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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF18076_high_2 (Length: 359)
Name: NF18076_high_2
Description: NF18076
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18076_high_2 |
 |  |
|
| [»] scaffold0310 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0740 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0876 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0251 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0706 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0574 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0303 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0367 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0310 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6609 - 6261
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6609 |
acaacaagacatatcaataacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacata |
6510 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6509 |
taccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaat |
6410 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6409 |
ttcatcatttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
6310 |
T |
 |
| Q |
301 |
accttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6309 |
accttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg |
6261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 315 - 1
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
315 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacata |
216 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
215 |
taccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaat |
116 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
115 |
ttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
16 |
T |
 |
| Q |
301 |
accttaattatcacc |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
15 |
accttaattatcacc |
1 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7284261 - 7283913
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7284261 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaagcatattttcaacata |
7284162 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
7284161 |
taccaacttctcatactttgaacatacaattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaat |
7284062 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7284061 |
ttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatataaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctt |
7283962 |
T |
 |
| Q |
301 |
accttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7283961 |
accttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatg |
7283913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 3895089 - 3895376
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
3895089 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
3895188 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
3895189 |
tgaacatgcaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaa |
3895288 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895289 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3895376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15822632 - 15822327
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822632 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcatattttcaacata |
15822533 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15822532 |
taccattttcatacattttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-caacatgtcatcataattagagcacgaat |
15822434 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15822433 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataactgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
15822334 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15822333 |
tacctta |
15822327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 11287463 - 11287768
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287463 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
11287562 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
11287563 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaat |
11287662 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11287663 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
11287761 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
11287762 |
tacctta |
11287768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45452367 - 45452063
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
45452367 |
acaacatgacatatcaacaacaacgacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcatg--tcacaaattgagcatattttcaacaca |
45452270 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45452269 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
45452170 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45452169 |
ttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccct |
45452070 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
45452069 |
tacctta |
45452063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 44865294 - 44865582
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
116 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
44865294 |
aacaacaacaattaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
44865392 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
44865393 |
tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
44865492 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44865493 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaa-tctaacccccttacctta |
44865582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12370041 - 12369735
Alignment:
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Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
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acaacatcacttagcaacaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcatattttcaacaga |
12369942 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
12369941 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
12369842 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12369841 |
ttaatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgataatgatgaaatctaaccccct |
12369742 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
12369741 |
tacctta |
12369735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 143703 - 143991
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
143703 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
143801 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
143802 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
143900 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
143901 |
aattaatcaattcatccaattaagcactttttatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
143991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Original strand, 35094890 - 35095166
Alignment:
| Q |
29 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35094890 |
attgatcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatatactttgaacatgt |
35094988 |
T |
 |
| Q |
128 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35094989 |
aattcaactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
35095087 |
T |
 |
| Q |
228 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35095088 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
35095166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39046824 - 39046523
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
39046824 |
acaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag-atattttca-cata |
39046727 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||| | || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
39046726 |
tactcatttttcaa---ttgaacatacaattcaactaacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
39046630 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39046629 |
ttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaaccccct |
39046530 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
39046529 |
tacctta |
39046523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 12759033 - 12759340
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12759033 |
acaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
12759132 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |
|
|
| T |
12759133 |
tacccctttttcacattttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaat |
12759232 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12759233 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccc |
12759332 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
12759333 |
ttacctta |
12759340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26070465 - 26070161
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26070465 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacata |
26070366 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26070365 |
taccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
26070266 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
26070265 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-cccc |
26070169 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
26070168 |
ttacctta |
26070161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26094252 - 26093948
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26094252 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacata |
26094153 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26094152 |
taccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
26094053 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
26094052 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-cccc |
26093956 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
26093955 |
ttacctta |
26093948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 310
Target Start/End: Original strand, 47289828 - 47290138
Alignment:
| Q |
2 |
caacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatat |
101 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
47289828 |
caacatgacttaacagcaacagcaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacat |
47289927 |
T |
 |
| Q |
102 |
accaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
47289928 |
acccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatatatctaaacatggcatcataattagagctcgaa |
47290025 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
47290026 |
tttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
47290125 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
47290126 |
cttaccttaatta |
47290138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13863113 - 13862828
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
13863113 |
aacaacaacaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatact |
13863014 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
13863013 |
ttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggaca |
13862914 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13862913 |
attaatctattcacccaattaagc----ttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13862828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12248322 - 12248015
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12248322 |
acaacatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacat |
12248223 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12248222 |
atactattttctcatactttaaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaa |
12248123 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaaaag-tgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12248122 |
tttcatcatttatgaacaagtaatcaatt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaaccc |
12248025 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12248024 |
ccttacctta |
12248015 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16570189 - 16569902
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16570189 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatact |
16570090 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
16570089 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagca |
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T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
305 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16569989 |
aataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
16569902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 16595473 - 16595760
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19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16595473 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatact |
16595572 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
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ttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagca |
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T |
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| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
305 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
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aataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49047875 - 49047569
Alignment:
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T |
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199 |
Q |
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ataccactctctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaa |
49047677 |
T |
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200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
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| T |
49047676 |
ttctaacaattctgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcata-taacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaaccc |
49047579 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
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|||||||||| |
|
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49047578 |
ccttacctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #20
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Target Start/End: Original strand, 13377575 - 13377924
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T |
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ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
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atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaa |
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T |
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200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaac |
294 |
Q |
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| T |
13377774 |
ttctaacaattatgaacaattaatcgatt-actcaatgaatcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac |
13377871 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
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13377872 |
ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
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Target Start/End: Complemental strand, 17224139 - 17223797
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Q |
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17224041 |
T |
 |
| Q |
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ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
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| T |
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atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaa |
17223941 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaa |
293 |
Q |
| |
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| T |
17223940 |
ttataacaactttgaacaattaat-tatttactcaattaagcacttaatcata-aaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaa |
17223843 |
T |
 |
| Q |
294 |
cccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttt |
339 |
Q |
| |
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cccccttaccttaattatcaccaattcttagcccaagcttcacttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 13274833 - 13275129
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Q |
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13274921 |
T |
 |
| Q |
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ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
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| T |
13274922 |
ataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaa |
13275021 |
T |
 |
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200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
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ttctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaaccc |
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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16915129 - 16914781
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Q |
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|
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acaatatgacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcata-attcaacat |
16915031 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
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| T |
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ataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaa |
16914931 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttaca-aaagtgattatga-tgaacactaacc |
295 |
Q |
| |
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||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||| |
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| T |
16914930 |
ttttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaagttacactaaatgattgtgattgaattctaacc |
16914833 |
T |
 |
| Q |
296 |
cccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| || || | |||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
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cctttaccttaattaggacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta |
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T |
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Target: chr7; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 9838943 - 9839236
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Q |
| |
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9838943 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
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T |
 |
| Q |
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ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
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||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
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| T |
9839042 |
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9839141 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
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|||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
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Target Start/End: Original strand, 48356708 - 48357001
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || ||||| || |
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|
| T |
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ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaaca |
48356906 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48356907 |
attaatcactt-actcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
48357001 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 275 - 349
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Q |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |
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tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatg |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 126739 - 126813
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Q |
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tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 9611371 - 9611665
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Q |
| |
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||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||| || ||||||||| || ||| ||||| |
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|
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aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataatt-caacatataacactttcacatac |
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T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9611470 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac |
9611569 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
9611570 |
aattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaatta |
9611665 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32493977 - 32493903
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275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 3049647 - 3049717
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|
|
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aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 42056480 - 42056410
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
42056480 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
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Q |
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|
|
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2029055 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
2190375 |
caacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2190307 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
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92 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| | || ||||| ||| |||||| ||| ||||| ||| |
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|
| T |
14272009 |
ttcaacatatatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattag |
14271910 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tga |
286 |
Q |
| |
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| T |
14271909 |
agcacgaatttga-caactatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattga |
14271813 |
T |
 |
| Q |
287 |
acactaacccccttaccttaattatcaccaa |
317 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14271812 |
attctaattcccttaccttaattatcaccaa |
14271782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 111460 - 111390
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111460 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
111390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 126479 - 126549
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126479 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
126549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 31501228 - 31501526
Alignment:
| Q |
10 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaact |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || | |
|
|
| T |
31501228 |
cataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattt |
31501326 |
T |
 |
| Q |
109 |
tctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcac |
208 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| || ||||| || ||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
31501327 |
tcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaa |
31501426 |
T |
 |
| Q |
209 |
atatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgatta-tgatgaacactaacccccttacct |
304 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31501427 |
ctatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaa-tgaaaattacaactaattgattattgttgaattctaacccccttacct |
31501524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 3060272 - 3060344
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3060272 |
tgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta |
3060344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1936948 - 1936874
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1936948 |
tgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatg |
1936874 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 32494237 - 32494167
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32494237 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
32494167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 16919623 - 16919758
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |
|
|
| T |
16919623 |
aacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatatt |
16919721 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || || |||||||| |||||| |
|
|
| T |
16919722 |
ttgaacatgaaatttcaccaataacaattcgattatc |
16919758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Original strand, 28722200 - 28722359
Alignment:
| Q |
45 |
atcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
28722200 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaaca |
28722298 |
T |
 |
| Q |
144 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28722299 |
attcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca |
28722359 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34241317 - 34241101
Alignment:
| Q |
92 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| || |
|
|
| T |
34241317 |
ttcaacatatattactttcacatacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattat |
34241218 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaac |
288 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
34241217 |
aacacgaattttatcaactatgaacaattaatcactt-actcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaat |
34241119 |
T |
 |
| Q |
289 |
actaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34241118 |
tctaacccccttacctta |
34241101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Original strand, 14935517 - 14935609
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
204 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14935517 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttca |
14935609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Original strand, 15363110 - 15363202
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
204 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15363110 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttca |
15363202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 306
Target Start/End: Original strand, 25124407 - 25124482
Alignment:
| Q |
233 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25124407 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
25124482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
| Q |
290 |
ctaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13389693 |
ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
13389750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1937177 - 1937133
Alignment:
| Q |
45 |
atcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1937177 |
atcataattcatcaacaaccatacataattcaccaattgagcata |
1937133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 1427 - 1775
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1427 |
acaacatgacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcatattttcaacata |
1526 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1527 |
taccaatttctcatactttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
1626 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1627 |
ttcatcacataggaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
1726 |
T |
 |
| Q |
301 |
accttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1727 |
accttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg |
1775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12349740 - 12349434
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349740 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
12349641 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12349640 |
taacaacttctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
12349541 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12349540 |
ttcatcatttatggacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
12349441 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
12349440 |
tacctta |
12349434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50112252 - 50111946
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
50112252 |
acaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
50112153 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
50112152 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaat |
50112053 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50112052 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
50111953 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
50111952 |
tacctta |
50111946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 8631836 - 8632142
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8631836 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaaagcataattcactaaataagcatattttcaacata |
8631935 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
8631936 |
taccaacttctcaaactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
8632035 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8632036 |
ttcatcacttaagaacaattaattaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaatcctaaccccct |
8632135 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
8632136 |
tacctta |
8632142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 54424076 - 54424364
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54424076 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactt |
54424175 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
54424176 |
tgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
54424275 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424276 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
54424364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 317709 - 317405
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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|||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |
|
|
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acaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatttagcatattttca-caca |
317611 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
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|||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
317610 |
tacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaat |
317511 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
317510 |
ttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccctt |
317411 |
T |
 |
| Q |
301 |
acctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
317410 |
acctta |
317405 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 13817576 - 13817862
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
116 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
13817576 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatacccattt-tcatacac |
13817673 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
13817674 |
tttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtac |
13817772 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13817773 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13817862 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16996260 - 16995956
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16996260 |
acaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-caca |
16996162 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
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| T |
16996161 |
tacccatttttcatactttgaacatacaattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaat |
16996062 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
16996061 |
ttcaccacttatgaataattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccctt |
16995962 |
T |
 |
| Q |
301 |
acctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
16995961 |
acctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19570889 - 19570586
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
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acaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-cata |
19570791 |
T |
 |
| Q |
101 |
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199 |
Q |
| |
