View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18007_high_2 (Length: 763)

Name: NF18007_high_2
Description: NF18007
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18007_high_2
NF18007_high_2
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (33-747)||(4883601-4884311)
chr2 (25-292)||(11222302-11222569)
chr2 (25-293)||(4654709-4654977)
chr2 (25-293)||(15182986-15183254)
chr2 (25-292)||(26342570-26342837)
chr2 (25-292)||(10812189-10812456)
chr2 (25-292)||(41885615-41885882)
chr2 (25-277)||(36404842-36405095)
chr2 (30-282)||(478969-479221)
chr2 (57-293)||(3363606-3363842)
chr2 (25-297)||(34399192-34399464)
chr2 (25-292)||(19594341-19594607)
chr2 (25-281)||(14295754-14296010)
chr2 (25-285)||(37093440-37093699)
chr2 (25-292)||(15893566-15893833)
chr2 (25-285)||(30264595-30264855)
chr2 (25-292)||(34357168-34357435)
chr2 (25-294)||(44360424-44360692)
chr2 (25-292)||(36375561-36375830)
chr2 (23-292)||(13215381-13215650)
chr2 (33-278)||(11560047-11560292)
chr2 (59-285)||(10263780-10264006)
chr2 (29-290)||(13965601-13965862)
chr2 (25-283)||(28145566-28145825)
chr2 (25-293)||(13753945-13754213)
chr2 (29-292)||(14288425-14288686)
chr2 (25-296)||(38072214-38072479)
chr2 (30-228)||(15677341-15677539)
chr2 (23-292)||(35158337-35158606)
chr2 (29-294)||(25558170-25558432)
chr2 (29-292)||(9369968-9370231)
chr2 (25-283)||(14541321-14541579)
chr2 (26-285)||(43077283-43077542)
chr2 (67-293)||(9706819-9707045)
chr2 (44-292)||(32854768-32855014)
chr2 (25-294)||(1395554-1395822)
chr2 (50-292)||(13000897-13001139)
chr2 (59-276)||(38186054-38186271)
chr2 (25-209)||(2012851-2013035)
chr2 (74-292)||(14308434-14308650)
chr2 (29-293)||(13849700-13849964)
chr2 (25-294)||(31024924-31025193)
chr2 (50-196)||(6013490-6013636)
chr2 (23-293)||(34884523-34884793)
chr2 (30-196)||(8443686-8443852)
chr2 (25-199)||(32674201-32674379)
chr2 (50-288)||(32543777-32544015)
chr2 (26-179)||(34309149-34309301)
chr2 (50-164)||(25187241-25187355)
chr2 (29-284)||(4952690-4952937)
chr2 (29-152)||(14284122-14284245)
chr2 (25-281)||(37077160-37077416)
chr2 (89-292)||(31011704-31011905)
chr2 (55-280)||(838068-838293)
chr2 (25-278)||(33947429-33947682)
chr2 (25-226)||(29041942-29042138)
chr2 (22-177)||(30544507-30544662)
chr2 (130-228)||(36824486-36824584)
chr2 (55-285)||(37116596-37116816)
chr2 (52-292)||(7529690-7529931)
chr2 (146-285)||(3376270-3376409)
chr2 (58-176)||(38148137-38148255)
chr2 (56-284)||(928028-928253)
chr2 (53-224)||(28967285-28967456)
chr2 (53-162)||(2991829-2991937)
chr2 (58-174)||(42088917-42089033)
chr2 (55-277)||(45065092-45065314)
chr2 (25-113)||(37660134-37660222)
chr2 (52-282)||(25787354-25787574)
chr2 (44-174)||(18904024-18904145)
chr2 (69-162)||(42263619-42263712)
chr2 (55-285)||(36173088-36173309)
chr2 (69-293)||(37354023-37354247)
chr2 (240-297)||(8443883-8443940)
chr2 (137-209)||(34721564-34721636)
chr2 (69-287)||(3041597-3041811)
chr2 (185-292)||(34262808-34262915)
chr2 (179-292)||(1259615-1259728)
chr2 (206-292)||(25186816-25186902)
chr2 (33-107)||(28301670-28301744)
chr2 (143-224)||(37660845-37660926)
chr2 (118-171)||(20682902-20682955)
chr2 (69-114)||(20683714-20683759)
[»] chr7 (88 HSPs)
chr7 (23-292)||(33173795-33174064)
chr7 (25-292)||(33921760-33922027)
chr7 (25-285)||(7477191-7477451)
chr7 (25-295)||(31430549-31430819)
chr7 (84-292)||(5732059-5732267)
chr7 (25-282)||(18470297-18470554)
chr7 (25-294)||(32528312-32528581)
chr7 (25-285)||(36922229-36922490)
chr7 (24-292)||(10227245-10227513)
chr7 (25-292)||(33099821-33100086)
chr7 (25-218)||(20035038-20035231)
chr7 (25-218)||(20045449-20045642)
chr7 (26-285)||(26723915-26724175)
chr7 (29-277)||(36298175-36298423)
chr7 (25-220)||(17896581-17896776)
chr7 (30-292)||(7312612-7312874)
chr7 (58-292)||(41891293-41891527)
chr7 (25-285)||(32966042-32966302)
chr7 (25-292)||(12838064-12838331)
chr7 (26-282)||(22950814-22951070)
chr7 (25-293)||(42841851-42842119)
chr7 (25-294)||(41675171-41675439)
chr7 (25-293)||(8264937-8265207)
chr7 (29-223)||(26632235-26632428)
chr7 (25-285)||(44480134-44480395)
chr7 (23-281)||(3837850-3838108)
chr7 (57-285)||(29497527-29497755)
chr7 (58-298)||(31398912-31399151)
chr7 (25-292)||(33257871-33258138)
chr7 (25-292)||(30866722-30866989)
chr7 (29-223)||(41889372-41889566)
chr7 (58-294)||(31815053-31815288)
chr7 (25-277)||(35112419-35112671)
chr7 (26-297)||(29722286-29722556)
chr7 (25-228)||(37353920-37354112)
chr7 (25-292)||(1553505-1553770)
chr7 (25-297)||(28608585-28608856)
chr7 (30-194)||(6799118-6799283)
chr7 (30-285)||(36406746-36407004)
chr7 (28-282)||(35746641-35746894)
chr7 (117-294)||(8381908-8382085)
chr7 (65-273)||(36648011-36648218)
chr7 (99-292)||(38168774-38168968)
chr7 (25-294)||(18194198-18194467)
chr7 (25-292)||(3310206-3310462)
chr7 (29-282)||(43874079-43874331)
chr7 (25-224)||(3177920-3178119)
chr7 (25-217)||(45324018-45324206)
chr7 (25-174)||(46285949-46286098)
chr7 (58-285)||(24283605-24283829)
chr7 (59-290)||(34368648-34368878)
chr7 (30-181)||(42880962-42881113)
chr7 (60-190)||(17354114-17354244)
chr7 (69-196)||(22382156-22382281)
chr7 (55-292)||(9601879-9602116)
chr7 (55-292)||(9829450-9829687)
chr7 (25-224)||(46563177-46563376)
chr7 (29-282)||(19327787-19328035)
chr7 (29-199)||(47459638-47459807)
chr7 (59-285)||(44820600-44820816)
chr7 (57-285)||(8965893-8966121)
chr7 (149-292)||(47408227-47408370)
chr7 (69-285)||(35860001-35860215)
chr7 (25-224)||(48981433-48981633)
chr7 (74-226)||(22057462-22057620)
chr7 (52-282)||(30586673-30586902)
chr7 (112-298)||(8380572-8380758)
chr7 (25-161)||(33071896-33072032)
chr7 (25-172)||(36339303-36339452)
chr7 (23-112)||(2408827-2408916)
chr7 (23-176)||(26803532-26803685)
chr7 (80-282)||(22785925-22786126)
chr7 (204-292)||(6799588-6799676)
chr7 (69-197)||(46715383-46715511)
chr7 (57-197)||(32049435-32049575)
chr7 (78-124)||(41409764-41409810)
chr7 (25-101)||(13431308-13431384)
chr7 (248-292)||(17896477-17896521)
chr7 (34-125)||(24233150-24233240)
chr7 (131-197)||(35684249-35684315)
chr7 (57-139)||(41480628-41480710)
chr7 (25-75)||(47408128-47408178)
chr7 (69-113)||(27235437-27235481)
chr7 (69-140)||(28408602-28408673)
chr7 (152-278)||(33072162-33072288)
chr7 (57-103)||(46392612-46392658)
chr7 (248-282)||(46715308-46715342)
chr7 (240-285)||(41888987-41889032)
[»] chr4 (169 HSPs)
chr4 (30-295)||(353964-354229)
chr4 (29-285)||(19093144-19093400)
chr4 (25-293)||(44217699-44217967)
chr4 (26-292)||(47251407-47251673)
chr4 (25-298)||(53599764-53600037)
chr4 (25-292)||(13629177-13629444)
chr4 (25-292)||(38617293-38617558)
chr4 (25-283)||(46871914-46872172)
chr4 (25-278)||(35381417-35381665)
chr4 (25-292)||(16464766-16465033)
chr4 (25-292)||(35232282-35232548)
chr4 (29-290)||(5374336-5374597)
chr4 (29-294)||(48782197-48782461)
chr4 (25-294)||(4201312-4201569)
chr4 (29-285)||(33084475-33084726)
chr4 (25-292)||(22828385-22828652)
chr4 (25-292)||(44069024-44069291)
chr4 (25-294)||(21044730-21044998)
chr4 (25-285)||(31861977-31862237)
chr4 (25-292)||(8735383-8735649)
chr4 (26-277)||(29295348-29295599)
chr4 (25-292)||(56576088-56576354)
chr4 (25-295)||(44013894-44014164)
chr4 (25-282)||(38542270-38542527)
chr4 (25-292)||(55147044-55147312)
chr4 (33-292)||(6195025-6195284)
chr4 (23-294)||(26620333-26620604)
chr4 (25-196)||(52677225-52677396)
chr4 (59-293)||(22678292-22678526)
chr4 (50-294)||(39671343-39671587)
chr4 (25-277)||(42099701-42099953)
chr4 (25-272)||(16664234-16664481)
chr4 (25-274)||(53125240-53125489)
chr4 (25-277)||(3436066-3436318)
chr4 (25-292)||(39683698-39683965)
chr4 (25-292)||(42513009-42513277)
chr4 (26-298)||(47428523-47428785)
chr4 (25-292)||(12252093-12252352)
chr4 (26-228)||(47093806-47094008)
chr4 (25-278)||(36408716-36408969)
chr4 (25-278)||(36422882-36423135)
chr4 (25-292)||(50623407-50623672)
chr4 (25-292)||(23719768-23720035)
chr4 (59-282)||(40411970-40412193)
chr4 (26-285)||(55702914-55703173)
chr4 (23-220)||(8741680-8741877)
chr4 (25-297)||(52061556-52061823)
chr4 (29-281)||(19527215-19527455)
chr4 (29-292)||(30939152-30939415)
chr4 (66-285)||(35231724-35231943)
chr4 (57-292)||(26906373-26906608)
chr4 (26-224)||(44549637-44549835)
chr4 (44-292)||(36659411-36659659)
chr4 (23-285)||(34464268-34464530)
chr4 (25-276)||(37502014-37502266)
chr4 (68-290)||(54231574-54231797)
chr4 (25-187)||(9834257-9834419)
chr4 (25-282)||(33809080-33809337)
chr4 (25-196)||(29833006-29833177)
chr4 (72-285)||(23237667-23237883)
chr4 (23-285)||(47884978-47885249)
chr4 (31-285)||(52257782-52258036)
chr4 (25-170)||(23623601-23623746)
chr4 (29-181)||(27492356-27492509)
chr4 (25-294)||(43887976-43888243)
chr4 (25-294)||(55935100-55935369)
chr4 (104-295)||(33755012-33755201)
chr4 (23-182)||(36750168-36750327)
chr4 (25-228)||(32239393-32239592)
chr4 (67-294)||(52057434-52057660)
chr4 (25-292)||(9220025-9220292)
chr4 (67-274)||(18781514-18781721)
chr4 (29-226)||(34361053-34361249)
chr4 (29-285)||(47596604-47596860)
chr4 (29-196)||(41415005-41415171)
chr4 (25-292)||(47751530-47751790)
chr4 (25-279)||(26933769-26934022)
chr4 (25-298)||(30151665-30151938)
chr4 (44-292)||(42629329-42629577)
chr4 (25-196)||(53691734-53691905)
chr4 (25-282)||(34603617-34603874)
chr4 (88-285)||(44176580-44176777)
chr4 (59-292)||(45725563-45725796)
chr4 (25-292)||(42133030-42133297)
chr4 (25-285)||(18091235-18091495)
chr4 (67-294)||(19399569-19399795)
chr4 (50-278)||(56499610-56499840)
chr4 (59-209)||(36750576-36750726)
chr4 (25-292)||(1146030-1146300)
chr4 (25-285)||(1180892-1181153)
chr4 (66-293)||(31369835-31370062)
chr4 (25-155)||(33755200-33755333)
chr4 (44-296)||(14090252-14090504)
chr4 (55-283)||(14949077-14949305)
chr4 (25-176)||(37551765-37551916)
chr4 (52-163)||(51347282-51347393)
chr4 (67-278)||(18135048-18135260)
chr4 (56-281)||(39308955-39309179)
chr4 (67-278)||(49122258-49122470)
chr4 (150-278)||(42645379-42645507)
chr4 (69-281)||(48509865-48510076)
chr4 (57-280)||(38865929-38866149)
chr4 (52-282)||(48087718-48087948)
chr4 (26-224)||(6150688-6150886)
chr4 (159-293)||(31984135-31984269)
chr4 (67-174)||(41955776-41955883)
chr4 (25-163)||(38617809-38617947)
chr4 (69-292)||(1615039-1615260)
chr4 (44-285)||(8456902-8457143)
chr4 (25-178)||(27918595-27918747)
chr4 (66-285)||(3036419-3036636)
chr4 (25-137)||(37394298-37394410)
chr4 (25-292)||(38009750-38010017)
chr4 (25-176)||(3802153-3802304)
chr4 (53-209)||(6091420-6091578)
chr4 (50-197)||(34925421-34925568)
chr4 (25-293)||(36292618-36292877)
chr4 (59-285)||(1391162-1391388)
chr4 (69-197)||(54029135-54029263)
chr4 (53-162)||(17978090-17978198)
chr4 (65-181)||(7242272-7242388)
chr4 (58-162)||(8752166-8752270)
chr4 (80-295)||(51654854-51655068)
chr4 (213-295)||(17698643-17698725)
chr4 (59-181)||(20087203-20087325)
chr4 (58-281)||(55430302-55430521)
chr4 (23-106)||(17698559-17698642)
chr4 (26-171)||(30151934-30152079)
chr4 (69-220)||(43086442-43086591)
chr4 (56-197)||(41813666-41813808)
chr4 (55-172)||(20294307-20294424)
chr4 (125-196)||(19731452-19731523)
chr4 (100-181)||(25098342-25098423)
chr4 (80-181)||(52978321-52978421)
chr4 (240-292)||(9834488-9834540)
chr4 (186-294)||(29511197-29511305)
chr4 (25-81)||(31984296-31984352)
chr4 (68-278)||(27654742-27654953)
chr4 (25-102)||(42645301-42645377)
chr4 (44-124)||(37987562-37987647)
chr4 (69-198)||(56486422-56486551)
chr4 (240-292)||(38027559-38027611)
chr4 (240-292)||(52677150-52677202)
chr4 (97-283)||(9746293-9746479)
chr4 (166-223)||(23621905-23621962)
chr4 (201-282)||(29832354-29832435)
chr4 (249-294)||(36408969-36409014)
chr4 (249-294)||(36423135-36423180)
chr4 (74-202)||(6129008-6129135)
chr4 (51-154)||(3588358-3588461)
chr4 (26-101)||(19740714-19740789)
chr4 (80-162)||(7037047-7037129)
chr4 (258-296)||(23621573-23621611)
chr4 (243-285)||(33751334-33751376)
chr4 (62-168)||(53219130-53219236)
chr4 (131-180)||(13435257-13435306)
chr4 (73-113)||(1615268-1615308)
chr4 (80-156)||(7037159-7037235)
chr4 (74-154)||(19692860-19692940)
chr4 (74-154)||(19703445-19703525)
chr4 (57-136)||(24948641-24948720)
chr4 (249-292)||(49089123-49089166)
chr4 (131-178)||(53467650-53467697)
chr4 (240-293)||(7243014-7243068)
chr4 (25-79)||(23237403-23237457)
chr4 (69-222)||(26915966-26916114)
chr4 (244-285)||(30151541-30151582)
chr4 (248-285)||(34361706-34361743)
chr4 (76-173)||(53855433-53855530)
[»] chr5 (121 HSPs)
chr5 (25-292)||(16124240-16124507)
chr5 (25-292)||(9127331-9127598)
chr5 (23-292)||(26854075-26854343)
chr5 (25-293)||(14793769-14794037)
chr5 (23-291)||(28024240-28024508)
chr5 (29-283)||(42911526-42911780)
chr5 (29-281)||(37303098-37303350)
chr5 (25-292)||(4175460-4175727)
chr5 (30-292)||(34261289-34261551)
chr5 (25-292)||(38502784-38503047)
chr5 (25-290)||(2133890-2134153)
chr5 (29-285)||(12664834-12665090)
chr5 (25-292)||(8229784-8230050)
chr5 (25-292)||(8825029-8825296)
chr5 (26-277)||(24074833-24075084)
chr5 (44-292)||(18020748-18020996)
chr5 (25-292)||(4985155-4985421)
chr5 (50-285)||(7403849-7404084)
chr5 (25-292)||(38910246-38910512)
chr5 (25-292)||(39073016-39073283)
chr5 (25-283)||(38702113-38702371)
chr5 (23-285)||(40198758-40199020)
chr5 (24-292)||(4017385-4017653)
chr5 (25-292)||(7579647-7579915)
chr5 (57-292)||(9076075-9076310)
chr5 (50-292)||(38017257-38017499)
chr5 (59-296)||(1087909-1088146)
chr5 (30-285)||(12869886-12870141)
chr5 (25-292)||(25343932-25344199)
chr5 (26-292)||(18794756-18795022)
chr5 (25-285)||(36239429-36239690)
chr5 (57-293)||(6754158-6754394)
chr5 (30-289)||(6689576-6689835)
chr5 (25-292)||(38363163-38363428)
chr5 (29-292)||(6072428-6072691)
chr5 (50-285)||(10359222-10359457)
chr5 (30-277)||(4962183-4962429)
chr5 (70-294)||(2673956-2674180)
chr5 (25-285)||(28446972-28447231)
chr5 (29-294)||(4098307-4098572)
chr5 (25-297)||(4427380-4427653)
chr5 (25-292)||(1297717-1297985)
chr5 (58-294)||(39893787-39894023)
chr5 (23-297)||(18437298-18437572)
chr5 (25-262)||(4694736-4694973)
chr5 (57-296)||(12784419-12784657)
chr5 (25-281)||(18465673-18465925)
chr5 (25-293)||(6007855-6008125)
chr5 (25-205)||(4688865-4689044)
chr5 (26-285)||(5119151-5119410)
chr5 (23-296)||(12722935-12723208)
chr5 (23-292)||(37809729-37809998)
chr5 (23-226)||(19831588-19831789)
chr5 (25-292)||(28463365-28463632)
chr5 (66-275)||(32388999-32389208)
chr5 (25-292)||(31803296-31803563)
chr5 (25-209)||(21606321-21606505)
chr5 (25-293)||(38297595-38297864)
chr5 (25-285)||(24228921-24229180)
chr5 (24-292)||(37633647-37633915)
chr5 (25-278)||(37306693-37306945)
chr5 (59-283)||(13461016-13461240)
chr5 (23-267)||(32439917-32440161)
chr5 (29-223)||(31802765-31802958)
chr5 (25-181)||(5144089-5144245)
chr5 (23-294)||(5842971-5843242)
chr5 (67-283)||(7408345-7408561)
chr5 (25-285)||(1795104-1795364)
chr5 (53-196)||(38297878-38298019)
chr5 (89-292)||(22582508-22582710)
chr5 (25-154)||(25027842-25027971)
chr5 (50-294)||(40208952-40209190)
chr5 (25-158)||(42394242-42394375)
chr5 (26-285)||(18392958-18393217)
chr5 (56-282)||(26906494-26906719)
chr5 (25-292)||(25785879-25786146)
chr5 (25-175)||(425101-425251)
chr5 (78-280)||(7466207-7466409)
chr5 (25-295)||(31985027-31985297)
chr5 (52-228)||(38160291-38160465)
chr5 (25-285)||(13703067-13703329)
chr5 (58-292)||(3243801-3244035)
chr5 (50-196)||(3892810-3892955)
chr5 (25-292)||(24469617-24469883)
chr5 (18-279)||(12637940-12638194)
chr5 (25-176)||(21150464-21150615)
chr5 (66-196)||(7735159-7735289)
chr5 (25-285)||(21157605-21157865)
chr5 (91-294)||(18000377-18000573)
chr5 (25-224)||(18676463-18676660)
chr5 (56-292)||(38308106-38308342)
chr5 (52-282)||(8849128-8849359)
chr5 (25-122)||(10889244-10889341)
chr5 (25-292)||(9958863-9959124)
chr5 (59-282)||(17869292-17869516)
chr5 (57-282)||(40927157-40927381)
chr5 (25-135)||(30368251-30368362)
chr5 (26-224)||(4608997-4609195)
chr5 (26-224)||(11413578-11413776)
chr5 (55-282)||(4440091-4440318)
chr5 (153-292)||(25027555-25027694)
chr5 (25-154)||(3686366-3686494)
chr5 (25-282)||(13957150-13957407)
chr5 (153-271)||(31546000-31546118)
chr5 (55-285)||(36481077-36481307)
chr5 (153-277)||(3686790-3686914)
chr5 (159-281)||(6330927-6331049)
chr5 (240-292)||(10889168-10889220)
chr5 (201-285)||(38297512-38297596)
chr5 (121-171)||(10734559-10734609)
chr5 (163-277)||(30368130-30368244)
chr5 (50-115)||(10735456-10735521)
chr5 (74-148)||(6330814-6330889)
chr5 (59-135)||(17872426-17872503)
chr5 (109-178)||(23418602-23418671)
chr5 (244-292)||(7734764-7734812)
chr5 (244-283)||(4688810-4688849)
chr5 (170-277)||(10734155-10734261)
chr5 (74-152)||(25683288-25683366)
chr5 (201-278)||(7834059-7834136)
chr5 (248-285)||(31803132-31803169)
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (23-293)||(43775378-43775648)
chr3 (25-292)||(33491128-33491395)
chr3 (25-292)||(28885668-28885934)
chr3 (25-292)||(53745271-53745537)
chr3 (26-292)||(47069846-47070112)
chr3 (23-281)||(54898086-54898344)
chr3 (26-294)||(54106254-54106522)
chr3 (23-281)||(3376304-3376566)
chr3 (25-284)||(19550236-19550495)
chr3 (25-292)||(43554380-43554646)
chr3 (25-277)||(17102744-17102996)
chr3 (25-292)||(27483777-27484042)
chr3 (23-285)||(51244612-51244874)
chr3 (25-285)||(790540-790800)
chr3 (23-294)||(34266427-34266696)
chr3 (25-220)||(7328445-7328640)
chr3 (25-292)||(32980630-32980897)
chr3 (57-292)||(45101347-45101582)
chr3 (25-278)||(39866852-39867104)
chr3 (25-285)||(52627234-52627494)
chr3 (25-285)||(52663432-52663692)
chr3 (59-297)||(13158423-13158662)
chr3 (29-285)||(35315126-35315382)
chr3 (25-223)||(45513673-45513871)
chr3 (50-294)||(45145144-45145387)
chr3 (25-294)||(36234357-36234623)
chr3 (25-286)||(46973410-46973674)
chr3 (81-282)||(27992286-27992487)
chr3 (30-292)||(29651667-29651925)
chr3 (29-285)||(29697985-29698241)
chr3 (25-285)||(47104151-47104411)
chr3 (26-292)||(42671879-42672145)
chr3 (25-298)||(50091935-50092208)
chr3 (29-292)||(3643185-3643448)
chr3 (25-292)||(33874535-33874802)
chr3 (59-273)||(51697571-51697786)
chr3 (26-289)||(24981286-24981544)
chr3 (50-292)||(51219082-51219315)
chr3 (27-292)||(40139831-40140083)
chr3 (25-292)||(41425619-41425886)
chr3 (25-215)||(13168006-13168197)
chr3 (23-292)||(27039595-27039864)
chr3 (25-292)||(40318917-40319184)
chr3 (59-285)||(41168785-41169008)
chr3 (59-294)||(41926701-41926939)
chr3 (68-296)||(49123556-49123783)
chr3 (25-181)||(20105182-20105338)
chr3 (25-292)||(20848713-20848975)
chr3 (25-280)||(51064873-51065128)
chr3 (55-278)||(54911305-54911527)
chr3 (26-283)||(33074276-33074532)
chr3 (25-282)||(11473392-11473649)
chr3 (99-292)||(43945443-43945636)
chr3 (25-285)||(45055177-45055437)
chr3 (25-292)||(41351183-41351451)
chr3 (25-285)||(48151975-48152235)
chr3 (58-290)||(52175743-52175974)
chr3 (25-292)||(40010653-40010920)
chr3 (69-281)||(24064-24276)
chr3 (56-292)||(27028004-27028240)
chr3 (25-209)||(30861614-30861798)
chr3 (25-292)||(42515163-42515428)
chr3 (50-284)||(6902293-6902527)
chr3 (50-196)||(32854033-32854179)
chr3 (75-282)||(25983662-25983868)
chr3 (25-297)||(48214057-48214317)
chr3 (23-293)||(5243924-5244193)
chr3 (25-282)||(35077377-35077634)
chr3 (26-283)||(54334181-54334437)
chr3 (25-199)||(53281969-53282143)
chr3 (25-154)||(44544296-44544425)
chr3 (29-196)||(55141561-55141725)
chr3 (25-285)||(49168354-49168614)
chr3 (59-290)||(52173771-52174000)
chr3 (25-224)||(23771277-23771476)
chr3 (102-292)||(29803727-29803905)
chr3 (25-292)||(28226417-28226673)
chr3 (25-226)||(36370883-36371086)
chr3 (69-279)||(26748387-26748596)
chr3 (142-282)||(29458202-29458342)
chr3 (59-221)||(42671473-42671635)
chr3 (111-209)||(28943606-28943704)
chr3 (23-129)||(44092181-44092287)
chr3 (52-297)||(2642727-2642964)
chr3 (97-281)||(32853360-32853542)
chr3 (25-282)||(47843842-47844094)
chr3 (57-281)||(34750677-34750900)
chr3 (25-196)||(22173925-22174096)
chr3 (66-181)||(43159860-43159975)
chr3 (30-196)||(22099909-22100075)
chr3 (69-292)||(35458493-35458716)
chr3 (59-136)||(2154184-2154261)
chr3 (84-282)||(8236894-8237089)
chr3 (55-282)||(24569570-24569800)
chr3 (55-285)||(53290757-53290987)
chr3 (153-228)||(44544080-44544155)
chr3 (25-108)||(29803625-29803708)
chr3 (29-135)||(29458865-29458974)
chr3 (69-113)||(40113415-40113459)
chr3 (55-106)||(1201083-1201134)
chr3 (240-291)||(13168210-13168261)
chr3 (55-174)||(31610216-31610334)
chr3 (248-292)||(2858566-2858610)
chr3 (74-154)||(18355927-18356007)
chr3 (66-196)||(42634431-42634562)
chr3 (248-292)||(45513307-45513351)
chr3 (58-113)||(3035581-3035636)
chr3 (143-197)||(53055339-53055393)
chr3 (243-292)||(7329032-7329081)
chr3 (259-292)||(20105397-20105430)
chr3 (238-295)||(22173734-22173791)
chr3 (244-297)||(31610071-31610123)
chr3 (240-285)||(44543727-44543772)
[»] chr8 (123 HSPs)
chr8 (25-285)||(21651736-21651996)
chr8 (25-295)||(36058223-36058492)
chr8 (26-293)||(10180361-10180628)
chr8 (25-292)||(18291454-18291720)
chr8 (29-282)||(12342607-12342860)
chr8 (25-292)||(33935043-33935310)
chr8 (25-285)||(14263534-14263794)
chr8 (57-292)||(38482775-38483010)
chr8 (25-291)||(26062698-26062963)
chr8 (25-277)||(27518711-27518957)
chr8 (29-293)||(34981823-34982087)
chr8 (25-292)||(23429899-23430166)
chr8 (25-281)||(33314533-33314790)
chr8 (25-284)||(34046841-34047100)
chr8 (25-281)||(9954639-9954895)
chr8 (25-293)||(23848538-23848806)
chr8 (25-292)||(15596334-15596601)
chr8 (25-292)||(39303498-39303766)
chr8 (58-293)||(35052076-35052311)
chr8 (57-282)||(4057310-4057535)
chr8 (25-292)||(25703561-25703827)
chr8 (25-292)||(25812732-25812998)
chr8 (55-289)||(43641975-43642209)
chr8 (58-281)||(40228318-40228541)
chr8 (64-294)||(2456096-2456321)
chr8 (55-292)||(14228305-14228541)
chr8 (59-295)||(1245336-1245572)
chr8 (25-296)||(18842520-18842790)
chr8 (62-285)||(45281368-45281590)
chr8 (71-293)||(32010066-32010288)
chr8 (29-290)||(16656695-16656955)
chr8 (25-292)||(38128530-38128790)
chr8 (24-296)||(13173918-13174190)
chr8 (26-293)||(11993884-11994139)
chr8 (23-292)||(6757394-6757663)
chr8 (25-293)||(8453218-8453483)
chr8 (25-293)||(2335423-2335691)
chr8 (25-292)||(2888451-2888718)
chr8 (25-298)||(8553993-8554266)
chr8 (25-194)||(13327769-13327938)
chr8 (51-278)||(1202441-1202668)
chr8 (18-292)||(35296027-35296301)
chr8 (23-196)||(6750603-6750776)
chr8 (29-292)||(167460-167723)
chr8 (53-285)||(17074572-17074804)
chr8 (53-285)||(17573466-17573698)
chr8 (65-294)||(26740118-26740347)
chr8 (25-285)||(3720670-3720930)
chr8 (25-228)||(17718493-17718696)
chr8 (58-308)||(23855581-23855831)
chr8 (65-223)||(9808026-9808184)
chr8 (25-179)||(16700989-16701143)
chr8 (67-285)||(43553071-43553289)
chr8 (25-297)||(8730807-8731077)
chr8 (26-220)||(7605954-7606146)
chr8 (24-292)||(23793254-23793526)
chr8 (57-196)||(40603930-40604069)
chr8 (25-226)||(12763425-12763625)
chr8 (55-196)||(11707564-11707705)
chr8 (67-292)||(12248753-12248978)
chr8 (62-222)||(15647452-15647612)
chr8 (25-294)||(7483734-7484001)
chr8 (68-220)||(3513390-3513542)
chr8 (62-222)||(15623664-15623824)
chr8 (25-292)||(14061132-14061399)
chr8 (25-196)||(43553322-43553493)
chr8 (25-181)||(43553544-43553701)
chr8 (51-196)||(31028670-31028815)
chr8 (25-224)||(38074266-38074465)
chr8 (58-292)||(19972302-19972536)
chr8 (58-292)||(21020297-21020531)
chr8 (53-278)||(39615450-39615674)
chr8 (59-196)||(35051870-35052007)
chr8 (23-285)||(11163254-11163516)
chr8 (69-292)||(27911655-27911878)
chr8 (69-292)||(27958074-27958297)
chr8 (25-282)||(13132111-13132366)
chr8 (27-285)||(14511419-14511686)
chr8 (25-180)||(40521337-40521493)
chr8 (55-226)||(35498119-35498290)
chr8 (54-209)||(41701548-41701703)
chr8 (52-292)||(9301526-9301766)
chr8 (29-285)||(38221807-38222062)
chr8 (153-292)||(41308013-41308153)
chr8 (18-224)||(41890505-41890711)
chr8 (74-292)||(9687497-9687711)
chr8 (84-181)||(17313126-17313223)
chr8 (29-224)||(8954750-8954945)
chr8 (25-284)||(45317642-45317901)
chr8 (25-154)||(41305634-41305763)
chr8 (25-281)||(6660943-6661199)
chr8 (25-281)||(6741345-6741601)
chr8 (57-195)||(10086235-10086373)
chr8 (175-292)||(17313282-17313399)
chr8 (112-292)||(36111926-36112104)
chr8 (69-278)||(42352773-42352980)
chr8 (51-284)||(40608051-40608287)
chr8 (65-130)||(8672332-8672397)
chr8 (69-282)||(11727617-11727829)
chr8 (69-282)||(29125936-29126148)
chr8 (57-157)||(13935194-13935294)
chr8 (123-292)||(35029635-35029803)
chr8 (124-296)||(8672583-8672755)
chr8 (117-285)||(41643480-41643648)
chr8 (125-282)||(15281469-15281626)
chr8 (125-282)||(15461838-15461995)
chr8 (55-162)||(37998224-37998330)
chr8 (25-148)||(30205450-30205573)
chr8 (80-224)||(27193104-27193248)
chr8 (50-162)||(40602870-40602982)
chr8 (186-285)||(13328121-13328220)
chr8 (25-122)||(35028598-35028693)
chr8 (244-282)||(1739902-1739940)
chr8 (245-283)||(17718906-17718944)
chr8 (109-174)||(10013317-10013382)
chr8 (74-154)||(28568056-28568136)
chr8 (74-154)||(28575649-28575729)
chr8 (190-285)||(11707444-11707539)
chr8 (57-155)||(12753116-12753215)
chr8 (25-72)||(32010306-32010352)
chr8 (244-282)||(9806829-9806867)
chr8 (50-112)||(38238932-38238994)
chr8 (248-285)||(29091075-29091112)
[»] chr1 (108 HSPs)
chr1 (25-292)||(10675892-10676159)
chr1 (25-285)||(13699164-13699424)
chr1 (24-292)||(30686400-30686668)
chr1 (25-293)||(13507760-13508028)
chr1 (25-293)||(13514948-13515216)
chr1 (25-292)||(32994450-32994720)
chr1 (25-295)||(21927675-21927943)
chr1 (25-278)||(35255476-35255729)
chr1 (23-292)||(43500494-43500763)
chr1 (25-292)||(35531275-35531542)
chr1 (29-285)||(19929453-19929709)
chr1 (25-292)||(50825553-50825819)
chr1 (25-285)||(37609291-37609548)
chr1 (52-296)||(37437029-37437273)
chr1 (25-295)||(13566666-13566939)
chr1 (26-292)||(38648448-38648714)
chr1 (57-295)||(19349356-19349594)
chr1 (26-292)||(45368079-45368345)
chr1 (66-295)||(1024587-1024816)
chr1 (25-293)||(35483760-35484026)
chr1 (25-292)||(18033806-18034073)
chr1 (25-292)||(31588720-31588986)
chr1 (62-292)||(12124671-12124901)
chr1 (30-292)||(20605604-20605866)
chr1 (25-278)||(28679011-28679264)
chr1 (25-278)||(45226571-45226824)
chr1 (25-294)||(51972259-51972528)
chr1 (25-292)||(1429274-1429541)
chr1 (25-287)||(49908164-49908429)
chr1 (26-282)||(7782942-7783197)
chr1 (25-285)||(49497142-49497402)
chr1 (29-222)||(43952782-43952975)
chr1 (15-292)||(32347956-32348234)
chr1 (98-292)||(12231051-12231245)
chr1 (25-285)||(44182750-44183008)
chr1 (25-295)||(32168289-32168559)
chr1 (25-223)||(44818444-44818642)
chr1 (25-285)||(9361963-9362223)
chr1 (25-284)||(48508123-48508382)
chr1 (95-293)||(1677258-1677456)
chr1 (26-296)||(51613402-51613672)
chr1 (23-292)||(40926733-40926992)
chr1 (29-292)||(18344320-18344583)
chr1 (25-295)||(36318343-36318612)
chr1 (59-296)||(35700351-35700588)
chr1 (108-292)||(2059792-2059976)
chr1 (25-294)||(31570615-31570884)
chr1 (29-285)||(52749011-52749265)
chr1 (25-209)||(15660577-15660761)
chr1 (26-281)||(30702281-30702536)
chr1 (52-294)||(4100887-4101129)
chr1 (110-292)||(29830828-29831010)
chr1 (23-282)||(38597578-38597838)
chr1 (26-289)||(9127658-9127923)
chr1 (29-294)||(31487757-31488022)
chr1 (67-285)||(51974158-51974376)
chr1 (59-292)||(12721464-12721697)
chr1 (128-292)||(8464237-8464401)
chr1 (50-283)||(10506828-10507059)
chr1 (107-283)||(39412500-39412676)
chr1 (23-226)||(19455445-19455647)
chr1 (25-292)||(37735119-37735386)
chr1 (27-285)||(43808890-43809154)
chr1 (27-283)||(1427672-1427927)
chr1 (90-196)||(24781810-24781916)
chr1 (25-196)||(1038073-1038245)
chr1 (25-196)||(1044979-1045151)
chr1 (25-285)||(52649716-52649976)
chr1 (25-136)||(8464585-8464696)
chr1 (25-226)||(48265082-48265283)
chr1 (25-292)||(17013412-17013683)
chr1 (67-289)||(46096581-46096800)
chr1 (50-181)||(38818016-38818147)
chr1 (25-195)||(1039445-1039614)
chr1 (25-195)||(1046351-1046520)
chr1 (25-285)||(52759018-52759278)
chr1 (125-285)||(5598145-5598295)
chr1 (66-281)||(42800139-42800352)
chr1 (25-255)||(37296745-37296972)
chr1 (25-196)||(48174748-48174919)
chr1 (67-196)||(8008245-8008374)
chr1 (25-134)||(19093258-19093367)
chr1 (100-292)||(33720582-33720774)
chr1 (80-282)||(2572016-2572217)
chr1 (26-132)||(5597814-5597920)
chr1 (30-132)||(35605453-35605555)
chr1 (59-224)||(11248805-11248970)
chr1 (23-282)||(8973442-8973700)
chr1 (77-224)||(42787334-42787481)
chr1 (24-176)||(50152422-50152574)
chr1 (26-118)||(1428210-1428302)
chr1 (52-282)||(1859112-1859337)
chr1 (55-159)||(52825297-52825401)
chr1 (149-292)||(1428519-1428662)
chr1 (50-139)||(36850660-36850747)
chr1 (84-282)||(10630461-10630657)
chr1 (56-282)||(41155296-41155521)
chr1 (80-174)||(38569718-38569812)
chr1 (159-283)||(35605722-35605846)
chr1 (29-122)||(3684786-3684876)
chr1 (240-282)||(45230722-45230764)
chr1 (25-74)||(1677206-1677255)
chr1 (240-292)||(48264756-48264808)
chr1 (240-274)||(43952983-43953017)
chr1 (80-174)||(45230030-45230124)
chr1 (82-168)||(49756678-49756764)
chr1 (125-174)||(22154705-22154754)
chr1 (244-285)||(42787140-42787181)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (25-281)||(26470718-26470974)
chr6 (23-294)||(8992536-8992808)
chr6 (23-294)||(9016983-9017255)
chr6 (25-297)||(17193148-17193420)
chr6 (25-294)||(24663369-24663638)
chr6 (25-292)||(1751415-1751682)
chr6 (22-292)||(3621577-3621847)
chr6 (25-294)||(22050039-22050307)
chr6 (57-281)||(17123980-17124202)
chr6 (25-276)||(373713-373964)
chr6 (25-296)||(23777286-23777557)
chr6 (25-292)||(23923697-23923964)
chr6 (57-294)||(12732198-12732434)
chr6 (25-282)||(8176426-8176680)
chr6 (25-292)||(17835883-17836150)
chr6 (26-286)||(22784658-22784918)
chr6 (25-215)||(30388711-30388901)
chr6 (25-292)||(9838106-9838373)
chr6 (55-292)||(30416059-30416296)
chr6 (25-292)||(364526-364794)
chr6 (44-292)||(17251239-17251488)
chr6 (25-293)||(34607088-34607356)
chr6 (44-295)||(7056121-7056374)
chr6 (65-292)||(32359424-32359646)
chr6 (68-283)||(7632030-7632245)
chr6 (30-220)||(27313495-27313688)
chr6 (25-292)||(31244733-31245000)
chr6 (23-292)||(33260688-33260962)
chr6 (59-285)||(1252189-1252416)
chr6 (25-292)||(24356038-24356305)
chr6 (44-292)||(11676599-11676844)
chr6 (25-293)||(34730550-34730817)
chr6 (81-297)||(11128877-11129093)
chr6 (25-206)||(52653-52834)
chr6 (25-297)||(24635698-24635970)
chr6 (25-294)||(34378849-34379118)
chr6 (84-292)||(1249588-1249796)
chr6 (25-293)||(22400547-22400815)
chr6 (67-224)||(7235472-7235629)
chr6 (58-223)||(30237001-30237166)
chr6 (26-278)||(17601131-17601390)
chr6 (56-278)||(32250950-32251170)
chr6 (44-189)||(24948252-24948397)
chr6 (53-282)||(1923869-1924099)
chr6 (67-221)||(11431212-11431366)
chr6 (66-295)||(7170183-7170412)
chr6 (55-283)||(19811976-19812204)
chr6 (125-292)||(3850408-3850577)
chr6 (68-226)||(13597443-13597600)
chr6 (25-130)||(3849055-3849160)
chr6 (25-195)||(31854570-31854742)
chr6 (145-292)||(26485669-26485816)
chr6 (57-277)||(11000809-11001028)
chr6 (69-282)||(15432705-15432917)
chr6 (23-102)||(19645846-19645925)
chr6 (26-292)||(1135165-1135425)
chr6 (69-224)||(2381061-2381216)
chr6 (203-290)||(53798-53886)
chr6 (56-176)||(7632464-7632584)
chr6 (240-292)||(30388971-30389023)
chr6 (50-113)||(11835095-11835158)
chr6 (183-294)||(24949255-24949366)
chr6 (153-296)||(19645702-19645847)
chr6 (60-103)||(847821-847864)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (33-292)||(8152-8411)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (25-292)||(49137-49403)
scaffold0024 (248-292)||(89383-89427)
[»] scaffold1213 (1 HSPs)
scaffold1213 (25-224)||(19-222)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (29-292)||(69094-69356)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (25-291)||(4506-4770)
[»] scaffold0831 (1 HSPs)
scaffold0831 (23-227)||(2795-2999)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (59-297)||(148326-148565)
scaffold0002 (25-215)||(138791-138982)
scaffold0002 (25-176)||(369394-369544)
scaffold0002 (69-162)||(492454-492547)
scaffold0002 (240-291)||(138727-138778)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (25-295)||(26108-26378)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (59-292)||(77112-77345)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (25-292)||(147111-147379)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (25-226)||(14771-14972)
scaffold0192 (265-298)||(13633-13666)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (74-292)||(419476-419694)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (28-292)||(7417-7681)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (25-293)||(223-490)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (25-209)||(184194-184378)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (25-292)||(30676-30943)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (30-156)||(72067-72193)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (29-292)||(309-572)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (23-285)||(96052-96314)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (29-224)||(23130-23325)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (25-132)||(195882-195989)
scaffold0014 (124-285)||(195578-195738)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (31-171)||(1029-1169)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (31-171)||(6460-6600)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (75-285)||(14241-14451)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (25-285)||(252584-252844)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (82-292)||(599-809)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (112-292)||(1802-1981)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (80-227)||(21017-21164)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (240-289)||(91875-91924)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 621; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 621; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 747
Target Start/End: Original strand, 4883601 - 4884311
Alignment:
Q  33 ttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 132  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4883601 ttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagtt 4883700  T
Q  133 atttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcatt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4883701 atttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaatcatt 4883800  T
Q  233 agctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataatagtaatagtaaagtctaaacaaacatactataaca 332  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4883801 ggctatattagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggatgtagtaataatagtaatagtaaagtctaaacaaacatactataaca 4883900  T
Q  333 aaaatatacatttgggatttaattggataagaacttatgatatgtatggtatgtgatggaagcatcatgtcatgctctctgcgttaaagaatgaatgaca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  4883901 aaaatatacatttgggatttaattggataagaacttatgatatgtatggaatgtgatggaagcattatgtcatgctctctgcgttaaa----gaatgaca 4883996  T
Q  433 gacaccaatgaatattgaacagaacacactattttttccctctatgtgtgaatgggaattaataacagtgaatggattactctaatggtagcaacaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4883997 gacaccaatgaatattgaacagaacacactattttttccctctatgtgtgaatgggaattaataacagtgaatggattactctaatggtagcaacaacat 4884096  T
Q  533 aacatggatcatgtctcaatcacattctattatgatgcaataagctttatgaatgcaccacaaccagacacaatagtaatggcatccnnnnnnncttttc 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  4884097 aacatggatcatgtctcaatcacattctattatgatgcaataagctttatgaatgcaccaaaaccagacacaatagtaatggcatcctttttttcttttc 4884196  T
Q  633 tcctgtattccaatcatttgatctcttctctcaatagtttttatctttccatgtgcacttcaacttttaagcttcatcatccattaaaaaccaaaataaa 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4884197 tcctgtattccaatcatttgatctcttctctcaatagtttttatctttccatgtgcacttcaacttttaagcttcatcatccattaaaaaccaaaataaa 4884296  T
Q  733 taaattcaaaccttt 747  Q
    |||||||||||||||    
T  4884297 taaattcaaaccttt 4884311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11222569 - 11222302
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11222569 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 11222470  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11222469 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaa 11222370  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11222369 caatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 11222302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 4654709 - 4654977
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4654709 gttccttcttacgtgtcttttttgaagaaatttttcgtttctatttaactgtcacttgcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattat 4654808  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4654809 ccttagttatttatagcggagagagaaatgtatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacacaacttattgcatcaaaagtagtaa 4654908  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4654909 caatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgagacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 4654977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15183254 - 15182986
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15183254 gttcctttttaagtgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 15183155  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  15183154 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtat 15183055  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||  ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15183054 caattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 15182986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 26342570 - 26342837
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26342570 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttggttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 26342669  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  26342670 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 26342769  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26342770 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 26342837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 10812189 - 10812456
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812189 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 10812288  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||     
T  10812289 ccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcatcaaaagtagtat 10812388  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10812389 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 10812456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 41885615 - 41885882
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41885615 gttcctttttaggtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgt 41885714  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  41885715 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtacagcttattgcatcaaaagtagtat 41885814  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41885815 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatgaaaaaggaacggaggtagta 41885882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36405095 - 36404842
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36405095 gttcatttttaagtgtctcttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattat 36404996  T
Q  125 ccttagttatttattg-cggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36404995 ccttagttatttatttacggatagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagta 36404896  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36404895 acaatcattgactatcttggttcatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaa 36404842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 479221 - 478969
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  479221 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcctta 479122  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||     
T  479121 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 479022  T
Q  230 attagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||   ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  479021 attgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaagaac 478969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 3363606 - 3363842
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3363606 ttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 3363705  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| |||   | | ||||||| |||||||||    
T  3363706 tgaaatgagatattaaatcaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatg 3363805  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3363806 tcaaaatgcgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 3363842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 34399192 - 34399464
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34399192 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaaccatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 34399291  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||     
T  34399292 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtat 34399391  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34399392 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaataat 34399464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 19594341 - 19594607
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19594341 gttcctttttaattgtcactttttgagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaa-ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 19594439  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||     
T  19594440 ccatagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatat 19594539  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19594540 caattgttgattatctttgtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 19594607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14296010 - 14295754
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14296010 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgt 14295911  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  14295910 ccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataccttattgcatcaaaagtagtat 14295811  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295810 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 14295754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 37093440 - 37093699
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  37093440 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattgt 37093539  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  37093540 ccttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag-tcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtat 37093638  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  |||  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37093639 caattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggtacgga 37093699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15893833 - 15893566
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893833 gttcctttttaagtgtcaattttggaaaataaatttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 15893734  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  15893733 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 15893634  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15893633 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 15893566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30264855 - 30264595
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30264855 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgt 30264756  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||     
T  30264755 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtat 30264656  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30264655 caattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 30264595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 34357168 - 34357435
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34357168 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 34357267  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  34357268 ccttagttatttactgtggaaagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaaatagtat 34357367  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||  ||   ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34357368 aaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcgaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 34357435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 44360424 - 44360692
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |     
T  44360424 gttcctttttaatcgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatat-ac 44360522  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44360523 ccttaaatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 44360622  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||| |||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44360623 caattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 44360692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 36375561 - 36375830
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36375561 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatagtat 36375660  T
Q  125 c--cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||    
T  36375661 tatcttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaggtagt 36375760  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36375761 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 36375830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 13215381 - 13215650
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13215381 ctgtacctttttaagtgtctcttttagagaattattttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatatt 13215480  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  13215481 atccttacttatttattacggagagagaaatatatgaaattagattttaaattaatagggttattatagtaaaaatacatatcattgtatcaaaagtagt 13215580  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| | |||   | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13215581 aacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaattaaaaaggaacggaggtagta 13215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11560292 - 11560047
Alignment:
Q  33 ttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 132  Q
    |||||||||  ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11560292 ttaagtgtcagttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt 11560193  T
Q  133 atttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcatt 232  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||    
T  11560192 atttattgtgaagagagaaatatatgcaatgagatattaaatgaataagataattatagtaaaagtacagcttattacatcaaaagtaatatcaattgtt 11560093  T
Q  233 agctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
       | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11560092 gattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 11560047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 285
Target Start/End: Original strand, 10263780 - 10264006
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt-atttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10263780 ttgttcctatttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtttatttattgcggagagagaaatatat 10263879  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  || | | | ||||||| ||||||||||    
T  10263880 gaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaat-tttggttgtcttggtttgtgtaaaatgt 10263978  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10263979 caaaatatgacaatttaaaaggaacgga 10264006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 290
Target Start/End: Original strand, 13965601 - 13965862
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13965601 ctttttaaatgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatataccaatattatcctt 13965700  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  ||||||    
T  13965701 agttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattggatcaaatgtaaaaacaat 13965800  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
     |||   | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13965801 tattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtag 13965862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28145825 - 28145566
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28145825 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 28145726  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||     
T  28145725 ccttagttatttattgcggagagagaattatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagt-aaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 28145627  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgt--aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    ||||  ||   | | ||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28145626 caattgttgattgtcttgatttatataaaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 28145566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 13753945 - 13754213
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13753945 gttcctttttaagtgtctcttttggagaacatttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattac 13754044  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaata-caacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||    
T  13754045 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgaaatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtagtaaattattgtatcaaaagtagta 13754144  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||| | | |   | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13754145 acatttaatgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaa 13754213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Original strand, 14288425 - 14288686
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14288425 ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttatcaatattgtcctt 14288524  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  14288525 aattatttatcgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtatcaat 14288624  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||   | | ||  ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14288625 tattgattgtctt--tttgtataaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagta 14288686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38072479 - 38072214
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38072479 gttccttttcaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcatttttgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 38072380  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||| | |||||||||||||||||||||     
T  38072379 ctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagttcattat------aatatagcttattgcatcaaaagtagtat 38072286  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38072285 caattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatatgacaaataaaaaggaacggaggtagtaataa 38072214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15677539 - 15677341
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15677539 tttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttatcaatattatcctta 15677440  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15677439 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaat 15677341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35158606 - 35158337
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35158606 ctgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatatt 35158507  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||| || |  |||||| ||||||||||||    
T  35158506 atccttgcttatttactgtggagaaagaaatatatgaaatgaaatagtaaatgaataaggttattacagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagt 35158407  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | | |||   | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35158406 aatatttattgaatgtcttggttcatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 35158337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25558432 - 25558170
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25558432 ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagtt-aatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcctt 25558334  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25558333 agttatttattgcgga--gagatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtctagcttattgtatcaaaagtagtatcaat 25558236  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
      ||   | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||    
T  25558235 ttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaatcaagaaagaacggaggtagtaat 25558170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Original strand, 9369968 - 9370231
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9369968 ctttttaattgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaagtgttgttttatcaatattaccctt 9370067  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||||||| |    
T  9370068 aaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacact 9370167  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||||    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  9370168 tattaatggtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagaaattgatgtagta 9370231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 14541321 - 14541579
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14541321 gttcctttttaaatgtcacttttggagaaaaatattgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattat 14541420  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |  ||| | ||||||||||||||    
T  14541421 ccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtatcgtatcaaaagtagtaa 14541520  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
     | | |||   | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14541521 tatttattgattgtattggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacg 14541579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Original strand, 43077283 - 43077542
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43077283 ttcctttttaattgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacc 43077382  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||  || |||||||||| ||  |   |||| |||||||||| ||||    
T  43077383 cttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaataaggccaatatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtaataac 43077482  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    | | |||   | | ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  43077483 acttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 43077542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 293
Target Start/End: Original strand, 9706819 - 9707045
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  9706819 atttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattatggagagataaatatataaaatgaga 9706918  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||| | | |||   | ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9706919 tatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtg 9707018  T
Q  267 acaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||    
T  9707019 acaattaaaaaggaacgggggtagtaa 9707045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32855014 - 32854768
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  32855014 ttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcgg 32854915  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattgg 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||| || ||   |||| |||||||||| ||||| | |||   ||| || |    
T  32854914 agagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattgtagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataacatttattgattatcttag 32854815  T
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32854814 tt--tgtaaaatgttaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 32854768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 1395554 - 1395822
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaatttttt-gttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||   |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  1395554 gttcctttttaagtgtcacatttgtagaaattttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgtt-ttttaccaacatta 1395652  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||  ||||||||||||||| || |||||| || | ||  ||||    
T  1395653 cccttagttaattattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaaagactaagactattatagtaaaaatataaattattgtataagaaaaagta 1395752  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1395753 acatttattaagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagt-acagttaaaaaggaacggaggtagtaat 1395822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13001139 - 13000897
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13001139 agaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatcttgttttatcagtattacccttagttatttattgcggagagag 13001040  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||| | |||   | | ||  ||| ||    
T  13001039 aaatatatgaaatgagatattaaataaataaggctattatagcaaaaatattaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtg 13000940  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  13000939 taaaatgtcacaaagtaacaattaaaaaagaacagatgtagta 13000897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38186271 - 38186054
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38186271 ttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaaagaaatatatg 38186172  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || ||||  ||   | | || |||| |||||||| ||    
T  38186171 aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaaataatatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatatc 38186072  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaa 276  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  38186071 aaaatgtgacaataaaaa 38186054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 2012851 - 2013035
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  2012851 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 2012950  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||| || || ||||||    
T  2012951 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaattactaaggttattatagtaaaagtataaattattg 2013035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 292
Target Start/End: Original strand, 14308434 - 14308650
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14308434 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatatcgttttatcaattgta--cttaattatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 14308531  T
Q  174 tgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 273  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14308532 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 14308631  T
Q  274 aaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  14308632 aaaagaaacggatgtagta 14308650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13849964 - 13849700
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  13849964 ctttttaattgtcacttttaaagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattaccttt 13849865  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||  |   |||| ||||||| || ||| | |    
T  13849864 agatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaatagcaattgtatcaaaactaataatatt 13849765  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
     |||   | | ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13849764 tattgattgttttggtttatataaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 13849700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31025193 - 31024924
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||     
T  31025193 gttcctttttaagtgtcattttgggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattac 31025094  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||  | |||||| || | ||  |||||    
T  31025093 ccttagttatttattatggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaa 31024994  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31024993 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagttacagttaaaaaggaacggatgtagtaat 31024924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 196
Target Start/End: Original strand, 6013490 - 6013636
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6013490 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggaaagag 6013589  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  6013590 aaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattataataaaa 6013636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34884793 - 34884523
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34884793 ctgttcctttttaactgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactttcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttatcaatatt 34884694  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | | |||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| ||||||||||||    
T  34884693 acctttagatgtttattgcggaaagaaaaacatatgaaataaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagt 34884594  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    || | | |||   ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| | |||||||    
T  34884593 aatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtttaaaatgaacgaaggtagtaa 34884523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 8443686 - 8443852
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattatcctt 128  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8443686 tttttaattgtcatttttgaagaaattttttgtccctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaa-attaaatgttgtttttaccaatattaccctt 8443784  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8443785 agatatttattgcggagagagaaacaaatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 8443852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 32674201 - 32674379
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  32674201 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaacaatcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 32674300  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga----tattaaatgaataagatcattatagtaaaaata 199  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  32674301 ccgtagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagaggagtattaaatgaataaggctattatagtaaaaata 32674379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32544015 - 32543777
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||| |     
T  32544015 agaatttttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacctttagttatttattacagagaaaa 32543916  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||  | |||||| || |||| |||||| | | |||   | | ||||||||||    
T  32543915 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaaactattatattaaaagtatcaattattgtataaaaattagtaatatttattgattgttttggtttatg 32543816  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgt 288  Q
    |||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  32543815 taaaatgttataaaatgacaattaaaaaggaacgaatgt 32543777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34309301 - 34309149
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34309301 ttcctttttaagtgtcacttttgaagaattttttt-ttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatgttatc 34309203  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 179  Q
     ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34309202 attgcttattcattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaata 34309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25187355 - 25187241
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  25187355 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattactcttaaatatttattgcggagagag 25187256  T
Q  150 aaatatatgaaatga 164  Q
    ||| |||||||||||    
T  25187255 aaacatatgaaatga 25187241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4952937 - 4952690
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          ||||||| ||||    
T  4952937 ctttttaattgtcatttttagagaaattttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatg---------aaatattaccctt 4952847  T
Q  129 agtta-tttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    |  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| || ||   || | || |||||||||||||     
T  4952846 aaatattttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccgttatagtaaaagtaaaaacaatagtattaaaagtagtaacat 4952747  T
Q  228 tcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
    | |||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4952746 ttattgatcattttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgg 4952690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 152
Target Start/End: Original strand, 14284122 - 14284245
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14284122 ctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttattcctgtttagttgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtcctt 14284221  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaa 152  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  14284222 aattatttattgcggagagagaaa 14284245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Original strand, 37077160 - 37077416
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||     
T  37077160 gttcatttttaattgtcacttttgaagaaattttttgtttttatttaagtgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttattttgtcattattac 37077259  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||| ||||| | || |||||| || |||||||||||    
T  37077260 cattggttatttattgcagatagagaaatatatgaaatgagatattaaattatgaaggttattatagaaaaaagataaattattgtataaaaagtagtaa 37077359  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaa-tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
     |   ||| | ||| ||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  37077360 aatgtatttgttatcttggtttgtgtaaaagactcaaaa-gtgacaattaaaaaggaa 37077416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31011905 - 31011704
Alignment:
Q  89 tcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatta 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||| | ||||    
T  31011905 tcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacctttatttatt-attgtggagagagaaatgtatgtaataagatattaaataaacaaggttatta 31011807  T
Q  189 tagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgt 288  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| | |||   | | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  31011806 tagtaaaaatagaa-ttattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggt 31011708  T
Q  289 agta 292  Q
    ||||    
T  31011707 agta 31011704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 838293 - 838068
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  838293 ttttttgtttctaattaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctattatgtccttagtaatttattgcagagagagaaata 838194  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaat-aagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaa 253  Q
    ||||||||  |||||||||| | | ||||| |||||||  |||| | || ||||||||||||||||||| | |  ||||   | | ||||||| ||||||    
T  838193 tatgaaatatgatattaaataattaaagat-attataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagtgaaatgcatttagtgtcttggtttgtgtaaa 838095  T
Q  254 atgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 280  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||    
