View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1807R-Insertion-10 (Length: 772)

Name: NF1807R-Insertion-10
Description: NF1807R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1807R-Insertion-10
NF1807R-Insertion-10
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (9-674)||(46144104-46144766)
chr1 (9-674)||(49998518-49999181)
chr1 (70-351)||(52399275-52399549)
chr1 (36-397)||(40437499-40437860)
chr1 (450-674)||(29217434-29217658)
chr1 (126-397)||(17022176-17022429)
chr1 (133-397)||(33395927-33396188)
chr1 (105-389)||(17607564-17607829)
chr1 (429-674)||(52398000-52398234)
chr1 (9-74)||(52400233-52400298)
chr1 (533-636)||(40437977-40438080)
chr1 (675-772)||(47955306-47955403)
chr1 (675-729)||(13589658-13589712)
chr1 (674-724)||(1176716-1176766)
chr1 (672-729)||(17518601-17518658)
chr1 (668-724)||(49318170-49318226)
chr1 (675-728)||(8108993-8109047)
chr1 (669-727)||(20480613-20480671)
chr1 (675-729)||(41083210-41083264)
chr1 (667-728)||(48190763-48190825)
chr1 (672-729)||(20371352-20371409)
chr1 (678-726)||(22149701-22149750)
chr1 (672-728)||(27172113-27172169)
chr1 (134-208)||(20821724-20821799)
chr1 (675-729)||(47955607-47955662)
chr1 (675-729)||(17518303-17518357)
chr1 (675-729)||(22149403-22149456)
chr1 (675-728)||(44911025-44911079)
chr1 (676-726)||(46056904-46056953)
chr1 (675-728)||(49284409-49284463)
chr1 (672-728)||(9347123-9347180)
chr1 (675-728)||(9347551-9347604)
chr1 (429-501)||(40437906-40437979)
chr1 (678-729)||(8108724-8108776)
chr1 (675-723)||(19007735-19007783)
chr1 (672-728)||(50615621-50615677)
chr1 (672-728)||(50623449-50623505)
chr1 (675-729)||(31848191-31848246)
chr1 (137-208)||(41212991-41213062)
chr1 (675-728)||(32163043-32163097)
chr1 (675-728)||(39692000-39692054)
chr1 (675-728)||(48191355-48191409)
chr1 (672-728)||(6002234-6002291)
chr1 (675-728)||(20480168-20480221)
chr1 (672-728)||(48105116-48105173)
chr1 (678-729)||(1177017-1177069)
chr1 (144-208)||(5769545-5769609)
chr1 (508-636)||(17021925-17022052)
chr1 (137-205)||(37235287-37235355)
chr1 (674-772)||(41082908-41083005)
chr1 (673-728)||(50430081-50430137)
chr1 (65-132)||(77184-77251)
chr1 (139-202)||(5471711-5471774)
chr1 (541-636)||(17607293-17607388)
chr1 (33-76)||(21224198-21224241)
chr1 (678-724)||(31847898-31847945)
chr1 (674-724)||(49317751-49317801)
chr1 (675-724)||(999529-999578)
chr1 (675-724)||(4692022-4692071)
chr1 (672-728)||(13918443-13918500)
chr1 (672-728)||(26814691-26814748)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (9-674)||(6068-6720)
[»] chr8 (94 HSPs)
chr8 (72-674)||(24266335-24266934)
chr8 (12-397)||(7468854-7469241)
chr8 (9-397)||(38636865-38637236)
chr8 (20-506)||(24553786-24554271)
chr8 (89-397)||(29296506-29296810)
chr8 (76-397)||(15931935-15932246)
chr8 (76-397)||(26010053-26010358)
chr8 (168-375)||(23227380-23227584)
chr8 (134-398)||(19332951-19333214)
chr8 (134-397)||(17265495-17265744)
chr8 (126-389)||(17283885-17284130)
chr8 (429-610)||(29296280-29296461)
chr8 (32-117)||(45560326-45560411)
chr8 (134-231)||(24238291-24238389)
chr8 (118-214)||(25608794-25608891)
chr8 (673-772)||(41662360-41662459)
chr8 (32-116)||(25294943-25295027)
chr8 (32-116)||(25756963-25757047)
chr8 (32-94)||(3845254-3845316)
chr8 (677-772)||(765736-765831)
chr8 (533-674)||(24554264-24554405)
chr8 (673-772)||(43245869-43245968)
chr8 (675-772)||(12281124-12281221)
chr8 (675-729)||(16928942-16928997)
chr8 (32-119)||(25609017-25609104)
chr8 (125-231)||(45560530-45560636)
chr8 (538-616)||(7468694-7468772)
chr8 (672-729)||(37752415-37752473)
chr8 (673-772)||(15156142-15156241)
chr8 (673-729)||(16929241-16929298)
chr8 (137-230)||(33171010-33171102)
chr8 (429-492)||(7468764-7468828)
chr8 (673-728)||(37752082-37752138)
chr8 (670-726)||(43162229-43162285)
chr8 (675-729)||(15155883-15155938)
chr8 (125-231)||(18042873-18042979)
chr8 (675-729)||(43246175-43246230)
chr8 (43-117)||(11543487-11543561)
chr8 (672-729)||(12281425-12281483)
chr8 (43-117)||(22312642-22312716)
chr8 (675-728)||(13936723-13936776)
chr8 (528-633)||(26009805-26009910)
chr8 (672-729)||(34313762-34313818)
chr8 (672-728)||(39724048-39724105)
chr8 (673-771)||(3463903-3464001)
chr8 (429-501)||(22312140-22312212)
chr8 (677-729)||(23123516-23123567)
chr8 (677-728)||(74688-74739)
chr8 (682-729)||(7127660-7127707)
chr8 (134-208)||(11543283-11543358)
chr8 (134-208)||(22312438-22312513)
chr8 (675-728)||(9823361-9823415)
chr8 (32-106)||(22498497-22498570)
chr8 (12-117)||(25609107-25609213)
chr8 (672-728)||(13027281-13027338)
chr8 (672-728)||(22851387-22851444)
chr8 (528-668)||(5851844-5851983)
chr8 (675-726)||(13026635-13026687)
chr8 (137-208)||(22498625-22498697)
chr8 (682-725)||(9930842-9930885)
chr8 (675-729)||(41662107-41662162)
chr8 (678-727)||(15042148-15042198)
chr8 (675-729)||(18020087-18020140)
chr8 (32-94)||(19332725-19332787)
chr8 (675-728)||(34498555-34498609)
chr8 (679-729)||(43162538-43162588)
chr8 (693-727)||(43598756-43598790)
chr8 (696-729)||(74983-75016)
chr8 (672-728)||(9822745-9822802)
chr8 (672-728)||(23123335-23123392)
chr8 (169-202)||(24270964-24270997)
chr8 (672-728)||(25438789-25438846)
chr8 (672-728)||(37397145-37397202)
chr8 (673-725)||(11007561-11007613)
chr8 (157-209)||(18179083-18179135)
chr8 (429-517)||(33170719-33170807)
chr8 (137-205)||(37654972-37655040)
chr8 (675-714)||(767720-767759)
chr8 (694-729)||(9465873-9465908)
chr8 (322-388)||(18032943-18033012)
chr8 (137-208)||(23116143-23116214)
chr8 (678-727)||(7127923-7127973)
chr8 (675-728)||(13937389-13937443)
chr8 (137-246)||(18033091-18033201)
chr8 (675-728)||(37396708-37396762)
chr8 (742-772)||(37752181-37752211)
chr8 (743-772)||(74942-74971)
chr8 (672-724)||(3307335-3307388)
chr8 (675-728)||(3463642-3463694)
chr8 (675-724)||(6092777-6092825)