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||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |
|
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| T |
19570790 |
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19570692 |
T |
 |
| Q |
200 |
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299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
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|
| T |
19570691 |
tttcatcacatatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaa-cccct |
19570593 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
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||||||| |
|
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| T |
19570592 |
tacctta |
19570586 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 17100720 - 17101004
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121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
17100720 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttga |
17100819 |
T |
 |
| Q |
122 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatta |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
17100820 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaatta |
17100919 |
T |
 |
| Q |
222 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17100920 |
atcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
17101004 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 17101405 - 17101689
Alignment:
| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttga |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
17101405 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttga |
17101504 |
T |
 |
| Q |
122 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatta |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
17101505 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaatta |
17101604 |
T |
 |
| Q |
222 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17101605 |
atcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 14298467 - 14298773
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acaacatgacatattaataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacg |
14298566 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| | | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
14298567 |
taaccatatcatacactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
14298666 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14298667 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
14298766 |
T |
 |
| Q |
300 |
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306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
14298767 |
tacctta |
14298773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 14304094 - 14304400
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acaacatgacatattaataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacg |
14304193 |
T |
 |
| Q |
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taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| | | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
14304194 |
taaccatatcatacactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
14304293 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14304294 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
14304393 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
14304394 |
tacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16182128 - 16181842
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| Q |
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116 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
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16182031 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16182030 |
tttgaacatgtaatttaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
16181932 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16181931 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22144473 - 22144167
Alignment:
| Q |
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22144473 |
acaacatggcttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgagcatattttcaacaca |
22144374 |
T |
 |
| Q |
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taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
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tacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaa |
22144276 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac-aaaagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22144275 |
atttcatcagttatgaacagttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaacccc |
22144176 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
22144175 |
cttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6154532 - 6154226
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
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Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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acaacatgacttaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
6154433 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcata--ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
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tacccattt-tcataaactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaactattcataatttcatacatctaaacatgtcattataattagaggacga |
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T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6154334 |
atttcatgacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccc |
6154235 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
6154234 |
cttacctta |
6154226 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 35123742 - 35124047
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
35123742 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
35123841 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatact-ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||| |
|
|
| T |
35123842 |
tacc--cttttcatacactttaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaa |
35123939 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
35123940 |
tttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccct |
35124039 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
35124040 |
ttacctta |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 17938620 - 17938925
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaacaaagcataattcatcaattaagcatattttcaacata |
17938719 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17938720 |
tatcaacttctcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccat-gctttatacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaat |
17938818 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
|||||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17938819 |
ttcatcactcaagaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaaccctaaccccct |
17938918 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
|| |||| |
|
|
| T |
17938919 |
tatctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439237
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131 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
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gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttaaacacatacccattttacatactttgaacatgtaatt |
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T |
 |
| Q |
132 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-taaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
230 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34439413 |
caaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
34439314 |
T |
 |
| Q |
231 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
34439313 |
tccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttacctta |
34439237 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 14295502 - 14295790
Alignment:
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117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14295502 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatact |
14295601 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
14295602 |
ttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
14295701 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14295702 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 14301129 - 14301417
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117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
14301229 |
ttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
14301328 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14301329 |
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14301417 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17523072 - 17522780
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118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
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tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttatgaacaa |
17522873 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
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Target Start/End: Complemental strand, 55441032 - 55440803
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatact |
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T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
55440932 |
ttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
55440833 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
55440832 |
attaatcaattcacccaattaagcacttat |
55440803 |
T |
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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
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Target Start/End: Original strand, 38527841 - 38528079
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Q |
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T |
 |
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tacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
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tacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaatagttgaaa |
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T |
 |
| Q |
265 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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38528038 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 3578135 - 3578440
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Q |
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|
|||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
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|
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acaacatgacttagcaacaacaa-atcaattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacat |
3578233 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
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atactattttctcatactttgaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacat-tcaacatgtcatcataattagagaatgaa |
3578332 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3578333 |
tatcatcatttatgaacaattaatcaatttacccaattaagcacttattcctac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccg |
3578431 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
3578432 |
cttacctta |
3578440 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
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Target Start/End: Complemental strand, 53898656 - 53898450
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
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acaacatgacatatcaacaacaacattaattgatcatgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
53898557 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
53898556 |
taccca-ttttcatacactttgaacatttaatgcaactaac-acaattcaattattcataacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacga |
53898459 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatca |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
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53898458 |
atttcatca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
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118 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
19261022 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
19260923 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19260922 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19260839 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11061189 |
aacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatact |
11061090 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| || | || |
|
|
| T |
11061089 |
ttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccattaaca |
11060991 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11060990 |
aataattaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaattatgattatgatgaattccaacccccttacctta |
11060902 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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Q |
| |
|
|||||||||| || ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
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6146848 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
184 |
Q |
| |
|
|||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
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|
||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
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|
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T |
 |
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ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
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| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||| |
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|
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T |
 |
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| |
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|
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ttctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac |
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T |
 |
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295 |
ccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
11328870 |
ccccttacctta |
11328859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 17139554 - 17139861
Alignment:
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1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17139554 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattt-caacat |
17139652 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
17139653 |
ataccattttctcatagtttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaa |
17139752 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacc |
295 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| || |||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17139753 |
ttctaacaattatgaacacttaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacc |
17139850 |
T |
 |
| Q |
296 |
cccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
17139851 |
cccttacctta |
17139861 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16880169 - 16880477
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataatt-caccaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
16880169 |
acaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagcatattct-aacat |
16880267 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
16880268 |
ataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaa |
16880367 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16880368 |
ttcaaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaaacacttgttcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac |
16880465 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
16880466 |
ccccttacctta |
16880477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12560437 - 12560131
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
12560437 |
acaacatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttc-acat |
12560339 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| || ||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
12560338 |
ataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaa |
12560239 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12560238 |
ttctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaaccc |
12560141 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12560140 |
ccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14059414 - 14059112
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14059414 |
acaacatcacatagcaacaataacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcata-tttcaacat |
14059316 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
14059315 |
atgtcattttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaa |
14059216 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
|| | || |||| |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14059215 |
ttctaacaatcatgaacaattagtcaatt-agtcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaattataaccc |
14059118 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttac |
302 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
14059117 |
ccttac |
14059112 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6146769 - 6146664
Alignment:
| Q |
202 |
tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6146769 |
tcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctt |
6146670 |
T |
 |
| Q |
301 |
acctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
6146669 |
acctta |
6146664 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 17191607 - 17191936
Alignment:
| Q |
21 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
17191607 |
caacatcaattaaacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataatt-caacataaatcactttctcatacttt |
17191705 |
T |
 |
| Q |
120 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
219 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
17191706 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaat |
17191805 |
T |
 |
| Q |
220 |
taatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcac |
314 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17191806 |
taatc-atttactcaattaagcaattgttcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaattatcac |
17191903 |
T |
 |
| Q |
315 |
caactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||| | |||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17191904 |
caattcctagcccaaacttcactttagctccta |
17191936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12488927 - 12488727
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12488927 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacat |
12488829 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
12488828 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaa |
12488729 |
T |
 |
| Q |
200 |
tt |
201 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
12488728 |
tt |
12488727 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11196457 - 11196291
Alignment:
| Q |
57 |
caacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcc |
155 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196457 |
caacaacaaatcataattcaaccaattaagcatattttcaacatataccattttctca--------acataaaattcaactaacaacaattcaattatcc |
11196366 |
T |
 |
| Q |
156 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196365 |
ataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca |
11196291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Original strand, 39656594 - 39656817
Alignment:
| Q |
23 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttga |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
39656594 |
acatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttga |
39656692 |
T |
 |
| Q |
122 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatta |
221 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||| | ||||||| |||| | || ||||| |||||| |
|
|
| T |
39656693 |
acatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaatta |
39656792 |
T |
 |
| Q |
222 |
atcaattcatccaattaagcacttat |
247 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656793 |
atc-atttactcaattaagcacttat |
39656817 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527975
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aaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattaca |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
14528110 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca |
14528012 |
T |
 |
| Q |
271 |
a-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528011 |
ataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3576621 - 3576323
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| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
3576621 |
aacaacatcaatcaaacatgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt-caatatatatcactttctcataca |
3576523 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || | ||| || |
|
|
| T |
3576522 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaaca |
3576423 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
312 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3576422 |
attaatc-atttactcaattaagcacttattcgtac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
3576325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12349931 - 12349834
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaaca |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12349931 |
acaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaactacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaaca |
12349834 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 7854306 - 7854380
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7854306 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Original strand, 17204818 - 17205076
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| Q |
92 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
17204818 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
17204917 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgat-ga |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
17204918 |
agcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttgttcgtac-cacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatgga |
17205015 |
T |
 |
| Q |
287 |
acactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17205016 |
attctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
17205076 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 30207280 - 30207570
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19 |
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117 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
30207280 |
aacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
30207378 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| | || || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | | ||||| | |
|
|
| T |
30207379 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaata |
30207478 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30207479 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
30207570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 3992614 - 3992684
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992614 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
3992684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 3992874 - 3992948
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992874 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
3992948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 19232090 - 19232164
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19232090 |
tgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
19232164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 54038055 - 54037981
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54038055 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg |
54037981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 55513194 - 55513268
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55513194 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
55513268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15876114 - 15876341
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca-atgcataattcaccaatt-gagcatattttcaaca |
98 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| || || ||| | |
|
|
| T |
15876114 |
acaacatcacttaccaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacttatg-ataatccaacaatttgagtatcatt-caaga |
15876211 |
T |
 |
| Q |
99 |
tataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||| | ||| |||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15876212 |
tatatcactttctcatacttggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacga |
15876311 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaatt |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15876312 |
atttcatcatctatgaacaattaatcaatt |
15876341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14528213 - 14528118
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttca |
95 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528213 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca |
14528118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 2844255 - 2844325
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844255 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2844325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 2844515 - 2844589
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844515 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
2844589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15857194 - 15857120
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15857194 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg |
15857120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 16261517 - 16261587
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16261517 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
16261587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 53771105 - 53771175
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53771105 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
53771175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47784876 - 47784767
Alignment:
| Q |
92 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
47784876 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
47784777 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
47784776 |
agcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 30153006 - 30153076
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30153006 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
30153076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 38167978 - 38168048
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38167978 |
aacaacatctattgatcatgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
38168048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 54685492 - 54685422
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54685492 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
54685422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14814948 - 14814658
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | || || ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
14814948 |
aacaacatcaattaaacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaatt-cacaatatatcattttcacatact |
14814850 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| || ||||| || |
|
|
| T |
14814849 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagca |
14814750 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14814749 |
aataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
14814658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 23492437 - 23492507
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23492437 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcata |
23492507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 33341945 - 33342015
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33341945 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
33342015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17955915 - 17955837
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagct----ctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17955915 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatg |
17955837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 7854046 - 7854116
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7854046 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgaacata |
7854116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16744072 - 16743998
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16744072 |
tgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatg |
16743998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17956175 - 17956109
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
85 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17956175 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag |
17956109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 45581695 - 45581765
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45581695 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
45581765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9590937 - 9590648
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || || |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9590937 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcataatt-catatcataccactttcacatact |
9590839 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| | || || |||||||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |
|
|
| T |
9590838 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaaca |
9590739 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9590738 |
attaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
9590648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Original strand, 12953028 - 12953210
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
12953028 |
aacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatatact |
12953126 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
12953127 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaatt |
12953210 |
T |
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Target: chr3; HSP #71
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Target Start/End: Original strand, 45581955 - 45582029
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| Q |
275 |
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349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
45581955 |
tgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca-tttttctcctatg |
45582029 |
T |
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Target: chr3; HSP #72
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54038315 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcata |
54038245 |
T |
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Target: chr3; HSP #73
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || || |
|
|
| T |
14080666 |
catactttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatcta |
14080765 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14080766 |
tgcacaattaatc-atttatccaattaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14080863 |
T |
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Target: chr3; HSP #74
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
13301559 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaacatcta |
13301460 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt |
309 |
Q |
| |
|
|| | | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13301459 |
agaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatt |
13301361 |
T |
 |
| Q |
310 |
atcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
| ||| || | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13301360 |
agcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
13301323 |
T |
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Target: chr3; HSP #75
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
