-8130565)
chr3 (653-694)||(21740097-21740138)
chr3 (397-430)||(40415639-40415672)
chr3 (653-778)||(44888429-44888554)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (24-666)||(43388260-43388903)
chr1 (24-470)||(16917608-16918056)
chr1 (24-412)||(37191069-37191457)
chr1 (39-818)||(47622527-47623307)
chr1 (24-802)||(6050496-6051277)
chr1 (24-698)||(35540942-35541619)
chr1 (24-668)||(11908705-11909352)
chr1 (24-294)||(51052373-51052643)
chr1 (24-108)||(51993891-51993975)
chr1 (204-457)||(2491285-2491539)
chr1 (653-778)||(22191272-22191397)
chr1 (706-817)||(35541612-35541723)
chr1 (681-778)||(33142703-33142800)
chr1 (736-802)||(25504460-25504526)
chr1 (653-778)||(21405362-21405487)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (24-821)||(54482606-54483406)
chr4 (24-821)||(48311988-48312787)
chr4 (138-821)||(55725153-55725819)
chr4 (24-673)||(2821629-2822284)
chr4 (24-301)||(12697706-12697983)
chr4 (24-325)||(8360993-8361294)
chr4 (24-342)||(20002611-20002936)
chr4 (345-778)||(11586688-11587124)
chr4 (156-372)||(45472608-45472824)
chr4 (36-821)||(19755169-19755960)
chr4 (36-821)||(19783846-19784637)
chr4 (24-817)||(23642042-23642838)
chr4 (411-775)||(5789585-5789952)
chr4 (537-807)||(47419213-47419483)
chr4 (585-817)||(23647700-23647932)
chr4 (552-817)||(1827991-1828256)
chr4 (140-821)||(46145684-46146370)
chr4 (552-808)||(15740645-15740900)
chr4 (24-151)||(4548339-4548466)
chr4 (30-294)||(7403812-7404076)
chr4 (39-280)||(1828531-1828772)
chr4 (24-294)||(13270868-13271138)
chr4 (24-220)||(47685946-47686142)
chr4 (30-471)||(15740120-15740562)
chr4 (24-289)||(47418697-47418962)
chr4 (612-692)||(19735311-19735391)
chr4 (396-475)||(48242642-48242722)
chr4 (653-802)||(8935599-8935748)
chr4 (30-89)||(11587380-11587439)
chr4 (24-82)||(159880-159938)
chr4 (636-694)||(42778746-42778804)
chr4 (653-694)||(23657822-23657863)
chr4 (228-291)||(19735727-19735790)
chr4 (744-802)||(19115052-19115110)
[»] scaffold1350 (1 HSPs)
scaffold1350 (585-821)||(1-237)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (24-817)||(105294-106090)
[»] scaffold0472 (3 HSPs)
scaffold0472 (540-817)||(3664-3941)
scaffold0472 (24-289)||(3145-3410)
scaffold0472 (344-471)||(3465-3593)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (24-289)||(11187-11452)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 636; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 636; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 43270343 - 43271130
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43270343 accatagaccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaacccgttacacaaaaccgagcttccacag 43270442  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43270443 atagaatctcacgttctaccaaatttgttttagtaggcaaacgatccttcaacagtcgccaagtaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 43270542  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcc---tgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43270543 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcaatatgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatatgatccggcaac 43270642  T
Q  321 cacaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgac 420  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43270643 cacaaccacctgtctgattctgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctccttccatacccataaacgacgac 43270742  T
Q  421 gccactgccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--c 518  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  43270743 gccactgccatgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgacagctaaatcatatagccgtctaaaacgc 43270842  T
Q  519 acacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccc 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43270843 acacacaacggaacactaccacaccaacagtctggccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccc 43270942  T
Q  619 caccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacct 718  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||    
T  43270943 caccctcgcctatcccatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaactccggccc---------------ccatccgccacaccatacct 43271027  T
Q  719 agccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaaca 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43271028 agccatcaacaccctacaccacaaaccacccatatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagggaaatgttaaactctctcaacctcctaaca 43271127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 17699375 - 17700173
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  17699375 accaaaggtcacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcctacatcccgatacacaaaatcgattttccacag 17699474  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||||||| || |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  17699475 atataatcccatgtgccaccaaatttgatatagtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgcca 17699574  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  17699575 aattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcatgtgatgtcaacaagtcatgaacaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcatccac 17699674  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    |||||||||| || || | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17699675 aaccacctgtctgtttctatttcctgcaaagagattgtcagta-taaatccctacactctactagcagttcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 17699773  T
Q  424 actgccacgcccccc-accatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--ac 520  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||| | |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||  ||    
T  17699774 actgccacgcccccccatcaacctccacccc-aacaaaaacatgttccgcaccgaaataattttattgacagttaaatcataaagccgcctaaaacgcac 17699872  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17699873 acacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 17699972  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  17699973 ccctcacctatcccatctctaatcctaactatctccctccaccgcgaagagcaactccggcccccatcctccaaaccaccatctgtcactccatacctag 17700072  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 820  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17700073 ccaagaacaccctactccacaaacctcccctatcaactaacagccgccaacaccatttccccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcctcacacc 17700172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 20824189 - 20824992
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  20824189 accagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacag 20824288  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20824289 ctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 20824388  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20824389 aattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcaccatgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccac 20824488  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||||||||  | || || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824489 atccacctgtcagtttctgattcctgcaaagtgactgtcagtaataaatccctacactctactaacaattcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 20824588  T
Q  424 actgccacgccccccacc-atc---ctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac- 518  Q
    ||| ||||||||||| || |||   ||||||||||||||| |||||||||  ||   |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||     
T  20824589 actaccacgccccccccccatctccctccacccccaacaaaaacatgttctgcattgtaataactttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacg 20824688  T
Q  519 -acacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcc 617  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20824689 cacacacaacggaacactaccacaccaacaatcacgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccagccctcc 20824788  T
Q  618 ccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacc 717  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20824789 ccaccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacaaagaacaactccggcccccatcctccaaaccaccatcctccacgccatacc 20824888  T
Q  718 tagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20824889 tagccaacaacaccctactccacaaacctcccctatcaactaacagcctccaacaccatttccccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcctaac 20824988  T
Q  818 accc 821  Q
    ||||    
T  20824989 accc 20824992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 595
Target Start/End: Original strand, 2170233 - 2170803
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaac--cgagcttccac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||    
T  2170233 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaccccgttacacaaaacaccgattttccac 2170332  T
Q  122 agatagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatgg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  2170333 agatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacggtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgc 2170432  T
Q  222 cagatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaacc 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2170433 cagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacggacagtataaccagtaatctgatccggcaacc 2170532  T
Q  322 acaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacg 421  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2170533 acaaccacatgtctgtttctgtttcctacaaagagactgttagtaataaatccctacactctactagcaattcctcctcccatacccataaacgacgacg 2170632  T
Q  422 ccactgccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--ca 519  Q
    |||||| ||||||||||     || || |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  ||    
T  2170633 ccactgtcacgcccccc-----cccccccccctaacaaaaacatgttccgcaccgtaattactttattgacagttaaatcataaagccgcctaaaacgca 2170727  T
Q  520 cacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaac 595  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  2170728 cacataacggaacactaccacaccaacaatctcgctaaaaatcggtatcgactctatcccccaccctcctcctaac 2170803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 13879734 - 13878934
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||  |    
T  13879734 accataggccacaaagcaccaaagaaaggacaagacaaaaacagatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccaacg 13879635  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||    |||||| | ||| || | ||| || ||    
T  13879634 gtaaaatgccacgatttgccaaattggctttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctatttgtgcca 13879535  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||   |||| | |||   ||||||    
T  13879534 gactaactccatactttgatgaatctgaggttgttcatgcgatgtcaataagtcatataccccacgaacagaatagccaccaatcgggtccaataaccac 13879435  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| || |  |     | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  13879434 acccatctatcagtaacggattcctgcaaagagactgttagtaataaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccacacccataaccggcgacgcc 13879335  T
Q  424 actgccacgc-cccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacac-- 520  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| ||||| || || ||||| | |      
T  13879334 actgccacgctcccccaccatcctccaccccgaacaagaacatgttcctcaccgtgattgatttatcgatagctaagtcataaagacgcctaaagcgctc 13879235  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||    
T  13879234 acacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatcagcttcatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaaccctctcca 13879135  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879134 ccctcgcctatcccatctctaatcttgactatctccctccaccacgaagaacaactctggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 13879035  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 820  Q
    ||| ||||||||||| ||| || ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13879034 ccaccaacaccctacgccataacccctctctatcaactaacaaccgccaacaccatttccctagcaaagcaatgttaaacttgctcaatctccgaacacc 13878935  T
Q  821 c 821  Q
    |    
T  13878934 c 13878934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 25090280 - 25091080
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| || ||| ||||  |    
T  25090280 accataggccacaaagcaccgaagaatggacaggacagaaacaaatgagacacattttcaacatgcccacatcccatgacacaaagcctagcctccatcg 25090379  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
      | ||| || || | || |||||| | ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||| ||| || ||||| ||  |    
T  25090380 gcaaaatgccgcgatttgtcaaattggctttagtaggtagtcgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttagaggtacctgtttgtgcta 25090479  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||  ||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| ||   |||| ||||||| ||||||    
T  25090480 gactaactccatattgtgatgaagatgagagtgttcatgtgatgtcaataagtcatataccccacgaacataatagccaccaatcggatccggtaaccac 25090579  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| ||||  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||  | ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  25090580 acccatctgtcagtatcagattcctgcaaagagactgttagtaataaagccctacactcctctaccaatttctcctcccacaccaataaacggcgacgcc 25090679  T
Q  424 actgccacgc-cccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacac-- 520  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||   | ||| ||| | || || ||||| | |      
T  25090680 actgccacgctcccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccgtgattgatttattggtggttaagtcaaaaagtcgcctaaagcgctc 25090779  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||  |||    
T  25090780 acacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatctgctccatcccccaccctcctcctaacacaatccgtaaaccaaccctttcca 25090879  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25090880 ccctcgcctatcccatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaacagctccggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacatag 25090979  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 820  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25090980 ccaccaacaccctacgccacaacccctctctatcaactaacaaccgctaacaccatttccctaacaaagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 25091079  T
Q  821 c 821  Q
    |    
T  25091080 c 25091080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Original strand, 37434025 - 37434302
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37434025 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 37434124  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||    
T  37434125 atataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagaatagagacttttaaaggaacatgtttatgcca 37434224  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacc 301  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37434225 aattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 37434302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 433 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 42177386 - 42177004
Alignment:
Q  433 ccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacac--acacaacgga 530  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| | |  ||||| || |    
T  42177386 cccccccccatcctccaccctcaacaagaacatgttcctcaccgtgattactttattggcagctagatcatatagccgcctaaatcgctcacacagcgaa 42177287  T
Q  531 acactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgccta 630  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||    
T  42177286 acactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcgatttcggccccatcccccaccctcctcctaacacaacccgcaaaccaa---tccccaccctcgccta 42177190  T
Q  631 tctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacac 730  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     ||||||||||| ||||||    
T  42177189 tcccatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccgcatcctccaaaccaccatctgcc---tgatacctagccaccaacac 42177093  T
Q  731 cctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacac 819  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||  | || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42177092 cctacgccacaaaccatccctatcaactaacaaccgtcaacatcatttctccaacaaaggaatgttaaactctctcaaccccctaacac 42177004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Original strand, 13200016 - 13200290
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||| ||    
T  13200016 accataggccacaatgcgccaaaaattgggcaagacaaaaacatatgagtcacatcttcaacatgcccacacccagtaacacaaaaccgagcctccatag 13200115  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     |||||| |  || |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  13200116 gtagaattctgcgctctgccaaattgtattttgtaggtaaacgatccctcaatagctgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacctgtttatgcca 13200215  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtata 298  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13200216 aactaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccacgaacagtata 13200290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42177670 - 42177422
Alignment:
Q  190 ggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 289  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42177670 ggatagaaacttttaaaggaacctgttaatgccatattaactccaaattttgatgaacataaagttgttcatgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 42177571  T
Q  290 aacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactacc 389  Q
     |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42177570 tacagtataacctctaatctgatccagtaacaacatccacatgtttgtttctgattcctgcaaagagactattagtaataaatccctacactcttctacc 42177471  T
Q  390 aggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccccc 438  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  42177470 gggtcctccacccacacccataaacgatgccgccactgccacgcacccc 42177422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 817
Target Start/End: Original strand, 8299696 - 8300492
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| || ||  | |||||||    
T  8299696 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaggacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataatcgctcctccacag 8299795  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  8299796 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgcca 8299895  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||| ||| || || |  || || |  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| || | |   ||||  || |||||     
T  8299896 aattaagtccaaattatggtgtaattggggctactcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 8299995  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| | |   || |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || |||||||    
T  8299996 agccatctgtctaacactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgccgacgcc 8300095  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacac 522  Q
    ||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  ||    
T  8300096 acctcaacgcctccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagacaagtcaaaaaggcgcctaaaccggac 8300195  T
Q  523 acaacg--gaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||| |  |||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||    
T  8300196 acaaagaggaacatctccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctcgcca 8300295  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8300296 ccctcacctatcccatctctaatcctcacgatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctag 8300395  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||  |||||| | | ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  8300396 ccactaacacctttctccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 8300492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 778
Target Start/End: Original strand, 9922500 - 9923251
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaa 129  Q
    ||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| || |  ||||| | ||| || |||| || || ||    
T  9922500 ggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaa 9922599  T
Q  130 tcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaa 229  Q
    | ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  ||||| || | ||||||| ||||||| | |||||| ||| |||| || || ||    
T  9922600 tgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgtcatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaa 9922699  T
Q  230 ctccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccac 329  Q
    |||||  |||||||| |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||  | |||||||| | | | || | |  ||||   || ||||| | |||     
T  9922700 ctccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgaacggaaaacccatcatcctgagttggtaaccaaatccat 9922799  T
Q  330 ctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgcc 429  Q
    || | ||    || ||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||  ||||||  || ||||||||  |||| || || | |||||||  |     
T  9922800 ctatctgtcactgattcctgcaatgaaactgttagtaataaagccctagactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctca 9922899  T
Q  430 acgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--cacacaa 526  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||    |||  ||| || | ||  || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  9922900 acgcctccccaccgacatccacccccaacaagaacatgttcctaacagagattggtttgttcacagtcaagtcataaaggcgactaaaccattcacacaa 9922999  T
Q  527 cggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcg 626  Q
     ||||||   ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||     
T  9923000 tggaacatctccacaccaacaatcccgccaaaaatctgtctctgcaccgtctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccaaccctctccaccctca 9923099  T
Q  627 cctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatca 726  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9923100 cctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccatgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccacca 9923199  T
Q  727 acaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||||| | | ||||||| |  || | ||   |||||||||||||||||||||    
T  9923200 acacctttctccacaaagcttccttctccaataacaaccgccaacaccattt 9923251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 556 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 41665080 - 41664819
Alignment:
Q  556 aaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctc 655  Q
    ||||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||     ||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41665080 aaaaatcagtgtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacacgtcccaaaccaaccctctccaccctcacatatcccatctctaatcctcactatctc 41664981  T
Q  656 cctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatca 755  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| |  |||| ||     
T  41664980 catccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccactaacaccttcctccacaaagcctccctctcc 41664881  T
Q  756 tctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41664880 aataacaaccgccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcgtaac 41664819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 817
Target Start/End: Original strand, 7924795 - 7925075
Alignment:
Q  537 ccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcat 636  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||  || ||||  || || |||||| ||||||||    ||||||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  7924795 ccacaccaacaatcacgcccaaaatcagtatgtgccccatgtcccactctcctcgtaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacgtatcccat 7924894  T
Q  637 ctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctaca 736  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | |     
T  7924895 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctagccactaacacctttct 7924994  T
Q  737 ccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  7924995 ccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 7925075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 604 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 172703 - 172499
Alignment:
Q  604 caaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatc 703  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  172703 caaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacgatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatc 172604  T
Q  704 cgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactct 803  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||  || |||| ||   |||||||| ||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||     
T  172603 ctccacaccatacctagccactaacacctttctccacaacgcatccctctccaataacaacctccagcaccatttacccaacaaagcaatgttaaactcc 172504  T
Q  804 ctcaa 808  Q
    |||||    
T  172503 ctcaa 172499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 552 - 817
Target Start/End: Original strand, 32266986 - 32267243
Alignment:
Q  552 cgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaacta 651  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  32266986 cgccaaaaatcagtatccgcaccatctcccaccttcctcctaacacaagacccaaaccacccctctccaccctcacctatcccatctctaatccttacta 32267085  T
Q  652 tctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccct 751  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||        |||||||||  |||||| | | ||||||| |  ||||    
T  32267086 tctccctccaccacgacgaacaactccggcccccaacctccaaacctccatccgc--------acctagccactaacacctttctccacaaagcttccct 32267177  T
Q  752 atcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
     ||   ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32267178 ctccaataacaaccgccaacaccatttacccaacaaagctatgttaaactctctcaatctcgtaac 32267243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 471
Target Start/End: Original strand, 13396281 - 13396729
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  13396281 accattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 13396380  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  13396381 gtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacttgtttatgcca 13396480  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||||||||  ||||| |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| ||      |||||  || |||||     
T  13396481 aattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagaccccacgtacagaatacccaccctcctgattaggtaaccaa 13396580  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| ||    || |||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||    
T  13396581 agccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaattgttagtaataaaaccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgcc 13396680  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcct 471  Q
    || || ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  13396681 accgcaacgcctccccacccacatccacccccaacaagaacatattcct 13396729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 2529779 - 2529957
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||| |     
T  2529779 accataggccacaatgtgccgaaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaa 2529878  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttt 202  Q
     |||||| ||||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||    
T  2529879 gtagaattccacgatctaccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttt 2529957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42177812 - 42177680
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||     
T  42177812 accataggccacaatgtaccgaaaattggacaagagaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaatcgatcctccacaa 42177713  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttag 156  Q
    ||  ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  42177712 atgtaatgccacgatctgccaagttggatttag 42177680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Original strand, 7924279 - 7924549
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | |||||||    
T  7924279 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacag 7924378  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  7924379 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgcca 7924478  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
     || || |||| ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  7924479 aattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacag 7924549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 32266457 - 32266667
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  32266457 accattggccacaatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 32266556  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  32266557 gtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 32266656  T
Q  224 gatgaactcca 234  Q
     || |||||||    
T  32266657 aattaactcca 32266667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 645 - 721
Target Start/End: Original strand, 38046875 - 38046951
Alignment:
Q  645 ctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagc 721  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  38046875 ctaactatctccctccatcacgaagaacaacttcggcccccatcctccaacctcccatcctccacaccatacctagc 38046951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 362 - 448
Target Start/End: Original strand, 13200296 - 13200383
Alignment:
Q  362 tagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgc-cccccaccatcctcc 448  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13200296 tagtaataaatccatacactcctctaccaactcctcctcccacacccataaacgacgtcgccactgccacgctcccccaccctcctcc 13200383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 749 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 37434478 - 37434406
Alignment:
Q  749 cctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37434478 cctatcaactaacagccgccaacaccattttcccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcctaacaccc 37434406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41665616 - 41665352
