View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18034_low_10 (Length: 325)

Name: NF18034_low_10
Description: NF18034
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18034_low_10
NF18034_low_10
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (16-321)||(43036561-43036869)
chr8 (94-321)||(40321218-40321442)
chr8 (94-325)||(1345176-1345405)
chr8 (91-321)||(6599110-6599336)
chr8 (91-321)||(6674563-6674789)
chr8 (94-311)||(5689418-5689635)
chr8 (99-323)||(3303475-3303702)
chr8 (94-323)||(4743027-4743246)
chr8 (99-321)||(41366423-41366645)
chr8 (91-311)||(4731805-4732029)
chr8 (94-321)||(15212924-15213155)
chr8 (94-294)||(30143504-30143708)
chr8 (117-325)||(42498328-42498541)
chr8 (118-325)||(34254154-34254365)
chr8 (93-321)||(12702430-12702664)
chr8 (117-325)||(17982787-17982999)
chr8 (91-277)||(18105873-18106058)
chr8 (118-325)||(34256330-34256541)
chr8 (94-323)||(10015215-10015443)
chr8 (92-311)||(19491501-19491720)
chr8 (117-325)||(44303989-44304201)
chr8 (103-323)||(1746028-1746251)
chr8 (92-325)||(19945156-19945393)
chr8 (117-325)||(31218391-31218603)
chr8 (137-325)||(1292311-1292498)
chr8 (94-321)||(4733844-4734075)
chr8 (117-321)||(27811416-27811626)
chr8 (94-321)||(33352288-33352518)
chr8 (171-288)||(18141988-18142105)
chr8 (210-311)||(30291755-30291856)
chr8 (93-308)||(3050924-3051142)
chr8 (94-278)||(8153967-8154147)
chr8 (100-283)||(3073686-3073867)
chr8 (94-321)||(8965492-8965721)
chr8 (93-287)||(32901988-32902180)
chr8 (118-325)||(2627870-2628084)
chr8 (93-235)||(4162692-4162833)
chr8 (118-165)||(25690258-25690305)
chr8 (287-325)||(25690088-25690126)
chr8 (135-287)||(29796169-29796317)
chr8 (287-325)||(3439637-3439675)
chr8 (287-325)||(42575320-42575358)
chr8 (163-276)||(7597798-7597909)
chr8 (93-150)||(31071461-31071517)
chr8 (93-167)||(7493284-7493353)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (101-311)||(13137787-13137997)
chr1 (93-321)||(40122000-40122226)
chr1 (94-325)||(833970-834201)
chr1 (93-311)||(50166979-50167196)
chr1 (99-311)||(30476251-30476467)
chr1 (100-321)||(28265365-28265584)
chr1 (94-321)||(45644158-45644384)
chr1 (91-321)||(28223218-28223451)
chr1 (117-321)||(50169037-50169240)
chr1 (100-325)||(4552454-4552671)
chr1 (94-294)||(1833677-1833876)
chr1 (93-321)||(28220025-28220256)
chr1 (92-321)||(3846919-3847151)
chr1 (93-325)||(8550583-8550821)
chr1 (94-321)||(196710-196937)
chr1 (90-311)||(10925373-10925594)
chr1 (99-325)||(3189464-3189707)
chr1 (99-325)||(3198281-3198524)
chr1 (99-325)||(3207120-3207363)
chr1 (92-323)||(23555069-23555298)
chr1 (91-321)||(37559661-37559897)
chr1 (94-325)||(46065052-46065278)
chr1 (91-286)||(16455793-16455987)
chr1 (123-321)||(3157003-3157205)
chr1 (92-311)||(41361061-41361280)
chr1 (99-325)||(13659156-13659370)
chr1 (101-321)||(49918488-49918711)
chr1 (92-325)||(20762806-20763039)
chr1 (93-321)||(44455298-44455529)
chr1 (91-321)||(31659376-31659609)
chr1 (94-322)||(927785-928007)
chr1 (99-325)||(15820441-15820656)
chr1 (94-311)||(37503362-37503578)
chr1 (117-325)||(13316174-13316386)
chr1 (118-325)||(51765531-51765744)
chr1 (117-265)||(8870549-8870698)
chr1 (148-282)||(5460083-5460215)
chr1 (272-325)||(9036550-9036604)
chr1 (272-325)||(20622217-20622271)
chr1 (121-187)||(36683885-36683951)
chr1 (272-325)||(40282511-40282565)
chr1 (136-323)||(44646655-44646836)
chr1 (239-282)||(3460872-3460915)
chr1 (233-308)||(16914118-16914193)
chr1 (226-323)||(44650101-44650194)
chr1 (287-325)||(9987335-9987373)
chr1 (272-325)||(21054092-21054146)
chr1 (287-325)||(44203766-44203804)
chr1 (246-286)||(36683852-36683892)
chr1 (134-165)||(20622072-20622103)
chr1 (118-165)||(40282680-40282727)
chr1 (273-311)||(19072915-19072953)
chr1 (273-311)||(19120805-19120843)
chr1 (91-141)||(19752985-19753035)
chr1 (255-304)||(1485742-1485791)
chr1 (255-287)||(14569088-14569120)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (91-321)||(46147192-46147421)
chr4 (94-321)||(26175436-26175666)
chr4 (99-321)||(52467162-52467384)
chr4 (91-321)||(12743725-12743955)
chr4 (86-321)||(12739345-12739580)
chr4 (93-311)||(45686986-45687203)
chr4 (94-321)||(48893443-48893668)
chr4 (99-325)||(47038221-47038445)
chr4 (91-321)||(5871958-5872186)
chr4 (99-325)||(56178441-56178671)
chr4 (94-321)||(36463196-36463419)
chr4 (93-325)||(5369880-5370117)
chr4 (93-325)||(52082462-52082698)
chr4 (105-325)||(48143177-48143405)
chr4 (93-321)||(9927257-9927488)
chr4 (94-325)||(31474285-31474512)
chr4 (157-311)||(36994671-36994824)
chr4 (91-325)||(52095159-52095396)
chr4 (117-321)||(29254632-29254838)
chr4 (89-311)||(34570209-34570435)
chr4 (101-311)||(37740772-37740987)
chr4 (94-322)||(6541987-6542210)
chr4 (89-305)||(54199703-54199922)
chr4 (91-285)||(4588132-4588323)
chr4 (117-325)||(13992113-13992327)
chr4 (107-325)||(5207664-5207876)
chr4 (99-323)||(37229534-37229753)
chr4 (91-325)||(24969799-24970033)
chr4 (153-311)||(5429826-5429989)
chr4 (93-175)||(29999627-29999709)
chr4 (207-286)||(29056531-29056609)
chr4 (207-325)||(29999723-29999840)
chr4 (91-325)||(5350042-5350271)
chr4 (272-325)||(31495296-31495350)
chr4 (241-287)||(48142327-48142373)
chr4 (228-321)||(51337202-51337294)
chr4 (93-149)||(50262486-50262542)
chr4 (94-141)||(36994851-36994898)
chr4 (207-286)||(39593649-39593728)
chr4 (287-325)||(8393528-8393566)
chr4 (287-325)||(8395737-8395775)
chr4 (141-199)||(51338334-51338392)
chr4 (268-321)||(12745292-12745344)
chr4 (239-308)||(21703784-21703853)
chr4 (105-149)||(2210040-2210084)
chr4 (121-165)||(31495130-31495174)
chr4 (94-149)||(41639746-41639801)
chr4 (263-305)||(3913600-3913642)
chr4 (287-325)||(5136199-5136237)
chr4 (287-325)||(5138424-5138462)
chr4 (233-283)||(37754902-37754952)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (93-321)||(29196188-29196416)
chr3 (86-321)||(23391704-23391939)
chr3 (93-321)||(44700283-44700509)
chr3 (94-311)||(9666270-9666487)
chr3 (100-321)||(39153170-39153391)
chr3 (92-321)||(31314583-31314810)
chr3 (93-321)||(760985-761212)
chr3 (91-307)||(29811019-29811240)
chr3 (91-321)||(23410128-23410359)
chr3 (113-323)||(19683706-19683921)
chr3 (94-303)||(21350811-21351017)
chr3 (91-321)||(22834804-22835032)
chr3 (106-325)||(7762399-7762622)
chr3 (93-311)||(29813210-29813431)
chr3 (105-325)||(7764598-7764822)
chr3 (105-325)||(9581416-9581640)
chr3 (91-321)||(40734636-40734868)
chr3 (91-286)||(32891276-32891461)
chr3 (94-325)||(37408592-37408827)
chr3 (93-321)||(40735521-40735751)
chr3 (117-325)||(5257966-5258178)
chr3 (105-325)||(16499163-16499371)
chr3 (112-311)||(29682506-29682707)
chr3 (92-321)||(51398952-51399184)
chr3 (93-321)||(5236256-5236487)
chr3 (91-323)||(9635920-9636158)
chr3 (117-325)||(45095297-45095509)
chr3 (94-283)||(27305519-27305703)
chr3 (121-323)||(5260149-5260355)
chr3 (94-325)||(2074883-2075109)
chr3 (93-282)||(51351940-51352125)
chr3 (126-321)||(32744288-32744466)
chr3 (117-237)||(9634644-9634764)
chr3 (118-325)||(23197767-23197973)
chr3 (118-325)||(23199960-23200172)
chr3 (209-324)||(53921422-53921536)
chr3 (91-167)||(37406985-37407060)
chr3 (90-140)||(4160055-4160105)
chr3 (273-325)||(34491346-34491397)
chr3 (272-325)||(801226-801280)
chr3 (117-165)||(801388-801436)
chr3 (94-149)||(40913591-40913646)
chr3 (287-325)||(3617584-3617622)
chr3 (287-325)||(6716633-6716671)
chr3 (272-325)||(7779984-7780038)
chr3 (287-325)||(54635258-54635296)
chr3 (94-149)||(6095390-6095446)
chr3 (207-287)||(33192002-33192081)
chr3 (91-149)||(43403527-43403586)
chr3 (94-149)||(47304575-47304629)
chr3 (287-325)||(4598519-4598557)
chr3 (287-325)||(4600740-4600778)
chr3 (287-325)||(10056353-10056391)
chr3 (287-325)||(10058575-10058613)
chr3 (287-325)||(10060797-10060835)
chr3 (287-325)||(10063019-10063057)
chr3 (287-325)||(10065241-10065279)
chr3 (287-325)||(10067440-10067478)
chr3 (287-325)||(10211529-10211567)
chr3 (287-325)||(25637561-25637599)
chr3 (99-149)||(34491505-34491555)
chr3 (91-129)||(44330950-44330988)
chr3 (287-325)||(45283120-45283158)
chr3 (136-283)||(2020335-2020480)
chr3 (117-165)||(54635427-54635476)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (94-321)||(41317238-41317464)
chr7 (92-321)||(14069631-14069863)
chr7 (92-321)||(14379659-14379891)
chr7 (94-325)||(19502312-19502547)
chr7 (94-321)||(47675936-47676166)
chr7 (93-321)||(36146211-36146438)
chr7 (93-321)||(41648813-41649041)
chr7 (93-325)||(23555174-23555411)
chr7 (100-321)||(8153480-8153699)
chr7 (94-321)||(38671025-38671252)
chr7 (93-311)||(47673743-47673965)
chr7 (94-321)||(1113795-1114021)
chr7 (94-321)||(31732768-31732999)
chr7 (94-325)||(31105200-31105427)
chr7 (94-325)||(25615987-25616223)
chr7 (92-321)||(18126782-18127017)
chr7 (99-321)||(48489569-48489794)
chr7 (117-321)||(24525328-24525532)
chr7 (92-311)||(4586308-4586532)
chr7 (99-321)||(43864382-43864608)
chr7 (93-321)||(27347955-27348186)
chr7 (101-323)||(495795-496015)
chr7 (94-311)||(26417462-26417685)
chr7 (117-325)||(29991187-29991399)
chr7 (117-325)||(35854048-35854262)
chr7 (117-325)||(4178907-4179119)
chr7 (94-325)||(23344107-23344332)
chr7 (101-252)||(30024569-30024714)
chr7 (212-321)||(12097789-12097897)
chr7 (94-294)||(48491742-48491944)
chr7 (99-286)||(23564876-23565058)
chr7 (94-325)||(31519037-31519258)
chr7 (93-325)||(36574323-36574550)
chr7 (117-325)||(25766779-25766994)
chr7 (188-325)||(39731503-39731642)
chr7 (86-325)||(48408938-48409183)
chr7 (136-325)||(4253376-4253562)
chr7 (136-287)||(40808759-40808909)
chr7 (99-214)||(12096971-12097084)
chr7 (91-149)||(6430441-6430499)
chr7 (91-149)||(4510336-4510394)
chr7 (91-149)||(4512178-4512236)
chr7 (265-325)||(24789975-24790036)
chr7 (280-325)||(34310705-34310750)
chr7 (94-149)||(22270266-22270321)
chr7 (207-323)||(43504064-43504186)
chr7 (99-149)||(2360777-2360827)
chr7 (225-321)||(2759128-2759227)
chr7 (287-325)||(6592336-6592374)
chr7 (287-325)||(6594554-6594592)
chr7 (287-325)||(18388756-18388794)
chr7 (287-325)||(18392192-18392230)
chr7 (93-149)||(30814715-30814771)
chr7 (118-165)||(20344200-20344247)
chr7 (272-325)||(1560646-1560700)
chr7 (255-305)||(13065365-13065415)
chr7 (240-286)||(26639498-26639544)
chr7 (287-325)||(32060318-32060356)
chr7 (117-165)||(43503974-43504022)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (99-321)||(538163-538384)
chr5 (94-321)||(28750455-28750685)
chr5 (91-321)||(533907-534130)
chr5 (101-321)||(42428237-42428460)
chr5 (99-325)||(13239885-13240114)
chr5 (93-321)||(5887234-5887464)
chr5 (93-321)||(42426034-42426265)
chr5 (99-321)||(32636962-32637187)
chr5 (93-321)||(31183109-31183342)
chr5 (117-325)||(37439275-37439489)
chr5 (81-321)||(19806501-19806742)
chr5 (94-321)||(8565748-8565976)
chr5 (93-321)||(30682721-30682952)
chr5 (94-321)||(13488341-13488569)
chr5 (94-321)||(33831818-33832046)
chr5 (94-311)||(16649635-16649851)
chr5 (94-311)||(39468348-39468570)
chr5 (92-323)||(42927027-42927262)
chr5 (91-325)||(30182722-30182960)
chr5 (118-323)||(36073866-36074075)
chr5 (117-325)||(13343194-13343406)
chr5 (117-325)||(25412894-25413106)
chr5 (136-325)||(16452214-16452402)
chr5 (92-174)||(3075547-3075629)
chr5 (117-325)||(16409609-16409825)
chr5 (92-325)||(26178016-26178257)
chr5 (94-149)||(40147555-40147610)
chr5 (91-165)||(9789018-9789092)
chr5 (109-325)||(26170896-26171119)
chr5 (272-325)||(10593392-10593446)
chr5 (272-325)||(29720498-29720552)
chr5 (99-201)||(42309829-42309930)
chr5 (262-323)||(3075630-3075690)
chr5 (272-325)||(9789203-9789258)
chr5 (109-165)||(18441457-18441512)
chr5 (272-325)||(18441627-18441682)
chr5 (239-286)||(13695639-13695686)
chr5 (182-286)||(30897585-30897684)
chr5 (94-149)||(38747298-38747353)
chr5 (287-325)||(22536286-22536324)
chr5 (287-325)||(25078255-25078293)
chr5 (287-325)||(25136224-25136262)
chr5 (272-325)||(29722658-29722712)
chr5 (287-325)||(29751156-29751194)
chr5 (287-325)||(40380225-40380263)
chr5 (287-325)||(40382436-40382474)
chr5 (149-311)||(9049209-9049363)
chr5 (270-325)||(28278450-28278504)
chr5 (245-303)||(9299739-9299797)
chr5 (273-311)||(10281738-10281776)
chr5 (287-325)||(16544543-16544581)
chr5 (287-325)||(16546765-16546803)
chr5 (291-323)||(213601-213633)
chr5 (94-193)||(12102534-12102637)
chr5 (92-167)||(15464341-15464414)
chr5 (97-149)||(28278609-28278661)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (91-321)||(723544-723774)
chr2 (92-325)||(36317811-36318043)
chr2 (93-321)||(34139572-34139800)
chr2 (94-321)||(39284974-39285202)
chr2 (88-321)||(33162248-33162480)
chr2 (94-321)||(11151395-11151621)
chr2 (93-325)||(36987874-36988110)
chr2 (94-325)||(2334218-2334452)
chr2 (128-321)||(11067443-11067635)
chr2 (93-321)||(14633627-14633855)
chr2 (94-300)||(42362506-42362713)
chr2 (94-311)||(36773709-36773926)
chr2 (94-321)||(29868007-29868237)
chr2 (94-325)||(6594804-6595040)
chr2 (93-309)||(14202223-14202440)
chr2 (102-311)||(38312387-38312600)
chr2 (94-286)||(24885761-24885953)
chr2 (91-311)||(11690648-11690859)
chr2 (91-321)||(17057166-17057399)
chr2 (91-321)||(17085149-17085382)
chr2 (117-325)||(36205487-36205699)
chr2 (117-325)||(45099888-45100100)
chr2 (111-325)||(5723072-5723290)
chr2 (92-276)||(2838132-2838315)
chr2 (117-325)||(4502955-4503167)
chr2 (93-283)||(11049729-11049913)
chr2 (117-325)||(4484150-4484364)
chr2 (189-311)||(1345613-1345733)
chr2 (138-325)||(26353318-26353495)
chr2 (117-325)||(30833480-30833694)
chr2 (137-286)||(12123434-12123581)
chr2 (109-325)||(32289698-32289921)
chr2 (99-282)||(13121942-13122121)
chr2 (237-325)||(17490095-17490182)
chr2 (137-286)||(7815127-7815270)
chr2 (241-283)||(41446315-41446357)
chr2 (239-325)||(28672065-28672151)
chr2 (148-287)||(43406144-43406280)
chr2 (287-325)||(6266825-6266863)
chr2 (287-325)||(12647382-12647420)
chr2 (239-286)||(7596960-7597007)
chr2 (94-145)||(26354127-26354176)
chr2 (287-325)||(13656028-13656066)
chr2 (257-311)||(42019836-42019890)
chr2 (280-325)||(17450711-17450755)
chr2 (94-196)||(17489958-17490060)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (94-323)||(26954091-26954318)
chr6 (121-317)||(33160177-33160378)
chr6 (92-286)||(14521476-14521673)
chr6 (99-294)||(3038732-3038927)
chr6 (94-321)||(16569160-16569389)
chr6 (117-325)||(5408892-5409103)
chr6 (117-325)||(5413217-5413428)
chr6 (94-325)||(28137211-28137442)
chr6 (121-311)||(9182857-9183052)
chr6 (92-325)||(16452125-16452363)
chr6 (112-325)||(31404492-31404709)
chr6 (171-325)||(33211066-33211219)
chr6 (117-325)||(5406025-5406234)
chr6 (117-325)||(5410350-5410559)
chr6 (103-325)||(30834343-30834570)
chr6 (117-325)||(2171349-2171566)
chr6 (93-149)||(602902-602958)
chr6 (117-325)||(3072579-3072793)
chr6 (272-325)||(412236-412291)
chr6 (272-325)||(6097430-6097485)
chr6 (272-325)||(16578497-16578552)
chr6 (272-325)||(16616828-16616883)
chr6 (272-325)||(16653246-16653301)
chr6 (118-165)||(412387-412434)
chr6 (239-286)||(4045590-4045637)
chr6 (91-149)||(17758346-17758405)
chr6 (272-323)||(16555005-16555058)
chr6 (272-323)||(16631561-16631614)
chr6 (287-325)||(25421440-25421478)
chr6 (287-325)||(34167214-34167252)
chr6 (118-165)||(6097270-6097317)
chr6 (107-154)||(22963522-22963568)
chr6 (107-154)||(23824825-23824871)
chr6 (111-149)||(3808512-3808550)
chr6 (287-325)||(6027381-6027419)
chr6 (287-325)||(13154049-13154087)
chr6 (99-149)||(22424620-22424670)
chr6 (287-325)||(27647994-27648032)
chr6 (287-325)||(33342101-33342139)
chr6 (287-325)||(34164992-34165030)
chr6 (90-159)||(257241-257308)
chr6 (134-167)||(9182829-9182862)
chr6 (234-311)||(12221048-12221125)
chr6 (93-149)||(21589252-21589309)
chr6 (94-149)||(17763313-17763369)
[»] scaffold1668 (1 HSPs)
scaffold1668 (94-294)||(1301-1502)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (99-325)||(148917-149131)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (93-321)||(20215-20445)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (117-325)||(114736-114950)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (117-325)||(434667-434880)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (117-325)||(1049-1262)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (118-325)||(8556-8769)
scaffold0491 (118-325)||(10982-11195)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (91-311)||(27247-27462)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (117-165)||(11864-11912)
scaffold0286 (262-325)||(11691-11757)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (285-325)||(2598-2638)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (91-149)||(17790-17849)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (287-325)||(3722-3760)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (108-149)||(7646-7687)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (207-300)||(25201-25292)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (287-323)||(1-37)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43036869 - 43036561
Alignment:
Q  16 acaatgacactttattgttgctaatatctaccaatatactttgcaaataaaaatatctacaagtaaatgtatgaaaattgttatgaattcggactcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43036869 acaatgacactttattgttgctaatatctaccaatatactttgcaaataaaaatatctacaagtaaatgtatgaaaattgttatgaatttggactcaaaa 43036770  T
Q  116 ctcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43036769 ctcacaccaatacaaaaaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataacaacaccacctagatctaa 43036670  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  43036669 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-a 43036571  T
Q  312 acttgaccta 321  Q
    ||||||||||    
T  43036570 acttgaccta 43036561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40321442 - 40321218
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40321442 tgttgtgaattccgactcaaaa-tcacac-aatacaaactatgatatgtggagcaaaggaaagtagcaatcaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 40321345  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40321344 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacatcaaagattgt 40321245  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40321244 tgacccagttcggtcc-aacttgaccta 40321218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Original strand, 1345176 - 1345405
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  1345176 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacacaaatacaaacaataatctgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 1345274  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1345275 taataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaatctcaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 1345374  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | ||| | |||||| | |||||||||||||||    
T  1345375 tgacctagttcggt-ctaacttgacctactct 1345405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6599336 - 6599110
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  6599336 aattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaa 6599238  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaaga 289  Q
     ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6599237 taataacaacacc---tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaaga 6599141  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6599140 ttgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 6599110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6674789 - 6674563
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  6674789 aattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaa 6674691  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaaga 289  Q
     ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6674690 taataacaacacc---tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaaga 6674594  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6674593 ttgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 6674563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5689635 - 5689418
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 192  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  5689635 tgttgtgaattccgactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 5689537  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |||| |||| ||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5689536 ataataacaacatctaaatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaacacatcaaagattg 5689437  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaa 311  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  5689436 ttgacccagttcggtccaa 5689418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 323
Target Start/End: Original strand, 3303475 - 3303702
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |    
T  3303475 tgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaaacaaacacaagcaacaacaataata 3303574  T
Q  199 acaccacttagatctaatctag----taaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgtt 294  Q
    ||  ||| ||||||||||||||     || ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3303575 actacacctagatctaatctaggaatcaatcaaagtgaaaagtacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgtt 3303674  T
Q  295 cacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3303675 tacccagttcggtcc-aacttgacctact 3303702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 323
Target Start/End: Original strand, 4743027 - 4743246
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||          
T  4743027 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaataccaaagtaaacacaagcaa------ 4743120  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743121 taacaacacc---tagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcgaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 4743217  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4743218 tgacccagttcggtcc-aacttgacctact 4743246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Original strand, 41366423 - 41366645
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  41366423 tgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaacaata 41366521  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa-gagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgttca 296  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  41366522 acaacacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaatgggagaagagaaacaaaacacaccaaagattgttgt 41366621  T
Q  297 cccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  41366622 cccagttcggtcc-aacttgaccta 41366645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4732029 - 4731805
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||| ||    
T  4732029 aattgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccgatatcaaagtgaacacaaacaataa 4731931  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacacca 285  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  4731930 tcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacca 4731831  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4731830 aagattgttgacccaattcggtccaa 4731805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15213155 - 15212924
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||    
T  15213155 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 15213056  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    | || |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15213055 acaataacagcaccttgatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 15212956  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15212955 attgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 15212924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30143708 - 30143504
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  30143708 tgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 30143610  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30143609 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 30143510  T
Q  289 attgtt 294  Q
    ||||||    
T  30143509 attgtt 30143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42498541 - 42498328
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||  || || |||| ||| |||||||||    
T  42498541 tcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataattaacaataacaacacctagatctaa 42498442  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaaga--gaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42498441 tctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagggaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 42498342  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  42498341 acttgacctactct 42498328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Original strand, 34254154 - 34254365
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  34254154 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 34254253  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaa 312  Q
    |||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34254254 ctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaa 34254352  T
Q  313 cttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||    
T  34254353 cttgacctactct 34254365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 12702430 - 12702664
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac- 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  12702430 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaaca 12702528  T
Q  192 --aataacaacaccacttagatctaatctag-taaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga----agagaaacaaacacacc 284  Q
      |||||||||  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||    ||||||||||||| |||    
T  12702529 ataataacaacgacacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaacaaacatacc 12702628  T
Q  285 aaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12702629 aaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 12702664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17982999 - 17982787
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  17982999 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaacgtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 17982900  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17982899 tctaggaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 17982801  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  17982800 acttgacctactct 17982787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 277
Target Start/End: Original strand, 18105873 - 18106058
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||    
T  18105873 aattgttatgaattcagactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaaacacaagcaataa 18105971  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaa 277  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18105972 caacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaa 18106058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Original strand, 34256330 - 34256541
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  34256330 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 34256429  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaa 312  Q
    |||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34256430 ctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaa 34256528  T
Q  313 cttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||    
T  34256529 cttgacctactct 34256541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10015443 - 10015215
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  10015443 tgttgtgaattcggatttaaaacttacaccaatgaaaacaaagatgtgtggagcagaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagcaaaaacaa 10015344  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| ||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||     
T  10015343 taataacaatacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagaaacaaatacaccaagaaatga 10015244  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10015243 ttacccagttcggtcc-aacttgacctact 10015215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 311
Target Start/End: Original strand, 19491501 - 19491720
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  19491501 attgttgtgaattcggactcaaaactctaaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaatcaatatcaaagtaaacacaagtaacaac 19491599  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agat 290  Q
    || || |||| ||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  19491600 aacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagtgagaaaagaaacaaacacaccaagatat 19491699  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||| ||| | ||||||||||    
