View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18061_low_7 (Length: 511)

Name: NF18061_low_7
Description: NF18061
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18061_low_7
NF18061_low_7
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (87-500)||(1804327-1804740)
chr8 (87-500)||(18681363-18681775)
chr8 (88-500)||(36799304-36799714)
chr8 (89-500)||(31567674-31568084)
chr8 (89-500)||(31572895-31573305)
chr8 (89-500)||(9273019-9273432)
chr8 (216-470)||(22055675-22055930)
chr8 (190-481)||(22177531-22177824)
chr8 (216-470)||(22050157-22050412)
chr8 (252-428)||(44476236-44476414)
chr8 (252-428)||(44479498-44479676)
chr8 (252-428)||(19902928-19903105)
chr8 (252-428)||(23865434-23865611)
chr8 (190-459)||(22025522-22025795)
chr8 (252-428)||(23825124-23825301)
chr8 (252-428)||(17053597-17053775)
chr8 (252-428)||(25409554-25409731)
chr8 (270-428)||(30766966-30767126)
chr8 (190-459)||(22063525-22063798)
chr8 (251-428)||(14057606-14057784)
chr8 (253-428)||(18609793-18609969)
chr8 (227-358)||(25110911-25111043)
chr8 (251-454)||(41009457-41009658)
chr8 (227-453)||(21326822-21327047)
chr8 (253-383)||(21668901-21669034)
chr8 (227-428)||(21322234-21322439)
chr8 (227-385)||(21282101-21282261)
chr8 (346-454)||(20974118-20974228)
chr8 (227-454)||(10606904-10607136)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (87-500)||(21678104-21678514)
chr5 (89-500)||(17264632-17265043)
chr5 (94-500)||(22174942-22175350)
chr5 (89-500)||(17271114-17271525)
chr5 (190-428)||(9775467-9775704)
chr5 (190-470)||(758190-758471)
chr5 (190-470)||(22509108-22509389)
chr5 (253-428)||(37805317-37805492)
chr5 (190-470)||(22312767-22313049)
chr5 (252-428)||(19510999-19511177)
chr5 (190-495)||(20937525-20937833)
chr5 (252-428)||(23527448-23527627)
chr5 (251-428)||(22439724-22439902)
chr5 (252-428)||(21675471-21675648)
chr5 (270-428)||(1857520-1857680)
chr5 (255-455)||(10816746-10816949)
chr5 (255-455)||(23538773-23538976)
chr5 (300-428)||(23112785-23112914)
chr5 (344-429)||(19362597-19362678)
chr5 (344-428)||(19801964-19802044)
chr5 (367-428)||(24751647-24751707)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (88-500)||(806836-807246)
chr7 (87-500)||(23201337-23201751)
chr7 (87-500)||(23507464-23507878)
chr7 (87-500)||(11631777-11632189)
chr7 (87-500)||(18055546-18055958)
chr7 (87-500)||(18049067-18049479)
chr7 (87-500)||(20579780-20580190)
chr7 (190-428)||(23665767-23666004)
chr7 (174-470)||(15338782-15339081)
chr7 (190-470)||(15723154-15723436)
chr7 (190-428)||(29795730-29795967)
chr7 (190-428)||(29799549-29799786)
chr7 (199-495)||(14431920-14432218)
chr7 (190-495)||(35962675-35962983)
chr7 (253-428)||(11302852-11303027)
chr7 (190-470)||(15710930-15711212)
chr7 (190-470)||(19599798-19600080)
chr7 (197-470)||(1612579-1612854)
chr7 (252-428)||(12591635-12591812)
chr7 (252-428)||(14421354-14421532)
chr7 (190-428)||(14281583-14281822)
chr7 (252-428)||(13123971-13124148)
chr7 (252-428)||(13006306-13006484)
chr7 (252-428)||(12710900-12711077)
chr7 (252-428)||(13742505-13742682)
chr7 (254-428)||(16676192-16676367)
chr7 (252-428)||(4279963-4280140)
chr7 (252-428)||(19616295-19616472)
chr7 (253-429)||(16109067-16109244)
chr7 (254-428)||(17650429-17650603)
chr7 (199-355)||(14128244-14128400)
chr7 (253-428)||(20328249-20328425)
chr7 (251-456)||(6411791-6412000)
chr7 (253-397)||(11390327-11390473)
chr7 (253-397)||(11383839-11383985)
chr7 (253-397)||(18606896-18607042)
chr7 (253-383)||(21232034-21232167)
chr7 (251-454)||(11220110-11220311)
chr7 (227-315)||(36306034-36306121)
chr7 (344-428)||(37244401-37244484)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (87-500)||(14033070-14033482)
chr6 (87-500)||(33682039-33682452)
chr6 (87-500)||(23834985-23835396)
chr6 (104-500)||(27562392-27562786)
chr6 (132-500)||(28359735-28360104)
chr6 (190-428)||(28290147-28290384)
chr6 (253-428)||(12941800-12941975)
chr6 (190-470)||(1592715-1592997)
chr6 (190-470)||(22906921-22907204)
chr6 (190-470)||(19726562-19726844)
chr6 (190-470)||(21724699-21724981)
chr6 (252-428)||(12167237-12167415)
chr6 (252-428)||(19286146-19286324)
chr6 (252-428)||(25470691-25470868)
chr6 (252-428)||(29615199-29615376)
chr6 (252-428)||(34647652-34647829)
chr6 (252-428)||(19877330-19877508)
chr6 (252-428)||(19883106-19883284)
chr6 (227-409)||(21566163-21566346)
chr6 (252-428)||(23837580-23837758)
chr6 (252-428)||(34640978-34641155)
chr6 (255-470)||(937685-937903)
chr6 (252-428)||(24562282-24562459)
chr6 (252-428)||(19786871-19787050)
chr6 (255-389)||(29416468-29416605)
chr6 (227-340)||(18788448-18788560)
chr6 (227-340)||(18799428-18799540)
chr6 (252-354)||(11289602-11289705)
chr6 (253-458)||(8760427-8760636)
chr6 (344-459)||(14581950-14582060)
chr6 (251-454)||(19588580-19588781)
chr6 (253-340)||(19439792-19439879)
chr6 (289-455)||(19300705-19300868)
chr6 (401-458)||(8768316-8768373)
chr6 (390-428)||(11283984-11284022)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (88-500)||(12578721-12579131)
chr2 (87-500)||(27785623-27786035)
chr2 (87-500)||(27790844-27791256)
chr2 (88-500)||(12572239-12572649)
chr2 (89-500)||(27295842-27296253)
chr2 (123-428)||(10685497-10685801)
chr2 (190-495)||(2105508-2105816)
chr2 (253-428)||(20260824-20260999)
chr2 (252-428)||(6482321-6482499)
chr2 (252-428)||(6485788-6485966)
chr2 (252-428)||(5707014-5707191)
chr2 (227-428)||(23090006-23090207)
chr2 (252-428)||(26582675-26582852)
chr2 (227-428)||(23102434-23102635)
chr2 (252-428)||(23169298-23169475)
chr2 (252-428)||(23580555-23580732)
chr2 (252-428)||(200641-200818)
chr2 (253-428)||(9241333-9241509)
chr2 (270-428)||(27367600-27367760)
chr2 (252-428)||(43693401-43693578)
chr2 (227-428)||(23877838-23878040)
chr2 (252-428)||(6744324-6744501)
chr2 (190-408)||(22809901-22810121)
chr2 (254-426)||(23263985-23264158)
chr2 (227-385)||(21907291-21907452)
chr2 (251-383)||(19703480-19703615)
chr2 (251-454)||(20724011-20724212)
chr2 (227-454)||(23290904-23291129)
chr2 (255-385)||(21073982-21074114)
chr2 (344-385)||(24943419-24943460)
chr2 (350-426)||(23269201-23269276)
chr2 (350-426)||(23276070-23276145)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (87-500)||(42701154-42701566)
chr4 (87-500)||(51601909-51602321)
chr4 (89-500)||(51607792-51608202)
chr4 (87-500)||(41799788-41800200)
chr4 (89-500)||(635600-636012)
chr4 (87-500)||(53748589-53748999)
chr4 (190-495)||(23121530-23121838)
chr4 (253-428)||(15533786-15533961)
chr4 (187-470)||(20940216-20940501)
chr4 (190-470)||(14484385-14484668)
chr4 (252-428)||(11847053-11847230)
chr4 (190-470)||(17000105-17000388)
chr4 (253-428)||(18212138-18212314)
chr4 (253-470)||(43284896-43285116)
chr4 (252-428)||(8046897-8047074)
chr4 (190-459)||(11171196-11171468)
chr4 (255-455)||(4831090-4831293)
chr4 (255-455)||(4834385-4834588)
chr4 (253-383)||(15406955-15407088)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (87-500)||(44775129-44775541)
chr3 (87-500)||(44780313-44780725)
chr3 (89-500)||(13946402-13946812)
chr3 (89-500)||(13909457-13909867)
chr3 (87-500)||(8742747-8743158)
chr3 (87-500)||(8760917-8761328)
chr3 (89-500)||(13939916-13940322)
chr3 (87-500)||(41175405-41175815)
chr3 (87-500)||(41180543-41180953)
chr3 (87-500)||(4677092-4677502)
chr3 (190-481)||(12200150-12200440)
chr3 (198-470)||(13203486-13203759)
chr3 (216-495)||(16838466-16838746)
chr3 (190-495)||(14652654-14652961)
chr3 (253-470)||(16382880-16383100)
chr3 (253-413)||(12304763-12304924)
chr3 (252-428)||(9532849-9533027)
chr3 (227-409)||(17157079-17157262)
chr3 (252-428)||(41456147-41456325)
chr3 (227-406)||(24191783-24191963)
chr3 (252-428)||(8583294-8583471)
chr3 (252-428)||(14084531-14084708)
chr3 (252-428)||(14089932-14090109)
chr3 (252-428)||(49399473-49399650)
chr3 (227-428)||(16802425-16802626)
chr3 (190-451)||(14544129-14544394)
chr3 (252-428)||(24123203-24123380)
chr3 (305-495)||(16830055-16830247)
chr3 (270-428)||(13968850-13969010)
chr3 (270-428)||(13974325-13974485)
chr3 (253-461)||(14292668-14292881)
chr3 (255-455)||(34852211-34852414)
chr3 (273-428)||(17190836-17190992)
chr3 (216-339)||(16829943-16830065)
chr3 (253-397)||(23174189-23174333)
chr3 (268-385)||(17199056-17199175)
chr3 (253-386)||(17243680-17243815)
chr3 (253-428)||(12961402-12961580)
chr3 (253-317)||(31690595-31690659)
chr3 (366-454)||(18719250-18719339)
chr3 (253-315)||(23173876-23173938)
chr3 (254-385)||(18889009-18889143)
chr3 (367-428)||(11850780-11850840)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (89-500)||(27280120-27280531)
chr1 (190-495)||(3706701-3707008)
chr1 (199-495)||(23066648-23066947)
chr1 (252-428)||(20438531-20438709)
chr1 (227-470)||(22448244-22448484)
chr1 (252-428)||(21542056-21542233)
chr1 (252-428)||(42095903-42096080)
chr1 (252-428)||(20045879-20046056)
chr1 (255-470)||(20242488-20242708)
chr1 (252-428)||(41110814-41110992)
chr1 (227-455)||(32650074-32650304)
chr1 (227-428)||(19664105-19664306)
chr1 (329-470)||(955118-955263)
chr1 (227-428)||(19778434-19778639)
chr1 (227-454)||(29554419-29554645)
chr1 (344-428)||(36614935-36615015)
chr1 (190-315)||(955004-955128)
chr1 (344-428)||(24079551-24079634)
chr1 (344-428)||(24109120-24109203)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (87-379)||(40549-40840)
scaffold0124 (383-500)||(8493-8610)
scaffold0124 (253-428)||(36818-36994)
scaffold0124 (225-317)||(43965-44057)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (190-495)||(14435-14742)
scaffold0239 (190-393)||(7152-7356)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (190-470)||(141282-141563)
scaffold0021 (255-383)||(146611-146742)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (190-470)||(265056-265337)
scaffold0005 (190-470)||(258630-258911)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (190-470)||(41887-42169)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (253-481)||(63194-63425)
scaffold0026 (251-428)||(12876-13054)
scaffold0026 (253-458)||(124471-124680)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (253-470)||(50972-51192)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (251-468)||(6029-6250)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (227-487)||(152300-152562)
scaffold0011 (252-428)||(174561-174738)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (175-495)||(13939-14262)
scaffold0063 (175-470)||(24165-24463)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (253-461)||(10306-10518)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (252-428)||(110758-110935)
scaffold0029 (360-428)||(116793-116861)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (251-428)||(4617-4795)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (252-428)||(174561-174739)
scaffold0001 (252-428)||(489127-489304)
scaffold0001 (344-429)||(179002-179083)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (253-428)||(10259-10435)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (227-409)||(4275-4458)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (270-428)||(9649-9809)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (299-470)||(15511-15685)
scaffold0348 (227-317)||(3034-3123)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (252-428)||(38401-38578)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (252-428)||(35546-35723)
scaffold0076 (270-428)||(30162-30322)
scaffold0076 (253-407)||(51701-51858)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (252-428)||(46979-47156)
scaffold0028 (252-428)||(52384-52561)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (252-428)||(2566-2743)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (253-455)||(14572-14776)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (190-451)||(47350-47615)
scaffold0067 (190-451)||(62770-63035)
scaffold0067 (190-451)||(56384-56649)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (227-409)||(15432-15615)
scaffold0025 (190-362)||(71155-71328)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (264-428)||(29748-29913)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (251-409)||(10217-10377)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (251-461)||(5113-5327)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (253-397)||(168-314)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (270-409)||(1-132)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (190-362)||(20456-20629)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (300-428)||(1-131)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (218-459)||(17443-17688)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (367-495)||(3589-3718)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (251-337)||(1-87)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (227-455)||(4981-5214)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (253-383)||(41617-41750)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (254-385)||(102930-103063)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (227-428)||(8410-8615)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (227-383)||(326816-326975)
scaffold0004 (227-454)||(321040-321266)
scaffold0004 (254-385)||(115778-115911)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (266-428)||(27781-27945)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (185-383)||(7293-7493)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (414-468)||(78538-78594)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (251-454)||(27840-28041)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (253-383)||(417-550)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (253-383)||(16939-17072)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (253-458)||(5903-6111)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (340-454)||(13504-13620)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (227-451)||(16021-16250)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (414-456)||(16912-16955)
scaffold0074 (253-317)||(17006-17070)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (227-317)||(55975-56065)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (225-317)||(1027-1119)
scaffold0461 (225-317)||(7963-8055)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 1804327 - 1804740
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804327 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgaatagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 1804426  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804427 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 1804526  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804527 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 1804626  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804627 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 1804726  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  1804727 tatgaattaatatt 1804740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 18681363 - 18681775
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||    
T  18681363 gctgatatatatttccctggatgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 18681461  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18681462 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 18681561  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681562 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 18681661  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  18681662 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 18681761  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  18681762 tatgaattaatatt 18681775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 36799714 - 36799304
Alignment:
Q  88 ctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttg 187  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  36799714 ctgatatgtactttcttggatgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtacttaattaaa--ttccttaacgttgtaagttg 36799617  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799616 gttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 36799517  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799516 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 36799417  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggttt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  36799416 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtgt 36799317  T
Q  488 atgaattaatatt 500  Q
    |||||||||||||    
T  36799316 atgaattaatatt 36799304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 31567674 - 31568084
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttga 188  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||     
T  31567674 tgatatatatttccctggacgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagttgg 31567772  T
Q  189 atggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31567773 ttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatatagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctc 31567872  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31567873 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 31567972  T
Q  389 cggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggttta 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||| ||    
T  31567973 cggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatatagttgagaggtgta 31568072  T
Q  489 tgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||    
T  31568073 tgaattaatatt 31568084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 31572895 - 31573305
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttga 188  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||     
T  31572895 tgatatatatttccctggacgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagttgg 31572993  T
Q  189 atggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31572994 ttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctc 31573093  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573094 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 31573193  T
Q  389 cggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggttta 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||| ||    
T  31573194 cggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatatagttgagaggtgta 31573293  T
Q  489 tgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||    
T  31573294 tgaattaatatt 31573305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 9273019 - 9273432
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaa-tttccttaa-tgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  9273019 tgatatatatttccctagatgtcctggttggttgtgatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaaatttacttaaatgttgtaagtt 9273118  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273119 ggatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaagggg-attagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 9273217  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9273218 tctggaacgcttggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgttctgatgagaatgctttaaccattcga 9273317  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggt 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||     
T  9273318 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatggattgcatatgttgttgagaggg 9273417  T
Q  486 ttatgaattaatatt 500  Q
    |||| ||||||||||    
T  9273418 ttataaattaatatt 9273432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 216 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22055930 - 22055675
Alignment:
Q  216 taggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggt 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  22055930 taggttggttg-tatgtagatatactcaagtgggtcat--ttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggt 22055834  T
Q  315 ggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattt 412  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||    
T  22055833 ggagcactagttgcttaaagtggtgttagtggtgaggatttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-tt 22055735  T
Q  413 ttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22055734 atggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 22055675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 22177824 - 22177531
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||| | | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  22177824 tggtgagtcatatacatatatatgcataggtttggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcaaaaaagtgggagagcttcggctc 22177727  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  22177726 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcacaagttgctcaaagtggtgttagtggtgaagacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 22177627  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgag 481  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  22177626 agcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagtggcatgtgtcgttgag 22177531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 216 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22050412 - 22050157
Alignment:
Q  216 taggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggt 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  22050412 taggttggttg-tatgtagatatactcaagtgggtcat--ttgcataagcataacagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagtggt 22050316  T
Q  315 ggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattt 412  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||    
T  22050315 ggagcactagttgcttaaagtggtgttagtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-tt 22050217  T
Q  413 ttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22050216 atggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggaatggtgatgagttgcat 22050157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44476414 - 44476236
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||  |||||  || ||||||    
T  44476414 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaacggtgtggagcggtgag 44476315  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44476314 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 44476236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44479676 - 44479498
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||  |||||  || ||||||    
T  44479676 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaacggtgtggagcggtgag 44479577  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44479576 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 44479498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 19902928 - 19903105
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  19902928 tagttgcataaatatca-agtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 19903026  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19903027 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 19903105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23865611 - 23865434
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23865611 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 23865513  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  23865512 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccatttgacagcggtgtgggtcatggccctggattatggtaccacatgcat 23865434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 459
Target Start/End: Original strand, 22025522 - 22025795
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||  | |||||||||||||  ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22025522 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgagttgtatgtagatatagacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctc 22025619  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcg 384  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||     
T  22025620 tggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattct 22025719  T