T  838094 aaatcaaaatgcgacaattaaaaagga 838068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33947682 - 33947429
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| | |    
T  33947682 gttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataatgt 33947583  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| | || |||||| ||||||| |||| |    
T  33947582 ccttagtaatttattgtagagagagaaatatataaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataaattattgtatcaaaaatagtga 33947483  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
     |  ||||   ||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  33947482 aatacatttagtattttggtttgtgtagaaaatcaaaatgtgacaattaaaaag 33947429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Original strand, 29041942 - 29042138
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  29041942 gttcctttttaattgtcacttttagataaatttttttt--ctatttaactgtcactttcaaagtccaatgcaacattagatattgttttaccaatattac 29042039  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||||| || ||   |||| ||||||| ||||||    
T  29042040 ccgtagatatttattgc--agagagaaacatatgaaatga-aaattaaattaataacgtcattattgtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaa 29042136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 177
Target Start/End: Original strand, 30544507 - 30544662
Alignment:
Q  22 cctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 121  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30544507 cctgtttctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttat 30544606  T
Q  122 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 177  Q
    || ||||  ||||||| ||  ||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  30544607 tacccttgattatttactgtagagggataagtatatgaaataagatattaaatgaa 30544662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 36824486 - 36824584
Alignment:
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36824486 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaataaataagatcattacagtaaaagtgcaacttattgcattaaaaatagtaacaat 36824584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37116816 - 37116596
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||| |||||||| ||| |    
T  37116816 ttttttgtatctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatcttacccttagataattattacggagagaaaaaca 37116717  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
     | ||||| | ||||||||| ||||||| ||    |||||||| |      |||| ||||||| |||||||| | ||| | | | ||||||| |||||||    
T  37116716 caagaaataaaatattaaataaataagacca----agtaaaaaca------attgtatcaaaaatagtaacatttattggttgtcttggtttgtgtaaaa 37116627  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  37116626 tgtcagagaatgacaattaaaaaggaacgga 37116596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7529931 - 7529690
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7529931 aaattttttgtttctaaataagtttcactttcaaagttcaacacaatattaaatgatgtgttacctatattacccttagttatttattgcagagagagaa 7529832  T
Q  152 atatatgaaatg-agatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt 250  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||   ||||||| ||||  | || || ||| |||||||||||||| | | ||||| | | ||  ||| |||    
T  7529831 atatatgaaatgaaaatattaaatgatgaaggctattataggaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatttattagttgtcttcatttgtgt 7529732  T
Q  251 aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| | |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7529731 aaaaagacaaaaaatgacaattaaaaaggaacagatggagta 7529690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3376409 - 3376270
Alignment:
Q  146 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| | ||||||  || |||||||||| |||| |||   | | ||| ||    
T  3376409 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgttattataataaaaatatagcttattatattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatt 3376310  T
Q  246 tatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3376309 tgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 3376270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38148255 - 38148137
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  38148255 tttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttttcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtatat 38148156  T
Q  158 gaaatgagatattaaatga 176  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38148155 gaaatgagatattaaatga 38148137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 928253 - 928028
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    |||||||| ||| |||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||    
T  928253 tttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtctaatacatcattaaatgttgttttacatatattattcttaaatatttatt--gtagagagaaatat 928156  T
Q  156 atgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaat 255  Q
    || ||||||  |||||||||| |||| | ||||||| ||||| | || || || |||||||| |||||| ||  ||| | ||| || ||||||||||||     
T  928155 attaaatgaagtattaaatgattaaggttattataggaaaaagataaattgttacatcaaaaatagtaa-aagtatttgttatcttagtttatgtaaaaa 928057  T
Q  256 gtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  928056 gtcaaaatatgacaattaaaaaagaacgg 928028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28967456 - 28967285
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaa 152  Q
    ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||| |  |||||||||     
T  28967456 aatttttagtttctaattaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttatcgtagagagagaag 28967357  T
Q  153 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||||||||||| ||||||    
T  28967356 taaatgaaatgagatattaaatgataaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaaatagtaa 28967285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 2991829 - 2991937
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaa 152  Q
    |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  2991829 aatttttttttccaatttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagaca 2991927  T
Q  153 tatatgaaat 162  Q
     |||||||||    
T  2991928 catatgaaat 2991937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Original strand, 42088917 - 42089033
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  42088917 tttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataa 42089016  T
Q  158 gaaatgagatattaaat 174  Q
    |||||  ||||||||||    
T  42089017 gaaatatgatattaaat 42089033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 277
Target Start/End: Original strand, 45065092 - 45065314
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||   |||||||| ||    
T  45065092 ttttttgtttctaattaagtgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtaaagagagaagta 45065191  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
     ||||||| |||||||||||||  ||  | ||||||| ||||| |  | || |||||||||||||||||| ||  ||| | | | ||||||| |||||||    
T  45065192 aatgaaataagatattaaatgatgaatgttattatagaaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaaatatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 45065291  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
      |  ||| ||||||||||||||    
T  45065292 aattcaaaagtgacaattaaaaa 45065314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Original strand, 37660134 - 37660222
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 113  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37660134 gttcatttttaattgtcacttttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 37660222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Original strand, 25787354 - 25787574
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||| |||||||  || |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||| |||||  ||||||||||  ||||||||    
T  25787354 aaatattttgtttttaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatatttattgcatagagagaa 25787453  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||   ||||||| ||||  | || || ||| |||||||||          ||| | | | ||||||| ||||    
T  25787454 atatatgaaatgaagtattaaatgattaaggatattataggaaaaggataaattgttgtatcaaaagt----------atttgttgtcttggtttgtgta 25787543  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25787544 aaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 25787574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18904145 - 18904024
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||  | ||||||| ||||||||| |    
T  18904145 ttttatagaaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgtt---------ataaaacccttagtaatttattgcag 18904055  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaat 174  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  18904054 agagagaaatatataaaatatgatattaaat 18904024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42263712 - 42263619
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaat 162  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42263712 ttaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 42263619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 285
Target Start/End: Original strand, 36173088 - 36173309
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  36173088 ttttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttttctataatgaccttagtaatttattgcagggagagaaata 36173187  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    |         |||||||||| | ||||   |||||||  |||  | || |||||| |||||||||||| | |  ||||   | | ||||||| |||||||    
T  36173188 t---------gatattaaataattaaggatattataggtaaaccataaattattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgttttggtttgtgtaaaa 36173278  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36173279 agtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacgga 36173309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 37354023 - 37354247
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||    ||||||| |||||||   |||||| |||||||| ||||  ||||    
T  37354023 ttaactgtcactttcaaagttcaacgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatataaaatatgata 37354122  T
Q  169 ttaaatgaat-aagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt-aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    |||||| | | ||||| |||||||  |||| | || |||||| |||||||||||| ||  || ||| | | | ||| ||| |||||||  | ||||||||    
T  37354123 ttaaataattaaagat-attataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatataatt-ggtgtcttgatttgtgtaaaaaattaaaatgtg 37354220  T
Q  267 acaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||    
T  37354221 acaattaaaatggaacggaggtagtaa 37354247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 297
Target Start/End: Original strand, 8443883 - 8443940
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8443883 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaataat 8443940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 209
Target Start/End: Original strand, 34721564 - 34721636
Alignment:
Q  137 attgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||| || || ||||||    
T  34721564 attgcggagagagaaatatatgaaataatatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattg 34721636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 287
Target Start/End: Original strand, 3041597 - 3041811
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||| |||||| ||| |  |||||||||   ||||||||||| |||||||||  ||    
T  3041597 ttaactatcattttcaaagtttaatgtatcattaaatgtggctttacctatattaccctaatatatttattgt--agagagaaatacatgaaatgaagta 3041694  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| | || || ||| || ||||||| ||| ||  ||| | | | ||||||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  3041695 ttaaatgattaagaatattataggaaaaagataaattgttgtattaaaagtaataa-aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtc-aaatgtaac 3041792  T
Q  269 aattaaaaaggaacggatg 287  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  3041793 aattaaaaagtaacagatg 3041811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34262915 - 34262808
Alignment:
Q  185 attatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
    ||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||| |||   | | ||||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  34262915 attatagtaaaaatatatattattatatcaaaagtagtaacaattattgaatgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaattgacaattaaaaaggaacgg 34262816  T
Q  285 atgtagta 292  Q
    | ||||||    
T  34262815 aggtagta 34262808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1259728 - 1259615
Alignment:
Q  179 aagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    ||||||||||| |||||| || |  ||||||| |||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1259728 aagatcattatggtaaaattatagtttattgcgtcaaaagtagtatcaattgttgattctcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaag 1259629  T
Q  279 gaacggatgtagta 292  Q
     |||||| ||||||    
T  1259628 aaacggaggtagta 1259615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25186902 - 25186816
Alignment:
Q  206 attgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||   ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  25186902 attgtatcaaaagtagtaacatatattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaacggaagtagta 25186816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28301744 - 28301670
Alignment:
Q  33 ttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  28301744 ttaagtgtctcttttgaagaaaaattttgtttcaatttaaatgtcactttcaaagatcaatacaacattgaatgt 28301670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 224
Target Start/End: Original strand, 37660845 - 37660926
Alignment:
Q  143 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| | || || ||| || |||||||||||    
T  37660845 gagagagaaacatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaaagaaaaattgttgtattaaaagtagtaa 37660926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20682955 - 20682902
Alignment:
Q  118 atattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatta 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||    
T  20682955 atattatccttagatatttattgtagatatagaaatatatgaaatgaggtatta 20682902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20683759 - 20683714
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  20683759 ttaactgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttgcttta 20683714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 88)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 33173795 - 33174064
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33173795 ctgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 33173894  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33173895 atccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataagatcattatattaaaagtacaacttattgtatcaaaagtagt 33173994  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33173995 aacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33174064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33922027 - 33921760
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33922027 gttcatttttaagtgtctcttttgaagaaaatttgtgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccgatattat 33921928  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33921927 ccttaattatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataatttattgcatcaaaagtagtaa 33921828  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33921827 caatcattgactatcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33921760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7477451 - 7477191
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7477451 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccgatattat 7477352  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7477351 ccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 7477252  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7477251 caatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaagaaacgga 7477191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 31430549 - 31430819
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31430549 gttcctttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 31430648  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||     
T  31430649 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatgaaaaatagtat 31430748  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31430749 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaata 31430819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 84 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5732267 - 5732059
Alignment:
Q  84 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5732267 aaagttcaatgcaacattaaatgctgttttaccaatattatccttagttatttatttcggagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataaggt 5732168  T
Q  184 cattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732167 cattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 5732068  T
Q  284 gatgtagta 292  Q
    || ||||||    
T  5732067 gaggtagta 5732059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 18470297 - 18470554
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18470297 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 18470396  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||     
T  18470397 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtat 18470496  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||  ||   | | |||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  18470497 caattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatattaaaatgcgacaattaaaaaggaac 18470554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32528581 - 32528312
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| |||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32528581 gttcttttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaatattaaatgttgttttaccaatattat 32528482  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |     
T  32528481 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcat 32528382  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||||  ||   | | ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32528381 caattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaacggaggtagtaat 32528312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 36922229 - 36922490
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36922229 gttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 36922328  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatc-aaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| ||    
T  36922329 ccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacatagcttattgcatcaaaaagtaata 36922428  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     ||||  ||   | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36922429 tcaattgttgattgtcttgatttatttaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 36922490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Original strand, 10227245 - 10227513
Alignment:
Q  24 tgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10227245 tgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcatcattaaatgttattttatcaatatta 10227344  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  10227345 tcctttgttatttattgcggagggagaaatatataaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaa 10227444  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||| |||   | | ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10227445 ataattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 10227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33100086 - 33099821
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33100086 gttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatcttgttttaccaatattgt 33099987  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  33099986 ccttagttatttattgtg--gagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtat 33099889  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33099888 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 33099821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Original strand, 20035038 - 20035231
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20035038 gttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 20035137  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  20035138 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaag 20035231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Original strand, 20045449 - 20045642
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045449 gttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 20045548  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  20045549 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaag 20045642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Original strand, 26723915 - 26724175
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |    
T  26723915 ttcctttttaagtgtctctttcggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattacc 26724014  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  26724015 cttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaat 26724114  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc-aaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||   | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26724115 aatcattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 26724175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36298423 - 36298175
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  36298423 ctttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaatgttcaatgcaacattaaatgatgttttatcagtattaccctt 36298324  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36298323 aattatttatttcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 36298224  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
     |||   | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36298223 tattgattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 36298175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17896776 - 17896581
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17896776 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgt 17896677  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17896676 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagta 17896581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Original strand, 7312612 - 7312874
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||  ||||  | ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7312612 tttttaagtgtcacttttggataaattttttatttctatttaagtgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 7312711  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7312712 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 7312811  T
Q  230 attagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||   | | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  7312812 gttgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattacaaaggaacgaaggtagta 7312874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 58 - 292
Target Start/End: Original strand, 41891293 - 41891527
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41891293 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccaatattgtcctgagttatttattgcggagagagaaatatat 41891392  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||    
T  41891393 aaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 41891492  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  41891493 caaaatgtgacaattaaaaaggcacagaggtagta 41891527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32966302 - 32966042
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32966302 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattttcaaagttaaatgcaacattaaatgttggtttaccaatattgt 32966203  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||     
T  32966202 ccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtggtat 32966103  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  ||   | | ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32966102 caattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 32966042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12838331 - 12838064
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12838331 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcagtgcaacattaaatgttgttttgccaatattat 12838232  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  || | ||||||| |||||||||| ||     
T  12838231 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaggtatagcttattgtatcaaaagtaatat 12838132  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12838131 caatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggatcggaggtagta 12838064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22951070 - 22950814
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22951070 ttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattctc 22950971  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||| |    
T  22950970 cttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatc 22950871  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22950870 aattttttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaaggaac 22950814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42842119 - 42841851
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  42842119 gttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattac 42842020  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||  |   |||| ||||||||||||||    
T  42842019 ccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtaa 42841920  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42841919 catttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 42841851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41675439 - 41675171
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41675439 gttcctttttaagtgtcacttttgcagaaaatttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattat 41675340  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||| |     
T  41675339 ccttagttatttattgcaaagaaataaatatattaaataaaatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaactatagcttattgcatcaaaaatag-at 41675241  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||| |||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41675240 caattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 41675171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 8264937 - 8265207
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatg----caacattaaatgttgttttaccaata 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8264937 gttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaccaacattaaatgttgttttactaata 8265036  T
Q  121 ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  8265037 ttatccttagttatttattgcggagagag--agatatgtaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagga 8265134  T
Q  221 gtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||| ||||  ||   | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8265135 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagtaa 8265207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26632428 - 26632235
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26632428 ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttat-cctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctt 26632330  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  26632329 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 26632235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44480395 - 44480134
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||   ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44480395 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaaaaatttgttcttatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattat 44480296  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||     
T  44480295 ccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcataaaaaatagtat 44480196  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtga-caattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  44480195 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcaaccatttaaaaaggaacgga 44480134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 3837850 - 3838108
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||  |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3837850 ctgttcatttttaagtgtttcttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatatt 3837949  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |    
T  3837950 atctttagttatttattgcggaaagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttatggcatcaaaagtaat 3838049  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    |||||| |||   | | ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3838050 aacaattattgattgtcttgatttgcgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 3838108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29497755 - 29497527
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29497755 ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgttcttcgttatttattgcggagagagaaatata 29497656  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||| ||||  ||   | |  |||||| |||||||||    
T  29497655 tgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttgattgtcctggtttgtgtaaaatg 29497556  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29497555 tcaaaatgtgataattaaaaagaaacgga 29497527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31399151 - 31398912
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31399151 tttgtttctttttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgaggagagataaatatat 31399052  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||  ||||||||||||| ||||  |||  | | |||||||||||||||||     
T  31399051 gaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattatatcaaaagtagtatcaatttttaattgtcttggtttatgtaaaatgc 31398953  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataata 298  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  31398952 taaaatgtgacaattaaaaagcaacggaagttgtaataata 31398912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 33257871 - 33258138
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33257871 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattac 33257970  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||    
T  33257971 ccttggttatttattatggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaa 33258070  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     | | |||   | ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33258071 tatttattgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33258138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30866989 - 30866722
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||     
T  30866989 gttcttttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttggtttaccaacattac 30866890  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||| || |||||| || | ||  |||||    
T  30866889 ccttagttatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaacatataaattattgtataagaaaaagtaa 30866790  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30866789 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 30866722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41889566 - 41889372
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  41889566 ctttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttccaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatattgttttatcaatattattctt 41889467  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||    
T  41889466 agttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagactattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 41889372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31815288 - 31815053
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31815288 tttgtttctatttaactgttactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatat 31815189  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||| || |||   ||| ||| ||| ||||||||||    
T  31815188 gaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaac-attattgattatcttgatttgtgtaaaatgt 31815090  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31815089 taaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtaataat 31815053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 35112419 - 35112671
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  35112419 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatattgttttaccaatattac 35112518  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||    
T  35112519 ccttagttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaaataaataaagttattatagtaaaaatatgaagtattgtatcaaaagtagtaa 35112618  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
     | | |||   | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35112619 tatttattgattgtatttgtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaa 35112671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29722556 - 29722286
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    |||||||||||  |||  ||||  ||||||||||||||  || |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29722556 ttcctttttaatcgtcacttttggagaaattttttgtttatacttaactttcactttcataattcaatgcaatattaaatgttgttttactaatattgtc 29722457  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  29722456 cttaattatttattgcggagatagaaatatatgaaataagatattaaataaataag-tcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatc 29722358  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
     ||  ||   | | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  29722357 gattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgttaaaatgtgacaattataaaggaacagaggtagtaataat 29722286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37354112 - 37353920
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  37354112 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattatttgatcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgc-----------ttgttttaccaatattat 37354024  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  37354023 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatgtaacttattgcatcagaagtagtaa 37353924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 1553505 - 1553770
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1553505 gttcctttttaatcgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 1553604  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||    || ||  ||||||||||||||    
T  1553605 ccttacttatttattac--agagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaaatatgcattgttctatcaaaagtagtaa 1553702  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | ||||  ||||||||||| | |||||| ||  || |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1553703 catttattaaatatattggtttgtataaaatatcttaaagtgacacttaaaaaagaacggatgtagta 1553770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 28608585 - 28608856
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  28608585 gttcctttttaaatgtctcttttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcctttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattac 28608684  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||    
T  28608685 ccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgatatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaa 28608783  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    || | |||   | | ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28608784 catttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaaaaaggaacagatgtagtaataat 28608856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 6799118 - 6799283
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6799118 tttttaagtgtctgttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcctta 6799217  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat-attaaatgaataagatcattatagtaa 194  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6799218 attatttattacggagagagaaatatataaaatgatataattaaatgaataagaccattatagtaa 6799283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Original strand, 36406746 - 36407004
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36406746 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 36406845  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || |||||| || | ||  ||||||| |     
T  36406846 gttatttattgcggatagagaaatatattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacattt 36406945  T
Q  230 att-ag---ctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||| ||   || | ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  36406946 attgagtgtct-tcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaagaaacgga 36407004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35746894 - 35746641
Alignment:
Q  28 cctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcct 127  Q
    ||||||||| ||||  ||||  ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35746894 cctttttaattgtcacttttggagaaaatttttatttctatttaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattaccct 35746795  T
Q  128 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    ||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| || || | |||| ||||||| ||||||||     
T  35746794 tagatatttattgc-gaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagtaacat 35746696  T
Q  228 tcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    | |||   | | ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35746695 ttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaac 35746641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Original strand, 8381908 - 8382085
Alignment:
Q  117 aatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaa 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  8381908 aatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaa 8382007  T
Q  217 agtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||| || ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8382008 agtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaat 8382085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36648218 - 36648011
Alignment:
Q  65 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36648218 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttaatttatcaatattatccttagctatttatttcggagagagaaatatatgaaatga 36648119  T
Q  165 gatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatg 264  Q
    ||| |||||| || ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  || ||| |||   | | ||||||| |||||||||| |||| |    
T  36648118 gatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaa-g 36648020  T
Q  265 tgacaatta 273  Q
    |||||||||    
T  36648019 tgacaatta 36648011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38168968 - 38168774
Alignment:
Q  99 attaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaat 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  38168968 attaagtgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagt 38168869  T
Q  199 acaacttattgcatcaaaagtagtaac-aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | |   | | ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38168868 ataacttattgcatcaaaaatagtaacaaattaatgattgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 38168774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18194467 - 18194198
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  18194467 gttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactatcattttcaaatttcaatgcaaaattaaatgttgttttaccaacattac 18194368  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||  | ||   |||| |||||||||||||     
T  18194367 ccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagcaaaaacaattgtatcaaaagtagtat 18194268  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18194267 catttattgattgtcttggtttgtgtaaaatttgaaaaactgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 18194198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 3310206 - 3310462
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||     
T  3310206 gttcctttttaagtgtctcttttggagattttttttgtttttatttaactgtcacttctaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattac 3310305  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||          ||||||||||||||| |||    
T  3310306 tcttagttatttattgcggagagagaaatatatgatataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaa----------attgcatcaaaagtaataa 3310395  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
      || |||   | | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3310396 -tattattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 3310462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43874331 - 43874079
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  43874331 ctttttaagtgtcacttttagagaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaacattaaatgttattttgccaatattatcatt 43874232  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    | ||||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||    |  || ||| |||||||||||||||| |    
T  43874231 acttatttattgcagata-agaaatacatgaaattagatattcaatgaataaggttattatagtaaaagagtatattgttgtatcaaaagtagtaacatt 43874133  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
     |||   | |||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  43874132 tattgaatgtatttgttcgtgtaaaatgtcaaaaagagaccattaaaaaggaac 43874079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Original strand, 3177920 - 3178119
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||     
T  3177920 gttcctttttaattgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgccgttattac 3178019  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| | ||||||| ||||| | || || ||| ||||||||||||||    
T  3178020 ccttggttatttattgcagagagagaaatatatgaaaagatatattaaatgacgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa 3178119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 217
Target Start/End: Original strand, 45324018 - 45324206
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    || |||| ||||||| ||||||||     
T  45324018 gttccttttcaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgc----ttgaatgatgttttatcaatattac 45324113  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaa 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  45324114 tcttaattatttattgcggagagagaaatatataaaataagatattaaataaataaaatcattataataaaagtataacttattgcatcaaaa 45324206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 46286098 - 46285949
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||     
T  46286098 gttcttttttaactgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaagaataaatattgttttaccaacattac 46285999  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  46285998 ccttagttatttattgcgtagagagaaatatatgaaataaaatattaaat 46285949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 285
Target Start/End: Original strand, 24283605 - 24283829
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||||    
T  24283605 tttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagatatttattgcg--gagagaaacatat 24283702  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
     || ||| ||||||||| || ||  |||||||||||||| || || | |||  |||||||||||||||| | ||||  | | || |||| ||||||| ||    
T  24283703 aaattgaaatattaaattaacaaagtcattatagtaaaagta-aaataattatatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttagtttgtgtaaaaggt 24283801  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||    
T  24283802 aaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 24283829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34368878 - 34368648
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  34368878 ttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcgaagagaaaaacatatg 34368779  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||| || ||   |||| |||||||||| |||  || ||||  | | ||  ||| |||||||| ||    
T  34368778 aaatgaaatattaaattaataaggtcattgcagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataa-tattattaattttcttaatttgtgtaaaatatc 34368680  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34368679 aaaaagtgacaattaaaaaggaactgatgtag 34368648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Original strand, 42880962 - 42881113
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  42880962 tttttaagtgttttttttggagaaaatttttgtttctatttaactatcactttttaaggtcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttg 42881061  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  42881062 gttattgattgcggagagagaaatatataaaattagatgttaaatgaataag 42881113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17354244 - 17354114
Alignment:
Q  60 tgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatga 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||    
T  17354244 tgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatattacccttagatatatattgcgaaaagagaaacatatga 17354145  T
Q  160 aatgagatattaaatgaataagatcattata 190  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  17354144 aatgaaatattaaattaataaggtcattata 17354114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22382281 - 22382156
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||    
T  22382281 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattatccttagatatttattgc--agagagaaacatatgaattgaaata 22382184  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  22382183 ttaaattaacaaggtcattatagtaaaa 22382156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9602116 - 9601879
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9602116 ttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaata 9602017  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    || |||||  |||||||||| | ||||   ||||||   |||  | || |||||| |||||||||||| | |  ||||   | | ||||||| |||||||    
T  9602016 taagaaatatgatattaaataattaaggatattataagcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaa 9601917  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9601916 agtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatggagta 9601879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9829687 - 9829450
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9829687 ttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaata 9829588  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    || |||||  |||||||||| | ||||   ||||||   |||  | || |||||| |||||||||||| | |  ||||   | | ||||||| |||||||    
T  9829587 taagaaatatgatattaaataattaaggatattataagcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaa 9829488  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9829487 agtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatggagta 9829450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46563376 - 46563177
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||     
T  46563376 gttcctttttaattgtcacttttgcagaaattttttgtttataattaactgtcactttcaaagttcagtacaacattaaatattgttttgacattattac 46563277  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| | || || ||  ||||||||||||||    
T  46563276 ccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaaagaaaaattgttatatcaaaagtagtaa 46563177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19328035 - 19327787
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcct 127  Q
    |||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||    
T  19328035 ctttttaagtgtcttttttggagattttttttgttcctatttaaatgtcattttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattactct 19327936  T
Q  128 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    || ||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||   |||||| || |||||| ||||||||||| || |     
T  19327935 tattta-ttactgtggagggagaaatatatgtaatgagatattaaataaataag---gttata--taaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaatat 19327842  T
Q  228 tcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    | |||   | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19327841 ttattgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaac 19327787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Original strand, 47459638 - 47459807
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat-gttgttttaccaatattatcct 127  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||    
T  47459638 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatatttttttttccaatattatcct 47459737  T
Q  128 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaata 199  Q
    |  | |||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  47459738 tgctcatttattgtg--gagagaaatatatcaaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaata 47459807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44820816 - 44820600
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44820816 ttgtttctatttaactgttatttttaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacatttagttatttatttcggagagaaaaatatatg 44820717  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||          || |||||||||||||||| ||| |||   | | ||||||| | |||||||||    
T  44820716 aaataaaatattaaatgaataaggttattatagtaaa----------atggcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttggtttgtataaaatgtc 44820627  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  44820626 aaaatatgacagttaaaaatgaacgga 44820600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8966121 - 8965893
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||| |    
T  8966121 ttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacattgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagagaaataca 8966022  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt-aaaat 255  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||| |||||||||||||| ||  ||| | | | |||||||  || ||||     
T  8966021 tgaaataagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgcgtaaaaaa 8965922  T
Q  256 gtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8965921 ctcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacgga 8965893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 292
Target Start/End: Original strand, 47408227 - 47408370
Alignment:
Q  149 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttat 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||| | |||   | | ||||||| |    
T  47408227 gaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgt 47408326  T
Q  249 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47408327 gtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 47408370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 285
Target Start/End: Original strand, 35860001 - 35860215
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||    
T  35860001 ttaagtgtcattttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttagtaatttattgc--agagagaaatataagaaatatgata 35860098  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||| | |||||  ||||||| ||||  | || ||||||||||||||||||| | |  ||||   | | ||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  35860099 ttaaataattaagaatattatagaaaaaccataagttattgcatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtaac 35860198  T
Q  269 aattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||||||||||||    
T  35860199 aattaaaaaggaacgga 35860215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48981633 - 48981433
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtca-ctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  |||| ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  48981633 gttcctttttaattgtcacttttgcagaatttttttgtttctaattacctgtcaactttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttgcctttatta 48981534  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||  | |||||||||||  ||| | ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||    
T  48981533 cccttagttatttattgcagagatgaaaatatatgaaaaaaaatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 48981434  T
Q  224 a 224  Q
    |    
T  48981433 a 48981433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22057620 - 22057462
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc------ggagagagaaatatatgaaatgagat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||  ||||    
T  22057620 tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttagcaatattacccttagttatttattacagagagagagagagaaatatatgaaacaagat 22057521  T
Q  168 attaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaaca 226  Q
    ||||||||||| ||   ||||| | ||||  |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  22057520 attaaatgaatgaggctattattgaaaaatgacaaattattgtatcaaaagtaataaca 22057462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30586902 - 30586673
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||| ||| ||||| |||  || |||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  30586902 aaattttttgtttccaattaactttcatttttaaagtccaacacatcattaaatgttgatttatctatattacccttagatatttactgcagagagagaa 30586803  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatag-taaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||| | || || |||  |||||| |||||| ||  ||| | | | ||||||||| |    
T  30586802 atatatgaaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaaaaagataaattgttgtttcaaaaatagtaa-aagtatttgttgt-ttggtttatct 30586705  T
Q  251 aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30586704 aaaaagtcaaaatgtgataattaaaaaggaac 30586673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8380758 - 8380572
Alignment:
Q  112 ttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgca 211  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || |||||| |    
T  8380758 ttaccaacattacccttagttatttattacggggagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtaaaaattattgta 8380659  T
Q  212 tcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataata 298  Q
    | | ||   |||||| | |||   | | ||||||| |||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8380658 taagaaaaggtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaatggacagttaaaaaggaacggaggtagtaataata 8380572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Original strand, 33071896 - 33072032
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||        
T  33071896 gttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgc 33071995  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa 161  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33071996 ccttaataatttattgcagagagagaaatatatgaaa 33072032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36339452 - 36339303
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa--atgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  || || |||||||||||||    
T  36339452 gttcctttttaagtgtctcttttgtagaaaagttttgtttttatttaagtgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatatatttttttaccaatatt 36339353  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 172  Q
    | ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36339352 acccttgattattaattatggagagagaaatatatgaaacaagatattaa 36339303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2408916 - 2408827
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 112  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2408916 ctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 2408827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26803685 - 26803532
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||  |||| |||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||    
T  26803685 ctgttcctttttaatagtcacttttgcagaatttttttgtttttaattaactgtcgcttttaaagttcaatacaacattaaatattgttttccccttatt 26803586  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 176  Q
    | ||||  |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26803585 acccttgattatttatcgtagagagagaaatatataaaatgagatattaaatga 26803532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 282
Target Start/End: Original strand, 22785925 - 22786126
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 179  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||  |||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||    
T  22785925 tttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttacatatattacccttatatattttttgctgagagagaaatatattgaatgaagtattaaattatta 22786024  T
Q  180 agatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 279  Q
    || | ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||| ||  ||| | | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22786025 aggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaggg 22786123  T
Q  280 aac 282  Q
    |||    
T  22786124 aac 22786126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 292
Target Start/End: Original strand, 6799588 - 6799676
Alignment:
Q  204 ttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6799588 ttatcgcatcaaaaatagtaacaatcactgactgtcttggtttatgtaaaatgtcaacatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 6799676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46715511 - 46715383
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| | |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||    
T  46715511 ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaataaaata 46715412  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaa 197  Q
    |||||| | |||| | ||||||| |||||    
T  46715411 ttaaattattaaggttattataggaaaaa 46715383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 197
Target Start/End: Original strand, 32049435 - 32049575
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||   |||||| ||||||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| |    
T  32049435 ttttgtttctaattaattgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgtctttacctatattactcttatatatttattgcagagagataaataca 32049534  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaa 197  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  32049535 tgaaatgaagtattaaatgattaagaatattatagaaaaaa 32049575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41409810 - 41409764
Alignment:
Q  78 actttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41409810 actttcaaagttcaacgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 41409764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13431384 - 13431308
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatt 101  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13431384 gttcttttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacatt 13431308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17896521 - 17896477
Alignment:
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17896521 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 17896477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 24233150 - 24233240
Alignment:
Q  34 taagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||  || |||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24233150 taagtgtctcttttaat-aaattttttgtttctatttaactagcatttttgaagtttaatgcaacattacaagttgttttaccaatattatc 24233240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 197
Target Start/End: Original strand, 35684249 - 35684315
Alignment:
Q  131 ttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaa 197  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  35684249 ttatttattgtagagagagaagtatatgaaatgagatattaaatgacgaagattattataggaaaaa 35684315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41480710 - 41480628
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt 139  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  41480710 ttttgttcctattaagttgtcattttgaaagttcaatgcaatattaactattgttttgtcaataatacccttagttatttatt 41480628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Original strand, 47408128 - 47408178
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactg 75  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47408128 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactg 47408178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27235481 - 27235437
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  27235481 ttaactgtcactttcaaagttcaataaaacattagatgttgtttt 27235437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 140
Target Start/End: Original strand, 28408602 - 28408673
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattg 140  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||    
T  28408602 ttaattgttactttcaaaattcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattg 28408673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 278
Target Start/End: Original strand, 33072162 - 33072288
Alignment:
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| | || |||||| ||||||| |||||| |  ||||   ||||||||||| ||||    
T  33072162 atatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataaattattgtatcaaaaatagtaaaatacatttagtatattggtttgtgta 33072261  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  33072262 aaaagtcaaaatataacaattaaaaag 33072288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 46392658 - 46392612
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 103  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46392658 ttttgttcctatttatttgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaa 46392612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46715342 - 46715308
Alignment:
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46715342 tgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 46715308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41889032 - 41888987
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  41889032 ttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgataattaaaaaggaacgga 41888987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 169)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Original strand, 353964 - 354229
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  353964 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 354063  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  354064 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaaatagtaacaatc 354163  T
Q  230 attagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  354164 attgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaata 354229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19093400 - 19093144
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19093400 ctttttaagtgtctcttttaaagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 19093301  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19093300 agttatttattgcggagagaggaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 19093201  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19093200 tattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 19093144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 44217699 - 44217967
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44217699 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 44217798  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  44217799 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaagaaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagtagtat 44217898  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44217899 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 44217967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Original strand, 47251407 - 47251673
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  47251407 ttcctttttaactgtctcttttgaagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattatt 47251506  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47251507 cttagctatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaac 47251606  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  47251607 aatcattgattattttggtttatgtaaaatgataaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 47251673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 53600037 - 53599764
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53600037 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 53599938  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  53599937 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatat 53599838  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataata 298  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53599837 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaataata 53599764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13629444 - 13629177
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13629444 gttcctttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 13629345  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||     
T  13629344 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatgaaaaatagtat 13629245  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13629244 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 13629177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38617558 - 38617293
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38617558 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 38617459  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  38617458 ccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtat 38617359  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  || | | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38617358 caattgtt-gat-tgttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38617293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 46871914 - 46872172
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46871914 gttcctttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 46872013  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||     
T  46872014 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtagtat 46872113  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46872114 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatttaaaaggaacg 46872172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35381665 - 35381417
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35381665 gttcctttttatgtgtctcttttgaagat-ttttttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattat 35381567  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||    
T  35381566 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtacaactta----atcaaaagtagtaa 35381471  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35381470 caatcattaactatcttaatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 35381417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16465033 - 16464766
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16465033 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 16464934  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||     
T  16464933 ccttagttatttagtgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtat 16464834  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16464833 caattgttgattgtctaggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaactaaaaaggaacggaggtagta 16464766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35232548 - 35232282
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35232548 gttcctttttaagtgtc-attttggagaaaattttggttcctatttaactatcacgttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 35232450  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||     
T  35232449 ccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagcagtat 35232350  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35232349 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggatgtagta 35232282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5374597 - 5374336