T  19491700 tgttgacctagttcggtccaa 19491720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44304201 - 44303989
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  44304201 tcacaccaatacatactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 44304102  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  44304101 tctagaaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagttcgatccaa 44304003  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  44304002 acttgacctactct 44303989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 323
Target Start/End: Original strand, 1746028 - 1746251
Alignment:
Q  103 ttcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaaca 201  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| || ||| || ||||    
T  1746028 ttcggtctcaaaa-tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataaca 1746126  T
Q  202 ccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcac 297  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1746127 gcacctagatctaatctaggaatcaaagtcaaaagcgcaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaacgattgttcac 1746225  T
Q  298 ccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1746226 ccagttcggtccaaacttgacctact 1746251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 19945156 - 19945393
Alignment:
Q  92 attgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| ||    
T  19945156 attgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactttgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataa 19945254  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacacca 285  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  19945255 tcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacacca 19945353  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19945354 aagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactct 19945393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31218603 - 31218391
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  31218603 tcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 31218504  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31218503 tctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaac-ataagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 31218405  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  31218404 acttgacctactct 31218391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 325
Target Start/End: Original strand, 1292311 - 1292498
Alignment:
Q  137 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag 236  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |  ||||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1292311 atgtggggagcaaagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagtagtaacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaag 1292410  T
Q  237 ctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1292411 ctcaaaaccacgagcaaaagataaggagagaagagaaacaaacacaccaagaaatgtttgcccagttcggtcc-aacttgacctactct 1292498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4734075 - 4733844
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaac-aatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    |||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| || |    
T  4734075 tgttgtgaattcggattcaaaatt-acaccaatacaaaccaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataatc 4733977  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaa 287  Q
    || || |||| ||| |||||| ||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  4733976 aacaataacaacacctagatcaaatgtaggaaacaaaatgaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaggtagagaagagaggaacaaacacaccaaa 4733877  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    || |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4733876 gactgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 4733844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27811626 - 27811416
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaat--gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatct 213  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||    
T  27811626 tcacaccaatacaaactatatgatgtgtggaggaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatct 27811527  T
Q  214 aatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaag--agagaaga--gaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcc 309  Q
    ||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27811526 aatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagcaagagaagaggggaaaaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 27811427  T
Q  310 aaacttgaccta 321  Q
     |||||||||||    
T  27811426 -aacttgaccta 27811416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33352518 - 33352288
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  33352518 tgttgtgaattcgtactcaaaa-tcacaccaatataaattatgatatgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 33352420  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    | || |||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  33352419 acaataacaacacctaaatctaatctagaaatcaaagtgaaaaacacaaatccacaagcaaaagataaaaggagataagagaggaacaaacacatcaaag 33352320  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33352319 attgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 33352288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 171 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18142105 - 18141988
Alignment:
Q  171 aaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaaga 270  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18142105 aaagtaaacacaagcaacaataataataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagcaga 18142006  T
Q  271 gaaacaaacacaccaaag 288  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  18142005 gaaacaagcacaccaaag 18141988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30291856 - 30291755
Alignment:
Q  210 atctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcc 309  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  30291856 atctaatctagtaatcaaagtggaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgattcagttcggtcc 30291757  T
Q  310 aa 311  Q
    ||    
T  30291756 aa 30291755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Original strand, 3050924 - 3051142
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat----aagcaac 188  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||| || ||     |||||||    
T  3050924 ttgttgtgaattgggactcaaatctcacaccaata--aataatgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccacaatcaaagcaagcaatcacaagcaac 3051021  T
Q  189 aacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagata--aagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||| |||| |  ||||||||||||||    
T  3051022 aacaataataacaacacctagatctaatctagaaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataagaaagcaagaaagaa-aacaacaaacacaccaa 3051120  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtc 308  Q
    |||||  | |||||||||||||    
T  3051121 agattagtaacccaattcggtc 3051142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8154147 - 8153967
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  8154147 tgttgtgaattcgggctcaaaa-tcacactaata-aaactatgatgtgtgaagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaa 8154050  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaa 278  Q
    ||| ||||  || ||||| |||||||| ||  |||||||||| | |||||  ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  8154049 taataaca-aacctagatgtaatctaggaa-taaagtgaaaaacacaaaattacatgcaaaagataaacaaagaagagaaacaaa 8153967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 3073686 - 3073867
Alignment:
Q  100 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataa---gcaacaacaataa 196  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||  ||| || || ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||   ||| |||||| ||    
T  3073686 gaattcggactcaaaaa-cacaccaata--aactatcatatgtggagcaaaggaaagtaataaccagtatcaaagtaaccacaatgagcagcaacaacaa 3073782  T
Q  197 caacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacac 283  Q
    |||||  || ||||| |||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3073783 caacaa-acctagatttaatctaggaat-aaagtgaagagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaacacac 3073867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 8965492 - 8965721
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  8965492 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgcgtggagcaa-ggaacgtagtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaa 8965588  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg--------aaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacacca 285  Q
     || ||||  || ||||| |||||||| || | |||||        ||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8965589 caataaca-aacctagatttaatctaggaatc-aagtgaaaaaaaaaaaaaaacaaaaccacaaacaaaagataaagagagaaaagaaacaaacacaccg 8965686  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8965687 ataaatgtttacccagttcggtcc-aacttgaccta 8965721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 287
Target Start/End: Original strand, 32901988 - 32902180
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaagga-aagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||   ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| || |  || |||||||    
T  32901988 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcagaccaat--aaacttagatgtgtggagcaaaagagaagtagtaactaatatcaaagcaacctcaaacaacaac 32902084  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagat-aaagag-agaagagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    || |||||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32902085 aacaacaaca-aacctagatctaatctaggaacc-aagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaaagagaagaagagaaacaaacacagcaaa 32902180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2628084 - 2627870
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa--caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| ||  ||| || |||| ||| |||||||||    
T  2628084 cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacacctagatctaa 2627985  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataa----agagagaagag--aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtc 308  Q
    ||||| || | |||||||||||  |||| ||||||||  ||||||    |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  2627984 tctaggaaac-aagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattattcacccagttcggtc 2627887  T
Q  309 caaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||||    
T  2627886 caaacttgacctactct 2627870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4162833 - 4162692
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatt----tcaaagtaaacataagcaac 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||    ||||||||| || || ||||    
T  4162833 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcataccagta-aaacaatgatgtgaggagcaaagaaaaatggtaaccaattaatatcaaagtaatcacaaacaac 4162736  T
Q  189 aacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaa 235  Q
    |||||||| || |||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  4162735 aacaataataaaacc---tagatctaatctaggaatcaaagtgaaaa 4162692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25690305 - 25690258
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25690305 cacaccaatacaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 25690258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25690126 - 25690088
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25690126 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 25690088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 287
Target Start/End: Original strand, 29796169 - 29796317
Alignment:
Q  135 tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaa 234  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||  |   |||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  29796169 tgatgtgtggagcaaaaggaagtaataaccagtatcaaagtattctcgagcaacaacaataataaca-atcttagatttaatctagtaa-ttaagtgtaa 29796266  T
Q  235 agctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  29796267 agcacaaaatcataagcaaaagataaa-agagaagataaac-aacacaccaaa 29796317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3439675 - 3439637
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3439675 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactct 3439637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 42575320 - 42575358
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42575320 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 42575358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7597909 - 7597798
Alignment:
Q  163 ccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaag 262  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||| ||| || ||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| | |||||| | || ||| ||||||||    
T  7597909 ccaatatcaaagtaacctgaagcaacaccaacaataacaa-acttagatctaatttaggaaccaa-gtgtaaaacacaaaacgataaacaaaagataaag 7597812  T
Q  263 agagaagagaaaca 276  Q
    ||||||||||||||    
T  7597811 agagaagagaaaca 7597798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31071517 - 31071461
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaa 150  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31071517 ttgttgtgaattcgga-taaaaactcacaccaatgtaaacaaagatgtgtggagcaaa 31071461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7493353 - 7493284
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaat 167  Q
    ||||| |||||||||||   ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7493353 ttgttgtgaattcggac---aaaatcacaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaagg-aagtagtaatcaat 7493284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 13137787 - 13137997
Alignment:
Q  101 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13137787 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataac 13137886  T
Q  201 accacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccca 300  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13137887 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaacctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacatcaaagattgttgaccca 13137986  T
Q  301 attcggtccaa 311  Q
     ||||||||||    
T  13137987 gttcggtccaa 13137997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 40122000 - 40122226
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  40122000 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgcgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatctaagtgaacacaagcaacaaca 40122098  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40122099 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 40122198  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    || ||| | |||||||| |||||||||||    
T  40122199 ttgacctagttcggtcc-aacttgaccta 40122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Original strand, 833970 - 834201
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  833970 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 834068  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
     || |||| |||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  834069 caataacaacaccaagatctaatctgggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagatt 834168  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  834169 gttgacccagttcggtcc-aacttgacctactct 834201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 93 - 311
Target Start/End: Original strand, 50166979 - 50167196
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  50166979 ttgttgtgaactcgaactcaaaa-tcacaccaaaacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagaaacaaca 50167077  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167078 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 50167177  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaa 311  Q
    || ||| | ||||||||||    
T  50167178 ttgacctagttcggtccaa 50167196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 311
Target Start/End: Original strand, 30476251 - 30476467
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30476251 tgaattcgaactcaaaactcacaccaatacaaactataatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataata 30476350  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgtt 294  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30476351 acaacacttagacctaatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgtt 30476450  T
Q  295 cacccaattcggtccaa 311  Q
     ||||| ||||||||||    
T  30476451 gacccagttcggtccaa 30476467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 321
Target Start/End: Original strand, 28265365 - 28265584
Alignment:
Q  100 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaa 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  28265365 gaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaaatagtagccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataa 28265463  T
Q  200 caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccc 299  Q
    || ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28265464 caacatctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgaccc 28265563  T
Q  300 aattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  28265564 agttcggtcc-aacttgaccta 28265584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 45644158 - 45644384
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 192  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  45644158 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 45644256  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |||| |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45644257 ataataacaacatctagatctaatctagcaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaagcacaccaaagattg 45644356  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  45644357 ttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 45644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 28223218 - 28223451
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  28223218 aattgttgtgaattcggactcaaaactcagaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaacgaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa 28223317  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaa 286  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||   |||||||||||||    
T  28223318 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaa 28223417  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28223418 agattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 28223451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 117 - 321
Target Start/End: Original strand, 50169037 - 50169240
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  50169037 tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaataataacaacacctatatctaat 50169136  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttg 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  50169137 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgatccagttcggtcc-aacttg 50169235  T
Q  317 accta 321  Q
    |||||    
T  50169236 accta 50169240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 325
Target Start/End: Original strand, 4552454 - 4552671
Alignment:
Q  100 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaa 199  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  4552454 gaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgcgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagtaacaacaataataa 4552553  T
Q  200 caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccc 299  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4552554 caacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagata-------aagagaaacaaacacaccaaagattgttgaccc 4552646  T
Q  300 aattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | |||||||| |||||||||||||||    
T  4552647 agttcggtcc-aacttgacctactct 4552671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1833876 - 1833677
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1833876 tgttgtgaattcggactcaata-tcacaccaatacaaactatgatctgtggagtaaaggaaagtcgtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 1833778  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1833777 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaagagagaaaataaacaaacacaccaaagattgt 1833678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 28220025 - 28220256
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||    
T  28220025 ttgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaagaaaattagtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacaaca 28220124  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||   |||||||||||||||    
T  28220125 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaag 28220224  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28220225 attgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 28220256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 3846919 - 3847151
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3846919 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcatactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaac 3847017  T
Q  192 aataacaa---caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaa 286  Q
    ||||| ||   || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3847018 aataataataacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaa 3847117  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtcc-aacttgaccta 3847151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Original strand, 8550583 - 8550821
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |    
T  8550583 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 8550681  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagag------aaacaaacacacca 285  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||       ||||||||||||||    
T  8550682 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaaacaaacacacca 8550781  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8550782 aagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 8550821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 196710 - 196937
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  196710 tgttgtgaattcgtactcaaat-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 196808  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  196809 taataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgagaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaaaaaacacaccaaagatt 196908  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  196909 gttgatccagttcggtcc-aacttgaccta 196937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10925594 - 10925373
Alignment:
Q  90 aaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaaca 189  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |    
T  10925594 aaattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaacaatacaaactatgttgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaata 10925496  T
Q  190 a-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaag 288  Q
    | ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10925495 atcaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagggaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagataaacaaacacatcaaag 10925396  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||| ||||| |||| |||||    
T  10925395 attgttgacccagttcgatccaa 10925373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3189707 - 3189464
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  3189707 tgaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataata 3189609  T
Q  199 acac--------------cacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaaca 280  Q
    | ||              ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  3189608 aaacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaaca 3189509  T
Q  281 caccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3189508 caccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 3189464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3198524 - 3198281
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  3198524 tgaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataata 3198426  T
Q  199 acac--------------cacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaaca 280  Q
    | ||              ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  3198425 aaacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaaca 3198326  T
Q  281 caccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3198325 caccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 3198281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3207363 - 3207120
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  3207363 tgaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataata 3207265  T
Q  199 acac--------------cacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaaca 280  Q
    | ||              ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  3207264 aaacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaaca 3207165  T
Q  281 caccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3207164 caccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 3207120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 323
Target Start/End: Original strand, 23555069 - 23555298
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23555069 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcgcaccaatagaaacaatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaatcaatgtcaaagtaaacacaagcaacaac 23555167  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    || || |||| ||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  23555168 aacaataacaacacctagatctaatttaggaatcatagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaacataaagagagaagagaaacaaacgcaccaagaaat 23555267  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    ||| || || |||| ||| |||||||||||||    
T  23555268 gtttactcagttcgatcc-aacttgacctact 23555298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 37559661 - 37559897
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  37559661 aattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataa 37559760  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatct-aatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa---gagagaagaga--aacaaacacac 283  Q
     ||| || |||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||  |||||||||||    
T  37559761 tcaacaataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggggagagaagagaggaacaaacacac 37559860  T
Q  284 caaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  37559861 caaagattgttgaccaagttcggtcc-aacttgaccta 37559897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46065278 - 46065052
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  46065278 tgttgtgaattcggactcaaaac-cacac-aatgaaaacaaagatgtgtggagcaaacgatagttgtaaccaatt-caaagtaaatacaagcaacaacaa 46065182  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46065181 taataacaacacctagatctaatctactaat-aatgtgaaaggctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 46065083  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  46065082 ttacccagttcgatcc-aacttgacctactct 46065052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16455987 - 16455793
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16455987 aattgttgtgaattcggactcaaaatt-acaccaatgaaaacaaagatttgtgtagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacgtaagcaacaa 16455889  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16455888 caataataacaacatatagatctaatctggtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaatacaccaa 16455793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3157205 - 3157003
Alignment:
Q  123 caatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagt 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||     
T  3157205 caatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagg 3157106  T
Q  222 aaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttga 317  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  3157105 aatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttga 3157007  T
Q  318 ccta 321  Q
    ||||    
T  3157006 ccta 3157003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41361280 - 41361061
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  41361280 attgttgtgaattcggactcaaaactctaaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaatcaatatcaaagtaaacacaagtaacaac 41361182  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agat 290  Q