Q  385 acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtg 459  Q
    ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  22025720 acagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagaggagtggtg 22025795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23825301 - 23825124
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  23825301 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 23825203  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23825202 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 23825124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17053775 - 17053597
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  17053775 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcagctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaaactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 17053676  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  17053675 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcggcagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 17053597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25409731 - 25409554
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||     
T  25409731 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggatcgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgat 25409632  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  25409631 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatggtaccacatgcat 25409554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 270 - 428
Target Start/End: Original strand, 30766966 - 30767126
Alignment:
Q  270 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||  |||    
T  30766966 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtccttatga 30767065  T
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30767066 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 30767126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 459
Target Start/End: Original strand, 22063525 - 22063798
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||  | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22063525 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctc 22063622  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcg 384  Q
     |||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||     
T  22063623 cggaacgccttgtcgttcaaagcggtggagcactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattct 22063722  T
Q  385 acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtg 459  Q
    ||||||||| |||   || |||||| || |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  22063723 acagcggtgagggcttcgaccctga-ttatggtactaaatgcatgggtgttgttagaggagtcttagaggagtggtg 22063798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 428
Target Start/End: Original strand, 14057606 - 14057784
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||    
T  14057606 ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtga 14057705  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||  | |||||||||||||||    
T  14057706 ggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgcat 14057784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18609969 - 18609793
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  18609969 agttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaatgccttgtcgttgaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 18609870  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||  | |||||||||||||||    
T  18609869 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcagtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgcat 18609793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25111043 - 25110911
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  25111043 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaatgtcttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 25110946  T
Q  326 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgt 358  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  25110945 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgt 25110911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 454
Target Start/End: Original strand, 41009457 - 41009658
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||    
T  41009457 ttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtga 41009556  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtct 446  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||     | |||||||||||    
T  41009557 ggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggtttcggccctga-ttatggtaccacatgcat-----tgtagaggagtct 41009650  T
Q  447 tagtggag 454  Q
    ||||||||    
T  41009651 tagtggag 41009658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 453
Target Start/End: Original strand, 21326822 - 21327047
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  21326822 gtatgtagatatacacaagtggatttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 21326921  T
Q  327 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 421  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| || ||||||||    
T  21326922 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtacca 21327020  T
Q  422 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtgga 453  Q
    |||||||     | ||||||||||||||||||    
T  21327021 catgcat-----tgtagaggagtcttagtgga 21327047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21669034 - 21668901
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  21669034 agttacataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 21668935  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  21668934 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 21668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 21322234 - 21322439
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| || ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  21322234 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggtctcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 21322333  T
Q  327 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 421  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| || ||||||||    
T  21322334 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtacca 21322432  T
Q  422 catgcat 428  Q
    |||||||    
T  21322433 catgcat 21322439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21282261 - 21282101
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||  ||||||  ||| ||    
T  21282261 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaaacggtggaacacttgt 21282164  T
Q  326 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
    |  |||||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  21282163 tgttcaaagcggtgtatagcggtgacgactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcga 21282101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 454
Target Start/End: Original strand, 20974118 - 20974228
Alignment:
Q  346 tgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagagga 442  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  20974118 tgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattctattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtgttgtagaaga 20974216  T
Q  443 gtcttagtggag 454  Q
    ||||||||||||    
T  20974217 gtcttagtggag 20974228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10607136 - 10606904
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtac-tagt 325  Q
    |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| ||||| || ||||| |||  ||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  || | ||    
T  10607136 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacaccttgt 10607037  T
Q  326 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 421  Q
    |  |||| | |||||  || |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || ||||||||    
T  10607036 tgttcaacgcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctga-ttatggtacca 10606938  T
Q  422 catgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggag 454  Q
    |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  10606937 catgcatgagtgttgtagaagggtcttagtggag 10606904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 21678104 - 21678514
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  21678104 gctgatatatatttccctggatgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa--ttccttaacgttgtaagtt 21678201  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678202 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 21678301  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678302 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 21678401  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678402 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggt-attagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 21678500  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  21678501 tatgaattaatatt 21678514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 17264632 - 17265043
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaa-tgttgcaagttg 187  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||    
T  17264632 tgatatatatttccctggatgtcctggttggttgtgatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattg 17264731  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17264732 gatggtgaatcatatataagtatatgtt-agattggttggtatgtagatatactcaagggg-attagttgcataaacatcacagtgggagagcttcggct 17264829  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17264830 ctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgac 17264929  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |    
T  17264930 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatgggttgcatatgttgttgagagggt 17265029  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||| ||||||||||    
T  17265030 tataaattaatatt 17265043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 94 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22175350 - 22174942
Alignment:
Q  94 tatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaa-tttccttaat-gttgcaagttgaatg 191  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||| |||    
T  22175350 tatattttcctggatgtcctggttggttgtgatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaaatttacttaaacgttgtaagttggatg 22175251  T
Q  192 gtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaa-cataacagtgggagagcttcggctctg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22175250 gtgaatcatatatatgtatatgtt-agattggttggtatgtagatatactcaagggg-attagttgcataaaacataacagtgggagagcttcggctctg 22175153  T
Q  291 gaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagc 389  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22175152 gaacgcttggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggttaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagc 22175053  T
Q  390 ggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtttat 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22175052 ggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatgggttgcatatgttgttgagagggttat 22174953  T
Q  490 gaattaatatt 500  Q
     ||||||||||    
T  22174952 aaattaatatt 22174942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 17271114 - 17271525
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaa-tgttgcaagttg 187  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||    
T  17271114 tgatatatatttccctggatgtcctggttggttgtgatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattg 17271213  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17271214 gatggtgaatcatatataagtatatgtt-agattggttggtatgtagatatactcaagggg-attagttgcataaacatcacagtgggagagcttcggct 17271311  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17271312 ctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcaac 17271411  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |    
T  17271412 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatgggttgcatatgttgttgagagggt 17271511  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||| ||||||||||    
T  17271512 tataaattaatatt 17271525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9775704 - 9775467
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9775704 tggtgagtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctc 9775607  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9775606 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgaca 9775507  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9775506 gtggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcat 9775467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Original strand, 758190 - 758471
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  758190 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 758287  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| |||    
T  758288 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttacgtcctgaaatgaatgctttaaccattctaca 758387  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  758388 gcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 758471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Original strand, 22509108 - 22509389
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22509108 tggtgagtcatatacacatatatgtataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggatc 22509205  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  22509206 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 22509305  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgg-gtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22509306 agcggtgagggctacggtcttga-ttttggtaccacatgcatggtgttgttagaggagtcttagttgagtggtgatgagttgcat 22509389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Original strand, 37805317 - 37805492
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37805317 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctgtaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 37805416  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37805417 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctga-ttttggtaccacatgcat 37805492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Original strand, 22312767 - 22313049
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  22312767 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcgactc 22312864  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  22312865 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtcagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 22312964  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22312965 agcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagaggtgatgagttgcat 22313049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19511177 - 19510999
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  19511177 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 19511078  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19511077 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 19510999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 20937833 - 20937525
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  20937833 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctg 20937736  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||| |    
T  20937735 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcttgaaaatgaatgctttaaccattcta 20937636  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagag 483  Q
    || ||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||| |    
T  20937635 catcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggggtggtgatgagttgcatgagtcgttgagtg 20937537  T
Q  484 gtttatgaatta 495  Q
    | |||| |||||    
T  20937536 ggttattaatta 20937525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23527627 - 23527448
Alignment:
Q  252 tagttgcat-aaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  23527627 tagttgcattaaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtga 23527528  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  23527527 ggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 23527448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 428
Target Start/End: Original strand, 22439724 - 22439902
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||| |||| |  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  22439724 ttagttgcataagcataaaagtgggagagctccggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtgaaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 22439823  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22439824 ggacttatgtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 22439902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 21675471 - 21675648
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  21675471 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 21675569  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21675570 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 21675648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 428
Target Start/End: Original strand, 1857520 - 1857680
Alignment:
Q  270 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  1857520 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 1857619  T
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  1857620 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 1857680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 255 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10816949 - 10816746
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10816949 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaattggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 10816850  T
Q  353 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 450  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  10816849 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacgacactga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 10816751  T
Q  451 ggagt 455  Q
    |||||    
T  10816750 ggagt 10816746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 255 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 23538976 - 23538773
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  23538976 ttgcataatcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgacttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 23538877  T
Q  353 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 450  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  23538876 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccatactacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 23538778  T
Q  451 ggagt 455  Q
    |||||    
T  23538777 ggagt 23538773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 300 - 428
Target Start/End: Original strand, 23112785 - 23112914
Alignment:
Q  300 gtcgttcaaagtggtggagtacta-gttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 397  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23112785 gtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgaggg 23112884  T
Q  398 tcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23112885 tcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 23112914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19362678 - 19362597
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatg 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  19362678 ggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg--ttttggtaccacatgcatg 19362597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 428
Target Start/End: Original strand, 19801964 - 19802044
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  19801964 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg--ttttggtaccacatgcat 19802044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Original strand, 24751647 - 24751707
Alignment:
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  24751647 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcat 24751707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 500
Target Start/End: Original strand, 806836 - 807246
Alignment:
Q  88 ctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttg 187  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  806836 ctgatatgtactttcttggatgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtacttaattaaa--ttccttaacgttgtaagttg 806933  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  806934 gttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 807033  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807034 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 807133  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggttt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  807134 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtgt 807233  T
Q  488 atgaattaatatt 500  Q
    |||||||||||||    
T  807234 atgaattaatatt 807246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 23201337 - 23201751
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23201337 gctgatatatctttccctggatgtcctggttggttgtgatgattagatgtggactgaatgtatgtcttatttaattaaaattcccttaatgttgtaagtt 23201436  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatat--gtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcg 284  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23201437 ggatggtgaatcatatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtggatatactcaagggg-attagttgcataaacataaaagtgagagagcttcg 23201535  T
Q  285 gctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23201536 gctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcg 23201635  T
Q  385 acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagagg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201636 acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagagg 23201735  T
Q  485 tttatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||||    
T  23201736 tttatgaattaatatt 23201751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 23507464 - 23507878
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23507464 gctgatatatctttccctggatgtcctggttggttgtgatgattagatgtggactgaatgtatgtcttatttaattaaaattcccttaatgttgtaagtt 23507563  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatat--gtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcg 284  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23507564 ggatggtgaatcatatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtggatatactcaagggg-attagttgcataaacataaaagtgagagagcttcg 23507662  T
Q  285 gctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23507663 gctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcg 23507762  T
Q  385 acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagagg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507763 acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagagg 23507862  T
Q  485 tttatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||||    
T  23507863 tttatgaattaatatt 23507878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 11631777 - 11632189
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || | ||||| |||||| | |||||||| ||| ||  |||||||| ||| ||||||| |||||| | || |||||    
T  11631777 gctgatatatatttccctggatgctttagctggttttgatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataaataaaattcccttaaaggtgtaagtt 11631875  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631876 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 11631975  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631976 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 11632075  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  11632076 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 11632175  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  11632176 tatgaattaatatt 11632189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 18055546 - 18055958