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  41665616 accattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 41665517  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||  || | | |||||||||   ||| ||||| ||  |||| || |  | |||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  41665516 gtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctcttaggaatcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 41665417  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccac 288  Q
     || ||||||||||  ||||| |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  41665416 aattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagaccccac 41665352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 5181569 - 5181635
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatc 96  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  5181569 ggccacaaggcaccaaaagttgggcaagacaaaaacatatgattctcatcttcaacttgcccgcatc 5181635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 799
Target Start/End: Original strand, 5585200 - 5585360
Alignment:
Q  639 ctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacacc 738  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||| |  | || |||||||||| ||     
T  5585200 ctaatcttcactatctctttccaccacatggaacaactccggcccccatcctccaacctaccatgcaccgcaccatatcgtgtcaacaacaccctataca 5585299  T
Q  739 acaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaa 799  Q
    ||| || ||| |||||  ||||||||  |||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  5585300 acagactacctctatcgactaacaactaccaacaccatttacctagtaaagcaatattaaa 5585360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 659 - 778
Target Start/End: Original strand, 36492912 - 36493031
Alignment:
Q  659 ccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatct 758  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||| || |||| |  |||||| || |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||| |     
T  36492912 ccaccaagaagaacctctccggcccccaaccgccaacctcccatcctcctcaccatacctcgccaccaacaccctataccataaactactcctctcaacc 36493011  T
Q  759 aacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  36493012 aacaaacgccaacaccattt 36493031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Original strand, 20496977 - 20497035
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttc 82  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20496977 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttc 20497035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 698 - 778
Target Start/End: Original strand, 8902397 - 8902477
Alignment:
Q  698 accatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||||||| || ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8902397 accatcctcctcaccataacgagccactaacaccctataccacaagccagctctatcaactaacatccgccaacaccattt 8902477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 34137204 - 34137156
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacat 78  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34137204 ggccacaaggcaccaaaatttgggcaagacaaaaacaagtgattcacat 34137156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 694
Target Start/End: Original strand, 36157660 - 36157720
Alignment:
Q  634 catctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    |||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  36157660 catctctaatcctcgccacctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctccaa 36157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 636 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 4310474 - 4310368
Alignment:
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||   ||| |||| ||||| | ||||||||||     
T  4310474 tctctaatcctaccaacctccttccaccaaaaagaaccactccggcccccatcctccaacctcccatccctaacatcatatctagcaaccaacaccctat 4310375  T
Q  736 accacaa 742  Q
    |||||||    
T  4310374 accacaa 4310368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 694
Target Start/End: Original strand, 17659356 - 17659397
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17659356 ctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctccaa 17659397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 573; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 14439646 - 14440437
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14439646 accataggccacaatgcatcaaaaattggacaagacaaaa-caaatgattcacatcttcaacctacccacatcccgttacataaaaccgagcttccacag 14439744  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14439745 atagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgtcaagccaagatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 14439844  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14439845 gattaactccatagtttgatgaacatgaggtcgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaatataacctttaatctgatccggcaaccac 14439944  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    |||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14439945 aaccacctgtctg------tttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaacaattcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 14440038  T
Q  424 actgccac-gccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--ac 520  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  14440039 actgcccccnccccccaccatcctccacccccaacaaaaacatgttccgcaccgtaattactttattgacagctaaatcatatagccgcctaaaacgcac 14440138  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14440139 acacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaatatcggtatcggctccatccctcaccctcctcc--acacaacctgcaaaccagccctcccca 14440236  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14440237 ccctcgcctatcccatctctaatcctagctatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccaccatccgccataccatacctag 14440336  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 820  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14440337 ccaacaacaccctacaccacaaaccacccctatcaactaacaaacgccaacaccatttcaccaacagagcaatgttaaactctctcaacctcctaacacc 14440436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 12645429 - 12646214
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||| ||    
T  12645429 accataggccacaatgcgccaaaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaag 12645528  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     |||||| |  || |||| ||||||  |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  12645529 gtagaattctgcgatctgtcaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagagaaacctgtttatgcca 12645628  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| | ||||||    
T  12645629 aattaactccatattttgataaacatgagggttttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccacgaacagtatatcctccagtctgatccagtaaccac 12645728  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    ||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12645729 aaccacctgtcagtttctgtttcctgcaaagagattgttagtaataaatccctacactcctctaccaaatcctccttccacacccataaacgacgtcgcc 12645828  T
Q  424 actgccacgc-cccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaa--acac 520  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||   | |    
T  12645829 actgccacgctcctccaccctcctccacccccaacaagaacatgttccttactgtgattactttattgacagctaagtcatatagtcgcctaaagcgctc 12645928  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  12645929 acacaaaggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatctgttgtggctccatctcccaccctcctcctaacacaatccgcaaaccaatcctcccca 12646028  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||               ||||||| |||||||    
T  12646029 ccctcgcctatcccatctctaatcctgactatctccctccaccaagaagaacaactccggcccccatcct---------------ccacaccttacctag 12646113  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 820  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||  ||||||||| |||||||||||| || |  | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12646114 ccaccaacaccctataccacaatccatctctatctactaacaacctccaacaccattttcctaacaaaacaaagttaaactctctcaacctcctaacacc 12646213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11000197 - 10999915
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11000197 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagataagaacaaatgattcacatcttcaacatgcccacattccgttacacaaaaccgagcttccacag 11000098  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11000097 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccct-aacagccaccaagcaaggatagaaacttttaaagaaacctgtttatggca 10999999  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaat 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10999998 gattaactccatattttgatgaacatgagattgttcctatgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaatataacctctaat 10999915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Original strand, 40176562 - 40177155
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||  |    
T  40176562 accataggccacaaagcaccgaagaatggacaaaacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcg 40176661  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || || ||  || | || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  40176662 gtaaaagccg-cgatttgtcaaattgactttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgcca 40176760  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| ||| ||   |||| ||||||| |||| |    
T  40176761 gactaactccatattttgatgaatatgaggttgttcctgtgatgtcaataagtcatataccccatgaacagaatagccacaaatcggatccggtaaccgc 40176860  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| ||||  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  40176861 acccatctgtcagtatcagattcctgcaaagagactgttagtaataaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccacacccataaccggcgacgcc 40176960  T
Q  424 actgccacgc-cccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--c 520  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||  ||||| ||||| || || ||||| |   |    
T  40176961 actgccacgctcccccaccatcctccacccccaacaagaacatcttcctcaccgtgattgatttattgatggctaagtcataaagtcgcctaaagcgttc 40177060  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccct 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  40177061 acacaacggaacactaccacaccaacaatctcaccaaaaatcggtatcaactccatcccccaccctcctcctaacacaatccgcaaaccaaccct 40177155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 821
Target Start/End: Original strand, 28252628 - 28253413
Alignment:
Q  39 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgtt 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |  ||||| |||||  | |||| |   | ||| ||| | |    
T  28252628 gcaccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcatcatgaccacaaccggaaacacataaccgcccctccatatgaataatgccatggt 28252727  T
Q  139 ctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatatt 238  Q
     ||||||||||   || ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||||| ||| || |||||||| || || || ||||||      
T  28252728 ttgccaaatttcccttcgtaggtaagcgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaattccataga 28252827  T
Q  239 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgat 338  Q
    |  ||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||| || | ||||||      ||||||||| | ||||||||| || | |||     
T  28252828 tgaatgtaactgaggctgttcctgtgatgtcagcatgtcatacaccctacggactgaataaccgcctccctgatccggtagccacaaccatctatctgaa 28252927  T
Q  339 tatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccc-c 437  Q
       | |||||||||| | ||||| ||||||||| || |||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |    
T  28252928 acagattcctgcaaaaaaactgtcagtaataaagccctacactcctctactaggtcatcctcccatgcccataaccgacgacgccactaccacgcctcac 28253027  T
Q  438 caccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacacac--aacggaacact 535  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| | | |||  ||| |||||      
T  28253028 caccaacctccacccccaacaaaaacatagtcctaaccgtgattactttgttgacggccaaatcatatagccgtctaaagcgctcacgaaacagaacatc 28253127  T
Q  536 accacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctca 635  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  28253128 accacaccgacaatcccgccaaaaatcagtatcggaaccatcccccaccctcctcctaacacaaaccgaaaaccaaccctccccaccctcgtctatccca 28253227  T
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28253228 tctctaatcctcactatctccctccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccctcaacaccttac 28253327  T
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
     ||| || ||  |||| ||  ||||||| |||||||||||||| || |  || || |  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28253328 gccataacccttccctctccactaacaaacgccaacaccattttcctaacagggctaaattaaactctctcaacctccttacaccc 28253413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 570 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 33515905 - 33515654
Alignment:
Q  570 gctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaag 669  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| | |||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33515905 gctccatcccccaccctcctcctaacacaatccgtaaaccaaccctccccaccctcacatatcccgtctttaatcttgactatctccctccaccacgaag 33515806  T
Q  670 aacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgcca 769  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||| ||    
T  33515805 aacagctccgacccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccaccaacaccctacgccacaacccatctctatcaactaacaaccgtca 33515706  T
Q  770 acaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33515705 acaccatttccctagcaaagcaatgttaaactctcttaatctcctaacaccc 33515654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 38604587 - 38604178
Alignment:
Q  58 acaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccac-agatagaatcccacgttctgccaaatttgatttag 156  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||  ||| || || ||||| | |||||||||   | | |    
T  38604587 acaaaaacacatgatttacatcttcaacatgcccacagcctgagacacataaccgagcctccatgaga-aggatgccacgatatgccaaattgactattg 38604489  T
Q  157 taggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatgaacatgaggttg 256  Q
    |||| |||||||| || |||||  |||| | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38604488 taggtaaacgatctcttaacagcagccatgcaaggattgaaacttttagaggtacttgtttatgccagattaactccatattttgatgaaaattaggttg 38604389  T
Q  257 ttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagag 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    | || ||| || |||     ||| ||||    ||||||||||||||||||     
T  38604388 ttcctgtgatgtcaacatgtcatacacaccccgaacagtgtaaccaccgacctaatctggtaac-----ccatctgtcaacttatgtttcctgcaaagaa 38604294  T
Q  357 actgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgc-cccccaccatcctccaccccca 455  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38604293 actgtaagtactaaattcctacactcctctaccaagtcttcctcccacacccataaactacggtgccactgccacgcacccccaccatcctccaccccca 38604194  T
Q  456 acaagaacatgttcct 471  Q
    |||||| ||| |||||    
T  38604193 acaagagcatattcct 38604178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 471
Target Start/End: Original strand, 41206915 - 41207357
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaa 129  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||  |  | ||    
T  41206915 ggccataaggcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccgcgcctccaagggaataa 41207014  T
Q  130 tcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaa 229  Q
    | ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| || || ||    
T  41207015 tgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 41207114  T
Q  230 ctccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccac 329  Q
    |||||||||| |||| |  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||  || | ||| ||   |  |||||| || |||||||||||     
T  41207115 ctccatatttggatgtaactgaggatgttcctgcgatgtcagcatgtcataaactccacatactgaatacccaccatcctgatctggtaaccacaaccat 41207214  T
Q  330 ctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgcc 429  Q
    || | ||    || ||||||||| || ||||| | ||||||| || |||||||  ||||||  || ||||||||| |||| || ||||||||||| |||     
T  41207215 ctatctgccactgattcctgcaaggaaactgtaaataataaaaccctacactcctctaccaactcttcctcccatgcccacaaccgacgacgccattgca 41207314  T
Q  430 acgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcct 471  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  41207315 acgcctccccacccacatccacccccaacaagaacatattcct 41207357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 15917553 - 15917769
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaa 129  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||  | ||    
T  15917553 ggccacaacgcgccaaaagttggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacaaccagtgacacacaaccgcacttccaaaggaataa 15917652  T
Q  130 tcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaa 229  Q
    | ||||| | |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||| | |||||| | ||||||  | || ||    
T  15917653 taccacgatttgccaaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagcaaggatacagactttcagaggaacctatttatgcgaaattaa 15917752  T
Q  230 ctccatattttgatgaa 246  Q
    ||| |||||||||||||    
T  15917753 ctcaatattttgatgaa 15917769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17765194 - 17764948
Alignment:
Q  39 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgtt 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| || |||| ||  |  || ||||| |    
T  17765194 gcaccaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgaccacaaccagtgacacacaaccgcgcctccaaaggaatgataccacggt 17765095  T
Q  139 ctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatatt 238  Q
     ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||| | |||| | |||||||| || || |||||||||||    
T  17765094 ttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaatagccgccaagcaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccatattaactccatatt 17764995  T
Q  239 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacac 285  Q
    |  ||  |    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17764994 tgaatataaccaaggatgttcatgtgatgtcaacatgtcatacacac 17764948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 653 - 782
Target Start/End: Original strand, 37445618 - 37445747
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccaccccta 752  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| | |||    
T  37445618 ctcccaccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaacctcctgtcctccgcaccatacctagccaccaacaccctacgccagaacccatcacta 37445717  T
Q  753 tcatctaacaaccgccaacaccatttcccc 782  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  37445718 tcaactaacagacgccaacaccatttcccc 37445747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Original strand, 4552074 - 4552332
Alignment:
Q  36 aatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccac 135  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||  | |||||||||||||| ||||    
T  4552074 aatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacattttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccac 4552173  T
Q  136 gttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccat 235  Q
    | | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| | |||||| || || || |||||    
T  4552174 gatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttaagaggaacctatttatgccaaattaagtccat 4552273  T
Q  236 attttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
    ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  4552274 attatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacag 4552332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 33516031 - 33515947
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaa 108  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  33516031 accataggccacaaagcaccaaagaaaggacaagacaaaaacatatgagacacatcttcaacatgcccacatctcgtgacacaaa 33515947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 333
Target Start/End: Original strand, 18154547 - 18154652
Alignment:
Q  228 aactccatattttgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaac 326  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||   | |||||||||| ||||| | |    
T  18154547 aactccgtattttgatgtaacatg-gattgttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccacaaaccgtatacccaccagtctgatccggtaaccaaagc 18154645  T
Q  327 cacctgt 333  Q
    |||||||    
T  18154646 cacctgt 18154652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 694
Target Start/End: Original strand, 1380603 - 1380648
Alignment:
Q  649 ctatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1380603 ctatctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctccaa 1380648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 694
Target Start/End: Original strand, 15018183 - 15018243
Alignment:
Q  634 catctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15018183 catccctaatcctccctacctcccgccaccaagaagaacaacttcggcccccaacctccaa 15018243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 22725073 - 22725013
Alignment:
Q  634 catctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    |||||| |||||| || | || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22725073 catctcaaatcctcacaaccttccgccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaa 22725013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 778
Target Start/End: Original strand, 26146746 - 26146865
Alignment:
Q  659 ccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatct 758  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |  |||||| || | ||||| || |||| |||||||||| ||||||||| || ||| ||  |     
T  26146746 ccaccaagaataaccactccggcccccaacctccaacctcccatcctcctcgccatatctcgccaccaacaccctataccacaaactactcctctccacc 26146845  T
Q  759 aacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  26146846 aacaaacgccaacaccattt 26146865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 17764822 - 17764757
Alignment:
Q  407 ccataaacgacgacgccactgccacg-ccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcct 471  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  17764822 ccataagcgacgacgccactgccacgtctccccaccgacatccaccccaaacaagaacatattcct 17764757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 641 - 694
Target Start/End: Original strand, 35488350 - 35488403
Alignment:
Q  641 aatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  35488350 aatcctacctacctcccgccaccacgaagaaccacttcggccccccacctccaa 35488403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 533; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 10577496 - 10576697
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10577496 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 10577397  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10577396 ttataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgcca 10577297  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  10577296 aattaactctatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaaaaagtcatatacaccacaaacagtataaccagaaatatgatccggcaaccac 10577197  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10577196 aaccacctgtctgtttctgtttcctgcaaagagactgtcagtaataaatccctacactctactagcaattcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 10577097  T
Q  424 actgccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--aca 521  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  10577096 actgccacgccccccatcaccctccacccccagcaaaaacatgttccgcactgtaataactttattgacagttaaatcataaagccgcctaaaacgaaca 10576997  T
Q  522 cacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccac 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10576996 cacaacggaacactaccacaccaacaatctcaccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctataaaccagccctccccac 10576897  T
Q  622 cctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagc 721  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10576896 cctcacctatcccatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagagcaactccggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagc 10576797  T
Q  722 catcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    || ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10576796 caacaacaccctactccgcaaacctcccctatcaactaacagccgccaacaccatttccccaacaaaacaatgttaaactctctcaacctcctaacaccc 10576697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 20883280 - 20882480
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20883280 accataggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcatatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaaccgagcctccacag 20883181  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||    
T  20883180 atataatgccacgatctaccaagttcgatttagtaggtaaacaatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctatttatgcca 20883081  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  20883080 gattaactccatattttgatgaacatgtggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaatatagcctctaatctgatccggtaaccac 20882981  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20882980 aaccacctgtctgtttctgattcctgcaaagagactgttagtaataaatccctacacccttctaccaggtcctcctcccacgcccataaacgacgacgcc 20882881  T
Q  424 actgccacgccccccaccatcctccacc-cccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaa--acac 520  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||   | |    
T  20882880 aatgccacaccccccaccatcctccacctctcaacaagaacatgttcctcacaatgattactttattaacaactaaatcatatagccgcctaaagcgctc 20882781  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20882780 acacagcggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaattggtttcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacatgcaaaccaaccctcccca 20882681  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacac-cataccta 719  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20882680 ccctcgcctatcccatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaacaactccgg-ccccgtcctccaaaccaccatccgccacacttataccta 20882582  T
Q  720 gccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacac 819  Q
    || | |||||||||||    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20882581 gcgaccaacaccctacgttgcaaaccatccctaacaactaacaaccgccaacaccatttctccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcctaacac 20882482  T
Q  820 cc 821  Q
    ||    
T  20882481 cc 20882480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 17606573 - 17605781
Alignment:
Q  32 ccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| || |||     
T  17606573 ccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgtatcccgttacacaaaatcgattttccacagctataatt 17606474  T
Q  132 ccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaact 231  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  17606473 ccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaatgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaact 17606374  T
Q  232 ccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacct 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17606373 ccatattttgatgaacatgagattgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataaccataaatctgatccggcaaccacatccacct 17606274  T
Q  332 gtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccac 431  Q
    ||  | || || ||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17606273 gtcagtttctgattcctgcaaagtgaatgtcaataataaatccctacactctactaaaaattcctcctcccatacccataaacgacaccgtcactgccac 17606174  T
Q  432 gcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--cacacacaacg 528  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||   ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  17606173 gcccccccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgaaataactttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacg 17606074  T
Q  529 gaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcc 628  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17606073 gaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgtaaaccagccctccccaccctcacc 17605974  T
Q  629 tatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaac 728  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  17605973 tatcccatctctaatcctcacaatctccctccacaaagaagaacaactccggcccccatcctccaaaccaccatcctccacgccatacctagccaacaac 17605874  T
Q  729 accctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17605873 accctactccacaaacctcccctatcaactaacagccaccaacaccatttccccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcctaacaccc 17605781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 21630356 - 21629569
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21630356 accaaaggccacaaagcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 21630257  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaattt--gatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatgg 221  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||||     
T  21630256 atataatcccacgttccaccaaatttttgattttgtaggtaaacgatccctcaatagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctggttatgc 21630157  T
Q  222 cagatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaacc 321  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21630156 caaattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaacc 21630057  T
Q  322 acaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacg 421  Q
    | | |||||||| || || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21630056 atatccacctgtctgtttctgtttcctgcaaagtaactgtcagtaataaatccctacactctactaacaattcctcctcccatacccataaacgacaccg 21629957  T
Q  422 ccactgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--c 518  Q
     |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||   ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |    
T  21629956 tcactgccacgcccccccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgaaataactttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgc 21629857  T
Q  519 acacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccc 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21629856 acacacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcgatatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccagccctccc 21629757  T