    || || |||| ||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  41361181 aacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagtgagaaaagaaacaaacacaccaagatat 41361082  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||| ||| | ||||||||||    
T  41361081 tgttgacctagttcggtccaa 41361061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Original strand, 13659156 - 13659370
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||      |||||    
T  13659156 tgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa------taaca 13659248  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc 298  Q
    |||||   || ||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13659249 acacc---taaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaatacaccaaagattgttgacc 13659344  T
Q  299 caattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||    
T  13659345 cagttcggtcc-aacttaacctactct 13659370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 49918711 - 49918488
Alignment:
Q  101 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaa 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || ||    
T  49918711 aattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataa 49918613  T
Q  200 caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttc 295  Q
    || ||| || ||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  49918612 cagcacctatatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttg 49918513  T
Q  296 acccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||    
T  49918512 acctagttcggtcc-aacttgaccta 49918488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20763039 - 20762806
Alignment:
Q  92 attgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   |||||| ||    
T  20763039 attgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaaccaatatcaaagtgaattcaagcaataa 20762941  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacacca 285  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| ||     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  20762940 tcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa-----gtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacacca 20762846  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20762845 aagattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactct 20762806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44455529 - 44455298
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||| || |    
T  44455529 ttgttgtgaattcgtactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatatgtggagaaaagaaaagtggtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatc 44455431  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaa 287  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  44455430 aacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaaggaagagaagagaggaacaaacacaccaaa 44455331  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  44455330 gatcgttgacccagttcggt-caaacttgaccta 44455298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31659609 - 31659376
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||    
T  31659609 aattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatataaaatatgatgtgtggagaaaagaaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataa 31659511  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataa----agagagaagagaaacaaacacacca 285  Q
     ||| || |||| ||| | |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    ||||| ||||| || ||||||||||    
T  31659510 tcaacaataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagtaaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaaaggagagaaaagaggaataaacacacca 31659411  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  31659410 aagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 31659376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 322
Target Start/End: Original strand, 927785 - 928007
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  927785 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaata--aactatgatgtgtggagtaaagggaagtggtaaccaatatcaaagtaatcacaaacaacaacaa 927881  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctag-taaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
     ||||| ||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||    
T  927882 caacaaaac---ttagatctaatatagataatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaacacacaaagaaatg 927978  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaaacttgacctac 322  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  927979 tttacccagttcggt-ctaacttgacctac 928007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15820656 - 15820441
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  15820656 tgaattcggactcaaaactcac--caata--aacttagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa---ca 15820564  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc 298  Q
    |||||   |||||||||| ||| || ||||  |||||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||    
T  15820563 acacc---tagatctaatataggaatcaaatagaaaagctcataaacacaagcaatggataaggagagaagagaaacaaacacaccaataaatgtttacc 15820467  T
Q  299 caattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
     | |||| ||| |||||||||||||||    
T  15820466 tagttcgatcc-aacttgacctactct 15820441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 37503362 - 37503578
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     ||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  37503362 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtag-----aatatcaaagtgaacacaagcaataatca 37503455  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    | || | || ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37503456 acaatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 37503555  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||| ||| | |||| |||||    
T  37503556 attgttgacctagttcgatccaa 37503578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 13316174 - 13316386
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  13316174 tcacaccaatacgaaatataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 13316273  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||  ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13316274 tctaggaatcaaagtgaaaaacacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaactcactaaagattgttcacccagttcggtccaa 13316372  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  13316373 acttgacctactct 13316386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51765744 - 51765531
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |    |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  51765744 cacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaattaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaat 51765645  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcca 310  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51765644 ctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcca 51765546  T
Q  311 aacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||||    
T  51765545 aacttgtcctactct 51765531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 265
Target Start/End: Original strand, 8870549 - 8870698
Alignment:
Q  117 tcacaccaat-acaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||| |||||||| || |  || |||||| ||    
T  8870549 tcacaccaatgaaaaacaaatatgtgtggaacaaaggaaagtagtaactagtatcaaagtaatcacaagcaaaaacaataaaaaaaaaacctagatcaaa 8870648  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagaga 265  Q
    ||||| || |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8870649 tctaggaatcaaagtgaaaaatacaaaaccacaagcaaaagataaagaga 8870698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5460215 - 5460083
Alignment:
Q  148 aaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccac 247  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |  || ||||||||| || ||||  || |||||| ||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||    
T  5460215 aaagggaaatagtaaccaatatcaaaataatctcaaacaacaacaacaagaacaa-acctagatcgaatctaggaacaaaa-tgtaaagcacaaaaccac 5460118  T
Q  248 aagcaacagataaagagagaagagaaacaaacaca 282  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5460117 aagcaaaagataaagagagaatagaaacaaacaca 5460083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9036604 - 9036550
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9036604 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 9036550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 20622217 - 20622271
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20622217 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 20622271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36683951 - 36683885
Alignment:
Q  121 accaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaa 187  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  36683951 accaataaaaacaaacatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaaaaacaagcaa 36683885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40282565 - 40282511
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40282565 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 40282511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 323
Target Start/End: Original strand, 44646655 - 44646836
Alignment:
Q  136 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaa 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | || |  |||||||| ||| || ||||  || || ||||||  ||| ||  ||||||||||    
T  44646655 gatgtgtgtagcaaaggaaagtagtaaccaatattaatgaaacctcaagcaacaccaaaaataacaa-acctaaatctaacatagaaat-aaagtgaaaa 44646752  T
Q  236 gctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||| | | || ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  44646753 gcacaaaatcacaagcaaaagataaaga---aagagaaacaaacgcaccaaaaaatatttacctagttcggtccaaa-ttgacctact 44646836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3460915 - 3460872
Alignment:
Q  239 caaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacaca 282  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3460915 caaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaacaca 3460872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Original strand, 16914118 - 16914193
Alignment:
Q  233 aaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtc 308  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||| |||||||    
T  16914118 aaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagagagaagagacacaaacacacatagaattgtttacccagttcggtc 16914193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 323
Target Start/End: Original strand, 44650101 - 44650194
Alignment:
Q  226 aaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||| | | || ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  44650101 aaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaga---aagagaaacaaacgcaccaaaaaatatttacctagttcggtccaaa-ttgacctact 44650194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9987373 - 9987335
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9987373 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 9987335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21054146 - 21054092
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21054146 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 21054092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44203804 - 44203766
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44203804 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 44203766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36683892 - 36683852
Alignment:
Q  246 acaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36683892 acaagcaaaagataaagagagaagacaaacaaacacaccaa 36683852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 165
Target Start/End: Original strand, 20622072 - 20622103
Alignment:
Q  134 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622072 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 20622103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40282727 - 40282680
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40282727 cacaccaatgcaaactatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 40282680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 311
Target Start/End: Original strand, 19072915 - 19072953
Alignment:
Q  273 aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19072915 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 19072953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 311
Target Start/End: Original strand, 19120805 - 19120843
Alignment:
Q  273 aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19120805 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 19120843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19753035 - 19752985
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtg 141  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  19753035 aattgttgtgaattcagactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtg 19752985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Original strand, 1485742 - 1485791
Alignment:
Q  255 agataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||    
T  1485742 agataaagagagaagagaaacaaacaaaccaatatttgtttacccaattc 1485791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 287
Target Start/End: Original strand, 14569088 - 14569120
Alignment:
Q  255 agataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14569088 agataaagagagtagagaaacaaacacaccaaa 14569120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 46147192 - 46147421
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  46147192 aattgttgtgaattccgcctcaaaactcacaccaatgcaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa 46147291  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
    |||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46147292 caataataacaatacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagat 46147391  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  46147392 tgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 46147421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 26175436 - 26175666
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  26175436 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaatagcaa 26175535  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaaga 289  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26175536 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 26175635  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 26175666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Original strand, 52467162 - 52467384
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaa-caacaataac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||||     
T  52467162 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaaagacaagcaatcatcaataat 52467261  T
Q  198 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcac 297  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52467262 aacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgac 52467361  T
Q  298 ccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  52467362 ccagttcggtcc-aacttgaccta 52467384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 12743725 - 12743955
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12743725 aattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgttgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 12743824  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaa 286  Q
     ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  12743825 taataacaacacc---tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaaaggagaaaagagaggaacaaacacaccaa 12743921  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12743922 agattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 12743955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 321
Target Start/End: Original strand, 12739345 - 12739580
Alignment:
Q  86 atgaaaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagc 185  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12739345 atgaatattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaagaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagc 12739444  T
Q  186 aacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacac 281  Q
    || || ||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  12739445 aataataataacaacacc---tagatctaatcaagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacac 12739541  T
Q  282 accaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12739542 accaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 12739580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 93 - 311
Target Start/End: Original strand, 45686986 - 45687203
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaac 191  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  45686986 ttgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaac 45687084  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45687085 aataataacaacacctagatc-aatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaaaagaaacaaacacaccaaagatt 45687183  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  45687184 gttgacccagttcggtccaa 45687203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 48893443 - 48893668
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  48893443 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 48893541  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
     || |||| ||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48893542 caataacagcacctagatctaatccaagaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 48893641  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  48893642 tgacccagttcggtcc-aacttgaccta 48893668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Original strand, 47038221 - 47038445
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || |    
T  47038221 tgaatttggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataacaacaata 47038319  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc 298  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47038320 acaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacc 47038419  T
Q  299 caattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||    
T  47038420 cagttcggtcc-aacttgacttactct 47038445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5872186 - 5871958
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  5872186 aattgttgtgaatccggactcaaaa-tcacaccaatacaaac--tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaa 5872090  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaa--gagaaacaaacacaccaaag 288  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5872089 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccaaaagcaaaagatagagagagaagagagaatcaaacacaccaaag 5871990  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  5871989 attgttgacccagttcggt-caaacttgaccta 5871958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Original strand, 56178441 - 56178671
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||  || ||     
T  56178441 tgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataataaacaat 56178539  T
Q  198 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  56178540 aacaacacctagatctaatctaggaatgaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgt 56178639  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56178640 tcacccagttcggtccaaacttgacctactct 56178671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 36463196 - 36463419
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36463196 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 36463294  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36463295 taataacaacacctagatctaatttggtaatcaaagcgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaa--acaccaaagattgt 36463392  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  36463393 tgacccagttcggtcc-aacttgaccta 36463419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Original strand, 5369880 - 5370117
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa- 190  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||     
T  5369880 ttgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataat 5369978  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaa 286  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||    
T  5369979 caacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacatcaa 5370078  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5370079 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactct 5370117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Original strand, 52082462 - 52082698
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |    
T  52082462 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggaacaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 52082560  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaa 287  Q
    || || |||| ||| ||||||| |||||| || ||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52082561 aacaataacagcacctagatcttatctaggaatcaaaaagaaaagcataaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaa 52082660  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52082661 gattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactct 52082698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48143405 - 48143177
Alignment:
Q  105 cggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacacc 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| |    
T  48143405 cggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaac 48143307  T
Q  204 acttagatctaatctagtaaccaaagtg----aaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttc 295  Q
    || |||||||||||||| || |||||||    |||||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48143306 acctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttc 48143207  T
Q  296 acccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  48143206 acccagtttggtccaaacttgacctactct 48143177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 9927257 - 9927488
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |    
T  9927257 ttgttgtgaattcggactcaaaactcgcaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagttaccaatatcaaagtaaacacaagcaataatc 9927356  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa-gagaga--agagaaacaaacacaccaaag 288  Q
    || || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  9927357 aacaataacagcacctagatttaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaatagaggaacaaacacaccaaag 9927456  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  9927457 attgttgactcagttcggtcc-aacttgaccta 9927488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31474512 - 31474285
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  31474512 tgttgtgaattcggactcaa---tcacaccaatacaaacaatgatgtgtgtagcaaatgaaagtagtaatcaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 31474416  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagat-tg 292  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31474415 caataacaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaatcaaaagctaaagataaagggagaagagaaacaaacacacc-aagatatg 31474317  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  31474316 tttacccagttcggtcc-aacttgatctactct 31474285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36994824 - 36994671
Alignment:
Q  157 tagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacag 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  36994824 tagtaatcaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaag 36994725  T
Q  257 ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  36994724 ataaagagagaagagaaacaaacacgccaaa-attgttgacccagttcggtccaa 36994671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 325
Target Start/End: Original strand, 52095159 - 52095396
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| || ||    
T  52095159 aattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgacgtgtggaacaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagtaataa 52095257  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacacca 285  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  52095258 tcaacaataacaacacctagatctaatctaggagtcaaagagaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacacca 52095357  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52095358 aaaattgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactct 52095396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29254838 - 29254632
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| || |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  29254838 tcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaag-aaagtagtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacgacaataataacaacacctagatctaat 29254740  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaa 312  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  29254739 ctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaatagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aa 29254641  T
Q  313 cttgaccta 321  Q
    |||||||||    
T  29254640 cttgaccta 29254632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 311
Target Start/End: Original strand, 34570209 - 34570435
Alignment:
Q  89 aaaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaac 188  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || |||     
T  34570209 aaaattgttgcgaattcggattcaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaaacaat 34570307  T
Q  189 aa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacac 283  Q
    || ||| || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  34570308 aatcaacaataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacac 34570407  T
Q  284 caaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  34570408 caaagattgttgacccagttcgatccaa 34570435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37740987 - 37740772
Alignment:
Q  101 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||| || ||| || ||    
T  37740987 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcacaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacagaatcaataatcaacaataa 37740888  T
Q  200 caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttc 295  Q
    || ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||     
T  37740887 cagcacctagatctaatgtaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacaaaaaattgttg 37740788  T
Q  296 acccaattcggtccaa 311  Q
    || || ||||||||||    
T  37740787 acacagttcggtccaa 37740772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 322
Target Start/End: Original strand, 6541987 - 6542210
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  6541987 tgttgtgaattcggacataaaactcacatcaata-atactttgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtaatcacaagcaacaacaa 6542085  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    |||||| |||   |||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||    
T  6542086 taacaaaacc---tagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacacaaaatcacaagaaaaagataaagagataagagaaacaaacacaccaagaaatgt 6542182  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctac 322  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6542183 ttacccagttcggtcc-aacttgacctac 6542210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 305
Target Start/End: Original strand, 54199703 - 54199922
Alignment:
Q  89 aaaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaac 188  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||     
T  54199703 aaaactgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaacgatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccagtatcaaagtgaacacaagcaat 54199801  T
Q  189 aa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa-gagagaagaga--aacaaacacacc 284  Q
    || ||  || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  54199802 aatcagcaataacatcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaatataaaggagagaagagaggaacaaacacacc 54199901  T
Q  285 aaagattgttcacccaattcg 305  Q
    ||| |||||| ||||| ||||    
T  54199902 aaaaattgttgacccagttcg 54199922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4588323 - 4588132
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaa-ctcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaaca 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || || || |||||    
