View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1804_low_29 (Length: 266)

Name: NF1804_low_29
Description: NF1804
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1804_low_29
NF1804_low_29
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-253)||(117147-117398)
scaffold0002 (27-185)||(475305-475464)
scaffold0002 (27-185)||(481825-481984)
scaffold0002 (6-185)||(156681-156861)
[»] chr6 (128 HSPs)
chr6 (1-253)||(13913066-13913317)
chr6 (2-253)||(11147177-11147428)
chr6 (2-253)||(12827710-12827961)
chr6 (2-253)||(20029832-20030082)
chr6 (2-253)||(25787719-25787969)
chr6 (2-253)||(7375686-7375936)
chr6 (2-253)||(20062583-20062833)
chr6 (1-253)||(29765552-29765803)
chr6 (1-253)||(8653677-8653928)
chr6 (2-253)||(25986099-25986350)
chr6 (1-253)||(18925690-18925942)
chr6 (4-253)||(27166371-27166619)
chr6 (1-253)||(18826166-18826417)
chr6 (2-253)||(26044231-26044481)
chr6 (1-253)||(17042638-17042890)
chr6 (1-253)||(18834562-18834813)
chr6 (1-226)||(5845101-5845325)
chr6 (15-253)||(28251493-28251730)
chr6 (15-253)||(28356640-28356877)
chr6 (1-253)||(16123464-16123716)
chr6 (1-253)||(4292743-4292994)
chr6 (1-253)||(17064211-17064463)
chr6 (2-253)||(9123059-9123311)
chr6 (1-249)||(31572431-31572678)
chr6 (2-253)||(27505959-27506212)
chr6 (1-226)||(17745737-17745961)
chr6 (2-253)||(9112422-9112674)
chr6 (2-253)||(31542825-31543077)
chr6 (2-253)||(27372849-27373102)
chr6 (2-253)||(27463199-27463452)
chr6 (1-253)||(7751163-7751415)
chr6 (1-253)||(9933599-9933850)
chr6 (1-253)||(22308807-22309058)
chr6 (2-253)||(12855038-12855290)
chr6 (2-253)||(12865564-12865816)
chr6 (1-249)||(17741635-17741881)
chr6 (2-253)||(17984637-17984889)
chr6 (6-253)||(25735486-25735732)
chr6 (2-253)||(32961856-32962108)
chr6 (2-253)||(32972475-32972727)
chr6 (2-253)||(33199345-33199597)
chr6 (2-253)||(34807087-34807339)
chr6 (2-253)||(34817719-34817971)
chr6 (2-253)||(3661400-3661651)
chr6 (2-253)||(3672064-3672315)
chr6 (2-253)||(17982428-17982680)
chr6 (6-253)||(25686677-25686923)
chr6 (2-253)||(26025476-26025728)
chr6 (2-253)||(26036050-26036302)
chr6 (2-253)||(26864805-26865057)
chr6 (2-253)||(26875429-26875681)
chr6 (2-249)||(31982557-31982805)
chr6 (2-253)||(16930468-16930719)
chr6 (1-253)||(25518707-25518956)
chr6 (2-249)||(27341711-27341959)
chr6 (2-249)||(27402451-27402699)
chr6 (2-249)||(27413110-27413358)
chr6 (2-253)||(29384769-29385020)
chr6 (2-253)||(4630890-4631142)
chr6 (2-253)||(16959639-16959890)
chr6 (2-253)||(32300970-32301222)
chr6 (2-253)||(32311659-32311911)
chr6 (19-253)||(25675196-25675429)
chr6 (6-253)||(25679259-25679505)
chr6 (2-253)||(12716761-12717014)
chr6 (2-253)||(12727410-12727663)
chr6 (2-253)||(27384450-27384701)
chr6 (2-253)||(27474863-27475114)
chr6 (2-253)||(27504362-27504613)
chr6 (1-240)||(19289322-19289559)
chr6 (95-253)||(6158317-6158475)
chr6 (79-253)||(25722886-25723059)
chr6 (1-185)||(12953126-12953309)
chr6 (3-185)||(11205965-11206146)
chr6 (6-228)||(11235521-11235741)
chr6 (1-227)||(31931440-31931664)
chr6 (1-185)||(18498637-18498820)
chr6 (138-253)||(13928341-13928456)
chr6 (28-228)||(7586210-7586408)
chr6 (1-185)||(18555287-18555470)
chr6 (6-228)||(21128103-21128323)
chr6 (6-185)||(17608401-17608579)
chr6 (6-185)||(20635595-20635775)
chr6 (3-228)||(17047573-17047795)
chr6 (6-185)||(22386678-22386858)
chr6 (6-165)||(14051495-14051654)
chr6 (2-93)||(26022881-26022972)
chr6 (64-169)||(29917951-29918056)
chr6 (64-169)||(9717777-9717882)
chr6 (6-165)||(14070176-14070335)
chr6 (208-259)||(5845324-5845375)
chr6 (64-169)||(15954637-15954742)
chr6 (64-169)||(32544199-32544304)
chr6 (98-169)||(16877180-16877252)
chr6 (98-169)||(22076517-22076589)
chr6 (98-169)||(22802108-22802180)
chr6 (98-169)||(14100550-14100620)
chr6 (64-169)||(21235058-21235164)
chr6 (64-169)||(20488028-20488133)
chr6 (64-169)||(20730814-20730919)
chr6 (97-169)||(12423227-12423300)
chr6 (98-169)||(13435499-13435571)
chr6 (98-165)||(15531738-15531806)
chr6 (98-169)||(16336094-16336166)
chr6 (98-169)||(17381488-17381560)
chr6 (98-169)||(18435523-18435595)
chr6 (138-174)||(19625816-19625852)
chr6 (83-169)||(19623932-19624018)
chr6 (64-169)||(16265260-16265365)
chr6 (64-169)||(19086092-19086197)
chr6 (115-169)||(21625086-21625140)
chr6 (116-169)||(19066128-19066181)
chr6 (117-169)||(12348980-12349032)
chr6 (213-253)||(16123143-16123183)
chr6 (98-169)||(17316635-17316707)
chr6 (98-169)||(33352036-33352108)
chr6 (138-169)||(21618252-21618283)
chr6 (64-169)||(15302134-15302239)
chr6 (96-169)||(19482717-19482791)
chr6 (115-169)||(26589584-26589638)
chr6 (115-169)||(26972336-26972390)
chr6 (219-253)||(32761860-32761894)
chr6 (101-169)||(24116798-24116867)
chr6 (132-169)||(26943578-26943615)
chr6 (142-174)||(18172139-18172171)
chr6 (142-174)||(19875844-19875876)
chr6 (98-169)||(23284531-23284603)
chr6 (138-174)||(25592625-25592661)
[»] chr2 (108 HSPs)
chr2 (1-253)||(26867113-26867364)
chr2 (1-253)||(18768842-18769093)
chr2 (1-253)||(27978318-27978569)
chr2 (1-253)||(28064847-28065098)
chr2 (1-253)||(26879702-26879953)
chr2 (1-253)||(38586022-38586274)
chr2 (2-253)||(21172402-21172652)
chr2 (2-253)||(28721252-28721502)
chr2 (1-253)||(24414958-24415209)
chr2 (2-253)||(28731840-28732088)
chr2 (2-253)||(2561532-2561782)
chr2 (1-252)||(967440-967689)
chr2 (2-253)||(29244263-29244515)
chr2 (2-253)||(29254842-29255094)
chr2 (1-252)||(24275068-24275317)
chr2 (2-253)||(7005742-7005994)
chr2 (1-252)||(17969146-17969395)
chr2 (2-253)||(43082688-43082941)
chr2 (2-253)||(43093297-43093550)
chr2 (2-253)||(17857372-17857624)
chr2 (2-253)||(9897509-9897761)
chr2 (2-253)||(9908097-9908349)
chr2 (2-253)||(24327669-24327921)
chr2 (2-253)||(36251779-36252031)
chr2 (1-253)||(36784740-36784984)
chr2 (1-253)||(22774401-22774652)
chr2 (2-253)||(11388744-11388996)
chr2 (2-253)||(24338339-24338591)
chr2 (2-253)||(40222374-40222626)
chr2 (2-253)||(40251235-40251487)
chr2 (2-253)||(1099130-1099382)
chr2 (2-253)||(4099825-4100077)
chr2 (2-253)||(4220524-4220776)
chr2 (2-253)||(9773241-9773493)
chr2 (2-253)||(10267035-10267287)
chr2 (2-253)||(10277612-10277864)
chr2 (2-253)||(18392572-18392824)
chr2 (2-253)||(22914799-22915051)
chr2 (2-253)||(32217915-32218167)
chr2 (2-253)||(34790152-34790404)
chr2 (2-253)||(34804295-34804547)
chr2 (2-253)||(39170030-39170282)
chr2 (2-253)||(4209932-4210184)
chr2 (2-253)||(9762705-9762957)
chr2 (2-253)||(11395107-11395359)
chr2 (2-253)||(11405423-11405675)
chr2 (2-253)||(21650467-21650718)
chr2 (2-253)||(22960267-22960519)
chr2 (2-253)||(34477970-34478221)
chr2 (2-253)||(43355064-43355315)
chr2 (2-253)||(27221422-27221675)
chr2 (1-240)||(19497940-19498177)
chr2 (2-253)||(30488758-30489011)
chr2 (2-253)||(35253023-35253276)
chr2 (2-253)||(35263632-35263885)
chr2 (2-253)||(35274257-35274510)
chr2 (2-253)||(43345449-43345700)
chr2 (2-212)||(16768984-16769195)
chr2 (1-253)||(22763697-22763948)
chr2 (3-240)||(19299959-19300194)
chr2 (108-253)||(28374450-28374595)
chr2 (64-253)||(22779842-22780030)
chr2 (3-240)||(19312966-19313201)
chr2 (110-253)||(24425487-24425629)
chr2 (3-240)||(20646557-20646791)
chr2 (1-185)||(19356362-19356545)
chr2 (1-105)||(24427670-24427774)
chr2 (6-182)||(1083884-1084061)
chr2 (6-185)||(24814633-24814813)
chr2 (64-185)||(22755395-22755516)
chr2 (64-169)||(28711765-28711870)
chr2 (64-169)||(31800954-31801059)
chr2 (98-169)||(28550985-28551057)
chr2 (98-169)||(33074187-33074259)
chr2 (64-169)||(6574191-6574297)
chr2 (98-169)||(1587100-1587171)
chr2 (140-228)||(21025488-21025575)
chr2 (98-169)||(22776355-22776427)
chr2 (98-169)||(22781733-22781805)
chr2 (6-169)||(23392735-23392898)
chr2 (98-169)||(31328033-31328104)
chr2 (98-169)||(31334754-31334825)
chr2 (98-169)||(31968110-31968182)
chr2 (115-169)||(22802440-22802493)
chr2 (115-169)||(28701296-28701350)
chr2 (138-174)||(20568137-20568173)
chr2 (98-169)||(22188169-22188241)
chr2 (98-169)||(24377062-24377134)
chr2 (98-169)||(24575996-24576068)
chr2 (98-169)||(30557388-30557459)
chr2 (98-169)||(40332048-40332120)
chr2 (98-169)||(44840395-44840467)
chr2 (64-162)||(6392562-6392659)
chr2 (64-150)||(20152112-20152198)
chr2 (64-169)||(22317521-22317626)
chr2 (98-166)||(10009820-10009889)
chr2 (98-166)||(22258162-22258231)
chr2 (98-169)||(38781359-38781432)
chr2 (98-169)||(13964045-13964117)
chr2 (98-169)||(14581476-14581548)
chr2 (98-169)||(19540377-19540449)
chr2 (142-174)||(24440794-24440826)
chr2 (98-169)||(25037326-25037398)
chr2 (98-169)||(25041433-25041505)
chr2 (98-169)||(30666950-30667022)
chr2 (98-169)||(34322003-34322075)
chr2 (98-169)||(39037709-39037781)
chr2 (138-166)||(41121789-41121817)
[»] chr8 (99 HSPs)
chr8 (1-253)||(18153814-18154064)
chr8 (1-253)||(18158333-18158584)
chr8 (1-253)||(18769088-18769340)
chr8 (1-253)||(16747079-16747330)
chr8 (2-253)||(19225013-19225263)
chr8 (2-253)||(19418431-19418681)
chr8 (2-253)||(23457255-23457505)
chr8 (2-253)||(23469411-23469662)
chr8 (2-253)||(19429006-19429258)
chr8 (2-253)||(30314647-30314897)
chr8 (2-253)||(20161180-20161430)
chr8 (2-253)||(20196037-20196287)
chr8 (5-253)||(31215097-31215344)
chr8 (1-253)||(40213120-40213372)
chr8 (1-252)||(3843601-3843850)
chr8 (2-253)||(6318467-6318718)
chr8 (2-229)||(30325227-30325453)
chr8 (23-253)||(1750193-1750423)
chr8 (2-253)||(3220710-3220962)
chr8 (2-253)||(19139358-19139610)
chr8 (2-253)||(19128826-19129078)
chr8 (2-253)||(15780660-15780912)
chr8 (2-253)||(26120988-26121240)
chr8 (2-253)||(15791249-15791501)
chr8 (2-253)||(18449448-18449700)
chr8 (1-252)||(20259570-20259819)
chr8 (1-252)||(21046200-21046449)
chr8 (2-253)||(6151148-6151400)
chr8 (2-253)||(9856422-9856674)
chr8 (2-253)||(26111310-26111562)
chr8 (2-253)||(36292997-36293249)
chr8 (2-253)||(36303600-36303852)
chr8 (12-253)||(6576470-6576712)
chr8 (2-253)||(210104-210355)
chr8 (2-253)||(252487-252738)
chr8 (2-253)||(723727-723978)
chr8 (2-253)||(848918-849169)
chr8 (2-253)||(3348577-3348829)
chr8 (2-253)||(3359174-3359426)
chr8 (2-253)||(9341222-9341474)
chr8 (2-253)||(9368366-9368618)
chr8 (2-253)||(32088220-32088471)
chr8 (2-253)||(241902-242153)
chr8 (2-253)||(29076809-29077060)
chr8 (2-253)||(29087060-29087311)
chr8 (2-253)||(32077647-32077898)
chr8 (2-253)||(36078013-36078266)
chr8 (2-253)||(36088599-36088852)
chr8 (2-253)||(6161103-6161355)
chr8 (2-253)||(44481169-44481421)
chr8 (2-253)||(44491785-44492037)
chr8 (1-238)||(7018348-7018583)
chr8 (1-222)||(22135841-22136060)
chr8 (2-251)||(13688519-13688770)
chr8 (2-253)||(43248404-43248647)
chr8 (1-252)||(23370632-23370876)
chr8 (1-185)||(22167042-22167225)
chr8 (1-185)||(22211407-22211590)
chr8 (2-130)||(795257-795384)
chr8 (3-185)||(23271223-23271405)
chr8 (64-240)||(19461090-19461264)
chr8 (64-240)||(19558768-19558942)
chr8 (27-185)||(28903349-28903507)
chr8 (27-185)||(8031923-8032081)
chr8 (6-185)||(40003097-40003277)
chr8 (27-185)||(17519161-17519320)
chr8 (6-182)||(21540820-21540997)
chr8 (5-169)||(15425273-15425437)
chr8 (64-185)||(29379504-29379626)
chr8 (5-169)||(15336208-15336372)
chr8 (5-169)||(15516577-15516741)
chr8 (6-169)||(45568021-45568184)
chr8 (98-169)||(13430748-13430820)
chr8 (98-169)||(45538559-45538631)
chr8 (64-169)||(1237563-1237668)
chr8 (64-169)||(23185346-23185452)
chr8 (98-169)||(36105154-36105226)
chr8 (64-169)||(21932809-21932914)
chr8 (5-169)||(9320436-9320599)
chr8 (98-166)||(14989574-14989643)
chr8 (98-169)||(16207265-16207337)
chr8 (98-169)||(19943194-19943266)
chr8 (98-166)||(18151769-18151839)
chr8 (115-169)||(6407703-6407757)
chr8 (115-169)||(17797399-17797453)
chr8 (84-169)||(22673724-22673809)
chr8 (64-169)||(24551200-24551305)
chr8 (64-169)||(30421549-30421654)
chr8 (64-160)||(18121235-18121331)
chr8 (216-253)||(28691193-28691230)
chr8 (98-169)||(43639741-43639814)
chr8 (138-174)||(26833036-26833072)
chr8 (98-169)||(40845507-40845579)
chr8 (142-174)||(17687986-17688018)
chr8 (98-169)||(21288362-21288434)
chr8 (98-169)||(21300981-21301053)
chr8 (98-169)||(24646297-24646369)
chr8 (98-169)||(24833177-24833248)
chr8 (98-169)||(39693494-39693566)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-253)||(7711-7963)
scaffold0068 (1-253)||(10558-10810)
[»] chr5 (157 HSPs)
chr5 (1-253)||(21705947-21706199)
chr5 (1-253)||(21703100-21703352)
chr5 (1-253)||(19478038-19478290)
chr5 (1-251)||(34062659-34062908)
chr5 (1-249)||(17446668-17446915)
chr5 (1-253)||(19464008-19464260)
chr5 (1-252)||(17457284-17457534)
chr5 (2-253)||(20797732-20797983)
chr5 (2-253)||(43043644-43043895)
chr5 (2-253)||(23406483-23406733)
chr5 (2-253)||(34782893-34783143)
chr5 (2-253)||(36084498-36084748)
chr5 (2-253)||(30069879-30070130)
chr5 (2-253)||(34771948-34772198)
chr5 (9-253)||(10754530-10754773)
chr5 (5-253)||(20551852-20552099)
chr5 (2-253)||(24926113-24926363)
chr5 (2-253)||(24983394-24983644)
chr5 (2-253)||(36228776-36229026)
chr5 (1-251)||(34051998-34052247)
chr5 (1-249)||(106159-106406)
chr5 (22-253)||(43621853-43622084)
chr5 (2-253)||(1109119-1109369)
chr5 (5-253)||(8521878-8522125)
chr5 (2-253)||(1121877-1122127)
chr5 (2-253)||(42395017-42395266)
chr5 (1-249)||(20624805-20625052)
chr5 (2-253)||(31448589-31448841)
chr5 (21-253)||(21414191-21414422)
chr5 (2-253)||(31418698-31418950)
chr5 (2-253)||(22559473-22559725)
chr5 (2-253)||(27622739-27622991)
chr5 (1-253)||(37406692-37406936)
chr5 (2-253)||(5290548-5290800)
chr5 (2-253)||(27603390-27603642)
chr5 (4-253)||(39352524-39352774)
chr5 (1-252)||(20416940-20417189)
chr5 (5-253)||(20562377-20562609)
chr5 (2-253)||(27203829-27204081)
chr5 (2-253)||(31843995-31844247)
chr5 (1-252)||(32753918-32754167)
chr5 (2-253)||(6130825-6131077)
chr5 (2-253)||(7032098-7032352)
chr5 (2-253)||(15993301-15993553)
chr5 (2-253)||(16003863-16004115)
chr5 (2-253)||(22146557-22146809)
chr5 (2-253)||(22157140-22157392)
chr5 (2-253)||(40401055-40401307)
chr5 (2-253)||(9377434-9377686)
chr5 (2-253)||(14557989-14558241)
chr5 (2-253)||(14568626-14568878)
chr5 (2-253)||(23306881-23307133)
chr5 (2-253)||(24816858-24817110)
chr5 (2-253)||(24827446-24827698)
chr5 (2-253)||(36582530-36582782)
chr5 (2-253)||(36593085-36593337)
chr5 (2-253)||(40390393-40390645)
chr5 (2-253)||(5301119-5301376)
chr5 (2-253)||(6975844-6976096)
chr5 (2-253)||(6986334-6986586)
chr5 (2-253)||(9335992-9336243)
chr5 (2-253)||(9346579-9346830)
chr5 (2-253)||(14030080-14030332)
chr5 (2-253)||(14040633-14040885)
chr5 (2-253)||(23296313-23296565)
chr5 (2-253)||(24807949-24808200)
chr5 (2-253)||(39490922-39491174)
chr5 (2-253)||(39502112-39502364)
chr5 (2-253)||(23362146-23362399)
chr5 (2-253)||(15694004-15694255)
chr5 (2-253)||(22676152-22676404)
chr5 (2-253)||(22686043-22686295)
chr5 (2-253)||(23707479-23707730)
chr5 (2-253)||(24567126-24567377)
chr5 (2-249)||(27042184-27042432)
chr5 (2-253)||(27460197-27460449)
chr5 (2-253)||(27470596-27470848)
chr5 (2-253)||(35215541-35215794)
chr5 (2-253)||(35226125-35226378)
chr5 (2-253)||(40513961-40514214)
chr5 (2-253)||(17607097-17607349)
chr5 (2-253)||(17617711-17617963)
chr5 (2-253)||(30227470-30227721)
chr5 (2-253)||(30237997-30238248)
chr5 (2-253)||(31348571-31348823)
chr5 (2-253)||(31359185-31359437)
chr5 (2-253)||(36687732-36687984)
chr5 (2-253)||(36698298-36698550)
chr5 (2-253)||(42042821-42043072)
chr5 (2-253)||(42053396-42053647)
chr5 (2-253)||(14446971-14447224)
chr5 (2-253)||(14457583-14457836)
chr5 (2-253)||(15740003-15740256)
chr5 (2-253)||(15769163-15769416)
chr5 (2-249)||(27052808-27053057)
chr5 (2-253)||(33951772-33952025)
chr5 (2-253)||(37729223-37729476)
chr5 (2-253)||(37740539-37740792)
chr5 (2-249)||(17718958-17719207)
chr5 (2-249)||(17729610-17729859)
chr5 (1-228)||(13533784-13534009)
chr5 (1-240)||(20168115-20168352)
chr5 (3-185)||(36095755-36095936)
chr5 (3-185)||(36097212-36097393)
chr5 (107-253)||(23392753-23392898)
chr5 (1-185)||(13523057-13523240)
chr5 (1-185)||(35543231-35543414)
chr5 (2-253)||(23372547-23372802)
chr5 (2-130)||(31833641-31833769)
chr5 (90-253)||(39362350-39362514)
chr5 (27-185)||(40228553-40228710)
chr5 (27-228)||(13405010-13405209)
chr5 (2-86)||(39364685-39364769)
chr5 (27-185)||(1915311-1915469)
chr5 (27-169)||(11208087-11208229)
chr5 (27-185)||(20215201-20215360)
chr5 (138-253)||(31815199-31815314)
chr5 (6-185)||(23478241-23478421)
chr5 (27-168)||(40032869-40033009)
chr5 (6-182)||(25111966-25112143)
chr5 (6-182)||(25171057-25171234)
chr5 (6-169)||(32160638-32160801)
chr5 (98-169)||(4886985-4887057)
chr5 (64-169)||(15516900-15517004)
chr5 (2-94)||(23696979-23697072)
chr5 (5-169)||(26765370-26765533)
chr5 (5-169)||(28139478-28139642)
chr5 (98-169)||(7745795-7745867)
chr5 (98-169)||(10848736-10848808)
chr5 (98-169)||(33933230-33933302)
chr5 (115-169)||(20550876-20550930)
chr5 (5-169)||(26759021-26759184)
chr5 (98-166)||(30115942-30116011)
chr5 (98-169)||(9088932-9089004)
chr5 (98-169)||(30742944-30743015)
chr5 (64-169)||(33022598-33022699)
chr5 (64-169)||(89524-89629)
chr5 (115-169)||(14086641-14086695)
chr5 (64-169)||(26784284-26784389)
chr5 (115-169)||(42243662-42243715)
chr5 (116-169)||(35932108-35932161)
chr5 (98-169)||(11993851-11993923)
chr5 (98-169)||(13545614-13545686)
chr5 (98-169)||(25096928-25096999)
chr5 (98-169)||(25154898-25154969)
chr5 (98-169)||(29138508-29138580)
chr5 (98-169)||(31117840-31117912)
chr5 (98-169)||(35986334-35986406)
chr5 (140-174)||(16607518-16607552)
chr5 (101-166)||(25930261-25930327)
chr5 (100-169)||(41566536-41566606)
chr5 (98-169)||(3245543-3245615)
chr5 (98-169)||(9398836-9398908)
chr5 (98-169)||(19536403-19536475)
chr5 (98-169)||(21660175-21660247)
chr5 (142-174)||(26119927-26119959)
chr5 (98-169)||(28464441-28464513)
[»] chr4 (107 HSPs)
chr4 (1-253)||(4987358-4987610)
chr4 (2-253)||(10909494-10909745)
chr4 (1-253)||(15207336-15207586)
chr4 (1-253)||(11535931-11536182)
chr4 (1-253)||(24713517-24713767)
chr4 (1-253)||(47152002-47152253)
chr4 (2-253)||(18077828-18078079)
chr4 (1-253)||(5873455-5873706)
chr4 (1-253)||(10695725-10695976)
chr4 (4-253)||(3370803-3371052)
chr4 (4-253)||(31266720-31266968)
chr4 (1-253)||(11515121-11515372)
chr4 (2-253)||(40470510-40470760)
chr4 (4-253)||(3390543-3390792)
chr4 (1-253)||(10300620-10300871)
chr4 (1-253)||(14836026-14836277)
chr4 (1-253)||(19581326-19581577)
chr4 (2-253)||(5022822-5023072)
chr4 (2-253)||(40454271-40454521)
chr4 (6-252)||(18763024-18763269)
chr4 (1-253)||(16317415-16317667)
chr4 (2-253)||(25657222-25657473)
chr4 (6-253)||(18752413-18752659)
chr4 (1-253)||(16305191-16305443)
chr4 (2-253)||(27814867-27815119)
chr4 (1-252)||(49001903-49002152)
chr4 (2-253)||(48371217-48371469)
chr4 (1-252)||(55651410-55651659)
chr4 (2-253)||(52703874-52704126)
chr4 (2-253)||(461243-461495)
chr4 (2-253)||(14843575-14843827)
chr4 (2-253)||(22007097-22007349)
chr4 (2-253)||(30936994-30937246)
chr4 (2-253)||(450662-450914)
chr4 (2-253)||(17918138-17918390)
chr4 (2-253)||(17928786-17929038)
chr4 (2-253)||(19944249-19944501)
chr4 (2-253)||(21996499-21996751)
chr4 (2-253)||(24028007-24028259)
chr4 (2-253)||(30926416-30926668)
chr4 (2-253)||(10751090-10751342)
chr4 (2-253)||(10964859-10965111)
chr4 (2-253)||(15561001-15561253)
chr4 (2-253)||(16255955-16256207)
chr4 (2-253)||(16266548-16266800)
chr4 (2-253)||(36018422-36018674)
chr4 (2-253)||(36028975-36029227)
chr4 (2-253)||(55745174-55745426)
chr4 (2-253)||(55755785-55756037)
chr4 (2-253)||(4948421-4948673)
chr4 (2-253)||(19954884-19955136)
chr4 (2-249)||(49518221-49518469)
chr4 (2-253)||(10740516-10740768)
chr4 (2-253)||(10954285-10954537)
chr4 (2-253)||(24640333-24640586)
chr4 (2-253)||(18130162-18130413)
chr4 (2-253)||(27656686-27656939)
chr4 (2-253)||(27667259-27667512)
chr4 (1-185)||(23509203-23509386)
chr4 (1-240)||(18774613-18774850)
chr4 (3-240)||(18007018-18007252)
chr4 (1-185)||(8997268-8997451)
chr4 (1-185)||(16819364-16819547)
chr4 (4-185)||(33378279-33378461)
chr4 (27-228)||(14778412-14778611)
chr4 (27-228)||(17993763-17993962)
chr4 (27-185)||(14710790-14710947)
chr4 (27-185)||(36210119-36210278)
chr4 (3-125)||(19242114-19242235)
chr4 (98-169)||(1672350-1672422)
chr4 (98-169)||(1674825-1674897)
chr4 (98-169)||(14604985-14605057)
chr4 (140-240)||(19244002-19244101)
chr4 (4-169)||(10692719-10692884)
chr4 (4-169)||(10906485-10906650)
chr4 (98-169)||(6517446-6517518)
chr4 (98-169)||(16853464-16853536)
chr4 (98-169)||(17398752-17398824)
chr4 (98-169)||(22190807-22190879)
chr4 (64-169)||(19884630-19884735)
chr4 (98-169)||(3105497-3105569)
chr4 (98-169)||(9751618-9751690)
chr4 (98-169)||(20977418-20977490)
chr4 (98-169)||(25651182-25651253)
chr4 (98-169)||(37435613-37435685)
chr4 (98-169)||(39419812-39419884)
chr4 (64-166)||(8105566-8105667)
chr4 (110-169)||(29121344-29121403)
chr4 (214-253)||(39526082-39526121)
chr4 (98-163)||(16848508-16848574)
chr4 (98-167)||(40860628-40860698)
chr4 (98-169)||(3395551-3395623)
chr4 (98-169)||(13576192-13576264)
chr4 (98-169)||(38513839-38513911)
chr4 (98-169)||(56533140-56533211)
chr4 (64-169)||(412929-413035)
chr4 (138-169)||(6641686-6641717)
chr4 (99-169)||(16939978-16940049)
chr4 (64-169)||(22675598-22675704)
chr4 (138-169)||(54679932-54679963)
chr4 (64-169)||(10072863-10072968)
chr4 (64-169)||(45833322-45833427)
chr4 (64-169)||(55380218-55380323)
chr4 (138-174)||(10661240-10661276)
chr4 (138-174)||(10875385-10875421)
chr4 (98-169)||(19621139-19621211)
chr4 (98-169)||(23750483-23750555)
[»] chr3 (171 HSPs)
chr3 (3-253)||(13261590-13261839)
chr3 (1-253)||(28169148-28169399)
chr3 (1-253)||(11163895-11164147)
chr3 (2-253)||(24706471-24706722)
chr3 (1-249)||(4456982-4457229)
chr3 (1-253)||(27883450-27883701)
chr3 (1-252)||(4404339-4404589)
chr3 (2-253)||(6500920-6501171)
chr3 (2-253)||(9535676-9535926)
chr3 (2-253)||(16666044-16666294)
chr3 (1-249)||(8740048-8740295)
chr3 (1-253)||(18851609-18851860)
chr3 (2-253)||(6490266-6490517)
chr3 (2-253)||(9380573-9380824)
chr3 (2-253)||(9391119-9391370)
chr3 (2-253)||(11216638-11216889)
chr3 (2-253)||(23635777-23636028)
chr3 (4-249)||(16076999-16077243)
chr3 (2-253)||(7804435-7804685)
chr3 (2-253)||(9993810-9994060)
chr3 (2-253)||(12237531-12237781)
chr3 (2-253)||(12249357-12249607)
chr3 (2-253)||(48337309-48337559)
chr3 (1-253)||(1064205-1064456)
chr3 (1-253)||(1053776-1054027)
chr3 (2-249)||(933695-933941)
chr3 (2-253)||(7794524-7794774)
chr3 (2-253)||(9981802-9982052)
chr3 (1-253)||(8995873-8996124)
chr3 (2-253)||(19887271-19887521)
chr3 (2-253)||(17909919-17910169)
chr3 (2-253)||(29461130-29461380)
chr3 (2-247)||(29471988-29472232)
chr3 (1-253)||(38314765-38315017)
chr3 (1-253)||(9006425-9006676)
chr3 (1-253)||(14581204-14581456)
chr3 (1-249)||(16671083-16671330)
chr3 (1-253)||(1783987-1784240)
chr3 (1-253)||(1794399-1794652)
chr3 (1-249)||(17281354-17281601)
chr3 (4-253)||(16391531-16391780)
chr3 (63-253)||(12567187-12567376)
chr3 (2-253)||(10626858-10627109)
chr3 (2-253)||(10655180-10655431)
chr3 (2-253)||(4174673-4174925)
chr3 (2-253)||(6220618-6220870)
chr3 (2-253)||(13383180-13383432)
chr3 (2-253)||(37885645-37885897)
chr3 (2-253)||(13121729-13121981)
chr3 (2-253)||(13131972-13132224)
chr3 (2-253)||(13372586-13372838)
chr3 (2-253)||(13393774-13394026)
chr3 (2-253)||(14465658-14465910)
chr3 (2-253)||(19778452-19778704)
chr3 (2-253)||(19789089-19789341)
chr3 (2-253)||(23767961-23768213)
chr3 (2-253)||(39672799-39673051)
chr3 (2-253)||(6180444-6180696)
chr3 (2-253)||(14476290-14476542)
chr3 (2-253)||(20683697-20683949)
chr3 (2-253)||(23647815-23648067)
chr3 (2-253)||(23757365-23757617)
chr3 (2-253)||(37759737-37759989)
chr3 (2-253)||(37866512-37866764)
chr3 (63-253)||(15216257-15216446)
chr3 (2-253)||(526450-526702)
chr3 (2-253)||(5579550-5579802)
chr3 (2-253)||(5627934-5628186)
chr3 (2-253)||(5865610-5865862)
chr3 (2-253)||(5876209-5876461)
chr3 (2-253)||(20673112-20673364)
chr3 (2-253)||(20721180-20721432)
chr3 (2-253)||(41683745-41683997)
chr3 (2-253)||(41694314-41694566)
chr3 (1-253)||(13199160-13199412)
chr3 (2-253)||(8774724-8774977)
chr3 (2-253)||(8785309-8785562)
chr3 (2-253)||(504084-504336)
chr3 (1-253)||(2246434-2246684)
chr3 (2-253)||(4743805-4744056)
chr3 (2-253)||(5510763-5511014)
chr3 (2-253)||(5520941-5521192)
chr3 (2-253)||(5536938-5537189)
chr3 (2-253)||(12286895-12287147)
chr3 (2-253)||(12296717-12296969)
chr3 (2-253)||(13557641-13557893)
chr3 (2-253)||(24383435-24383687)
chr3 (2-253)||(24659967-24660219)
chr3 (2-253)||(28314148-28314400)
chr3 (2-253)||(28324764-28325016)
chr3 (2-253)||(35187444-35187696)
chr3 (2-253)||(18484111-18484364)
chr3 (1-253)||(29933476-29933727)
chr3 (1-253)||(29982630-29982881)
chr3 (2-253)||(38194791-38195044)
chr3 (2-253)||(38205327-38205580)
chr3 (2-253)||(4754391-4754641)
chr3 (2-253)||(5547522-5547773)
chr3 (2-253)||(24670547-24670799)
chr3 (2-253)||(39382757-39383010)
chr3 (2-253)||(10099135-10099386)
chr3 (1-253)||(29947263-29947513)
chr3 (1-253)||(29996417-29996667)
chr3 (2-253)||(11272299-11272552)
chr3 (2-253)||(39372120-39372373)
chr3 (1-253)||(29906098-29906348)
chr3 (80-253)||(14321598-14321771)
chr3 (2-253)||(16476345-16476597)
chr3 (1-185)||(15651055-15651238)
chr3 (1-185)||(15662690-15662873)
chr3 (1-228)||(21736177-21736402)
chr3 (3-240)||(27172900-27173135)
chr3 (31-228)||(51989086-51989282)
chr3 (27-185)||(10529243-10529401)
chr3 (138-253)||(16348552-16348667)
chr3 (2-105)||(16386141-16386243)
chr3 (3-222)||(31113935-31114152)
chr3 (1-135)||(17961418-17961551)
chr3 (1-135)||(18006363-18006496)
chr3 (27-185)||(41045640-41045797)
chr3 (6-185)||(15850884-15851065)
chr3 (142-253)||(16493245-16493356)
chr3 (6-185)||(15833281-15833459)
chr3 (6-182)||(51340886-51341063)
chr3 (79-185)||(17021975-17022082)
chr3 (27-185)||(22151142-22151301)
chr3 (6-169)||(45861693-45861856)
chr3 (4-169)||(2561061-2561226)
chr3 (6-182)||(12752727-12752904)
chr3 (6-185)||(13148141-13148321)
chr3 (4-150)||(49990134-49990280)
chr3 (64-169)||(40799807-40799912)
chr3 (5-169)||(5213452-5213615)
chr3 (64-169)||(24775655-24775760)
chr3 (64-169)||(47405542-47405647)
chr3 (98-169)||(25398376-25398448)
chr3 (64-169)||(2784998-2785102)
chr3 (64-169)||(11909145-11909250)
chr3 (115-169)||(12726351-12726405)
chr3 (115-169)||(47207690-47207744)
chr3 (115-169)||(53056848-53056902)
chr3 (101-169)||(21605775-21605844)
chr3 (98-166)||(30054341-30054410)
chr3 (98-169)||(1728136-1728208)
chr3 (98-169)||(6090698-6090770)
chr3 (98-169)||(21636791-21636863)
chr3 (98-169)||(22140730-22140802)
chr3 (115-169)||(11868253-11868307)
chr3 (64-169)||(14955361-14955465)
chr3 (115-169)||(18121743-18121797)
chr3 (115-169)||(18142873-18142927)
chr3 (64-169)||(28582039-28582144)
chr3 (115-169)||(29855393-29855447)
chr3 (64-169)||(33583163-33583267)
chr3 (132-169)||(12388993-12389030)
chr3 (132-169)||(16032526-16032563)
chr3 (140-253)||(16487098-16487211)
chr3 (98-169)||(16658739-16658811)
chr3 (98-169)||(20646120-20646192)
chr3 (98-169)||(38177764-38177836)
chr3 (98-169)||(46796488-46796560)
chr3 (98-169)||(49642883-49642955)
chr3 (98-169)||(49666526-49666598)
chr3 (118-169)||(49553610-49553661)
chr3 (115-169)||(11223548-11223601)
chr3 (64-169)||(20627552-20627657)
chr3 (98-166)||(37412571-37412640)
chr3 (98-169)||(46349965-46350038)
chr3 (98-169)||(9700157-9700229)
chr3 (142-174)||(16880026-16880058)
chr3 (98-169)||(31303352-31303424)
[»] chr7 (123 HSPs)
chr7 (2-253)||(1367682-1367932)
chr7 (2-253)||(15888326-15888576)
chr7 (2-253)||(21769940-21770190)
chr7 (1-253)||(18441248-18441499)
chr7 (5-253)||(19985810-19986058)
chr7 (2-253)||(9171038-9171288)
chr7 (2-253)||(31116508-31116759)
chr7 (1-253)||(40054750-40055002)
chr7 (2-253)||(589265-589515)
chr7 (1-253)||(18419167-18419418)
chr7 (2-253)||(9170237-9170487)
chr7 (2-253)||(14745666-14745917)
chr7 (2-253)||(9159782-9160032)
chr7 (2-253)||(44280549-44280799)
chr7 (2-253)||(3165787-3166037)
chr7 (2-253)||(20491059-20491309)
chr7 (1-253)||(30049570-30049822)
chr7 (1-252)||(26209547-26209796)
chr7 (2-253)||(5685570-5685822)
chr7 (2-253)||(9433315-9433567)
chr7 (2-253)||(541136-541388)
chr7 (2-253)||(9443911-9444163)
chr7 (2-253)||(20989704-20989956)
chr7 (6-253)||(21003005-21003253)
chr7 (1-253)||(3476338-3476588)
chr7 (4-253)||(6867222-6867472)
chr7 (4-253)||(6877854-6878104)
chr7 (2-253)||(467578-467830)
chr7 (2-253)||(11096106-11096358)
chr7 (2-253)||(24930600-24930852)
chr7 (2-253)||(26653322-26653574)
chr7 (2-253)||(26699651-26699903)
chr7 (1-253)||(29590045-29590295)
chr7 (2-253)||(37344251-37344503)
chr7 (2-253)||(454796-455048)
chr7 (2-253)||(2705609-2705861)
chr7 (2-253)||(4222661-4222913)
chr7 (2-253)||(8617437-8617689)
chr7 (2-253)||(8628000-8628252)
chr7 (2-253)||(17950115-17950367)
chr7 (1-252)||(15216369-15216618)
chr7 (2-253)||(2716213-2716465)
chr7 (2-253)||(4212062-4212314)
chr7 (2-253)||(17960721-17960973)
chr7 (2-253)||(48710488-48710740)
chr7 (1-252)||(12734165-12734414)
chr7 (63-253)||(8933634-8933823)
chr7 (63-253)||(38593732-38593921)
chr7 (2-253)||(166933-167185)
chr7 (2-253)||(177525-177777)
chr7 (2-253)||(9085335-9085586)
chr7 (2-253)||(9095049-9095300)
chr7 (2-253)||(11005236-11005488)
chr7 (1-253)||(13682373-13682623)
chr7 (2-253)||(8002061-8002314)
chr7 (2-253)||(8012706-8012959)
chr7 (2-253)||(22089174-22089426)
chr7 (2-253)||(22099789-22100041)
chr7 (2-253)||(26390093-26390345)
chr7 (2-253)||(26400735-26400987)
chr7 (2-253)||(40042106-40042357)
chr7 (2-253)||(40052655-40052906)
chr7 (2-253)||(1987591-1987844)
chr7 (2-253)||(1998212-1998465)
chr7 (2-253)||(42865878-42866131)
chr7 (2-253)||(42876504-42876757)
chr7 (2-253)||(24734804-24735056)
chr7 (2-253)||(24744751-24745003)
chr7 (2-212)||(26294067-26294278)
chr7 (107-253)||(6044208-6044354)
chr7 (1-228)||(24882443-24882668)
chr7 (1-127)||(38403331-38403456)
chr7 (109-253)||(48382304-48382449)
chr7 (27-185)||(8998998-8999155)
chr7 (27-183)||(11087110-11087265)
chr7 (6-165)||(602636-602796)
chr7 (27-185)||(13174668-13174827)
chr7 (98-169)||(30944446-30944518)
chr7 (64-169)||(16112007-16112112)
chr7 (64-169)||(33691835-33691940)
chr7 (64-169)||(48237025-48237130)
chr7 (1-55)||(48382242-48382296)
chr7 (101-169)||(4821440-4821509)
chr7 (98-169)||(21283496-21283568)
chr7 (98-169)||(27871681-27871753)
chr7 (98-169)||(44467027-44467099)
chr7 (64-169)||(9069492-9069597)
chr7 (64-169)||(30945479-30945584)
chr7 (98-169)||(1292993-1293065)
chr7 (98-169)||(4494540-4494612)
chr7 (64-167)||(28622481-28622584)
chr7 (98-169)||(35952811-35952883)
chr7 (83-169)||(21692236-21692322)
chr7 (64-169)||(23280081-23280187)
chr7 (115-169)||(8182911-8182965)
chr7 (115-169)||(24788122-24788176)
chr7 (115-169)||(28409020-28409074)
chr7 (98-166)||(4412088-4412157)
chr7 (132-169)||(14426545-14426582)
chr7 (132-169)||(22578144-22578181)
chr7 (116-169)||(24794838-24794891)
chr7 (98-169)||(331608-331680)
chr7 (98-169)||(2265642-2265713)
chr7 (98-169)||(9709925-9709997)
chr7 (98-169)||(19711136-19711208)
chr7 (98-169)||(41842396-41842468)
chr7 (98-169)||(48806002-48806074)
chr7 (138-169)||(19237166-19237197)
chr7 (83-169)||(21695350-21695436)
chr7 (64-169)||(14193044-14193149)
chr7 (138-167)||(13894123-13894152)
chr7 (132-169)||(14425445-14425482)
chr7 (140-169)||(19339373-19339402)
chr7 (115-168)||(32264842-32264895)
chr7 (98-169)||(2913731-2913803)
chr7 (138-174)||(7488023-7488059)
chr7 (98-169)||(12174464-12174535)
chr7 (98-169)||(13138018-13138090)
chr7 (142-174)||(13172470-13172502)
chr7 (98-169)||(16316680-16316752)
chr7 (98-169)||(29935481-29935553)
chr7 (117-169)||(33605668-33605720)
chr7 (98-165)||(48062947-48063015)
[»] chr1 (118 HSPs)
chr1 (1-253)||(20441277-20441529)
chr1 (1-253)||(18381864-18382115)
chr1 (2-253)||(7689418-7689669)
chr1 (2-253)||(4250525-4250775)
chr1 (2-253)||(39194054-39194304)
chr1 (1-239)||(20195667-20195904)
chr1 (1-253)||(39586964-39587216)
chr1 (1-253)||(9050447-9050699)
chr1 (2-253)||(5973760-5974011)
chr1 (2-253)||(154249-154499)
chr1 (2-253)||(35012918-35013169)
chr1 (1-253)||(47195256-47195508)
chr1 (1-253)||(11195027-11195278)
chr1 (1-253)||(14388086-14388337)
chr1 (2-253)||(23580286-23580538)
chr1 (2-253)||(148174-148424)
chr1 (1-251)||(675442-675690)
chr1 (1-253)||(17957235-17957487)
chr1 (1-252)||(41132577-41132826)
chr1 (2-253)||(19187833-19188086)
chr1 (2-253)||(4167254-4167506)
chr1 (2-253)||(4177910-4178162)
chr1 (4-253)||(18310932-18311180)
chr1 (2-253)||(12730542-12730794)
chr1 (2-253)||(12741135-12741387)
chr1 (2-253)||(12897943-12898195)
chr1 (2-253)||(5639670-5639922)
chr1 (2-253)||(5650227-5650479)
chr1 (2-253)||(21877762-21878014)
chr1 (2-253)||(21895197-21895449)
chr1 (2-253)||(33084557-33084809)
chr1 (2-253)||(10997744-10997996)
chr1 (2-253)||(12614276-12614528)
chr1 (2-253)||(21863656-21863908)
chr1 (2-253)||(19178954-19179207)
chr1 (2-253)||(7507297-7507549)
chr1 (2-253)||(7517894-7518146)
chr1 (2-253)||(12623741-12623993)
chr1 (2-253)||(51629147-51629399)
chr1 (2-253)||(51656408-51656660)
chr1 (2-253)||(2538531-2538782)
chr1 (2-253)||(3171617-3171870)
chr1 (2-253)||(3182219-3182472)
chr1 (2-253)||(5833213-5833466)
chr1 (2-253)||(5843815-5844068)
chr1 (2-253)||(35401124-35401377)
chr1 (2-253)||(35404351-35404604)
chr1 (2-253)||(35648650-35648903)
chr1 (2-253)||(35637998-35638251)
chr1 (2-253)||(38095071-38095324)
chr1 (2-253)||(38105696-38105949)
chr1 (2-253)||(47607890-47608143)
chr1 (2-253)||(47618498-47618751)
chr1 (2-253)||(36236390-36236641)
chr1 (2-253)||(36246937-36247188)
chr1 (109-252)||(12946818-12946961)
chr1 (1-228)||(46180865-46181090)
chr1 (1-185)||(20798935-20799118)
chr1 (1-228)||(22609960-22610185)
chr1 (1-237)||(45070630-45070864)
chr1 (1-185)||(20883910-20884093)
chr1 (1-185)||(23926929-23927112)
chr1 (27-228)||(5929600-5929799)
chr1 (3-228)||(28474100-28474323)
chr1 (31-228)||(44200912-44201108)
chr1 (27-228)||(19037903-19038103)
chr1 (6-185)||(17370917-17371097)
chr1 (27-185)||(28379892-28380049)
chr1 (27-228)||(52350670-52350869)
chr1 (6-184)||(19170360-19170539)
chr1 (27-185)||(20251671-20251828)
chr1 (6-185)||(22655352-22655532)
chr1 (27-185)||(22019232-22019391)
chr1 (64-185)||(22642828-22642950)
chr1 (117-228)||(23064935-23065045)
chr1 (6-166)||(21543904-21544064)
chr1 (98-169)||(1900311-1900383)
chr1 (26-169)||(25448608-25448751)
chr1 (98-169)||(36134156-36134228)
chr1 (64-169)||(22464851-22464956)
chr1 (98-169)||(21702780-21702852)
chr1 (27-185)||(26548282-26548441)
chr1 (98-169)||(35040132-35040204)
chr1 (27-169)||(22600224-22600366)
chr1 (64-169)||(2327482-2327587)
chr1 (115-169)||(22153841-22153895)
chr1 (64-169)||(32785979-32786084)
chr1 (93-169)||(7745132-7745209)
chr1 (98-169)||(19215578-19215650)
chr1 (98-169)||(21135202-21135274)
chr1 (98-169)||(22427399-22427471)
chr1 (98-169)||(30572163-30572235)
chr1 (98-169)||(46088955-46089027)
chr1 (99-169)||(37642215-37642286)
chr1 (98-169)||(39201034-39201104)
chr1 (4-169)||(2266962-2267127)
chr1 (115-169)||(2268515-2268569)
chr1 (64-169)||(10757354-10757459)
chr1 (98-167)||(21121108-21121178)
chr1 (81-146)||(24028751-24028816)
chr1 (98-169)||(14263493-14263566)
chr1 (4-166)||(2834562-2834725)
chr1 (98-169)||(16235338-16235410)
chr1 (98-169)||(23024754-23024826)
chr1 (98-169)||(29215763-29215835)
chr1 (98-169)||(33256393-33256465)
chr1 (98-169)||(33276565-33276637)
chr1 (98-169)||(48570273-48570345)
chr1 (138-169)||(21191907-21191938)
chr1 (135-174)||(23054370-23054409)
chr1 (101-169)||(35401777-35401847)
chr1 (115-169)||(44821587-44821641)
chr1 (116-169)||(21204965-21205017)
chr1 (64-169)||(23036569-23036676)
chr1 (98-166)||(34255561-34255630)
chr1 (64-164)||(38282500-38282600)
chr1 (98-169)||(1577833-1577905)
chr1 (98-169)||(10250952-10251024)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (1-253)||(12072-12323)
scaffold0407 (63-253)||(15903-16092)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (5-253)||(6175-6423)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-253)||(32860-33111)
scaffold0047 (2-253)||(40409-40661)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (2-253)||(54080-54330)
scaffold0028 (2-253)||(14632-14884)
scaffold0028 (98-169)||(5674-5746)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (3-253)||(6842-7092)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (15-249)||(1-235)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (1-253)||(10244-10495)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (2-253)||(2175-2425)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (1-252)||(13565-13815)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-253)||(5344-5595)
scaffold0042 (159-253)||(12896-12990)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (2-253)||(2848-3098)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (2-253)||(42477-42727)
scaffold0133 (2-253)||(31180-31432)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (2-253)||(52058-52313)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-253)||(36691-36943)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (1-253)||(56738-56989)
scaffold0084 (64-148)||(464-548)
scaffold0084 (93-169)||(32447-32524)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (1-253)||(175373-175624)
scaffold0017 (141-253)||(180424-180536)
scaffold0017 (3-185)||(40369-40551)
scaffold0017 (3-185)||(58915-59097)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-253)||(35586-35836)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-204)||(40551-40753)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (2-253)||(6798-7050)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-252)||(15778-16027)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (1-253)||(140853-141104)
scaffold0012 (1-253)||(127695-127945)
scaffold0012 (3-228)||(7632-7856)
scaffold0012 (98-169)||(215569-215641)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (1-240)||(12795-13032)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (2-253)||(12404-12656)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (2-241)||(19290-19538)
scaffold0099 (1-227)||(16912-17153)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (2-253)||(8009-8262)
scaffold0105 (2-253)||(36913-37166)
scaffold0105 (17-253)||(47547-47785)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-240)||(2043-2280)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (95-253)||(8019-8177)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (84-253)||(7362-7530)
scaffold0201 (135-172)||(19137-19174)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (1-185)||(29523-29707)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (3-240)||(697-932)
scaffold0090 (3-240)||(5077-5312)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (1-185)||(58350-58533)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (1-240)||(1869-2106)
scaffold0752 (1-185)||(1254-1437)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (115-253)||(1617-1755)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-185)||(28820-29004)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-185)||(767-950)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-185)||(59316-59498)
scaffold0007 (64-175)||(143031-143142)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (138-253)||(35115-35230)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (27-228)||(61119-61318)
scaffold0005 (98-169)||(212321-212393)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (3-185)||(17861-18044)
scaffold0280 (98-169)||(2802-2874)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (6-185)||(20432-20611)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (27-182)||(5014-5170)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (6-185)||(6577-6757)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (27-185)||(61629-61788)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (64-185)||(11695-11816)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (1-86)||(38120-38205)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (27-185)||(1727-1886)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (27-169)||(7181-7324)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (6-169)||(38157-38319)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (6-185)||(990-1170)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (6-185)||(1183-1363)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-93)||(9907-9999)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (141-253)||(6166-6278)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (6-181)||(16831-17007)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (93-169)||(165018-165095)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (27-169)||(3967-4110)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (141-241)||(4468-4568)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (27-130)||(1116-1218)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (64-169)||(15694-15799)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (98-169)||(7348-7420)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (140-240)||(22050-22149)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (98-169)||(3271-3343)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (98-169)||(17837-17909)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (98-169)||(9122-9194)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (98-169)||(27501-27573)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (98-169)||(25737-25809)
scaffold0056 (115-169)||(34876-34930)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (115-185)||(9281-9352)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (64-169)||(1771-1876)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (98-164)||(2951-3016)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (115-169)||(9954-10008)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (98-169)||(15811-15884)
scaffold0247 (98-169)||(25471-25544)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (64-169)||(1869-1974)
[»] scaffold0774 (1 HSPs)
scaffold0774 (147-228)||(6346-6426)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (138-174)||(379-415)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (98-169)||(14615-14687)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (98-165)||(22643-22711)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (98-169)||(18998-19070)
scaffold0217 (98-169)||(22203-22275)
scaffold0217 (101-169)||(9530-9599)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (98-169)||(1627-1699)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (98-169)||(21043-21115)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (138-174)||(31851-31887)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (98-169)||(211365-211437)
scaffold0004 (138-169)||(244356-244387)
scaffold0004 (98-170)||(377630-377703)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (98-169)||(90127-90199)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (64-169)||(7639-7742)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (115-169)||(36847-36901)
scaffold0120 (115-169)||(42104-42158)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-43)||(16559-16601)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (115-169)||(99277-99331)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (115-169)||(37387-37441)
scaffold0022 (115-169)||(135447-135501)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (132-169)||(727-764)
scaffold1359 (132-169)||(1827-1864)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (216-253)||(2550-2587)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (216-253)||(27001-27038)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (115-167)||(5991-6043)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (98-169)||(9873-9945)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (117-169)||(2763-2815)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (98-169)||(893-964)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (98-169)||(9923-9995)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (98-169)||(1657-1729)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (98-169)||(78438-78510)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (98-169)||(60770-60842)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (98-164)||(84362-84429)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (219-253)||(2390-2424)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (115-169)||(5019-5073)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (220-253)||(19175-19208)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (101-169)||(87672-87741)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (142-174)||(948-980)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (98-169)||(6812-6884)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (142-174)||(10474-10506)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (102-169)||(10180-10248)
scaffold0161 (102-169)||(14844-14912)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (98-169)||(5397-5469)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (138-174)||(144913-144949)


Alignment Details
Target: scaffold0002 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 117147 - 117398
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  117147 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattt-tgc 117245  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  117246 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagcggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 117345  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  117346 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 117398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 475464 - 475305
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 125  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  475464 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgt 475366  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  475365 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 475305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 481984 - 481825
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 125  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  481984 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgt 481886  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  481885 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 481825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 156861 - 156681
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  156861 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggta 156763  T
Q  106 gagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| |||     || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  156762 gagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 156681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 128)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 13913066 - 13913317
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13913066 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 13913164  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  13913165 aggcagagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttatcgaaggacaa 13913264  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13913265 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13913317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11147428 - 11147177
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11147428 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 11147329  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  11147328 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 11147229  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11147228 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11147177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 12827710 - 12827961
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  12827710 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcaaattctgca 12827809  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  12827810 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 12827909  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12827910 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12827961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20030082 - 20029832
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20030082 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 20029983  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20029982 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20029884  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20029883 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20029832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 25787719 - 25787969
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25787719 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 25787818  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  25787819 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 25787917  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25787918 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 25787969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7375936 - 7375686
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  7375936 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgct 7375837  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  7375836 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 7375738  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7375737 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7375686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20062833 - 20062583
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20062833 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 20062734  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20062733 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20062635  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20062634 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20062583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 29765552 - 29765803
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29765552 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 29765650  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29765651 aggcagagctgttgtcttgtctgatagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 29765750  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29765751 gtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29765803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 8653677 - 8653928
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |    
T  8653677 ttcctttgatcatccaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccgttttgaaggaaca-tttctac 8653775  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8653776 aggcatagcttttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 8653875  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8653876 gtattcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8653928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 25986099 - 25986350
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25986099 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaatttattcccatcttgaaggcacaaattctgca 25986198  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  25986199 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 25986298  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25986299 tgctcagtgctattcatatgaccgttggtacctccctttcaattcttcgttc 25986350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18925942 - 18925690
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18925942 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 18925844  T
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18925843 aggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaca 18925744  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18925743 agtactaagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 18925690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27166619 - 27166371
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27166619 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaatt-ctgcagg 27166521  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagta 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  27166520 cagagccgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagtgtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaaggacaagta 27166421  T
Q  204 ctcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27166420 cacagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27166371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18826417 - 18826166
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18826417 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 18826319  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||    
T  18826318 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggataa 18826219  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18826218 gtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18826166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 26044231 - 26044481
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26044231 tcctttgatcattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 26044330  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  26044331 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-agcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 26044429  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26044430 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26044481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 17042638 - 17042890
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17042638 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagtattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgc 17042737  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| | |||||    
T  17042738 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaacgaaagacaa 17042837  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17042838 gtacccagtgctttgcaaaagaccgttgatacctcccttgcaattcttcgttc 17042890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18834813 - 18834562
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18834813 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggaaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 18834715  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  18834714 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 18834615  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18834614 gtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 18834562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 5845101 - 5845325
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  5845101 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaatcggcttcaaattcattcccatcttgaatgaaca-ttcctgc 5845199  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  5845200 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 5845299  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5845300 gtactcagtgctcttcaaatgaccgt 5845325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28251730 - 28251493
Alignment:
Q  15 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  28251730 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 28251631  T
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||    
T  28251630 tcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgttcagagctct 28251532  T
Q  215 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28251531 ccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 28251493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28356877 - 28356640
Alignment:
Q  15 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  28356877 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 28356778  T
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||    
T  28356777 tcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgttcagagctct 28356679  T
Q  215 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28356678 ccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 28356640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16123716 - 16123464
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||     
T  16123716 ttcctttgatcatccaccagtaatactttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattacaatcttgaaggaac-atttatga 16123618  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  16123617 aggcatggatgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggaca 16123518  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16123517 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 16123464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 4292743 - 4292994
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4292743 ttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 4292841  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | |||||||    
T  4292842 aggcagagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggacaa 4292941  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4292942 gtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4292994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 17064211 - 17064463
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17064211 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagtattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgc 17064310  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  || | | |||||    
T  17064311 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacatagtagtggaggtagttgttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaatgaaagacaa 17064410  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17064411 gtacccagtgctttgcaaaagaccgttgatacctcccttgcaattcttcgttc 17064463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9123311 - 9123059
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9123311 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 9123212  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9123211 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9123112  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9123111 gtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 31572431 - 31572678
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  31572431 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgatagaaca-tttctgc 31572529  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||    
T  31572530 aggcatggtcgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtagtttgtcaactctgataacgaaggacaa 31572629  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31572630 atactcagtgcttttcaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttc 31572678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27505959 - 27506212
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27505959 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 27506058  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||||    
T  27506059 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagaca 27506158  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27506159 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17745961 - 17745737
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17745961 ttcctttgattattcaccagtaatgattttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 17745863  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  17745862 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtacacttctactttgtcaactctgataacgaaggacaa 17745763  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17745762 gtactcagtgctcttcaaatgaccgt 17745737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9112674 - 9112422
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  9112674 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattttgca 9112575  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9112574 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9112475  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9112474 gtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9112422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31543077 - 31542825
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  31543077 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 31542978  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  31542977 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 31542878  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31542877 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31542825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27372849 - 27373102
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27372849 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 27372948  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||||    
T  27372949 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagaca 27373048  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27373049 agtgctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27373102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27463199 - 27463452
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27463199 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 27463298  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||||    
T  27463299 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagaca 27463398  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27463399 agtgctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27463452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7751415 - 7751163
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||    
T  7751415 ttcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcacattctgc 7751316  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   |||||    
T  7751315 aggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaa 7751216  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7751215 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7751163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9933850 - 9933599
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  9933850 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgattttggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattccttcctatcttgaaggaaca-tttctgc 9933752  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  9933751 aggcagagttgttgtcttgtcttgtagcatagacagaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaa 9933652  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9933651 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 9933599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22308807 - 22309058
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  22308807 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctttgaggaatcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaata-tttctac 22308905  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||    
T  22308906 aggtagagctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaagaacaa 22309005  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22309006 ttacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 22309058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 12855038 - 12855290
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12855038 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12855137  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  12855138 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 12855237  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12855238 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12855290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 12865564 - 12865816