chr8 (668-728)||(9623495-9623556)
chr8 (678-726)||(22786843-22786892)
chr8 (672-728)||(24473340-24473397)
chr8 (675-724)||(33747984-33748033)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (74-674)||(29912388-29912984)
chr5 (68-674)||(24082455-24083047)
chr5 (68-397)||(6455283-6455611)
chr5 (72-513)||(26561057-26561491)
chr5 (73-402)||(5622699-5623024)
chr5 (32-242)||(33627613-33627823)
chr5 (99-397)||(21224000-21224277)
chr5 (137-363)||(21108173-21108394)
chr5 (126-246)||(14343079-14343199)
chr5 (540-674)||(6455045-6455179)
chr5 (533-674)||(5623119-5623260)
chr5 (169-307)||(18532161-18532295)
chr5 (169-307)||(22055125-22055259)
chr5 (673-772)||(18433013-18433112)
chr5 (675-728)||(22428934-22428987)
chr5 (32-132)||(20455205-20455305)
chr5 (12-94)||(21108505-21108586)
chr5 (33-205)||(24226695-24226861)
chr5 (533-674)||(26561477-26561618)
chr5 (332-409)||(33627798-33627875)
chr5 (32-119)||(11964921-11965008)
chr5 (673-772)||(34576865-34576962)
chr5 (675-728)||(22429196-22429249)
chr5 (675-731)||(25116058-25116115)
chr5 (134-208)||(11964720-11964795)
chr5 (675-729)||(18433315-18433370)
chr5 (672-727)||(23011076-23011131)
chr5 (675-772)||(25115757-25115854)
chr5 (675-772)||(25174849-25174946)
chr5 (675-729)||(25175150-25175205)
chr5 (675-772)||(26020450-26020547)
chr5 (674-728)||(34577164-34577218)
chr5 (672-726)||(37610620-37610674)
chr5 (39-116)||(20833224-20833301)
chr5 (678-727)||(41382896-41382945)
chr5 (675-728)||(41383167-41383220)
chr5 (673-728)||(18817611-18817667)
chr5 (18-106)||(23414117-23414204)
chr5 (672-727)||(9665828-9665882)
chr5 (135-229)||(20455419-20455513)
chr5 (675-724)||(16466746-16466796)
chr5 (430-501)||(5623049-5623121)
chr5 (672-720)||(12441320-12441367)
chr5 (32-116)||(14342875-14342959)
chr5 (676-728)||(22729440-22729492)
chr5 (678-726)||(31569910-31569958)
chr5 (672-726)||(37780744-37780799)
chr5 (678-728)||(9665560-9665609)
chr5 (675-728)||(12498567-12498621)
chr5 (675-728)||(12498928-12498982)
chr5 (675-728)||(18816952-18817006)
chr5 (675-728)||(26571164-26571218)
chr5 (678-727)||(41383048-41383100)
chr5 (429-501)||(6455184-6455257)
chr5 (674-728)||(19514524-19514580)
chr5 (678-727)||(23011383-23011432)
chr5 (675-728)||(37610202-37610255)
chr5 (675-728)||(37780320-37780373)
chr5 (673-728)||(3888237-3888293)
chr5 (429-489)||(11964434-11964494)
chr5 (163-199)||(17301584-17301620)
chr5 (673-725)||(22729006-22729058)
chr5 (675-729)||(5187829-5187884)
chr5 (678-728)||(11351427-11351478)
chr5 (678-728)||(21207229-21207280)
chr5 (131-198)||(24851786-24851853)
chr5 (675-726)||(43464194-43464245)
chr5 (692-726)||(16726096-16726130)
chr5 (675-728)||(19514963-19515017)
chr5 (678-728)||(43463759-43463809)
chr5 (672-721)||(2817582-2817631)
chr5 (673-726)||(12441040-12441093)
[»] chr4 (92 HSPs)
chr4 (9-674)||(38763115-38763772)
chr4 (12-397)||(12732754-12733139)
chr4 (76-409)||(18275414-18275739)
chr4 (69-358)||(42707399-42707684)
chr4 (174-409)||(7187277-7187509)
chr4 (20-155)||(18240949-18241084)
chr4 (174-389)||(19823806-19824003)
chr4 (547-674)||(7187637-7187763)
chr4 (169-307)||(15676248-15676382)
chr4 (169-259)||(10105523-10105613)
chr4 (169-259)||(31114517-31114607)
chr4 (675-772)||(3930437-3930533)
chr4 (673-772)||(16555774-16555873)
chr4 (667-729)||(22681567-22681629)
chr4 (134-211)||(24237655-24237733)
chr4 (134-231)||(54364894-54364992)
chr4 (32-105)||(19558317-19558390)
chr4 (150-238)||(10115705-10115795)
chr4 (533-636)||(12732552-12732654)
chr4 (675-729)||(13198905-13198960)
chr4 (134-213)||(17213168-17213247)
chr4 (675-729)||(35393775-35393829)
chr4 (675-728)||(56505693-56505747)
chr4 (675-728)||(26207361-26207414)
chr4 (32-132)||(5371807-5371906)
chr4 (675-729)||(16555515-16555570)
chr4 (675-729)||(18077201-18077256)
chr4 (134-208)||(19558102-19558177)
chr4 (137-208)||(41257679-41257750)
chr4 (666-728)||(11241661-11241723)
chr4 (32-94)||(12134860-12134922)
chr4 (436-501)||(12732652-12732718)
chr4 (132-245)||(18420208-18420320)
chr4 (429-551)||(42707202-42707324)
chr4 (675-728)||(50678779-50678833)
chr4 (672-729)||(3930176-3930233)
chr4 (676-729)||(8488481-8488534)
chr4 (9-106)||(24237783-24237879)
chr4 (672-728)||(32703650-32703707)
chr4 (672-728)||(36096475-36096532)
chr4 (9-106)||(49070721-49070817)
chr4 (32-132)||(17376668-17376768)
chr4 (673-729)||(27304716-27304771)
chr4 (673-728)||(50679424-50679480)
chr4 (137-231)||(5372022-5372116)
chr4 (675-732)||(8182168-8182227)
chr4 (541-668)||(18275154-18275280)
chr4 (679-729)||(49178815-49178866)
chr4 (675-728)||(24775783-24775837)
chr4 (675-728)||(28196346-28196400)
chr4 (675-728)||(28196773-28196827)
chr4 (675-728)||(36095817-36095871)
chr4 (673-727)||(48406386-48406440)
chr4 (9-87)||(54364658-54364735)
chr4 (673-729)||(11241387-11241444)
chr4 (675-728)||(23539841-23539893)
chr4 (676-728)||(25161879-25161932)
chr4 (694-727)||(39415244-39415277)
chr4 (533-610)||(50223854-50223931)
chr4 (673-728)||(4239366-4239422)
chr4 (697-772)||(13198626-13198701)
chr4 (675-726)||(22681881-22681933)
chr4 (668-715)||(49178526-49178574)
chr4 (137-205)||(50223487-50223555)
chr4 (674-725)||(7603422-7603473)
chr4 (676-729)||(8181992-8182047)
chr4 (675-725)||(9380744-9380795)
chr4 (137-208)||(10238780-10238851)
chr4 (680-729)||(27304892-27304943)
chr4 (692-727)||(54509116-54509151)
chr4 (675-728)||(5205988-5206042)
chr4 (674-727)||(5206231-5206284)
chr4 (675-728)||(9023244-9023298)
chr4 (675-728)||(9023680-9023734)
chr4 (675-728)||(9380307-9380361)
chr4 (157-199)||(13908430-13908472)
chr4 (322-360)||(14617785-14617823)
chr4 (675-728)||(26207746-26207800)
chr4 (675-728)||(32703225-32703279)
chr4 (675-728)||(39744465-39744519)
chr4 (675-728)||(43051252-43051306)
chr4 (696-726)||(47219203-47219233)
chr4 (134-211)||(49070594-49070672)