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  || ||||||| |||||| | |||| ||| ||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||    
T  18055546 gctgatatatatttccctagatgctttagttggttttgatgaatggatgttgactga-tgtgtgttgtatataattaaaattcccttaaaggtgtaagtt 18055644  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055645 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 18055744  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055745 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 18055844  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||     
T  18055845 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatatggttgagaggtg 18055944  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  18055945 tatgaattaatatt 18055958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 18049067 - 18049479
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  || ||||||| |||||| | |||| ||| ||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||    
T  18049067 gctgatatatatttccctagatgctttagttggttttgatgaatggatgttgactga-tgtgtgttgtatataattaaaattcccttaaaggtgtaagtt 18049165  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049166 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 18049265  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049266 tctggaatgcttagtcgttcaaagaggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 18049365  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||     
T  18049366 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatatggttgagaggtg 18049465  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  18049466 tatgaattaatatt 18049479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 20579780 - 20580190
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||| | |||||||| ||| ||  |||||||| |||||||| || | |||| | || |||||    
T  20579780 gctgatatatatttccctggatgc-ttagttggttttgatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataattaaa-ttcctttaaaggtgtaagtt 20579876  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20579877 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 20579976  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579977 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 20580076  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  20580077 agcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgagaggtg 20580176  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  20580177 tatgaattaatatt 20580190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 428
Target Start/End: Original strand, 23665767 - 23666004
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23665767 tggtgagtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctc 23665864  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23665865 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgaca 23665964  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665965 gtggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcat 23666004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15339081 - 15338782
Alignment:
Q  174 aatgttgcaagttgaa-tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacag 271  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  15339081 aatgttgtaaattgaagtggtgagtcatatacacatatatgtataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacag 15338984  T
Q  272 tgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||    
T  15338983 tgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaa 15338884  T
Q  370 tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttg 467  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15338883 tgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttg 15338785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Original strand, 15723154 - 15723436
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15723154 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 15723251  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  15723252 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 15723351  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15723352 agcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 15723436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29795967 - 29795730
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  29795967 tggtgagtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctc 29795870  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29795869 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgaca 29795770  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29795769 gtggtatgggtcacggccctg-gttttggtaccacatgcat 29795730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29799786 - 29799549
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  29799786 tggtgagtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctc 29799689  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29799688 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgaca 29799589  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29799588 gtggtatgggtcacggccctg-gttttggtaccacatgcat 29799549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14432218 - 14431920
Alignment:
Q  199 atatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgct 297  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  14432218 atatatatatatatgcataggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaacgcc 14432121  T
Q  298 tagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtg 395  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14432120 ttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgag 14432021  T
Q  396 ggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtttatgaat 493  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| || |||| |||    
T  14432020 ggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggggtcttagtggagtggtgatgagttgcatgagtcgttgagtgggttattaat 14431922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 495
Target Start/End: Original strand, 35962675 - 35962983
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| |||||||  | ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35962675 tggtgagtcatatacttatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctc 35962772  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  35962773 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcta 35962872  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagag 483  Q
    |||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |    
T  35962873 cagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcatgagtcgttgagtg 35962971  T
Q  484 gtttatgaatta 495  Q
    | |||| |||||    
T  35962972 ggttattaatta 35962983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11303027 - 11302852
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11303027 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 11302928  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11302927 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaaaggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcat 11302852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Original strand, 15710930 - 15711212
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15710930 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggatc 15711027  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||    
T  15711028 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgatttaaccattctac 15711127  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15711128 agcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgaagagttgcat 15711212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19600080 - 19599798
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  |||||| | | |||||||||||||| ||| |||||   ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19600080 tggtgagtcatatatatatatatgcataggtttggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgtataagcataatagtgggagagcttcggctc 19599983  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| ||    
T  19599982 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggatcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaataaatgctttaaccattctac 19599883  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19599882 agcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcgtgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 19599798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1612854 - 1612579
Alignment:
Q  197 tcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgc 296  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||  | |||||||||||||| |||  ||  | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1612854 tcatatatacgtatatgtat-ggttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttggataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 1612756  T
Q  297 ttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgt 394  Q
     | ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||     
T  1612755 cttgtcgttcaaagtggtggaacactatttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgg 1612656  T
Q  395 gggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1612655 gggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagtggcat 1612579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 12591635 - 12591812
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  12591635 tagttgcataatcatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcttcgtcgttcaaagcggtggagcactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 12591733  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12591734 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 12591812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14421532 - 14421354
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||   ||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  14421532 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacgctagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 14421433  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14421432 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 14421354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 428
Target Start/End: Original strand, 14281583 - 14281822
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14281583 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctc 14281680  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  14281681 tggaatgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcta 14281780  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  14281781 cagcggtgagggctacggccctga-ttatggtaccacatgcat 14281822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 13123971 - 13124148
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  13123971 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 13124069  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  13124070 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggattatggtaccacatgcat 13124148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13006484 - 13006306
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  13006484 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 13006385  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  13006384 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 13006306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 12710900 - 12711077
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  12710900 tagttgcataaatatca-agtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 12710998  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  12710999 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggattatggtaccacatgcat 12711077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13742682 - 13742505
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  13742682 tagttgcataaacatca-agtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 13742584  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  13742583 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtaacggccctaaattatggtaccacatgcat 13742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16676367 - 16676192
Alignment:
Q  254 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 351  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  16676367 gttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtcgagcggtgagga 16676268  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  16676267 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcctta-atatggtaccacatgcat 16676192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4280140 - 4279963
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  4280140 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 4280042  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4280041 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 4279963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19616472 - 19616295
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  19616472 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 19616374  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19616373 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 19616295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 429
Target Start/End: Original strand, 16109067 - 16109244
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16109067 agttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 16109166  T
Q  352 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatg 429  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16109167 cttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatg 16109244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17650603 - 17650429
Alignment:
Q  254 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 351  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  17650603 gttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaa-gcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtcgagcggtgagga 17650505  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  17650504 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcct-aaatatggtaccacatgcat 17650429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14128400 - 14128244
Alignment:
Q  199 atatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgct 297  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  14128400 atatatatatatatgcataggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaacgcc 14128303  T
Q  298 tagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggactta 355  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14128302 ttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggactta 14128244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Original strand, 20328249 - 20328425
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  20328249 agttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 20328348  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | | |||||||||||||||    
T  20328349 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggctacggtcctg-tatatggtaccacatgcat 20328425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 6412000 - 6411791
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||  |||  ||| |||||    
T  6412000 ttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgcattgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcagtgtatagcggtga 6411901  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtc 445  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6411900 ggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaacaattctacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtgttgttagaggagtc 6411802  T
Q  446 ttagtggagtg 456  Q
    |||||||||||    
T  6411801 ttagtggagtg 6411791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 397
Target Start/End: Original strand, 11390327 - 11390473
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  ||||||||||    
T  11390327 agttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagtggtgagg 11390426  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 397  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11390427 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggagtggg 11390473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 397
Target Start/End: Original strand, 11383839 - 11383985
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||  ||||||   |||||| ||||  ||| |||||||    
T  11383839 agttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtggttcaaagcggtgtttagcggtgagg 11383938  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 397  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11383939 acttaagtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggagtggg 11383985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18607042 - 18606896
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| || | || |||||||| ||||||  ||||||   |||||| |||||  || |||||||    
T  18607042 agttgcataagcataaaagtgagagagcttcgactctggaacgccttgtggttcaaagcggtggaacactagtggttcaaagcggtgtttagcggtgagg 18606943  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 397  Q
    |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606942 acttatgttctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 18606896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 383
Target Start/End: Original strand, 21232034 - 21232167
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  21232034 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 21232133  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  21232134 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 21232167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 454
Target Start/End: Original strand, 11220110 - 11220311
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  11220110 ttagttgcagaagcataaaagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttaagcggtga 11220209  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtct 446  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||||||  | ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||     | |||||||||||    
T  11220210 ggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaaatagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat-----tgtagaggagtct 11220303  T
Q  447 tagtggag 454  Q
    ||||||||    
T  11220304 tagtggag 11220311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 315
Target Start/End: Original strand, 36306034 - 36306121
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 315  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  36306034 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 36306121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 428
Target Start/End: Original strand, 37244401 - 37244484
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||    
T  37244401 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat 37244484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14033482 - 14033070
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||    
T  14033482 gctgatatatatttccctggatgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 14033384  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14033383 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 14033284  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033283 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 14033184  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  14033183 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 14033084  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  14033083 tatgaattaatatt 14033070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 33682039 - 33682452
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||| |||| || ||    
T  33682039 gctgatatatacttccctggatgctttggttggttgtgatgaatggatgctgactgaatgtacgttgtacttaattaaaattcccttaaagttgtaaatt 33682138  T
Q  187 gaatggtgaatcatatat-atgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcgg 285  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33682139 ggatggtgaatcatatattatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactcaagggg-attagttgcataaacataacagtgggagagctttgg 33682237  T
Q  286 ctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33682238 ctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcga 33682337  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggt 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33682338 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagatgt 33682437  T
Q  486 ttatgaattaatatt 500  Q
    |||||||||||||||    
T  33682438 ttatgaattaatatt 33682452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23835396 - 23834985
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||| | |||| ||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| | || | |||    
T  23835396 gctgatatatatttccctggatgctttagttggtt-tgatgaatggatgttgactga-tgtgtgttgtatataattaaaatttccttaaagatgaaggtt 23835299  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835298 gattggtgaatcatatatatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 23835199  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835198 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 23835099  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  23835098 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgagaggtg 23834999  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||| ||||||||    
T  23834998 tatgatttaatatt 23834985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 104 - 500
Target Start/End: Original strand, 27562392 - 27562786
Alignment:
Q  104 tggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttgaatggtgaatcatata 203  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  27562392 tggatgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtgtttaattaaaatt-ccttaacgttgtaagttggttggtgaatcatata 27562490  T
Q  204 tatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcg 303  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27562491 tatgtatatgtctaggttgggtagtatgtagatatactcaatggggattagttgcattaacataacagcgggagagcttcggctctggaatgcttagtcg 27562590  T
Q  304 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27562591 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 27562690  T
Q  404 ccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtttatgaattaatatt 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27562691 ccctgattcttggtaccacatgcatgggtg-ttagaggagttttagtggagtggtgataagttgcatttgttattgagaggtttatgaattattatt 27562786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 132 - 500
Target Start/End: Original strand, 28359735 - 28360104
Alignment:
Q  132 gatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttgaatggtgaatcatatatatgtatat--gtttaggttggttggta 229  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||  || ||||| ||||||||    
T  28359735 gatgctgactgattgaatgttgtatttaaataaaatt-ccttaacgttgtaagttggttggtgaaacatatatatatatatatgtctaggtgggttggta 28359833  T
Q  230 tgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttact 329  Q
    |||||||||||   | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28359834 tgtagatatacaacaaggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttact 28359933  T
Q  330 caaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28359934 caaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacaaaggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatg 28360033  T
Q  430 ggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtttatgaattaatatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28360034 ggtgtttagaggagtcttagtggagtagtaataagttgcatatattgttgagaggtgtatgagttaatatt 28360104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 428
Target Start/End: Original strand, 28290147 - 28290384