13312215 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaacatcta |
13312116 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt |
309 |
Q |
| |
|
|| | | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13312115 |
agaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatt |
13312017 |
T |
 |
| Q |
310 |
atcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
| ||| || | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13312016 |
agcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
13311979 |
T |
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Target: chr3; HSP #76
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| Q |
272 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaa |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15550919 |
aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaa |
15550964 |
T |
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Target: chr3; HSP #77
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| Q |
270 |
aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38810945 |
aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
38810868 |
T |
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Target: chr3; HSP #78
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Target Start/End: Complemental strand, 51961106 - 51961031
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| Q |
233 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51961106 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
51961031 |
T |
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Target: chr3; HSP #79
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
202 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6228715 |
catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
6228625 |
T |
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Target: chr3; HSP #80
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Target Start/End: Complemental strand, 11882240 - 11882113
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| Q |
180 |
catcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
277 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||| |||| || || || ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
11882240 |
catcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaatga |
11882142 |
T |
 |
| Q |
278 |
ttatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11882141 |
ttatgatgaattctaacccccttacctta |
11882113 |
T |
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
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Q |
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|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19946744 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
19946776 |
T |
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Target: chr3; HSP #82
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Target Start/End: Complemental strand, 31412423 - 31412331
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
204 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31412423 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca |
31412331 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
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Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Original strand, 50313344 - 50313436
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
204 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
50313344 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttca |
50313436 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15654 - 15324
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc-atact |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||| |
|
|
| T |
15654 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttttatact |
15556 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |
|
|
| T |
15555 |
ttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaaca |
15456 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaa |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15455 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatttaaaattacaaaagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaa |
15356 |
T |
 |
| Q |
318 |
ctattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||| | | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15355 |
ctattagcccaagcttcacttttgctcctatg |
15324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 22737 - 23043
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22737 |
acaacatgacaaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
22836 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22837 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
22936 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22937 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
23036 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
23037 |
tacctta |
23043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1023 - 717
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1023 |
acaacatgacatatcaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactca |
924 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
923 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcatctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
824 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
823 |
ttcatcacatatgaacaatcaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
724 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
723 |
tacctta |
717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7028 - 6749
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
116 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
7028 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
6931 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
6930 |
tctgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
6831 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6830 |
aattaatcaattcacccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
6749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 57 - 349
Target Start/End: Original strand, 20274 - 20567
Alignment:
| Q |
57 |
caacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20274 |
caacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt |
20372 |
T |
 |
| Q |
155 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20373 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
20472 |
T |
 |
| Q |
255 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20473 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg |
20567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11909 - 11603
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
11909 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactaa |
11810 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |
|
|
| T |
11809 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcatccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaat |
11710 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11709 |
ttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
11610 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
|| |||| |
|
|
| T |
11609 |
tagctta |
11603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Original strand, 11584115 - 11584448
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaat---gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcata |
115 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
11584115 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcataca |
11584214 |
T |
 |
| Q |
116 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgac |
215 |
Q |
| |
|
||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
11584215 |
cttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactcatgaa |
11584314 |
T |
 |
| Q |
216 |
caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacc |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11584315 |
caattaattaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcacc |
11584414 |
T |
 |
| Q |
316 |
aactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11584415 |
aactattaactcaagcttcacttttgctcctatg |
11584448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 21397156 - 21397444
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
116 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
21397156 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
21397254 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
21397255 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
21397353 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397354 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21397444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24183332 - 24183027
Alignment:
| Q |
2 |
caacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatat |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183332 |
caacatgacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatat |
24183233 |
T |
 |
| Q |
102 |
accaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
201 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24183232 |
acccttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatt |
24183133 |
T |
 |
| Q |
202 |
tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24183132 |
tcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccctt |
24183033 |
T |
 |
| Q |
301 |
acctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
24183032 |
acctta |
24183027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 4865330 - 4865613
Alignment:
| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttga |
121 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
4865330 |
aacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaccc-atacccatttttcatactttga |
4865428 |
T |
 |
| Q |
122 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatta |
221 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
4865429 |
acatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccatttatgaacaatta |
4865528 |
T |
 |
| Q |
222 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4865529 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4865613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1168405 - 1168100
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168405 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
1168306 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
1168305 |
tatcattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaat |
1168206 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1168205 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtga-tatgatgaattctaaccccct |
1168107 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
1168106 |
tacctta |
1168100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 306
Target Start/End: Original strand, 28261568 - 28261867
Alignment:
| Q |
2 |
caacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-acata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28261568 |
caacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacacata |
28261667 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28261668 |
t------ttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaat |
28261761 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28261762 |
ttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccctt |
28261861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 20712122 - 20712428
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
20712122 |
acaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattatcaacaca |
20712221 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20712222 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
20712321 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20712322 |
ttcatca-ttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataagtgattatgatgaattctaaccccc |
20712420 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
20712421 |
ttacctta |
20712428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11337384 - 11337081
Alignment:
| Q |
4 |
acatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatac |
103 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11337384 |
acatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgagcatattttcaacatttac |
11337285 |
T |
 |
| Q |
104 |
caacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttc |
203 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11337284 |
catattctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttc |
11337185 |
T |
 |
| Q |
204 |
atcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctta |
301 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11337184 |
atcatttatgaacaattaaccaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
11337086 |
T |
 |
| Q |
302 |
cctta |
306 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
11337085 |
cctta |
11337081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 19405583 - 19405891
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcacc-aattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19405583 |
acaacatcacataccagtaacaatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacat |
19405682 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
19405683 |
atacccttttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaa |
19405782 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19405783 |
tttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccc |
19405881 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
19405882 |
ccttacctta |
19405891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21646914 - 21646636
Alignment:
| Q |
27 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-acatataccaacttctcatactttgaacat |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
21646914 |
caattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattgaacatattttcatacatac-ccattttcatacacttttaacat |
21646816 |
T |
 |
| Q |
126 |
gtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatca |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
21646815 |
gtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaacatttaatca |
21646717 |
T |
 |
| Q |
226 |
attcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21646716 |
attcacccaaataagcacttttcatacaaataattg-aaattgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
21646636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 24475644 - 24475861
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
24475644 |
aacaacaacaattgatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
24475739 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24475740 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaac |
24475838 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaa |
239 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24475839 |
aattaatcaattcatccaattaa |
24475861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 21906781 - 21907011
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118 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21906781 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcatcaattgaacatattttca------------------tactt |
21906862 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |
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| T |
21906863 |
tgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttcatatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
21906962 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
267 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21906963 |
ttaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatt |
21907011 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 3673926 - 3674215
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19 |
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117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3673926 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatact |
3674024 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
3674025 |
ttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattatgaaca |
3674124 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3674125 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3674215 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 19862273 - 19862604
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
19862273 |
aacaacatcaattgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
19862371 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
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| T |
19862372 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaaca |
19862471 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatca |
313 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
19862472 |
attaatcactt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatca |
19862570 |
T |
 |
| Q |
314 |
ccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19862571 |
ccaatttttagcctaaacttcactttagctccta |
19862604 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 306
Target Start/End: Original strand, 16595576 - 16595860
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122 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| || | || ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaa |
16595674 |
T |
 |
| Q |
123 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaa |
222 |
Q |
| |
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|||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| |||||| |
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|
| T |
16595675 |
catgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattag |
16595774 |
T |
 |
| Q |
223 |
tcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16595775 |
tcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16595860 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23981606 - 23981433
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23981606 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcactta |
23981507 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgat |
284 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23981506 |
tgaacaattaatcaatgcactaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
23981433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 23493965 - 23494272
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99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
23493965 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcata-tctcaacat |
23494063 |
T |
 |
| Q |
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ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
23494064 |
atacctattcttcatactttgaacataaaattccactaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaa |
23494163 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacc |
295 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |
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|
| T |
23494164 |
ttctaacaattatgaacaattaattgatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacc |
23494261 |
T |
 |
| Q |
296 |
cccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
23494262 |
cccttacctta |
23494272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5451044 - 5450731
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
5451044 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacat |
5450946 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
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atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaa |
5450846 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| | || | || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5450845 |
ttctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttatttatgc-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac |
5450748 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttaccttaattat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5450747 |
ccccttaccttaattat |
5450731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 7728466 - 7728774
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7728466 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacat |
7728564 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || | |||||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
7728565 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaa |
7728664 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacc |
295 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7728665 |
ttctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacc |
7728763 |
T |
 |
| Q |
296 |
cccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
7728764 |
cccttacctta |
7728774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 28902255 - 28902545
Alignment:
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28902255 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
28902353 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||| | | || || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |
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|
| T |
28902354 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
28902453 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28902454 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28902545 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 28938650 - 28938940
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117 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28938650 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
28938748 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||| | | || || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |
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|
| T |
28938749 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
28938848 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28938849 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28938940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21222791 - 21222462
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| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
21222791 |
aacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatatact |
21222693 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||| || |
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| T |
21222692 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaaca |
21222593 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatca |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
21222592 |
attaatcaat--actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaataattatgattgaactctaacccccataccttaattatca |
21222496 |
T |
 |
| Q |
314 |
ccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21222495 |
ccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
21222462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 432527 - 432815
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
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|
| T |
432527 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcattttctcatact |
432625 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| | || || |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||| | || ||||| || |
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|
| T |
432626 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaattatgatca |
432725 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
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| T |
432726 |
attaatc-atttactcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432815 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 21650759 - 21650829
Alignment:
| Q |
19 |
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89 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21650759 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21650829 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 21617080 - 21617374
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19 |
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | | |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
21617080 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcata-gttcaacatataacactttcatatact |
21617178 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt-tcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | | || |||| | |
|
|
| T |
21617179 |
tggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaatgaac |
21617278 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21617279 |
aattaatccctt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
21617374 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 2031874 - 2031944
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| Q |
19 |
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89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2031874 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2031944 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 11342749 - 11342819
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
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11342749 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
11342819 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 21310819 - 21310603
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191 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
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ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttag |
21310720 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
21310719 |
agcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaat |
21310621 |
T |
 |
| Q |
289 |
actaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
21310620 |
tttaacccccttacctta |
21310603 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Original strand, 21205000 - 21205060
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| Q |
29 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21205000 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21205060 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 23466521 - 23466787
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
23466521 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattca--------------------accaattgagcata-tttcaacatacaccatttttctcatact |
23466599 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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|||| |||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| | | ||||| || |
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| T |
23466600 |
ttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcttacatacaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaaca |
23466698 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466699 |
attaatcaatt-acacaattaatcacttattcatac-aataattgaaaattgcaataattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23466787 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21297285 - 21297069
Alignment:
| Q |
92 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| | | |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21297285 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttag |
21297186 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaac |
288 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |
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| T |
21297185 |
aggacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatgatgaat |
21297087 |
T |
 |
| Q |
289 |
actaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297086 |
tctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 37983428 - 37983758
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| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
37983428 |
aacaacatcaattaaacatgattctcattacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataatt-cacaatatatcactttcacatact |
37983526 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
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||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| || ||| |||| ||||||||| ||||| | || ||||| || |
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|
| T |
37983527 |
ttgaatatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatagagcacaaattttaacaactatgaaca |
37983626 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcac |
314 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
37983627 |
attaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcac |
37983725 |
T |
 |
| Q |
315 |
caactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37983726 |
aaatttctagcccaagcttcactttagctccta |
37983758 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 22885799 - 22885932
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
22885799 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttcaacaacca |
22885898 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
246 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22885899 |
tgaacaaattatcaatt-attcaattaagcactta |
22885932 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22054028 - 22053963
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| Q |
22 |
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87 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22054028 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
22053963 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18531262 - 18531200
Alignment:
| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga |
84 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18531262 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattga |
18531200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Original strand, 29918122 - 29918214
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
204 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
29918122 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttca |
29918214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 55376780 - 55376494
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
55376780 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagtatattttca-cacatacccatttttcatactt |
55376682 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
55376681 |
agaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
55376582 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55376581 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatttcaaaagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
55376494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 44055979 - 44056266
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
44055979 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatactt |
44056078 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
44056079 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaaa-attcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
44056177 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056178 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
44056266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Original strand, 30457952 - 30458255
Alignment:
| Q |
4 |
acatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatac |
103 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30457952 |
acatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattcaccaattgagcatattttcaacacatac |
30458051 |
T |
 |
| Q |
104 |
caacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttc |
203 |
Q |
| |
|
| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ccattttacatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttc |
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T |
 |
| Q |
204 |
atcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttac |
302 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30458152 |
atcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttac |
30458251 |
T |
 |
| Q |
303 |
ctta |
306 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
30458252 |
ctta |
30458255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 53704934 - 53704629
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
53704934 |
acaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcatattttca-caca |
53704836 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