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5374597 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagctcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 5374498  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5374497 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 5374398  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
      ||   | | ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  5374397 tgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggaggtag 5374336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Original strand, 48782197 - 48782461
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48782197 ctttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt 48782296  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48782297 agttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtattgcttattgcatcaaaagtagtatcaat 48782395  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
      ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48782396 tgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggatgtaataat 48782461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4201569 - 4201312
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4201569 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaattcaacattaaatgttgttttactaatattat 4201470  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||           
T  4201469 ccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcataaaaa------- 4201377  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
         |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  4201376 -----attgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaacgaacggaagtagtaat 4201312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 33084475 - 33084726
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33084475 ctttttaagtgtctcttttgaagaaactttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcttt 33084574  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084575 agttatttgttgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 33084674  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |||      |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33084675 tatt-----gattggtttctgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 33084726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22828652 - 22828385
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  22828652 gttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattacatgatgttttatcaatattac 22828553  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  22828552 ccttaattatttattgcagatagagaaatatatgaaataatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtag 22828453  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| ||| | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22828452 caattattggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 22828385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 44069024 - 44069291
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  44069024 gttcctttttaagtgtcacttttgtagaaaaattttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgt 44069123  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  44069124 tcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 44069223  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44069224 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 44069291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21044998 - 21044730
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21044998 gttcctttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 21044899  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||     
T  21044898 ctttagttatttattgcggagagagaaatatatgcaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtat 21044799  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  21044798 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataa-taaaaaggaacggaggtagtaat 21044730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31862237 - 31861977
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31862237 gttcctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 31862138  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  31862137 ccttatttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataattttttgcatcaaaagtagtaa 31862038  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||| |||   ||| || |||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31862037 caattattgattatcttagtttgtgtaaaatttcaaaaaataacaattaaaaaggaacgga 31861977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 8735383 - 8735649
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8735383 gttcatttttaagtgtc-attttagagaaaaattttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattat 8735481  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  8735482 tcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 8735581  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8735582 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 8735649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 29295348 - 29295599
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29295348 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtgactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 29295447  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |    
T  29295448 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtataacttattgcatcgaaagtagtatc 29295547  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    ||| |||   | | ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29295548 aattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgataattaaaaa 29295599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 56576354 - 56576088
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56576354 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 56576255  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||     
T  56576254 ccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaggtagtat 56576156  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56576155 caattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 56576088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44014164 - 44013894
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||| |||||  ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014164 gttcctttttatgtgtcatttttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 44014065  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||      
T  44014064 ccttagttatttattgtggagagataaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagttt 44013965  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44013964 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaata 44013894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38542527 - 38542270
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||  |||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38542527 gttcctttttaatcgtcttttttggagaaaaattttgttcctatttaaatgtcactttcaaaattcagtgcaacattaaatattgttttaccaatattat 38542428  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  38542427 ccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataagttcattatagtaaaagtctaacttattgcatcaaaagtagtaa 38542328  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||| ||||  | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38542327 caattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaac 38542270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 55147312 - 55147044
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55147312 gttcttttttaagtgtcttttttggagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 55147213  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||    
T  55147212 ccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaataa 55147113  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgt-caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| ||||  | | ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  55147112 caattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtaaaaaaaatgacaattaaaaaagaacggaggtagta 55147044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 6195025 - 6195284
Alignment:
Q  33 ttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 132  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6195025 ttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacattcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 6195124  T
Q  133 atttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcatt 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  6195125 atttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaataaacaaggtcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaattatg 6195224  T
Q  233 agctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
       | | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6195225 gattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 6195284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26620604 - 26620333
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    ||||| |||||||||||||   |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620604 ctgtttctttttaagtgtcacatttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 26620505  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  26620504 atccttagttatttattgcggataaataaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagt 26620405  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    | ||||  ||   | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26620404 atcaattgttgtttgttttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagttagtaat 26620333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52677396 - 52677225
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52677396 gttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 52677297  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52677296 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa 52677225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22678526 - 22678292
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22678526 ttgttcttatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtaatttattgcggagagataaatatatg 22678427  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||  ||   ||| ||||||||| |||||||||    
T  22678426 aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaatagtagtatcaattgttgattatcttggtttatataaaatgtc 22678327  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22678326 aaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagtaa 22678292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 294
Target Start/End: Original strand, 39671343 - 39671587
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  39671343 agaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtccttaattatttattgcagagaaag 39671442  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||  ||   | | ||||||| ||    
T  39671443 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtg 39671542  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39671543 taaaatgtcataatgtgacaattaaataggaacggaggtagtaat 39671587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 42099701 - 42099953
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  42099701 gttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatggtgttttatcaatattac 42099800  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  42099801 ccttaattatttattgcggaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 42099900  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    |||| |||   | | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42099901 caattattgattgtcttggtttgtgtttaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 42099953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Original strand, 16664234 - 16664481
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  16664234 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaatattttgtccctatttaacggtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccagtattgt 16664333  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  16664334 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 16664433  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 272  Q
    ||||  ||   | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16664434 caattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 16664481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 53125489 - 53125240
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  53125489 gttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactttcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattac 53125390  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||    
T  53125389 ccttaattatttattgcggagaaagaaatgtatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcataaaaaatagtaa 53125290  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 274  Q
    |||| |||   ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  53125289 caattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 53125240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3436318 - 3436066
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3436318 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 3436219  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||     
T  3436218 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtat 3436119  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
     |||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3436118 taattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaa 3436066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39683965 - 39683698
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  39683965 gttcttttttaagtgtcatttttgtagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgt 39683866  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  39683865 ccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcgttatactaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtat 39683766  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39683765 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtgaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 39683698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42513277 - 42513009
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42513277 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttactatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 42513178  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  42513177 ccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgtgatattaaatgaataaggtcatgatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 42513078  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc-aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||  ||   | | ||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42513077 taattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatttcaaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 42513009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Original strand, 47428523 - 47428785
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||| ||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47428523 ttcctttataagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtc 47428622  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||      ||     
T  47428623 cttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtattacttattgcatcaaa------aat 47428716  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataata 298  Q
    ||| ||    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47428717 aatgat----tatcttgatttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtattaata 47428785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 12252093 - 12252352
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12252093 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 12252192  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  12252193 ccttagttatttat--------atgaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtattat 12252284  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12252285 caattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 12252352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 47093806 - 47094008
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47093806 ttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattatatgttgttttaccaatattatc 47093905  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  47093906 ctttgttatttattgcgaagagagaaatatataaaatgatatgttaaattaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaac 47094005  T
Q  226 aat 228  Q
    |||    
T  47094006 aat 47094008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 36408716 - 36408969
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36408716 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaacaatattct 36408815  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  36408816 ctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 36408915  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    |||   ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36408916 caaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 36408969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 36422882 - 36423135
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36422882 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaacaatattct 36422981  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  36422982 ctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 36423081  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    |||   ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36423082 caaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 36423135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 50623407 - 50623672
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||   |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50623407 gttcctttttaagtgtcactttaggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 50623506  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||     
T  50623507 ccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtat 50623605  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50623606 caatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaa-aaacggatgtagta 50623672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23720035 - 23719768
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23720035 gttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctgtttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 23719936  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||  | |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||    
T  23719935 tcttgctcatttattgtggagaaagaaatatatgaaaagaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaa 23719836  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     | | |||   | | || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23719835 tatttattgaatgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaacggaggtagta 23719768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 282
Target Start/End: Original strand, 40411970 - 40412193
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40411970 ttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttatcaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatg 40412069  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||  | | ||  |||||||||||||||    
T  40412070 aaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattacatcaaaaatagtaacaattattaattgtcttaatttatgtaaaatgtc 40412169  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||    
T  40412170 aaaaaatgacagttaaataggaac 40412193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Original strand, 55702914 - 55703173
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||| |    
T  55702914 ttcctttttaagcatctcttttgaagattttttttgtttttatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgataatttattaatattacc 55703013  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  55703014 cttaattatttattgcagagagagaaatatatgaaataagataataaatgaataaggtcgttatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtaataac 55703113  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||| |||   | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55703114 aattattgattgtcttggtatatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacgga 55703173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8741877 - 8741680
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8741877 ctgttcctttttaagtgtcaattttgaagaaaaatttggttcatatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatatt 8741778  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  8741777 atctttagttatttattgtggagagtgaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagta 8741680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 52061556 - 52061823
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |  ||||||| | |||||||||||||     ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  52061556 gttcctttttaagtgtctcttttgaagatttttttttgttttatttaattatcactttcaaagt-----gcaacattaaatgatgttttatcaatattac 52061650  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  52061651 ccttaattatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 52061750  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    |||| |||   | | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52061751 caatgattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaataat 52061823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19527455 - 19527215
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19527455 ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 19527356  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19527355 agttatttattgtggagagagaaatatatgaa------------atgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgtatcaaaagtagtatcaat 19527268  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
      ||   ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19527267 tgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 19527215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Original strand, 30939152 - 30939415
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30939152 ctttttaattgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctt 30939251  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
     | |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| |||||||||| || || |    
T  30939252 ggatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtactaccatt 30939351  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||  |  | ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30939352 tattgaccgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 30939415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 285
Target Start/End: Original strand, 35231724 - 35231943
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  35231724 tatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataaa 35231823  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgt 265  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  35231824 atattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgt 35231923  T
Q  266 gacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35231924 gacaattaaaaaggaacgga 35231943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26906608 - 26906373
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26906608 ttttgtttttatttaactgtcactttcaaggttcaatgcaacattaaatattgttttactaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatata 26906509  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||  ||   | | || |||| ||||||||     
T  26906508 tgaaatgagatattaaattaataaggtcattaaagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaatatcaattgttgattgttttagtttgtgtaaaata 26906409  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26906408 tcaaaatatgacaattaaaaatgaacggatgcagta 26906373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 44549637 - 44549835
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  44549637 ttcctttttaagtatcttttttggagaaattttttgttattatttaactgtcgctttcaaagtttaatgcaacattaaatgctgttttatcaatattatt 44549736  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  44549737 cttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaa 44549835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36659659 - 36659411
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36659659 ttttagagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttattaatattattcttagttatttattgcgg 36659560  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattgg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || || ||  ||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||  |||||| |||   | | |||     
T  36659559 agagagaaatatatgaaatgagatgttagataaacaatgtcattatagtaaaagcataacttattgcattaaaaataaaaacaattattgattgtcttga 36659460  T
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36659459 tttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaagaaggaacggaggtagta 36659411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 34464268 - 34464530
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34464268 ctgtttctttttaagtgtcatttttgaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcatagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatatt 34464367  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |    
T  34464368 atcattagttatttattgtgaagagataaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaat 34464467  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    | |||| |||   | | ||  ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34464468 atcaattattgattgttttaatttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaacgga 34464530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 276
Target Start/End: Original strand, 37502014 - 37502266
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagt-tcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37502014 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagggtcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatatta 37502113  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  37502114 cccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatgtaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtagta 37502213  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 276  Q
    ||| | |||   | | ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37502214 acatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaatcaaaa 37502266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 54231574 - 54231797
Alignment:
Q  68 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaca-ttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  54231574 tttaactgtcatttttaaagttcaattcaacaattaaatgttattttactaatattatccttagttatttattatggaaagagaaatatattaaatgaga 54231673  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||   | | ||| ||| |||||||||||||||  ||    
T  54231674 tgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatg 54231773  T
Q  267 acaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  54231774 acaattaaaaaggaacggaggtag 54231797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Original strand, 9834257 - 9834419
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |    
T  9834257 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatcttattttacatatattgt 9834356  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9834357 ccttagttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataagatcatt 9834419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 33809080 - 33809337
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  33809080 gttcctttttaattgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacattcaaagtttaatgcaatagtaaatgttgttttaccaatattac 33809179  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| || ||| ||   |||||||||||||||||||    
T  33809180 ccctagatatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtcaatataaaaacaattgcatcaaaagtagtaa 33809279  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    || | |||   | | ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33809280 catttattgattgttttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaac 33809337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29833177 - 29833006
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29833177 gttcatttttaagtgtctcttttggagaaatttcttgttcctatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatgttat 29833078  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29833077 cgttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgctaaatgaataaaatcattatagtaaaa 29833006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Original strand, 23237667 - 23237883
Alignment:
Q  72 actgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagag---agaaatatatgaaatgagata 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  23237667 actgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagattataaatatatgaaatgagata 23237766  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||||  ||   | |  | |||| |||||||||| ||||||| ||    
T  23237767 ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatcgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttctagtttgtgtaaaatgttaaaatgtaac 23237866  T
Q  269 aattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||||||||||||    
T  23237867 aattaaaaaggaacgga 23237883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 47885249 - 47884978
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaa--------agttcaatgcaacattaaatgttgtttta 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47885249 ctgttcctttttaagtgtctcttatggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaagttcaataagtttaatgcaacattaaatgatgtttta 47885150  T
Q  115 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg-aataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatc 213  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  47885149 tcaatattacccttaattatttattggagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaaataaggtcattatagtaaaagtcaaacttattgcatc 47885050  T
Q  214 aaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||| ||| ||| |||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47885049 aaaagtaataataattattgattgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaattggaacgga 47884978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 52258036 - 52257782
Alignment:
Q  31 ttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttag 130  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  52258036 ttttaagtgtcattttttgagaaattttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatctttag 52257937  T
Q  131 ttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatca 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| || || |||||| || | ||  | ||||| | |    
T  52257936 ttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacattta 52257837  T
Q  231 ttagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||   | | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  52257836 ttgagtgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaagaaacgga 52257782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23623746 - 23623601
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23623746 gttcctttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 23623647  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatt 170  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23623646 ccttaagtatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatt 23623601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 181
Target Start/End: Original strand, 27492356 - 27492509
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27492356 ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatgctt 27492455  T
Q  129 agt-tatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27492456 agtcaatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataag 27492509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 43887976 - 43888243
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||     
T  43887976 gttcctttttaattgtcacttttagataaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatacatcattaa-tgttgttttatcaatattac 43888074  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||  |   |||| ||| ||||||||||    
T  43888075 ccttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaatagcaattgtatc-aaagtagtaa 43888173  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    || | |||   | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43888174 catttattgattctcttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaat 43888243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 55935100 - 55935369
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  55935100 gttcctttttaagtgttatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 55935199  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||  | |||||| || | ||  |||||    
T  55935200 ccttagttatttattatggagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaa 55935299  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    || | |||   | | ||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  55935300 catttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaat 55935369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33755201 - 33755012
Alignment:
Q  104 atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |    
T  33755201 atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagc 33755104  T
Q  204 ttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||  ||   | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33755103 ttattgcattaaaaggagtatcaattgttgattgtcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaata 33755012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 36750168 - 36750327
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36750168 ctgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatatt 36750267  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 182  Q
    |  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36750268 aatcttacttatttattgtggagagacaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaga 36750327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 32239393 - 32239592
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32239393 gttcctttttaaatgtcacttttggagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 32239492  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  32239493 ccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataaagtc---atagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 32239588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 52057660 - 52057434
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  52057660 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgaaa 52057561  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||| | | |||   |  |||||||| ||||||||||||||  ||     
T  52057560 tattaaataaataagattattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattggattggtttgtgtaaaatgtcaaatagt- 52057462  T
Q  267 acaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  52057461 acagttaaaaaggaagggaggtagtaat 52057434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9220292 - 9220025
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  9220292 gttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattac 9220193  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||   |||| ||||||||||||||    
T  9220192 ccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaaattagcaaggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaa 9220093  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     | | ||||  | | ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9220092 gatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 9220025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 274
Target Start/End: Original strand, 18781514 - 18781721
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18781514 atttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatattcttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaa 18781613  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    |||||| |||||||| | |||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||| |||   ||| ||  ||| ||||||||||| |||  ||    
T  18781614 tattaattgaataaggtaattataataaaagtatatcttattgcatcaaaagtaataataattattgattatcttaatttgtgtaaaatgtcgaaaaatg 18781713  T
Q  267 acaattaa 274  Q
    ||||||||    
T  18781714 acaattaa 18781721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 34361053 - 34361249
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||    
T  34361053 ctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaa---tgttttaccgatattaccctt 34361149  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatg--agatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaaca 226  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||||||||    
T  34361150 agatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaaaatattaaattaataagaccattatagtaaaaatgaaaacaattgtatcaaaagtagtaaca 34361249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 47596860 - 47596604
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||  |||    
T  47596860 ctttttaagtgtctcttttgtagaaaatttttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattgagtattgttttatcaatattactctt 47596761  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||  |||||  | |||||||||||||||| | ||||| | ||||  | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  47596760 aattatttattacggagacagaaataattgaaacaatatattaaatgaataaggttattattggaaaaggataatttattgtatcaaaagtagtaacatt 47596661  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |||  || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47596660 tattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 47596604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Original strand, 41415005 - 41415171
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41415005 ctttttaagtgtcatttttgaagaaattttt-gtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctt 41415103  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41415104 agctatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaa 41415171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 47751530 - 47751790
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||   ||| |||| |||     
T  47751530 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcatttttaaggt-caatgcaactttaaatgtt---ttatcaatgttac 47751625  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||  | |||||| ||||||| ||||||    
T  47751626 ccttagttattt---gcggagagagaaatatctgaaatgagatattaaatgaataaaactattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaaatagtaa 47751722  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | || |  ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47751723 catttataaattattttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaactgaggtagta 47751790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26934022 - 26933769
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||| ||   ||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  26934022 gttcctttttaagcgttatttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 26933923  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||| ||  | ||||||  |||||||||||||    
T  26933922 ccttagttatttatcgcagagagagaaatatatgaaatgaaatattaaa-gaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtgtcaaaagtagtaa 26933824  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 279  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||||||| || |||||  |||||||||    
T  26933823 catttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacggttaaaaagg 26933769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 30151665 - 30151938
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30151665 gttcctttttaagtatatcttttagagaatttttttgttcttatttaactgtcattttcgaagttcaacgcaacattaaatgttgttttatcaatattat 30151764  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||   ||||||||||||    |  || ||| |||||||| |||||    
T  30151765 ccttacttatttattgcgcatagagaaatatatgaaattaaatattgaatgaataaggctattatagtaaaagagtatattgttgtatcaaaagcagtaa 30151864  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataata 298  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| | |||| | |||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  30151865 catttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagagacaattaaaaatgaacgaaagtagtagtaata 30151938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 292
Target Start/End: Original strand, 42629329 - 42629577
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    ||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  42629329 ttttagagaaattttttatttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttatcaatattacccttaattatttaatgcgg 42629428  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattgg 243  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||   ||| ||||| || || || ||| || | |||||||||||||| | |||   | | ||||    
T  42629429 agagagaaatttatgaaacaaaatattaaatgaaaaaggctattttagtacaagtataaattactgtaccaaaagtagtaacatttattgattgtcttgg 42629528  T
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42629529 tttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaacgaacggatgtagta 42629577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 53691905 - 53691734
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||     
T  53691905 gttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacatcattaaatgttgttttatcaatattac 53691806  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  53691805 ccttaaatatttattgtggaaagagaaacatatgaaataaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaa 53691734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 34603617 - 34603874
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||     
T  34603617 gttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatac 34603716  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| |||| |||||| |||||| ||||| |    
T  34603717 ccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacacaagttattgtatcaaatgtagtga 34603816  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
     |  ||||   | | ||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34603817 aatacatttagtgtcttgatttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 34603874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44176777 - 44176580
Alignment:
Q  88 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatt 187  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||    
T  44176777 ttcaatgcaaaattaaattttgttttaccaatattattcttgcttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaagttatt 44176678  T
Q  188 atagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||| ||||| || |  |||||| |||||||||||||| | | ||||  | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44176677 ataataaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgttttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagaaacgga 44176580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 292
Target Start/End: Original strand, 45725563 - 45725796
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||    
T  45725563 ttgtttctatttaattgtcatttttaaagttcaatgcaatattaaatattattttatcaatattatccttaattatttattacagagagagaaataattg 45725662  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||  ||||||||||||||| || | ||||| | ||||  | || |||||| |||||||||||||||| | |||  || |||| |||| |||||||||||    
T  45725663 aaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaatgataatttattgtatcaaaagtagtaacatttattgactttatttgtttgtgtaaaatgtc 45725762  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45725763 aaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 45725796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 42133030 - 42133297
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42133030 gttcctttttaatcgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttatcaatattat 42133129  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaat-acaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||| || |||||| ||||||   |||||||||||| | | ||   |||| ||||||| |||||    
T  42133130 ccttagatatttattgcggagtgagaaacatatgatgtgaaat-ttaaatcaataaggctattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaaatagta 42133228  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | |||   | | ||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  42133229 acatttattgattgttttggtttgtgtaaaatattgaaaagtgacaattaaaaagaaacgaaggtagta 42133297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 18091235 - 18091495
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| |      
T  18091235 gttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgc 18091334  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||   |||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| |    
T  18091335 ccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataattaaaacataagttattgcatcaaaagtagtga 18091434  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |  ||||   | | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18091435 aatacatttagtgtcttggtttgtgtataaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacgga 18091495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 294
Target Start/End: Original strand, 19399569 - 19399795
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19399569 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaataataaa-gttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaga 19399667  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    |||||||| | ||||   |||||| ||||| || || |||||| || | ||  ||||||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19399668 tattaaattactaaggctattatattaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagcg 19399767  T
Q  267 acaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    | | |||||||| |||||| ||||||||    
T  19399768 aaagttaaaaagaaacggaggtagtaat 19399795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 56499840 - 56499610
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  56499840 agaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgtttttcttatattacccttatttatttattgcagagagag 56499741  T
Q  150 --aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggttta 247  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||| ||||| | || || ||| ||||||| |||||| |   ||| | | | |||||||     
T  56499740 aaaaatatatgaaatgagatattaaatgattagggctattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaatagtaaaatgtatttgttgtcttggtttg 56499641  T
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  56499640 tgtaaaaagtcaaaaggtgacaattaaaaag 56499610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Original strand, 36750576 - 36750726
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  36750576 ttgttcttatttaactgtcacttacaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattgcggagagagaaatatata 36750675  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    |||| | ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| || ||||||    
T  36750676 aaataatatattaaatgattaaggctattatagtacaaatataaattattg 36750726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1146300 - 1146030
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  |||  ||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||     
T  1146300 gttcctttttaattgtcacttttgcagattttttttgtttcttattaactatcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttgcctttattac 1146201  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag---atcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   || ||||||| |||||||  | || |||||||||||||||    
T  1146200 ccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatgaaggtaattattatagaaaaaatatgaattgttgcatcaaaagtag 1146101  T
Q  222 taacaatcattagctatattggtttatgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| ||  |||   ||| ||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1146100 taaaaagtatttattatcttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacggatggagta 1146030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1181153 - 1180892
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaatttttt-gttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || | |||    
T  1181153 gttcctttttaattgtcacttttgcagaaatttttttgtttctaattacctgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttggcattctta 1181054  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||    
T  1181053 cctttgattatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgagaaaggttattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagtagta 1180954  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    | |  |||| | | | ||||||| |||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1180953 aaatgcatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaacctaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 1180892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 293
Target Start/End: Original strand, 31369835 - 31370062
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||    
T  31369835 tatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttag 31369934  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgt 265  Q
      ||||||  |||||| | |||||||||||| ||    || ||  |||||||||| ||||| | |||   | ||||||||| |||||||||||  || ||    
T  31369935 tgattaaacaaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtaataacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtcttaaagt 31370034  T
Q  266 gacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31370035 gacacttaaaaagaaacggaggtagtaa 31370062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33755333 - 33755200
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33755333 gttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 33755234  T
Q  125 ccttagt---tatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    |||||||   |||||||||| |||||||| ||||    
T  33755233 ccttagttattatttattgcagagagagatatat 33755200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Original strand, 14090252 - 14090504
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||||| |    
T  14090252 ttttatagaaattttttgtttataattaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatacccttagtaatttattgcag 14090351  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattgg 243  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| |||| |||||| |||||| ||||| | |  ||||   | | || |    
T  14090352 agagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacacaagttattgtatcaaatgtagtgaaatacatttagtgtcttag 14090451  T
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||    
T  14090452 tttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaagaacagagggagtaataa 14090504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14949305 - 14949077
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14949305 ttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaata 14949206  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    || |||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||  | || |||||| |||||||||||| | |  ||||   | ||||||||| |||||||    
T  14949205 taagaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtattggtttgtgtaaaa 14949106  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14949105 cgtcaaaatgtggcaattaaaaaggaacg 14949077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37551916 - 37551765
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||     
T  37551916 gttcctttttaattgtcacttttgtagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttgtgcctttattac 37551817  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 176  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37551816 ccttggttatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatga 37551765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 163
Target Start/End: Original strand, 51347282 - 51347393
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  51347282 aaatattttgttcctatttatctgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagaaaa 51347381  T
Q  152 atatatgaaatg 163  Q
    | ||||||||||    
T  51347382 acatatgaaatg 51347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18135260 - 18135048
Alignment:
Q  67 atttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||   |||||||||||||||| |||||     
T  18135260 atttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaa 18135162  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatc-aaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatg 264  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||| | | |||   | | ||||||| ||||||||||||||||     
T  18135161 atattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaata 18135062  T
Q  265 tgacaattaaaaag 278  Q
    ||||||||||||||    
T  18135061 tgacaattaaaaag 18135048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 281
Target Start/End: Original strand, 39308955 - 39309179
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    |||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  39308955 tttttgtttctaattaactgtaatttttaaagtacaatgtatcattaaatgtagttttacctatattatccttatatatttattgcagagagagaaatat 39309054  T
Q  156 atgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaat 255  Q
    |||||||||  |||||||| | |||| | ||||||| ||||| | || |||||  || |||||| |||| ||  ||| | ||| || ||||||||||||     
T  39309055 atgaaatgaagtattaaattattaaggttattataggaaaaagataaattattatattaaaagtggtaa-aagtatttgttatcttagtttatgtaaaaa 39309153  T
Q  256 gtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  39309154 gtcaaaatatgacaattaaaaaggaa 39309179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49122470 - 49122258
Alignment:
Q  67 atttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||   |||||||||||||||| |||||     
T  49122470 atttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaa 49122372  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatc-aaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatg 264  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||| | | |||   | | ||||||| ||||||||||||||||     
T  49122371 atattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaata 49122272  T
Q  265 tgacaattaaaaag 278  Q
    ||||||||||||||    
T  49122271 tgacaattaaaaag 49122258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 278
Target Start/End: Original strand, 42645379 - 42645507
Alignment:
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||| || || ||||    
T  42645379 aaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaataacaattattgattatcttagtatatg 42645478  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42645479 taaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 42645507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 48510076 - 48509865
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||  ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  48510076 ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattactcttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagta 48509977  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||  | || || ||| |||||||||||||| ||| ||| | | | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48509976 ttaaatgattaagaatattatagaaaaatgataaatttttgtatcaaaagtagtaaaaat-atttgttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatgtgac 48509878  T
Q  269 aattaaaaaggaa 281  Q
    |||||||||||||    
T  48509877 aattaaaaaggaa 48509865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 280
Target Start/End: Original strand, 38865929 - 38866149
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| |||  ||||||||||||||    
T  38865929 ttttgtttctaattcactgtcattttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttt-acctatattacccttggatatttgttgtagagagagaaatata 38866027  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    || ||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||| ||| ||| | | | ||  ||||||||||| |    
T  38866028 tgtaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagtaa-aat-atttgttgtcttaatttatgtaaaaag 38866125  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaagga 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  38866126 tcaaaatatgacaattaaaaagga 38866149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Original strand, 48087718 - 48087948
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  48087718 aaattttttgtttttaattaactctcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatacccttagtaatttattgcagagagaaaa 48087817  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaat-aagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt 250  Q
    |||||||||||  |||||||||| | | ||||| ||| |||  |||| |||| |||||| |||||| ||||| | |  ||||   | | ||||||| |||    
T  48087818 atatatgaaatatgatattaaataattaaagat-attgtaggcaaaacacaagttattgtatcaaatgtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgt 48087916  T
Q  251 aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  48087917 aaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 48087948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 6150688 - 6150886
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  6150688 ttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacc 6150787  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||||||||||||||||||    
T  6150788 cttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaagtgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaa 6150886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31984269 - 31984135
Alignment:
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||   | | ||||||| |||||||||||    
T  31984269 aaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtgttggtttgtgtaaaatgtc 31984170  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31984169 aaaaagtgacaattaaaaagaaatggatgtagtaa 31984135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41955883 - 41955776
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  41955883 atttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatataattttatcaatattatccttagatatttattgcagagagagaaaaatatgaaatgaaa 41955784  T
Q  167 tattaaat 174  Q
    ||||||||    
T  41955783 tattaaat 41955776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 38617809 - 38617947
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  38617809 gttcctttttaattgtcacttttagagaaactatctgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattat 38617908  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatg 163  Q
    |||||  |||||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  38617909 ccttatatatttattgcagagagaaaaacatattaaatg 38617947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1615260 - 1615039
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1615260 ttaactgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattaccattgattatttatt--gtagagagaaatatatgaaatgagata 1615163  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt-aaaatgtcaaaatgtga 267  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |||||||  |  | |||||||||||||||||| ||  ||| | | | ||||||| ||| ||||  |||||| ||||    
T  1615162 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaactgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtga 1615064  T
Q  268 caattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1615063 caattaaaaagaaacggatggagta 1615039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8457143 - 8456902
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |  ||| |  ||||||| ||||||||| |    
T  8457143 ttttacagaatttttttgtttcttattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaagggtgttcttcttataatgcccttagtaatttattgcag 8457044  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattgg 243  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| | || |||||| |||||||||||| | |  ||||   | | ||||    
T  8457043 agagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttgg 8456944  T
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8456943 tttgtgtagaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 8456902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 27918595 - 27918747
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||     
T  27918595 gttcctttttaagtatctcttttgtagaaatgttttgtttctatttagctgtcactttcaaagttcaatcaaatattaaatgttg-tttatcaatattac 27918693  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 178  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  27918694 cattagttatatattgcaaagagagaaatatatgaaacaagatataaaatgaat 27918747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 285
Target Start/End: Original strand, 3036419 - 3036636
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| ||    
T  3036419 tatttaattgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttattttaccgatattacccttagtaatttatt--atagagagaaatatatgaaataag 3036516  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgt 265  Q
    ||||||||||||| | |  ||||| | ||| | | || | |||| |||||||||| ||||| | |||   | |  || |||||||||||||| ||||| |    
T  3036517 atattaaatgaatgaaactattattggaaagagataaatcattgtatcaaaagtaataacatttattgattgttatgatttatgtaaaatgtaaaaatat 3036616  T
Q  266 gacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3036617 gacaattaaaaaggaacgga 3036636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37394410 - 37394298
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  37394410 gttcctttctaaatgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 37394311  T
Q  125 ccttagttattta 137  Q
    ||||| |||||||    
T  37394310 ccttaattattta 37394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38010017 - 38009750
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| | || ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||        
T  38010017 gttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttccaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaactttaaatgttgtttttcctataaagc 38009918  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa-gatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||  |||||||||| |  || ||| |||||||  |||| | || |||||| ||||||||||||     
T  38009917 ccttagtaatttattggagagagaaaagtatatgaaatatgatattaaataatcaatgat-attataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtg 38009819  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | |  ||||   | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38009818 aaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38009750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 3802153 - 3802304
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||     
T  3802153 gttcctttttaattgtcatttttgcataaattttttgtttctaattaaccgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttacctttattac 3802252  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 176  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  3802253 ccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataaaatattaaatga 3802304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6091578 - 6091420
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgt--cactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga 150  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  6091578 aatttttttttcctatttaactatatcactttcaaaattcaatgcaacaataaatattgttttttcaatattatttttagttatttattgtgcagagaga 6091479  T
Q  151 aatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||    |||||||||||| || || ||||||    
T  6091478 aatatatgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattg 6091420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34925568 - 34925421
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | | ||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  34925568 agaaattttttgtttttaattaattgtcactttcaaaattcaatataacattaaatgttgttttaatattgttatccttgattatttattgcagaaagag 34925469  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||    
T  34925468 aaatatatgaaatgagatattaaattaggaagattattatagaaaaaa 34925421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 36292618 - 36292877
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  36292618 gttcctttttaattctcacttttagagaaattttttgttcc-atttaagtgtcactt--------caatgcaacattaaatgttgttttatcaatattac 36292708  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
      |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||| || || | | || ||| ||||||||||    
T  36292709 ttttagatatttaatgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagacaattataataaaagtaaaaataactgtatcgaaagtagtaa 36292808  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    || | |||   | | ||||||  ||||||||||||||| || |  |||||||||   ||||||||||||    
T  36292809 catttattgattgttttggttagtgtaaaatgtcaaaaagtaatcattaaaaagtggcggatgtagtaa 36292877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1391388 - 1391162
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  1391388 ttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacactaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatgtg 1391289  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||   |||||||||| | ||||   ||||||   |||| | || |||||| |||||||||||| | |  ||||   ||| ||||||| ||||||| |||    
T  1391288 aaaaatgatattaaataattaaggatattatacgtaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtatcttggtttgtgtaaaaagtc 1391189  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1391188 aaaaagtgacaaataaaaaggaacgga 1391162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Original strand, 54029135 - 54029263
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||    
T  54029135 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttacctttattaaccttgattatttattgtagagagataattatatgaaataagata 54029234  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaa 197  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |||||    
T  54029235 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaa 54029263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 17978090 - 17978198
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaa 152  Q
    |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  17978090 aatttttttttccaatttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagaca 17978188  T
Q  153 tatatgaaat 162  Q
     |||||||||    
T  17978189 catatgaaat 17978198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 181
Target Start/End: Original strand, 7242272 - 7242388
Alignment:
Q  65 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| | |||| ||||||||    
T  7242272 ctatgtaactgtcgctttcaaagtttaatacaacattaaatattgttttatcaatattatctttagttatttattaatgagagaaatatatgtgaaatga 7242371  T
Q  165 gatattaaatgaataag 181  Q
    |||||||||| ||||||    
T  7242372 gatattaaattaataag 7242388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Original strand, 8752166 - 8752270
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8752166 tttgttcctatttgattgtcaatttcaaattttaaagcaacattaaatgttattttagcaatattacccttagttatttattaaggagagagaaatatat 8752265  T
Q  158 gaaat 162  Q
    |||||    
T  8752266 gaaat 8752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51655068 - 51654854
