View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18071_low_31 (Length: 406)

Name: NF18071_low_31
Description: NF18071
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18071_low_31
NF18071_low_31
[»] chr6 (77 HSPs)
chr6 (18-406)||(27604711-27605106)
chr6 (18-406)||(27611008-27611397)
chr6 (18-406)||(27724851-27725240)
chr6 (18-406)||(27718385-27718774)
chr6 (18-406)||(27698500-27698888)
chr6 (17-406)||(28780931-28781321)
chr6 (17-406)||(26802230-26802624)
chr6 (21-406)||(28786070-28786456)
chr6 (21-406)||(28792191-28792577)
chr6 (18-400)||(27678744-27679127)
chr6 (17-367)||(27593025-27593375)
chr6 (92-406)||(27229026-27229339)
chr6 (17-406)||(26655781-26656171)
chr6 (17-406)||(26761752-26762142)
chr6 (18-367)||(27677620-27677969)
chr6 (21-400)||(27706411-27706791)
chr6 (17-406)||(31284080-31284470)
chr6 (17-370)||(26646302-26646661)
chr6 (17-370)||(26752270-26752629)
chr6 (17-400)||(27338070-27338454)
chr6 (17-400)||(27398810-27399194)
chr6 (17-370)||(26622805-26623158)
chr6 (17-370)||(26728783-26729136)
chr6 (17-339)||(26884023-26884347)
chr6 (17-318)||(27531202-27531503)
chr6 (17-406)||(26823638-26824022)
chr6 (53-305)||(25579613-25579865)
chr6 (28-369)||(26861446-26861784)
chr6 (53-305)||(25481636-25481888)
chr6 (53-305)||(26142759-26143011)
chr6 (18-406)||(27427612-27427996)
chr6 (53-305)||(26048739-26048991)
chr6 (61-305)||(26055820-26056064)
chr6 (53-305)||(26069908-26070160)
chr6 (61-305)||(26075790-26076034)
chr6 (53-305)||(25538434-25538686)
chr6 (71-325)||(28234438-28234692)
chr6 (64-337)||(28325343-28325616)
chr6 (64-301)||(28242702-28242939)
chr6 (64-304)||(26848555-26848795)
chr6 (64-304)||(28226845-28227085)
chr6 (69-365)||(28098426-28098725)
chr6 (71-343)||(28185222-28185494)
chr6 (64-343)||(28180970-28181249)
chr6 (17-286)||(28139454-28139723)
chr6 (28-343)||(26341947-26342265)
chr6 (64-366)||(27665169-27665471)
chr6 (64-304)||(26635585-26635825)
chr6 (64-304)||(26741551-26741791)
chr6 (28-220)||(26937073-26937265)
chr6 (50-225)||(28149912-28150086)
chr6 (81-268)||(29825958-29826145)
chr6 (78-194)||(25506975-25507091)
chr6 (67-297)||(26959067-26959298)
chr6 (174-304)||(25071554-25071684)
chr6 (66-304)||(26974947-26975185)
chr6 (64-301)||(28297765-28298002)
chr6 (64-301)||(28514071-28514308)
chr6 (64-304)||(27214312-27214552)
chr6 (176-304)||(27234788-27234916)
chr6 (161-304)||(26949556-26949699)
chr6 (70-185)||(2184302-2184417)
chr6 (341-388)||(25481586-25481633)
chr6 (341-388)||(25538384-25538431)
chr6 (51-185)||(2184912-2185046)
chr6 (174-259)||(26617266-26617351)
chr6 (174-259)||(26723194-26723279)
chr6 (341-385)||(25579566-25579610)
chr6 (340-388)||(26055770-26055818)
chr6 (341-388)||(26048689-26048736)
chr6 (341-388)||(26069858-26069905)
chr6 (341-388)||(26075740-26075787)
chr6 (341-388)||(26142709-26142756)
chr6 (339-406)||(27531503-27531569)
chr6 (174-304)||(26811404-26811534)
chr6 (64-118)||(27234676-27234730)
chr6 (69-117)||(25071741-25071789)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (18-406)||(3427-3817)
scaffold0349 (18-406)||(14362-14749)
scaffold0349 (273-406)||(8062-8196)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (17-406)||(13637-14027)
scaffold0277 (18-406)||(4677-5066)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (17-400)||(7323-7707)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (105-400)||(10-306)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (28-406)||(18699403-18699782)
chr4 (17-406)||(18731496-18731886)
chr4 (28-406)||(18679570-18679949)
chr4 (17-406)||(18655469-18655859)
chr4 (17-372)||(18724077-18724432)
chr4 (18-406)||(18073559-18073943)
chr4 (201-406)||(17989226-17989430)
chr4 (18-298)||(5090960-5091240)
chr4 (61-157)||(17989089-17989185)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (27-395)||(28164364-28164733)
chr1 (17-372)||(268349-268704)
chr1 (17-392)||(28127671-28128042)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (17-365)||(29273775-29274123)
chr8 (81-322)||(31903728-31903969)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (18-406)||(59367-59751)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (64-325)||(34599-34860)
scaffold0038 (64-337)||(116658-116931)
scaffold0038 (64-301)||(42864-43101)
scaffold0038 (64-304)||(27343-27583)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (64-325)||(58334-58595)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (64-295)||(3279592-3279823)
chr2 (174-304)||(17993846-17993976)
chr2 (64-117)||(17993736-17993789)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (71-266)||(16688944-16689139)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (145-191)||(214467-214513)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 27604711 - 27605106
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27604711 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatt 27604810  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27604811 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaa 27604910  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604911 ggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 27605010  T
Q  318 gcataggaaattgaa------gaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    |||||||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27605011 gcataggaaaatgaagaggatgaggatgaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 27605106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 27611008 - 27611397
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611008 tccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 27611107  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27611108 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaa 27611207  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27611208 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 27611307  T
Q  318 gcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27611308 ccataggaaaatgaagaagaagaggaagctaattgcatagccatgaaaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 27611397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 27724851 - 27725240
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27724851 tccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagt 27724950  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27724951 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 27725050  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27725051 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 27725150  T
Q  318 gcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27725151 ccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 27725240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 27718385 - 27718774
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718385 tccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 27718484  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27718485 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 27718584  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27718585 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 27718684  T
Q  318 gcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||| ||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27718685 ccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 27718774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 27698500 - 27698888
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27698500 tccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 27698599  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27698600 tgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 27698699  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27698700 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaat 27698799  T
Q  318 gcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698800 ccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaagagtttgagaatgcagaa 27698888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28781321 - 28780931
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    |||| |||||||    
T  28781321 atccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatag 28781222  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28781221 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatga 28781122  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28781121 aggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaa 28781022  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28781021 tgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaa 28780931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26802624 - 26802230
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||    
T  26802624 atccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatag 26802525  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26802524 ttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatga 26802425  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26802424 aggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaa 26802325  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-----aaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  26802324 tccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaa 26802230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28786456 - 28786070
Alignment:
Q  21 acaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttga 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    || | ||| |||||||    
T  28786456 acaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttga 28786357  T
Q  121 tagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28786356 tagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 28786257  T
Q  221 atggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgca 320  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28786256 tttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatcca 28786157  T
Q  321 taggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28786156 taggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaa 28786070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28792577 - 28792191
Alignment:
Q  21 acaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttga 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    || | ||| |||||||    
T  28792577 acaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttga 28792478  T
Q  121 tagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28792477 tagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 28792378  T
Q  221 atggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgca 320  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28792377 tttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatcca 28792278  T
Q  321 taggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28792277 taggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaa 28792191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27679127 - 27678744
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27679127 tccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 27679028  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||    
T  27679027 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaa 27678928  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  || |     
T  27678927 ggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtac 27678828  T
Q  318 gcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaat 400  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27678827 tcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 27678744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 27593025 - 27593375
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27593025 atccacaccaaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatag 27593124  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27593125 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatga 27593224  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  || |    
T  27593225 aggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgta 27593324  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaat 367  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27593325 atcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 92 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27229339 - 27229026
Alignment:
Q  92 caaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcct 191  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  27229339 caaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgatttcgtctcct 27229240  T
Q  192 cttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaa 291  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27229239 ctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaa 27229140  T
Q  292 aactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagag 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27229139 aactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgagacttgagagaaattggatg-aaaagag 27229041  T
Q  392 tttgagaatgcagaa 406  Q
    ||| |||||||||||    
T  27229040 ttttagaatgcagaa 27229026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26656171 - 26655781
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||     | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26656171 atccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatag 26656072  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26656071 ttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatga 26655972  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||    
T  26655971 aagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaa 26655872  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26655871 cccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaa 26655781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26762142 - 26761752
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||     | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26762142 atccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatag 26762043  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26762042 ttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatga 26761943  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||    
T  26761942 aagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaa 26761843  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26761842 cccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaa 26761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 27677620 - 27677969
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27677620 tccacagcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 27677719  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||    
T  27677720 tgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaa 27677819  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || || ||| | ||||| ||||||||  || |     
T  27677820 ggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtac 27677919  T
Q  318 gcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaat 367  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27677920 tcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 400
Target Start/End: Original strand, 27706411 - 27706791
Alignment:
Q  21 acaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttga 120  Q
    |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27706411 acaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtga 27706510  T
Q  121 tagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||  |  |||||||||||    
T  27706511 tagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggt 27706610  T
Q  221 atggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgca 320  Q
     |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||   || || ||||| ||||| ||||||||  || |  ||    
T  27706611 gtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactca 27706710  T
Q  321 taggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaat 400  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27706711 taggaaattgaagtggaagagaaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 27706791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31284470 - 31284080
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||  | | ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31284470 atccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatag 31284371  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||  ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  31284370 ttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatga 31284271  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  31284270 aggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaa 31284171  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaa-aaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31284170 tacataggaaattgaagaggaagaggaagatgattgcatagccatgagatttgagagaatatggatgaagaaagaatttgagaatgcagaa 31284080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26646661 - 26646302
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  26646661 atccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatag 26646562  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||    
T  26646561 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatga 26646462  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||    
T  26646461 aggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaa 26646362  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaaga------ggaaggtaattgcatagccatgagaattga 370  Q
    | | ||||||||| ||||||||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26646361 tccgtaggaaattaaagaggaagaggaataggaaggagattgcatagccatgagaattga 26646302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26752629 - 26752270
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  26752629 atccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatag 26752530  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||    
T  26752529 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatga 26752430  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||    
T  26752429 aggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaa 26752330  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaaga------ggaaggtaattgcatagccatgagaattga 370  Q
    | | ||||||||| ||||||||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26752329 tccgtaggaaattaaagaggaagaggaataggaaggagattgcatagccatgagaattga 26752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Original strand, 27338070 - 27338454