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12865564 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12865663  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  12865664 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 12865763  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12865764 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12865816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17741881 - 17741635
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17741881 ttcctttgatcatacaccagtaatcttatgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 17741783  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||    
T  17741782 aggcagagatgttgtattgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-ttagagaaggacaa 17741684  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    | || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  17741683 gcacccagtgcttttcaaatgattgttgatacctccctttcaattcttc 17741635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17984889 - 17984637
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17984889 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17984790  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  17984789 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 17984690  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17984689 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17984637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25735732 - 25735486
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25735732 ttgatcatctaccagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 25735634  T
Q  106 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| ||     
T  25735633 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacc 25735535  T
Q  206 cagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25735534 cagtgctttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 25735486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32962108 - 32961856
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32962108 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32962009  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32962008 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32961909  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32961908 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32961856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32972727 - 32972475
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32972727 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32972628  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32972627 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32972528  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32972527 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32972475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 33199345 - 33199597
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  33199345 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcctatcttgaatgtacaaattctgca 33199444  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  33199445 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 33199544  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33199545 gtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcaatttttcgttc 33199597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34807339 - 34807087
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34807339 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 34807240  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  34807239 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 34807140  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34807139 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34807087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34817971 - 34817719
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34817971 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 34817872  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  34817871 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 34817772  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34817771 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34817719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 3661400 - 3661651
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  3661400 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 3661498  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3661499 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3661598  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3661599 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 3661651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 3672064 - 3672315
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  3672064 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 3672162  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3672163 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3672262  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3672263 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 3672315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17982680 - 17982428
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17982680 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctctgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17982581  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  17982580 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 17982481  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17982480 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17982428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25686923 - 25686677
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25686923 ttgatcatccaccagtaatctttttcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 25686825  T
Q  106 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| ||     
T  25686824 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacc 25686726  T
Q  206 cagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25686725 cagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 25686677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 26025476 - 26025728
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26025476 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26025575  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26025576 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26025675  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26025676 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 26025728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 26036050 - 26036302
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26036050 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26036149  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26036150 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26036249  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26036250 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 26036302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 26864805 - 26865057
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  26864805 tcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaatctgca 26864904  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26864905 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26865004  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26865005 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26865057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 26875429 - 26875681
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  26875429 tcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaatctgca 26875528  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26875529 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26875628  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26875629 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26875681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31982805 - 31982557
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31982805 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31982706  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  31982705 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 31982606  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31982605 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 31982557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 16930468 - 16930719
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  16930468 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 16930566  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16930567 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16930666  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16930667 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16930719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 25518707 - 25518956
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||  || | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||     
T  25518707 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgttgtgctatgaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttgaaggaaca-tttctgg 25518805  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  25518806 aggcagagctgttgtcttgtcttgtaacgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 25518904  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  25518905 gcacccagtgcttttcagatgaccgttgata-ctcctttttaattcttcgttc 25518956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 27341711 - 27341959
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27341711 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27341810  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  27341811 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 27341910  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27341911 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27341959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 27402451 - 27402699
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27402451 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27402550  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  27402551 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 27402650  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27402651 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27402699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 27413110 - 27413358
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27413110 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27413209  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  27413210 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 27413309  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27413310 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27413358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 29384769 - 29385020
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  29384769 tcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 29384867  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29384868 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29384967  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29384968 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29385020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4630890 - 4631142
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4630890 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4630989  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4630990 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4631089  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4631090 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4631142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 16959639 - 16959890
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  16959639 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 16959737  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16959738 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16959837  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16959838 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16959890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32301222 - 32300970
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32301222 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32301123  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32301122 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32301023  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32301022 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32300970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32311911 - 32311659
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32311911 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32311812  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32311811 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32311712  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32311711 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32311659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 25675196 - 25675429
Alignment:
Q  19 agtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtctt 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25675196 agtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttgtctt 25675294  T
Q  119 gtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgc-tcttca 217  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || |||||| | ||||    
T  25675295 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgctttttca 25675393  T
Q  218 aatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25675394 aatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 25675429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 25679259 - 25679505
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  25679259 ttgatcatctactagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggaa 25679357  T
Q  106 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| ||     
T  25679358 gagctgatgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacc 25679456  T
Q  206 cagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25679457 cagtgctttttcaaatgaccgttgatacctacctttcaattcttcgttc 25679505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12717014 - 12716761
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  12717014 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 12716915  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  12716914 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 12716815  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12716814 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 12716761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12727663 - 12727410
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  12727663 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 12727564  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  12727563 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 12727464  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12727463 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 12727410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27384450 - 27384701
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  27384450 tcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgca 27384549  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   ||||||    
T  27384550 ggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaag 27384649  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | || ||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  27384650 tgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttc 27384701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27474863 - 27475114
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  27474863 tcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgca 27474962  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   ||||||    
T  27474963 ggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaag 27475062  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | || ||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  27475063 tgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttc 27475114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27504362 - 27504613
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  27504362 tcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgca 27504461  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   ||||||    
T  27504462 ggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaag 27504561  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | || ||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  27504562 tgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttc 27504613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19289559 - 19289322
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19289559 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttggatgtagtcctatgaaggatcgacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 19289461  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  19289460 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 19289362  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19289361 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 19289322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 253
Target Start/End: Original strand, 6158317 - 6158475
Alignment:
Q  95 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  6158317 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgag 6158416  T
Q  195 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| | ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6158417 ggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgttacctccctttcaattcttcgttc 6158475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25723059 - 25722886
Alignment:
Q  79 atcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgt 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  25723059 atcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacatttgtactttgt 25722961  T
Q  179 caactctgttaacgcaggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||| | || | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25722960 caactct-tcaatgaaggacaagtacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 25722886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12953309 - 12953126
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  12953309 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctac 12953211  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12953210 aggcagagctgttatcttgtattgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 12953126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 11205965 - 11206146
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || || |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11205965 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatattgtactatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 11206063  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11206064 gcagagctgttatcttgtgttgtagcatagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 11206146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 11235521 - 11235741
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11235521 ttgatcatccacctgtaatcttttgcctgatttggatattgtcctatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 11235619  T
Q  106 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || | |||||||| ||     
T  11235620 gagctgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaagtagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtaatttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacc 11235718  T
Q  206 cagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  11235719 cagtgcttttcaaatgaacgttg 11235741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 31931440 - 31931664
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  31931440 ttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctaacttgaaggaacaa-ttctgc 31931538  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  ||||||    
T  31931539 aggcagagttgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgagggacaa 31931637  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgtt 227  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||||    
T  31931638 gcacccagtgcttttcaaatgaacgtt 31931664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 18498637 - 18498820
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  || | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18498637 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcttatcttgaaggaacaa-ttctgc 18498735  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18498736 aggcagagctgttattttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 13928341 - 13928456
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13928341 aacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttatcgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 13928440  T
Q  238 tttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||| ||||||||||    
T  13928441 tttcaattcttcgttc 13928456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7586408 - 7586210
Alignment:
Q  28 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 127  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7586408 ttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtag 7586310  T
Q  128 cgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgtt 227  Q
    ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  7586309 cgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgtt 7586211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 18555287 - 18555470
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  18555287 ttccttagatcatccacgagtaaacttttgcctgatttgggtgtagtcctacgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgagggaacaatt-ctgc 18555385  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18555386 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18555470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 21128103 - 21128323
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21128103 ttgatcaatcaccaattatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaagaatcgcattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 21128201  T
Q  106 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 205  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| ||     
T  21128202 gagatgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacc 21128300  T
Q  206 cagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  21128301 cagtgcttttcaaatgaacgttg 21128323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17608579 - 17608401
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17608579 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 17608481  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17608480 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaa-aacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 17608401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 20635595 - 20635775
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  20635595 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-ttgctgcaggca 20635693  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20635694 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20635775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 17047573 - 17047795
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  17047573 cctttgatctttcaccattaaacttttgcctgatttggatgtagtcctttaaagaattaacttaaaattcattcctatcttgaaggaacaa-atctgcag 17047671  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagag-tagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||   ||   | ||||||    
T  17047672 gcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtacatttgtactttgtcaactcttaaaa---aagacaag 17047768  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
     || ||||||| |||||||||||||||    
T  17047769 cacccagtgcttttcaaatgaccgttg 17047795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 22386678 - 22386858
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  || |||| ||||   |||||||||||||| || |||||||||    
T  22386678 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttaaaatccattaatatcttgaaggaaca-ttactgcaggca 22386776  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22386777 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttggtactttgtcaactct 22386858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14051654 - 14051495
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  ||||||| |||||  |  |||||| |||| ||||||||||||    
T  14051654 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaaca-tttctgcaggca 14051556  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 165  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14051555 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtac 14051495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26022972 - 26022881
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa 93  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26022972 tcctttgattattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattaggtttaaattcattcccattttgaaggcacaa 26022881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 29917951 - 29918056
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  |||| |||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29917951 ttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 29918049  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  29918050 tacactt 29918056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 9717777 - 9717882
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9717777 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 9717875  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  9717876 tacactt 9717882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14070335 - 14070176
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||| |||||  ||||||| |||||  |  |||||| |||| ||||||||||||    
T  14070335 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgatgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaaca-tttctgcaggca 14070237  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 165  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14070236 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtac 14070176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Original strand, 5845324 - 5845375
Alignment:
Q  208 gtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttcatctca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5845324 gtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctca 5845375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 15954637 - 15954742
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15954637 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 15954735  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  15954736 tacactt 15954742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 32544199 - 32544304
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32544199 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttg 32544297  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  32544298 tacactt 32544304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 16877180 - 16877252
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877180 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaggcaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16877252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22076589 - 22076517
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22076589 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 22076517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 22802108 - 22802180
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802108 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22802180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14100620 - 14100550
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14100620 tgcatgcagagttgttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14100550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 21235058 - 21235164
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggtt 161  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21235058 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcttc-gcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatcagagtagtggaggtagtggtt 21235156  T
Q  162 gtacactt 169  Q
    ||||||||    
T  21235157 gtacactt 21235164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20488133 - 20488028
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20488133 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 20488035  T
Q  163 tacactt 169  Q
    || ||||    
T  20488034 taaactt 20488028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20730919 - 20730814
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||  || || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20730919 ttcaaatgcattcacattgtgaaggaacatctt-tgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttg 20730821  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  20730820 tacactt 20730814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 12423227 - 12423300
Alignment:
Q  97 ctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12423227 ctgcaggcagagttgtttttcttgtcttatagcggagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 12423300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 13435499 - 13435571
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435499 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 13435571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15531806 - 15531738
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 165  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15531806 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtac 15531738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 16336094 - 16336166
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16336094 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacactt 16336166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 17381488 - 17381560
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17381488 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacactt 17381560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 18435523 - 18435595
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18435523 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactt 18435595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Original strand, 19625816 - 19625852
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19625816 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 19625852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 169
Target Start/End: Original strand, 19623932 - 19624018
Alignment:
Q  83 tgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19623932 tgaaggaaca-ttgctgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 19624018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16265365 - 16265260
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||  || ||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16265365 ttcaaatgcattcccattgcgaaggaacatctt-tgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttg 16265267  T
Q  163 tacactt 169  Q
     ||||||    
T  16265266 cacactt 16265260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 19086092 - 19086197
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19086092 ttcaaattcattccaagtatgaaggaaca-ttgatgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttg 19086190  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  19086191 tacactt 19086197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 21625086 - 21625140
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21625086 tcttgtcttgtagcacggacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 21625140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19066181 - 19066128
Alignment:
Q  116 cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19066181 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 19066128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Original strand, 12348980 - 12349032
Alignment:
Q  117 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12348980 ttgtcttgtagtagggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 12349032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16123183 - 16123143
Alignment:
Q  213 cttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16123183 cttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 16123143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17316707 - 17316635
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17316707 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacactt 17316635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33352108 - 33352036
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33352108 tgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacactt 33352036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 169
Target Start/End: Original strand, 21618252 - 21618283
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618252 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21618283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 15302134 - 15302239
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | | |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  15302134 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcatagctgttatccttgtcttgtagcagagacactaactgagtagtggagatagtggttg 15302232  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  15302233 tacactt 15302239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Original strand, 19482717 - 19482791
Alignment:
Q  96 tctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19482717 tctgcaggcagagctgttattcttgtcttttagtagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 19482791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 26589584 - 26589638
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26589584 tcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 26589638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26972390 - 26972336
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26972390 tcttgtcttgtagcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 26972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32761894 - 32761860
Alignment:
Q  219 atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32761894 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32761860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Original strand, 24116798 - 24116867
Alignment:
Q  101 aggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24116798 aggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 24116867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Original strand, 26943578 - 26943615
Alignment:
Q  132 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26943578 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 26943615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18172171 - 18172139
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18172171 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 18172139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Original strand, 19875844 - 19875876
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19875844 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 19875876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 23284531 - 23284603
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  23284531 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagataatggttatacactt 23284603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Original strand, 25592625 - 25592661
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25592625 aacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 25592661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 108)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 26867113 - 26867364
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26867113 ttcctttgatcatccaccaacaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 26867211  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26867212 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 26867311  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26867312 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatgcttcgttc 26867364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18769093 - 18768842
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18769093 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 18768994  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18768993 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 18768895  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18768894 atactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18768842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27978569 - 27978318
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27978569 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-tttctgc 27978471  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  27978470 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 27978371  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27978370 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27978318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28065098 - 28064847
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28065098 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-tttctgc 28065000  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  28064999 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 28064900  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28064899 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28064847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 26879702 - 26879953
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26879702 ttcctttgatcattcaccagcaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 26879800  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||    
T  26879801 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaatgaaggataa 26879900  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26879901 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26879953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38586274 - 38586022
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38586274 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttctgc 38586176  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  38586175 aggcagagctgttgtcttgtcttttagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactatgttaaagaaggaca 38586076  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38586075 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 38586022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21172652 - 21172402
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21172652 tcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 21172553  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||     
T  21172552 agcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaggacaaa 21172454  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21172453 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21172402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28721502 - 28721252
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28721502 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 28721403  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  28721402 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaga 28721304  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28721303 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28721252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24415209 - 24414958
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24415209 ttcctttgatcattcaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggcacaaattctgc 24415110  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  24415109 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaacgaaggacaa 24415011  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24415010 atactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24414958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28732088 - 28731840
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28732088 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 28731989  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  28731988 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggt--tacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 28731892  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28731891 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28731840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 2561532 - 2561782
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  2561532 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 2561631  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  2561632 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 2561730  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2561731 tgctcagcgctgtccaagtgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 2561782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 967689 - 967440
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  967689 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 967591  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  967590 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 967492  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  967491 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 967440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 29244263 - 29244515
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29244263 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 29244362  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29244363 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29244462  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29244463 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29244515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 29254842 - 29255094
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29254842 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 29254941  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29254942 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29255041  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29255042 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29255094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 24275068 - 24275317
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   || |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24275068 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgacggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 24275166  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  24275167 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 24275265  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24275266 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 24275317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7005994 - 7005742
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  7005994 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 7005895  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  7005894 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 7005795  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7005794 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7005742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17969395 - 17969146
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17969395 ttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 17969297  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||| |    
T  17969296 aggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacga 17969198  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17969197 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 17969146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 43082688 - 43082941
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43082688 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 43082787  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || ||    
T  43082788 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagataa 43082887  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaa-atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082888 gtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43082941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 43093297 - 43093550
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43093297 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 43093396  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  43093397 ggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 43093496  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaa-atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43093497 gtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43093550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17857624 - 17857372
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  17857624 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 17857525  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  17857524 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 17857425  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17857424 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17857372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9897761 - 9897509
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9897761 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9897662  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9897661 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9897562  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9897561 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9897509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9908349 - 9908097
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9908349 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9908250  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9908249 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9908150  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9908149 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9908097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24327921 - 24327669
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  24327921 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 24327822  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24327821 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24327722  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24327721 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36252031 - 36251779
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36252031 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36251932  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36251931 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36251832  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36251831 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36251779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36784984 - 36784740
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36784984 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatttgagggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 36784886  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||       ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  36784885 aggc-------ttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatagcgaaggacaa 36784793  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36784792 gtatccaatgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36784740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22774401 - 22774652
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22774401 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 22774499  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  22774500 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 22774598  T
Q  201 gtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22774599 gcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 22774652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11388996 - 11388744
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11388996 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11388897  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  11388896 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 11388797  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11388796 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11388744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24338591 - 24338339
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  24338591 tcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 24338492  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24338491 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24338392  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |||| |||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24338391 gtgctcaatgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24338339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 40222374 - 40222626
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  40222374 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 40222473  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  40222474 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 40222573  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40222574 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40222626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 40251235 - 40251487
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  40251235 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 40251334  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  40251335 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 40251434  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40251435 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40251487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1099382 - 1099130
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  1099382 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 1099283  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  1099282 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 1099183  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1099182 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1099130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4099825 - 4100077
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4099825 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4099924  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4099925 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4100024  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4100025 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4100077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4220524 - 4220776
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4220524 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4220623  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4220624 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4220723  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4220724 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4220776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9773493 - 9773241
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9773493 tcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9773394  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9773393 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9773294  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9773293 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9773241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 10267035 - 10267287
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10267035 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10267134  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10267135 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10267234  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10267235 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10267287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 10277612 - 10277864
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10277612 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10277711  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10277712 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10277811  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10277812 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10277864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18392824 - 18392572
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  18392824 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 18392725  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  18392724 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 18392625  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18392624 gtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 18392572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22915051 - 22914799
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22915051 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22914952  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22914951 ggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22914852  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22914851 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22914799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 32217915 - 32218167
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32217915 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32218014  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32218015 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32218114  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32218115 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34790404 - 34790152
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34790404 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 34790305  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  34790304 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 34790205  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34790204 gtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34790152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34804547 - 34804295
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34804547 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 34804448  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  34804447 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 34804348  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34804347 gtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34804295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39170282 - 39170030
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  39170282 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 39170183  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  39170182 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 39170083  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39170082 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39170030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4209932 - 4210184
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4209932 tcctttgattatccaccagtgatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4210031  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4210032 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4210131  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4210132 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4210184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9762957 - 9762705
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9762957 tcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9762858  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  9762857 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaa 9762758  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9762757 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9762705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11395359 - 11395107
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11395359 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11395260  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  11395259 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 11395160  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11395159 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 11395107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11405675 - 11405423
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11405675 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11405576  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  11405575 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 11405476  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11405475 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 11405423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21650718 - 21650467
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  21650718 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 21650620  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  21650619 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 21650520  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21650519 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21650467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22960519 - 22960267
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||    
T  22960519 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgagtgtacaaattctgca 22960420  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22960419 ggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22960320  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22960319 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22960267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 34477970 - 34478221
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34477970 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 34478068  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  34478069 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 34478168  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34478169 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34478221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 43355064 - 43355315
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  43355064 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 43355162  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  43355163 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 43355262  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43355263 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43355315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27221422 - 27221675
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  27221422 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 27221521  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  27221522 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 27221621  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27221622 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 27221675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19498177 - 19497940
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19498177 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaattcattcctatcttaaaggaaca-tttctgc 19498079  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  19498078 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagagtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 19497980  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19497979 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 19497940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30489011 - 30488758
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||   | |||| ||||||    
T  30489011 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcgttcccatcttgagttgtacaaattctgc 30488912  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  30488911 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 30488812  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30488811 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30488758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 35253023 - 35253276
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35253023 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35253122  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35253123 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35253222  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35253223 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35253276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 35263632 - 35263885
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35263632 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35263731  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35263732 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35263831  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35263832 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35263885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 35274257 - 35274510
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35274257 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35274356  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35274357 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35274456  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35274457 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35274510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 43345449 - 43345700
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||    
T  43345449 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcatttccatcttgagtgtacaa-ttctgca 43345547  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  43345548 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 43345647  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43345648 gagctcagtgctatccatatatccattgatacctccctttcaattcttcgttc 43345700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 16768984 - 16769195
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  16768984 tcctttgattattcaccagtaatactttgcctgatttgggtgtggtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 16769083  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16769084 ggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16769183  T