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 179  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| | |||| | |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  51655068 tttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaactattaaattatta 51654969  T
Q  180 agatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 279  Q
    || | |||| |||||||| | || || ||| ||||||||||| || ||  |||   ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51654968 aggttattacagtaaaaagataaattgttgtatcaaaagtag-aaaaagtatttattattttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacgattaaaaagg 51654870  T
Q  280 aacggatgtagtaata 295  Q
    ||| || | |||||||    
T  51654869 aacagaggaagtaata 51654854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Original strand, 17698643 - 17698725
Alignment:
Q  213 caaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17698643 caaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaata 17698725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 181
Target Start/End: Original strand, 20087203 - 20087325
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  20087203 ttgttcctatttaactgttacttataaagtttaatgcaatgttaaatgttgttttattaatgttattcttatttatttattgcggagagagaaatataga 20087302  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    |||| | ||||||||||| ||||    
T  20087303 aaataatatattaaatgagtaag 20087325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 55430521 - 55430302
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||    
T  55430521 tttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcattgtatcattaaatgtggttttacctatattatccttagatacttattgtgaagagataaatatat 55430422  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||| |  |||||||||| | || | ||||||| ||||| | || || ||| ||||||| |    | ||  ||| | ||| ||||||| ||||||| ||    
T  55430421 gaaattaagtattaaatgattgaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaat----aaaagtatttgttatcttggtttgtgtaaaaagt 55430326  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  55430325 aaaaatgtgacaattaaaaaggaa 55430302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 106
Target Start/End: Original strand, 17698559 - 17698642
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatg 106  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17698559 ctgttccttttttagtgtcgtttttgaagaaattttttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatg 17698642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30152079 - 30151934
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| |  |    
T  30152079 ttcctttataactgtcacttttacataaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttattcctataatgcc 30151980  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatta 171  Q
    |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  30151979 cttaataatttattgcagagatagaaatatatgaaatatgatatta 30151934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 220
Target Start/End: Original strand, 43086442 - 43086591
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||    
T  43086442 ttaactgtgactttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttttcctttattacccttgattatttactgc--agagagaaatatatgaaaagaaata 43086539  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| ||||| | || || ||| ||||||||||    
T  43086540 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagta 43086591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 197
Target Start/End: Original strand, 41813666 - 41813808
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc-aatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || |     
T  41813666 tttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccttttattacccttgattatttattgtagagagataagtg 41813765  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaa 197  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||| | ||||||| |||||    
T  41813766 tatgaaataatatattaaatgatgaaggttattataggaaaaa 41813808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Original strand, 20294307 - 20294424
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |  ||||| || |  |||||||||   || |||||||||    
T  20294307 ttttttgtttctaattaactatcactttcaaagttcaatacaacattaaatcttgttttgtctttattacccgtgattatttattctagaaagagaaata 20294406  T
Q  155 tatgaaatgagatattaa 172  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20294407 tatgaaatgagatattaa 20294424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19731523 - 19731452
Alignment:
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19731523 ccttagatatttattgcggagagagaaacatttgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 19731452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25098423 - 25098342
Alignment:
Q  100 ttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25098423 ttaaatgttgttttattaatattacccttgtttatttattacggagagagaaatgtatgaaataagatattaaataaataag 25098342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52978421 - 52978321
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 179  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| | | ||| ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52978421 tttcaaagttcaatttaatattaaatgttgttctacaagt-ttaccctttattatttattgtgtagagagaaatatatgaaaagagatattaaatgaata 52978323  T
Q  180 ag 181  Q
    ||    
T  52978322 ag 52978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 292
Target Start/End: Original strand, 9834488 - 9834540
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9834488 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 9834540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 294
Target Start/End: Original strand, 29511197 - 29511305
Alignment:
Q  186 ttatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||| || |  || ||| |||||||||||||||| | || |  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29511197 ttatagtaaaagtatacattgttgtatcaaaagtagtaacatttatgaaatttcttggtttatgtaaaatgtcaaaaggtgacaattaaaaatgaacgga 29511296  T
Q  286 tgtagtaat 294  Q
     ||||||||    
T  29511297 ggtagtaat 29511305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 31984352 - 31984296
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactt 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31984352 gttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactt 31984296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27654953 - 27654742
Alignment:
Q  68 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac-attaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||  ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| |    
T  27654953 tttaattgtcactttcaaagttcaacacaaatattaaattatgtgttatctatattacccttagttatttattgcagattgataaatatatgaaatgaaa 27654854  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    ||||||||||  ||    ||||||| ||||  | || || ||| |||||||||||||| | | ||||| | | || |||| ||||||| || ||||  ||    
T  27654853 tattaaatgatgaaagctattatagaaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatttattagttgtcttagtttgtgtaaaaagttaaaaaatg 27654754  T
Q  267 acaattaaaaag 278  Q
    ||||||||||||    
T  27654753 acaattaaaaag 27654742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 102
Target Start/End: Original strand, 42645301 - 42645377
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttc-ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatta 102  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42645301 gttcctttttaagcgtctcttttgaaga--tttttttttctctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatta 42645377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Original strand, 37987562 - 37987647
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac-----attaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  37987562 ttttgaagaaaaattttgttcctatttaaccgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaattaaatgttgttttaccaatattat 37987647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 198
Target Start/End: Original strand, 56486422 - 56486551
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||| | |||  |||||||||   | | |||||||||| |||||| |||    
T  56486422 ttaattgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttggtttatctatattacctttaaatatttattgtaaataaagaaatatataaaatgaaata 56486521  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaat 198  Q
    |||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  56486522 ttaaatgattaaggttattgtagtaaaaat 56486551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38027611 - 38027559
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38027611 ttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38027559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52677202 - 52677150
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  52677202 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagta 52677150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 9746293 - 9746479
Alignment:
Q  97 acattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||| ||||  ||||||||||  |||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  9746293 acattaaatgttgttttgtctttattacccttgattatttattgtagagaaagaagtaaatgaactgagatattaaatgatgaagattattataggaaaa 9746392  T
Q  197 atacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    | |  | || |||||||||| ||| ||| ||  ||| | | | ||||||| |||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  9746393 agatgaattgttgcatcaaaggtaataaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaattcaaaagtgacaattaaaaaggaacg 9746479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23621962 - 23621905
Alignment:
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  23621962 atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagta 23621905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29832435 - 29832354
Alignment:
Q  201 aacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||   | | ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29832435 aacttattgcatcaaaagttgtaacaattattgattgtcttggtataagtaaaatgtcaaaaggagacaattaaaaaggaac 29832354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 294
Target Start/End: Original strand, 36408969 - 36409014
Alignment:
Q  249 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36408969 gtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 36409014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 294
Target Start/End: Original strand, 36423135 - 36423180
Alignment:
Q  249 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36423135 gtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 36423180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 202
Target Start/End: Original strand, 6129008 - 6129135
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 173  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||| || |||||  |||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  6129008 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataatacccttatctatttattgtagagagagaaata-atggaatgaaataataaa 6129106  T
Q  174 tgaataagatcattatagtaaaaatacaa 202  Q
    ||| ||||   ||| ||| ||||||||||    
T  6129107 tgattaagggtattgtagaaaaaatacaa 6129135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 154
Target Start/End: Original strand, 3588358 - 3588461
Alignment:
Q  51 gaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga 150  Q
    |||| |||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  3588358 gaaagtttttgtttctatctatttgtcattttcaaagttcatttcaacatcacatgttgttttgtcaatatcacccttaattatttattgcagagcgaga 3588457  T
Q  151 aata 154  Q
    ||||    
T  3588458 aata 3588461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19740789 - 19740714
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatt 101  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19740789 ttcctttttaattgtcacttttagagaaaacaattgttcttatttaactgtcactatcaaagttcaatgcaacatt 19740714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7037129 - 7037047
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaat 162  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  ||||  |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  7037129 tttcaaagttcaatacaatattaaatattgctttacctgtattgcccttagttatttattatagagaaagaaatatatgaaat 7037047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23621611 - 23621573
Alignment:
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23621611 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaataa 23621573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33751376 - 33751334
Alignment:
Q  243 gtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33751376 gtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacgga 33751334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 53219236 - 53219130
Alignment:
Q  62 ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa 161  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||    |||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  53219236 ttcctatttaactgttcttttcaaagttcaatgcaacattaattattgatttgtcaataacccccttagctatttattacatagagagaaatagatgaaa 53219137  T
Q  162 tgagata 168  Q
    || ||||    
T  53219136 tgtgata 53219130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13435306 - 13435257
Alignment:
Q  131 ttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 180  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13435306 ttatttattacagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaattaataa 13435257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1615308 - 1615268
Alignment:
Q  73 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 113  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1615308 ctgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgtttt 1615268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7037235 - 7037159
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||||   |||| |||||||||    
T  7037235 tttcaaagttcaatacaatattaaatattgttttacctatattgcccttaattatttattatagagaaagaaatata 7037159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19692940 - 19692860
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |||| |||||  | ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19692940 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata 19692860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19703525 - 19703445
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |||| |||||  | ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19703525 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata 19703445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 136
Target Start/End: Original strand, 24948641 - 24948720
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttattt 136  Q
    |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||| || ||||||||||||    
T  24948641 ttttgttcatatttagttgtcatttttaaagttcaatgaaacattaattgttattttgtcaataatacccttagttattt 24948720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 292
Target Start/End: Original strand, 49089123 - 49089166
Alignment:
Q  249 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49089123 gtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 49089166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53467697 - 53467650
Alignment:
Q  131 ttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 178  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53467697 ttatttattacatagagagaagtatatgaaatgagatattaaatgaat 53467650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Original strand, 7243014 - 7243068
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatg-tgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  7243014 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgttaacaattaaaaagaaacgaatgtagtaa 7243068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Original strand, 23237403 - 23237457
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcac 79  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23237403 gttcctttttaagtgtcatttttggagaatttttttgttcctatttatctgtcac 23237457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Original strand, 26915966 - 26916114
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| || |||||||| |||| | || ||| |||||||||| | ||||||| ||||||     |||||||||  ||||    
T  26915966 ttaactgttattttcaaagtttaatgtaatattaaatggtgttcttcctataatatccttagtaagttattgcagagaga-----atatgaaatatgata 26916060  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    |||||| | ||||   |||||||  |||| | || |||||| ||||||||||||    
T  26916061 ttaaataattaaggatattatagacaaaacataagttattgtatcaaaagtagt 26916114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30151582 - 30151541
Alignment:
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30151582 tttatgtagaaagtcaaaatgtgataattaaaaaggaacgga 30151541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 285
Target Start/End: Original strand, 34361706 - 34361743
Alignment:
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34361706 tgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagtaacgga 34361743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Original strand, 53855433 - 53855530
Alignment:
Q  76 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 173  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||   ||  ||||||||||  ||| || ||||||||| |||||| |||||||    
T  53855433 tcacttttaaagttcaatacaacattaaatattgttttgcctttattacttttgattatttattgtagagcgaaaaatatatgcaatgagttattaaa 53855530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 121)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16124507 - 16124240
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124507 gttcatttttaagtatctcttttgaataaattttttattactatttaactgttaccttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 16124408  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124407 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 16124308  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16124307 caatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 16124240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9127598 - 9127331
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9127598 gttcctttttaagtgtctattttgatgaaattttttgttcgtatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattat 9127499  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  9127498 ctttaattatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtgataa 9127399  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9127398 caatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 9127331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26854343 - 26854075
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26854343 ctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 26854244  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  26854243 atccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagt 26854145  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | |||| |||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26854144 atcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgaatgtagta 26854075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14794037 - 14793769
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14794037 gttcctttttaaatgtctgttttggagaaattttttgtttctatttaaatgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattat 14793938  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  14793937 ccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtaa 14793838  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
     ||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14793837 taattattgattatattggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaagggaggtagtaa 14793769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28024508 - 28024240
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28024508 ctgttcctttttaagtgtctcttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatatt 28024409  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28024408 atccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagt 28024309  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 291  Q
    || ||| |||   | | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28024308 aataattattgattgtcttggttggtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagt 28024240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 42911526 - 42911780
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42911526 ctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctt 42911625  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42911626 agttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaatatgatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 42911725  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
     |||   | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42911726 tattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 42911780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37303350 - 37303098
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37303350 ctttttatgtgtcttttttgaagattttttctgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaatgttgtttcaccaatattatcctt 37303251  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  37303250 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattacatcaaaagtagtaataat 37303151  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    |||   |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37303150 catcgactaccttagtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaa 37303098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4175727 - 4175460
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4175727 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgt 4175628  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||     
T  4175627 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtat 4175528  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4175527 caattgtttattgtcttgctttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 4175460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Original strand, 34261289 - 34261551
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34261289 tttttaagtgtcaattttgcagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatcctta 34261388  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||     
T  34261389 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgtatcaaaagtagtatcaatt 34261488  T
Q  230 attagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||   | | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  34261489 gttgattgtcttggtttgtctaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 34261551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38503047 - 38502784
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38503047 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattattttaccaatattat 38502948  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38502947 ccttaactatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg----aggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaa 38502852  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||    
T  38502851 caatcattgactattttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtaacaattaaaaagaaacagaggtagta 38502784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2134153 - 2133890
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2134153 gttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattttttgttcttatttaattgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattat 2134054  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  2134053 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaa-tagtaa 2133955  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
    |||| |||   | | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  2133954 caattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaa-atgataattaaaaaggcacggaggtag 2133890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 12664834 - 12665090
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    ||||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12664834 ctttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtcctt 12664933  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  12664934 agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacatcatattgcatcaaaagtagtatcaat 12665033  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
      ||   | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12665034 tgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacgga 12665090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8230050 - 8229784
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8230050 gttcctttttaagtgtctattttgaagaaattttttattcctatttaactgtcattttccaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 8229951  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  8229950 ccttagttatttattccggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcactatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtattaa 8229851  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| |||   | | ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8229850 caattattgattgtcttaatttgtgtaagatgtcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 8229784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 8825029 - 8825296
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8825029 gttcctttttaagtgtcattttttgagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 8825128  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||     
T  8825129 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtat 8825228  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8825229 caattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 8825296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24075084 - 24074833
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||      
T  24075084 ttcctttttaagtgtctcttttaaagaatttttttgtttatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattact 24074985  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24074984 cttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaac 24074885  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    ||| |||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24074884 aattattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 24074833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18020996 - 18020748
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020996 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 18020897  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattgg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||  ||   | | ||||    
T  18020896 agagagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgg 18020797  T
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18020796 tctgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgaagta 18020748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4985421 - 4985155
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||     
T  4985421 gttcctttttaagtgtctcttttggagat-ttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattac 4985323  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4985322 ccttaattatttattgaggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaa 4985223  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||  |||   | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4985222 caactattgattgtcttggtatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 4985155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 285
Target Start/End: Original strand, 7403849 - 7404084
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  7403849 agaaattttttgttcatatttaactctcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaat 7403948  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||  ||   ||| ||||||||||    
T  7403949 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattatcttggtttatg 7404048  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7404049 taaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 7404084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 38910246 - 38910512
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38910246 gttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 38910345  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  38910346 ccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 38910444  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38910445 caattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38910512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 39073016 - 39073283
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39073016 gttcctttttaagtgtcaattttggaaaaaaaatttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 39073115  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  39073116 ccttagttatttattgcgaagtgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 39073215  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39073216 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 39073283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 38702113 - 38702371
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  38702113 gttcctttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattgt 38702212  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  38702213 ccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 38702312  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    ||||  ||   | | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  38702313 caattgttgattgtcttggtttatgtaaaatattaaaatatgacaattaaaaaggaacg 38702371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 40198758 - 40199020
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40198758 ctgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatatt 40198857  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40198858 atccgtagttatttattgcggagagagaaataaatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagt 40198957  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||  ||   | | ||| | | |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  40198958 aacaattgttgattgtcttgatctgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaaaaaagaacgga 40199020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Original strand, 4017385 - 4017653
Alignment:
Q  24 tgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4017385 tgtttctttttaaccgtctcttttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaatattaaatgttgatttaccaatatta 4017484  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |    
T  4017485 tccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaa 4017584  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||| |||   ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4017585 acaattattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaatggatgtagta 4017653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7579915 - 7579647
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7579915 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 7579816  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatc-aaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| | ||||||||||    
T  7579815 ccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcaacaaaaagtagta 7579716  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||||  ||   | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7579715 tcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 7579647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 57 - 292
Target Start/End: Original strand, 9076075 - 9076310
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9076075 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatata 9076174  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| |||||||||    
T  9076175 tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatg 9076274  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9076275 tcaaattatgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 9076310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38017499 - 38017257
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38017499 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagag 38017400  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||  ||   | | || |||| ||    
T  38017399 aaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttcgtttgtg 38017300  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  38017299 taaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaagaacgaaggtagta 38017257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 59 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1088146 - 1087909
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1088146 ttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 1088047  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||     
T  1088046 aaatgagatattaaatgaataaagtcgttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtt 1087947  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1087946 aaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagtaataa 1087909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12870141 - 12869886
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12870141 tttttaagtgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgttctta 12870042  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12870041 gttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 12869942  T
Q  230 attagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     ||   ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12869941 gttgattatcttggtttgtataaaatatcaaaatgtgacaattaaaaatgaacgga 12869886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 25343932 - 25344199
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25343932 gttcctttgtaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaaccgttactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 25344031  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |     
T  25344032 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaggat 25344131  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25344132 caattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgacaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 25344199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Original strand, 18794756 - 18795022
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18794756 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtc 18794855  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||  | |    
T  18794856 cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacatcaaaagtatgatc 18794955  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||  ||   | | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18794956 aattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaagtgtgaaaattaaaaaggaacggaggtagta 18795022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 36239429 - 36239690
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaaga-aattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36239429 gttcctttttaagtgtctcttttggagatttttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatatta 36239528  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36239529 cccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaattaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagta 36239628  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  |||   | | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36239629 acaactattgattgtcttgatatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacgga 36239690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6754394 - 6754158
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754394 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatatcatttttagttatttattgcggagagagaaatata 6754295  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  | |||| |||   | | ||||||| |||||||||    
T  6754294 tgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtatgatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatg 6754195  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6754194 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaa 6754158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 289
Target Start/End: Original strand, 6689576 - 6689835
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6689576 ttttcaagtgtctcttttggagaaattttttgtttctgtttatctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattctta 6689675  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  6689676 attatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaaatagtaacaatt 6689775  T
Q  230 attagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgta 289  Q
    ||||  | | ||| ||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  6689776 attaattgttttgatttgtgtaaaatgtaaaaaaataacaattaaaaaggaacggatgta 6689835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 38363163 - 38363428
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||   ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38363163 gttcctttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat--t 38363260  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||     
T  38363261 ccttagttattaattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattagtat 38363360  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38363361 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaattgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 38363428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Original strand, 6072428 - 6072691
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    ||||||||| |||  ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6072428 ctttttaagcgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt 6072527  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6072528 agttatttattacggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaat 6072627  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
      ||   | | ||  ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6072628 tgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtttaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 6072691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10359457 - 10359222
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  10359457 agaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagaaaa 10359358  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| ||    
T  10359357 aaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtg 10359258  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10359257 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacgga 10359222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4962429 - 4962183
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgtt-cctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4962429 tttttaagtgtctcttttagaaaaactttttgtttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatggaacattaaatgttgttttacaaatattatcttt 4962330  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||  |    
T  4962329 agttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaaatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtgataacggt 4962230  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
     |||   ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4962229 tattgattatcttggtttatgtaaaatgtcaaaa--tgacaattaaaaa 4962183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2674180 - 2673956
Alignment:
Q  70 taactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2674180 taactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctcagttatttactgcgaagagagaaatatatgaaattagatat 2674081  T
Q  170 taaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgaca 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2674080 taaatgaataaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgaca 2673981  T
Q  270 attaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  2673980 attaaaaaggaacggaggtagtaat 2673956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28447231 - 28446972
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  28447231 gttcctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttcctatttaactctcactttcaaagttaaatgcaacattaaatgttattttataaatattat 28447132  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  28447131 ccttagt-atttattgagaaaagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaaatagtaa 28447033  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||| |||   ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28447032 caattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagaaacgga 28446972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Original strand, 4098307 - 4098572
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||| ||  ||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4098307 ctttttaagtatcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcagtacaacattaaatgttgttttgccaatattatcctt 4098406  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| || ||||    
T  4098407 tgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaggtataacttattgtatcaaaagtaatatcaat 4098506  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
      ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  4098507 ttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggagatagtaat 4098572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4427653 - 4427380
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4427653 gttcctttttaagtgtttcttttggagaaattttttgttcatattcaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattat 4427554  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4427553 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgagtgaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagcaa 4427454  T
Q  225 -caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
      ||| | |   | | ||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4427453 taaattactgattgtcttgattcgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtactaat 4427380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1297985 - 1297717
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1297985 gttcttttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgt 1297886  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatc-aaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| |||| |||||    
T  1297885 ccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaaatagta 1297786  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
      |||  ||   | | || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1297785 ttaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaatggaggtagta 1297717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39894023 - 39893787
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39894023 tttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatat 39893924  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||| ||||||||||    
T  39893923 gaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattattttggtttgtgtaaaatgt 39893824  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893823 taaaaagtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 39893787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18437572 - 18437298
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18437572 ctgtttctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttcaatttaagtgtcactttcaaaatccaatgtaacattaaatgttgttttaccaatatt 18437473  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| || ||  ||||| ||||||| | ||    
T  18437472 acccttagttatttattatggagagagaaatatatgaaatgagataataaataaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatcaaaaatggt 18437373  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    |||| | |||   | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18437372 aacatttattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtattaat 18437298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Original strand, 4694736 - 4694973
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4694736 gttcatttttaagtatctcttttggagaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttattttactaatattat 4694835  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||     
T  4694836 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtattag 4694935  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaa 262  Q
    |||| |||   ||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  4694936 caattattgattatcttggtttgtgaaaaatgtaaaaa 4694973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12784657 - 12784419
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  12784657 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagagaaacata 12784558  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||  |||| |||||||||||||||| | |||   | | ||||||| |||||||||    
T  12784557 tgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagtaaaac-aattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatg 12784459  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  12784458 tcaaaaagtgagaattaaaaaggaacagaggtagtaataa 12784419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Original strand, 18465673 - 18465925
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18465673 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 18465772  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||| || || |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  18465773 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg----attaaatgaacaaaattattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtagtat 18465868  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    ||||  ||   | | ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18465869 caattgttgattgttttggtttctgaaaaatatcaaaatatgataattaaaaaggaa 18465925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 6007855 - 6008125
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6007855 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattgt 6007954  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatag-taaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  6007955 ctttagttatatattacagagagagaaatatatgaaatgtggtattaaattaataaggctattatagttaaaaatataaatcattgtatcaaaagtagta 6008054  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc-aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||| |||   | ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6008055 acaattattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 6008125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4689044 - 4688865
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689044 gttcctttttaagtgtc-attttgaagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 4688946  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaactt 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  4688945 ccttagttatttattgcagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattaaagtaaaagtataactt 4688865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Original strand, 5119151 - 5119410
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5119151 ttcctttttaagtttctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgccactttcaaagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatc 5119250  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  5119251 ctttgttatttattactgagagaaaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaac 5119350  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||| |||   | ||||  ||| | |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  5119351 aattattgattgtattaatttgtataaaatattaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 5119410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12723208 - 12722935
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12723208 ctgttcctttttaactgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatatt 12723109  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||   |||| ||||||||||||    
T  12723108 acccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagt 12723009  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    || | | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  12723008 aatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaattaaaaaggaacagaggtagtaataa 12722935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 37809729 - 37809998
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37809729 ctgttcctttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatatt 37809828  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||    
T  37809829 acccttatatatttattgcagagagagaaacatatgaattaaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgcatcaaaagtagt 37809928  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| | ||||  | | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37809929 aacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggatcggaggtagta 37809998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19831789 - 19831588
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831789 ctgttcctttttaagtgtcttttttagagaaattttttgtttctatttaactctcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 19831690  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | |||||  ||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| || |    
T  19831689 acccttaactatttattgtggaaagagaa--atattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaacatataaattattgtatcaaaaatatt 19831592  T
Q  223 aaca 226  Q
    ||||    
T  19831591 aaca 19831588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28463632 - 28463365
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  28463632 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 28463533  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || |||||| || | ||  |||||    
T  28463532 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaa 28463433  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| |||||| | || | |||||||| |||||| ||||||    
T  28463432 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagcgatagttaaaaagaaacggaggtagta 28463365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 275
Target Start/End: Original strand, 32388999 - 32389208
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  32388999 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaa 32389098  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgt 265  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||| | |||   | | |||||||||||||||||| |||| ||    
T  32389099 atattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagt 32389198  T
Q  266 gacaattaaa 275  Q
    ||||||||||    
T  32389199 gacaattaaa 32389208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 31803296 - 31803563
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  31803296 gttcctttttaactgtcatttttagagaaaaaatttgttcttatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgatgttttactaatattat 31803395  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||| || || |||||||| || || | |||| ||||||||||||||    
T  31803396 ccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcgttttagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaa 31803495  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | ||||  | | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31803496 catttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 31803563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21606505 - 21606321
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  21606505 gttcctttttaaatgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 21606406  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||    
T  21606405 ccttaattatttattacggagaaagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaaatataaattattg 21606321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38297864 - 38297595
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaatttttt-gttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38297864 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatta 38297765  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||   |||||||||||| || || |||||| || | ||  ||||    
T  38297764 cccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattacatgattaaggcgattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagta 38297665  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||| | |||   | | || |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||    
T  38297664 acatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaactgaggtagtaa 38297595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 24228921 - 24229180
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||| | | | | |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24228921 gttcctttttaagtgtttctat-atagaaattttttgctcctatttaattgttactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattat 24229019  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |  |  || ||| ||||||||||||||    
T  24229020 ctttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaagtgtatattgttgtatcaaaagtagtaa 24229119  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||||| |||||||    
T  24229120 catttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatatcagaaaaagacaattaaaaatgaacgga 24229180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Original strand, 37633647 - 37633915
Alignment:
Q  24 tgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||  |||  ||||| |||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37633647 tgttcctttttaaccgtcacttttagagaaaaaatttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatatta 37633746  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     |||||  |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||||    
T  37633747 cccttatatatttattgcagaaagagaaacatatgaattaaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagta 37633846  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | ||||  | | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37633847 acatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggatcggacgtagta 37633915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37306945 - 37306693
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  37306945 gttcctttttaactgtcacttttagagaaaaattt-gttcctaattaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattac 37306847  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||  |   |||| ||||||||||||||    
T  37306846 ccttagatatttattgcagagagaaaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaagaacaattgtatcaaaagtagtaa 37306747  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    || | ||||  | | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37306746 catttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaag 37306693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 283
Target Start/End: Original strand, 13461016 - 13461240
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  13461016 ttgtttctatttaactgtcacttttaatgttgaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattactcttaattatttattgtggagagagaaatatata 13461115  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||| || | ||  ||||||| | |||   | ||||||||| |||||||||||    
T  13461116 aaataagatattaaatgaaaaagattattataataaaaatataaattattgtataacaaaaagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtc 13461215  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  13461216 aaaaagtgacaattaaaaaggaacg 13461240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32440161 - 32439917
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  32440161 ctgttcctttttaagtgtcactttaggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatt 32440062  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| ||||| ||| | |||||| || | ||  |||    
T  32440061 acctttagttatttattgcagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattataataaaagtactaattattgtataagaaaaagt 32439962  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtga 267  Q
    |||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32439961 aacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtga 32439917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 31802765 - 31802958
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31802765 ctttttaagtgtctcttttggagaaaatttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctt 31802863  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||  ||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  31802864 agttatttattgtggagagaaaattatatgaaagaagatattaaattaataaggtcattatgataaaagtataaattattgtatcaaaagtagta 31802958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5144245 - 5144089
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||     
T  5144245 gttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattac 5144146  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5144145 ccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaag 5144089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5843242 - 5842971
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    ||||||||||||||  ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||     
T  5843242 ctgttcctttttaatcgttacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcgttttcaaagttcaatgcaatattaaatgtagttttatcaatatc 5843143  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaat-acaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    | | |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||||||  |||||||||||| | | ||   |||| |||||||||||    
T  5843142 acctttagatatttattgcagagtgagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaagtag 5843044  T
Q  222 taacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||||| | |||   | | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5843043 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattaaaaaggaacggatatagtaat 5842971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 283
Target Start/End: Original strand, 7408345 - 7408561
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  7408345 atttaattgtcactttcaaagttcaaagcaatattaaatattgttttaccaatattactcttacttatttattatggagagaaaaatatatgaaatgaga 7408444  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||   | |||   | | ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  7408445 tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtattaatgtttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaagatg 7408544  T
Q  267 acaattaaaaaggaacg 283  Q
    |||||||||||||||||    
T  7408545 acaattaaaaaggaacg 7408561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1795364 - 1795104
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||     
T  1795364 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgttacaataaatgttgttttaccaacattac 1795265  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    |||||||||||| || || |||||| || | ||  |||||    
T  1795264 ccttatttatttattgcgaagagagaaatatacgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaa 1795165  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    || | |||   | | ||| ||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  1795164 catttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaaggaacgga 1795104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38298019 - 38297878
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaa 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38298019 aatttttttttcctatttaactgtcactttcaaagtt--atgcatcattaaatgttgttttaccaatattatcctttgttatttattgcggagagagaaa 38297922  T
Q  153 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||| | |||||| |||||    
T  38297921 tatatgaaatgatatgttaaattaataaggttattatactaaaa 38297878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 292
Target Start/End: Original strand, 22582508 - 22582710
Alignment:
Q  89 tcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatta 188  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22582508 tcaatgtaacattaaatgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta 22582607  T
Q  189 tagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgt 288  Q
    ||||| || || |  ||||||||||||||||||||  |||  ||   | | ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  22582608 tagtacaagtatagtttattgcatcaaaagtagtataaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatgtga-tattaaaaaggaacggaggt 22582706  T
Q  289 agta 292  Q
    ||||    
T  22582707 agta 22582710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25027971 - 25027842
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  25027971 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 25027872  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25027871 ccttagttatttattgcggagagagaaata 25027842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40209190 - 40208952
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  40209190 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgtggatagag 40209091  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| |      |||||||||||| || || ||||||||| | ||  ||||| | | |||   | | || |||||||    
T  40209090 aaatataggaaatatgatattaaatgact------attatagtaaaagtataaattattgcataagaaaaagtaatatttattgagtgtcttagtttatg 40208997  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  40208996 taaaatgtcaaaaactgacggttaaaaaggaacggaggtaataat 40208952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 42394375 - 42394242
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||     
T  42394375 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttatgaacattac 42394276  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42394275 ccttaggtatttattggggagagagaaatatatg 42394242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18393217 - 18392958
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  18393217 ttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacc 18393118  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||||||||||||||||||     
T  18393117 cttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaa 18393018  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||  ||| | | | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18393017 aagtatttgttgtcttggtttatgtaaaaatctcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacgga 18392958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 26906494 - 26906719
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg-ttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26906494 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttttaccaatatcacccttagttatttattac--agagagaaata 26906591  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |  | ||||| | ||||  | || |||||| |||||||||||||| | | |||   | | ||||||| |||||||    
T  26906592 tatgaaacaagatattaaatgaatgatgttattattggaaaaggataaattattgtatcaaaagtagtaagatttattgaatgttttggtttgtgtaaaa 26906691  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||    
T  26906692 tatcaaaaagtgacaattaaaaaggaac 26906719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 25785879 - 25786146
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  || |  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||     
T  25785879 gttcctttttaattgtcacttctgcagaaatttttagtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttggcattattac 25785978  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||| | || || ||| ||||||||||||||    
T  25785979 ccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataagaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagtagtaa 25786078  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |  |||| | | | ||||||| | |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25786079 aatgcatttggtgtcttggtttgtataaaaaatctaaaagcgacaattaaaaaggaacggatggagta 25786146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 425101 - 425251
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||      
T  425101 gttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctgtttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatttc 425200  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 175  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  425201 tcttagttatttattgcggagagagaaataaatgaaataagatattaaatg 425251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 280
Target Start/End: Original strand, 7466207 - 7466409
Alignment:
Q  78 actttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  7466207 actttcaaacttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaa 7466306  T
Q  178 taagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    |||| ||||||||| |||| || || | |||| || ||||||| ||||| | ||||  | | ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  7466307 taaggtcattatagcaaaagtaaaaataattgtattaaaagtaataacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaa 7466406  T
Q  278 gga 280  Q
    |||    
T  7466407 gga 7466409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31985297 - 31985027
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  31985297 gttcctttttaagtgtctcttgcggagaaattttttgtttatattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaaagttattttaccgatattac 31985198  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||   | | | |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||  || ||||||| | |    
T  31985197 ccttaattatttatcttgaacaaagaaatatataaaacgagacattaaatgaataagactattctagtaaaaatataaattattatattaaaagtaatga 31985098  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    || | |||   | | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||  |||||||||||    
T  31985097 catttattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattagaaagaaacatatgtagtaata 31985027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 38160291 - 38160465
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||      
T  38160291 aaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattatccttaaatatttattacggagagag-- 38160388  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaat-acaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    | ||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| | | || | |||| ||||||||||| ||||||    
T  38160389 acatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagattattatagtaaaattaaaaaataattgtatcaaaagtagcaacaat 38160465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 13703067 - 13703329
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaa--ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13703067 gttcctttttaatcgtcacttttagagaaattttttatttctatttaagactgttgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatatt 13703166  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaat-acaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||||  |||||||||||| | | ||   |||| ||||||| |||    
T  13703167 acctttagatatttattgcggagagagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaaatag 13703265  T
Q  222 taacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||| | | |||   | | ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13703266 taatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 13703329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 292
Target Start/End: Original strand, 3243801 - 3244035
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| |||||||||  ||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3243801 tttgtttctatttaaccatcgttttcaaaaatcaatgcaatattaaatgttgttttatcaaatttgtcctttgttatttattgtggagagaaaaatatat 3243900  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
     |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | || |||||| || |||| |||||||| | ||||  | | ||| ||||||||||||||    