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||     | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27338070 atccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatag 27338169  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||   |||||| |  ||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  27338170 tttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatga 27338269  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||  ||||    
T  27338270 aggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaa 27338369  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaat 400  Q
      || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  27338370 cccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaataagatgaaaaaaaagtttgagaat 27338454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Original strand, 27398810 - 27399194
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||     | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27398810 atccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatag 27398909  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||   |||||| |  ||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  27398910 tttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatga 27399009  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||  ||||    
T  27399010 aggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaa 27399109  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaat 400  Q
      || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  27399110 cccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaataagatgaaaaaaaagtttgagaat 27399194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26623158 - 26622805
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  26623158 atccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatag 26623059  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| || || || || || |||  ||||| |||| ||||||| || |||||| |||| |||   ||||||||||    
T  26623058 ttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatga 26622959  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  ||||    
T  26622958 aggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaa 26622859  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattga 370  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26622858 ttgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26729136 - 26728783
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  26729136 atccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatag 26729037  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| || || || || || |||  ||||| |||| ||||||| || |||||| |||| |||   ||||||||||    
T  26729036 ttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatga 26728937  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  ||||    
T  26728936 aggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaa 26728837  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattga 370  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26728836 ttgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26728783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26884347 - 26884023
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatga--tgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcat 114  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26884347 atccacaccaacaaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcat 26884248  T
Q  115 agttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaat 214  Q
    ||||| ||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  26884247 agttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaat 26884148  T
Q  215 gaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtg 314  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26884147 gaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtg 26884048  T
Q  315 aatgcataggaaattgaagaggaag 339  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26884047 aatccataggaaaatgaagaggaag 26884023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 27531202 - 27531503
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |  | |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27531202 atccacaccaataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatag 27531301  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||   |||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27531302 ttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatga 27531401  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27531402 aggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaa 27531501  T
Q  317 tg 318  Q
    ||    
T  27531502 tg 27531503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26824022 - 26823638
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||  | |||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26824022 atccacaccatagaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatag 26823923  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    |||| | ||  ||||| ||| |||||| |||| |||   |||||||  |    
T  26823922 ttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaa 26823823  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||    
T  26823822 aggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaa 26823723  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaa-aaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
      |||| |||| |      |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26823722 atcatatgaaact------gaagaggaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaattggacgaagaaagagtttgagaatgcagaa 26823638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25579865 - 25579613
Alignment:
Q  53 ctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattca 152  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||     
T  25579865 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 25579766  T
Q  153 tcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 252  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25579765 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 25579666  T
Q  253 gattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 305  Q
    |||| || ||||||  ||  ||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  25579665 gattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26861784 - 26861446
Alignment:
Q  28 agaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||   | |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  26861784 agaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttgcag---ttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaa 26861688  T
Q  128 cacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 227  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||| |||   |||| |  | |||||||||| |||||| |||| |||   ||||| |||||||| || |||    
T  26861687 cacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaatt 26861588  T
Q  228 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| || |||||  ||||| |||||||||    
T  26861587 cccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaa 26861488  T
Q  328 ttgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattg 369  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26861487 tggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 26861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25481888 - 25481636
Alignment:
Q  53 ctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattca 152  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| ||||||| |||||     
T  25481888 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattct 25481789  T
Q  153 tcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 252  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25481788 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 25481689  T
Q  253 gattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 305  Q
    |||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  25481688 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26143011 - 26142759
Alignment:
Q  53 ctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattca 152  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||     
T  26143011 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26142912  T
Q  153 tcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 252  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26142911 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 26142812  T
Q  253 gattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 305  Q
    |||| || |||||   ||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26142811 gattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 27427612 - 27427996
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  27427612 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagt 27427711  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatc------ 211  Q
    ||  |||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||         ||    |||||||| ||  |||| |||| |||||||| |||||||          
T  27427712 tggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat---------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatc 27427802  T
Q  212 aatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaa 311  Q
    |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||| | ||||    
T  27427803 atggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaa 27427902  T
