View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18020_low_9 (Length: 385)

Name: NF18020_low_9
Description: NF18020
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18020_low_9
NF18020_low_9
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (41-318)||(9838106-9838383)
chr6 (41-307)||(26470718-26470984)
chr6 (41-322)||(22050029-22050309)
chr6 (40-308)||(23777275-23777543)
chr6 (41-320)||(17193138-17193417)
chr6 (34-308)||(22784662-22784936)
chr6 (41-320)||(34378839-34379118)
chr6 (41-321)||(24663359-24663639)
chr6 (41-320)||(24635688-24635967)
chr6 (41-307)||(23923708-23923974)
chr6 (51-318)||(3621580-3621847)
chr6 (41-302)||(373703-373964)
chr6 (41-318)||(1751415-1751692)
chr6 (41-318)||(24356038-24356315)
chr6 (56-308)||(1249543-1249786)
chr6 (47-307)||(17123980-17124239)
chr6 (81-318)||(30416059-30416296)
chr6 (41-307)||(8992528-8992795)
chr6 (41-307)||(9016975-9017242)
chr6 (45-318)||(17251239-17251513)
chr6 (41-318)||(8176416-8176690)
chr6 (41-318)||(17835873-17836150)
chr6 (41-319)||(34607078-34607356)
chr6 (41-318)||(31244733-31245010)
chr6 (41-318)||(33260680-33260962)
chr6 (41-319)||(34730540-34730817)
chr6 (48-318)||(364526-364797)
chr6 (40-319)||(22400547-22400826)
chr6 (38-318)||(11676599-11676875)
chr6 (69-320)||(7056122-7056375)
chr6 (41-308)||(7632031-7632292)
chr6 (41-314)||(17601121-17601401)
chr6 (41-249)||(30236958-30237166)
chr6 (171-318)||(26485669-26485816)
chr6 (107-316)||(11128877-11129086)
chr6 (41-226)||(30388701-30388886)
chr6 (42-318)||(1252147-1252423)
chr6 (41-321)||(12732157-12732435)
chr6 (79-308)||(1923869-1924099)
chr6 (41-303)||(31854488-31854752)
chr6 (40-271)||(27313479-27313713)
chr6 (48-226)||(52650-52828)
chr6 (92-264)||(7235471-7235643)
chr6 (41-318)||(32359424-32359695)
chr6 (93-315)||(11431144-11431366)
chr6 (80-308)||(7170171-7170399)
chr6 (40-312)||(32250942-32251212)
chr6 (41-308)||(19811936-19812203)
chr6 (41-312)||(15432651-15432921)
chr6 (41-208)||(24948223-24948390)
chr6 (41-303)||(11000809-11001070)
chr6 (129-267)||(13597477-13597615)
chr6 (179-320)||(19645704-19645847)
chr6 (41-149)||(3849045-3849153)
chr6 (151-318)||(3850408-3850577)
chr6 (40-318)||(1135165-1135437)
chr6 (211-321)||(24949257-24949367)
chr6 (41-124)||(19645850-19645933)
chr6 (41-285)||(2381027-2381270)
chr6 (237-316)||(53807-53886)
chr6 (82-202)||(7632464-7632584)
chr6 (230-318)||(30388935-30389023)
chr6 (100-217)||(30734542-30734659)
chr6 (65-167)||(847800-847902)
chr6 (83-217)||(29260293-29260427)
chr6 (100-217)||(17942546-17942661)
chr6 (74-146)||(11835093-11835165)
chr6 (39-67)||(25056399-25056427)
chr6 (287-319)||(28778259-28778291)
chr6 (287-319)||(28784274-28784306)
chr6 (246-318)||(30237425-30237496)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (41-320)||(35700353-35700632)
chr1 (41-308)||(10506793-10507058)
chr1 (46-318)||(32347963-32348234)
chr1 (41-318)||(30686391-30686668)
chr1 (41-320)||(32168290-32168569)
chr1 (40-315)||(9361952-9362227)
chr1 (41-318)||(37609284-37609558)
chr1 (41-319)||(13507750-13508028)
chr1 (41-319)||(13514938-13515216)
chr1 (41-318)||(35531275-35531552)
chr1 (41-315)||(19929449-19929723)
chr1 (41-318)||(10675882-10676159)
chr1 (41-318)||(13699154-13699431)
chr1 (44-320)||(19349357-19349633)
chr1 (41-320)||(21927676-21927953)
chr1 (40-319)||(38597569-38597849)
chr1 (41-320)||(36318333-36318611)
chr1 (41-320)||(51613391-51613670)
chr1 (48-314)||(35255473-35255739)
chr1 (41-318)||(45368068-45368345)
chr1 (41-318)||(50825553-50825829)
chr1 (41-305)||(15660567-15660831)
chr1 (41-285)||(19455413-19455655)
chr1 (41-320)||(37437031-37437310)
chr1 (51-318)||(43500496-43500763)
chr1 (41-318)||(1429264-1429541)
chr1 (41-320)||(13566656-13566938)
chr1 (41-318)||(32994450-32994730)
chr1 (40-315)||(51974154-51974429)
chr1 (41-307)||(30702281-30702547)
chr1 (46-304)||(45226571-45226829)
chr1 (41-318)||(38648437-38648714)
chr1 (41-321)||(31570614-31570894)
chr1 (47-311)||(9127653-9127919)
chr1 (41-324)||(18344306-18344589)
chr1 (41-318)||(18033806-18034083)
chr1 (41-318)||(31588720-31588996)
chr1 (40-304)||(28679000-28679264)
chr1 (49-318)||(12721428-12721697)
chr1 (48-319)||(35483760-35484029)
chr1 (41-320)||(1024536-1024815)
chr1 (39-318)||(20605604-20605883)
chr1 (41-308)||(44182740-44183005)
chr1 (52-318)||(7782942-7783207)
chr1 (41-318)||(40926733-40927000)
chr1 (53-308)||(43808890-43809151)
chr1 (45-314)||(52649713-52649982)
chr1 (56-321)||(4100886-4101151)
chr1 (41-318)||(37735119-37735396)
chr1 (41-321)||(51972258-51972538)
chr1 (41-304)||(49908173-49908439)
chr1 (34-319)||(1677189-1677456)
chr1 (41-318)||(1427660-1427935)
chr1 (41-318)||(17013402-17013683)
chr1 (46-300)||(43952773-43953017)
chr1 (94-318)||(12124677-12124901)
chr1 (85-311)||(46096573-46096796)
chr1 (41-304)||(48508113-48508376)
chr1 (55-321)||(31487756-31488022)
chr1 (46-315)||(48174656-48174924)
chr1 (41-285)||(52748997-52749239)
chr1 (126-318)||(12231051-12231243)
chr1 (48-308)||(49497139-49497399)
chr1 (47-249)||(44818440-44818642)
chr1 (39-262)||(48265072-48265295)
chr1 (152-318)||(29830844-29831010)
chr1 (134-318)||(2059792-2059976)
chr1 (44-307)||(42800091-42800352)
chr1 (154-318)||(8464237-8464401)
chr1 (34-226)||(38817997-38818184)
chr1 (133-308)||(39412501-39412676)
chr1 (41-319)||(52759008-52759286)
chr1 (41-162)||(8464585-8464706)
chr1 (39-281)||(37296745-37296984)
chr1 (116-226)||(24781806-24781916)
chr1 (41-249)||(1039417-1039624)
chr1 (41-249)||(1046323-1046530)
chr1 (49-306)||(1038071-1038332)
chr1 (49-306)||(1044977-1045238)
chr1 (56-308)||(36850640-36850884)
chr1 (85-307)||(11248805-11249027)
chr1 (51-268)||(8008200-8008414)
chr1 (41-158)||(5597803-5597920)
chr1 (149-308)||(5598143-5598292)
chr1 (123-318)||(33720579-33720774)
chr1 (185-321)||(35605722-35605858)
chr1 (44-160)||(19093251-19093367)
chr1 (175-318)||(1428519-1428662)
chr1 (39-158)||(35605436-35605555)
chr1 (50-318)||(1859084-1859347)
chr1 (106-255)||(42787329-42787478)
chr1 (83-318)||(8973432-8973666)
chr1 (51-250)||(50152423-50152622)
chr1 (105-309)||(2572015-2572218)
chr1 (41-123)||(1428199-1428281)
chr1 (99-318)||(10630450-10630667)
chr1 (41-311)||(41155255-41155524)
chr1 (195-312)||(45230652-45230768)
chr1 (44-200)||(45229968-45230124)
chr1 (81-185)||(52825297-52825401)
chr1 (104-243)||(38569675-38569814)
chr1 (41-108)||(40680631-40680698)
chr1 (246-308)||(1039062-1039124)
chr1 (246-308)||(1045968-1046030)
chr1 (257-315)||(42787136-42787194)
chr1 (41-194)||(49756611-49756764)
chr1 (41-104)||(2571929-2571992)
chr1 (240-320)||(47591450-47591530)
chr1 (41-75)||(2626785-2626819)
chr1 (100-217)||(40783716-40783833)
chr1 (100-217)||(47037911-47038028)
chr1 (83-180)||(51064796-51064893)
chr1 (46-140)||(3684777-3684868)
[»] chr8 (140 HSPs)
chr8 (41-314)||(43553020-43553292)
chr8 (41-267)||(12763415-12763640)
chr8 (37-319)||(14263520-14263802)
chr8 (41-318)||(15596324-15596601)
chr8 (41-318)||(14061132-14061409)
chr8 (41-318)||(23429889-23430166)
chr8 (42-318)||(33935043-33935319)
chr8 (43-318)||(6757388-6757663)
chr8 (41-318)||(167460-167737)
chr8 (41-305)||(34046831-34047095)
chr8 (41-319)||(23848538-23848816)
chr8 (41-319)||(34981809-34982087)
chr8 (41-318)||(38482775-38483046)
chr8 (41-318)||(18291444-18291720)
chr8 (41-320)||(13173909-13174188)
chr8 (41-307)||(9954629-9954895)
chr8 (41-320)||(7483724-7484001)
chr8 (41-320)||(8730810-8731087)
chr8 (40-319)||(35052032-35052311)
chr8 (41-318)||(39303498-39303776)
chr8 (41-323)||(23855536-23855819)
chr8 (44-320)||(18842513-18842788)
chr8 (51-318)||(35296034-35296301)
chr8 (41-320)||(36058213-36058491)
chr8 (41-307)||(2335413-2335679)
chr8 (43-318)||(38128530-38128798)
chr8 (41-324)||(2888445-2888728)
chr8 (41-279)||(17718483-17718721)
chr8 (41-318)||(3720660-3720937)
chr8 (41-318)||(21651729-21652006)
chr8 (88-321)||(26740117-26740350)
chr8 (55-315)||(12342600-12342860)
chr8 (41-318)||(19972260-19972536)
chr8 (41-318)||(21020297-21020573)
chr8 (41-318)||(25812732-25813008)
chr8 (41-317)||(26062688-26062963)
chr8 (41-319)||(10180350-10180628)
chr8 (41-318)||(14228305-14228582)
chr8 (93-311)||(43641979-43642197)
chr8 (41-318)||(25703561-25703837)
chr8 (93-308)||(1245344-1245559)
chr8 (43-234)||(6750597-6750788)
chr8 (41-304)||(16656681-16656943)
chr8 (41-318)||(12248753-12249031)
chr8 (51-318)||(23793254-23793525)
chr8 (97-319)||(32010066-32010288)
chr8 (48-319)||(8453218-8453486)
chr8 (41-320)||(8553997-8554276)
chr8 (41-312)||(33314523-33314795)
chr8 (41-318)||(45281361-45281638)
chr8 (41-318)||(38221793-38222069)
chr8 (66-307)||(40228300-40228541)
chr8 (41-220)||(13327759-13327938)
chr8 (40-319)||(11993872-11994139)
chr8 (81-319)||(35498053-35498290)
chr8 (40-249)||(43553295-43553504)
chr8 (41-226)||(11707560-11707741)
chr8 (41-315)||(17074568-17074840)
chr8 (41-315)||(17573430-17573702)
chr8 (41-303)||(27518711-27518967)
chr8 (95-318)||(27911655-27911878)
chr8 (95-318)||(27958074-27958297)
chr8 (41-288)||(40603864-40604111)
chr8 (83-309)||(4057310-4057536)
chr8 (41-308)||(31028634-31028900)
chr8 (53-319)||(14511411-14511686)
chr8 (44-205)||(16700989-16701150)
chr8 (146-318)||(36111926-36112096)
chr8 (93-304)||(1202441-1202652)
chr8 (41-318)||(11163246-11163523)
chr8 (46-318)||(38074261-38074532)
chr8 (41-318)||(9687497-9687759)
chr8 (41-249)||(35051828-35052034)
chr8 (80-319)||(41701464-41701703)
chr8 (87-249)||(9808026-9808188)
chr8 (41-318)||(13132101-13132376)
chr8 (94-248)||(15647452-15647606)
chr8 (94-246)||(3513390-3513542)
chr8 (41-206)||(40521337-40521503)
chr8 (93-321)||(2456095-2456318)
chr8 (37-307)||(6660929-6661199)
chr8 (37-307)||(6741331-6741601)
chr8 (94-248)||(15623664-15623818)
chr8 (48-249)||(43553502-43553704)
chr8 (52-316)||(7605885-7606146)
chr8 (49-250)||(41890510-41890711)
chr8 (39-323)||(29125880-29126163)
chr8 (79-314)||(39615440-39615674)
chr8 (47-319)||(15281379-15281636)
chr8 (47-319)||(15461748-15462005)
chr8 (41-308)||(45317632-45317899)
chr8 (154-318)||(35029640-35029803)
chr8 (143-318)||(41643473-41643648)
chr8 (41-318)||(8954682-8954959)
chr8 (56-307)||(10086150-10086398)
chr8 (179-318)||(41308013-41308153)
chr8 (43-308)||(9301536-9301799)
chr8 (48-313)||(42352726-42352989)
chr8 (38-272)||(13935105-13935339)
chr8 (218-308)||(31964726-31964816)
chr8 (41-180)||(41305624-41305763)
chr8 (84-318)||(11727606-11727839)
chr8 (151-320)||(8672584-8672753)
chr8 (44-156)||(8672285-8672397)
chr8 (110-208)||(17313126-17313224)
chr8 (212-318)||(13328121-13328227)
chr8 (41-250)||(27193104-27193313)
chr8 (39-148)||(35028586-35028693)
chr8 (41-302)||(30205440-30205697)
chr8 (104-298)||(11015868-11016062)
chr8 (238-308)||(29091078-29091148)
chr8 (49-304)||(40608022-40608281)
chr8 (249-309)||(1739881-1739941)
chr8 (201-318)||(17313282-17313399)
chr8 (76-248)||(40602810-40602982)
chr8 (69-180)||(26628844-26628955)
chr8 (70-180)||(28568056-28568166)
chr8 (70-180)||(28575649-28575759)
chr8 (244-318)||(35052305-35052379)
chr8 (70-150)||(41644317-41644395)
chr8 (216-304)||(11707451-11707539)
chr8 (83-207)||(12489737-12489861)
chr8 (70-222)||(28562518-28562669)
chr8 (41-318)||(31760009-31760286)
chr8 (209-304)||(39663927-39664021)
chr8 (246-321)||(43552948-43553023)
chr8 (271-308)||(17718906-17718943)
chr8 (100-217)||(37345672-37345789)
chr8 (69-138)||(38238925-38238994)
chr8 (41-89)||(32010315-32010362)
chr8 (41-89)||(36112103-36112150)
chr8 (88-151)||(33751227-33751290)
chr8 (135-200)||(10013317-10013382)
chr8 (41-74)||(11163490-11163523)
chr8 (100-217)||(11174282-11174399)
chr8 (100-217)||(40058362-40058479)
chr8 (100-217)||(40918790-40918907)
chr8 (105-202)||(43929788-43929885)
chr8 (100-216)||(7147015-7147131)
chr8 (41-73)||(13174154-13174186)
[»] chr2 (93 HSPs)
chr2 (40-318)||(13000897-13001175)
chr2 (41-319)||(13753935-13754213)
chr2 (41-318)||(26342560-26342837)
chr2 (39-318)||(11222302-11222581)
chr2 (41-308)||(14541311-14541578)
chr2 (37-323)||(15893561-15893847)
chr2 (41-318)||(10812179-10812456)
chr2 (44-322)||(44360417-44360694)
chr2 (43-318)||(478959-479235)
chr2 (41-320)||(31024924-31025203)
chr2 (41-308)||(32543783-32544049)
chr2 (41-320)||(34399182-34399461)
chr2 (41-319)||(15182986-15183264)
chr2 (41-318)||(14295743-14296020)
chr2 (41-318)||(41885605-41885882)
chr2 (50-313)||(30264593-30264856)
chr2 (51-319)||(9706778-9707045)
chr2 (46-318)||(37093435-37093706)
chr2 (41-304)||(9369954-9370217)
chr2 (61-319)||(3363584-3363842)
chr2 (41-318)||(35158337-35158614)
chr2 (43-321)||(25558169-25558444)
chr2 (41-315)||(43077272-43077546)
chr2 (38-318)||(19594328-19594607)
chr2 (41-318)||(14288411-14288686)
chr2 (41-318)||(32854768-32855043)
chr2 (41-318)||(13215373-13215650)
chr2 (41-321)||(11560030-11560310)
chr2 (40-237)||(32674190-32674391)
chr2 (41-323)||(34357158-34357440)
chr2 (49-318)||(36375559-36375830)
chr2 (41-316)||(13965587-13965862)
chr2 (41-303)||(36404842-36405105)
chr2 (59-320)||(4883601-4883862)
chr2 (39-319)||(4654697-4654977)
chr2 (41-319)||(13849700-13849978)
chr2 (41-308)||(28145567-28145835)
chr2 (41-320)||(1395544-1395822)
chr2 (48-320)||(38072216-38072482)
chr2 (41-319)||(15677282-15677554)
chr2 (48-238)||(2012848-2013038)
chr2 (41-319)||(34884523-34884801)
chr2 (70-286)||(6013484-6013700)
chr2 (93-315)||(10263788-10264010)
chr2 (46-307)||(37077155-37077416)
chr2 (45-320)||(8443675-8443937)
chr2 (41-308)||(4952692-4952950)
chr2 (100-318)||(14308434-14308650)
chr2 (46-302)||(38186054-38186312)
chr2 (115-318)||(31011704-31011905)
chr2 (81-323)||(37116584-37116816)
chr2 (67-311)||(7529697-7529942)
chr2 (41-281)||(29041932-29042167)
chr2 (48-318)||(25787324-25787584)
chr2 (172-315)||(3376266-3376409)
chr2 (47-321)||(838053-838327)
chr2 (41-205)||(34309149-34309312)
chr2 (41-303)||(45065052-45065314)
chr2 (55-250)||(30544514-30544706)
chr2 (41-178)||(14284108-14284245)
chr2 (41-318)||(33947415-33947692)
chr2 (84-308)||(38148032-38148255)
chr2 (41-308)||(928030-928294)
chr2 (48-280)||(28967255-28967486)
chr2 (75-190)||(25187241-25187356)
chr2 (46-139)||(37660129-37660222)
chr2 (210-318)||(34262808-34262916)
chr2 (44-216)||(42088877-42089049)
chr2 (46-308)||(36173053-36173306)
chr2 (79-259)||(2991829-2992002)
chr2 (167-259)||(34721568-34721659)
chr2 (232-318)||(25186816-25186902)
chr2 (41-311)||(3041544-3041809)
chr2 (41-319)||(37353969-37354247)
chr2 (156-260)||(36824486-36824590)
chr2 (169-280)||(37660845-37660956)
chr2 (65-215)||(18904009-18904150)
chr2 (100-200)||(14117661-14117761)
chr2 (230-318)||(14284253-14284340)
chr2 (238-318)||(1259615-1259695)
chr2 (248-308)||(32674638-32674698)
chr2 (45-188)||(42263619-42263762)
chr2 (59-133)||(28301670-28301744)
chr2 (228-301)||(29056179-29056252)
chr2 (41-129)||(10562463-10562551)
chr2 (102-194)||(14901944-14902036)
chr2 (95-141)||(20683713-20683759)
chr2 (287-321)||(30545510-30545544)
chr2 (41-70)||(10263748-10263777)
chr2 (100-165)||(28110154-28110219)
chr2 (105-162)||(32901127-32901184)
chr2 (70-155)||(40756940-40757025)
chr2 (112-180)||(17772559-17772627)
[»] chr4 (171 HSPs)
chr4 (41-305)||(26933769-26934032)
chr4 (41-302)||(37502004-37502266)
chr4 (41-319)||(44217689-44217967)
chr4 (41-318)||(13629177-13629454)
chr4 (41-320)||(55935090-55935369)
chr4 (40-318)||(47751519-47751790)
chr4 (41-314)||(19093141-19093414)
chr4 (41-318)||(22828385-22828662)
chr4 (40-320)||(53599768-53600048)
chr4 (41-318)||(44069014-44069291)
chr4 (41-318)||(46871904-46872180)
chr4 (41-303)||(3436066-3436328)
chr4 (41-318)||(38617293-38617568)
chr4 (41-303)||(42099691-42099953)
chr4 (41-318)||(16464766-16465043)
chr4 (41-303)||(29295337-29295599)
chr4 (41-318)||(31861970-31862247)
chr4 (39-320)||(44013895-44014176)
chr4 (56-320)||(353964-354228)
chr4 (41-321)||(21044729-21045008)
chr4 (46-318)||(23719768-23720040)
chr4 (41-321)||(48782183-48782462)
chr4 (59-318)||(6195025-6195284)
chr4 (41-318)||(56576088-56576364)
chr4 (43-318)||(55147044-55147320)
chr4 (41-316)||(5374336-5374611)
chr4 (41-300)||(53125240-53125499)
chr4 (41-303)||(50623397-50623658)
chr4 (41-298)||(16664224-16664481)
chr4 (41-318)||(35232282-35232558)
chr4 (41-321)||(39671308-39671588)
chr4 (41-304)||(36408706-36408969)
chr4 (41-304)||(36422872-36423135)
chr4 (48-318)||(42629307-42629577)
chr4 (57-315)||(52257778-52258036)
chr4 (41-318)||(30939138-30939415)
chr4 (41-318)||(47251396-47251673)
chr4 (41-321)||(43887966-43888244)
chr4 (48-318)||(42513009-42513280)
chr4 (41-315)||(33809070-33809344)
chr4 (41-318)||(39683698-39683975)
chr4 (56-321)||(52057433-52057699)
chr4 (41-225)||(52677222-52677406)
chr4 (41-308)||(33084461-33084723)
chr4 (47-308)||(38542270-38542531)
chr4 (50-318)||(8735382-8735649)
chr4 (41-318)||(12252083-12252352)
chr4 (41-321)||(26620332-26620612)
chr4 (46-308)||(47596607-47596869)
chr4 (41-319)||(22678292-22678571)
chr4 (41-308)||(30151655-30151922)
chr4 (41-320)||(52061546-52061820)
chr4 (40-318)||(40411926-40412203)
chr4 (41-318)||(42133020-42133297)
chr4 (47-315)||(35231679-35231947)
chr4 (41-308)||(41414991-41415257)
chr4 (47-318)||(44549632-44549902)
chr4 (47-278)||(53691678-53691909)
chr4 (41-307)||(19527215-19527469)
chr4 (94-316)||(54231574-54231797)
chr4 (41-304)||(35381417-35381675)
chr4 (41-318)||(9220025-9220302)
chr4 (52-317)||(55702914-55703179)
chr4 (93-320)||(19399569-19399795)
chr4 (41-318)||(47428512-47428779)
chr4 (41-225)||(4201395-4201579)
chr4 (93-319)||(31369836-31370062)
chr4 (69-318)||(36659411-36659660)
chr4 (42-311)||(56499603-56499874)
chr4 (41-279)||(34361039-34361276)
chr4 (41-263)||(47093795-47094017)
chr4 (41-318)||(34603607-34603884)
chr4 (85-318)||(45725563-45725796)
chr4 (40-246)||(8741680-8741886)
chr4 (43-208)||(27492344-27492510)
chr4 (51-301)||(47884988-47885247)
chr4 (48-300)||(18781469-18781721)
chr4 (44-196)||(23623601-23623753)
chr4 (40-207)||(9834246-9834413)
chr4 (48-283)||(36750539-36750774)
chr4 (40-304)||(18135048-18135312)
chr4 (41-304)||(36292608-36292862)
chr4 (40-304)||(49122258-49122522)
chr4 (41-268)||(32239383-32239606)
chr4 (114-315)||(44176576-44176777)
chr4 (47-318)||(1180885-1181157)
chr4 (130-320)||(33755013-33755201)
chr4 (41-308)||(34464260-34464527)
chr4 (83-308)||(26906383-26906608)
chr4 (41-320)||(48509852-48510130)
chr4 (41-207)||(36750160-36750326)
chr4 (41-308)||(1146040-1146310)
chr4 (41-226)||(29833002-29833187)
chr4 (41-318)||(38009750-38010027)
chr4 (57-318)||(6091337-6091599)
chr4 (48-320)||(14090230-14090502)
chr4 (41-318)||(37551650-37551926)
chr4 (98-308)||(23237667-23237880)
chr4 (41-319)||(18091225-18091503)
chr4 (93-324)||(3036420-3036649)
chr4 (41-308)||(6150677-6150944)
chr4 (41-306)||(38865887-38866149)
chr4 (40-267)||(7242223-7242446)
chr4 (41-310)||(48087681-48087950)
chr4 (41-161)||(33755223-33755343)
chr4 (41-307)||(3802143-3802409)
chr4 (41-308)||(14949078-14949345)
chr4 (41-212)||(27918585-27918755)
chr4 (41-320)||(51654855-51655133)
chr4 (94-311)||(27654735-27654953)
chr4 (41-163)||(37394298-37394420)
chr4 (41-318)||(8456895-8457172)
chr4 (185-304)||(31984150-31984269)
chr4 (41-318)||(39308914-39309190)
chr4 (41-250)||(20294267-20294478)
chr4 (95-304)||(1615053-1615260)
chr4 (212-322)||(29511197-29511307)
chr4 (41-320)||(55430289-55430564)
chr4 (41-249)||(41813625-41813834)
chr4 (93-280)||(41955707-41955883)
chr4 (176-304)||(42645379-42645507)
chr4 (126-223)||(25098326-25098423)
chr4 (48-189)||(38617806-38617947)
chr4 (41-189)||(51347240-51347393)
chr4 (157-309)||(53467544-53467697)
chr4 (41-308)||(1391165-1391432)
chr4 (211-318)||(49089059-49089166)
chr4 (100-188)||(8752182-8752270)
chr4 (79-259)||(17978090-17978263)
chr4 (94-222)||(52978306-52978433)
chr4 (93-307)||(20087211-20087419)
chr4 (67-200)||(34925444-34925577)
chr4 (246-318)||(38027559-38027631)
chr4 (95-243)||(54029135-54029283)
chr4 (41-132)||(17698551-17698642)
chr4 (95-311)||(43086442-43086656)
chr4 (241-318)||(9834463-9834540)
chr4 (40-197)||(30151934-30152091)
chr4 (149-249)||(19731425-19731525)
chr4 (230-309)||(29832353-29832432)
chr4 (95-222)||(56486422-56486549)
chr4 (239-320)||(17698643-17698724)
chr4 (47-104)||(31984299-31984356)
chr4 (157-304)||(13435160-13435306)
chr4 (126-308)||(9746296-9746478)
chr4 (39-124)||(42645289-42645373)
chr4 (93-194)||(53219130-53219231)
chr4 (254-318)||(52677150-52677214)
chr4 (77-180)||(3588358-3588461)
chr4 (83-222)||(6128991-6129129)
chr4 (83-222)||(19692819-19692957)
chr4 (83-222)||(19703404-19703542)
chr4 (44-131)||(37987536-37987623)
chr4 (246-320)||(52977911-52977985)
chr4 (47-104)||(23237399-23237456)
chr4 (88-199)||(2285584-2285693)
chr4 (106-188)||(7037047-7037129)
chr4 (100-162)||(24948658-24948720)
chr4 (256-318)||(33751327-33751389)
chr4 (192-249)||(23621905-23621962)
chr4 (266-322)||(4201310-4201366)
chr4 (106-182)||(7037159-7037235)
chr4 (275-322)||(36408969-36409016)
chr4 (275-322)||(36423135-36423182)
chr4 (41-80)||(39923770-39923809)
chr4 (41-91)||(9746231-9746281)
chr4 (95-277)||(26915966-26916143)
chr4 (45-122)||(13423758-13423835)
chr4 (252-321)||(27918841-27918910)
chr4 (41-73)||(1180885-1180917)
chr4 (274-318)||(34361706-34361750)
[»] chr5 (131 HSPs)
chr5 (40-318)||(4175460-4175738)
chr5 (41-318)||(18437303-18437580)
chr5 (41-318)||(28463365-28463642)
chr5 (41-319)||(6007845-6008125)
chr5 (41-318)||(4985155-4985431)
chr5 (41-318)||(34261274-34261551)
chr5 (41-318)||(39073006-39073283)
chr5 (41-308)||(26854085-26854351)
chr5 (41-319)||(38297595-38297874)
chr5 (41-318)||(7579647-7579925)
chr5 (41-318)||(8825019-8825296)
chr5 (41-318)||(38910236-38910512)
chr5 (41-318)||(42911512-42911788)
chr5 (44-321)||(4098296-4098573)
chr5 (46-319)||(14793769-14794042)
chr5 (41-317)||(28024240-28024516)
chr5 (41-315)||(12664820-12665094)
chr5 (41-318)||(18794745-18795022)
chr5 (41-318)||(25343922-25344199)
chr5 (41-320)||(12784421-12784699)
chr5 (41-318)||(9076028-9076310)
chr5 (41-303)||(24074833-24075095)
chr5 (41-318)||(6072414-6072691)
chr5 (41-318)||(8229784-8230060)
chr5 (46-318)||(36239424-36239697)
chr5 (41-318)||(40198750-40199027)
chr5 (41-308)||(38702103-38702370)
chr5 (41-318)||(4427385-4427663)
chr5 (41-318)||(38363153-38363428)
chr5 (41-314)||(1795101-1795374)
chr5 (41-318)||(16124240-16124517)
chr5 (41-318)||(28446965-28447241)
chr5 (41-308)||(7403816-7404081)
chr5 (41-320)||(12722937-12723216)
chr5 (40-293)||(32439917-32440170)
chr5 (48-316)||(2133890-2134156)
chr5 (41-313)||(5143983-5144255)
chr5 (40-304)||(10359229-10359493)
chr5 (48-301)||(32388953-32389208)
chr5 (67-308)||(18020758-18020999)
chr5 (39-318)||(9127331-9127610)
chr5 (47-319)||(6754158-6754427)
chr5 (41-318)||(38017257-38017528)
chr5 (41-321)||(5842970-5843250)
chr5 (41-281)||(21606275-21606515)
chr5 (57-323)||(26906470-26906734)
chr5 (40-319)||(425090-425363)
chr5 (41-318)||(1297717-1297995)
chr5 (88-322)||(7408340-7408574)
chr5 (40-280)||(19831560-19831798)
chr5 (55-307)||(4017390-4017642)
chr5 (41-308)||(5119140-5119407)
chr5 (56-308)||(6689576-6689828)
chr5 (93-320)||(1087911-1088138)
chr5 (56-315)||(12869882-12870141)
chr5 (41-308)||(24228911-24229177)
chr5 (41-320)||(31985028-31985307)
chr5 (84-322)||(39893785-39894023)
chr5 (41-318)||(37306679-37306955)
chr5 (41-318)||(38502784-38503057)
chr5 (50-321)||(2673955-2674226)
chr5 (38-249)||(31802748-31802958)
chr5 (41-283)||(4694726-4694968)
chr5 (46-180)||(25027842-25027976)
chr5 (41-307)||(18465663-18465925)
chr5 (41-318)||(31803286-31803563)
chr5 (41-321)||(40208951-40209225)
chr5 (47-318)||(13703063-13703336)
chr5 (41-318)||(37809721-37809998)
chr5 (56-303)||(4962183-4962429)
chr5 (179-318)||(25027555-25027694)
chr5 (51-306)||(37633648-37633903)
chr5 (41-307)||(37303098-37303364)
chr5 (94-318)||(38308106-38308330)
chr5 (46-318)||(21150459-21150731)
chr5 (46-318)||(21157600-21157872)
chr5 (84-308)||(3243801-3244025)
chr5 (85-308)||(13461016-13461239)
chr5 (41-313)||(18392956-18393228)
chr5 (106-306)||(7466209-7466409)
chr5 (47-226)||(4688870-4689048)
chr5 (41-308)||(25785869-25786136)
chr5 (41-184)||(42394242-42394385)
chr5 (41-318)||(9958863-9959134)
chr5 (115-318)||(22582508-22582710)
chr5 (49-305)||(12637940-12638189)
chr5 (35-313)||(18676399-18676676)
chr5 (56-304)||(3892790-3893036)
chr5 (41-318)||(24469617-24469893)
chr5 (52-280)||(11413548-11413776)
chr5 (41-226)||(38297874-38298056)
chr5 (41-318)||(13957140-13957417)
chr5 (41-318)||(4608986-4609264)
chr5 (64-323)||(8849113-8849373)
chr5 (43-148)||(10889244-10889349)
chr5 (84-249)||(7735132-7735297)
chr5 (41-322)||(40927115-40927395)
chr5 (185-307)||(6330927-6331049)
chr5 (41-309)||(4440053-4440319)
chr5 (117-321)||(18000377-18000574)
chr5 (179-303)||(3686790-3686914)
chr5 (85-309)||(17869291-17869516)
chr5 (181-303)||(42393743-42393865)
chr5 (135-285)||(23418602-23418752)
chr5 (41-318)||(36481038-36481314)
chr5 (41-180)||(3686356-3686494)
chr5 (78-252)||(38160291-38160463)
chr5 (189-303)||(30368130-30368244)
chr5 (179-297)||(31546000-31546118)
chr5 (196-303)||(10734155-10734261)
chr5 (230-308)||(38297515-38297593)
chr5 (41-161)||(30368251-30368372)
chr5 (244-318)||(7734764-7734838)
chr5 (257-318)||(10889168-10889229)
chr5 (100-174)||(6330814-6330889)
chr5 (72-141)||(35796179-35796248)
chr5 (246-314)||(31803104-31803172)
chr5 (41-108)||(249676-249743)
chr5 (253-304)||(4688815-4688866)
chr5 (41-119)||(3818159-3818237)
chr5 (41-104)||(16965754-16965817)
chr5 (210-274)||(36494138-36494204)
chr5 (151-197)||(10734559-10734605)
chr5 (40-74)||(21150698-21150732)
chr5 (40-74)||(21157839-21157873)
chr5 (41-74)||(4609231-4609264)
chr5 (230-311)||(7834052-7834133)
chr5 (100-217)||(40886669-40886786)
chr5 (41-140)||(10735457-10735554)
chr5 (102-154)||(12305688-12305740)
chr5 (44-108)||(36437451-36437515)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (40-320)||(31430538-31430818)
chr7 (46-318)||(33257866-33258138)
chr7 (39-318)||(12838064-12838343)
chr7 (41-303)||(35112409-35112671)
chr7 (41-319)||(42841851-42842129)
chr7 (42-318)||(30866722-30866998)
chr7 (41-315)||(32966038-32966312)
chr7 (41-313)||(26723904-26724177)
chr7 (41-309)||(18470287-18470555)
chr7 (51-318)||(33173797-33174064)
chr7 (41-318)||(33099821-33100096)
chr7 (41-309)||(35746640-35746907)
chr7 (40-315)||(22950807-22951082)
chr7 (41-249)||(41889372-41889580)
chr7 (41-318)||(7312596-7312874)
chr7 (41-318)||(33921760-33922037)
chr7 (41-304)||(7477198-7477461)
chr7 (51-318)||(10227246-10227513)
chr7 (55-314)||(36298164-36298423)
chr7 (50-318)||(41891258-41891527)
chr7 (41-321)||(18194197-18194477)
chr7 (50-314)||(36922228-36922493)
chr7 (41-321)||(41675170-41675449)
chr7 (41-320)||(32528312-32528591)
chr7 (48-321)||(31815052-31815322)
chr7 (41-315)||(36406730-36407008)
chr7 (41-320)||(28608575-28608853)
chr7 (41-307)||(3837842-3838108)
chr7 (40-319)||(8264926-8265207)
chr7 (41-268)||(20035028-20035255)
chr7 (41-268)||(20045439-20045666)
chr7 (41-246)||(17896581-17896786)
chr7 (110-318)||(5732059-5732267)
chr7 (41-304)||(31398932-31399194)
chr7 (41-312)||(46285837-46286108)
chr7 (44-320)||(29722289-29722564)
chr7 (41-318)||(3177910-3178187)
chr7 (41-269)||(26632215-26632443)
chr7 (52-304)||(29497534-29497786)
chr7 (41-285)||(44480161-44480405)
chr7 (41-318)||(1553495-1553770)
chr7 (41-318)||(3310196-3310462)
chr7 (41-309)||(43874078-43874345)
chr7 (41-220)||(6799103-6799283)
chr7 (44-315)||(24283565-24283833)
chr7 (175-318)||(47408227-47408370)
chr7 (126-318)||(38168774-38168967)
chr7 (88-299)||(36648011-36648221)
chr7 (135-321)||(8381900-8382086)
chr7 (41-318)||(8965886-8966163)
chr7 (41-308)||(19327787-19328049)
chr7 (40-323)||(48981360-48981644)
chr7 (44-283)||(45324011-45324243)
chr7 (146-320)||(8380576-8380750)
chr7 (42-315)||(44820596-44820858)
chr7 (50-318)||(47459633-47459895)
chr7 (41-318)||(37353855-37354122)
chr7 (41-250)||(46563177-46563386)
chr7 (100-267)||(22057447-22057620)
chr7 (40-309)||(30586672-30586940)
chr7 (41-308)||(9601889-9602156)
chr7 (41-308)||(9829460-9829727)
chr7 (93-321)||(34368643-34368870)
chr7 (56-208)||(42880962-42881114)
chr7 (47-246)||(17354084-17354283)
chr7 (41-307)||(26803426-26803693)
chr7 (41-225)||(22382153-22382337)
chr7 (41-312)||(46715304-46715565)
chr7 (40-308)||(35859945-35860212)
chr7 (46-149)||(2408817-2408919)
chr7 (50-198)||(36339303-36339453)
chr7 (99-311)||(22785918-22786129)
chr7 (246-318)||(41888980-41889052)
chr7 (49-187)||(33071894-33072032)
chr7 (172-300)||(41409872-41410000)
chr7 (41-101)||(47408118-47408178)
chr7 (195-306)||(24233668-24233779)
chr7 (240-318)||(17896477-17896555)
chr7 (237-318)||(6799595-6799676)
chr7 (41-309)||(9142259-9142524)
chr7 (41-124)||(13431311-13431394)
chr7 (228-307)||(36340553-36340632)
chr7 (83-222)||(32049435-32049574)
chr7 (232-303)||(41408793-41408864)
chr7 (100-166)||(41480627-41480693)
chr7 (230-312)||(42881118-42881199)
chr7 (41-88)||(5732271-5732318)
chr7 (237-304)||(35683212-35683279)
chr7 (178-312)||(33072162-33072296)
chr7 (83-222)||(3091613-3091748)
chr7 (41-114)||(8921026-8921099)
chr7 (102-154)||(6737254-6737306)
chr7 (41-129)||(46392612-46392700)
chr7 (78-149)||(24233167-24233238)
chr7 (182-225)||(41409701-41409744)
chr7 (106-149)||(41409765-41409808)
chr7 (100-222)||(36453183-36453305)
chr7 (41-74)||(8965886-8965919)
chr7 (100-217)||(27813912-27814029)
chr7 (169-202)||(35684261-35684294)
chr7 (39-68)||(39426215-39426244)
chr7 (44-108)||(4963046-4963110)
chr7 (41-73)||(14771015-14771047)
chr7 (41-73)||(15221467-15221499)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (41-261)||(14762-14982)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (91-318)||(419476-419703)
scaffold0001 (46-96)||(419840-419890)
[»] chr3 (123 HSPs)
chr3 (48-318)||(33491128-33491398)
chr3 (41-307)||(54898086-54898352)
chr3 (41-321)||(34266426-34266704)
chr3 (41-318)||(53745271-53745547)
chr3 (46-318)||(27039595-27039867)
chr3 (41-321)||(54106243-54106523)
chr3 (42-308)||(48151966-48152232)
chr3 (41-318)||(32980620-32980897)
chr3 (41-318)||(47069846-47070123)
chr3 (42-319)||(43775378-43775655)
chr3 (40-318)||(48214046-48214312)
chr3 (41-315)||(790530-790804)
chr3 (46-320)||(50091930-50092204)
chr3 (41-318)||(19550226-19550503)
chr3 (41-318)||(33874535-33874812)
chr3 (41-318)||(43554370-43554646)
chr3 (41-303)||(17102734-17102996)
chr3 (48-309)||(11473389-11473650)
chr3 (55-318)||(3643185-3643448)
chr3 (41-318)||(41351183-41351461)
chr3 (41-318)||(28885658-28885934)
chr3 (41-308)||(52663422-52663689)
chr3 (48-320)||(13158426-13158700)
chr3 (41-318)||(41425609-41425886)
chr3 (50-318)||(42515163-42515429)
chr3 (41-285)||(32853970-32854213)
chr3 (41-318)||(40139831-40140095)
chr3 (50-320)||(30861531-30861799)
chr3 (41-304)||(39866852-39867114)
chr3 (41-308)||(47104154-47104421)
chr3 (46-319)||(5243924-5244196)
chr3 (56-318)||(29651667-29651925)
chr3 (51-318)||(40010653-40010920)
chr3 (41-308)||(54334182-54334448)
chr3 (46-318)||(27483777-27484047)
chr3 (41-320)||(36234347-36234623)
chr3 (41-318)||(42671879-42672156)
chr3 (41-315)||(29697971-29698245)
chr3 (55-318)||(35315126-35315389)
chr3 (40-306)||(51064862-51065128)
chr3 (41-318)||(20848713-20848985)
chr3 (95-318)||(24053-24276)
chr3 (41-318)||(40318917-40319194)
chr3 (41-318)||(52627227-52627504)
chr3 (40-249)||(45513673-45513882)
chr3 (48-320)||(55141459-55141732)
chr3 (83-318)||(45101347-45101582)
chr3 (41-315)||(51244604-51244878)
chr3 (41-246)||(7328435-7328640)
chr3 (40-304)||(54911305-54911569)
chr3 (41-317)||(13167996-13168261)
chr3 (41-304)||(46973400-46973666)
chr3 (41-318)||(3376293-3376574)
chr3 (107-315)||(27992286-27992494)
chr3 (70-321)||(45145138-45145388)
chr3 (82-318)||(27028004-27028240)
chr3 (41-308)||(33074277-33074543)
chr3 (40-308)||(24981274-24981537)
chr3 (41-308)||(41168741-41169005)
chr3 (85-323)||(51697545-51697786)
chr3 (41-208)||(20105172-20105339)
chr3 (41-308)||(45055167-45055434)
chr3 (44-323)||(41926659-41926942)
chr3 (126-318)||(43945444-43945636)
chr3 (40-319)||(35077366-35077645)
chr3 (46-308)||(49168349-49168611)
chr3 (75-304)||(6902292-6902521)
chr3 (41-222)||(53281959-53282140)
chr3 (41-308)||(23771267-23771534)
chr3 (41-272)||(36370863-36371096)
chr3 (94-320)||(49123556-49123781)
chr3 (75-318)||(51219082-51219316)
chr3 (168-318)||(29458192-29458342)
chr3 (101-312)||(25983658-25983868)
chr3 (41-321)||(52175698-52175979)
chr3 (41-320)||(2642690-2642961)
chr3 (137-318)||(28943523-28943704)
chr3 (126-307)||(32853360-32853539)
chr3 (41-321)||(52173726-52174005)
chr3 (40-318)||(26748332-26748609)
chr3 (41-318)||(34750635-34750911)
chr3 (157-315)||(8236887-8237045)
chr3 (40-318)||(47843832-47844105)
chr3 (114-269)||(42671451-42671605)
chr3 (41-318)||(53290750-53291027)
chr3 (42-241)||(22099890-22100089)
chr3 (41-180)||(44544296-44544435)
chr3 (47-244)||(28226413-28226608)
chr3 (48-241)||(22173906-22174099)
chr3 (95-318)||(35458493-35458716)
chr3 (128-318)||(29803727-29803905)
chr3 (52-209)||(43159858-43160015)
chr3 (177-323)||(3114374-3114520)
chr3 (81-255)||(31610161-31610334)
chr3 (228-318)||(2858566-2858656)
chr3 (179-252)||(44544082-44544155)
chr3 (41-132)||(1201043-1201134)
chr3 (41-155)||(44092181-44092295)
chr3 (93-162)||(2154184-2154253)
chr3 (41-311)||(24569530-24569803)
chr3 (50-134)||(29803624-29803708)
chr3 (241-324)||(7329004-7329087)
chr3 (93-246)||(42634407-42634561)
chr3 (242-308)||(31610085-31610151)
chr3 (169-250)||(53055339-53055420)
chr3 (52-188)||(40113366-40113502)
chr3 (83-222)||(18355910-18356048)
chr3 (266-320)||(22173735-22173789)
chr3 (43-161)||(29458865-29458986)
chr3 (100-217)||(198956-199073)
chr3 (255-304)||(44543734-44543783)
chr3 (84-139)||(3035581-3035636)
chr3 (41-108)||(16237680-16237747)
chr3 (230-318)||(20105350-20105430)
chr3 (287-318)||(44092264-44092295)
chr3 (83-217)||(13364944-13365078)
chr3 (41-87)||(32853543-32853589)
chr3 (41-74)||(2642926-2642959)
chr3 (100-217)||(23087990-23088107)
chr3 (100-217)||(46694169-46694286)
chr3 (180-272)||(7678128-7678220)
chr3 (78-180)||(37293549-37293648)
chr3 (44-76)||(51241759-51241791)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (59-318)||(8152-8411)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (41-324)||(184105-184388)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (41-318)||(49127-49403)
scaffold0024 (257-308)||(89366-89417)
[»] scaffold0831 (2 HSPs)
scaffold0831 (41-319)||(2787-3067)
scaffold0831 (30-73)||(3034-3077)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (43-318)||(147111-147387)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (48-320)||(26109-26381)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (40-318)||(69079-69356)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (48-320)||(148288-148562)
scaffold0002 (41-317)||(138727-138992)
scaffold0002 (46-268)||(369389-369610)
scaffold0002 (45-188)||(492454-492597)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (50-317)||(4505-4770)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (54-318)||(7417-7681)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (41-319)||(223-500)
[»] scaffold1213 (1 HSPs)
scaffold1213 (41-268)||(1-232)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (93-318)||(77120-77345)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (41-311)||(295-565)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (41-318)||(30676-30953)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (108-318)||(599-809)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (55-318)||(23130-23394)
scaffold0036 (40-74)||(23361-23395)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (43-318)||(96045-96320)
scaffold0006 (41-74)||(96045-96078)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (40-318)||(252573-252851)
scaffold0003 (41-74)||(252818-252851)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (146-318)||(1802-1973)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (44-313)||(14239-14508)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (41-182)||(72067-72208)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (41-158)||(195882-195999)
scaffold0014 (151-308)||(195581-195737)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (83-243)||(1055-1209)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (83-243)||(6420-6574)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (88-252)||(20999-21163)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (287-315)||(16713-16741)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9838383 - 9838106
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9838383 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 9838284  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9838283 tcaatattacccttagttatttattgcggagagggaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 9838184  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9838183 aaagtagtaacatttattgattgttttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 9838106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26470984 - 26470718
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26470984 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttg 26470885  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  26470884 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 26470785  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26470784 aaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 26470718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 41 - 322
Target Start/End: Original strand, 22050029 - 22050309
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22050029 tactccctccgttcctttttaatcgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgtttta 22050128  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  22050129 tcaatat-acccttaaatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatca 22050227  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatta 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22050228 aaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaatta 22050309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 23777275 - 23777543
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23777275 gtactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 23777374  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23777375 accaatattatccttgctcatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc 23777474  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23777475 aaaagtagtaacatttatttaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaac 23777543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 17193138 - 17193417
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17193138 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 17193237  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || | |||||| ||||    
T  17193238 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaataataacttattgcatca 17193337  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17193338 aaagtaggatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 17193417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22784936 - 22784662
Alignment:
Q  34 aagattgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgt 133  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22784936 aagattatactccttcctttcctttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgt 22784837  T
Q  134 tgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattat 233  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22784836 tgttttaccaatattatccttacttatttattgtggagagaaaaatatattaaataaattattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatacattat 22784737  T
Q  234 tgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22784736 tgtatcaaaagtagtatcatttattgaatatcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaac 22784662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 34378839 - 34379118
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34378839 tactccatccgttcctttttaagtgtcatttttggaaaaaaaatttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 34378938  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34378939 ccaacattacccttagttatttattatggagagtgaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggcttttatagtaaaagtatgaattattgtataa 34379038  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34379039 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaat 34379118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 24663359 - 24663639
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24663359 tactccatccgttcctttttaagtatcacttttggagaaaatttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 24663458  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  24663459 ccaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 24663558  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24663559 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaatt 24663639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 24635688 - 24635967
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  24635688 tactccctccgttcctttttaagtgtcccttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacaatgaatgttgtttta 24635787  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  24635788 ccaacattacccttagttatttattgcagagagagaaatatgtgatataagatattaaatgactaaggctattatagtaaatgtataaattattgtataa 24635887  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
     ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||    
T  24635888 gaaaaagtaacatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacatttaaagagaaacggaggtggtaat 24635967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23923974 - 23923708
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  23923974 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagagattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacgttaaatgctgtttta 23923875  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||   |||||  || |    
T  23923874 tcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaactgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacatta 23923775  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23923774 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 23923708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 51 - 318
Target Start/End: Original strand, 3621580 - 3621847
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||     
T  3621580 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaaatttatttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttctaccaatattat 3621679  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||     
T  3621680 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtat 3621779  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3621780 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 3621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 302
Target Start/End: Original strand, 373703 - 373964
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  373703 tactctctccgttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaattttaaatgttgtttta 373802  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  373803 ccaatattgtcattatttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 373902  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaa 302  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  373903 aaagtagtatcaattgctgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 373964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1751692 - 1751415
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1751692 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactttcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 1751593  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  1751592 ccaatattgtccttaattatttattgcagagaaagaaatatatgaaaagagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 1751493  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1751492 aaagtagtatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 1751415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24356315 - 24356038
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24356315 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaatttattgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 24356216  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| |   || ||||||    
T  24356215 tcaatattacccttagatatttattccggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatcaacaaggtcattatagtaaaagtattagcaatggtatca 24356116  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  24356115 aaagtagtaacatttattgattgttttggtttggataaaatatcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 24356038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 308
Target Start/End: Original strand, 1249543 - 1249786
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||        |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1249543 tttttaaatgtcacttttggagaaattttt-gttccaatttaactg--------aaagttcaattcaattttaaatgttgttttatcaatattaccctta 1249633  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1249634 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaatgagacaattatagtaaaaatatcaattattgtatcaaaaatagtaacattt 1249733  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1249734 attgattgtcttagtttatataaaatatcataaagtgacaattaaaaaggaac 1249786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17124239 - 17123980
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcactttt-ggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17124239 ctccgttcctttttagatgtcactttttggagaaaagttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 17124140  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  17124139 attatccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagt 17124042  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17124041 agtatcaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 17123980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 81 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30416296 - 30416059
Alignment:
Q  81 ttttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30416296 ttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagttatttatggcggagagagaaata 30416197  T
Q  181 tatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa 280  Q
    |||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30416196 tatgaaacagaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaa 30416097  T
Q  281 tgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||  |  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30416096 tgtcaacatatgataattaaaaaggaacggaggtagta 30416059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 8992528 - 8992795
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8992528 tacttcctctgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 8992627  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  8992628 ctaatattatccttagttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 8992727  T
Q  241 aaagtagtaac-atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  8992728 aaagtagtaacaaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 8992795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 9016975 - 9017242
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9016975 tacttcctctgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 9017074  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  9017075 ctaatattatccttagttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 9017174  T
Q  241 aaagtagtaac-atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  9017175 aaagtagtaacaaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 9017242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17251513 - 17251239
Alignment:
Q  45 ccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaa 144  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17251513 ccctccgttcttttttaattatcacttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaa 17251414  T
Q  145 tattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 244  Q
    |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  17251413 tattacccttagatatttattgcaaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaagcaattgtatcaaaag 17251314  T
Q  245 tagtaaca-tttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17251313 tagtaacacttaattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 17251239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 8176416 - 8176690
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||   |||    
T  8176416 tactcccttcgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgtt---tta 8176512  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  8176513 ccaatattatcttttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 8176612  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8176613 aaagtagaaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaagaacagagatagta 8176690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 17835873 - 17836150
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  17835873 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgttactttcaaattttaatgcaacattaaatgttttttta 17835972  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| || |    
T  17835973 ccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatta 17836072  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17836073 aaagtagaatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaatatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 17836150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 34607078 - 34607356
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  34607078 tactcgctccgttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgttccaatttaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatggtgtttta 34607177  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  34607178 ccaatattatccttacttatttattgcagagagagacatatatgaaattagatattaaacgaataagattattatagtaaaagtatacattgttgtatca 34607277  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34607278 aaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaattaacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 34607356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31245010 - 31244733
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  31245010 tactctctccgttcatttttaattgtcatttttagagaaattttttgtttgtatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaattcttgtttta 31244911  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  31244910 tcaatattattcttagatatttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 31244811  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31244810 aaagtactaccatttattgattgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 31244733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 33260680 - 33260962
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33260680 tactccctctgttcctttataatggtcagttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 33260779  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||| ||||||  ||  |||||||||    
T  33260780 ccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatca 33260879  T
Q  241 aaagtagtaac-----atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  33260880 aaagtagtaacattatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttataaaggaacggaggtagta 33260962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 34730540 - 34730817
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  34730540 tactcgctccgttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgtttta 34730639  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  34730640 tcaatattatccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatca 34730739  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34730740 aaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatca-aaaatgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 34730817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 364797 - 364526
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttg-ttttatcaata 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  364797 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcattttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgtttttaccaata 364698  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    ||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  364697 ttgtcattaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaagaaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagta 364598  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
      | || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  364597 agatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 364526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22400826 - 22400547
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22400826 gtactacctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgtttt 22400727  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| || ||||    
T  22400726 accaatattatccttacttatttattatgaggagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataatgttattatagtaaaagtatgcattgttctatc 22400627  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  22400626 aaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaacaagaacggaggtagtaa 22400547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11676875 - 11676599
Alignment:
Q  38 ttgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11676875 ttgtactccctccgttcctttttat-tgtaacttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactt-caaagttcaatgcaacattaaatgttatt 11676778  T
Q  138 ttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||    
T  11676777 ttaccaatattactcttagatatttattgc--agagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgta 11676680  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  11676679 tcaaaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaaaaatgaatggaggtagta 11676599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7056375 - 7056122
Alignment:
Q  69 cttttggagaaattttttgtttcaatttaact--gtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatta 166  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||     
T  7056375 cttttagagaatttttttgtttctatttaactctgtcactttcaaaattcaatccaacattaaatgttgatttatcaatattatctttagttatttattg 7056276  T
Q  167 cggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||  || | ||||||||| |||    
T  7056275 cggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaccaaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattatct 7056176  T
Q  267 tggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7056175 tgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggtacggaggtagtaat 7056122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7632292 - 7632031
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  7632292 tactccatccgttcctttgtaagtgtctcttttggaga---ttttttttt---tttaactgtcactttcaaagttcaaagcaacattaaatattgtttta 7632199  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  7632198 ccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatgttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 7632099  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  7632098 aaaatagtaataattattgattgtcttgatttatataaaatgtcaaaaagtgattattaaaaaggaac 7632031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17601401 - 17601121
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17601401 tactccctccattcctttttaagtgtcacttttggagattttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 17601302  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagta-------aaagtatcaatta 232  Q
    |  ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||       ||| ||| |||||    
T  17601301 actaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaaatataaatta 17601203  T
Q  233 ttgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  17601202 ttgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacagaggt 17601121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Original strand, 30236958 - 30237166
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30236958 tactccttccattcctttttaaatgttacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaacgttgtttta 30237057  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30237058 ccaatattacccttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatca 30237157  T
Q  241 aaagtagta 249  Q
    |||||||||    
T  30237158 aaagtagta 30237166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26485816 - 26485669
Alignment:
Q  171 gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggt 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26485816 gagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggt 26485717  T
Q  271 ttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26485716 ttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 26485669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 107 - 316
Target Start/End: Original strand, 11128877 - 11129086
Alignment:
Q  107 ttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 206  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  11128877 ttcaaagttcaattcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagatacatatgaattgaaatattaaattaataa 11128976  T
Q  207 ggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagga 306  Q
    ||  |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11128977 ggtcattatagtaaaaataaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 11129076  T
Q  307 acagaggtag 316  Q
    ||||||||||    
T  11129077 acagaggtag 11129086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Original strand, 30388701 - 30388886
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30388701 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgtttta 30388800  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtat 226  Q
     ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30388801 ccaatattatgcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtat 30388886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 318
Target Start/End: Original strand, 1252147 - 1252423
Alignment:
Q  42 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  1252147 actccctctattcctttttaagtgtcatttttggaaaaaaaatt-gttcctatttaattgtctttttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttac 1252245  T
Q  142 caatattacccttagttattt-attacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||  ||||    
T  1252246 caatattatccttagttgttttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatca 1252345  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  1252346 aaagtagtatcaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaatgaacggagatagta 1252423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 12732157 - 12732435
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| || |||||||||| |  |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  12732157 tactccctccatttctttttaagtatatcttt-ggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttta 12732255  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  12732256 ccactattatcct-agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 12732354  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||| || || || ||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12732355 aaagtagtatcaattgttaattgtcttgttttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaatt 12732435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 308
Target Start/End: Original strand, 1923869 - 1924099
Alignment:
Q  79 aattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt-atcaatattacccttagttatttattacggagagagaa 177  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |   |||| ||    
T  1923869 aattttttgtttctatttaattgtcacttttaaattttaatgcaaccttaaatattgtttttatcaatattacctttagttatttattgcaatgagataa 1923968  T
Q  178 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgta 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1923969 atatatgaaatgagatattaaatgaataatactgttatagtaaaagtataaattatttcatcaaaattaataacatttattgattatcttggtttatata 1924068  T
Q  278 aaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  1924069 aaatgtgaaaaagtgacaattaaagaggaac 1924099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31854752 - 31854488
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31854752 tactccctccgttcctttttaagtgttacttttggagaaaaattttgtttttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttatttta 31854653  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttatt--acggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  31854652 ccaacattacccttagttatttattgcaaagagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaggtataaatttttgtat 31854553  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
       ||  ||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||| ||  ||||| |||||||    
T  31854552 acgaaaaagtaacatttattaaatgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaagatgacagttaaaaa 31854488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 271
Target Start/End: Original strand, 27313479 - 27313713
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  27313479 gtactccctccgtttttttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgttgattt 27313578  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaa---tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||| ||||| || | ||||||     
T  27313579 accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatagtatatgaaatgagatgttaaatgaacaagataattatagaaaaagaataacttattgc 27313678  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtt 271  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  27313679 atcaaaagtaaaaacaattattgattatcttggtt 27313713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 52650 - 52828
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  52650 tccgttcctttttaagtgtttcttttggagattttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaattatgttttatcaatat 52749  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtat 226  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  52750 tacccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtat 52828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 264
Target Start/End: Original strand, 7235471 - 7235643
Alignment:
Q  92 aatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgag 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  7235471 aatttaactgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagttatttattgtggagagagggatatatgaaatgag 7235570  T
Q  192 atattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgt 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7235571 atattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatattgtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgt 7235643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32359695 - 32359424
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||    ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32359695 tactccctctgttccttgttaagtgttacttttggaaaaaaaaattgtt-ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat-ttgtttta 32359598  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||  || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  32359597 ccaat--tatccttagttatttattgcggagagaga--tatatgaaatgagatatttaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 32359502  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| |||  || ||||| ||||||||||||| | |||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  32359501 aaagaagtgtcaattattaattgtcttggtttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggtagta 32359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11431366 - 11431144
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| |||    
T  11431366 atttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaaccttagttatttattgtcgagagataaatataggaaataaga 11431267  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    |||||||| | ||| | |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||| |||| | || |||    
T  11431266 tattaaattagtaaagttattatcgtaaaagtataagttattgtatcaaaagtaggaatagctattgattgtcttgatttgtgtaacatgtaaaaatgtg 11431167  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||||||||| | ||||||||||    
T  11431166 acaattaaaacgaaacagaggta 11431144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 308
Target Start/End: Original strand, 7170171 - 7170399
Alignment:
Q  80 attttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaat 179  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||     
T  7170171 attttttctttatatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccattattacccctaaatatttattgcggagagagaaac 7170270  T
Q  180 atatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaa 279  Q
    |||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  7170271 atataaaatgaaatattaaatttataaggttattataataaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaa 7170370  T
Q  280 atgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||   | ||| || |||||||||||||||    
T  7170371 atactaaaaaatggcaattaaaaaggaac 7170399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32251212 - 32250942
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  32251212 gtactccctctgtttttttataattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtccaatacatcattaaatgttgtttt 32251113  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||  || |||| ||| |||    
T  32251112 acctatattacccttagata-ttattgcagagagagaaatatatgaaatgaggtattaaatgattaaggttattataggaaaaagataaattcttgcatc 32251014  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagag 312  Q
    ||||||||||| |  ||||  |||||||||||| ||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||||    
T  32251013 aaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgataattaaaaagaaacagag 32250942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 19811936 - 19812203
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  19811936 tactccctccgttcctttttaattgtcacgtttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 19812035  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||| |||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||  || |||| ||| ||||    
T  19812036 cctttattacccttaattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataagaaaaagatgaattgttgcatca 19812135  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg-tcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||| |  ||||  |||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19812136 aaagtagtaaaaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaac 19812203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Original strand, 15432651 - 15432921
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttg-tttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |   |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||| |||||    
T  15432651 tactccctccgttcctttataattgtcacttttgcatacaaaatttgatttcaatt-aactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggtttt 15432749  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||  || |||| |||||||    
T  15432750 acctatattacccttatatatttattactgagagataaatatatgaaatgaaatattaaattattaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatc 15432849  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagag 312  Q
    ||||||||||| |  ||||  ||||||| |||| |||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15432850 aaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttagtttgtgtagaaagtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagag 15432921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Original strand, 24948223 - 24948390
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  24948223 tactcgctccgttccgttttatatgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatagtgtttta 24948322  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 208  Q
      |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24948323 ctaatattacccttggatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataagg 24948390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11001070 - 11000809
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  11001070 tactccatccattcctttataattgtcacttttgcataaagattttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggtttta 11000971  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  11000970 cctatattacccttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggatattataggaaaaagataaattgttgtatca 11000871  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    ||| |||||| |  ||||  ||||||| |||| |||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  11000870 aaaatagtaa-aagtatttgttgtcttagtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaa 11000809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 267
Target Start/End: Original strand, 13597477 - 13597615
Alignment:
Q  129 aatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatca 228  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |    
T  13597477 aatgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagaaagaaatttatgaaatgagatattaaatgtaaaaggttattatagtaaaaatataa 13597576  T
Q  229 attattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtctt 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13597577 attattatatcaaaagtagtaacatttatcgattgtctt 13597615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19645847 - 19645704
Alignment:
Q  179 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat--caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt 276  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  19645847 tatatgaaatgtaatattaaatgaacaaggctattatagtaaaagtataaagtattgtatatcaaaagtagtaacatctattgattgtcttagtttgtgt 19645748  T
Q  277 aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  19645747 aaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaagaacggaagtagtaat 19645704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 149
Target Start/End: Original strand, 3849045 - 3849153
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3849045 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 3849144  T
Q  141 tcaatatta 149  Q
     ||||||||    
T  3849145 ccaatatta 3849153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 318
Target Start/End: Original strand, 3850408 - 3850577
Alignment:
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatat--gaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   || | | ||||||||||||    
T  3850408 ccttagttatttattacggagggagatatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttgtggcatcaaaagtagt 3850507  T
Q  249 aacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3850508 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 3850577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1135437 - 1135165
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| |     ||||||||||||  |||||||||   ||    
T  1135437 gtacttcctcctttcctttttaagtgtctcttttatagaaaatttttgtttctatttaactatcactg----agttcaatgcaatattaaatgtt---tt 1135345  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttat-tacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| ||   ||||| |||||  |||||  |||||||||||||||| || |||| | | ||||| || | ||||| |||    
T  1135344 atcaatattattcttagttaattatatagatagagaaaaataattgaaacaagatattaaatgaatatggttatttttggaaaaggataatttattatat 1135245  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | | ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1135244 caaaagtaataacatttattgagtttatcggtctctgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 1135165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 211 - 321
Target Start/End: Original strand, 24949257 - 24949367
Alignment:
Q  211 attatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacag 310  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |    
T  24949257 attatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaaggaacgg 24949356  T
Q  311 aggtagtaatt 321  Q
    |||||||||||    
T  24949357 aggtagtaatt 24949367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19645933 - 19645850
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaac 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19645933 tactccctctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaac 19645850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2381270 - 2381027
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||  ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| | ||||    
T  2381270 tactctctccgttcctttataattgtcacttttgcataaaaattttgttttcaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtattattaaatgtggcttta 2381171  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||||||| ||||  || | || ||||||||    
T  2381170 cctatattacccttatatatttattgcaaagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataattaaggttattataggaaaaagataatttgttgtatca 2381071  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtca 285  Q
    ||| |||||| |  |||| || |||||| ||||||||||| ||||    
T  2381070 aaaatagtaa-acgtatttatagtcttgatttatgtaaaaagtca 2381027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 316
Target Start/End: Original strand, 53807 - 53886
Alignment:
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtag 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  53807 atcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtatatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtag 53886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 7632464 - 7632584
Alignment:
Q  82 tttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatat 181  Q
    |||||||||| | |||| ||| |||||| |||| ||||| | |  |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||   |||| | ||||||    
T  7632464 tttttgtttctaattaaatgttattttctaagtccaatgaatcaataaatgttgttttatttatattactcttagatatttattgtagagataaaaatat 7632563  T
Q  182 atgaaatgagatattaaatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7632564 atgaaatgagatattaaatga 7632584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 318
Target Start/End: Original strand, 30388935 - 30389023
Alignment:
Q  230 ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||||| |||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30388935 ttattgcatcaaaaatagtattaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 30389023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 30734542 - 30734659
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| | || | ||||||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  30734542 tgtcattttcaaatttcaatgcaacattaattattatcttatcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 30734641  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  30734642 tgattaagggtattatag 30734659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 167
Target Start/End: Original strand, 847800 - 847902
Alignment:
Q  65 gtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttat 164  Q
    |||||||||| |||||  || |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| |||||| ||| ||||  |||||||    
T  847800 gtcacttttgtagaaaaattgtgttcctatttacttgtcattttcaaagttcaatgcaacattaattattgctttgtcaataatactcttaaatatttat 847899  T
Q  165 tac 167  Q
    |||    
T  847900 tac 847902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29260427 - 29260293
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| |  ||| || |||||| ||||||||  ||||||||   |||||||||| | |    
T  29260427 ttttgtttcaaaatacttgtcattttcaagtttcaatgcaacattaattactgtcttgtcaataatacccttacatatttattgtagagagagaaaaaaa 29260328  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatag 217  Q