Q  201 gtactcagtgct 212  Q
    || |||||||||    
T  16769184 gtgctcagtgct 16769195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22763697 - 22763948
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||| |||   || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22763697 ttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttggatgttctcctatgacggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 22763795  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || | |||||||    
T  22763796 aggtagagctggtgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttatcaactct-tcaatgaaggacaa 22763894  T
Q  201 gtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22763895 gcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 22763948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19300194 - 19299959
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19300194 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggataaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgcag 19300096  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||      
T  19300095 gcagagctgttatcttgtctggtagcgtagacacactcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaaac 19299997  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19299996 acccagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 19299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28374595 - 28374450
Alignment:
Q  108 gctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28374595 gctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactca 28374496  T
Q  208 gtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28374495 gtgctctccaactgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 28374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Original strand, 22779842 - 22780030
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22779842 ttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgt 22779940  T
Q  164 acacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22779941 acacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 22780030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19313201 - 19312966
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  19313201 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatttctatcttgaaggaacaa-ttctgcag 19313103  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||||     
T  19313102 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacactcagagttgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagc 19313004  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||    
T  19313003 acacagtgcttttcaaatgaacgttgaaacatcccttt 19312966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24425629 - 24425487
Alignment:
Q  110 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24425629 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagt 24425531  T
Q  210 gctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24425530 gctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttc 24425487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20646791 - 20646557
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  20646791 cctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgcag 20646693  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||     
T  20646692 gcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaac-aaggacaagc 20646595  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    || ||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||    
T  20646594 acccagtgcttttcaaattaacgttggcacctcccttt 20646557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 19356362 - 19356545
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19356362 ttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 19356460  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19356461 aggcagagctgttaacttgtcttgtaacgaggagacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgccaactct 19356545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24427774 - 24427670
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24427774 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 24427675  T
Q  101 aggca 105  Q
    |||||    
T  24427674 aggca 24427670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 1083884 - 1084061
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1083884 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 1083982  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaac 182  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  1083983 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactttgtactttgtcaac 1084061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24814813 - 24814633
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24814813 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 24814715  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24814714 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 24814633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 22755395 - 22755516
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  22755395 ttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcagacagagctgttatacttgtcttgtagcgcagacaa-aacagagtagtggaagtagtggtcg 22755492  T
Q  163 taca-cttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  22755493 tacaccttgtactttgtcaactct 22755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28711870 - 28711765
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28711870 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttttagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 28711772  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  28711771 tacactt 28711765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31801059 - 31800954
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31801059 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttg 31800961  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  31800960 tacactt 31800954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28551057 - 28550985
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28551057 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 28550985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 33074187 - 33074259
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33074187 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 33074259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6574297 - 6574191
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggtt 161  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6574297 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 6574199  T
Q  162 gtacactt 169  Q
    ||||||||    
T  6574198 gtacactt 6574191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1587171 - 1587100
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1587171 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1587100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21025575 - 21025488
Alignment:
Q  140 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || || |||| ||||||||| |||||    
T  21025575 cagagtcgtggaggaagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccaatgcttttcaaatgaacgttg 21025488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22776427 - 22776355
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22776427 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22776355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22781805 - 22781733
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22781805 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22781733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23392898 - 23392735
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  23392898 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatttctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 23392800  T
Q  106 gagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| || ||||||||||||   |||||    |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23392799 gagctgttatcattgtcttgtagcagagacaaacttagagtaatggaagtagtggttgtacactt 23392735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31328104 - 31328033
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31328104 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31328033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31334825 - 31334754
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31334825 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31968182 - 31968110
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31968182 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 31968110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 22802440 - 22802493
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802440 tcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22802493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28701350 - 28701296
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28701350 tcttgtcttgtagcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacactt 28701296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Original strand, 20568137 - 20568173
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20568137 aacagagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 20568173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22188241 - 22188169
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22188241 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 22188169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 24377062 - 24377134
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24377062 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 24377134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 24575996 - 24576068
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24575996 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 24576068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30557459 - 30557388
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557459 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30557388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 40332048 - 40332120
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40332048 tgcaggcagagctgttatccgtgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacactt 40332120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 44840395 - 44840467
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44840395 tgcaggcagagctggtatccttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 44840467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 162
Target Start/End: Original strand, 6392562 - 6392659
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6392562 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttg 6392659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20152198 - 20152112
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtgg 150  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  20152198 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 20152112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 22317521 - 22317626
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||| |||   || || ||| || ||||||||||||||||||    
T  22317521 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgcagcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttg 22317619  T
Q  163 tacactt 169  Q
    || ||||    
T  22317620 tatactt 22317626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10009889 - 10009820
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10009889 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 10009820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Original strand, 22258162 - 22258231
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22258162 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 38781359 - 38781432
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaac-agagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38781359 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacactt 38781432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13964117 - 13964045
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13964117 tgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 13964045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 14581476 - 14581548
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14581476 tgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacactt 14581548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 19540377 - 19540449
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19540377 tgcaggcagagctgttattcttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 19540449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24440826 - 24440794
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24440826 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 24440794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25037398 - 25037326
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25037398 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 25037326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25041505 - 25041433
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25041505 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 25041433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 30666950 - 30667022
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30666950 tgcaggcagcgctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 30667022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34322075 - 34322003
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||    |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34322075 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaaacaaaaatagagtagtgaagatagtggttgtacactt 34322003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39037781 - 39037709
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| ||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39037781 tgcaggcatagctgttatccttgtcatgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 39037709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 41121817 - 41121789
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41121817 aacagagtagtggaggtagtggttgtaca 41121789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 99)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 18153814 - 18154064
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  18153814 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattt--gc 18153911  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18153912 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 18154011  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18154012 gtactcagtgctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18154064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 18158333 - 18158584
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18158333 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 18158431  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  18158432 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagagtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactccgttaacgaaggacaa 18158531  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18158532 gtactcagttctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18158584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18769340 - 18769088
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18769340 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 18769241  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18769240 aggcatagctgttgtcttatcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 18769141  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18769140 atactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctgtcaattcttcgttc 18769088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 16747079 - 16747330
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  16747079 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccatcttgaaggcacaaattctgc 16747178  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16747179 aggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 16747277  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16747278 atactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16747330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19225013 - 19225263
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19225013 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgttgtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 19225112  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  19225113 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 19225211  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19225212 tgctcagcgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19225263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19418431 - 19418681
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19418431 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 19418530  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  19418531 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaa 19418629  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19418630 tactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19418681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23457505 - 23457255
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23457505 tcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 23457406  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  23457405 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaa 23457307  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23457306 tactcagtgctatccaaatgaccattgatacctccctttcaattcttggttc 23457255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23469662 - 23469411
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23469662 tcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 23469563  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  23469562 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaa 23469463  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23469462 tactcagtgctatccaaatgaccattgatacctccctttcaattcttggttc 23469411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19429006 - 19429258
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19429006 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 19429105  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  19429106 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaa 19429205  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19429206 atactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19429258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30314897 - 30314647
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30314897 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 30314798  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  30314797 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 30314699  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30314698 tgctaagcgctatccaaatgaccgttggtacctccctttcaattcttcgttc 30314647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20161430 - 20161180
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  20161430 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 20161331  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20161330 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20161232  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20161231 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 20161180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 20196037 - 20196287
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  20196037 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 20196136  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20196137 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20196235  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20196236 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 20196287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Original strand, 31215097 - 31215344
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||    
T  31215097 tttgatcatccaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattatgcaggc 31215196  T
Q  105 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 204  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |    
T  31215197 atagctgttgtcttgtcttatagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaaatgc 31215296  T
Q  205 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31215297 tcagtgct-atcaaatgacagttgatacctccctttcaattcttcgttc 31215344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40213372 - 40213120
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40213372 ttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttctgc 40213274  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  40213273 aggcatgactgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggaca 40213174  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40213173 agtacgcagtgctcttcaaacggccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 40213120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 3843601 - 3843850
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3843601 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 3843699  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  3843700 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 3843798  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3843799 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 3843850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6318718 - 6318467
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||    
T  6318718 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaggacacaaattatgca 6318619  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  6318618 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgagggacaaa 6318519  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  6318518 tgctcagtgctatccatatgaccgttggtacatccctttcaattcttcgttc 6318467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30325453 - 30325227
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30325453 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 30325354  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  30325353 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 30325255  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttga 229  Q
    | || || ||| | ||||||||||||||    
T  30325254 tgctaagcgctatccaaatgaccgttga 30325227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 1750193 - 1750423
Alignment:
Q  23 atcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtct 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1750193 atcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgttttgtct 1750292  T
Q  123 tgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatga 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| | |||||||    
T  1750293 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatga 1750392  T
Q  223 ccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1750393 ccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 1750423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 3220710 - 3220962
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3220710 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 3220809  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3220810 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3220909  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3220910 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacttccctttcaattcttcgttc 3220962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19139358 - 19139610
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19139358 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 19139457  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19139458 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19139557  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19139558 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19139610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19128826 - 19129078
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19128826 tcctttgattatccaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 19128925  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19128926 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19129025  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19129026 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19129078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15780912 - 15780660
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  15780912 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 15780813  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15780812 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15780713  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15780712 gtactcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 15780660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 26120988 - 26121240
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26120988 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaatttattcccatcttgaacgtacaaattctgca 26121087  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26121088 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26121187  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26121188 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26121240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15791501 - 15791249
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  15791501 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 15791402  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15791401 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15791302  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15791301 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 15791249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 18449448 - 18449700
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||    
T  18449448 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccattttgagtgtacaaattctgca 18449547  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  18449548 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 18449647  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18449648 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18449700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20259819 - 20259570
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20259819 ttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 20259721  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || | |||||||    
T  20259720 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactct-tcaatgaaggacaa 20259622  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20259621 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 20259570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21046449 - 21046200
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21046449 ttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 21046351  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || | |||||||    
T  21046350 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactct-tcaatgaaggacaa 21046252  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21046251 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 21046200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 6151148 - 6151400
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6151148 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6151247  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  6151248 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 6151347  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6151348 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccatttcaattcttcgttc 6151400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9856674 - 9856422
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9856674 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9856575  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9856574 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9856475  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9856474 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 9856422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 26111310 - 26111562
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26111310 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 26111409  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26111410 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggttgtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26111509  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26111510 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattcttcgttc 26111562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 36292997 - 36293249
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36292997 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36293096  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36293097 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36293196  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36293197 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36293249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 36303600 - 36303852
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36303600 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36303699  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36303700 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36303799  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36303800 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36303852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6576712 - 6576470
Alignment:
Q  12 atccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctg 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||  ||||    
T  6576712 atccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctg 6576613  T
Q  112 ttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtg 210  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| | |||||||    
T  6576612 ttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaaatgctcagtg 6576513  T
Q  211 ctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6576512 ctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6576470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 210355 - 210104
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  210355 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 210257  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  210256 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 210157  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  210156 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 210104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 252487 - 252738
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  252487 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 252585  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  252586 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 252685  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  252686 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 252738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 723978 - 723727
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  723978 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 723880  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  723879 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 723780  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  723779 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 849169 - 848918
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  849169 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 849071  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  849070 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 848971  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  848970 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 848918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3348829 - 3348577
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  3348829 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 3348730  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3348729 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3348630  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3348629 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 3348577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3359426 - 3359174
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  3359426 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 3359327  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3359326 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3359227  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3359226 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 3359174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9341222 - 9341474
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9341222 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9341321  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9341322 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9341421  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9341422 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 9341474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9368366 - 9368618
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9368366 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9368465  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9368466 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9368565  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9368566 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 9368618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32088471 - 32088220
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  32088471 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 32088373  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  32088372 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 32088273  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32088272 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32088220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 241902 - 242153
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  241902 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 242000  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  242001 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 242100  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  242101 gagctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttc 242153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 29076809 - 29077060
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  29076809 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 29076907  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29076908 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29077007  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29077008 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29077060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 29087060 - 29087311
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  29087060 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 29087158  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29087159 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29087258  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29087259 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29087311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32077898 - 32077647
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  32077898 tcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 32077800  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  32077799 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 32077700  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32077699 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32077647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 36078013 - 36078266
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  36078013 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 36078112  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  36078113 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 36078212  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36078213 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36078266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 36088599 - 36088852
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  36088599 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 36088698  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  36088699 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 36088798  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36088799 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36088852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 6161103 - 6161355
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6161103 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6161202  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  | |||||| |||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  6161203 ggcatggttgttgttttgttttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 6161302  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6161303 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccatttcaattcttcgttc 6161355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 44481169 - 44481421
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  44481169 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 44481268  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  44481269 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 44481368  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44481369 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 44481421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 44491785 - 44492037
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  44491785 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 44491884  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  44491885 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 44491984  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44491985 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 44492037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7018583 - 7018348
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7018583 ttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 7018485  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  7018484 aggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 7018386  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 238  Q
      || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  7018385 acacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctccct 7018348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22136060 - 22135841
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22136060 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa-ttctgc 22135962  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  | ||||    
T  22135961 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tgaacgaggtacaa 22135863  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatga 222  Q
    | || ||||||| |||||||||    
T  22135862 gcacccagtgcttttcaaatga 22135841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13688770 - 13688519
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  13688770 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 13688671  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  13688670 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 13688571  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgt 251  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13688570 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgt 13688519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 43248404 - 43248647
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43248404 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 43248503  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  43248504 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacaga---------gtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 43248594  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43248595 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43248647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 23370632 - 23370876
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||  || | |||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  23370632 ttcctttgatcatccaccagtaatctttttcctgatttgggtgtagtcctacgaaggatcaactttgaattcattcctatcttaaaggaaca-tttctgt 23370730  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  23370731 aggcagaggtgttgtcttgtcttgtag-----acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaa 23370824  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  23370825 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttggtacctcccttttaattcttcgtt 23370876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22167225 - 22167042
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22167225 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa-ttctgc 22167127  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22167126 aggcaaagctgttatcttatcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22167042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22211590 - 22211407
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22211590 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 22211492  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22211491 aggcagggctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22211407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 795257 - 795384
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  795257 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 795355  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 130  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  795356 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgt 795384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23271405 - 23271223
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23271405 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 23271307  T
Q  103 gcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23271306 gcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaggcagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23271223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Original strand, 19461090 - 19461264
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 163  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  19461090 ttcaaatctattcctatattgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttatagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgt 19461188  T
Q  164 acacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    || ||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19461189 actcttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 19461264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Original strand, 19558768 - 19558942
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 163  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  19558768 ttcaaatctattcctatattgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttatagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgt 19558866  T
Q  164 acacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    || ||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19558867 actcttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 19558942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 28903349 - 28903507
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28903349 tttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 28903447  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28903448 agcgtagacaa-aacagagtagtggagctagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 28903507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 8031923 - 8032081
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  8031923 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaagcagagctgtttatcttgtcttgt 8032021  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8032022 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 8032081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 40003097 - 40003277
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||| |||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40003097 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgttgtcctaagaagaattacgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgcaggca 40003195  T
Q  106 gagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  40003196 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacagtcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 40003277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17519320 - 17519161
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  17519320 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggaagagctgtttttcttgtcttgt 17519222  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  17519221 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgttaactct 17519161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 21540820 - 21540997
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  21540820 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttatgcaggca 21540918  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaac 182  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  21540919 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 21540997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15425437 - 15425273
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||    
T  15425437 tttgatcattcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggc 15425339  T
Q  105 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425338 atagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15425273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 29379504 - 29379626
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  29379504 ttcaaatccattcctatcctgaaggaaca-tttctgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttg 29379602  T
Q  163 tacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| || ||||| |||||||||    
T  29379603 tacactttctactttgtcaactct 29379626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15336372 - 15336208
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||    
T  15336372 tttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggc 15336274  T
Q  105 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15336273 atagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15336208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15516741 - 15516577
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||    
T  15516741 tttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggc 15516643  T
Q  105 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516642 atagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15516577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45568184 - 45568021
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  45568184 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggca 45568086  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45568085 gagctgtttttcttgtcttatagcgtagacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacactt 45568021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13430820 - 13430748
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13430820 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 13430748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45538631 - 45538559
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538631 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 45538559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 1237563 - 1237668
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1237563 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttctcttgtagcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttg 1237661  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  1237662 tacactt 1237668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23185452 - 23185346
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt--cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggtt 161  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||| ||||||||| |  |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23185452 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggaagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggtt 23185354  T
Q  162 gtacactt 169  Q
    ||||||||    
T  23185353 gtacactt 23185346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 36105154 - 36105226
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36105154 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 36105226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 21932809 - 21932914
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  21932809 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttg 21932907  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  21932908 tacactt 21932914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 9320436 - 9320599
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| ||| |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  ||||| |||| | | ||||| |    
T  9320436 tttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttgttgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagaaacattgt-tgcagtc 9320534  T
Q  105 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320535 acagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9320599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14989643 - 14989574
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14989643 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 14989574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 16207265 - 16207337
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16207265 tgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 16207337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 19943194 - 19943266
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943194 tgcaggcagagctggttttcttgtcttgtaggagagaccaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19943266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18151839 - 18151769
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt--cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18151839 tgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 18151769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 6407703 - 6407757
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6407703 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 6407757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 17797399 - 17797453
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17797399 tcttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17797453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 22673724 - 22673809
Alignment:
Q  84 gaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22673724 gaaggaacaatgt-tgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 22673809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 24551200 - 24551305
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | || ||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24551200 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 24551298  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  24551299 tacactt 24551305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30421654 - 30421549
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||||||| | | |||||| ||||||||| | |||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30421654 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaaca-tctatgcaggaagagctgtttttcttgtcttgttgcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 30421556  T
Q  163 tacactt 169  Q
    || ||||    
T  30421555 taaactt 30421549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18121331 - 18121235
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggt 160  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  18121331 ttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt 18121235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 253
Target Start/End: Original strand, 28691193 - 28691230
Alignment:
Q  216 caaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28691193 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28691230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 43639741 - 43639814
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43639741 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 43639814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Original strand, 26833036 - 26833072
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26833036 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttatact 26833072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40845579 - 40845507
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | ||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40845579 tgcaggcagagttgtttttcttctcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 40845507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Original strand, 17687986 - 17688018
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17687986 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 17688018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 21288362 - 21288434
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||   || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21288362 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcaaagtagtggaagtagtggttgtacactt 21288434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 21300981 - 21301053
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||   |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21300981 tgcaggcagagcagttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 24646297 - 24646369
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24646297 tgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 24646369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24833248 - 24833177
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24833248 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacagagacaa-aatagagtaatggaggtagtggttgtacactt 24833177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 39693494 - 39693566
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39693494 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 39693566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7963 - 7711
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7963 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 7864  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7863 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 7764  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7763 atactcagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10810 - 10558
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10810 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 10711  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10710 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 10611  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10610 atacttagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 157)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 21705947 - 21706199
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21705947 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 21706046  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21706047 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 21706146  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21706147 atactcagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21706199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 21703100 - 21703352
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21703100 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 21703199  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21703200 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 21703299  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21703300 atacttagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21703352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19478290 - 19478038
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19478290 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 19478191  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19478190 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 19478091  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19478090 atactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19478038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34062908 - 34062659
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  34062908 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-tttctgc 34062810  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34062809 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 34062710  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgt 251  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34062709 gtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgt 34062659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17446668 - 17446915
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17446668 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-tttctgc 17446766  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17446767 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 17446866  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17446867 gtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 17446915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19464260 - 19464008
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19464260 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 19464161  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  19464160 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaacgaaggacaa 19464061  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19464060 atactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19464008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 17457284 - 17457534
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17457284 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-tttctgc 17457382  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17457383 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 17457482  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17457483 gtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 17457534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20797983 - 20797732
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20797983 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 20797884  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20797883 ggcatagctgttgtcttgtcttgcagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20797784  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20797783 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20797732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 43043644 - 43043895
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43043644 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 43043743  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  43043744 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 43043843  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43043844 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43043895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23406733 - 23406483
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23406733 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 23406634  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  23406633 ggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 23406535  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23406534 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 23406483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34783143 - 34782893
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34783143 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 34783044  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  34783043 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 34782945  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34782944 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34782893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36084748 - 36084498
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36084748 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 36084649  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  36084648 ggcatagctgttgtcttgtcatgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 36084550  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36084549 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36084498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 30069879 - 30070130
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30069879 tcctttgatcatccaccagtaatcctatgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 30069978  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  30069979 ggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtcaacgaaggacaaa 30070078  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30070079 tgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30070130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34772198 - 34771948
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34772198 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 34772099  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  34772098 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 34772000  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34771999 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34771948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10754773 - 10754530
Alignment:
Q  9 atcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  10754773 atcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatag 10754674  T
Q  109 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  10754673 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacaaatgctcag 10754575  T
Q  209 tgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10754574 agctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10754530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20552099 - 20551852
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  20552099 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgcaggc 20552000  T