Q  619 caccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacct 718  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||               |||| ||||||||    
T  21629756 caccctcacttatcccatctctaatcctaacaatctccctccaccacgaagagcaactccggcccccatcct---------------ccacgccatacct 21629672  T
Q  719 agccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaaca 818  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21629671 agccaacaacaccctactccacaaacctcacctatcaactaacagccgccaacacaatttccccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcctaaca 21629572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 17573902 - 17573268
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  17573902 accagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacag 17573803  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||    
T  17573802 ctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaatcttttaaaggaacctgtttatgcca 17573703  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17573702 aattaactccatattttgataaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcacaacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccac 17573603  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||||||||  | || || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17573602 atccacctgtcagtttctgattcctgcaaagtgactgtcagtaataaatccctacactctactaacaattcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 17573503  T
Q  424 actgccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--caca 521  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  17573502 actgccacaccccccatctccctccacccccaacaaaaacatgttccgcattgtaataactttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcaca 17573403  T
Q  522 cacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccac 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17573402 cacaacggaacactaccacaccaacaatcgcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccagccctccccac 17573303  T
Q  622 cctcgcctatctcatctctaatcctaactatctcc 656  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  17573302 cctcacctatcccatctctaatcctcacaatctcc 17573268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 388
Target Start/End: Original strand, 11462306 - 11462664
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||     
T  11462306 accataggc-acaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacaaaaaaccgagtctccgcat 11462404  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||     | |||||||  ||    
T  11462405 atataatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaaaagatccctcaacagctgccaagcaaggattgaaacttttaa-----cctgtttatacca 11462499  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||| |||||||| ||||||    
T  11462500 gattaactccatattttgatgaatatgttgttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaatatagcatctaatatgatccggtaaccac 11462599  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactac 388  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11462600 aaccacctgtttgtttttgattcctgcaaagagactgttagtaataaatccctacactcttctac 11462664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 14373223 - 14372481
Alignment:
Q  39 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgtt 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | || |  ||||| |||||  | |||| ||| | ||| ||||| |    
T  14373223 gcaccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgatttacatcttcatcatgcccataaccggaaacacacaaccgcccctccatagaaataatgccacggt 14373124  T
Q  139 ctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatatt 238  Q
     ||||||||||  ||| ||||| || |  | |||||| ||  |||||| ||| ||| | ||||||| ||| || |||||||| || || || ||||||      
T  14373123 ttgccaaatttcctttcgtaggtaagccgttcctcaaaagctgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaaatccataga 14373024  T
Q  239 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgat 338  Q
       ||| |  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| || |  |||||      ||||||||| ||||||||||| || |  ||     
T  14373023 agaatgtaactgaggctgttcctgggatgtcagcatgtcatacaccccacggactgagtaaccacctccctgatccggtaaccacaaccatctatcggaa 14372924  T
Q  339 tatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccc-c 437  Q
       | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |    
T  14372923 acagattcctgcaaagaaactgtcagtaataaagccctacactcctctactaggtcctcgtcccacgcccataaccgatgacgccacttccacgcctcac 14372824  T
Q  438 caccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacacac--aacggaacact 535  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||| ||||  || |||||||||| |||||||||   | |||  ||||||||| |    
T  14372823 caccaacctccacccccaataaaaacatatttctaaccgtgattactttgttgacggccaaatcatataaccgtctaaagtgctcacgaaacggaacatt 14372724  T
Q  536 accacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctca 635  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||| |     
T  14372723 accacaccaacaatcccgccaaaaatcagtatcggaaccatcccccaccctcctcctgacacaacccgaaaaccaaccctccccaccctcatctatcccg 14372624  T
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  14372623 tctctaatcctgactatctccctccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaaactttcgtccgccacaccatacctagccaccaacaccttac 14372524  T
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
     ||| || ||  |||| ||  ||||||| |||| |||||||||    
T  14372523 gccataacccttccctctccactaacaaacgcctacaccattt 14372481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17579328 - 17579109
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  17579328 accagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacag 17579229  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17579228 ctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 17579129  T
Q  224 gatgaactccatattttgat 243  Q
     || ||||||||||||||||    
T  17579128 aattaactccatattttgat 17579109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 15959054 - 15958462
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaa 129  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | || ||||| ||| |  | |||| ||  |  |    
T  15959054 ggccataaggcaccaaaaattgggcaagataaaaacaagtgattcacatcttccacgtgcccacaatcagtgacacacaactgcacctccaaaggaatga 15958955  T
Q  130 tcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaa 229  Q
    | ||| | | ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||| | |||||| |||||||| || || ||    
T  15958954 taccatggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagagactttaagaggaacctgtttatgccatattaa 15958855  T
Q  230 ctccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccac 329  Q
    || ||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| | ||| ||   |   |||||||| |||||||||||     
T  15958854 cttcatatttggatgtaactgaagttgttcctgtgatgtcagcatgtcagacacaccgcgaactgaatacccaccaccttgatccggtaaccacaaccat 15958755  T
Q  330 ctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgcc 429  Q
    || |  |   ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||  ||| || ||  |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15958754 ctatcaggcaatgattcctgcaaagaaactgtcagtaataaaaccctacattcctctaacaagttttcctaccacgcccataaacgacgacgcaactgcc 15958655  T
Q  430 acgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--cacacacaa 526  Q
    ||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||   | |||| ||    
T  15958654 acgcctccccaccaacatccacctccagcaagaacatatgcctaactgtgattactttgttgacagccaaatcatatagccgactaaagagctcacaaaa 15958555  T
Q  527 cggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccc 619  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  15958554 cggaacattaccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtttcggatccatcccccaccctcctcctaacacaatccgaaaaccaaccctcccc 15958462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 573 - 817
Target Start/End: Original strand, 2554051 - 2554295
Alignment:
Q  573 ccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaac 672  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2554051 ccatctcccaccctcctcctaacacaagtcccaaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaaccctcattatctccctccaccacgaagaac 2554150  T
Q  673 aacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaaca 772  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| |  |||| ||   ||||||| |||||||    
T  2554151 aactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccactaacacctttctccacaaagcttccctctccaataacaactgccaaca 2554250  T
Q  773 ccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2554251 ccatttacccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcgtaac 2554295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 518 - 821
Target Start/End: Original strand, 13938109 - 13938411
Alignment:
Q  518 cacacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcc 617  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || || || || ||||| || |||   ||||||||||    ||||||||| |||||     
T  13938109 cacacaaaacggaacatttccacaccaacaatcacgacaaaagtcagtctcagcaccatctcccacctctctcctaacacctgatgcaaaccaaccctct 13938208  T
Q  618 ccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacc 717  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13938209 cctccctctcctatcccatctctaatcctcactatctcctgccaccaagatgaacaactccggcccccatcctccaaaccaccatccgccgcaccatacc 13938308  T
Q  718 tagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    ||||||  |||||||||| |||| ||||| | || ||  ||||||||| |||||||||||| |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13938309 tagccactaacaccctacgccac-aaccatctctctctactaacaacctccaacaccattttcttaacaaagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 13938407  T
Q  818 accc 821  Q
    ||||    
T  13938408 accc 13938411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 651 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 17577335 - 17577171
Alignment:
Q  651 atctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccc 750  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17577335 atctccctccaccacaaagaacaactctggcccccatcctccaaaccatcatcctccacgccatacctagccaacaacaccctactccacaaacctcccc 17577236  T
Q  751 tatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctccta 815  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17577235 tatcaactaacagcctccaacaccatttccccaacaaagcaatgttaaactctcgcaacctccta 17577171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 24767656 - 24766904
Alignment:
Q  39 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgtt 138  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| || ||    ||||| ||||| || |||| || || ||| ||||| |    
T  24767656 gcactaaaagttggacaagacaaaaacaaattattaacatcttcaacgttcccgcaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacgat 24767557  T
Q  139 ctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatatt 238  Q
     |||||||||   ||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||| ||||||| | ||||| | |||||| ||||||||  | || |||||||||||    
T  24767556 ttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctaagaagtcgtcaagcaaggatagagactttgataggaacctgtttatgcaaaattaactccatatt 24767457  T
Q  239 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatc-tgatccggcaaccacaaccacctgtttga 337  Q
    |||||| |  |  || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| ||| | ||| ||||  || ||||| | ||| || ||||     
T  24767456 ttgatgtaactagggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaata-cctatcatcctgatttggtaaccatagccatctatttgt 24767358  T
Q  338 ttatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc-cc 436  Q
       | ||     ||| || ||||||||||||| | || |||||||  ||||||  || ||||||||  |||| || || ||||||||| || ||||| ||    
T  24767357 cactctt-----caaggaaactgttagtaatacaaccctacactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgtcgacgccaccgcaacgcctcc 24767263  T
Q  437 ccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--cacacaacggaacac 534  Q
    |||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||  | |||  ||| || | ||| || |||||||| || |||||||   ||||||  ||||||     
T  24767262 ccacccacgtccacgcccaacaagaacatattcctaactgtgattgatttgttaacagccaagtcatataggcgactaaaacggtcacacagtggaacat 24767163  T
Q  535 taccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctc 634  Q
     ||| |||||||  || |||||||||||  | |  || || || || |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  24767162 caccgcaccaacgatcacgccaaaaatctattttagcaccgtcacccaccctcctcctaacacacgccccaaaccagccctctccaccctcacatatccc 24767063  T
Q  635 atctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctc---------------caaaccaccatccgccacaccataccta 719  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||               |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24767062 atccctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactccgacccccatcctccaaatctccatcctccaaacctccatccgccacaccataccta 24766963  T
Q  720 gccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| |  |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  24766962 gccaccaacacctttcgccacaaagcttccctatctagtaacaaccgccaacaccattt 24766904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 602 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 18682240 - 18682064
Alignment:
Q  602 tgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccacca 701  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||   ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18682240 tgcaaaccatccctcctcaccctcacctataccattattaatcttcactatctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaaacctcca 18682141  T
Q  702 tccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||| ||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||  | || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18682140 tcctccgaaccatacctggccaccaacaccttacaccataacccctctctgtcaactaacaacctccaacaccattt 18682064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 2553542 - 2553744
Alignment:
Q  36 aatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccac 135  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||| | || |||| || || ||| ||||    
T  2553542 aatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaactgcgcctccaaaggtaaaatgccac 2553641  T
Q  136 gttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccat 235  Q
    | | |||||||||   ||| ||||| || |||||  |||| |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  2553642 ggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctttcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccat 2553741  T
Q  236 att 238  Q
    |||    
T  2553742 att 2553744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 438
Target Start/End: Original strand, 13937709 - 13938007
Alignment:
Q  140 tgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattt 239  Q
    ||||||||||  ||||||||| || || ||||||| ||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  13937709 tgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattt 13937808  T
Q  240 tgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgat 338  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||  ||| ||||| ||   | ||||||| || ||||| | ||||||||   |     
T  13937809 tgatgtaacatg-ggttgttcctgcgaagtcaacatatcatacacaccattaaccgtatacccaccagtctgatctggtaaccaaagccacctgtcaaaa 13937907  T
Q  339 tatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccccc 438  Q
     | |  ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||  || |||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||    
T  13937908 gaggaatcctgcaaagtaactgtaagtaataattccctacactcctctaccaactcttcctcccaaacccacaagcggcgacgccactgccacgaccccc 13938007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 396 - 675
Target Start/End: Original strand, 33185700 - 33185982
Alignment:
Q  396 tcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagag 494  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||| ||    
T  33185700 tcctcccatgtccacaaacggcgacgtcactgccacgcctccccaccatcctcccaacccaacaggagcatgttcctaaccgtgattactttgttgacag 33185799  T
Q  495 ctaaatcatatagccgtctaaaacacacac--aacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcct 592  Q
      || ||||| || || | | | | | |||  || ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||     
T  33185800 tcaagtcataaagacgacgagagcgctcacggaaaggaacatcaccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtttcagccccatcccccaccctcctcca 33185899  T
Q  593 aacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaac 675  Q
     ||| ||  | ||||||| ||||| |||||  |||| | | ||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33185900 gacataagatacaaaccacccctcaccacctccgccaaccccatctcttattctcactatctccatccaccaagaagaacaac 33185982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18651442 - 18651225
Alignment:
Q  63 aacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggca 162  Q
    ||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||| |  ||||| ||||| || |||| || || ||||||||| | | |||||||   ||| ||||| |    
T  18651442 aacaagtgattgacatcttcaacggtcccgcatccagagacacacaaccgcgcatccaaaggtaaaatcccacggttttccaaattattttttgtaggta 18651343  T
Q  163 aacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctg 262  Q
    | ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  |  || || || |||||    
T  18651342 accgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatctaactggggctgctcctg 18651243  T
Q  263 tgatgtcaacatgtcata 280  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18651242 tgatgtcagcatgtcata 18651225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 244
Target Start/End: Original strand, 12734018 - 12734238
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| || | ||||||||  |  ||||| |||||  | |||| ||    
T  12734018 accatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattcccacatctagaaacacataaccgctcctccagag 12734117  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| |||||   | |||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  12734118 atagaatgccacgggttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 12734217  T
Q  224 gatgaactccatattttgatg 244  Q
     || || |||||||| |||||    
T  12734218 aattaaatccatattatgatg 12734238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 15956560 - 15956442
Alignment:
Q  699 ccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaa 798  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |   | ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||| ||||    
T  15956560 ccatccgccacaccatacctagccaccaacaccttacgccacaa-ctttctctatcaattaacaaccgccaaaaccattttcccaacagggcaatattaa 15956462  T
Q  799 actctctcaatctcctaaca 818  Q
    | |||||||| | |||||||    
T  15956461 agtctctcaaccacctaaca 15956442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 634 - 778
Target Start/End: Original strand, 32186189 - 32186333
Alignment:
Q  634 catctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccct 733  Q
    |||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||| |  ||| || || ||| ||| || |||| |||||||||    
T  32186189 catccctaatcttcactacctccctccaccaagaagaagcactccggcccccaacctccaacctcccagccacctcactatatctcgccaccaacaccct 32186288  T
Q  734 acaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    | |||| || ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||    
T  32186289 ataccaaaacccacctctatccaccaacaactgccaacaccattt 32186333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 648 - 715
Target Start/End: Original strand, 10922073 - 10922140
Alignment:
Q  648 actatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccata 715  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||| ||||||||||    
T  10922073 actatctccctccaccaagaagaacaactccggcccccatccttcagccttccatcctccacaccata 10922140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 653 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 5085641 - 5085600
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5085641 ctcccgccaccaagaagaacaacttcggcccccatcctccaa 5085600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 17078824 - 17078764
Alignment:
Q  634 catctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17078824 catctctaatccgccctacctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctccaa 17078764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 18051083 - 18051023
Alignment:
Q  634 catctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18051083 catctctaatccgccctacctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctccaa 18051023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 403
Target Start/End: Original strand, 21168412 - 21168471
Alignment:
Q  344 ttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctccca 403  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||  |||||||||||    
T  21168412 ttcctgcaaagaaactgttagtaataaagccctacactcctctaccaactcctcctccca 21168471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 624 - 739
Target Start/End: Original strand, 26514220 - 26514335
Alignment:
Q  624 tcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagcca 723  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||  || || ||||||||| |||||    
T  26514220 tcgcctatcccatccctaatcttcgctatctccctccaccaaatagaaccactccggcccccaacctccaaactccctgcctcctcaccataccgagcca 26514319  T
Q  724 tcaacaccctacacca 739  Q
     |||||| ||| ||||    
T  26514320 ccaacactctatacca 26514335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18682636 - 18682503
Alignment:
Q  140 tgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattt 239  Q
    ||||||||||  ||||||||| || | ||||||| |||  ||||||  || |||| ||||||| ||||| |||||||| || |  || ||||||| ||||    
T  18682636 tgccaaatttactttagtaggtaaccaatccctcgacaaacgccaaaaaaagatagaaactttcaaaggtacttgtttgtgccgtatcaactccagattt 18682537  T
Q  240 tgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaaca 273  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18682536 tgatgcaaaatg-ggttgttcctgcgatgtcaaca 18682503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 741 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 503059 - 502998
Alignment:
Q  741 aaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactc 802  Q
    ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  503059 aaaccacccctatccactaacatcctccaacaccatttccctagtaaggcaatattaaactc 502998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 503147 - 503106
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  503147 ctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaa 503106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 301
Target Start/End: Original strand, 5041648 - 5041685
Alignment:
Q  264 gatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacc 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5041648 gatgtcaacatgtcataaacaccacgaacagaataacc 5041685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 694
Target Start/End: Original strand, 8264748 - 8264789
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8264748 ctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaa 8264789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 11060477 - 11060436
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11060477 ctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctccaa 11060436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 783
Target Start/End: Original strand, 37254651 - 37255413
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  37254651 accataggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaaaatgtccacattccgtgacacaaaaccgagtctccacag 37254750  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  37254751 atataatgccacaatctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaagtaacctgtttatgcca 37254850  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  37254851 gattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccgtgatgtcaacatgtcgtatacaccacgaacaggatagcctctaatctgatccggtaaccac 37254950  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    |||||||||| || || |  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37254951 aaccacctgtctgtttctaattcctgcaaagagtttgttagtaataaatccctacactcttctaccaagtcctcctcccacacccataaccgacggcgcc 37255050  T
Q  424 actgccacgccccccaccatcctcca-cccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaa--acac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   | |    
T  37255051 actgccacgccccccaccatcctccaccccccaacaagaacatgttcctcaccgtgattactttattgacagctaaatcatatagccgcctaaagcgctc 37255150  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  37255151 acacagcggaacactaccgcaccaacaatctcgccaaaaatcggtttcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacccgcaaaccaactctcctca 37255250  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255251 ccctcgcctatctcatctctaatcctgactatctccctccatcacgatgaacaactccagcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 37255350  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttcccca 783  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37255351 ccaccaacaccctacgccccaaaccatccctatcaactaacaaccgccaacatcatttcccca 37255413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 290 - 821
Target Start/End: Original strand, 31422763 - 31423295
Alignment:
Q  290 aacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactacc 389  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  31422763 aacagtatagccttcaatctgatccggtaaccacaaccacctgttagtttttgattcctgcaaagagtctgttagtaataaattcatacactcctctacc 31422862  T
Q  390 aggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttatt 489  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  31422863 aagtcatcctcccacacccataaacgacgatgccactgccacgcccac-accatcctccacccccaacaagagcatgttcctcactgtgattactttatt 31422961  T
Q  490 gagagctaaatcatatagccgtctaaaacac--acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctc 587  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||   ||||||| | ||||||    
T  31422962 gacagctaagtcatatagccgcctaaatcgctcacacaacggaactctaccacaccaacaatctcgccaaaaatccgtttcaattccatcctccaccctc 31423061  T
Q  588 ctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccat 687  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31423062 ctcctaacacaacccgcaaaccatccctccccaccctcgcctatcccatctctaatcctgactatctccctcaaccacgaagaacaactccggcccccat 31423161  T
Q  688 cctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtag 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |     
T  31423162 cctccaaaccaccatccgccacaccatgcctagccaccaacaccctacgccacaaaccatccctatcaactaacaaccgccaacaccatttccccaacaa 31423261  T
Q  788 agcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31423262 agcactgttaaactctctcaacctcctaacaccc 31423295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 28 - 624
Target Start/End: Original strand, 25619356 - 25619961
Alignment:
Q  28 taggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatag 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||      
T  25619356 taggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcctgtgacacaaaatcggtcctccacagatgc 25619455  T
Q  128 aatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatg 227  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  25619456 aatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgttccctcaacaaccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccatatt 25619555  T
Q  228 aactccatattttgatgaacat------gaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25619556 aactccatattttgatgaacatgtacatgaggttgttcctgtgatataaacatgtcatatacaccacagacaatataacctctaatctgatccggaaacc 25619655  T
Q  322 acaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacg 421  Q
    ||| |||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  25619656 acatccacctgtctgtttctgattcctgcaaagagtctgttagtaataaatccttacactcttctaccaggtcctcctcccacacccataaacgatgccg 25619755  T
Q  422 ccactgccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--a 519  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |       
T  25619756 ccactaccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccgtgattactttattgacaactagatcatatagccgcctaaatcgtt 25619855  T
Q  520 cacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccat-cccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccc 618  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| || |||     
T  25619856 cacacagcggaacactataacaccaacaatctcgcccaaaatcgatttcggctccatccccccacccttctcctaacacaaaccgcaaaccaaccttcct 25619955  T
Q  619 caccct 624  Q
    ||||||    
T  25619956 caccct 25619961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 71 - 330
Target Start/End: Original strand, 18532568 - 18532827
Alignment:
Q  71 attcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatcc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18532568 attcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgattttccacagatagaattccacgttctaccaaaattgatttagtaggtaaacgatcc 18532667  T
Q  171 ctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtca 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18532668 ctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgcgagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcatgtgatgtca 18532767  T
Q  271 acatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacc 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18532768 acaagtcatatacaccacgaacaatataaccagaaatctgatccggcaaccacaaccacc 18532827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 4938375 - 4937579
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | |||||||    
T  4938375 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacag 4938276  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  4938275 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgcca 4938176  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||| ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| || | |   ||||  || |||||     
T  4938175 aattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 4938076  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| | |   ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||    
T  4938075 agccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgcc 4937976  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacac 522  Q
