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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF18005_high_3 (Length: 448)
Name: NF18005_high_3
Description: NF18005
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18005_high_3 |
 | |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0061 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 38348744 - 38348372
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
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| T |
38348744 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
38348645 |
T |
|
| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
214 |
Q |
| |
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| T |
38348644 |
aaaaaaaatatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaatttcaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
38348545 |
T |
|
| Q |
215 |
actcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaatnn |
314 |
Q |
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| T |
38348544 |
actcacaaataatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcatcaattttgcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaatat |
38348445 |
T |
|
| Q |
315 |
nnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
387 |
Q |
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| T |
38348444 |
aaaaacatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
38348372 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 20787884 - 20788204
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
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| T |
20787884 |
catagggtgaatatatgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
20787983 |
T |
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| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
214 |
Q |
| |
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|
| T |
20787984 |
aaaaaaaatatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
20788083 |
T |
|
| Q |
215 |
actcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaatnn |
314 |
Q |
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| T |
20788084 |
actcacaaacaatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaataa |
20788183 |
T |
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| Q |
315 |
nnnnncatgaaatgcattgaa |
335 |
Q |
| |
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| T |
20788184 |
aaaaacatgaaatgcattgaa |
20788204 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Original strand, 10028388 - 10028768
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
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| T |
10028388 |
catagggcgaatatgtgaacttggacaaaatacatggatatccacaa-atgtagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
10028486 |
T |
|
| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10028487 |
aaaaaaa-tatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaataaaagagagattttagagaagaatttcaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
10028585 |
T |
|
| Q |
215 |
actcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaa-----------attaaatagcaaaaac |
303 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10028586 |
actcacaaacaatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcatcaattttccccttaatttagtaatgaaattaatatgatattaaatagcaaaaac |
10028685 |
T |
|
| Q |
304 |
aatttgaatnnnnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtacttt |
386 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10028686 |
aatttgaataaaaaaacatgaaatgtattgaatcaaaacaacattaaatatctcttagaattctaggatgacacgtgtacttt |
10028768 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Original strand, 20795535 - 20795587
Alignment:
| Q |
335 |
atcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
387 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20795535 |
atcagaacaacattaaatgttcctaaaaattctaggatgacacgtgtactttt |
20795587 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 387
Target Start/End: Original strand, 58293 - 58665
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
58293 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcagcttttgaaattagagtgatg |
58392 |
T |
|
| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
58393 |
aaaaaaaatatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaatttcaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
58492 |
T |
|
| Q |
215 |
actcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaatnn |
314 |
Q |
| |
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| T |
58493 |
actcacgaacaatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcatcaattttgcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttaaataa |
58592 |
T |
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| Q |
315 |
nnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
387 |
Q |
| |
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|
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| T |
58593 |
aaaaacatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
58665 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27429070 - 27428698
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27429070 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcagcttttgaaattagagtgatg |
27428971 |
T |
|
| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27428970 |
aaaaaaaatatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaatttcaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
27428871 |
T |
|
| Q |
215 |
actcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaatnn |
314 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27428870 |
actcacgaacaatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcatcaattttgcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttaaataa |
27428771 |
T |
|
| Q |
315 |
nnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27428770 |
aaaaacatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
27428698 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12515399 - 12515021
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12515399 |
catagggcgaatatgtgtatttggacaaaatacatggatatccacaacatttaatggattgatatcataaattgaatcaatttttggaattagagtgatg |
12515300 |
T |
|
| Q |
115 |
nnnnnnnn-tatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttga |
213 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12515299 |
aaaaaaaaatatgctacgaagaaaagtgtttcaataaaataaaagagagatttcatagaagaatttcaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatattga |
12515200 |
T |
|
| Q |
214 |
gactcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaa-----------attaaatagcaaaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12515199 |
gactcacaaacaatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcatcaattttgcccttaatttagtaatgaaattaatatgatattaaatag-aaaaa |
12515101 |
T |
|
| Q |
303 |
caatttgaatnnnnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgta |
382 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12515100 |
caatttcaataaaaaaacatgaaatgcactgaatcagaacaacattaaatgtaccttagaattctataatgacacgtgta |
12515021 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7823615 - 7823552
Alignment:
| Q |
321 |
atgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtact |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7823615 |