T  4588323 aattgttgtgaattcggactcaaaaactcacaccaata-atactttgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccactatcaaagcaatcacaaacaaca 4588225  T
Q  190 acaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacacca 285  Q
    |||||||||| |||| |   ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4588224 acaataacaaaaccaat---atctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaggagaaacaaacacacca 4588132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 13992113 - 13992327
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  13992113 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 13992212  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc-aacagataaa---gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcc 309  Q
    |||||  | ||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13992213 tctaggtatcaaagtgaaaagcac-aaatcacaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagttcggtcc 13992311  T
Q  310 aaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||    
T  13992312 aaacttgacctactct 13992327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Original strand, 5207664 - 5207876
Alignment:
Q  107 gactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccact 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |  |||||||||||||| |||    ||     
T  5207664 gactcaaaa-tcacaccaatataaata-tggtgtgtggagcaaaggaaagtagtaattgatatcaaagtaacctcaagcaacaacaatatcaa----acc 5207757  T
Q  207 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaa--acacaccaaagattgttcacccaattc 304  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||| |||||||||    
T  5207758 tagatctaatttaggaatcaa-gtgaaaagcacaaaaccacatgcaacagataaatagagaagagaaacaaatacacaccaataaatgtttacccaattc 5207856  T
Q  305 ggtccaaacttgacctactct 325  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  5207857 agtccaaa-ttgacctactct 5207876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 323
Target Start/End: Original strand, 37229534 - 37229753
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| || |    
T  37229534 tgaattcggactcaaaa-taaaaccaata-aaactatgttgtgtggagcaatgggaagtagtaaccaatatcaaagtaacaacaagcaataacaacaata 37229631  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc 298  Q
    || | || |||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||    
T  37229632 ac-caacctagatctaatttaggaat-aaagtgaaaagcacaaaaccataagtaaaagataaagagagaagagaaacaaacacgccaagaaatgtttacc 37229729  T
Q  299 caattcggtccaaacttgacctact 323  Q
     | |||||||| |||||||||||||    
T  37229730 tagttcggtcc-aacttgacctact 37229753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24970033 - 24969799
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||    
T  24970033 aattgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacactgatgaaaacaaagatgtgtg-agcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaataatcacaaccaacaa 24969936  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag---ctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    ||| ||      ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24969935 caagaaagtagacacctagatctaatctactaatctaagtgaaaaaaaactcaaaaccataagcaaacgataaagtgagaagagaaacaaacacaccaag 24969836  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
     | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24969835 aaatgtttacccagttcggtcc-aacttgacctactct 24969799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5429989 - 5429826
Alignment:
Q  153 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 251  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| || ||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  5429989 aaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagt 5429890  T
Q  252 aacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    || |||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5429889 aaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaa 5429826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Original strand, 29999627 - 29999709
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagt 175  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29999627 ttgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagt 29999709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29056609 - 29056531
Alignment:
Q  207 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29056609 tagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaagagaaaagagaaacaaacacaccaa 29056531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 325
Target Start/End: Original strand, 29999723 - 29999840
Alignment:
Q  207 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaat 302  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||| |    
T  29999723 tagatctaatctaggaatcaaagagaaaaacacaaa-ccacaagcaaaagacaaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaa----tgttcacccagt 29999817  T
Q  303 tcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29999818 tcggtccaaacttgacctactct 29999840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5350271 - 5350042
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataa-gcaaca 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||   | |||||| || |||||||||||||||||||| | |||   ||||| | | ||||    
T  5350271 aattgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaata--aacttaggtgtgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaatataaaat--aacatcacgtaaca 5350176  T
Q  190 acaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaaga 289  Q
    |||| || ||||  || ||||||| ||  || || ||| ||||||| | ||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  5350175 acaacaataacaa-acctagatctcatacaggaatcaa-gtgaaaaacacaagactacaaacaaaagataacgagagaagagaaacaaacacaccaataa 5350078  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
     |||| ||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  5350077 atgtttacccaattcagtccaacaatgacctactct 5350042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 31495296 - 31495350
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31495296 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 31495350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 287
Target Start/End: Original strand, 48142327 - 48142373
Alignment:
Q  241 aaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48142327 aaaccacaatcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 48142373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51337294 - 51337202
Alignment:
Q  228 agtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  51337294 agtgaagagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaagagaagataaacaaacacaccacgaaatgtttacccagttcggtcc-aacttgaccta 51337202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 149
Target Start/End: Original strand, 50262486 - 50262542
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50262486 ttgttgtgaattcagactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 50262542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36994898 - 36994851
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtg 141  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36994898 tgttgtgaattctgactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtg 36994851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 39593649 - 39593728
Alignment:
Q  207 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  39593649 tagatctaatctagaaaccaaatgtaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataagaagagaggagacacaaacacaccaa 39593728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8393566 - 8393528
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8393566 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 8393528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8395775 - 8395737
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8395775 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 8395737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51338392 - 51338334
Alignment:
Q  141 gtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaa 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  51338392 gtggagcaaatgaaagtagtaatcaatatcaaagtagtcacaagcaacaacaataacaa 51338334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 12745292 - 12745344
Alignment:
Q  268 agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12745292 agaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 12745344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 308
Target Start/End: Original strand, 21703784 - 21703853
Alignment:
Q  239 caaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtc 308  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| ||||| |||||||    
T  21703784 caaaatcacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacatcaagaaatgtttacccagttcggtc 21703853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2210084 - 2210040
Alignment:
Q  105 cggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2210084 cggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 2210040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 165
Target Start/End: Original strand, 31495130 - 31495174
Alignment:
Q  121 accaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495130 accaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 31495174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 41639801 - 41639746
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41639801 tgttgtgaattcagactcaaatttcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaa 41639746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3913642 - 3913600
Alignment:
Q  263 agagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcg 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3913642 agagaagagaaacgaacacaccaaagattgttgacccagttcg 3913600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5136237 - 5136199
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5136237 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 5136199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5138462 - 5138424
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5138462 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 5138424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 283
Target Start/End: Original strand, 37754902 - 37754952
Alignment:
Q  233 aaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacac 283  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37754902 aaagcccaaaaccacaaacataagataaagagagaagaaaaacaaacacac 37754952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 29196188 - 29196416
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaac 191  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  29196188 ttgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaac 29196287  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29196288 aataataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 29196387  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29196388 gttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 29196416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 321
Target Start/End: Original strand, 23391704 - 23391939
Alignment:
Q  86 atgaaaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagc 185  Q
    |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||     
T  23391704 atgataattgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagaaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaaga 23391803  T
Q  186 aacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg-aaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacacc 284  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23391804 aacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacacc 23391903  T
Q  285 aaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23391904 aaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 23391939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 44700283 - 44700509
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44700283 ttgttttgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgcatggagcaaagaaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaaca 44700381  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44700382 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaacacacgaaagattg 44700481  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    || ||| | |||||||| |||||||||||    
T  44700482 ttgacctagttcggtcc-aacttgaccta 44700509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 9666270 - 9666487
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 192  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||| |||    
T  9666270 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatctgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaataacaagcaactaca 9666368  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9666369 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaacacaccaaagattg 9666468  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaa 311  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  9666469 ttgacccagttcggtccaa 9666487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 321
Target Start/End: Original strand, 39153170 - 39153391
Alignment:
Q  100 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| ||    
T  39153170 gaattcgggctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcggcagcaataataa 39153269  T
Q  200 caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacc 298  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  39153270 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacc 39153369  T
Q  299 caattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    || ||| |||| |||||||||||    
T  39153370 cagttcagtcc-aacttgaccta 39153391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31314810 - 31314583
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||    
T  31314810 attgttgtgaataccgactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtaataactaatattaaagtaaacacaagcaacaac 31314712  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    ||||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31314711 aataataacaacacctaaatataatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 31314612  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||    
T  31314611 gttgactcagttcggtcc-aacttgaccta 31314583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 761212 - 760985
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| ||||    
T  761212 ttgttgtgaattcggactcaaa--tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataaca 761115  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaa--gagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
    | || | || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  761114 acaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 761015  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  761014 tgttaacccatttcagtcc-aacttgaccta 760985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29811240 - 29811019
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||    
T  29811240 aattgttgtgaattcgaactcaaaactcacaccaatacaaaatatgatttgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagagaacacaagcaataa 29811141  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacacca 285  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  29811140 tcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagatgaacaaacacacca 29811041  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  29811040 aagattgttgacccaattcggt 29811019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 23410128 - 23410359
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  23410128 aattgttgtgaattcggacacaaaactcacatcaatacaaactatgatgtgtggatcaaaggaaagtagtaacatatatcaaagtgaacacaagcaacaa 23410227  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagt--gaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaag 288  Q
     ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23410228 aaatattaacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaatataaacaaacacaccaaag 23410327  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  23410328 attgttgacccaattcgttcc-aacttgaccta 23410359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 113 - 323
Target Start/End: Original strand, 19683706 - 19683921
Alignment:
Q  113 aaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagat 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||    
T  19683706 aaactcacaccaatacaaactatgatgtttggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagat 19683805  T
Q  212 ctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggt 307  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19683806 ctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggt 19683905  T
Q  308 ccaaacttgacctact 323  Q
    ||||||||||||||||    
T  19683906 ccaaacttgacctact 19683921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 303
Target Start/End: Original strand, 21350811 - 21351017
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  21350811 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatg-aaataaagatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 21350909  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattg 292  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21350910 taacaacac---ttagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcataaccacaagcataagataaagtgagaagagaaacaaacacaccaagaaattg 21351006  T
Q  293 ttcacccaatt 303  Q
    || ||||||||    
T  21351007 ttgacccaatt 21351017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 22834804 - 22835032
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | || ||    
T  22834804 aattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaggtaataa 22834902  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaa-caaacacaccaaaga 289  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |    
T  22834903 caacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggaagaagagaaagaaaacacaccaaata 22835002  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  22835003 ttgttga-ccagttcggtcc-aacttgaccta 22835032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7762622 - 7762399
Alignment:
Q  106 ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacacca 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || || ||| || |||| ||    
T  7762622 ggactcaaaact-acaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacaaca 7762524  T
Q  205 cttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcaccca 300  Q
    | |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7762523 cctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcatagattgttcaccca 7762424  T
Q  301 attcggtccaaacttgacctactct 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  7762423 gttcggtccaaacttgacctactct 7762399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29813431 - 29813210
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||| || |    
T  29813431 ttgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaactaatatcaaagtgaacacaaacaataatc 29813332  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaaga 289  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  29813331 aacaataacagcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaagggagaagagaggaacaaacacatcaaaga 29813232  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  29813231 ttgttgacccagttcggtccaa 29813210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7764822 - 7764598
Alignment:
Q  105 cggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacacc 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| |    
T  7764822 cggactcaaaact-acaccaatacaaactatgatgtgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagc 7764724  T
Q  204 acttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcaccc 299  Q
    || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7764723 acctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccc 7764624  T
Q  300 aattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  7764623 agttcggtctaaatttgacctactct 7764598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9581640 - 9581416
Alignment:
Q  105 cggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacacc 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| |    
T  9581640 cggactcaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagc 9581542  T
Q  204 acttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattgttcaccc 299  Q
    || |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9581541 acctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaacaaacacatcaaagattgttcaccc 9581442  T
Q  300 aattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  9581441 agttcggtccaaacttgacctactct 9581416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40734868 - 40734636
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||    
T  40734868 aattgttgtgaattcggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaataa 40734770  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa-gagagaagaga--aacaaacacaccaa 286  Q
      || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  40734769 taaaaaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgcaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaagagaggaacaaacactccaa 40734670  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40734669 agattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 40734636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32891461 - 32891276
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  32891461 aattgttgtgacttcggactcaaaactcacaccaatg-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaaacacaagcaacaa 32891363  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||         ||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32891362 caa---------cacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagaaacaaacacaccaa 32891276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37408827 - 37408592
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || || ||| || ||    
T  37408827 tgttgtgaattcggcctcaaag-tcacatcaatacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaaacaataatca 37408729  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37408728 acaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcactaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaag 37408629  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37408628 attgttcacccagttcgatccaaacttgacctactct 37408592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40735751 - 40735521
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || |    
T  40735751 ttgttgtgaattcggtatcaaaa-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatc 40735653  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa-gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    || || |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  40735652 aacaataacagcacctagatctaatataggaaccaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaagagaggaacaaatacaccaaag 40735553  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40735552 attgctgacccagttcggtcc-aacttgaccta 40735521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 5257966 - 5258178
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  5257966 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 5258065  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5258066 tctaggaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccaagttcggtccaa 5258164  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  5258165 acttgacctactct 5258178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16499371 - 16499163
Alignment:
Q  105 cggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacacca 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||      ||||||||||     
T  16499371 cggactcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa------taacaacacc- 16499280  T
Q  205 cttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattc 304  Q
      || ||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  16499279 --taaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaatacaccaaagattgttgacccagttc 16499183  T
Q  305 ggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  16499182 ggtcc-aacttaacctactct 16499163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29682707 - 29682506
Alignment:
Q  112 aaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagat 211  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| || | |||||| ||||| || | || ||| |||||    
T  29682707 aaaaatcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaaaattaaagtgaatacaagcaataacaacaatagcagcacctagat 29682608  T
Q  212 ctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcc 309  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29682607 ctaacctaggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagagaaacatacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 29682508  T
Q  310 aa 311  Q
    ||    
T  29682507 aa 29682506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51399184 - 51398952
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa- 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||  ||||| ||     
T  51399184 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcataccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagaaaacaatatcaaagtgagcactagcaataat 51399086  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaa 286  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  51399085 caacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaa 51398986  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  51398985 agattgttgaccaagttcggtcc-aacttgaccta 51398952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 5236256 - 5236487
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||| || |    
T  5236256 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtacaggaaagtagtaatcgatatcaaagtgaacacaagcaataatc 5236354  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaa 287  Q
    || || || | | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5236355 aacaataagagctcctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 5236454  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  5236455 gattgttgacccagtttggtccaaa-ttgaccta 5236487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 323
Target Start/End: Original strand, 9635920 - 9636158
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaaca 189  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |    
T  9635920 aattgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaata 9636018  T
Q  190 a-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa---gagag--aagagaaacaaacacac 283  Q
    | ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||   ||| ||||||||  |||||||   |||||   ||||||||||||||||    
T  9636019 atcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagc-ataaatcacaagcacaagataaaagggagagcagagagaaacaaacacac 9636117  T
Q  284 caa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9636118 caagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctact 9636158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45095509 - 45095297
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  45095509 tcacatcaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacatagatctaa 45095410  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaa--gagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||  || ||||| | ||| | |||| |||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45095409 tctatgaatcaaagagtaaaacacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaacaaatacgccaaagattgttcacccagttcggtccaa 45095311  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  45095310 acttgacctactct 45095297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 283
Target Start/End: Original strand, 27305519 - 27305703
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  27305519 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaata--aactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaacaacaagcaacaacaa 27305615  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacac 283  Q
     || ||| | || ||||||||||||||  |  |||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27305616 caataac-caacctagatctaatctag-gagtaaagtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaatagagaagagaaacaaacacac 27305703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 323
Target Start/End: Original strand, 5260149 - 5260355
Alignment:
Q  121 accaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatcta 219  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||| ||    
T  5260149 accaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaattta 5260248  T