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28290147 tggtgagtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcatgagcataacagtgggagagtttcggctc 28290244  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28290245 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtgatgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgaca 28290344  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28290345 gcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 28290384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12941975 - 12941800
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12941975 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 12941876  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12941875 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcat 12941800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1592997 - 1592715
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||| ||||| ||| |||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1592997 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtaggtatacacaagtgggtc--agttgcaaaagcataacagtgggagagcttcggctc 1592900  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  1592899 tggaacgccttctcgttcaaagtggtggagtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcgac 1592800  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1592799 agcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcataggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 1592715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22907204 - 22906921
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22907204 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agctgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 22907107  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  22907106 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcta 22907007  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22907006 cagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatacatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 22906921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19726844 - 19726562
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||| | | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19726844 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttaggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctc 19726747  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    | ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  19726746 tagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 19726647  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19726646 agcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttggtggagtggtgatgagttgcat 19726562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Original strand, 21724699 - 21724981
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||| ||||| ||| |||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21724699 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtaggtatacacaagtgggtc--agttgcaaaagcataacagtgggagagcttcggctc 21724796  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggt-gtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || || | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |     
T  21724797 tggaacgcctaatagatcaaagtggtggagtactagttgctcaaagtggtattagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctat 21724896  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21724897 agcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgtatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 21724981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12167415 - 12167237
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  12167415 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 12167316  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  12167315 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 12167237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19286324 - 19286146
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  19286324 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 19286225  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  19286224 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 19286146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 25470691 - 25470868
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  25470691 tagttgcataatcatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagaggtgag 25470789  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25470790 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 25470868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 29615199 - 29615376
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  29615199 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 29615298  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  29615299 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatggtaccacatgcat 29615376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 34647652 - 34647829
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  34647652 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 34647750  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  34647751 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 34647829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19877508 - 19877330
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  19877508 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 19877409  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  19877408 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 19877330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19883284 - 19883106
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  19883284 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 19883185  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  19883184 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 19883106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 409
Target Start/End: Original strand, 21566163 - 21566346
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  21566163 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 21566260  T
Q  326 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 409  Q
    |  |||||| |||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21566261 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcatgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga 21566346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23837758 - 23837580
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23837758 tagttccataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaaacggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 23837659  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23837658 aacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 23837580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 34640978 - 34641155
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  34640978 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgccgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 34641076  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  34641077 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 34641155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 255 - 470
Target Start/End: Original strand, 937685 - 937903
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggact 353  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  937685 ttgcataagcatagaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcgttgctcaaagtggtgttagaggtgaggact 937784  T
Q  354 tatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagt 450  Q
    |||||||||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |||  | || | ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  937785 tatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagaggtgagggctaaggtcatga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagt 937883  T
Q  451 ggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  937884 ggagtggtgatgagttgcat 937903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24562459 - 24562282
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  24562459 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 24562361  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24562360 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 24562282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 19786871 - 19787050
Alignment:
Q  252 tagttgcat-aaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  19786871 tagttgcattaaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtga 19786970  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||    
T  19786971 ggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtaatggccctgaattatggtaccacatgcat 19787050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 389
Target Start/End: Original strand, 29416468 - 29416605
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  29416468 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggagcaccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 29416567  T
Q  353 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagc 389  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  29416568 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagc 29416605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18788560 - 18788448
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  18788560 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 18788463  T
Q  326 tactcaaagtggtgt 340  Q
    |  |||||| |||||    
T  18788462 tgttcaaagcggtgt 18788448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18799540 - 18799428
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  18799540 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 18799443  T
Q  326 tactcaaagtggtgt 340  Q
    |  |||||| |||||    
T  18799442 tgttcaaagcggtgt 18799428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 354
Target Start/End: Original strand, 11289602 - 11289705
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  11289602 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 11289700  T
Q  350 gactt 354  Q
    |||||    
T  11289701 gactt 11289705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 458
Target Start/End: Original strand, 8760427 - 8760636
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||| ||||| || |||||| || | || |||||||||||||||  ||||||   |||||| |||||  || |||||||    
T  8760427 agttgcataagcataaaagctggagggcttctgccctggaacgccttgttgttcaaagtggtggaacactagtcgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 8760526  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgaca-gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtctt 447  Q
    ||| ||||||||   | ||||||||||||||||||| | | |||| |||   ||| ||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  8760527 actcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgataagtggtgagggcttcggtcctgattat-ggtaccacatgcatgagtattgtagaggagtctt 8760625  T
Q  448 agtggagtggt 458  Q
    |||||||||||    
T  8760626 agtggagtggt 8760636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 459
Target Start/End: Original strand, 14581950 - 14582060
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagagg 441  Q
    |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||  || |||||||||||||||     | ||||||    
T  14581950 ggtgaggactcatgtcctgatgaaagaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccctg--ttatggtaccacatgcat-----tatagagg 14582042  T
Q  442 agtcttagtggagtggtg 459  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14582043 agtcttagtggagtggtg 14582060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 454
Target Start/End: Original strand, 19588580 - 19588781
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || |  |||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||    
T  19588580 ttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttatcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtga 19588679  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtct 446  Q
    ||||||||||| ||   | |||| |||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||     | |||||||||||    
T  19588680 ggacttatgtcatgaaaatgaatactttaaccattcaattagcggtgagggattcggccctga-ttatggtaccacatgcat-----tgtagaggagtct 19588773  T
Q  447 tagtggag 454  Q
    ||||||||    
T  19588774 tagtggag 19588781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19439879 - 19439792
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt 340  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||    
T  19439879 agttacataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgt 19439792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 455
Target Start/End: Original strand, 19300705 - 19300868
Alignment:
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta-gttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgtt--gagaatgctttaaccattcg 384  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||  |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||     
T  19300705 tggaacgctttgtcgttcaaagtggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttagcggtgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattct 19300804  T
Q  385 acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 455  Q
    | ||||||| |||   ||| |||||  | |||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||    
T  19300805 atagcggtgagggcttcggtcctga--tatggtaccacatgcat-----tgtagaggagtcttagtggagt 19300868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 458
Target Start/End: Original strand, 8768316 - 8768373
Alignment:
Q  401 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggagtggt 458  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  8768316 cggccctgattat-ggtaccacatgcatgagtattgtagaggagtcttagtggagtggt 8768373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 428
Target Start/End: Original strand, 11283984 - 11284022
Alignment:
Q  390 ggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11283984 ggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 11284022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12579131 - 12578721
Alignment:
Q  88 ctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttg 187  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  12579131 ctgatatgtactttcttggatgttttggttggttttgacgaatggatgctgactgaatgaatgttgtacttaattaaa--ttccttaacgttgtaagttg 12579034  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12579033 gttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 12578934  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578933 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 12578834  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggttt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  12578833 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtgt 12578734  T
Q  488 atgaattaatatt 500  Q
    |||||||||||||    
T  12578733 atgaattaatatt 12578721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27786035 - 27785623
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||    
T  27786035 gctgatatatatttccctggacgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 27785937  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27785936 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 27785837  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785836 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 27785737  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  27785736 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 27785637  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  27785636 tatgaattaatatt 27785623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27791256 - 27790844
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||    
T  27791256 gctgatatatatttccctggacgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 27791158  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27791157 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 27791058  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27791057 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 27790958  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  27790957 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 27790858  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  27790857 tatgaattaatatt 27790844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 88 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12572649 - 12572239
Alignment:
Q  88 ctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttg 187  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  12572649 ctgatatgtactttcttggatgttttggttggttttgacgaatggatgctgactgaatgaatgttgtacttaattaaa--ttccttaacgttgtaagttg 12572552  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572551 gttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 12572452  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572451 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 12572352  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggttt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  12572351 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagcggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtgt 12572252  T
Q  488 atgaattaatatt 500  Q
    |||||||||||||    
T  12572251 atgaattaatatt 12572239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 27295842 - 27296253
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaa-tgttgcaagttg 187  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||    
T  27295842 tgatatatatttccctggatgtcctggttggttgtgatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattg 27295941  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27295942 gatggtgaatcatatatatgtatatgtt-agattggttggtatgtagatatactcaagggg-attagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 27296039  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27296040 ctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgac 27296139  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |    
T  27296140 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatgggttgcatatgttgttgagagggt 27296239  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||| ||||||||||    
T  27296240 tataaattaatatt 27296253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 123 - 428
Target Start/End: Original strand, 10685497 - 10685801
Alignment:
Q  123 tgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttgaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttg 222  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10685497 tgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaactc-ccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttg 10685595  T
Q  223 gttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685596 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 10685695  T
Q  323 agttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10685696 agttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttttggtacca 10685794  T
Q  422 catgcat 428  Q
    |||||||    
T  10685795 catgcat 10685801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 2105816 - 2105508
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2105816 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 2105719  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  2105718 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 2105619  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagagg 484  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||    
T  2105618 agcggtgagggctacggtcctgaattatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcatgagtcgttgagtgg 2105519  T
Q  485 tttatgaatta 495  Q
     |||| |||||    
T  2105518 gttattaatta 2105508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20260999 - 20260824
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20260999 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 20260900  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20260899 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcat 20260824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6482499 - 6482321
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  6482499 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 6482400  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6482399 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 6482321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6485966 - 6485788
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  6485966 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 6485867  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6485866 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 6485788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 5707014 - 5707191
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  5707014 tagttgcataatcatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcttcgtcgttcaaagcggtggagcactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 5707112  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5707113 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 5707191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 23090006 - 23090207
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||  ||||||    
T  23090006 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttaaaagcggtggaacactagt 23090103  T
Q  326 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 423  Q
    || |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  23090104 tattcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctga-atatggtaccaca 23090202  T
Q  424 tgcat 428  Q
    |||||    
T  23090203 tgcat 23090207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26582852 - 26582675
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  26582852 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 26582753  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  26582752 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatggtaccacatgcat 26582675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 23102434 - 23102635
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  23102434 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcctaaaagtgggagagcttcggctctggaactccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 23102531  T
Q  326 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 423  Q
    |  |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23102532 ttttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccaca 23102630  T
Q  424 tgcat 428  Q
    |||||    
T  23102631 tgcat 23102635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 23169298 - 23169475
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23169298 tagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 23169397  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23169398 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 23169475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 23580555 - 23580732
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23580555 tagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 23580654  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23580655 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 23580732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 200818 - 200641
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  200818 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 200720  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  200719 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 200641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9241509 - 9241333