Q  105 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20551999 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatac 20551901  T
Q  205 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20551900 tcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 20551852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24926113 - 24926363
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24926113 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 24926212  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  24926213 ggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 24926311  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24926312 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccttttcaattcttcgttc 24926363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24983394 - 24983644
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24983394 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 24983493  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||     
T  24983494 ggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaaa 24983592  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24983593 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24983644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36229026 - 36228776
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36229026 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 36228927  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  36228926 ggcatagctgttgtcttgtcttgtggcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 36228828  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36228827 tactcagtgttatccaaatgaccgttgatacctcccttacaattcttcgttc 36228776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34052247 - 34051998
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  34052247 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccaacttgaaggaaca-tttctgc 34052149  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  34052148 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaa 34052049  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgt 251  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34052048 gtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgt 34051998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 106406 - 106159
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  106406 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctac 106308  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  106307 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 106208  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  106207 gtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 106159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 253
Target Start/End: Original strand, 43621853 - 43622084
Alignment:
Q  22 aatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43621853 aatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtc 43621952  T
Q  122 ttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttc-aaat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||    
T  43621953 ttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaaat 43622051  T
Q  221 gaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43622052 gaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43622084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 1109119 - 1109369
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  1109119 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 1109218  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  1109219 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 1109317  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1109318 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 1109369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8522125 - 8521878
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8522125 tttgatcattcactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggc 8522026  T
Q  105 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |      
T  8522025 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaaatga 8521927  T
Q  205 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8521926 tcagcgctatccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 8521878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 1121877 - 1122127
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  1121877 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 1121976  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  1121977 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 1122075  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  1122076 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgatacattcctttcaattcttcgttc 1122127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 42395266 - 42395017
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  42395266 tcctttgatcattcaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccatcttgaaggcacaaattctgca 42395167  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  42395166 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaa-aacaga-tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 42395069  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42395068 tgctcagcgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 42395017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20625052 - 20624805
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20625052 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-tttctgc 20624954  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  20624953 aggcatagctgttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttatcaactctgataacgaaggacaa 20624854  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20624853 gtacccagtgcctttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 20624805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31448841 - 31448589
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31448841 tcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 31448742  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  31448741 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaaccaaggacaa 31448642  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31448641 atgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31448589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 21414191 - 21414422
Alignment:
Q  21 taatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgt 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21414191 taatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttgtcttgt 21414289  T
Q  121 cttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaat 220  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  21414290 cttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaac 21414389  T
Q  221 gaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21414390 gaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21414422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31418950 - 31418698
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  31418950 tcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgca 31418851  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31418850 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 31418751  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     | |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31418750 atgctcaatgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31418698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22559725 - 22559473
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22559725 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 22559626  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  22559625 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 22559526  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |||||||||   || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22559525 gtgctcagtgctaaccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22559473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27622739 - 27622991
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  27622739 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 27622838  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27622839 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27622938  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27622939 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27622991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37406936 - 37406692
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37406936 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattaattctcatcttgaaggaacaatt-ctgc 37406838  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  37406837 aggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 37406738  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37406737 gtactcagtgtt-------tgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37406692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5290548 - 5290800
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||    
T  5290548 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattaccatcttgaacgtacaacttctgca 5290647  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5290648 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5290747  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5290748 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5290800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27603390 - 27603642
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  27603390 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 27603489  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27603490 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27603589  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27603590 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27603642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39352774 - 39352524
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  39352774 ctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcagg 39352675  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||    
T  39352674 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagt 39352575  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39352574 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39352524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20417189 - 20416940
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||  || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  20417189 ttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttagatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctctcttgaaggaaca-tttctgc 20417091  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  20417090 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 20416992  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20416991 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgtt 20416940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20562609 - 20562377
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||               |    
T  20562609 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg---------------c 20562525  T
Q  105 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 204  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||    
T  20562524 atagctgttgtcttgtcttgtagcatggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatac 20562426  T
Q  205 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20562425 tcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20562377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27204081 - 27203829
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27204081 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27203982  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27203981 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27203882  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27203881 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27203829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31844247 - 31843995
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31844247 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31844148  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  31844147 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 31844048  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31844047 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31843995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 32753918 - 32754167
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32753918 ttcctttgatcatctaccattaatctttttcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 32754016  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||| |    
T  32754017 aggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacga 32754115  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32754116 gcatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 32754167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6131077 - 6130825
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6131077 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6130978  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  6130977 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 6130878  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6130877 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6130825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 7032098 - 7032352
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  7032098 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 7032197  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac---aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggac 198  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||    
T  7032198 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagac 7032297  T
Q  199 aagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7032298 aagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctctcaattcttcgttc 7032352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 15993301 - 15993553
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  15993301 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 15993400  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15993401 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagattagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15993500  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15993501 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15993553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 16003863 - 16004115
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  16003863 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 16003962  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16003963 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16004062  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16004063 gtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16004115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22146809 - 22146557
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22146809 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22146710  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22146709 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22146610  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22146609 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22146557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22157392 - 22157140
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22157392 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22157293  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22157292 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22157193  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22157192 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22157140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40401307 - 40401055
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40401307 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 40401208  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||   |||||    
T  40401207 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatttacgagagacaa 40401108  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40401107 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40401055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9377434 - 9377686
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9377434 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9377533  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9377534 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9377633  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9377634 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9377686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 14557989 - 14558241
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14557989 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14558088  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14558089 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14558188  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14558189 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14558241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 14568626 - 14568878
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14568626 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14568725  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14568726 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14568825  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14568826 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14568878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23307133 - 23306881
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23307133 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23307034  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23307033 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23306934  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23306933 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23306881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24816858 - 24817110
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24816858 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24816957  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24816958 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24817057  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24817058 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24817110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24827446 - 24827698
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24827446 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24827545  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24827546 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24827645  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24827646 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24827698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 36582530 - 36582782
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  36582530 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 36582629  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36582630 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36582729  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  |||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36582730 gtggtcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 36582782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 36593085 - 36593337
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  36593085 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 36593184  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36593185 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36593284  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  |||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36593285 gtggtcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 36593337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40390645 - 40390393
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40390645 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 40390546  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||   |||||    
T  40390545 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatttacgagagacaa 40390446  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     | || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40390445 ttgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40390393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5301119 - 5301376
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||     
T  5301119 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgct 5301218  T
Q  102 ggcagagctg-----ttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 195  Q
    ||||  ||||     ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||       
T  5301219 ggcatggctgttgtcttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcagctctattaacgaga 5301318  T
Q  196 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     |||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5301319 aacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5301376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6976096 - 6975844
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6976096 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6975997  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6975996 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6975897  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6975896 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 6975844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6986586 - 6986334
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6986586 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6986487  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6986486 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6986387  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6986386 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 6986334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9336243 - 9335992
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  9336243 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 9336145  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9336144 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9336045  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9336044 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9335992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9346830 - 9346579
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  9346830 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 9346732  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9346731 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9346632  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9346631 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9346579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14030332 - 14030080
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14030332 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14030233  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14030232 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14030133  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14030132 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 14030080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14040885 - 14040633
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14040885 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14040786  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14040785 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14040686  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14040685 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 14040633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23296565 - 23296313
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23296565 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23296466  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23296465 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23296366  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23296365 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23296313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24808200 - 24807949
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  24808200 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 24808102  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24808101 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24808002  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24808001 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24807949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 39490922 - 39491174
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  39490922 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 39491021  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  39491022 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 39491121  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39491122 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 39491174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 39502112 - 39502364
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  39502112 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 39502211  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  39502212 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 39502311  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39502312 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 39502364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23362399 - 23362146
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttt-gaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  23362399 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgc 23362300  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  23362299 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 23362200  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | ||  |   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23362199 agtgctcagtgctatccatttattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23362146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 15694004 - 15694255
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  15694004 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 15694102  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15694103 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15694202  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15694203 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15694255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22676404 - 22676152
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22676404 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22676305  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  22676304 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 22676205  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |   |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22676204 gagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 22676152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22686295 - 22686043
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22686295 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22686196  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  22686195 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 22686096  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |   |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22686095 gagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 22686043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23707730 - 23707479
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  23707730 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 23707632  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23707631 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23707532  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23707531 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23707479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24567377 - 24567126
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  24567377 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 24567279  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24567278 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24567179  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24567178 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24567126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 27042184 - 27042432
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27042184 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27042283  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  27042284 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 27042383  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27042384 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27042432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27460449 - 27460197
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27460449 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27460350  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27460349 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27460250  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27460249 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattctttgttc 27460197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27470848 - 27470596
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27470848 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27470749  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27470748 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27470649  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27470648 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattctttgttc 27470596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35215794 - 35215541
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35215794 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35215695  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35215694 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35215595  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215594 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35215541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35226378 - 35226125
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35226378 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35226279  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35226278 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35226179  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35226178 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35226125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 40513961 - 40514214
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  40513961 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 40514060  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  40514061 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 40514160  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40514161 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 40514214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17607349 - 17607097
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17607349 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17607250  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  17607249 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 17607150  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17607149 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17607097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17617963 - 17617711
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17617963 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17617864  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  17617863 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 17617764  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17617763 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17617711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 30227470 - 30227721
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  30227470 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 30227568  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  30227569 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 30227668  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30227669 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30227721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 30237997 - 30238248
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  30237997 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 30238095  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  30238096 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 30238195  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30238196 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30238248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31348823 - 31348571
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31348823 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31348724  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  31348723 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 31348624  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31348623 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31359437 - 31359185
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31359437 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31359338  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  31359337 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 31359238  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31359237 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31359185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36687984 - 36687732
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36687984 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36687885  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36687884 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36687785  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36687784 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36687732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36698550 - 36698298
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36698550 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36698451  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36698450 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36698351  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36698350 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36698298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 42043072 - 42042821
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  42043072 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 42042974  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  42042973 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 42042874  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42042873 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 42042821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 42053647 - 42053396
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  42053647 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 42053549  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  42053548 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 42053449  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42053448 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 42053396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 14446971 - 14447224
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  14446971 tcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 14447070  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  14447071 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 14447170  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14447171 agtgctcagtgctttccatatgtccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 14447224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 14457583 - 14457836
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  14457583 tcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 14457682  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  14457683 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 14457782  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14457783 agtgctcagtgctttccatatgtccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 14457836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15740256 - 15740003
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  15740256 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 15740157  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  15740156 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 15740057  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15740056 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15740003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15769416 - 15769163
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  15769416 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 15769317  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  15769316 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 15769217  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15769216 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15769163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 27052808 - 27053057
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27052808 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27052907  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgt-acacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  27052908 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgtaacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 27053007  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27053008 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27053057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 33951772 - 33952025
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  33951772 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 33951871  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
     ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  33951872 gggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 33951971  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33951972 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 33952025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 37729223 - 37729476
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  37729223 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 37729322  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  37729323 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 37729422  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37729423 agtgcaaagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37729476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 37740539 - 37740792
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  37740539 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 37740638  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  37740639 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 37740738  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37740739 agtgcaaagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37740792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17719207 - 17718958
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  17719207 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 17719108  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  17719107 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 17719008  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    ||| |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17719007 agtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 17718958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17729859 - 17729610
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  17729859 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 17729760  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  17729759 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 17729660  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    ||| |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17729659 agtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 17729610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13533784 - 13534009
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13533784 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 13533882  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  ||||||    
T  13533883 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgagggacaa 13533981  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||    
T  13533982 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 13534009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20168352 - 20168115
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  20168352 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgagggaacaa-ttctgc 20168254  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  20168253 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 20168155  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20168154 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 20168115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36095936 - 36095755
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36095936 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattt-tgcag 36095838  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36095837 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 36095755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36097393 - 36097212
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36097393 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattt-tgcag 36097295  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36097294 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 36097212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23392898 - 23392753
Alignment:
Q  107 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23392898 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactc 23392800  T
Q  207 agtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23392799 agtgctatccaaatgacctttgatacctcccttttaattcttcgttc 23392753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 13523057 - 13523240
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13523057 ttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaagatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 13523155  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13523156 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 13523240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35543414 - 35543231
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  35543414 ttcctttgatcatccacaagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcatatcttgaaggaacaa-ttctgc 35543316  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35543315 aggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtcgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 35543231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23372802 - 23372547
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcc-tttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac--aatttct 98  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| |    
T  23372802 tcctttgattatccaccagtgttcctttgcctgatttgggggtagtccttttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaaattttt 23372703  T
Q  99 gcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagt-ggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcagg 196  Q
    | |||||  |||||||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |    
T  23372702 g-aggcatggctgttgttttttcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtgggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagag 23372604  T
Q  197 acaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| ||||||||| | ||  |   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23372603 acaagtgctcagtgctatccatttattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23372547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31833769 - 31833641
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31833769 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31833670  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 130  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  31833669 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgt 31833641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39362514 - 39362350
Alignment:
Q  90 acaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgtt 188  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  39362514 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 39362415  T
Q  189 aacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||   ||||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39362414 aacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39362350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 40228553 - 40228710
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40228553 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 40228651  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40228652 gcgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcagctct 40228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 13405010 - 13405209
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  ||||  || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13405010 tttgcctgatttggatgttgtccaatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 13405108  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 226  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||    
T  13405109 gcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttctaatgaacgt 13405207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39364769 - 39364685
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaa 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39364769 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaa 39364685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 1915311 - 1915469
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1915311 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagttgttatcttgtcttgta 1915409  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1915410 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 1915469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11208229 - 11208087
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  ||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11208229 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaagttcaaatccattcttattttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 11208131  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11208130 agcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 11208087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20215360 - 20215201
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20215360 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgt 20215262  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20215261 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20215201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31815314 - 31815199
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||    
T  31815314 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccc 31815215  T
Q  238 tttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||| ||||||||||    
T  31815214 tttcaattcttcgttc 31815199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 23478241 - 23478421
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||  |||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23478241 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctacaggca 23478339  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23478340 tagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 23478421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40033009 - 40032869
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40033009 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaagcagagctgttatcttgtcttgta 40032911  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacact 168  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40032910 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacact 40032869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25112143 - 25111966
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  25112143 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaaca-tttctgcaggca 25112045  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaac 182  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  25112044 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 25111966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25171234 - 25171057
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  25171234 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaaca-tttctgcaggca 25171136  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaac 182  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  25171135 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 25171057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Original strand, 32160638 - 32160801
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  | | |||||| ||||||||||||    
T  32160638 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctaagggaaca-tttctgcaggca 32160736  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32160737 gagctgtttttcttatcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 32160801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 4886985 - 4887057
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4886985 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4887057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 15516900 - 15517004
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15516900 ttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttg 15516997  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  15516998 tacactt 15517004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23697072 - 23696979
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaat-aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 94  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||  | |||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  23697072 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtggagtccttttaaagaaaaaccttcaaattccttcccatcttgagtgaacaat 23696979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 26765370 - 26765533
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||   ||||||||| | | |||||||    
T  26765370 tttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggc 26765468  T
Q  105 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26765469 agagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaa-aacagagtagtggaggcagtggttgtacactt 26765533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 28139478 - 28139642
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||  ||||||||   |||| |||||| | |||||||    
T  28139478 tttgatcaatcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacaatgt-tgcaggc 28139576  T
Q  105 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28139577 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 28139642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7745867 - 7745795
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745867 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacactt 7745795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 10848736 - 10848808
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10848736 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 10848808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 33933230 - 33933302
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33933230 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 33933302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 20550876 - 20550930
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20550876 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20550930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 26759021 - 26759184
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||||| | | | |||||||    
T  26759021 tttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcctattatgaaggaatattgt-tgcaggc 26759119  T
Q  105 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26759120 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26759184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30116011 - 30115942
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30116011 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 30115942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 9088932 - 9089004
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9088932 tgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 9089004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 30742944 - 30743015
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30742944 tgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30743015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 33022598 - 33022699
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 163  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||| |   |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33022598 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagcttt---cttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgt 33022693  T
Q  164 acactt 169  Q
    ||||||    
T  33022694 acactt 33022699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 89629 - 89524
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  89629 ttcaaattcattccaagtatgaaggaaca-ttgatgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttg 89531  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  89530 tacactt 89524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14086695 - 14086641
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14086695 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacactt 14086641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 26784284 - 26784389
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  26784284 ttcaaatccattcccagcatgtaggaacatttt-tgcaggcagagttgttattcttgtcttgtagcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttg 26784382  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  26784383 tacactt 26784389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 42243662 - 42243715
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42243662 tcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 42243715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35932161 - 35932108
Alignment:
Q  116 cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35932161 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 35932108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 11993851 - 11993923
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| |||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11993851 tgcaggcatagctgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 11993923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13545686 - 13545614
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13545686 tgcaggcagagttgtttatcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacactt 13545614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25096999 - 25096928
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25096999 tgcaggcatagctgttattcttgtcttgttgcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25096928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25154969 - 25154898
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25154969 tgcaggcatagctgttattcttgtcttgttgcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25154898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29138580 - 29138508
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29138580 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 29138508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 31117840 - 31117912
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31117840 tgcaggcagcgctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacactt 31117912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35986406 - 35986334
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35986406 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 35986334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Original strand, 16607518 - 16607552
Alignment:
Q  140 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16607518 cagagtagtggagatagtggttgtacacttgtact 16607552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25930327 - 25930261
Alignment:
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25930327 aggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtaca 25930261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41566606 - 41566536
Alignment:
Q  100 caggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41566606 caggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 41566536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3245615 - 3245543
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3245615 tgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 3245543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9398908 - 9398836
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9398908 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacactt 9398836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19536475 - 19536403
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19536475 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacactt 19536403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 21660175 - 21660247
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21660175 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21660247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26119959 - 26119927
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26119959 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 26119927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28464513 - 28464441
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28464513 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttatagtagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacactt 28464441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 107)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 4987358 - 4987610
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4987358 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 4987457  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  4987458 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctcttaacgaaggacaa 4987557  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4987558 atactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4987610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 10909494 - 10909745
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10909494 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 10909593  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10909594 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaag 10909693  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10909694 tactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10909745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15207586 - 15207336
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15207586 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 15207488  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15207487 aggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 15207389  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15207388 gtactcagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15207336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 11535931 - 11536182
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11535931 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 11536029  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  11536030 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 11536129  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11536130 gtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11536182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 24713517 - 24713767
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24713517 ttcctttgatcatctaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 24713615  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  24713616 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtg-acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 24713714  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24713715 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttaatacctccctttcaattcttcgttc 24713767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47152253 - 47152002
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47152253 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 47152155  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47152154 aggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 47152055  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47152054 gtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 47152002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18078079 - 18077828
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18078079 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 18077980  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  18077979 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 18077880  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18077879 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18077828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 5873455 - 5873706
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5873455 ttccttggatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaatttcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 5873553  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  5873554 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactatgttaatgaaggacaa 5873653  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5873654 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5873706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 10695725 - 10695976