    ||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  ||    
T  4937975 acctcaacgcctccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagtcaagtcaaaaaggcgcctaaaccggac 4937876  T
Q  523 acaacg--gaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||| |  |||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||    
T  4937875 acaaagaggaacatctccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctcca 4937776  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4937775 ccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctag 4937676  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||  |||||| | | ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  4937675 ccactaacacctttctccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 4937579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 817
Target Start/End: Original strand, 17720534 - 17721324
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaa 129  Q
    ||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | | |||||| |  |  ||||| | ||| || |||| || || ||    
T  17720534 ggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcttcattcccacaactagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaa 17720633  T
Q  130 tcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaa 229  Q
    | ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||| | |||||| ||| |||| || || ||    
T  17720634 tgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaa 17720733  T
Q  230 ctccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccac 329  Q
    |||||  |||||||| |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||  | |||||||| | ||| || | |  ||||   || ||||| | |||     
T  17720734 ctccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgaacggaatacccatcatcctgagttggtaaccaaatccat 17720833  T
Q  330 ctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgcc 429  Q
    || | ||    || ||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||  ||||||  || ||||||||  |||| || || | |||||||  |     
T  17720834 ctatctgtcactgattcctgcaatgaaactgttagtaataaagccntaaactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctca 17720933  T
Q  430 acgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--cacacaa 526  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||    |||| ||| || | ||  || ||||| || || ||||| |   |||||||    
T  17720934 acgcctccccaccgacatccacccccaacaagatcatgttcctaacagagattagtttgttcacagtcaagtcataaaggcgactaaaccgttcacacaa 17721033  T
Q  527 cggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcg 626  Q
     | ||||   ||||||||||| || | ||||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||     
T  17721034 tgaaacatctccacaccaacaatcccaccaaaaatctgtctctgcaccgtctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccaaccctctccaccctca 17721133  T
Q  627 cctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatca 726  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17721134 cctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccatgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccacca 17721233  T
Q  727 acaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    ||||| | | ||||||| |  || | ||   ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| |  |||||||||||||| ||| ||||    
T  17721234 acacctttctccacaaagcttccttctccaataacaaccgccaacaccatttacccaacaaagctaaattaaactctctcaacctcgtaac 17721324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 554 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 11276962 - 11276699
Alignment:
Q  554 ccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatc 653  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11276962 ccaaaaatcggtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccacccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcactatc 11276863  T
Q  654 tccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctat 753  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| |  |||| |    
T  11276862 tccctccaccacgacgaacaactccgggccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccactaacacctttctccacaaagcttccctct 11276763  T
Q  754 catctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |   ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  11276762 ccaataacaaccgccaacaccatttacccaccaaagcaatgttaaactccctcaacctcgtaac 11276699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 808
Target Start/End: Original strand, 47876888 - 47877662
Alignment:
Q  36 aatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccac 135  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| ||||| || |||| || || ||| ||||    
T  47876888 aatgcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccgcatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccac 47876987  T
Q  136 gttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccat 235  Q
    | | |||||||||   ||| ||||| ||  |||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| || || |||||| |    
T  47876988 ggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccct 47877087  T
Q  236 attttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgttt 335  Q
    ||||||||| |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||  ||| ||   |  |||||  || ||||| |  || |||| |    
T  47877088 attttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataaactccacgtacataatacccaccatcctgattaggtaaccaaagtcatctgtct 47877187  T
Q  336 gattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc- 434  Q
    |    || ||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||  || ||||||||  |||| || || | ||||||| || |||||     
T  47877188 gtcactgattcctgcaaggaaactgttagtaataaaaccccacactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 47877287  T
Q  435 ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--cacacaacggaac 532  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||    |||  ||| || | ||  || ||||| || || |||||||   | ||||  |||||    
T  47877288 ccccacccacgtccacccccaacaagaacatattcctaactgagattgatttgttaacagtcaagtcataaaggcgactaaaacggtcgcacagtggaac 47877387  T
Q  533 actaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatc 632  Q
    |   || |||||||  || ||||||||||| || |  || || || || |||||| ||||||||||     ||||||| || || |||||||||||||||    
T  47877388 atctccgcaccaacgatcacgccaaaaatctgtttatgcaccgtctcccaccctcatcctaacacacgtcccaaaccatccatctccaccctcgcctatc 47877487  T
Q  633 tcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccc 732  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  47877488 ccatctctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactccgg-ccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccaccaacacct 47877586  T
Q  733 tacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaa 808  Q
      | ||||||| |  |||| ||   |||||||||||||||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||||    
T  47877587 gtcgccacaaagcttccctctccaataacaaccgccaacaccatttatccaacaaagcaatattaaactctctcaa 47877662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 552 - 817
Target Start/End: Original strand, 29968398 - 29968663
Alignment:
Q  552 cgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaacta 651  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||    |||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  29968398 cgccaaaaatcggtatccgcaccatctcccaccttcctcctaacacaagacccaaatcatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacta 29968497  T
Q  652 tctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccct 751  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | ||||||| |  ||||    
T  29968498 tctccctccaccacgacgaacaactccggcccgcatcctccaaacctccatccgccacgccatacctagccactaacacctttctccacaaagcttccct 29968597  T
Q  752 atcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
     ||   ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  29968598 ctccaataacaaccgccaacaccatttacccaacaaagcaatattaaactccctcaatctcgtaac 29968663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 582 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 235124 - 234889
Alignment:
Q  582 accctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggc 681  Q
    |||||||||||||||||     |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  235124 accctcctcctaacacacgtcccaaatcagccctctccaccctcgcctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactccggc 235025  T
Q  682 ccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccc 781  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| |  | || ||   |||||||| |||||||||||| ||    
T  235024 ccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccactaacacctttcgccacaaagcttctctctccaataacaaccaccaacaccatttacc 234925  T
Q  782 cagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    ||  | |||||| |||||||||| ||| ||| ||||    
T  234924 caacaaagcaatattaaactctcgcaacctcgtaac 234889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11277499 - 11277051
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  11277499 accattggccataatgcactaaaatttacacaagactaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 11277400  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  11277399 gtaaaatgccacggtttgccaaattatttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 11277300  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||||||||| || || |  || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||  || || | |   ||||  || | |||     
T  11277299 aattaactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtacagagtacccatcatcatgattaggtacccaa 11277200  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| ||    || |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||    
T  11277199 agccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaactgttagcaataaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgcc 11277100  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcct 471  Q
    || || ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  11277099 accgcaacgcctccccacccacatccacccccaacaagaacatattcct 11277051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 648 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 39931216 - 39931047
Alignment:
Q  648 actatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccac 747  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  39931216 actatctcccaccaccaacaagaacaactccggcccccatcctccaaccgcccatcctccacaccatacctagccaccaacaccctacaccacaaatcat 39931117  T
Q  748 ccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    | |  ||  ||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  39931116 caccctccactaacaaacgccaacaccatttacctaacagagcaatattaagctccctcaacctcctaac 39931047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 235686 - 235414
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | || || |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  235686 accattggccataaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctcgcaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 235587  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaat--ttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatgg 221  Q
     || ||| ||||| | ||||||||  ||  ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | | |||| ||||||||     
T  235586 gtaaaatgccacggtttgccaaatgattttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagatgaacctgtttatgc 235487  T
Q  222 cagatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
    || || ||||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  235486 caaattaactccatattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 235414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 75
Target Start/End: Original strand, 18530403 - 18530454
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattca 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530403 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattca 18530454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 648 - 817
Target Start/End: Original strand, 36364036 - 36364205
Alignment:
Q  648 actatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccac 747  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||||||     
T  36364036 actatctccctccatcaagaagaacaacttcggccctcatcctccaactatttatcctccacaccttaactagccaccaacaccctacgccccaaaccat 36364135  T
Q  748 ccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
      |  ||  ||||||| |||||||||||||| | ||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36364136 taccctccactaacaaacgccaacaccatttactcaacaaagcaatattaaactccctcaatctcctaac 36364205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 280
Target Start/End: Original strand, 29967868 - 29968124
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  29967868 accattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 29967967  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||| | | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||| ||||  |||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  29967968 gtaaaatgccatggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcctcaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 29968067  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcata 280  Q
     || ||||||||| | || || |  || ||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  29968068 aattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtcagcatatcata 29968124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Original strand, 37919437 - 37919707
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |  |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  37919437 accattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaataaatgattaacatcttcaacgttcccacaactagaaacacacaaccgcgcctccaaag 37919536  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| | ||| | |||||||||   ||| ||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||  ||    
T  37919537 gtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatacca 37919636  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
     || |||| |||||  ||||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  37919637 aattaacttcatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatatactccacgcacag 37919707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 653 - 778
Target Start/End: Original strand, 17056054 - 17056179
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccaccccta 752  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||| |  |||||| || ||||||| |  |||| |||||||||| |||||| || |||| ||    
T  17056054 ctccttccaccacgaagaaacactccggcccccaaccaccaacctcccatcctcctcaccataacgcgccaccaacaccctataccacatactaccctta 17056153  T
Q  753 tcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  17056154 tcaactaataacctccaacaccattt 17056179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31177552 - 31177440
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||  | ||||||     
T  31177552 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataaccgctcctccacat 31177453  T
Q  124 atagaatcccacg 136  Q
    ||||||| |||||    
T  31177452 atagaatgccacg 31177440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 750 - 817
Target Start/End: Original strand, 18768030 - 18768097
Alignment:
Q  750 ctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  18768030 ctatcaactaacatcctccaacaccatttacctagtaaagcaatattaaactccttcaatctcctaac 18768097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 462
Target Start/End: Original strand, 29968187 - 29968306
Alignment:
Q  344 ttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc-ccccacca 442  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||  ||||||  |||||||| ||  ||||||| |  | ||||||| || ||||| |||||||     
T  29968187 ttcctgcaaagaaactgttagcaataaagccctacactcctctaccaattcctcctctcaagcccataacctcctacgccaccgcaacgcctccccaccc 29968286  T
Q  443 tcctccacccccaacaagaa 462  Q
     | |||||||||||||||||    
T  29968287 acatccacccccaacaagaa 29968306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 37919757 - 37919879
Alignment:
Q  344 ttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccac-gccccccacca 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||  | |||||||||  |||| || || | ||||||| || ||  |||||||||     
T  37919757 ttcctgcaaagaaactgttagtaataaaactctacactcctctaccaacttctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacacccccccaccc 37919856  T
Q  443 tcctccacccccaacaagaacat 465  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  37919857 acatccacccccaacaagaacat 37919879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 8300424 - 8299629
Alignment:
Q  29 aggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagataga 128  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |    
T  8300424 aggccacaaggcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctata 8300325  T
Q  129 atcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatga 228  Q
    ||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  8300324 atccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaatta 8300225  T
Q  229 actccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaacca 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||    
T  8300224 actccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaggtcatatgcaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccacatcca 8300125  T
Q  329 cctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgc 428  Q
    |||||  | || || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8300124 cctgtcagtttctgattcctgcaaagtgactgtcagtaataaatccctacactctactaacaattcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgc 8300025  T
Q  429 cacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--cacacaca 525  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  8300024 cacgcccccccatctccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgtaataacattattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacaca 8299925  T
Q  526 acggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctc 625  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8299924 atggaacactgccacaccaacaatcgcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccatccctccccaccctc 8299825  T
Q  626 gcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatc 725  Q
     |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  8299824 acctatcccatctttaatcctcacaatctccctccaccacaaagaacaactccggcccccatcctccaaaccaccatcctccacgccatacctagccaac 8299725  T
Q  726 aacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8299724 aacaccctactccacaaacctcccctatcaactaacagcctccaacaccatttccccaacaaagcaatgttaaactctcgcaacctcctaacaccc 8299629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 25857671 - 25856886
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  25857671 accagaggccacaaggcaccaaaagtcaaacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaatcggttttccacag 25857572  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25857571 ctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 25857472  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  25857471 aattaactccatattttgatgaacaagaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaatcac 25857372  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||||||||  | || || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25857371 atccacctgtcagtttctgattcctgcaaagtgactgtcagtaataaatccctacactctactaacaattcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 25857272  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--cac 520  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| || ||||||| |||  |||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||    
T  25857271 actgccacgcccccccatctccctccacccccaacaaaaatatgttccgcactgtaataacattattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcac 25857172  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25857171 acacaacggaacactgccacaccaacaatcgcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccatccctcccca 25857072  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||               |||| ||||||||||    
T  25857071 ccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacaaagaacaactccggcccccatcct---------------ccacgccatacctag 25856987  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 820  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25856986 ccaacaacaccctactccacaaacctcccctatcaactaacagcctctaacaccatttccccaacaaagcaatgttaaactctcgcaacctcctaacacc 25856887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 670
Target Start/End: Original strand, 10776662 - 10777326
Alignment:
Q  29 aggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagataga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |    
T  10776662 aggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacttgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacagatata 10776761  T
Q  129 atcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatga 228  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  10776762 atcccacgtgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaatta 10776861  T
Q  229 actccatat-tttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaacc 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  10776862 actccatatatttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacggacagtataaccaaaaatctgatccggcaaccacaacc 10776961  T
Q  328 acctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactg 427  Q
    |||||| || ||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10776962 acctgtctgtttccgtttcctacaaagagattgtcagtaataaatctctacactctactagcagttcctcctcccatacccataaaccacgacgccgctg 10777061  T
Q  428 ccacgccc--------------------cccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatag 507  Q
    ||||||||                    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  10777062 ccacgccccccccccccccccccccccacccatcaacctccacccccaacaagaacatgttccgcaccgtaataattttattgacagctaaatcataaag 10777161  T
Q  508 ccgtctaaaa--cacacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgca 605  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10777162 ccgcctaaaacgcacacacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgca 10777261  T
Q  606 aaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaaga 670  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777262 aaccagccctccccaccctcacatatcccatctctaatcctaactatctccctccaccacgaaga 10777326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 27795376 - 27796177
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | || ||| ||||  |    
T  27795376 accataggccacaaagcaccaaagaaaggacaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacagcccgtgacacatagcctagcctccaacg 27795475  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||    |||||| | ||| || ||||| || ||    
T  27795476 gtaaaatgccacgatttgccaaattggctttagtaggcaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctgtttgtgcca 27795575  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||  ||||||||| || ||||||  ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||   |||| | |||   ||||||    
T  27795576 gactaactccatacttggatgaatctgaggttgttcatgcgatgtcaataagtcatataccccacgaacagaatagccaccaatcgggtccaataaccac 27795675  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| || |  |     | ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27795676 acccatctatcagtaacggattcctccaaagaaactgttagtaataaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccacacccataatcggcgacgcc 27795775  T
Q  424 actgccacgc-cccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacac-- 520  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||  ||||| || |||||| ||||| || || ||||| | |      
T  27795776 actgccacgctcccccaccatcctccacccctaacaagaacatgttcctcgccgtgattgatttatggatagctaagtcataaagacgcctaaagcgctc 27795875  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||    
T  27795876 acacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaaccctctcca 27795975  T
Q  621 ccctcgc-ctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccataccta 719  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27795976 ccctcgcgctatcccatctctaatcttgacttactccctccaccacgaagaacaactctggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccataccta 27796075  T
Q  720 gccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacac 819  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  27796076 gccaccaacaccctacgccataacccctctctatcaactaacaaccgccaacaccatttccctagcaaagcaatgttaaacttgctcaatctccgaacac 27796175  T
Q  820 cc 821  Q
    ||    
T  27796176 cc 27796177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 384
Target Start/End: Original strand, 27766940 - 27767295
Alignment:
Q  29 aggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagataga 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  27766940 aggccacaaagcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacatatata 27767039  T
Q  129 atcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatga 228  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  27767040 atcccacgttccaccaaatttgattttgtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaatta 27767139  T
Q  229 actccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaacca 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||    
T  27767140 actccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccatatcca 27767239  T
Q  329 cctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactcta 384  Q
    ||||| || || ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  27767240 cctgtctgtttctgtttcctgcaaagtaactgtcagtaagaaatccctacactcta 27767295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33385621 - 33385296
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  33385621 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacag 33385522  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  33385521 atataattccacgtgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgcca 33385422  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||    
T  33385421 aattaactccatattttgatgaatatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataaccagaaatctgatctggcatccac 33385322  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctg 349  Q
    |||||||||| || || |||||||||    
T  33385321 aaccacctgtctgtttctgtttcctg 33385296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18359337 - 18359061
Alignment:
Q  25 ccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacaga 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |    
T  18359337 ccataggccacaatgcaccgaaaatcggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccagatcccgtgacacaaaaccgatcctccacata 18359238  T
Q  125 tagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcag 224  Q
    || ||| | ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  18359237 tataatgc-acgatctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaaggaacctgtttatgctag 18359139  T
Q  225 atgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacct 302  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18359138 attaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacct 18359061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 821
Target Start/End: Original strand, 42928039 - 42928824
Alignment:
Q  39 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgtt 138  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||||  | ||||  | || ||| ||||  |    
T  42928039 gcactaaaagttggacatgacaagaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcacctccaagggtaaaatgccacagt 42928138  T
Q  139 ctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatatt 238  Q
     || ||||||   ||| ||||  || ||||||||||  || ||||||  ||||||| | ||||| | |||||| |||||||  || || |||||||||||    
T  42928139 ttgtcaaattattttttgtagttaaccgatccctcagaagccgccaaacaaggatagagactttgagaggaacctgtttataccaaattaactccatatt 42928238  T
Q  239 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgat 338  Q
    | |||| |  || || |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| ||   |  |||||  || ||||||||||| || | ||      
T  42928239 tggatgtaactggggctgttcctgcgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccaccatcctgatttggtaaccacaaccatctatctgtc 42928338  T
Q  339 tatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc-ccc 437  Q
      || |||||| ||| | || || ||||||||| || |||||||  ||||||  || ||||||||  |||| || || |||||||||||| ||||| |||    
T  42928339 actgattcctgtaaaaaaacggtaagtaataaaaccctacactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgccgacgccactgcaacgcctccc 42928438  T
Q  438 caccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--cacacaacggaacact 535  Q
    ||||  | ||| || ||||||||||||| ||||| ||  | |||  |||||| | ||| || |||||||| || |||||||   |||||  |||||||      
T  42928439 cacccacatccgcctccaacaagaacatattcctaactgtgattgatttattaacagccaagtcatataggcgactaaaacggtcacacctcggaacatc 42928538  T
Q  536 accacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctca 635  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||||| || || || || || || ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  42928539 accgcaccaacaatcacgctaaaaatctgtttcagcaccgtcacccaccctcctcctaaaacacgccccaaaccagccctctccaccctcacctatccca 42928638  T
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42928639 tctctaaccctcactatctgcctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacatcatacctagccaccaacaccctac 42928738  T
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    |||| ||| |  |||||||   |||||| ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42928739 accataaagcttccctatctattaacaatcgccaacaccactttcccaacaaagcaatattaaactctctcaacctcctaacaccc 42928824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 140 - 821
Target Start/End: Original strand, 33169667 - 33170351
Alignment:
Q  140 tgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattt 239  Q
    ||||||||||  ||||||||| || || ||||||| ||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  33169667 tgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattt 33169766  T