Q  312 gtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  27427903 ctgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg-agaagagtttgagaatgcagaa 27427996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26048991 - 26048739
Alignment:
Q  53 ctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattca 152  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||     
T  26048991 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26048892  T
Q  153 tcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 252  Q
    || |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  26048891 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttataga 26048792  T
Q  253 gattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 305  Q
    |||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26048791 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26056064 - 26055820
Alignment:
Q  61 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggc 160  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||  ||||| || |||||    
T  26056064 tgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggc 26055965  T
Q  161 cttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcca 260  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||     
T  26055964 cttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccg 26055865  T
Q  261 gtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 305  Q
    ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  26055864 gtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26070160 - 26069908
Alignment:
Q  53 ctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattca 152  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||     
T  26070160 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26070061  T
Q  153 tcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 252  Q
    || |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  26070060 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttataga 26069961  T
Q  253 gattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 305  Q
    |||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26069960 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26076034 - 26075790
Alignment:
Q  61 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggc 160  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||  ||||| || |||||    
T  26076034 tgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggc 26075935  T
Q  161 cttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcca 260  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||     
T  26075934 cttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccg 26075835  T
Q  261 gtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 305  Q
    ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  26075834 gtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25538686 - 25538434
Alignment:
Q  53 ctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattca 152  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| || |||||     
T  25538686 ctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattct 25538587  T
Q  153 tcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 252  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25538586 tcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttataga 25538487  T
Q  253 gattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 305  Q
    |||| || |||||   ||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  25538486 gattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28234692 - 28234438
Alignment:
Q  71 aatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagt 170  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  28234692 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28234593  T
Q  171 gctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgt 270  Q
    | |||||| ||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||  | |||||||| |    
T  28234592 gatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccat 28234493  T
Q  271 atcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagga 325  Q
    | ||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||    
T  28234492 agcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 28234438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325343
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || |||||  ||||| ||||| || |||| | |||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 28325417  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 337  Q
    ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||  ||||||||    
T  28325416 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 28325343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28242939 - 28242702
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  28242939 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28242840  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| |||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| | |  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  28242839 gaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagta 28242740  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaa 301  Q
    ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  28242739 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26848795 - 26848555
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| || ||| ||||  ||||||| || || ||||||  |||    
T  26848795 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttctt 26848696  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    ||| || |  |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||     
T  26848695 gaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagattaccagtg 26848596  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    |||| | ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  26848595 aaactgaatctagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26848555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28227085 - 28226845
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  28227085 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 28226986  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| || ||| |||||||| |||| | |||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  |||||||||| ||||||    
T  28226985 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagta 28226886  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  28226885 aaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 28226845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 365
Target Start/End: Original strand, 28098426 - 28098725
Alignment:
Q  69 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaa 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||    
T  28098426 tgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgacaa 28098525  T
Q  169 gtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaacc 268  Q
    | | | ||||||||  ||| |||    ||||||| || |  |||||||||||  ||| |||   ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28098526 gggattgtgtgattctatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaacc 28098625  T
Q  269 gtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaatt---gcatagccatgaga 365  Q
     || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  || |||||| |||| || | ||||||| ||||||||| | |||   ||||||||||||||    
T  28098626 ataccgagtgtcggtgcccctaaaattaagaaacacgtcataggtgaatccataagagaatgaagagaaagaggaagatgattggagcatagccatgaga 28098725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28185494 - 28185222
Alignment:
Q  71 aatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagt 170  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  28185494 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28185395  T
Q  171 gctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgt 270  Q
    | || ||| ||||| || |||| | |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | |||||| ||||||||||  |    
T  28185394 gatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacgat 28185295  T
Q  271 atcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagagga 343  Q
    | ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |  || |||||| ||||||| |  |||||||| |||||    
T  28185294 aacgagtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28181249 - 28180970
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  28181249 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28181150  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| || ||| ||||| || |||| | |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | |||||| ||||||    
T  28181149 gaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagta 28181050  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagagga 343  Q
    ||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||| | |  || |||||| ||||||| |  |||||||| |||||    
T  28181049 aaaccataacgagtgtcaccacctctaaagctaaggaacgcgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28180970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28139723 - 28139454
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |  |  ||||||||  || |||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28139723 atccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatag 28139624  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||  ||||  ||||| || |||| | |||| ||  | |||||||| |    