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10695725 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctcgaaggaacaatt-ctgc 10695823  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10695824 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 10695923  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10695924 gtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10695976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Original strand, 3370803 - 3371052
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  3370803 ctttgatcacccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattttgcagg 3370902  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagta 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3370903 catagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaata 3371002  T
Q  204 ctcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3371003 ctcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 3371052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31266968 - 31266720
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31266968 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgcagg 31266870  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31266869 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaata 31266770  T
Q  204 ctcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  31266769 ctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcctttacaattcttcgttc 31266720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 11515121 - 11515372
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11515121 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-tttctgc 11515219  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  11515220 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttttactttgttaactctgataacgaaggacaa 11515319  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11515320 gtactcagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11515372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40470760 - 40470510
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  40470760 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgca 40470661  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  40470660 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 40470562  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40470561 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgttc 40470510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Original strand, 3390543 - 3390792
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |    
T  3390543 ctttgatcacccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgcatg 3390642  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagta 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3390643 catagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaata 3390742  T
Q  204 ctcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3390743 ctcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 3390792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 10300620 - 10300871
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10300620 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 10300718  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  10300719 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 10300818  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10300819 atactcaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattctttgttc 10300871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14836277 - 14836026
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14836277 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagctttaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 14836178  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14836177 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 14836079  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14836078 atactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattattcgttc 14836026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 19581326 - 19581577
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19581326 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 19581424  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19581425 aggcatggctgttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacaaaggacaa 19581524  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19581525 gtactcagtgttttccaaatgatcgttgatacctcccttttaattcttcgttc 19581577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5022822 - 5023072
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||    
T  5022822 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctccaaattcattcccatcttaaaggcacatattctgca 5022921  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  5022922 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 5023020  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5023021 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5023072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40454521 - 40454271
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  40454521 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgca 40454422  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  40454421 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 40454323  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40454322 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgttc 40454271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18763269 - 18763024
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18763269 ttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggca 18763170  T
Q  106 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 205  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18763169 taactgttgccttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgct 18763071  T
Q  206 cagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18763070 cagagctattcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 18763024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 16317415 - 16317667
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16317415 ttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 16317513  T
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16317514 aggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgaaggaca 16317613  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16317614 aatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 16317667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 25657222 - 25657473
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25657222 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 25657321  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactc-tgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  25657322 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-agcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactcttgttaacgaaggacaa 25657420  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     | ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25657421 atgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctctctttcaattcttcgttc 25657473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18752659 - 18752413
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18752659 ttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggca 18752560  T
Q  106 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 205  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18752559 tagctgttgccttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgct 18752461  T
Q  206 cagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18752460 tagagcaattcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18752413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 16305191 - 16305443
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16305191 ttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-tttctgc 16305289  T
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16305290 aggcatggttgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttatactttgtcaactctgttaacgaaggaca 16305389  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16305390 aatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 16305443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27815119 - 27814867
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27815119 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 27815020  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27815019 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacataaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27814920  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27814919 gtgctcagtgctatccatatatccgtttatacctccctttcaattcttcgttc 27814867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 49002152 - 49001903
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49002152 ttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 49002054  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  49002053 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 49001955  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || || |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49001954 gcacccaatgcttttcaaatgactgttgatacctccctttcaattcttcgtt 49001903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 48371217 - 48371469
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  48371217 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattatgca 48371316  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  48371317 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 48371416  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  48371417 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacccccctttcaattcttcgttc 48371469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 55651410 - 55651659
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55651410 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgactgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 55651508  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  55651509 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 55651607  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55651608 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttgatacctccctttcaattcttcgtt 55651659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 52703874 - 52704126
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  52703874 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 52703973  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  52703974 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 52704073  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52704074 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 52704126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 461243 - 461495
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  461243 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 461342  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  461343 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 461442  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  461443 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 461495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14843827 - 14843575
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14843827 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14843728  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14843727 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14843628  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14843627 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14843575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 22007097 - 22007349
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22007097 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22007196  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  22007197 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttagtcaactctattaacgagagacaa 22007296  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007297 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22007349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30937246 - 30936994
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  30937246 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 30937147  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  30937146 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 30937047  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30937046 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30936994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 450662 - 450914
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  450662 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 450761  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || ||    
T  450762 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagataa 450861  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  450862 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 450914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 17918138 - 17918390
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17918138 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17918237  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||    
T  17918238 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactctgtcaactctattaacgagagacaa 17918337  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17918338 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17918390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 17928786 - 17929038
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17928786 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17928885  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||    
T  17928886 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactctgtcaactctattaacgagagacaa 17928985  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17928986 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19944501 - 19944249
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19944501 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 19944402  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19944401 ggcatggctgttgttttgtcttatagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19944302  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19944301 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatagctccctttcaattcttcgttc 19944249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 21996499 - 21996751
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  21996499 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 21996598  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  21996599 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtacttagtcaactctattaacgagagacaa 21996698  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21996699 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21996751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24028259 - 24028007
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24028259 tcctttgataatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24028160  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24028159 ggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24028060  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24028059 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24028007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30926668 - 30926416
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  30926668 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctttaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 30926569  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  30926568 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 30926469  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30926468 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30926416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10751342 - 10751090
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10751342 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10751243  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10751242 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10751143  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10751142 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 10751090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10965111 - 10964859
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10965111 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10965012  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10965011 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10964912  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10964911 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 10964859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15561253 - 15561001
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  15561253 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 15561154  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15561153 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15561054  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15561053 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15561001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 16255955 - 16256207
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  16255955 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaagttctgca 16256054  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  16256055 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 16256154  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16256155 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 16256207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 16266548 - 16266800
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  16266548 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 16266647  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  16266648 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 16266747  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16266748 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 16266800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 36018422 - 36018674
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36018422 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36018521  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36018522 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36018621  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36018622 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36018674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 36028975 - 36029227
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36028975 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36029074  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36029075 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36029174  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36029175 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36029227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55745426 - 55745174
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  55745426 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 55745327  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  55745326 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 55745227  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55745226 gtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 55745174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55756037 - 55755785
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  55756037 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 55755938  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  55755937 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 55755838  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55755837 gtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 55755785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4948421 - 4948673
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||    
T  4948421 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtggtcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacatattctgca 4948520  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4948521 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4948620  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4948621 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4948673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19955136 - 19954884
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  19955136 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgaacgtacaaattctgca 19955037  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19955036 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19954937  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19954936 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatagctccctttcaattcttcgttc 19954884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 49518221 - 49518469
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  49518221 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 49518320  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  49518321 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 49518420  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  49518421 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 49518469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10740768 - 10740516
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10740768 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10740669  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10740668 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10740569  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10740568 gagctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattctttgttc 10740516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10954537 - 10954285
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10954537 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10954438  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10954437 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10954338  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10954337 gagctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattctttgttc 10954285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24640333 - 24640586
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  24640333 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 24640432  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  24640433 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 24640532  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24640533 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 24640586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18130413 - 18130162
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  18130413 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 18130314  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  18130313 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 18130214  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || || | | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18130213 gagctcagtgctatccatat-atccttgatacctccctttcaattctttgttc 18130162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27656686 - 27656939
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  27656686 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 27656785  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  27656786 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 27656885  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27656886 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 27656939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 27667259 - 27667512
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  27667259 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 27667358  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  27667359 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 27667458  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27667459 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 27667512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 23509203 - 23509386
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23509203 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 23509301  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23509302 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23509386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18774850 - 18774613
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  18774850 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttatgc 18774752  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     || || |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||    
T  18774751 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggagatagtggttgtacaattgtattttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 18774653  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
      || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  18774652 acacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 18774613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18007252 - 18007018
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  18007252 cctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgcag 18007154  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||     
T  18007153 gcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaac-aaggacaagc 18007056  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    || ||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||    
T  18007055 acccagtgcttttcaaattaacgttggcacctcccttt 18007018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8997451 - 8997268
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || | |||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  8997451 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttgaaggaac-acttctgc 8997353  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8997352 aggcagaactgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 8997268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16819547 - 16819364
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  16819547 ttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaa-ttctgc 16819449  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16819448 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 16819364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 33378279 - 33378461
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33378279 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcagg 33378377  T
Q  104 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
     ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33378378 tagaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 33378461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14778611 - 14778412
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14778611 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 14778513  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 226  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||    
T  14778512 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttctaatgaacgt 14778414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17993962 - 17993763
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17993962 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggaca-tttctgcaggcagagctattatcttgtcttgta 17993864  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 226  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||    
T  17993863 gcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaagtgaacgt 17993765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14710947 - 14710790
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14710947 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaaca-tttctataggcagagctgttatcttgtcttgta 14710849  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14710848 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 14710790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36210278 - 36210119
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36210278 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttatgcaggcagagctgtttatcttgtcttgt 36210180  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36210179 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 36210119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 19242114 - 19242235
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    |||||||||||  |||| | ||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19242114 cctttgatcatttaccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaatgatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgcag 19242212  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgt 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  19242213 gcagagctgttatcttgtcttgt 19242235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 1672350 - 1672422
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1672350 tgcagacagagctgttattcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1672422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 1674825 - 1674897
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674825 tgcagacagagctgttattcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1674897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14605057 - 14604985
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14605057 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14604985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 240
Target Start/End: Original strand, 19244002 - 19244101
Alignment:
Q  140 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19244002 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaacaaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttgacaccttcctt 19244100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 10692719 - 10692884
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||   |||||||  |||||||||| | | ||||||    
T  10692719 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgt-tgcagg 10692817  T
Q  104 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    || ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10692818 catagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10692884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 10906485 - 10906650
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||   |||||||  |||||||||| | | ||||||    
T  10906485 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgt-tgcagg 10906583  T
Q  104 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    || ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906584 catagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10906650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 6517446 - 6517518
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6517446 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 6517518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 16853464 - 16853536
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16853464 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16853536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17398824 - 17398752
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17398824 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 17398752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 22190807 - 22190879
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22190807 tgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 22190879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 19884630 - 19884735
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  19884630 ttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttg 19884728  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  19884729 tacactt 19884735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3105569 - 3105497
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3105569 tgcaggcagagctgttatccttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 3105497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9751690 - 9751618
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9751690 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 9751618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 20977418 - 20977490
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20977418 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 20977490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25651253 - 25651182
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25651253 tgcaggccgagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25651182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 37435685 - 37435613
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37435685 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttatagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 37435613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39419884 - 39419812
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39419884 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacactt 39419812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 166
Target Start/End: Original strand, 8105566 - 8105667
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8105566 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttg 8105663  T
Q  163 taca 166  Q
    ||||    
T  8105664 taca 8105667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Original strand, 29121344 - 29121403
Alignment:
Q  110 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||| |||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29121344 tgttttcttgtcttgtaacagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29121403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39526121 - 39526082
Alignment:
Q  214 ttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39526121 ttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39526082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 163
Target Start/End: Original strand, 16848508 - 16848574
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 163  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16848508 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaggagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 16848574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Original strand, 40860628 - 40860698
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 167  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40860628 tgcagtcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacac 40860698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 3395551 - 3395623
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3395551 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 3395623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13576264 - 13576192
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  13576264 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacactt 13576192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 38513839 - 38513911
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||   ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38513839 tgcaggcagagctgtttttctcgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacactt 38513911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 56533211 - 56533140
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56533211 tgcaggcagagctgtttttattgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 56533140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 412929 - 413035
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaa-gaacagagtagtggaggtagtggtt 161  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||| ||||| | ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  412929 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagaactgtttttcttgttttgtagcaaagacaaagaacagagtagtggaggcagtggtt 413027  T
Q  162 gtacactt 169  Q
    ||||||||    
T  413028 gtacactt 413035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 169
Target Start/End: Original strand, 6641686 - 6641717
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6641686 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6641717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Original strand, 16939978 - 16940049
Alignment:
Q  99 gcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  16939978 gcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagggacaaaaacatagcagtggagatagtggttgtacactt 16940049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22675704 - 22675598
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggtt 161  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | || |||||||||| || | |||||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  22675704 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgtaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaactgagtagtggaggtagtggtt 22675606  T
Q  162 gtacactt 169  Q
    ||||||||    
T  22675605 gtacactt 22675598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 169
Target Start/End: Original strand, 54679932 - 54679963
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679932 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 54679963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 10072863 - 10072968
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||| || |||||| | |||||||| ||||   ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  10072863 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggtagggctgtttttcttgtcttatagcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttg 10072961  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  10072962 tacactt 10072968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 45833322 - 45833427
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| |||| | ||||| |||||||   ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  45833322 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagttgtttttcttgttttgtagcagagaccaaaacagagtagtggagatagtggttg 45833420  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  45833421 tacactt 45833427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 55380218 - 55380323
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| | | |||||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  55380218 ttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgttattattgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttg 55380316  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  55380317 tacactt 55380323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10661276 - 10661240
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10661276 aacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 10661240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10875421 - 10875385
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10875421 aacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 10875385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19621211 - 19621139
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  19621211 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacactt 19621139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 23750483 - 23750555
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  23750483 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacactt 23750555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 171)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13261839 - 13261590
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13261839 cctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgcag 13261741  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13261740 gcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaagt 13261641  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13261640 actcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13261590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 28169148 - 28169399
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28169148 ttcctttgatcatccaccagtaatcatttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 28169246  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28169247 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgcaggacaa 28169346  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28169347 gtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28169399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 11163895 - 11164147
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||     
T  11163895 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaaaaattctgt 11163994  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11163995 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 11164094  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11164095 atactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttc 11164147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24706722 - 24706471
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24706722 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 24706623  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  24706622 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 24706523  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24706522 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24706471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 4456982 - 4457229
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4456982 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-tttctgc 4457080  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4457081 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 4457180  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4457181 gtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 4457229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 27883450 - 27883701
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27883450 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtagtcctttgaagaatcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 27883548  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  27883549 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 27883648  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27883649 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctgtcaattcttcgttc 27883701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 4404339 - 4404589
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4404339 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-tttctgc 4404437  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4404438 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 4404537  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4404538 gtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 4404589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6501171 - 6500920
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  6501171 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 6501072  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  6501071 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 6500972  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6500971 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6500920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9535676 - 9535926
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9535676 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9535775  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9535776 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9535874  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9535875 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9535926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16666294 - 16666044
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16666294 tcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaaggaacaatt-ctgca 16666196  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16666195 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaag 16666096  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16666095 tacccagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16666044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8740295 - 8740048
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8740295 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggagcaatt-ctgc 8740197  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  8740196 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 8740097  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8740096 gtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 8740048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18851860 - 18851609
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18851860 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattt-tgc 18851762  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  18851761 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacat 18851662  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18851661 ttactcagtgttttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18851609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6490517 - 6490266
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  6490517 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 6490418  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  6490417 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 6490318  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6490317 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 6490266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9380824 - 9380573
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9380824 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgca 9380725  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  9380724 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactatgttaacgaaggacaaa 9380625  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9380624 tactcagtgcgcttcaagtgactgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9380573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9391370 - 9391119
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9391370 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgca 9391271  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||     
T  9391270 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtggtacatttgtactttctcaactctgttaacgaaggacaaa 9391171  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9391170 tactcagtgcgcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9391119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11216889 - 11216638
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11216889 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 11216790  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  11216789 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 11216690  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11216689 tactcaatggacttcaaatgatcattgatacctccctttcaattcttcgttc 11216638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 23635777 - 23636028
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23635777 tcctttgatcattcaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 23635876  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  23635877 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 23635976  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23635977 tgctcagtactatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23636028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 16076999 - 16077243
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16076999 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-ttgctgcagg 16077097  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16077098 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagta 16077197  T
Q  204 ctcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16077198 ctcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 16077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7804685 - 7804435
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7804685 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 7804586  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  7804585 ggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 7804487  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7804486 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 7804435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9994060 - 9993810
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9994060 tcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9993961  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9993960 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacaaa 9993862  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9993861 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9993810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12237781 - 12237531
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12237781 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 12237682  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  12237681 ggcatagctattgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 12237583  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12237582 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12237531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12249607 - 12249357
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12249607 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 12249508  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  12249507 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 12249409  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12249408 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12249357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 48337309 - 48337559
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  48337309 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 48337408  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||     
T  48337409 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaattctgttaacgaaggacaaa 48337507  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48337508 tactcagtgctgtccaaatgaccgatgatacctccctttcaattcttcgttc 48337559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 1064205 - 1064456
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1064205 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 1064303  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  1064304 aggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 1064403  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1064404 atacctagtgctcttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1064456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 1053776 - 1054027
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1053776 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctac 1053874  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  1053875 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 1053974  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1053975 gtacctagtgctcttcaaatgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 1054027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 933695 - 933941
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  933695 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctgatttggatgtagtcctttgaagaattagtttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 933794  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  933795 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 933893  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  933894 tactcagagcacttcaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttc 933941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7794774 - 7794524
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7794774 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 7794675  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  7794674 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaa 7794576  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7794575 tacttagtgctatctaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 7794524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9982052 - 9981802
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9982052 tcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9981953  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  9981952 ggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacaga 9981854  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9981853 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9981802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8996124 - 8995873
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8996124 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 8996026  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  8996025 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaaggacaa 8995926  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8995925 atactcagtgcttttaaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8995873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19887521 - 19887271
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19887521 tcctttgatcattcaccagtaatcgtttgcctgatttgggtgtactactttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 19887422  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||     
T  19887421 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggagttagtggttgtacacttgtgctttgtcaactctgttaacgaagtacaaa 19887323  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19887322 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19887271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17910169 - 17909919
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  17910169 tcctttgatcattcaccagtaatccttttcctgatttgggtgttgtccttttaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgca 17910070  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  17910069 ggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 17909971  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17909970 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17909919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29461380 - 29461130
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  29461380 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 29461281  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  29461280 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 29461182  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  29461181 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattctccgttc 29461130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29472232 - 29471988
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  29472232 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 29472133  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  29472132 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 29472034  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttct 247  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29472033 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattct 29471988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 38314765 - 38315017
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38314765 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaaacagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 38314863  T
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38314864 aggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaca 38314963  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  38314964 aatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 38315017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9006676 - 9006425
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9006676 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 9006578  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  9006577 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaaggacaa 9006478  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9006477 atactcagtgcttttaaaatgcccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 9006425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 14581204 - 14581456
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14581204 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgaagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaaattctgc 14581303  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || | |||||||    
T  14581304 aggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaatgaaggacaa 14581403  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14581404 gtacccagtgctttgtaaatgaccgttgatacctcccttgcaattcttcgttc 14581456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16671330 - 16671083
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  16671330 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaaggaacaatt-ctac 16671232  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  16671231 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaagagaaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 16671132  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16671131 atacccactgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 16671083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1784240 - 1783987
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1784240 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 1784142  T
Q  101 aggcagagctgt-tgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggac 198  Q
    |||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1784141 aggcatggctgtgtttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggac 1784042  T
Q  199 aagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1784041 aagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 1783987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1794652 - 1794399
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1794652 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttctgc 1794554  T
Q  101 aggcagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggac 198  Q
    |||||  |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1794553 aggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggac 1794454  T
Q  199 aagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1794453 aagtacttagttttctccaaatgatcgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 1794399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17281601 - 17281354
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  17281601 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgccagatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattttcattttgaaggaaca-tttctgc 17281503  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  17281502 aggtatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 17281403  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17281402 gtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 17281354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16391780 - 16391531
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  16391780 ctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtactcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggtacacattctgcagg 16391681  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagta 203  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |     
T  16391680 catagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtatacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatg 16391581  T
Q  204 ctcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16391580 ctcagtgttatccaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16391531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12567376 - 12567187
Alignment:
Q  63 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12567376 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttg 12567278  T
Q  163 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12567277 tacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12567187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10627109 - 10626858
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||    
T  10627109 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataataatcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcagaatctgca 10627010  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||    
T  10627009 ggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactatgtcaactctgttaataggagacaag 10626910  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10626909 tgctcagtgatatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10626858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10655431 - 10655180
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  10655431 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataatcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcaaaatctgca 10655332  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||    
T  10655331 ggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactatgtcaactctgttaataggagacaag 10655232  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10655231 tgctcagtgatatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4174925 - 4174673
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  4174925 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 4174826  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4174825 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4174726  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4174725 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4174673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6220870 - 6220618
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  6220870 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 6220771  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6220770 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6220671  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6220670 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6220618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13383432 - 13383180
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  13383432 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 13383333  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  13383332 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaagacaa 13383233  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13383232 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13383180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 37885645 - 37885897
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  37885645 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 37885744  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  37885745 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 37885844  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37885845 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37885897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 13121729 - 13121981