T  3243901 aaaatgagatattaaatgaataaggctattataggaaaaacaaaaattattgtataaaaaatagtaacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatgt 3244000  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  3244001 caaaaaatgacaattaaaaatgaacgtatatagta 3244035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 196
Target Start/End: Original strand, 3892810 - 3892955
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3892810 agaaattttttgttcctatttaactatcacttt-aaagttcaatgcaacgttaaatgttattttaccagtattacccttaaatatttattgcggagagag 3892908  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    ||| ||||  ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3892909 aaacatatataataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 3892955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24469883 - 24469617
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaa-gttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24469883 gttcctttttaagtatc-actttgaagaaattttt-gttcatatttaactgtcactttaaaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacatta 24469786  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || | |||| || | ||  ||||    
T  24469785 tccttaattatttattgcagagaggaaaatttattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaaatataaatcattgtataagaaaaagta 24469686  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | ||    | | ||||||| |||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  24469685 acatttatagtgtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaattgacagtcaaaaaggaacggaggtagta 24469617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12638194 - 12637940
Alignment:
Q  18 tactcctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacca 117  Q
    |||||| |||||||||||| |||   ||||| |||||   ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12638194 tactcccgttcctttttaattgttacttttagagaaaaaatttgttcgtatttaattgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatca 12638095  T
Q  118 atattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaa 217  Q
    | |||| | |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||||    
T  12638094 aaattacctttagatatttattgcagaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaatg-------tcattatagtaaagataaaaacaattgtatcaaaa 12638002  T
Q  218 gtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 279  Q
    ||||||| | | |||   | | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12638001 gtagtaatatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 21150464 - 21150615
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  21150464 gttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattac 21150563  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 176  Q
    ||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  21150564 ccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatga 21150615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7735289 - 7735159
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7735289 tatttaactgtcactgtcaaaattcaatgcaaaattcaatgttgttttaccaacattatccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaa 7735190  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  7735189 atattaaattaataaggctattatagtaaaa 7735159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 21157605 - 21157865
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  | ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  21157605 gttcctttttaattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattac 21157704  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||| ||||| |  | || ||| ||||||||||||||    
T  21157705 ccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggtttttatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaa 21157804  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |   ||| | | | ||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21157805 aatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacgga 21157865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 294
Target Start/End: Original strand, 18000377 - 18000573
Alignment:
Q  91 aatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattata 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||| |||| | |    
T  18000377 aatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaaccttagatatttattgtggagagagaaacatatgtattgaaatattaaattaacaaggtcataaaa 18000476  T
Q  191 gtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
    |||||||||      |||  ||||||||||||||| || ||||  | | ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  18000477 gtaaaaata------attctatcaaaagtagtaac-attattaattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaggtaacaattaaaaaggaacggaggtag 18000569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18676660 - 18676463
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18676660 gttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttttaatta--tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattat 18676563  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||| ||||||||||||||    
T  18676562 ccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataggatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaa 18676463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38308342 - 38308106
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||   ||||||| |||     
T  38308342 tttttgttcctgtttaactatcactttcaaaattcattgtaataataaatgttgttttatcaacattacccttagttatatattgtaaagagagacatac 38308243  T
Q  156 atgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaat 255  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||  | |||||| || ||||  ||||||| | |||   | | ||||||| ||||||||    
T  38308242 atgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataaaaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaat 38308143  T
Q  256 gtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  38308142 gtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacggaggtagta 38308106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8849359 - 8849128
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  8849359 aaattttttgtttctaattaactatcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatatttattgcagagagagaa 8849260  T
Q  152 atatatgaaatgaga--tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||| ||  ||| | | |  || ||| ||    
T  8849259 atgtatgaaatgagaagtattaaatgattaaggttattatagaaaaaagataattttttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcatgatttgtg 8849161  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8849160 taaaaagtcaaaatgagacaattaaaaaggaac 8849128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10889341 - 10889244
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10889341 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 10889244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9959124 - 9958863
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||| |||||   |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9959124 gttcctttttacgtgtcacatttagagaaaatttttgtttctatttaaccgtcgctttcaaagttcaatgcaatatcaaatgttgttttaccaatattat 9959025  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||  |||||||| |  ||||| |||| ||||    || | | ||||  |||||||| |||||||||||| |  || |||||| |||||||||||| |    
T  9959024 ccttacctatttattacaaagagaaaaat-tatg----gaca-aataaacaaataagattattatagtaaaagtgtaaattattgtatcaaaagtagtga 9958931  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | ||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  9958930 catttattgaatgtattgatttgtgtaaattgtcaaaaaatgacaattaaaaatgaacgaaggtagta 9958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17869516 - 17869292
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || | ||||  ||||||||||    
T  17869516 ttgtttctatttaagtgtcattttacatagttaaatggaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-atcgtggagtaagaaatatat 17869418  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttat-gtaaaatg 256  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||||  ||||||||||| |||| | |||  |  | || |||| | | ||||||    
T  17869417 gtaatgagatattaaataaataagattattataataaaaatagaaattattatatcaaaagtagcaacatttattgaccgtcttagtttgtggaaaaatg 17869318  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17869317 tcaaaatgtgacaattaaaaatgaac 17869292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 282
Target Start/End: Original strand, 40927157 - 40927381
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||  ||||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  40927157 ttttgtttctaattaattgtcgttttcaaaattcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattactcttatatatttattgcagagagagcaatata 40927256  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    | ||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||| ||  ||| | | | ||  ||| |||||||      
T  40927257 taaaatgaagtattaaatgattaagattattataggaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttaatttgtgtaaaaaa 40927355  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  40927356 tcaaaacgtgacaattaaaaaggaac 40927381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 30368362 - 30368251
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30368362 gttcctttttaagtgtctcttttaaagaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagatcaatgcaacattaaatgttattttactaatatta 30368263  T
Q  124 tccttagttatt 135  Q
     ||||| |||||    
T  30368262 cccttatttatt 30368251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 4608997 - 4609195
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  | || |||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  4608997 ttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttttaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacc 4609096  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     ||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| | |||| || ||||| |  | || ||||||||||||||||||    
T  4609097 tttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattacaggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaa 4609195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11413776 - 11413578
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  11413776 ttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttttaattaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacatttattacc 11413677  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     ||  |||||||||   ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||| ||||||||||||||    
T  11413676 tttgattatttattatagagagagaagtatgtgaaattagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaa 11413578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Original strand, 4440091 - 4440318
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |  ||||||| ||||||||  ||  || |||||    
T  4440091 ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttatttttcctataatgcccttagtaatttattggagactgaaaaata 4440190  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaat-aagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaa 253  Q
    ||| ||||  |||||||||| | | ||||| |||||||  |||| | || |||||| |||||||||||||| |  ||||   | | ||||||| ||||||    
T  4440191 tataaaatatgatattaaataattaaagat-attataggcaaaacataaattattgtatcaaaagtagtaaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaa 4440289  T
Q  254 atgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  4440290 aagttaaaatatgacaattaaaaaggaac 4440318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25027694 - 25027555
Alignment:
Q  153 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaa 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||| | |||   | | || ||||||||||    
T  25027694 tatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttatgtaa 25027595  T
Q  253 aatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25027594 aatgtcacaaagtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 25027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Original strand, 3686366 - 3686494
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3686366 gttcctttttaagtgtcacttttggagat-ttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatatta 3686464  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
     ||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  3686465 cccttattta-ttattgtggagagagaaata 3686494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13957407 - 13957150
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||        
T  13957407 gttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttccaattaactgtcactctcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataaagc 13957308  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||||| ||||||||  ||||||  | ||||||||||  |||||||||| |  |||   |||||||  |||| | || |||||| |||||||||||| |    
T  13957307 tcttagtaatttattgaagagagaagagtatatgaaatatgatattaaataatcaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtga 13957208  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
     |  ||||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13957207 aatacatttagtgtcttggtttatgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaac 13957150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31546118 - 31546000
Alignment:
Q  153 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaa 252  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||   | | ||||||| |||||    
T  31546118 tatatgaaatgtgttattaattgaatcaggtcattgtagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaa 31546019  T
Q  253 aatgtcaaaatgtgacaat 271  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  31546018 aatgtcaaaaggtgacaat 31546000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 285
Target Start/End: Original strand, 36481077 - 36481307
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |  ||||||| ||||||||| |||||| ||||     
T  36481077 ttttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcttataatgcccttagtaatttattgcagagagataaatt 36481176  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    || |||||   ||||||||| | ||||   |||||||  |||  | || |||||| |||||||||||| | |  ||||   | | ||||||| |||||||    
T  36481177 taagaaatataatattaaataattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttaatgttttggtttgtgtaaaa 36481276  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36481277 agtcaaaatatgataattaaaaaggaacgga 36481307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 277
Target Start/End: Original strand, 3686790 - 3686914
Alignment:
Q  153 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaa 252  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| | |||   | | ||||||||| |||    
T  3686790 tatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgttttggtttatataa 3686889  T
Q  253 aatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  3686890 aacgtcaaaatgtgataattaaaaa 3686914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 281
Target Start/End: Original strand, 6330927 - 6331049
Alignment:
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| | | |||   | | |  ||||||||||||||||    
T  6330927 aaatgagatattacatgaataagattattatagtaaaaatataaattattttatcaaaagtagtaatatttattgattgtctaagtttatgtaaaatgtc 6331026  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    |||| | || |||||||||||||    
T  6331027 aaaaagagataattaaaaaggaa 6331049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10889220 - 10889168
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10889220 ttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 10889168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38297596 - 38297512
Alignment:
Q  201 aacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||   | | ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38297596 aacttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttgttttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 38297512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10734609 - 10734559
Alignment:
Q  121 ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatta 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10734609 ttatccttagttatttattgtggagagagaaatataagaaattagatatta 10734559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30368244 - 30368130
Alignment:
Q  163 gagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaa 262  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||| | |||   | | || |||| |||||||||| ||||    
T  30368244 gagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattatatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaa 30368145  T
Q  263 tgtgacaattaaaaa 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  30368144 tgtaacaattaaaaa 30368130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 10735521 - 10735456
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttac 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  10735521 agaaattttttgttcatatttaaatgtcacttttaaagtttaacgcaacattaaatattattttac 10735456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Original strand, 6330814 - 6330889
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg-ttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga 148  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  6330814 tgtcattttcaaagtttaatataacattaaatgttgtttttatcaatattacccctagttatatattgcggagaga 6330889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17872503 - 17872426
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatt 135  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  17872503 ttgtttctatttaagtgtcactttacatagttaaatggaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt 17872426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 178
Target Start/End: Original strand, 23418602 - 23418671
Alignment:
Q  109 gttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  23418602 gttttaccaatattatggttagttatttattagagatagagaaatatacgaaataaaatattaaatgaat 23418671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7734812 - 7734764
Alignment:
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7734812 tttatgtaaaatttgaaaaaatgacaattaaaaaggaacggatgtagta 7734764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4688849 - 4688810
Alignment:
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4688849 tttatggaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacg 4688810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10734261 - 10734155
Alignment:
Q  170 taaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgaca 269  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || || |||||   ||||||||||||||| | | |   ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  10734261 taaatgaataagactattatagtaaaattataaattattatctcaaaagtagtaacatttacttattatcttggtttaagtaaaatg-caaaaagtgaca 10734163  T
Q  270 attaaaaa 277  Q
    ||||||||    
T  10734162 attaaaaa 10734155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 152
Target Start/End: Original strand, 25683288 - 25683366
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaa 152  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||  ||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||    
T  25683288 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgttttgtcaataatacccttacatatttattgtagagagagaaa 25683366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7834136 - 7834059
Alignment:
Q  201 aacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| |||   ||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7834136 aacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattattttgatttgtgtaaaatatcaaaaggtgacaattaaaaag 7834059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 285
Target Start/End: Original strand, 31803132 - 31803169
Alignment:
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31803132 tgtaaaatatcaaaaggtgacaattaaaaaggaacgga 31803169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43775648 - 43775378
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43775648 ctgttcctttttaactgtctcttttgaagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatatt 43775549  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43775548 atccttagctatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagt 43775449  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43775448 aacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgaaaattaaaaaggaacggaggtagtaa 43775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33491395 - 33491128
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491395 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 33491296  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33491295 ccttaattatttattacggagagtgaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 33491196  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33491195 caatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33491128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 28885668 - 28885934
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885668 gttcatttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 28885767  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28885768 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt-aaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaa 28885866  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  28885867 caataattgactatcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaagagcagatgtagta 28885934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53745537 - 53745271
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53745537 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 53745438  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  53745437 ccttagttatttcttgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 53745339  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53745338 caattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 53745271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47070112 - 47069846
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47070112 ttcctttttaagtgtcactttcgtagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtc 47070013  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  47070012 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaaattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatc 47069913  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47069912 aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 47069846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 54898344 - 54898086
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54898344 ctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 54898245  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  54898244 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagt 54898145  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    | ||||  ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54898144 atcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 54898086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 54106254 - 54106522
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54106254 ttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 54106353  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |    
T  54106354 cttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtaatatc 54106453  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||  ||   | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54106454 aattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 54106522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3376566 - 3376304
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3376566 ctgttcctttttaagtgtctcttttaaagataatatttgtttctatttaactgtcagtttcaaagtccaatgcaacattaaatgttattttaccaatatt 3376467  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagag----aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  3376466 atccttagttatttattgcggagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattacataaaaaa 3376367  T
Q  219 tagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    ||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3376366 tagtaacaatcattgattatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacagataaaaaggaa 3376304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Original strand, 19550236 - 19550495
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| |||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  19550236 gttcctttttaaatgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttatcaatattgt 19550335  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||     
T  19550336 tcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatat 19550435  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
    ||||  ||   | | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19550436 caattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 19550495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 43554380 - 43554646
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43554380 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 43554479  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |     
T  43554480 ccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtatgat 43554578  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43554579 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 43554646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 17102744 - 17102996
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17102744 gttcttttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattat 17102843  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17102844 ccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataaattattgcatcaaaagtagtaa 17102943  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    |||| ||||  | | ||  ||| |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17102944 caattattaattgttttaatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaa 17102996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27484042 - 27483777
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27484042 gttcctttttaagtgttactttttaagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 27483943  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27483942 ccttagttatttattgcgga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtat 27483845  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | |  || ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  27483844 caattgttgattgtcctgatttgtataaaatgttaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 27483777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 51244612 - 51244874
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51244612 ctgttcctttttaaatgtcacttttgaagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatatt 51244711  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  51244712 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattataataaaaatatggcttattgcatcaaaactagt 51244811  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    | ||||  ||   | | ||||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  51244812 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatattacaagtaaaaagaaacgga 51244874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 790540 - 790800
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  790540 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttatgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 790639  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  790640 ccttagttatttattgcggagagagaattatatgaactgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 790739  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  790740 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgatcattaaaaaggaacgga 790800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34266696 - 34266427
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34266696 ctgttcttctttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatatt 34266597  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
     ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34266596 gtccttagttatttattgc--tgcgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagt 34266499  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    | ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34266498 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaaggaacggaggtagtaat 34266427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Original strand, 7328445 - 7328640
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7328445 gttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattat 7328544  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  7328545 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataatgaaagtataacttattgcatcaaaagta 7328640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 32980630 - 32980897
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||     
T  32980630 gttcttttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaataatgttttatcaatattac 32980729  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  32980730 ccttagttatttattgtagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcagtataataaaagtataacttattgcatcaaaagtattaa 32980829  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| |||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32980830 caattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagatgtagta 32980897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45101582 - 45101347
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45101582 ttttgttcctatttaactgtcactttgaaagttccatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 45101483  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||| | ||    ||   | | ||||||| |||||||||    
T  45101482 tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataggaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcagctgttgattgtcttggtttgtgtaaaatg 45101383  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45101382 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 45101347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39867104 - 39866852
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39867104 gttcctttttaagtgtctcttttggagaattttttt-ttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattat 39867006  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||    
T  39867005 tcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaa 39866906  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    |||| |||   | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39866905 caattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 39866852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 52627494 - 52627234
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaa-gttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52627494 gttcctttttaagtgtcacttttggagaagttttttgtttctatttaattgtcacttttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattg 52627395  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  52627394 tccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaata 52627296  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     ||||| |||  ||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52627295 tcaatcgttaattatcttggtatgaggaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 52627234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 52663432 - 52663692
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  52663432 gttcatttttaagtgtcagttttggagaaattttttgttactatttaattgtcattttcaaagttcaaagcaatattaaacgttgttttaccaatattgt 52663531  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||     
T  52663532 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagcaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 52663631  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||| |||   | | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52663632 caattattgattgtcttggtttgtgtgaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaacgga 52663692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13158662 - 13158423
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13158662 ttgtttctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatccttagttatttattgcggagagagaaatataa 13158563  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||||||||||||||    
T  13158562 gaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgt 13158463  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13158462 caaaatataacaattaaaaaggaacggaggtagtaataat 13158423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 35315126 - 35315382
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35315126 ctttttaagtgtctttttttaagaatttttttttttctatttaattgtcattttcaaagttcaatacaaccttaaatgttgttttaccaatattatcttt 35315225  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35315226 agttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 35315325  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
      ||   | | ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35315326 tgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 35315382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45513871 - 45513673
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| |||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  45513871 gttcttttttaagtgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattgt 45513772  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  45513771 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 45513673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 294
Target Start/End: Original strand, 45145144 - 45145387
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45145144 agaaaatttttattcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta-ttatttattgcggaaagag 45145242  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||   | | ||||||| ||    
T  45145243 atatatatgaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcagcaaaagtaataataattattgattgtcttggtttgtg 45145342  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45145343 taaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaaaggaggtagtaat 45145387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 36234357 - 36234623
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||||||||  || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36234357 gttcctttgtaagtgtcacttatgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattat 36234456  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||   ||||     
T  36234457 ccttagttattttttgcggagagagaaatatatgaaataggatattaaatgaataagatcattacagtaaaagtatagcttattgtatcaaa---agtat 36234553  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    || |  ||   | | ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36234554 cactttttgattgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 36234623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 286
Target Start/End: Original strand, 46973410 - 46973674
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtcta---ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 121  Q
    ||||||||||||||||||    ||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46973410 gttcctttttaagtgtcttcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacatcaaatgttattttaccaatat 46973509  T
Q  122 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  46973510 tatccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtag 46973609  T
Q  222 taacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggat 286  Q
    || ||||  ||   |   ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  46973610 tatcaattgttgattgctttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaagaaacggat 46973674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 282
Target Start/End: Original strand, 27992286 - 27992487
Alignment:
Q  81 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27992286 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgccgagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataa 27992385  T
Q  181 gatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 280  Q
    | |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  ||   | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27992386 ggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtattgggttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 27992485  T
Q  281 ac 282  Q
    ||    
T  27992486 ac 27992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Original strand, 29651667 - 29651925
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29651667 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttttatttaactgt----ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatcctta 29651762  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||      
T  29651763 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaact 29651862  T
Q  230 attagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||   | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29651863 gttgattgttttggtttgtgtaaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 29651925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 29697985 - 29698241
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29697985 ctttttaagtgtcattttttgagaaagtttttgttcctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattgtcctt 29698084  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata-agatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||    
T  29698085 agttatttattgcggagagagaaatatatg-aatgagatattaaatgaatagaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaa 29698183  T
Q  228 tcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |  ||   | | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29698184 ttgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 29698241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 47104411 - 47104151
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47104411 gttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 47104312  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||   |||  ||||||| ||||||    
T  47104311 cattagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtaaaatcaattatatcaaaaatagtaa 47104212  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    || | |||   | | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47104211 catttattgattgttttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtggcaattaaaaaggaacgga 47104151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42672145 - 42671879
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    |||||||||||| |||  ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  42672145 ttcctttttaagcgtcatttttggagaaaatttttgttcctattcaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattgtc 42672046  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |    
T  42672045 cttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtaatatc 42671946  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||  ||   | | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42671945 aattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 42671879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 50091935 - 50092208
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  50091935 gttcctttttaagtgttatttttggagaaactttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatatttt 50092034  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || |||||| || | ||  | |||    
T  50092035 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataa 50092134  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataata 298  Q
    || | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50092135 catttatttagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacagttaaaaaggaacggaggtagtaataata 50092208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3643448 - 3643185
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaatttttt-gttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcct 127  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  3643448 ctttttaattgtcacttttagagaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac-ttaaatgttgttttatcaatattaccct 3643350  T
Q  128 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||     
T  3643349 tagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacat 3643250  T
Q  228 tcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |  ||   | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  3643249 ttcttgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacacttaaaaaggaatggaggtagta 3643185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33874802 - 33874535
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  33874802 gttcctttttatctgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattac 33874703  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa-atacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||  || |||  |||| |||||||||||||    
T  33874702 ccttagatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaaggtaaaac-aattgtatcaaaagtagta 33874604  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | |||   | | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33874603 acatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33874535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51697786 - 51697571
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51697786 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttacgaatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatg 51697687  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaa-tacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||    
T  51697686 aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 51697587  T
Q  258 caaaatgtgacaatta 273  Q
    |||||| |||||||||    
T  51697586 caaaatatgacaatta 51697571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Original strand, 24981286 - 24981544
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24981286 ttcctttttaagtgtc-actttgaagaaattttttgttcaaa----actatcactttcaaagttcgatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtc 24981380  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |    
T  24981381 tttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatc 24981480  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgta 289  Q
    |||  ||   ||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24981481 aattgttgattatcttagtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggatgta 24981544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 51219315 - 51219082
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51219315 agaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 51219216  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa---tcattagctatattggttt 246  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |  ||   | | |||||||    
T  51219215 aaatatatgaa------------atgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgttgattgtcttggttt 51219128  T
Q  247 atgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51219127 gtgtaaaatgtcaatatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 51219082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40140083 - 40139831
Alignment:
Q  27 tcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcc 126  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  40140083 tcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttt-----ttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattaccc 40139989  T
Q  127 ttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaaca 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40139988 ttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaaca 40139889  T
Q  227 atcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || |||   | | ||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40139888 attattgattgtcttggtttgtgt--------aaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 40139831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 41425619 - 41425886
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  41425619 gttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatatta 41425718  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  41425719 cccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagca 41425817  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | |||   | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41425818 acatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 41425886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 13168006 - 13168197
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168006 gttcctttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 13168105  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  13168106 tccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattgcatcaa 13168197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27039864 - 27039595
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27039864 ctgttcctttttaagtgtcactttaggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatt 27039765  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||||| || | ||  |||    
T  27039764 acccttgattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagt 27039665  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||    
T  27039664 aacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaacagaggtagta 27039595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40319184 - 40318917
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  40319184 gttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatatta 40319085  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  40319084 cccttatttatt-attgtggagagagaaatatatctaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagca 40318986  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | |||   ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40318985 acatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 40318917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 285
Target Start/End: Original strand, 41168785 - 41169008
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41168785 ttgttcctatttaactgtcattttcaaacttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatg 41168884  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaa---agtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||      || | ||||||||||||||   ||||||| ||||  ||   | | ||||||| ||||||||    
T  41168885 aaatgagatattaaatgaataaggtcattatag------tatagcttattgcatcaaaagtagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaat 41168978  T
Q  256 gtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41168979 gtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacgga 41169008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 294
Target Start/End: Original strand, 41926701 - 41926939
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata-tat 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||    
T  41926701 ttgttcctatttaactatcactttcaaagtttcatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcgttagttatttattgcggagataaaaaaaatat 41926800  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta---acaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||| |||   | | ||||||| |||||||    
T  41926801 gaaatgagatgttaaatgaataagatcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaa 41926900  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41926901 tgtaaaaa-gtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 41926939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 296
Target Start/End: Original strand, 49123556 - 49123783
Alignment:
Q  68 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 167  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49123556 tttaagtgtcactttcaaagatcaatgcaacattaaatattgttttactaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 49123655  T
Q  168 attaaatgaataagatcattatagtaaaa--atacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgt 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   || |  ||||||||||||| |||||| ||   |||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49123656 attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtgtatagtttattgcatcaaatgtagtatca---attgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgt 49123752  T
Q  266 gacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49123753 gactattaaaaaggaacggaggtagtaataa 49123783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Original strand, 20105182 - 20105338
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20105182 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 20105281  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20105282 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataag 20105338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20848975 - 20848713
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20848975 gttcctttataattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattac 20848876  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     ||||| |     ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||   |||| ||||||||||||||    
T  20848875 tcttagat-----ttgcggaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaa 20848781  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20848780 catttattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 20848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 51064873 - 51065128
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  51064873 gttcctttttaattgtcatttttggagaatttttttgttcctgattaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttattataccaatattat 51064972  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||   |||| ||||||||||||||    
T  51064973 ccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaa 51065072  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 280  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  51065073 catttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgataattaaaaagga 51065128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 54911527 - 54911305
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  54911527 ttttttgtttatatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttatcaatattacctttaattatttattgtggagtgagaaata 54911428  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||   | | ||  | |||||||||    
T  54911427 tatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtctt-atatatgtaaaa 54911329  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  54911328 ttttaaaatgtgacaattaaaaag 54911305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33074532 - 33074276
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  33074532 ttccattttaagtgtctcttttaaagaa-ttttttattcctatttaagtatcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattac 33074434  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |     
T  33074433 tcttatttatt-attgcggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcag 33074335  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    || | |||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33074334 catttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaaataaaaaggaacg 33074276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 11473392 - 11473649
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  11473392 gttcctttttaaatgtcacttttggagaaattttttgttcctgtttaactttcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 11473491  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || |||||| || | ||  |||||    
T  11473492 ccttagttatttattgcggaaagagaagtatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaa 11473591  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    || | |||   | | || |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11473592 catttattgaatgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacaattaaaaaggaac 11473649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 292
Target Start/End: Original strand, 43945443 - 43945636
Alignment:
Q  99 attaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaat 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  43945443 attaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattacagtaaaagt 43945542  T
Q  199 acaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | |  |||||||||||||| ||||| ||||  ||   | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43945543 atagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaactaaaaaggaacggaggtagta 43945636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 45055177 - 45055437
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaatttttt-gttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45055177 gttcatttttaagtgtctattttgaagaattttttttgttccaatttaac-gtcactttcaaagtttaatgcatcattaaatgttgttttactaatatta 45055275  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |    
T  45055276 tcttttattatttattgcggagagagaaatataagaaatgagatgttaaattaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtaaaa 45055375  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    | ||| |||   | | ||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||    
T  45055376 ataattattgattgtcttgatttatgtaaaatattaaaaattgacaattaaaaaagaacgga 45055437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41351451 - 41351183
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttca-aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41351451 gttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttttgaagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatatta 41351352  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    || ||  |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||  |||||||||||||    
T  41351351 tctttgttcgtttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattatatcaaaagtagta 41351252  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | |||   | | ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41351251 acattaattgaatgtcttgatttatgtaaaatatcagaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 41351183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 48151975 - 48152235
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48151975 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattac 48152074  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||| |||    
T  48152075 ccttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtaataa 48152174  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     | | |||   | ||||| ||| |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  48152175 tatttattgattgtattgatttgtgtaaaatataaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 48152235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 290
Target Start/End: Original strand, 52175743 - 52175974
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52175743 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttgaatatttattgcggagagaaaaacatat 52175842  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||| || ||   |||| |||||||||| |||| ||  |||  | | ||||||| ||||||||||    
T  52175843 gaaatgaaatattaaattaataaagtcattacagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataac-attgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgt 52175941  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52175942 caaaatgtcataattaaaaaggaacggatgtag 52175974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40010920 - 40010653
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||| ||||||||||  ||| | |||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  40010920 gttcctatttaagtgtcactttaagagaaaaattttgttcatatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccgacattac 40010821  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| | |||||| || | ||  |||||    
T  40010820 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaa 40010721  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40010720 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtaacacttaaaaaggaacggaggtagta 40010653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24276 - 24064
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24276 ttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttgctaatttattttggagaaagaaatatatgaaatgaaata 24177  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| | | ||||  | | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24176 ttaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 24077  T
Q  269 aattaaaaaggaa 281  Q
    | |||||||||||    
T  24076 acttaaaaaggaa 24064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27028240 - 27028004
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27028240 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttggttatttattgcggagagagaaatat 27028141  T
Q  156 atgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaat 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | || ||| || | ||  ||||||| | |||   | ||||||| | ||||||||    
T  27028140 atgaaataagatattaaatgaataagactattataataaaagtactaatttttgtataagaaaaagtaacatttatttaatgtattggtatgtgtaaaat 27028041  T
Q  256 gtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  27028040 gtcaaaaaatgacggttaaaaaggaacggaggtagta 27028004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30861798 - 30861614
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  30861798 gttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattatcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 30861699  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| || || ||||||    
T  30861698 ccttagctatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattg 30861614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42515428 - 42515163
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  42515428 gttcctctttaattgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacaattattac 42515329  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | |||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||| || ||   |||| ||||||| ||||||    
T  42515328 ctttagatatctattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggcgattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaa 42515229  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |  | |||   | | ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42515228 c--ttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagttacaattaaaaaggaacggatgtagta 42515163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 284
Target Start/End: Original strand, 6902293 - 6902527
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  6902293 agaaaatttttgtttctatttaactgtcccttttaaagttcaatttaacattaaattttgttttatcaatattgttcttagttatttattacagagagag 6902392  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||  ||     | ||||||| ||    
T  6902393 aaatatatgaaatgaaatattaaataaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaatgtagtatcaattgttgatggtcttggtttgtg 6902492  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6902493 taaaatatcaaaatgtgacagttaaaaagaaacgg 6902527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32854179 - 32854033
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32854179 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttatcaacattacccttagttatttattgcggagagag 32854080  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  32854079 aaatatatgaaataaaatattaaatgactaaggttattatagtaaaa 32854033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25983868 - 25983662
Alignment:
Q  75 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  25983868 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatataaaatgagaagttaaat 25983769  T
Q  175 gaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 274  Q
    ||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||  |    ||| ||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  25983768 gaacaaagtcattatagtaaaagtataacttatt-catcaaaaatagtaacaattgtagattatcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaactgacaattaa 25983670  T
Q  275 aaaggaac 282  Q
    ||| ||||    
T  25983669 aaaagaac 25983662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 48214057 - 48214317
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48214057 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattac 48214156  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||            |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||    
T  48214157 ccttagttatttattgtggagagagaaat------------atataaaatgaataagactattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaa 48214244  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
     | | |||   | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48214245 tatttattgattgtattggtgtgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagatgtagtattaat 48214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5244193 - 5243924
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  |||   | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  5244193 ctgttcctttttacgtgtcactttcggataaaatttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatt 5244094  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || | |||| || | ||  |||    
T  5244093 acccttagttatttattgcagagagagaaatatatggaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaatgattgtataagaaaaagt 5243994  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||| | |||   | |  || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  5243993 aacatttattgagtgtcctgatttatgtaaaatgtcaaaa-atgacagttaaaaaggaacagaggtagtaa 5243924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 35077377 - 35077634
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | |    
T  35077377 gttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgt 35077476  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| | || ||||||||||||||||||| |    
T  35077477 ccttagtaatttattgcagagagagaaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagtga 35077576  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
     |  ||||   | | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35077577 aatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaaggaac 35077634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 54334437 - 54334181
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  54334437 ttcctttttaagtgtc-attttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacc 54334339  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||   |||||| ||||| || || |||||| || | ||  ||||||    
T  54334338 cttatttatttatcgcggagagaaaaatatatgacataagatattaaataactaaggctattataataaaagtataaattattgtataagaaaaagtaac 54334239  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    | | |||   | | |||||||  || ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  54334238 atttattgagtgtcttggtttgagttaaatgtcaaaaagtgatagttaaaaaggaacg 54334181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 53281969 - 53282143
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||| |||  ||||  ||||||| |||| |||||||| | | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  53281969 gttcctttttaagggtcacttttggagaaattctttgctcctatttgagtatcactttcaaggttcaatgcagcaataaatgttgttttaccaacattac 53282068  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaata 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  53282069 ccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaaata 53282143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44544425 - 44544296
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44544425 gttcctttttaagtgtctcttttgaaaaaaaaaattgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattat 44544326  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544325 ccttagttatttattgcggagagagaaata 44544296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 55141725 - 55141561
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| | ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55141725 ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaactc---ctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctt 55141629  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    ||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  55141628 agttatttattgttgaaagataaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaa 55141561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 49168354 - 49168614
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||     
T  49168354 gttcttttttaagtatcatttttggagaaattttctgtttctatttaattgtcaattttaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattac 49168453  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||| || | ||  |||||    
T  49168454 tcttagttatttattgaggagagaaaaatatttgaaataatatattaaatgactaagattattataataaaaatataaattattgtattagaaaaagtaa 49168553  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    || | ||||  ||| ||||||| | |||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||    
T  49168554 catttattaagtatcttggtttgtttaaaatgtcaaaaaatgatagttaaaaatgaacgga 49168614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 290
Target Start/End: Original strand, 52173771 - 52174000
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  52173771 ttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcagagagaaaaacatatg 52173870  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||||| ||||||||  |||||| |||||  ||||||| || ||   |||  |||||||||| |||| || ||||  | | ||||||| ||| |||| ||    
T  52173871 aaatgaaatattaaactaataaggtcattgcagtaaaagtaaaaacaattatatcaaaagtaataac-attattaattgtcttggtttgtgt-aaatatc 52173968  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52173969 aaaaagtgacaattaaaaaggaacggatgtag 52174000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Original strand, 23771277 - 23771476
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  | ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  23771277 gttcctttttaattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttacctttattac 23771376  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| | || || ||| ||||||||||||||    
T  23771377 ccttgattatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa 23771476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 292
Target Start/End: Original strand, 29803727 - 29803905
Alignment:
Q  102 aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaataca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  29803727 aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaat------------atattaaatgaataagatcattatagtaaaagtata 29803814  T
Q  202 acttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||  ||   | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29803815 acttattgcatcaataatagtatcaattgttgattgtcttggttcgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 29803905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 28226417 - 28226673
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |      
T  28226417 gttcctttataactgtcgcttttacataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgc 28226516  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| | || |||||| |||||||| ||| |    
T  28226517 ccttagtaatttattgc--agagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagcagtga 28226614  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |         ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28226615 aa---------taacttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgaagta 28226673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36371086 - 36370883