Q  220 gtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaactt 315  Q
    | || ||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5260249 ggaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccaagttcggtccaaactt 5260347  T
Q  316 gacctact 323  Q
    ||||||||    
T  5260348 gacctact 5260355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Original strand, 2074883 - 2075109
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||    
T  2074883 tgttgtgaattcggacccaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaataaccacaagcaacaataa 2074980  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
     || || |  ||  |||| |||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  2074981 caataata-aacccagatttaatctaggaaac-aagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaataaacacacccagaaatgt 2075078  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  2075079 ttacccagttcgatcc-aacttgacctactct 2075109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 282
Target Start/End: Original strand, 51351940 - 51352125
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || ||    
T  51351940 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaata-atactacgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaatcacaagcagcagca 51352037  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacaca 282  Q
    | || ||||  || |||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51352038 acaataacaa-acctagatctaatctaggaatcaaa-tgaaaaacacaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaacaca 51352125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 321
Target Start/End: Original strand, 32744288 - 32744466
Alignment:
Q  126 tacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaacc 225  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||         |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| || |    
T  32744288 tacaaactatgatgtatggagcaatagaaagtagtaaccaatttcaaa---------agcaacaacaatgataacaacacctagatctaatctagaaatc 32744378  T
Q  226 aaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||||||       ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  32744379 aaagtgaaaa-------accacaagcaaaagataaagagatatgagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 32744466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 9634644 - 9634764
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  9634644 tcacaccaatacaaactatgat-tgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 9634742  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagc 237  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  9634743 tctaggaatcaaagtgaaaagc 9634764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Original strand, 23197767 - 23197973
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatc 217  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||  |  | ||||||||| |    ||| |||||||||||    
T  23197767 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataataaagcaagcaata--atcaacaataaaa----cacatagatctaatc 23197860  T
Q  218 tagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||| || |||| |||||| | |||| |||||||||  |||||||    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23197861 taggaaacaaaatgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 23197959  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  23197960 acttgacctactct 23197973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Original strand, 23199960 - 23200172
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || || || || ||||||||||    
T  23199960 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataaaac-acctagatctaat 23200058  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcca 310  Q
    |||| || |||| |||||| | |||| |||||||||  |||||||    ||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23200059 ctaggaaacaaaatgaaaaacacaaa-ccacaagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcca 23200157  T
Q  311 aacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||    
T  23200158 aacttgacctactct 23200172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 324
Target Start/End: Original strand, 53921422 - 53921536
Alignment:
Q  209 gatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtc 308  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| | ||| ||||||     
T  53921422 gatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaatataaagagagaagagaaacaaacacactaagaaatgtttatccagttcggt- 53921520  T
Q  309 caaacttgacctactc 324  Q
    ||||||||| ||||||    
T  53921521 caaacttgatctactc 53921536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37407060 - 37406985
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaat 167  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37407060 aattgttgtgaattcggcctcaaag-tcacaccactacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaat 37406985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 140
Target Start/End: Original strand, 4160055 - 4160105
Alignment:
Q  90 aaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4160055 aaattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgt 4160105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34491397 - 34491346
Alignment:
Q  273 aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34491397 aacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc-aacttgacctactct 34491346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 801280 - 801226
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  801280 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 801226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 801436 - 801388
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801436 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 801388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40913646 - 40913591
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40913646 tgttgtgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaacaataatgtgcggagcaa 40913591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3617622 - 3617584
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3617622 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 3617584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6716671 - 6716633
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6716671 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 6716633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 7779984 - 7780038
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7779984 aaacaaagacaccaagagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactct 7780038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 54635296 - 54635258
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54635296 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 54635258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Original strand, 6095390 - 6095446
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcgg-actcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6095390 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 6095446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33192081 - 33192002
Alignment:
Q  207 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  33192081 tagatctaatgtaggaaccag-gtgtaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaatcgagaaaagaaacaaacacaccaaa 33192002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 43403527 - 43403586
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43403527 aattgttgtgaattccggactaaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 43403586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 47304629 - 47304575
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  47304629 tgttctgaattcggacttaaaa-tcacaacaatacaaactatgatgtgtggagcaa 47304575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 4598519 - 4598557
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4598519 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 4598557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 4600740 - 4600778
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4600740 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 4600778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10056391 - 10056353
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10056391 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 10056353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10058613 - 10058575
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10058613 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 10058575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10060835 - 10060797
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10060835 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 10060797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10063057 - 10063019
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10063057 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 10063019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10065279 - 10065241
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10065279 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 10065241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10067478 - 10067440
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10067478 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 10067440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10211567 - 10211529
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10211567 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 10211529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25637599 - 25637561
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25637599 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 25637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 34491555 - 34491505
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  34491555 tgaattcggactcaaattttacaccaatacaaactataatgtgtggagcaa 34491505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44330988 - 44330950
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaataca 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44330988 aattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccagtaca 44330950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45283158 - 45283120
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45283158 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactct 45283120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2020480 - 2020335
Alignment:
Q  136 gatgtgtggagcaaag--gaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaa 233  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||  |   ||||||||||||||| |  |    ||||| |||||||| ||||||    ||    
T  2020480 gatgtgtggagcaaaaatgaaagtagtaaccgatatcaaagtagcctcgagcaacaacaataaccaatc----tagatttaatctaggaaccaagtataa 2020385  T
Q  234 aagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacac 283  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2020384 aagcgcaaaatcacaagcagaagataaagagagaattgaaacaaacacac 2020335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 54635476 - 54635427
Alignment:
Q  117 tcacaccaatac-aaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  54635476 tcacaccaatactaaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 54635427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 41317238 - 41317464
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  41317238 tgttgtgaattcgaactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtttggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 41317337  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41317338 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaggagaaacaaacacaccaaagattgt 41317437  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41317438 tgacccagttcggtcc-aacttgaccta 41317464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 14069631 - 14069863
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  14069631 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaat 14069730  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaa 287  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||   ||||||||||||||    
T  14069731 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaa 14069830  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14069831 gattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 14069863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 14379659 - 14379891
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  14379659 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaat 14379758  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaa 287  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||   ||||||||||||||    
T  14379759 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaa 14379858  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14379859 gattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 14379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19502547 - 19502312
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19502547 tgttgtgaattcagactcaaaactcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaatacaagcaacaacaa 19502448  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaaga 289  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||    
T  19502447 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaaga 19502348  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  19502347 ttgttcacccacttcgttccaaacttgacttactct 19502312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 47675936 - 47676166
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  47675936 tgttgtgaattcggacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 47676035  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaaga 289  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47676036 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 47676135  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  47676136 ttgttgatccagttcggtcc-aacttgaccta 47676166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 36146211 - 36146438
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaac 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  36146211 ttgttgtgaattcggactcaaaatt-acacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaac 36146309  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36146310 aataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 36146409  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  36146410 gttgacctagttcggtcc-aacttgaccta 36146438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 41648813 - 41649041
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  41648813 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagtgaacacaagcaataaca 41648911  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
    | || | || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41648912 acaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 41649011  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41649012 tgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 41649041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23555411 - 23555174
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |    
T  23555411 ttgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 23555312  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  23555311 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcaaa 23555212  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23555211 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 23555174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8153699 - 8153480
Alignment:
Q  100 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaa 199  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||| ||    
T  8153699 gaattcggactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgcgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaacaacaataataa 8153601  T
Q  200 caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccc 299  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8153600 caacacctagatctgatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaataaacacaccaaagattgttgaccc 8153501  T
Q  300 aattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | ||| |||| |||||||||||    
T  8153500 agttcagtcc-aacttgaccta 8153480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 38671025 - 38671252
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||    
T  38671025 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaacaaaaatcaaagtgaacacaagcaacgacaa 38671123  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    |||  ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38671124 taatgacaacacctagatcaaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagatt 38671223  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  38671224 gttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 38671252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 93 - 311
Target Start/End: Original strand, 47673743 - 47673965
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  47673743 ttgttatgaattcggacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaaca 47673842  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47673843 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 47673942  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||| |  || ||||||||||    
T  47673943 attgttgattcagttcggtccaa 47673965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1114021 - 1113795
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  1114021 tgttgtgaattccgaatcaaaactcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaactaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 1113922  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
     || || | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1113921 caataataacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 1113822  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||    
T  1113821 tgactcaattcggt-caaacttgaccta 1113795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 31732768 - 31732999
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||    
T  31732768 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccagtacaaactatgatgtgtggagcaaatgaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataatca 31732867  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    | || |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  31732868 acaataacaacctttagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaactcaccaaag 31732967  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  31732968 attgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 31732999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Original strand, 31105200 - 31105427
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31105200 tgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaata-aaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 31105298  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc-aacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||    
T  31105299 taacaacacca---agatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaagataaggagagaagagaaacaaacagaccaagaaatg 31105395  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  31105396 tttacccagttcggtcc-aacttgatctactct 31105427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25616223 - 25615987
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  25616223 tgttgtgaatacgtactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 25616125  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga-----agagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  25616124 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaacaaacacaccaaa 25616025  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25616024 gattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactct 25615987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18127017 - 18126782
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa- 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||     
T  18127017 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataat 18126918  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga------agagaaacaaacacacc 284  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||      |||| ||||||||||||    
T  18126917 caagaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaatagaggaacaaacacacc 18126818  T
Q  285 aaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||    
T  18126817 aaagattgttgacccaggtcggt-caaacttgaccta 18126782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48489794 - 48489569
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||| ||     
T  48489794 tgaattcggactcaaaa-tcacaccaataccaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacatgagcaataatcaacaat 48489696  T
Q  198 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48489695 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggcgagaagagaggaacaaacacaccaaagattgt 48489596  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  48489595 ttacccagttcggtcc-aacttgaccta 48489569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 117 - 321
Target Start/End: Original strand, 24525328 - 24525532
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaacaataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  24525328 tcacatcaatacaaactatgatatgtgtagcaaagaaaagtagtaatcaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacacctagatcaaa 24525427  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaactt 315  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||    
T  24525428 tttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagttccgtcc-aactt 24525526  T
Q  316 gaccta 321  Q
    ||||||    
T  24525527 gaccta 24525532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4586532 - 4586308
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa- 190  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||     
T  4586532 attgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatgtaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataat 4586433  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaa 286  Q
     || || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  4586432 aaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacgaa 4586333  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||    
T  4586332 agattgtcgacccagttcggtccaa 4586308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43864608 - 43864382
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| || ||| ||     
T  43864608 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtggtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaat 43864509  T
Q  198 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||   |||||    
T  43864508 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccatctattgt 43864409  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  43864408 tgacccagttcggtcc-aacttgaccta 43864382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27348186 - 27347955
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||| || |    
T  27348186 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacacaaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatc 27348088  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaa 287  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  27348087 aacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagtgagagaagagaggaacaaacacaccaaa 27347988  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27347987 gattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 27347955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 323
Target Start/End: Original strand, 495795 - 496015
Alignment:
Q  101 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaac 200  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || |||    
T  495795 aatttggactcaaaa-tcacactaatacaaattatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataacaacaataac 495893  T
Q  201 accacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccca 300  Q
    | ||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  495894 aacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaatagaaaatcacaagcaagagataaagagagaaaagaaacaaacacaccaaagattgttgacccg 495993  T
Q  301 attcggtccaaacttgacctact 323  Q
     ||| |||| |||||||||||||    
T  495994 gttctgtcc-aacttgacctact 496015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26417685 - 26417462
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || ||    
T  26417685 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatatgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaataatca 26417586  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaa-a 287  Q
    | || |||| ||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |    
T  26417585 acaataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaga 26417486  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
     |||||| ||||| || |||||||    
T  26417485 aattgttgacccagtttggtccaa 26417462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29991399 - 29991187
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||| || || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  29991399 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaa 29991300  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    | ||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29991299 tataggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 29991201  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  29991200 acttgacctactct 29991187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35854262 - 35854048
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  35854262 tcacacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaa 35854163  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa---gagaga--agagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtcc 309  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35854162 tctaggaagcaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtcc 35854064  T
Q  310 aaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||    
T  35854063 aaacttgacctactct 35854048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4179119 - 4178907
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  4179119 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgtaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 4179020  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||| | | ||||||||||||| | |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||    
T  4179019 tctaggaatcaaagtgaaaaacac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagtttggttcaa 4178921  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||| ||||    
T  4178920 acttgacctgctct 4178907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23344332 - 23344107
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||    
T  23344332 tgttgtgaattcagacccaaaa-tcacatcaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatccaagtaaccacaagcaacaacaa 23344235  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    |||||| |||   ||||| |||||||  || ||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  23344234 taacaaaacc---tagatttaatctacgaatcaaagtgaaaaacacaaaaccgcaagaaagagataaagagagaagagaaacatacacaccaagaaatgt 23344138  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  23344137 ttaccttgttcggtcc-aacttgacctactct 23344107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Original strand, 30024569 - 30024714
Alignment:
Q  101 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30024569 aattcggactcaaaa-tcataccaatataaactatgatg-----aacaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataac 30024662  T
Q  201 accacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 252  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024663 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagca 30024714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 321
Target Start/End: Original strand, 12097789 - 12097897
Alignment:
Q  212 ctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  12097789 ctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtcc-a 12097887  T
Q  312 acttgaccta 321  Q
    ||||||||||    
T  12097888 acttgaccta 12097897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48491944 - 48491742
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||    