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  | |||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  9241509 agttgcataagcataaaagtggaagaacttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacattagttgttcaaagcggtgttgagcggtgagg 9241410  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  9241409 acttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctga-ttatggtaccacatgcat 9241333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 270 - 428
Target Start/End: Original strand, 27367600 - 27367760
Alignment:
Q  270 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  27367600 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 27367699  T
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27367700 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 27367760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43693578 - 43693401
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  43693578 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 43693480  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43693479 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 43693401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23878040 - 23877838
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  ||||||    
T  23878040 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtagttcaaagcggtggaacactagt 23877943  T
Q  326 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 423  Q
    |  |||||| |||||  || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  23877942 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaagacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctgaaatatggtaccaca 23877843  T
Q  424 tgcat 428  Q
    |||||    
T  23877842 tgcat 23877838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 6744324 - 6744501
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  ||| |||  ||||| | |||||  || |||||    
T  6744324 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactggttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 6744422  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6744423 ggacttaggtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 6744501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22810121 - 22809901
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  | |||||  | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  22810121 tggtgagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagcaggagagcttcggctc 22810024  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  22810023 tggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcta 22809924  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctg 408  Q
     ||||||| ||| | ||||||||    
T  22809923 tagcggtgagggcctcggccctg 22809901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23264158 - 23263985
Alignment:
Q  254 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagga 351  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  23264158 gttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 23264059  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgc 426  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||| || |||| |||   |||||||||  | |||||||||||||    
T  23264058 cttatgtcctgaaaagaatgctttaatcattcgatagtggtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgc 23263985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21907452 - 21907291
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtac-tagt 325  Q
    |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  || | ||    
T  21907452 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgt 21907353  T
Q  326 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
    |  |||||| ||||  | | |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  21907352 tgttcaaagcggtgttttgcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgttttaaccattcga 21907291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 383
Target Start/End: Original strand, 19703480 - 19703615
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||  |||||    
T  19703480 ttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttatcggtga 19703579  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  19703580 ggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 19703615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20724212 - 20724011
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||    
T  20724212 ttagttgcataagcaaaaaagcgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtga 20724113  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtct 446  Q
    ||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||     | |||||||||||    
T  20724112 ggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat-----tgtagaggagtct 20724019  T
Q  447 tagtggag 454  Q
    ||||||||    
T  20724018 tagtggag 20724011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23291129 - 23290904
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtac-tagt 325  Q
    |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||| || | ||||||||||| |||| |  || | ||    
T  23291129 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgaaacactttgt 23291030  T
Q  326 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 422  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||||  | |||||||||    
T  23291029 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaacgaatgctttaaccattcgattagcggtgagggctccggccctga-atatggtaccac 23290931  T
Q  423 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 454  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  23290930 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 23290904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 385
Target Start/End: Original strand, 21073982 - 21074114
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  21073982 ttgcataaccataaaagcgggagggcttcggccctggaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggac 21074081  T
Q  353 ttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
      ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21074082 ccatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 21074114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24943460 - 24943419
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24943460 ggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 24943419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23269276 - 23269201
Alignment:
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgc 426  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||  | |||||||||||||    
T  23269276 gacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgc 23269201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23276145 - 23276070
Alignment:
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgc 426  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||  | |||||||||||||    
T  23276145 gacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgc 23276070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 42701566 - 42701154
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||    
T  42701566 gctgatatatatttccctggacgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 42701468  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42701467 ggttggtgaatcatatatacgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 42701368  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701367 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 42701268  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  42701267 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 42701168  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  42701167 tatgaattaatatt 42701154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 51601909 - 51602321
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||    
T  51601909 gctgatatatatttccctggacgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 51602007  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51602008 ggttggtgaatcatatatacgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 51602107  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602108 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 51602207  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  51602208 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 51602307  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  51602308 tatgaattaatatt 51602321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 51607792 - 51608202
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttga 188  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||     
T  51607792 tgatatatatttccctggacgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagttgg 51607890  T
Q  189 atggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51607891 ttggtgaatcatatatacgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctc 51607990  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51607991 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 51608090  T
Q  389 cggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggttta 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||    
T  51608091 cggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtgta 51608190  T
Q  489 tgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||    
T  51608191 tgaattaatatt 51608202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 41799788 - 41800200
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |  |||||    
T  41799788 gctgatatatatttccctggacgttttggttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtataagtt 41799886  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41799887 ggttggtgaatcatatatacgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 41799986  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41799987 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 41800086  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  41800087 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 41800186  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  41800187 tatgaattaatatt 41800200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 635600 - 636012
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaa-tgttgcaagttg 187  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||    
T  635600 tgatatatatttccctggatgtcctggttggttgtgatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattg 635699  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  635700 gatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaagggg-attagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 635798  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  635799 ctggaacgcttggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgac 635898  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |    
T  635899 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatgggttgcatatgttgttgggagggt 635998  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||| ||||||||||    
T  635999 tataaattaatatt 636012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 53748589 - 53748999
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||  |||||||| |||||||| || |||||| | || |||||    
T  53748589 gctgatatatatttccctggatgc-ttggttggttttgatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 53748685  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53748686 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 53748785  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748786 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 53748885  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  53748886 agcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgagaggtg 53748985  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  53748986 tatgaattaatatt 53748999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23121838 - 23121530
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23121838 tggtgattcatatacatatatatgaataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 23121741  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  23121740 tggaatgcctcgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcta 23121641  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagag 483  Q
    |||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||| |    
T  23121640 cagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgagtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttacatgagtcgttgagtg 23121542  T
Q  484 gtttatgaatta 495  Q
    | |||| |||||    
T  23121541 ggttattaatta 23121530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15533961 - 15533786
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15533961 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 15533862  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15533861 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcat 15533786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20940501 - 20940216
Alignment:
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcgg 285  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  20940501 gaatggtgagtcatatacacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcatgagcataacagtgggagagcttcag 20940404  T
Q  286 ctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  20940403 ctctggaacgccttgttgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 20940304  T
Q  384 gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
     ||| ||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20940303 tacaacggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 20940216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14484668 - 14484385
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | ||||||||||| || ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14484668 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatacacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctc 14484571  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |    
T  14484570 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgttttaaccattcta 14484471  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14484470 cagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgtatgggtgttgttagtggagtcttagtggagtggtgatgagtggcat 14484385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11847230 - 11847053
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  11847230 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 11847131  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11847130 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-tttatggtaccacatgcat 11847053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Original strand, 17000105 - 17000388
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  17000105 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgagagagcttcggctc 17000202  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    |||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||  |    
T  17000203 tggaacaccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgagaacttatgtcctgaaaatgaatgttttaaccatttta 17000302  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17000303 cagcggtgaggactacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgaattgcat 17000388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18212314 - 18212138
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  18212314 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgagg 18212215  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  18212214 acttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 18212138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 253 - 470
Target Start/End: Original strand, 43284896 - 43285116
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43284896 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgttgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 43284995  T
Q  352 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 448  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||| || | |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43284996 cttatgtcctgaaaatgaatgatttaaccattctacagaggagagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 43285094  T
Q  449 gtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  43285095 gtggagtggtgatgagttgcat 43285116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 8046897 - 8047074
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtg--gtgag 349  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||| | |  |||||    
T  8046897 tagtggcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcagtgag 8046995  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8046996 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 8047074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 459
Target Start/End: Original strand, 11171196 - 11171468
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  11171196 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgagtggtatgtatatatacacaagtgggtc--agttgcataaacataaaagtgggagagcttcggctt 11171293  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||| || |  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  11171294 tggaacgccttatcgtttaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcta 11171393  T
Q  386 cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtg 459  Q
    | |||||| |||  ||| |||||| || |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11171394 cggcggtgagggctacgaccctga-ttatggtactacatgcatggttgttattagaggagtcttagtggagtggtg 11171468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 455
Target Start/End: Original strand, 4831090 - 4831293
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4831090 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 4831189  T
Q  353 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 450  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  4831190 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 4831288  T
Q  451 ggagt 455  Q
    |||||    
T  4831289 ggagt 4831293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 455
Target Start/End: Original strand, 4834385 - 4834588
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4834385 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 4834484  T
Q  353 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 450  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  4834485 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 4834583  T
Q  451 ggagt 455  Q
    |||||    
T  4834584 ggagt 4834588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15407088 - 15406955
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  15407088 agttgcataaacatgaaagcgagagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 15406989  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15406988 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 15406955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44775541 - 44775129
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||    
T  44775541 gctgatatatatttccctggatgttttcgttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 44775443  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44775442 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 44775343  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775342 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 44775243  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  44775242 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 44775143  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  44775142 tatgaattaatatt 44775129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44780725 - 44780313
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||    
T  44780725 gctgatatatatttccctggatgttttcgttggttttgatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 44780627  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44780626 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 44780527  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780526 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 44780427  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  44780426 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgtatatattgttgagaggtg 44780327  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  44780326 tatgaattaatatt 44780313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13946812 - 13946402
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaa-tgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttg 187  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||    
T  13946812 tgatatatattt-cctggatgtcttggatggttatgatgaatagatgctggctgaaatgtatgttgtatttaattaaaatttccttgaagttgtaaattg 13946714  T
Q  188 aatggtgaatcatatat-atgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13946713 gatggtgaatcatatattatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactcaaggggt--tagttgcattaacataacagtgggagagtttcggc 13946616  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13946615 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgac 13946516  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13946515 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataggttgcatttgttgttgagaggat 13946416  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  13946415 tatgaattaatatt 13946402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13909867 - 13909457
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaa-tgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttg 187  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||    
T  13909867 tgatatatattt-cctggatgtcttggatggttatgatgaatagatgctggctgaaatgtatgttgtatttaattaaaatttccttgaagttttaaattg 13909769  T
Q  188 aatggtgaatcatatat-atgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13909768 gatggtgaatcatatattatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactcaaggggt--tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 13909671  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13909670 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgac 13909571  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  13909570 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataggttggatttgttgttgagaggat 13909471  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  13909470 tatgaattaatatt 13909457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 8742747 - 8743158
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||| | |||| ||| ||  ||  |||||||| ||||||| ||| |||||| | || |||||    
T  8742747 gctgatatatatttccctggatgc-ttagttggttttgatgaatggatgttgactgg-tgtgtgttgtatataattaagattcccttaaaggtgtaagtt 8742844  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8742845 gattggtgaatcatatatatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 8742944  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8742945 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 8743044  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  8743045 agcggtgtgggtcacggccctgaattttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgagaggtg 8743144  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  8743145 tatgaattaatatt 8743158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Original strand, 8760917 - 8761328
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||| | |||| ||| ||  ||  |||||||| ||||||| ||| |||||| | || |||||    
T  8760917 gctgatatatatttccctggatgc-ttagttggttttgatgaatggatgttgactgg-tgtgtgttgtatataattaagattcccttaaaggtgtaagtt 8761014  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761015 gattggtgaatcatatatatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 8761114  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761115 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 8761214  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  8761215 agcggtgtgggtcacggccctgaattttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgagaggtg 8761314  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  8761315 tatgaattaatatt 8761328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13940322 - 13939916