chr4 (672-728)||(169439-169496)
chr4 (676-729)||(7603146-7603198)
chr4 (676-728)||(11529169-11529222)
chr4 (217-246)||(14617896-14617925)
chr4 (675-727)||(25225399-25225452)
chr4 (517-566)||(42707152-42707201)
chr4 (138-231)||(47469662-47469754)
chr4 (675-728)||(48405962-48406015)
chr4 (436-501)||(50223791-50223856)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (68-672)||(918-1518)
scaffold0174 (134-397)||(21405-21672)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (68-674)||(4146937-4147525)
chr3 (68-674)||(6229894-6230491)
chr3 (9-409)||(18968687-18969086)
chr3 (12-409)||(43428739-43429138)
chr3 (32-397)||(25105183-25105554)
chr3 (68-397)||(14816956-14817285)
chr3 (68-397)||(17319836-17320166)
chr3 (74-391)||(4163450-4163767)
chr3 (73-402)||(21167986-21168311)
chr3 (76-397)||(34558477-34558790)
chr3 (335-674)||(4163743-4164078)
chr3 (99-397)||(17203283-17203563)
chr3 (483-674)||(14819487-14819678)
chr3 (113-391)||(12020574-12020834)
chr3 (496-673)||(18968417-18968594)
chr3 (103-389)||(15549143-15549411)
chr3 (134-397)||(17759761-17760020)
chr3 (134-397)||(19061081-19061340)
chr3 (126-246)||(8603428-8603548)
chr3 (126-388)||(27050327-27050593)
chr3 (533-674)||(21168406-21168547)
chr3 (533-674)||(43429226-43429367)
chr3 (134-327)||(17391997-17392195)
chr3 (32-132)||(5229222-5229322)
chr3 (675-729)||(47871121-47871175)
chr3 (533-674)||(17320266-17320407)
chr3 (32-116)||(11401549-11401633)
chr3 (672-772)||(20968977-20969076)
chr3 (134-231)||(5229398-5229495)
chr3 (672-729)||(10293908-10293966)
chr3 (429-490)||(14817314-14817375)
chr3 (137-209)||(17385633-17385704)
chr3 (468-547)||(18968577-18968655)
chr3 (675-729)||(20968718-20968773)
chr3 (666-727)||(1927763-1927825)
chr3 (12-94)||(8603617-8603698)
chr3 (667-728)||(3353120-3353181)
chr3 (429-501)||(17320195-17320268)
chr3 (675-727)||(8315083-8315135)
chr3 (674-729)||(17372297-17372353)
chr3 (675-765)||(18875155-18875245)
chr3 (137-208)||(41660382-41660453)
chr3 (678-728)||(1928434-1928484)
chr3 (674-728)||(9027033-9027087)
chr3 (678-728)||(14015964-14016014)
chr3 (674-724)||(42627550-42627600)
chr3 (674-728)||(42672977-42673031)
chr3 (667-728)||(48160333-48160395)
chr3 (674-765)||(13657444-13657536)
chr3 (675-727)||(18874882-18874935)
chr3 (429-513)||(43429155-43429240)
chr3 (675-727)||(45060872-45060925)
chr3 (672-725)||(53688306-53688359)
chr3 (693-772)||(10293627-10293705)
chr3 (430-501)||(21168336-21168408)
chr3 (672-728)||(24485460-24485516)
chr3 (672-728)||(42673296-42673352)
chr3 (429-636)||(34558237-34558432)
chr3 (137-211)||(38377137-38377212)
chr3 (675-728)||(47870823-47870877)
chr3 (675-728)||(48159897-48159951)
chr3 (672-728)||(3644783-3644840)
chr3 (675-728)||(26007182-26007235)
chr3 (675-728)||(40848521-40848574)
chr3 (674-722)||(45060595-45060644)
chr3 (668-727)||(1100908-1100968)
chr3 (157-209)||(8023014-8023066)
chr3 (544-636)||(15548876-15548968)
chr3 (676-728)||(17372594-17372645)
chr3 (673-727)||(8314011-8314066)
chr3 (665-727)||(22429148-22429211)
chr3 (677-728)||(22429596-22429647)
chr3 (682-721)||(26540876-26540915)
chr3 (674-728)||(47666335-47666390)
chr3 (678-728)||(9026739-9026789)
chr3 (680-732)||(18875017-18875071)
chr3 (674-728)||(21896511-21896565)
chr3 (675-728)||(40848961-40849015)
chr3 (675-728)||(53687888-53687942)
chr3 (675-727)||(1101182-1101235)
chr3 (679-727)||(4947263-4947312)
chr3 (743-772)||(18874957-18874986)
chr3 (672-728)||(27238900-27238957)
chr3 (675-727)||(53766580-53766633)
[»] chr7 (106 HSPs)
chr7 (9-547)||(14939242-14939769)
chr7 (9-547)||(15366835-15367362)
chr7 (68-397)||(31499816-31500145)
chr7 (85-501)||(4437357-4437771)
chr7 (88-501)||(4444758-4445169)
chr7 (72-409)||(33558291-33558624)
chr7 (76-391)||(48353956-48354264)
chr7 (76-409)||(16921193-16921518)
chr7 (74-397)||(34242379-34242695)
chr7 (76-397)||(9609852-9610165)
chr7 (76-397)||(9837424-9837737)
chr7 (99-389)||(17225206-17225478)
chr7 (429-674)||(20587232-20587475)
chr7 (99-409)||(16918182-16918474)
chr7 (429-587)||(16381985-16382143)
chr7 (134-397)||(45148171-45148431)
chr7 (134-359)||(16382178-16382399)
chr7 (496-674)||(14939048-14939225)
chr7 (496-674)||(15366641-15366818)
chr7 (533-674)||(4437214-4437355)
chr7 (533-674)||(4444615-4444756)
chr7 (533-674)||(33558062-33558203)
chr7 (542-674)||(31499579-31499711)
chr7 (429-674)||(34242740-34242976)
chr7 (541-674)||(16921650-16921783)
chr7 (32-132)||(4483686-4483786)
chr7 (125-229)||(21539488-21539592)
chr7 (32-116)||(21676066-21676150)
chr7 (32-132)||(28719413-28719513)
chr7 (675-772)||(9412282-9412379)
chr7 (34-116)||(8564736-8564818)
chr7 (125-246)||(15979389-15979510)
chr7 (673-772)||(3687614-3687712)
chr7 (18-94)||(16382544-16382619)
chr7 (137-208)||(9322388-9322459)
chr7 (53-116)||(21539368-21539431)
chr7 (134-211)||(8564899-8564977)
chr7 (672-729)||(13772900-13772958)
chr7 (672-722)||(27096044-27096094)
chr7 (672-722)||(27182209-27182259)
chr7 (678-727)||(6908485-6908534)
chr7 (672-729)||(3687350-3687409)
chr7 (168-231)||(19066362-19066425)
chr7 (672-727)||(23686418-23686473)
chr7 (672-727)||(35079957-35080012)
chr7 (298-360)||(8325309-8325371)
chr7 (322-391)||(16207027-16207097)
chr7 (676-729)||(8953888-8953941)
chr7 (429-501)||(33558201-33558274)
chr7 (672-728)||(44599486-44599543)
chr7 (675-727)||(6908213-6908265)
chr7 (18-106)||(13617717-13617804)
chr7 (32-92)||(15979213-15979273)
chr7 (134-208)||(4483498-4483573)
chr7 (674-728)||(5349733-5349785)
chr7 (675-729)||(9412023-9412078)
chr7 (134-208)||(21676354-21676429)
chr7 (134-208)||(28719224-28719299)
chr7 (675-728)||(13772641-13772695)
chr7 (675-728)||(44600135-44600189)
chr7 (56-106)||(46472948-46472998)
chr7 (665-725)||(5735242-5735303)
chr7 (672-728)||(37888830-37888887)
chr7 (35-92)||(39292895-39292952)