T  48491944 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacaccaataccaactataatgtgcggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 48491846  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
    | || |||| | | |||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48491845 acaataacaacgcctagatctaatataggaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagaggaacaaacacatcaaagat 48491746  T
Q  291 tgtt 294  Q
    ||||    
T  48491745 tgtt 48491742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Original strand, 23564876 - 23565058
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||  |||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23564876 tgaattcagactcaaaa-tcacactaata--aacatagatgtgtggagtgaagaaaagtagtgaccaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaataaca 23564972  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaa-ccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    | |||   |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23564973 aaacc---tagatctaatctagaaatcaaagtgaaaatcacaaaaaccacaagcaaaagataaatagagaagagaaacaaacacaccaa 23565058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31519258 - 31519037
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||||||    
T  31519258 tgttgtgaatttggactcaaaactcacgccaatgaaaataa-gatgtgtggagcaaataaaaatagtaattaatatcaatgtaatcataagcagcaacaa 31519160  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||        ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||    
T  31519159 taataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaag--------cacaagcaaaagataaagaaagaagagaaacaaacacaccaagaaatgt 31519068  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31519067 ttatccagttcggtcc-aacttgacctactct 31519037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Original strand, 36574323 - 36574550
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| |  | || ||||||    
T  36574323 ttgttgtgaattcagactcaattctcacaccaat--aaacttagatgtgtggatcaaaggaaaatattaaccaatatcaaagtaatctcaggccacaaca 36574420  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    | || ||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||    
T  36574421 acaataaca-aacttagatctaatctaggaatc-aagtgaaaaacacaaaaccacaagaaaaagataaagagagaagaaaaacaaacacatcaagaaatg 36574518  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  36574519 tttacccagtttggtccaaa-ttgacctactct 36574550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 25766779 - 25766994
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |  |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  25766779 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaataacaaagtgagcgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 25766878  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaca-gataaa---gagagaa--gagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtc 308  Q
    |||||  | ||||||||||| | |||| | |||||||| | ||||||   |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25766879 tctaggtatcaaagtgaaaaacacaaatc-acaagcaaaaagataaaagggagagaatagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtc 25766977  T
Q  309 caaacttgacctactct 325  Q
     ||||||||||||||||    
T  25766978 taaacttgacctactct 25766994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39731642 - 39731503
Alignment:
Q  188 caacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacac 281  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||    
T  39731642 caacaataacaacacc---tagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagac 39731547  T
Q  282 accaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39731546 accaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 39731503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48409183 - 48408938
Alignment:
Q  86 atgaaaattgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataag 184  Q
    ||||||| |||| ||||||| || ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |||    
T  48409183 atgaaaactgttgtgaattctggtctcaaa--tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaag 48409086  T
Q  185 caacaa-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc-aacagataaa---gagaga--agagaaacaa 277  Q
    ||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||   ||||||  ||||||||||    
T  48409085 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcac-aaatcacaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaacaa 48408987  T
Q  278 acacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  48408986 acacaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactct 48408938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 325
Target Start/End: Original strand, 4253376 - 4253562
Alignment:
Q  136 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaa 235  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||| || |  || |||||||||| ||| || ||| | |||||    
T  4253376 gatgtgtgtagcaaaagaaagtattaaccaatatcaaagtaacctcaggcaacaacaataataaaaa-acctagatctaatatagaaatcaa-gcgaaaa 4253473  T
Q  236 gctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |  ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  4253474 gtacaaaagcacaagcaaacgataaagagtgaagagaaacaaacacaccaagaaatgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactct 4253562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40808909 - 40808759
Alignment:
Q  136 gatgtgtggagcaaa-ggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaa 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |  ||||||||||||||| ||||  || ||| | |||||||| | |||| ||| ||    
T  40808909 gatgtgtggagcaaaaggaaagtagtaacaaatatcaaagtattctcaagcaacaacaataataacag-acctaggtttaatctaggacccaa-gtgtaa 40808812  T
Q  235 agctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    | | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40808811 aacacaaaaccacaagcaaaagatatagagagaaaagaaacaaacacaccaaa 40808759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 214
Target Start/End: Original strand, 12096971 - 12097084
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  12096971 tgaattcggactcaaaa-tcacacca-tataaactatgatgcttggaataaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaacaataaca 12097068  T
Q  199 acaccacttagatcta 214  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  12097069 acaacacctagatcta 12097084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6430499 - 6430441
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6430499 aattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 6430441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 4510336 - 4510394
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4510336 aattgttgtgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 4510394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 4512178 - 4512236
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4512178 aattgttgtgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 4512236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24790036 - 24789975
Alignment:
Q  265 agaagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24790036 agaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 24789975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 325
Target Start/End: Original strand, 34310705 - 34310750
Alignment:
Q  280 acaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34310705 acaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 34310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22270321 - 22270266
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22270321 tgttatgaattcggactcaaatttcacagcaatacaaactatgatgtgtggagcaa 22270266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 323
Target Start/End: Original strand, 43504064 - 43504186
Alignment:
Q  207 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaa-agattgttcaccc 299  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43504064 tagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcaccc 43504162  T
Q  300 aattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  43504163 agttcgatccaaacttgacctact 43504186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Original strand, 2360777 - 2360827
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2360777 tgaatttggactcaaaattcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 2360827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 321
Target Start/End: Original strand, 2759128 - 2759227
Alignment:
Q  225 caaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacct 320  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  2759128 caaagttaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaagggagagaagagagaaagaaacacaccaatgattgttgaccaagttcggtcc-aacttgacct 2759226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 6592336 - 6592374
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6592336 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 6592374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 6594554 - 6594592
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6594554 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 6594592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 18388756 - 18388794
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18388756 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 18388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 18392192 - 18392230
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18392192 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 18392230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 30814771 - 30814715
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  30814771 ttgttgtgaattcggactcaaatttcacaccagtacaaaatatgatgtgtggagcaa 30814715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20344247 - 20344200
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20344247 cacaccaatgcaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 20344200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 1560646 - 1560700
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1560646 aaacaaatacaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactct 1560700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 305
Target Start/End: Original strand, 13065365 - 13065415
Alignment:
Q  255 agataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcg 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  13065365 agataaaaagagaagagaaacaaacacaccgagatttgttcacccaattcg 13065415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26639544 - 26639498
Alignment:
Q  240 aaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26639544 aaaaccacaagcaaaaggtaaagagataagagaaacaaacgcaccaa 26639498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 32060318 - 32060356
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32060318 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactct 32060356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 165
Target Start/End: Original strand, 43503974 - 43504022
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43503974 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 43504022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 538384 - 538163
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  538384 tgaattcagactcaaaactcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataata 538285  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc 298  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  538284 acaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaagaaacacaccaaagattgttgatc 538185  T
Q  299 caattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  538184 cagttcggtcc-aacttgaccta 538163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 28750455 - 28750685
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28750455 tgttgtgaatttggactcaaaactcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtaaacacaagcaacaacaa 28750554  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaaga 289  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28750555 taataacaacacctagatctaatctagtaatccaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaatataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaga 28750654  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  28750655 ttattgacccaattcggtcc-aacttgaccta 28750685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 534130 - 533907
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  534130 aattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatagaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtagacacaagcaacaa 534031  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
     ||||| |||| |||      |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  534030 taataataacaacac------ctaatctagtaatcaaagtgaaaatctcaaaaccacaagcaaaagataaaaagagaagagaagcaaagacaccaaagat 533937  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  533936 tgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 533907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 101 - 321
Target Start/End: Original strand, 42428237 - 42428460
Alignment:
Q  101 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaac 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||    
T  42428237 aattcgaactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaataataataac 42428336  T
Q  201 accacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttca 296  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |    
T  42428337 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaagaagaacaaacacactaaagattgttga 42428436  T
Q  297 cccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  42428437 cccagttcggtcc-aacttgaccta 42428460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13240114 - 13239885
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  13240114 tgaattcgaactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtaaacacaagcaacaacaacaata 13240016  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgtt 294  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13240015 acaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaaaattgtt 13239916  T
Q  295 cacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13239915 cacccagttcggtccaaatttgacctactct 13239885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 5887234 - 5887464
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  5887234 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaaca 5887332  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccac--aagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaag 288  Q
    |||| |||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5887333 ataataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaaatgaaaaacttaaaaccacaaaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaag 5887432  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  5887433 attgttgatccaattcggtcc-aacttgaccta 5887464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 42426034 - 42426265
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  42426034 ttgttgtgaattcgaactcaaaactcacacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacatca 42426133  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42426134 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacaaaag 42426233  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| ||| | ||| |||| |||||||||||    
T  42426234 attgttgacctagttcagtcc-aacttgaccta 42426265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32637187 - 32636962
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||| |    
T  32637187 tgaattcggattcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacaaatttcacactaaacacaagcaacatcaataata 32637088  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagag----aagagaaacaaacacaccaaagattgtt 294  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  32637087 acaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaagggagggaagagagaaacaaacacaccaaagattgtt 32636988  T
Q  295 cacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||    
T  32636987 gacccagttcggtcc-aacttgaccta 32636962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31183342 - 31183109
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||| |    
T  31183342 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaccatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagggaacacaagcaacaaaa 31183244  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaac-----agataaagagagaagaga--aacaaacacacca 285  Q
    |||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31183243 ataataacaacacctatatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaattcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacacca 31183144  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  31183143 aagaatgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 31183109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37439489 - 37439275
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaa---tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatct 213  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||    
T  37439489 tcacaccaatacaaaaaactatgatgtgtggagcaaaagaa-gtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctaggtct 37439391  T
Q  214 aatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcc 309  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37439390 aatctagtaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagcataagataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 37439291  T
Q  310 aaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||    
T  37439290 aaacttgacctactct 37439275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19806742 - 19806501
Alignment:
Q  81 aatgtatgaaaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaaca 180  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19806742 aatgtatccaaaatgttgtgaattcggactcaaaactcac--caatacaaactatgatgtgtggggcaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtgaaca 19806645  T
Q  181 taagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aaca 276  Q
    || |||| | |||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||    
T  19806644 taggcaatagcaataataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaaca 19806545  T
Q  277 aacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19806544 aacaccccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 19806501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 8565748 - 8565976
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||| ||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  8565748 tgttgtgaatttggattcaaaa-tcacactaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaacaacaa 8565846  T
Q  194 taacaa---caccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagag-aaacaaacacaccaaaga 289  Q
    ||| ||   || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8565847 taataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaaacaaacacacc-aaga 8565945  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  8565946 ttgttgacctagttcggtcc-aacttgaccta 8565976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 30682721 - 30682952
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |    
T  30682721 ttgttgtgaatacggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 30682820  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaa 287  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  30682821 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaattcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 30682920  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  30682921 gattgttga-ccagttcggtcc-aacttgaccta 30682952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13488569 - 13488341
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| | |||    
T  13488569 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagtaaaggaaagtaataaccaatttcaaagtgaacacaatcaatagcaa 13488470  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagatt 291  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  13488469 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagaaagggagagaagagaggaacaaagacacaaaagatt 13488370  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13488369 attgacccagttcggtcc-aacttgaccta 13488341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33832046 - 33831818
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||    
T  33832046 tgttgtgaattcggactcaaaatt-acacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaacacaagcaataacaa 33831948  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtg-aaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
     || | || ||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  33831947 caatagcagcacctaaatctaatctaggaatcaaagtgaaaaagctcaaagccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaaaacaccaaagat 33831848  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  33831847 tgttgacccagttcagtcc-aacttgaccta 33831818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16649635 - 16649851
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||| |  | |||    
T  16649635 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacaatcaaagtgaacacaagtagtagcaa 16649733  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16649734 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaacggaaaagagaaacaaacacaccaaggattgt 16649833  T
Q  294 tcacccaattcggtccaa 311  Q
    | ||| | || |||||||    
T  16649834 tgacctagtttggtccaa 16649851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 39468348 - 39468570
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||    
T  39468348 tgttgtgaattcgaactcaaaacttacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 39468447  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaag 288  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  39468448 acaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacgagcacaagataaagggagagaagagaggaacaaacacactaaag 39468547  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||    
T  39468548 attgttgacccagttcagtccaa 39468570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42927262 - 42927027
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42927262 attgttgtgaattcgaactcaaaa-tcataccaacgaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaaagtagcaactaatatcaaagtaaacacaagcaacaac 42927164  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaa------gcaacagataaagagagaagagaaacaaacacacca 285  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||      |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42927163 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagcaaaagataaggagataagagaaacaaacacacca 42927064  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42927063 agaaatgtttacccagttcggtcc-aacttgacctact 42927027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30182960 - 30182722
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaaca 189  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   || ||| |    
T  30182960 aattgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaaaacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaaacaata 30182862  T
Q  190 a-caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacacc 284  Q
    | ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  30182861 atcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacacc 30182763  T
Q  285 aaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30182762 aaagattgttcatccagttcggtccaaacttgacatactct 30182722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 323
Target Start/End: Original strand, 36073866 - 36074075
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  36073866 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 36073965  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaa 312  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36073966 ctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatc-acaagcaaaacataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcatccagttcggtccaaa 36074064  T
Q  313 cttgacctact 323  Q
    |||||||||||    
T  36074065 cttgacctact 36074075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13343406 - 13343194
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  13343406 tcacactaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 13343307  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13343306 tctaggaatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcaaagattgttcacccagttcggtccaa 13343208  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    || |||||||||||    
T  13343207 acatgacctactct 13343194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25413106 - 25412894
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| | || |||||| || ||| || |||| ||| || ||||||    
T  25413106 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaattagtaatcaatatccaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctatatctaa 25413007  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25413006 tctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcagtccaa 25412908  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  25412907 acttgacctactct 25412894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16452402 - 16452214
Alignment:
Q  136 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaa 235  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  16452402 gatgtgtggagtaaaggaaaatagtaaccaatattaacgtaaacacaagcaacaacaataacaa---cagttagatctaatctaggaatcaaattgaaaa 16452306  T
Q  236 gctcaaaaccacaagc-aacagataaag--agagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||  |||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16452305 gctcaaaaccacaagcaaaaaaataaaggaagagaagataaacaaacacaccaagaaatgtttacccagttcggtcc-aacttgacctactct 16452214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 174
Target Start/End: Original strand, 3075547 - 3075629
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaag 174  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3075547 attgttgtgaattcggactaaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaag 3075629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16409825 - 16409609
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  16409825 tcacaccaatacaaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 16409726  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataa----agagagaagag--aaacaaacacaccaa--agattgttcacccaattcggt 307  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||    |||| ||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  16409725 tctaggaaacaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggt 16409627  T
Q  308 ccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16409626 ccaaacttgacctactct 16409609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26178257 - 26178016
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcgga-ctcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| ||    
T  26178257 attgttgtgaattccgatctcaaaac-cacaccaatacgaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataa 26178159  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacac 283  Q
     |||| | |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||||    
T  26178158 tcaatgataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacac 26178060  T
Q  284 caaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26178059 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 26178016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40147610 - 40147555
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40147610 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 40147555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 9789018 - 9789092
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcgga-ctcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9789018 aattgttgtgaattccgatctcaaaac-cacaccaatacaaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 9789092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26171119 - 26170896
Alignment:
Q  109 ctcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccactt 207  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||      |||||| || | || | |||| ||| |    
T  26171119 ctcaaaac-cacaccaatacgaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaagcactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcgatgataacaacacct 26171021  T
Q  208 agatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaaga--ttgttcaccc 299  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||| |||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  26171020 agatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcaccc 26170922  T