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13121729 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 13121828  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  13121829 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 13121928  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13121929 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13121981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 13131972 - 13132224
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13131972 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 13132071  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  13132072 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 13132171  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13132172 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13132224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13372838 - 13372586
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  13372838 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 13372739  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||    
T  13372738 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttattaacgaaagacaa 13372639  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13372638 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13372586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13394026 - 13393774
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  13394026 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 13393927  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  13393926 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 13393827  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13393826 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13393774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 14465658 - 14465910
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  14465658 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 14465757  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  14465758 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 14465857  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14465858 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14465910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19778452 - 19778704
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19778452 tcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 19778551  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19778552 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19778651  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19778652 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19778704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19789089 - 19789341
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19789089 tcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 19789188  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19789189 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19789288  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19789289 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19789341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 23767961 - 23768213
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23767961 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23768060  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23768061 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23768160  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23768161 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23768213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39673051 - 39672799
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  39673051 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgaacatacaacttctgca 39672952  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  39672951 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 39672852  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39672851 gtgctcagtgctatccatatatccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 39672799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6180696 - 6180444
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||    
T  6180696 tcctttgattatccaccaatgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattatgca 6180597  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6180596 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6180497  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6180496 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6180444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 14476290 - 14476542
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  14476290 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 14476389  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  14476390 ggcatggctgttgttttgtcttgtagtgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 14476489  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14476490 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14476542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20683949 - 20683697
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  20683949 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 20683850  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  20683849 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 20683750  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20683749 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20683697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 23647815 - 23648067
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23647815 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23647914  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23647915 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23648014  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23648015 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23648067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 23757365 - 23757617
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23757365 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23757464  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   |||||    
T  23757465 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaaatctattaacgagagacaa 23757564  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23757565 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23757617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 37759737 - 37759989
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  37759737 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 37759836  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  37759837 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 37759936  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37759937 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37759989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 37866512 - 37866764
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  37866512 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcccgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 37866611  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||   |||||    
T  37866612 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagttgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacactattaacgagagacaa 37866711  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37866712 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37866764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15216446 - 15216257
Alignment:
Q  63 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15216446 cttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 15216348  T
Q  163 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15216347 tacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaggtacccagtgctcttcaaatgatcgttgatacctcactttcaattcttcgttc 15216257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 526702 - 526450
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  526702 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 526603  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  526602 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 526503  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  526502 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 526450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5579802 - 5579550
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5579802 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 5579703  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5579702 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5579603  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5579602 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5579550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5628186 - 5627934
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5628186 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 5628087  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5628086 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5627987  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5627986 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5627934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5865862 - 5865610
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5865862 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 5865763  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5865762 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5865663  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5865662 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5865610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5876461 - 5876209
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5876461 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 5876362  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5876361 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5876262  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5876261 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5876209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20673364 - 20673112
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  20673364 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 20673265  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  20673264 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 20673165  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20673164 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20673112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 20721180 - 20721432
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  20721180 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 20721279  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  20721280 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 20721379  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20721380 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20721432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 41683745 - 41683997
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  41683745 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 41683844  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  41683845 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 41683944  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41683945 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 41683997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 41694314 - 41694566
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  41694314 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 41694413  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  41694414 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 41694513  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41694514 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 41694566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13199412 - 13199160
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  13199412 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggatc-atttctgc 13199314  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||    
T  13199313 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggac 13199215  T
Q  199 aagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  13199214 aaacacccagtgcttttcaaatgaccgttggtacctcccttttaattcatcgttc 13199160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 8774724 - 8774977
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8774724 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 8774823  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  8774824 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 8774923  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8774924 agtgctcagtgcttttcatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8774977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 8785309 - 8785562
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8785309 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 8785408  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  8785409 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 8785508  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8785509 agtgctcagtgcttttcatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8785562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 504336 - 504084
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  504336 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 504237  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  504236 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 504137  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  504136 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 504084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 2246434 - 2246684
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  2246434 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttatgc 2246532  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  2246533 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 2246631  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
      ||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  2246632 acacctagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc 2246684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4743805 - 4744056
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4743805 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 4743903  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4743904 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4744003  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4744004 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4744056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5510763 - 5511014
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5510763 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 5510861  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5510862 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5510961  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5510962 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5511014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5520941 - 5521192
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5520941 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 5521039  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5521040 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5521139  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5521140 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5521192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5537189 - 5536938
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  5537189 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 5537091  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5537090 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5536991  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5536990 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5536938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12287147 - 12286895
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12287147 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12287048  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12287047 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12286948  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |   |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12286947 gagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12286895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12296969 - 12296717
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12296969 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12296870  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12296869 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12296770  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |   |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12296769 gagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12296717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 13557641 - 13557893
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  13557641 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaactcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 13557740  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
     |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  13557741 tgcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 13557840  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||| ||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13557841 gtgctccgtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13557893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24383687 - 24383435
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24383687 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24383588  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24383587 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24383488  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24383487 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24383435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24659967 - 24660219
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24659967 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24660066  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24660067 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24660166  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||| ||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24660167 gagctcagagctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24660219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28314400 - 28314148
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  28314400 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 28314301  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  28314300 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 28314201  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28314200 gtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 28314148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28325016 - 28324764
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  28325016 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 28324917  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  28324916 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 28324817  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28324816 gtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 28324764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 35187444 - 35187696
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  35187444 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 35187543  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  35187544 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 35187643  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35187644 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 35187696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 18484111 - 18484364
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  18484111 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 18484210  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  18484211 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 18484310  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18484311 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 18484364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29933727 - 29933476
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataatt-agcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29933727 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctg 29933629  T
Q  100 caggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||    
T  29933628 caggcagagctattgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggaca 29933530  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29933529 agcactccgtgctttccaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29933476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29982881 - 29982630
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataatt-agcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29982881 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctg 29982783  T
Q  100 caggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||    
T  29982782 caggcagagctattgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggaca 29982684  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29982683 agcactccgtgctttccaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29982630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 38194791 - 38195044
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  38194791 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 38194890  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  38194891 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 38194990  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38194991 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 38195044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 38205327 - 38205580
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  38205327 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 38205426  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  38205427 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 38205526  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38205527 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 38205580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4754391 - 4754641
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  4754391 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataa-cttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 4754488  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4754489 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4754588  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4754589 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4754641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5547773 - 5547522
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| |    
T  5547773 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgta 5547675  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5547674 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5547575  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5547574 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5547522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24670547 - 24670799
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24670547 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24670646  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24670647 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24670746  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||| ||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24670747 gagctcagagctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24670799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 39382757 - 39383010
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  39382757 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 39382856  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  39382857 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 39382956  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39382957 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 39383010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 10099135 - 10099386
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10099135 tcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 10099233  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | |||    
T  10099234 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaa 10099333  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10099334 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10099386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29947513 - 29947263
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29947513 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaa-aatttctgc 29947415  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  29947414 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaa 29947316  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29947315 gcactccgtgcttttcaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29947263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29996667 - 29996417
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29996667 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaa-aatttctgc 29996569  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  29996568 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaa 29996470  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29996469 gcactccgtgcttttcaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29996417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11272552 - 11272299
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  11272552 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 11272453  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  11272452 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 11272353  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11272352 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 11272299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 39372120 - 39372373
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  39372120 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 39372219  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  39372220 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 39372319  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | |  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39372320 agtgctcagtgttatctatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 39372373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29906348 - 29906098
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29906348 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaa-aatttctgc 29906250  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  29906249 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaa 29906151  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29906150 gcactccgtgctttacaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29906098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 80 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14321771 - 14321598
Alignment:
Q  80 tcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtc 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14321771 tcttgaaggaaca-tttctgcaggaagagttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 14321673  T
Q  180 aactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttc-aaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14321672 aactctgataacaaaggacaagtactcagtgttcttcaaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14321598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 16476345 - 16476597
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||| |||| ||||||||   ||||| |||||| || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||  | |||| |||||||    
T  16476345 tcctgtgattatccaccaaggatcctgtgcctgtttggggtgtagtcctttgaaggataagcttcaaattcattcccatggtgagtgtacaaattctgca 16476444  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16476445 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16476544  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16476545 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16476597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15651238 - 15651055
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||     
T  15651238 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctattttgaaggaaaaatt-ctgt 15651140  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15651139 aggcagagctgttgtcttttcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 15651055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15662873 - 15662690
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||     
T  15662873 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctattttgaaggaaaaatt-ctgt 15662775  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15662774 aggcagagctgttgtcttttcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 15662690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21736177 - 21736402
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  21736177 ttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaa-ttctgc 21736275  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  ||||||    
T  21736276 aggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgagggacaa 21736374  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||    
T  21736375 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 21736402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 27172900 - 27173135
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  27172900 cctttgatctttcaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcctatcttgaaagaacaa-atctgcag 27172998  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagag-tagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  || |   | ||||||    
T  27172999 gcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtacatttgtactttgtcaactc--ttcaataaagacaag 27173096  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
     || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  27173097 cacccagtgcttttcaaatgaccgttggcacctcccttt 27173135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51989282 - 51989086
Alignment:
Q  31 cctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcg 129  Q
    |||||||||| ||| ||||| | || ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  51989282 cctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 51989184  T
Q  130 tggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    | ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  51989183 tagacacaaacagattcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 51989086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 10529243 - 10529401
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10529243 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttttcttgtcttgta 10529341  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 185  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10529342 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 10529401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16348667 - 16348552
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16348667 aacaaagtagtggaggtagtggttgcacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaagacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccc 16348568  T
Q  238 tttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||| ||||||||||    
T  16348567 tttcaattcttcgttc 16348552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Original strand, 16386141 - 16386243
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16386141 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagattcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttctgca 16386239  T
Q  102 ggca 105  Q
    ||||    
T  16386240 ggca 16386243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31114152 - 31113935
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31114152 cctttgatcattcaacattaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaaaccattcctaacttgaaggaaca-tttctgcag 31114054  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||||     
T  31114053 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagc 31113955  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatga 222  Q
    ||  |||||| |||||||||    
T  31113954 acctagtgcttttcaaatga 31113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 17961418 - 17961551
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||    
T  17961418 ttcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaacaa-atctgc 17961516  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17961517 aggcagagctgttttcttgtcttgtagcgcggaca 17961551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18006363 - 18006496
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||    
T  18006363 ttcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaacaa-atctgc 18006461  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18006462 aggcagagctgttttcttgtcttgtagcgcggaca 18006496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 41045640 - 41045797
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41045640 tttgcatgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 41045738  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41045739 gcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 41045797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 15850884 - 15851065
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  15850884 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctggaggca 15850982  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtgg-ttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  15850983 gagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtttgtacactttgtactttgtcaactct 15851065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 253
Target Start/End: Original strand, 16493245 - 16493356
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||    
T  16493245 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttc 16493344  T
Q  242 atttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||||    
T  16493345 aattcttcgttc 16493356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 15833281 - 15833459
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  15833281 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctat--tgaaggaaca-tttctgcaggca 15833377  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15833378 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 15833459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 51340886 - 51341063
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| || || ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  51340886 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtactatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcgggca 51340984  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaac 182  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  51340985 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 51341063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Original strand, 17021975 - 17022082
Alignment:
Q  79 atcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttc 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17021975 atcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtacttt 17022073  T
Q  177 gtcaactct 185  Q
    |||||||||    
T  17022074 gtcaactct 17022082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 22151142 - 22151301
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22151142 tttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 22151240  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  22151241 agcgtagacacaagcagaatcgtggaggtagtggttgtacgctttgtactttgtcaactct 22151301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45861856 - 45861693
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  45861856 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 45861758  T
Q  106 gagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45861757 gagctgttttttttgtcttgtagcgtagacataaacatagtagtggaggtagtggtcgtacactt 45861693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 2561061 - 2561226
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||||||   | ||||||    
T  2561061 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcagg 2561159  T
Q  104 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
     ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561160 tagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2561226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12752904 - 12752727
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||  |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  12752904 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaatgatcacgttcaaagccattcctattctgaaggaacatttt-tgcaggca 12752806  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaac 182  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  12752805 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagttgtggagatagtggtcgtacactttgtactttgtcaac 12752727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 13148141 - 13148321
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13148141 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggta 13148239  T
Q  106 gagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| |||     || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13148240 gagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 13148321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 49990134 - 49990280
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  49990134 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgcagg 49990232  T
Q  104 cagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtgg 150  Q
    || ||||| || |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  49990233 caaagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataagcagagtagtgg 49990280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 40799807 - 40799912
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40799807 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 40799905  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  40799906 tacactt 40799912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 5213452 - 5213615
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||   ||||||||| | | |||| ||    
T  5213452 tttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggctattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcacgc 5213550  T
Q  105 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5213551 agagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24775760 - 24775655
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24775760 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttacttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttg 24775662  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  24775661 tacactt 24775655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 47405647 - 47405542
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47405647 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttg 47405549  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  47405548 tacactt 47405542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25398448 - 25398376
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398448 tgcaggcagagctgtttttattgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25398376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 2784998 - 2785102
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2784998 ttcaaatgcattcccattgagaaggaacattct-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-atcagagtagtggaggtagtggttg 2785095  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  2785096 tacactt 2785102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11909250 - 11909145
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||  |||| |||||||||||||||||| |    
T  11909250 ttcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcg 11909152  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  11909151 tacactt 11909145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12726405 - 12726351
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726405 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12726351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 47207690 - 47207744
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47207690 tcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 47207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 53056902 - 53056848
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53056902 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 53056848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21605844 - 21605775
Alignment:
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21605844 aggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21605775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30054410 - 30054341
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30054410 tgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtaca 30054341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1728208 - 1728136
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1728208 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 1728136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 6090698 - 6090770
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090698 tgcaggaagagctgtttttcttgtcttgcagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6090770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21636863 - 21636791
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21636863 tgcaggcagagttgttttgcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21636791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 22140730 - 22140802
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22140730 tgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 22140802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 11868253 - 11868307
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11868253 tcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11868307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 14955361 - 14955465
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||| || | |||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14955361 ttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagataa-aacagagtagtggaggtagtggttg 14955458  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  14955459 tacactt 14955465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18121797 - 18121743
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121797 tcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18121743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18142927 - 18142873
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18142927 tcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18142873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 28582039 - 28582144
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||| ||||| |   ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28582039 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgttttgtaccagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttg 28582137  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  28582138 tacactt 28582144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 29855393 - 29855447
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855393 tcttgtcttgtagcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29855447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 33583163 - 33583267
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  33583163 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aatagagtattggaggtagtggttg 33583260  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  33583261 tacactt 33583267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12389030 - 12388993
Alignment:
Q  132 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12389030 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12388993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Original strand, 16032526 - 16032563
Alignment:
Q  132 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032526 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16032563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 253
Target Start/End: Original strand, 16487098 - 16487211
Alignment:
Q  140 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 239  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||| || |||   ||||||  ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||    
T  16487098 cagagtagtggaggtactggttgaacacttgtagtgtgtcaactctattgacgagagacaagagctcagtggtatccatatatccgttgatacctccctt 16487197  T
Q  240 tcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||| ||||    
T  16487198 tcaattctttgttc 16487211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16658811 - 16658739
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16658811 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 16658739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 20646120 - 20646192
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646120 tgcaggcagaactgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 20646192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38177836 - 38177764
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38177836 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagtcaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 38177764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 46796560 - 46796488
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46796560 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 46796488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49642955 - 49642883
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49642955 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 49642883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49666598 - 49666526
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49666598 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacactt 49666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49553661 - 49553610
Alignment:
Q  118 tgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49553661 tgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 49553610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 11223548 - 11223601
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11223548 tcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggagatagtggttgtacactt 11223601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20627657 - 20627552
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| |||| | ||| |||||||||   || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  20627657 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagttgtttttcttatcttgtagcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 20627559  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  20627558 tacactt 20627552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Original strand, 37412571 - 37412640
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37412571 tgcaggcatagctgttttacttgtcttgtagtgaagacagaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 37412640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 46350038 - 46349965
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaa-gaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  46350038 tgcaggcagagctgttttttttgtcttgtagcagagacaaagaacatagtagtggaggcagtggttgtacactt 46349965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9700229 - 9700157
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  9700229 tgcaggcagagatgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacactt 9700157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Original strand, 16880026 - 16880058
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16880026 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 16880058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 31303352 - 31303424
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31303352 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacactt 31303424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 123)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 1367682 - 1367932
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1367682 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 1367781  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  1367782 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 1367880  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1367881 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15888576 - 15888326
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15888576 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 15888477  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  15888476 ggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 15888378  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15888377 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15888326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21770190 - 21769940
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21770190 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 21770091  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  21770090 ggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 21769992  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21769991 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21769940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 18441248 - 18441499
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18441248 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 18441346  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  18441347 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 18441446  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18441447 gtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18441499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19986058 - 19985810
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19986058 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggc 19985959  T
Q  105 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 204  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |      
T  19985958 atagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgt 19985859  T
Q  205 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985858 tcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 19985810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9171038 - 9171288
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9171038 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9171137  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9171138 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9171236  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9171237 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9171288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31116759 - 31116508
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31116759 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 31116660  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||     
T  31116659 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgctaacgaaggacaaa 31116560  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31116559 tacttagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31116508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40055002 - 40054750
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  40055002 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaac-atttatgc 40054904  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  40054903 aggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggaca 40054804  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40054803 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 40054750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 589265 - 589515
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  589265 tcctttgatcaatcaccagtgatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 589364  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  589365 ggcctagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 589463  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  589464 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 589515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 18419167 - 18419418
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18419167 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 18419265  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  18419266 aggaagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctaataacgaaggacaa 18419365  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18419366 gtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18419418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9170237 - 9170487
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9170237 tcctttgatcattcaccagtaatcntttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttnaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9170336  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9170337 ggcatagctgttgtnttgtcttgtagcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9170435  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9170436 tactcantgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9170487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14745917 - 14745666
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  14745917 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggcacaaattctgca 14745818  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  14745817 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 14745718  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14745717 tgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14745666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9159782 - 9160032
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9159782 tcctttgatcattcaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagctttaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9159881  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9159882 ggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9159980  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9159981 tactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9160032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 44280549 - 44280799
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  44280549 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 44280648  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  44280649 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 44280747  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44280748 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 44280799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 3165787 - 3166037
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  3165787 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 3165886  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  3165887 gacatacctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 3165985  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3165986 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 3166037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 20491059 - 20491309
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||    
T  20491059 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggcacaaattttgca 20491158  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20491159 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20491257  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| | | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20491258 tgctcagcgttgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 20491309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 30049570 - 30049822
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30049570 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaatgaaca-tttctgc 30049668  T
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30049669 aggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaca 30049768  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| |||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  30049769 agtacttagttttctccaaatgactgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 30049822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26209796 - 26209547
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26209796 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 26209698  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  26209697 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 26209599  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26209598 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 26209547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5685570 - 5685822
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5685570 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 5685669  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5685670 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5685769  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5685770 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5685822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9433315 - 9433567
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  9433315 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 9433414  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9433415 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9433514  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9433515 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9433567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 541136 - 541388
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  541136 tcctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 541235  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  541236 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 541335  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  541336 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 541388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9443911 - 9444163
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  9443911 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 9444010  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9444011 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9444110  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9444111 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9444163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 20989704 - 20989956
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20989704 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 20989803  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  20989804 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 20989903  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     | ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20989904 atgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20989956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21003253 - 21003005
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21003253 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtagaaattctgcaggca 21003154  T
Q  106 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 204  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| |    
T  21003153 tggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgc 21003054  T
Q  205 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21003053 tcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21003005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3476588 - 3476338
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3476588 ttcctttgatcatccaccattaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 3476490  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |||||||    
T  3476489 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaaggacaa 3476391  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  3476390 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc 3476338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6867472 - 6867222
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  6867472 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcagg 6867373  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||    
T  6867372 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagt 6867273  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||| | || ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6867272 gctcagtgctatccatatatccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 6867222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6878104 - 6877854
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  6878104 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccaacttgaatgtacaaattctgcagg 6878005  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||    
T  6878004 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagt 6877905  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6877904 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6877854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 467830 - 467578
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  467830 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 467731  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  467730 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 467631  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  467630 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 467578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 11096106 - 11096358
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11096106 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11096205  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  11096206 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 11096305  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11096306 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11096358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24930852 - 24930600