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaa-tgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttg 187  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||    
T  13940322 tgatatatattt-cctggatgtcttggatggttatgatgaatagatgctggctgaaatgtatgttgtatttaattaaaatttccttgaagttgtaaattg 13940224  T
Q  188 aatggtgaatcatatat-atgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13940223 gatggtgaatcatatattatgtatat----aggttggttggtatgtagatatactcaaggggt--tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 13940130  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13940129 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgac 13940030  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13940029 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataggttgcatttgttgttgagaggat 13939930  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  13939929 tatgaattaatatt 13939916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41175815 - 41175405
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||  |||||||| |||||||| || |||||| | || |||||    
T  41175815 gctgatatatatttccctggatgc-ttggttggttttgatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 41175719  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41175718 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 41175619  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175618 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 41175519  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  41175518 agcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgagaggtg 41175419  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  41175418 tatgaattaatatt 41175405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41180953 - 41180543
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||  |||||||| |||||||| || |||||| | || |||||    
T  41180953 gctgatatatatttccctggatgc-ttggttggttttgatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 41180857  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41180856 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 41180757  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180756 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 41180657  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  41180656 agcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgagaggtg 41180557  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  41180556 tatgaattaatatt 41180543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 87 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4677502 - 4677092
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  || ||||||| |||||| | |||||||| ||  || ||||||||| |||||||| || |||||| | || |||||    
T  4677502 gctgatatatatttccctagatgc-ttagttggttttgatgaatggatgctgactgg-tgtatgttgtatataattaaa-ttcccttaaaggtgtaagtt 4677406  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggc 286  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4677405 ggttggtgaatcatatatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggc 4677306  T
Q  287 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677305 tctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 4677206  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  4677205 agcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgagaggtg 4677106  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  4677105 tatgaattaatatt 4677092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 190 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12200440 - 12200150
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12200440 tggtgagtcatatatacgtatatgcttaggttggttggtatgtagatatactcaagtgggta--agttgcataagcataacagtgggagagcttcagctc 12200343  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    |||||    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12200342 tggaacaacttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagaacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgaca 12200243  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgag 481  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  12200242 gcggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcatgggtgtttacaggagtcttagtggagtggtgatgggttgcataagttgttgag 12200150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 198 - 470
Target Start/End: Original strand, 13203486 - 13203759
Alignment:
Q  198 catatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgc 296  Q
    ||||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13203486 catatatatatatatgcataagttggttg-tatgtagatatactcaagtgggt--tagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgc 13203582  T
Q  297 ttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgt 394  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||| |||| |||||||||     
T  13203583 cttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaactattctacagcggtga 13203682  T
Q  395 gggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13203683 gggctacggtcctg-tttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagcggtgataagttgcat 13203759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 216 - 495
Target Start/End: Original strand, 16838466 - 16838746
Alignment:
Q  216 taggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggt 314  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  16838466 taggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggt 16838563  T
Q  315 ggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattt 412  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| ||    
T  16838564 ggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctggaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaggct-acggtcctga-tt 16838661  T
Q  413 ttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtttatgaatta 495  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||||    
T  16838662 atggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagaggtgatgagttgcatgagttgttgagtgggttattaatta 16838746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 190 - 495
Target Start/End: Original strand, 14652654 - 14652961
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14652654 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataatagtgggagagcttcggctc 14652751  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  14652752 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 14652851  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagagg 484  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||    
T  14652852 agcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcatgagtcgttgagtgg 14652950  T
Q  485 tttatgaatta 495  Q
     |||| |||||    
T  14652951 gttattaatta 14652961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 253 - 470
Target Start/End: Original strand, 16382880 - 16383100
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16382880 agttgcataagcattacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 16382979  T
Q  352 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 448  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16382980 cttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 16383078  T
Q  449 gtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  16383079 gtggagtggtgatgagttgcat 16383100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 253 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12304924 - 12304763
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12304924 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 12304825  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12304824 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgatttt 12304763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9533027 - 9532849
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||  || ||||||    
T  9533027 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagtggtgtggagcggtgag 9532928  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9532927 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 9532849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17157262 - 17157079
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  17157262 gtatgtagatatacacaaggggg-ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 17157164  T
Q  327 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 409  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157163 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 17157079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 41456147 - 41456325
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  41456147 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 41456246  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  41456247 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 41456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24191963 - 24191783
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  24191963 gtatgtagatatacacaaggggg-ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 24191865  T
Q  327 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 406  Q
      |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24191864 gttcaaagcggtgttgagcggtgagaacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 24191783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 8583294 - 8583471
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  8583294 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 8583392  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8583393 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 8583471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14084708 - 14084531
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  14084708 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 14084610  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14084609 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 14084531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14090109 - 14089932
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  14090109 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 14090011  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14090010 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 14089932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 49399650 - 49399473
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  49399650 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 49399552  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  49399551 ggacttaggtcctggtgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 49399473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 16802425 - 16802626
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  16802425 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacactagt 16802522  T
Q  326 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 423  Q
    |  |||||| |||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  16802523 tgttcaaagcggtgttgagcggtgatgacttatgtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccaca 16802621  T
Q  424 tgcat 428  Q
    |||||    
T  16802622 tgcat 16802626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 451
Target Start/End: Original strand, 14544129 - 14544394
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctct 289  Q
    |||||| |||| || || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14544129 tggtgagtcatttacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagcggg-tcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctct 14544227  T
Q  290 ggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
     ||| || | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  14544228 agaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgac 14544327  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 451  Q
    | ||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14544328 aacggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 14544394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 24123203 - 24123380
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  24123203 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 24123301  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  24123302 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacgtgcat 24123380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 495
Target Start/End: Original strand, 16830055 - 16830247
Alignment:
Q  305 tcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacg 402  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||    
T  16830055 tcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctggaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaggct-acg 16830153  T
Q  403 gccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt--tagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtttatgaatta 495  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||||    
T  16830154 gtcctgattat-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagaggtgatgagttgcatgagttgttgagtgggttattaatta 16830247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 270 - 428
Target Start/End: Original strand, 13968850 - 13969010
Alignment:
Q  270 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  13968850 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 13968949  T
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13968950 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 13969010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 270 - 428
Target Start/End: Original strand, 13974325 - 13974485
Alignment:
Q  270 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  13974325 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 13974424  T
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13974425 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 13974485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 253 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 14292881 - 14292668
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||    
T  14292881 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcgttggagcactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgagg 14292782  T
Q  351 acttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtct 446  Q
    |||||||||||    |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  14292781 acttatgtcctaaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgtatggatgttgttagaggagtct 14292683  T
Q  447 tagtggagtggtgat 461  Q
    |||||||||||||||    
T  14292682 tagtggagtggtgat 14292668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 255 - 455
Target Start/End: Original strand, 34852211 - 34852414
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  34852211 ttgcataatcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 34852310  T
Q  353 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 450  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  34852311 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacaacggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 34852409  T
Q  451 ggagt 455  Q
    |||||    
T  34852410 ggagt 34852414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17190992 - 17190836
Alignment:
Q  273 gggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagt--ggtgaggacttatgtcctgttgagaat 370  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17190992 gggagagcttcggctctggaacgccttgtctttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgatcggtgaggacttatgtcctgatgagaat 17190893  T
Q  371 gctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17190892 gctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga-atttggtaccacatgcat 17190836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 216 - 339
Target Start/End: Original strand, 16829943 - 16830065
Alignment:
Q  216 taggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggt 314  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  16829943 taggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggt 16830040  T
Q  315 ggagtactagttactcaaagtggtg 339  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  16830041 ggagcactagttgctcaaagtggtg 16830065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 253 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23174333 - 23174189
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 351  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||| ||| ||||||||    
T  23174333 agttgcaaaagcataaaagtgggagagcttcggctcttgaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttagcggtgagga 23174234  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 397  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23174233 cttatgtcctg-aaaaaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 23174189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 385
Target Start/End: Original strand, 17199056 - 17199175
Alignment:
Q  268 acagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgt-tg 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||       
T  17199056 acagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttagcggtgaggacttaggtcctgtaaa 17199155  T
Q  366 agaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17199156 agaatgctttaaccattcga 17199175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 386
Target Start/End: Original strand, 17243680 - 17243815
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |  | ||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||| |||||  || |||||||    
T  17243680 agttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctagaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 17243779  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  17243780 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgac 17243815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Original strand, 12961402 - 12961580
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    ||||||||||  |||| || || || |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| ||||| |    
T  12961402 agttgcataagtataaaagcggaagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgatg 12961501  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  12961502 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggtttcggccctga-ttatggtaccacatgcat 12961580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 317
Target Start/End: Original strand, 31690595 - 31690659
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 317  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  31690595 agttgcataaacataaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 31690659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 454
Target Start/End: Original strand, 18719250 - 18719339
Alignment:
Q  366 agaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggag 454  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  18719250 agaatgctttaaccattcgataagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtgttgtagaagagtcttagtggag 18719339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23173938 - 23173876
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 315  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  23173938 agttgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 23173876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18889143 - 18889009
Alignment:
Q  254 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactag-ttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||   ||  |||||| |||||  |||| |||||    
T  18889143 gttgcacaagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttattgttcaaagcggtgttcagtgatgagg 18889044  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18889043 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 18889009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Original strand, 11850780 - 11850840
Alignment:
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  11850780 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcat 11850840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27280531 - 27280120
Alignment:
Q  89 tgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaa-tgttgcaagttg 187  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||    
T  27280531 tgatatatatttccctggatgtcctggttggttgtgatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattg 27280432  T
Q  188 aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280431 gatggtgaatcatatatatgtatatgtt-agattggttggtatgtagatatactcaagggg-attagttgcataaacataacagtgggagagcttcggct 27280334  T
Q  288 ctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27280333 ctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgac 27280234  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |    
T  27280233 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatgggttgcatatgttgttgagagggt 27280134  T
Q  487 tatgaattaatatt 500  Q
    ||| ||||||||||    
T  27280133 tataaattaatatt 27280120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 495
Target Start/End: Original strand, 3706701 - 3707008
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3706701 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 3706798  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  3706799 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactaattgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 3706898  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagagg 484  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||| ||    
T  3706899 agcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagcggtgatgagttgcatgagtcgttgagtgg 3706997  T
Q  485 tttatgaatta 495  Q
     |||| |||||    
T  3706998 gttattaatta 3707008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 495
Target Start/End: Original strand, 23066648 - 23066947
Alignment:
Q  199 atatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgct 297  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  23066648 atatatatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgcc 23066745  T
Q  298 tagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgt 394  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||| |     
T  23066746 ttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggaga 23066845  T
Q  395 gggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggtttatgaa 492  Q
    |||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||    
T  23066846 gggctacgatcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagagttgtcttagtggagtggtgatgagttgcatgagttgttgagtgggttattaa 23066944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 20438531 - 20438709
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  20438531 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 20438630  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20438631 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 20438709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 227 - 470
Target Start/End: Original strand, 22448244 - 22448484
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggt--attagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta 323  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22448244 gtatgtagatatacacaagtgggtcaattaattgcataagcataaaagtagaagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcacta 22448343  T
Q  324 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 422  Q
    ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22448344 gttgctcaaagtggtg--------aggacttatgtcctgtaaatgaatgctttaaccattcaacagcggtgagggctacggccctgattat-ggtaccac 22448434  T
Q  423 atgcatgggtgtt--tagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22448435 atgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtgatgataagttgcat 22448484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21542233 - 21542056