Q  300 aattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  26170921 agttcggtccaaacttgacctactct 26170896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10593446 - 10593392
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10593446 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 10593392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29720552 - 29720498
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29720552 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 29720498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Original strand, 42309829 - 42309930
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  42309829 tgaattaggactcaaaa-tcacatcaatgaaaacaaagatgtatgcagcaaaggaaagtgataacctatatcatagtaatcacaagcaacaacaataaca 42309927  T
Q  199 aca 201  Q
    |||    
T  42309928 aca 42309930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 323
Target Start/End: Original strand, 3075630 - 3075690
Alignment:
Q  262 gagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3075630 gagagaagagaaacaaacacaccaagaaatgttcacccaatttggtcc-aacttgacctact 3075690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 9789203 - 9789258
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9789203 aaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 9789258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 165
Target Start/End: Original strand, 18441457 - 18441512
Alignment:
Q  109 ctcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18441457 ctcaaaac-cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 18441512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 18441627 - 18441682
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18441627 aaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 18441682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 13695639 - 13695686
Alignment:
Q  239 caaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13695639 caaaacaacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 13695686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30897684 - 30897585
Alignment:
Q  182 aagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacac 281  Q
    |||||||||||||||||     ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  30897684 aagcaacaacaataacag----acttaaatctaatctaggaaccaa-gtgtaaagcataaaatcacaagcaaaagatagagagaaaacagaaacaaacac 30897590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 38747353 - 38747298
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38747353 tgttgtgaatttggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 38747298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 22536286 - 22536324
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22536286 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 22536324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25078293 - 25078255
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25078293 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 25078255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25136262 - 25136224
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25136262 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 25136224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29722712 - 29722658
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29722712 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactct 29722658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 29751156 - 29751194
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29751156 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 29751194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40380263 - 40380225
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40380263 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 40380225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40382474 - 40382436
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40382474 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 40382436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 311
Target Start/End: Original strand, 9049209 - 9049363
Alignment:
Q  149 aaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccaca 248  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||| || ||||   || | ||||||| ||| ||  || ||||||| | ||||||||||    
T  9049209 aaggaaaatagtaaccaatatcaaagtaaccacaagaaacaacaacaataacaaatctaa-atctaatatagaaattaa-gtgaaaaacacaaaaccaca 9049306  T
Q  249 agcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| |||||      |||||||||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||||    
T  9049307 agcaaaagata------gaagagaaacaaacacaccaaaaaatgtttatccatttcggtccaa 9049363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28278504 - 28278450
Alignment:
Q  270 agaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28278504 agaaagaaacacaccaagaattgttcacccagttcggtcc-aacttgacctactct 28278450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9299797 - 9299739
Alignment:
Q  245 cacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaatt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||   ||| ||||||||||    
T  9299797 cacaagcaaaagataaagagagaagagaaataagcacaccaagatttggtcacccaatt 9299739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 311
Target Start/End: Original strand, 10281738 - 10281776
Alignment:
Q  273 aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10281738 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 10281776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16544581 - 16544543
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16544581 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 16544543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16546803 - 16546765
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16546803 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 16546765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213601
Alignment:
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 213601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12102637 - 12102534
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaa-----ggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaac 188  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||     ||||||||  ||||||| ||||||||| || || ||||    
T  12102637 tgttgtgaattcgtacccaaaactcacaccaata-atactttgatgtgtggagcaaattaaaggaaagtataaaccaatatcaaagtaatcacaaccaac 12102539  T
Q  189 aacaa 193  Q
    |||||    
T  12102538 aacaa 12102534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Original strand, 15464341 - 15464414
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaat 167  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  15464341 attgttgtgaattcggat--aaaactcacaccaatgtaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaat 15464414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28278661 - 28278609
Alignment:
Q  97 tatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28278661 tatgagtttggactcaaatttcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagcaa 28278609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 723544 - 723774
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  723544 aattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaa 723642  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaag 288  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  723643 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaag 723742  T
Q  289 attgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  723743 attgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 723774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 36317811 - 36318043
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  36317811 attgttgtgaatttggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtagaacaaatgaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacagc 36317910  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36317911 aataataacaacacctagatttaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagaaagaagataaacaaacacaccaaagatt 36318010  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36318011 gttgacccagttcggtcc-aacttgacctactct 36318043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 34139572 - 34139800
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  34139572 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaaca 34139670  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34139671 ataataacaagacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 34139770  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34139771 tgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 34139800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39285202 - 39284974
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39285202 tgttgtgaattcggacttaaaactcataccaatacaa-ctatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 39285104  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacacc---aaagat 290  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  39285103 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccattaaagat 39285004  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  39285003 tgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 39284974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 321
Target Start/End: Original strand, 33162248 - 33162480
Alignment:
Q  88 gaaaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagca 186  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||    
T  33162248 gaaaagtgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagca 33162346  T
Q  187 acaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33162347 acaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaatagagaagagaaacaaacacaccaa 33162446  T
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  33162447 agattgttgacctagttcggtcc-aacttgaccta 33162480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Original strand, 11151395 - 11151621
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  11151395 tgttgtgaattcgaactcaaaactcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaataaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 11151494  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11151495 taataacaacagctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 11151594  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11151595 tgacccagttcggtcc-aacttgaccta 11151621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Original strand, 36987874 - 36988110
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  36987874 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaataatc 36987972  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36987973 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaa 36988072  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36988073 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 36988110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Original strand, 2334218 - 2334452
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2334218 tgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 2334316  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaaga 289  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||    
T  2334317 taataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaacttcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaaga 2334416  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2334417 ttgttcccccagttcggtccaaacttgacctactct 2334452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11067635 - 11067443
Alignment:
Q  128 caaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaa 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  11067635 caaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaa 11067536  T
Q  228 agtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  11067535 agtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgaccgagttcggtcc-aacttgaccta 11067443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 14633627 - 14633855
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  14633627 ttgttgtgatttcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaaca 14633725  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14633726 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcaaaagataaagagagaatagagaaacaaacacaccaaagat 14633825  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    |||| || || |||||||| |||||||||||    
T  14633826 tgttgactcagttcggtcc-aacttgaccta 14633855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42362713 - 42362506
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||    
T  42362713 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaacaacaa 42362615  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaa--gagaaacaaacacaccaaagatt 291  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42362614 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagatt 42362515  T
Q  292 gttcaccca 300  Q
    ||| |||||    
T  42362514 gttgaccca 42362506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36773926 - 36773709
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaaca 192  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||    
T  36773926 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagccaacaagaagcaacaaca 36773828  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773827 ataataacaacacctagatctaatctagtaataaaaaagaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagaaagaagagaaacaaacacaccaaagattg 36773728  T
Q  293 ttcacccaattcggtccaa 311  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  36773727 ttgacccagttcggtccaa 36773709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29868237 - 29868007
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29868237 tgttgtgaattcggactcaaatttcacagcaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaatcaattttaaagtaaacacaagcaacaacaa 29868138  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaaga 289  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  29868137 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaacggagagaagagagaaacaaacacatcaaaga 29868038  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29868037 ttattgacccagttcggtcc-aacttgaccta 29868007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Original strand, 6594804 - 6595040
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-ca 192  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || || ||    
T  6594804 tgttgtgaatttggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagtaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatca 6594902  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa---gagagaagag--aaacaaacacaccaaa 287  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6594903 acaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaa 6595002  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6595003 gattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactct 6595040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 93 - 309
Target Start/End: Original strand, 14202223 - 14202440
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||    
T  14202223 ttgttgtgaattcggagtcaaaa-tcataccaacacaaactatgatatgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacgcaagcaacaaca 14202321  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagag--aaacaaacacaccaaagat 290  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14202322 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcttaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagataaacaaacacaccaaagat 14202421  T
Q  291 tgttcacccaattcggtcc 309  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  14202422 tgttgacccagttcggtcc 14202440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38312600 - 38312387
Alignment:
Q  102 attcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaac 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| || |||    
T  38312600 attcggactcaaaa-tcacaccaatataaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaatcaacaataac 38312502  T
Q  201 accacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttca 296  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  38312501 agcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacatcaaagattgttga 38312402  T
Q  297 cccaattcggtccaa 311  Q
    |||| ||||||||||    
T  38312401 cccagttcggtccaa 38312387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24885953 - 24885761
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  24885953 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgtagcaaaggaaaatagtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaacaacaa 24885855  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaa 286  Q
    | | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24885854 tgataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaa 24885761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11690859 - 11690648
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||       
T  11690859 aattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaa-gtgaacacaagcaa--- 11690764  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaaga 289  Q
       ||||||||||   |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11690763 ---taacaacacc---tagatctaatctaggaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaaga 11690670  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  11690669 ttgttgatccagttcggtccaa 11690648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 17057166 - 17057399
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  17057166 aattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaatatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataa 17057264  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga----agagaaacaaacacacca 285  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    |||| |||||||||||||    
T  17057265 tcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaacaaacacacca 17057364  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17057365 aagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 17057399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 17085149 - 17085382
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  17085149 aattgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaatatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataa 17085247  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagaga----agagaaacaaacacacca 285  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    |||| |||||||||||||    
T  17085248 tcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaacaaacacacca 17085347  T
Q  286 aagattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17085348 aagattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 17085382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 36205487 - 36205699
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  36205487 tcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 36205586  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36205587 tctaggaatcaaagtgaaaagcagaaa-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 36205685  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  36205686 acttgacctactct 36205699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45100100 - 45099888
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  45100100 tcacaccaatacgaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 45100001  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45100000 tctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatc-acaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 45099902  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  45099901 acttgacctactct 45099888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 325
Target Start/End: Original strand, 5723072 - 5723290
Alignment:
Q  111 caaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || || ||| || ||| || |||| ||| |||    
T  5723072 caaaaatcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagtaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacaacacctag 5723171  T
Q  210 atctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcg 305  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5723172 atctaatctaggaatcaaaaagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcg 5723270  T
Q  306 gtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  5723271 gtccaaacttaacctactct 5723290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2838315 - 2838132
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  2838315 attgttgtgagttcggacacaaaactcacaccaata-atactttgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccactatcaaagtaaacacaaacaacaac 2838217  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaaca 276  Q
    || || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2838216 aacaataacaacacctagatataatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagtgagaagagaaaca 2838132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 4502955 - 4503167
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  4502955 tcacaccaatacaaactataatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 4503054  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4503055 tctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaa 4503153  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  4503154 acttgacctactct 4503167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11049913 - 11049729
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaaca 192  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11049913 ttgttgtgagttcggacgcaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgcgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtaatcataagcaacaaca 11049816  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacac 283  Q
    |||| ||    || |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11049815 ataataa----acctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacac 11049729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 4484150 - 4484364
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  4484150 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 4484249  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcc 309  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    ||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4484250 tctaggaaacaaagtgaaaagca-aaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttctgtcc 4484348  T
Q  310 aaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||    
T  4484349 aaacttgacctactct 4484364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1345733 - 1345613
Alignment:
Q  189 aacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-a 287  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1345733 aacaataacaacacc---tagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcataagataaagtgagaagagaaacaaacacaccaaga 1345637  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
     |||||| ||||| ||||||||||    
T  1345636 aattgttgacccagttcggtccaa 1345613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26353495 - 26353318
Alignment:
Q  138 tgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagc 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||   |||||||||||     || ||||||||||| |    
T  26353495 tgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaatcacaaggaacaacaataacaaaac---ttagatctaat-----aatcaaagtgaaaaac 26353404  T
Q  238 tcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  26353403 acaaaaccacaagcaaaagataaggagaggagagaaacaaacaca-caaaaaatgtttacccggttcggtcc-aacttgacctactct 26353318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30833694 - 30833480
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    | || |    |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  30833694 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattaattatgtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 30833595  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcc 309  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30833594 tctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcagtcc 30833496  T
Q  310 aaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||    
T  30833495 aaacttgacctactct 30833480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Original strand, 12123434 - 12123581
Alignment:
Q  137 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaag 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| || ||||  || || ||||||||||| || | |||||||||     
T  12123434 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaacctcaaacaacaacaacaataaca-aacctatatctaatctagaaatc-aagtgaaaaa 12123531  T
Q  237 ctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
      ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12123532 tacaaaatcacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaacacgccaa 12123581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32289921 - 32289698
Alignment:
Q  109 ctcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccactt 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| || ||| || |||| ||| |    
T  32289921 ctcaaaac-cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacct 32289823  T
Q  208 agatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataa----agagagaagag--aaacaaacacaccaa--agattgttcaccc 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||    |||| ||||||  ||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  32289822 agatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttcaccc 32289724  T
Q  300 aattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  32289723 agttcggtccaaacttgacctactct 32289698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13122121 - 13121942
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaacaataac 197  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||| ||| |||||  ||||| ||     
T  13122121 tgaattcggacacaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtactaatcaatatcaaaataa-catcaagcagtaacaacaat 13122025  T
Q  198 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacaca 282  Q
    ||||  || ||||| |||||||| || ||| ||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13122024 aacaa-acctagatgtaatctagaaatcaa-gtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacaca 13121942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Original strand, 17490095 - 17490182
Alignment:
Q  237 ctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||  | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17490095 ctcaaaaccacaagcaaatgataaagagagaagagaaacaaacatattaagaaatgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactct 17490182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Original strand, 7815127 - 7815270
Alignment:
Q  137 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaattt-caaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaa 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |  ||||||||||||||  |    |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  7815127 atgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaattttcaaagtaa-cttca--aacaacaataacaagtc----tagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaa 7815218  T
Q  236 g-ctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
      | ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7815219 aacacaaaatcgcaagcaaaagataaagaaagaagagaaacaaacacaccaa 7815270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41446357 - 41446315
Alignment:
Q  241 aaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacac 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41446357 aaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacac 41446315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28672151 - 28672065
Alignment:
Q  239 caaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagat-tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  28672151 caaaatcacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaacaca-caaagatatatttacctaattcggtccaacaatgacctactct 28672065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43406280 - 43406144
Alignment:
Q  148 aaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccac 247  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||| || ||||  || || || ||||||| ||||| | ||| ||| | |||| ||||    
T  43406280 aaaggaaggtagtaaccaatattaaagtagagttaagcaacaacaacaataacat-acctaaatttaatctaataaccta-gtgtaaaacacaaa-ccac 43406184  T