    | |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  29260327 taaaatgaaataataaatgattaagggtattatag 29260293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17942661 - 17942546
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||  | ||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  17942661 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgttttgtcaataatacccttacatatttatt--gtagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 17942564  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||  ||||| ||||||||    
T  17942563 tggttaagggtattatag 17942546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 146
Target Start/End: Original strand, 11835093 - 11835165
Alignment:
Q  74 ggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||    
T  11835093 ggagaaattctttgttcctatttaagtatcactttcaaagttcaatggagcaataaatgttgttttgtcaata 11835165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 67
Target Start/End: Original strand, 25056399 - 25056427
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtc 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25056399 tgtactccctccgttcctttttaagtgtc 25056427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 319
Target Start/End: Original strand, 28778259 - 28778291
Alignment:
Q  287 aaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28778259 aaagtgacaattaaaaaggaacagagggagtaa 28778291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 319
Target Start/End: Original strand, 28784274 - 28784306
Alignment:
Q  287 aaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28784274 aaagtgacaattaaaaaggaacagagggagtaa 28784306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 318
Target Start/End: Original strand, 30237425 - 30237496
Alignment:
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| |||||||||||||  |  ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30237425 agtaatatttattgattgttattttttgtgtaaaatgtaaaaaa-tgacaattaaaaaggaacggaggtagta 30237496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35700632 - 35700353
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35700632 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggaaaaaaaaattgttccaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgtttta 35700533  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35700532 tcaatattacccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattatatca 35700433  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35700432 aaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 35700353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 10506793 - 10507058
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10506793 tactccctccattcattttaaagtgtcacttttggagaaattttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 10506892  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10506893 tcgatattacccttagttatttattgcggaga--gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtacaagtatcaattattgcatca 10506990  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10506991 aaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaaggaac 10507058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 32347963 - 32348234
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32347963 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 32348062  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32348063 attacccttagttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattctagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagt 32348162  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32348163 agtaatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtca-aaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 32348234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 30686391 - 30686668
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30686391 tactccctatgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 30686490  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  30686491 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 30686590  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30686591 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 30686668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32168569 - 32168290
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32168569 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcagtttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 32168470  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  32168469 tcaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatca 32168370  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32168369 aaagtagtaccatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 32168290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 315
Target Start/End: Original strand, 9361952 - 9362227
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9361952 gtactccctccgttcctttttaagtgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt 9362051  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9362052 accaacattacccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtata 9362151  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    | ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9362152 agaaaaagtaaaatttattgagtgtcttgatttgtataaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggta 9362227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37609558 - 37609284
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37609558 tactctctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgtttta 37609459  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  37609458 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 37609359  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||  ||   || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37609358 aaagtatcaa---ttgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagatagta 37609284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 13507750 - 13508028
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13507750 tactccctaagttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta 13507849  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||   |||||| |||     
T  13507850 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcc 13507949  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13507950 aaagtagtatcaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 13508028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 13514938 - 13515216
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13514938 tactccctaagttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta 13515037  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||   |||||| |||     
T  13515038 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcc 13515137  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13515138 aaagtagtatcaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 13515216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35531552 - 35531275
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35531552 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 35531453  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  35531452 ccaatattatccttagttatttattgcagagagataaatatatgaaataggatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 35531353  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35531352 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 35531275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19929723 - 19929449
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19929723 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 19929624  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19929623 ccaatattattctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 19929524  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19929523 aaagtagaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 19929449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 10675882 - 10676159
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10675882 tactccctccgttcttttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 10675981  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  10675982 ccaatattatcctaagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtacaacttattgcatca 10676081  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||| | ||||| | | ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10676082 aaagtaataacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacagaggtagta 10676159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 13699154 - 13699431
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13699154 tactccatccgttcctttttaagtgtcgcttttgaataaattttttatttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 13699253  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  13699254 cgaatactatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 13699353  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  13699354 aaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatggcaattaaaaaggaacggagatagta 13699431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19349633 - 19349357
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19349633 tccctccgttcctttttaaatgtcactttcggagaaaaattttgttcctatttaacagtcactttcaaagttgaatgcaacattaaatgttgttttacca 19349534  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  19349533 atattgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaa 19349434  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19349433 gtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcagaatgtgacaattaaaaaggaacagtggtagtaat 19349357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21927953 - 21927676
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21927953 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 21927854  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  21927853 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 21927754  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21927753 aaagtagtatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgt--caatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 21927676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 40 - 319
Target Start/End: Original strand, 38597569 - 38597849
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaa-gtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  38597569 gtactccctctgttcctttttaaagtgtcatttttggagaaacttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttt 38597668  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38597669 taccaacattacccttagttatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat 38597768  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
     | ||  ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38597769 aagaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaacagagatagtaa 38597849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 36318333 - 36318611
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36318333 tacttcctccgttcctttttaagtgtcacttttagataaattttttgtttctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 36318432  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  36318433 tcaatattatccttatttatttattacaaagagaaaaat-tatgaaatgacacattaaacaaataaggttattatagtaaaggtgtaaattattgtatca 36318531  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36318532 aaagtagtgacatttattgaatgtattggtttgtgtaaattgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 36318611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 51613391 - 51613670
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  51613391 tactccctccattcctttttaattgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 51613490  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  51613491 tcaatattactcttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatca 51613590  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51613591 aaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 51613670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 314
Target Start/End: Original strand, 35255473 - 35255739
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  35255473 tccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatat 35255572  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||     
T  35255573 tatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaa 35255672  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35255673 aaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagtaacagaggt 35255739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 45368068 - 45368345
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  45368068 tactccctcctttcctttttaaatgtcacttttggggaaaatttttgtttctatttatctgtcactttcaaagttcaatgaaacattgaatgttgtttta 45368167  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  45368168 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 45368267  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  45368268 aaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaagaactgaggtagta 45368345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 50825829 - 50825553
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  50825829 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcttacttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttta 50825730  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  50825729 ccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 50825630  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  50825629 aaagtagtagca-atgttgattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaaaaacggaggtagta 50825553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 305
Target Start/End: Original strand, 15660567 - 15660831
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15660567 tactctctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 15660666  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15660667 ccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgtataa 15660766  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagg 305  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  15660767 gaaaaaataacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgatagttaaaaagg 15660831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19455655 - 19455413
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19455655 tactccctctgttcctttataagtgtcacttttggagaaattttt-gtttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 19455557  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  19455556 ccaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatctatgaaacataatattaaatgaataagactattttagtaaaggtataaattattgtatca 19455457  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtca 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19455456 aaagtagtaaca-ttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtca 19455413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 37437310 - 37437031
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37437310 tactctctcccttcttttttaagtgtcacgttaggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 37437211  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||   |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  37437210 ccaatattgttcttagttatttattgcggagataaaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 37437111  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37437110 aaagtggtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 37437031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 318
Target Start/End: Original strand, 43500496 - 43500763
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||     
T  43500496 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaaatatttgttcctatttaagtgtcacttttaaagttcaatgcagtattaaatgttgttttaccaatattat 43500595  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||     
T  43500596 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 43500695  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43500696 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 43500763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 1429264 - 1429541
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1429264 tactccctccgttcttttctaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgtttta 1429363  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  1429364 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatacaaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 1429463  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1429464 aaagtagtatcatttgtagattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 1429541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 13566656 - 13566938
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13566656 tactccctccgttcctttttaagtgtcattttttgagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 13566755  T
Q  141 tcaatattacccttagttatt---tattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
     |||||||  ||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| |    
T  13566756 ccaatattgtccttaattattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgca 13566855  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13566856 tcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 13566938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32994730 - 32994450
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatt----ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    | |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32994730 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattaatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgt 32994631  T
Q  137 tttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||     
T  32994630 tttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgc 32994531  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  32994530 atcaaaagtagtaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaaagacaattaaaaa-gaacggaggtagta 32994450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 51974429 - 51974154
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||    
T  51974429 gtactccctccgttcctttttaagtgtcatttttttaaaaaaaaattgtttccatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaatattaaatattgtttt 51974330  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51974329 accaatattatccttgcttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatacattattgtatc 51974230  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51974229 aaaagtagtaatatttattgaatgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggta 51974154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30702547 - 30702281
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30702547 tactccctcaattcctttttaagtgtttcttttgcataaattttttgttttaatttaaatctcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgtttta 30702448  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||   |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30702447 ccaatattatccttagttatttattgtagagaaaaaaatatataaaatgagataataaataaataatgttattatagtaaaagtataaaatattgtatca 30702348  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30702347 aaagtggtaacatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 30702281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45226829 - 45226571
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45226829 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaat 45226730  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   |||||  |||||||||    
T  45226729 attgtccttagttatttattgtggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattataataaaagtatagcttattacatcaaaagt 45226630  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||| || || |||||||||||  ||| | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  45226629 agtatcaattgttgattgtcttaatttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 45226571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 38648437 - 38648714
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38648437 tacttcctccattcctttttaaatgtcactttttgagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38648536  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  38648537 ccaatattatccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 38648636  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38648637 aaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 38648714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31570894 - 31570614
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  31570894 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattatttta 31570795  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||    
T  31570794 ccaatattatccttacttatttatcacggagtgagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatca 31570695  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  31570694 aaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgccttaaagtgacacttaaaaaggaacggatgtagtaatt 31570614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 311
Target Start/End: Original strand, 9127653 - 9127919
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||  || ||    
T  9127653 ctcccttcctttttaagtgtcacttttggataaattttttgtgtttatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgtttttccagta 9127752  T
Q  147 ttacccttagttatttattacg--gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 244  Q
    ||| ||||  | |||||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9127753 ttatccttgctcatttattgtggagagagagaaatatatgaagtgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaag 9127852  T
Q  245 tagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9127853 tagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacaga 9127919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 324
Target Start/End: Original strand, 18344306 - 18344589
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18344306 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttaacgaaaatttttgtttcaatttaagtgtcaattttaaaattcaatgtaacattaaatgttgtttta 18344405  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18344406 ccaatattacccttagttatttattgtgcagagagaaatatatgaaatgagataataaacaaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatca 18344505  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaaa 324  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| | ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  18344506 aaagtggtaatatttattaattatattgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaatgaacggaggtagtacttaaa 18344589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18034083 - 18033806
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  18034083 tactccatccgttcctttttaagtgtcactttttgagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatccaacattaaatattgtttta 18033984  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaag-tatcaattattgtatc 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||   |||||| |||    
T  18033983 tcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaaatatagcttattgcatc 18033884  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||  |||| || || ||||||||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18033883 aaaatgagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgaaa-aatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 18033806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31588996 - 31588720
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31588996 tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 31588897  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||   |||||||||||    
T  31588896 ccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgtatca 31588798  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||  | || |||||| ||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  31588797 aaagtagtattaatttttgattatcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaaagaacgtaggtagta 31588720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Original strand, 28679000 - 28679264
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28679000 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 28679099  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  28679100 accaatattgtctttagttatttattgcggagagagaaatatatcaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatc 28679199  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||||||  | || || ||||||||  ||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  28679200 aaaagtagtataaattgttaattgtcttaatttatataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 28679264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 318
Target Start/End: Original strand, 12721428 - 12721697
Alignment:
Q  49 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatt 148  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  12721428 ccgtttctttttaattgtcacttttagagaaaaaaattgttcctatttaactatcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaagatt 12721527  T
Q  149 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
     ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||    
T  12721528 tcccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatcaaaagtagt 12721627  T
Q  249 aacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12721628 aatatttatttattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 12721697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35484029 - 35483760
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  35484029 tccgttcatttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatat 35483930  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||     
T  35483929 tatccttagttatttattgc--agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaataa 35483832  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    || || || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35483831 tatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaagaacggaggtagtaa 35483760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 1024536 - 1024815
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    || |||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1024536 tactccttccgttcctttttaagtgtcacttttgaaaaaaaaaattatttttatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta 1024635  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  1024636 ccaatattgtcgttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 1024735  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1024736 aaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 1024815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20605883 - 20605604
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||   ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20605883 tgtacttcctccgtttttttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcttattaaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttt 20605784  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||   |||||| ||    
T  20605783 taccaatattatcattggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcat 20605684  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  20605683 caaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaatggaggtagta 20605604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 44182740 - 44183005
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44182740 tactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaaaaatttgtttctatttaactgtcactctcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 44182839  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||     
T  44182840 ccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaataaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattatatc- 44182937  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  44182938 aaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaaggaac 44183005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 318
Target Start/End: Original strand, 7782942 - 7783207
Alignment:
Q  52 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||       
T  7782942 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttgttttatcaatattgtt 7783041  T
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaac 251  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||| |    
T  7783042 cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-aaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagttaattgcatcaaaagtagtatc 7783140  T
Q  252 atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | || |||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  7783141 aattgttgattatcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacaaagatagta 7783207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40927000 - 40926733
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| | |||||||    
T  40927000 tactccctctgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaacgatgtttta 40926901  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||         ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40926900 tcaatattactctta-ttatttatggcggagagagaaatatatgaaacgaaat---------ataaggtcgttatagtaaaagtataacttattgtatca 40926811  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40926810 aaagtagtaacaattattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 40926733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 308
Target Start/End: Original strand, 43808890 - 43809151
Alignment:
Q  53 tcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttg-ttttatcaatattacc 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43808890 tcctttttaattgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaccatcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttttaccaatattacc 43808989  T
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga-----tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |     |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  43808990 cttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatactgtattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagca 43809089  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43809090 gtaacacttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaac 43809151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52649982 - 52649713
Alignment:
Q  45 ccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaa 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||   |||||  ||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||    
T  52649982 ccctccgttcctttttaaatgtccttttcatagaaaagttttgtttatatttaattatcactttcaaagttcaaagcaatattaaatgttgttttaccaa 52649883  T
Q  145 tattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  52649882 tattacccttagttatttattacagagagtgaaatatatgaaacaagatattaaatgaatgaggctattattggaaaaggatatattattgtatcaaaag 52649783  T
Q  245 tagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  52649782 tagtaacatttattgattgtcttgattagtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggt 52649713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4101151 - 4100886
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4101151 tttttaattgtcacttttggaaaaatcttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgtagcattaaatgttgttttaccaatattaccctta 4101052  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  4101051 tatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataacattt 4100952  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4100951 attgattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaaagtaataattaaaaaggaacggaggtagtaatt 4100886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37735396 - 37735119
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||   |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  37735396 tactctctccgttcctttttaactgtcacttttaaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactgtcaaagttcaatgcaaaattaaatattgtttta 37735297  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||  |||||||||    
T  37735296 ccaacattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaatcaaaaacaattgtatca 37735197  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37735196 aaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatttgaaaaagtgataattaaaaaggaacggaggtagta 37735119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51972538 - 51972258
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| || |||||    
T  51972538 tactccatacgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaaattcaatgcaacatgaaatattatttta 51972439  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | |||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  51972438 ccaatattatcattagctatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtataacttattgcatca 51972339  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  51972338 aaagtagtaacaactattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaattaaaaaataacagaggtagtaatt 51972258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 49908439 - 49908173
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49908439 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttaaagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 49908340  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatca---attattgta 237  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||| ||| |    |||||| |    
T  49908339 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatcgaattaataaggtcattatagtaaaaatataatagtttattgca 49908240  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| |||  | |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  49908239 tcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagttcgtataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 49908173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 319
Target Start/End: Original strand, 1677189 - 1677456
Alignment:
Q  34 aagattgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgt 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||                  || ||||||||    
T  1677189 aagattatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactatca------------------acattaaatgt 1677270  T
Q  134 tgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattat 233  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||    
T  1677271 tgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcaatatagtaaaagtatagcttat 1677370  T
Q  234 tgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    || || |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1677371 tgcattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 1677456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 1427660 - 1427935
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  1427660 tactccctccgatcctttttaagtgttattttttgagaaattttt-gttcttatttaactgtcattttcaaaggtcaatgcaacaataaatgttgtttta 1427758  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  1427759 ccaacattatccttagttatttattgcaaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaatgctattatagtaaaagtaaaaattattgtataa 1427858  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||  |||||||||||| |  | |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1427859 gaaaaagtaacatttatagtgtatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgataattaaaaaggaac-gaggtagta 1427935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 17013402 - 17013683
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17013402 tactacctccgttcctttttaagtgtttcttttggagaattttttttcttctatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 17013501  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgag---at-attaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
     |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||   || || |    
T  17013502 ccaatattatctttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgaatgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcgttgttct 17013601  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17013602 atcaaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgttttaaattgacacttaaaaaggaacggaggtagta 17013683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 300
Target Start/End: Original strand, 43952773 - 43953017
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||    
T  43952773 cctccgtttctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttacaaat 43952872  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  43952873 attatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgcgatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagt 43952972  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaa 300  Q
    ||          ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  43952973 ag----------tgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 43953017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 318
Target Start/End: Original strand, 12124677 - 12124901
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagat 193  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12124677 tttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 12124776  T
Q  194 attaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtga 293  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | || || |||||| ||||| ||| ||||||||| || || ||||    
T  12124777 attaaatgaataagattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagcatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatggcaaaatgtga 12124876  T
Q  294 caattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  12124877 caattaaaaaggaacgaaggtagta 12124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Original strand, 46096573 - 46096796
Alignment:
Q  85 ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatg 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||||||     
T  46096573 ttgtttcaatttaactgtcactt---aaattcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttagttattaattatggggagagaaatatata 46096669  T
Q  185 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||| ||    
T  46096670 aaatgagatattaaatgaataagattattgtagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattgatgtgtataaaatatc 46096769  T
Q  285 acaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  46096770 aaaaagtgacaattaagaaggaacaga 46096796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 48508113 - 48508376
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||| |||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  48508113 tactccctccgttcctttttaagtgtctattttgaagaatttttatgttcctatttaattgtcactttacacagttcaatgcaacattaaaagttatttt 48508212  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  48508213 actaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc 48508311  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  48508312 aaaagtaacaacatttattgattattttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 48508376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31488022 - 31487756
Alignment:
Q  55 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaa-agttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccct 153  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  31488022 ctttttaagtgtctctttttgagaatttttttgttcctattcaagtgtcactttatatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccct 31487923  T
Q  154 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacat 253  Q
    || ||||| |||   || ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||    
T  31487922 tatttatt-attgtagaaagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaatat 31487824  T
Q  254 ttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31487823 ttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtaataatt 31487756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48174924 - 48174656
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||| | |||||| |||    
T  48174924 cctccgttcctttttaattgttatttttagagaaattttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcatagttaaatgctcttttatgaat 48174825  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| || ||||  |||||||||||||||   |  |||||||||||| |    
T  48174824 attacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaattacaattgtatcaaaa-t 48174726  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48174725 agtatcatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgataattaaaaaggaacggaggta 48174656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 285
Target Start/End: Original strand, 52748997 - 52749239
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||    
T  52748997 tactccctccgtttctttttaaatgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttata 52749096  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  52749097 tcaatattatccttagttatttatt--gtggagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagattattatagtaaaagtatagtttattgcatca 52749194  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtca 285  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  52749195 aaaatagtatcaattgttgattgtcttgattcgtgtaaaatgtca 52749239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 126 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12231243 - 12231051
Alignment:
Q  126 ttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12231243 ttaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta 12231144  T
Q  226 tcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
        |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12231143 cagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 12231051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 308
Target Start/End: Original strand, 49497139 - 49497399
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||   |||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  49497139 tccgttcttttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttcttatttaactgttatttttgaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatat 49497238  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||     
T  49497239 tgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaataa 49497338  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    || || || || |||||||| |||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  49497339 tatcaattgttaattgtcttagtttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaac 49497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 249
Target Start/End: Original strand, 44818440 - 44818642
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  44818440 ctccgttcctttttaagcgtcacttttgcagaaaatctttgttcctatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaata 44818539  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||   |||||| ||||||||||    
T  44818540 ttatccttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaactatagcttattgcatcaaaagta 44818639  T
Q  247 gta 249  Q
    |||    
T  44818640 gta 44818642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48265295 - 48265072
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtt 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48265295 tgtactccctccgttcttttttaagtgtcacttttcgagattttttttgttcctatttaagtgtcactttacgtagttcaatgcaacattaaatgttatt 48265196  T
Q  138 ttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  48265195 ttactaatattacccttatttatt-attatggagagagaaatatatgtaatgagacattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgta 48265097  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgatt 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  48265096 tcaaaagtagcaacatttattgatt 48265072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 318
Target Start/End: Original strand, 29830844 - 29831010
Alignment:
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| || |    
T  29830844 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatc 29830943  T
Q  252 atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29830944 aattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 29831010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2059976 - 2059792
Alignment:
Q  134 tgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattat 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||||    
T  2059976 tgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtgaaagtataacttat 2059877  T
Q  234 tgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2059876 tgcatcaaatgtagtaacaattattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagta 2059792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 307
Target Start/End: Original strand, 42800091 - 42800352
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||   |||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||    
T  42800091 tcccttcgtttctttttaattgtcattttttgagaaaagatttgtttatatttaactgttactttcaaa-ttcaatgtaatattaaatgttgttttacca 42800189  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagt-atcaattattgtatcaaa 242  Q
    |||||| |||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||| |  ||  ||||||||||     
T  42800190 atattatccttatatatttatt--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataatgccattttagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaag 42800287  T
Q  243 agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42800288 agtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 42800352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8464401 - 8464237
Alignment:
Q  154 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacat 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||     
T  8464401 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 8464302  T
Q  254 ttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8464301 ttgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagta 8464237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38818184 - 38817997
Alignment:
Q  34 aagattgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgt 133  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||     || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  38818184 aagatggtactcactccgttcgtttttaagtgt-----ttcgagaaattttttatttctatttaactgtcacttttaaaattcaatgcaacaataaatgt 38818090  T
Q  134 tgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtat 226  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38818089 tgttttagcaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatgtgaaataatatattaaatgaataaggctgttatagtaaaagtat 38817997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39412676 - 39412501
Alignment:
Q  133 ttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaatta 232  Q
    |||||||| |||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||| | |||    
T  39412676 ttgttttaccaatattatcttttgttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaaatataactta 39412577  T
Q  233 ttgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39412576 ttgcatcaaaagtagaaacaattattgattgttttggtttgtataaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaac 39412501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 52759008 - 52759286
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |     
T  52759008 tactacctccgttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttctt 52759107  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||| | |||  || | ||||||||| |    
T  52759108 cctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataattaaaacataagttattgtataa 52759207  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  52759208 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtataaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggagggagtaa 52759286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8464706 - 8464585
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8464706 tactccctccgttcgtttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 8464607  T
Q  141 tcaatattacccttagttattt 162  Q
     |||||||  ||||||||||||    
T  8464606 ccaatattgtccttagttattt 8464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37296984 - 37296745
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| || |||    
T  37296984 tgtactccctccgttcgtttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaacgcaacattgaatattattt 37296885  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| | |   ||||||| ||||||  |||  |||||||| ||   ||| || |||    
T  37296884 taccaatattatccttacttatttatta-ggggagagaaatgtatgaagttactgattaaataaataagattat--tagtaaaaatagacattgttctat 37296788  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  37296787 caaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaat 37296745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24781916 - 24781806
Alignment:
Q  116 caatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattat 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  24781916 caatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattat 24781817  T
Q  216 agtaaaagtat 226  Q
    |||||||||||    
T  24781816 agtaaaagtat 24781806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1039624 - 1039417
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||   ||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1039624 tactccctccgttcctttttaattgtcacctttagagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgtttta 1039525  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||  |||||||||    
T  1039524 ccaagattacacttagatatttattgc-aagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatca 1039426  T
Q  241 aaagtagta 249  Q
    |||||||||    
T  1039425 aaagtagta 1039417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1046530 - 1046323
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||   ||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1046530 tactccctccgttcctttttaattgtcacctttagagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgtttta 1046431  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||  |||||||||    
T  1046430 ccaagattacacttagatatttattgc-aagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatca 1046332  T
Q  241 aaagtagta 249  Q
    |||||||||    
T  1046331 aaagtagta 1046323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 306
Target Start/End: Original strand, 1038071 - 1038332
Alignment:
Q  49 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttg-ttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  1038071 ccgttcctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatat 1038170  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag--- 244  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    |||||| ||||||||  ||  ||||| |||||||       
T  1038171 tatccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaaatcattataataaaagtaaaaacaattgtttcaaaagtaa 1038270  T
Q  245 tagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagga 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||| ||  ||| | ||||||||||||||    
T  1038271 tagtaatatttattgattgtctttattcgtgtaaaatatctaaaaataacaattaaaaagga 1038332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 306
Target Start/End: Original strand, 1044977 - 1045238
Alignment:
Q  49 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttg-ttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  1044977 ccgttcctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatat 1045076  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag--- 244  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    |||||| ||||||||  ||  ||||| |||||||       
T  1045077 tatccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaaatcattataataaaagtaaaaacaattgtttcaaaagtaa 1045176  T
Q  245 tagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagga 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||| ||  ||| | ||||||||||||||    
T  1045177 tagtaatatttattgattgtctttattcgtgtaaaatatctaaaaataacaattaaaaagga 1045238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 308
Target Start/End: Original strand, 36850640 - 36850884
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||||||  ||||| |||||||||  |||    
T  36850640 ttttttagtgtcacttttgtagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttca-tgcaatattaaatgta-ttttaccaatattactttta 36850737  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    |||||||||||   |||| ||||||||| | |  | |||||||||    |||| | |||| | ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36850738 gttatttattat--agagtgaaatatataatacaatatattaaat----aaggttgttattgaaaaatgataaattattatatcaaaagtagtaacattt 36850831  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36850832 attgactgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaac 36850884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 11248805 - 11249027
Alignment:
Q  85 ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatg 184  Q
    ||||||| | |||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11248805 ttgtttctaattaagtgtcgctttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttgattatttatttcagagagagaaatatatg 11248904  T
Q  185 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg-t 283  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| || ||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||| |||||||   |    
T  11248905 aaatgagatattacatgatgaaggttactataagaaaaagataaattattgtatcaaaagtagtaaaatgtatttgttgtcttagtttgtgtaaaaaaat 11249004  T
Q  284 cacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  11249005 ca-aaagtgacgattaaaaaggaa 11249027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8008414 - 8008200
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8008414 gttcctttttaagtctc--ttttggagaaaaaatttgtctcaatttaactgtcacttttaaagatcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattac 8008317  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
     |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||   ||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||| |||    
T  8008316 tcttaattatttattgtggagagagaagtatatgaaagaagatattaaattaataagatcattatggtaaaattatacactattgtataaaaagtaataa 8008217  T
Q  251 catttattgattgtcttg 268  Q
    ||||| || |||||||||    
T  8008216 cattt-tttattgtcttg 8008200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Original strand, 5597803 - 5597920
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  5597803 tactcccttcattcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaataatgtttta 5597902  T
Q  141 tcaatattacccttagtt 158  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5597903 tcaatattacccttagtt 5597920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 308
Target Start/End: Original strand, 5598143 - 5598292
Alignment:
Q  149 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||          |||| ||||||||||||    
T  5598143 acccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaa----------attgcatcaaaagtagt 5598232  T
Q  249 aacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    || | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  5598233 aataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaac 5598292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 318
Target Start/End: Original strand, 33720579 - 33720774
Alignment:
Q  123 actttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  33720579 actttaaatgttgttttaccaatattacccttaaatatt-attgcggagagagaaaaacatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaa 33720677  T
Q  223 gt-atcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || |  ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||| ||| || ||||||    
T  33720678 gtaaaaaacaattgtatcaaaaatagtatcatttattgataatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaagaaacggatgtagta 33720774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Original strand, 35605722 - 35605858
Alignment:
Q  185 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtc 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35605722 aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattatatcaaaattaataatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtc 35605821  T
Q  285 acaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    | | ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  35605822 aaatagtgacaattaaaaaggaacgaagatagtaatt 35605858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Original strand, 19093251 - 19093367
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  19093251 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttacca 19093350  T
Q  144 atattacccttagttat 160  Q
    |||||| ||||||||||    
T  19093351 atattatccttagttat 19093367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 318
Target Start/End: Original strand, 1428519 - 1428662
Alignment:
Q  175 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttat 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  | |||||||||||   | |||| |||| |    
T  1428519 gaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattaggtatcttagtttgt 1428618  T
Q  275 gtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1428619 gtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaaaaggaacagatgtagta 1428662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Original strand, 35605436 - 35605555
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  35605436 tgtacttcctccgttgatttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgtttaaatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaaaattaaatgttgttt 35605535  T
Q  139 tatcaatattacccttagtt 158  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  35605536 taccaatattatccttagtt 35605555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 318
Target Start/End: Original strand, 1859084 - 1859347
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||| | ||||||||| |||  | |||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| | ||||||    
T  1859084 cgttcctttatatttgttacttttgcataaattttttatttttagttaagtgtcattttcaaagtttaatacatcattaaatgttgttttacctatatta 1859183  T
Q  150 cccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
    ||||||  |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||  |  ||||||| |||| |||||||||    
T  1859184 cccttatatatttatta--tagagagaagtatatgaaatgagatattagatgattaaggttgttatagaaaaa--aaaaattattttatctaaagtagta 1859279  T
Q  250 acatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | |  ||||  |||||||| ||||||||||| || | || |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1859280 a-aagtatttgttgtcttgatttatgtaaaaagttaaaatgtgataattaaaaaggaaccgagggagta 1859347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42787478 - 42787329
Alignment:
Q  106 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 205  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||    
T  42787478 tttcaaaattcaatggaatattaactgttcttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatacattatacaagatattaaatgaata 42787379  T
Q  206 aggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    ||| |||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42787378 aggttattattgagaaaggataaattattgtatcaaaagtagtaatattt 42787329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8973666 - 8973432
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||||   | ||||||||||||    
T  8973666 ttttgtttctaattaactgttgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgattttacctatattacccttatatatttattgtagggagagaaatata 8973567  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg 282  Q
    ||||||||  |||||||||| | | | |||||||| ||||  || |||| |||||| ||||||||||| |  ||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  8973566 tgaaatgaagtattaaatgattgatgttattataggaaaaagataaattgttgtataaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttgatttatgtaaaaag 8973468  T
Q  283 tcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8973467 tcaaaatatgacaattaaaaaggaactgaggaagta 8973432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 50152423 - 50152622
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    |||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||    
T  50152423 gttcctttttaattgtcgcttttgcataaatgttttgtttctaattaacttttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattac 50152522  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    ||||  |||||||||   || | | || |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  50152523 ccttgattatttattgtagaaatataattatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattgtaggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaa 50152622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 309
Target Start/End: Original strand, 2572015 - 2572218
Alignment:
Q  105 ttttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 204  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| | |||| | |||||||| |||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  2572015 ttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattacctttatatatttattgcagagagtgaaatatatgaaatgaaatattaaataatt 2572114  T
Q  205 aaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||| |||||||| ||||  || | ||||| ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||| | | ||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  2572115 aaggttattatagaaaaaagataatttattatatcaaaagtagtaa-aaatatttattatcttgatatgtgtaaaaagtcaaaatgagacaattaaaaag 2572213  T
Q  305 gaaca 309  Q
    |||||    
T  2572214 gaaca 2572218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 1428199 - 1428281
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaa 123  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1428199 tactacctcccttcctttttaagtatcagttttagagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaa 1428281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Original strand, 10630450 - 10630667
Alignment:
Q  99 ctgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 198  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | | |||||| | | |||| | ||||||||||||  |||||||| |  ||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  10630450 ctgtcgtttttaaagttcaatgtatcattaaatatggctttacctatattacccttatatatttattgca-agataaaaatatatgaaatgaagtattaa 10630548  T
Q  199 atgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatt 298  Q
    || | ||||| |||||||| ||||  || | || |||||||||||||||||| |  ||||  |||||||  ||||||||||| |||| || |  ||||||    
T  10630549 ataattaaggttattatagaaaaaagataatttgttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttaatttatgtaaaaagtcaaaatgaaacaatt 10630647  T
Q  299 aaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  10630648 aaaaaggaaccgagggagta 10630667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Original strand, 41155255 - 41155524
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||| |||  | ||| |||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||||  |||||    
T  41155255 tactccctccgttcctttattatcgtcacctttccataaaatttttgtttttaattaactgtcgttttcaaaattcaatttatcattaaatgtaatttta 41155354  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||||||| |||  ||||||||   |||  ||||| |||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||  ||||  || | || |||| |||    
T  41155355 cctatattacctttatatatttattggagaggaagaaaaatatgaaatgaagtattaaataattaaggttattatacgaaaaagataatttgttgtctca 41155454  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||||||| | |  ||| || ||||| ||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  41155455 aaagtagtaaaagtatttg-ttatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaataagacaattaaaaaggaacaga 41155524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 312
Target Start/End: Original strand, 45230652 - 45230768
Alignment:
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 294  Q
    |||||| | ||||| ||||| || ||||  || |||| |||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||    
T  45230652 ttaaattattaaggttattagagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaaaagtatttg-ttgtcttggtttatgtaaaaagtcaaaatgtaac 45230750  T
Q  295 aattaaaaaggaacagag 312  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45230751 aattaaaaaggaacagag 45230768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Original strand, 45229968 - 45230124
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |   |||||||| | |||  |||| ||||||||||  |||| | | |||||||| | ||| ||     
T  45229968 tccctccgttcctttataattgtcacttttgcatataaaatttgtttccaattagttgtcgttttcaaagtctaatgtatcattaaatgtggctttgtct 45230067  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  45230068 atattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaat 45230124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Original strand, 52825297 - 52825401
Alignment:
Q  81 ttttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||| | |||||| | |||||||   ||||||||||||    
T  52825297 ttttttgtttttaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttaataatttattgtagagagagaaata 52825396  T
Q  181 tatga 185  Q
    |||||    
T  52825397 tatga 52825401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38569814 - 38569675
Alignment:
Q  104 attttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 203  Q
    ||||||||||| ||||  | | |||||||| |||||| |  |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||| |     
T  38569814 attttcaaagtccaatatatcattaaatgtggttttacctctattacccttatatatttattgccgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattat 38569715  T
Q  204 taaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    ||||| |||||||  ||||  || ||||||||||| ||||    
T  38569714 taaggttattataagaaaaagataaattattgtattaaaa 38569675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 40680698 - 40680631
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt 108  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40680698 tactccctcagttccttttttagtgtttttttgggagaaattttttgtttctatttaactgtcatttt 40680631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1039124 - 1039062
Alignment:
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  1039124 agtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaagaac 1039062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1046030 - 1045968
Alignment:
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  1046030 agtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaagaac 1045968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42787194 - 42787136
Alignment:
Q  257 ttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42787194 ttgattgtcttgatttaggtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 42787136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 49756611 - 49756764
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||  |   |||  |||  || |||||||||||||||||  ||| | |||||||     
T  49756611 tactccctccattcctttttaactgttgcttttgtagaaattttttgtcccttcttatttgttgttgtcaaagttcaatgcaacaataattattgttttg 49756710  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||||  ||||||||  |||||||| | |||| |||||||| || |||||||||    
T  49756711 tcaattatacccttaagtatttattgcagagatagaaatatgtgtaatgagata 49756764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Original strand, 2571929 - 2571992
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtca 104  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||    
T  2571929 tactccatccgttcctttataattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtca 2571992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47591530 - 47591450
Alignment:
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||| || | ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  47591530 aaaagtagcaaaattcattgattgtcttggtatgtgtaaaaggtgaaaaaatgaccattaaaaaggaaccgagggagtaat 47591450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2626819 - 2626785
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2626819 tactccctccgttcctttataagtgtcacttttgg 2626785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 40783716 - 40783833
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  40783716 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 40783815  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  40783816 tgattaagggtattatag 40783833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 47037911 - 47038028
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  47037911 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 47038010  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  47038011 tgattaagggtattatag 47038028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Original strand, 51064796 - 51064893
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  51064796 ttttgtttcactttatttgtcactttcaagtttcaatgcaacgttaattattagtttatcaataatacccttacctatttattgtagagagagaaata 51064893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 140
Target Start/End: Original strand, 3684777 - 3684868
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||  ||||| |||  |||||| ||   |||||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3684777 cctccgtttctttttaaatgtcttttttgaagattttttttctt---atttaactgttatttttaaaattcaatgcaatattaaatgttgtttta 3684868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 140)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 314
Target Start/End: Original strand, 43553020 - 43553292
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43553020 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgga-aaaaaaattgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaacgttgtttta 43553118  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43553119 tcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatca 43553218  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  43553219 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcacaaagcgacaattaaaaagaaacggaggt 43553292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Original strand, 12763415 - 12763640
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12763415 tactccttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-tgtttcaatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 12763513  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12763514 tcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgatattatagtaaaagtatcaattattgtatca 12763613  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtctt 267  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  12763614 aaaacagtaacatttattgattgtctt 12763640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 319
Target Start/End: Original strand, 14263520 - 14263802
Alignment:
Q  37 attgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14263520 attgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgt 14263619  T
Q  137 tttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||     
T  14263620 tttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgc 14263719  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  14263720 atcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggagttagtaa 14263802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 15596324 - 15596601
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  15596324 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaaaattaaatgatgtttta 15596423  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |    
T  15596424 tcaatattacctttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcataa 15596523  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15596524 aaagtaataacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 15596601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14061409 - 14061132
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14061409 tactctctccgttcctttttaagtgtcattttttgaaaaaaattttgtttctgtttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaacattaaaagttgtttta 14061310  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14061309 tcaatattgcccttagttatttattacagagagagaaataaataaaatgtaatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtatca 14061210  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14061209 aaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 14061132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 23429889 - 23430166
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23429889 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 23429988  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  23429989 ccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 23430088  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  23430089 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacgattaaaaaggaatggaggtagta 23430166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33935319 - 33935043
Alignment:
Q  42 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||     
T  33935319 actccctccgttcctttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttac 33935220  T
Q  142 caatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| |||||    
T  33935219 caatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaa 33935120  T
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33935119 aagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 33935043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 318
Target Start/End: Original strand, 6757388 - 6757663
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  6757388 ctccctctgttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttacc 6757487  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaa 242  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |    
T  6757488 aacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattatataaga 6757587  T
Q  243 agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  6757588 aaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtaaaaaaggaacggaggtagta 6757663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 167737 - 167460
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  167737 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttttaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 167638  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  167637 ccaatattatccttagttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagt-tgaagtattgtatca 167539  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg-tcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167538 aaagtagtaatatttattgattatattggtttgtgtgaaatgttaaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 167460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 305
Target Start/End: Original strand, 34046831 - 34047095
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34046831 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 34046930  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  34046931 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 34047030  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagg 305  Q
    ||| ||||| || || |||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34047031 aaaatagtatcaattgttgatattcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 34047095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23848816 - 23848538
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  23848816 tactacctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaacattaaatgttgtttta 23848717  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||   |||||| ||||    
T  23848716 ccaatattatccttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaaatatagtttattgcatca 23848617  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23848616 aaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtcaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 23848538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 34981809 - 34982087