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  21542233 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 21542135  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21542134 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 21542056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 42095903 - 42096080
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  42095903 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 42096001  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  42096002 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 42096080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 20045879 - 20046056
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  20045879 tagtttcataaacatca-agcgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 20045977  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20045978 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattctacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 20046056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 255 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20242708 - 20242488
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  20242708 ttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggac 20242609  T
Q  353 ttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 448  Q
    ||||||||||   |  |||||| |||| ||||| ||||||||  |||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  20242608 ttatgtcctggaaaatgaatgccttaatcattctacagcggttagggcttcggccttga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagagaagtctta 20242510  T
Q  449 gtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||||||| | ||||||||    
T  20242509 gtggagtggtggtgagttgcat 20242488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41110992 - 41110814
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||   |||||| |||||  || ||||||    
T  41110992 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtcgttcaaagcggtgtggagcggtgag 41110893  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||    
T  41110892 gacttaggtcatgctgagaatgctttaaccattcgacaatggtgtgggtcatgaccctgaattatggtatcacatgcat 41110814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 32650304 - 32650074
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  | |||||    
T  32650304 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacattagtt 32650205  T
Q  327 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 424  Q
      |||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  32650204 gttcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggctacggtcctga-atatggtaccacat 32650106  T
Q  425 gcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggagt 455  Q
    ||||| |  || | ||||||||||||||||||    
T  32650105 gcatgcgcattgttgaggagtcttagtggagt 32650074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 19664105 - 19664306
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  19664105 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcattaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 19664202  T
Q  326 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 423  Q
    |  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  19664203 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgatagcagtgagggctccggccctga-atatggtaccaca 19664301  T
Q  424 tgcat 428  Q
    |||||    
T  19664302 tgcat 19664306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 470
Target Start/End: Original strand, 955118 - 955263
Alignment:
Q  329 tcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 425  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  955118 tcaaagtggtgtttagtggtgagggcttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagtggtgagggctacggtcctgatttt-ggtaccacatg 955216  T
Q  426 catgggtgtt--tagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  955217 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 955263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 19778434 - 19778639
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  19778434 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 19778533  T
Q  327 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 421  Q
      ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||| || ||||||||    
T  19778534 gttcaaagctgtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgaacagcggtgagggctgcgaccctga-ttatggtacca 19778632  T
Q  422 catgcat 428  Q
    |||||||    
T  19778633 catgcat 19778639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 454
Target Start/End: Original strand, 29554419 - 29554645
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| || || || ||||| ||| |||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  29554419 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 29554518  T
Q  327 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 422  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||| ||| |||   ||||||||| || |||||||||    
T  29554519 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcagtgagggcttcggccctga-ttatggtaccac 29554617  T
Q  423 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 454  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  29554618 atgcattgg----tagaggagtcttagtggag 29554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36615015 - 36614935
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36615015 ggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggtttcggccctg--ttttggtaccacatgcat 36614935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 315
Target Start/End: Original strand, 955004 - 955128
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  | |||||| | |||||||||||||| ||| |||||   ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  955004 tggtgagtcatatacatatatatgcatgggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agtagcatgagcataaaagtggaagagcttcggctc 955101  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 315  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||    
T  955102 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtg 955128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24079634 - 24079551
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||    
T  24079634 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat 24079551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 428
Target Start/End: Original strand, 24109120 - 24109203
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||    
T  24109120 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat 24109203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 87 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40840 - 40549
Alignment:
Q  87 gctgatatatattttcctggatgtattggttggttgtgatgattagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagtt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||| | |||| ||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||    
T  40840 gctgatatatatttccctggatgctttagttggtt-tgatgaatggatgttgactga-tgtgtgttgtatataattaaaatttccttaaagatgtaagtt 40743  T
Q  187 gaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcat-aaacataacagtgggagagcttcgg 285  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40742 gattggtgaatcatatatatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaaacataacagtggaagagcttcgg 40643  T
Q  286 ctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaacc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40642 ctctggaatgcttggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaacc 40549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 500
Target Start/End: Original strand, 8493 - 8610
Alignment:
Q  383 cgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgaga 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8493 cgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggggtttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatatattgttgaga 8592  T
Q  483 ggtttatgaattaatatt 500  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  8593 ggtgtatgatttaatatt 8610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Original strand, 36818 - 36994
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  36818 agttgcataagcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgagg 36917  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  36918 acttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctga-ttatggtaccacatgcat 36994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 317
Target Start/End: Original strand, 43965 - 44057
Alignment:
Q  225 tggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  |  ||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  43965 tggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcattaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 44057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 495
Target Start/End: Original strand, 14435 - 14742
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14435 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctc 14532  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  14533 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 14632  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagagg 484  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||    
T  14633 agcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcatgagtcgttgagtgg 14731  T
Q  485 tttatgaatta 495  Q
     |||| |||||    
T  14732 attattaatta 14742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 393
Target Start/End: Original strand, 7152 - 7356
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctct 289  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||  || |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7152 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggac-agttggataagcataacagtgggagagcttcggctct 7250  T
Q  290 ggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggt-gtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  7251 ggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtattagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctaca 7350  T
Q  388 gcggtg 393  Q
    ||||||    
T  7351 gcggtg 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 141563 - 141282
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| |||||||||  ||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  141563 tggtgagtcatatatacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 141466  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| |||    
T  141465 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttacgtcctgaaatgaatgctttaaccattctaca 141366  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |||||| |||   ||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  141365 gcggtgagggcttcggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggagatgagttgcat 141282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 255 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 146742 - 146611
Alignment:
Q  255 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtgg--tgtagtggtgaggac 352  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  146742 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcgtctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtttttagtggtgaggac 146643  T
Q  353 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  146642 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 265337 - 265056
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  265337 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggtggtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 265240  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  265239 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggggcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcatgaaatgaatgctttaaccattctaca 265140  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||  ||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  265139 gcggtgaaggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaagagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 265056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 258911 - 258630
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  258911 tggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggtggtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctc 258814  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgaca 387  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  258813 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggggcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacatatgtcatgaaatgaatgctttaaccattctaca 258714  T
Q  388 gcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||  ||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  258713 gcggtgaaggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaagagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 258630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42169 - 41887
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| || |||| || ||||||  |||||| | | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  42169 tggtgagtcttatacatatatatgcataggttaggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctc 42072  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac 386  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||    
T  42071 tggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctac 41972  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41971 agcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 41887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 481
Target Start/End: Original strand, 63194 - 63425
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  63194 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttatcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 63293  T
Q  352 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 448  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  63294 cttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 63392  T
Q  449 gtggagtggtgataagttgcatttgttgttgag 481  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  63393 gtggagtggtgatgagtggcatgtgtcgttgag 63425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 251 - 428
Target Start/End: Original strand, 12876 - 13054
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtg--gtga 348  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  || ||||  |||||| ||||||| |  ||||    
T  12876 ttagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacaagttgttcaaagcggtgtagagcggtga 12975  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12976 ggacttaggtcctgataagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggacctga-ttatggtaccacatgcat 13054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 458
Target Start/End: Original strand, 124471 - 124680
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  |||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  124471 agttgcataagcataaaagcgggagggcttctgacctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 124570  T
Q  351 acttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtctt 447  Q
    ||| ||||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  124571 actcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgataagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtattgtagaggagtctt 124669  T
Q  448 agtggagtggt 458  Q
    |||||||||||    
T  124670 agtggagtggt 124680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 470
Target Start/End: Original strand, 50972 - 51192
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  50972 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttatcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 51071  T
Q  352 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 448  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  51072 cttatgtcctgaaaacgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 51170  T
Q  449 gtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  51171 gtggagtggtgatgagttgcat 51192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 468
Target Start/End: Original strand, 6029 - 6250
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  6029 ttagttacataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtga 6128  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtc 445  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6129 ggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtc 6227  T
Q  446 ttagtggagtggtgataagttgc 468  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  6228 ttagtggaatggtgatgagttgc 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 152562 - 152300
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  152562 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 152465  T
Q  326 tactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 423  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||| |||| | || |||  |||| ||||| || ||||||||||    
T  152464 tgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgattgctttaaccattctacagtgttgagggctacggtcctga-ttatggtaccaca 152366  T
Q  424 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcatttgttgttgagaggttt 487  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||    
T  152365 tgcatggttgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcatgagtcgttgagtggttt 152300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 174561 - 174738
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  174561 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 174659  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  174660 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 174738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14262 - 13939
Alignment:
Q  175 atgttgcaagttg-aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtg 273  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| || ||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||  ||||    
T  14262 atgttgtaagttggaatgttgagtcatatacatatatatgtataggttaggttgtatgtagatatacacaaggggg-ttagttgcataaacatagaagtg 14164  T
Q  274 ggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatg 371  Q
    |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | |||||    
T  14163 ggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcgttgctcaaagtggtgttagtggcgaggacttatgtcctgaaaatgaatg 14064  T
Q  372 ctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgca 469  Q
    |||||||||||| || | |||| |||  |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14063 ctttaaccattctaccgaggtgagggctacggtcctga-tttcgataccacatgcatgggtgttgttagcggagtcttagtggagtggtgatgagttgca 13965  T
Q  470 tttgttgttgagaggtttatgaatta 495  Q
    |  || |||||| || |||| |||||    
T  13964 tgagtcgttgagtgggttattaatta 13939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24463 - 24165
Alignment:
Q  175 atgttgcaagttg-aatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtg 273  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| || ||||||| |||||| | | |||||| ||||||| ||| | |  |||||||||||| ||||  ||||    
T  24463 atgttgtaagttggaatgttgagtcatatacatatatatgtataggttaggttgtatgtggatatacacaaggcgg-ttagttgcataagcatagaagtg 24365  T
Q  274 ggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatg 371  Q
    | |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | |||||    
T  24364 gaagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcattcctcaaagtggtgttagtggcgaggacttatgtcctgaaaatgaatg 24265  T
Q  372 ctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgca 469  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24264 ctttaaccattctacagaggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccagatgcatgggtgttgttagcggagtcttagtggagtggtgatgagttgca 24166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 253 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10518 - 10306
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtg--gtgtagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  || ||||| |||||    
T  10518 agttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactggttgctcaaagtgatgtttagtgatgagg 10419  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctt 447  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10418 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctt 10320  T
Q  448 agtggagtggtgat 461  Q
    ||||||||||||||    
T  10319 agtggagtggtgat 10306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 110935 - 110758
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||| | |||||  || ||||||    
T  110935 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaatgcggtgtggagcggtgag 110837  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  110836 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 110758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 360 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 116861 - 116793
Alignment:
Q  360 ctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  116861 ctgttaagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 116793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 251 - 428
Target Start/End: Original strand, 4617 - 4795
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  4617 ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 4716  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  4717 ggacttatgtcctgatgagaatgctttaacaattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 174561 - 174739
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  | |||| |||||  || ||||||    
T  174561 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttaaaagcggtgtggagcggtgag 174660  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  174661 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccaagaattatggtaccacatgcat 174739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 489304 - 489127
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  489304 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 489206  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  489205 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagtgttgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 489127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 179083 - 179002
Alignment:
Q  344 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatg 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  179083 ggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg--ttttggtaccacatgcatg 179002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Original strand, 10259 - 10435
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  10259 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcagctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgagg 10358  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  10359 acttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 10435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 409
Target Start/End: Original strand, 4275 - 4458
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||| ||    
T  4275 gtatgtagatatacacaagtgg-attagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactaatt 4373  T
Q  327 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 409  Q
      ||| || |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 gttcacagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 4458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 270 - 428
Target Start/End: Original strand, 9649 - 9809
Alignment:
Q  270 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| ||||| |||||    
T  9649 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctattgag 9748  T
Q  368 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9749 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 9809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 299 - 470