chr7 (667-726)||(18925054-18925114)
chr7 (675-722)||(23686723-23686771)
chr7 (696-732)||(34235974-34236010)
chr7 (167-246)||(3193396-3193475)
chr7 (673-728)||(3204667-3204721)
chr7 (674-728)||(9035293-9035348)
chr7 (496-547)||(14939208-14939259)
chr7 (496-547)||(15366801-15366852)
chr7 (137-208)||(20584208-20584279)
chr7 (675-728)||(10533034-10533088)
chr7 (675-728)||(13863313-13863367)
chr7 (675-728)||(37889259-37889313)
chr7 (675-728)||(37972396-37972450)
chr7 (674-728)||(48359319-48359373)
chr7 (675-728)||(13744233-13744286)
chr7 (157-201)||(17150771-17150815)
chr7 (676-728)||(18925322-18925373)
chr7 (677-729)||(33628397-33628449)
chr7 (675-729)||(9034867-9034922)
chr7 (675-726)||(18864404-18864455)
chr7 (678-728)||(20418891-20418942)
chr7 (678-729)||(27096341-27096392)
chr7 (678-729)||(27181911-27181962)
chr7 (678-729)||(42419028-42419079)
chr7 (675-728)||(3205093-3205147)
chr7 (675-728)||(8643766-8643820)
chr7 (154-204)||(9128652-9128702)
chr7 (675-720)||(13863964-13864010)
chr7 (675-728)||(17156967-17157021)
chr7 (675-728)||(20419324-20419378)
chr7 (675-728)||(22740156-22740210)
chr7 (678-728)||(22740591-22740641)
chr7 (672-729)||(29291803-29291861)
chr7 (672-729)||(29292040-29292098)
chr7 (675-724)||(29292922-29292972)
chr7 (672-725)||(29293349-29293403)
chr7 (675-728)||(33628660-33628714)
chr7 (533-566)||(4483185-4483218)
chr7 (217-246)||(8325230-8325259)
chr7 (528-636)||(9609613-9609720)
chr7 (528-636)||(9837185-9837292)
chr7 (676-732)||(39983700-39983757)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (99-673)||(29603899-29604462)
chr6 (72-397)||(32350683-32351010)
chr6 (68-381)||(18630875-18631184)
chr6 (174-501)||(15006014-15006342)
chr6 (12-212)||(22463314-22463514)
chr6 (127-318)||(25649839-25650024)
chr6 (135-397)||(11374178-11374437)
chr6 (113-397)||(22363497-22363763)
chr6 (429-674)||(33539821-33540066)
chr6 (100-389)||(21621752-21622023)
chr6 (134-397)||(29161836-29162096)
chr6 (438-668)||(25649599-25649829)
chr6 (134-360)||(5485657-5485886)
chr6 (137-255)||(25918421-25918539)
chr6 (125-246)||(31162201-31162322)
chr6 (135-397)||(4228611-4228872)
chr6 (135-397)||(4173002-4173263)
chr6 (125-298)||(16375068-16375241)
chr6 (675-772)||(3403946-3404043)
chr6 (32-119)||(17084466-17084553)
chr6 (533-636)||(22467796-22467899)
chr6 (675-772)||(21031979-21032075)
chr6 (670-724)||(30388057-30388111)
chr6 (545-634)||(32350492-32350581)
chr6 (68-152)||(33539664-33539750)
chr6 (667-728)||(3403709-3403771)
chr6 (675-728)||(10039676-10039729)
chr6 (533-674)||(15006340-15006482)
chr6 (32-132)||(23220659-23220758)
chr6 (40-119)||(16135254-16135333)
chr6 (168-246)||(17857743-17857821)
chr6 (322-397)||(17375262-17375338)
chr6 (678-729)||(3825530-3825581)
chr6 (675-729)||(18241854-18241909)
chr6 (330-389)||(25918305-25918364)
chr6 (673-765)||(11656746-11656838)
chr6 (675-729)||(13579650-13579704)
chr6 (429-494)||(32350588-32350654)
chr6 (137-231)||(34965658-34965751)
chr6 (429-501)||(22467725-22467798)
chr6 (675-732)||(33655111-33655168)
chr6 (672-728)||(33828987-33829044)
chr6 (134-208)||(16135053-16135128)
chr6 (694-772)||(18242113-18242190)
chr6 (137-204)||(19852973-19853040)
chr6 (678-724)||(31598732-31598778)
chr6 (675-728)||(33829636-33829690)
chr6 (675-723)||(21032285-21032334)
chr6 (675-728)||(29074372-29074425)
chr6 (675-728)||(29079136-29079189)
chr6 (675-728)||(29106945-29106998)
chr6 (692-729)||(30388361-30388398)
chr6 (675-727)||(31598274-31598326)
chr6 (673-729)||(33971992-33972048)
chr6 (134-208)||(21930666-21930741)
chr6 (32-94)||(11373970-11374032)
chr6 (672-728)||(22684358-22684414)
chr6 (672-728)||(22754654-22754710)
chr6 (680-729)||(2762611-2762662)
chr6 (680-729)||(10039842-10039893)
chr6 (674-728)||(10087858-10087913)
chr6 (168-231)||(18104830-18104892)
chr6 (429-500)||(23220173-23220244)
chr6 (674-728)||(33974299-33974354)
chr6 (691-729)||(2762500-2762538)
chr6 (675-728)||(7654548-7654602)
chr6 (680-729)||(12714436-12714486)
chr6 (675-729)||(23250592-23250646)
chr6 (675-729)||(23250891-23250945)
chr6 (429-494)||(19852752-19852817)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (223-666)||(25354-25795)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (20-501)||(25132688-25133162)
chr2 (69-383)||(24881224-24881538)
chr2 (134-397)||(20271974-20272243)
chr2 (466-674)||(24868880-24869088)
chr2 (134-397)||(6093433-6093692)
chr2 (148-389)||(40641631-40641854)
chr2 (264-390)||(19660948-19661073)
chr2 (169-259)||(24342740-24342830)
chr2 (168-254)||(19665386-19665472)
chr2 (32-132)||(18534785-18534885)
chr2 (99-213)||(9782201-9782314)
chr2 (34-106)||(22331702-22331774)
chr2 (675-772)||(24832331-24832428)
chr2 (675-772)||(30190923-30191020)
chr2 (672-729)||(11883925-11883983)
chr2 (533-674)||(25132549-25132690)
chr2 (322-382)||(9782417-9782477)
chr2 (678-772)||(40469686-40469780)
chr2 (32-205)||(43641597-43641774)
chr2 (675-729)||(11883623-11883678)
chr2 (673-726)||(6171154-6171207)
chr2 (672-729)||(43495604-43495661)
chr2 (125-230)||(45619350-45619455)
chr2 (675-729)||(20347463-20347518)
chr2 (667-729)||(30191224-30191287)
chr2 (134-231)||(24562193-24562291)
chr2 (672-728)||(26737781-26737838)
chr2 (673-726)||(40221311-40221364)
chr2 (32-92)||(6093831-6093891)
chr2 (675-772)||(6171414-6171510)
chr2 (677-729)||(18055050-18055101)
chr2 (12-132)||(24561960-24562079)
chr2 (584-636)||(30994734-30994786)
chr2 (678-729)||(32673142-32673193)
chr2 (322-388)||(34135780-34135849)
chr2 (675-728)||(2639482-2639536)
chr2 (675-728)||(18296693-18296747)
chr2 (32-94)||(19434686-19434748)
chr2 (137-231)||(24276632-24276725)
chr2 (675-729)||(26737482-26737535)
chr2 (675-728)||(26841587-26841641)
chr2 (672-729)||(40469424-40469482)
chr2 (672-728)||(17850975-17851032)