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34981809 tactccctccgttactttttaagtgtcgcttttggagaaattttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 34981908  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  34981909 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatacatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 34982008  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||  | || |||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34982009 aaagtagtattaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 34982087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38483046 - 38482775
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38483046 tactccctccgttcctttttaagtttcacttttgga------ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38482953  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  38482952 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 38482853  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38482852 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38482775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 18291444 - 18291720
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  18291444 tactccctccgttcctttttaagtgtctcctttgaagaaattttttgttgctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgtttta 18291543  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  18291544 cca-tattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 18291642  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18291643 aaagtagtaacaatcattgactatcttgatttttgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 18291720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 13173909 - 13174188
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13173909 tactccctatgttcctttttaagtgtcactttaagagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 13174008  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  13174009 ctaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtactaattattgtataa 13174108  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  13174109 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggagggagtaat 13174188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 9954629 - 9954895
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9954629 tacttcctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaatttagttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 9954728  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  9954729 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatggtaaaagtataacttattgcatca 9954828  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  9954829 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatatgacaattaaaaaggaa 9954895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 7483724 - 7484001
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7483724 tactccatccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttcactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 7483823  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7483824 ccaacattacccttaattatttattatggaga--gaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataa 7483921  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
     ||  ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7483922 gaaaaagtaacatttatttagtgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaat 7484001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8731087 - 8730810
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8731087 tactccctccgttcctttctaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 8730988  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8730987 ccaacattacccttag-tatttattgcggagagagaaatatatg-aataagataataaatgattaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataa 8730890  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  8730889 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtggcacttaaaaaggaatggaggtagtaat 8730810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 319
Target Start/End: Original strand, 35052032 - 35052311
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35052032 gtactccctccgttcctttttatttgtcacttttggagaaaaaatttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 35052131  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  35052132 accaatattatccttatttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 35052231  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35052232 aaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 35052311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39303776 - 39303498
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39303776 tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 39303677  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  39303676 ccaatattgtctttagttttttattgcggagagagaaatatatgatataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 39303577  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac-aattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39303576 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaaattaaaaaggaacggaggtagta 39303498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 323
Target Start/End: Original strand, 23855536 - 23855819
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggag--aaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |   |||   |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  23855536 tactccctccgttcttttttaagtgtcatttttgaaagaaaaaaatttgtttcaatttaaccgtcactttcaaagtttattgcaacattaaatgttgttt 23855635  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23855636 -atcaatattacccttagttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtatgacgtattgtat 23855734  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23855735 caaaagtagtaatatttattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaaaatgacgattaaaaaggaacggaggtagtaattaa 23855819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 320
Target Start/End: Original strand, 18842513 - 18842788
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||||||||| |||||  |    
T  18842513 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttactagttcaatgcaatattaaatgttattttacta 18842612  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18842613 atattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaa 18842711  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18842712 gtagtaacatttattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 18842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 318
Target Start/End: Original strand, 35296034 - 35296301
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | | |||||    
T  35296034 gttcctttttaagtgtcactttagtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccgacattac 35296133  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||  | |||    
T  35296134 ctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgattaaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaaataa 35296233  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35296234 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 35296301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 36058213 - 36058491
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36058213 tactcactccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 36058312  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  36058313 -caatattatccttagttatttattgctgagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtacaacttattgcatca 36058411  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||| | ||||| | | ||  |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36058412 aaagtagtaacaatcattgactattttaatttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaggaacggagatagtaat 36058491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 2335413 - 2335679
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2335413 tactccatccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 2335512  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  2335513 ccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtatagattattgtataa 2335612  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
     ||  || || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  2335613 gaaaaagaaatatttattgagtatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaaggaa 2335679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38128798 - 38128530
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||| ||||||||||||||| |    
T  38128798 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaa-------tgcaacattaaatgttgttttacc 38128706  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaa 242  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||    
T  38128705 aatattatccttagttatttactacggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaa 38128606  T
Q  243 agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  38128605 agtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggtagta 38128530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2888728 - 2888445
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||  |||    
T  2888728 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttacttt 2888629  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  2888628 actaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatc 2888530  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaaa 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2888529 aaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtatttaaa 2888445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 279
Target Start/End: Original strand, 17718483 - 17718721
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17718483 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgtttta 17718582  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  17718583 ccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 17718682  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaa 279  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17718683 aaaatagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaa 17718721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 3720660 - 3720937
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3720660 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttgaataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 3720759  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||| || || |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||    
T  3720760 ccaatattactctaagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaagcaattgtatca 3720859  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| ||| | | ||||||||||| || |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3720860 aaagcagtcaaacttattgattgttttagtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggagatagta 3720937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21652006 - 21651729
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21652006 tactctctccgttcctttttaagtgtcttttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgccacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 21651907  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  21651906 ccaatattatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaagttattgcatca 21651807  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||  | ||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  21651806 aaagtagtaacgatcattggctatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggagttagta 21651729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 88 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26740350 - 26740117
Alignment:
Q  88 tttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 187  Q
    |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  26740350 tttctatttaactctcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaa 26740251  T
Q  188 tgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaca 287  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26740250 tgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaa 26740151  T
Q  288 aagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26740150 aagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaatt 26740117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 55 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12342860 - 12342600
Alignment:
Q  55 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  12342860 ctttttaactctctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcttt 12342761  T
Q  155 agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatt 254  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |    
T  12342760 aactatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 12342661  T
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12342660 cattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggta 12342600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 19972260 - 19972536
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||   |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  19972260 tactccctccgttcttttttaagtatcactttt-aaaaaaaaatttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgtttta 19972358  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19972359 ccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatattaaataagatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataa 19972458  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19972459 gaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacggaggtagta 19972536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21020573 - 21020297
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||   |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21020573 tactccctccgttcttttttaagtatcactttt-aaaaaaaaatttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgtttta 21020475  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21020474 ccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatattaaataagatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataa 21020375  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21020374 gaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacggaggtagta 21020297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25813008 - 25812732
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25813008 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttta 25812909  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| || |    
T  25812908 ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcataa 25812810  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||  | || |||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25812809 aaagtagtattaattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 25812732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 317
Target Start/End: Original strand, 26062688 - 26062963
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26062688 tactctctccgttcctttttaagtgtcatttttagaaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaa-tgttgtttta 26062786  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  26062787 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 26062886  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagt 317  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26062887 aaagtagtatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagt 26062963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 10180350 - 10180628
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  10180350 tacttcctccattcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaacgttatttta 10180449  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  10180450 ccaatattatctttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatca 10180549  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  10180550 aaagtagtaacaatcattgactatcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggatgtagtaa 10180628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14228582 - 14228305
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttca-atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14228582 tactctctacgttcctttttaagtgtcacttttggagatttttttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 14228483  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||   |||    
T  14228482 accaatattatcctt-gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatgacatc 14228384  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14228383 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 14228305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 93 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43642197 - 43641979
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  43642197 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaattaga 43642098  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  43642097 tgttaaaagaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtg 43641998  T
Q  293 acaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43641997 acaattaaaaaggaacaga 43641979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25703837 - 25703561
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  25703837 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttatttta 25703738  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| || |    
T  25703737 ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcataa 25703639  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||  | || |||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25703638 aaagtagtattaattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 25703561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Original strand, 1245344 - 1245559
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  1245344 atttaattgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgtggagtgaaaaatatatgaaatgaga 1245443  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1245444 atttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgaatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtg 1245543  T
Q  293 acaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||||||    
T  1245544 acaattaaaaaggaac 1245559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 6750597 - 6750788
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  6750597 ctccctctgttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttacc 6750696  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattatt 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6750697 aacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattatt 6750788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 16656681 - 16656943
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16656681 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgtttta 16656780  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  16656781 gcaatattattcttagttatt-attgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 16656879  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||| ||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16656880 aaattagtatcaattgttgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 16656943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12249031 - 12248753
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||     |||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12249031 tactccctccgttcttttttaagtgtcgcttttgaagaaaaaaaattgttctcatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt 12248932  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||  |||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12248931 accaatattatccttgcttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc 12248832  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12248831 aaaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcgtgtaaaatgtcaaaaactgtcaattaaaaaggaacggaggtagta 12248753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23793525 - 23793254
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||     
T  23793525 gttcctttttaattgtcatttttaaaaaaatattttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgtaacattgaatgttgttttaccaatattat 23793426  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  23793425 ccttagatatttattacggagagaaaaacatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagtaa 23793326  T
Q  251 catt----tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||    |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793325 catttatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 23793254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32010288 - 32010066
Alignment:
Q  97 aactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatatt 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32010288 aactgtcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgtt 32010189  T
Q  197 aaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaa 296  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  32010188 aaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataaattattgcatcaaaagtagtagcaattattgattgtcttggtttgtgaaaaatgttaaaaagtgacaa 32010089  T
Q  297 ttaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||| |||| || |||||||    
T  32010088 ttaaaaatgaacggaagtagtaa 32010066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8453486 - 8453218
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8453486 tccgttcctttttaagcgtctcttttgaagaa-ttttttgcttctatttaactgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatat 8453388  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    ||||||   |||||||||  ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  8453387 taccctcgattatttattgtggagata--aatatatgaaataagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtataatttattgcatcaaaagtag 8453290  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8453289 taacaattattgattatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 8453218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8554276 - 8553997
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||   |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8554276 tactccctccgttcctttttaagtgtctctcttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 8554177  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  ||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  8554176 actaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatgttaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc 8554078  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  8554077 aaaagtagcaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaaggaacgaaggtagtaat 8553997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Original strand, 33314523 - 33314795
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgga-gaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33314523 tactccgtccgttcctttttaagtgtttctttttgaagaaattttttgtttccatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 33314622  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  | |||||| ||     
T  33314623 actagtatgatccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaggacaacttattgcata 33314722  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagag 312  Q
    |||| |||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  33314723 aaaaatagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaggaaaagag 33314795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45281638 - 45281361
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattt-tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45281638 tactccctccattcttttttaagtgtcacttttggagaaaaaaatttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 45281539  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
      |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  45281538 gccaatattatccttagttatttattgtggagagggaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtgattatagtaaaagtatagtttattgcatc 45281440  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  45281439 aaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaagggaacggagctagta 45281361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 38221793 - 38222069
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  38221793 tactctctccgtttctttttaagtgtcatttttagagaaattttttgtc-ctatttaattgtcactttcaaagttcaatataacaataaatgttgtttta 38221891  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      || |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  38221892 caaacattacccttaattatttatcatggagaaagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattatataa 38221991  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  38221992 gaaaaaataacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacggagttagta 38222069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Original strand, 40228300 - 40228541
Alignment:
Q  66 tcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatt 165  Q
    |||||||||||||||   |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  40228300 tcacttttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttatt 40228399  T
Q  166 acggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtc 265  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||    
T  40228400 gtggagagagaaatatatgaaatgacatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtc 40228499  T
Q  266 ttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  40228500 ttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 40228541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 220
Target Start/End: Original strand, 13327759 - 13327938
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13327759 tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttg 13327858  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaa 220  Q
     |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13327859 ccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaa 13327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 319
Target Start/End: Original strand, 11993872 - 11994139
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11993872 gtactccatccattcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgtttt 11993971  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||            |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  11993972 accaatattgtccttagttatttatagcggagagagaaat------------atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 11994059  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11994060 aaaagtagtatcaattgtttattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 11994139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35498290 - 35498053
Alignment:
Q  81 ttttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  35498290 ttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattagatgtagttttatcaatattgtccttagttatttattacagagatagaaata 35498191  T
Q  181 tatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa 280  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  35498190 tatgatatgtgatattgaataaataagactattatagtaaaagtataaattattatatcaaaagtagtaacatttatgaattgtcttggtttgtgtaaaa 35498091  T
Q  281 tgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    | ||| ||| | | | |||||||||||| ||||||||||    
T  35498090 tttcagaaa-ttaaacttaaaaaggaacggaggtagtaa 35498053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43553504 - 43553295
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||    
T  43553504 gtactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattatttt 43553405  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||    
T  43553404 accaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgcttaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcactgttctatc 43553305  T
Q  240 aaaagtagta 249  Q
    ||||||||||    
T  43553304 aaaagtagta 43553295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11707741 - 11707560
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11707741 tactccctccgttcctttttaagtgtc----ttggagattttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgtttta 11707646  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtat 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  11707645 tcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtat 11707560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17074840 - 17074568
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  17074840 tactccctccgttccttttta-gtgtctcttttgtagaa-ttttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaatttt 17074743  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  ||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||    
T  17074742 actaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgcatc 17074644  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17074643 aaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 17074568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 17573430 - 17573702
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  17573430 tactccctccgttccttttta-gtgtctcttttgtagaa-ttttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaatttt 17573527  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  ||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||    
T  17573528 actaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgcatc 17573626  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17573627 aaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 17573702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27518967 - 27518711
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27518967 tactctctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttta 27518868  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |      || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||  | |||||| || |    
T  27518867 t------tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaagtcattatagtaacagtacaacttattgcataa 27518774  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  27518773 aaagtagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaactattaaaaa 27518711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27911878 - 27911655
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27911878 ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata 27911779  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 294  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||    
T  27911778 ttaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataac 27911679  T
Q  295 aattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | ||||||||| || |||||||||    
T  27911678 acttaaaaaggtacggaggtagta 27911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27958297 - 27958074
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27958297 ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata 27958198  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 294  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||    
T  27958197 ttaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataac 27958098  T
Q  295 aattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | ||||||||| || |||||||||    
T  27958097 acttaaaaaggtacggaggtagta 27958074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40604111 - 40603864
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40604111 tactccctccgttcctttttaagtgtcactgatggataaaaattttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 40604012  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| |   |||||  ||||    
T  40604011 ccaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtttagtttattacatca 40603912  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaa 288  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  40603911 aaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtgacaa 40603864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 309
Target Start/End: Original strand, 4057310 - 4057536
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4057310 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatata 4057409  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||   |||| | || |||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||    
T  4057410 tgaaatgagatattaaattaataagatcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatg 4057509  T
Q  283 tcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  4057510 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaaca 4057536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 31028634 - 31028900
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31028634 tactctctccgtttctttataattgtcacttttagggaaaatttttgtttttatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 31028733  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||| |    
T  31028734 ccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatta 31028833  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| || |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  31028834 aaa-taataacatatattgattatcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaaggaac 31028900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14511686 - 14511411
Alignment:
Q  53 tcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgc--------aactttaaatgttgttttatcaa 144  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |        ||  |||||||||||||||  ||    
T  14511686 tcctttttaattgtcacttttagagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacttcaatgtaatattaaatgttgttttactaa 14511587  T
Q  145 tattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 244  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||||||||     
T  14511586 tattacccttagatatttattgcggagagagaagcatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaa 14511487  T
Q  245 tagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatta-aaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  14511486 tagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaaaggaacggagatagtaa 14511411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16701150 - 16700989
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||    
T  16701150 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaatattaaatgttgttttacca 16701051  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 205  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16701050 atattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 16700989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36112096 - 36111926
Alignment:
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||      
T  36112096 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgtataagaaaa 36111997  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36111996 agtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgt--caaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 36111926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1202652 - 1202441
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||    
T  1202652 atttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtctttagttatttattgcggaaagagaaatatataaaataaga 1202553  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||| | || |||    
T  1202552 tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtg 1202453  T
Q  293 acaattaaaaag 304  Q
    ||||||||||||    
T  1202452 acaattaaaaag 1202441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 11163246 - 11163523
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  11163246 tactccctctgttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 11163345  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  |||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||| ||||    
T  11163346 cctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatca 11163445  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11163446 aaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 11163523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 38074261 - 38074532
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  || |    
T  38074261 cctccgttcctttttaattgtcacttttgtagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttgacatt 38074360  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||  |  |||| |||||||||||||    
T  38074361 attacccttgattatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaatgagcaagattattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagt 38074460  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| || ||||  |||||||| ||| | |||||   |  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  38074461 agtaaaatatatttgttgtcttgatttgtataaaa-aacttaaagtgacaattaaaaaagaacggagggagta 38074532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9687759 - 9687497
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||           |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9687759 tactccttccgttcttttttaagtgtcacttttggagaatttttttgtt-----------gtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 9687671  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| | ||||     |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9687670 ccaacaatacc----attatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataa 9687575  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||  ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||  ||||||||    
T  9687574 gaaaaagtaacatttattgcgtatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgatagttaacaaggaacgaaggtagta 9687497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Original strand, 35051828 - 35052034
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||  ||  ||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35051828 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttgaaaaaaagtt--gttcctctttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 35051925  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||    
T  35051926 ccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaaattagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttttatca 35052025  T
Q  241 aaagtagta 249  Q
    |||||||||    
T  35052026 aaagtagta 35052034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41701703 - 41701464
Alignment:
Q  80 attttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaat 179  Q
    ||||||||||   ||||||||| || ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||| | || ||||||||    
T  41701703 attttttgttcgtatttaactgacacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttcttttaccaacattacttttagttatttattgcagaaagagaaat 41701604  T
Q  180 atatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaa 279  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  41701603 atatgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaaatataaattattgtacaagaaaaagtaatatttattgagtgtcttgatttgtgtaaa 41701504  T
Q  280 atgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    || | | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41701503 atattaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 41701464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9808188 - 9808026
Alignment:
Q  87 gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaa 186  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9808188 gtttctatttaactctcattttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttactaatattgtcattagttatttattgcggagagagaaatatatgaa 9808089  T
Q  187 atgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  9808088 atgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 9808026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13132376 - 13132101
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  13132376 tactcgctccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 13132277  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| |  ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || | |||||| ||||    
T  13132276 cctataatgtccttagtaatttattgcagagagagaaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatca 13132177  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13132176 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagt--caaaatgacaattaaaaaggaacagagggagta 13132101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15647606 - 15647452
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagat 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15647606 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagat 15647507  T
Q  194 attaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||    
T  15647506 attaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15647452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Original strand, 3513390 - 3513542
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagat 193  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3513390 tttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttacctatattatcattagttatttattacagagagataaatatatgaaatgagat 3513489  T
Q  194 attaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  3513490 attaaatgaataaggtcattatagtaaatgtatagcttattgtatcaaaagta 3513542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40521503 - 40521337
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40521503 tactccccccgttcctttttaattgtcacttttggagaaatttttt-ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 40521405  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaa--atatatgaaatgagatattaaatgaataa 206  Q
     |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40521404 ccaatattacctttaaatatttattgcggagagagaaacatatatgaaatgaaatattaaattaataa 40521337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2456318 - 2456095
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||   ||| ||| ||  ||||||||||||| |||| | |    
T  2456318 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcttta---attaattgcg--gagagaaatatataaaataaaa 2456224  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| | ||||| | | ||| |||||||||||||||| || |||    
T  2456223 tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtg 2456124  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    || ||||||||| | | ||||||||||||    
T  2456123 acgattaaaaagaatcggaggtagtaatt 2456095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 307
Target Start/End: Original strand, 6660929 - 6661199
Alignment:
Q  37 attgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | || ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6660929 attgtactccctccgttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgt 6661028  T
Q  137 tttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
    ||| || ||| |  ||||||| ||||||| | |||||| ||||| | |||||  |||||||||| | ||| | ||||||||  |||  || | |||||||    
T  6661029 tttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaataaaagaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaccataagttattgt 6661128  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||||||| | || |||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  6661129 atcaaaagtagtgaaatatatttagtgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 6661199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 307
Target Start/End: Original strand, 6741331 - 6741601
Alignment:
Q  37 attgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | || ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6741331 attgtactccctccgttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgt 6741430  T
Q  137 tttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
    ||| || ||| |  ||||||| ||||||| | |||||| ||||| | |||||  |||||||||| | ||| | ||||||||  |||  || | |||||||    
T  6741431 tttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaataaaagaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaccataagttattgt 6741530  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||||||| | || |||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  6741531 atcaaaagtagtgaaatatatttagtgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 6741601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15623818 - 15623664
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagat 193  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15623818 tttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagat 15623719  T
Q  194 attaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||    
T  15623718 attaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15623664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43553704 - 43553502
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  43553704 tccgttcctttttaagtgtctcttttagagaatttttttgttcctattaaactgtcactttcgaagttaaatgcaacattaaatgttgttttaccgatat 43553605  T
Q  148 tacccttagtta-tttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
     | ||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |  ||| ||||||||||||||    
T  43553604 catccttacttattttattgcggagagaaaaatatatgaaattagatattgaatgaataaggctattataggaaatgggtatattgttgtatcaaaagta 43553505  T
Q  247 gta 249  Q
    |||    
T  43553504 gta 43553502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7606146 - 7605885
Alignment:
Q  52 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacc 151  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  7606146 ttcctttttaagtgtatcttttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttcaagttcaatacaatattaaatgttattttaccaatattatc 7606047  T
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaac 251  Q
    |||| ||||||||   | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||     
T  7606046 cttaattatttatg--gtagagagaaatatatgaaattagatgttaaataaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcattaaaagtaataat 7605949  T
Q  252 atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtag 316  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||  |||||||    
T  7605948 gattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtta-aaaataacaattaaaaaggaagtgaggtag 7605885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 41890510 - 41890711
Alignment:
Q  49 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatt 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  41890510 ccgttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttatt 41890609  T
Q  149 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    || |||  |||||| ||   |||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  41890610 acacttgattatttcttgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagt 41890709  T
Q  249 aa 250  Q
    ||    
T  41890710 aa 41890711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 323
Target Start/End: Original strand, 29125880 - 29126163
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||   |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| ||||    
T  29125880 tgtactccctccgttcctttataaatgtcacttttgcataaaaaatttgtttttaattaactgtcgttttcaaagtccaatgcattattaaatgtggttt 29125979  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || | ||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||| ||||  || |||| ||||||    
T  29125980 tacctatattacgcttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggttatcataggaaaaagataaattgttgtat 29126079  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    |||||||||||| |  ||||  |||||||||||| ||||||| |  | || |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  29126080 caaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagctaaaatgtgacagtgaaaaaggaacagagggagtatttaa 29126163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39615674 - 39615440
Alignment:
Q  79 aattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaa 177  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| |||  | |  |||||    
T  39615674 aattttttgttgctatttaagtgtcactttacatcgttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgtgaaatgagaa 39615576  T
Q  178 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgta 277  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39615575 atatatataatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtaacaaca-ttattaattgtcttggtttatgta 39615477  T
Q  278 aaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  39615476 aaatatcaaaatgtgacaattaaaaagaaacagaggt 39615440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 319
Target Start/End: Original strand, 15281379 - 15281636
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||||||| | | |||                   
T  15281379 ctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaattttttttgtttcaatttatctatcacattcaaagttcaatgcagcatgaaag-------------- 15281464  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
     |||||||||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15281465 -ttacccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagt 15281563  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15281564 agcaacatttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaaca-aggtagtaa 15281636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 319
Target Start/End: Original strand, 15461748 - 15462005
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||||||| | | |||                   
T  15461748 ctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaattttttttgtttcaatttatctatcacattcaaagttcaatgcagcatgaaag-------------- 15461833  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
     |||||||||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15461834 -ttacccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagt 15461932  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15461933 agcaacatttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaaca-aggtagtaa 15462005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 45317632 - 45317899
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  45317632 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttccaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 45317731  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||   |||||| | |||||||   |||||| |||||||||||||  |||| ||||| |  |||| ||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  45317732 cctataaagcccttaataatttattggagagagaaaaatatatgaaatatgataataaataatcaaggatattataggcaaaacataagttattgtatca 45317831  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  45317832 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 45317899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 318
Target Start/End: Original strand, 35029640 - 35029803
Alignment:
Q  154 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacat 253  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||    
T  35029640 tagttatttattgtggagagagaaatatat-aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtgatat 35029738  T
Q  254 ttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| |||| | ||| ||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35029739 ttatggattatattgatttgtataaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 35029803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41643648 - 41643473
Alignment:
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| || | ||||| |||||||    
T  41643648 aatattacccttagttatttattacgaagagagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaaggataatttattatatcaaa 41643549  T
Q  243 agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  41643548 agtagtaacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaattacaattaaaaatgaacggagatagta 41643473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8954959 - 8954682
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  8954959 tactccttccgtttctttttaattgtcatttttgtagaatttttttgtttctaattaactgttactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgtttta 8954860  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||  ||||| ||||  |||||||||   |||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||| ||||  || |||| || |||||    
T  8954859 tctttattatccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaagattattataggaaaaaaataaattgttttatca 8954760  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg-tcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| |  ||||  ||||||| |||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8954759 aaagtagtaaaaagtatttgttgtcttagtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaatgaacggagggagta 8954682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10086398 - 10086150
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||   ||||||||||| ||| |||||| | ||||||  |||||||||||||| | | || | |||||    
T  10086398 tttttaagtgtcattttttgagaaattttgttcttg--tttaactgtcacttttaaagtttagtgcaacaataaatgttgttttaccgacatcatcctta 10086301  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||  |||| |||||    
T  10086300 attatttattgcagagagagaaatatatgaaataatatattaaataactaagactattataat-aaagtataaattattgtataagaaaaagtagcattt 10086202  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  10086201 attgaatgtcttaatttatgtaaaatataaaaaagtgacaatttaaaaggaa 10086150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 318
Target Start/End: Original strand, 41308013 - 41308153
Alignment:
Q  179 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta-tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgta 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  41308013 tatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcaatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttggtatatgta 41308112  T
Q  278 aaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41308113 aaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggaggtagta 41308153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9301799 - 9301536
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||       
T  9301799 ctccatccgttcctttttaattgtcacttttgca--aattttttgtttctaattaactgtcacttttaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgct 9301702  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaa 242  Q
      ||||||||||  || || |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||    
T  9301701 tttattacccttgatttttaattgtagggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaattgttgcatcaaa 9301602  T
Q  243 agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||| |  ||||   | ||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9301601 agtagtaaaaaatatttgatatcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaac 9301536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 313
Target Start/End: Original strand, 42352726 - 42352989
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||   |||||||  | |||||| ||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||||    
T  42352726 tccgttcttttataattgtcacttttgcataaaaaatttgtttttaattaactctcatttttaaagttcattacatcattaaatgttgtttta-ctatat 42352824  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    ||||||||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||  || |||| ||| |||||||||||    
T  42352825 tacccttagatatttattgcagaatgataaatatatgaaatgaggtattaaatgaataaggttattatatgaaaaagataaattgttgcatcaaaagtag 42352924  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagagg 313  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  42352925 taa-aagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaacatgacaattaaaaagaaacagagg 42352989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13935339 - 13935105
Alignment:
Q  38 ttgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||   |||||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||| || ||    
T  13935339 ttgtactccctccgttcctttttaagtgtttcttttggtgaataattttgttcatatttaactgttactttcgaagttcaatacaacattaaatattatt 13935240  T
Q  138 ttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| || |  |  ||||||| || ||||  || |||||||||||||  ||| || ||    
T  13935239 ttaccaatattatccctacttatttattatggagagagaaatatataaagttggtgattaaataaacaaggtaatcatagtaaaagtatgtattgttcta 13935140  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggttt 272  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||||| ||||    
T  13935139 tcaatagtagtaatatttatagaatgtcttagttt 13935105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 308
Target Start/End: Original strand, 31964726 - 31964816
Alignment:
Q  218 taaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31964726 taaaagtatcaattattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaagaggaac 31964816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Original strand, 41305624 - 41305763
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |||  | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41305624 tactcactccgttcttttttaagtatcttttttgaagatttcttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgtttta 41305723  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  41305724 tcaatattacccttaattatttattgcggagagataaata 41305763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 318
Target Start/End: Original strand, 11727606 - 11727839
Alignment:
Q  84 tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatat 183  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||| | ||||   ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  11727606 tttgtttccaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcatcaaatgtggctttacttatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatat 11727705  T
Q  184 gaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt 283  Q
    | |||||  |||||||| | ||||  |||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||| | |  ||||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  11727706 ggaatgaagtattaaattattaagattattatagaaaaaagataaatttttgtatcaaaagtagt-agaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagt 11727804  T
Q  284 cacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     | || | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11727805 taaaatgcgacaattaaaaaggaacagaggaagta 11727839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 320
Target Start/End: Original strand, 8672584 - 8672753
Alignment:
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||| || |||    
T  8672584 ccttagataattattgccgagagagaaacataaaaaatgaaatagtaaataaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaataataa 8672683  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8672684 catttattgattattttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaagtagtaat 8672753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 156
Target Start/End: Original strand, 8672285 - 8672397
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||   ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8672285 tccctccgtttctttttaattgtcacttttagaaaaaaaatttgtatctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacca 8672384  T
Q  144 atattacccttag 156  Q
    |||||||||||||    
T  8672385 atattacccttag 8672397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Original strand, 17313126 - 17313224
Alignment:
Q  110 aaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 208  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17313126 aaagttcaacgcaacattaaatgttattttacaaatattaaccttagttatttattgcggagtgagaaatatattaaatgagatattaaatgaataagg 17313224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 318
Target Start/End: Original strand, 13328121 - 13328227
Alignment:
Q  212 ttatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  13328121 ttatagtaaaagtataacttattgtattaaaagtagtatcaatttttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 13328220  T
Q  312 ggtagta 318  Q
    | |||||    
T  13328221 gatagta 13328227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27193313 - 27193104
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |   |||||||| | |||| |||  |||||||||||||||  | | ||||||||  |||||    
T  27193313 tactccctccgttcctttataattgtcacttttgtatacaaaatttgtttccaattaattgttgttttcaaagttcaatttatcattaaatgtgatttta 27193214  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatag-taaaagtatcaattattgtatc 239  Q
     | |||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  27193213 cctatattacctttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattattaaggttattataggtaaaag-ataaattgttgtatc 27193115  T
Q  240 aaaagtagtaa 250  Q
    |||||||||||    
T  27193114 aaaagtagtaa 27193104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Original strand, 35028586 - 35028693
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35028586 tgtactccttccgttcctttttaaatgtcacttttgaagaaaaattttgtttcaattta--tgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatattgttt 35028683  T
Q  139 tatcaatatt 148  Q
    || |||||||    
T  35028684 taccaatatt 35028693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 302
Target Start/End: Original strand, 30205440 - 30205697
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | || |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  30205440 tactccccccgttcctttataactgtcacttttacataatttttttatttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 30205539  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| |  | ||||| ||||||| |    ||||| |||||  ||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || |||||||||||||    
T  30205540 cctataatgtctttagtaatttattgc----agagagatataaaaaatatgatattaaataattaaggatattatagacaaaccataaattattgtatca 30205635  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaa 302  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||    
T  30205636 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaa 30205697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11016062 - 11015868
Alignment:
Q  104 attttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat-tacccttagttatttatt-acggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 201  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||||  || | ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  11016062 attttcaaagttcaatgtaacattaattatt-ttttatcaataaatatcattagttatttatttatggaatgagaaatatatgaaatcgaatattaaatg 11015964  T
Q  202 aataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatt 298  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||  ||||||   |||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  11015963 agtaaggttattatagtaatagtaaaaattatcccatcaaa-gtagtagcatttaataattgttttggtttatgttaaatgtcaaaacgtgacaatt 11015868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29091148 - 29091078
Alignment:
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29091148 tcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaagaac 29091078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 304
Target Start/End: Original strand, 40608022 - 40608281
Alignment:
Q  49 ccgttcctttttaagtgtcacttttggag-aaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  | |||     
T  40608022 ccgttcctttataactgtcacttttacaggaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataa 40608121  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaat---atatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 244  Q
    | ||||| || ||||||| | ||||| |||||   |||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || | ||||||||||||||     
T  40608122 tgcccttggtaatttattgcagagagggaaatacaatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaaa 40608221  T
Q  245 tagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||| | ||  ||| | | | ||||||| |||| || |||| || |||||||||||||||    
T  40608222 tagtgaaatacatttagtatattggtttgtgtagaaagtcaaaatgtgacaattaaaaag 40608281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 309
Target Start/End: Original strand, 1739881 - 1739941
Alignment:
Q  249 aacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1739881 aacatttattgattgtgttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaaca 1739941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 318
Target Start/End: Original strand, 17313282 - 17313399
Alignment:
Q  201 gaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaa 300  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  17313282 gaataaggtcattatagtaaaagtagaacttattgcatcaaaagtaataacaataattgactatcttcgtttatgtaagatgtcaaaatgtaacaattaa 17313381  T
Q  301 aaaggaacagaggtagta 318  Q
    || ||||| |||||||||    
T  17313382 aagggaacggaggtagta 17313399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40602982 - 40602810
Alignment:
Q  76 agaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagag 175  Q
    ||||||||  |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||  |||| | || ||| |  | ||||| ||||||| |||||||||    
T  40602982 agaaatttcctgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatataacattaaataatgttctttctataatgtctttagtcatttattgcggagagag 40602883  T
Q  176 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    |||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  40602882 aaatatatgaaatataatattaaataattaaggatattataggtaaaatataaattattatataaaaagtagt 40602810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 180
Target Start/End: Original strand, 26628844 - 26628955
Alignment:
Q  69 cttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacg 168  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||       
T  26628844 cttttggagaataattttgtttcactttatttgtcattttcaagtttcaatgcaacattaattattgatttatcaataatacccttacctatttattgta 26628943  T
Q  169 gagagagaaata 180  Q
    ||||||||||||    
T  26628944 gagagagaaata 26628955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28568166 - 28568056
Alignment:
Q  70 ttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacgg 169  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||  ||||| ||| ||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||   |    
T  28568166 ttttggagaattattttgtttcattttacttgtcactttgaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattacccttacctatttattgttg 28568067  T
Q  170 agagagaaata 180  Q
    |||||||||||    
T  28568066 agagagaaata 28568056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28575759 - 28575649
Alignment:
Q  70 ttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacgg 169  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||  ||||| ||| ||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||   |    
T  28575759 ttttggagaattattttgtttcattttacttgtcactttgaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattacccttacctatttattgttg 28575660  T
Q  170 agagagaaata 180  Q
    |||||||||||    
T  28575659 agagagaaata 28575649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 35052305 - 35052379
Alignment:
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  35052305 gtagtaacatttattgaatgtattgatttgtgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaaaaagaacggaggtagta 35052379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41644395 - 41644317
Alignment:
Q  70 ttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||    
T  41644395 ttttgtagaatttttttgtttctatttaattgtcattttcaaaattcaatgcaatattaaatat--ttttatcaatattac 41644317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11707539 - 11707451
Alignment:
Q  216 agtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||||||| | ||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  11707539 agtaaaagtataacttaatacatcaaaagtagtaataattattgattgtcttaatttatgtaaaatgtaaaaatatgacaattaaaaag 11707451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12489861 - 12489737
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||| ||| | || | ||| ||| |||||| ||||||||  ||| ||||||  | ||| |||||||    
T  12489861 ttttgtttcaattaaattgtcgtttttgaagttcaatgaaacatcaattattgatttgtcaataatacccttaactatatattacaaaaagaaaaatata 12489762  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataag 207  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  12489761 tgaaatgagataataaatgattaag 12489737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28562669 - 28562518
Alignment:
Q  70 ttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacgg 169  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||   |    
T  28562669 ttttgaagaattattttgtttcattttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattactcttacctatttatttttg 28562570  T
Q  170 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28562569 agagagaaata-attgaatgaaatcataaatgagtaagggtattatagaaaaa 28562518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31760286 - 31760009
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |     
T  31760286 tactacctccgctcctttgtaact-tcacttttatagatattttttgtttctaattaagtgttattttcaaagtttaatgtaacgttaaatggtgttctt 31760188  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa---tgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
     | ||| |  | ||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||   |  |||||||||| | ||||| ||||||||| |||  || | ||||||||    
T  31760187 cctataatgtctttagtaatttatttcagagagaaaaatatataaaatagtatgatattaaataattaaggatattatagtcaaaacataagttattgta 31760088  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| |||| | ||  |||  | ||||| ||||||||| || |||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31760087 tcaaaaatagtgaaatacatt--tagtcttagtttatgtagaaagtcaaagtatgacaattaaaaaggaacggagggagta 31760009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 304
Target Start/End: Original strand, 39663927 - 39664021
Alignment:
Q  209 ctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  39663927 ctattatagaaaaag-ataaattattctatcaaaagtaataatatttatttattgtcatgatttgtgtaaagagtcaaaaagtaacaattaaaaag 39664021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43553023 - 43552948
Alignment:
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  43553023 agtaacatttattgaatgtattagtttgtataaaatgtcttaaagtgacttttaaaaaggaacggaggtagtaatt 43552948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 308
Target Start/End: Original strand, 17718906 - 17718943
Alignment:
Q  271 ttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17718906 ttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaac 17718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37345789 - 37345672
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  37345789 tgtcattttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 37345690  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  37345689 tgattaagggtattatag 37345672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Original strand, 38238925 - 38238994
Alignment:
Q  69 cttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  38238925 cttttgtagaatttttttgtttctattcatttgtcattttcaaagttcaatgcaacattaactattgttt 38238994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 32010362 - 32010315
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtt 89  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32010362 tactccatccgttcctttttaagtgtc-tttttggagaaattttttgtt 32010315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36112150 - 36112103
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtt 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36112150 tactccctccgttcatttttaagtgtca-ttttggagaatttttttgtt 36112103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 151
Target Start/End: Original strand, 33751227 - 33751290
Alignment:
Q  88 tttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacc 151  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||    
T  33751227 tttcatttttactttcattttcaaagttcaatgcaatattaattattgttttatcaataatacc 33751290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 10013317 - 10013382
Alignment:
Q  135 gttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 200  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  10013317 gttttacctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaat 10013382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11163523 - 11163490
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11163523 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttg 11163490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 11174282 - 11174399
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  11174282 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 11174381  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  11174382 tgattaagggtattatag 11174399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 40058362 - 40058479
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  40058362 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 40058461  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  40058462 tgattaagggtattatag 40058479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 40918790 - 40918907
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  40918790 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 40918889  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  40918890 tgattaagggtattatag 40918907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43929885 - 43929788
Alignment:
Q  105 ttttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 202  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||||| | |||||||    
T  43929885 ttttcaaatctcaatgcaacaataatttttgttttgtcaatatcaccattagttatttattgcaaagagagaaatagattgaatgagacagtaaatga 43929788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7147131 - 7147015
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  7147131 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 7147032  T
Q  200 tgaataaggctattata 216  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  7147031 tgattaagggtattata 7147015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13174186 - 13174154
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcactttt 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13174186 tactccctccgttcctttttaactgtcactttt 13174154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 93)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13001175 - 13000897
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13001175 gtacttcctccgttcgttcttaagtgttacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatcttgtttt 13001076  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  13001075 atcagtattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggctattatagcaaaaatattaattattgtatc 13000976  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13000975 aaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcacaaagtaacaattaaaaaagaacagatgtagta 13000897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 13753935 - 13754213
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13753935 tactcccttcgttcctttttaagtgtctcttttggagaacatttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta 13754034  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta-tcaattattgtatc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13754035 tcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgaaatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtagtaaattattgtatc 13754134  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13754135 aaaagtagtaacatttaatgattgtcttggtttgtgtaaaatgtca-aaagtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaa 13754213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 26342560 - 26342837
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26342560 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttggttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 26342659  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  26342660 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 26342759  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26342760 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 26342837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 39 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11222581 - 11222302
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11222581 tgtactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 11222482  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | |||||| ||    