atgaaatgcactaaataagaacaatataatatgcaccttagaattctaggatgacacgtgtact |
7823552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17990502 - 17990130
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17990502 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcagcttttgaaattagagtgatg |
17990403 |
T |
|
| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17990402 |
aaaaaaaatatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaatttcaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
17990303 |
T |
|
| Q |
215 |
actcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaatnn |
314 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17990302 |
actcacgaacaatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcatcaattttgcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttaaataa |
17990203 |
T |
|
| Q |
315 |
nnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17990202 |
aaaaacatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
17990130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 387
Target Start/End: Original strand, 18072487 - 18072859
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18072487 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcagcttttgaaattagagtgatg |
18072586 |
T |
|
| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18072587 |
aaaaaaaatatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaatttcaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
18072686 |
T |
|
| Q |
215 |
actcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaatnn |
314 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18072687 |
actcacgaacaatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcatcaattttgcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttaaataa |
18072786 |
T |
|
| Q |
315 |
nnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18072787 |
aaaaacatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
18072859 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 42614815 - 42614443
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42614815 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
42614716 |
T |
|
| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42614715 |
aaaaaaaatatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagattttagagaagaatttcaaaattgaattctgaatgacgtgaaaatgttgag |
42614616 |
T |
|
| Q |
215 |
actcacaaacaatatttatagnnnnnnngaagcaagtaaattgcatcaatttttcccttaatttagtaatgaaattaaatagcaaaaacaatttgaatnn |
314 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42614615 |
acccgcaaacaatatttatagaaaaaaagaagcaagtaaattgcattaattttgcccttaatttagtaatgatattaaatagcaaaaacaatttgaataa |
42614516 |
T |
|
| Q |
315 |
nnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42614515 |
aaaaacatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtactttt |
42614443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 40700523 - 40700150
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
| |
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| T |
40700523 |
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40700424 |
T |
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214 |
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40700323 |
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T |
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387 |
Q |
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40700223 |
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40700150 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 384
Target Start/End: Original strand, 163545 - 163925
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
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| T |
163545 |
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163644 |
T |
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214 |
Q |
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| T |
163645 |
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T |
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303 |
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T |
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| Q |
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384 |
Q |
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| T |
163845 |
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163925 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0061 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:
Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35234 - 34855
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
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Q |
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| T |
35234 |
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35135 |
T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
35134 |
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35035 |
T |
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215 |
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303 |
Q |
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| T |
35034 |
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34936 |
T |
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| Q |
304 |
aatttgaatnnnnnnncatgaaatgcattgaatcagaacaacattaaatgttccttagaattctaggatgacacgtgtact |
384 |
Q |
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| T |
34935 |
aatttgaataaaaaaacatgaaatgcactgaatcataacattattaaatgtaccttagaattctaggatgacacgtgtact |
34855 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 12164777 - 12165002
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
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| T |
12164777 |
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12164876 |
T |
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| Q |
115 |
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207 |
Q |
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| T |
12164877 |
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12164974 |
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235 |
Q |
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| T |
12164975 |
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12165002 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 12409205 - 12409430
Alignment:
| Q |
15 |
catagggcgaatatgtgaatttggacaaaatacatggatatccacaacatttagtggattgatatcataaattgaatcaatttttgaaattagagtgatg |
114 |
Q |
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| T |
12409205 |
catagggtgaatatgtgaatttgaacaaaatacatggatatatacaacatgtagtggagtaatatcataaattgaatcaattttcgaaattagagtgatg |
12409304 |
T |
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| Q |
115 |
nnnnnnnntatgctaagaagaaaagtgtttcaataaaatataagagagatttcagagaagaattttaaaatt-------gaattctgaatgacgtgaaaa |
207 |
Q |
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| T |
12409305 |
-aaaaaaatatgttaagaagaaaagtgtttcaataaaataaaagagagattt-tgagaagaattttaaaattttcgtaagaattctgaatgatgtgaaaa |
12409402 |
T |
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| Q |
208 |
tgttgagactcacaaacaatatttatag |
235 |
Q |
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| T |
12409403 |
tgttgagactgacaaactatatttatag |
12409430 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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