53704835 |
tacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
53704736 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
53704735 |
ttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaaccccct |
53704636 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
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53704635 |
tacctta |
53704629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23270135 - 23269829
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
23270135 |
acaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtatattttcaacaca |
23270036 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23270035 |
tacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacga |
23269938 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23269937 |
atttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccc |
23269838 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
23269837 |
cttacctta |
23269829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45459056 - 45458769
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
45459056 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaacaacagcaaagcataattcaccaattgaacatatctttaacata |
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T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
45458956 |
tacaaacttctcatattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatctatcacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
45458857 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
45458856 |
ttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaa |
45458769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16732215 - 16732520
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16732215 |
acaacatgacttagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
16732314 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16732315 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
16732414 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatt-gaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| | | |
|
|
| T |
16732415 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-actaattaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacctctt |
16732513 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
16732514 |
tacctta |
16732520 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12837383 - 12837096
Alignment:
| Q |
19 |
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118 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12837383 |
aacaacatccattgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactt |
12837284 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
12837283 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaa |
12837184 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837183 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcattcaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12837096 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8872654 - 8872372
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
8872654 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactt |
8872556 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |
|
|
| T |
8872555 |
tgaacatacaattcaactaacaacacttcaatcattcatagcttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaa |
8872456 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8872455 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttac |
8872372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 34395303 - 34395609
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
34395303 |
acaacatgacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
34395402 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
34395403 |
taccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacga |
34395500 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34395501 |
atttcatcatttatgaacaattaatcagttcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccc |
34395600 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
34395601 |
cttacctta |
34395609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 44346891 - 44347177
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || | ||| |
|
|
| T |
44346891 |
aacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcttacact |
44346989 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
44346990 |
ttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaaca |
44347088 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44347089 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaactcccttacctta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21959664 - 21959359
Alignment:
| Q |
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21959664 |
acaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
21959565 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21959564 |
tacccatttttcatactttgag-atgtaattcaatcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
21959466 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21959465 |
ttcatcatttatgaacaatcaattaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccct |
21959366 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
21959365 |
tacctta |
21959359 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 53907882 - 53907604
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| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
53907882 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgggcatattttca-cacatacccatttttcatactt |
53907784 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
53907783 |
tgaacatacaatccaactaataacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
53907684 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53907683 |
tta--------atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaactacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
53907604 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20813658 - 20813442
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91 |
tttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaata |
190 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20813658 |
tttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatta |
20813559 |
T |
 |
| Q |
191 |
gagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaaca |
289 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813558 |
gagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaatt |
20813459 |
T |
 |
| Q |
290 |
ctaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813458 |
ctaacccccttacctta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 820099 - 819826
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| | |
|
|
| T |
820099 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacacattt-tcaca--- |
820004 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
820003 |
--aac--------caac-aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaa |
819915 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
819914 |
ttaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
819826 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52265691 - 52265403
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19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52265691 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatact |
52265593 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
52265592 |
ttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaaca |
52265493 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52265492 |
attaatcaatt-acccaattaaacacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
52265403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 27961017 - 27961324
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|
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27961017 |
acaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaatttagcatattt-caacat |
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T |
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| Q |
100 |
ataccaacttc-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
27961116 |
atacc-acttcttcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgg |
27961214 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
||| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27961215 |
attctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaacaatgattatgatgaattctaac |
27961312 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
27961313 |
ccccttacctta |
27961324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13809693 - 13809405
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcacc-aattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13809693 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcatattt-caacatataccattttctcatact |
13809595 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
13809594 |
ttgaacatgaaatctcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
13809495 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13809494 |
attaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13809405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 15044874 - 15045181
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15044874 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacat |
15044972 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
15044973 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaa |
15045072 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacc |
295 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15045073 |
ttctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacc |
15045170 |
T |
 |
| Q |
296 |
cccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15045171 |
cccttacctta |
15045181 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30232679 - 30232391
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
30232679 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatac |
30232582 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| | |
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|
| T |
30232581 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac |
30232483 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg--aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30232482 |
aattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctta |
30232391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18494529 - 18494224
Alignment:
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1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
18494529 |
acaacatcacttaacaacaacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcaca-tttcaacat |
18494431 |
T |
 |
| Q |
100 |
atacca-acttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
18494430 |
ataccatttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacga |
18494332 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
||| | || ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18494331 |
attctaacaattatgaacaattgatcaatt-acacaattaagcacctattcatac-cataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccc |
18494234 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18494233 |
ccttacctta |
18494224 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47535254 - 47535042
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||| |
|
|
| T |
47535254 |
atcaacaacaacgtcaattgaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatattt-caacatatatcactttct |
47535156 |
T |
 |
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
47535155 |
catactttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcattta |
47535056 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatca |
225 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
47535055 |
tgaacaattaatca |
47535042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15109550 - 15109243
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
15109550 |
acaacattacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataatt-caacat |
15109452 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
15109451 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaa |
15109352 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacc |
295 |
Q |
| |
|
|| | | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15109351 |
ttctaactattatgaataattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacc |
15109254 |
T |
 |
| Q |
296 |
cccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15109253 |
cccttacctta |
15109243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7186027 - 7185701
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||| | || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
7186027 |
aacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcatttagtgcacaatt-caacatatatcattttcacatact |
7185929 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
7185928 |
atgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaaca |
7185829 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacc |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7185828 |
attaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacctccttaccttaattagcaca |
7185730 |
T |
 |
| Q |
316 |
aactattagctctaacttcacttttgctc |
344 |
Q |
| |
|
|| | |||| | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7185729 |
aattcctagcccaaacttcactttagctc |
7185701 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41166147 - 41165983
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
41166147 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacat |
41166049 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
165 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
41166048 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcat |
41165983 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 54118199 - 54118125
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| Q |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
54118199 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatg |
54118125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25119138 - 25119064
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25119138 |
tgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
25119064 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41256552 - 41256263
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
41256552 |
aacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatact |
41256454 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |
|
|
| T |
41256453 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaaca |
41256355 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41256354 |
attaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
41256263 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Original strand, 18276498 - 18276743
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||| || |
|
|
| T |
18276498 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatgct |
18276596 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
18276597 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaaca |
18276696 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18276697 |
attaatcacat-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaa |
18276743 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5682459 - 5682385
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275 |
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349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682459 |
tgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatg |
5682385 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
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Target Start/End: Original strand, 14951826 - 14951896
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Q |
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|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14951826 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
14951896 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15272503 - 15272433
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15272503 |
aacaacatctattgatcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15272433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15013465 - 15013137
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || || |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
15013465 |
aacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatgtcattttcacatact |
15013367 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
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|
| T |
15013366 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcat-tcaacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaaca |
15013268 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatca |
313 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |
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|
| T |
15013267 |
attaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagca |
15013170 |
T |
 |
| Q |
314 |
ccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||| | |||||| | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15013169 |
-caaatcctagctcaagcttcactttagctccta |
15013137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 14901296 - 14901584
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||| || || |||||||||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
14901296 |
aacaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcatattta-aacatatatcactttctcatact |
14901394 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| || ||||||||| ||||| || | || ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| | || |||||| || |
|
|
| T |
14901395 |
tcaaacatgaaatttcaccaacaacaat-caattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaaca |
14901493 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14901494 |
attaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttacctta |
14901584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5682704 - 5682648
Alignment:
| Q |
33 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682704 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
5682648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25119398 - 25119328
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25119398 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata |
25119328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7964894 - 7964565
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
7964894 |
aacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
7964796 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |
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|
| T |
7964795 |
t-gaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatgaaca |
7964697 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcac |
314 |
Q |
| |
|
|||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
7964696 |
attactcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcac |
7964598 |
T |
 |
| Q |
315 |
caactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|| | | || | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7964597 |
aaattccttgcccaaacttcactttagctccta |
7964565 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 10104454 - 10104380
Alignment:
| Q |
13 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104454 |
atcaacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
10104380 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 38764773 - 38765066
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | || || ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
38764773 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcataattgaacaacaacatcgcataattcaacaatttgagcacaatt-cacaatataacattttcacatact |
38764871 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| || ||||| || ||||||||||||| || ||||| | |
|
|
| T |
38764872 |
atgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaacaactatga-aa |
38764970 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcac-ttatcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38764971 |
aataatcaatt-attcaactaagcactttatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttaatta |
38765066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 40885758 - 40885676
Alignment:
| Q |
13 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca |
95 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40885758 |
atcaacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttca |
40885676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15675284 - 15675219
Alignment:
| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675284 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
15675219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41165885 - 41165808
Alignment:
| Q |
270 |
aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41165885 |
aaaaatgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
41165808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40905024 - 40904932
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
204 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40905024 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca |
40904932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Original strand, 31115697 - 31115764
Alignment:
| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31115697 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcata |
31115764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20573393 - 20573087
Alignment:
| Q |
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20573393 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
20573294 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20573293 |
tacccttttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
20573194 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20573193 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
20573094 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
20573093 |
tacctta |
20573087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 41246704 - 41247009
Alignment:
| Q |
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |
|
|
| T |
41246704 |
acaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcatattt-catcata |
41246802 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41246803 |
tacccatttttcctacttttaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaat |
41246902 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41246903 |
ttcatcatttatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaaccccct |
41247002 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
41247003 |
tacctta |
41247009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561526
Alignment:
| Q |
23 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaa |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561810 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaa |
20561711 |
T |
 |
| Q |
123 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaa |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
20561710 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaa |
20561611 |
T |
 |
| Q |
223 |
tcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561610 |
tcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20561526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22235004 - 22234700
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
22235004 |
acaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-caca |
22234906 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22234905 |
tacccattt-tcatacactttgagcatgtaattcaactaaca-caattaaattattcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacga |
22234808 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22234807 |
atttcatcacttatgaacaattaatcaattcattcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccc |
22234708 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22234707 |
ttacctta |
22234700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Original strand, 37611717 - 37612020
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37611717 |
acatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatac |
37611816 |
T |
 |
| Q |
104 |
caacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
201 |
Q |
| |
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| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37611817 |
ccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatt |
37611914 |
T |
 |
| Q |
202 |
tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
37611915 |
tcatcacttatgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaaccccctt |
37612014 |
T |
 |
| Q |
301 |
acctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
37612015 |
acctta |
37612020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 20481651 - 20481955
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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|||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
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| T |
20481651 |
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20481750 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
20481751 |
tatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
20481850 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
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| T |
20481851 |
ttcatcatccatgaacaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-attaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattttaaccccct |
20481948 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
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| T |
20481949 |
tacctta |
20481955 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19993255 - 19992952
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
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T |
 |
| Q |
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taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
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| T |
19993156 |
tacccattt-tcatacactttgaacaagtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacgg |
19993059 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
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| T |
19993058 |
atttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattg-aaattacaaaagtgattatgatgaattataaccccc |
19992960 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
19992959 |
ttacctta |
19992952 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 21681048 - 21681356
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99 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21681048 |
acaacatcacataccagtaacaacatcaattgatcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacat |
21681147 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |
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| T |
21681148 |
atacccttctctcatactttaaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaa |
21681247 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
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||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |
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| T |
21681248 |
ttttatcatttatgaacaattaatcaattcaacaaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccc |
21681346 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
21681347 |
ccttacctta |
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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
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Target Start/End: Complemental strand, 20654106 - 20653944
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Q |
| |
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|||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20654106 |
acaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattaagcatattttcaatata |
20654007 |
T |
 |
| Q |
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taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
163 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20654006 |
taccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
20653944 |
T |
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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21198352 - 21198005
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| Q |
2 |
caacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |
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|
| T |
21198352 |
caacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt-caacata |
21198254 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
21198253 |
tatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
21198154 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
21198153 |
ttcatcatctatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaaccc |
21198056 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21198055 |
ccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122793
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230 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25122618 |
tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca |
25122717 |
T |
 |
| Q |
231 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25122718 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25122793 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 23837244 - 23837561
Alignment:
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Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
23837244 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagtt-caacat |
23837342 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaa |
23837442 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat---tacaaaagtgattatga-tgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||| || ||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
23837443 |
ttttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatctatattaaaatgattatgattgaattctaac |
23837540 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttaccttaattatcacc |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23837541 |
ccccttaccttaattatcacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39446967 - 39446660
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| Q |
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39446967 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacat |
39446869 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttc-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| || |
|
|
| T |
39446868 |
ataac-acttcttcatactttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatga |
39446770 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
||| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
39446769 |
attctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac |
39446672 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
39446671 |
ccccttacctta |
39446660 |
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Target: chr8; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 20648030 - 20647882
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Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |
|
|
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20648030 |
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20647931 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20647930 |
taccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa |
20647882 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981622
Alignment:
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atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
131 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22981351 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
22981449 |
T |
 |
| Q |
132 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
22981450 |
tctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcat--catctgaacaattaatcaatt-ac |
22981546 |
T |
 |
| Q |
232 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22981547 |
ccaattaagcacttattcatacaa--aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22981622 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