T  11222481 taccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtacaacttattgcat 11222382  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11222381 caaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 11222302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 14541311 - 14541578
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14541311 tactccctccgttcctttttaaatgtcacttttggagaaaaatattgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgtttta 14541410  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  14541411 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtatcgtatca 14541510  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14541511 aaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaac 14541578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15893847 - 15893561
Alignment:
Q  37 attgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15893847 attgtactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggaaaataaatttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgt 15893748  T
Q  137 tttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||     
T  15893747 tttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgc 15893648  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15893647 atcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtacttaa 15893561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 10812179 - 10812456
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10812179 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 10812278  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| | ||||    
T  10812279 ccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcatca 10812378  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10812379 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 10812456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 322
Target Start/End: Original strand, 44360417 - 44360694
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44360417 tccctccgttcctttttaatcgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatca 44360516  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  44360517 atat-acccttaaatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaa 44360615  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatta 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44360616 gtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaatta 44360694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 43 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 479235 - 478959
Alignment:
Q  43 ctccctccgttccttttt-aagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  479235 ctccctccgttccttttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttat 479136  T
Q  142 caatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||    
T  479135 caatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaa 479036  T
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  479035 aagtagtatcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaagaacagagatagta 478959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31025203 - 31024924
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  31025203 tactccctccgttcctttttaagtgtcattttgggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgtttta 31025104  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31025103 ccaacattacccttagttatttattatggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataa 31025004  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  31025003 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagttacagttaaaaaggaacggatgtagtaat 31024924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32544049 - 32543783
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32544049 tactccctcagttcctttt-aagagtcatttttggagaatttttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 32543951  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  32543950 tcaatattacctttagttatttattacagagaaaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaaactattatattaaaagtatcaattattgtataa 32543851  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  32543850 aaattagtaatatttattgattgttttggtttatgtaaaatgttataaaatgacaattaaaaaggaac 32543783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 34399182 - 34399461
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34399182 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaaccatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 34399281  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  34399282 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 34399381  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34399382 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaat 34399461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15183264 - 15182986
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15183264 tactcccttcgttcctttttaagtgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 15183165  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  15183164 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 15183065  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15183064 aaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 15182986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14296020 - 14295743
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14296020 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta 14295921  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  14295920 ccaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataccttattgcatca 14295821  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14295820 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaattgaggtagta 14295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 41885605 - 41885882
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41885605 tactccctccgttcctttttaggtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 41885704  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    |||||| ||||    
T  41885705 ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtacagcttattgcatca 41885804  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41885805 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatgaaaaaggaacggaggtagta 41885882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30264856 - 30264593
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||     
T  30264856 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattg 30264757  T
Q  150 cccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  30264756 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagta 30264657  T
Q  250 acatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagagg 313  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  30264656 tcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagg 30264593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 51 - 319
Target Start/End: Original strand, 9706778 - 9707045
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  9706778 gttcttttttaagtgtcatttttgaagaaaaattt-gttttaatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 9706876  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9706877 ccttagttatttattatggagagataaatatataaaatgagatatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaa 9706976  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9706977 tatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgggggtagtaa 9707045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 37093435 - 37093706
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  37093435 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatcaat 37093534  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  37093535 attgtccttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagtc-attatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagt 37093633  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  37093634 agtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggtacggagggagta 37093706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 9369954 - 9370217
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  9369954 tactccctcagtttctttttaattgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaagtgttgtttta 9370053  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  9370054 tcaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 9370153  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9370154 aaagtagtaacacttattaatggtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 9370217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Original strand, 3363584 - 3363842
Alignment:
Q  61 aagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttat 160  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3363584 aagtgtcacttttggagaaaagttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttat 3363683  T
Q  161 ttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattga 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  3363684 ttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatcaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattga 3363783  T
Q  261 ttgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3363784 ttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 3363842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35158614 - 35158337
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35158614 tactccctctgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaatattaaatgttgtttta 35158515  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  35158514 ccaatattatccttgcttatttactgtggagaaagaaatatatgaaatgaaatagtaaatgaataaggttattacagtaaaagtatatattattgtatca 35158415  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35158414 aaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 35158337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25558444 - 25558169
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25558444 ctccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagtt-aatgcaacattaaatgttgttttatc 25558346  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaa 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  25558345 aatattatccttagttatttattgcggagagata--tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtctagcttattgtatcaaa 25558248  T
Q  243 agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||||||    
T  25558247 agtagtatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaatcaagaaagaacggaggtagtaatt 25558169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 43077272 - 43077546
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43077272 tactccctctattcctttttaattgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 43077371  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||  |||||||||    
T  43077372 ccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaataaggccaatatagtaaaagtaataacaattgtatca 43077471  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43077472 aaagtaataacacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 43077546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 318
Target Start/End: Original strand, 19594328 - 19594607
Alignment:
Q  38 ttgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19594328 ttgtactccctccgttcctttttaattgtcactttttgagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaa-ttcaatgcaacattaaatgttgtt 19594426  T
Q  138 ttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
    ||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| |    
T  19594427 ttaccaatattgtccatagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgca 19594526  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || || |||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19594527 tcaaaagtaatatcaattgttgattatctttgtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 19594607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 14288411 - 14288686
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  14288411 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttta 14288510  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| || |    
T  14288511 tcaatattgtccttaattatttatcgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcataa 14288610  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  ||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14288611 aaagtagtatcaattattgattgtctt--tttgtataaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagta 14288686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32855043 - 32854768
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32855043 tactccctccgttcatttataattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 32854944  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||  |||||||||    
T  32854943 ccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattgtagtaaaagtaaaaacaattgtatca 32854844  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32854843 aaagtaataacatttattgattatcttagtt--tgtaaaatgttaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 32854768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 13215373 - 13215650
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13215373 tactccctctgtacctttttaagtgtctcttttagagaattattttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta 13215472  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||||||||||| ||   || |||||||||    
T  13215473 ccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatatatgaaattagattttaaattaatagggttattatagtaaaaatacatatcattgtatca 13215572  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13215573 aaagtagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaattaaaaaggaacggaggtagta 13215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11560310 - 11560030
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11560310 tactccctccgtttcttcttaagtgtcagttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 11560211  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    |||||  ||||    
T  11560210 ccaatattgtccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgcaatgagatattaaatgaataagataattatagtaaaagtacagcttattacatca 11560111  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11560110 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaagtaacagagatagtaatt 11560030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 237
Target Start/End: Original strand, 32674190 - 32674391
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674190 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaacaatcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 32674289  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga----tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattg 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32674290 atcaatattacccgtagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagaggagtattaaatgaataaggctattatagtaaaaatatcaattattg 32674389  T
Q  236 ta 237  Q
    ||    
T  32674390 ta 32674391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 323
Target Start/End: Original strand, 34357158 - 34357440
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34357158 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 34357257  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  34357258 ccaatattatccttagttatttactgtggaaagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatca 34357357  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    ||| |||||  | || |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34357358 aaaatagtataaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcgaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtatttaa 34357440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 318
Target Start/End: Original strand, 36375559 - 36375830
Alignment:
Q  49 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36375559 ccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatagt 36375658  T
Q  149 acc--cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    |    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| |||||| |||    
T  36375659 attatcttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaggta 36375758  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36375759 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 36375830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 316
Target Start/End: Original strand, 13965587 - 13965862
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  13965587 tactccctccattactttttaaatgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatata 13965686  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13965687 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattggatca 13965786  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtag 316  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13965787 aatgtaaaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtag 13965862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36405105 - 36404842
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  36405105 tactccttccgttcatttttaagtgtctcttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttatttta 36405006  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttatt-acggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||    
T  36405005 ccaatattatccttagttatttatttacggatagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatataacttattgcatc 36404906  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  36404905 aaaagtagtaacaatcattgactatcttggttcatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaa 36404842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 320
Target Start/End: Original strand, 4883601 - 4883862
Alignment:
Q  59 ttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagtt 158  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  4883601 ttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagtt 4883700  T
Q  159 atttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttatt 258  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | |||    
T  4883701 atttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaatcatt 4883800  T
Q  259 gattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |  | | || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  4883801 ggctatattagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggatgtagtaat 4883862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 319
Target Start/End: Original strand, 4654697 - 4654977
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||    
T  4654697 tgtactccctccgttccttcttacgtgtcttttttgaagaaatttttcgtttctatttaactgtcacttgcaaagttcaatgcaacattaaatattattt 4654796  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  | |||||| ||    
T  4654797 taccaatattatccttagttatttatagcggagagagaaatgtatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacacaacttattgcat 4654896  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4654897 caaaagtagtaacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgagacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 4654977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13849978 - 13849700
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13849978 tactccctccgtttctttttaattgtcacttttaaagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 13849879  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||  |   |||||||||    
T  13849878 tcaatattacctttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaatagcaattgtatca 13849779  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13849778 aaactaataatatttattgattgttttggtttatataaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 13849700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145567
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28145835 tacttcctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 28145736  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||   |||||| ||||    
T  28145735 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaattatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagt-aaagtatagcttattgcatca 28145637  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt--aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||||| |  ||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  28145636 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttatataaaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 28145567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 1395544 - 1395822
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  1395544 tactccctccgttcctttttaagtgtcacatttgtagaaattttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgtt-tttt 1395642  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  1395643 accaacattacccttagttaattattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaaagactaagactattatagtaaaaatataaattattgtata 1395742  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    | ||  ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1395743 agaaaaagtaacatttattaagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagt-acagttaaaaaggaacggaggtagtaat 1395822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38072482 - 38072216
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38072482 tccgttccttttcaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcatttttgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 38072383  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    || |  |||||| |||||||||||    
T  38072382 tgtctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagttcattataata----tagc--ttattgcatcaaaagtag 38072289  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    || || || |||||||| ||||||| |||||||||| | ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38072288 tatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatatgacaaataaaaaggaacggaggtagtaat 38072216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15677554 - 15677282
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  15677554 tactccctccgttattttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattatttta 15677455  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  15677454 tcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatca 15677355  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||    |||||| || ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15677354 aaagtagtatca-atgttgattgtcttggtttgtg----atgtcaaaatgtgacaatt-aaaaggaacgaaggtagtaa 15677282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 2012848 - 2013038
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||    
T  2012848 tccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 2012947  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2012948 tacccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaattactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat 2013038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 34884801 - 34884523
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34884801 tactacctctgttcctttttaactgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactttcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgtttta 34884702  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||| ||| ||||||||| | | ||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  34884701 tcaatattacctttagatgtttattgcggaaagaaaaacatatgaaataaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 34884602  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||  |||||||||    
T  34884601 aaagtagtaatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtttaaaatgaacgaaggtagtaa 34884523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 286
Target Start/End: Original strand, 6013484 - 6013700
Alignment:
Q  70 ttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacgg 169  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6013484 tttttgagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcgg 6013583  T
Q  170 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgg 269  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||     
T  6013584 aaagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattataataaaagtataaatgattgtataagaaaaagtaacatttattgaatgtcttga 6013683  T
Q  270 tttatgtaaaatgtcac 286  Q
    ||| |||||||||||||    
T  6013684 tttgtgtaaaatgtcac 6013700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 93 - 315
Target Start/End: Original strand, 10263788 - 10264010
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagtt-atttattacggagagagaaatatatgaaatgag 191  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10263788 atttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 10263887  T
Q  192 atattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagt 291  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |    
T  10263888 atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt-ttggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatat 10263986  T
Q  292 gacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||    
T  10263987 gacaatttaaaaggaacggaggta 10264010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 307
Target Start/End: Original strand, 37077155 - 37077416
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |    
T  37077155 cctccgttcatttttaattgtcacttttgaagaaattttttgtttttatttaagtgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttattttgtcatt 37077254  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||    
T  37077255 attaccattggttatttattgcagatagagaaatatatgaaatgagatattaaattatgaaggttattatagaaaaaagataaattattgtataaaaagt 37077354  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa-tgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||| || ||||  || ||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  37077355 agtaaaatgtatttgttatcttggtttgtgtaaaagactca-aaagtgacaattaaaaaggaa 37077416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 320
Target Start/End: Original strand, 8443675 - 8443937
Alignment:
Q  45 ccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt-atca 143  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  8443675 ccctccgctcatttttaattgtcatttttgaagaaattttttgtccctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaatt-aaatgttgtttttacca 8443773  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  |||||           
T  8443774 atattacccttagatatttattgcggagagagaaacaaatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgt------- 8443866  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
          ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8443867 ------acacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 8443937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4952950 - 4952692
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            
T  4952950 tactccctcctttc-tttttaattgtcatttttagagaaattttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatga------- 4952859  T
Q  141 tcaatattacccttagttattt-attacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
      |||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||  || ||||     
T  4952858 --aatattacccttaaatattttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccgttatagtaaaagtaaaaacaatagtatt 4952761  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4952760 aaaagtagtaacatttattgatcattttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaac 4952692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 318
Target Start/End: Original strand, 14308434 - 14308650
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||  ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14308434 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatatcgttttatcaattgtac--ttaattatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 14308531  T
Q  200 tgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatta 299  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  14308532 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 14308631  T
Q  300 aaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| ||| || ||||||    
T  14308632 aaaagaaacggatgtagta 14308650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38186312 - 38186054
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt--ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||      |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  38186312 cctccgttcctttttaagtgttatttttggagaaaaaaaaattgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacca 38186213  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    |||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||  |||||||    
T  38186212 atattgtccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaa 38186113  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaa 302  Q
     || || || || ||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  38186112 ataatatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaataaaaa 38186054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31011905 - 31011704
Alignment:
Q  115 tcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctatta 214  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  31011905 tcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacctttatttatt-attgtggagagagaaatgtatgtaataagatattaaataaacaaggttatta 31011807  T
Q  215 tagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||    
T  31011806 tagtaaaaatag-aattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggt 31011708  T
Q  315 agta 318  Q
    ||||    
T  31011707 agta 31011704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37116816 - 37116584
Alignment:
Q  81 ttttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| |    
T  37116816 ttttttgtatctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatcttacccttagataattattacggagagaaaaaca 37116717  T
Q  181 tatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa 280  Q
     | ||||| | ||||||||| |||||| | |    ||||||      ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37116716 caagaaataaaatattaaataaataagacca----agtaaa------aacaattgtatcaaaaatagtaacatttattggttgtcttggtttgtgtaaaa 37116627  T
Q  281 tgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  37116626 tgtcagagaatgacaattaaaaaggaacggagatagtatttaa 37116584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7529942 - 7529697
Alignment:
Q  67 cacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatta 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |  ||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||     
T  7529942 cacttttgtataaattttttgtttctaaataagtttcactttcaaagttcaacacaatattaaatgatgtgttacctatattacccttagttatttattg 7529843  T
Q  167 cggagagagaaatatatgaaatgaga-tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtc 265  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  7529842 cagagagagaaatatatgaaatgaaaatattaaatgatgaaggctattataggaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatttattagttgtc 7529743  T
Q  266 ttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    ||  ||| ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||    
T  7529742 ttcatttgtgtaaaaagacaaaaaatgacaattaaaaaggaacaga 7529697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 281
Target Start/End: Original strand, 29041932 - 29042167
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  29041932 tactcgctccgttcctttttaattgtcacttttagataaatttttt--ttctatttaactgtcactttcaaagtccaatgcaacattagatattgtttta 29042029  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |  ||||| |||||||||  ||  |||||||||    
T  29042030 ccaatattacccgtagatatttatt--gcagagagaaacatatgaaatga-aaattaaattaataacgtcattattgtaaaagtaaaaacaattgtatca 29042126  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaat 281  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||    
T  29042127 aaaatagtaacatttactgattgtctcgatttgtgtaaaat 29042167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Original strand, 25787324 - 25787584
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||   |||| | ||||    
T  25787324 tccgttcctttataattgtcacttttgcataaatattttgtttttaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatat 25787423  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    ||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||       
T  25787424 tacccttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggatattataggaaaaggataaattgttgtatcaaaag--- 25787520  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
           ||||  |||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25787521 -------tatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagagggagta 25787584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3376409 - 3376266
Alignment:
Q  172 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||   ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  3376409 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgttattataataaaaatatagcttattatattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatt 3376310  T
Q  272 tatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3376309 tgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 3376266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 838327 - 838053
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||  | || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||     
T  838327 ctccgttcttttataactgtcgcttttatataatttttttgtttctaattaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctatt 838228  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
     |  ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | ||||||||  |||  || | |||||| ||||||||||    
T  838227 atgtccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagta 838128  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    || | ||  ||| | ||||||||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  838127 gtgaaatgcatttagtgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgcgacaattaaaaaggagcagagggagtaatt 838053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34309312 - 34309149
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34309312 tactccttccattcctttttaagtgtcacttttgaagaattttttt-ttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 34309214  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 205  Q
     |||| ||| | ||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34309213 ccaatgttatcattgcttattcattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaata 34309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Original strand, 45065052 - 45065314
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |  ||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  45065052 tactccctccgttcttttttaattgtcacttttgcatattttttttgtttctaattaagtgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 45065151  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  |||||||||    |||||||| || ||||||| |||||||||||||  || | |||||||| ||||  || |||| ||| ||||    
T  45065152 cctttattacccttgattatttattgtaaagagagaagtaaatgaaataagatattaaatgatgaatgttattatagaaaaaagatgaattgttgcatca 45065251  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||    
T  45065252 aaagtagtaaaaaatatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaattcaaaagtgacaattaaaaa 45065314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 250
Target Start/End: Original strand, 30544514 - 30544706
Alignment:
Q  55 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  30544514 ctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattaccctt 30544613  T
Q  155 agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
      ||||||| |   ||| || || |||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||  || |   |||||||||||||||||||    
T  30544614 gattatttactgtagagggataagtatatgaaataagatattaaatgaagaaagttattataggaaaaagatga---attgtatcaaaagtagtaa 30544706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 178
Target Start/End: Original strand, 14284108 - 14284245
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14284108 tactccatccgtttctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttattcctgtttagttgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 14284207  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaa 178  Q
     |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14284208 ccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaa 14284245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33947692 - 33947415
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |     
T  33947692 tactacctccgttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttctt 33947593  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| |  ||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || |||||||||||||    
T  33947592 cctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatataaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataaattattgtatca 33947493  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| |||| | ||  ||| | | | ||||||| |||| ||  ||| || ||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  33947492 aaaatagtgaaatacatttagtattttggtttgtgtagaaaatcaaaatgtgacaattaaaaagaaactgagggagta 33947415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38148255 - 38148032
Alignment:
Q  84 tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatat 183  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |  ||||||||||  |||||||||   ||||||||| |||||    
T  38148255 tttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttttcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtatat 38148156  T
Q  184 gaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatg 282  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| || |  ||||  ||||||||| || ||| ||||      
T  38148155 gaaatgagatattaaatgatgaaagttattatagaaaaag-atgaattattttatcaaaagtagcaaaaagtatttgttgtcttggcttgtgtaaaaaac 38148057  T
Q  283 tcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38148056 tca-aaagtgacaattaaaaaggaac 38148032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 928294 - 928030
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||||||||||    
T  928294 tactccctccgttcctttataattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtctaatacatcattaaatgttgtttta 928195  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
       ||||||  ||||  ||||||||  | |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||  || |||| ||  ||||    
T  928194 catatattattcttaaatatttatt--gtagagagaaatatattaaatgaagtattaaatgattaaggttattataggaaaaagataaattgttacatca 928097  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| |||||| |  ||||  || |||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  928096 aaaatagtaa-aagtatttgttatcttagtttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaaagaac 928030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28967486 - 28967255
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |  |||    
T  28967486 tccgttcctttttaattgtcacttttgcataa-tttttagtttctaattaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttat 28967388  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    |||||||  ||||||||    ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||| ||||||| |||    
T  28967387 tacccttgattatttatcgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgataaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaaatag 28967288  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa 280  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||| |||||||    
T  28967287 taaaaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaa 28967255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25187356 - 25187241
Alignment:
Q  75 gagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagaga 174  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  25187356 gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattactcttaaatatttattgcggagaga 25187257  T
Q  175 gaaatatatgaaatga 190  Q
    |||| |||||||||||    
T  25187256 gaaacatatgaaatga 25187241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 139
Target Start/End: Original strand, 37660129 - 37660222
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37660129 cctccgttcatttttaattgtcacttttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 37660222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34262916 - 34262808
Alignment:
Q  210 tattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||     
T  34262916 tattatagtaaaaatatatattattatatcaaaagtagtaacaattattgaatgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaattgacaattaaaaaggaacg 34262817  T
Q  310 gaggtagta 318  Q
    |||||||||    
T  34262816 gaggtagta 34262808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Original strand, 42088877 - 42089049
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||  | || || |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |     
T  42088877 tccctccgttcttttataactgtcacttttacataatttctttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcct 42088976  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattata 216  Q
    ||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| |||||||    
T  42088977 ataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattata 42089049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 308
Target Start/End: Original strand, 36173053 - 36173306
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||  | || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||    
T  36173053 cctctgttcttttataactgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttttctat 36173152  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    | |  ||||||| ||||||| | | |||||||||||         |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || ||||||||||||||||||    
T  36173153 aatgaccttagtaatttattgcagggagagaaatat---------gatattaaataattaaggatattataggtaaaccataaattattgtatcaaaagt 36173243  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| | ||  ||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  36173244 agtgaaatacatttagtgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaac 36173306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Original strand, 2991829 - 2992002
Alignment:
Q  79 aattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaa 178  Q
    |||||||| || |||||||||  ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |    
T  2991829 aatttttttttccaatttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagaca 2991927  T
Q  179 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattg 259  Q
     |||||||     ||||||||| ||||| || |||||||| || |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2991928 catatgaa-----atattaaattaataaagccattatagtgaatgtaaaaataatttta-caaaagtagtaacatttattg 2992002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 259
Target Start/End: Original strand, 34721568 - 34721659
Alignment:
Q  167 cggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattg 259  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34721568 cggagagagaaatatatgaaataatatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat-aaaaaaagtaacatttattg 34721659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25186902 - 25186816
Alignment:
Q  232 attgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  25186902 attgtatcaaaagtagtaacatatattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaacggaagtagta 25186816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Original strand, 3041544 - 3041809
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| | ||||    
T  3041544 tactccttacgtccctttataattgtcacttttgcataaaattttgtttttaatt-aactatcattttcaaagtttaatgtatcattaaatgtggcttta 3041642  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||||||||| |  ||||||||  | ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||  |||||||| ||||  || |||| |||||| |    
T  3041643 cctatattaccctaatatatttatt--gtagagagaaatacatgaaatgaagtattaaatgattaagaatattataggaaaaagataaattgttgtatta 3041740  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||| ||| |  ||||  |||||||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||| ||||||    
T  3041741 aaagtaataa-aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtca-aatgtaacaattaaaaagtaacaga 3041809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 37353969 - 37354247
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||  | |||    ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||||     
T  37353969 tactccctctgttcctttataactgtcacttttataaaaaaaaattgtttttaattaactgtcactttcaaagttcaacgtgacattaaatgttgttttt 37354068  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||   |||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||  |||||||||| | ||| | ||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  37354069 cctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatataaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaacataagttattgtatca 37354168  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||| | || || |   ||||||| ||| |||||||  | | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37354169 aaagtagtgaaatataattggtgtcttgatttgtgtaaaaaattaaaatgtgacaattaaaatggaacggaggtagtaa 37354247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 260
Target Start/End: Original strand, 36824486 - 36824590
Alignment:
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||   | |||||| || |||| |||||||| ||    
T  36824486 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaataaataagatcattacagtaaaagtgcaacttattgcattaaaaatagtaacaatt 36824585  T
Q  256 attga 260  Q
    |||||    
T  36824586 attga 36824590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 280
Target Start/End: Original strand, 37660845 - 37660956
Alignment:
Q  169 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttg 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  |  |||| |||||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||    
T  37660845 gagagagaaacatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaaagaaaaattgttgtattaaaagtagtaaaatgcatttgttgtcttg 37660944  T
Q  269 gtttatgtaaaa 280  Q
    |||| |||||||    
T  37660945 gtttgtgtaaaa 37660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18904150 - 18904009
Alignment:
Q  65 gtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttat 164  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||         |||  ||||||||| ||||||    
T  18904150 gtcacttttatagaaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgtt---------ataaaacccttagtaatttat 18904060  T
Q  165 tacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattat 215  Q
    | | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||| ||||||    
T  18904059 tgcagagagagaaatatataaaatatgatattaaataattaaggatattat 18904009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 14117661 - 14117761
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| |||||| ||||||||  | |||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  14117661 tgtcattttcaaagttcaatgtaacgttaactgttattttgtcaataatacccttaactgtttattccagagagataaatagatgaaataagataataaa 14117760  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  14117761 t 14117761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 318
Target Start/End: Original strand, 14284253 - 14284340
Alignment:
Q  230 ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14284253 ttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaactgaggtagta 14284340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1259695 - 1259615
Alignment:
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  1259695 tcaaaagtagtatcaattgttgattctcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaagaaacggaggtagta 1259615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 308
Target Start/End: Original strand, 32674638 - 32674698
Alignment:
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  32674638 taacctttattgactgtcttggtttgtgtaaaatatcacaaagtgacagttaagaaggaac 32674698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42263762 - 42263619
Alignment:
Q  45 ccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaa 144  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||  | | |||||||  ||| | |||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  42263762 ccctcctttcctttataaccgtcacttttacatatatttttttcttctaattaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttccta 42263663  T
Q  145 tattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 188  Q
    || | || ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  42263662 taatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 42263619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28301744 - 28301670
Alignment:
Q  59 ttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgt 133  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||    
T  28301744 ttaagtgtctcttttgaagaaaaattttgtttcaatttaaatgtcactttcaaagatcaatacaacattgaatgt 28301670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Original strand, 29056179 - 29056252
Alignment:
Q  228 aattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaa 301  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||    
T  29056179 aattgttgcatcaaaagtagtaaaatatatttgttgtcttggtttgtgtagaaagtcaaaaagtgacaattaaa 29056252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10562551 - 10562463
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaa 129  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||   ||||| ||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  10562551 tactccctcctttcctttttaactgtcatttttttggaaatattttgtttctatttatttgtcgttttcaatgttcaatacaacattaa 10562463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 14901944 - 14902036
Alignment:
Q  102 tcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| | ||| ||||| |||| |||||| | |||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  14901944 tcattttcaaagttcaacgtaacattaattattgatttattaataataccctcaattatttatgatggagagagaaatggatgaattgagata 14902036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20683759 - 20683713
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  20683759 ttaactgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttgctttat 20683713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 321
Target Start/End: Original strand, 30545510 - 30545544
Alignment:
Q  287 aaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30545510 aaagtgacaattaaaaaggaacagagggagtaatt 30545544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 70
Target Start/End: Original strand, 10263748 - 10263777
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcact 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10263748 tactccctccgttcctttttaagtgtcact 10263777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 28110154 - 28110219
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatt 165  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  28110154 tgtcattttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataatacccttacatatttatt 28110219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 32901127 - 32901184
Alignment:
Q  105 ttttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttattt 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||| ||| |||||||    
T  32901127 ttttcaaagttcaatgcaacattaattgatgatttatcaataatactcttggttattt 32901184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 40756940 - 40757025
Alignment:
Q  70 ttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  40756940 ttttggagaataattttgtttcactttagttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataataccctta 40757025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 180
Target Start/End: Original strand, 17772559 - 17772627
Alignment:
Q  112 agttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| | |||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17772559 agttcaatgcaacattaactattgttttgttaataatacttttagttatttatttcagagagagaaata 17772627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 171)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26934032 - 26933769
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26934032 tactccctccgttcctttttaagcgttatttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 26933933  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26933932 tcaatattacccttagttatttatcgcagagagagaaatatatgaaatgaaatattaaa-gaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtgtca 26933834  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26933833 aaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacggttaaaaagg 26933769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 302
Target Start/End: Original strand, 37502004 - 37502266
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagt-tcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  37502004 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagggtcaatgcaacattaaatgttgtttt 37502103  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37502104 atcaatattacccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatgtaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatc 37502203  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37502204 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaatcaaaa 37502266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 44217689 - 44217967
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44217689 tactctctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 44217788  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  44217789 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaagaaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatca 44217888  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44217889 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 44217967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13629454 - 13629177
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13629454 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 13629355  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || |    
T  13629354 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatga 13629255  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13629254 aaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 13629177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 55935090 - 55935369
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  55935090 tactccatccgttcctttttaagtgttatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 55935189  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  55935190 ccaacattacccttagttatttattatggagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataa 55935289  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  55935290 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaat 55935369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Original strand, 47751519 - 47751790
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||   ||    
T  47751519 gtactccttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcatttttaaggt-caatgcaactttaaatgtt---tt 47751614  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47751615 atcaatgttacccttagttatttg---cggagagagaaatatctgaaatgagatattaaatgaataaaactattatagtaaaagtatcaattattgtatc 47751711  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| |||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47751712 aaaaatagtaacatttataaattattttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaactgaggtagta 47751790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 41 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19093414 - 19093141
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19093414 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttaaagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 19093315  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  19093314 ccaatattatccttagttatttattgcggagagaggaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatca 19093215  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  19093214 aaagtagtaacaattattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggt 19093141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22828662 - 22828385
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  22828662 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattacatgatgtttta 22828563  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  22828562 tcaatattacccttaattatttattgcagatagagaaatatatgaaataatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 22828463  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22828462 aaagtagtagcaattattggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 22828385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 53600048 - 53599768
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53600048 gtactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttt 53599949  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  53599948 accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatc 53599849  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53599848 aaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 53599768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 44069014 - 44069291
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44069014 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaaaattttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 44069113  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  44069114 tcaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 44069213  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44069214 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 44069291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 46871904 - 46872180
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46871904 tacttcctccgttcctttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 46872003  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  46872004 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagaataacttattgcatca 46872103  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  46872104 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatttaaaaggaac-gaggtagta 46872180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3436328 - 3436066
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3436328 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 3436229  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  3436228 ccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatca 3436129  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  3436128 aaagtagtattaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaa 3436066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38617568 - 38617293
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38617568 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38617469  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  38617468 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 38617369  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38617368 aaagtagtatcaattgttgattg--ttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38617293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Original strand, 42099691 - 42099953
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42099691 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatggtgtttta 42099790  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  42099791 tcaatattacccttaattatttattgcggaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatca 42099890  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  42099891 aaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtttaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 42099953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16465043 - 16464766
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16465043 tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 16464944  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  16464943 ccaatattgtccttagttatttagtgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 16464844  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| ||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16464843 aaaatagtatcaattgttgattgtctaggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaactaaaaaggaacggaggtagta 16464766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Original strand, 29295337 - 29295599
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29295337 tactccctcctttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtgactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 29295436  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| |||     
T  29295437 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtataacttattgcatcg 29295536  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  29295537 aaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgataattaaaaa 29295599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31862247 - 31861970
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31862247 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 31862148  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||| ||||    
T  31862147 ccaatattatccttatttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataattttttgcatca 31862048  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||||    
T  31862047 aaagtagtaacaattattgattatcttagtttgtgtaaaatttcaaaaaataacaattaaaaaggaacggagatagta 31861970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44014176 - 44013895
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44014176 tgtactccctccgttcctttttatgtgtcatttttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 44014077  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||    
T  44014076 taccaatattatccttagttatttattgtggagagataaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcat 44013977  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||| ||||  || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44013976 caaaaatagtttcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 44013895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 320
Target Start/End: Original strand, 353964 - 354228
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  353964 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 354063  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||| |     
T  354064 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaaatagtaacaatc 354163  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  354164 attgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 354228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21045008 - 21044729
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21045008 tactccctcagttcctttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 21044909  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  21044908 ccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgcaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 21044809  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  21044808 aaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataa-taaaaaggaacggaggtagtaatt 21044729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23720040 - 23719768
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23720040 cctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctgtttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 23719941  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||  |||  | |||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23719940 attattcttgctcatttattgtggagaaagaaatatatgaaaagaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagt 23719841  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  23719840 agtaatatttattgaatgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaacggaggtagta 23719768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 48782183 - 48782462
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48782183 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 48782282  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  48782283 ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtattgcttattgcatca 48782381  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  48782382 aaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggatgtaataatt 48782462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 59 - 318
Target Start/End: Original strand, 6195025 - 6195284
Alignment:
Q  59 ttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagtt 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6195025 ttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacattcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 6195124  T
Q  159 atttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttatt 258  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||  || ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||     
T  6195125 atttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaataaacaaggtcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaattatg 6195224  T
Q  259 gattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6195225 gattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 6195284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 56576364 - 56576088
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  56576364 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 56576265  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  56576264 ccaatattatccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 56576166  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || |||||| || || |||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56576165 aaggtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 56576088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 55147320 - 55147044
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  55147320 ctccttccgttcttttttaagtgtcttttttggagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc 55147221  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaa 242  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||   |||||| ||||||    
T  55147220 aatattatccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtatagcttattgcatcaaa 55147121  T
Q  243 agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt-cacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  55147120 agtaataacaattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtaaaaaaaatgacaattaaaaaagaacggaggtagta 55147044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5374611 - 5374336
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5374611 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagctcaatgcaacattaaatgttgtttta 5374512  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  5374511 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 5374412  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtag 316  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  5374411 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggaggtag 5374336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53125499 - 53125240
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  53125499 tactccatccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactttcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgtttta 53125400  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| || |    
T  53125399 tcaatattacccttaattatttattgcggagaaagaaatgtatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcataa 53125300  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaa 300  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  53125299 aaaatagtaacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 53125240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Original strand, 50623397 - 50623658
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50623397 tactccctccgttcctttttaagtgtcactttaggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 50623496  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  50623497 ccaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatca 50623595  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  50623596 aaagtagtatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaa 50623658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Original strand, 16664224 - 16664481
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16664224 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatattttgtccctatttaacggtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 16664323  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     || ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  16664324 ccagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 16664423  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatt 298  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  16664424 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 16664481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35232558 - 35232282
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35232558 tacttcctccgttcctttttaagtgtca-ttttggagaaaattttggttcctatttaactatcacgttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 35232460  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  35232459 ccaatattatccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatca 35232360  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| |||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  35232359 aaagcagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggatgtagta 35232282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 39671308 - 39671588
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39671308 tactctctccgttccttcataattgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagtttta 39671407  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  39671408 ccaatattgtccttaattatttattgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 39671507  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39671508 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcataatgtgacaattaaataggaacggaggtagtaatt 39671588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 36408706 - 36408969
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36408706 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 36408805  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  36408806 acaatattctctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 36408905  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||||| ||  | || ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36408906 aaagtagtatcaaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 36408969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 36422872 - 36423135
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36422872 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 36422971  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  36422972 acaatattctctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 36423071  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||||| ||  | || ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36423072 aaagtagtatcaaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 36423135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Original strand, 42629307 - 42629577
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42629307 tccgttcatttataattgtcatttttagagaaattttttatttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttatcaatat 42629406  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  42629407 tacccttaattatttaatgcggagagagaaatttatgaaacaaaatattaaatgaaaaaggctattttagtacaagtataaattactgtaccaaaagtag 42629506  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  42629507 taacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaacgaacggatgtagta 42629577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 52258036 - 52257778
Alignment:
Q  57 ttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttag 156  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  52258036 ttttaagtgtcattttttgagaaattttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatctttag 52257937  T
Q  157 ttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattta 256  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  | |||||||||    
T  52257936 ttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacattta 52257837  T
Q  257 ttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  52257836 ttgagtgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaagaaacggaggta 52257778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 30939138 - 30939415
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30939138 tacttcctccgtttctttttaattgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 30939237  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  30939238 ccaatattacccttggatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 30939337  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30939338 aaagtactaccatttattgaccgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 30939415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 47251396 - 47251673
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47251396 tactccttcctttcctttttaactgtctcttttgaagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 47251495  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | |||||| ||||    
T  47251496 tcaatattattcttagctatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtacaacttattgcatca 47251595  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47251596 aaagtagtaacaatcattgattattttggtttatgtaaaatgataaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 47251673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 43887966 - 43888244
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  43887966 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttagataaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatacatcattaa-tgttgtttta 43888064  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||  |   ||||||||     
T  43888065 tcaatattacccttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaatagcaattgtatc- 43888163  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43888164 aaagtagtaacatttattgattctcttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaatt 43888244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42513280 - 42513009
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42513280 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttactatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 42513181  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  42513180 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgtgatattaaatgaataaggtcatgatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtag 42513081  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaa-gtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||  | || |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42513080 tattaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatttcaaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 42513009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 33809070 - 33809344
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  33809070 tactctctccgttcctttttaattgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacattcaaagtttaatgcaatagtaaatgttgtttta 33809169  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||  ||  |||| ||||    