T  28139623 ttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataa 28139524  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcc 286  Q
    | || ||||||||   ||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  28139523 aagtgtggattccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaaccgaaacgagtgtcactgcc 28139454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 26341947 - 26342265
Alignment:
Q  28 agaaaacaggcaaaatgacgcgaccctt---tgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 124  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||   || | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26341947 agaaaacaggcaaaattttgcgacccttctttgccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattga 26342046  T
Q  125 aaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgg 224  Q
     || |  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||| | |||||||||  || ||||   |||| ||  | ||||||||||||||  ||    
T  26342047 gaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggctttgacaagtgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcgg 26342146  T
Q  225 attcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagg 324  Q
    | |||   ||||   |||||  | |||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| | |||||||| |  || |||||| |||| |    
T  26342147 actccaccgtcacatagagctctatagatattgccagtaaaaccatagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacacatcatatgtgaatccatatg 26342246  T
Q  325 aaattgaagaggaagagga 343  Q
    | | ||||||| |||||||    
T  26342247 agaatgaagagaaagagga 26342265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 366
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665471
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||| || | |  |||   |||||| ||||| ||||||  |||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagttcttagagaatataataatggcaatcctcgattcttcaatgctctt 27665268  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
      | ||||  ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || ||     
T  27665269 ccggagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtg 27665368  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatga 363  Q
    |||||  |||||||||| || ||||| ||||||| |||||| | | |  ||||  |||| || |  || ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27665369 aaaccaaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacacatcgaagttgaaatcataagagagggaggaggaggaagtaggtaattgcatagccatga 27665468  T
Q  364 gaa 366  Q
    |||    
T  27665469 gaa 27665471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635585
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  |||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26635726  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    ||| || |  |||||||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || || ||     
T  26635725 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtg 26635626  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    |||||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  26635625 aaaccgaattgagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26635585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741551
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  |||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26741692  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    ||| || |  |||||||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || || ||     
T  26741691 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtg 26741592  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    |||||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  26741591 aaaccgaattgagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26741551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26937265 - 26937073
Alignment:
Q  28 agaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 127  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| |||||| || |||| | || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26937265 agaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaa 26937166  T
Q  128 cacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggt 220  Q
     ||||| ||   ||||| ||| || ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||   | || || |||||||||||||||||    
T  26937165 tacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggt 26937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28150086 - 28149912
Alignment:
Q  50 accctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggat 149  Q
    |||||||| | || |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |  ||||| |||||||||||     
T  28150086 accctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggac 28149987  T
Q  150 tcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 225  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| |  ||| ||  | |||||||||||||| ||||    
T  28149986 tcttcaatggccttgag-agtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtgga 28149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29826145 - 29825958
Alignment:
Q  81 acaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtga 180  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||||||    ||||| ||||| | ||| ||||| | |||||  |||||||    
T  29826145 acaagttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtga 29826046  T
Q  181 tttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaacc 268  Q
    |||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||  | |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29826045 tttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 194
Target Start/End: Original strand, 25506975 - 25507091
Alignment:
Q  78 tgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||  | || |||||    
T  25506975 tgaacaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtg 25507074  T
Q  178 tgatttcatctcctctt 194  Q
    |||||||||||||||||    
T  25507075 tgatttcatctcctctt 25507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26959298 - 26959067
Alignment:
Q  67 aatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt-ga 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  ||| ||    
T  26959298 aatgaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgagtcttcaatgctctttga 26959199  T
Q  166 gaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaa 265  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || || || ||    
T  26959198 gaagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaa 26959099  T
Q  266 accgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaa 297  Q
    || | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  26959098 actgaatcgagtgtcggtgcccctgaaactaa 26959067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25071684 - 25071554
Alignment:
Q  174 ggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatc 273  Q
    ||||||||||| || |||||   ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||| |||    
T  25071684 ggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagctttataaagattaccggtaaaaccgaatc 25071585  T
Q  274 gagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  25071584 gagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 25071554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26975185 - 26974947
Alignment:
Q  66 caatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttga 165  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  |||||    
T  26975185 caatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggtaatcctcgagtcttcaatgctcttga 26975086  T
Q  166 gaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaa 265  Q
    | || |  ||||||||||| || ||| ||  ||| || ||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || || || ||    
T  26975085 ggagcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaa 26974986  T
Q  266 accgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    |||| |||||||||| || || || ||||||| ||||||    
T  26974985 accgaatcgagtgtcggtacctctgaaactaatgaacac 26974947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 301
Target Start/End: Original strand, 28297765 - 28298002
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||| |  || ||||||  |||    
T  28297765 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28297864  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| |||||| ||||| || |||| |  ||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||   |  |||| | |||| |||||| ||| ||    
T  28297865 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttccaata 28297964  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaa 301  Q
    |||| ||| || |||||| | || |||||||| |||||    
T  28297965 aaactgtagcgtgtgtcactacctctaaaacttaggaa 28298002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28514308 - 28514071
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||| |  || ||||||  |||    
T  28514308 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28514209  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| |||||| ||||| || |||| |  ||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||   |  |||| | |||| |||||| ||| ||    
T  28514208 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttccaata 28514109  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaa 301  Q
    |||| ||| || |||||| | || |||||||| |||||    