chr2 (672-728)||(26842238-26842295)
chr2 (676-728)||(16911269-16911321)
chr2 (675-726)||(17346037-17346088)
chr2 (134-208)||(18534598-18534672)
chr2 (675-728)||(2638820-2638874)
chr2 (675-728)||(5378661-5378715)
chr2 (675-728)||(20347163-20347217)
chr2 (675-728)||(37720204-37720258)
chr2 (675-728)||(41790912-41790966)
chr2 (672-728)||(7591850-7591907)
chr2 (675-728)||(7980003-7980056)
chr2 (688-729)||(15920792-15920833)
chr2 (676-728)||(18296077-18296130)
chr2 (32-85)||(45618405-45618458)
chr2 (675-726)||(6495723-6495775)
chr2 (688-728)||(7591215-7591255)
chr2 (150-198)||(23154174-23154222)
chr2 (150-198)||(23565431-23565479)
chr2 (134-198)||(39668570-39668633)
chr2 (678-729)||(43495483-43495535)
chr2 (678-728)||(8851151-8851202)
chr2 (677-771)||(15321394-15321486)
chr2 (678-729)||(17345736-17345786)
chr2 (675-721)||(43495309-43495356)
chr2 (675-728)||(5379959-5380013)
chr2 (667-728)||(7664673-7664735)
chr2 (675-728)||(8851582-8851636)
chr2 (671-728)||(26692820-26692878)
chr2 (674-724)||(38490845-38490895)
chr2 (671-724)||(19141853-19141905)
chr2 (137-206)||(22137152-22137221)
chr2 (680-727)||(26737657-26737706)
chr2 (692-728)||(40221488-40221525)
[»] scaffold0387 (3 HSPs)
scaffold0387 (68-547)||(2219-2674)
scaffold0387 (496-668)||(2691-2863)
scaffold0387 (496-547)||(2657-2708)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (270-636)||(9723-10086)
scaffold0253 (270-636)||(19148-19511)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (76-404)||(12040-12360)
scaffold0107 (528-636)||(11806-11914)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (68-397)||(23300-23623)
scaffold0021 (107-397)||(19073-19358)
scaffold0021 (107-397)||(28649-28934)
scaffold0021 (429-566)||(23667-23804)
scaffold0021 (455-566)||(19428-19540)
scaffold0021 (455-566)||(29004-29116)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (76-397)||(1344-1658)
scaffold0047 (541-641)||(1827-1927)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (76-397)||(98430-98743)
scaffold0031 (429-636)||(98788-98995)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (88-397)||(198640-198941)
scaffold0006 (541-668)||(199074-199199)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (76-409)||(29703-30018)
scaffold0010 (528-636)||(29474-29582)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (76-397)||(68111-68414)
scaffold0009 (125-246)||(255736-255857)
scaffold0009 (675-729)||(205687-205741)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (76-270)||(3231-3425)
scaffold0327 (533-674)||(6581-6722)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (168-397)||(105967-106195)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (118-397)||(11193-11478)
scaffold0017 (12-118)||(11553-11659)
scaffold0017 (673-728)||(185274-185330)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (193-409)||(6543-6755)
scaffold0175 (547-639)||(6897-6989)
scaffold0175 (429-491)||(6787-6850)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (118-397)||(10662-10946)
scaffold0013 (9-95)||(8316-8400)
scaffold0013 (137-204)||(34243-34310)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (212-397)||(63867-64049)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (72-223)||(1061-1210)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (99-389)||(356-628)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (105-248)||(52047-52188)
scaffold0025 (338-389)||(51954-52005)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (99-255)||(5464-5620)
scaffold0483 (333-389)||(5348-5404)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (134-397)||(15213-15481)
scaffold0317 (32-116)||(14959-15043)
[»] scaffold1204 (2 HSPs)
scaffold1204 (134-398)||(1538-1800)
scaffold1204 (32-94)||(1331-1393)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (533-674)||(21558-21699)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (32-132)||(1372-1472)
scaffold0090 (32-132)||(5752-5852)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (674-772)||(6654-6751)
scaffold0319 (675-729)||(6394-6449)
[»] scaffold0110 (2 HSPs)
scaffold0110 (669-772)||(45764-45866)
scaffold0110 (675-725)||(45537-45587)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (675-771)||(25327-25423)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (169-255)||(50304-50390)
scaffold0109 (333-389)||(50188-50244)
[»] scaffold0442 (2 HSPs)
scaffold0442 (533-674)||(1669-1810)
scaffold0442 (453-501)||(1622-1671)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (136-231)||(9532-9628)
scaffold0183 (32-106)||(9795-9870)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (429-520)||(14234-14325)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (672-729)||(438927-438985)
scaffold0001 (675-729)||(183662-183716)
scaffold0001 (675-729)||(439198-439253)
scaffold0001 (678-727)||(183367-183416)
[»] scaffold0802 (2 HSPs)
scaffold0802 (673-772)||(1377-1476)
scaffold0802 (673-729)||(1116-1173)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (134-211)||(2299-2376)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (134-232)||(12464-12562)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (311-391)||(3979-4062)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (673-726)||(17158-17211)
scaffold0015 (673-729)||(16851-16906)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (32-115)||(12202-12284)
scaffold0468 (169-246)||(12358-12434)
[»] scaffold0376 (2 HSPs)
scaffold0376 (674-729)||(7599-7654)
scaffold0376 (675-728)||(7455-7508)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (130-360)||(20289-20518)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (138-232)||(326-420)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (137-231)||(130634-130727)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (675-729)||(411923-411977)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (672-729)||(50506-50563)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (137-208)||(44935-45007)