Q  240 tgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgat 338  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||   | ||||||| || ||||| | ||||||||  ||     
T  33169767 tgatgtaacatg-ggtttttcctacgaagtcagcatatcatacacaccacgaaccgtatacccaccagtctgatctggtaaccaaagccacctgtcagaa 33169865  T
Q  339 tatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccccc 438  Q
     | |  ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||  || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  33169866 gaggaatcctgcaaagtaactgtaagtaataattccctacactcctctaccaactcgtcctcccaaacccacaagcggcgtcgccactgccacgcccccc 33169965  T
Q  439 -accatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacacacaa--cggaacact 535  Q
     |||| ||||||  ||||||  |||||||||||| ||| | |  ||||| ||||  |  |||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||| |    
T  33169966 caccaacctccaaacccaactggaacatgttcctaaccgtgacaactttgttgactgtcaaatcaaaaagccgtctaaatcgcacacaaaacggaacatt 33170065  T
Q  536 accacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctca 635  Q
     ||||||||||| || |||||||| || || || || || || || |||   ||||||||||    ||||||||| ||||| |  |||||  ||||| ||    
T  33170066 tccacaccaacaatcacgccaaaagtcagtctcagcaccgtctcccacctgtctcctaacacctgatgcaaaccaaccctctcatccctcttctatccca 33170165  T
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  33170166 tccctaatcctcactatctcccgccaccaagatgaacaactccggcccccatcctccaaaccaccatccgccgcaccatacctagccactaacaccctac 33170265  T
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
     |||||| ||| | || ||  ||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33170266 gccacaacccatctctctctactaacaacctccaacaccattttcctaacaaagcaatattaaactccctcaaactcctaacaccc 33170351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 30732549 - 30731765
Alignment:
Q  36 aatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccac 135  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||  | |||||||||||||| ||||    
T  30732549 aatgcaccaaaagttgtacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccac 30732450  T
Q  136 gttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccat 235  Q
    | | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| || |||| | ||||| | |||||| |||||||| || || || |||||    
T  30732449 gatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaagatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccat 30732350  T
Q  236 attttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgttt 335  Q
    ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| || | |   ||||  || ||||| | ||| |||| |    
T  30732349 attatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtct 30732250  T
Q  336 gatta-tgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc 434  Q
     || | || |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||||  | |||||    
T  30732249 -atcactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcc 30732151  T
Q  435 -ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgag-agctaaatcatatagccgtctaaaac--acacacaacgga 530  Q
     |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| | ||| ||  || ||| | || |||||||| |  |||||||  |||    
T  30732150 tccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgt-gagcagtcaagtcaaaaaggcgtctaaaccggacacacagagga 30732052  T
Q  531 acactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgccta 630  Q
    |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||     ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  30732051 acatctccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacatgtcccaaaccaaccctctccaccctcaccta 30731952  T
Q  631 tctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacac 730  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  30731951 tcccatctctaatcctcacaatctccctccaccatgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctagccactaatac 30731852  T
Q  731 cctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |   | ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  30731851 ctgtctccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 30731765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 778
Target Start/End: Original strand, 31641537 - 31642161
Alignment:
Q  156 gtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatgaacatgaggtt 255  Q
    ||||| || ||||||||||  |||| ||| | ||||||| ||||||| | |||||| ||| |||| || || |||||||| |||||||| |  ||||| |    
T  31641537 gtaggtaaccgatccctcagtagtctccatgcaaggatagaaacttt-agaggaacctgtgtatgccaaattaactccatgttttgatgtaagtgaggct 31641635  T
Q  256 gttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaaga 355  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||| || | |  ||||   || ||||| | ||| || | ||    || ||||||||| ||    
T  31641636 gctcctgtgatgtcagcatgtcatatgctccacgaacggaatatccatcatcctgagttggtaaccaaatccatctatctgtcactgattcctgcaatga 31641735  T
Q  356 gactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc-ccccaccatcctccaccccc 454  Q
     ||||||||||||||| || || ||||  ||||||  || ||||||||  |||| || || | |||||||  | ||||| |||||||  |||||||||||    
T  31641736 aactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcctccccaccgacctccaccccc 31641835  T
Q  455 aacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--cacacaacggaacactaccacaccaacagtctc 552  Q
    | ||||||||||||||| ||    |||  ||| || | ||  || ||||| || || ||||| |   ||||||| |||||| | ||||||||||| || |    
T  31641836 atcaagaacatgttcctaacagagattggtttgttcacagtcaagtcataaaggcgactaaaccggtcacacaaaggaacatttccacaccaacaatccc 31641935  T
Q  553 gccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactat 652  Q
    |||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  31641936 gccaaaaatctgtatctgcaccgtctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccaaccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcactat 31642035  T
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccaccccta 752  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||| |  || |     
T  31642036 ctcccgccaccatgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatatctagccaccaacacctttctccacaaagcttccttc 31642135  T
Q  753 tcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||   |||||||||||||||||||||    
T  31642136 tccaataacaaccgccaacaccattt 31642161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 724
Target Start/End: Original strand, 12825092 - 12825795
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||  | |||||||    
T  12825092 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacag 12825191  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  12825192 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatacatactttgagaggaacttgtttatgcca 12825291  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||||||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||| ||| || | |   ||||  || |||||     
T  12825292 aattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtgcagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 12825391  T
Q  324 aaccacctgtttgatta-tgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgc 422  Q
    | ||| |||| | || | || |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  ||||| |||||  |||| || || | ||||    
T  12825392 agccatctgtct-atcactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcatcccaagcccacaaccgcctacgc 12825490  T
Q  423 cactgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--a 519  Q
    |||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  |    
T  12825491 cacctcaacgcctccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagtcaagtcaaaaaggcgcctaaaccgga 12825590  T
Q  520 cacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccc 619  Q
    ||||||| ||||||   |||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||     ||||||| ||||| ||    
T  12825591 cacacaaaggaacatctccactccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacatgtcccaaaccaaccctctcc 12825690  T
Q  620 accctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccataccta 719  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  12825691 accctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactctgacccccatcctccaaactgccatcctccacaccataccta 12825790  T
Q  720 gccat 724  Q
    |||||    
T  12825791 gccat 12825795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 552 - 817
Target Start/End: Original strand, 23238807 - 23239072
Alignment:
Q  552 cgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaacta 651  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  23238807 cgccaaaaatcggtatccgtaccatctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccacccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacta 23238906  T
Q  652 tctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccct 751  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | | |||||||    ||||    
T  23238907 tctccctccaccacgacgaacaactccggcccccaacctccaaacctccatccgccacaccatacctagccactaacacctttctccacaaagattccct 23239006  T
Q  752 atcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
     ||   ||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  23239007 ctccaataacaaccgtcaacaccatttacccaacaaagcaatgttgaactccctcaatctcgtaac 23239072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 817
Target Start/End: Original strand, 42514129 - 42514409
Alignment:
Q  537 ccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcat 636  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  42514129 ccacaccaacaatcacgccagaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 42514228  T
Q  637 ctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctaca 736  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | |     
T  42514229 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaactgccatcctccacaccatacctagccactaacacctttct 42514328  T
Q  737 ccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    ||||||| || |||| ||   |||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  42514329 ccacaaagcatccctctctaataacaacctccaacacaatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 42514409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 520 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 28535423 - 28535160
Alignment:
Q  520 cacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccc 619  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||| || ||||||||||| || ||  | || || || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||    
T  28535423 cacacaaaggaacatctccacaccaacaatcccgccaaaaatctgtttctacaccgtctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccaaccctctcc 28535324  T
Q  620 accctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccataccta 719  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28535323 accctcacctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccatgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccataccta 28535224  T
Q  720 gccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttcccca 783  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| |  || | ||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28535223 gccaccaacacctttctccacaaagcttccttctccaataacaaccgccaacaccatttaccca 28535160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 667 - 821
Target Start/End: Original strand, 10780740 - 10780894
Alignment:
Q  667 aagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccg 766  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  10780740 aagagcaactccggcccccatcctccaaaccaccatccgccactccatacctagccaacaacaccctactccacaaacctcccctatcaactaacagccg 10780839  T
Q  767 ccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10780840 ccaacaccatttccccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcctcacaccc 10780894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 35984038 - 35983281
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || | |||||| ||    ||||| ||||| || |||| ||    
T  35984038 accattggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacaacttctacattcccacaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaag 35983939  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||  || | | |||||||||   ||| ||||| || |||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| ||| || | ||    
T  35983938 gtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgattcctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtgtaagcca 35983839  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||  || ||   |  |||||  || |||||     
T  35983838 aattaactccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgtacagagtacccaccatcctgatttggtaaccaa 35983739  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | | | || | ||    || |||||| || || ||||||||||||||| || || ||||  ||||||  ||||||||| |  |||| || || | |||||    
T  35983738 agctatctatctgtcactgattcctgtaatgaaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcctcctcctaagcccacaaccgcctacgcc 35983639  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--ac 520  Q
    ||  | ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||    |||  ||| || | ||  || |||||||| || |||||||   |    
T  35983638 acctcaacgcctccccaccctcatccacccccaacaagaacatattcctaacagagattggtttgttcacagtcaagtcatataggcgactaaaacggtc 35983539  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||||  ||||||   ||||||| ||| || ||||||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||    
T  35983538 acacataggaacatctccacacctacaatcacgccaaaaatccgtttctgcaccgtctcccaccctcctcctaacacaagatccaaaccaaccctctcca 35983439  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    || || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35983438 ccgtcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgcctcaccatacctag 35983339  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||| ||||||| | | ||||||| |  || | ||   |||||||||||||||||||||    
T  35983338 ccaccaacacctttctccacaaagcttccttctccaataacaaccgccaacaccattt 35983281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 552 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 27116889 - 27116624
Alignment:
Q  552 cgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaacta 651  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||||||    ||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| || |    
T  27116889 cgccaaaaatcagtatctacaccatctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccatccccctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacga 27116790  T
Q  652 tctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccct 751  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  |||||| | | ||||||  || ||      
T  27116789 tctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacgccatacctagccactaacacctttctccacaacgcatcctg 27116690  T
Q  752 atcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
     ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  27116689 ctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 27116624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 582 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 27165636 - 27165412
Alignment:
Q  582 accctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggc 681  Q
    ||||||||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27165636 accctcctcctgacacacagcgcaaacaacccctccccaccctcgcctatcccatctctaatcctcattatctccctccaccaagaagaacaacttcggc 27165537  T
Q  682 ccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccc 781  Q
    |||||||||               ||||| |||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27165536 ccccatcct---------------ccacaacatacctagccaccaacaccttacgcaacaacccttccctatctactaacaaccgccaacaccatttccc 27165452  T
Q  782 cagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27165451 cagcaatgcaatgttaaactttctcaacctcctaacaccc 27165412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Original strand, 23238277 - 23238547
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  23238277 accattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 23238376  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| | |||||| | |||||| ||    
T  23238377 ctaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctatttatgcca 23238476  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
     || ||||||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||    
T  23238477 aattaactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgttagcatatcatagactccacgtacag 23238547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 438
Target Start/End: Original strand, 24407995 - 24408235
Alignment:
Q  198 acttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagta 296  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  24407995 actttcaaaggtacctgtttatgccaaatcaactccatactttgatgtaacatg-ggttgttcctgcgatgtcaacatatcatacacaccacgaaccgta 24408093  T
Q  297 taacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcct 396  Q
    || ||   |||||||||||| ||||| | ||||||||  ||  | |  ||||||||||  ||||| |||||||  ||| |||||||  ||||||  || |    
T  24408094 tacccaccaatctgatccggtaaccaaagccacctgtcagaagaggaatcctgcaaagtaactgtaagtaatagttccctacactcctctaccaactctt 24408193  T
Q  397 cctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccccc 438  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  24408194 cctcccaagcccacaagcgacgacgccactaccacgcccccc 24408235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18090008 - 18089703
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||| || || |  |||| ||    
T  18090008 accaaaggccacaacgctccaaaaaccgggcaagacaaaaacagatgattcacgtcctcaacctgcccacatccagctaaacataatcgtgaatccatag 18089909  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    | | ||||||||| | ||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| || |||| | ||||| || || || ||||| || ||    
T  18089908 agacaatcccacgatttgccaaattttgcctagtaggtaaacgatctctcaatagtcgtcaagcaaagatagagactttcaacggtacctgtttgtgcca 18089809  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||||| |||||| |||| | | ||||||||||    ||||||||||||||| |||||||  || || || ||   | |||||||||||||||||    
T  18089808 aattaactccaaattttgttgaataaggggttgttcctacactgtcaacatgtcatacacaccacagaccgtgtacccgccactctgatccggcaaccac 18089709  T
Q  324 aaccac 329  Q
    | ||||    
T  18089708 agccac 18089703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28535922 - 28535666
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||| || |  ||||| | | | || |||| ||    
T  28535922 accattggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatctgcgcctccaaag 28535823  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| | |||||| ||| |||| ||    
T  28535822 gtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgcca 28535723  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcata 280  Q
     || |||||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  28535722 aattaactccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcata 28535666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 8227919 - 8228133
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  8227919 accattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctcacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 8228018  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||  |||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  8228019 gtaaaatgtcacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtca 8228118  T
Q  224 gatgaactccatatt 238  Q
     || |||||||||||    
T  8228119 aattaactccatatt 8228133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Original strand, 42513613 - 42513883
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | |||||||    
T  42513613 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaaaaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacag 42513712  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    |||||||  |||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  42513713 atagaatgtcacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgcca 42513812  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
     || || |||| ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  42513813 aattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacag 42513883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 298
Target Start/End: Original strand, 26072913 - 26073059
Alignment:
Q  152 tttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatgaacatga 251  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||  || ||||   ||||| |||||||| | |||||| || || ||||||| ||||||||| | |||     
T  26072913 tttagtaggtaatcgatccctcaacagtcgccaaacaaagatagggactttcaaaggaacatatttatgccaaattaactccaaattttgatgcaaatgg 26073012  T
Q  252 ggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtata 298  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||| |||||||| || |||||    
T  26073013 ggctgttcctgcgatgtcagcaagtcatacacaccacggaccgtata 26073059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12820196 - 12820035
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||  | |||||||    
T  12820196 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagagacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacag 12820097  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaa 185  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  12820096 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcataagtcgccaa 12820035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27166192 - 27165931
Alignment:
Q  31 gccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaat 130  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||| |||||| | || |  ||||| ||| | ||||||| ||  |||||    
T  27166192 gccacaacgcgccgaaagttggacaagacagaaacaaatgagtcgaatcctcaacatgcccataaccagccacacacaactgcgcttccaaaggaagaat 27166093  T
Q  131 cccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaac 230  Q
     |||||   ||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||| |  |||||||   | |||| | ||||||| ||| || ||||  || || || ||     
T  27166092 tccacgacttgccaaatttgcttttataggtaaacgatccttcagcgttcgccaaacgaagatagagacttttagaggtacctgttggtgccaaattaat 27165993  T
Q  231 tccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaac 292  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27165992 tccatattttgatgtaaattgggttgttcctgtgatgccaacatgtcataaacaccacgaac 27165931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19255355 - 19255282
Alignment:
Q  39 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  19255355 gcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccg 19255282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 653 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 22094865 - 22094716
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccaccccta 752  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    || | ||||| | ||| |  || || ||| |||| ||||||||||||    
T  22094865 ctcccgccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaacctcccacaaacctcgccataacgagcgactaaaactctataccaaaaaccaccccta 22094766  T
Q  753 tcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactc 802  Q
    ||  |||||| || ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22094765 tccactaacatcctccaacaccacttccctagtaaagcaatattaaactc 22094716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27117408 - 27117194
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| || | |||||| || |  ||||| |||||  | |||| ||    
T  27117408 accatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattcccacagccagaaacacataaccgctcctccatag 27117309  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||   ||| || || || || |||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  27117308 atagaatgccacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 27117209  T
Q  224 gatgaactccatatt 238  Q
     || || ||||||||    
T  27117208 aattaagtccatatt 27117194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Original strand, 3418676 - 3418734
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttc 82  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3418676 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttc 3418734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 750 - 817
Target Start/End: Original strand, 38358089 - 38358156
Alignment:
Q  750 ctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  38358089 ctatcaactaacatcctccaacaccatttacctagtaaagcaatattaaactccttcaatctcctaac 38358156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 778
Target Start/End: Original strand, 41590627 - 41590746
Alignment:
Q  659 ccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatct 758  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||| || |||| |  |||||| || |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||  || ||| ||| |     
T  41590627 ccaccaagaagaacctctccggcccccaaccgccaacctcccatcctcctcaccatacctcgccaccaacaccctataccataaagtactcctctcaacc 41590726  T
Q  759 aacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41590727 aacaaacgccaacaccattt 41590746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 634 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 15862311 - 15862206
Alignment:
Q  634 catctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccct 733  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||  | |||||||| |  |||||| ||||||| |  ||| || |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15862311 catctctaatcctagccacctccctccaccaatacgaacaactccatcccccaacctccaaccgcccagcctcttcaccatacctagcaatcaacaccct 15862212  T
Q  734 acacca 739  Q
    | ||||    
T  15862211 atacca 15862206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 19890571 - 19891370
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||| || || ||||  ||| | ||||||     
T  19890571 accatagacaacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgagtcgtatcttcaacatgcccacatcctgtgacgcaaattcgatcctccacaa 19890670  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||  ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||  ||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19890671 atgtaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgatccctcaacaaccgcaatgcaaggatggaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 19890770  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  19890771 gattaactccatattttgatgaacatgaggttattcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctctaatctgatccgataaccac 19890870  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | |||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  19890871 atccacctgtctgtttctaattcctgcaaagagactgttagtaataaatccccacactcttctaccaggtcctcctcccacacccataaatgacgtcgcc 19890970  T
Q  424 actgccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaa--acaca 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||   | ||    
T  19890971 actgccacgccccccaccatcctccacccccaaccagaacatgttcctcacaatgattactttattgacagctagatcgtatagccgcctaaatcgcgca 19891070  T
Q  522 cacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccac 621  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  19891071 cacagcggaacactaccacaccaacaatctcacaaaaaatcgatttcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgcaaaccaaccttcctcac 19891170  T
Q  622 cctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagc 721  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19891171 cctcgcttatcccatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatctgccacaccatacctagc 19891270  T
Q  722 catcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19891271 caccaacaccctacgccacaaaccaaccctatcaactaacaatcgccaacaccatttcctcaacaatgcaaagttaaactctctcaacctcctaacaccc 19891370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 48570286 - 48569486
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||||||| || ||||| || |  ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||  |    
T  48570286 accataggccataaagcaccgaagaaaggacaagtcaaaaacatatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcg 48570187  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| || || | || || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||   ||||||||| ||| |  ||||| ||  |    
T  48570186 gtaaaatgccgcgatttgtcagattagctttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgctaagcaaggactgaaacttttagaggtatctgtttgtgcta 48570087  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||||| ||||||    
T  48570086 gattaactccatattttgatgaatatgaggttgttcatgtgatgtcaacaagtcatataccccacgaacagtatagccaccaatcggatccggtaaccac 48569987  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| ||||  |  |  | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48569986 acccatctgtcagtatcggattcctgcaaagagactgttagtagtaaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccacacccataaacggcgacgcc 48569887  T
Q  424 actgccacgc-cccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacac-- 520  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||  ||||| ||||| || ||  |||| | |      
T  48569886 actgccacgctcccccaccatcctcaacccccaacaagaacatgttccttaccgtgattgctttattgacggctaagtcataaagacgcataaagcgctc 48569787  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  48569786 acacaacagaacactaccacaccaacaatcttgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaaccctcccca 48569687  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48569686 ccctcacctatcccatctctaatcctgactatctccctctaccacgaagaacagcttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 48569587  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 820  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48569586 ccaccaacaccctacgccacaacccatctctatcaactaacaaccgccaacaccatttctctagcaaagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 48569487  T
Q  821 c 821  Q
    |    
T  48569486 c 48569486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 401 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 12342124 - 12341702
Alignment:
Q  401 ccatacccataaacgacgacgccactgccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||  |||  |||| |||||| ||| ||||||||    