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaatttttt--gttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  36371086 gttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaatattaaatgttactttactaatat 36370987  T
Q  122 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    || ||||| ||||| | || ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  36370986 tacccttatttatt-actgtggagagaaaaatatatgttatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtag 36370888  T
Q  222 taaca 226  Q
     ||||    
T  36370887 caaca 36370883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 279
Target Start/End: Original strand, 26748387 - 26748596
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  26748387 ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagta 26748486  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||| | |||| | ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||| || |||| | | | ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26748487 ttaaattattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa-aagcatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaatgtgac 26748585  T
Q  269 aattaaaaagg 279  Q
    |||||||||||    
T  26748586 aattaaaaagg 26748596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29458342 - 29458202
Alignment:
Q  142 ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatatt 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| | |||   | | ||    
T  29458342 ggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtctt 29458243  T
Q  242 ggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29458242 ggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaatgaac 29458202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42671635 - 42671473
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42671635 ttgttcttatttaagtgtcactttacatcattcaatgcaacattaaatgttaatttattaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatat 42671537  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    | ||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||    
T  42671536 gtaatgagatattaaataaataaagttattatagtacaaatataaattattgtatcaaaagtag 42671473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28943704 - 28943606
Alignment:
Q  111 tttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| || || ||||||    
T  28943704 tttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattg 28943606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44092287 - 44092181
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44092287 ctgttcctttttaattgtcacttttagagaagaattttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 44092188  T
Q  123 atcctta 129  Q
    |||||||    
T  44092187 atcctta 44092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Original strand, 2642727 - 2642964
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||         |     
T  2642727 aaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattg--------tag 2642818  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt- 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||| | ||||| |  | || ||| |||||||||||||| ||  ||| | | | ||||||| |||     
T  2642819 atatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattattggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgta 2642918  T
Q  251 aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2642919 aaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacggagggagtaataat 2642964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32853542 - 32853360
Alignment:
Q  97 acattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  32853542 acattaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcagagagagaa--acatgaaatgaaatattaaattaataaggtcgttatagtaaaa 32853445  T
Q  197 atacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
     || ||   |||| |||||||||||||||| | |||   | | || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32853444 gtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagttacaattaaaaaggaa 32853360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47844094 - 47843842
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||     
T  47844094 gttcctttataactgtcacttttacataaattttttatttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttttcctataatac 47843995  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||     |||||||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| |||| |||||| |||||| ||||| |    
T  47843994 cgttagtaatttattgcagagaga-----atatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacacaagttattgtatcaaatgtagtga 47843900  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
     |  ||||   | | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47843899 aatacatttagtgtcttgatttatgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 47843842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 281
Target Start/End: Original strand, 34750677 - 34750900
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| | ||| || |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  34750677 ttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttgcctatattacccttatatatttattgcagagagagaaatata 34750776  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    ||||||||   ||||||| | |||| | ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||| ||  ||| | | | ||| ||| ||||||| |    
T  34750777 tgaaatgaagcattaaataattaaggttattataggaaaaagataatttgttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttgatttgtgtaaaaag 34750875  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  34750876 acaaaatgagacaattaaaaaggaa 34750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22174096 - 22173925
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  22174096 gttcatttttaagtgtcttttttggataaattttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattat 22173997  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    | ||| |||||||||  ||| |||||||| || ||| |  |  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22173996 ctttacttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaa 22173925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43159975 - 43159860
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||| |||| |||| |     
T  43159975 tatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgatttatcaatattacccttaaatatttattgcagagagaaaaacatataaaataaa 43159876  T
Q  166 atattaaatgaataag 181  Q
    ||||||||| ||||||    
T  43159875 atattaaattaataag 43159860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22100075 - 22099909
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  22100075 tttttaagtatctcttttggagaaaatttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatcctta 22099976  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
     |||||||||  ||| |||||||| || ||| |  |  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22099975 cttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaa 22099909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35458716 - 35458493
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||    ||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||  ||||    
T  35458716 ttaactgtcactttcaaagttcaatgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatatgaaatatgata 35458617  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt-aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtga 267  Q
    |||||| | ||||   |||||||  |||| | || |||||| |||||||||||| ||  |  ||||| | | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35458616 ttaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacaattag-tgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatgtga 35458518  T
Q  268 caattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||    
T  35458517 caattaaaaagaaacggaggtagta 35458493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2154261 - 2154184
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttattt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||    
T  2154261 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtcttatcaatattactcttagatattt 2154184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8237089 - 8236894
Alignment:
Q  84 aaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||    |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  8237089 aaagttcaatgtaacattaaatattgtttttaccaatgttcccctta----tttattaccgagagaaaaatatatgaaattagatattaaatgaacaagg 8236994  T
Q  183 tcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    | |||||||||||| || || |||||  | |||||||||| ||| | ||   || | ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8236993 ttattatagtaaaagtataaattattataacaaaagtagttacatttatggacttttttgatttatataaaatgtcaaaatgtgtcagttaaaaaggaac 8236894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Original strand, 24569570 - 24569800
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||| |   |||| | ||||||||| |||| | |||||    
T  24569570 ttttttgtttctaattaattgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttatttttcctataatgctcttaataatttattgcagagacaaaaata 24569669  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt-aacaatcattagcta-tat-tggtttatgta 251  Q
    ||||||||  |||||||||| | |||||  |||||||  |||| | ||||||||| |||||||||| | ||  ||  |||  || ||| |||||||||||    
T  24569670 tatgaaatatgatattaaataattaagaatattataggcaaaacataacttattgtatcaaaagtaatgaaatatatttatttagtatctggtttatgta 24569769  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24569770 aaaagtcaaaatgtaacaattaaaaatgaac 24569800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 53290987 - 53290757
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |  ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  53290987 ttttttgtttttaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttattttttctataatgcccttaataatttattgcagagagagaaata 53290888  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    || |||||  |||||||||| | ||||   |||||||   ||  | || |||||| |||||||||||| | |  ||||   | |  |||||| |||||||    
T  53290887 taagaaatatgatattaaataattaaggatattatagacgaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcatggtttgtgtaaaa 53290788  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53290787 aatcaaaatatgacaattaaaaaggaacgga 53290757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44544155 - 44544080
Alignment:
Q  153 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44544155 tatatgaaatgagatattaaatgaaaaaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtattaacaat 44544080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Original strand, 29803625 - 29803708
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 108  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29803625 gttcatttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcatatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 29803708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29458974 - 29458865
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgtt--cctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  29458974 ctttttaagtgtctcttttgaagatttttttttttttcctatttaagtgtcactctacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacc 29458875  T
Q  126 cttagttatt 135  Q
    |||| |||||    
T  29458874 cttatttatt 29458865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 40113459 - 40113415
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40113459 ttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttt 40113415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 106
Target Start/End: Original strand, 1201083 - 1201134
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatg 106  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1201083 ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatg 1201134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 291
Target Start/End: Original strand, 13168210 - 13168261
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 291  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168210 ttggtttgtataaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 13168261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31610334 - 31610216
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||   ||||||||||||    
T  31610334 ttttttctttctatttaagtgtcattttcaaagtttaatacaatattaaatgttattttaccaatatactcatg-gttatttattatagagagagaaata 31610236  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaat 174  Q
    |||||||  | |||||||||    
T  31610235 tatgaaacaatatattaaat 31610216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2858610 - 2858566
Alignment:
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2858610 tgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 2858566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 154
Target Start/End: Original strand, 18355927 - 18356007
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  18355927 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgatttatcaataatacccttacttatttattgtagagagagaaata 18356007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42634562 - 42634431
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta---gttatttattgcggagagagaaatatatgaaat 162  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||    |||||||||  |  |||||||||||||||| |    
T  42634562 tatttaactgtcacttttgaagttcagtgcaatattaaatattgttttataaatattatcgttacttcttatttattatg--gagagaaatatatgaagt 42634465  T
Q  163 gagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
     ||  ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  42634464 tagtgattaaataaataaggttattatagtaaaa 42634431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45513351 - 45513307
Alignment:
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45513351 tgtaaaatatcaaaatatgacaattaaaaaggaacggatgtagta 45513307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3035636 - 3035581
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 113  Q
    |||||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3035636 tttgtttctatttatttgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttt 3035581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 53055339 - 53055393
Alignment:
Q  143 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaa 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||    
T  53055339 gagagataaatatatgaaatgagatattaaatgataaaggttattatagaaaaaa 53055393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 292
Target Start/End: Original strand, 7329032 - 7329081
Alignment:
Q  243 gtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  7329032 gtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagaaatggaggtagta 7329081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 292
Target Start/End: Original strand, 20105397 - 20105430
Alignment:
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20105397 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 20105430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22173791 - 22173734
Alignment:
Q  238 tattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  22173791 tattggtttatgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaaaaggaacagagatagtaata 22173734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31610123 - 31610071
Alignment:
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  31610123 tttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattataaaagaacgga-gtagtaataat 31610071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44543772 - 44543727
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  44543772 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaagtaacgga 44543727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 123)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21651996 - 21651736
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651996 gttcctttttaagtgtcttttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgccacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 21651897  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21651896 ccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaagttattgcatcaaaagtagtaa 21651797  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21651796 cgatcattggctatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacgga 21651736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 36058223 - 36058492
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36058223 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttac-aatattat 36058321  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36058322 ccttagttatttattgctgagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaa 36058421  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36058422 caatcattgactattttaatttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaggaacggagatagtaata 36058492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Original strand, 10180361 - 10180628
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10180361 ttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaacgttattttaccaatattatc 10180460  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10180461 tttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaac 10180560  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10180561 aatcattgactatcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggatgtagtaa 10180628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 18291454 - 18291720
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18291454 gttcctttttaagtgtctcctttgaagaaattttttgttgctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttacca-tattat 18291552  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18291553 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 18291652  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18291653 caatcattgactatcttgatttttgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 18291720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12342860 - 12342607
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12342860 ctttttaactctctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcttt 12342761  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12342760 aactatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 12342661  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12342660 cattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaac 12342607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33935310 - 33935043
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33935310 gttcctttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 33935211  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  33935210 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtat 33935111  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| |||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33935110 caattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 33935043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 14263534 - 14263794
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263534 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 14263633  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  14263634 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatat 14263733  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14263734 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacgga 14263794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38483010 - 38482775
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38483010 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 38482911  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| ||||||||     
T  38482910 tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaata 38482811  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38482810 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38482775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Original strand, 26062698 - 26062963
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26062698 gttcctttttaagtgtcatttttagaaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaa-tgttgttttaccaatattgt 26062796  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  26062797 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtat 26062896  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 291  Q
    ||||  ||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26062897 caattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagt 26062963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27518957 - 27518711
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||      ||||    
T  27518957 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttta------ttat 27518864  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27518863 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaagtcattatagtaacagtacaacttattgcataaaaagtagtaa 27518764  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27518763 caatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaactattaaaaa 27518711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 293
Target Start/End: Original strand, 34981823 - 34982087
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34981823 ctttttaagtgtcgcttttggagaaattttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt 34981922  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||    
T  34981923 agttatttattgcggagagagaaatacatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtattaat 34982022  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
      ||   | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34982023 tgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 34982087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 23429899 - 23430166
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23429899 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 23429998  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  23429999 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 23430098  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  23430099 caattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacgattaaaaaggaatggaggtagta 23430166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Original strand, 33314533 - 33314790
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctatttta-aagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  33314533 gttcctttttaagtgtttctttttgaagaaattttttgtttccatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtatga 33314632  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  33314633 tccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaggacaacttattgcataaaaaatagta 33314732  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33314733 acaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaggaa 33314790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Original strand, 34046841 - 34047100
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34046841 gttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgt 34046940  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||     
T  34046941 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaaatagtat 34047040  T
Q  225 caatcattagcta-tattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
    ||||  || | || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34047041 caattgtt-gatattcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggtacgg 34047100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Original strand, 9954639 - 9954895
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9954639 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaatttagttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 9954738  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  9954739 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatat 9954838  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    ||||  ||   | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9954839 caattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatatgacaattaaaaaggaa 9954895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23848806 - 23848538
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23848806 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 23848707  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  23848706 ccttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtat 23848607  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||| |||   | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23848606 caattattgattgtcttggtttgtgtcaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 23848538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 15596334 - 15596601
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||     
T  15596334 gttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaaaattaaatgatgttttatcaatattac 15596433  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  15596434 ctttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaataa 15596533  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| |||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15596534 caattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 15596601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39303766 - 39303498
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39303766 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 39303667  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  39303666 ctttagttttttattgcggagagagaaatatatgatataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 39303567  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac-aattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39303566 caattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaaattaaaaaggaacggaggtagta 39303498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 293
Target Start/End: Original strand, 35052076 - 35052311
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35052076 tttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttatttatttattgtggagagagaaatatat 35052175  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||    
T  35052176 gaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 35052275  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35052276 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 35052311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 282
Target Start/End: Original strand, 4057310 - 4057535
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4057310 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatata 4057409  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||| ||||  |||  | | ||||||| |||||||||    
T  4057410 tgaaatgagatattaaattaataagatcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatg 4057509  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4057510 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 4057535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25703827 - 25703561
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  25703827 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttattttaccaatattgt 25703728  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||     
T  25703727 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtat 25703629  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||  ||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25703628 taattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 25703561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25812998 - 25812732
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  25812998 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgttttaccaatattgt 25812899  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||     
T  25812898 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtat 25812800  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||  ||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25812799 taattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 25812732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43642209 - 43641975
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43642209 ttttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggggagagaaata 43642110  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||   | | || |||| |||||||    
T  43642109 tatgaaattagatgttaaaagaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaa 43642010  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgta 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43642009 tgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagatgta 43641975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 281
Target Start/End: Original strand, 40228318 - 40228541
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40228318 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgtggagagagaaatatat 40228417  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||   | | ||||||| ||||||| ||    
T  40228418 gaaatgacatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaacgt 40228517  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40228518 caaaatgtgacaattaaaaaggaa 40228541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2456321 - 2456096
Alignment:
Q  64 cctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||  ||||||| ||||     
T  2456321 cctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttaatta---attgcggagaga--aatatataaaata 2456227  T
Q  164 agatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaat 263  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2456226 aaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaat 2456127  T
Q  264 gtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  2456126 gtgacgattaaaaagaatcggaggtagtaat 2456096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14228541 - 14228305
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14228541 ttttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt-gttatttattgcggagagagaaata 14228443  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| |||||||    
T  14228442 tatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatgacatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaa 14228343  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14228342 tgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 14228305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Original strand, 1245336 - 1245572
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  1245336 ttgttcttatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgtggagtgaaaaatatatg 1245435  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||   | | ||| |||||||||||||||    
T  1245436 aaatgagaatttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgaatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtc 1245535  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1245536 aaaaagtgacaattaaaaaggaacggatgtaataata 1245572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 18842520 - 18842790
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||     
T  18842520 gttcctttttaagtgtcacttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttactagttcaatgcaatattaaatgttattttactaatattac 18842619  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  18842620 ccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagtaa 18842718  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    || | |||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18842719 catttattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaataa 18842790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45281590 - 45281368
Alignment:
Q  62 ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  45281590 ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgtggagagggaaatatatgaaa 45281491  T
Q  162 tgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaa 261  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  ||   ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  45281490 tg-gatattaaatgaataaggtgattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaa 45281392  T
Q  262 atgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  45281391 atgtgacaattaaaagggaacgga 45281368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32010288 - 32010066
Alignment:
Q  71 aactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatt 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32010288 aactgtcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgtt 32010189  T
Q  171 aaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaa 270  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||   | | ||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  32010188 aaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataaattattgcatcaaaagtagtagcaattattgattgtcttggtttgtgaaaaatgttaaaaagtgacaa 32010089  T
Q  271 ttaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  32010088 ttaaaaatgaacggaagtagtaa 32010066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 290
Target Start/End: Original strand, 16656695 - 16656955
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16656695 ctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttagcaatattattctt 16656794  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16656795 agttatt-attgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattagtatcaat 16656893  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
      ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16656894 tgttgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggatgtag 16656955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38128790 - 38128530
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38128790 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaa-------tgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 38128698  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  38128697 ccttagttatttactacggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 38128598  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38128597 caattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggtagta 38128530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Original strand, 13173918 - 13174190
Alignment:
Q  24 tgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  13173918 tgttcctttttaagtgtcactttaagagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttactaacatta 13174017  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||| | |||||| || | ||  ||||    
T  13174018 cccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagta 13174117  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    ||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  13174118 acatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggagggagtaataa 13174190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Original strand, 11993884 - 11994139
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11993884 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtc 11993983  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||            |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |    
T  11993984 cttagttatttatagcggagagagaaat------------atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatc 11994071  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||  ||   | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11994072 aattgtttattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 11994139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 6757394 - 6757663
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6757394 ctgttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatt 6757493  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| || || |||||  || | ||  |||    
T  6757494 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattatataagaaaaagt 6757593  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| | |||   | | ||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6757594 aacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtaaaaaaggaacggaggtagta 6757663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8453483 - 8453218
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  8453483 gttcctttttaagcgtctcttttgaagaa-ttttttgcttctatttaactgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattac 8453385  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||   |||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8453384 cctcgattatttattgtggagata--aatatatgaaataagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaa 8453287  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||| |||   ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8453286 caattattgattatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 8453218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 2335423 - 2335691
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  2335423 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 2335522  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |  |||||| || | ||  || ||    
T  2335523 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtatagattattgtataagaaaaagaaa 2335622  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
     | | |||   ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  2335623 tatttattgagtatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaaggaatggatgcagtaa 2335691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2888718 - 2888451
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  2888718 gttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatatta 2888619  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  2888618 cccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagca 2888520  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | |||   | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2888519 acatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 2888451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8554266 - 8553993
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8554266 gttcctttttaagtgtctctcttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatatta 8554167  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  8554166 tccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatgttaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagca 8554068  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataata 298  Q
    ||| | |||   | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  8554067 acatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaaggaacgaaggtagtaataata 8553993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Original strand, 13327769 - 13327938
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13327769 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattat 13327868  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaa 194  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13327869 ctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaa 13327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1202668 - 1202441
Alignment:
Q  51 gaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga 150  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  1202668 gaaaatttttgttcatatttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtctttagttatttattgcggaaagaga 1202569  T
Q  151 aatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt 250  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||   | | ||| ||| |||    
T  1202568 aatatataaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgt 1202469  T
Q  251 aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1202468 aaaatgttaaaatgtgacaattaaaaag 1202441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Original strand, 35296027 - 35296301
Alignment:
Q  18 tactcctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacca 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  35296027 tacttctgttcctttttaagtgtcactttagtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccg 35296126  T
Q  118 atattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaa 217  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||| | |||||| || | ||    
T  35296127 acattacctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgattaaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaa 35296226  T
Q  218 gtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
      | ||||| | |||   | | ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35296227 aaaataacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 35296301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 6750603 - 6750776
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6750603 ctgttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatt 6750702  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6750703 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaa 6750776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 167723 - 167460
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167723 ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttttaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 167624  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |  ||  ||||| |||||||||||||| | |    
T  167623 agttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagttgaa-gtattgtatcaaaagtagtaatatt 167525  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatg-tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||   ||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  167524 tattgattatattggtttgtgtgaaatgttaaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 167460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17074804 - 17074572
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  17074804 aattttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaa 17074706  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | | |||   | | ||||||| ||||    
T  17074705 atatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgcatcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgta 17074606  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17074605 aaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 17074572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 285
Target Start/End: Original strand, 17573466 - 17573698
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  17573466 aattttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaa 17573564  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | | |||   | | ||||||| ||||    
T  17573565 atatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgcatcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgta 17573664  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17573665 aaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 17573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26740347 - 26740118
Alignment:
Q  65 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga 164  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26740347 ctatttaactctcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatga 26740248  T
Q  165 gatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatg 264  Q
     ||||||||| ||||||   |||||||||||| || ||   |||| |||||||||||||||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| |    
T  26740247 aatattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaag 26740148  T
Q  265 tgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26740147 tgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaat 26740118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 3720670 - 3720930
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3720670 gttcctttttaattgtcacttttgaataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattac 3720769  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     || || |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||| || ||   |||| |||||||| ||| |    
T  3720770 tctaagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaagcaattgtatcaaaagcagtca 3720869  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     | | |||   | | || |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3720870 aacttattgattgttttagtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 3720930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 17718493 - 17718696
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  17718493 gttcctttttaattgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattac 17718592  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||   |||| ||||||| ||||||    
T  17718593 ccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaa 17718692  T
Q  225 caat 228  Q
    ||||    
T  17718693 caat 17718696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Original strand, 23855581 - 23855831
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23855581 tttgtttcaatttaaccgtcactttcaaagtttattgcaacattaaatgttgttt-atcaatattacccttagttatttattgtggagagataaatatat 23855679  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
     |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||||| | | |||   | ||||||||||||||||||||    
T  23855680 aaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtatgacgtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttatgtaaaatgt 23855779  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa-taatagtaatagtaa 308  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  23855780 caaaaaatgacgattaaaaaggaacggaggtagtaattaatagtagtagtaa 23855831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9808184 - 9808026
Alignment:
Q  65 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga 164  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9808184 ctatttaactctcattttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttactaatattgtcattagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga 9808085  T
Q  165 gatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9808084 gatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 9808026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16701143 - 16700989
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16701143 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattat 16701044  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16701043 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 16700989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 285
Target Start/End: Original strand, 43553071 - 43553289
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43553071 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaacgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaa 43553170  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||| | |||   | | |||||||  ||||||||||| || | |    
T  43553171 tattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcacaaagcg 43553270  T
Q  267 acaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  43553271 acaattaaaaagaaacgga 43553289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8731077 - 8730807
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  8731077 gttcctttctaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 8730978  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||   |||||||||||| || || |||||| || | ||  |||||    
T  8730977 ccttag-tatttattgcggagagagaaatatatg-aataagataataaatgattaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaa 8730880  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8730879 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtggcacttaaaaaggaatggaggtagtaataat 8730807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7606146 - 7605954
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7606146 ttcctttttaagtgtatcttttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttcaagttcaatacaatattaaatgttattttaccaatattatc 7606047  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    |||| ||||||||   | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  7606046 cttaattatttat--ggtagagagaaatatatgaaattagatgttaaataaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcattaaaagta 7605954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23793526 - 23793254
Alignment:
Q  24 tgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23793526 tgttcctttttaattgtcatttttaaaaaaatattttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgtaacattgaatgttgttttaccaatatta 23793427  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || | |||| ||||||| |||||    
T  23793426 tccttagatatttattacggagagaaaaacatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagta 23793327  T
Q  224 ac----aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||    | | ||||  | | ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  23793326 acatttatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 23793254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40604069 - 40603930
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40604069 ttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgcggagagataaatata 40603970  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40603969 tgaaatgaaatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaa 40603930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Original strand, 12763425 - 12763625
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  12763425 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttt-gtttcaatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 12763523  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa-gatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  | |||||| |||||||  ||||    
T  12763524 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgat-attatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaaacagta 12763622  T
Q  224 aca 226  Q
    |||    
T  12763623 aca 12763625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11707705 - 11707564
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11707705 ttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaata 11707606  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11707605 tatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaa 11707564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12248978 - 12248753
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  12248978 atttaactgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttgcttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgaaa 12248879  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| | | |||   | | ||||||  |||||||||||||||  ||    
T  12248878 tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcgtgtaaaatgtcaaaaactg 12248779  T
Q  267 acaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||||||||||||||||| ||||||    
T  12248778 tcaattaaaaaggaacggaggtagta 12248753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15647612 - 15647452
Alignment:
Q  62 ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15647612 ttcctttttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaa 15647513  T
Q  162 tgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  15647512 taagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15647452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 7483734 - 7484001
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  7483734 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttcactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 7483833  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||  | |||||| || | ||  |||||    
T  7483834 ccttaattatttattatg--gagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaa 7483931  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    || | |||   | | || |||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7483932 catttatttagtgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaat 7484001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Original strand, 3513390 - 3513542
Alignment:
Q  68 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  3513390 tttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttacctatattatcattagttatttattacagagagataaatatatgaaatgagat 3513489  T
Q  168 attaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  3513490 attaaatgaataaggtcattatagtaaatgtatagcttattgtatcaaaagta 3513542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15623824 - 15623664
Alignment:
Q  62 ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa 161  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15623824 ttcctttttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaa 15623725  T
Q  162 tgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  15623724 taagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15623664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14061399 - 14061132
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||      
T  14061399 gttcctttttaagtgtcattttttgaaaaaaattttgtttctgtttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaacattaaaagttgttttatcaatattgc 14061300  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||    |||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  14061299 ccttagttatttattacagagagagaaataaataaaatgtaatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtagtaa 14061200  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     | | |||   | | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14061199 tatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 14061132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43553493 - 43553322
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43553493 gttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattat 43553394  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43553393 ccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgcttaaatgaataaggttattatagtaaaa 43553322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43553701 - 43553544
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43553701 gttcctttttaagtgtctcttttagagaatttttttgttcctattaaactgtcactttcgaagttaaatgcaacattaaatgttgttttaccgatatcat 43553602  T
Q  125 ccttagtta-tttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43553601 ccttacttattttattgcggagagaaaaatatatgaaattagatattgaatgaataag 43553544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 196
Target Start/End: Original strand, 31028670 - 31028815
Alignment:
Q  51 gaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  31028670 gaaaatttttgtttttatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcggagagaga 31028769  T
Q  151 aatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31028770 aacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaa 31028815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Original strand, 38074266 - 38074465
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||     
T  38074266 gttcctttttaattgtcacttttgtagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttgacattattac 38074365  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | || || ||| ||||||||||||||    
T  38074366 ccttgattatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaatgagcaagattattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagtagtaa 38074465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 292
Target Start/End: Original strand, 19972302 - 19972536
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19972302 tttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatat 19972401  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
     |||| |||||||||| || ||||   |||||||||||| || || |||||| || | ||   |||||| | |||   | | ||||||| ||||||||||    
T  19972402 taaataagatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgt 19972501  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  19972502 caaaaagtgaccgttaaaaaggaacggaggtagta 19972536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21020531 - 21020297
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21020531 tttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatat 21020432  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
     |||| |||||||||| || ||||   |||||||||||| || || |||||| || | ||   |||||| | |||   | | ||||||| ||||||||||    
T  21020431 taaataagatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgt 21020332  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21020331 caaaaagtgaccgttaaaaaggaacggaggtagta 21020297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39615674 - 39615450
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |  |||||    
T  39615674 aattttttgttgctatttaagtgtcactttacatcgttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgtgaaatgagaa 39615576  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||| || ||||  | | ||||||||||||    
T  39615575 atatatataatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtaacaac-attattaattgtcttggtttatgta 39615477  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39615476 aaatatcaaaatgtgacaattaaaaag 39615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Original strand, 35051870 - 35052007
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35051870 ttgttcctctttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatg 35051969  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35051970 aaattagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaa 35052007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 11163254 - 11163516
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||  | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  11163254 ctgttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttatt 11163353  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | ||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||||||||||||||||    
T  11163354 acccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagt 11163453  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    || ||  ||| | | | ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11163454 aaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacgga 11163516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27911878 - 27911655
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27911878 ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata 27911779  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||||||| | |||   | | ||| ||| |||||||||||||||  | ||    
T  27911778 ttaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataac 27911679  T
Q  269 aattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||    
T  27911678 acttaaaaaggtacggaggtagta 27911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27958297 - 27958074
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27958297 ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata 27958198  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||||||| | |||   | | ||| ||| |||||||||||||||  | ||    
T  27958197 ttaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataac 27958098  T
Q  269 aattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||    
T  27958097 acttaaaaaggtacggaggtagta 27958074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13132366 - 13132111
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | |    
T  13132366 gttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgt 13132267  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| | || ||||||||||||||||||| |    
T  13132266 ccttagtaatttattgcagagagagaaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagtga 13132167  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
     |  ||||   | | ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  13132166 aatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaa--tgacaattaaaaaggaac 13132111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14511686 - 14511419
Alignment:
Q  27 tcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgc--------aacattaaatgttgttttaccaa 118  Q
    |||||||||| ||||  ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |        || ||||||||||||||||| ||    
T  14511686 tcctttttaattgtcacttttagagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacttcaatgtaatattaaatgttgttttactaa 14511587  T
Q  119 tattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaag 218  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| |||||||     
T  14511586 tattacccttagatatttattgcggagagagaagcatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaa 14511487  T
Q  219 tagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta-aaaaggaacgga 285  Q
    |||||||| | ||||  | | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14511486 tagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaaaggaacgga 14511419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40521493 - 40521337
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  40521493 gttcctttttaattgtcacttttggagaaatttttt-ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattac 40521395  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaa--atatatgaaatgagatattaaatgaataa 180  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40521394 ctttaaatatttattgcggagagagaaacatatatgaaatgaaatattaaattaataa 40521337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35498290 - 35498119
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  35498290 ttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattagatgtagttttatcaatattgtccttagttatttattacagagatagaaata 35498191  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaaca 226  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||    
T  35498190 tatgatatgtgatattgaataaataagactattatagtaaaagtataaattattatatcaaaagtagtaaca 35498119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41701703 - 41701548
Alignment:
Q  54 attttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaat 153  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||| || ||||||||    
T  41701703 attttttgttcgtatttaactgacacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttcttttaccaacattacttttagttatttattgcagaaagagaaat 41701604  T
Q  154 atatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  41701603 atatgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaaatataaattattg 41701548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9301766 - 9301526
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||| ||||  || || ||||  | |||||||    
T  9301766 aaattttttgtttctaattaactgtcacttttaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcttttattacccttgatttttaattgtagggagagaa 9301667  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt- 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||| ||  ||| | ||| ||||||| |||     
T  9301666 atatatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaaatatttgatatcttggtttgtgta 9301567  T
Q  251 aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9301566 aaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacggatgaagta 9301526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 38221807 - 38222062
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  38221807 ctttttaagtgtcatttttagagaaattttttgt-cctatttaattgtcactttcaaagttcaatataacaataaatgttgttttacaaacattaccctt 38221905  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    | ||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| || || |||||  || | ||  | ||||| |    
T  38221906 aattatttatcatggagaaagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattatataagaaaaaataacatt 38222005  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |||   | | ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  38222006 tattgaatgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacgga 38222062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Original strand, 41308013 - 41308153
Alignment:
Q  153 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgca-tcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | | ||||| ||||||    
T  41308013 tatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcaatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttggtatatgta 41308112  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41308113 aaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggaggtagta 41308153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 41890505 - 41890711
Alignment:
Q  18 tactcctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacca 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  ||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41890505 tactcccgttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacct 41890604  T
Q  118 atattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaa 217  Q
     |||||  |||  |||||| |||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||| |||||||    
T  41890605 ttattacacttgattatttcttgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaa 41890704  T
Q  218 gtagtaa 224  Q
    |||||||    
T  41890705 gtagtaa 41890711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9687711 - 9687497
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9687711 tgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacaataccatta----tttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaa 9687616  T
Q  174 tgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 273  Q
    ||| |||| | |||||||||||| || || |||||| || | ||  ||||||| | |||   ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||    
T  9687615 tgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgcgtatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgatagtta 9687516  T
Q  274 aaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | |||||||| | ||||||    
T  9687515 acaaggaacgaaggtagta 9687497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 181
Target Start/End: Original strand, 17313126 - 17313223
Alignment:
Q  84 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17313126 aaagttcaacgcaacattaaatgttattttacaaatattaaccttagttatttattgcggagtgagaaatatattaaatgagatattaaatgaataag 17313223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8954945 - 8954750
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  ||||  |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  8954945 ctttttaattgtcatttttgtagaatttttttgtttctaattaactgttactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatctttattatcctt 8954846  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
      ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | || || ||  ||||||||||||||    
T  8954845 gattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaagattattataggaaaaaaataaattgttttatcaaaagtagtaa 8954750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Original strand, 45317642 - 45317901
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||        
T  45317642 gttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttccaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataaagc 45317741  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||  |||| ||||| |  |||   |||||||  |||| | || |||||| |||||||||||| |    
T  45317742 ccttaataatttattggagagagaaaaatatatgaaatatgataataaataatcaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtga 45317841  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
     |  ||||   | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45317842 aatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 45317901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Original strand, 41305634 - 41305763