T  28514108 aaactgtagcgtgtgtcactacctctaaaacttaggaa 28514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27214552 - 27214312
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    || || |||  || | ||||||| || || |||||   |||    
T  27214552 agcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcctcgagtcttcaattttctt 27214453  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    | | || |  | ||||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| || ||     
T  27214452 gtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtg 27214353  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  27214352 aaaccgtgtcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 304
Target Start/End: Original strand, 27234788 - 27234916
Alignment:
Q  176 tgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcga 275  Q
    ||||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| || || ||||||| ||||    
T  27234788 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27234887  T
Q  276 gtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  27234888 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26949699 - 26949556
Alignment:
Q  161 cttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcca 260  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| || ||| |  |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||     
T  26949699 cttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccg 26949600  T
Q  261 gtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    || |||||| |||||||||| || || || ||||||| ||||||    
T  26949599 gtgaaaccgaatcgagtgtcggtacctctgaaactaatgaacac 26949556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2184417 - 2184302
Alignment:
Q  70 gaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaag 169  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || | |||    
T  2184417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattctggactcttcaatggctttcataag 2184318  T
Q  170 tgctggtgtgatttca 185  Q
    || || ||| ||||||    
T  2184317 tgatgctgttatttca 2184302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25481633 - 25481586
Alignment:
Q  341 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25481633 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaa 25481586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25538431 - 25538384
Alignment:
Q  341 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25538431 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaa 25538384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2185046 - 2184912
Alignment:
Q  51 ccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggatt 150  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||   | || || ||||| || ||||| |||||||    
T  2185046 ccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaaaacagggatgaaaattctggatt 2184947  T
Q  151 catcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttca 185  Q
    | |||||||| || | ||| | |||||| ||||||    
T  2184946 cttcaatggctttcacaagcgatggtgttatttca 2184912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617266
Alignment:
Q  174 ggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 259  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || |||||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgcc 26617266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723194
Alignment:
Q  174 ggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 259  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || |||||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgcc 26723194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25579610 - 25579566
Alignment:
Q  341 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaa 385  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25579610 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaa 25579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26055818 - 26055770
Alignment:
Q  340 aggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaa 388  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26055818 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaa 26055770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26048736 - 26048689
Alignment:
Q  341 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26048736 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaa 26048689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26069905 - 26069858
Alignment:
Q  341 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26069905 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaa 26069858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26075787 - 26075740
Alignment:
Q  341 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26075787 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaa 26075740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26142756 - 26142709
Alignment:
Q  341 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26142756 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaa 26142709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 406
Target Start/End: Original strand, 27531503 - 27531569
Alignment:
Q  339 gaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||    
T  27531503 gaggaaggtgattgcgtagccatgagaactgagagaaact-tatgacaaggagtttgagaatgcagaa 27531569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26811534 - 26811404
Alignment:
Q  174 ggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatc 273  Q
    ||||||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||  || || || ||  |||    
T  26811534 ggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagatgaccggtgaagccagatc 26811435  T
Q  274 gagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    |||||||  | ||||| ||||||| ||||||    
T  26811434 gagtgtcgatacccctgaaactaatgaacac 26811404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 118
Target Start/End: Original strand, 27234676 - 27234730
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagtt 118  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27234676 agcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 25071789 - 25071741
Alignment:
Q  69 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  25071789 tgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 3427 - 3817
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag- 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  3427 tccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagg 3526  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3527 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatga 3626  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3627 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 3726  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3727 tccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 3817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 14362 - 14749
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14362 tccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagt 14460  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14461 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 14560  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14561 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaat 14660  T
Q  318 gcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14661 ccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaagagtttgagaatgcagaa 14749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 273 - 406
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8196
Alignment:
Q  273 cgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgaga 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8062 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgaga 8161  T
Q  373 gaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8162 gaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 8196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Original strand, 13637 - 14027
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    |||| ||| |||    
T  13637 atccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtag 13736  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13737 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatga 13836  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13837 aggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaa 13936  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13937 tgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaa 14027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 4677 - 5066
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  4677 tccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcataga 4776  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4777 agatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 4876  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaat 317  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4877 ggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 4976  T
Q  318 gcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4977 ccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaa 5066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7707 - 7323
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    |||| ||| |||    