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Target Start/End: Complemental strand, 7000624 - 7000524
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tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctta |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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tcatcacatatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctta |
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T |
 |
| Q |
302 |
c |
302 |
Q |
| |
|
| |
|
|
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7000524 |
c |
7000524 |
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ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
17285341 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattgg |
17285440 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatga-tg |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||| || |
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|
| T |
17285441 |
agcacgaattctaacaattatgaacaattattcaatt-attcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattg |
17285538 |
T |
 |
| Q |
286 |
aacactaacccccttaccttaattatcaccaa |
317 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17285539 |
aattctaacccccttaccttaattatcaccaa |
17285570 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 38533695 - 38533895
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38533695 |
acaacatcacctagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcata-tttcaacat |
38533793 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| ||||| |
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|
| T |
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T |
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200 |
tt |
201 |
Q |
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|| |
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| T |
38533894 |
tt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 26011558 - 26011848
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117 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
|
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| T |
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ttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
26011756 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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T |
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Target: chr8; HSP #20
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Target Start/End: Original strand, 5854678 - 5854971
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| || ||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
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| T |
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T |
 |
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ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
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||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
|
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| T |
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ttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
5854876 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
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|
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T |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24716793 - 24716719
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| Q |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
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|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
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24716793 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
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T |
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Target: chr8; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 15933362 - 15933655
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| || || ||||||| || |||||| || || ||| |||||| |
|
|
| T |
15933362 |
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T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || ||||| || |
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| T |
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ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaaca |
15933560 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatg-aacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15933561 |
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T |
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Target: chr8; HSP #24
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Target Start/End: Complemental strand, 20529839 - 20529748
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216 |
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306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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20529839 |
caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
20529748 |
T |
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349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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T |
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275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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641082 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
641008 |
T |
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Target: chr8; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 275 - 349
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349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
826814 |
T |
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| Q |
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89 |
Q |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
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274577 |
T |
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Target: chr8; HSP #29
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| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
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aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
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T |
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Target: chr8; HSP #30
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
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827078 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 16039072 - 16039002
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| Q |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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T |
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| || | || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | || ||||| || |
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|
| T |
29306580 |
ttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaacatctatgaaca |
29306679 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccc-cttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29306680 |
atcaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccctcttaccttaatta |
29306776 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
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39115599 |
tgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| | || ||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
33528489 |
aacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt-caacatatatcattttcatatact |
33528587 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||| || |||| | |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| || || || || |
|
|
| T |
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aagaagatacaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaaca |
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T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcac |
314 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
33528688 |
attaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcac |
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T |
 |
| Q |
315 |
caactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|| | |||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Q |
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Q |
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|
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Q |
| |
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 |
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ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
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Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| || ||||| || |
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|
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atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttcaacaactatgaaca |
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T |
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|
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| |
|
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| |
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| T |
22735922 |
tttgaacatgaagttttaccaacaacaactcaattatcaaccacttcatgcat-tcaacatattatcataattggagcacgaatt |
22735839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24385914 - 24385873
Alignment:
| Q |
48 |
acaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24385914 |
acaattcatcaacaacaatgcttaattcaccaattgagcata |
24385873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38635831 - 38635541
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||| || || ||||| || ||| |||| | |
|
|
| T |
38635831 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtataatt-cacaatatatcattttcgcatatt |
38635733 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||| || |
|
|
| T |
38635732 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaaca |
38635633 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
| | ||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38635632 |
aagattcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
38635541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22497399 - 22497329
Alignment:
| Q |
12 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
82 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
22497399 |
tatcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
22497329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23151918 - 23151810
Alignment:
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||| | || ||||||||| | || |||||| | |
|
|
| T |
23151918 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaac |
23151819 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatca |
225 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
23151818 |
aattaatca |
23151810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31194253 - 31194217
Alignment:
| Q |
270 |
aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31194253 |
aaaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta |
31194217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 32898836 - 32899142
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
32898836 |
acaacatgactaaacaacaacaacttcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
32898935 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32898936 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
32899035 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32899036 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
32899135 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
32899136 |
tacctta |
32899142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Original strand, 18570353 - 18570630
Alignment:
| Q |
29 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgta |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570353 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
18570452 |
T |
 |
| Q |
129 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaatt |
228 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18570453 |
atttaactaataacaattcaattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
18570552 |
T |
 |
| Q |
229 |
catccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570553 |
catccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18570630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16086063 - 16086369
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16086063 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacaca |
16086162 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16086163 |
tacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaat |
16086262 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16086263 |
ttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccct |
16086362 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
16086363 |
tacctta |
16086369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16106562 - 16106868
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16106562 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacaca |
16106661 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
16106662 |
tactcatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
16106761 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16106762 |
ttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
16106861 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
16106862 |
tacctta |
16106868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 22440980 - 22441285
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22440980 |
acaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactca |
22441079 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
22441080 |
tacccatttttcatacttttaacatgtaattcaccccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaat |
22441179 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22441180 |
ttcatcatatatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaaaagtgattatgatgaattctaaccccctt |
22441279 |
T |
 |
| Q |
301 |
acctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
22441280 |
acctta |
22441285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 31628314 - 31628552
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628314 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacata |
31628413 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
31628414 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaat |
31628513 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaa |
239 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31628514 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaa |
31628552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 18432689 - 18432994
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18432689 |
acaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacata |
18432788 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
18432789 |
cacccatttttcatacttttaacatgtaattcaatcaacaacaattcaagtattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaat |
18432888 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18432889 |
ttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaattaagctcttttcatac-aataattgaaaatttgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
18432987 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
18432988 |
tacctta |
18432994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13014890 - 13014603
Alignment:
| Q |
21 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
120 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
13014890 |
caacaacaattgatcttgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatacttc- |
13014792 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
13014791 |
aacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaatt |
13014692 |
T |
 |
| Q |
221 |
aatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa--ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13014691 |
aatcaattcacccaatttagcacttttcatacaaacataattgaaaattacaataagtgattatgataaattctaacccccttacctta |
13014603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 18777210 - 18777481
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
18777210 |
aacaacattcattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactt |
18777309 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18777310 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatga---- |
18777405 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777406 |
-------------acaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18777481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 18398984 - 18399290
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18398984 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacat |
18399082 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
18399083 |
atactattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaa |
18399182 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |
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|
| T |
18399183 |
ttctaacaattatgaacaattagtcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaatttacactaaaatgattatgaagaattctaaccc |
18399280 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18399281 |
ccttacctta |
18399290 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25367438 - 25367130
Alignment:
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1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25367438 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-tttcaacat |
25367340 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc-cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
25367339 |
aaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacga |
25367240 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
||| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25367239 |
attctaacaattatgaacaattaatcaattgct-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaac |
25367142 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
25367141 |
ccccttacctta |
25367130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22361948 - 22361649
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19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
22361948 |
aacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacttatgtcactttctcatact |
22361850 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || |
|
|
| T |
22361849 |
ttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaaca |
22361750 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcac |
314 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22361749 |
attaatcatttgct-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaattactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcac |
22361652 |
T |
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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Original strand, 21623215 - 21623563
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| Q |
2 |
caacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
21623215 |
caacatcacttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacata |
21623313 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
21623314 |
tatcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaat |
21623413 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga-aaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacc |
295 |
Q |
| |
|
| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
21623414 |
tctaacatttatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacc |
21623511 |
T |
 |
| Q |
296 |
cccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21623512 |
cccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
21623563 |
T |
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Target: chr6; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18381884 - 18381684
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99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||||||| |
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|
| T |
18381884 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcata-attcaacat |
18381786 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | |||||||| || ||| || ||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
18381785 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaa |
18381686 |
T |
 |
| Q |
200 |
tt |
201 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
18381685 |
tt |
18381684 |
T |
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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21411228 - 21410944
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| Q |
23 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaa |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || | || ||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21411228 |
acatcaattgcacatgaatctcagcataatccaacatcaacatagcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaa |
21411130 |
T |
 |
| Q |
123 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaa |
222 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||| |||| | | ||||| |||||| |
|
|
| T |
21411129 |
catgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattag |
21411030 |
T |
 |
| Q |
223 |
tcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21411029 |
tcaattcct-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21410944 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28195295 - 28195108
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1 |
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98 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
28195295 |
acaacatcacttagcaacaaccacaacaattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacattt-catca |
28195197 |
T |
 |
| Q |
99 |
tataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
187 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28195196 |
tataccattttctcatactatgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataa |
28195108 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
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Target Start/End: Original strand, 18583375 - 18583451
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583375 |
atcaacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
18583451 |
T |
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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 18583641 - 18583715
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| Q |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583641 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg |
18583715 |
T |
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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19983223 - 19983149
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19983223 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
19983149 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 26089799 - 26089869
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26089799 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
26089869 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35015088 - 35015014
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015088 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
35015014 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17083386 - 17083093
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13 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
111 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
17083386 |
atcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcaca-attcaacatatatcattttca |
17083288 |
T |
 |
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | | || || |
|
|
| T |
17083287 |
catactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattat-caccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaacta |
17083189 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17083188 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattaaaatgaattctaacccccttacctta |
17083093 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18629791 - 18629502
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||| || || |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
18629791 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacattcagagcataatt-cacaatataccactttcacatact |
18629693 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
18629692 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
18629593 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18629592 |
attaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
18629502 |
T |
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Target: chr6; HSP #24
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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15742411 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23994987 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
23995057 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
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ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
17557127 |
ttcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattag |
17557029 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaaaag-tgattatga-tgaac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
17557028 |
agcacgaattt-aacaactatgaacaaataatcaatt-attcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattacactagatgattatgattgaat |
17556931 |
T |
 |
| Q |
289 |
actaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
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tctaacccccttaccttaatta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18002687 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcata |
18002617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 35015348 - 35015278
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015348 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
35015278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 25651301 - 25651436
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
25651301 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
25651399 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25651400 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
25651436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 306
Target Start/End: Original strand, 33324874 - 33325046
Alignment:
| Q |
137 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33324874 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaat |
33324972 |
T |
 |
| Q |
237 |
taagcactta-tcatacaaataattgaa--aattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33324973 |
taatcacttattcatac-attaattgaaataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33325046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25744414 - 25744331
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga |
84 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25744414 |
acaacatgactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga |
25744331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35136078 - 35135906
Alignment:
| Q |
137 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
35136078 |
aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaat |
35135980 |
T |
 |
| Q |
237 |
taagcactta-tcatacaaataattg--aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35135979 |
taatcacttattcatac-aataattgaaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
35135906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 29605607 - 29605739
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
29605607 |
catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaacta |
29605705 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
246 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
29605706 |
tgaacaaataatcactt-attcaattaagcactta |
29605739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16887879 - 16887685
Alignment:
| Q |
115 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
16887879 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatga |
16887780 |
T |
 |
| Q |
215 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16887779 |
acaattaatcattt-attcaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16887685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19983466 - 19983412
Alignment:
| Q |
35 |
catgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19983466 |
catgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcactaattgagcata |
19983412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15079795 - 15079606
Alignment:
| Q |
115 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
15079795 |
actttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcat-acaacatatcatcctagttagagcacgaattt-aacatctatga |
15079699 |
T |
 |
| Q |
215 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15079698 |
ataattaatcaatt-atccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
15079606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 35009637 - 35009569
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009637 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagca |
35009569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 22848172 - 22848304
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| || || |
|
|
| T |
22848172 |
catactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaacta |
22848271 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
246 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
22848272 |
tgaacaa-taatcaatt-attcaactaagcactta |
22848304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 29665938 - 29666004
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
85 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | |||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29665938 |
aacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag |
29666004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 18823597 - 18823565
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
33 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18823597 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18823565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 18839452 - 18839420
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
33 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18839452 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18839420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 27740907 - 27740971
Alignment:
| Q |
23 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27740907 |
acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagca |
27740971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 9983 - 10289
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9983 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
10082 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatact--ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10083 |
tacc--cttttcatactctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacga |
10180 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
10181 |
attttatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaagaattgaaaatttgcaataatgattattatgaattctaacccc |
10280 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
10281 |
cttacctta |
10289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 118164 - 117857
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
118164 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacata |
118065 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
118064 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
117965 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
117964 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccc |
117866 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
117865 |
cttacctta |
117857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 109663 - 109356
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
109663 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatttatcatattttcaatata |
109564 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
109563 |
taccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
109464 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
109463 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccc |
109365 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
109364 |
cttacctta |
109356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 60852 - 61159
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| | |
|
|
| T |
60852 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagtatatttttaacaca |
60951 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
60952 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaat |
61051 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
61052 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccc |
61151 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
61152 |
ttacctta |
61159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 70823 - 70552
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
70823 |
acaacatgactaaacaacaacaacatccaatgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
70724 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcca-taacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
70723 |
tacctacttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaataaatcaattattcattaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaa |
70624 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa |
271 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70623 |
tttcatcatttatgaacaattaatcaactcatccaaataagcacttttcttacaaataattgaaaattacaa |
70552 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79785
Alignment:
| Q |
167 |
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266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79925 |
catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat |
79826 |
T |
 |
| Q |
267 |
tacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
79825 |
tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagctta |
79785 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9784249 - 9783959
Alignment:
| Q |
14 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
113 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784249 |
tcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaa---gcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctca |
9784153 |
T |
 |
| Q |
114 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9784152 |
tactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatg |
9784053 |
T |
 |
| Q |
214 |
accaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784052 |
aacaatttatcaattcacccaattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9783959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 49967696 - 49968002
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
49967696 |
acaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
49967795 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49967796 |
tacccattttttataatttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaat |
49967895 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49967896 |
ttcatgatttttgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatgcaaataattgaaaattacaataagtgattacgatgaattctaaccccct |
49967995 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
49967996 |
tacctta |
49968002 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 21718274 - 21718537
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
21718274 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttgaacaca |
21718373 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21718374 |
taccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
21718473 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21718474 |
ttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
21718537 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22403311 - 22403005
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22403311 |
acaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
22403212 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22403211 |
tacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacga |
22403114 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22403113 |
atttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccc |
22403014 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
22403013 |
cttacctta |
22403005 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 299
Target Start/End: Original strand, 41212136 - 41212415
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| Q |
19 |
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118 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
41212136 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcatattttta-cacatacccatttttcatactt |
41212234 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
41212235 |
tgaacatacagttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
41212334 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41212335 |
ttaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccct |
41212415 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 35054820 - 35055108
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| Q |
19 |
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118 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
35054820 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
35054919 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |
|
|
| T |
35054920 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaa |
35055019 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat-tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35055020 |
ttaaccaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
35055108 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 122 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522247
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221 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
35522432 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta |
35522333 |
T |
 |
| Q |
222 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35522332 |
atcaattcacccaattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
35522247 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 20177221 - 20177570
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
20177221 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacat |
20177319 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
20177320 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaa |
20177419 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
|| | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
20177420 |
ttctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttaaacatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaac |
20177517 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20177518 |
cccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
20177570 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27329938 - 27329757
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116 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
27329938 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatac |
27329841 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
201 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
27329840 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
27329757 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 16645976 - 16646266
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
16645976 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaata-attcaacatatatcactttctcatact |
16646074 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
16646075 |
ttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16646174 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16646175 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16646266 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 51627847 - 51627558
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51627847 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacatattt-caacatataccattttctcatact |
51627749 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||| || ||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||||| || |
|
|
| T |
51627748 |
ttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaaca |
51627649 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51627648 |
aataatcaatt-actcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
51627558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 16656702 - 16656992
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
16656702 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
16656800 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||| | | || || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
16656801 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16656900 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16656901 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16656992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 35522520 - 35522432
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522520 |
acaacatgacgtatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
35522432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13376969 - 13376711
Alignment:
| Q |
92 |
ttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaat |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
13376969 |
ttcaacatatacca-cttcttcatactttgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataatt |
13376872 |
T |
 |
| Q |
190 |
agagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-t |
284 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
13376871 |
agagcacgattctcatcatctatgaacaattaatcaatt-actaaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatt |
13376774 |
T |
 |
| Q |
285 |
gaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13376773 |
gaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta |
13376711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 21860335 - 21860409
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21860335 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
21860409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 41218729 - 41218803
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41218729 |
tgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg |
41218803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44034902 - 44034829
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctat |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44034902 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
44034829 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37234043 - 37233750
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
37234043 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatatatcactttcatatact |
37233945 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||| | || |
|
|
| T |
37233944 |
ttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaactattaaca |
37233845 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||| ||| || | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37233844 |
attactcactt-actcaattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
37233750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9784301 - 9784238
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
64 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784301 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
9784238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 41394528 - 41394602
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41394528 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatg |
41394602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15861618 - 15861547
Alignment:
| Q |
18 |
aaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15861618 |
aaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15861547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 17608992 - 17609281
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
17608992 |
aacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatatact |
17609090 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
17609091 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgatca |
17609190 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
| |||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17609191 |
actaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
17609281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22143451 - 22143256
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
22143451 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
22143352 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22143351 |
tgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
22143256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 21860075 - 21860145
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21860075 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21860145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44035162 - 44035092
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44035162 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcata |
44035092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 22367083 - 22367152
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22367083 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcata |
22367152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 21195078 - 21195368
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
21195078 |
aacaacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatact |
21195176 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
21195177 |
atgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
21195276 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21195277 |
attaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaaccccttacctta |
21195368 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 306
Target Start/End: Original strand, 19603279 - 19603449
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| Q |
137 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
236 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
19603279 |
aacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
19603377 |
T |
 |
| Q |
237 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19603378 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttgcactaaa-tgattatgatgaattctagcccccttacctta |
19603449 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8538000 - 8537803
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
8538000 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8537901 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| | | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8537900 |
tgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
8537803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8603239 - 8603042
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
8603239 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8603140 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| | | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8603139 |
tgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
8603042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 20445747 - 20445812
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22 |
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87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445747 |
aacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
20445812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 20531512 - 20531577
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22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20531512 |
aacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
20531577 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #33
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||||| || |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||| || | |
|
|
| T |
49997371 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatca |
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T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatg-atgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49997271 |
tgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgtttgaattctaacccccttacctta |
49997174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 255015 - 254710
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
255015 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
254916 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
254915 |
tacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaacta-caacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacga |
254818 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
254817 |
atttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccc |
254719 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
254718 |
cttacctta |
254710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 261621 - 261316
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
261621 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
261522 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
261521 |
tacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaacta-ctacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacga |
261424 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
261423 |
atttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccc |
261325 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
261324 |
cttacctta |
261316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 67 - 370
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67 |
acaagatgacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacata |
166 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
167 |
taccaatttctcatactttgaacatgcaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcat---tagagcacgaat |
263 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
264 |
ttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaaccccct |
363 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
364 |
tacctta |
370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 132451 - 132144
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
132451 |
acaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
132352 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
132351 |
tacccatttttcatactttgaacatataattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
132252 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
132251 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaaccccc |
132152 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
132151 |
ttacctta |
132144 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 88341 - 88631
Alignment:
| Q |
21 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
120 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
88341 |
caacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgatcatattttcaacacatacccatttttcatactttg |
88440 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
88441 |
aacatgtaattcaactaacaacattttaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatggacaatt |
88540 |
T |
 |
| Q |
221 |
aatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
88541 |
aatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttatta |
88631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 11751 - 12041
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
11751 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatact |
11850 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |
|
|
| T |
11851 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaaca |
11950 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11951 |
attaatcaattgacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttacctta |
12041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Original strand, 16022 - 16253
Alignment:
| Q |
78 |
caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
177 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16022 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat |
16121 |
T |
 |
| Q |
178 |
gtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg-accaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaa |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
16122 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaa |
16220 |
T |
 |
| Q |
274 |
gtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16221 |
atgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25784
Alignment:
| Q |
78 |
caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
177 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25553 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat |
25652 |
T |
 |
| Q |
178 |
gtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg-accaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaa |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
25653 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaa |
25751 |
T |
 |
| Q |
274 |
gtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25752 |
atgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 253190 - 252903
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
253190 |
acaacatgacttaacaaaaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcatattttcaacata |
253091 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
253090 |
taccaatttctcatactttgaaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaat |
252991 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa |
287 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
252990 |
tttatcatttatgcacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaa |
252903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 190 - 496
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
190 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
289 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| | |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
290 |
tacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
389 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
390 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgattaattctaaccccct |
489 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
490 |
tacctta |
496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 25257 - 25563
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25257 |
acaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacata |
25356 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| | |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25357 |
tacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaat |
25456 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25457 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaaccccct |
25556 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25557 |
tacctta |
25563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 25004 - 25210
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25004 |
acaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacata |
25103 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| | |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25104 |
tacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaat |
25203 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatca |
207 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25204 |
ttcatca |
25210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 115 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19807
Alignment:
| Q |
115 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
| Q |
215 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19941 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac |
19842 |
T |
 |
| Q |
315 |
caactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19841 |
caactattaactcaagcttcacttttgctcctatg |
19807 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 115 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24111
Alignment:
| Q |
115 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24345 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
24246 |
T |
 |
| Q |
215 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24245 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac |
24146 |
T |
 |
| Q |
315 |
caactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24145 |
caactattaactcaagcttcatttttgctcctatg |
24111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11769 - 11464
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
11769 |
acaacatgacatatcaacaacaacataaattgatcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacaca |
11670 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11669 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
11570 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11569 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattca-acaattaaacacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccca |
11471 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
11470 |
tacctta |
11464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 271216 - 271521
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
271216 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacaca |
271315 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
271316 |
tacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
271415 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
271416 |
ttcttcatttatgaataattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
271514 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
271515 |
tacctta |
271521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4448334 - 4448028
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
4448334 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaattgaacatattttcaacaca |
4448235 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4448234 |
aacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
4448135 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4448134 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatataaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
4448035 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
4448034 |
tacctta |
4448028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25876120 - 25875816
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
25876120 |
acaacatgactaaacaataacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-caca |
25876022 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25876021 |
tacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacga |
25875924 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25875923 |
atttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccc |
25875824 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25875823 |
ttacctta |
25875816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23836888 - 23836601
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--ac |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| || |
|
|
| T |
23836888 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacataccca-ttttcatacac |
23836790 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
23836789 |
tttgaacatgtaattccactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
23836691 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23836690 |
aattaatcaattcatctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23836601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 32465904 - 32466207
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
32465904 |
acaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-caca |
32466002 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
32466003 |
tatccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
32466102 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
32466103 |
ttcatcacatatgaacaattaatcaattcattcaaataagcacttatcgtacaaataattaaaattttcaaaagtgattatgatgaagactaa-cccctt |
32466201 |
T |
 |
| Q |
301 |
acctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
32466202 |
acctta |
32466207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 25602070 - 25602377
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25602070 |
acaacatgacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcatattttcaacata |
25602169 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
25602170 |
tatcaatttctcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaat |
25602269 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25602270 |
ttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccc |
25602368 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
25602369 |
cttacctta |
25602377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36890886 - 36890581
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36890886 |
acaacatcacttagcaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaattaagcatattttcaacata |
36890787 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
36890786 |
ttccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaat |
36890687 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36890686 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagcacttttcatac-cataattgaaaataacaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
36890588 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
36890587 |
tacctta |
36890581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 28974095 - 28974400
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28974095 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgagcatattttcaacata |
28974194 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28974195 |
taccattttctcatactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
28974294 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28974295 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgaaataatgattatgatgaattctaaccccct |
28974393 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
28974394 |
tacctta |
28974400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 306
Target Start/End: Original strand, 27261916 - 27262156
Alignment:
| Q |
67 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27261916 |
gcataattcaccaat-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattgaactaacaacaattcaattatccataactttata |
27262014 |
T |
 |
| Q |
167 |
catctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaa |
264 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
27262015 |
catccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaa |
27262113 |
T |
 |
| Q |
265 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27262114 |
attgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
27262156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24571493 - 24571188
Alignment:
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1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24571493 |
acaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatattt-caacat |
24571395 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
24571394 |
atatcattttctcataccttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaa |
24571295 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaa-attacaaaagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24571294 |
tttcatcatctatgaacaattaatcaatt-acccaattaagcatttattcatac-aataattgaaacattgcaataatgattatgatgaattctaacccc |
24571197 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
24571196 |
ctaacctta |
24571188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22580060 - 22579758
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22580060 |
acaacatcacatatcagcagcaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaa---gcataattcaaccaattgagcatattt-caacat |
22579965 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaactt-ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
||| || || ||||||| |||| ||| | || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
22579964 |
ataacatttttctcataccttgatcataaagtttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacga |
22579866 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
||| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22579865 |
attctaacaattatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaatagtgattatgatgaattctaaccc |
22579768 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22579767 |
ccttacctta |
22579758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 68056 - 68351
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
68056 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatact |
68154 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
68155 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
68254 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
311 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
68255 |
attaatctattactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
68351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 43645939 - 43646289
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
43645939 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacat |
43646037 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43646038 |
atatcactttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaa |
43646137 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
|| | || | ||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||| | | |||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
43646138 |
ttataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaaacacttattcatacaacaattggaaatttacactaaaaatgattatgactgaattctaac |
43646236 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43646237 |
ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
43646289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31146360 - 31146073
Alignment:
| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
31146360 |
aacatcaattgaacaggaatcttattacaattcaacaaca-catagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttg |
31146263 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt |
220 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | || |||||||| | || |||| ||||| |
|
|
| T |
31146262 |
aacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaatt |
31146163 |
T |
 |
| Q |
221 |
aatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31146162 |
aatcaatt-actcagttaagcacttattcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
31146073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 22284279 - 22284353
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284279 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
22284353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19794660 - 19794586
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19794660 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatg |
19794586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20627269 - 20627195
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20627269 |
tgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
20627195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 22275046 - 22275120
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22275046 |
tgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
22275120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 349
Target Start/End: Original strand, 15633535 - 15633612
Alignment:
| Q |
272 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15633535 |
aagtgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatg |
15633612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 6879501 - 6879577
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca |
95 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6879501 |
aacaacaacaattgatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagtatattttca |
6879577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43642912 - 43642838
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43642912 |
tgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
43642838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22775393 - 22775206
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| Q |
14 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
112 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22775393 |
tcaacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctc |
22775295 |
T |
 |
| Q |
113 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22775294 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22780771 - 22780584
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| Q |
14 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
112 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22780771 |
tcaacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctc |
22780673 |
T |
 |
| Q |
113 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22780672 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 347
Target Start/End: Original strand, 19666685 - 19666921
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | || || ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| | || || |
|
|
| T |
19666685 |
catactttgaacatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaacta |
19666784 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat |
308 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19666785 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaat |
19666882 |
T |
 |
| Q |
309 |
tatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|| ||| || | |||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19666883 |
tagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta |
19666921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21274240 - 21274174
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
85 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21274240 |
aacaacatctattgatcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
21274174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 22274786 - 22274856
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22274786 |
aacaacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22274856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Original strand, 22284029 - 22284089
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| Q |
29 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284029 |
attgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22284089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
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| Q |
21 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
85 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9653085 |
caacatctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 347
Target Start/End: Original strand, 19660037 - 19660273
Alignment:
| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
19660037 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaacatcta |
19660136 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat |
308 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| || |||| |||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19660137 |
agaacaaataatcacttattcca-ttaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaagtgattatgatgaattctaacccc-ttaccttaat |
19660234 |
T |
 |
| Q |
309 |
tatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19660235 |
tatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
19660273 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #30
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Target Start/End: Complemental strand, 23821714 - 23821534
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| Q |
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taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23821714 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23821615 |
T |
 |
| Q |
227 |
ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23821614 |
tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23821534 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 127 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23830793 - 23830613
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| Q |
127 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23830793 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23830694 |
T |
 |
| Q |
227 |
ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23830693 |
tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23830613 |
T |
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Target: chr2; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 25305509 - 25305622
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19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaa-caacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
25305509 |
aacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacacatatcactttctcatac |
25305607 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaatt |
131 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
25305608 |
tttgaacatgaaatt |
25305622 |
T |
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Target: chr2; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 9636809 - 9636944
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
9636809 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcata-attcacaatatatcattttcacatact |
9636907 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9636908 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
9636944 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19669199 - 19669003
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||| | |||| | || || |
|
|
| T |
19669199 |
catacttagaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatcta |
19669100 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19669099 |
tgaacaattaatcattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccgttacctta |
19669003 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24341584 - 24341519
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| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341584 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
24341519 |
T |
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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25265588 - 25265520
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265588 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagca |
25265520 |
T |
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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 27261852 - 27261899
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatca |
48 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27261852 |
acaacatgacttagcaacaacaatatcaattgatcatgaaacttatca |
27261899 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 4627 - 4913
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| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
4627 |
aacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatact |
4726 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
4727 |
ttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaaca |
4826 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4827 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9527
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
9241 |
aacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatact |
9340 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
9341 |
ttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaaca |
9440 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9441 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5447 - 5143
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
5447 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcatattttcg-caca |
5349 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5348 |
tacctattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacga |
5251 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5250 |
atttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaaaagtgattatgatgaattctaaccccc |
5151 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
5150 |
ttacctta |
5143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9083 - 8776
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9083 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatat-caacat |
8985 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8984 |
atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaa |
8885 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaaccc |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8884 |
tttcatcatttatgaacaattaatcaattttcccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaaccc |
8786 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
8785 |
ccttacctta |
8776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 9033 - 9339
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9033 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
9132 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9133 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
9232 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg--aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
9233 |
ttcatcatttatgaaaaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaattgcaataatgattatgataaattctaaccccc |
9331 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
9332 |
ttacctta |
9339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 7615 - 7922
Alignment:
| Q |
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7615 |
acaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcatcata |
7714 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat-gtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
7715 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcatacatctaaacataggcatcataattagatcatgaa |
7814 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7815 |
tttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtaattatgatgaattctaaccccc |
7914 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
7915 |
ttacctta |
7922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 14938 - 15224
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
14938 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
15035 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
15036 |
tttgaacatgtaatctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
15134 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15135 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacatataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 85378 - 85683
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
85378 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattaagcatattttcaatata |
85477 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
85478 |
taccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
85577 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
85578 |
ttcatcatttataaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
85676 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
85677 |
tacctta |
85683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 306
Target Start/End: Original strand, 159346 - 159651
Alignment:
| Q |
2 |
caacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
159346 |
caacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactca |
159445 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
159446 |
tatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
159545 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
159546 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcgtac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
159644 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
159645 |
tacctta |
159651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1667
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |
|
|
| T |
1363 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcatcaca |
1462 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
1463 |
tacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaccaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaat |
1562 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1563 |
ttcatcatttatacacaattaatcaattcattcaattaaccacttttcatacaaataattg--aattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
1660 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
| ||||| |
|
|
| T |
1661 |
tgcctta |
1667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11548
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
11837 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcactaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
11739 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
11738 |
tttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
11639 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11638 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 7235 - 7522
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatc-aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
7235 |
aacaacatccaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac |
7334 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
7335 |
tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaac |
7434 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7435 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
7522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 112746 - 112441
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
112746 |
acaacatgacttaacaacaacaacataaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgagcatattttcaacata |
112647 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
112646 |
taccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
112547 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
112546 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagtacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
112448 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
112447 |
tacctta |
112441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 103102 - 102815
Alignment:
| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
103102 |
aacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattc-caccatataccactttctcatactttg |
103004 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||| |
|
|
| T |
103003 |
aacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatt |
102904 |
T |
 |
| Q |
221 |
aatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
102903 |
aatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttacctta |
102815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 109636 - 109821
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
109636 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcata-tttcaacat |
109734 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcata |
186 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
109735 |
ataccactttctcatactttaaacatgaaatttcattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcata |
109821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4987 - 5231
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4987 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttcaacata |
5086 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
5087 |
taccaacttctcatactgtgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
5186 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5187 |
ttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcactt |
5231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24911 - 24623
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
24911 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactt |
24812 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
24811 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaa |
24712 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24711 |
ttaatcaattcacctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
24623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Original strand, 95023 - 95109
Alignment:
| Q |
3 |
aacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
95023 |
aacatcacttatcaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
95109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 306
Target Start/End: Original strand, 48219 - 48496
Alignment:
| Q |
27 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
48219 |
caattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacata |
48317 |
T |
 |
| Q |
127 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48318 |
aaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa |
48417 |
T |
 |
| Q |
227 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48418 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
48496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 306
Target Start/End: Original strand, 61667 - 61944
Alignment:
| Q |
27 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
61667 |
caattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacata |
61765 |
T |
 |
| Q |
127 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
61766 |
aaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa |
61865 |
T |
 |
| Q |
227 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
61866 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
61944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 38344 - 38650
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1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
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Q |
| |
|
|||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38344 |
acaacatgactaaacaacaacaacgtcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcatattttcaacata |
38443 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
38444 |
tacccatttctcttcctttgaacatgtaattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtat |
38543 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38544 |
ttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
38643 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
38644 |
tacctta |
38650 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0740 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:
Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 4351 - 4635
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| Q |
21 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tt |
118 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | || |||||| || |
|
|
| T |
4351 |
caacaacaattgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccattt-tcatacactt |
4448 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
4449 |
tgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaa |
4547 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4548 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaacgtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4635 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 164261 - 164565
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
164261 |
acaacatgactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatcttca-caca |
164359 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
164360 |
tacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatga |
164457 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
164458 |
atttcatcacttatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttaccatacaattaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccc |
164557 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
164558 |
ttacctta |
164565 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 166195 - 166121
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
166195 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
166121 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 162109 - 162036
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctat |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162109 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
162036 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 162369 - 162299
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162369 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
162299 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 166455 - 166385
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
166455 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
166385 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 116664 - 116410
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| Q |
91 |
tttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaata |
190 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| | || ||||| | | |||||| |||||||| | |
|
|
| T |
116664 |
tttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaaacccac-----acaattcaattatcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattg |
116570 |
T |
 |
| Q |
191 |
gagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca---aaagtgattatgatga |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
116569 |
gagcacgaattctaacaattatgagcaattaat-aatttactcaattaagcacttattcatacaaccattcaaaatttacactaaaaatgattatgatga |
116471 |
T |
 |
| Q |
287 |
acactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
116470 |
aatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
116410 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 70659 - 70964
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
70659 |
acaacatcatatatcagcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaacat |
70758 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
70759 |
attccattttctcatactttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaa |
70857 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | | |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
70858 |
tttcatcatttataaactattaattaattcacccaattaagcacttttcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaaccccc |
70956 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
70957 |
ttacctta |
70964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 31098 - 31352
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| Q |
9 |
acatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31098 |
acatatcagcaacaacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactacaaa-cataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccatt |
31196 |
T |
 |
| Q |
108 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca |
207 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31197 |
ttcttatactttgaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatca |
31295 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31296 |
tttatgaacaaataatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
31352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 97381 - 97088
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
97381 |
aacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
97283 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || || || ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | | || ||||| || |
|
|
| T |
97282 |
ttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaaca |
97183 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
97182 |
attaatcact-cactcaattaaacactaaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttcatta |
97088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 33726 - 34014
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33726 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactt |
33825 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
33826 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaa |
33925 |
T |
 |
| Q |
219 |
ttaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33926 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttaatcatac-agtaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
34014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 777 - 471
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| Q |
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acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
777 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacata |
678 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
677 |
taccattttctcatactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
578 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
297 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| || ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
577 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccc |
480 |
T |
 |
| Q |
298 |
cttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
479 |
cttacctta |
471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
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Target Start/End: Original strand, 21558 - 21862
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1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21558 |
acaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
21657 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21658 |
taccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaat |
21756 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21757 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcctttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattataaccccct |
21855 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
21856 |
tacctta |
21862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 31257 - 31561
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31257 |
acaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattgagcatattttcaacata |
31356 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
| T |
31357 |
taccattttctcatactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaat |
31455 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31456 |
ttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
31554 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
31555 |
tacctta |
31561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47445
Alignment:
| Q |
197 |
gaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacc |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47554 |
gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacc |
47456 |
T |
 |
| Q |
296 |
cccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
47455 |
cccttacctta |
47445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:
Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 302
Target Start/End: Original strand, 1963 - 2263
Alignment:
| Q |
2 |
caacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1963 |
caacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcata |
2061 |
T |
 |
| Q |
101 |
taccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
2062 |
taccattttcgcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaat |
2161 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2162 |
ttcatcatttatgagcaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaaccccct |
2260 |
T |
 |
| Q |
300 |
tac |
302 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
2261 |
tac |
2263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 46229 - 46521
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
46229 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatac |
46326 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgac |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
46327 |
tttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaa |
46426 |
T |
 |
| Q |
216 |
caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46427 |
caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaatta |
46521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 40722 - 41010
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
40722 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaacaatatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatac |
40819 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgac |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40820 |
tttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaa |
40919 |
T |
 |
| Q |
216 |
caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40920 |
caattaatcaattcacccaattaagcactattcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
41010 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 80188 - 80262
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80188 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg |
80262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 79928 - 79998
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79928 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
79998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0876 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:
Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 345
Target Start/End: Original strand, 1 - 164
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| Q |
182 |
tcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattat |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1 |
tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattat |
100 |
T |
 |
| Q |
282 |
gatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcc |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
101 |
gatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc |
164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6251
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
6004 |
aacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttctcatac |
6103 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
6104 |
tttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
6203 |
T |
 |
| Q |
217 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6204 |
aattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
6251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 309
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
383 |
tgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg |
309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 642 - 572
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
642 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Original strand, 146665 - 146848
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
146665 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
146764 |
T |
 |
| Q |
119 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
146765 |
tgaacatgtaattcaactaacaacagttcaattatacataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcatgaattt |
146848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 53410 - 53703
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||| | || || ||||||| || ||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
53410 |
aacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataatt-caacatataacaccttcacatact |
53508 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
53509 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactatgaaca |
53608 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53609 |
attaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
53703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 242
Target Start/End: Original strand, 85690 - 85818
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
85690 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaacta |
85788 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagca |
242 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
85789 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagca |
85818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 8917 - 8982
Alignment:
| Q |
22 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| || | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8917 |
aacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
8982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0816 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:
Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
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cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3112 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcatacaa |
3013 |
T |
 |
| Q |
255 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3012 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33929 - 33622
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33929 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacat |
33831 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttc-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| || |
|
|
| T |
33830 |
ataac-acttcttcatactttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatga |
33732 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
||| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33731 |
attctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac |
33634 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
33633 |
ccccttacctta |
33622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 3385 - 3671
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21 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3385 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttca-catataccactttctcatacttt |
3483 |
T |
 |
| Q |
120 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
219 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| |||| |
|
|
| T |
3484 |
gaacattaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
3583 |
T |
 |
| Q |
220 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3584 |
taatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 77030 - 76699
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
77030 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataatt-caacatatatcactttctcatact |
76932 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
76931 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaaca |
76832 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
312 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76831 |
attactcaatt-actcaattaagtacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
76734 |
T |
 |
| Q |
313 |
accaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
| ||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
76733 |
agcaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
76699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 306
Target Start/End: Original strand, 7927 - 8157
Alignment:
| Q |
76 |
accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
7927 |
accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac |
8025 |
T |
 |
| Q |
176 |
atgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-a |
272 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
8026 |
ataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaata |
8123 |
T |
 |
| Q |
273 |
agtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8124 |
aatgattacgatgaattctaacccccttacctta |
8157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2499 - 2211
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
2499 |
aacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatgtcactttctcatact |
2401 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | | ||||| | |
|
|
| T |
2400 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatgatta |
2301 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2300 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 197436 - 197143
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | | |||||| || || ||||||| || |||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
197436 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataatt-caacttataacactttcacatact |
197338 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| |||| || || || || |
|
|
| T |
197337 |
ttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaagaaca |
197238 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197237 |
attaatcactt-atccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
197143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7208 - 6907
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
7208 |
aacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
7110 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |
|
|
| T |
7109 |
ttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaaca |
7010 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatca |
313 |
Q |
| |
|
| |||| ||| | |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7009 |
acaaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttaccttaattatca |
6911 |
T |
 |
| Q |
314 |
ccaa |
317 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
6910 |
ccaa |
6907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 719 - 618
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacata |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
719 |
acaacatgacttagtaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacata |
620 |
T |
 |
| Q |
101 |
ta |
102 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
619 |
ta |
618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 35524 - 35873
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| || |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
35524 |
acaacatcacttagcaacaaaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataatt-caacat |
35622 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
35623 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaa |
35722 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
|| | | | ||| ||||||||| || | ||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
35723 |
ttataagaactttgaacaattaatc-ttttactcaattaagcacctattcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaac |
35820 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35821 |
ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
35873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 69521 - 69814
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
69521 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcacatact |
69619 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
69620 |
ttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
69719 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
69720 |
attaatcactttct-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaatta |
69814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 2589 - 2795
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
2589 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatact |
2687 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
2688 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
2787 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
2788 |
attaatca |
2795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6907
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6725 |
aacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaatt-caacatatatcactttctcatact |
6823 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6824 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:
Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 32249 - 32344
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaa |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32249 |
acaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
32344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 42054 - 41959
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaa |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42054 |
acaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
41959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:
Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5808 - 5735
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctat |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5808 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
5735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6014 - 5941
Alignment:
| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctat |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6014 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
5941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 6274 - 6204
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6274 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 28582 - 28781
Alignment:
| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
28582 |
acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcataatt-caacat |
28680 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28681 |
atatcactttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaa |
28780 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
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Target Start/End: Complemental strand, 93973 - 93728
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1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
93973 |
acaacatcacttattaataacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaatttaacaaca-catagcatacttcaataatttgagcatattt-caacaa |
93876 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
93875 |
ataccattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaa |
93776 |
T |
 |
| Q |
200 |
tttc-atcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat |
247 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
93775 |
tttctaacagttatgaacaattaat-aatttacccaattaagcacttat |
93728 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
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Target Start/End: Original strand, 55645 - 55715
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55645 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
55715 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 104713 - 104477
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| Q |
112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || | || |||||||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| | || || |
|
|
| T |
104713 |
catactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatcta |
104614 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat |
308 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
104613 |
tgaacaattaatcacttactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccacttaccttaat |
104516 |
T |
 |
| Q |
309 |
tatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
|| ||| || | ||||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
104515 |
tagcacaaattcttagcccaagcttcactttagctccta |
104477 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
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Target Start/End: Complemental strand, 17595 - 17525
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17595 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
17525 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
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Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||| || || |||||| ||||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
31084 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcata-attcaacatataacactttcacatact |
31182 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
31183 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaaca |
31282 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatca |
313 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
31283 |
attaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagca |
31380 |
T |
 |
| Q |
314 |
ccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
| || | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31381 |
caaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
31414 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 8056 - 8363
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcacc-aattgagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || | |
|
|
| T |
8056 |
acaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcataaat-cataag |
8154 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttct-catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacga |
198 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8155 |
ttagca-cttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacga |
8253 |
T |
 |
| Q |
199 |
atttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaac |
294 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8254 |
attttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacattaaaatgattatgatgaattctaac |
8351 |
T |
 |
| Q |
295 |
ccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
8352 |
ccccttacctta |
8363 |
T |
 |
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Target: scaffold0028 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
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Target Start/End: Complemental strand, 89652 - 89584
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89652 |
aacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagca |
89584 |
T |
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Target: scaffold0833 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
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Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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| Q |
1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaac |
63 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3345 |
acaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
3407 |
T |
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Target: scaffold0597 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
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Target: scaffold0597; HSP #1
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1169 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
1099 |
T |
 |
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Target: scaffold0251 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 13577 - 13507
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13577 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
13507 |
T |
 |
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Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 21551 - 21481
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21551 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21481 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
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Target: scaffold0184; HSP #1
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31211 |
tgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
31137 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 31471 - 31401
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31471 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
31401 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
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Target: scaffold0175; HSP #1
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15013 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
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Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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| Q |
275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41633 |
tgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
41707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41373 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
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137 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1611 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
1513 |
T |
 |
| Q |
237 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1512 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
1440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 137 - 306
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137 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
8756 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
8658 |
T |
 |
| Q |
237 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8657 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
8585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0706 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
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Target: scaffold0706; HSP #1
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19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6734 |
aacaagatctattgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0574 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
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Target: scaffold0574; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9698 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcata |
9628 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| || || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
1438 |
catactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
1339 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1338 |
tgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
1242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
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211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| || || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
9693 |
catactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
9594 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9593 |
tgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9497 |
T |
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Target: scaffold0116; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 30418 - 30492
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275 |
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349 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30418 |
tgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatg |
30492 |
T |
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Target: scaffold0116; HSP #2
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19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaac |
63 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30155 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac |
30199 |
T |
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Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
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Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
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137 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
236 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
89929 |
aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaatt-atccaat |
89832 |
T |
 |
| Q |
237 |
taagcacttat-catacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89831 |
taatcacttattcatacaa-taattgaaaattacactaaaaagattatgatgaattctaacccccttacctta |
89760 |
T |
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Target: scaffold0389 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
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Target: scaffold0389; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 10845 - 11014
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138 |
acaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaatt |
237 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
10845 |
acaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaat-tatttatccaatt |
10943 |
T |
 |
| Q |
238 |
aagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10944 |
aatcacttattcatac-aataattgaaaattatactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11014 |
T |
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Target: scaffold0132 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
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Target: scaffold0132; HSP #1
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275 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42678 |
tgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg |
42749 |
T |
 |
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Target: scaffold0132; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 13571 - 13639
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13571 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagca |
13639 |
T |
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Target: scaffold0465; HSP #1
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19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
82 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10157 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt |
10094 |
T |
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12711 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
12641 |
T |
 |
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Target: scaffold0004; HSP #1
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
186716 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaata-atcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
186647 |
T |
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Target: scaffold0004; HSP #2
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| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193678 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaata-atcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
193609 |
T |
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Target: scaffold0004; HSP #3
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112 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || || |
|
|
| T |
27654 |
catactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaacta |
27753 |
T |
 |
| Q |
212 |
tga-ccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| | || ||||| ||| || ||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27754 |
tgagcaaaataatc-atttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctta |
27852 |
T |
 |
| Q |
307 |
atta |
310 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
27853 |
atta |
27856 |
T |
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Target: scaffold0521; HSP #1
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1 |
acaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| | ||||| |||| | ||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
11140 |
acaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcataatt-caacat |
11238 |
T |
 |
| Q |
100 |
ataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
187 |
Q |
| |
|
||| || ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11239 |
atatcactttcacacactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataa |
11326 |
T |
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Target: scaffold0303; HSP #1
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
89 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
219 |
aacaacatttattgatcatgaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcaccaattgagcata |
149 |
T |
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Target: scaffold0138; HSP #1
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115 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| | ||| || |||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
22516 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatctatga |
22417 |
T |
 |
| Q |
215 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22416 |
acaatcaatcaat-catccaattaatcacttattcatacaa-taattaaaaaataacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22323 |
T |
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Target: scaffold0058 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
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Target: scaffold0058; HSP #1
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210 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70298 |
tatgaacaattaatcaatt-atacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
70201 |
T |
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Target: scaffold0387; HSP #1
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||||||| | || || |
|
|
| T |
1052 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattttaacaacta |
953 |
T |
 |
| Q |
212 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
306 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || || |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
952 |
tgaacaaataatcactt-atttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctta |
855 |
T |
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Target: scaffold0080; HSP #1
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117 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| | || || ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
23855 |
aacaacgtcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt-cacaatatatcattttcacatact |
23757 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||||||||||||||||| | || ||||| || |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| || ||||| || |
|
|
| T |
23756 |
atgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaaaaatttcatgtatacaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgaaca |
23657 |
T |
 |
| Q |
218 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
310 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23656 |
aataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaatcattatgattgaattctaacccccttatcttaatta |
23562 |
T |
 |
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ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
43908 |
ttcaacatatatcactttcatatcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattag |
43809 |
T |
 |
| Q |
192 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaa |
287 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
43808 |
agcattaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa |
43711 |
T |
 |
| Q |
288 |
cactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| || | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43710 |
ttctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
43651 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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339 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
1435 |
tgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcacttt |
1371 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0165; HSP #1
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||| | |||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
22063 |
aacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcccaattcaacatttagagcaca-attcacaatataccattttcacatact |
22161 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22162 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
22198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0020 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:
Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 108074 - 108208
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||| || || |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
108074 |
aacaacatcaattaaacatgatcttcatcacaattcaacaataacaa-gcataattcaacatttagagcataatt-cataatataccattttcacatact |
108171 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108172 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
108208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 373 - 436
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
82 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
373 |
aacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt |
436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 41713 - 41778
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga |
84 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41713 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattga |
41778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:
Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17504 - 17428
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca |
95 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
17504 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca |
17428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 61417 - 61341
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca |
95 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
61417 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca |
61341 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 51380 - 51312
Alignment:
| Q |
19 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51380 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaattgagca |
51312 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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