T  12342124 ccatacccataaacgacgacgccactgccacgccccccatcaccctccacacccaacaaaaacatgttctgcactgtaataactttagtgacagctaaat 12342025  T
Q  501 catatagccgtctaaaac--acacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacaca 598  Q
    |||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12342024 cataaagctgcctaaaacgcacacacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaattggtatcagctccatcccccaccctcctcttaacaca 12341925  T
Q  599 acctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaacca 698  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12341924 acctgtaaaccagccctccccaccctcacctatcccatctctaatcctaacaatctccctccaccacgaagagcaactccggcccccatcctccaaacca 12341825  T
Q  699 ccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaa 798  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  12341824 ccatcctccacgccatacctagccaacaacaccctactccacaaacctcccctatcaactaacagccgccaacaccatttccccaacaaagcaatgttaa 12341725  T
Q  799 actctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  12341724 actctctcaacctcctcacaccc 12341702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 24 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29523992 - 29523578
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29523992 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaagaataaatgattcacatctttaacctgcctgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 29523893  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  29523892 ctataatcccacgtgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 29523793  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  29523792 aattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataaccagaaatctgatccgacaaccac 29523693  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    |||||||| | || || | ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29523692 aaccacctatctgtttctatttcctgcaaagtaactgtcagtaataaatccctacactctactagcaattcctcctcccatacccataaacaacgacgcc 29523593  T
Q  424 actgccacgcccccc 438  Q
    |||||||||||||||    
T  29523592 actgccacgcccccc 29523578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 24 - 371
Target Start/End: Original strand, 33496440 - 33496787
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  33496440 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgtccgcatcccattacacaaaaccgattttccacag 33496539  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  33496540 atataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaatgatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 33496639  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||| |||||||    
T  33496640 aattaactccatatattgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccatgaacagtataaccagaaatctaatccgacaaccac 33496739  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaa 371  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33496740 aaccacctgtctgtttctgtttcctgcaaagagactgtcagtaataaa 33496787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 372
Target Start/End: Original strand, 11203712 - 11204061
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11203712 accaaaggccacaatgaaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 11203811  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11203812 ctataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagtatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 11203911  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11203912 aattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaaatcatatacaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccac 11204011  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagac-tgttagtaataaat 372  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  11204012 atccacctgtctgtttctgtttcctgcaaagtgacatgtcagtaataaat 11204061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 24 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12342472 - 12342143
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12342472 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagagaagaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 12342373  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  12342372 ctataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaa-gaacctgtttatgcca 12342274  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12342273 aattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccatgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccac 12342174  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaag 354  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  12342173 aaccacctatttgtttctgtttcctgcaaag 12342143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35214618 - 35214334
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35214618 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaagaacaaatgattcacatcttcaacatgccaacatcccgttacacaaaactgagcttccacat 35214519  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  35214518 atagaatcccacgttctggcaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacatccgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 35214419  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgat 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35214418 gattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccgtgatgttaacatgt----tacaccacgaacagtataacctctaatatgat 35214334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 34333062 - 34332266
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  34333062 accattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 34332963  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||  ||| |||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  34332962 gtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaatcgatctctcagaagttgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 34332863  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||||||||| ||||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||   |  |||||  || |||||     
T  34332862 aattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgtacataatacccaccatcctgattaggtaaccaa 34332763  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| |||   || |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||    
T  34332762 agccatctgtctgacactgattcctgcaaagaaactgttagtaataaaaccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgcc 34332663  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--ac 520  Q
    || || ||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||    |||  |||  | | |   || ||| | || || ||||| |  ||    
T  34332662 accgcaacgcctccccacccatgtccacccccaacaagaacatattcctaactgagattgatttgataacattcaagtcaaaaaggcgcctaaaccggac 34332563  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||||  |||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |  || || ||||| || |||||||||||||||||     ||||||| ||||| |||    
T  34332562 acacagtggaacatttccacaccaacgatcacgccaaaaatctgagtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacacgtcccaaaccatccctctcca 34332463  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34332462 ccctcacctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactcccgcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctag 34332363  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||  |||||| | | ||||||| |  |||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34332362 ccactaacacctttctccacaaagcctccctctccaataacaaccgccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactctctcaacctcgtaac 34332266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 817
Target Start/End: Original strand, 2364170 - 2364966
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | |||||||    
T  2364170 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacag 2364269  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  2364270 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgcca 2364369  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||||||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| || | |   ||||  || |||||     
T  2364370 aattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 2364469  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| | |   || |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||    
T  2364470 agccatctgtctaacactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgcc 2364569  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacac 522  Q
    ||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  ||    
T  2364570 acctcaacgcctccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagtcaagtcaaaaaggcgcctaaaccggac 2364669  T
Q  523 acaacg--gaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||| |  |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||    
T  2364670 acaaagaggaacatcaccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctcca 2364769  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2364770 ccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctag 2364869  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||  |||||| | | ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  2364870 ccactaacacctttctccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 2364966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 140 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 963294 - 962610
Alignment:
Q  140 tgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattt 239  Q
    ||||||||||  ||||||||| || || ||||||| ||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  963294 tgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattt 963195  T
Q  240 tgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgat 338  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||   | ||||||| || ||||| | ||||||||  ||     
T  963194 tgatgtaacatg-ggttgttcctgcgaagtcagcatatcatacacaccacgaaccgtatacccaccagtctgatctggtaaccaaagccacctgtcagaa 963096  T
Q  339 tatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccccc 438  Q
     | |  ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||  || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  963095 gaggaatcctgcaaagtaactgtaagtaataattccctacactcctctaccaattcttcctcccaaacccacaagcggcgacgccactgccacgcccccc 962996  T
Q  439 -accatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacacacaa--cggaacact 535  Q
     |||| ||||||  ||||||  |||||||||||| | | | |  ||||| ||||  |  |||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||| |    
T  962995 caccaacctccaaacccaactggaacatgttcctaatcgtgacaactttgttgactgtcaaatcaaaaagccgtctaaatcgcacacaaaacggaacatt 962896  T
Q  536 accacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctca 635  Q
     ||||||||||| || |||||| | || || || || || || || |||   ||||||||||    ||||||||| ||||  || |||||  ||||| ||    
T  962895 tccacaccaacaatcacgccaacagtcagtctcagcaccgtctcccacctgtctcctaacacctgatgcaaaccaaccctatcctccctcttctatccca 962796  T
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  962795 tccctaatcctcactatctccctccaccaagatgaacaactccgacccccatcctccaaaccaccatccgccccaccatacctagccactaacaccctac 962696  T
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
     |||||| ||| | || ||  ||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  962695 gccacaacccatctctctctactaacaacctccaacaccattttcctaacaaagcaatattaaactccctcaaactcctaacaccc 962610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 17098115 - 17097488
Alignment:
Q  32 ccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatc 131  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||  | |  | ||| ||||| || |||| ||| | ||||    
T  17098115 ccacaacgcaccaaaagatggacaagatagaaacagatgattcaagtcctcaacatgcccacacacggcgatacacaaccgtgcctccatagaaataatc 17098016  T
Q  132 ccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaact 231  Q
    ||||| | ||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||| || |||| | ||||| | |    | |||||||| || || ||||    
T  17098015 ccacggtttgccaaattttctttagtaggtaaccgatccatcaacagtcgctaagcaaagatagagactttcacatatgcctgtttatgccaaattaact 17097916  T
Q  232 ccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacct 331  Q
    ||| ||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| || || || ||   | ||||||| || ||||| | ||||||    
T  17097915 ccacattttgatgtaaatggggttgttcatgcgatgtcaacaagtcatacacaccacggaccgtgtacccaccagtctgatcaggtaaccaaagccacct 17097816  T
Q  332 gtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccac 431  Q
    ||| ||  | |  || |||||||  ||||| |||||||  | | |||||||  ||||||  || || || ||  |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  17097815 gttagaagaagagtcatgcaaagtaactgtgagtaatagtttcctacactcctctaccaactcttcttctcaagcccacaaacgacggcgccactaccac 17097716  T
Q  432 gccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaa--cacacacaacgg 529  Q
    ||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  17097715 gccccctgccaacctccaaacccaacaagaacatgttccttaccgtgactactttgttgacagccaaatcatatagccgtctaaaacgctcacacaacgg 17097616  T
Q  530 aacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcct 629  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17097615 aacattaccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatcagctccgtcccccacccgtctcctaacacacgacacaaaccacccctccccaccctcgcct 17097516  T
Q  630 atctcatctctaatcctaactatctccc 657  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  17097515 atcccatctctaattctcactatctccc 17097488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 697
Target Start/End: Original strand, 15312855 - 15313151
Alignment:
Q  405 acccataaacgacgacgccactgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcat 503  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||| || ||||    
T  15312855 acccacaaacgacggcgccactgccacgcctcccctccaacctccacacccaacaagaacatgttccttaccgtgactactttgttgacagccaattcat 15312954  T
Q  504 atagccgtctaaaacac--acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctc-ctcctaacacaac 600  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||      
T  15312955 atagtcgtctaaaacgctcacacaacggaacattaccacaccaactatcacaccaaaaatcagtatcggctccatcccccaccctttctcctaacacacg 15313054  T
Q  601 ctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaacc 697  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  15313055 acgcaaaccatccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctcactatcttccgccatcaagaagaacaactccaacccccatcctccaaacc 15313151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36801322 - 36801106
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  36801322 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgatttacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacag 36801223  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| |||| ||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |    
T  36801222 atataatctcacatgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcagcagttgccaagcaaggatataaacttttaagggaacctatttatgcta 36801123  T
Q  224 gatgaactccatatttt 240  Q
     || |||||||||||||    
T  36801122 aattaactccatatttt 36801106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 228 - 821
Target Start/End: Original strand, 3140949 - 3141544
Alignment:
Q  228 aactccatattttgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaac 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||   | ||| |||||| ||||| | |    
T  3140949 aactccatattttgatgtaacatg-ggttgttcctgcgatgtgaacatatcatacacaccacgaaacgtatacccaccagtctaatccggtaaccaaagc 3141047  T
Q  327 cacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccact 426  Q
    ||||||   ||  | |  ||||||||||  ||||| |||||||  ||| |||||||  ||||||  || |||||||| || || || || | ||||||||    
T  3141048 cacctgccagaagaggaatcctgcaaagtaactgtaagtaatagttccctacactcctctaccaactcttcctcccaaactcacaagcggcaacgccact 3141147  T
Q  427 gccacgccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacacacaa 526  Q
    |||||  ||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||| ||  | |  ||||| ||||  |  |||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  3141148 gccacatcccccaccaacctccaaacccaactggaacatgttcctaactgtgacaactttgttgactgtcaaatcaaagagccgtctaaatcgcacacaa 3141247  T
Q  527 c--ggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccct 624  Q
       |||||| | ||||||||||| || |||||||| || || || || || || || |||   ||||||||||    ||||||||| ||||| |  ||||    
T  3141248 aatggaacatttccacaccaacaatcacgccaaaactcagtctcagcaccgtctcccacctgtctcctaacacccaatgcaaaccaaccctctctgccct 3141347  T
Q  625 cgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccat 724  Q
    | |||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  3141348 ctcctatcccatctctagtcctcactatctcccgccaccaagatgaacaattccggcccccatcctccaaatcaccatccgccgcaccatacctagccac 3141447  T
Q  725 caacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
     |||||||||| |||||| ||| | || ||  ||||||||| |||||||||||| || |  | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3141448 taacaccctacgccacaacccatctctctctactaacaacctccaacaccattttcctaacaaagcagtgttaaactccctcaatctcctaacaccc 3141544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 537 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 10323302 - 10323032
Alignment:
Q  537 ccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcat 636  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  10323302 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 10323203  T
Q  637 ctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctaca 736  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | |     
T  10323202 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaataactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctagccactaacacctttct 10323103  T
Q  737 ccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctca 807  Q
    ||||||| || |||| ||    ||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  10323102 ccacaaagcatccctctccaacaacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctca 10323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7031264 - 7031055
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  7031264 accagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacag 7031165  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  7031164 ctaaaatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagacgccaagcaaggatagaaagttttaaaggaacctgtttatgcca 7031065  T
Q  224 gatgaactcc 233  Q
     || ||||||    
T  7031064 aattaactcc 7031055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 19919960 - 19919680
Alignment:
Q  537 ccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaac-ctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctca 635  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  19919960 ccacaccagcaatcacgccaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacaagtctg-aaaccaaccctcacctccctcacctatccca 19919862  T
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||   |    
T  19919861 tctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgtcatcctccacaccatacctagccactaacacctgtc 19919762  T
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
     ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  |  |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19919761 tccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttgcccaacaaggcaatgttaaactccctcaacctcttaac 19919680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 500 - 817
Target Start/End: Original strand, 16179317 - 16179636
Alignment:
Q  500 tcatatagccgtctaaaacaca--cacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacac 597  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||| | ||| ||||||  || ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||    
T  16179317 tcatatagacgtctaaaacgcaaacacaaaggaacaattccataccaactatcgcgccaaaaatcagtattggatccatcccccaccctcctactaacac 16179416  T
Q  598 aacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaacc 697  Q
    |     ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16179417 acgacacaaaccatctctccccaccctcgcctatcccatctctaatcctcacaatctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaaacc 16179516  T
Q  698 accatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgtta 797  Q
     ||| |  | ||||||||||| ||||  |||||| ||| |||||| ||  | || ||  ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |  |||    
T  16179517 tccaccgtctacaccatacctcgccactaacaccttacgccacaacccttcactctctactaacaacctccaacaccatttccccaacaaagcgacatta 16179616  T
Q  798 aactctctcaatctcctaac 817  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  16179617 aactccctcaacctcctaac 16179636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 433 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 29523558 - 29523379
Alignment:
Q  433 ccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--acacacaacgga 530  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  29523558 ccccccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacgga 29523459  T
Q  531 acactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaacca 610  Q
     |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  29523458 gcactaccacaccaacaatctcgcaacaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcttaacacaacatgtaaacca 29523379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26771230 - 26770968
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaa 129  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||| |  | |||| ||  |  |    
T  26771230 ggccataaggcactaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgcccacaaccagtgacacacaactgcacctccaaaggaatga 26771131  T
Q  130 tcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaa 229  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| | |||| | |||||||| || || ||    
T  26771130 taccacggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaacgatccctcaaaagccgccaagtaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccacattaa 26771031  T
Q  230 ctccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaac 292  Q
    |||||||||| |||| |  | ||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  26771030 ctccatatttggatgtaactaaggatgttcctgtaatgttagcatgtcatacacaccacgaac 26770968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 536 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20531782 - 20531515
Alignment:
Q  536 accacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctca 635  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || || || || ||||| ||||||||||| |||||  | |||||| | ||||| |||    | |||| | ||    
T  20531782 accacaccaacagtcacgccaaaaataagtttcagccccgtcccccaccctcctcctgacacaggccgcaaactacccctcaccatttccccctacc-ca 20531684  T
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | ||||||| |||    
T  20531683 tatctaattctcactatctccctccaccaagaagaataactccaacccccatcttccaaacctccatcctccgcagcatacctagctaccaacaccttac 20531584  T
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctc 804  Q
     |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||    
T  20531583 gccacaaaccttccctatcaattaacaaacgccaacaccatttccccaataatgcggtgttaaactctc 20531515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40930775 - 40930505
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| || |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  40930775 accattggccataaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcgacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 40930676  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||  ||||| | |||||||||   ||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  40930675 gtaaaaggccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatccctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtca 40930576  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
     |  |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  40930575 aactaactccatgttttgatgcaactgaggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacag 40930505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Original strand, 7312681 - 7312939
Alignment:
Q  36 aatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccac 135  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||||| |||  | |||||||| ||||| ||||    
T  7312681 aatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacaaagccgctcctccacagacagaatgccac 7312780  T
Q  136 gttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccat 235  Q
    | | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| || || || |||||    
T  7312781 gatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaagtccat 7312880  T
Q  236 attttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
    ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  7312881 attatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacag 7312939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 333
Target Start/End: Original strand, 2755851 - 2756044
Alignment:
Q  140 tgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattt 239  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||||| ||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  2755851 tgccaaattttatttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaatatagacactttcaaaggtacctgtttgtgccaaatcaactccatattt 2755950  T
Q  240 tgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgt 333  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||   | |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  2755951 tgatgtaacatg-ggttgttcctgcgatgtcaacatatcatacacaccacgaatcgtatacccaccagtctgatccggtaaccaaagccacctgt 2756044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19920476 - 19920206
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    ||||||| || | ||||||||| |  ||||| |||||  | |||||||    
T  19920476 accatcggccataatgcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgagaagcatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacag 19920377  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| || || | | |||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  19920376 atagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 19920277  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
     || || |||||||  || || |  || || |  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19920276 aattaagtccatatgatggtgtaactggggcttctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 19920206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10323818 - 10323553
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | ||| |||    
T  10323818 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcatccccag 10323719  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| |||||   |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  10323718 atagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgcca 10323619  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 289  Q
     || || |||||| | || || |  || || || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  10323618 aattaagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacg 10323553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 11310442 - 11310382
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaa 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11310442 accataggccacagtgcgccaaaatttgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaa 11310382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 288
Target Start/End: Original strand, 15312604 - 15312740
Alignment:
Q  152 tttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatgaacatga 251  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||| | |||     
T  15312604 tttaataggcaaacgattcctcagcagtcaccaagcaaatatatagacttttagaggtacctgtttatgccaaattaactccaaattttgatgtaaatgg 15312703  T
Q  252 ggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccac 288  Q
    |  |||||||| |||||||  | |||||| |||||||    
T  15312704 gtatgttcctgcgatgtcagtaagtcatacacaccac 15312740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 22734352 - 22734192
Alignment:
Q  639 ctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacacc 738  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||| |  | || |||||||||| ||     
T  22734352 ctaatcttcactatctctttccaccacatggaacaactccggcccccatcctccaacctaccatgcaccgcaccatatcgtgtcaacaacaccctataca 22734253  T
Q  739 acaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaa 799  Q
    ||| || ||| |||||  ||||||||  |||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  22734252 acagactacctctatcgactaacaactaccaacaccatttacctagtaaagcaatattaaa 22734192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 659 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 52250733 - 52250612
Alignment:
Q  659 ccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatct 758  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |  |||||| || ||||||| || |||| |||||||||| |||| |||| |||| | ||  |     
T  52250733 ccaccaagaagaaccactccggcccccaacctccaacctcccatcctcctcaccatatctcgccaccaacaccctataccataaactaccc-tctccacc 52250635  T
Q  759 aacaaccgccaacaccatttccc 781  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  52250634 aacaaacgccaacaccatttccc 52250612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 767 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 19652258 - 19652211
Alignment:
Q  767 ccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcct 814  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19652258 ccaacaccatttagccagaagagcaatgttaaactctttcaatctcct 19652211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20532179 - 20532028
Alignment:
Q  141 gccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatatttt 240  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||| | | ||||||||||| ||  ||| | ||||| ||| | || |  ||||| || || || ||||||||||    
T  20532179 gccaaatttgattttgtaggtaatcgttccattagcagtcgccaaggaaaaataaatactttcaaatggaccttcttatgccaaattaattccatatttt 20532080  T
Q  241 gatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaac 292  Q