T  7707 atccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtag 7608  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7607 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatga 7508  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507 aggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 7408  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaat 400  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7407 tgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 7323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 105 - 400
Target Start/End: Original strand, 10 - 306
Alignment:
Q  105 gaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcat 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  205 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 209  T
Q  305 ttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  210 ttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 406
Target Start/End: Original strand, 18699403 - 18699782
Alignment:
Q  28 agaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 127  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18699403 agaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18699502  T
Q  128 cacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 227  Q
    ||||||||| || ||||| || || |||||||| |||   |||| |||| |||||||||| || ||| | || |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18699503 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18699602  T
Q  228 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaa 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18699603 cccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaa 18699702  T
Q  328 ttgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18699703 atgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaactagatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 18699782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Original strand, 18731496 - 18731886
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18731496 atccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatag 18731595  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||   |||| |||| |||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||    
T  18731596 ttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatga 18731695  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18731696 aggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaa 18731795  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18731796 tcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatcgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 18731886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 406
Target Start/End: Original strand, 18679570 - 18679949
Alignment:
Q  28 agaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 127  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18679570 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18679669  T
Q  128 cacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 227  Q
    ||||||||| || ||||| || || |||||||| |||   |||| |||| |||||||||| |||||| | || |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18679670 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18679769  T
Q  228 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaa 327  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18679770 cctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaa 18679869  T
Q  328 ttgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18679870 atgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatagagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 18679949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Original strand, 18655469 - 18655859
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18655469 atccacgccatagaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatag 18655568  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||| |||   |||| |||| |||||||||| || ||| | || |||  |||||||||||    
T  18655569 ttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatga 18655668  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18655669 aggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaa 18655768  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18655769 tcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccatgaaaattgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaa 18655859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 18724077 - 18724432
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  18724077 atccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatag 18724176  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||   |||| |||| |||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||    
T  18724177 ttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatga 18724276  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18724277 aggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaa 18724376  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgaga 372  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18724377 tcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaga 18724432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18073943 - 18073559
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  18073943 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagt 18073844  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatc------ 211  Q
    ||  |||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||         ||    |||||||| ||  |||| |||| |||||||| |||||||          
T  18073843 tggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat---------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatc 18073753  T
Q  212 aatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaa 311  Q
    |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||| | ||||    
T  18073752 atggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaa 18073653  T
Q  312 gtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  18073652 ctgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg-agaagagtttgagaatgcagaa 18073559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 406
Target Start/End: Original strand, 17989226 - 17989430
Alignment:
Q  201 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaagga 300  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || || | ||||    
T  17989226 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 17989325  T
Q  301 acacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaat 400  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  17989326 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg-agaagagtttgagaat 17989424  T
Q  401 gcagaa 406  Q
    ||||||    
T  17989425 gcagaa 17989430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Original strand, 5090960 - 5091240
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  | || ||| |||  | || |||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5090960 tccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttccttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagt 5091059  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaa 217  Q
     | |||| || ||   ||| | |||| | ||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||   |||| ||  |||||||||||||    
T  5091060 ggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatggccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaa 5091159  T
Q  218 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaag 298  Q
    ||| || ||||||||| ||   ||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5091160 ggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaactaag 5091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 157
Target Start/End: Original strand, 17989089 - 17989185
Alignment:
Q  61 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaat 157  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  17989089 tgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 395
Target Start/End: Original strand, 28164364 - 28164733
Alignment:
Q  27 aagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 126  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28164364 aagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagata 28164463  T
Q  127 acacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 226  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||   |||||||   ||||||||||| || || ||    
T  28164464 acacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaat 28164563  T
Q  227 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaa 326  Q
    |||||||||   ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28164564 tcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaa 28164663  T
Q  327 attgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttg 395  Q
    |||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28164664 attgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacagaaattggatgagaaaagagtttg 28164733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 268349 - 268704
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  268349 atccacgccatagaagacgggcaaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatag 268448  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||   |||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||    
T  268449 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatga 268548  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||  ||| || ||  | ||||| || ||||| |  ||    