scaffold0088 (533-610)||(45294-45371)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (676-727)||(6877-6927)
scaffold0598 (677-726)||(6609-6659)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (137-208)||(34787-34858)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (137-208)||(85189-85260)
scaffold0004 (137-231)||(26305-26398)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (12-94)||(4851-4932)
scaffold0057 (134-211)||(4711-4789)
[»] scaffold1221 (2 HSPs)
scaffold1221 (672-728)||(1508-1564)
scaffold1221 (678-726)||(1786-1834)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (672-728)||(763-819)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (673-728)||(6150-6206)
scaffold0328 (675-728)||(6795-6849)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (32-116)||(5232-5316)
scaffold0079 (125-193)||(5511-5580)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (322-388)||(1500-1569)
scaffold0333 (132-245)||(1314-1427)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (429-501)||(99601-99673)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (137-208)||(457-528)
scaffold0786 (137-208)||(5512-5583)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (137-208)||(4045-4116)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (675-724)||(10012-10062)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (322-360)||(79444-79482)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (675-728)||(38695-38749)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (322-360)||(199554-199592)
scaffold0005 (217-246)||(199452-199481)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (29-94)||(14072-14137)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (675-728)||(19621-19674)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 520; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 46144766 - 46144104
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46144766 atatttatcataaggtgttgtatgttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 46144667  T
Q  109 tacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46144666 tacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgtaattgttgttga 46144567  T
Q  209 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46144566 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatta 46144467  T
Q  309 tcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46144466 tcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaataggaggtgtactcttacataagatgtatggttgacat 46144367  T
Q  409 cnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaat 508  Q
    |                   |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46144366 c---ttgttgttgttgtttggtaccacatgcatgtacgtgtcgaaattaggcgtataacatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaat 46144270  T
Q  509 gttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtat 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46144269 gttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgagtatttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtat 46144170  T
Q  609 attgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46144169 attgaattaattgtttatgtgaagtactcggaattgattttaattcatatatgctcaaatttattt 46144104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 674
Target Start/End: Original strand, 49998518 - 49999181
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49998518 atatttaacataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatgtagttgttgaactatatgatatagttggagtggattaatgaa 49998617  T
Q  109 tacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998618 tacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 49998717  T
Q  209 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  49998718 agttgaacaatgtaattggaggtgtagttttatattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattatcgagtctttgcttatgtccatgcatca 49998817  T
Q  309 tcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacat 408  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  49998818 ttgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgcacttttacataactgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttggcat 49998917  T
Q  409 cnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaat 508  Q
    |                   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |    
T  49998918 c---ttattgttgttgtttggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcatatgaatgataatt 49999014  T
Q  509 gttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatattt-gggattgttatgtgaatgtgta 607  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  49999015 gttgaagattgtgatgagattgtgaatgatatttgttgatgataagtgtgtttggtgagtacttgatcgtgatatttggggattgttatgtaaatatgta 49999114  T
Q  608 tattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  49999115 tattgaattaactgtttatgtgaagtactcggaattgatttcaattcatatgtgctcaaatttattt 49999181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 70 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 52399549 - 52399275
Alignment:
Q  70 ttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||| ||    
T  52399549 ttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgttgactcttaattgat-------atgttgat 52399457  T
Q  170 tgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagt 269  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52399456 tgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgctgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttagtgtatgtatatgttgagt 52399357  T