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| ||||  | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  41305634 gttcttttttaagtatcttttttgaagatttcttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattac 41305733  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41305734 ccttaattatttattgcggagagataaata 41305763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Original strand, 6660943 - 6661199
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| | || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| | |    
T  6660943 gttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgt 6661042  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat-aagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt- 222  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||  |||||||||| | | ||||| |||||||  |||  | || |||||| ||||||||||||     
T  6661043 ccttagtaatttattgcagagagaaaaataaaagaaatatgatattaaataattaaagat-attataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtg 6661141  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    ||  ||  |||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6661142 aaatatatttag-tgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 6661199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Original strand, 6741345 - 6741601
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| | || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| | |    
T  6741345 gttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgt 6741444  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat-aagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt- 222  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||  |||||||||| | | ||||| |||||||  |||  | || |||||| ||||||||||||     
T  6741445 ccttagtaatttattgcagagagaaaaataaaagaaatatgatattaaataattaaagat-attataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtg 6741543  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    ||  ||  |||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6741544 aaatatatttag-tgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 6741601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10086373 - 10086235
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10086373 ttttgttcttgtttaactgtcacttttaaagtttagtgcaacaataaatgttgttttaccgacatcatccttaattatttattgcagagagagaaatata 10086274  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaa 195  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||  |||||| ||||    
T  10086273 tgaaataatatattaaataactaagactattataataaa 10086235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Original strand, 17313282 - 17313399
Alignment:
Q  175 gaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 274  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17313282 gaataaggtcattatagtaaaagtagaacttattgcatcaaaagtaataacaataattgactatcttcgtttatgtaagatgtcaaaatgtaacaattaa 17313381  T
Q  275 aaaggaacggatgtagta 292  Q
    || |||||||| ||||||    
T  17313382 aagggaacggaggtagta 17313399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36112104 - 36111926
Alignment:
Q  112 ttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgca 211  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |  |||||| |    
T  36112104 ttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgta 36112005  T
Q  212 tcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | | ||  ||||||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  36112004 taagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaa--gtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 36111926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 278
Target Start/End: Original strand, 42352773 - 42352980
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||| ||    
T  42352773 ttaactctcatttttaaagttcattacatcattaaatgttgttttacta-tattacccttagatatttattgcagaatgataaatatatgaaatgaggta 42352871  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||||| | || || |||||||||||||||||| ||  ||| | | | ||||||| ||||||| |||||||  ||||    
T  42352872 ttaaatgaataaggttattatatgaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaacatgac 42352970  T
Q  269 aattaaaaag 278  Q
    ||||||||||    
T  42352971 aattaaaaag 42352980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 284
Target Start/End: Original strand, 40608051 - 40608287
Alignment:
Q  51 gaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga 150  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| |  |||| || ||||||||| ||||| ||    
T  40608051 gaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataatgcccttggtaatttattgcagagaggga 40608150  T
Q  151 aat---atatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggttta 247  Q
    |||   |||||||||  |||||||||| | ||||   |||||||  |||| | || |||||| ||||||| |||| | |  ||||   |||||||||||     
T  40608151 aatacaatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaaatagtgaaatacatttagtatattggtttg 40608250  T
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40608251 tgtagaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagcaacgg 40608287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 130
Target Start/End: Original strand, 8672332 - 8672397
Alignment:
Q  65 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttag 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8672332 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttag 8672397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Original strand, 11727617 - 11727829
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||||  |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  11727617 ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcatcaaatgtggctttacttatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagta 11727716  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||| | ||  ||| | | | ||||||| ||||||| || |||||| |||    
T  11727717 ttaaattattaagattattatagaaaaaagataaatttttgtatcaaaagtagt-agaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatgcgac 11727815  T
Q  269 aattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||||||||||    
T  11727816 aattaaaaaggaac 11727829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Original strand, 29125936 - 29126148
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  29125936 ttaactgtcgttttcaaagtccaatgcattattaaatgtggttttacctatattacgcttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagta 29126035  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||| | || || ||| |||||||||||||| ||  ||| | | | ||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  29126036 ttaaatgattaaggttatcataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagctaaaatgtgac 29126134  T
Q  269 aattaaaaaggaac 282  Q
    | | ||||||||||    
T  29126135 agtgaaaaaggaac 29126148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13935294 - 13935194
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||    
T  13935294 ttttgttcatatttaactgttactttcgaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattatccctacttatttattatggagagagaaatata 13935195  T
Q  157 t 157  Q
    |    
T  13935194 t 13935194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 292
Target Start/End: Original strand, 35029635 - 35029803
Alignment:
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |  ||||| ||||||||||||    
T  35029635 atccatagttatttattgtggagagagaaatatat-aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagt 35029733  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     | | | ||    ||||||| ||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35029734 gatatttatggattatattgatttgtataaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 35029803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 296
Target Start/End: Original strand, 8672583 - 8672755
Alignment:
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| ||||||| || ||    
T  8672583 tccttagataattattgccgagagagaaacataaaaaatgaaatagtaaataaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaataata 8672682  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    ||| | |||   ||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8672683 acatttattgattattttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaagtagtaataa 8672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41643648 - 41643480
Alignment:
Q  117 aatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaa 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || | ||||| | ||||  | || |||||  ||||||    
T  41643648 aatattacccttagttatttattacgaagagagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaaggataatttattatatcaaa 41643549  T
Q  217 agtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||||| | |||  || ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  41643548 agtagtaacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaattacaattaaaaatgaacgga 41643480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 282
Target Start/End: Original strand, 15281469 - 15281626
Alignment:
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||| || |||||| || |||||||| ||    
T  15281469 ccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagtagcaa 15281568  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    || | |||    || |||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  15281569 catttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaac 15281626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 282
Target Start/End: Original strand, 15461838 - 15461995
Alignment:
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||| || |||||| || |||||||| ||    
T  15461838 ccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagtagcaa 15461937  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    || | |||    || |||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  15461938 catttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaac 15461995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37998330 - 37998224
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| || || ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37998330 ttttttgtttttaattaactgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtctt-cctataatattcttagtaatttattgcagagagagaaata 37998232  T
Q  155 tatgaaat 162  Q
    ||||||||    
T  37998231 tatgaaat 37998224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 148
Target Start/End: Original strand, 30205450 - 30205573
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| | || |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | |    
T  30205450 gttcctttataactgtcacttttacataatttttttatttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgt 30205549  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagaga 148  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||    
T  30205550 ctttagtaatttattgcagagaga 30205573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27193248 - 27193104
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 179  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| |||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  27193248 tttcaaagttcaatttatcattaaatgtgattttacctatattacctttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattatta 27193149  T
Q  180 agatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    || | |||||||  |||| | || || ||| ||||||||||||||    
T  27193148 aggttattataggtaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa 27193104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40602982 - 40602870
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |  | ||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  40602982 agaaatttcctgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatataacattaaataatgttctttctataatgtctttagtcatttattgcggagagag 40602883  T
Q  150 aaatatatgaaat 162  Q
    |||||||||||||    
T  40602882 aaatatatgaaat 40602870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 285
Target Start/End: Original strand, 13328121 - 13328220
Alignment:
Q  186 ttatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||  ||   | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13328121 ttatagtaaaagtataacttattgtattaaaagtagtatcaatttttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 13328220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Original strand, 35028598 - 35028693
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35028598 gttcctttttaaatgtcacttttgaagaaaaattttgtttcaattta--tgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatatt 35028693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 282
Target Start/End: Original strand, 1739902 - 1739940
Alignment:
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1739902 tttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaac 1739940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 283
Target Start/End: Original strand, 17718906 - 17718944
Alignment:
Q  245 ttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17718906 ttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacg 17718944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 174
Target Start/End: Original strand, 10013317 - 10013382
Alignment:
Q  109 gttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 174  Q
    |||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  10013317 gttttacctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaat 10013382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28568136 - 28568056
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  28568136 tgtcactttgaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattacccttacctatttattgttgagagagaaata 28568056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28575729 - 28575649
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  28575729 tgtcactttgaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattacccttacctatttattgttgagagagaaata 28575649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11707539 - 11707444
Alignment:
Q  190 agtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||| |||   | | ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11707539 agtaaaagtataacttaatacatcaaaagtagtaataattattgattgtcttaatttatgtaaaatgtaaaaatatgacaattaaaaagaaacgga 11707444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 155
Target Start/End: Original strand, 12753116 - 12753215
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac-attaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  12753116 ttttgtttttatttaactatcatttttaaagttctatgcaattattaaatgttgatttaccgatattactcttagttattaattacagagagaaaaatat 12753215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32010352 - 32010306
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaa 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32010352 gttcctttttaagtgtct-ttttggagaaattttttgttcctatttaa 32010306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9806867 - 9806829
Alignment:
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9806867 tttatgtaaaatgttaaaatatgacaattaaaaaggaac 9806829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 112
Target Start/End: Original strand, 38238932 - 38238994
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 112  Q
    |||| ||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38238932 agaatttttttgtttctattcatttgtcattttcaaagttcaatgcaacattaactattgttt 38238994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29091112 - 29091075
Alignment:
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29091112 tgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaagaacgga 29091075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 108)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 10675892 - 10676159
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10675892 gttcttttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 10675991  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10675992 cctaagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtaataa 10676091  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  10676092 caatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacagaggtagta 10676159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 13699164 - 13699424
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13699164 gttcctttttaagtgtcgcttttgaataaattttttatttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatactat 13699263  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13699264 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 13699363  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13699364 caatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatggcaattaaaaaggaacgga 13699424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Original strand, 30686400 - 30686668
Alignment:
Q  24 tgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30686400 tgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattg 30686499  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30686500 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 30686599  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||||  ||   | | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30686600 tcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 30686668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 13507760 - 13508028
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13507760 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattat 13507859  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||     
T  13507860 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtat 13507959  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||| |||   | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13507960 caattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 13508028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 13514948 - 13515216
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13514948 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattat 13515047  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||     
T  13515048 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtat 13515147  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    |||| |||   | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13515148 caattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 13515216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32994720 - 32994450
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaatt----ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32994720 gttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattaatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 32994621  T
Q  121 ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32994620 ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagta 32994521  T
Q  221 gtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| ||| |||   | | ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32994520 gtaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaaagacaattaaaaa-gaacggaggtagta 32994450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21927943 - 21927675
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21927943 gttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattat 21927844  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  21927843 ccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 21927744  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    ||||  ||   | | || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21927743 caattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtc--aatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 21927675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 35255476 - 35255729
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35255476 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattat 35255575  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||    
T  35255576 ccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaa 35255675  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    |||| |||   | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35255676 caattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 35255729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 43500494 - 43500763
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43500494 ctgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaatatttgttcctatttaagtgtcacttttaaagttcaatgcagtattaaatgttgttttaccaatatt 43500593  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  43500594 atccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagt 43500693  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43500694 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 43500763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35531542 - 35531275
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35531542 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 35531443  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  35531442 ccttagttatttattgcagagagataaatatatgaaataggatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 35531343  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35531342 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 35531275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19929709 - 19929453
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19929709 ctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttaccaatattattctt 19929610  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19929609 tgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaat 19929510  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |||   | | ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  19929509 tattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 19929453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 50825819 - 50825553
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50825819 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcttacttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattat 50825720  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  50825719 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtag 50825620  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  50825619 caat-gttgattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaaaaacggaggtagta 50825553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37609548 - 37609291
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37609548 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattat 37609449  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||   ||||     
T  37609448 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaa---agtat 37609352  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37609351 caattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 37609291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 52 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37437273 - 37437029
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||    
T  37437273 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggagataaaa 37437174  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||| |||   | | ||||||| ||||    
T  37437173 atatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtggtatcaattattgattgtcttggtttgtgta 37437074  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37437073 aaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagtaataa 37437029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 13566666 - 13566939
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13566666 gttcctttttaagtgtcattttttgagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 13566765  T
Q  125 ccttagttat---ttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13566766 ccttaattattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtag 13566865  T
Q  222 taacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    || ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13566866 tatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaata 13566939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Original strand, 38648448 - 38648714
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38648448 ttcctttttaaatgtcactttttgagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 38648547  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |    
T  38648548 cttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatc 38648647  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||  ||   | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38648648 aattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 38648714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19349594 - 19349356
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19349594 ttttgttcctatttaacagtcactttcaaagttgaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagataaatata 19349495  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| |||||||||    
T  19349494 tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatg 19349395  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  19349394 tcagaatgtgacaattaaaaaggaacagtggtagtaata 19349356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Original strand, 45368079 - 45368345
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||  ||||   |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45368079 ttcctttttaaatgtcacttttggggaaaatttttgtttctatttatctgtcactttcaaagttcaatgaaacattgaatgttgttttaccaatattatc 45368178  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |    
T  45368179 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatc 45368278  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||    
T  45368279 aattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaagaactgaggtagta 45368345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 295
Target Start/End: Original strand, 1024587 - 1024816
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1024587 tatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattgtcgttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 1024686  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||| |||||||| |||||||||    
T  1024687 atattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgt 1024786  T
Q  266 gacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1024787 gacaattaaaaaggaacggaggtagtaata 1024816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35484026 - 35483760
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35484026 gttcatttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattat 35483927  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||     
T  35483926 ccttagttatttattgc--agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaataatat 35483829  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35483828 caattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaagaacggaggtagtaa 35483760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18034073 - 18033806
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18034073 gttcctttttaagtgtcactttttgagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatccaacattaaatattgttttatcaatattat 18033974  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagta-aaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||    
T  18033973 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaaatatagcttattgcatcaaaatgagta 18033874  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||||  ||   | | |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18033873 tcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatg-aaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 18033806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31588986 - 31588720
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31588986 gttcctttttaagtgtcatttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattat 31588887  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||| |||||||||||||     
T  31588886 ccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtat 31588788  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||  ||   ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  31588787 taatttttgattatcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaaagaacgtaggtagta 31588720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 292
Target Start/End: Original strand, 12124671 - 12124901
Alignment:
Q  62 ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa 161  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12124671 ttcctttttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa 12124770  T
Q  162 tgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaa 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  ||   ||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  12124771 tgagatattaaatgaataagattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagcatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatggcaaa 12124870  T
Q  262 atgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12124871 atgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 12124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20605866 - 20605604
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20605866 tttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcttattaaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcattg 20605767  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||     
T  20605766 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 20605667  T
Q  230 attagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||   | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  20605666 gttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaatggaggtagta 20605604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 28679011 - 28679264
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28679011 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 28679110  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  28679111 ctttagttatttattgcggagagagaaatatatcaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtat 28679210  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
     |||  |||  | | ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28679211 aaattgttaattgtcttaatttatataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 28679264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45226824 - 45226571
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  45226824 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgt 45226725  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||     
T  45226724 ccttagttatttattgtggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattataataaaagtatagcttattacatcaaaagtagtat 45226625  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    ||||  ||   | | ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45226624 caattgttgattgtcttaatttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 45226571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51972528 - 51972259
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  51972528 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaaattcaatgcaacatgaaatattattttaccaatattat 51972429  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  51972428 cattagctatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 51972329  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||  |||   | | ||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||  ||| || ||||||||    
T  51972328 caactattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaattaaaaaataacagaggtagtaat 51972259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 1429274 - 1429541
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1429274 gttcttttctaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 1429373  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  1429374 ccttagttatttattgcggagagagaaatatacaaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 1429473  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || |  |    | | || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1429474 catttgtagattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 1429541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49908429 - 49908164
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49908429 gttcctttttaagtgtcacttttaaagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 49908330  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaa---cttattgcatcaaaagtag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  49908329 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatcgaattaataaggtcattatagtaaaaatataatagtttattgcatcaaaagtag 49908230  T
Q  222 taacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatg 287  Q
    || ||||  ||   | | || |||  | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49908229 tatcaattgttgattgtcttagttcgtataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaagtaacggatg 49908164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 282
Target Start/End: Original strand, 7782942 - 7783197
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  7782942 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttgttttatcaatattgtt 7783041  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| |    
T  7783042 cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-aaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagttaattgcatcaaaagtagtatc 7783140  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||  ||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7783141 aattgttgattatcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 7783197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 49497142 - 49497402
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49497142 gttcttttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttcttatttaactgttatttttgaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattgt 49497241  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||     
T  49497242 ccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaataatat 49497341  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  |||  | | || |||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49497342 caattgttaattgtcttagtttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaacgga 49497402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 222
Target Start/End: Original strand, 43952782 - 43952975
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  43952782 ctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttacaaatattatcttt 43952881  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  43952882 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgcgatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtagt 43952975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 32347956 - 32348234
Alignment:
Q  15 taatactcct--gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32347956 taatactcctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 32348055  T
Q  113 taccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcat 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  |  ||||| ||    
T  32348056 taccaatattacccttagttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattctagtaaaagtatgaagtattgtat 32348155  T
Q  213 caaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||| | | |||   | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32348156 caaaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 32348234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12231245 - 12231051
Alignment:
Q  98 cattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12231245 cattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaag 12231146  T
Q  198 tacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12231145 tacagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 12231051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 44182750 - 44183008
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44182750 gttcctttttaagtgtcaattttggagaaaaaatttgtttctatttaactgtcactctcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 44182849  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||  ||| |||||| ||     
T  44182850 ccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaataaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattatatc-aaagtaatat 44182947  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44182948 caatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 44183008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32168559 - 32168289
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  32168559 gttcctttttaattgtcacttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcagtttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattac 32168460  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||  |   |||| |||||||||||||     
T  32168459 ccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtac 32168360  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32168359 catttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaata 32168289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 44818444 - 44818642
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||| |||  ||||  ||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44818444 gttcctttttaagcgtcacttttgcagaaaatctttgttcctatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 44818543  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  44818544 ccttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaactatagcttattgcatcaaaagtagta 44818642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 9361963 - 9362223
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  9361963 gttcctttttaagtgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 9362062  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || |||||| || | ||  |||||    
T  9362063 ccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaa 9362162  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     | | |||   | | ||| ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9362163 aatttattgagtgtcttgatttgtataaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaacgga 9362223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Original strand, 48508123 - 48508382
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  48508123 gttcctttttaagtgtctattttgaagaatttttatgttcctatttaattgtcactttacacagttcaatgcaacattaaaagttattttactaatatta 48508222  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  |    
T  48508223 cccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtaaca 48508321  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgg 284  Q
    ||| | |||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48508322 acatttattgattattttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacgg 48508382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 95 - 293
Target Start/End: Original strand, 1677258 - 1677456
Alignment:
Q  95 caacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1677258 caacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcaatatagtaa 1677357  T
Q  195 aaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    || || | |||||||||| |||||||||| |||| |||   | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1677358 aagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 1677456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 51613402 - 51613672
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  51613402 ttcctttttaattgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattact 51613501  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||  |   |||| ||||||||||||| |    
T  51613502 cttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtatc 51613601  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    | | |||   | | ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51613602 atttattgattgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaataa 51613672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40926992 - 40926733
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  40926992 ctgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaacgatgttttatcaatatt 40926893  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||         ||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  40926892 actctta-ttatttatggcggagagagaaatatatgaaacgaaat---------ataaggtcgttatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagt 40926803  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40926802 aacaattattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 40926733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Original strand, 18344320 - 18344583
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18344320 ctttttaagtgtctcttttaacgaaaatttttgtttcaatttaagtgtcaattttaaaattcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattaccctt 18344419  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||| || ||  ||||| ||||||||| |||| | |    
T  18344420 agttatttattgtgcagagagaaatatatgaaatgagataataaacaaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatcaaaagtggtaatatt 18344519  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18344520 tattaattatattgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 18344583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 36318343 - 36318612
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36318343 gttcctttttaagtgtcacttttagataaattttttgtttctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattat 36318442  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||||||  |  || |||||| |||||||||||| |    
T  36318443 ccttatttatttattacaaagagaaaaat-tatgaaatgacacattaaacaaataaggttattatagtaaaggtgtaaattattgtatcaaaagtagtga 36318541  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    || | |||   | ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36318542 catttattgaatgtattggtttgtgtaaattgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaata 36318612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35700588 - 35700351
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35700588 ttgttccaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagaaagaaatatatg 35700489  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||  | |||||  |||||||||||||||| | |||   | | ||| ||| |||||||| ||    
T  35700488 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattatatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatc 35700389  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35700388 acaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaataa 35700351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2059976 - 2059792
Alignment:
Q  108 tgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  2059976 tgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtgaaagtataacttat 2059877  T
Q  208 tgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2059876 tgcatcaaatgtagtaacaattattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagta 2059792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31570884 - 31570615
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31570884 gttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattat 31570785  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||    || ||  ||||||||||||||    
T  31570784 ccttacttatttatcacggagtgagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtagtaa 31570685  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    || | |||   | ||||||||| ||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31570684 catttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgccttaaagtgacacttaaaaaggaacggatgtagtaat 31570615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 52749011 - 52749265
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  52749011 ctttttaaatgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttatatcaatattatcctt 52749110  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  52749111 agttatttattgtg--gagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagattattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaaatagtatcaat 52749208  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
      ||   | | ||| ||  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  52749209 tgttgattgtcttgattcgtgtaaaatgtcaaaatataacgattaaaaatgaacgga 52749265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 15660577 - 15660761
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  15660577 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 15660676  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||| || || ||||||    
T  15660677 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattg 15660761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30702536 - 30702281
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30702536 ttcctttttaagtgtttcttttgcataaattttttgttttaatttaaatctcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatc 30702437  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||| || ||  ||||| ||||||||| |||||    
T  30702436 cttagttatttattgtagagaaaaaaatatataaaatgagataataaataaataatgttattatagtaaaagtataaaatattgtatcaaaagtggtaac 30702337  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    | | |||   | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30702336 atttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 30702281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4101129 - 4100887
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  4101129 aaatcttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgtagcattaaatgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagaaaa 4101030  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   |||| |||||||||| ||||| | |||   | | || |||| ||||    
T  4101029 acatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttagtttgtgta 4100930  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4100929 aaatatcaaaaagtaataattaaaaaggaacggaggtagtaat 4100887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 292
Target Start/End: Original strand, 29830828 - 29831010
Alignment:
Q  110 ttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||    
T  29830828 ttttaccaatattggtcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg 29830927  T
Q  210 catcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||| || |||| |||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29830928 catcaaaagtaatatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 29831010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 38597578 - 38597838
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaa-gtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 121  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  38597578 ctgttcctttttaaagtgtcatttttggagaaacttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacat 38597677  T
Q  122 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || |||||| || | ||  ||    
T  38597678 tacccttagttatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaag 38597777  T
Q  222 taacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||| | |||   | | || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38597778 taacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaac 38597838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Original strand, 9127658 - 9127923
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9127658 ttcctttttaagtgtcacttttggataaattttttgtgtttatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgtttttccagtattatc 9127757  T
Q  126 cttagttatttattgcg--gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||  | |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||    
T  9127758 cttgctcatttattgtggagagagagaaatatatgaagtgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 9127857  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgta 289  Q
    ||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9127858 acatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagatgta 9127923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31488022 - 31487757
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaa-agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcct 127  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  31488022 ctttttaagtgtctctttttgagaatttttttgttcctattcaagtgtcactttatatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccct 31487923  T
Q  128 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    || ||||| ||||  || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |     
T  31487922 tatttatt-attgtagaaagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaatat 31487824  T
Q  228 tcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    | |||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31487823 ttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtaataat 31487757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51974376 - 51974158
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  51974376 atttaactgtcattttcgaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattatccttgcttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaa 51974277  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| | | |||   | | ||||||  ||||||||||||||| |||    
T  51974276 tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatacattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaaagtg 51974177  T
Q  267 acaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51974176 acaattaaaaaggaacgga 51974158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 292
Target Start/End: Original strand, 12721464 - 12721697
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  12721464 ttgttcctatttaactatcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaagatttcccttagatatttattgcagagagagaaacatatg 12721563  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||   |||| |||||||||||||| | | |||   | | ||||||||||||||||||     
T  12721564 aaataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttatttattgtcttggtttatgtaaaatgtt 12721663  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12721664 aaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 12721697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8464401 - 8464237
Alignment:
Q  128 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||    
T  8464401 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 8464302  T
Q  228 tcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |  ||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8464301 ttgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagta 8464237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 10506828 - 10507059
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  10506828 agaaattttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcgatattacccttagttatttattgcg--gagag 10506925  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||| | | |||   | | ||| ||| ||    
T  10506926 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtacaagtatcaattattgcatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtg 10507025  T
Q  250 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  10507026 taaaatatcacaaaatgacaattaaaaaggaacg 10507059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39412676 - 39412500
Alignment:
Q  107 ttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaactta 206  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39412676 ttgttttaccaatattatcttttgttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaaatataactta 39412577  T
Q  207 ttgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||   | | ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39412576 ttgcatcaaaagtagaaacaattattgattgttttggtttgtataaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacg 39412500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19455647 - 19455445
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455647 ctgttcctttataagtgtcacttttggagaaattttt-gtttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 19455549  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||  ||| |||||||  || || |||||| ||||||||||||    
T  19455548 acccttaattatttattgcggagagagaaatctatgaaacataatattaaatgaataagactattttagtaaaggtataaattattgtatcaaaagtagt 19455449  T
Q  223 aaca 226  Q
    ||||    
T  19455448 aaca 19455445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37735386 - 37735119
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||     
T  37735386 gttcctttttaactgtcacttttaaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactgtcaaagttcaatgcaaaattaaatattgttttaccaacattac 37735287  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||  | ||   |||| |||||||||||||     
T  37735286 ccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaatcaaaaacaattgtatcaaaagtagtat 37735187  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | | |||||||  ||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37735186 catttattgattgtcttggtttgcgtaaaatttgaaaaagtgataattaaaaaggaacggaggtagta 37735119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 285
Target Start/End: Original strand, 43808890 - 43809154
Alignment:
Q  27 tcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg-ttttaccaatattatc 125  Q
    |||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  43808890 tcctttttaattgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaccatcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttttaccaatattacc 43808989  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga-----tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |     |||||||| ||||||   |||||||||||| || || | |||| |||||||| |    
T  43808990 cttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatactgtattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagca 43809089  T
Q  221 gtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||| | |||   | | ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43809090 gtaacacttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 43809154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 283
Target Start/End: Original strand, 1427672 - 1427927
Alignment:
Q  27 tcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcc 126  Q
    ||||||||||||||   ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1427672 tcctttttaagtgttattttttgagaaattttt-gttcttatttaactgtcattttcaaaggtcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatcc 1427770  T
Q  127 ttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaaca 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    |||||||||||| || || |||||| || | ||  |||||||    
T  1427771 ttagttatttattgcaaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaatgctattatagtaaaagtaaaaattattgtataagaaaaagtaaca 1427870  T
Q  227 atcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
     | ||    ||| || |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1427871 tttatagtgtatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgataattaaaaaggaacg 1427927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24781916 - 24781810
Alignment:
Q  90 caatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24781916 caatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattat 24781817  T
Q  190 agtaaaa 196  Q
    |||||||    
T  24781816 agtaaaa 24781810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 1038073 - 1038245
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg-ttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1038073 gttcctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatatta 1038172  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  1038173 tccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaaatcattataataaaa 1038245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 1044979 - 1045151
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg-ttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1044979 gttcctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatatta 1045078  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  1045079 tccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaaatcattataataaaa 1045151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 52649976 - 52649716
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||| | |||||  |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  52649976 gttcctttttaaatgtccttttcatagaaaagttttgtttatatttaattatcactttcaaagttcaaagcaatattaaatgttgttttaccaatattac 52649877  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||   ||||| | ||||  | |  |||||| ||||||||||||||    
T  52649876 ccttagttatttattacagagagtgaaatatatgaaacaagatattaaatgaatgaggctattattggaaaaggatatattattgtatcaaaagtagtaa 52649777  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    || | |||   | | ||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52649776 catttattgattgtcttgattagtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 52649716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8464696 - 8464585
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8464696 gttcgtttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 8464597  T
Q  125 ccttagttattt 136  Q
    ||||||||||||    
T  8464596 ccttagttattt 8464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48265283 - 48265082
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  48265283 gttcttttttaagtgtcacttttcgagattttttttgttcctatttaagtgtcactttacgtagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatatta 48265184  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  48265183 cccttatttatt-attatggagagagaaatatatgtaatgagacattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagca 48265085  T
Q  224 aca 226  Q
    |||    
T  48265084 aca 48265082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 17013412 - 17013683
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17013412 gttcctttttaagtgtttcttttggagaattttttttcttctatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 17013511  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag---at-attaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||   || |||||||||||||| | |||||||||||| ||    || ||  ||||||||||    
T  17013512 ctttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgaatgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcgttgttctatcaaaagta 17013611  T
Q  221 gtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||| | |||   | ||||||||| ||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17013612 gtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgttttaaattgacacttaaaaaggaacggaggtagta 17013683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 289
Target Start/End: Original strand, 46096581 - 46096800
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  46096581 atttaactgtcactt---aaattcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttagttattaattatggggagagaaatatataaaatgaga 46096677  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtg 266  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||| | | |||   | ||||| | | | |||||| |||||| |||    
T  46096678 tattaaatgaataagattattgtagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattgatgtgtataaaatatcaaaaagtg 46096777  T
Q  267 acaattaaaaaggaacggatgta 289  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  46096778 acaattaagaaggaacagatgta 46096800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38818147 - 38818016
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 149  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38818147 agaaattttttatttctatttaactgtcacttttaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttagcaacattacccttagttatttattacggagagag 38818048  T
Q  150 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  38818047 aaatatgtgaaataatatattaaatgaataag 38818016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1039614 - 1039445
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||   |||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1039614 gttcctttttaattgtcacctttagagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattac 1039515  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaa 195  Q
     ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1039514 acttagatatttattgc-aagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaa 1039445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1046520 - 1046351
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||   |||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1046520 gttcctttttaattgtcacctttagagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattac 1046421  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaa 195  Q
     ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1046420 acttagatatttattgc-aagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaa 1046351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 52759018 - 52759278
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| |      
T  52759018 gttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgc 52759117  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||   |||||| | |||| | || |||||| || ||||||||| |    
T  52759118 ccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataattaaaacataagttattgtataaaaagtagtga 52759217  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     |  ||||   | | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52759218 aatacatttagtgtcttggtttgtgtataaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacgga 52759278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 285
Target Start/End: Original strand, 5598145 - 5598295
Alignment:
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  5598145 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaa----------attgcatcaaaagtagtaa 5598234  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     ||| |||   | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5598235 taattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacgga 5598295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 281
Target Start/End: Original strand, 42800139 - 42800352
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||     
T  42800139 tatttaactgttactttcaaa-ttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatccttatatatttatt--ggagagagaaacatatgaaatgaa 42800235  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaat-acaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatg 264  Q
    ||||||||| |||||   |||| |||||||| | | ||   |||| ||||| |||||||||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| |    
T  42800236 atattaaattaataatgccattttagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaagagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaag 42800335  T
Q  265 tgacaattaaaaaggaa 281  Q
    |||||||||||||||||    
T  42800336 tgacaattaaaaaggaa 42800352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37296972 - 37296745
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  37296972 gttcgtttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaacgcaacattgaatattattttaccaatattat 37296873  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||  || ||||||||| |||||| | |   ||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  || ||  ||||||||||||||    
T  37296872 ccttacttatttatt-aggggagagaaatgtatgaagttactgattaaataaataagattat--tagtaaaaatagacattgttctatcaaaagtagtaa 37296776  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaat 255  Q
    || | |||   | ||||||||| ||||||||    
T  37296775 catttattgaatgtattggtttgtgtaaaat 37296745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 48174919 - 48174748
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| | |||||  |||||||     
T  48174919 gttcctttttaattgttatttttagagaaattttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcatagttaaatgctcttttatgaatattac 48174820  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  48174819 ccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaa 48174748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8008374 - 8008245
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||    
T  8008374 atttaactgtcacttttaaagatcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattactcttaattatttattgtggagagagaagtatatgaaagaaga 8008275  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaa 196  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8008274 tattaaattaataagatcattatggtaaaa 8008245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Original strand, 19093258 - 19093367
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19093258 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattat 19093357  T
Q  125 ccttagttat 134  Q
    ||||||||||    
T  19093358 ccttagttat 19093367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 33720582 - 33720774
Alignment:
Q  100 ttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaat- 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |     
T  33720582 ttaaatgttgttttaccaatattacccttaaatatt-attgcggagagagaaaaacatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaagta 33720680  T
Q  199 acaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||   |||| ||||||| ||||| || | |||    || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33720681 aaaaacaattgtatcaaaaatagtatcatttattgataatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaagaaacggatgtagta 33720774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 282
Target Start/End: Original strand, 2572016 - 2572217
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 179  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| |||||| | |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  2572016 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattacctttatatatttattgcagagagtgaaatatatgaaatgaaatattaaataatta 2572115  T
Q  180 agatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 279  Q
    || | ||||||| ||||| | || |||||  |||||||||||||| ||| |||   ||| ||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2572116 aggttattatagaaaaaagataatttattatatcaaaagtagtaaaaat-atttattatcttgatatgtgtaaaaagtcaaaatgagacaattaaaaagg 2572214  T
Q  280 aac 282  Q
    |||    
T  2572215 aac 2572217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 5597814 - 5597920
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  5597814 ttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacc 5597913  T
Q  126 cttagtt 132  Q
    |||||||    
T  5597914 cttagtt 5597920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 35605453 - 35605555
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35605453 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgtttaaatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaaaattaaatgttgttttaccaatattatcctta 35605552  T
Q  130 gtt 132  Q
    |||    
T  35605553 gtt 35605555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 11248805 - 11248970
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11248805 ttgtttctaattaagtgtcgctttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttgattatttatttcagagagagaaatatatg 11248904  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| | | ||||  ||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  11248905 aaatgagatattacatgatgaaggttactataagaaaaagataaattattgtatcaaaagtagtaa 11248970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8973700 - 8973442
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||  ||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||    