    |||| | |||||| || || || ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20532079 gatgtaaatgaggatgctcatgggatgtcagcatgtcataaacaccacgaac 20532028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 5342827 - 5342786
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  5342827 ctccctccaccacgaagaaccactccggcccctatcctccaa 5342786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 742
Target Start/End: Original strand, 8130476 - 8130565
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaa 742  Q
    |||| |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||| |  |||||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  8130476 ctccttccaccaaaaagaaccactccggcccccaacctccaacctcccatcacgcacaccatacctagcaaccaacaccctataccacaa 8130565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 21740138 - 21740097
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21740138 ctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctccaa 21740097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 40415639 - 40415672
Alignment:
Q  397 cctcccatacccataaacgacgacgccactgcca 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40415639 cctcccatgcccataaacgacgacgccactgcca 40415672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 778
Target Start/End: Original strand, 44888429 - 44888554
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccaccccta 752  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| || ||| || || |||| |  |||||| || ||||||| |  |||| |||||||||| |||||| || |||| ||    
T  44888429 ctccttccaccacgaagaaacactccgaccctcaaccaccaacctcccatcctcctcaccataacgcgccaccaacaccctataccacatactaccctta 44888528  T
Q  753 tcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  44888529 tcaactaataacctccaacaccattt 44888554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 666
Target Start/End: Original strand, 43388260 - 43388903
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43388260 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcctgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 43388359  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43388360 ctataatcccacgttccaccaattttgatttagtaggtaaacgatccctcaacaatcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 43388459  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  43388460 aattaactccatattttgatgaacatgaagttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccac 43388559  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43388560 atccacctgtctgtttctgtttcctgcaaagtgactgtcagtaataaatccctacactctactagcaattcctcctcccatacccataaacgacgacgtc 43388659  T
Q  424 actgccacg-ccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacac 522  Q
    ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  43388660 actaccacgcccccccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttcctcactgaaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcac 43388759  T
Q  523 acaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccacc 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43388760 acaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcagcatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacttgtaaaccagccctccccacc 43388859  T
Q  623 ctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacg 666  Q
     || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43388860 atcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacg 43388903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 24 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16918056 - 16917608
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||    
T  16918056 accagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccattacacaaaaccggttttccgcag 16917957  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16917956 ctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 16917857  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  16917856 aattaactccatattttgatgaacaagaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccac 16917757  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||||||||  | || || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16917756 atccacctgtcagtttctgattcctgcaaagtgactgtcagtaataaatccctacactctactaacaattccttctcccatacccataaacgacgacgcc 16917657  T
Q  424 actgccacgccccccaccat---cctccacccccaacaagaacatgttcc 470  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16917656 actgccacgcccccc-ccatctccctccacccccaacaaaaacatgttcc 16917608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37191457 - 37191069
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  37191457 accataggccataatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaatcgatcctccacag 37191358  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||  ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||    
T  37191357 atgtaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgatctctcaacagccgccaagcaaggatataaacttttaaatgaaccagtttatgcca 37191258  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37191257 gattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcatgtgatgtcaacatgtcatatacaccacagacattataacctctaatctgatccggtaaccac 37191158  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataa 412  Q
    |  ||||| | || || || |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||    
T  37191157 attcacctatctgtttttgattcctgcaaaaagactgttagtaataaattcttacactcttccacgaggtcctcctcccacacccataa 37191069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 39 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 47623307 - 47622527
Alignment:
Q  39 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgtt 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |  ||||||  |||  | |||| ||  | |||  |||| |    
T  47623307 gcaccaaaaaatgggcaagacagaaacaagtgattcacatcttcatcatgcccacaaccagaaacacaa--ccgcccctccataggaataatgtcacggt 47623210  T
Q  139 ctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatatt 238  Q
     ||||||||||   || ||||| || || |||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||| | ||| || |||||||| || || || |||||||     
T  47623209 ttgccaaatttcccttcgtaggtaagcggtccctcaaaagccgccaagcaagaatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaattccatata 47623110  T
Q  239 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgat 338  Q
    |  ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || | ||| ||      ||||||||  |||||||||||||| | |||     
T  47623109 tgaatgtaactgaggttgttcctgtgatgtcagcatgtcatacaccccatggactgaatacccgcctccctgatccgataaccacaaccacctatctgac 47623010  T
Q  339 tatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccc-c 437  Q
     | | |||||||||| |  |||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| || | |    
T  47623009 aaagattcctgcaaaaaagctgtcagtaataaagccttacactcctctaccaggtcctcctcccacgcccataaccgacgacgccactaccacacctcac 47622910  T
Q  438 caccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacacac--aacggaacact 535  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  || | | | | |||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||| | | |||  |||||||||      
T  47622909 caccaacctccacccccaacaaaaacatagtcataatcgtgattactttgttgacggccaaattatatagccgtctaaagcgctcacgaaacggaacatc 47622810  T
Q  536 accacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctca 635  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| |||||  |||| ||    
T  47622809 accacaccaacaatcccgccaaaaatcagtatcggaaccatcccccaccctcctcctaacacaatccgaaaaccaaccctccccatcctcgtttatccca 47622710  T
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctac 735  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  47622709 tctctaatcctcactatctctctccaccaagaagaacaactccggcccctatcctccaaacctccatccaccacaccatacctagccaccaacaccttac 47622610  T
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaaca 818  Q
      || || ||  |||||||| ||||||| || ||||| ||||| || |  || || || |||||||||| ||| |||||||||    
T  47622609 gtcataacccttccctatcaactaacaaacgtcaacatcattttcctaacagggctatattaaactctcccaacctcctaaca 47622527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 802
Target Start/End: Original strand, 6050496 - 6051277
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | |||||||    
T  6050496 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcagaaccgctcctccacag 6050595  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||  | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  6050596 atagaatgccacaatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgcca 6050695  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||| ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| || | |   ||||  || |||||     
T  6050696 aattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 6050795  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| | |   ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||    
T  6050796 agccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgcc 6050895  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacac 522  Q
    ||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  ||    
T  6050896 acctcaacgcctccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagtcaagtcaaaaaggcgcctaaaccggac 6050995  T
Q  523 acaacg--gaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||| |  |||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||    
T  6050996 acaaagaggaacatctccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctcca 6051095  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6051096 ccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctag 6051195  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactc 802  Q
    |||  |||||| | | ||||||| || |||  ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  6051196 ccactaacacctttctccacaaagcatcccgctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactc 6051277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 698
Target Start/End: Original strand, 35540942 - 35541619
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || || ||  | |||||||    
T  35540942 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataatcgttcctccacag 35541041  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| || || || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  35541042 atagaatgccacgatttgccaaattatgttttgtgggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgcca 35541141  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||||||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| || | |   ||||  || |||||     
T  35541142 aattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 35541241  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| | |   || |||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || |||||||    
T  35541242 agccatctgtctaacactgattcctgcaaaaaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgccgacgcc 35541341  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacac 522  Q
    ||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  ||    
T  35541342 acctcaacgcctccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagacaagtcaaaaaggcgcctaaaccggac 35541441  T
Q  523 acaacg--gaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||| |  |||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||    
T  35541442 acaaagaggaacatctccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctcgcca 35541541  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaacca 698  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35541542 ccctcacctatcccatctctaatcctcacgatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccacacca 35541619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 11909352 - 11908705
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| | |||  | |||||||    
T  11909352 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacatagccgctcctccacag 11909253  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| || |||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  11909252 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaatgatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 11909153  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||||||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| | || ||| || | |   ||||  || |||||     
T  11909152 aattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtatagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 11909053  T
Q  324 aaccacctgtttgatta-tgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgc 422  Q
    | ||| |||| | || | || |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | ||||    
T  11909052 agccatctgtct-atcactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgc 11908954  T
Q  423 cactgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaac--a 519  Q
    |||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  |    
T  11908953 cacctcaacgcctccccgcccacatccacccccatcatgaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagtcaagtcaaaaaggcgcctaaaccgga 11908854  T
Q  520 cacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccc 619  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||     ||||||| ||||| ||    
T  11908853 cacacaaaggaacatctccacaccaacaatcacgtcaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacatgtcccaaaccaaccctctcc 11908754  T
Q  620 accctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaa 668  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11908753 accctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaa 11908705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Original strand, 51052373 - 51052643
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||  | |||||||    
T  51052373 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacag 51052472  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  51052473 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 51052572  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
     || || |||||||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  51052573 aattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacag 51052643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 51993975 - 51993891
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaa 108  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51993975 accataggccacaaagcaccgaagaatggacaagacaaaatcaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaa 51993891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 457
Target Start/End: Original strand, 2491285 - 2491539
Alignment:
Q  204 aaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacct 302  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||     
T  2491285 aaaggtacctgtttgtgccagatcaactccataatttgatgtaacatg-ggttgttcctgcgaggtcaacatatcatataccccacgaaccgtatacccg 2491383  T
Q  303 ttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctccc 402  Q
      | || ||||||| ||||| |  |||||||  ||  | |  || |||||||  ||||| |||||||   || |||||||  ||||||  || |||||||    
T  2491384 ccagtcggatccggtaaccaaagtcacctgtcagaagaggaatcttgcaaagtaactgtaagtaatagtaccctacactcctctaccaactcttcctccc 2491483  T
Q  403 atacccataaacgacgacgccactgccacg-ccccccaccatcctccacccccaac 457  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  2491484 aagcccacaaacgacgacgccactgccacgcccccccaccagcctccacacccaac 2491539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 653 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 22191397 - 22191272
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccaccccta 752  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||| |  |||||| || ||||||| |  |||| |||||||||| |||||| || |||| ||    
T  22191397 ctccttccaccacgaagaaacactccggcccccaaccaccaacctcccatcctcctcaccataacacgccaccaacaccctataccacatactaccctta 22191298  T
Q  753 tcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  22191297 tcaactaataacctccaacaccattt 22191272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 706 - 817
Target Start/End: Original strand, 35541612 - 35541723
Alignment:
Q  706 ccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctct 805  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||    
T  35541612 ccacaccatacctagccactaacacctttctccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccct 35541711  T
Q  806 caatctcctaac 817  Q
    ||| ||| ||||    
T  35541712 caacctcttaac 35541723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 681 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 33142800 - 33142703
Alignment:
Q  681 cccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || |||| || |  |||| |||||||||| ||||||| ||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33142800 cccccatccttcaaaacaccatcctcctcaccgtaacgggccaccaacaccctataccacaagccttctctatcaactaacaacctccaacaccattt 33142703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 736 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 25504526 - 25504460
Alignment:
Q  736 accacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactc 802  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  25504526 accaaaaaccacccctatccactaacatcctccaacaccatttccctagtaaggcaatattaaactc 25504460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 778
Target Start/End: Original strand, 21405362 - 21405487
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccaccccta 752  Q
    |||| ||||||||||||||  |||  |||||||| || |||| |  |||||| || ||||||| |  || | |||||||||| |||||| || |||| ||    
T  21405362 ctccttccaccacgaagaaacactctggcccccaaccaccaacctcccatcctcctcaccataacgtgctaccaacaccctataccacatactaccctta 21405461  T
Q  753 tcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21405462 tcaactaataacctccaacaccattt 21405487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 54483406 - 54482606
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||  |    
T  54483406 accataggccacaaagcaccaaagaatggacaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcg 54483307  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||| || || | || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||    |||||||| ||| || ||||| || ||    
T  54483306 ataaaatgccgcgatttgtcaaattggttttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaacttttagaggtacctgtttgtgcca 54483207  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||| ||||  ||| ||   |||| |||||   ||||||    
T  54483206 gactaactccatactttgatgaatctgaggttgttcatgcgatgtcaataagtcatataccccacaaacataatagccaccaatcggatccaataaccac 54483107  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| || |  |     | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  54483106 acccatctatcagtaacggattcctgcaaagagactgttagtaataaacccctacactcctctaccaaatcctcctcccacacccataaccggcgacgcc 54483007  T
Q  424 actgccacgc-cccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacac-- 520  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||| ||||| ||  | ||||| | |      
T  54483006 actgccacgctcccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccgtaattgatttattgatggctaagtcataaagatgcctaaagcgctc 54482907  T
Q  521 acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| | ||| |||    
T  54482906 acacaagggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaactctctcca 54482807  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54482806 ccctcgcctatcccatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaacaactccgacccccatcctccaaaccaccatctgccacaccatacctag 54482707  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacacc 820  Q
    ||| ||||||||||| ||| || ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  54482706 ccaccaacaccctacgccataacccctctctatcaactaacaaccgccaacaccatttccctagcaaagcaatgttaaactcgctcaatctccgaacacc 54482607  T
Q  821 c 821  Q
    |    
T  54482606 c 54482606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 24 - 821
Target Start/End: Original strand, 48311988 - 48312787
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||  |    
T  48311988 accataggccacaaagcaccgaagaatggacaagataaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcg 48312087  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| |  || | || |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||| |||||    |||||||| | | || ||||| || ||    
T  48312088 gtaaaatgctgcgatttgtcaaattggctttagtaggtaaatgatccctcaacaacccccaagcaaggactgtaacttttagatgtacctgtttgtgcca 48312187  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||   |||| |||||   ||||||    
T  48312188 gactaactccatactttgatgaatctgaggttgttcatgcgatgtcaataagtcatataccccacgaacagaatagccaccaatcggatccaataaccac 48312287  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgt-ttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgc 422  Q
    | ||| ||||  | | | |  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||| || ||| |||| || ||||||    
T  48312288 acccatctgtcag-taacgaattcctgcaaatagactgttagtaataaagccctacactcctctaccaagtcctcctcacacaccaataaccggcgacgc 48312386  T
Q  423 cactgccacgcccccc-accatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacac- 520  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||  ||||| ||||| || || ||||| | |     
T  48312387 cactgccacgcccccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccgtgattgatttattgatggctaagtcataaagtcgcctaaagcgct 48312486  T
Q  521 -acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccc 619  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||    
T  48312487 cacacaacggaaca-taccacaccaacaatctcgccaaaaatcgatatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaaccctctcc 48312585  T
Q  620 accctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccataccta 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48312586 accctcgcctatctcatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccataccta 48312685  T
Q  720 gccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacac 819  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48312686 gccaccaacaccctacgccacaacccctctctatcaactaacaaccgctaacaccatttccctagcaaagcaatgttaaactctctcaatctccgaacac 48312785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 138 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 55725819 - 55725153
Alignment:
Q  138 tctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatat 237  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  55725819 tctgccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacttgtttatgccaaattaactccatat 55725720  T
Q  238 tttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttga 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||  |     
T  55725719 tttgataaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccatgaacagtatatcctccagtctgatccggtaaccacaaccacctgtcagt 55725620  T
Q  338 ttatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccc- 436  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||  |||                    ||| | |||||||||||| ||     
T  55725619 ttctgtttcctgcaaagagattgttagtaataaatcgctacactcctctaccaaatcc--------------------acgtcaccactgccacgctccg 55725540  T
Q  437 ccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacac--acacaacggaacac 534  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |  |||||| |||||||    
T  55725539 ccaccctcctccacccccaacaagaacatgttccttactgtgattactttattgacagctaagtcatatagtcgcctaaagcgcttacacaaaggaacac 55725440  T
Q  535 taccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctc 634  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  55725439 taccacaccaacaatctcgccaaaaatctgttgtggctccatctcccaccctcatcctaacacaatccgcaaaccaaccctccccaccctcgcctatccc 55725340  T
Q  635 atctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacacccta 734  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55725339 atctctgatcatgactatctccctccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaaaccaccatcctccacaccatacctagccaccaacacccta 55725240  T
Q  735 caccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
     |||| || ||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55725239 taccataatccatctctatctactaacaacctccaacaccatttccctaacaaagcaaagttaaactctctcaacctcctaacaccc 55725153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 2822284 - 2821629
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||| || |||| || ||| ||||  |    
T  2822284 accataggccacaaagcaccgaagaacggacatgataaaaacacatgagacacatcttcaacatgcccacattccgtgacgcaaagcctagcctccatcg 2822185  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||  | | || || ||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| | |||   ||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  2822184 gtaaaattccgtgatttgtcagattagctttagtaggtaagcgatccctcaacaatcgccaagcatggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgcca 2822085  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||   |||| ||||||| ||||||    
T  2822084 gattaactccatattttgatgaatatgaggttgttcctatgatgtcaacaagtcatataccccatgaacagtatagccaccaatcggatccggtaaccac 2821985  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactacca---ggtcctcctcccatacccataaacgacgac 420  Q
    | ||| ||||  |     | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||   ||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  2821984 acccatctgtcagtaacagattcctgcaaagagactgttagtattaaagccctacactcctctaccaattggtcctcctcccacacccataagcggcgac 2821885  T
Q  421 gccactgccacgc-cccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca 519  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||  ||||| ||||| || || ||||| |     
T  2821884 gccaccaccacgctcccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttccttaccgtgattgctttattgatggctaagtcataaagacgcctaaagcg 2821785  T
Q  520 c--acacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcc 617  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2821784 ctcacacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatctgcaaaccaaccctcc 2821685  T
Q  618 ccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaaca 673  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2821684 ccaccctcgcctatcccatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaaca 2821629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Original strand, 12697706 - 12697983
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12697706 accaaaggccataatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 12697805  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12697806 ctataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 12697905  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacc 301  Q
     || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12697906 aattaatttcatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 12697983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 325
Target Start/End: Original strand, 8360993 - 8361294
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  8360993 accaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttcaacag 8361092  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||| ||| |||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  8361093 atataattccacgtgccaccaaatttgatttactaggtaaacgattcctcagcagtcgccaaacaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgcca 8361192  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || ||||    
T  8361193 aattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatggcaacaaatcatatacaccacgaacaatataaccagaaatctgatccgacatccac 8361292  T
Q  324 aa 325  Q
    ||    
T  8361293 aa 8361294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 342
Target Start/End: Original strand, 20002611 - 20002936
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20002611 accataggccacaatgcaccgaaaaatggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaaccgagcctccacag 20002710  T
Q  124 -------atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtt 216  Q
           ||  ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  20002711 tccacagatgtaatgccacggtctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacagccgccaagcaatgatagaaacttttaaaagaacctgtt 20002810  T
Q  217 tatggcagatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccgg 316  Q
    |||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    
T  20002811 tatgccaaattaactccatattttgattaacatgaggttgttcgtgtgatgtcaacatgtcataaacaccacgaacagtatagcctctaatctgatttgg 20002910  T
Q  317 caaccacaaccacctgtttgattatg 342  Q
     |||||||||||||||| || |||||    
T  20002911 taaccacaaccacctgtctgtttatg 20002936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 345 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 11587124 - 11586688
Alignment:
Q  345 tcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccccc-accat 443  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||  |||  |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||     
T  11587124 tcctgcaaagaaactgtcagtaataaagccctacattcctctaataggttctcctctcacacccataaacgacggcgccactgccacgcctccctaccaa 11587025  T
Q  444 cctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacacacaac--ggaacactaccaca 541  Q
    | |||||||||||||| |||||  || | |||   ||| ||||||||| | |||  ||||||| ||||||||| | | |||||   || |||  ||||||    
T  11587024 catccacccccaacaataacatagtcataaccgcgattgctttattgacaactatgtcatataaccgtctaaagcgctcacaaaatgggacatcaccaca 11586925  T
Q  542 ccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctcta 641  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||   |||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  11586924 ccaacagtcacgccagaaatcagtttcggatccatccttcaccctcctcctaacacaatccgagaaccagcccaccccaccctcacctatcccatctcta 11586825  T
Q  642 atcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccaca 741  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  11586824 atcctaactatctccctccaccaagaagaacaacttcggcccccattctccaaacctccatccgccacaccatacctagccactaacaccttacaccaca 11586725  T
Q  742 aaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccattt 778  Q
    | ||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11586724 acccttccttatcaactaacaaccgccaacaccattt 11586688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45472824 - 45472608
Alignment:
Q  156 gtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattttgatgaacatgaggtt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  45472824 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtg 45472725  T