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  24930852 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 24930753  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24930752 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24930653  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24930652 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24930600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26653574 - 26653322
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  26653574 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 26653475  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26653474 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26653375  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26653374 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26653322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26699903 - 26699651
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  26699903 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 26699804  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26699803 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26699704  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26699703 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26699651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 29590045 - 29590295
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29590045 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 29590143  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  29590144 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 29590242  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  29590243 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc 29590295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 37344251 - 37344503
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  37344251 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcttttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 37344350  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   | |||    
T  37344351 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagaggcaa 37344450  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37344451 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37344503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 455048 - 454796
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  455048 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 454949  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  454948 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 454849  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  454848 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 454796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2705861 - 2705609
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  2705861 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 2705762  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  2705761 ggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 2705662  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2705661 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2705609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4222661 - 4222913
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4222661 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4222760  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4222761 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4222860  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4222861 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4222913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 8617437 - 8617689
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  8617437 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 8617536  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  8617537 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 8617636  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8617637 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8617689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 8628000 - 8628252
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  8628000 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 8628099  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  8628100 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 8628199  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8628200 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8628252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17950367 - 17950115
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17950367 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17950268  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  17950267 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 17950168  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17950167 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17950115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 15216369 - 15216618
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15216369 ttcctttgatcattcaccagtaatctattgcctgatttgggtgtagtcctatgacagatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 15216467  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  15216468 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttttactttgtcaactct-tcaaagaaggacaa 15216566  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15216567 gcacccagtgcttctcaaatggccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 15216618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2716465 - 2716213
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||    
T  2716465 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgagtgtacaaattctgca 2716366  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||   |||||    
T  2716365 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactctattaacgagagacaa 2716266  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2716265 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2716213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4212062 - 4212314
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||    
T  4212062 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatttccatcttgagtgtacaaattctgca 4212161  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4212162 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4212261  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4212262 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4212314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17960973 - 17960721
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17960973 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17960874  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  17960873 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 17960774  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17960773 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17960721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48710740 - 48710488
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  48710740 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 48710641  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  48710640 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 48710541  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48710540 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 48710488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12734414 - 12734165
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12734414 ttcctttgatcatccaccagtaatctcttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatttattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 12734316  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |||||||    
T  12734315 aggcagagttgttgtcttgtcttatagcgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaaggacaa 12734217  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12734216 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgtt 12734165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 253
Target Start/End: Original strand, 8933634 - 8933823
Alignment:
Q  63 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8933634 cttcaaattcattcctatcttgaaggaacaatt-ctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 8933732  T
Q  163 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8933733 tacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 8933823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38593921 - 38593732
Alignment:
Q  63 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38593921 cttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgcaggcatgactgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttg 38593823  T
Q  163 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38593822 tacacttgtactttgtcaactctgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 38593732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 166933 - 167185
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  166933 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 167032  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  167033 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 167132  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  167133 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 167185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 177525 - 177777
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  177525 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 177624  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  177625 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 177724  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  177725 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 177777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9085335 - 9085586
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9085335 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 9085433  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9085434 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9085533  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9085534 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9085586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 9095049 - 9095300
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9095049 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 9095147  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9095148 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9095247  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9095248 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9095300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 11005236 - 11005488
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11005236 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11005335  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  11005336 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 11005435  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11005436 gtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 11005488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 13682373 - 13682623
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13682373 ttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcttgtgaaggattaacttcaaattcattcccattttgaaggaaca-tttctgc 13682471  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |||||||    
T  13682472 aggaatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaaggacaa 13682570  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  13682571 gcacccagtgattttcaaatgaacgttggtacctcccttttaattcttcgttc 13682623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8002314 - 8002061
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8002314 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 8002215  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  8002214 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 8002115  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8002114 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8002061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8012959 - 8012706
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8012959 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 8012860  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  8012859 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 8012760  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8012759 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8012706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 22089174 - 22089426
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22089174 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22089273  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||   |||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22089274 ggcatgactgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22089373  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089374 gtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22089426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 22099789 - 22100041
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22099789 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22099888  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  | ||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22099889 ggcatggttgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22099988  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22099989 gtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22100041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26390345 - 26390093
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26390345 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26390246  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26390245 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26390146  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26390145 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 26390093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26400987 - 26400735
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26400987 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26400888  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26400887 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26400788  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26400787 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 26400735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40042357 - 40042106
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  40042357 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 40042259  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  40042258 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 40042159  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40042158 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40042106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40052906 - 40052655
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  40052906 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 40052808  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  40052807 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 40052708  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40052707 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40052655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 1987591 - 1987844
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  1987591 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 1987690  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  1987691 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 1987790  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1987791 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1987844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 1998212 - 1998465
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  1998212 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 1998311  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  1998312 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 1998411  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1998412 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1998465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 42865878 - 42866131
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  42865878 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 42865977  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  42865978 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 42866077  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42866078 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 42866131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 42876504 - 42876757
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  42876504 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 42876603  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  42876604 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 42876703  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42876704 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 42876757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24734804 - 24735056
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24734804 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24734903  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |   |||||    
T  24734904 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctaataatgagagacaa 24735003  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24735004 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24735056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 24744751 - 24745003
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24744751 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24744850  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |   |||||    
T  24744851 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctaataatgagagacaa 24744950  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24744951 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24745003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26294278 - 26294067
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26294278 tcctttgattatacaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26294179  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26294178 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26294079  T
Q  201 gtactcagtgct 212  Q
    || |||||||||    
T  26294078 gtgctcagtgct 26294067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6044354 - 6044208
Alignment:
Q  107 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  6044354 agctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtaccc 6044255  T
Q  207 agtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6044254 agtgcctttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6044208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24882668 - 24882443
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24882668 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 24882570  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||    
T  24882569 aggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgttgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-ttaatgagggacaa 24882471  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    | || || |||| ||||||||| |||||    
T  24882470 gcacccattgcttttcaaatgaacgttg 24882443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38403456 - 38403331
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38403456 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttctgc 38403358  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtag 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38403357 aggcagagctgttgtcttgtcttgtag 38403331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 253
Target Start/End: Original strand, 48382304 - 48382449
Alignment:
Q  109 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactca 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| || ||    
T  48382304 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcaccca 48382403  T
Q  208 gtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  48382404 gtgcttttcaaatgaccgttgatacatcccttttaattcttcgttc 48382449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8999155 - 8998998
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8999155 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatattgtcttgta 8999057  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8999056 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 8998998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11087265 - 11087110
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11087265 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaaca-tttatgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 11087167  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaact 183  Q
    | || ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11087166 gtgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 11087110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 602636 - 602796
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||   ||||||| |||||  |  |||| |||||| ||||||||||||    
T  602636 ttgatcaagcaccaatgatcctttgcctgatttggatatagtcctatgaagaattgatttcaaatccattctgaatttgagggaaca-tttctgcaggca 602734  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaa-gaacagagtagtggaggtagtggttgtac 165  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  602735 gagctgtttttcttgtcctgtagcgtagacaaagaacagagtagtggaggaagtggttgtac 602796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13174827 - 13174668
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  13174827 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagtaaca-tttctgcatgcaaagctgtttttcttgtcttgt 13174729  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    || || || |  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13174728 agtgtagagacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 13174668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30944518 - 30944446
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944518 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30944446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16112112 - 16112007
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16112112 ttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttg 16112014  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  16112013 tacactt 16112007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33691940 - 33691835
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33691940 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtta 33691842  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  33691841 tacactt 33691835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48237130 - 48237025
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48237130 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 48237032  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  48237031 tacactt 48237025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 48382242 - 48382296
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaa 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48382242 ttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaa 48382296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Original strand, 4821440 - 4821509
Alignment:
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4821440 aggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4821509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21283568 - 21283496
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21283568 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21283496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 27871681 - 27871753
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27871681 tgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27871753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 44467027 - 44467099
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467027 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 44467099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 9069492 - 9069597
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9069492 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttg 9069590  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  9069591 tacactt 9069597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30945584 - 30945479
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||| | | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30945584 ttcaaatgcattcccattctgagggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 30945486  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  30945485 tacactt 30945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 1292993 - 1293065
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1292993 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1293065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 4494540 - 4494612
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4494540 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacactt 4494612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28622584 - 28622481
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  28622584 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttg 28622486  T
Q  163 tacac 167  Q
    |||||    
T  28622485 tacac 28622481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35952883 - 35952811
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35952883 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacactt 35952811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 169
Target Start/End: Original strand, 21692236 - 21692322
Alignment:
Q  83 tgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21692236 tgaaggaacaatgt-tgcaggcagagatgttatacttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 21692322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23280187 - 23280081
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggtt 161  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  23280187 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggtt 23280089  T
Q  162 gtacactt 169  Q
    ||||||||    
T  23280088 gtacactt 23280081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 8182911 - 8182965
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8182911 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 8182965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 24788122 - 24788176
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788122 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24788176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 28409020 - 28409074
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409020 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28409074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4412157 - 4412088
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4412157 tgcaggcagagctgttttccttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtaca 4412088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Original strand, 14426545 - 14426582
Alignment:
Q  132 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426545 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14426582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22578181 - 22578144
Alignment:
Q  132 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22578181 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22578144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24794891 - 24794838
Alignment:
Q  116 cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24794891 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 24794838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 331608 - 331680
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  331608 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacactt 331680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2265713 - 2265642
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2265713 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaa-aacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 2265642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9709997 - 9709925
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9709997 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacactt 9709925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19711208 - 19711136
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19711208 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacactt 19711136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41842468 - 41842396
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41842468 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacactt 41842396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48806074 - 48806002
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48806074 tgcatgcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 48806002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19237197 - 19237166
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19237197 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19237166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 169
Target Start/End: Original strand, 21695350 - 21695436
Alignment:
Q  83 tgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21695350 tgaaggaacaatgt-tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacactt 21695436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 14193044 - 14193149
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||| ||||||||| | |||||||| || |   ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14193044 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatggt-tgcaggaagagctgtttttcttgtcttttaacagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttg 14193142  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  14193143 tacactt 14193149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13894152 - 13894123
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894152 aacagagtagtggaggtagtggttgtacac 13894123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Original strand, 14425445 - 14425482
Alignment:
Q  132 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14425445 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 14425482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19339402 - 19339373
Alignment:
Q  140 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19339402 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19339373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32264895 - 32264842
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacact 168  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32264895 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacact 32264842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2913803 - 2913731
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2913803 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 2913731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7488059 - 7488023
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7488059 aacagagtagtggagatagtggttgtacagttgtact 7488023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12174535 - 12174464
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  12174535 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtactaaaggtagtggttgtacactt 12174464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13138090 - 13138018
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13138090 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacactt 13138018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13172502 - 13172470
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13172502 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 13172470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16316752 - 16316680
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16316752 tgcaggaagagctgctgttcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 16316680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29935553 - 29935481
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29935553 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacactt 29935481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Original strand, 33605668 - 33605720
Alignment:
Q  117 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||   ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33605668 ttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacactt 33605720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48063015 - 48062947
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 165  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48063015 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtac 48062947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 118)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20441529 - 20441277
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  20441529 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgt 20441430  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  20441429 aggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaa 20441330  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20441329 atactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20441277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18382115 - 18381864
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18382115 ttcctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 18382017  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18382016 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 18381917  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18381916 gtactcagggctctccaaatgactgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18381864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7689669 - 7689418
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7689669 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcacatcttgaaggcacaaattctgca 7689570  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  7689569 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 7689471  T
Q  202 t-actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7689470 taactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7689418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4250775 - 4250525
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4250775 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 4250676  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  4250675 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 4250577  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4250576 tgctcagcgctatccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 4250525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39194304 - 39194054
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39194304 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 39194205  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  39194204 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaga 39194106  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39194105 tactcagtgctatccaaataaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39194054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20195904 - 20195667
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20195904 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgatggaacaatt-ctgc 20195806  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20195805 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 20195706  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 239  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20195705 gtacctagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 20195667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 39586964 - 39587216
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39586964 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 39587062  T
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39587063 aggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaca 39587162  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  39587163 agtacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 39587216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9050699 - 9050447
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9050699 ttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaaatagcttcaaattcattaccatcttgaaggaac-atttctgc 9050601  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | | ||||    
T  9050600 aggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactttgttaaagaatgaca 9050501  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9050500 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttaatacctccctttcaaatcttcgttc 9050447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5973760 - 5974011
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5973760 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 5973859  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  5973860 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggcagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 5973958  T
Q  202 tactcagtgctcttc-aaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| | | | | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5973959 tgctcagcgttgtccaaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 5974011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 154499 - 154249
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  154499 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 154400  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  154399 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttatacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 154301  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  154300 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 154249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 35012918 - 35013169
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  35012918 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 35013017  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||    
T  35013018 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaag 35013117  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35013118 tgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 35013169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 47195256 - 47195508
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47195256 ttcctttgatcatccaccagtaatccttcgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 47195354  T
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  47195355 aggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaca 47195454  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| |||  ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47195455 agtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 47195508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11195278 - 11195027
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11195278 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgagtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 11195180  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||    
T  11195179 aggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaagacaa 11195080  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11195079 gtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11195027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14388337 - 14388086
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14388337 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 14388239  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  14388238 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaa 14388139  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14388138 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 14388086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23580538 - 23580286
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23580538 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 23580439  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23580438 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23580339  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23580338 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23580286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 148424 - 148174
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  148424 tcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 148325  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  148324 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 148226  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  148225 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgatactttcctttcaattcttcgttc 148174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 675442 - 675690
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  675442 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaaca-tttctgc 675540  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  675541 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 675639  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgt 251  Q
    | ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  675640 gcaccgagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgt 675690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 17957235 - 17957487
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17957235 ttcctttgatcttccaccagtaattctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttctgc 17957333  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||||||    
T  17957334 aggcatggttgttttcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtaaactctgataaagaaggaca 17957433  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17957434 aatactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 17957487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41132826 - 41132577
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  41132826 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaacagtt-ctgc 41132728  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  41132727 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaa 41132629  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
      || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41132628 acacccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 41132577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19187833 - 19188086
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19187833 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 19187932  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19187933 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19188032  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaa-atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19188033 gtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19188086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4167254 - 4167506
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  4167254 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 4167353  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4167354 ggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4167453  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4167454 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4167506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4177910 - 4178162
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||    
T  4177910 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattttgca 4178009  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4178010 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4178109  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4178110 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4178162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18311180 - 18310932
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18311180 ctttgatcattcaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgcagg 18311082  T
Q  104 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagta 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |    
T  18311081 tagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagca 18310982  T
Q  204 ctcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  18310981 cccagtgcttttcaaatgaccgttgatatcttcctttcaatccttcgttc 18310932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 12730542 - 12730794
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12730542 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12730641  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12730642 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12730741  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12730742 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12730794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 12741135 - 12741387
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12741135 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12741234  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12741235 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12741334  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12741335 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12741387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12898195 - 12897943
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12898195 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12898096  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12898095 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12897996  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12897995 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5639922 - 5639670
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5639922 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 5639823  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5639822 ggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5639723  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5639722 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5639670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5650479 - 5650227
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5650479 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 5650380  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5650379 ggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5650280  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5650279 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5650227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 21877762 - 21878014
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  21877762 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 21877861  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  21877862 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 21877961  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| |  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21877962 gtgctcagtgctatctatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21878014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 21895197 - 21895449
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  21895197 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 21895296  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  21895297 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 21895396  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21895397 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21895449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 33084557 - 33084809
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  33084557 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 33084656  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  33084657 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 33084756  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33084757 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 33084809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10997996 - 10997744
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10997996 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10997897  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  10997896 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 10997797  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10997796 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10997744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12614528 - 12614276
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12614528 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12614429  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  12614428 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 12614329  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12614328 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 12614276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 21863656 - 21863908
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  21863656 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 21863755  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  21863756 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaaacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 21863855  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21863856 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21863908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 19178954 - 19179207
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19178954 tcctttgattatccaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 19179053  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||   |||||    
T  19179054 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactatattaacgagagacaa 19179153  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaa-atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || || |||||| | ||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19179154 gtgcttagtgctatccaatatatccgttgataactccctttcaattcttcgttc 19179207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 7507297 - 7507549
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  7507297 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 7507396  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  7507397 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 7507496  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7507497 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 7507549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 7517894 - 7518146
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  7517894 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 7517993  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  7517994 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 7518093  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7518094 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 7518146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12623993 - 12623741
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12623993 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12623894  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  12623893 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 12623794  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12623793 gtgctcagtgatatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12623741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51629399 - 51629147
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  51629399 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 51629300  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  51629299 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 51629200  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51629199 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 51629147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51656660 - 51656408
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  51656660 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 51656561  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  51656560 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 51656461  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51656460 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 51656408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 2538531 - 2538782
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||   |||||    
T  2538531 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaa-ctgca 2538629  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  2538630 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 2538729  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2538730 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2538782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 3171617 - 3171870
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  3171617 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 3171716  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  3171717 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 3171816  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3171817 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 3171870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 3182219 - 3182472
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  3182219 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 3182318  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  3182319 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 3182418  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3182419 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 3182472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5833213 - 5833466
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  5833213 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 5833312  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  5833313 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 5833412  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5833413 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 5833466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 5843815 - 5844068
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  5843815 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 5843914  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  5843915 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 5844014  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5844015 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 5844068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35401377 - 35401124
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35401377 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35401278  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35401277 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35401178  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35401177 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35401124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35404604 - 35404351
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35404604 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35404505  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35404504 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35404405  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35404404 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35404351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35648903 - 35648650
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35648903 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35648804  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35648803 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35648704  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35648703 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35648650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35638251 - 35637998
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35638251 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35638152  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35638151 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35638052  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35638051 agtgctcagtgttatccatatatctgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35637998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 38095071 - 38095324
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  38095071 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 38095170  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  38095171 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 38095270  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38095271 ggtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 38095324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 38105696 - 38105949
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  38105696 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 38105795  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  38105796 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 38105895  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38105896 ggtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 38105949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47608143 - 47607890
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  47608143 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 47608044  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  47608043 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 47607944  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47607943 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 47607890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47618751 - 47618498
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  47618751 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 47618652  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  47618651 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 47618552  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47618551 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 47618498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36236641 - 36236390
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36236641 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 36236543  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36236542 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36236443  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36236442 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36236390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36247188 - 36246937
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36247188 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 36247090  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36247089 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36246990  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36246989 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36246937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 109 - 252
Target Start/End: Original strand, 12946818 - 12946961
Alignment:
Q  109 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcag 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||    
T  12946818 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggataaatactcag 12946917  T
Q  209 tgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12946918 tgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 12946961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46181090 - 46180865
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  46181090 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 46180992  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  ||||||    
T  46180991 aggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaagacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgagggacaa 46180893  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||    
T  46180892 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 46180865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 20798935 - 20799118
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20798935 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatagaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaatt-ctgc 20799033  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20799034 aggcagagctgttattttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 20799118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22610185 - 22609960
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||  || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22610185 ttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgagtgtagtcctataaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaacaatt-ctgc 22610087  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  | ||||    
T  22610086 aggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaggtacaa 22609988  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  22609987 gcactcagtgcttttcaaatgagcgttg 22609960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45070864 - 45070630
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45070864 ttcctttgatcattcaccactaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 45070766  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||     
T  45070765 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtaatttgtcaactct-tcaatgaaggacag 45070667  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 237  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  45070666 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctccc 45070630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20884093 - 20883910
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20884093 ttcctttgatcatccaccagtaatctgttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaagaa-ttctgc 20883995  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20883994 tggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagctaatggttgtacacttgtactttgtcaactct 20883910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 23926929 - 23927112
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || |  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||     
T  23926929 ttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgt 23927027  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23927028 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23927112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 5929600 - 5929799