T  33809170 ccaatattacccctagatatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtcaatataaaaacaattgcatca 33809269  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33809270 aaagtagtaacatttattgattgttttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 33809344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39683975 - 39683698
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39683975 tactccttccgttcttttttaagtgtcatttttgtagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 39683876  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||   |||||| ||||    
T  39683875 tcaatattgtccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcgttatactaaaaatatagcttattgcatca 39683776  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39683775 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtgaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 39683698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 52057699 - 52057433
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttt--caatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccct 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  52057699 tttttaagtgtcacttttgaagaatttttttttttttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttattttatcaatattatcct 52057600  T
Q  154 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacat 253  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  52057599 tagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgaaatattaaataaataagattattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatat 52057500  T
Q  254 ttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  52057499 ttattgattggattggtttgtgtaaaatgtcaaatagt-acagttaaaaaggaagggaggtagtaatt 52057433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52677406 - 52677222
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52677406 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 52677307  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52677306 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta 52677222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 33084461 - 33084723
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33084461 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttgaagaaactttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta 33084560  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  33084561 ccaatattatctttagttatttgttgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 33084660  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||||| |||||||     ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33084661 aaagtagtaacaattattga-----ttggtttctgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaac 33084723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38542531 - 38542270
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||    
T  38542531 ctccgttcctttttaatcgtcttttttggagaaaaattttgttcctatttaaatgtcactttcaaaattcagtgcaacattaaatattgttttaccaata 38542432  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  38542431 ttatccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataagttcattatagtaaaagtctaacttattgcatcaaaagta 38542332  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38542331 gtaacaattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaac 38542270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 318
Target Start/End: Original strand, 8735382 - 8735649
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  8735382 cgttcatttttaagtgtca-ttttagagaaaaattttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatatta 8735480  T
Q  150 cccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
      |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  8735481 ttcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagta 8735580  T
Q  250 acatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8735581 tcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 8735649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 12252083 - 12252352
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12252083 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 12252182  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  12252183 ccaatattatccttagttatttat--------atgaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 12252274  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12252275 aaagtattatcaattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 12252352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26620612 - 26620332
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26620612 tactccttctgtttctttttaagtgtcacatttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 26620513  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||   |||||| ||||    
T  26620512 ccaatattatccttagttatttattgcggataaataaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatca 26620413  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||| || || ||| |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26620412 aaagtagtatcaattgttgtttgttttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagttagtaatt 26620332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47596869 - 47596607
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||    
T  47596869 cctccgtttctttttaagtgtctcttttgtagaaaatttttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattgagtattgttttatcaat 47596770  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||  | ||||||||||||||||| |||||| | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  47596769 attactcttaattatttattacggagacagaaataattgaaacaatatattaaatgaataaggttattattggaaaaggataatttattgtatcaaaagt 47596670  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47596669 agtaacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaac 47596607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22678571 - 22678292
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggaga-aattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    |||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22678571 tactccctcagttcctttttaagtgtcacttttggaaagaaaaaattgttcttatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt 22678472  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  22678471 accaatattatccttagtaatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 22678372  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    || ||||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22678371 aatagtagtatcaattgttgattatcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagtaa 22678292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 30151655 - 30151922
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30151655 tactcactccgttcctttttaagtatatcttttagagaatttttttgttcttatttaactgtcattttcgaagttcaacgcaacattaaatgttgtttta 30151754  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||    
T  30151755 tcaatattatccttacttatttattgcgcatagagaaatatatgaaattaaatattgaatgaataaggctattatagtaaaagagtatattgttgtatca 30151854  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||| ||||    
T  30151855 aaagcagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagagacaattaaaaatgaac 30151922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 52061546 - 52061820
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||  ||  |||||| | ||| ||||||||     |||||| ||||||| |||||||    
T  52061546 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagatttttttttgttttatttaattatcactttcaaag-----tgcaacattaaatgatgtttta 52061640  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  52061641 tcaatattacccttaattatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 52061740  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52061741 aaagtagtaacaatgattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 52061820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Original strand, 40411926 - 40412203
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  40411926 gtactccctc-gatcctttttaagtgtctcttttggaaaaaaaaattgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatattgtttt 40412024  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||  |||    
T  40412025 atcaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattacatc 40412124  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  40412125 aaaaatagtaacaattattaattgtcttaatttatgtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaataggaacataggtagta 40412203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 42133020 - 42133297
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42133020 tactccctccgttcctttttaatcgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagtttta 42133119  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagt-atcaattattgtatc 239  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||    
T  42133120 tcaatattatccttagatatttattgcggagtgagaaacatatgatgtgaaat-ttaaatcaataaggctattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatc 42133218  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  42133219 aaaaatagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatattgaaaagtgacaattaaaaagaaacgaaggtagta 42133297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Original strand, 35231679 - 35231947
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35231679 ctccgttcttttttaagtatcatttttggagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 35231778  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  35231779 ttgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagta 35231878  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||| || || |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35231879 gtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 35231947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 41414991 - 41415257
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41414991 tactctctccgtttctttttaagtgtcatttttgaagaaattttt-gtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 41415089  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  41415090 ccaacattacccttagctatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtatgaattattatataa 41415189  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||    
T  41415190 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttaatttgtgtaaaatattaaaaagtaaccgttaaaaaggaac 41415257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 318
Target Start/End: Original strand, 44549632 - 44549902
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44549632 ctccattcctttttaagtatcttttttggagaaattttttgttattatttaactgtcgctttcaaagtttaatgcaacattaaatgctgttttatcaata 44549731  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44549732 ttattcttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgtatcaaaagta 44549831  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| | |||||||| || ||| ||||| |||||| ||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  44549832 gtaataattattgatcgttttgatttatataaaatatcaaacagtgataatt-aaaaggaacggaggtagta 44549902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 53691909 - 53691678
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  53691909 ctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacatcattaaatgttgttttatcaata 53691810  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    |||||||||  ||||||||  ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  53691809 ttacccttaaatatttattgtggaaagagaaacatatgaaataaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagta 53691710  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaa 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53691709 gtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaa 53691678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19527469 - 19527215
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19527469 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 19527370  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||            ||||||||||  |||||||||||| |||   |||||||||||    
T  19527369 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaa------------atgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgtatca 19527282  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19527281 aaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 19527215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 316
Target Start/End: Original strand, 54231574 - 54231797
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaact-ttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  54231574 tttaactgtcatttttaaagttcaattcaacaattaaatgttattttactaatattatccttagttatttattatggaaagagaaatatattaaatgaga 54231673  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  54231674 tgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatg 54231773  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggtag 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  54231774 acaattaaaaaggaacggaggtag 54231797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35381675 - 35381417
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35381675 tactccatccgttcctttttatgtgtctcttttgaagat-ttttttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 35381577  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | |||    ||||    
T  35381576 ctaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtacaactta----atca 35381481  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||||| | ||| | | ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35381480 aaagtagtaacaatcattaactatcttaatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 35381417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9220302 - 9220025
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  9220302 tactccctccgttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgtttta 9220203  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |  ||||   ||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  9220202 ccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaaattagcaaggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 9220103  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9220102 aaagtagtaagatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 9220025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 317
Target Start/End: Original strand, 55702914 - 55703179
Alignment:
Q  52 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacc 151  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  55702914 ttcctttttaagcatctcttttgaagattttttttgtttttatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgataatttattaatattacc 55703013  T
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaac 251  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  55703014 cttaattatttattgcagagagagaaatatatgaaataagataataaatgaataaggtcgttatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtaataac 55703113  T
Q  252 atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagt 317  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  55703114 aattattgattgtcttggtatatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggagatagt 55703179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Original strand, 19399569 - 19399795
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  19399569 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaataataaa-gttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaga 19399667  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  19399668 tattaaattactaaggctattatattaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagcg 19399767  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    | | |||||||| ||| |||||||||||    
T  19399768 aaagttaaaaagaaacggaggtagtaat 19399795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 47428512 - 47428779
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47428512 tactccctccattcctttataagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 47428611  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  47428612 ccaatattgtccttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtattacttattgcatca 47428711  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||           || ||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47428712 aaa----------ataatgattatcttgatttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 47428779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4201579 - 4201395
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4201579 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaattcaacattaaatgttgtttta 4201480  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
      ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4201479 ctaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta 4201395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 319
Target Start/End: Original strand, 31369836 - 31370062
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||     
T  31369836 atttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagt 31369935  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
     ||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  31369936 gattaaacaaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtaataacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtcttaaagtg 31370035  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  31370036 acacttaaaaagaaacggaggtagtaa 31370062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36659660 - 36659411
Alignment:
Q  69 cttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  36659660 cttttagagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttattaatattattcttagttatttattgcg 36659561  T
Q  169 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |  ||||||||||||| || | |||||| || |||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  36659560 gagagagaaatatatgaaatgagatgttagataaacaatgtcattatagtaaaagcataacttattgcattaaaaataaaaacaattattgattgtcttg 36659461  T
Q  269 gtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36659460 atttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaagaaggaacggaggtagta 36659411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 56499874 - 56499603
Alignment:
Q  42 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    ||||| || ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||      
T  56499874 actccttctgttcccttttaattttcacttttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgtttttc 56499775  T
Q  142 caatattacccttagttatttattacggagagagaaa--tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
      |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  || |||| |||||||    
T  56499774 ttatattacccttatttatttattgcagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgattagggctattataggaaaaagataaattgttgtatc 56499675  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||| |||||| || ||||  |||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  56499674 aaaaatagtaaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaaggtgacaattaaaaagaaacaga 56499603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 279
Target Start/End: Original strand, 34361039 - 34361276
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   |||||||    
T  34361039 tactccctccgtttctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaa---tgtttta 34361135  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatg--agatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
     | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||| | |||||||||||| |   ||  |||||||    
T  34361136 ccgatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaaaatattaaattaataagaccattatagtaaaaatgaaaacaattgtat 34361235  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34361236 caaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaa 34361276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 47093795 - 47094017
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  47093795 tacttcctccattcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattatatgttgtttta 47093894  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||   |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  47093895 ccaatattatcctttgttatttattgcgaagagagaaatatataaaatgatatgttaaattaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatca 47093994  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattg 263  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    
T  47093995 aaagtagaaacaattattgattg 47094017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 34603607 - 34603884
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  34603607 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 34603706  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    || ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  |  | |||||||||||    
T  34603707 tctataatacccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacacaagttattgtatca 34603806  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || ||||| | ||  ||| | ||||||| ||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34603807 aatgtagtgaaatacatttagtgtcttgatttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagagggagta 34603884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Original strand, 45725563 - 45725796
Alignment:
Q  85 ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatg 184  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  45725563 ttgtttctatttaattgtcatttttaaagttcaatgcaatattaaatattattttatcaatattatccttaattatttattacagagagagaaataattg 45725662  T
Q  185 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtc 284  Q
    |||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| |||||||||||    
T  45725663 aaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaatgataatttattgtatcaaaagtagtaacatttattgactttatttgtttgtgtaaaatgtc 45725762  T
Q  285 acaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  45725763 aaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 45725796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8741886 - 8741680
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8741886 gtactccctctgttcctttttaagtgtcaattttgaagaaaaatttggttcatatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 8741787  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||   |||||| |||    
T  8741786 accaatattatctttagttatttattgtggagagtgaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatc 8741687  T
Q  240 aaaagta 246  Q
    |||||||    
T  8741686 aaaagta 8741680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 27492344 - 27492510
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27492344 ctccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc 27492443  T
Q  143 aatattacccttagt-tatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 208  Q
    |||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27492444 aatattatgcttagtcaatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataagg 27492510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 47885247 - 47884988
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaa--------agttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||        |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  47885247 gttcctttttaagtgtctcttatggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaagttcaataagtttaatgcaacattaaatgatgttttatc 47885148  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg-aataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||   | |||||| |||||    
T  47885147 aatattacccttaattatttattggagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaaataaggtcattatagtaaaagtcaaacttattgcatcaa 47885048  T
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaa 301  Q
    ||||| ||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  47885047 aagtaataataattattgattgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 47884988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 300
Target Start/End: Original strand, 18781469 - 18781721
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| || ||||| ||||||    
T  18781469 tccgttcctttttaagtctcacttttgttggattttttttcttcaatttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatattcttttaccaatat 18781568  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||   |||||| ||||||||||     
T  18781569 tatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaattgaataaggtaattataataaaagtatatcttattgcatcaaaagtaa 18781668  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaa 300  Q
    ||| | ||||||||| ||||  ||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  18781669 taataattattgattatcttaatttgtgtaaaatgtcgaaaaatgacaattaa 18781721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23623753 - 23623601
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23623753 tccctccgttcctttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacca 23623654  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatatt 196  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23623653 atattatccttaagtatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatt 23623601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Original strand, 9834246 - 9834413
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  9834246 gtactccctcagttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatcttatttt 9834345  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 207  Q
    |   |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9834346 acatatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataag 9834413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 283
Target Start/End: Original strand, 36750539 - 36750774
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||    |||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||    
T  36750539 tccgttcctttttaagtgttatttttggaaaaaaaaattgttcttatttaactgtcacttacaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 36750638  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||  ||    
T  36750639 tacccttaattatttattgcggagagagaaatatataaaataatatattaaatgattaaggctattatagtacaaatataaattattgtataagaaaaag 36750738  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt 283  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  36750739 taacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgt 36750774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18135312 - 18135048
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||  ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18135312 gtactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgtaaaaaaaattgttttca-tttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattt 18135214  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  18135213 tactaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtat 18135115  T
Q  239 c-aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  18135114 caaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaag 18135048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 36292608 - 36292862
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||        ||||||||| |||||||||||||||    
T  36292608 tactccctccgttcctttttaattctcacttttagagaaattttttgttcca-tttaagtgtcactt--------caatgcaacattaaatgttgtttta 36292698  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||  ||| | ||||||     
T  36292699 tcaatattacttttagatatttaatgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagacaattataataaaagtaaaaataactgtatcg 36292798  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  36292799 aaagtagtaacatttattgattgttttggttagtgtaaaatgtcaaaaagtaatcattaaaaag 36292862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 49122522 - 49122258
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||  ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  49122522 gtactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgtaaaaaaaattgttttca-tttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattt 49122424  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  49122423 tactaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtat 49122325  T
Q  239 c-aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  49122324 caaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaag 49122258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 32239383 - 32239606
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32239383 tactccctccgttcctttttaaatgtcacttttggagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 32239482  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   | |||||||||||||   |||||| ||||    
T  32239483 ccaatattatccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataaag---tcatagtaaaagtatagcttattgcatca 32239578  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttg 268  Q
    ||||||||| || || || |||||||||    
T  32239579 aaagtagtatcaattgttaattgtcttg 32239606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44176777 - 44176576
Alignment:
Q  114 ttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctatt 213  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  44176777 ttcaatgcaaaattaaattttgttttaccaatattattcttgcttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaagttatt 44176678  T
Q  214 atagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagagg 313  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44176677 ataataaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgttttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagaaacggagg 44176578  T
Q  314 ta 315  Q
    ||    
T  44176577 ta 44176576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1181157 - 1180885
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  || |    
T  1181157 ctccgttcctttttaattgtcacttttgcagaaatttttttgtttctaattacctgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttggcatt 1181058  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
     ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  |  |||| |||||||||||||    
T  1181057 cttacctttgattatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgagaaaggttattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagt 1180958  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||   |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1180957 agtaaaatgcatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaacctaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 1180885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33755201 - 33755013
Alignment:
Q  130 atgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaa 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||       
T  33755201 atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagc 33755104  T
Q  230 ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||| || ||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33755103 ttattgcattaaaaggagtatcaattgttgattgtcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 33755013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 34464260 - 34464527
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| ||||| |||||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34464260 tactccatctgtttctttttaagtgtcatttttgaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcatagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 34464359  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||   |||||| ||||    
T  34464360 tcaatattatcattagttatttattgtgaagagataaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtatagcttattgcatca 34464459  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||  ||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  34464460 aaagtaatatcaattattgattgttttaatttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaac 34464527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26906608 - 26906383
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26906608 ttttgtttttatttaactgtcactttcaaggttcaatgcaacattaaatattgttttactaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatata 26906509  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| || || || |||||||| || |||| ||||||||     
T  26906508 tgaaatgagatattaaattaataaggtcattaaagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaatatcaattgttgattgttttagtttgtgtaaaata 26906409  T
Q  283 tcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  26906408 tcaaaatatgacaattaaaaatgaac 26906383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 48510130 - 48509852
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||  ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| | ||||    
T  48510130 tactccctccgtttctttataattgtcacttttgcataaagattttgtttttaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggcttta 48510031  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||||||| ||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  48510030 cctatattactcttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaagaatattatagaaaaatgataaatttttgtatca 48509931  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48509930 aaagtagtaa-aaatatttgttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagagggagtaat 48509852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 36750160 - 36750326
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  36750160 tacttcctctgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatacaatattaaatgttgtttta 36750259  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 207  Q
     ||||||||  |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36750260 ccaatattaatcttacttatttattgtggagagacaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataag 36750326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1146310 - 1146040
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||   |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  1146310 tactccatccgttcctttttaattgtcacttttgcagattttttttgtttcttattaactatcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttg 1146211  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg---ctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
     |  ||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    |||||||| |||| ||| |||| ||| |    
T  1146210 cctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatgaaggtaattattatagaaaaaatatgaattgttgca 1146111  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1146110 tcaaaagtagtaaaaagtatttattatcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaac 1146040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29833187 - 29833002
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29833187 tacttcctccgttcatttttaagtgtctcttttggagaaatttcttgttcctatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 29833088  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtat 226  Q
     |||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    ||||||||||||||||    
T  29833087 ccaatgttatcgttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgctaaatgaataaaatcattatagtaaaagtat 29833002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38010027 - 38009750
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  38010027 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttccaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaactttaaatgttgttttt 38009928  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||   |||||||| |||||||   |||||| || ||||||||||  |||||||||| |  || | ||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  38009927 cctataaagcccttagtaatttattggagagagaaaagtatatgaaatatgatattaaataatcaatgatattataggcaaaacataagttattgtatca 38009828  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38009827 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38009750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6091599 - 6091337
Alignment:
Q  57 ttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgt--cattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||| || | |||||||| |  || ||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||   ||    
T  6091599 ttttaaatgtcactttttgagaattttttt-ttcctatttaactatatcactttcaaaattcaatgcaacaataaatattgttttttcaatattattttt 6091501  T
Q  155 agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatt 254  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||    
T  6091500 agttatttattgtgcagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtataaaaaataataagatt 6091401  T
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||||| ||| | | |||| ||| |||   ||| |||||||||||| |||||||||    
T  6091400 tattgagtgtcttgatttgtatgaaatctcaaaaaacaacacttaaaaaggaacggaggtagta 6091337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 320
Target Start/End: Original strand, 14090230 - 14090502
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||     
T  14090230 tccgttcatttataactgtcacttttatagaaattttttgtttataattaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataa 14090329  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  14090330 tacccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacacaagttattgtatcaaatgtag 14090429  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    | | ||  ||| | |||||| |||| |||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14090430 tgaaatacatttagtgtcttagtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaagaacagagggagtaat 14090502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37551926 - 37551650
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |     
T  37551926 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttgtagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttgtg 37551827  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc- 239  Q
     |  |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||||  || | || ||| |||     
T  37551826 cctttattacccttggttatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatgatgaagg--attataggaaaaagataagttgttgaatca 37551729  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| | |||| || || |  |||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37551728 aaaaatggtaaaatgtaattgttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaactgaggtagta 37551650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 308
Target Start/End: Original strand, 23237667 - 23237880
Alignment:
Q  98 actgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagag---aaatatatgaaatgagata 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||    
T  23237667 actgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagattataaatatatgaaatgagata 23237766  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 294  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| || || ||||||||  | |||| |||||||||| | || || ||    
T  23237767 ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatcgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttctagtttgtgtaaaatgttaaaatgtaac 23237866  T
Q  295 aattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||||    
T  23237867 aattaaaaaggaac 23237880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 18091225 - 18091503
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |     
T  18091225 tactacctccgttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttctt 18091324  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||| | |||  || | |||||| ||||    
T  18091325 cctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataattaaaacataagttattgcatca 18091424  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  18091425 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtataaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggagggagtaa 18091503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 324
Target Start/End: Original strand, 3036420 - 3036649
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |||    
T  3036420 atttaattgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttattttaccgatattacccttagtaatttattat--agagagaaatatatgaaataaga 3036517  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    |||||||||||| |  ||||||| | |||   || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||  ||    
T  3036518 tattaaatgaatgaaactattattggaaagagataaatcattgtatcaaaagtaataacatttattgattgttatgatttatgtaaaatgtaaaaatatg 3036617  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggtagtaattaaa 324  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  3036618 acaattaaaaaggaacggaggtaatatttaaa 3036649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 6150677 - 6150944
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  6150677 tactccctccattcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 6150776  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  |||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||| ||||    
T  6150777 cctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaagtgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatca 6150876  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||| |  ||||  ||||||| |||| | |||||  |   ||||||| ||||||||||||||    
T  6150877 aaagtagtaaaaagtatttgttgtcttagtttgtataaaaaattcaaaagtgataattaaaaaggaac 6150944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 306
Target Start/End: Original strand, 38865887 - 38866149
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||  ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |    
T  38865887 tactccttccgttcctttataattgtcacttttgtataaaaattttgtttctaattcactgtcattttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttt-a 38865985  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  || |||| ||| ||||    
T  38865986 cctatattacccttggatatttgttgtagagagagaaatatatgtaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgcatca 38866085  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagga 306  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  38866086 aaagtagtaaaa--tatttgttgtcttaatttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaagga 38866149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 7242223 - 7242446
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||   ||| || ||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  7242223 gtactccttctgttcttttttaactgtctcttttggagaaatgtttc--ttctatgtaactgtcgctttcaaagtttaatacaacattaaatattgtttt 7242320  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |  ||||    
T  7242321 atcaatattatctttagttatttattaatgagagaaatatatgtgaaatgagatattaaattaataaggctatcatagtaaaagtgtaaattgt--tatc 7242418  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtctt 267  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  7242419 aaaagtaacaacatatattgattgtctt 7242446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 310
Target Start/End: Original strand, 48087681 - 48087950
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  48087681 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacttaaattttttgtttttaattaactctcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 48087780  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||| | |||| |||  |||  |  | |||||||||||    
T  48087781 cctataatacccttagtaatttattgcagagagaaaaatatatgaaatatgatattaaataattaaagatattgtaggcaaaacacaagttattgtatca 48087880  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacag 310  Q
    || ||||| | ||  ||| | ||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  48087881 aatgtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacag 48087950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33755343 - 33755223
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33755343 tactcccttcgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 33755244  T
Q  141 tcaatattacccttagttatt 161  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  33755243 ccaatattatccttagttatt 33755223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 3802143 - 3802409
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  3802143 tactccctccgttcctttttaattgtcatttttgcataaattttttgtttctaattaaccgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatattgtttta 3802242  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  |||||||||   ||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||  ||||  ||  |||  |||||||    
T  3802243 cctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataaaatattaaatgatgaaggttattatacgaaaaagatggattgatgtatca 3802342  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgta-aaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||| ||| |  ||||  |||||||||||| ||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  3802343 aaagtaataaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtacgaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaa 3802409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14949345 - 14949078
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||    || ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  14949345 tacttcctctgttcctttataattgtcacttttacgtaatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 14949246  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  14949245 cctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatca 14949146  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  14949145 aaagtagtgaaatacatttagtgtattggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtggcaattaaaaaggaac 14949078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Original strand, 27918585 - 27918755
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  27918585 tactccttccgttcctttttaagtatctcttttgtagaaatgttttgtttctatttagctgtcactttcaaagttcaatcaaatattaaatgttg-ttta 27918683  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctat 212  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  27918684 tcaatattaccattagttatatattgcaaagagagaaatatatgaaacaagatataaaatgaatgaggctat 27918755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 51655133 - 51654855
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||  | | |   |||||||| | |||||| || |||||||||| ||||| | | |||||||| | ||||    
T  51655133 tactccctctgttcctttataattgtcacttttacatacaaaatttgtttccaattaactctcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggcttta 51655034  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    || ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| ||||| |||||||  || |||| ||||||||    
T  51655033 tctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaactattaaattattaaggttattacagtaaaaagataaattgttgtatca 51654934  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||| || |  |||| ||| | ||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  51654933 aaagtag-aaaaagtatttattattttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacgattaaaaaggaacagaggaagtaat 51654855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27654953 - 27654735
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaact-ttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  ||| | ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||| |    
T  27654953 tttaattgtcactttcaaagttcaacacaaatattaaattatgtgttatctatattacccttagttatttattgcagattgataaatatatgaaatgaaa 27654854  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    ||||||||||  || |||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||| || | ||| ||    
T  27654853 tattaaatgatgaaagctattatagaaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatttattagttgtcttagtttgtgtaaaaagttaaaaaatg 27654754  T
Q  293 acaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  27654753 acaattaaaaagaaacaga 27654735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37394420 - 37394298
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37394420 tactctctccgttcctttctaaatgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 37394321  T
Q  141 tcaatattacccttagttattta 163  Q
     ||| |||||||||| |||||||    
T  37394320 ccaacattacccttaattattta 37394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8457172 - 8456895
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||  |||| |||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||| |     
T  8457172 tactacctccgttcctttataaccgtcacttttacagaatttttttgtttcttattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaagggtgttctt 8457073  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
       ||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  8457072 cttataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatca 8456973  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8456972 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtagaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagggagta 8456895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31984269 - 31984150
Alignment:
Q  185 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtc 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31984269 aaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtgttggtttgtgtaaaatgtc 31984170  T
Q  285 acaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  31984169 aaaaagtgacaattaaaaag 31984150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 39308914 - 39309190
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | ||| ||||| | ||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| | | |||||||| ||||||    
T  39308914 tactccctttgttcctttataattatcatttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtaatttttaaagtacaatgtatcattaaatgtagtttta 39309013  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||| ||||  || ||||||| ||| |    
T  39309014 cctatattatccttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagtattaaattattaaggttattataggaaaaagataaattattatatta 39309113  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| |||| |  ||||  || |||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39309114 aaagtggtaa-aagtatttgttatcttagtttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaaggaatagagggagta 39309190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Original strand, 20294267 - 20294478
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||     
T  20294267 tactccctccgtttctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactatcactttcaaagttcaatacaacattaaatcttgttttg 20294366  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaa--atgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    ||  |||||||| |  |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| || |  |  |||| ||||||    
T  20294367 tctttattacccgtgattatttattctagaaagagaaatatatgaaatgagatattaataatgatgaaggttattataggaataagacgaattgttgtat 20294466  T
Q  239 caaaagtagtaa 250  Q
    ||||||||||||    
T  20294467 caaaagtagtaa 20294478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1615260 - 1615053
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  |  ||||||| ||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1615260 ttaactgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattaccattgattatttatt--gtagagagaaatatatgaaatgagata 1615163  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg-tcacaaagtga 293  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||| ||| || | ||| |||||||||||||| |  ||||  |||||||||||| |||||||   ||| |||||||    
T  1615162 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaactgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtga 1615064  T
Q  294 caattaaaaag 304  Q
    |||||||||||    
T  1615063 caattaaaaag 1615053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Original strand, 29511197 - 29511307
Alignment:
Q  212 ttatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||    
T  29511197 ttatagtaaaagtatacattgttgtatcaaaagtagtaacatttatgaaatttcttggtttatgtaaaatgtcaaaaggtgacaattaaaaatgaacgga 29511296  T
Q  312 ggtagtaatta 322  Q
    |||||||||||    
T  29511297 ggtagtaatta 29511307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 55430564 - 55430289
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||   |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||    
T  55430564 tactccctccgttcctttataattgtcacttttgcataaaaaatttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcattgtatcattaaatgtggtttta 55430465  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||||| |||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| | ||| |||||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  55430464 cctatattatccttagatacttattgtgaagagataaatatatgaaattaagtattaaatgattgaggttattataggaaaaagataaattgttgtatca 55430365  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||| |    | |  ||||  || ||||||||| ||||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55430364 aaaat----aaaagtatttgttatcttggtttgtgtaaaaagtaaaaatgtgacaattaaaaaggaaaagagggagtaat 55430289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Original strand, 41813625 - 41813834
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41813625 tactacctccgttcctttttaattgttacttttgcataaaatttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 41813724  T
Q  141 tc-aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
     |   ||||||||||  |||||||||   |||||| || | |||||||| | |||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| || ||||    
T  41813725 ccttttattacccttgattatttattgtagagagataagtgtatgaaataatatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttatatc 41813824  T
Q  240 aaaagtagta 249  Q
    ||||||||||    
T  41813825 aaaagtagta 41813834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41955883 - 41955707
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  41955883 atttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatataattttatcaatattatccttagatatttattgcagagagagaaaaatatgaaatgaaa 41955784  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa 280  Q
    ||||||||           ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  41955783 tattaaat-----------ttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtattaatatttattgattattttggtttgtgtaaaa 41955707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 304
Target Start/End: Original strand, 42645379 - 42645507
Alignment:
Q  176 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatg 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  42645379 aaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaataacaattattgattatcttagtatatg 42645478  T
Q  276 taaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  42645479 taaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 42645507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25098423 - 25098326
Alignment:
Q  126 ttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaag 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  25098423 ttaaatgttgttttattaatattacccttgtttatttattacggagagagaaatgtatgaaataagatattaaataaataagggtatcataggaaaag 25098326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 189
Target Start/End: Original strand, 38617806 - 38617947
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38617806 tccgttcctttttaattgtcacttttagagaaactatctgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatat 38617905  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatg 189  Q
    || |||||  |||||||| | |||||| ||| |||| |||||    
T  38617906 tatccttatatatttattgcagagagaaaaacatattaaatg 38617947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Original strand, 51347240 - 51347393
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaa-----ttttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttg 135  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||     | ||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  51347240 tactccttccgttcctttttaattatcacttttaaagaaaaaaaatattttgttcctatttatctgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttg 51347339  T
Q  136 ttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatg 189  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  51347340 ttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatg 51347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 53467697 - 53467544
Alignment:
Q  157 ttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattta 256  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||   ||||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  53467697 ttatttattacatagagagaagtatatgaaatgagatattaaatgaatgagactataattaaaaaatgataaattattatatcaaaagtagtaatattta 53467598  T
Q  257 ttgattgtcttggtttatgtaaaatgtc-acaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    ||||||   ||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  53467597 ttgattcatttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaaatgacaattaaaaaggaaca 53467544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1391432 - 1391165
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||  | |||    ||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||     
T  1391432 tactccctccgttcctttataaccgtcacttttacaaaaaaaaattgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacactaaatgttgttttt 1391333  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattata-gtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
     | ||| |  ||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||   |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  1391332 cctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatgtgaaaaatgatattaaataattaaggatattatacgtaaaac-ataagttattgtatc 1391234  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||| | ||  ||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  1391233 aaaagtagtgaaatacatttagtatcttggtttgtgtaaaaagtcaaaaagtgacaaataaaaaggaac 1391165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 318
Target Start/End: Original strand, 49089059 - 49089166
Alignment:
Q  211 attatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacag 310  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  49089059 attatagtaaaagtaataacaattgtatcaaacgtagtaatatttattgattgtcttggttcgagtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgg 49089158  T
Q  311 aggtagta 318  Q
    ||||||||    
T  49089159 aggtagta 49089166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 8752182 - 8752270
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 188  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8752182 tgtcaatttcaaattttaaagcaacattaaatgttattttagcaatattacccttagttatttattaaggagagagaaatatatgaaat 8752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Original strand, 17978090 - 17978263
Alignment:
Q  79 aattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaa 178  Q
    |||||||| || |||||||||  ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |    
T  17978090 aatttttttttccaatttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagaca 17978188  T
Q  179 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattg 259  Q
     |||||||     ||||||||| ||||| || |||||||| || |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  17978189 catatgaa-----atattaaattaataaagccattatagtgaatgtaaaaataatttta-caaaagtagtaacatttattg 17978263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52978433 - 52978306
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagat 193  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  52978433 tttaagtgttattttcaaagttcaatttaatattaaatgttgttcta-caagtttaccctttattatttattgtgtagagagaaatatatgaaaagagat 52978335  T
Q  194 attaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52978334 attaaatgaataaggctattatagaaaaa 52978306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 307
Target Start/End: Original strand, 20087211 - 20087419
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||| | ||  |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| | |    
T  20087211 atttaactgttacttataaagtttaatgcaatgttaaatgttgttttattaatgttattcttatttatttattgcggagagagaaatatagaaaataata 20087310  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    |||||||||| ||||  |||| ||||| |||     || | | |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||   |||||||||| ||| ||    
T  20087311 tattaaatgagtaagtttattgtagtagaag-----atcactctatcaaaagtagtaacatttattgatagttttgatttgcctaaaatgtca-aaaatg 20087404  T
Q  293 acaattaaaaaggaa 307  Q
    | |||||||||||||    
T  20087405 ataattaaaaaggaa 20087419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34925577 - 34925444
Alignment:
Q  67 cacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatta 166  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||  | | ||| ||||  |||||||||     
T  34925577 cacttttgcagaaattttttgtttttaattaattgtcactttcaaaattcaatataacattaaatgttgttttaatattgttatccttgattatttattg 34925478  T
Q  167 cggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34925477 cagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaat 34925444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38027631 - 38027559
Alignment:
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38027631 agtaacatttattgagtgttttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38027559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 243
Target Start/End: Original strand, 54029135 - 54029283
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||| ||||  |||||||||   |||||| || |||||||||| |||||    
T  54029135 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttacctttattaaccttgattatttattgtagagagataattatatgaaataagata 54029234  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| || ||||||||    
T  54029235 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttatatcaaaa 54029283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 132
Target Start/End: Original strand, 17698551 - 17698642
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatg 132  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17698551 tactccctctgttccttttttagtgtcgtttttgaagaaattttttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatg 17698642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 311
Target Start/End: Original strand, 43086442 - 43086656
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| || |||    
T  43086442 ttaactgtgactttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttttcctttattacccttgattatttactgc--agagagaaatatatgaaaagaaata 43086539  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtga 293  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| ||| || || |  || ||||  ||| ||| ||||  ||| |||||||    
T  43086540 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtaataaaatgtaatttttatcttaatttgtgtaaaaaactca-aaagtga 43086638  T
Q  294 caattaaaaaggaacaga 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43086639 caattaaaaaggaacaga 43086656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 318
Target Start/End: Original strand, 9834463 - 9834540
Alignment:
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9834463 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 9834540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30152091 - 30151934
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |    
T  30152091 gtactacctccattcctttataactgtcacttttacataaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttat 30151992  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatatta 197  Q
      | ||| | |||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  30151991 tcctataatgcccttaataatttattgcagagatagaaatatatgaaatatgatatta 30151934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19731525 - 19731425
Alignment:
Q  149 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||    
T  19731525 acccttagatatttattgcggagagagaaacatttgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaagtgtatcaaaagtagt 19731426  T
Q  249 a 249  Q
    |    
T  19731425 a 19731425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29832432 - 29832353
Alignment:
Q  230 ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  29832432 ttattgcatcaaaagttgtaacaattattgattgtcttggtataagtaaaatgtcaaaaggagacaattaaaaaggaaca 29832353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Original strand, 56486422 - 56486549
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||    | | |||||||||| |||||| |||    
T  56486422 ttaattgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttggtttatctatattacctttaaatatttattgtaaataaagaaatatataaaatgaaata 56486521  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  56486522 ttaaatgattaaggttattgtagtaaaa 56486549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 320
Target Start/End: Original strand, 17698643 - 17698724
Alignment:
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17698643 caaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaat 17698724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 31984356 - 31984299
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtca 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31984356 ctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtca 31984299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13435306 - 13435160
Alignment:
Q  157 ttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattata-gtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta-acatt 254  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||| || ||| |  |||| ||| |||||| |||||    
T  13435306 ttatttattacagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaattaataatgttattatatgaaaaagaataaataagggtatgaaatgtagtacacatt 13435207  T
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||||   ||| ||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13435206 tattgatt---ttgttttgtgtaaaatacccaaaagtgacaattaaaaag 13435160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 308
Target Start/End: Original strand, 9746296 - 9746478
Alignment:
Q  126 ttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||   |||| |||| || ||||| |||||||||||||||  |||  |||||||| ||||  |    
T  9746296 ttaaatgttgttttgtctttattacccttgattatttattgtagagaaagaagtaaatgaactgagatattaaatgatgaagattattataggaaaaaga 9746395  T
Q  226 tcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    | |||| ||| |||||| ||| ||| |  ||||  |||||||||||| |||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  9746396 tgaattgttgcatcaaaggtaataaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaattcaaaagtgacaattaaaaaggaac 9746478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 42645289 - 42645373
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaac 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42645289 tgtactccttccgttcctttttaagcgtctcttttgaagatttttttt-tctctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac 42645373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53219231 - 53219130
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| ||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  53219231 atttaactgttcttttcaaagttcaatgcaacattaattattgatttgtcaataacccccttagctatttattacatagagagaaatagatgaaatgtga 53219132  T
Q  193 ta 194  Q
    ||    
T  53219131 ta 53219130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52677214 - 52677150
Alignment:
Q  254 ttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52677214 ttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagta 52677150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Original strand, 3588358 - 3588461
Alignment:
Q  77 gaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagaga 176  Q
    |||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||||| | |||| | | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  3588358 gaaagtttttgtttctatctatttgtcattttcaaagttcatttcaacatcacatgttgttttgtcaatatcacccttaattatttattgcagagcgaga 3588457  T
Q  177 aata 180  Q
    ||||    
T  3588458 aata 3588461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 6128991 - 6129129
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||   |||||||||||| |    
T  6128991 ttttgtttcattttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataatacccttatctatttattgtagagagagaaata-a 6129089  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    || ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  6129090 tggaatgaaataataaatgattaagggtattgtagaaaaa 6129129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19692957 - 19692819
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||   |||||||||||| |    
T  19692957 ttttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata-a 19692859  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    |  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19692858 tagaatgaaataataaatgagtaaggatattatagaaaaa 19692819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19703542 - 19703404
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||   |||||||||||| |    
T  19703542 ttttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata-a 19703444  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    |  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19703443 tagaatgaaataataaatgagtaaggatattatagaaaaa 19703404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Original strand, 37987536 - 37987623
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaat 131  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||  ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37987536 tccctccgtttctttctaagtgttatttttgaagaaaaattttgttcctatttaaccgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaat 37987623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52977985 - 52977911
Alignment:
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  52977985 agtaatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaggtaacaattaaaaatgaacaaagatagtaat 52977911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 23237399 - 23237456
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtca 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  23237399 ctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaatttttttgttcctatttatctgtca 23237456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2285693 - 2285584
Alignment:
Q  88 tttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 187  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| | ||||||| |||||  || ||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |    
T  2285693 tttcgatttatctgtctttttcaaagtttaatgcgatgttaactattgttttgtcaatgatagccttagttatttat--cgtagagagaaatttatgaca 2285596  T
Q  188 tgagatattaaa 199  Q
    ||||||||||||    
T  2285595 tgagatattaaa 2285584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7037129 - 7037047
Alignment:
Q  106 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 188  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||| |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  7037129 tttcaaagttcaatacaatattaaatattgctttacctgtattgcccttagttatttattatagagaaagaaatatatgaaat 7037047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 162
Target Start/End: Original strand, 24948658 - 24948720
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttattt 162  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  24948658 tgtcatttttaaagttcaatgaaacattaattgttattttgtcaataatacccttagttattt 24948720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33751389 - 33751327
Alignment:
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||    
T  33751389 attgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggagatagta 33751327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23621962 - 23621905
Alignment:
Q  192 atattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  23621962 atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagta 23621905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4201366 - 4201310
Alignment:
Q  266 ttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatta 322  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  4201366 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaacgaacggaagtagtaatta 4201310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7037235 - 7037159
Alignment:
Q  106 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  7037235 tttcaaagttcaatacaatattaaatattgttttacctatattgcccttaattatttattatagagaaagaaatata 7037159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 322
Target Start/End: Original strand, 36408969 - 36409016
Alignment:
Q  275 gtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatta 322  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36408969 gtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaatta 36409016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 322
Target Start/End: Original strand, 36423135 - 36423182
Alignment:
Q  275 gtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatta 322  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36423135 gtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaatta 36423182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 80
Target Start/End: Original strand, 39923770 - 39923809
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaa 80  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39923770 tactccatccgttcctttttaagtgccacttttggagaaa 39923809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 91
Target Start/End: Original strand, 9746231 - 9746281
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttc 91  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||    
T  9746231 tactacctccgttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttc 9746281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 277
Target Start/End: Original strand, 26915966 - 26916143
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||| |||| |  | ||| || ||||||| | ||||| | ||||||     |||||||||  ||||    
T  26915966 ttaactgttattttcaaagtttaatgtaatattaaatggtgttcttcctataatatccttagtaagttattgcagagaga-----atatgaaatatgata 26916060  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgta 277  Q
    |||||| | ||||| ||||||||  |||  || | ||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||| ||||    
T  26916061 ttaaataattaaggatattatagacaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatatatttagtgtcttggtttgtgta 26916143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13423835 - 13423758
Alignment:
Q  45 ccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgca 122  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||  | || ||||||||||| ||||||    
T  13423835 ccctgcgttcctttttacttgtcacttttgtagaaaatatttgtttctatttacttttcgttttcaaagtttaatgca 13423758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 27918841 - 27918910
Alignment:
Q  252 atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  27918841 atttattgattgtcttgatatgtttaaaatgttaaaaagtaacaattaaaaagaaacggagatagtaatt 27918910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 73
Target Start/End: Original strand, 1180885 - 1180917
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcactttt 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1180885 tactccctccgttcctttttaattgtcactttt 1180917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 318
Target Start/End: Original strand, 34361706 - 34361750
Alignment:
Q  274 tgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  34361706 tgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagtaacggagatagta 34361750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 131)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4175738 - 4175460
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4175738 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 4175639  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  4175638 atcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgtatc 4175539  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4175538 aaaagtagtatcaattgtttattgtcttgctttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 4175460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18437580 - 18437303