Q  270 agtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtact 351  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  52399356 agtttgcattattgagtcttcgcttatgttcatgcatcatcgtcatatcgagtcgtatgagaaatgtaaaaggaggtgtact 52399275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 397
Target Start/End: Original strand, 40437499 - 40437860
Alignment:
Q  36 ctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttg 135  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  40437499 ctcctttacttggattgtgagaaattgtgcgaagttgttgaactataggatataattgaagttgattaatgaatacatgttgattaattgtgacattttg 40437598  T
Q  136 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtac 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40437599 gtgatgactcttaattggataatgacatgatgattgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac 40437698  T
Q  236 ttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaa 333  Q
     |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||| || |||||||| | | ||||||||||    
T  40437699 -tttacattgtgttgatgtatgtattcgttgagtggtttgcattattgagtc-ttgcttgtatgtcaatgcatcatagtcatatcgagtaatatgagaaa 40437796  T
Q  334 tgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40437797 tgtaaaaggatgtgtacttttacatagtttatcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgt 40437860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 450 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 29217658 - 29217434
Alignment:
Q  450 cgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatg 549  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29217658 cgaaattaggcgcatatcatattgacatgagtcgtaattgtagcatgtgaatgataattgttgaagattgtgatgagattgtgaatgataattgttgatg 29217559  T
Q  550 ataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagatttt 649  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     |||    
T  29217558 ataagtgtgcttggtgagtacttgatcgtgatatttgagattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagtactcggaatttgattt 29217459  T
Q  650 aattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||    
T  29217458 aattcatatatactcaaacttattt 29217434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 126 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17022429 - 17022176
Alignment:
Q  126 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaatt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17022429 tgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaatt 17022330  T
Q  226 ggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcat 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||    ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| || |          ||||    
T  17022329 ggagatgtacttttacattgtgttgttgtaagt---tgtggag----ttgcattatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattg----------tcat 17022248  T
Q  326 atgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17022247 atgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgt 17022176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 133 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 33396188 - 33395927
Alignment:
Q  133 ttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33396188 ttggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattttgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggt 33396089  T
Q  232 gtacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatg 328  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||         | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  | |||||||    
T  33396088 gtacttttacattgttgttggtgaatgtat--------gattttgcattattgattctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatg 33395997  T
Q  329 agaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33395996 agaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacataagatgt 33395927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 17607829 - 17607564
Alignment:
Q  105 tgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||   | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17607829 tgaatacatgttgatgaattatgatcatta--taatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttg 17607732  T
Q  205 ttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgc 304  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |      ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  17607731 ttgaggttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttgtcg------tatgttgcgtag-ttgcattatttggtctttgcttatgtccatgc 17607639  T
Q  305 attatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    || || |          ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17607638 atcattg----------tcatatgtgaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatggttgtgcgtaagaggaagtgtgctcttaca 17607564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 429 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 52398234 - 52398000
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagat 528  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||||          
T  52398234 gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcacattgacatgagtcgtaattaatgtatgtgaatgataattgttgaagattgtga------ 52398141  T
Q  529 tgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgt 628  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  52398140 -----atgataattgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttgatcgtgatatttgagattgttatgcgaacgtgtatattgaattaaccgtttatgt 52398046  T
Q  629 gaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
     ||||||| | ||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52398045 taagtacttggaatttgatttaattcatatatgctcaaatttattt 52398000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 52400298 - 52400233
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 74  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52400298 atatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 52400233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 533 - 636