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5929600 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctggtgtcttgtcttgta 5929698  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 226  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||   |||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  5929699 gcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaataaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgt 5929797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 28474100 - 28474323
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28474100 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaaca-tttctgcag 28474198  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||     
T  28474199 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaacaaaggacaagc 28474297  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||    
T  28474298 acccagtgcttttcaaatgaacgttg 28474323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Original strand, 44200912 - 44201108
Alignment:
Q  31 cctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 130  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  44200912 cctgatttggatgttgtcctatgaaagatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcaaagttgttatcttgtcttgtagcgt 44201010  T
Q  131 ggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  44201011 agacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcactcagtgcttttcaaatgaacgttg 44201108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 19037903 - 19038103
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | || ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19037903 tttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 19038001  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccg 225  Q
    ||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  19038002 agcgcagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagtgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacg 19038100  T
Q  226 ttg 228  Q
    |||    
T  19038101 ttg 19038103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 17370917 - 17371097
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17370917 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcatgaaggaaca-tttctgcaggca 17371015  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17371016 gagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 17371097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 28379892 - 28380049
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28379892 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 28379990  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||| ||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28379991 gcgtagacacaattagagtcgtggaggtactggttgtacacttgtactttgtcaactct 28380049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52350869 - 52350670
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  52350869 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggaca-tttctgcaggcagagctattatcttgtcttgta 52350771  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 226  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||    
T  52350770 gcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaagtgaacgt 52350672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19170539 - 19170360
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19170539 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaacgaaca-tttctgcaggca 19170441  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactc 184  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19170440 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtactttgtcaactc 19170360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 20251671 - 20251828
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20251671 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgttttgta 20251769  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    || | ||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20251770 gcatagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacccttgcactttgtcaactct 20251828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 22655352 - 22655532
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||  |||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22655352 ttgatcagtcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 22655450  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    || ||||| | ||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22655451 gaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22655532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 22019232 - 22019391
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 125  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  22019232 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggaagagctgtttatcttgtcttgt 22019330  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22019331 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22019391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 22642828 - 22642950
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  22642828 ttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagaactgtttatcttgtcttgtaccgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttg 22642926  T
Q  163 tacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  22642927 tacactttgtactttgtcaactct 22642950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Original strand, 23064935 - 23065045
Alignment:
Q  117 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttc 216  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| |||    
T  23064935 ttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttc 23065033  T
Q  217 aaatgaccgttg 228  Q
    |||||| |||||    
T  23065034 aaatgaacgttg 23065045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 21543904 - 21544064
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| | || ||| |  ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  21543904 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcatgttcaaatccattcctaacttgaaggaaca-tttctacaggca 21544002  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  21544003 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaagcaaagtagtggaggtagtggtcgtaca 21544064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 1900311 - 1900383
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900311 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1900383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25448751 - 25448608
Alignment:
Q  26 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttg 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  25448751 ctttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttg 25448653  T
Q  125 tagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25448652 tagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25448608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 36134156 - 36134228
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134156 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36134228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22464956 - 22464851
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  22464956 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatg 22464858  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  22464857 tacactt 22464851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 21702780 - 21702852
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21702780 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21702852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26548441 - 26548282
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  26548441 tttgcctgatttggatgctgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaaca-tttatgcagacagagctgtttatcctgtcttgt 26548343  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26548342 agcgtagacagaggcagtgtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 26548282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 35040132 - 35040204
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35040132 tgcaggcagagctttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35040204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22600366 - 22600224
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22600366 tttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgt 22600268  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 22600224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2327587 - 2327482
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||| ||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2327587 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaagcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttg 2327489  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  2327488 tacactt 2327482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 22153841 - 22153895
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22153841 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22153895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32786084 - 32785979
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||| ||||||||||| | |||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  32786084 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaagcagagctgtttttcttgtcttttagcggagacaaaaacatagtagtggagatagtggttg 32785986  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  32785985 tacactt 32785979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7745209 - 7745132
Alignment:
Q  93 atttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745209 atttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcatgtagcgaaggcaatagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7745132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 19215578 - 19215650
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19215578 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 19215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21135274 - 21135202
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21135274 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacactt 21135202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22427471 - 22427399
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22427471 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 22427399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 30572163 - 30572235
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30572163 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 30572235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 46088955 - 46089027
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46088955 tgcaggcagagctgttatccttgtctagtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 46089027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Original strand, 37642215 - 37642286
Alignment:
Q  99 gcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37642215 gcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 37642286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39201104 - 39201034
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39201104 tgcaggcagagctgtttt-ttgtgttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39201034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 2266962 - 2267127
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||| ||||  ||||||||||  || |||||     
T  2266962 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctt-tgcaga 2267060  T
Q  104 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    || ||||||| | ||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2267061 caaagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 2267127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 2268515 - 2268569
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2268515 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacactt 2268569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 10757354 - 10757459
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| |||||||| || |||||||||    
T  10757354 ttcaaattcattccaagtatgaaggaacaatg-ctgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttg 10757452  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  10757453 tacactt 10757459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21121178 - 21121108
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 167  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21121178 tgcagacagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacac 21121108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24028816 - 24028751
Alignment:
Q  81 cttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24028816 cttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagta 24028751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14263566 - 14263493
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263566 tgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14263493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Original strand, 2834562 - 2834725
Alignment:
Q  4 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 103  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  ||||| ||||   | |||||     
T  2834562 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatcgt-tgcaga 2834660  T
Q  104 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaa-gaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2834661 cagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtaca 2834725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16235410 - 16235338
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16235410 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacactt 16235338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 23024754 - 23024826
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23024754 tgcatgcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 23024826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 29215763 - 29215835
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29215763 tgcaggcagagctgtttttcttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacactt 29215835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33256465 - 33256393
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33256465 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 33256393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33276637 - 33276565
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33276637 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 33276565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48570345 - 48570273
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48570345 tgcaggcatagctgtttttcttgtcctgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 48570273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21191938 - 21191907
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191938 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21191907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 174
Target Start/End: Original strand, 23054370 - 23054409
Alignment:
Q  135 aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23054370 aagaacagagtagtgaaggtagtggttgtacaattgtact 23054409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Original strand, 35401777 - 35401847
Alignment:
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  35401777 aggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 35401847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44821641 - 44821587
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44821641 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacactt 44821587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21205017 - 21204965
Alignment:
Q  116 cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21205017 cttgtcttgtagcacagacaa-aacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21204965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23036676 - 23036569
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggt 160  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||  || |||| ||||| ||||||||||||    
T  23036676 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaacaaagtagaggaggtagtggt 23036578  T
Q  161 tgtacactt 169  Q
    |||||||||    
T  23036577 tgtacactt 23036569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34255630 - 34255561
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 166  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34255630 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtaca 34255561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Original strand, 38282500 - 38282600
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||| |||||||| || | ||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38282500 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaagcagagctatttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttg 38282598  T
Q  163 ta 164  Q
    ||    
T  38282599 ta 38282600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 1577833 - 1577905
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1577833 tgcaggcagagctggtatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 1577905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 10250952 - 10251024
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10250952 tgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacactt 10251024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12323 - 12072
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12323 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgc 12225  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  12224 aggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 12125  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12124 gtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16092 - 15903
Alignment:
Q  63 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16092 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgtaggtagtggttg 15994  T
Q  163 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||  | | ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15993 tacacttgtactttgtcaacttttatattgaatgacaagtatccattgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6423 - 6175
Alignment:
Q  5 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||    
T  6423 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctttaaggcacaaattttgcaggc 6324  T
Q  105 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  6323 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaattctgttaacgaaggacaaatac 6224  T
Q  205 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6223 tcagtgcttttcatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33111 - 32860
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33111 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 33012  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33011 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 32913  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  32912 atactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattattcgttc 32860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40661 - 40409
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  40661 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 40562  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  40561 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 40462  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40461 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 54330 - 54080
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  54330 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 54231  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  54230 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaaa 54132  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54131 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 54080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 14632 - 14884
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14632 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 14731  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14732 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14831  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14832 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5746 - 5674
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5746 tgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 5674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6842
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7092 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcag 6993  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  6992 gcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaat 6893  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     || |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6892 gcttagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Original strand, 1 - 235
Alignment:
Q  15 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  1 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaatttattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttg 100  T
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  101 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctat 200  T
Q  215 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 249  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  201 ccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttc 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10495 - 10244
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10495 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttaaaggaaca-tttctgc 10397  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  10396 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 10297  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10296 gtacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2425 - 2175
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  2425 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgattttggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgca 2326  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  2325 agcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 2227  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2226 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 2175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13815 - 13565
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  13815 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggaataatta-tgc 13717  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  13716 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaggacaa 13617  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
     |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13616 atactcagtgcttctgaaatgaccgttgatacctccctttcgattcttcgtt 13565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 5344 - 5595
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5344 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 5442  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  5443 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 5542  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     ||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5543 ttacccagtgcttttcaaccgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 5595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 253
Target Start/End: Original strand, 12896 - 12990
Alignment:
Q  159 gttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12896 gttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaccgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 12990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 2848 - 3098
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  2848 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggcacaaattctgca 2947  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  2948 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtattggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 3046  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3047 tgctaagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttc 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 42727 - 42477
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42727 tcctttgatcattcaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 42628  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||     
T  42627 ggcatagctgatgtcttgtcttgtagcgaggacaa-aacagagtagtggaggtagtcgttgtacacttgtacgttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 42529  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42528 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 42477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 31180 - 31432
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31180 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31279  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  31280 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 31379  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31380 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 31432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 52313 - 52058
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52313 tcctttgatcattcatcagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttatgca 52215  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagc----gtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgcagg 196  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||    
T  52214 ggcagagctgttatcttgtcttgcagcgtaggtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaagg 52115  T
Q  197 acaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52114 acaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 52058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36943 - 36691
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36943 ttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 36845  T
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  36844 aggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgttaactctgttaacgaaggaca 36745  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| |||  ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  36744 agtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 36691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 56989 - 56738
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56989 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 56891  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||    
T  56890 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaaatctgataacgaaggaaaa 56791  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     | | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56790 tttccccgtgcttttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 56738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 464
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagt 148  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  548 ttcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagt 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Original strand, 32447 - 32524
Alignment:
Q  93 atttctgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32447 atttttgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 32524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 175373 - 175624
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  175373 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 175471  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |  || ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | |||||||    
T  175472 aaacaaagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggacaa 175571  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  175572 gtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 175624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 253
Target Start/End: Original strand, 180424 - 180536
Alignment:
Q  141 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  180424 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttt 180523  T
Q  241 catttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||||    
T  180524 caattcttcgttc 180536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40551 - 40369
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40551 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 40453  T
Q  103 gcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  40452 gcaaagctgttatacttgtcttgtagcgaagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 40369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 59097 - 58915
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  59097 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 58999  T
Q  103 gcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| |   |||  | |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  58998 gcagagctgttatacttgtctcgtagtgcaaacacaagcagattcgtggaggtagtgattgtacaattgtactttgtcaactct 58915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 35586 - 35836
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35586 ttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 35684  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  35685 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaa 35783  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  35784 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc 35836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 40551 - 40753
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40551 ttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgc 40649  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40650 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 40749  T
Q  201 gtac 204  Q
    ||||    
T  40750 gtac 40753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7050 - 6798
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  7050 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 6951  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6950 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6851  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6850 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 15778 - 16027
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  15778 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttctaattcattcctttcttgaaggaaca-tttctgc 15876  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || | |||||||    
T  15877 aggcagagatgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtaccttgtcaactct-tcaatgaaggacaa 15975  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 252  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15976 gcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 16027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 140853 - 141104
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttt-gaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  140853 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttttgaaggatcaacttcaaactcattcccatcttgaaggaaca-tttctg 140951  T
Q  100 caggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | || | ||||||    
T  140952 caggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtaaact-tttcaatgaaggaca 141050  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |  || ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  141051 aacacccagtgctttttaaatgactgttgatacctcccttttaattcttcgttc 141104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 127695 - 127945
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  127695 ttcctttgatcatccaccagtaatcgtttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 127793  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || | |||||||    
T  127794 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttagtcaaatct-tcaatgaaggacaa 127892  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    | || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  127893 gcacccagtgctttttaaatgaccgttgatacctcccttttaattattcgttc 127945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7856 - 7632
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  7856 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagcatcaagttcaaattcattcatatcttgaatgaaca-tttctgcag 7758  T
Q  103 gcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 201  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  |||| |||    
T  7757 gcagagctgttatacttgtcttgtagcgcagacacactcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaacaaaggataag 7659  T
Q  202 tactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||    
T  7658 cacccagtgcttttcaaatgaacgttg 7632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 215641 - 215569
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215641 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 215569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13032 - 12795
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |    
T  13032 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggttgtagtcctttgaagtatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttttt-c 12934  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  ||||||    
T  12933 atgcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagagggacaa 12835  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12834 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttt 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 12404 - 12656
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 101  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12404 tcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12503  T
Q  102 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12504 ggcatggctgttgttttgtcttgtagagtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12603  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12604 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttaaattcttcgttc 12656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 19290 - 19538
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttt-gaataatt-agcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  19290 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaggaatttaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattcgg 19389  T
Q  100 c----aggcaga-gctgttgtcttgtcttgtagcgtgg--acaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacg 192  Q
         ||||| | | ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19390 tgtcgaggcataaggtgttgtcttgtcttgtagcgttggaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatg 19489  T
Q  193 caggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttc 241  Q
     ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19490 aaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttc 19538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17153 - 16912
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagt-aatcctttgcctgatttgggtgtag-tcctttgaataattagcttcaaa--ttcattcccatctt-gaaggaacaatt 95  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |    
T  17153 ttcctttgatcattcaccagttaatcctttgcctgatttgggtgtaggtcctttgaggaattaacttcaaaatttcattcccatctttgaaggcacaaat 17054  T
Q  96 tc---tgc-aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt-ggacaagaacagagtagtggaggtagt-ggttgtac-acttgtacttcgtcaactctgtt 188  Q
    ||   | | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17053 tcgtgtacgaggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgttggacaaaaacagagtagtggaggtagtgggttgtactacttgtactttgtcaactctgtt 16954  T
Q  189 --aacgcaggacaagtactcagtgctctt-caaatgaccgtt 227  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  16953 aaaacgaaggacaaatactcagtgctattccaaatgaccgtt 16912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 8009 - 8262
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8009 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 8108  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | ||    
T  8109 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggca 8208  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8209 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37166 - 36913
Alignment:
Q  2 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  37166 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 37067  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 199  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | ||    
T  37066 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggca 36967  T
Q  200 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36966 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 36913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47785 - 47547
Alignment:
Q  17 ccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgcaggcagagctgttgt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||  ||||||||    
T  47785 ccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgt 47686  T
Q  116 cttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 214  Q
     |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | ||||| ||||||| | |    
T  47685 tttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaagtgctcagtgttat 47586  T
Q  215 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
     || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47585 ccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 47547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 2043 - 2280
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2043 ttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgc 2141  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||| |     
T  2142 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggaaag 2240  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2241 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttt 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8177 - 8019
Alignment:
Q  95 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8177 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 8078  T
Q  195 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8077 ggacaaatactcagagctaaccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 253
Target Start/End: Original strand, 7362 - 7530
Alignment:
Q  84 gaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaact 183  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7362 gaaggaaca-tttatgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 7460  T
Q  184 ctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7461 ctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttc 7530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 172
Target Start/End: Original strand, 19137 - 19174
Alignment:
Q  135 aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgta 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19137 aagaacagagtagtcgaggtagtggttgtacaattgta 19174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 29523 - 29707
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcct-ttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29523 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctattgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctg 29621  T
Q  100 caggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29622 caggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 29707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 697 - 932
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  697 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcctatcttgaaggaacaa-ttctacag 795  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||||     
T  796 gcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagc 894  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  895 acacagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 5077 - 5312
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  5077 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcctatcttgaaggaacaa-ttctacag 5175  T
Q  103 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 202  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||||     
T  5176 gcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagc 5274  T
Q  203 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5275 acacagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 5312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 58350 - 58533
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  58350 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 58448  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  58449 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 58533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 1869 - 2106
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1869 ttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 1967  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | ||||||     
T  1968 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacag 2066  T
Q  201 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  2067 gcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 2106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 1254 - 1437
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1254 ttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgc 1352  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1353 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1755 - 1617
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||    
T  1755 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctaataatgaaggacaagtactcagtgttct 1656  T
Q  215 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1655 tcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 1617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29004 - 28820
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  29004 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccaatcttaaaggaacaa-ttctgc 28906  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggagg-tagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28905 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtagaggatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 28820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 767 - 950
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  767 ttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaa-ttctgc 865  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  866 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 59498 - 59316
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  59498 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttaggtgtagtcctatgaaggatgaacttcaaattcattcctatcttgaagg-acaa-ttctgc 59401  T
Q  101 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    ||| || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  59400 aggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagggtcgtggagataatggttgtacacttgtactttgtcaactct 59316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 175
Target Start/End: Original strand, 143031 - 143142
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgt-cttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | || | |||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  143031 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttttttttcttgtagcatagacaaaaactaagtagtggaggtagtggttg 143129  T
Q  163 tacacttgtactt 175  Q
    |||||||||||||    
T  143130 tacacttgtactt 143142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35230 - 35115
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  |||||    
T  35230 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccc 35131  T
Q  238 tttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||| ||||||||||    
T  35130 tttcaattcttcgttc 35115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 61119 - 61318
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  61119 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 61217  T
Q  127 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 226  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||    
T  61218 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttctaatgaacgt 61316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 212321 - 212393
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212321 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 212393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18044 - 17861
Alignment:
Q  3 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 102  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18044 cctttgatcattcaccattgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 17946  T
Q  103 gcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17945 gcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 17861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2874 - 2802
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2874 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 2802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20611 - 20432
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||   |||||| ||||||    
T  20611 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggac--atttctacaggca 20514  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20513 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 182
Target Start/End: Original strand, 5014 - 5170
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5014 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 5112  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaac 182  Q
    ||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5113 agcgtagacacacgcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaac 5170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6757 - 6577
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  6757 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 6659  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6658 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 6577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Original strand, 61629 - 61788
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  61629 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgtaggcagagctgtttatcttgtcttgt 61727  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  61728 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 61788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 11695 - 11816
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11695 ttcaaatccattcctatcttgaaggatcaatt-ctgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcgtagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttt 11792  T
Q  163 tacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  11793 tacactttgtactttgtcaactct 11816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38205 - 38120
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  38205 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 38120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1886 - 1727
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  1886 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacattttttt-aggcagagctgtttttcttgtcttgt 1788  T
Q  126 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 185  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1787 agcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtactttgtcaactct 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Original strand, 7181 - 7324
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7181 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaact-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 7279  T
Q  126 agcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7280 agcgtagacaaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacactt 7324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38319 - 38157
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||    
T  38319 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattttgatggaaca-tttctgcaggca 38221  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38220 gagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaa-aacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 38157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 990
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1170 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaaca-tttctgcaggca 1072  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 185  Q
    || ||||| | |||||||||||| || ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1071 gaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1363 - 1183
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1363 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaaca-tttctgcaggca 1265  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 185  Q
    || ||||| | |||||||||||| || ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1264 gaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 9999 - 9907
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9999 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttagatgcagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa 9907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6278 - 6166
Alignment:
Q  141 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||||| |  |||||| | || ||  ||||||||||||||||||    
T  6278 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctcccttt 6179  T
Q  241 catttcttcgttc 253  Q
    || ||||||||||    
T  6178 caattcttcgttc 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 16831 - 17007
Alignment:
Q  6 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 105  Q
    |||||||  ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  16831 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttatgcaggca 16929  T
Q  106 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaa 181  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  16930 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaa 17007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 165095 - 165018
Alignment:
Q  93 atttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  165095 atttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 165018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4110 - 3967
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 125  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  4110 tttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaact-tttctgcaggtagagctgtttttcttgtcttgt 4012  T
Q  126 agcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4011 agcgtagacgaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacactt 3967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4568 - 4468
Alignment:
Q  141 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | || ||  ||||||  ||||||||||    
T  4568 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctcccttt 4469  T
Q  241 c 241  Q
    |    
T  4468 c 4468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 1116
Alignment:
Q  27 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1218 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcagacagagctgttatcttgtcttgta 1120  T
Q  127 gcgt 130  Q
    ||||    
T  1119 gcgt 1116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15799 - 15694
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| |    
T  15799 ttcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggagatagtggtcg 15701  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  15700 tacactt 15694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 7348 - 7420
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7348 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 240
Target Start/End: Original strand, 22050 - 22149
Alignment:
Q  140 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22050 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaacaaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttgacaccttcctt 22148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 3271 - 3343
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3271 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 3343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17909 - 17837
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17909 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 17837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 9122 - 9194
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9122 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacactt 9194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27573 - 27501
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27573 tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25737
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25809 tgcaggcagagctgcttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34930 - 34876
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34930 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9352
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 185  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9281 tcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 9352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1876 - 1771
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1876 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttg 1778  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  1777 tacactt 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Original strand, 2951 - 3016
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgta 164  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2951 tgcaggcagagctgtttt-ttgtcttgtagcagggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgta 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 9954 - 10008
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9954 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15884 - 15811
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt--cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15884 tgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 15811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25544 - 25471
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt--cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25544 tgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 25471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1869
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||  |||| |||||||||||||||||| |    
T  1974 ttcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcg 1876  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  1875 tacactt 1869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6426 - 6346
Alignment:
Q  147 gtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  6426 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgagggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 6346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 415 - 379
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  415 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 14615 - 14687
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 14687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Original strand, 22643 - 22711
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 165  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22643 tgcaggcagtgctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 18998 - 19070
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18998 tgcaggcagagctgtttttcttttcttgtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 19070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22275 - 22203
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22275 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Original strand, 9530 - 9599
Alignment:
Q  101 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9530 aggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 9599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 1627 - 1699
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1627 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttctagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 1699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21115 - 21043
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21115 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31887 - 31851
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31887 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 31851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 211365 - 211437
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  211365 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatactt 211437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 244387 - 244356
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244387 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 244356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 377703 - 377630
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttg 170  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  377703 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttg 377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 90199 - 90127
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  90199 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacactt 90127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Original strand, 7639 - 7742
Alignment:
Q  64 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 162  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  7639 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa--actgagtagtggaggtagtggttg 7735  T
Q  163 tacactt 169  Q
    |||||||    
T  7736 tacactt 7742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36901 - 36847
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36901 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 36847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 42104 - 42158
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42104 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 42158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 16559 - 16601
Alignment:
Q  1 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtg 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16559 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtg 16601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 99331 - 99277
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  99331 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 99277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 37387 - 37441
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37387 tcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 37441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 135447 - 135501
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  135447 tcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 135501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 764 - 727
Alignment:
Q  132 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  764 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1864 - 1827
Alignment:
Q  132 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1864 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 253
Target Start/End: Original strand, 2550 - 2587
Alignment:
Q  216 caaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2550 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 253
Target Start/End: Original strand, 27001 - 27038
Alignment:
Q  216 caaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27001 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Original strand, 5991 - 6043
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 167  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5991 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 9873 - 9945
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9873 tgcaggcagagctgttttccttgttttgtagcagagataaaaacagagtagtgcaggtagtggttgtacactt 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2815 - 2763
Alignment:
Q  117 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2815 ttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 964 - 893
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  964 tgcagacagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 9923 - 9995
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9923 tgcaggcatagctgttatccttgtcttgtagcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 9995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 1657 - 1729
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1657 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 78510 - 78438
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  78510 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacactt 78438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 60770 - 60842
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60770 tgcaggcagagctgtttttcatgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 60842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Original strand, 84362 - 84429
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgta 164  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  84362 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgta 84429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2390
Alignment:
Q  219 atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2424 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5073 - 5019
Alignment:
Q  115 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5073 tcttgtcttgtagcagggacaaaaacatggtaatggaggtagtggttgtacactt 5019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19208 - 19175
Alignment:
Q  220 tgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19208 tgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 87741 - 87672
Alignment:
Q  101 aggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  87741 aggcagagttgttatcattgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 87672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 980 - 948
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  980 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6812
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| |||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6884 tgcatgcagagctgtttttcttgtgttgtagcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacactt 6812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10506 - 10474
Alignment:
Q  142 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10506 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 10474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10180
Alignment:
Q  102 ggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10248 ggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 10180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14912 - 14844
Alignment:
Q  102 ggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14912 ggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 14844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5469 - 5397
Alignment:
Q  98 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 169  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||   |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5469 tgcaggcagagctgttatccttttcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 5397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Original strand, 144913 - 144949
Alignment:
Q  138 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  144913 aacagagtagtggaggtagtggatgtacaattgtact 144949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University