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  18437580 tactccctctgtttctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttcaatttaagtgtcactttcaaaatccaatgtaacattaaatgttgtttta 18437481  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18437480 ccaatattacccttagttatttattatggagagagaaatatatgaaatgagataataaataaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatca 18437381  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18437380 aaaatggtaacatttattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 18437303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28463642 - 28463365
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28463642 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 28463543  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28463542 ccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataa 28463443  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| || | |||||||| ||| |||||||||    
T  28463442 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagcgatagttaaaaagaaacggaggtagta 28463365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 6007845 - 6008125
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6007845 tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 6007944  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatag-taaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    ||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  6007945 tcaatattgtctttagttatatattacagagagagaaatatatgaaatgtggtattaaattaataaggctattatagttaaaaatataaatcattgtatc 6008044  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtc-acaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6008045 aaaagtagtaacaattattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 6008125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4985431 - 4985155
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  4985431 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagat-ttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaataatgtttta 4985333  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  4985332 tcaatattacccttaattatttattgaggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatca 4985233  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4985232 aaagtagtaacaactattgattgtcttggtatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 4985155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 34261274 - 34261551
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34261274 tacttcctccattcttttttaagtgtcaattttgcagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgtttta 34261373  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||||||||    
T  34261374 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgtatca 34261473  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34261474 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtctaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 34261551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 39073006 - 39073283
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39073006 tactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggaaaaaaaatttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 39073105  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  39073106 ccaatattatccttagttatttattgcgaagtgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatca 39073205  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39073206 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 39073283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26854351 - 26854085
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26854351 tactccctctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 26854252  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  26854251 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 26854153  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26854152 aaagtagtatcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 26854085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38297874 - 38297595
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttca-atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38297874 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt 38297775  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  38297774 accaacattacccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattacatgattaaggcgattatagtaaaagtataaattattgtata 38297675  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    | ||  ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  38297674 agaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaactgaggtagtaa 38297595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7579925 - 7579647
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7579925 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 7579826  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc- 239  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| | |     
T  7579825 ccaatattgtccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcaaca 7579726  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7579725 aaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 7579647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 8825019 - 8825296
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8825019 tactccttccgttcctttttaagtgtcattttttgagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 8825118  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  8825119 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 8825218  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8825219 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 8825296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 38910236 - 38910512
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38910236 tactctctccgttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38910335  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  38910336 ccaatattatccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 38910434  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38910435 aaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38910512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 42911512 - 42911788
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42911512 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 42911611  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  42911612 ccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaatatgatcattatagtaaaagtataacttattgcatca 42911711  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42911712 aaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaac-gaggtagta 42911788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 321
Target Start/End: Original strand, 4098296 - 4098573
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||  ||    
T  4098296 tccctccgtttctttttaagtatcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcagtacaacattaaatgttgttttgcca 4098395  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4098396 atattatcctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaggtataacttattgtatcaaaa 4098495  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  4098496 gtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggagatagtaatt 4098573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 46 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14794042 - 14793769
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14794042 cctccgttcctttttaaatgtctgttttggagaaattttttgtttctatttaaatgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaat 14793943  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |    
T  14793942 attatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaat 14793843  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14793842 agtaataattattgattatattggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaagggaggtagtaa 14793769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 41 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28024516 - 28024240
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28024516 tactctctctgttcctttttaagtgtctcttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta 28024417  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  28024416 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 28024317  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagt 317  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28024316 aaagtagtaataattattgattgtcttggttggtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagt 28024240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 12664820 - 12665094
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12664820 tactccctccgtttctttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagtttta 12664919  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     ||||| ||||    
T  12664920 ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacatcatattgcatca 12665019  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  12665020 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggta 12665094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 18794745 - 18795022
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18794745 tactccctccattcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 18794844  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||  ||||    
T  18794845 ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacatca 18794944  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||  | || || |||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18794945 aaagtatgatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaagtgtgaaaattaaaaaggaacggaggtagta 18795022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 25343922 - 25344199
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25343922 tactccttccgttcctttgtaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaaccgttactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgtttta 25344021  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  25344022 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatatagcttattgcatca 25344121  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||| | || || |||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25344122 aaagtaggatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgacaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 25344199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12784699 - 12784421
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  12784699 tactccctccgtttctttttaactgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacactaattgttgtttta 12784600  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||| |||||||||||  ||  |||||||||    
T  12784599 ccaatattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagta-aaacaattgtatca 12784501  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12784500 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaattaaaaaggaacagaggtagtaat 12784421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 9076028 - 9076310
Alignment:
Q  41 tactccctccgttccttttta-----agtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttg 135  Q
    |||||||||||||||||||||     | ||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9076028 tactccctccgttcctttttaccaatattgtcacttttggataaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg 9076127  T
Q  136 ttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattg 235  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  9076128 ttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattg 9076227  T
Q  236 tatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9076228 catcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaattatgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 9076310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24075095 - 24074833
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  24075095 tactccctccattcctttttaagtgtctcttttaaagaatttttttgtttatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatatttta 24074996  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  24074995 tcaatattactcttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtataacttattgcatca 24074896  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24074895 aaagtagtaacaattattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 24074833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 6072414 - 6072691
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6072414 tactccctccgtttctttttaagcgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 6072513  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  6072514 ccaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 6072613  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||  ||| ||||||||||   || |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6072614 aaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtttaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 6072691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8230060 - 8229784
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8230060 tactcctttcgttcctttttaagtgtctattttgaagaaattttttattcctatttaactgtcattttccaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 8229961  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  8229960 ccaatattatccttagttatttattccggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcactatagtaaaagtataacttattgcatca 8229861  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8229860 aaagtattaacaattattgattgtcttaatttgtgtaagatgtca-aaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 8229784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 36239424 - 36239697
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36239424 cctccgttcctttttaagtgtctcttttggagatttttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaa 36239523  T
Q  145 tattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 244  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  36239524 tattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaattaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaag 36239623  T
Q  245 tagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  36239624 tagtaacaactattgattgtcttgatatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggagatagta 36239697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 40198750 - 40199027
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  40198750 tacttcctctgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta 40198849  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  40198850 ccaatattatccgtagttatttattgcggagagagaaataaatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 40198949  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  40198950 aaagtagtaacaattgttgattgtcttgatctgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaaaaaagaacggagatagta 40199027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 38702103 - 38702370
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38702103 tactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 38702202  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  38702203 ccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 38702302  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||    
T  38702303 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatattaaaatatgacaattaaaaaggaac 38702370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4427663 - 4427385
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4427663 tactctctccgttcctttttaagtgtttcttttggagaaattttttgttcatattcaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgtttta 4427564  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4427563 ccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgagtgaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatca 4427464  T
Q  241 aaagtagtaa-catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4427463 aaagtagcaataaattactgattgtcttgattcgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 4427385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 38363153 - 38363428
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38363153 tactccatccgttcctttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38363252  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  38363253 ccaatatt--ccttagttattaattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 38363350  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38363351 aaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaattgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 38363428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1795374 - 1795101
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  1795374 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgttacaataaatgttgtttta 1795275  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1795274 ccaacattacccttatttatttattgcgaagagagaaatatacgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtataa 1795175  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1795174 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaaggaacggaggt 1795101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16124517 - 16124240
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||| || | |||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16124517 tactccctccgttcatttttaagtatctcttttgaataaattttttattactatttaactgttaccttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgtttta 16124418  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||| ||||    
T  16124417 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattgcatca 16124318  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16124317 aaagtagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 16124240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28447241 - 28446965
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  28447241 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttcctatttaactctcactttcaaagttaaatgcaacattaaatgttatttta 28447142  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||  | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28447141 taaatattatccttagt-atttattgagaaaagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatca 28447043  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  28447042 aaaatagtaacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggagatagta 28446965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 7403816 - 7404081
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7403816 tactccctccgttcctttataagtgtcacttt--gagaaattttttgttcatatttaactctcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 7403913  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  7403914 ccaatattatccttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatca 7404013  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  7404014 aaaatagtatcaattgttgattatcttggtttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 7404081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12723216 - 12722937
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  12723216 tactccctctgttcctttttaactgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacactaattgttgtttta 12723117  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||| |||||||||||  ||  |||||||||    
T  12723116 ccaatattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagtaaaaacaattgtatca 12723017  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12723016 aaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaattaaaaaggaacagaggtagtaat 12722937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32440170 - 32439917
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32440170 gtactccctctgttcctttttaagtgtcactttaggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt 32440071  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  32440070 accaacattacctttagttatttattgcagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattataataaaagtactaattattgtata 32439971  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtga 293  Q
    | ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32439970 agaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtga 32439917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2134156 - 2133890
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||   |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  2134156 tccgttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattttttgttcttatttaattgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatat 2134057  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  2134056 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaa-tag 2133958  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtag 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  2133957 taacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtca-aaaatgataattaaaaaggcacggaggtag 2133890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5144255 - 5143983
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  5144255 tactccctccgttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgtttta 5144156  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  5144155 ccaacattacccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattataataaaagtataaattattgtataa 5144056  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagagg 313  Q
    | |  ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||| ||| | ||  |||||||||||| ||||    
T  5144055 ataaaagtaacatttattgagtgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaaaataacggttaaaaaggaacggagg 5143983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10359493 - 10359229
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10359493 gtactctctccgtttctttataactgtaacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 10359394  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||   |||||| |||    
T  10359393 accaatattgtccttagttatttattgcggagaaaaaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgcatc 10359294  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10359293 aaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 10359229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 301
Target Start/End: Original strand, 32388953 - 32389208
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttg-tttca-atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32388953 tccgttcctttttaattgtcatttttgaagatttttttttctttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 32389052  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  32389053 attacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagt 32389152  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaa 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32389153 agtaacacttattgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaa 32389208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18020999 - 18020758
Alignment:
Q  67 cacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatta 166  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  18020999 cacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattg 18020900  T
Q  167 cggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| || |||||||||| || || ||||||||||    
T  18020899 cggagagagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattgttgattgtct 18020800  T
Q  267 tggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18020799 tggtctgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 18020758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9127610 - 9127331
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||   |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9127610 tgtactccctccgttcctttttaagtgtctattttgatgaaattttttgttcgtatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattt 9127511  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||    
T  9127510 taccaatattatctttaattatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcat 9127411  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||  ||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9127410 caaaagtgataacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 9127331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6754427 - 6754158
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6754427 ctccgttcctttttaagtgtcacta---gagaaaagttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaata 6754331  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    | |   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  6754330 tcatttttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagta 6754231  T
Q  247 gtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
      | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6754230 tgatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaa 6754158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38017528 - 38017257
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38017528 tactccctccgttcctttttaagtgtc------gtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38017435  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  38017434 ccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 38017335  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| || || || ||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  38017334 aaagtaatatcaattgttgattgtcttcgtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaagaacgaaggtagta 38017257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5843250 - 5842970
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  5843250 tactccctctgttcctttttaatcgttacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcgttttcaaagttcaatgcaatattaaatgtagtttta 5843151  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagt-atcaattattgtatc 239  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||||||    
T  5843150 tcaatatcacctttagatatttattgcagagtgagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatc 5843052  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  5843051 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattaaaaaggaacggatatagtaatt 5842970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21606515 - 21606275
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21606515 tactccctccgttcctttttaaatgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 21606416  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  21606415 ccaacattacccttaattatttattacggagaaagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaaatataaattattgtataa 21606316  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaat 281  Q
     ||  ||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  21606315 gaaaaagtaatatttattaagtgtcttagtttgtgtaaaat 21606275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 323
Target Start/End: Original strand, 26906470 - 26906734
Alignment:
Q  57 ttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt-atcaatattaccctta 155  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  26906470 ttttaagtatcacttttgtagaaattttt-gtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttttaccaatatcaccctta 26906568  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26906569 gttatttattac--agagagaaatatatgaaacaagatattaaatgaatgatgttattattggaaaaggataaattattgtatcaaaagtagtaagattt 26906666  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26906667 attgaatgttttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggaaataattaa 26906734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 319
Target Start/End: Original strand, 425090 - 425363
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  425090 gtactccctccgttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctgtttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt 425189  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     || ||||||||||||| |||  ||||| || |     
T  425190 accaacatttctcttagttatttattgcggagagagaaataaatgaaataagatattaaatg-----ggttattatagtaaaaatatacattatagtcta 425284  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    | ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  425285 agaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtca-aaaatgacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 425363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1297995 - 1297717
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1297995 tactctctccgttcttttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgtttta 1297896  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc- 239  Q
     |||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||     
T  1297895 ccaatattgtccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 1297796  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| |||||  | || ||||||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||    
T  1297795 aaaaatagtattaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaatggaggtagta 1297717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 322
Target Start/End: Original strand, 7408340 - 7408574
Alignment:
Q  88 tttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 187  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7408340 tttcaatttaattgtcactttcaaagttcaaagcaatattaaatattgttttaccaatattactcttacttatttattatggagagaaaaatatatgaaa 7408439  T
Q  188 tgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  7408440 tgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtattaatgtttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaa 7408539  T
Q  288 aagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatta 322  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  7408540 agatgacaattaaaaaggaacgaaggtaataatta 7408574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19831798 - 19831560
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19831798 gtactccctctgttcctttttaagtgtcttttttagagaaattttttgtttctatttaactctcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 19831699  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  19831698 accaatattacccttaactatttattgtggaaagagaa--atattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaacatataaattattgtatc 19831601  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa 280  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19831600 aaaaatattaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaa 19831560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 307
Target Start/End: Original strand, 4017390 - 4017642
Alignment:
Q  55 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  4017390 ctttttaaccgtctcttttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaatattaaatgttgatttaccaatattatcctt 4017489  T
Q  155 agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatt 254  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||  |||| |    
T  4017490 agttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaacaat 4017589  T
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4017590 tattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 4017642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 5119140 - 5119407
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5119140 tactccatcctttcctttttaagtttctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgccactttcaaagttcaatgcatcattaaatattgtttta 5119239  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  5119240 ccaatattatcctttgttatttattactgagagaaaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatca 5119339  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||| | |||||| | | ||| ||||||||||||||||||    
T  5119340 aaagtagaaacaattattgattgtattaatttgtataaaatattaaaaaatgacaattaaaaaggaac 5119407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 308
Target Start/End: Original strand, 6689576 - 6689828
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  6689576 ttttcaagtgtctcttttggagaaattttttgtttctgtttatctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattctta 6689675  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6689676 attatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaaatagtaacaatt 6689775  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| ||||| ||| ||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  6689776 attaattgttttgatttgtgtaaaatgtaaaaaaataacaattaaaaaggaac 6689828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1088138 - 1087911
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1088138 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 1088039  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| | || |||    
T  1088038 tattaaatgaataaagtcgttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtg 1087939  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1087938 acaattaaaaagaaacggaggtagtaat 1087911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12870141 - 12869882
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||   ||||    
T  12870141 tttttaagtgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgttctta 12870042  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||    
T  12870041 gttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 12869942  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
     |||||| ||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  12869941 gttgattatcttggtttgtataaaatatcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggta 12869882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 24228911 - 24229177
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  || |   |||||||||||| | | |||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24228911 tactccgtccgttcctttttaagtgtttctatat-agaaattttttgctcctatttaattgttactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 24229009  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  24229010 tcaatattatctttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaagtgtatattgttgtatca 24229109  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||    
T  24229110 aaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatatcagaaaaagacaattaaaaatgaac 24229177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31985307 - 31985028
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  31985307 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttgcggagaaattttttgtttatattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaaagttatttta 31985208  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||||||||||| ||||||||   | | | |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  31985207 ccgatattacccttaattatttatcttgaacaaagaaatatataaaacgagacattaaatgaataagactattctagtaaaaatataaattattatatta 31985108  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||    
T  31985107 aaagtaatgacatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattagaaagaaacatatgtagtaat 31985028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 84 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39894023 - 39893785
Alignment:
Q  84 tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatat 183  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  39894023 tttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatat 39893924  T
Q  184 gaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt 283  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  39893923 gaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattattttggtttgtgtaaaatgt 39893824  T
Q  284 cacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatta 322  Q
     | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  39893823 taaaaagtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaatta 39893785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37306955 - 37306679
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37306955 tactccatccgttcctttttaactgtcacttttagagaaaaattt-gttcctaattaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgtttta 37306857  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  37306856 ccaatattacccttagatatttattgcagagagaaaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaagaacaattgtatca 37306757  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  37306756 aaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagaaaatgaggtagta 37306679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38503057 - 38502784
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  38503057 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattatttta 38502958  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||  | |||||  ||||    
T  38502957 ccaatattatccttaactatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg----aggtcattatagtaaaagtacaacttattacatca 38502862  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| | ||||| | | ||||||| |||||||||| | || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  38502861 aaagtagtaacaatcattgactattttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtaacaattaaaaagaaacagaggtagta 38502784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2674226 - 2673955
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| |||   |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2674226 cgttcctttttaagtattatttttggaaaaaaaatttgtttgtatataactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 2674127  T
Q  150 cccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
     ||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||    
T  2674126 tcctcagttatttactgcgaagagagaaatatatgaaattagatattaaatgaataaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaata 2674027  T
Q  250 acatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
     || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2674026 tcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaatt 2673955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 249
Target Start/End: Original strand, 31802748 - 31802958
Alignment:
Q  38 ttgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtt 137  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31802748 ttgtacttcttccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaaatttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtt 31802846  T
Q  138 ttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  31802847 ttaccaatattacccttagttatttattgtggagagaaaattatatgaaagaagatattaaattaataaggtcattatgataaaagtataaattattgta 31802946  T
Q  238 tcaaaagtagta 249  Q
    ||||||||||||    
T  31802947 tcaaaagtagta 31802958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Original strand, 4694726 - 4694968
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  4694726 tactccctccgttcatttttaagtatctcttttggagaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttatttta 4694825  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||  ||||    
T  4694826 ctaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattacatca 4694925  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt 283  Q
    |||||| || || ||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  4694926 aaagtattagcaattattgattatcttggtttgtgaaaaatgt 4694968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25027976 - 25027842
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25027976 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 25027877  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25027876 attacccttagttatttattgcggagagagaaata 25027842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 18465663 - 18465925
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18465663 tactcccaccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 18465762  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||  ||||    
T  18465763 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg----attaaatgaacaaaattattatagtaaaagtataacttattacatca 18465858  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||||| || ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||    
T  18465859 aaagtagtatcaattgttgattgttttggtttctgaaaaatatcaaaatatgataattaaaaaggaa 18465925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 31803286 - 31803563
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||   ||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  31803286 tactccatccgttcctttttaactgtcatttttagagaaaaaatttgttcttatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgatgtttta 31803385  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||   || |||||||||||  ||| |||||||||    
T  31803386 ctaatattatccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcgttttagtaaaagtaaaaataattgtatca 31803485  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31803486 aaagtagtaacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 31803563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40209225 - 40208951
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  40209225 tactccctccgttttttattaagtgtcacttctggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgtttta 40209126  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  40209125 ccaacattacccttagttatttattgtggatagagaaatataggaaatatgatattaaatga------ctattatagtaaaagtataaattattgcataa 40209032  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
     ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  40209031 gaaaaagtaatatttattgagtgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaactgacggttaaaaaggaacggaggtaataatt 40208951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 318
Target Start/End: Original strand, 13703063 - 13703336
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaa--ctgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaa 144  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  13703063 ctccgttcctttttaatcgtcacttttagagaaattttttatttctatttaagactgttgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaa 13703162  T
Q  145 tattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagt-atcaattattgtatcaaaa 243  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||    
T  13703163 tattacctttagatatttattgcggagagagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaa 13703261  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13703262 atagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggagatagta 13703336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 37809721 - 37809998
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37809721 tacttcctctgttcctttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgtttta 37809820  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||| | | ||||||||| || |||   |||||||||||||||  ||  |||| ||||    
T  37809821 ccaatattacccttatatatttattgcagagagagaaacatatgaattaaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgcatca 37809920  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37809921 aaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggatcggaggtagta 37809998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4962429 - 4962183
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttca-atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  4962429 tttttaagtgtctcttttagaaaaactttttgtttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatggaacattaaatgttgttttacaaatattatcttt 4962330  T
Q  155 agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatt 254  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||  |    
T  4962329 agttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaaatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtgataacggt 4962230  T
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  4962229 tattgattatcttggtttatgtaaaatgt--caaaatgacaattaaaaa 4962183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25027694 - 25027555
Alignment:
Q  179 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaa 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25027694 tatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttatgtaa 25027595  T
Q  279 aatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  25027594 aatgtcacaaagtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 25027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 306
Target Start/End: Original strand, 37633648 - 37633903
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  37633648 gttcctttttaaccgtcacttttagagaaaaaatttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattac 37633747  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    |||||  |||||||| | || ||||||| ||||||| | | ||||||||| || |||   |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  37633748 ccttatatatttattgcagaaagagaaacatatgaattaaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaa 37633847  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagga 306  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  37633848 catttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaagga 37633903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37303364 - 37303098
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||| |||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  37303364 tactctctccgtttctttttatgtgtcttttttgaagattttttctgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaatgttgtttca 37303265  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||  | |||||  ||||    
T  37303264 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattacatca 37303165  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||||| | | || || |  ||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  37303164 aaagtagtaataatcatcgactaccttagtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaa 37303098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38308330 - 38308106
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagat 193  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| || ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  38308330 tttaactatcactttcaaaattcattgtaataataaatgttgttttatcaacattacccttagttatatattgtaaagagagacatacatgaaataagat 38308231  T
Q  194 attaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtga 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38308230 attaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataaaaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtga 38308131  T
Q  294 caattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |  |||||||||||| |||||||||    
T  38308130 ccgttaaaaaggaacggaggtagta 38308106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 21150459 - 21150731
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |    
T  21150459 cctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccttt 21150558  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||||||||  |||||||||   |||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||| ||||  || |||| |||||||||||||    
T  21150559 attacccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggtttttatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagt 21150658  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg-tcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||   ||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  21150659 agtaaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacagttaaaaaggaacggagggagta 21150731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 21157600 - 21157872
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |    
T  21157600 cctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccttt 21157699  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||||||||  |||||||||   |||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||| ||||  || |||| |||||||||||||    
T  21157700 attacccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggtttttatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagt 21157799  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg-tcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21157800 agtaaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 21157872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 308
Target Start/End: Original strand, 3243801 - 3244025
Alignment:
Q  84 tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatat 183  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  3243801 tttgtttctatttaaccatcgttttcaaaaatcaatgcaatattaaatgttgttttatcaaatttgtcctttgttatttattgtggagagaaaaatatat 3243900  T
Q  184 gaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt 283  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3243901 aaaatgagatattaaatgaataaggctattataggaaaaacaaaaattattgtataaaaaatagtaacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatgt 3244000  T
Q  284 cacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||    
T  3244001 caaaaaatgacaattaaaaatgaac 3244025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Original strand, 13461016 - 13461239
Alignment:
Q  85 ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatg 184  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||     
T  13461016 ttgtttctatttaactgtcacttttaatgttgaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattactcttaattatttattgtggagagagaaatatata 13461115  T
Q  185 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtc 284  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  13461116 aaataagatattaaatgaaaaagattattataataaaaatataaattattgtataacaaaaagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtc 13461215  T
Q  285 acaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  13461216 aaaaagtgacaattaaaaaggaac 13461239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18393228 - 18392956
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  18393228 tactccctctattcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 18393129  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  |||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||| ||||    
T  18393128 cctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatca 18393029  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagagg 313  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18393028 aaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttatgtaaaaatctca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagg 18392956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 306
Target Start/End: Original strand, 7466209 - 7466409
Alignment:
Q  106 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 205  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7466209 tttcaaacttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 7466308  T
Q  206 aggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagg 305  Q
    |||  ||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  7466309 aggtcattatagcaaaagtaaaaataattgtattaaaagtaataacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaagg 7466408  T
Q  306 a 306  Q
    |    
T  7466409 a 7466409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4689048 - 4688870
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4689048 ctccgttcctttttaagtgtca-ttttgaagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 4688950  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtat 226  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  4688949 ttatccttagttatttattgcagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattaaagtaaaagtat 4688870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 25785869 - 25786136
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  25785869 tactacctccgttcctttttaattgtcacttctgcagaaatttttagtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 25785968  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     || ||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||  |  |||| ||||||||    
T  25785969 gcattattacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataagaaaaagaaaaattgttgtatca 25786068  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||| ||  |||   ||||||||||| | |||||  ||  |||| |||||||||||||||||    
T  25786069 aaagtagtaaaatgcatttggtgtcttggtttgtataaaaaatctaaaagcgacaattaaaaaggaac 25786136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42394385 - 42394242
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42394385 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 42394286  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatg 184  Q
    | || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  42394285 tgaacattacccttaggtatttattggggagagagaaatatatg 42394242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9959134 - 9958863
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  9959134 tactccctccgttcctttttacgtgtcacatttagagaaaatttttgtttctatttaaccgtcgctttcaaagttcaatgcaatatcaaatgttgtttta 9959035  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||  ||||| |||| ||||    || | | ||||  ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9959034 ccaatattatccttacctatttattacaaagagaaaaat-tatg----gaca-aataaacaaataagattattatagtaaaagtgtaaattattgtatca 9958941  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  9958940 aaagtagtgacatttattgaatgtattgatttgtgtaaattgtcaaaaaatgacaattaaaaatgaacgaaggtagta 9958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 318
Target Start/End: Original strand, 22582508 - 22582710
Alignment:
Q  115 tcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctatta 214  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22582508 tcaatgtaacattaaatgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta 22582607  T
Q  215 tagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    ||||| ||||||   |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||    
T  22582608 tagtacaagtatagtttattgcatcaaaagtagtataaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatgtga-tattaaaaaggaacggaggt 22582706  T
Q  315 agta 318  Q
    ||||    
T  22582707 agta 22582710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12638189 - 12637940
Alignment:
Q  49 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatt 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||   ||||||   |||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  12638189 ccgttcctttttaattgttacttttagagaaaaaatttgttcgtatttaattgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaaaatt 12638090  T
Q  149 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    ||| |||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||       |  |||||||||||  ||  ||  |||||||||||||||||    
T  12638089 acctttagatatttattgcagaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaat-------gtcattatagtaaagataaaaacaattgtatcaaaagtagt 12637997  T
Q  249 aacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagg 305  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12637996 aatatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18676676 - 18676399
Alignment:
Q  35 agattgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18676676 agattgtacttcctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttttaatta--tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 18676579  T
Q  135 gttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattatt 234  Q
    |||||| |  ||||| ||||  |||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||    
T  18676578 gttttacctttattatccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataggatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgtt 18676479  T
Q  235 gtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt--aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagagg 313  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  |||||||| ||| |||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18676478 gtatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttgatttgtgtaaaaaaattca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagg 18676399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 304
Target Start/End: Original strand, 3892790 - 3893036
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  3892790 tttttaaccgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactatcacttt-aaagttcaatgcaacgttaaatgttattttaccagtattaccctta 3892888  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||| || ||| | ||    
T  3892889 aatatttattgcggagagagaaacatatataataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaataataata-tt 3892987  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  3892988 attgattgacttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaag 3893036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24469893 - 24469617
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaa-gttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||   |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  24469893 tactccttccgttcctttttaagtatcacttt-gaagaaattttt-gttcatatttaactgtcactttaaaaagttcaatgtaacaataaatgttgtttt 24469796  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||| |||| ||||| ||||||||| | |||||  |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||     
T  24469795 accaacattatccttaattatttattgcagagaggaaaatttattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaaatataaatcattgtata 24469696  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | ||  |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  24469695 agaaaaagtaacatttatagtgtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaattgacagtcaaaaaggaacggaggtagta 24469617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11413776 - 11413548
Alignment:
Q  52 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacc 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||    
T  11413776 ttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttttaattaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacatttattacc 11413677  T
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaac 251  Q
     ||  ||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||     
T  11413676 tttgattatttattatagagagagaagtatgtgaaattagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaa 11413577  T
Q  252 atttattgattgtcttggtttatgtaaaa 280  Q
    |  ||||  |||||||||||| |||||||    
T  11413576 aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 11413548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38298056 - 38297874
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  38298056 tactccctccgtttctttttaagtgcctcttttgaataattttttt-ttcctatttaactgtcactttcaaagtt--atgcatcattaaatgttgtttta 38297960  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtat 226  Q
     |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38297959 ccaatattatcctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggttattatactaaaagtat 38297874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13957417 - 13957140
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  13957417 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttccaattaactgtcactctcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 13957318  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    || |||   | |||||| |||||||   ||||||  | ||||||||||  |||||||||| |  |||| ||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  13957317 tctataaagctcttagtaatttattgaagagagaagagtatatgaaatatgatattaaataatcaaggatattataggcaaaacataagttattgtatca 13957218  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  13957217 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttatgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacaaaagtagta 13957140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 4608986 - 4609264
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  4608986 tactccctccattcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttttaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 4609085  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||| ||  |||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||| || ||||  || |||| ||| ||||    
T  4609086 cctttattacctttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattacaggaaaaagatgaattgttgcatca 4609185  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcac-aaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| |  |||   |||||||||||| |||||||   | | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4609186 aaagtagtaaaaagtatgtgttgtcttggtttgtgtaaaaaaactcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 4609264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8849373 - 8849113
Alignment:
Q  64 tgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttattta 163  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||   |||| | ||||||||||||  ||||||    
T  8849373 tgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactatcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatattta 8849274  T
Q  164 ttacggagagagaaatatatgaaatgaga--tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgat 261  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||  || | || |||||||||||||||||| |  ||||  |    
T  8849273 ttgcagagagagaaatgtatgaaatgagaagtattaaatgattaaggttattatagaaaaaagataattttttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgt 8849175  T
Q  262 tgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    |||| || ||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8849174 tgtcatgatttgtgtaaaaagtcaaaatgagacaattaaaaaggaacagagagagtaattaa 8849113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10889349 - 10889244
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10889349 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc 10889250  T
Q  143 aatatt 148  Q
    ||||||    
T  10889249 aatatt 10889244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7735297 - 7735132
Alignment:
Q  84 tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatat 183  Q
    |||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||  || |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  7735297 tttgtttttatttaactgtcactgtcaaaattcaatgcaaaattcaatgttgttttaccaacattatccttatatatttattgcggagagagaaacatat 7735198  T
Q  184 gaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  7735197 gaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagcaaaaacaattgtatcaaaagtagta 7735132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 322
Target Start/End: Original strand, 40927115 - 40927395
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||  ||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||    
T  40927115 tactccatccgttcctttataattgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaattgtcgttttcaaaattcaatgtatcattaaatgtggtttta 40927214  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||||||| ||||  |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||  |||||||| ||||  || |||| ||| ||||    
T  40927215 cctatattactcttatatatttattgcagagagagcaatatataaaatgaagtattaaatgattaagattattataggaaaaagataaattgttgcatca 40927314  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatta 322  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||  ||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40927315 aaagtagtaa-aagtatttgttgtcttaatttgtgtaaaaaatcaaaacgtgacaattaaaaaggaacagagagagtaatta 40927395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 307
Target Start/End: Original strand, 6330927 - 6331049
Alignment:
Q  185 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtc 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6330927 aaatgagatattacatgaataagattattatagtaaaaatataaattattttatcaaaagtagtaatatttattgattgtctaagtttatgtaaaatgtc 6331026  T
Q  285 acaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    | |||| || |||||||||||||    
T  6331027 aaaaagagataattaaaaaggaa 6331049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 309
Target Start/End: Original strand, 4440053 - 4440319
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||   ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  4440053 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacagt--ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttattttt 4440150  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| | |||||||| |||||||   ||  || |||||||| ||||  |||||||||| | ||| | ||||||||  |||  || |||||||||||||    
T  4440151 cctataatgcccttagtaatttattggagactgaaaaatatataaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaacataaattattgtatca 4440250  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    |||||||||| ||  ||| | ||||||||||| ||||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  4440251 aaagtagtaaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatatgacaattaaaaaggaaca 4440319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 321
Target Start/End: Original strand, 18000377 - 18000574
Alignment:
Q  117 aatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattata 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||  || | |    
T  18000377 aatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaaccttagatatttattgtggagagagaaacatatgtattgaaatattaaattaacaaggtcataaaa 18000476  T
Q  217 gtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtag 316  Q
    |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  18000477 gtaaaaata------attctatcaaaagtagtaacatt-attaattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaggtaacaattaaaaaggaacggaggtag 18000569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 303
Target Start/End: Original strand, 3686790 - 3686914
Alignment:
Q  179 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaa 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3686790 tatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgttttggtttatataa 3686889  T
Q  279 aatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    || |||| || |||| |||||||||    
T  3686890 aacgtcaaaatgtgataattaaaaa 3686914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17869516 - 17869291
Alignment:
Q  85 ttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatat 183  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||   ||||  ||||||||||    
T  17869516 ttgtttctatttaagtgtcattttacatagttaaatggaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-atcgtggagtaagaaatatat 17869418  T
Q  184 gaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttat-gtaaaatg 282  Q
    | ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| | | ||||||    
T  17869417 gtaatgagatattaaataaataagattattataataaaaatagaaattattatatcaaaagtagcaacatttattgaccgtcttagtttgtggaaaaatg 17869318  T
Q  283 tcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||    
T  17869317 tcaaaatgtgacaattaaaaatgaaca 17869291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42393865 - 42393743
Alignment:
Q  181 tatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa 280  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42393865 tatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattgattatcttggtttgtgtaaaa 42393766  T
Q  281 tgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    ||||| |||| |||| |||||||    
T  42393765 tgtcaaaaagcgacagttaaaaa 42393743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 285
Target Start/End: Original strand, 23418602 - 23418752
Alignment:
Q  135 gttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattatt 234  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||    ||||| || |||||||    
T  23418602 gttttaccaatattatggttagttatttattagagatagagaaatatacgaaataaaatattaaatgaatgaggctattaataaaaaaggataaattatt 23418701  T
Q  235 gtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtca 285  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23418702 gtatcaaaggtaataacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtca 23418752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 36481038 - 36481314
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  | || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  36481038 tactccctccgttcctttatacatgtca-ttttatataatttttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 36481136  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
       ||| | |||||||| ||||||| | |||||| |||| || |||||   ||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  36481137 cttataatgcccttagtaatttattgcagagagataaatttaagaaatataatattaaataattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatca 36481236  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||| ||||||| ||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  36481237 aaagtagtgaaatacatttaatgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaatatgataattaaaaaggaacggagggagta 36481314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Original strand, 3686356 - 3686494
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtca-ttttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3686356 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggag-atttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 3686454  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    |  ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  3686455 actaatattacccttattta-ttattgtggagagagaaata 3686494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 252
Target Start/End: Original strand, 38160291 - 38160463
Alignment:
Q  78 aaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaa 177  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||      
T  38160291 aaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattatccttaaatatttattacggagagag-- 38160388  T
Q  178 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagt-atcaattattgtatcaaaagtagtaaca 252  Q
    | ||||||| ||| || |||||| ||||||  ||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  38160389 acatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagattattatagtaaaattaaaaaataattgtatcaaaagtagcaaca 38160463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30368244 - 30368130
Alignment:
Q  189 gagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaa 288  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||    
T  30368244 gagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattatatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaa 30368145  T
Q  289 agtgacaattaaaaa 303  Q
     || |||||||||||    
T  30368144 tgtaacaattaaaaa 30368130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31546118 - 31546000
Alignment:
Q  179 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaa 278  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| |||  ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31546118 tatatgaaatgtgttattaattgaatcaggtcattgtagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaa 31546019  T
Q  279 aatgtcacaaagtgacaat 297  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  31546018 aatgtcaaaaggtgacaat 31546000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10734261 - 10734155
Alignment:
Q  196 taaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgaca 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  10734261 taaatgaataagactattatagtaaaattataaattattatctcaaaagtagtaacatttacttattatcttggtttaagtaaaatg-caaaaagtgaca 10734163  T
Q  296 attaaaaa 303  Q
    ||||||||    
T  10734162 attaaaaa 10734155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38297593 - 38297515
Alignment:
Q  230 ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38297593 ttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttgttttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaac 38297515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 30368372 - 30368251
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtca-ttttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||   |||||| ||||| ||| || || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  30368372 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttaaagaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagatcaatgcaacattaaatgttatttt 30368273  T
Q  140 atcaatattacccttagttatt 161  Q
    |  ||||||||||||| |||||    
T  30368272 actaatattacccttatttatt 30368251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7734838 - 7734764
Alignment:
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  7734838 gtagtatcatttattgattgtcttgatttatgtaaaatttgaaaaaatgacaattaaaaaggaacggatgtagta 7734764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10889229 - 10889168
Alignment:
Q  257 ttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10889229 ttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 10889168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 6330814 - 6330889
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt-atcaatattacccttagttatttattacggagaga 174  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  6330814 tgtcattttcaaagtttaatataacattaaatgttgtttttatcaatattacccctagttatatattgcggagaga 6330889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Original strand, 35796179 - 35796248
Alignment:
Q  72 ttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  35796179 ttggagattttttttttttcaatttaagtgtcatttgcaaagttcaatgcgacattaaatgatgttttat 35796248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Original strand, 31803104 - 31803172
Alignment:
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  31803104 agtaatatttatttattgtcttggtatgtgtaaaatatcaaaaggtgacaattaaaaaggaacggaggt 31803172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 249743 - 249676
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  249743 tactctctccgttcctttttaagtgtcgttttaggatgaattttttgttcctatttaactgtcatttt 249676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4688866 - 4688815
Alignment:
Q  253 tttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4688866 tttattgattgtcttgatttatggaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 4688815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Original strand, 3818159 - 3818237
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| | | || | ||| ||||||||||||||    
T  3818159 tactacctccgttcctttttaattgccacttttgaagaaattttttatttctaatcaagtatcactttcaaagttcaat 3818237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Original strand, 16965754 - 16965817
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtca 104  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  16965754 tactccctcagtttcttttcaagcgtctcttttggagaaattttttgttcttatttaactgtca 16965817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36494204 - 36494138
Alignment:
Q  210 tattatagtaaaagtatc--aattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttat 274  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  36494204 tattatagtaaaaatatacaaattattgtatcaaaagtagtcatgtatattgattgtcttggtttat 36494138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10734605 - 10734559
Alignment:
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatatta 197  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10734605 ccttagttatttattgtggagagagaaatataagaaattagatatta 10734559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21150732 - 21150698
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21150732 gtactccctccgttcctttttaactgtcacttttg 21150698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21157873 - 21157839
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21157873 gtactccctccgttcctttttaattgtcacttttg 21157839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4609264 - 4609231
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4609264 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttg 4609231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7834133 - 7834052
Alignment:
Q  230 ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||| | ||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  7834133 ttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattattttgatttgtgtaaaatatcaaaaggtgacaattaaaaagaaacaga 7834052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 40886669 - 40886786
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  40886669 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 40886768  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  40886769 tgattaagggtattatag 40886786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10735554 - 10735457