Target Start/End: Original strand, 15511 - 15685
Alignment:
Q  299 agtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 396  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  15511 agtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaacgattctacagcggtgagg 15610  T
Q  397 gtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtggtgataagttgcat 470  Q
    |  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15611 gctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgcat 15685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3123 - 3034
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 317  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||    
T  3123 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttatcgttcaaagcggtgga 3034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38578 - 38401
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  38578 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 38480  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38479 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 38401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 35546 - 35723
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  35546 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 35644  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35645 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 35723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 270 - 428
Target Start/End: Original strand, 30162 - 30322
Alignment:
Q  270 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  30162 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 30261  T
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30262 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 30322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 407
Target Start/End: Original strand, 51701 - 51858
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||||||  | |||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  51701 agttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctttggaacgccttgtcattcaaagcggtggaacagtagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 51800  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccct 407  Q
     |||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||    
T  51801 gcttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccct 51858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 46979 - 47156
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  46979 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 47077  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47078 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 47156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 52384 - 52561
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  52384 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 52482  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52483 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 52561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2743 - 2566
Alignment:
Q  252 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 349  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  || ||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  2743 tagttgcataagcatcaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacaccagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 2644  T
Q  350 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2643 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 2566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 455
Target Start/End: Original strand, 14572 - 14776
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 351  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14572 agttgaataagcataacagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 14671  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttag 449  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||| ||  ||  |||| |||||  | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14672 cttatgtcctgaaatgaatgttttaaccattctacagcgatgatggctacggtcctga-atatgataccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttag 14770  T
Q  450 tggagt 455  Q
    ||||||    
T  14771 tggagt 14776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 451
Target Start/End: Original strand, 47350 - 47615
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctct 289  Q
    |||||| |||| || || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  47350 tggtgagtcatttacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagcggg-tcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctct 47448  T
Q  290 ggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
     ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  47449 agaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgac 47548  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 451  Q
    | ||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  47549 aacggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 47615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 451
Target Start/End: Original strand, 62770 - 63035
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctct 289  Q
    |||||| |||| || || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  62770 tggtgagtcatttacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagcggg-tcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctct 62868  T
Q  290 ggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
     ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  62869 agaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgac 62968  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 451  Q
    | ||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  62969 aacggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 63035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 451
Target Start/End: Original strand, 56384 - 56649
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctct 289  Q
    |||||| |||| || || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  56384 tggtgagtcatttacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagaggg-tcagttgcataagcataaaagtgggagagattcggctct 56482  T
Q  290 ggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgac 386  Q
     ||| || | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  56483 agaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgac 56582  T
Q  387 agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 451  Q
    | ||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  56583 aacggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 56649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 409
Target Start/End: Original strand, 15432 - 15615
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  15432 gtatgtagatatacacaaggggg-ttagttgcacaagcataaaagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcattcaaagcggtggaacactagtt 15530  T
Q  327 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 409  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15531 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga 15615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 71328 - 71155
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctct 289  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  | |||||  | |||||||||||||| ||| | || | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  71328 tggtgagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaa-gtgtgtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctct 71230  T
Q  290 ggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg 362  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  71229 ggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctg 71155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 264 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29913 - 29748
Alignment:
Q  264 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcct 361  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29913 cataaaagtgggagagctttggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagtggtgttgagcggtgaggacttatgtcct 29814  T
Q  362 gttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  29813 gatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggttacggccctga-ttatggtaccacatgcat 29748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10377 - 10217
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 348  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  10377 ttagtcgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 10278  T
Q  349 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 409  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10277 ggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctga 10217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 5327 - 5113
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||    
T  5327 ttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtatagcggtga 5228  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtc 445  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||    |||||| | || |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5227 ggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctttggccct-aattatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtc 5129  T
Q  446 ttagtggagtggtgat 461  Q
    ||||||||||||||||    
T  5128 ttagtggagtggtgat 5113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 397
Target Start/End: Original strand, 168 - 314
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  168 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 267  T
Q  351 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 397  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 270 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 1
Alignment:
Q  270 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||        |||||||| |||||||||||||    
T  132 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaagcggtg--------aggacttaggtcctgttgagaa 41  T
Q  370 tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40 tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcctga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 362
Target Start/End: Original strand, 20456 - 20629
Alignment:
Q  190 tggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 288  Q
    |||||| ||||||| || ||||||  |||||||  | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20456 tggtgagtcatatacatatatatgcataggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctc 20553  T
Q  289 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg 362  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20554 tggaacgccttgtcgttcaaagcggtggagtactagttgctcaacgcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctg 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 300 - 428
Target Start/End: Original strand, 1 - 131
Alignment:
Q  300 gtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 397  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1 gtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgga 100  T
Q  398 tcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  101 tcacggccctggattatggtaccacatgcat 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17688 - 17443
Alignment:
Q  218 ggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgg 316  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  17688 ggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagcgggaaagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgg 17591  T
Q  317 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 413  Q
    || |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||| || |||   |||||| || ||     
T  17590 agcactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcgatgagggcttcggccccga-tta 17492  T
Q  414 tggtaccacatgcat---gggtgtttagaggagtcttagtggagtggtg 459  Q
    |||||||||||||||   || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17491 tggtaccacatgcatgagggttgattagaagagtcttagtggagtggtg 17443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 367 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 3718 - 3589
Alignment:
Q  367 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt--tagaggagtcttagtggagtggtgataag 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3718 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgag 3620  T
Q  465 ttgcatttgttgttgagaggtttatgaatta 495  Q
    ||||||  || |||||| || |||| |||||    
T  3619 ttgcatgagtcgttgagtgggttattaatta 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 1
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtgg 337  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  87 ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgctttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 455
Target Start/End: Original strand, 4981 - 5214
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtac-tag 324  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| || | |    
T  4981 gtatgtagatatacacaagtgggt--tagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggagcactttg 5078  T
Q  325 ttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 421  Q
    ||  |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| || ||||||||    
T  5079 ttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtacca 5177  T
Q  422 catgcat---gggtgtttagaggagtcttagtggagt 455  Q
    |||||||   || || |||||||| ||||||||||||    
T  5178 catgcatgagggttgattagaggaatcttagtggagt 5214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 383
Target Start/End: Original strand, 41617 - 41750
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  41617 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttaaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 41716  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  41717 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 41750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 102930 - 103063
Alignment:
Q  254 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagga 351  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  102930 gttgcataagcataaaagcgggagagcttcggccctggaacgagttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 103029  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  103030 cttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 103063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8615 - 8410
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  8615 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 8516  T
Q  327 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 421  Q
      ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||| || ||||||||    
T  8515 gttcaaagctgtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgaacagcggtgagggctgcgaccctga-ttatggtacca 8417  T
Q  422 catgcat 428  Q
    |||||||    
T  8416 catgcat 8410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 326975 - 326816
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  326975 gtatgtagatatacacaaggggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 326876  T
Q  327 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  326875 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 326816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 321266 - 321040
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 326  Q
    |||||||||||||| ||| |||  || ||||||||| || || | |||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  321266 gtatgtagatatacacaaggggagtttgttgcataagcacaaaaatgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 321167  T
Q  327 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 422  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||    
T  321166 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctga-ttatggtaccac 321068  T
Q  423 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 454  Q
    |||||    | | |||||||||||||||||||    
T  321067 atgca----tttgtagaggagtcttagtggag 321040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 115911 - 115778
Alignment:
Q  254 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 351  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||| | |||||| || | ||||||||||| ||||||  ||  |||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  115911 gttgcataagcataaaagcgggagggcttcgaccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacccgttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 115812  T
Q  352 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 385  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  115811 cttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 115778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 428
Target Start/End: Original strand, 27781 - 27945
Alignment:
Q  266 taacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgt- 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||  || ||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||| |     
T  27781 taacagcgggagagcttcggctctggaacggcttgtcgttcaaagtggtggaacacgagttgttcaaagcggtgttagcgatgaggacttatgtcctata 27880  T
Q  364 tgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 428  Q
      ||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||    
T  27881 aaagaatgctttaaccattcgaatagcggtgagggctccggccctga-ttatggtaccacatgcat 27945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7493 - 7293
Alignment:
Q  185 ttgaatggtgaatcatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-tgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttc 283  Q
    |||| |||||| ||||||| || ||||||  | |||||  | |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  7493 ttgagtggtgagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtc--agttgcataagcataaaagcgggagagcttc 7396  T
Q  284 ggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaacca 380  Q
    |||||||||| || | |||||||| || ||||||  ||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||   | ||||||||||||||    
T  7395 ggctctggaacgccttgtcgttcatagcggtggaacactagatattcaaagcggtgtttagtggtaaggacttatatcctgaaaatgaatgctttaacca 7296  T
Q  381 ttc 383  Q
    |||    
T  7295 ttc 7293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 78538 - 78594
Alignment:
Q  414 tggtaccacatgcatgggtgtt--tagaggagtcttagtggagtggtgataagttgc 468  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78538 tggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatgagttgc 78594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28041 - 27840
Alignment:
Q  251 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 348  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||    
T  28041 ttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtga 27942  T
Q  349 ggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtct 446  Q
    ||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||     | |||||||||||    
T  27941 ggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat-----tgtagaggagtct 27848  T
Q  447 tagtggag 454  Q
    ||||||||    
T  27847 tagtggag 27840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 383
Target Start/End: Original strand, 417 - 550
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtg--gtgtagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| |  || ||| | |||||    
T  417 agttgcataagcattaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaatcggtggaacactagttgttcaaagcggagtttagcgatgagg 516  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  517 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 383
Target Start/End: Original strand, 16939 - 17072
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa--gtggtgtagtggtgagg 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||  |||||||  |||||  |  || ||| |||||||    
T  16939 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttgttcaaaacggagtttagcggtgagg 17038  T
Q  351 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 383  Q
     |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  17039 ccttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 17072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 458
Target Start/End: Original strand, 5903 - 6111
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 351  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||| |||| |||||| || | | ||||||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||| || | ||||||    
T  5903 agttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaacgccttgccgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagcggtgttagcgatgagga 6002  T
Q  352 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtctta 448  Q
    |||||||||||   | |||| |||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  6003 cttatgtcctgaaaatgaattctttaaccattctattagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccacatgtatgagtgttgtagaggagtctta 6101  T
Q  449 gtggagtggt 458  Q
    ||||||||||    
T  6102 gtggagtggt 6111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 454
Target Start/End: Original strand, 13504 - 13620
Alignment:
Q  340 tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-t 436  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  13504 tagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattctattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtgttgt 13602  T
Q  437 agaggagtcttagtggag 454  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13603 agaagagtcttagtggag 13620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 451
Target Start/End: Original strand, 16021 - 16250
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta-gt 325  Q
    |||||||||||||| |||  ||  | |||||||||| || || ||  |||| ||| |||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||  ||    
T  16021 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcaggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgt 16120  T
Q  326 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 422  Q
    |  |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||    
T  16121 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaagcattcgaatagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccac 16219  T
Q  423 atgcatggg--tgtttagaggagtcttagtg 451  Q
    ||||||| |  | | ||||||||||||||||    
T  16220 atgcatgagcatttgtagaggagtcttagtg 16250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16955 - 16912
Alignment:
Q  414 tggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggagtg 456  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16955 tggtaccacatgcatgagtgttgtagaggagtcttagtggagtg 16912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17070 - 17006
Alignment:
Q  253 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 317  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  17070 agttgcataagcataaaagcgggagggcttcggcgctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 17006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 56065 - 55975
Alignment:
Q  227 gtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 317  Q
    |||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  56065 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacacaaaagcgggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 55975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 317
Target Start/End: Original strand, 1027 - 1119
Alignment:
Q  225 tggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  |  ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  1027 tggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 1119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 317
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8055
Alignment:
Q  225 tggtatgtagatatactcaatgggtattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  |  ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  7963 tggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University