T  268549 aggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccctcacgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaa 268648  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgaga 372  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  268649 tccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaactgaga 268704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Original strand, 28127671 - 28128042
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28127671 atccacgccaaagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatag 28127770  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtga-tttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatg 215  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||  ||||||| |||  ||||||||   ||||| |   |||||||||    
T  28127771 ttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatg 28127870  T
Q  216 aaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtga 315  Q
    || || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  28127871 aatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtga 28127970  T
Q  316 atgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagt 392  Q
    || |||||||||||      ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28127971 atccataggaaatt------gaagaggaatgtgattgcatagccatgagaattgacaaaaattggatgagaaaagagt 28128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 365
Target Start/End: Original strand, 29273775 - 29274123
Alignment:
Q  17 atccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatag 116  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29273775 atccacgccatagaagacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatag 29273874  T
Q  117 ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| | |||   |||| || | |||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||    
T  29273875 ttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatga 29273974  T
Q  217 aggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaa 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||  ||| |||||  | ||||| || |||||||||||    
T  29273975 aggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaa 29274074  T
Q  317 tgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgaga 365  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29274075 tccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 29274123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31903969 - 31903728
Alignment:
Q  81 acaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtga 180  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||  |||| | ||||  |||   |||||| || || ||||| ||||  | ||||| ||||||||    
T  31903969 acaagttcatgtaagcaaaatgaagaagaagcatagtttttagagagcacaataatggcaatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtga 31903870  T
Q  181 tttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtc 280  Q
    |||||| ||||||| |||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  31903869 tttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtc 31903770  T
Q  281 agtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcata 322  Q
       ||| ||||| || |||||||| | ||| |||||| ||||    
T  31903769 taagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaatccata 31903728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 59751 - 59367
Alignment:
Q  18 tccacaccaaagaaaacaggcaaaatgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  59751 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagt 59652  T
Q  118 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatc------ 211  Q
    ||  |||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||         ||    |||||||| ||  |||| |||| |||||||| |||||||          
T  59651 tggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat---------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatc 59561  T
Q  212 aatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaa 311  Q
    |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||| | ||||    
T  59560 atggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaa 59461  T
Q  312 gtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaa 406  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  59460 ctgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg-agaagagtttgagaatgcagaa 59367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34860 - 34599
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  34860 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 34761  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||  | |||    
T  34760 gaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggta 34661  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagga 325  Q
    ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||    
T  34660 aaaccatagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 34599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116658
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || |||||  ||||| ||||| || |||| | |||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 116732  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 337  Q
    ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||  ||||||||    
T  116731 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 116658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43101 - 42864
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  43101 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 43002  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| |||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| | |  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  43001 gaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagta 42902  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaa 301  Q
    ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  42901 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27583 - 27343
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  27583 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 27484  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| || ||| |||||||| |||| | |||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  |||||||||| ||||||    
T  27483 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagta 27384  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  27383 aaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 27343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 325
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58595
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || | |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| |||||| ||||| || |||| | |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagga 325  Q
    ||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| || || |||||| |||||||    
T  58534 aaaccatagcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccatagga 58595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279592
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| |||| || || ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  164 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 263  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||   |||| ||  | ||||||||||||||   || |||   |||| | | |||  | |||||||| ||||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcagaatccaccgtcacttaaagctctatagagatttccagta 3279624  T
Q  264 aaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaact 295  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3279623 aaaccatagcgagtgtcagtgcccctaaaact 3279592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Original strand, 17993846 - 17993976
Alignment:
Q  174 ggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtatc 273  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||||| || || ||||| ||||    
T  17993846 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagattaccggtgaaaccatatc 17993945  T
Q  274 gagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 304  Q
    |||| || || ||||| ||||||| ||||||    
T  17993946 gagtatcggtacccctgaaactaatgaacac 17993976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Original strand, 17993736 - 17993789
Alignment:
Q  64 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  17993736 agcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 17993789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16688944
Alignment:
Q  71 aatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagt 170  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| || ||   |||||| || || ||||| ||||||| ||||    
T  16689139 aatgatgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagt 16689040  T
Q  171 gctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaa 266  Q
    | |||||||||||  || |||||  |||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16689039 gatggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtcacatagagctttgtacagattaccagtaaaa 16688944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 191
Target Start/End: Original strand, 214467 - 214513
Alignment:
Q  145 tggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcct 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  214467 tggattcatcaattgccttgaaaagtgatggtgtaatttcatctcct 214513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University