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||| || |||||    
T  10735554 tactccctccgtt--ttttgaaccgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaaatgtcacttttaaagtttaacgcaacattaaatattatttta 10735457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12305740 - 12305688
Alignment:
Q  102 tcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||| |||||||    
T  12305740 tcattttcaaagttcaatgcaacattgattattgttttgtcaataataccctt 12305688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 36437515 - 36437451
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  36437515 tccctccgtttctttttaagtgtcttttttggatgaatttttcgttactatttaactgtcttttt 36437451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 31430538 - 31430818
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31430538 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 31430637  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||     
T  31430638 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatg 31430737  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31430738 aaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 31430818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 33257866 - 33258138
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33257866 cctcagttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 33257965  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33257966 attacccttggttatttattatggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagt 33258065  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33258066 agtaatatttattgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33258138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 39 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12838343 - 12838064
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12838343 tgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcagtgcaacattaaatgttgttt 12838244  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||    
T  12838243 tgccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaggtatagcttattgtat 12838144  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12838143 caaaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggatcggaggtagta 12838064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Original strand, 35112409 - 35112671
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  35112409 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatattgtttta 35112508  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  35112509 ccaatattacccttagttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaaataaataaagttattatagtaaaaatatgaagtattgtatca 35112608  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35112609 aaagtagtaatatttattgattgtatttgtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaa 35112671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42842129 - 42841851
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  42842129 tactccatccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttatttta 42842030  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  42842029 tcaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatca 42841930  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  42841929 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 42841851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30866998 - 30866722
Alignment:
Q  42 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  30866998 actccctccgttcttttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttggtttac 30866899  T
Q  142 caatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |     
T  30866898 caacattacccttagttatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaacatataaattattgtataag 30866799  T
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30866798 aaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 30866722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32966312 - 32966038
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  32966312 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattttcaaagttaaatgcaacattaaatgttggttta 32966213  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  32966212 ccaatattgtccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 32966113  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||||| ||| || || |||||||||||  ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32966112 aaagtggtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 32966038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 313
Target Start/End: Original strand, 26723904 - 26724177
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||    
T  26723904 tactccctccattcctttttaagtgtctctttcggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgatatttta 26724003  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  26724004 tcaatattacccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 26724103  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaa-gtgacaattaaaaaggaacagagg 313  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26724104 aaagtagtaataatcattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagg 26724177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 41 - 309
Target Start/End: Original strand, 18470287 - 18470555
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18470287 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 18470386  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   |||||| || |    
T  18470387 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaagtatagcttattgcataa 18470486  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| | | || | ||||||||||||||||||    
T  18470487 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatattaaaatgcgacaattaaaaaggaaca 18470555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 318
Target Start/End: Original strand, 33173797 - 33174064
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  33173797 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 33173896  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  33173897 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataagatcattatattaaaagtacaacttattgtatcaaaagtagtaa 33173996  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || | ||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33173997 caatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33174064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33100096 - 33099821
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33100096 tactccctccgttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatcttgtttta 33099997  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  |||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  33099996 ccaatattgtccttagttatttatt--gtggagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 33099899  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33099898 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 33099821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35746907 - 35746640
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35746907 tactccctccgtacctttttaattgtcacttttggagaaaatttttatttctatttaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta 35746808  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  35746807 ccaatattacccttagatatttattgcgaa-agagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatca 35746709  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35746708 aaaatagtaacatttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaaca 35746640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22951082 - 22950807
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22951082 gtactccctctcttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgtagtttt 22950983  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   ||||||||||    
T  22950982 accaatattctccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtatagcttattgtatc 22950883  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  22950882 aaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaaggaacagaggta 22950807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41889580 - 41889372
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41889580 tactccatccgtttctttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttccaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatattgtttta 41889481  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41889480 tcaatattattcttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagactattatagtaaaagtatcaattattgtatca 41889381  T
Q  241 aaagtagta 249  Q
    |||||||||    
T  41889380 aaagtagta 41889372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 7312596 - 7312874
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttt-taagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7312596 tactccctcctttccttttttaagtgtcacttttggataaattttttatttctatttaagtgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 7312695  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  7312696 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatc 7312795  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  7312796 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattacaaaggaacgaaggtagta 7312874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33922037 - 33921760
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33922037 tactccctcagttcatttttaagtgtctcttttgaagaaaatttgtgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgtttta 33921938  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  33921937 ccgatattatccttaattatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataatttattgcatca 33921838  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33921837 aaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33921760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7477461 - 7477198
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7477461 tactccctcagttcctttttaagtgtctcttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 7477362  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  7477361 ccgatattatccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 7477262  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  7477261 aaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaag 7477198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 318
Target Start/End: Original strand, 10227246 - 10227513
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||     
T  10227246 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattat 10227345  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  10227346 cctttgttatttattgcggagggagaaatatataaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaa 10227445  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     | ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10227446 taattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 10227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 55 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36298423 - 36298164
Alignment:
Q  55 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36298423 ctttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaatgttcaatgcaacattaaatgatgttttatcagtattaccctt 36298324  T
Q  155 agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatt 254  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |    
T  36298323 aattatttatttcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 36298224  T
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  36298223 tattgattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaagagaggt 36298164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 318
Target Start/End: Original strand, 41891258 - 41891527
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattt-tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  41891258 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccaatatt 41891357  T
Q  149 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  41891358 gtcctgagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaattagt 41891457  T
Q  249 aacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41891458 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggcacagaggtagta 41891527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18194477 - 18194197
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18194477 tactccctccgttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactatcattttcaaatttcaatgcaaaattaaatgttgtttta 18194378  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||    
T  18194377 ccaacattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagcaaaaacaattgtatca 18194278  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18194277 aaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatttgaaaaactgacaattaaaaaggaacggatgtagtaatt 18194197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 314
Target Start/End: Original strand, 36922228 - 36922493
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36922228 cgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 36922327  T
Q  150 cccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc-aaaagtagt 248  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   |||||| ||| ||||||| |    
T  36922328 tccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacatagcttattgcatcaaaaagtaat 36922427  T
Q  249 aacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggt 314  Q
    | || || |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  36922428 atcaattgttgattgtcttgatttatttaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggt 36922493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41675449 - 41675170
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  41675449 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaaatttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta 41675350  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  41675349 ccaatattatccttagttatttattgcaaagaaataaatatattaaataaaatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaactatagcttattgcatca 41675250  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41675249 aaaatag-atcaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 41675170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32528591 - 32528312
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  32528591 tactctctccgttcttttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaatattaaatgttgtttta 32528492  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  32528491 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 32528392  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||| | || || |||||||||||| ||| | |||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32528391 aaagtagcatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaacggaggtagtaat 32528312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31815322 - 31815052
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  31815322 tccgttcctttttaactgtcatttttggagaaaattt--gtttctatttaactgttactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatat 31815225  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  31815224 tacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtag 31815125  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31815124 taaca-ttattgattatcttgatttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtaataatt 31815052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 36406730 - 36407008
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttt-taagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  36406730 tactccctcctttccttttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgtttt 36406829  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36406830 accaacattacccttagttatttattgcggatagagaaatatattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtata 36406929  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattg---tcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    | ||  ||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  36406930 agaaaaagtaacatttattgagtgtcttcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaagaaacggaggta 36407008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 28608575 - 28608853
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||   |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28608575 tactccctccgttcctttttaaatgtctcttttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcctttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttta 28608674  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  28608675 ctaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgatatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatca 28608773  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28608774 aaagtagcaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaaaaaggaacagatgtagtaat 28608853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 3837842 - 3838108
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  3837842 tactccctctgttcatttttaagtgtttcttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgtttta 3837941  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||||    
T  3837942 tcaatattatctttagttatttattgcggaaagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttatggcatca 3838041  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3838042 aaagtaataacaattattgattgtcttgatttgcgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 3838108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 319
Target Start/End: Original strand, 8264926 - 8265207
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaact----ttaaatgttg 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||    
T  8264926 gtactccttccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaccaacattaaatgttg 8265025  T
Q  136 ttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattg 235  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||   ||||||    
T  8265026 ttttactaatattatccttagttatttattgcggagagagagatatgt--aatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaaatatagtttattg 8265123  T
Q  236 tatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
     |||||||| |||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8265124 catcaaaaggagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagtaa 8265207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 20035028 - 20035255
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20035028 tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 20035127  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| || |    
T  20035128 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatta 20035227  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttg 268  Q
    |||| | || || || ||||||||||||    
T  20035228 aaaggaatatcaattgttgattgtcttg 20035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 20045439 - 20045666
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20045439 tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 20045538  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| || |    
T  20045539 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatta 20045638  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttg 268  Q
    |||| | || || || ||||||||||||    
T  20045639 aaaggaatatcaattgttgattgtcttg 20045666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17896786 - 17896581
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17896786 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 17896687  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  17896686 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 17896587  T
Q  241 aaagta 246  Q
    ||||||    
T  17896586 aaagta 17896581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5732267 - 5732059
Alignment:
Q  110 aaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5732267 aaagttcaatgcaacattaaatgctgttttaccaatattatccttagttatttatttcggagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataaggt 5732168  T
Q  210 tattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
     |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  5732167 cattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 5732068  T
Q  310 gaggtagta 318  Q
    |||||||||    
T  5732067 gaggtagta 5732059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31399194 - 31398932
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31399194 tactccctccattcctttttaagtatcatttttggagaaaaaatttgtttctttttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 31399095  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| |||||    
T  31399094 ccaatattatctttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattatatca 31398996  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  31398995 aaagtagtatcaatttttaattgtcttggtttatgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaag 31398932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46286108 - 46285837
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  46286108 tacttcctccgttcttttttaactgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaagaataaatattgtttta 46286009  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  46286008 ccaacattacccttagttatttattgcgtagagagaaatatatgaaataaaatattaaattactaaggctaatatagtaaaagtataaattactgtataa 46285909  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagag 312  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||    
T  46285908 gaaaaaataacatttattgagtgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacgcttaaacagaaacagag 46285837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29722564 - 29722289
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||| | ||||||||||  |||||||||||||||  |    
T  29722564 tccctccattcctttttaatcgtcacttttggagaaattttttgtttatacttaactttcactttcataattcaatgcaatattaaatgttgttttacta 29722465  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  29722464 atattgtccttaattatttattgcggagatagaaatatatgaaataagatattaaataaataagtc-attatagtaaaagtataacttattgcatcaaaa 29722366  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29722365 gtagtatcgattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgttaaaatgtgacaattataaaggaacagaggtagtaat 29722289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 3177910 - 3178187
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  3177910 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 3178009  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  3178010 ccgttattacccttggttatttattgcagagagagaaatatatgaaaagatatattaaatgacgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatca 3178109  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| || || |  |||||||||||| ||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3178110 aaagtagtaaaatgtaattgttgtcttggtttgtgtcaaaaatctaaaagtgacaattaaaaaggaacagagggagta 3178187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26632443 - 26632215
Alignment:
Q  41 tactccctccgttc-ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26632443 tactccctccgttttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttatc-ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt 26632345  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  26632344 accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 26632245  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttgg 269  Q
    |||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  26632244 aaaaatagtatcatttgttatttgtcttgg 26632215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29497786 - 29497534
Alignment:
Q  52 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacc 151  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  29497786 ttcctatttaactgtcactttttgagaaaaattttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtt 29497687  T
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaac 251  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| | || |||||||||| |    
T  29497686 cttcgttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatc 29497587  T
Q  252 atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    | || ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  29497586 aattgttgattgtcctggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 29497534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44480405 - 44480161
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||   ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44480405 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaaaaatttgttcttatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 44480306  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| || |    
T  44480305 tcaatattatccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcataa 44480206  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtca 285  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44480205 aaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtca 44480161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 1553495 - 1553770
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1553495 tactccctccgttcctttttaatcgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 1553594  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| || |||||    
T  1553595 ccaatattatccttacttatttattac--agagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaaatatgcattgttctatca 1553692  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||||||| | |||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  1553693 aaagtagtaacatttattaaatatattggtttgtataaaatatcttaaagtgacacttaaaaaagaacggatgtagta 1553770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 3310196 - 3310462
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  3310196 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagattttttttgtttttatttaactgtcacttctaaagttcaatgcaacattaaataatgtttta 3310295  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||  |||||||||||          |||| ||||    
T  3310296 tcaatattactcttagttatttattgcggagagagaaatatatgatataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaa----------attgcatca 3310385  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3310386 aaagtaataata-ttattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 3310462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 43874345 - 43874078
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  43874345 tactccatccgtttctttttaagtgtcacttttagagaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaacattaaatgttattttg 43874246  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | ||| ||||||||| | || | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |  ||| ||||||||    
T  43874245 ccaatattatcattacttatttattgcagata-agaaatacatgaaattagatattcaatgaataaggttattatagtaaaagagtatattgttgtatca 43874147  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  43874146 aaagtagtaacatttattgaatgtatttgttcgtgtaaaatgtcaaaaagagaccattaaaaaggaaca 43874078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 220
Target Start/End: Original strand, 6799103 - 6799283
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6799103 tactccctccattcatttttaagtgtctgttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 6799202  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagat-attaaatgaataaggctattatagtaa 220  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  6799203 tcaatattatccttaattatttattacggagagagaaatatataaaatgatataattaaatgaataagaccattatagtaa 6799283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 315
Target Start/End: Original strand, 24283565 - 24283833
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||   |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24283565 tccctccgttcctttttaacggtcacttctagagaaaaaatttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatca 24283664  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || ||| ||||||||| || || |  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  24283665 atattacccttagatatttattgcg--gagagaaacatataaattgaaatattaaattaacaaagtcattatagtaaaagta-aaataattatatcaaaa 24283761  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || | ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24283762 gtagtaacatttattaattgtcttagtttgtgtaaaaggtaaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 24283833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 318
Target Start/End: Original strand, 47408227 - 47408370
Alignment:
Q  175 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttat 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47408227 gaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgt 47408326  T
Q  275 gtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47408327 gtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 47408370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38168967 - 38168774
Alignment:
Q  126 ttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  38168967 ttaagtgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagta 38168868  T
Q  226 tcaattattgtatcaaaagtagtaac-atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | | |||||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38168867 taacttattgcatcaaaaatagtaacaaattaatgattgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 38168774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36648221 - 36648011
Alignment:
Q  88 tttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 187  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36648221 tttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttaatttatcaatattatccttagctatttatttcggagagagaaatatatgaaa 36648122  T
Q  188 tgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaca 287  Q
    |||||| |||||| || ||||  ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  36648121 tgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtta-a 36648023  T
Q  288 aagtgacaatta 299  Q
    ||||||||||||    
T  36648022 aagtgacaatta 36648011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 135 - 321
Target Start/End: Original strand, 8381900 - 8382086
Alignment:
Q  135 gttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattatt 234  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||    
T  8381900 gttttattaatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttatt 8381999  T
Q  235 gtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    | |||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8382000 gcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaatt 8382086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8966163 - 8965886
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  8966163 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacattgtttta 8966064  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  |||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  8966063 cctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatca 8965964  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| |  ||||  ||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8965963 aaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgcgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 8965886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19328049 - 19327787
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19328049 tactccctccgtttctttttaagtgtcttttttggagattttttttgttcctatttaaatgtcattttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 19327950  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  |||||||| |||| ||| ||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  19327949 actaatattactcttattta-ttactgtggagggagaaatatatgtaatgagatattaaataaataagg---ttata-taaaa-taaaaattattgtatc 19327856  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  19327855 aaaagtagcaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaac 19327787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48981644 - 48981360
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcat-tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  48981644 gtactctctccgttcctttttaattgtcacttttgcagaatttttttgtttctaattacctgtcaactttcaaagttcaatataacattaaatgttgttt 48981545  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||||||    
T  48981544 tgcctttattacccttagttatttattgcagagatgaaaatatatgaaaaaaaatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagataaattgttgtat 48981445  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    |||||||||||| || || |  |||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48981444 caaaagtagtaaaatgtaattgttgtcttggtttgtgtcaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacagaggaagtaattaa 48981360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 45324011 - 45324243
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    || |||| ||||||||||    
T  45324011 tccctccgttccttttcaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgc----ttgaatgatgttttatca 45324106  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    |||||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  45324107 atattactcttaattatttattgcggagagagaaatatataaaataagatattaaataaataaaatcattataataaaagtataacttattgcatcaaaa 45324206  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt 283  Q
     || |||   | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45324207 ataataa---taattgattgtattggtttgtgtaaaatgt 45324243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8380750 - 8380576
Alignment:
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||      
T  8380750 attacccttagttatttattacggggagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtaaaaattattgtataagaaaa 8380651  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8380650 ggtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaatggacagttaaaaaggaacggaggtagtaat 8380576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44820858 - 44820596
Alignment:
Q  42 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||   || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  44820858 actccctccgttcctttttaattatttcttttggaaaaaaaatt-gtttctatttaactgttatttttaaagttcaatgcaacattaaataatgttttat 44820760  T
Q  142 caatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||          || | |||||    
T  44820759 caatattacatttagttatttatttcggagagaaaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatagtaaa----------atggcatcaa 44820670  T
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  44820669 aagtagtaataattattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatatgacagttaaaaatgaacggaggta 44820596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 318
Target Start/End: Original strand, 47459633 - 47459895
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat-caatatt 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  47459633 cgtttctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatatttttttttccaatatt 47459732  T
Q  149 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagt 248  Q
    | ||||  | |||||||  |  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||     |     
T  47459733 atccttgctcatttatt--gtggagagaaatatatcaaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaatatatattattgt-tcaa----tgc 47459825  T
Q  249 aacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  47459826 aacatttattgaatgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaaggaacggaggtagta 47459895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37354122 - 37353855
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||           ||||||||    
T  37354122 tactcctttcgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattatttgatcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgc-----------ttgtttta 37354034  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| | | | |||||| ||||    
T  37354033 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatgtaacttattgcatca 37353934  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaa-ttaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  37353933 gaagtagtaacaattattgattgttttgattcatgtaaaatgtcaacaagtaacaacttaaaaagaaattgaggtagta 37353855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46563386 - 46563177
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||     
T  46563386 tactacctccgttcctttttaattgtcacttttgcagaaattttttgtttataattaactgtcactttcaaagttcagtacaacattaaatattgttttg 46563287  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     || ||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  |  |||| || |||||    
T  46563286 acattattacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaaagaaaaattgttatatca 46563187  T
Q  241 aaagtagtaa 250  Q
    ||||||||||    
T  46563186 aaagtagtaa 46563177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22057620 - 22057447
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagaga------aatatatgaaatgagat 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||  ||||    
T  22057620 tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttagcaatattacccttagttatttattacagagagagagagagaaatatatgaaacaagat 22057521  T
Q  194 attaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtctt 267  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22057520 attaaatgaatgaggctattattgaaaaatgacaaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtctt 22057447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30586940 - 30586672
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||  || | |||||||||| |||    
T  30586940 gtactccctccgctcttttataattgtcacttttgcataaattttttgtttccaattaactttcatttttaaagtccaacacatcattaaatgttgattt 30586841  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatag-taaaagtatcaattattgtat 238  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  || |||| |||| |    
T  30586840 atctatattacccttagatatttactgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaaaaagataaattgttgttt 30586741  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    ||||| |||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||| || |||| |||||||||||||||    
T  30586740 caaaaatagtaa-aagtatttgttgt-ttggtttatctaaaaagtcaaaatgtgataattaaaaaggaaca 30586672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9602156 - 9601889
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||  | || ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  9602156 tactccctccgttcctttatacccgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 9602057  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| |||||||   |||  || | |||||||||||    
T  9602056 cctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattataagcaaaccataagttattgtatca 9601957  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  9601956 aaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 9601889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9829727 - 9829460
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||  | || ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  9829727 tactccctccgttcctttatacccgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 9829628  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| |||||||   |||  || | |||||||||||    
T  9829627 cctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattataagcaaaccataagttattgtatca 9829528  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  9829527 aaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 9829460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34368870 - 34368643
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |    
T  34368870 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcgaagagaaaaacatatgaaatgaaa 34368771  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    |||||||| |||||||  |||  ||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||  ||| |||||||| ||| ||||||    
T  34368770 tattaaattaataaggtcattgcagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataata-ttattaattttcttaatttgtgtaaaatatcaaaaagtg 34368672  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  34368671 acaattaaaaaggaactgatgtagcaatt 34368643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 208
Target Start/End: Original strand, 42880962 - 42881114
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  42880962 tttttaagtgttttttttggagaaaatttttgtttctatttaactatcactttttaaggtcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttg 42881061  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 208  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  42881062 gttattgattgcggagagagaaatatataaaattagatgttaaatgaataagg 42881114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17354283 - 17354084
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   | ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  17354283 ctccgttcctttataattgtcacttttagagaaaaaatatgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaata 17354184  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    |||||||||| ||| |||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||  |||||||  ||  |||||||||||||||    
T  17354183 ttacccttagatatatattgcgaaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattataagaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagta 17354084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26803693 - 26803426
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||     
T  26803693 tacttcctctgttcctttttaatagtcacttttgcagaatttttttgtttttaattaactgtcgcttttaaagttcaatacaacattaaatattgttttc 26803594  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||  || |||| ||||||||    
T  26803593 cccttattacccttgattatttatcgtagagagagaaatatataaaatgagatattaaatgatgaaggttattatagggaaaagatgaattgttgtatca 26803494  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcac-aaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||||||| |||||||   | | |||||||||||||||||||||    
T  26803493 aaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaaacccaaaagtgacaattaaaaaggaa 26803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22382337 - 22382153
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtt--tcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22382337 tactccctccgttcctttttaaccgtcacttttagagaaaaaatttgttcctctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttt 22382238  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  22382237 taccaatattatccttagatatttatt--gcagagagaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta 22382153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46715565 - 46715304
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| | | |   |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||    
T  46715565 tactccatccgttcctttataattgtgacttttgcatacaaaatttgtttccaattaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggtttta 46715466  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    || ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||| |||||||| ||||  || |||| |||||| |    
T  46715465 tctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaataaaatattaaattattaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatga 46715366  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagag 312  Q
    ||||          ||||  |||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46715365 aaag----------tatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagag 46715304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 35859945 - 35860212
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgt-ttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  | || |||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  35859945 gtactccatccgttcctttataactgtcatttttacataatttttttttcttctaattaagtgtcattttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttt 35860044  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    |  | |||   |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||| ||||  || | |||||| ||    
T  35860045 ttcctataacgcccttagtaatttattgc--agagagaaatataagaaatatgatattaaataattaagaatattatagaaaaaccataagttattgcat 35860142  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||| | ||  ||| | ||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||||||    
T  35860143 caaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtaacaattaaaaaggaac 35860212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2408919 - 2408817
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2408919 cctctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg-tttatcaat 2408821  T
Q  146 atta 149  Q
    ||||    
T  2408820 atta 2408817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36339453 - 36339303
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaa--atgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||||  || || ||||| ||||||    
T  36339453 cgttcctttttaagtgtctcttttgtagaaaagttttgtttttatttaagtgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatatatttttttaccaatat 36339354  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 198  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36339353 tacccttgattattaattatggagagagaaatatatgaaacaagatattaa 36339303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 311
Target Start/End: Original strand, 22785918 - 22786129
Alignment:
Q  99 ctgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 198  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | | |||||||| | ||||   ||||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||  |||||  ||||||    
T  22785918 ctgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttacatatattacccttatatattttttgctgagagagaaatatattgaatgaagtattaa 22786017  T
Q  199 atgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatt 298  Q
    || | ||||| |||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||| |  ||||  |||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  22786018 attattaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaatt 22786116  T
Q  299 aaaaaggaacaga 311  Q
    |||| ||||||||    
T  22786117 aaaagggaacaga 22786129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41889052 - 41888980
Alignment:
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  41889052 agtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgataattaaaaaggaacggagatagta 41888980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 187
Target Start/End: Original strand, 33071894 - 33072032
Alignment:
Q  49 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatt 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |||      
T  33071894 ccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataac 33071993  T
Q  149 acccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 187  Q
     |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33071994 gcccttaataatttattgcagagagagaaatatatgaaa 33072032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41410000 - 41409872
Alignment:
Q  172 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtt 271  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||    
T  41410000 agagagatgtataaaatgaaatattaaattaataaggccattataataaaagtaaaaacaattgtatcaaaattaataacatttattaattgtcttgatt 41409901  T
Q  272 tatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaa 300  Q
    | |||||||||  | ||||||||||||||    
T  41409900 tgtgtaaaatgataaaaagtgacaattaa 41409872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 101
Target Start/End: Original strand, 47408118 - 47408178
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  47408118 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactg 47408178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 306
Target Start/End: Original strand, 24233668 - 24233779
Alignment:
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 294  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||    
T  24233668 ttaaatgaataagattattatagtaaaagtgtaaattcttgtattaaaattagtaatttttattgaatgtcttgatttttgtaaaatgttaaaaaatgac 24233767  T
Q  295 aattaaaaagga 306  Q
    ||||||||||||    
T  24233768 aattaaaaagga 24233779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17896555 - 17896477
Alignment:
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17896555 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 17896477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 318
Target Start/End: Original strand, 6799595 - 6799676
Alignment:
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6799595 atcaaaaatagtaacaatcactgactgtcttggtttatgtaaaatgtcaacatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 6799676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9142524 - 9142259
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||  | | |  ||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||||| | | || ||||| | ||||    
T  9142524 tacttcctccattcctttataattgtcactttttaatataaattttgcttctaattaactgtcgttttcaaaattcaatgtatcatttaatgtggcttta 9142425  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    || ||| ||||||||  |||||||| |  | | |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||  || |||| || |||||    
T  9142424 tctatactacccttatatatttattgc--acatagaaatatataaaatgaagtattaaatgattaaggatattataggaaaaagataaattgttatatca 9142327  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||| ||| ||||||| |||| ||    |||||||||||||||||    
T  9142326 aaagtagtaa-aagtatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaataaaacaattaaaaaggaaca 9142259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13431394 - 13431311
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaac 124  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13431394 tactccctccgttcttttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaac 13431311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 307
Target Start/End: Original strand, 36340553 - 36340632
Alignment:
Q  228 aattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  36340553 aattattgtatcgaaaggagcaacatttactgattgtcttggtttgtgtaaaatgtaaaaaaataacaattaaaaaggaa 36340632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 32049435 - 32049574
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| | | ||||||||   |||| | ||||||| ||||  |||||||| | |||||| ||||| |    
T  32049435 ttttgtttctaattaattgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgtctttacctatattactcttatatatttattgcagagagataaataca 32049534  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  32049535 tgaaatgaagtattaaatgattaagaatattatagaaaaa 32049574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41408864 - 41408793
Alignment:
Q  232 attgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  41408864 attgtatcaaaattaataacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgataaaaagtgacaattaaaaa 41408793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 41480693 - 41480627
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatta 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41480693 tgtcattttgaaagttcaatgcaatattaactattgttttgtcaataatacccttagttatttatta 41480627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 312
Target Start/End: Original strand, 42881118 - 42881199
Alignment:
Q  230 ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagag 312  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  42881118 ttattgcatcaaaagtagtaaaaattattaattgtcttggtttgtataaaatatca-aaaataacaattaaaaaggaacagag 42881199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 5732318 - 5732271
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgt 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  5732318 tactccctccgttcctttttaagcgtctcttttgaagaaattttttgt 5732271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35683279 - 35683212
Alignment:
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  35683279 atcaaaagtattaatttttattgattgttttggtgtatgtaaaatgtcaaaaggtgataattaaaaag 35683212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Original strand, 33072162 - 33072296
Alignment:
Q  178 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgta 277  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || |||||||||||||||| |||||| ||  ||| | | | ||||||| ||||    
T  33072162 atatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataaattattgtatcaaaaatagtaaaatacatttagtatattggtttgtgta 33072261  T
Q  278 aaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagag 312  Q
    ||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||    
T  33072262 aaaagtcaaaatataacaattaaaaagaaacagag 33072296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3091748 - 3091613
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  3091748 ttttgtttcactttacttgtcatttttaagtttcaatgcaacattaaatattggtttgtcaataatacccttacatatttatt--gtagagagaaatata 3091651  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
       ||||| ||| ||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  3091650 --gaatgaaataataaatggttaagggtattatagaaaaa 3091613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 114
Target Start/End: Original strand, 8921026 - 8921099
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||  | || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  8921026 tactccctccgttcctttataactgtcgcttttacataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagt 8921099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6737306 - 6737254
Alignment:
Q  102 tcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  6737306 tcattttcaaagttcaatgcaatattaattattgttttatcaataataccctt 6737254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 46392700 - 46392612
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaa 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||   ||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  46392700 tacttcctccgttcctttttaattttcgcttttgtagaacaattttgttcctatttatttgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaa 46392612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 149
Target Start/End: Original strand, 24233167 - 24233238
Alignment:
Q  78 aaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  24233167 aaattttttgtttctatttaactagcatttttgaagtttaatgcaacattacaagttgttttaccaatatta 24233238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41409744 - 41409701
Alignment:
Q  182 atgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41409744 atgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagta 41409701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 41409808 - 41409765
Alignment:
Q  106 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41409808 tttcaaagttcaacgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 41409765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 222
Target Start/End: Original strand, 36453183 - 36453305
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  36453183 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 36453282  T
Q  200 tgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||    
T  36453283 tgattaagggtattatagaaaaa 36453305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Original strand, 8965886 - 8965919
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8965886 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttg 8965919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27814029 - 27813912
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  27814029 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtgttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 27813930  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  27813929 tgattaagggtattatag 27813912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 202
Target Start/End: Original strand, 35684261 - 35684294
Alignment:
Q  169 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35684261 gagagagaagtatatgaaatgagatattaaatga 35684294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 68
Target Start/End: Original strand, 39426215 - 39426244
Alignment:
Q  39 tgtactccctccgttcctttttaagtgtca 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39426215 tgtactccctccgttcctttttaagtgtca 39426244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4963110 - 4963046
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  4963110 tccctccgttcctttttaagtgtcgttttagggtgaattttttgttcctatttaactgtcgtttt 4963046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 73
Target Start/End: Original strand, 14771015 - 14771047
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcactttt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14771015 tactccctccgttcctttttaagtgtcagtttt 14771047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 73
Target Start/End: Original strand, 15221467 - 15221499
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcactttt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15221467 tactccctccgttcctttttaagtgtcagtttt 15221499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14982 - 14762
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14982 tactccctccgttcctttttaagtgtcactttcggagaaactttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 14883  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882 tcaatattacccctagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgagatattaaatgaataagtctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 14783  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgat 261  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14782 aaagtagtaacatttattgat 14762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 91 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 419703 - 419476
Alignment:
Q  91 caatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatga 190  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  419703 caatttatttgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattactcttagttatttattacggaaagagaaatatatgaaatga 419604  T
Q  191 gatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaag 290  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  419603 gatattaaataaataagattattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaag 419504  T
Q  291 tgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  419503 tgacaattaaaaagaaacagaggtagta 419476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 419890 - 419840
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaattt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  419890 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaattt 419840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 123)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33491398 - 33491128
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33491398 tccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 33491299  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  33491298 tatccttaattatttattacggagagtgaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtag 33491199  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33491198 taacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33491128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54898352 - 54898086
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54898352 tactccctctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 54898253  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||   |||||| ||||    
T  54898252 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatca 54898153  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  54898152 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 54898086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34266704 - 34266426
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34266704 tactccctctgttcttctttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 34266605  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  34266604 tcaatattgtccttagttatttatt--gctgcgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 34266507  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34266506 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaaggaacggaggtagtaatt 34266426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 53745547 - 53745271
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53745547 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 53745448  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  53745447 ccaatattatccttagttatttcttgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 53745349  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53745348 aaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 53745271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27039867 - 27039595
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  27039867 cctctgttcctttttaagtgtcactttaggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaac 27039768  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||      
T  27039767 attacccttgattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaa 27039668  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27039667 agtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaacagaggtagta 27039595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 54106243 - 54106523
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54106243 tactccctccattcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 54106342  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  54106343 ccaatattatccttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 54106442  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54106443 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggtagtaatt 54106523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 308
Target Start/End: Original strand, 48151966 - 48152232
Alignment:
Q  42 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  48151966 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttac 48152065  T
Q  142 caatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48152066 caatattacccttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaa 48152165  T
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||    
T  48152166 aagtaataatatttattgattgtattgatttgtgtaaaatataaaaaaatgacaattaaaaaggaac 48152232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 32980620 - 32980897
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||    
T  32980620 tactccctccgttcttttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaataatgtttta 32980719  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  32980720 tcaatattacccttagttatttattgtagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcagtataataaaagtataacttattgcatca 32980819  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32980820 aaagtattaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagatgtagta 32980897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47070123 - 47069846
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47070123 tactccctccattcctttttaagtgtcactttcgtagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 47070024  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  47070023 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaaattattatagtaaaagtataacttattgcatca 47069924  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  47069923 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 47069846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 43775655 - 43775378
Alignment:
Q  42 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  43775655 actccttctgttcctttttaactgtctcttttgaagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttac 43775556  T
Q  142 caatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  43775555 caatattatccttagctatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaa 43775456  T
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43775455 aagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgaaaattaaaaaggaacggaggtagtaa 43775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Original strand, 48214046 - 48214312
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48214046 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 48214145  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||            |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  48214146 accaatattacccttagttatttattgtggagagagaaat------------atataaaatgaataagactattatagtaaaagtatgaagtattgtatc 48214233  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48214234 aaaagtagtaatatttattgattgtattggtgtgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagatgtagta 48214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 790530 - 790804
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  790530 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttatgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 790629  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  790630 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaattatatgaactgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 790729  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  790730 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgatcattaaaaaggaacggaggta 790804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 320
Target Start/End: Original strand, 50091930 - 50092204
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  50091930 cctccgttcctttttaagtgttatttttggagaaactttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaat 50092029  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||      
T  50092030 attttccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaa 50092129  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50092130 aataacatttatttagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacagttaaaaaggaacggaggtagtaat 50092204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 19550226 - 19550503
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19550226 tactccatccgttcctttttaaatgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgtttta 19550325  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  19550326 tcaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 19550425  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| || || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19550426 aaagtaatatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgggggtagta 19550503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33874812 - 33874535
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  33874812 tactcccaccgttcctttttatctgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatagtgtttta 33874713  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    ||  |||||||||    
T  33874712 ccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaaggtaaaacaattgtatca 33874613  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33874612 aaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33874535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 43554370 - 43554646
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43554370 tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 43554469  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  43554470 ccaatattgtccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 43554568  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||  | || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43554569 aaagtatgatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 43554646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Original strand, 17102734 - 17102996
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17102734 tactccctccgttcttttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta 17102833  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  17102834 ccaatattatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataaattattgcatca 17102933  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaa 303  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  17102934 aaagtagtaacaattattaattgttttaatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaa 17102996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 309
Target Start/End: Original strand, 11473389 - 11473650
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||    
T  11473389 tccgttcctttttaaatgtcacttttggagaaattttttgttcctgtttaactttcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 11473488  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||    
T  11473489 tacccttagttatttattgcggaaagagaagtatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaag 11473588  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaaca 309  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11473589 taacatttattgaatgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacaattaaaaaggaaca 11473650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 55 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3643448 - 3643185
Alignment:
Q  55 ctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccct 153  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3643448 ctttttaattgtcacttttagagaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactt-aaatgttgttttatcaatattaccct 3643350  T
Q  154 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacat 253  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3643349 tagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacat 3643250  T
Q  254 ttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  3643249 ttcttgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacacttaaaaaggaatggaggtagta 3643185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41351461 - 41351183
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtca-ttttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  41351461 tactccctccgttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttttgaagttcaatgcatcattaaatattgtttt 41351362  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| | ||  |  ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41351361 accaatattatctttgttcgtttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattatatc 41351262  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41351261 aaaagtagtaacattaattgaatgtcttgatttatgtaaaatatcagaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 41351183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 28885658 - 28885934
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28885658 tactccttccgttcatttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 28885757  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||||    
T  28885758 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt-aaagtacaacttattgcatca 28885856  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||| ||||||    
T  28885857 aaagtagtaacaataattgactatcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaagagcagatgtagta 28885934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 52663422 - 52663689
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  52663422 tactctctccgttcatttttaagtgtcagttttggagaaattttttgttactatttaattgtcattttcaaagttcaaagcaatattaaacgttgtttta 52663521  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   |||||| ||||    
T  52663522 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagcaaaagtatagcttattgcatca 52663621  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  52663622 aaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtgaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaac 52663689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13158700 - 13158426
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-ttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13158700 tccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaaaaattgtttctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 13158601  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13158600 ataatccttagttatttattgcggagagagaaatataagaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagt 13158501  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13158500 agtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 13158426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 41425609 - 41425886
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||  |||    
T  41425609 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttacttt 41425708  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  41425709 actaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatc 41425807  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41425808 aaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 41425886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42515429 - 42515163
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||    
T  42515429 cgttcctctttaattgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacaattatta 42515330  T
Q  150 cccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||| |||||    
T  42515329 cctttagatatctattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggcgattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagta 42515230  T
Q  250 acatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  42515229 ac--ttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagttacaattaaaaaggaacggatgtagta 42515163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32854213 - 32853970
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  32854213 tactccctccattcctttttaggt-tcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgtttta 32854115  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  32854114 tcaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatacattattgtataa 32854015  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtca 285  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32854014 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtca 32853970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40140095 - 40139831
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||     ||||||||||| ||||||| | |||||    
T  40140095 tactccctcctatcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttt-----ttcaatgcaacattaaatgatatttta 40140001  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  40140000 tcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 40139901  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40139900 aaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaat--------gtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 40139831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30861799 - 30861531
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  30861799 cgttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattatcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatta 30861700  T
Q  150 cccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  | ||    
T  30861699 cccttagctatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaata 30861600  T
Q  250 acatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  30861599 acatttgttg--tgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgaacgttaaaaaggaacggaggtagtaat 30861531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39867114 - 39866852
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  39867114 tactccatccgttcctttttaagtgtctcttttggagaattttttt-ttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgattta 39867016  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  39867015 ccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatca 39866916  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39866915 aaagtaaaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 39866852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47104421 - 47104154