T  8973700 ctgttcctttataattgtcttttttacatcaaaattttgtttctaattaactgttgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgattttacctatatt 8973601  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  | ||||||| ||||| | || || ||| || |||||||||    
T  8973600 acccttatatatttattgtagggagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattgatgttattataggaaaaagataaattgttgtataaaaagtagt 8973501  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    || ||  ||| | | | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8973500 aa-aagtatttgttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaaggaac 8973442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42787481 - 42787334
Alignment:
Q  77 cactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 176  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |  |||||||||||||    
T  42787481 cactttcaaaattcaatggaatattaactgttcttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatacattatacaagatattaaatga 42787382  T
Q  177 ataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| | ||||| |  |||  | || |||||| ||||||||||||||    
T  42787381 ataaggttattattgagaaaggataaattattgtatcaaaagtagtaa 42787334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 176
Target Start/End: Original strand, 50152422 - 50152574
Alignment:
Q  24 tgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||  | |||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  50152422 tgttcctttttaattgtcgcttttgcataaatgttttgtttctaattaacttttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttatta 50152521  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 176  Q
     ||||  ||||||||||  || | | || |||||||||| |||||||||||||    
T  50152522 cccttgattatttattgtagaaatataattatatgaaataagatattaaatga 50152574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 1428210 - 1428302
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaa 118  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  1428210 ttcctttttaagtatcagttttagagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaataataaaggttggtttaccaa 1428302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Original strand, 1859112 - 1859337
Alignment:
Q  52 aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    ||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||    ||||||||    
T  1859112 aaattttttatttttagttaagtgtcattttcaaagtttaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttatatatttatt--atagagagaa 1859209  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||  |||| | || |||||  ||| |||||||||| ||  ||| | | | ||| ||||||||    
T  1859210 gtatatgaaatgagatattagatgattaaggttgttatag--aaaaaaaaaattattttatctaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttgatttatgta 1859306  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  1859307 aaaagttaaaatgtgataattaaaaaggaac 1859337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 52825297 - 52825401
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |  ||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  52825297 ttttttgtttttaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttaataatttattgtagagagagaaata 52825396  T
Q  155 tatga 159  Q
    |||||    
T  52825397 tatga 52825401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 292
Target Start/End: Original strand, 1428519 - 1428662
Alignment:
Q  149 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttat 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| || || |||||| || | ||  | ||||| | ||||| ||| || |||| |    
T  1428519 gaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattaggtatcttagtttgt 1428618  T
Q  249 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1428619 gtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaaaaggaacagatgtagta 1428662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 139
Target Start/End: Original strand, 36850660 - 36850747
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  36850660 agaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttc-atgcaatattaaatg-tattttaccaatattacttttagttatttatt 36850747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 282
Target Start/End: Original strand, 10630461 - 10630657
Alignment:
Q  84 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 183  Q
    ||||||||||| | |||||||| | | |||||| |||||| |||||  ||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||||||| | |||| |    
T  10630461 aaagttcaatgtatcattaaatatggctttacctatattacccttatatatttattgca-agataaaaatatatgaaatgaagtattaaataattaaggt 10630559  T
Q  184 cattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
     ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||| ||  ||| | | | ||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10630560 tattatagaaaaaagataatttgttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttaatttatgtaaaaagtcaaaatgaaacaattaaaaaggaac 10630657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 41155296 - 41155521
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    ||||||||  || |||||||||  ||||||| ||||||  | ||||||||||  ||||||| |||||| | |||  |||||||||  |||  ||||| ||    
T  41155296 tttttgtttttaattaactgtcgttttcaaaattcaatttatcattaaatgtaattttacctatattacctttatatatttattggagaggaagaaaaat 41155395  T
Q  156 atgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaat 255  Q
    |||||||||  |||||||| | |||| | ||||||  ||||| | || || |||  ||||||||||||| ||  ||| | ||| ||| ||| ||||||||    
T  41155396 atgaaatgaagtattaaataattaaggttattatacgaaaaagataatttgttgtctcaaaagtagtaa-aagtatttgttatcttgatttgtgtaaaat 41155494  T
Q  256 gtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    
T  41155495 gtcaaaataagacaattaaaaaggaac 41155521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38569812 - 38569718
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 174  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||  ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  38569812 tttcaaagtccaatatatcattaaatgtggttttacctctattacccttatatatttattgccgagagagaaatatatggaatgaagtattaaat 38569718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 283
Target Start/End: Original strand, 35605722 - 35605846
Alignment:
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |  ||||  ||||||| || ||| | | |||   | ||||||||| |||||||||||    
T  35605722 aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattatatcaaaattaataatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtc 35605821  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    |||  ||||||||||||||||||||    
T  35605822 aaatagtgacaattaaaaaggaacg 35605846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Original strand, 3684786 - 3684876
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||   ||||| ||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3684786 ctttttaaatgtcttttttgaaga---ttttttttcttatttaactgttatttttaaaattcaatgcaatattaaatgttgttttactaatatt 3684876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 282
Target Start/End: Original strand, 45230722 - 45230764
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45230722 ttggtttatgtaaaaagtcaaaatgtaacaattaaaaaggaac 45230764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 1677206 - 1677255
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaact 74  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1677206 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaact 1677255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48264808 - 48264756
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48264808 ttggtttgtataaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 48264756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Original strand, 43952983 - 43953017
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43952983 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 43953017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Original strand, 45230030 - 45230124
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 174  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| | |||  | |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  45230030 tttcaaagtctaatgtatcattaaatgtggctttgtctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaat 45230124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 49756678 - 49756764
Alignment:
Q  82 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||  || |||||  |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  49756678 tcaaagttcaatgcaacaataattattgttttgtcaattatacccttaagtatttattgcagagatagaaatatgtgtaatgagata 49756764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22154754 - 22154705
Alignment:
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 174  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  22154754 ccttagtaatttattgcagagaaagaaatatatgaaatatgatattaaat 22154705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42787181 - 42787140
Alignment:
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42787181 tttaggtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 42787140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26470974 - 26470718
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26470974 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattat 26470875  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26470874 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 26470775  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    |||| |||   | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26470774 caattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 26470718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Original strand, 8992536 - 8992808
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8992536 ctgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatatt 8992635  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8992636 atccttagttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagt 8992735  T
Q  223 aac-aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||| ||| | |   ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8992736 aacaaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaagggatgtattaat 8992808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Original strand, 9016983 - 9017255
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9016983 ctgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatatt 9017082  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9017083 atccttagttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagt 9017182  T
Q  223 aac-aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||| ||| | |   ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9017183 aacaaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaagggatgtattaat 9017255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 17193148 - 17193420
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17193148 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 17193247  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |     
T  17193248 ccttagttatttattgcggagagagatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaataataacttattgcatcaaaagtaggat 17193347  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    ||||  ||   | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17193348 caattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaataat 17193420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 24663369 - 24663638
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24663369 gttcctttttaagtatcacttttggagaaaatttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 24663468  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||     
T  24663469 tcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatat 24663568  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24663569 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 24663638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1751682 - 1751415
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1751682 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactttcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 1751583  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  1751582 ccttaattatttattgcagagaaagaaatatatgaaaagagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtat 1751483  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1751482 caattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 1751415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 3621577 - 3621847
Alignment:
Q  22 cctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 121  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3621577 cctgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaaatttatttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttctaccaatat 3621676  T
Q  122 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3621677 tatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtag 3621776  T
Q  222 taacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || ||||  ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3621777 tatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 3621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 22050039 - 22050307
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |     
T  22050039 gttcctttttaatcgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatat-ac 22050137  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22050138 ccttaaatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 22050237  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    |||| |||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22050238 caattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 22050307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17124202 - 17123980
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17124202 ttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga--gagaaatata 17124105  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||   | | || |||| |||||||||    
T  17124104 tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatg 17124005  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17124004 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 17123980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 276
Target Start/End: Original strand, 373713 - 373964
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  373713 gttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaattttaaatgttgttttaccaatattgt 373812  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||     
T  373813 cattatttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtat 373912  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 276  Q
    ||||   |   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  373913 caattgctgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 373964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 23777286 - 23777557
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23777286 gttcctttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 23777385  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||    
T  23777386 ccttgctcatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaa 23777485  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    || | |||   | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  23777486 catttatttaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtaataataa 23777557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23923964 - 23923697
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23923964 gttcctttttaagtgtcacttttggagagattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacgttaaatgctgttttatcaatattat 23923865  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||||     
T  23923864 ccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaactgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacattaaaagtagtat 23923765  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23923764 caattgttgattgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggatgtagta 23923697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 294
Target Start/End: Original strand, 12732198 - 12732434
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12732198 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccactattatcct-agttatttattgcggagagagaaatata 12732296  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  |||  | | ||| ||| |||||||||    
T  12732297 tgaaatgaaatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttgttttgtgtaaaatg 12732396  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12732397 ttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaat 12732434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 8176426 - 8176680
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  8176426 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgtt---ttaccaatattat 8176522  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  8176523 cttttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaa 8176622  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||| |||   | | ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  8176623 caattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaagaac 8176680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 17835883 - 17836150
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17835883 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgttactttcaaattttaatgcaacattaaatgtttttttaccaatattat 17835982  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| |     
T  17835983 ccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagaat 17836082  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17836083 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaatatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 17836150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22784918 - 22784658
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22784918 ttcctttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 22784819  T
Q  126 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaac 225  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||| |    
T  22784818 cttacttatttattgtggagagaaaaatatattaaataaattattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatacattattgtatcaaaagtagtatc 22784719  T
Q  226 aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggat 286  Q
    | | |||   ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22784718 atttattgaatatcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggat 22784658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 30388711 - 30388901
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30388711 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattat 30388810  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaa 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  30388811 gcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaa 30388901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9838373 - 9838106
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  9838373 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 9838274  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||    
T  9838273 ccttagttatttattgcggagagggaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 9838174  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | | ||| ||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  9838173 catttattgattgttttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 9838106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30416296 - 30416059
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30416296 ttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagttatttatggcggagagagaaata 30416197  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa 254  Q
    |||||||    |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||   | | |||||||||||||||    
T  30416196 tatgaaacagaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaa 30416097  T
Q  255 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30416096 tgtcaacatatgataattaaaaaggaacggaggtagta 30416059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 364794 - 364526
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  364794 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcattttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgtttttaccaatattg 364695  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |    
T  364694 tcattaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaagaaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaaga 364595  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     ||||  ||   | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  364594 tcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 364526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17251488 - 17251239
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||      
T  17251488 ttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcaa 17251389  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaaca-atcattagctatattg 242  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| ||||||||||||||||  | |||   | | |||    
T  17251388 agagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaagcaattgtatcaaaagtagtaacacttaattgattgtcttg 17251289  T
Q  243 gtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17251288 gtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 17251239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 34607088 - 34607356
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  34607088 gttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgttccaatttaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatggtgttttaccaatattat 34607187  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  || ||| ||||||||||||||    
T  34607188 ccttacttatttattgcagagagagacatatatgaaattagatattaaacgaataagattattatagtaaaagtatacattgttgtatcaaaagtagtaa 34607287  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    || |||||   | | ||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34607288 cattcattgaatgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaattaacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 34607356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7056374 - 7056121
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaact--gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc 141  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7056374 ttttagagaatttttttgtttctatttaactctgtcactttcaaaattcaatccaacattaaatgttgatttatcaatattatctttagttatttattgc 7056275  T
Q  142 ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatatt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  || ||| |||   ||| ||    
T  7056274 ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaccaaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattatctt 7056175  T
Q  242 ggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7056174 gatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggtacggaggtagtaata 7056121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32359646 - 32359424
Alignment:
Q  65 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32359646 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat-ttgttttaccaat--tatccttagttatttattgcggagagaga--tatatgaaatga 32359552  T
Q  165 gatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatg 264  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||  |||| ||||  | | ||||||| | |||||| ||||||||    
T  32359551 gatatttaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagaagtgtcaattattaattgtcttggtttgtataaaatatcaaaatg 32359452  T
Q  265 tgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32359451 taacaattaaaaaggaacggaggtagta 32359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7632245 - 7632030
Alignment:
Q  68 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7632245 tttaactgtcactttcaaagttcaaagcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagat 7632146  T
Q  168 attaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtga 267  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| |||   | | ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  7632145 gttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtaataattattgattgtcttgatttatataaaatgtcaaaaagtga 7632046  T
Q  268 caattaaaaaggaacg 283  Q
      ||||||||||||||    
T  7632045 ttattaaaaaggaacg 7632030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Original strand, 27313495 - 27313688
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27313495 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgttgatttaccaatattatcctta 27313594  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaa---tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  27313595 gttatttattgcggagagagaaatagtatatgaaatgagatgttaaatgaacaagataattatagaaaaagaataacttattgcatcaaaagta 27313688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31245000 - 31244733
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  31245000 gttcatttttaattgtcatttttagagaaattttttgtttgtatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaattcttgttttatcaatattat 31244901  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| |||||||||| ||     
T  31244900 tcttagatatttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtactac 31244801  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31244800 catttattgattgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 31244733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 33260688 - 33260962
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33260688 ctgttcctttataatggtcagttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 33260787  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||   |||| ||||||||||||    
T  33260788 acccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagt 33260887  T
Q  223 aac-----aatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||     | | |||   ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  33260888 aacattatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttataaaggaacggaggtagta 33260962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 285
Target Start/End: Original strand, 1252189 - 1252416
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttattt-attgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  1252189 ttgttcctatttaattgtctttttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttgttttattacggagagagaaatatat 1252288  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||  ||   | | || |||||| ||||||||    
T  1252289 gaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagtttatataaaatgt 1252388  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1252389 caaaatgtgataattaaaaatgaacgga 1252416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24356305 - 24356038
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  24356305 gttcctttttaattgtcacttttagagaaatttattgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattac 24356206  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||  |   || | ||||||||||||||    
T  24356205 ccttagatatttattccggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatcaacaaggtcattatagtaaaagtattagcaatggtatcaaaagtagtaa 24356106  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | | |||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24356105 catttattgattgttttggtttggataaaatatcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 24356038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11676844 - 11676599
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||      
T  11676844 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattactcttagatatttattgc-- 11676748  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattgg 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||||| | | |||   | | ||||    
T  11676747 agagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgg 11676648  T
Q  244 tttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  11676647 tttgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaaaaatgaatggaggtagta 11676599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 34730550 - 34730817
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34730550 gttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattat 34730649  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||    
T  34730650 ccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatcaaaagtagtaa 34730749  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    || |||||   | | ||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34730750 cattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatcaaaa-atgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 34730817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 297
Target Start/End: Original strand, 11128877 - 11129093
Alignment:
Q  81 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  11128877 ttcaaagttcaattcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagatacatatgaattgaaatattaaattaataa 11128976  T
Q  181 gatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||| | ||||  | | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11128977 ggtcattatagtaaaaataaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 11129076  T
Q  281 acggatgtagtaataat 297  Q
    || || |||| ||||||    
T  11129077 acagaggtaggaataat 11129093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Original strand, 52653 - 52834
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||     
T  52653 gttcctttttaagtgtttcttttggagattttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaattatgttttatcaatattac 52752  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaactta 206  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  52753 ccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataactta 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 24635698 - 24635970
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||     
T  24635698 gttcctttttaagtgtcccttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacaatgaatgttgttttaccaacattac 24635797  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||   |||||||||||  || || |||||| || | ||  |||||    
T  24635798 ccttagttatttattgcagagagagaaatatgtgatataagatattaaatgactaaggctattatagtaaatgtataaattattgtataagaaaaagtaa 24635897  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    || | |||   ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| || ||||||||    
T  24635898 catttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacatttaaagagaaacggaggtggtaataat 24635970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 34378849 - 34379118
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  34378849 gttcctttttaagtgtcatttttggaaaaaaaatttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 34378948  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    ||||||||||| ||  | |||||| || | ||  |||||    
T  34378949 ccttagttatttattatggagagtgaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggcttttatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaa 34379048  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 294  Q
    || | |||   | | ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34379049 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaat 34379118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 292
Target Start/End: Original strand, 1249588 - 1249796
Alignment:
Q  84 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 183  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  1249588 aaagttcaattcaattttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaatgagac 1249687  T
Q  184 cattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
     |||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||| | |||   | | || |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  1249688 aattatagtaaaaatatcaattattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttagtttatataaaatatcataaagtgacaattaaaaaggaacg 1249787  T
Q  284 gatgtagta 292  Q
     ||||||||    
T  1249788 aatgtagta 1249796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22400815 - 22400547
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22400815 gttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 22400716  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||  |  ||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||  | |||||||||||| ||    || ||  ||||||||||||||    
T  22400715 ccttacttatttattatgaggagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataatgttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtagtaa 22400616  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    || | |||   | ||||||||| |||||||||||  || |||||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  22400615 catttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaacaagaacggaggtagtaa 22400547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 224
Target Start/End: Original strand, 7235472 - 7235629
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  7235472 atttaactgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagttatttattgtggagagagggatatatgaaatgaga 7235571  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || |   ||||| ||||||||||||||    
T  7235572 tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatattgtattgtatcaaaagtagtaa 7235629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Original strand, 30237001 - 30237166
Alignment:
Q  58 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  30237001 tttgtttcaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattacccttagttatttattgttgaaagagaaatatat 30237100  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
     |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||    
T  30237101 aaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagta 30237166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17601390 - 17601131
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  17601390 ttcctttttaagtgtcacttttggagattttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattac 17601291  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaa-------aatacaacttattgcatcaaaa 217  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||       |||| || |||||| |||||||    
T  17601290 ccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaaatataaattattgtatcaaaa 17601192  T
Q  218 gtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    |||| |||| | |||   | | || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17601191 gtagcaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaag 17601131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32251170 - 32250950
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    |||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  32251170 tttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttagatatt-attgcagagagagaaatat 32251072  T
Q  156 atgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaat 255  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||| ||  ||| | | | ||||||| |||||||     
T  32251071 atgaaatgaggtattaaatgattaaggttattataggaaaaagataaattcttgcatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaa 32250973  T
Q  256 gtcaaaatgtgacaattaaaaag 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  32250972 gtcaaaatgtgataattaaaaag 32250950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Original strand, 24948252 - 24948397
Alignment:
Q  44 ttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  24948252 ttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatagtgttttactaatattacccttggatatttattgcgg 24948351  T
Q  144 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattat 189  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  24948352 agagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattat 24948397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 282
Target Start/End: Original strand, 1923869 - 1924099
Alignment:
Q  53 aattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattatccttagttatttattgcggagagagaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||   |||| ||    
T  1923869 aattttttgtttctatttaattgtcacttttaaattttaatgcaaccttaaatattgtttttatcaatattacctttagttatttattgcaatgagataa 1923968  T
Q  152 atatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgta 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| | |||   ||| ||||||||| ||    
T  1923969 atatatgaaatgagatattaaatgaataatactgttatagtaaaagtataaattatttcatcaaaattaataacatttattgattatcttggtttatata 1924068  T
Q  252 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  1924069 aaatgtgaaaaagtgacaattaaagaggaac 1924099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11431366 - 11431212
Alignment:
Q  67 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||    
T  11431366 atttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaaccttagttatttattgtcgagagataaatataggaaataaga 11431267  T
Q  167 tattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtag 221  Q
    |||||||| | |||  | ||||| |||||| || || |||||| |||||||||||    
T  11431266 tattaaattagtaaagttattatcgtaaaagtataagttattgtatcaaaagtag 11431212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 295
Target Start/End: Original strand, 7170183 - 7170412
Alignment:
Q  66 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  7170183 tatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccattattacccctaaatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaa 7170282  T
Q  166 atattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgt 265  Q
    |||||||||  ||||| | |||||| ||||| || ||   |||| |||||||||||||||| | |||   | | ||  ||| ||||||||   ||||  |    
T  7170283 atattaaatttataaggttattataataaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaaatactaaaaaat 7170382  T
Q  266 gacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7170383 ggcaattaaaaaggaacgtatgtagtaata 7170412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 283
Target Start/End: Original strand, 19811976 - 19812204
Alignment:
Q  55 ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  19811976 ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttaattatttattgtagagagagaagta 19812075  T
Q  155 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt-aaa 253  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||| |  | || |||||||||||||||||| ||  ||| | | | ||||||| ||| |||    
T  19812076 aatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataagaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaa 19812175  T
Q  254 atgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 283  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19812176 aactcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacg 19812204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Original strand, 3850408 - 3850577
Alignment:
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatat--atgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  3850408 ccttagttatttattacggagggagatatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttgtggcatcaaaagtagt 3850507  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | ||||  ||   | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3850508 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 3850577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Original strand, 13597443 - 13597600
Alignment:
Q  68 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 167  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13597443 tttaattgttactttcaaagtttaatgtaaaattaa-tgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagaaagaaatttatgaaatgagat 13597541  T
Q  168 attaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaaca 226  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  13597542 attaaatgtaaaaggttattatagtaaaaatataaattattatatcaaaagtagtaaca 13597600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Original strand, 3849055 - 3849160
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3849055 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 3849154  T
Q  125 ccttag 130  Q
     |||||    
T  3849155 tcttag 3849160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31854742 - 31854570
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||||||   ||||  |||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||     
T  31854742 gttcctttttaagtgttacttttggagaaaaattttgtttttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttattttaccaacattac 31854643  T
Q  125 ccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaa 195  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  31854642 ccttagttatttattgcaaagagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaa 31854570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26485816 - 26485669
Alignment:
Q  145 gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggt 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||| | |||   | | |||||    
T  26485816 gagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggt 26485717  T
Q  245 ttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26485716 ttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 26485669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11001028 - 11000809
Alignment:
Q  57 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  11001028 ttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgcatagagagaaatata 11000929  T
Q  157 tgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatg 256  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||   ||||||| ||||| | || || ||| ||||||| |||||| ||  ||| | | | || |||| |||||||      
T  11000928 tgaaatgaagtattaaatgattaaggatattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaatagtaa-aagtatttgttgtcttagtttgtgtaaaaaa 11000830  T
Q  257 tcaaaatgtgacaattaaaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11000829 tcaaaatgtgacaattaaaaa 11000809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Original strand, 15432705 - 15432917
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||    
T  15432705 ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattactgagagataaatatatgaaatgaaata 15432804  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 268  Q
    |||||| | |||| | ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||| ||  ||| | | | || |||| |||| || |||||||| ||||    
T  15432805 ttaaattattaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttagtttgtgtagaaagtcaaaatatgac 15432903  T
Q  269 aattaaaaaggaac 282  Q
    ||||||||||||||    
T  15432904 aattaaaaaggaac 15432917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19645925 - 19645846
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatta 102  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19645925 ctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaacatta 19645846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1135425 - 1135165
Alignment:
Q  26 ttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||     |||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||     
T  1135425 ttcctttttaagtgtctcttttatagaaaatttttgtttctatttaactatcact----gagttcaatgcaatattaaa---tgttttatcaatattatt 1135333  T
Q  126 cttagttatttat-tgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||| |||| |    ||||| |||||  |||||  |||||||||||||||| | | ||| | | ||||  | || |||||  |||||||||| |||    
T  1135332 cttagttaattatatagatagagaaaaataattgaaacaagatattaaatgaatatggttatttttggaaaaggataatttattatatcaaaagtaataa 1135233  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    || | |||   | ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1135232 catttattgagtttatcggtctctgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 1135165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2381216 - 2381061
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagata 168  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||   |    
T  2381216 ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtattattaaatgtggctttacctatattacccttatatatttattgcaaagagagaaatatatgaaatgaagca 2381117  T
Q  169 ttaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| | |||| | ||||||| ||||| | || || ||| ||||||| ||||||    
T  2381116 ttaaataattaaggttattataggaaaaagataatttgttgtatcaaaaatagtaa 2381061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 290
Target Start/End: Original strand, 53798 - 53886
Alignment:
Q  203 cttattgca-tcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtag 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||   | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53798 cttattgcaatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtatatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtag 53886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 7632464 - 7632584
Alignment:
Q  56 tttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatat 155  Q
    |||||||| ||| |||| ||| | |||| |||| ||||| | || ||||||||||||||   ||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||    
T  7632464 tttttgtttctaattaaatgttattttctaagtccaatgaatcaataaatgttgttttatttatattactcttagatatttattgtagagataaaaatat 7632563  T
Q  156 atgaaatgagatattaaatga 176  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7632564 atgaaatgagatattaaatga 7632584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 292
Target Start/End: Original strand, 30388971 - 30389023
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30388971 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 30389023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 113
Target Start/End: Original strand, 11835095 - 11835158
Alignment:
Q  50 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  11835095 agaaattctttgttcctatttaagtatcactttcaaagttcaatggagcaataaatgttgtttt 11835158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 24949255 - 24949366
Alignment:
Q  183 tcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 282  Q
    |||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||| | |||   | | ||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  24949255 tcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaaggaac 24949354  T
Q  283 ggatgtagtaat 294  Q
    ||| ||||||||    
T  24949355 ggaggtagtaat 24949366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19645847 - 19645702
Alignment:
Q  153 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcat--caaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgt 250  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||   |||||||||||| || ||  ||||| ||  ||||||||||||||   |||   | | || |||| |||    
T  19645847 tatatgaaatgtaatattaaatgaacaaggctattatagtaaaagtataaagtattgtatatcaaaagtagtaacatctattgattgtcttagtttgtgt 19645748  T
Q  251 aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataa 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19645747 aaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaagaacggaagtagtaataa 19645702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 103
Target Start/End: Original strand, 847821 - 847864
Alignment:
Q  60 tgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 103  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  847821 tgttcctatttacttgtcattttcaaagttcaatgcaacattaa 847864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8411
Alignment:
Q  33 ttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 132  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8152 ttaagtgtcacttttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattcttcttagtt 8251  T
Q  133 atttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcatt 232  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  8252 atttattgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 8351  T
Q  233 agctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
       | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8352 gattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 8411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 49137 - 49403
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49137 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 49236  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||     
T  49237 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-aaattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtat 49335  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||  ||   | | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49336 caattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 49403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Original strand, 89383 - 89427
Alignment:
Q  248 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  89383 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacgaatgtagta 89427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1213 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1213
Description:

Target: scaffold1213; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 222 - 19
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaatt----ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222 gttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattaatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 123  T
Q  121 ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  122 ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagta 23  T
Q  221 gtaa 224  Q
    ||||    
T  22 gtaa 19  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 160; Significance: 7e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Original strand, 69094 - 69356
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69094 ctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt 69193  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| | |||    
T  69194 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt-ataat 69292  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
      ||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  69293 tgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaaggaacggaggtagta 69356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Original strand, 4506 - 4770
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |     
T  4506 gttcctttttaagcgtcttttttgaagaatttttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttattaatat-ac 4604  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4605 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaa 4704  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 291  Q
    |||| |||   | | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4705 caattattgattgtcttggtttatgtaaaat-accaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagt 4770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0831 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0831
Description:

Target: scaffold0831; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 2795 - 2999
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2795 ctgttcatttttaagtgtctcttttggagaatttttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 2894  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2895 atccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagttgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagt 2994  T
Q  223 aacaa 227  Q
    |||||    
T  2995 aacaa 2999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Original strand, 148326 - 148565
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatat 157  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  148326 ttgtttctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatccttagttatttattgcggagagagaaatataa 148425  T
Q  158 gaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgt 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||||||||||||||    
T  148426 gaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgt 148525  T
Q  258 caaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataat 297  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  148526 caaaatataacaattaaaaaggaacggaggtagtaataat 148565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 138982 - 138791
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138982 gttcctttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 138883  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  138882 tccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattgcatcaa 138791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 369394 - 369544
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaatttttt-gttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 123  Q
    ||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||    
T  369394 gttccttcttaattgtcacttttgaagaaatttttttgtttctagttaagtgtgactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattatta 369493  T
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 176  Q
     |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  369494 cccttggttatttattgc--agagagaaatatatgaaatgaaatattaaatga 369544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 492547 - 492454
Alignment:
Q  69 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaat 162  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  492547 ttaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 492454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 138778 - 138727
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 291  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138778 ttggtttgtataaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 138727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26378 - 26108
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26378 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 26279  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||     
T  26278 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaattgaatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatat 26179  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaata 295  Q
    ||||  ||   | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  26178 caattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaacgaacagaggtagtaata 26108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 292
Target Start/End: Original strand, 77112 - 77345
Alignment:
Q  59 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77112 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagtccaatgcaatattaaatgttgttttactaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatg 77211  T
Q  159 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||| ||| ||||||||||     
T  77212 aaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtt 77311  T
Q  259 aaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  77312 aaaatgtgacaattaagaaggaacggaggtagta 77345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 147379 - 147111
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  147379 gttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattac 147280  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaat-gagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||   |||| |||||||||||||    
T  147279 ccttagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaataaaaatattaaattaataaggccattatagtaaaaatgaaaacaattgtatcaaaagtagta 147180  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||| | ||||  | | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  147179 acatttattaattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 147111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14972 - 14771
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  |||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  14972 gttcctttttaagtgtcactttcggagaaactttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 14873  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||    
T  14872 ccctagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgagatattaaatgaataagtctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 14773  T
Q  225 ca 226  Q
    ||    
T  14772 ca 14771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13666 - 13633
Alignment:
Q  265 tgacaattaaaaaggaacggatgtagtaataata 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13666 tgacaattaaaaaggaacggatgtagtattaata 13633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 419694 - 419476
Alignment:
Q  74 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  419694 tgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattactcttagttatttattacggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaa 419595  T
Q  174 tgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 273  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||| | |||   | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  419594 taaataagattattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatta 419495  T
Q  274 aaaaggaacggatgtagta 292  Q
    ||||| ||| || ||||||    
T  419494 aaaagaaacagaggtagta 419476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Original strand, 7417 - 7681
Alignment:
Q  28 cctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcct 127  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  7417 cctttttaattgtcatttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattaccct 7516  T
Q  128 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||| ||  |   |||| |||||||||||||| |     
T  7517 tagatatttattgcggggagagaaacatacgaaatgaaatcttaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtaatat 7616  T
Q  228 tcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | |||   | | ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7617 ttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 7681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 490 - 223
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  490 gttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattat 391  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||    
T  390 ccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatcaaaagtagtaa 291  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 293  Q
    || |||||   | | ||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  290 cattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatcaaaa-atgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 184378 - 184194
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||     
T  184378 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattac 184279  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| || || ||||||    
T  184278 ccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattg 184194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30943 - 30676
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  30943 gttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattac 30844  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||   |||| ||||||||||||||    
T  30843 ccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaaattagcaaggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaa 30744  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     | | ||||  | | ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30743 gatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 30676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 72193 - 72067
Alignment:
Q  30 tttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 129  Q
    ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  72193 tttttaagtgtatcttttggagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattatcctta 72094  T
Q  130 gttatttattgcggagagagaaatata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  72093 gttatttattgcggagagagaaatata 72067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 292
Target Start/End: Original strand, 309 - 572
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  309 ctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttactatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaaaattactttt 408  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 228  Q
    || |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||   |||| |||||||||| ||| | |    
T  409 agatatttattgcagagagggaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaggtaaaaacaattgtatcaaaagtaataatatt 508  T
Q  229 cattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 292  Q
     |||   | | || ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  509 tattgattgtcttagtttacgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacagatggagta 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 96314 - 96052
Alignment:
Q  23 ctgttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||  | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  96314 ctgttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttatt 96215  T
Q  123 atccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagt 222  Q
    | ||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || ||||||||||||||||    
T  96214 acccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagt 96115  T
Q  223 aacaatcattagctatattggtttatgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
    || ||  ||| | | | ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  96114 aaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacgga 96052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 23130 - 23325
Alignment:
Q  29 ctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 128  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||    
T  23130 ctttttaattgtcatttttgaagaaaatttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattaccctt 23229  T
Q  129 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
     |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||||| || || | || || ||| ||||||||||||||    
T  23230 ggttatttattgccgagagaaaaatatataaaatgagatattaaatgataaaggttattataggaagaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa 23325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 195989 - 195882
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  195989 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattat 195890  T
Q  125 ccttagtt 132  Q
    ||||||||    
T  195889 ccttagtt 195882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 195738 - 195578
Alignment:
Q  124 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagta 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||| ||||||  |||||    
T  195738 tccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataagatcgttatagtaaaagtatagtttattgtatcaaacatagta 195640  T
Q  224 acaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     ||||  |    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  195639 tcaattgtcgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacgga 195578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Original strand, 1029 - 1169
Alignment:
Q  31 ttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttag 130  Q
    ||||| |||||| ||||||||||   ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  1029 ttttatgtgtcttttttaaagaataattttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttag 1128  T
Q  131 ttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatta 171  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1129 ttatttattacagaaagataaatatatgaaatgaaatatta 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6600 - 6460
Alignment:
Q  31 ttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttag 130  Q
    ||||| |||||| ||||||||||   ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6600 ttttatgtgtcttttttaaagaataattttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttag 6501  T
Q  131 ttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatta 171  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6500 ttatttattacagaaagataaatatatgaaatgaaatatta 6460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14451 - 14241
Alignment:
Q  75 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 174  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14451 gtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaat 14352  T
Q  175 gaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaa-tgtcaaaatgtgacaatta 273  Q
    ||  ||| | ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| ||| | | | ||| ||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  14351 gatgaaggttattataggaaaaaaataaattattgcatcaaaagtagtaaaaattatttgttgtcttgatttctgtaaaagactcaaaa-gtgacaatta 14253  T
Q  274 aaaaggaacgga 285  Q
    ||||||||||||    
T  14252 aaaaggaacgga 14241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 252584 - 252844
Alignment:
Q  25 gttcctttttaagtgtctattttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |  |||||     
T  252584 gttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatattgttttgtctttattac 252683  T
Q  125 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaa 224  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||| |  | || |||||| |||||||||||    
T  252684 ccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcataaaaagtagtaa 252783  T
Q  225 caatcattagctatattggtttatgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 285  Q
     ||  |||   | | ||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  252784 aaagtatttcttgtcttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaaggaacgga 252844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 292
Target Start/End: Original strand, 599 - 809
Alignment:
Q  82 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||    
T  599 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttttcaatattacccttaattatttattacaaagagagaaatatatgaaacaatatattaaatgaatgag 698  T
Q  182 atcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 281  Q
       ||||| | |||   | || |||||| |||| ||||||| | | | |||   | ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  699 gctattattggaaattgataaattattgtatcagaagtagttatatttattgattgtattgatttatgtaaaatgttaaaaagtgaaaattaaaaaggaa 798  T
Q  282 cggatgtagta 292  Q
    |||| ||||||    
T  799 cggaggtagta 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1981 - 1802
Alignment:
Q  112 ttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattgca 211  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |  |||||| |    
T  1981 ttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgta 1882  T
Q  212 tcaaaagtagtaacaatcattagctatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt-aaaaaggaacggatgtagta 292  Q
    | | ||  ||||||| | |||   | | ||||||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1881 taagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaa--gtgacagttaaaaaaggaacggaggtagta 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Original strand, 21017 - 21164
Alignment:
Q  80 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    || |||||||||||   || ||||||| |||||||||    
T  21017 tttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttactaatactattcttagtcatttatcctagatagagaaatataaataacgagatatcaaatgaata 21116  T
Q  180 agatcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 227  Q
    |    ||||||| ||||| | || |||||  |||||||||| ||||||    
T  21117 aaggtattataggaaaaagataaattattatatcaaaagtaataacaa 21164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 289
Target Start/End: Original strand, 91875 - 91924
Alignment:
Q  240 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgta 289  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  91875 ttggtttgtttaaaatgttaaaatgtgataattaaaatggaacggatgta 91924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University