Q  248 aagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 287  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43406183 aagcaacatataaagagaaaagagaaacaaacacatcaaa 43406144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6266863 - 6266825
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6266863 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 6266825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 12647382 - 12647420
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12647382 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 12647420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 7596960 - 7597007
Alignment:
Q  239 caaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7596960 caaaaacaaaagcaaaagataaagagagaagagaaataaacacaccaa 7597007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26354176 - 26354127
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtgga 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26354176 tgttatgaattcggactcaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgtgtgga 26354127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 13656028 - 13656066
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13656028 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 13656066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 311
Target Start/End: Original strand, 42019836 - 42019890
Alignment:
Q  257 ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||| |||||||    
T  42019836 ataaagagagaagagaaacaaacacaccaagaagtgtttatccaatttggtccaa 42019890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17450755 - 17450711
Alignment:
Q  280 acaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  17450755 acaccaaagattgttcacctagttcggtcc-aacttgacctactct 17450711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 196
Target Start/End: Original strand, 17489958 - 17490060
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtg--tggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||||     
T  17489958 tgttgtgaattcggactcaaaattg-caccaata-aaactatgatgtgtgtggagcaagagaaaatagtaaccaatatcaaagtaaccacaaacaacaat 17490055  T
Q  192 aataa 196  Q
    |||||    
T  17490056 aataa 17490060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 323
Target Start/End: Original strand, 26954091 - 26954318
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26954091 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagaaataacaa 26954189  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgt 293  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26954190 caataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaatgtaaagagagaagagaaacaaagtcaccaaagattgt 26954289  T
Q  294 tcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    | ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  26954290 tgacctagttcggtcc-aacttgacctact 26954318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 317
Target Start/End: Original strand, 33160177 - 33160378
Alignment:
Q  121 accaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctag 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  33160177 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaatttcaaagtaaatacaagcaacaacaatattaacaacacctagatctaatctag 33160276  T
Q  221 taaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa---gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaactt 315  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33160277 taatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagtttggtccaaactt 33160376  T
Q  316 ga 317  Q
    ||    
T  33160377 ga 33160378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 286
Target Start/End: Original strand, 14521476 - 14521673
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagta----gtaaccaatttcaaagtaaacataagcaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14521476 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatg-aaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtacgtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaa 14521574  T
Q  188 caacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14521575 caacaataacaacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataagataaagtgagaaaagaaataaacacaccaa 14521673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 294
Target Start/End: Original strand, 3038732 - 3038927
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacat-aagcaacaacaataac 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||     
T  3038732 tgaattcgaactcaaaa-tcagaccaatacaaactatgatgtgtcgagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagcaaacaacaagtaacaacaataat 3038830  T
Q  198 aacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgtt 294  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3038831 aacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaaaagaaacaaacacaccaaagattgtt 3038927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16569389 - 16569160
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaataca-aacaatgatgtgtggagcaaa-ggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||    
T  16569389 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatattcaactatgatgtgtggagcaaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataac 16569291  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaa--gagaaacaaacacaccaaaga 289  Q
    || || | || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16569290 aacaatagcagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaaga 16569191  T
Q  290 ttgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16569190 ttgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 16569160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 5408892 - 5409103
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  5408892 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 5408991  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5408992 tctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttca-ccagttcggtccaa 5409089  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  5409090 acttgacctactct 5409103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 5413217 - 5413428
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  5413217 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 5413316  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5413317 tctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttca-ccagttcggtccaa 5413414  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  5413415 acttgacctactct 5413428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Original strand, 28137211 - 28137442
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaa 193  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  28137211 tgttgtgaattcggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgacgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacga 28137309  T
Q  194 taacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaa--caaacacaccaaagatt 291  Q
     || |||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||   ||||| |||||  | |    
T  28137310 caataacaacacatagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacataaccacaagcaaaagataaagggagaagataaaacaaaacataccaagaaat 28137409  T
Q  292 gttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28137410 gttcacacaattcggtcc-aacttgacctactct 28137442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 311
Target Start/End: Original strand, 9182857 - 9183052
Alignment:
Q  121 accaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaatcta 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  9182857 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatcta 9182956  T
Q  220 gtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    | || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9182957 ggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaa 9183052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 16452125 - 16452363
Alignment:
Q  92 attgttatgaattcgga-ctcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||| ||    
T  16452125 attgttgtgaattccgatctcaaaa-tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatacaagcaataa 16452223  T
Q  191 -caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc-aacagataaa--gagaga--agagaaacaaacacacc 284  Q
     ||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  16452224 tcaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacacc 16452322  T
Q  285 aaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16452323 aaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 16452363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 325
Target Start/End: Original strand, 31404492 - 31404709
Alignment:
Q  112 aaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttaga 210  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | || |||||| || ||| || |||| ||| ||||    
T  31404492 aaaaatcactccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctaga 31404591  T
Q  211 tctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcgg 306  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31404592 tctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcgg 31404690  T
Q  307 tccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  31404691 tccaaacttggcctactct 31404709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 325
Target Start/End: Original strand, 33211066 - 33211219
Alignment:
Q  171 aaagtaaacataagcaacaacaataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaaga 270  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33211066 aaagtaaacacaagcaataacaacaataataacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaatcacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaaga 33211165  T
Q  271 gaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33211166 gaaacaaacataccaaagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctactct 33211219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 5406025 - 5406234
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || |||||| | ||||   |||||||||    
T  5406025 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaataatagcacc---tagatctaa 5406121  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5406122 tctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggttcaa 5406220  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  5406221 acttgacctactct 5406234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 5410350 - 5410559
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| | || |||||| || |||||| | ||||   |||||||||    
T  5410350 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaataatagcacc---tagatctaa 5410446  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5410447 tctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggttcaa 5410545  T
Q  312 acttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  5410546 acttgacctactct 5410559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 30834343 - 30834570
Alignment:
Q  103 ttcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaaca 201  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||   |||||| || ||| || ||||    
T  30834343 ttcggtctcaaaa-tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataaca 30834441  T
Q  202 ccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctca-aaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttca 296  Q
     ||| |||||||||||||  || |||||||||||   || ||||||||||||| | |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  30834442 gcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaagattattca 30834541  T
Q  297 cccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30834542 cccagttcggtccaaacttgacctactct 30834570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 2171349 - 2171566
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  2171349 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 2171448  T
Q  216 tctagtaaccaaagtg-aaaagctca-aaaccacaagcaacagataaa---gagagaagag--aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggt 307  Q
    ||||| || ||||||| ||||   || ||| ||||||||  |||||||   ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2171449 tctaggaatcaaagtgaaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaaagggagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggt 2171548  T
Q  308 ccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2171549 ccaaacttgacctactct 2171566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 149
Target Start/End: Original strand, 602902 - 602958
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  602902 ttgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 602958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 3072579 - 3072793
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||      |||||| || ||| || || | ||| |||||||||    
T  3072579 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaa 3072678  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtc 308  Q
    ||||| || ||| |||||||||  ||||| |||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3072679 tctaggaaacaa-gtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtc 3072776  T
Q  309 caaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||||    
T  3072777 caaacttgacctactct 3072793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 412291 - 412236
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  412291 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 412236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 6097430 - 6097485
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6097430 aaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 6097485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 16578497 - 16578552
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16578497 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 16578552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16616883 - 16616828
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16616883 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 16616828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16653301 - 16653246
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16653301 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 16653246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 412434 - 412387
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412434 cacaccaataccaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 412387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4045637 - 4045590
Alignment:
Q  239 caaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 286  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4045637 caaaaccacgagtaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 4045590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17758405 - 17758346
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcgg-actcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17758405 aattgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 17758346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16555058 - 16555005
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16555058 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 16555005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16631614 - 16631561
Alignment:
Q  272 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16631614 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 16631561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25421478 - 25421440
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25421478 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 25421440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34167252 - 34167214
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34167252 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 34167214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 165
Target Start/End: Original strand, 6097270 - 6097317
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6097270 cacaccgatgcaaagaatgatgtgtggagcaacggaaagtagtaacca 6097317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 154
Target Start/End: Original strand, 22963522 - 22963568
Alignment:
Q  107 gactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22963522 gactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagctaaggaa 22963568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23824871 - 23824825
Alignment:
Q  107 gactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23824871 gactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagctaaggaa 23824825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 149
Target Start/End: Original strand, 3808512 - 3808550
Alignment:
Q  111 caaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3808512 caaaactcacaccaatacaaactatgatatgtggagcaa 3808550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6027419 - 6027381
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6027419 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactct 6027381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13154087 - 13154049
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13154087 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 13154049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Original strand, 22424620 - 22424670
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22424620 tgaattcggactcaaatttcacattaatacaaactatgatgtgtggagcaa 22424670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27648032 - 27647994
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27648032 agattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactct 27647994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 33342101 - 33342139
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33342101 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 33342139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34165030 - 34164992
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34165030 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 34164992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 159
Target Start/End: Original strand, 257241 - 257308
Alignment:
Q  90 aaattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtag 159  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  257241 aaattgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaatataatta-taatgtgtggagcaaaggaaagtag 257308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 167
Target Start/End: Original strand, 9182829 - 9182862
Alignment:
Q  134 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaat 167  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9182829 atgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaat 9182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 311
Target Start/End: Original strand, 12221048 - 12221125
Alignment:
Q  234 aagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||| |||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||    
T  12221048 aagcacaaaactacacgcaaaagataaagatataagagaaataaacacaccaagaaatgtttacccagttcggtccaa 12221125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21589309 - 21589252
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21589309 ttgttgtgaattctggactcaaatttcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaa 21589252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17763369 - 17763313
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcgg-actcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17763369 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaa 17763313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1668 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1668
Description:

Target: scaffold1668; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 294
Target Start/End: Original strand, 1301 - 1502
Alignment:
Q  94 tgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagt-aaacataagcaacaaca 192  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||| || ||||    
T  1301 tgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaatacaatctatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatattaaagttaaacacaagtaataaca 1400  T
Q  193 ataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 292  Q
    |  | |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1401 acgataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattg 1500  T
Q  293 tt 294  Q
    ||    
T  1501 tt 1502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Original strand, 148917 - 149131
Alignment:
Q  99 tgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaacaataaca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||      |||||    
T  148917 tgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa------taaca 149009  T
Q  199 acaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc 298  Q
    |||||   || ||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  149010 acacc---taaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaatacaccaaagattgttgacc 149105  T
Q  299 caattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||    
T  149106 cagttcggtcc-aacttaacctactct 149131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 321
Target Start/End: Original strand, 20215 - 20445
Alignment:
Q  93 ttgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-c 191  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||      
T  20215 ttgttgtgaattcggactcaa--ctcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaggtagtaaccaatgtcaaagtgaacacaagcaataatt 20312  T
Q  192 aataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaa 287  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  20313 aacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaa 20412  T
Q  288 gattgttcacccaattcggtccaaacttgaccta 321  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20413 aattgttgacccagttcggtcc-aacttgaccta 20445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 114950 - 114736
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaa-caatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatcta 214  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||| || ||| || |||| ||| || |||||    
T  114950 tcacaccaatacaaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaatcaataatcaacaataacaacacctatatcta 114851  T
Q  215 atctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcca 310  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  114850 atctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacaacaagaaaaagataaaaggagagaagagagaaacaagcacaccaaagattgttcatccagttcggtcta 114751  T
Q  311 aacttgacctactct 325  Q
    ||||| |||||||||    
T  114750 aacttaacctactct 114736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 434880 - 434667
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||      || ||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  434880 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattattaaagtgttttcaatcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 434781  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcca 310  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||   |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  434780 tctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaatattgttcacccagttcggtcca 434682  T
Q  311 aacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||    
T  434681 aacttgacctactct 434667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1049
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaa 215  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| || ||   |||||| || ||| || |||||||| |||||||||    
T  1262 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggaacaaaggatagtagtaaccaatgacaatgtgaatgcaagcaataatcaacaataacaccacctagatctaa 1163  T
Q  216 tctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa--gagaga--agagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcca 310  Q
    |||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1162 tctaggtatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaagtataaaaggagagaagagagaaacaaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcca 1064  T
Q  311 aacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||    
T  1063 aacttgacctactct 1049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Original strand, 8556 - 8769
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  | ||||      |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  8556 cacaccaatacaaagtatgatacgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatgactaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaat 8655  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcca 310  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8656 ctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcca 8754  T
Q  311 aacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||    
T  8755 aacttgacctactct 8769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Original strand, 10982 - 11195
Alignment:
Q  118 cacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa-caataacaacaccacttagatctaat 216  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||      |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  10982 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatgactaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaat 11081  T
Q  217 ctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattgttcacccaattcggtcca 310  Q
    |||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11082 ctaggaaacaaagtgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcca 11180  T
Q  311 aacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||    
T  11181 aacttgacctactct 11195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 311
Target Start/End: Original strand, 27247 - 27462
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagcaacaa 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |||   || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||| |  ||||| |||    
T  27247 aattgttgtgaattcggactcaaatctcacatcaata--aacttagaagtgtggagaaaaggaa-gtagtaaccaatatgaaagtaacctcaagcagcaa 27343  T
Q  191 caataacaacaccacttagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagat 290  Q
     ||||| ||||  |||||||   ||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||  |     
T  27344 aaataataacaa-acttagaagaaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaaggtaaagagagaagagaaataaacacatcaataaa 27441  T
Q  291 tgttcacccaattcggtccaa 311  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  27442 tgtttacctaattcggtccaa 27462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11912 - 11864
Alignment:
Q  117 tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11912 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 11864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11757 - 11691
Alignment:
Q  262 gagagaagaga--aacaaacacaccaa-agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11757 gagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 11691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 325
Target Start/End: Original strand, 2598 - 2638
Alignment:
Q  285 aaagattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2598 aaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 2638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 17790 - 17849
Alignment:
Q  91 aattgttatgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17790 aattgttatgaattctggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtgtagcaa 17849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3760
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 325  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3722 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactct 3760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7687 - 7646
Alignment:
Q  108 actcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaa 149  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7687 actcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 7646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25292 - 25201
Alignment:
Q  207 tagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccca 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| |||   |||||||||||    
T  25292 tagatctaatctagtaacc-aagtgtaaagcac-aaaccaaaagcaaaagataaattgaggagagaaataaacacagcaagatttgttcaccca 25201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37 - 1
Alignment:
Q  287 agattgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 323  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University