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47104421 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 47104322  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | |||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||  |   ||| |||||    
T  47104321 ccaatattatcattagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtaaaatcaattatatca 47104222  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  47104221 aaaatagtaacatttattgattgttttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtggcaattaaaaaggaac 47104154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5244196 - 5243924
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  5244196 cctctgttcctttttacgtgtcactttcggataaaatttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaac 5244097  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||      
T  5244096 attacccttagttatttattgcagagagagaaatatatggaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaatgattgtataagaaaa 5243997  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5243996 agtaacatttattgagtgtcctgatttatgtaaaatgtca-aaaatgacagttaaaaaggaacagaggtagtaa 5243924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 318
Target Start/End: Original strand, 29651667 - 29651925
Alignment:
Q  56 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29651667 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttttatttaactgt----ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatcctta 29651762  T
Q  156 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||  |    
T  29651763 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaact 29651862  T
Q  256 attgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29651863 gttgattgttttggtttgtgtaaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 29651925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40010920 - 40010653
Alignment:
Q  51 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattac 150  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||||    
T  40010920 gttcctatttaagtgtcactttaagagaaaaattttgttcatatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccgacattac 40010821  T
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||  |||||    
T  40010820 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaa 40010721  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  40010720 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtaacacttaaaaaggaacggaggtagta 40010653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54334448 - 54334182
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  54334448 tactccctcaattcctttttaagtgtca-ttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 54334350  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  54334349 ccaacattacccttatttatttatcgcggagagaaaaatatatgacataagatattaaataactaaggctattataataaaagtataaattattgtataa 54334250  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
     ||  ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  54334249 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgagttaaatgtcaaaaagtgatagttaaaaaggaac 54334182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27484047 - 27483777
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27484047 cctccgttcctttttaagtgttactttttaagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 27483948  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  27483947 attgtccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagt 27483850  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| || || ||||||||| || ||| | |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27483849 agtatcaattgttgattgtcctgatttgtataaaatgttaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 27483777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 36234347 - 36234623
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36234347 tactccctccgttcctttgtaagtgtcacttatgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgtttta 36234446  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| |||||||||||   |||||||||||    
T  36234447 ccaatattatccttagttattttttgcggagagagaaatatatgaaataggatattaaatgaataagatcattacagtaaaagtatagcttattgtatca 36234546  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||||||    || || |||||||||||  ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36234547 aaagtat---cactttttgattgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaat 36234623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42672156 - 42671879
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  42672156 tactccctccattcctttttaagcgtcatttttggagaaaatttttgttcctattcaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttta 42672057  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  42672056 ccaatattgtccttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatca 42671957  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| || || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42671956 aaagtaatatcaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 42671879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 29697971 - 29698245
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29697971 tactccgttcgtttctttttaagtgtcattttttgagaaagtttttgttcctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 29698070  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata-aggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  29698071 tcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatg-aatgagatattaaatgaatagaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 29698169  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29698170 aaaaatagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 29698245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 318
Target Start/End: Original strand, 35315126 - 35315389
Alignment:
Q  55 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    |||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  35315126 ctttttaagtgtctttttttaagaatttttttttttctatttaattgtcattttcaaagttcaatacaaccttaaatgttgttttaccaatattatcttt 35315225  T
Q  155 agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatt 254  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |    
T  35315226 agttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 35315325  T
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35315326 tgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggagttagta 35315389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 306
Target Start/End: Original strand, 51064862 - 51065128
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| || |    
T  51064862 gtactccctccgttcctttttaattgtcatttttggagaatttttttgttcctgattaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttattat 51064961  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||| ||||||  ||  ||||||||    
T  51064962 accaatattatccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatc 51065061  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  51065062 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgataattaaaaagga 51065128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20848985 - 20848713
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20848985 tactccctccgttcctttataattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 20848886  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||| ||||| |     || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  20848885 ccaatattactcttagat-----ttgcggaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 20848791  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20848790 aaagtagtaacatttattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 20848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 95 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24276 - 24053
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||  | |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24276 ttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttgctaatttattttggagaaagaaatatatgaaatgaaata 24177  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 294  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24176 ttaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 24077  T
Q  295 aattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||    
T  24076 acttaaaaaggaatagagggagta 24053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40319194 - 40318917
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||  |||    
T  40319194 tactccatccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttacttt 40319095  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  40319094 actaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatctaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatc 40318996  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40318995 aaaagtagcaacatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 40318917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52627504 - 52627227
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtca-ttttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52627504 tactccttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaagttttttgtttctatttaattgtcacttttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 52627405  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  52627404 accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatc 52627306  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||| || || |  || ||| ||||||| |  | ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52627305 aaaagtaatatcaatcgttaattatcttggtatgaggaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagatagta 52627227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45513882 - 45513673
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45513882 gtacttcctccgttcttttttaagtgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 45513783  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| |||    
T  45513782 atcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatc 45513683  T
Q  240 aaaagtagta 249  Q
    ||||||||||    
T  45513682 aaaagtagta 45513673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 55141732 - 55141459
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  55141732 tccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaact---cctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 55141636  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    ||||||||||||||||||   || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||    
T  55141635 tacccttagttatttattgttgaaagataaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattatatcaaaaatag 55141536  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt----cacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| | |     | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55141535 taatatttattgattgtattgatttgcgtaaagtataaaaaaaaaaatgacaattaaaaaggaaccgaggtagtaat 55141459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45101582 - 45101347
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45101582 ttttgttcctatttaactgtcactttgaaagttccatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 45101483  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  45101482 tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataggaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcagctgttgattgtcttggtttgtgtaaaatg 45101383  T
Q  283 tcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45101382 tcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 45101347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 51244604 - 51244878
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51244604 tactccctctgttcctttttaaatgtcacttttgaagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 51244703  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||   |||||| ||||    
T  51244704 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattataataaaaatatggcttattgcatca 51244803  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | |||| ||||||| ||| ||||||    
T  51244804 aaactagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatattacaagtaaaaagaaacggaggta 51244878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 246
Target Start/End: Original strand, 7328435 - 7328640
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7328435 tactccttccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 7328534  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||| | |||||| ||||    
T  7328535 ctaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataatgaaagtataacttattgcatca 7328634  T
Q  241 aaagta 246  Q
    ||||||    
T  7328635 aaagta 7328640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 54911569 - 54911305
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  54911569 gtactccctccgtttctttttaaatgtctattttggagatttttttttgtttatatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttt 54911470  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||    
T  54911469 tatcaatattacctttaattatttattgtggagtgagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcat 54911370  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| | | || |||||||||||||||    
T  54911369 caaaagtagtaacaattattgattgtctt-atatatgtaaaattttaaaatgtgacaattaaaaag 54911305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 317
Target Start/End: Original strand, 13167996 - 13168261
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13167996 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 13168095  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| | |||||| |||    
T  13168096 accaatattatccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattgcatc 13168195  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagt 317  Q
    ||            || |||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||    
T  13168196 aa------------ttgttgattgtcttggtttgtataaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 13168261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 46973400 - 46973666
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtc---acttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  46973400 tactccctccgttcctttttaagtgtcttcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacatcaaatgttatt 46973499  T
Q  138 ttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| |    
T  46973500 ttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgca 46973599  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||||||| || || |||||||  ||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  46973600 tcaaaagtagtatcaattgttgattgctttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaag 46973666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3376574 - 3376293
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  3376574 tactccctctgttcctttttaagtgtctcttttaaagataatatttgtttctatttaactgtcagtttcaaagtccaatgcaacattaaatgttatttta 3376475  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagag----aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||      
T  3376474 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattac 3376375  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || |||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  3376374 ataaaaaatagtaacaatcattgattatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacagataaaaaggaattgaggtagta 3376293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 27992286 - 27992494
Alignment:
Q  107 ttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27992286 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgccgagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataa 27992385  T
Q  207 ggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaagga 306  Q
    ||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27992386 ggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtattgggttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 27992485  T
Q  307 acagaggta 315  Q
    |||||||||    
T  27992486 acagaggta 27992494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 321
Target Start/End: Original strand, 45145138 - 45145388
Alignment:
Q  70 ttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacgg 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  45145138 ttttggagaaaatttttattcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta-ttatttattgcgg 45145236  T
Q  170 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgg 269  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  45145237 aaagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcagcaaaagtaataataattattgattgtcttgg 45145336  T
Q  270 tttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45145337 tttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaaaggaggtagtaatt 45145388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27028240 - 27028004
Alignment:
Q  82 tttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatat 181  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27028240 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttggttatttattgcggagagagaaatat 27028141  T
Q  182 atgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaat 281  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||| | ||  ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||    
T  27028140 atgaaataagatattaaatgaataagactattataataaaagtactaatttttgtataagaaaaagtaacatttatttaatgtattggtatgtgtaaaat 27028041  T
Q  282 gtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  27028040 gtcaaaaaatgacggttaaaaaggaacggaggtagta 27028004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33074543 - 33074277
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||| |||||| || | |||||| | ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33074543 tactccctccattccattttaagtgtctcttttaaagaa-ttttttattcctatttaagtatcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 33074445  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  33074444 actaatattactcttatttatt-attgcggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc 33074346  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  33074345 aaaagtagcagcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaaataaaaaggaac 33074277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 24981274 - 24981537
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||   |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  24981274 gtactccctccattcctttttaagtgtcacttt-gaagaaattttttgtt-caa---aactatcactttcaaagttcgatgcaacattaaatattgtttt 24981368  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  24981369 accaatattgtctttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatc 24981468  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||| || || |||||| |||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24981469 aaaagtagtatcaattgttgattatcttagtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaac 24981537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 41168741 - 41169005
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  41168741 tactccatccgttcctttttaagtgtcacttctgcaaaaaaaaattgttcctatttaactgtcattttcaaacttcaatgcaacaataaatgttgtttta 41168840  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    || |  |||||| ||||    
T  41168841 ccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagta----tagc--ttattgcatca 41168934  T
Q  241 aa---agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||   ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  41168935 aaagtagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaac 41169005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51697786 - 51697545
Alignment:
Q  85 ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatg 184  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51697786 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttacgaatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatg 51697687  T
Q  185 aaatgagatattaaatgaataaggctattatagt-aaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51697686 aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 51697587  T
Q  284 cacaaagtgacaat---taaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    || ||  |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51697586 caaaatatgacaattagtaaaaaggaac-gaggtagtaattaa 51697545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Original strand, 20105172 - 20105339
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20105172 tactacctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 20105271  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 208  Q
     |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20105272 ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataagg 20105339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 45055167 - 45055434
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  45055167 tactccctccgttcatttttaagtgtctattttgaagaattttttttgttccaatttaac-gtcactttcaaagtttaatgcatcattaaatgttgtttt 45055265  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    |  ||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45055266 actaatattatcttttattatttattgcggagagagaaatataagaaatgagatgttaaattaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgtatc 45055365  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||    
T  45055366 aaaagtaaaaataattattgattgtcttgatttatgtaaaatattaaaaattgacaattaaaaaagaac 45055434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 323
Target Start/End: Original strand, 41926659 - 41926942
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||     ||||| | |||||||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  41926659 tccctccattcttttttaagtgtctcttttgaagaaaaaaaattgttcctatttaactatcactttcaaagtttcatgtaacattaaatgttgttttacc 41926758  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggaga-gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| | |||||| |||||    
T  41926759 aatattatcgttagttatttattgcggagataaaaaaaatatgaaatgagatgttaaatgaataagatcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaa 41926858  T
Q  242 a---agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    |   |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41926859 aagtagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgt-aaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 41926942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 126 - 318
Target Start/End: Original strand, 43945444 - 43945636
Alignment:
Q  126 ttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  43945444 ttaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattacagtaaaagta 43945543  T
Q  226 tcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |   |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43945544 tagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaactaaaaaggaacggaggtagta 43945636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 319
Target Start/End: Original strand, 35077366 - 35077645
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35077366 gtactccctccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttt 35077465  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
      | ||| |  ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || | |||||| |||    
T  35077466 tcctataatgtccttagtaatttattgcagagagagaaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatc 35077565  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35077566 aaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagagggagtaa 35077645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 308
Target Start/End: Original strand, 49168349 - 49168611
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||     
T  49168349 cctccgttcttttttaagtatcatttttggagaaattttctgtttctatttaattgtcaattttaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaac 49168448  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||      
T  49168449 attactcttagttatttattgaggagagaaaaatatttgaaataatatattaaatgactaagattattataataaaaatataaattattgtattagaaaa 49168548  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||    
T  49168549 agtaacatttattaagtatcttggtttgtttaaaatgtcaaaaaatgatagttaaaaatgaac 49168611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 304
Target Start/End: Original strand, 6902292 - 6902521
Alignment:
Q  75 gagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagaga 174  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  6902292 gagaaaatttttgtttctatttaactgtcccttttaaagttcaatttaacattaaattttgttttatcaatattgttcttagttatttattacagagaga 6902391  T
Q  175 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttat 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||   |||||| |||||| |||||| || || ||||| |||||||||| |    
T  6902392 gaaatatatgaaatgaaatattaaataaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaatgtagtatcaattgttgatggtcttggtttgt 6902491  T
Q  275 gtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  6902492 gtaaaatatcaaaatgtgacagttaaaaag 6902521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 53281959 - 53282140
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||| | | ||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  53281959 tactccttccgttcctttttaagggtcacttttggagaaattctttgctcctatttgagtatcactttcaaggttcaatgcagcaataaatgttgtttta 53282058  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  53282059 ccaacattacccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaa 53282140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 23771267 - 23771534
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23771267 tacttcctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 23771366  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  |||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  23771367 cctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatca 23771466  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||| |  |||   ||||||||||||  || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23771467 aaagtagtaaaaagtatatgttgtcttggtttgcgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaac 23771534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36371096 - 36370863
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt--gtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||  |    
T  36371096 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaatattaaatgttact 36370997  T
Q  138 ttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgta 237  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| | |  ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  36370996 ttactaatattacccttatttatt-actgtggagagaaaaatatatgttatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgta 36370898  T
Q  238 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggttt 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36370897 tcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggttt 36370863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 320
Target Start/End: Original strand, 49123556 - 49123781
Alignment:
Q  94 tttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagat 193  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49123556 tttaagtgtcactttcaaagatcaatgcaacattaaatattgttttactaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 49123655  T
Q  194 attaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaa--ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagt 291  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |  |  |||||| |||||| |||||| ||   ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||    
T  49123656 attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtgtatagtttattgcatcaaatgtagtatca---attgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgt 49123752  T
Q  292 gacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  49123753 gactattaaaaaggaacggaggtagtaat 49123781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 51219316 - 51219082
Alignment:
Q  75 gagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagaga 174  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51219316 gagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga 51219217  T
Q  175 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaaca---tttattgattgtcttggtt 271  Q
    ||||||||||||            |||||||||   |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||    || |||||||||||||||    
T  51219216 gaaatatatgaa------------atgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgttgattgtcttggtt 51219129  T
Q  272 tatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51219128 tgtgtaaaatgtcaatatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 51219082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29458342 - 29458192
Alignment:
Q  168 ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtctt 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29458342 ggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtctt 29458243  T
Q  268 ggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  29458242 ggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaatgaacaaagatagta 29458192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25983868 - 25983658
Alignment:
Q  101 gtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  25983868 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatataaaatgagaagttaaat 25983769  T
Q  201 gaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaa 300  Q
    ||| || |  |||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||| || | |||| ||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25983768 gaacaaagtcattatagtaaaagtataacttatt-catcaaaaatagtaacaattgtagattatcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaactgacaattaa 25983670  T
Q  301 aaaggaacagag 312  Q
    ||| ||||||||    
T  25983669 aaaagaacagag 25983658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 52175698 - 52175979
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattt--tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttt 138  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| |     |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52175698 tactcccaccgttcctttctaactgtcacttttagagagagaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttt 52175797  T
Q  139 tatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtat 238  Q
    || |||||||| | ||   |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||  ||  |||||||    
T  52175798 taccaatattatctttgaatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaagtcattacagtaaaagtaaaaacaattgtat 52175897  T
Q  239 caaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| || || | |||||||||||||| || |||| ||||    
T  52175898 caaaagtaataaca-ttgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtcataattaaaaaggaacggatgtagcaatt 52175979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 2642690 - 2642961
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2642690 tacttcctccgttcctttttaattgtcacatttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 2642789  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |  ||||||||||  |||||||||  | ||      ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||||||||    
T  2642790 cctttattacccttgattatttatt--gtag------atatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattattggaaaaagatgaattgttgtatca 2642881  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2642882 aaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagtaat 2642961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28943704 - 28943523
Alignment:
Q  137 tttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28943704 tttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgt 28943605  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtc-ttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    || | ||  ||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  28943604 ataagaaaaagtaacatttattgagtgcctttgatttgtgtaaaatgtta-aaagtgaccgttaaaaaagaacggaggtagta 28943523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32853539 - 32853360
Alignment:
Q  126 ttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  32853539 ttaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcagagagagaaacat--gaaatgaaatattaaattaataaggtcgttatagtaaaagta 32853442  T
Q  226 tcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
      ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32853441 aaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagttacaattaaaaaggaa 32853360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 52173726 - 52174005
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgga-gaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||    |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  52173726 tactccctccgttcctttctaactgtcacttttagaagaaaaaaattgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt 52173825  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||||| ||   |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||  |||  ||||||||||  ||  ||| ||||    
T  52173826 accaatattacctttgaatatttattgcagagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaactaataaggtcattgcagtaaaagtaaaaacaattatatc 52173925  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaatt 321  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  52173926 aaaagtaataaca-ttattaattgtcttggtttgtgt-aaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggatgtagcaatt 52174005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Original strand, 26748332 - 26748609
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |   |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||| |||||    
T  26748332 gtactccctccgttcctttataattgtcacttttgcatacaaaatttgttttcaattaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggtttt 26748431  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | | ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||| ||||  || |||| |||||||    
T  26748432 acctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatc 26748531  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||| |   |||  |||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26748532 aaaagtagtaa-aagcatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagggacagagggagta 26748609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 34750635 - 34750911
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| | |||     
T  34750635 tactccttccgttcctttataattgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttg 34750734  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||||||| ||||  || | || ||||||||    
T  34750735 cctatattacccttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataattaaggttattataggaaaaagataatttgttgtatca 34750834  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| |  ||||  |||||||| ||| ||||||| | || || | |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34750835 aaagtagtaa-aagtatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagacaaaatgagacaattaaaaaggaatagagggagta 34750911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8237045 - 8236887
Alignment:
Q  157 ttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattta 256  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  8237045 ttatttattaccgagagaaaaatatatgaaattagatattaaatgaacaaggttattatagtaaaagtataaattattataacaaaagtagttacattta 8236946  T
Q  257 ttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    | || | | ||| ||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||    
T  8236945 tggacttttttgatttatataaaatgtcaaaatgtgtcagttaaaaaggaacataggta 8236887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47844105 - 47843832
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  47844105 gtactccctccgttcctttataactgtcacttttacataaattttttatttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttt 47844006  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
      | ||| |||| ||||| ||||||| | ||||||     |||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  |  | ||||||||||    
T  47844005 tcctataataccgttagtaatttattgcagagaga-----atatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacacaagttattgtatc 47843911  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||| ||||| | ||  ||| | ||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47843910 aaatgtagtgaaatacatttagtgtcttgatttatgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagagggagta 47843832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42671605 - 42671451
Alignment:
Q  114 ttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctatt 213  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  42671605 ttcaatgcaacattaaatgttaatttattaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaagttatt 42671507  T
Q  214 atagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgg 269  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  42671506 atagtacaaatataaattattgtatcaaaagtagccacatttattgattgttttgg 42671451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 53291027 - 53290750
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | || ||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  53291027 tactccctccgttcctttataactgtcactcttacataatttttttgtttttaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttattttt 53290928  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    || ||| | |||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| ||||||||   ||  || | |||||||||||    
T  53290927 tctataatgcccttaataatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattatagacgaaccataagttattgtatca 53290828  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| | ||  ||| | |||| |||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53290827 aaagtagtgaaatacatttagtgtcatggtttgtgtaaaaaatcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggaagta 53290750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22100089 - 22099890
Alignment:
Q  42 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttat 141  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||     
T  22100089 actccatccgtttatttttaagtatctcttttggagaaaatttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttac 22099990  T
Q  142 caatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
     ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| |  |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  22099989 taatattatccttacttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaagtatgcattattttatcaa 22099890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44544435 - 44544296
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||| | |||    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44544435 tactctcttcgttcctttttaagtgtctcttttgaaaaaaaaaattgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttatttta 44544336  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44544335 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 44544296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 244
Target Start/End: Original strand, 28226413 - 28226608
Alignment:
Q  47 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 146  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||  | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||    
T  28226413 ctccgttcctttataactgtcgcttttacataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctata 28226512  T
Q  147 ttacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 244  Q
     | |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  || | |||||||||||||||    
T  28226513 atgcccttagtaatttatt--gcagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaag 28226608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22174099 - 22173906
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||  |||||    
T  22174099 tccgttcatttttaagtgtcttttttggataaattttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatat 22174000  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    || | ||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| |  |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  22173999 tatctttacttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaagtatgcattattttatcaa 22173906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35458716 - 35458493
Alignment:
Q  95 ttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagata 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||   |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||    
T  35458716 ttaactgtcactttcaaagttcaatgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatatgaaatatgata 35458617  T
Q  195 ttaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 294  Q
    |||||| | ||||| ||||||||  |||  || | ||||||||||||||||||| | ||  | | | ||||||||||| ||||||| || | || |||||    
T  35458616 ttaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacaattagtgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatgtgac 35458517  T
Q  295 aattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  35458516 aattaaaaagaaacggaggtagta 35458493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 318
Target Start/End: Original strand, 29803727 - 29803905
Alignment:
Q  128 aaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatc 227  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||            ||||||||||||   ||||||||||||||||     
T  29803727 aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatat------------taaatgaataagatcattatagtaaaagtata 29803814  T
Q  228 aattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    | |||||| ||||| | ||||| || || |||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29803815 acttattgcatcaataatagtatcaattgttgattgtcttggttcgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 29803905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43160015 - 43159858
Alignment:
Q  52 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacc 151  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43160015 ttcctttttaattatcacttttagagaaaaaaattgtttttatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgatttatcaatattacc 43159916  T
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggc 209  Q
    ||||  |||||||| | |||||| ||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  43159915 cttaaatatttattgcagagagaaaaacatataaaataaaatattaaattaataaggc 43159858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3114520 - 3114374
Alignment:
Q  177 aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagt-atcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatg 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |    
T  3114520 aatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggctgttatatgaaaaatgaaaaattattgtattaaaagtagtaacatttactgattgt-ttggtttgag 3114422  T
Q  276 taaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaa 323  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  3114421 taaaatattaaaaagtgacaattaaaaaggaatagagataataattaa 3114374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31610334 - 31610161
Alignment:
Q  81 ttttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaata 180  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| |||||| || | | |||||||||||  ||||||||||||    
T  31610334 ttttttctttctatttaagtgtcattttcaaagtttaatacaatattaaatgttattttaccaatat-actcatggttatttattatagagagagaaata 31610236  T
Q  181 tatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 255  Q
    |||||||  | ||||||||| ||| |||||||||| | ||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31610235 tatgaaacaatatattaaataaatgaggctattattgaaaaatgataaataattgtattaaaagtagtaacattt 31610161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2858656 - 2858566
Alignment:
Q  228 aattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2858656 aattattgtatcaaaagtagcaacctttattgattgtcttggtctgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 2858566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44544155 - 44544082
Alignment:
Q  179 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaaca 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  44544155 tatatgaaatgagatattaaatgaaaaaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtattaaca 44544082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 132
Target Start/End: Original strand, 1201043 - 1201134
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatg 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  1201043 tactccctccgttcctttttaattgtcacatttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatg 1201134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44092295 - 44092181
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44092295 tactacctctgttcctttttaattgtcacttttagagaagaattttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 44092196  T
Q  141 tcaatattaccctta 155  Q
     |||||||| |||||    
T  44092195 ccaatattatcctta 44092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2154253 - 2154184
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttattt 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  2154253 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtcttatcaatattactcttagatattt 2154184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Original strand, 24569530 - 24569803
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||  | || ||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||     
T  24569530 tactccctccgtttctttataattgtcgcttttacataatttttttgtttctaattaattgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttattttt 24569629  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     | ||| | | |||| | ||||||| | |||| | |||||||||||||  |||||||||| | ||||  ||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  24569630 cctataatgctcttaataatttattgcagagacaaaaatatatgaaatatgatattaaataattaagaatattataggcaaaacataacttattgtatca 24569729  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgatt--gtct-tggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||| | | || |||| |||  || | |||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||    
T  24569730 aaagtaatgaaatatatttatttagtatctggtttatgtaaaaagtcaaaatgtaacaattaaaaatgaacaga 24569803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Original strand, 29803624 - 29803708
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29803624 cgttcatttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcatatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 29803708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Original strand, 7329004 - 7329087
Alignment:
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaaa 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  7329004 aaagtagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagaaatggaggtagtatttaaa 7329087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42634561 - 42634407
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta---gttatttattacggagagagaaatatatgaaatg 189  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||| | |||    |||||||||| |  |||||||||||||||| |     
T  42634561 atttaactgtcacttttgaagttcagtgcaatattaaatattgttttataaatattatcgttacttcttatttattatg--gagagaaatatatgaagtt 42634464  T
Q  190 agatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 246  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  42634463 agtgattaaataaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagta 42634407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31610151 - 31610085
Alignment:
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  31610151 aagtaataacatttattgattgtcttgatttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattataaaagaac 31610085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 53055339 - 53055420
Alignment:
Q  169 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| || |||||||||||||||    
T  53055339 gagagataaatatatgaaatgagatattaaatgataaaggttattatagaaaaaagatgaattgttttatcaaaagtagtaa 53055420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40113502 - 40113366
Alignment:
Q  52 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacc 151  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||| || |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||   ||    
T  40113502 ttcctttataactgtcacttttacagaatttgtttgttttcaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataaagcc 40113403  T
Q  152 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 188  Q
    |||| | |||||||   |||||| || ||||||||||    
T  40113402 cttaataatttattggagagagaaaagtatatgaaat 40113366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 18355910 - 18356048
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||| |    
T  18355910 ttttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgatttatcaataatacccttacttatttattgtagagagagaaata-a 18356008  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 222  Q
    |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  18356009 tagaatgaaatgataaatgagtaagggtattatagaaaaa 18356048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22173789 - 22173735
Alignment:
Q  266 ttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22173789 ttggtttatgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaaaaggaacagagatagtaat 22173735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29458986 - 29458865
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttt--caatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||  | |||||| ||||| | | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29458986 ctccctccgtttctttttaagtgtctcttttgaagatttttttttttttcctatttaagtgtcactctacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 29458887  T
Q  140 atcaatattacccttagttatt 161  Q
    |  ||||||||||||| |||||    
T  29458886 actaatattacccttatttatt 29458865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 199073 - 198956
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  199073 tgtcattttcaagtttcaatgcaacattaattattgttttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 198974  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  198973 tgattaagggtattatag 198956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44543783 - 44543734
Alignment:
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaag 304  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44543783 tattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaag 44543734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3035636 - 3035581
Alignment:
Q  84 tttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3035636 tttgtttctatttatttgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttt 3035581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16237747 - 16237680
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  16237747 tactccctccgttcctttttaagtgtctttttaggaataatttttcgttcctatttaactgtcttttt 16237680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 318
Target Start/End: Original strand, 20105350 - 20105430
Alignment:
Q  230 ttattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20105350 ttattgcatcaaaagtggtatcaattgttgattgtcttgatttatgtaaaat--------gtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 20105430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 318
Target Start/End: Original strand, 44092264 - 44092295
Alignment:
Q  287 aaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44092264 aaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 44092295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13365078 - 13364944
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    |||||||||||  ||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | |    
T  13365078 ttttgtttcaaaatacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaa 13364979  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatag 217  Q
    | |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  13364978 taaaatgaaataataaatgattaagggtattatag 13364944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 32853589 - 32853543
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  32853589 tactccctccgtttctttttaattgttacttttagagaaattttttg 32853543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2642959 - 2642926
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2642959 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttg 2642926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 23087990 - 23088107
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  23087990 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 23088089  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  23088090 tgattaagggtattatag 23088107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 46694169 - 46694286
Alignment:
Q  100 tgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   ||||||||   |||||||||| | || |||||| ||| ||||    
T  46694169 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 46694268  T
Q  200 tgaataaggctattatag 217  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  46694269 tgattaagggtattatag 46694286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 272
Target Start/End: Original strand, 7678128 - 7678220
Alignment:
Q  180 atatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggttt 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || | |||||||| || |  || |||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  7678128 atataaaatgagatattaaatgatgaaagttattataggaagaagataaattgttgtattaaaagtagtaaaatgtatttgttgtcttggttt 7678220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37293648 - 37293549
Alignment:
Q  78 aaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaa 177  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||  ||||||  ||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||    
T  37293648 aaatattttgtttcattttacttgtccctttcaagtttcaatgcaacattaa---ttgatttatcaatattacccttacctatttattgtagagagagaa 37293552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 76
Target Start/End: Original strand, 51241759 - 51241791
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttgga 76  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51241759 tccctccgttcctttataagtgtcacttttgga 51241791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 59 - 318
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8411
Alignment:
Q  59 ttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagtt 158  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  8152 ttaagtgtcacttttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattcttcttagtt 8251  T
Q  159 atttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttatt 258  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || || ||    
T  8252 atttattgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 8351  T
Q  259 gattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8352 gattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 8411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 184388 - 184105
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  184388 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacaataaatattgtttta 184289  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  184288 ccaacattacccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataa 184189  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaattaaa 324  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||  |||||| || |||||    
T  184188 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacacttaaaaaagaaaggaggtaatacttaaa 184105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 49127 - 49403
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49127 tactccatcagttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 49226  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||   |||||| ||||    
T  49227 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-aaattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagtttattgcatca 49325  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  49326 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 49403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 308
Target Start/End: Original strand, 89366 - 89417
Alignment:
Q  257 ttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  89366 ttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaac 89417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0831 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0831
Description:

Target: scaffold0831; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 2787 - 3067
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2787 tactccctctgttcatttttaagtgtctcttttggagaatttttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 2886  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  2887 ccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagttgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatca 2986  T
Q  241 aaagtagtaac-atttattgattgtcttggtttatgtaaaatgt-cacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2987 aaagtagtaacaaattactgattgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagtaa 3067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0831; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3077 - 3034
Alignment:
Q  30 aagtaagattgtactccctccgttcctttttaagtgtcactttt 73  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3077 aagtaagtttttactccctccgttcctttttaattgtcactttt 3034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 147387 - 147111
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  147387 ctccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatc 147288  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat-gagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaa 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |   ||  ||||||||||    
T  147287 aatattacccttagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaataaaaatattaaattaataaggccattatagtaaaaatgaaaacaattgtatcaa 147188  T
Q  242 aagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  147187 aagtagtaacatttattaattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 147111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26109
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26381 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 26282  T
Q  148 tacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtag 247  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||| |||||||||   |||||| ||||||||||     
T  26281 tgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaattgaatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaa 26182  T
Q  248 taacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26181 tatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaacgaacagaggtagtaat 26109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Original strand, 69079 - 69356
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  69079 gtactccctccgtttctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt 69178  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  69179 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 69278  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||| |||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  69279 aaaaatagt-ataattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaaggaacggaggtagta 69356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 320
Target Start/End: Original strand, 148288 - 148562
Alignment:
Q  48 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-ttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  148288 tccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaaaaattgtttctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 148387  T
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  148388 ataatccttagttatttattgcggagagagaaatataagaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagt 148487  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaat 320  Q
    |||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  148488 agtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaaggaacggaggtagtaat 148562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 138992 - 138727
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  138992 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 138893  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| | |||||| |||    
T  138892 accaatattatccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattgcatc 138793  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagt 317  Q
    ||            || |||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||    
T  138792 aa------------ttgttgattgtcttggtttgtataaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagt 138727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 268
Target Start/End: Original strand, 369389 - 369610
Alignment:
Q  46 cctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-ttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaa 144  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  369389 cctccgttccttcttaattgtcacttttgaagaaatttttttgtttctagttaagtgtgactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcat 369488  T
Q  145 tattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 244  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||||||| ||||  || || | ||||||||||||    
T  369489 tattacccttggttatttatt--gcagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgataaaagttattataggaaaaagataaactgttgtatcaaaag 369586  T
Q  245 tagtaacatttattgattgtcttg 268  Q
    |||||| || ||||  ||||||||    
T  369587 tagtaaaatgtatttgttgtcttg 369610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 492597 - 492454
Alignment:
Q  45 ccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaa 144  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||  | | |||||||  ||| | |||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  492597 ccctcctttcctttataaccgtcacttttacatatatttttttcttctaattaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttccta 492498  T
Q  145 tattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 188  Q
    || | || ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  492497 taatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 492454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 317
Target Start/End: Original strand, 4505 - 4770
Alignment:
Q  50 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatatta 149  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  4505 cgttcctttttaagcgtcttttttgaagaatttttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttattaatat-a 4603  T
Q  150 cccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 249  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||    
T  4604 cccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagta 4703  T
Q  250 acatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagt 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4704 acaattattgattgtcttggtttatgtaaaatacca-aatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagt 4770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 318
Target Start/End: Original strand, 7417 - 7681
Alignment:
Q  54 cctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccct 153  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7417 cctttttaattgtcatttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattaccct 7516  T
Q  154 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacat 253  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| || |||||| || ||||  |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||    
T  7517 tagatatttattgcggggagagaaacatacgaaatgaaatcttaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtaatat 7616  T
Q  254 ttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7617 ttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 7681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 500 - 223
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  500 tactcgctccgttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgtttta 401  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  400 tcaatattatccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatca 301  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  300 aaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatca-aaaatgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1213 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1213
Description:

Target: scaffold1213; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 232 - 1
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatt----ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    | |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  232 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattaatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgt 133  T
Q  137 tttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgt 236  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||     
T  132 tttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgc 33  T
Q  237 atcaaaagtagtaacatttattgattgtcttg 268  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32 atcaaaagtagtaataattattgattgtcttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 93 - 318
Target Start/End: Original strand, 77120 - 77345
Alignment:
Q  93 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaga 192  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  77120 atttaactgtcactttcaaagtccaatgcaatattaaatgttgttttactaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 77219  T
Q  193 tattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtg 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||| | || |||    
T  77220 tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtg 77319  T
Q  293 acaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    
T  77320 acaattaagaaggaacggaggtagta 77345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Original strand, 295 - 565
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  295 tactccctccgtttctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttactatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 394  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||| |||||  |||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||  ||  |||||||||    
T  395 ccaaaattacttttagatatttattgcagagagggaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaggtaaaaacaattgtatca 494  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacaga 311  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  495 aaagtaataatatttattgattgtcttagtttacgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacaga 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30953 - 30676
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  30953 tactccctccgttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgtttta 30854  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 240  Q
     ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |  ||||   ||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  30853 ccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaaattagcaaggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 30754  T
Q  241 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30753 aaagtagtaagatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 30676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 318
Target Start/End: Original strand, 599 - 809
Alignment:
Q  108 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 207  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||    
T  599 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttttcaatattacccttaattatttattacaaagagagaaatatatgaaacaatatattaaatgaatgag 698  T
Q  208 gctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaa 307  Q
    |||||||| | |||   || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  699 gctattattggaaattgataaattattgtatcagaagtagttatatttattgattgtattgatttatgtaaaatgttaaaaagtgaaaattaaaaaggaa 798  T
Q  308 cagaggtagta 318  Q
    | |||||||||    
T  799 cggaggtagta 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 318
Target Start/End: Original strand, 23130 - 23394
Alignment:
Q  55 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt 154  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23130 ctttttaattgtcatttttgaagaaaatttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattaccctt 23229  T
Q  155 agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatt 254  Q
     |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||| ||     
T  23230 ggttatttattgccgagagaaaaatatataaaatgagatattaaatgataaaggttattataggaagaagataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatg 23329  T
Q  255 tattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcac-aaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||  ||||||| |||| |||||||   | | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23330 tatttgttgtcttagtttgtgtaaaaaaactcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 23394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23395 - 23361
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23395 gtactccctccgttcctttttaattgtcacttttg 23361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 96320 - 96045
Alignment:
Q  43 ctccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatc 142  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  96320 ctccctctgttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcc 96221  T
Q  143 aatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaa 242  Q
      ||||||||||  |||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||| ||||||    
T  96220 tttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaa 96121  T
Q  243 agtagtaacatttattgattgtcttggtttatgt-aaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    |||||||| |  ||||  |||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  96120 agtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 96045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Original strand, 96045 - 96078
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  96045 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttg 96078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Original strand, 252573 - 252851
Alignment:
Q  40 gtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  252573 gtactccctccgttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatattgtttt 252672  T
Q  140 atcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 239  Q
     ||  ||||||||||  |||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||| ||| ||     
T  252673 gtctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcata 252772  T
Q  240 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatg-tcacaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||| |  ||||  |||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  252773 aaaagtagtaaaaagtatttcttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 252851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 252851 - 252818
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  252851 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttg 252818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 146 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1973 - 1802
Alignment:
Q  146 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||      
T  1973 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgtataagaaaa 1874  T
Q  246 agtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatt-aaaaaggaacagaggtagta 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  1873 agtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgt--caaagtgacagttaaaaaaggaacggaggtagta 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14508 - 14239
Alignment:
Q  44 tccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatca 143  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | || |||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  14508 tccctccgttccttttaaattgtcacttttgcataatttttttatttctaattaagcgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtct 14409  T
Q  144 atattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
     ||||||||||  |||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||    
T  14408 ttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaaaataaattattgcatcaaaa 14309  T
Q  244 gtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaa-tgtcacaaagtgacaattaaaaaggaacagagg 313  Q
    ||||||| | |||||  |||||||| ||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14308 gtagtaaaaattatttgttgtcttgatttctgtaaaagactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagg 14239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 72208 - 72067
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  72208 tactccctccgtttttttttaagtgtatcttttggagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgattta 72109  T
Q  141 tcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  72108 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 72067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 195999 - 195882
Alignment:
Q  41 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  195999 tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 195900  T
Q  141 tcaatattacccttagtt 158  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  195899 tcaatattatccttagtt 195882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 195737 - 195581
Alignment:
Q  151 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaa 250  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||     
T  195737 ccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataagatcgttatagtaaaagtatagtttattgtatcaaacatagtat 195639  T
Q  251 catttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaac 308  Q
    || || | |||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  195638 caattgtcgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaac 195581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 1055 - 1209
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  1055 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttattacagaaagataaatata 1154  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    |||||||| |||||      ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  1155 tgaaatgaaatatt------ataagactattatagtagaagtaaaaattattttatcaaaa 1209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6574 - 6420
Alignment:
Q  83 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatata 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  6574 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttattacagaaagataaatata 6475  T
Q  183 tgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 243  Q
    |||||||| |||||      ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  6474 tgaaatgaaatatt------ataagactattatagtagaagtaaaaattattttatcaaaa 6420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Original strand, 20999 - 21163
Alignment:
Q  88 tttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 187  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||  |||||| ||||||    || |||||||||||   ||    
T  20999 tttctatttagccgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttactaatactattcttagtcatttatcctagatagagaaatataaataa 21098  T
Q  188 tgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaaca 252  Q
     ||||||| |||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  21099 cgagatatcaaatgaataaaggtattataggaaaaagataaattattatatcaaaagtaataaca 21163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16741 - 16713
Alignment:
Q  287 aaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741 aaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 16713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University