Q  256 gttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgattatgtttcctgcaaaga 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||     
T  45472724 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataaccagaaatctgatccggcaaccacatccacctgtctgtttctgtttcctgcaaagt 45472625  T
Q  356 gactgttagtaataaat 372  Q
    || ||| ||||||||||    
T  45472624 gattgtcagtaataaat 45472608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 821
Target Start/End: Original strand, 19755169 - 19755960
Alignment:
Q  36 aatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag---atagaatcc 132  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||   ||| |||      
T  19755169 aatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgt 19755268  T
Q  133 cacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactc 232  Q
    |||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| || || |||||    
T  19755269 cacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactc 19755368  T
Q  233 catattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctg 332  Q
    |||||  |||||||  || || || || |||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| ||      |||||  || ||||| | ||| |||    
T  19755369 catatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtcagcatgtcatagaccccacgtacagaatacccaccctcctgattaggtaaccaaagccatctg 19755468  T
Q  333 tttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacg 432  Q
    | ||    || |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||  ||||||||| |  |||| || || | ||||||| || |||    
T  19755469 tctgtcactgattcctgcaaagaaactattagtaataaaaccctacactcctctaccaactcctcctcctaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacg 19755568  T
Q  433 cc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--cacacaacgg 529  Q
    || |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |    ||||  ||| || | |   || ||| | || || ||||| |   ||||||  ||    
T  19755569 cctccccacccacatccacccccaacaagaacatattcctaaatgaaattgatttgttaacattcaagtcaaaaaggcgcctaaaccggtcacacagtgg 19755668  T
Q  530 aacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcct 629  Q
    ||||   || |||||||  || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||     ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  19755669 aacatctccgcaccaacgatcacgccaaaaatcggtgtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacacatcccaaaccatccctctccaccctcacct 19755768  T
Q  630 atctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaaca 729  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19755769 atcccatctctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccactaaca 19755868  T
Q  730 ccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    || | | ||||||| |  |||| ||   |||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  19755869 ccttcctccacaaagcttccctctccaataacaaccgccaacaccatttatccaacaaagcaatgttaaactctctcaaccttgtaacaccc 19755960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 19784637 - 19783846
Alignment:
Q  36 aatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag---atagaatcc 132  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||   ||| |||      
T  19784637 aatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgt 19784538  T
Q  133 cacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactc 232  Q
    |||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| || || |||||    
T  19784537 cacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactc 19784438  T
Q  233 catattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctg 332  Q
    |||||  |||||||  || || || || |||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| ||      |||||  || ||||| | ||| |||    
T  19784437 catatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtcagcatgtcatagaccccacgtacagaatacccaccctcctgattaggtaaccaaagccatctg 19784338  T
Q  333 tttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacg 432  Q
    | ||    || |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||  ||||||||| |  |||| || || | ||||||| || |||    
T  19784337 tctgtcactgattcctgcaaagaaactattagtaataaaaccctacactcctctaccaactcctcctcctaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacg 19784238  T
Q  433 cc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaaca--cacacaacgg 529  Q
    || |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |    ||||  ||| || | |   || ||| | || || ||||| |   ||||||  ||    
T  19784237 cctccccacccacatccacccccaacaagaacatattcctaaatgaaattgatttgttaacattcaagtcaaaaaggcgcctaaaccggtcacacagtgg 19784138  T
Q  530 aacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcct 629  Q
    ||||   || |||||||  || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||     ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  19784137 aacatctccgcaccaacgatcacgccaaaaatcggtgtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacacatcccaaaccatccctctccaccctcacct 19784038  T
Q  630 atctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaaca 729  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19784037 atcccatctctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccatccgccacaccatacctagccactaaca 19783938  T
Q  730 ccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    || | | ||||||| |  |||| ||   |||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  19783937 ccttcctccacaaagcttccctctccaataacaaccgccaacaccatttatccaacaaagcaatgttaaactctctcaaccttgtaacaccc 19783846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 23642838 - 23642042
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | |||||||    
T  23642838 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacag 23642739  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  23642738 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgcca 23642639  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||| ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| || | |   ||||  || |||||     
T  23642638 aattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 23642539  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| | |   ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||    
T  23642538 agccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgcc 23642439  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacac 522  Q
    ||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  ||    
T  23642438 acctcaacgcctccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagtcaagtcaaaaaggcgcctaaaccggac 23642339  T
Q  523 acaacg--gaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||| |  |||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||    
T  23642338 acaaagaggaacatctccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctcca 23642239  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23642238 ccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctag 23642139  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||  |||||| | | ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  23642138 ccactaacacctttctccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 23642042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 411 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 5789952 - 5789585
Alignment:
Q  411 aaacgacgacgccactgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagcc 509  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||   ||| |||||| ||||| | |||   || |||| ||| || |||||||| |    
T  5789952 aaacgatgacgccactgccatgcctccccaccaacctccacacctaagtcgaatatgttcatcaccgtgattggcttgttgacagccaagtcatataggc 5789853  T
Q  510 gtctaaaac--acacacaacggaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaa 607  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||    |||||    
T  5789852 gtctaaaacgcacacacaacggaacatttccacaccaacaatcacgccaaaaatcaatattggctccatcccgcaccctcctactaacacacgacgcaaa 5789753  T
Q  608 ccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgcc 707  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  5789752 ccatccctccccaccctcgcctatcccatctctaatcttcacaatctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaaacctccaccctcc 5789653  T
Q  708 acaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacacca 775  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||  | || ||  ||||||||| |||||||||    
T  5789652 acaccatacctagccactaacaccttacgccacaacccttcactctctactaacaacctccaacacca 5789585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 537 - 807
Target Start/End: Original strand, 47419213 - 47419483
Alignment:
Q  537 ccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcat 636  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  47419213 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 47419312  T
Q  637 ctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctaca 736  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | |     
T  47419313 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctagccactaacacctttct 47419412  T
Q  737 ccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctca 807  Q
    ||||||| || |||| ||    ||||||| |||||||||||| || |  | ||||||||||||||| ||||    
T  47419413 ccacaaagcatccctctccaacaacaacctccaacaccatttacctaacaaagcaatgttaaactccctca 47419483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 585 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 23647932 - 23647700
Alignment:
Q  585 ctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccc 684  Q
    |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23647932 ctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccc 23647833  T
Q  685 catcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccag 784  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| || |||| ||   |||||||| ||||||||||||  |||     
T  23647832 catcctccaaaccgccatcctccacaccatacctagccactaacacctttctccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttatccaa 23647733  T
Q  785 tagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
     | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  23647732 caaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 23647700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 552 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 1828256 - 1827991
Alignment:
Q  552 cgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaacta 651  Q
    |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  1828256 cgccaaaagtcagtgtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccatccctcaccaccctcacctatcccatctctaatcctcacta 1828157  T
Q  652 tctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccct 751  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| || || |    
T  1828156 tctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccatccgccaaacctccatcctccacaccatacctagccactaacaccttcctccacaaaacatcctt 1828057  T
Q  752 atcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
     ||   |||||||||||||||||||||  |||  | || |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1828056 ctccaataacaaccgccaacaccatttatccaacaaagaaatgttaaactctctcaacctcgtaac 1827991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 821
Target Start/End: Original strand, 46145684 - 46146370
Alignment:
Q  140 tgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatattt 239  Q
    ||||||||||  ||||||||| || || ||||||| ||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| || | ||| || || || ||||||||||||    
T  46145684 tgccaaattttgtttagtaggtaatcggtccctcagcaagcgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctatttgtgccaaatcaactccatattt 46145783  T
Q  240 tgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccacctgtttgat 338  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||     |||||||  | ||||| | ||||||||  ||     
T  46145784 tgatgtaacatg-ggttgttcctgcgaagtcaacatatcatacacaccacgaaccgtatacccaccggtctgatctagtaaccaaagccacctgtcagaa 46145882  T
Q  339 tatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcccccc 438  Q
     | |  ||||||||||  ||||| |||||||  ||| |||||||  || |||  || |||||||| ||||| || || |||| || |  || | ||||||    
T  46145883 gaggaatcctgcaaagtaactgtaagtaatagttccctacactcctctgccaactcttcctcccaaacccacaagcggcgacaccccccccccccccccc 46145982  T
Q  439 --accatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacacacaa--cggaacac 534  Q
      |||| ||||||  |||| |  |||||||||||| ||| | |  ||||| ||||  | ||||||| | ||||||||||| | |||||||  |||||||     
T  46145983 ccaccaacctccaatcccacctggaacatgttcctaaccgtgacaactttgttgactgttaaatcaaaaagccgtctaaatcgcacacaaaacggaacat 46146082  T
Q  535 taccacaccaacag-tctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatct 633  Q
    | |||||||||||  || |||||||| || || || || || || || |||   ||||||||||    ||||||||| || || || ||||| ||||||     
T  46146083 ttccacaccaacaaatcacgccaaaagtcagtctcagcaccgtctcccacctgtctcctaacacccgatgcaaaccaaccatctccgccctctcctatcc 46146182  T
Q  634 catctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccct 733  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  46146183 catctataatcctcactatctcccgccaccaagatgaacaactccggcccccattctccaaaccaccatccgctgcaccatatctagccaccaacaccct 46146282  T
Q  734 acaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
    || |||||| ||| | || ||  |||||||||  ||||||||||| || |  | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46146283 acgccacaacccatctctctctactaacaaccttcaacaccattttcctaacaaagcaatgttaaaccccctcaatctcctaacaccc 46146370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 552 - 808
Target Start/End: Original strand, 15740645 - 15740900
Alignment:
Q  552 cgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaacta 651  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  15740645 cgccaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctccta-cacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatctcatctttaatcctcacta 15740743  T
Q  652 tctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccct 751  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| |  || |    
T  15740744 tctcccgccaccatgaagaacaactccggcccccatccgccaaacctccatcctccacaccatacctagccactaacacctttctccacaaaacttcctt 15740843  T
Q  752 atcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaa 808  Q
     ||   |||||||||  |||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  15740844 ctccaataacaaccgtaaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactctgtcaa 15740900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4548466 - 4548339
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4548466 accagaggccacaatgcaccaaaaattgggcaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacag 4548367  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttga 151  Q
     || ||||||||||||  ||||||||||    
T  4548366 ctataatcccacgttccaccaaatttga 4548339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 294
Target Start/End: Original strand, 7403812 - 7404076
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaa 129  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| ||||| || |||| |  || ||    
T  7403812 ggccataaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcgcctccaaacgtaaaa 7403911  T
Q  130 tcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaa 229  Q
    | ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| || || ||    
T  7403912 tgccacggtttgccaaattcttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgaaatgaacttgtttatgccaaattaa 7404011  T
Q  230 ctccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
    || |||||||||||| |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  7404012 cttcatattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacag 7404076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1828772 - 1828531
Alignment:
Q  39 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgtt 138  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || |  ||||| ||||| || |||| || || ||| ||||| |    
T  1828772 gcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggt 1828673  T
Q  139 ctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaactccatatt 238  Q
     ||||||||| | ||| ||||| || | ||| | ||| |||| ||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  1828672 ttgccaaattagtttttgtaggtaacctatctcgcaatagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 1828573  T
Q  239 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcata 280  Q
     ||||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  1828572 atgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatatcata 1828531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13271138 - 13270868
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||   ||||||||| || || || |||||  | |||||||    
T  13271138 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaataaattagtaacatcttcgacaatcccacatccagtaactcataaccgctcctccacag 13271039  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  13271038 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgcca 13270939  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 294  Q
     || || |||| ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  13270938 aattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacag 13270868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47686142 - 47685946
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||   |||||||| || | ||||||||| |  ||||| |||||  | |||||||    
T  47686142 accatcggccataatgcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaacgagaaacatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacag 47686043  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatg 220  Q
    ||| ||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| ||||||||    
T  47686042 ataaaatgccacggtttgccaaattatgttttgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatg 47685946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 471
Target Start/End: Original strand, 15740120 - 15740562
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaa 129  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| || |  ||||| ||||| || |||| || || ||    
T  15740120 ggccataaggcaccaaaagttagacaagacaaaaacaaatgattaacatctttaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaa 15740219  T
Q  130 tcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggcagatgaa 229  Q
    | |||||   || ||||||   ||| ||||| || ||||| | ||| |||| ||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| || || ||    
T  15740220 tgccacggcttgtcaaattattttttgtaggtaaccgatctcgcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 15740319  T
Q  230 ctccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccacaaccac 329  Q
    ||||||||| || || |  || || || |||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||   |   ||||  || ||||| | |||     
T  15740320 ctccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtcaacatatcatagactccacgtacagaatacccaccatcatgattaggtaaccaaagccat 15740419  T
Q  330 ctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgcc 429  Q
    |||| ||    || |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | | ||||||||     
T  15740420 ctgtctgtcactgattcctgcaaagaaactgttagtaataaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctatgccactgca 15740519  T
Q  430 acgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcct 471  Q
    ||||| |||| ||  | || |||||||||||||| || |||||    
T  15740520 acgcctcccctcccacgtctacccccaacaagaatatattcct 15740562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Original strand, 47418697 - 47418962
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | ||| |||    
T  47418697 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatcctgcaacgcataaccgctcctccccag 47418796  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| |||||   |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  47418797 atagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgcca 47418896  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 289  Q
     || || |||||| | || || |  || || || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  47418897 aattaagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacg 47418962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 612 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19735391 - 19735311
Alignment:
Q  612 ccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctcc 692  Q
    ||||| || ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19735391 ccctctccgccctctcttatcccatctctaatcctcactatctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccatcctcc 19735311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 396 - 475
Target Start/End: Original strand, 48242642 - 48242722
Alignment:
Q  396 tcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcacc 475  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48242642 tcctcccaaacccacaaacgatgtcgccactgccacgcctccccgccaacctccacacccaacaagaacatgttcctcacc 48242722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 653 - 802
Target Start/End: Original strand, 8935599 - 8935748
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccaccccta 752  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||  | || | ||||| | ||| |  || || ||| |||| ||||||||||||    
T  8935599 ctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccatcctccaacctcccacacacctcgccataacgagcgactaaaactctataccaaaaaccaccccta 8935698  T
Q  753 tcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactc 802  Q
    ||  |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  8935699 tccactaacatcctccaacaccatttccctagtaaggcaatattaaactc 8935748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 11587439 - 11587380
Alignment:
Q  30 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgc 89  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  11587439 ggccacaaagcaccaaaatttgggcaagacaaaaacaagtgattcacattttcaacgtgc 11587380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 159938 - 159880
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttc 82  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  159938 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttc 159880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 694
Target Start/End: Original strand, 42778746 - 42778804
Alignment:
Q  636 tctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42778746 tctctaatccgccctatctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctccaa 42778804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 653 - 694
Target Start/End: Original strand, 23657822 - 23657863
Alignment:
Q  653 ctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaa 694  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23657822 ctcccgccaccaagaagaacaacttcggcccccatcctccaa 23657863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19735790 - 19735727
Alignment:
Q  228 aactccatattttgatg-aacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaa 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19735790 aactccaaattttgatgtaacat-aggttgttcctgcgatgtcagcatgtcatacacaccacgaa 19735727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Original strand, 19115052 - 19115110
Alignment:
Q  744 ccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactc 802  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  19115052 ccacccctatccactaacaacctccaacaccatttccctaataaagcaatattaaactc 19115110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1350 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1350
Description:

Target: scaffold1350; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 585 - 821
Target Start/End: Original strand, 1 - 237
Alignment:
Q  585 ctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccc 684  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1 ctcctcctaacacaatccgcaaaccaaccctccacaccctcgcctatcccatctctaattctgactatctccctccaccaagaagagcaacttcggcccc 100  T
Q  685 catcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccag 784  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |     
T  101 catcctccaaaccaccatcctccacaccatacctaaccaccaacaccttacgccacaatccatctctatctactaacaacctccaacaccatttccctaa 200  T
Q  785 tagagcaatgttaaactctctcaatctcctaacaccc 821  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  201 caaagcaatgttaaactctctcaacctcctaacaccc 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 106090 - 105294
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||||| |  || || |||||  | |||||||    
T  106090 accatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacag 105991  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  105990 atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgcca 105891  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatctgatccggcaaccac 323  Q
     || || |||| ||| || || |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| || | |   ||||  || |||||     
T  105890 aattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccag 105791  T
Q  324 aaccacctgtttgattatgtttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgcc 423  Q
    | ||| |||| | |   ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || || | |||||    
T  105790 agccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgcc 105691  T
Q  424 actgccacgcc-ccccaccatcctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgagagctaaatcatatagccgtctaaaacacac 522  Q
    ||  | ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||| ||||| ||    |||  ||| |  | ||  || ||| | || || ||||| |  ||    
T  105690 acctcaacgcctccccgcccacatccacccccagcaggaacatattcctaactgagattgatttgtgaacagtcaagtcaaaaaggcgcctaaaccggac 105591  T
Q  523 acaacg--gaacactaccacaccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctcccca 620  Q
    |||| |  |||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    ||||||| ||||| |||    
T  105590 acaaagaggaacatctccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctcca 105491  T
Q  621 ccctcgcctatctcatctctaatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctag 720  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  105490 ccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggcccccatcctccaaaccgccatcctccacaccatacctag 105391  T
Q  721 ccatcaacaccctacaccacaaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||  |||||| | | ||||||| || |||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  105390 ccactaacacctttctccacaaagcatccctctccaataacaacctccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaacctcttaac 105294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 540 - 817
Target Start/End: Original strand, 3664 - 3941
Alignment:
Q  540 caccaacagtctcgccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatctcatctc 639  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||     ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  3664 caccaacaatcacgccaaaaatcggtatccgcaccatctcccaccctcctcctaacgcaggacccaaaccacccctctccaccctcacctatcccatctc 3763  T
Q  640 taatcctaactatctccctccaccacgaagaacaacttcggcccccatcctccaaaccaccatccgccacaccatacctagccatcaacaccctacacca 739  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| | | |||    
T  3764 taatcctcactatctccctccaccacgacgaacaactccggcccccaacctccaaacctccatccgtcacaccatacctagccactaacacctttctcca 3863  T
Q  740 caaaccacccctatcatctaacaaccgccaacaccatttccccagtagagcaatgttaaactctctcaatctcctaac 817  Q
    |||| || |||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3864 caaagcatccctctccaataacaaccgccaacaccatttacccaacaaagcaatgttaaactccctcaatctcgtaac 3941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Original strand, 3145 - 3410
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||    
T  3145 accattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaag 3244  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
     || ||| ||| | | |||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  3245 gtaaaatgccatggtttgccaaattgcttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttaagaggaacctgtttatgcca 3344  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 289  Q
     || ||||||||||| || || |  |  ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  3345 aattaactccatattatggtgtaactagggttgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacg 3410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 471
Target Start/End: Original strand, 3465 - 3593
Alignment:
Q  344 ttcctgcaaagagactgttagtaataaatccatacactctactaccaggtcctcctcccatacccataaacgacgacgccactgccacgcc-ccccacca 442  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||  |||||||||||  |||| || |  | ||||||| || ||||| |||||||     
T  3465 ttcctgtaaagaaactgttagtaataaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaggcccacaacctcctacgccaccgcaacgcctccccaccc 3564  T
Q  443 tcctccacccccaacaagaacatgttcct 471  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||    
T  3565 acatccacccccaacaagaacatattcct 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11452 - 11187
Alignment:
Q  24 accataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccacag 123  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||| || | ||||||||| |  ||||| |||||  | |||||||    
T  11452 accatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgaaaaacattttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacag 11353  T
Q  124 atagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagtcgccaagtaaggatataaacttttaaaggaacttgtttatggca 223  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || |||||||| |  |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  11352 atagaatgccacggtttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctgagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 11253  T
Q  224 gatgaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 289  Q
     || || |||| ||| || || |  || |  || ||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  11252 aattaagtccagattatggtgtagctgggtctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 11187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University