Target Start/End: Original strand, 40437977 - 40438080
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||| |||    
T  40437977 aatgatgattattgatgataagtgtgcttgatgagtactcattcgtgatatttggaattgttatgtgaaagtgtataatgaattaaatgcttatgttaag 40438076  T
Q  633 tact 636  Q
    ||||    
T  40438077 tact 40438080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Original strand, 47955306 - 47955403
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47955306 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgca-ccccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 47955403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13589712 - 13589658
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13589712 ggcttaattgcacttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 13589658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 724
Target Start/End: Original strand, 1176716 - 1176766
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1176716 tggcttaattgcactttcccccctatattttgctaattgtgcgattttgca 1176766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 17518658 - 17518601
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17518658 tttgacttaattgcacttttccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcaccccc 17518601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 668 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 49318226 - 49318170
Alignment:
Q  668 tttatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  49318226 tttatttggcttaattgcactttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgca 49318170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 8109047 - 8108993
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8109047 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 8108993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 669 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20480671 - 20480613
Alignment:
Q  669 ttatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20480671 ttatttggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcaccc 20480613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 41083264 - 41083210
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41083264 ggcttaattgcacttttccccctatcttttgttagttgtgcgattttgcaccccc 41083210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 667 - 728
Target Start/End: Original strand, 48190763 - 48190825
Alignment:
Q  667 atttatttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48190763 atttttttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 48190825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 20371409 - 20371352
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20371409 tttggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcaccccc 20371352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 22149750 - 22149701
Alignment:
Q  678 ttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22149750 ttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 22149701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 27172113 - 27172169
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27172113 tttggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 27172169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20821799 - 20821724
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20821799 tggtgatgactctcaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 20821724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 47955662 - 47955607
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47955662 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttattaattgtgcgattttgcaccccc 47955607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 17518303 - 17518357
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17518303 ggcttaattgcacctttccccttatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 17518357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 22149403 - 22149456
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22149403 ggcttaattgcacttttccccctatc-tttggtaattgtgcgattttgcaccccc 22149456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 44911025 - 44911079
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccc-tatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44911025 ggcttaattgcactttccccccctatattttgccaattgtgcgattttgcacccc 44911079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 726
Target Start/End: Original strand, 46056904 - 46056953
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46056904 gcttaattgcactttcccc-ctatcttttgctaattttgcgattttgcacc 46056953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 49284409 - 49284463
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49284409 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 49284463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 9347123 - 9347180
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9347123 tttggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 9347180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9347604 - 9347551
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9347604 ggcttaattgcactttcccccctatagtttgccaattgtgcaattttgcacccc 9347551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Original strand, 40437906 - 40437979
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40437906 gtaccacatgcatatatgtgtcggaattaggcgcataacatatttgatatgagtcgtaattgttgcatgtgaat 40437979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Original strand, 8108724 - 8108776
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8108724 ttaattgcacttttcctccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 8108776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 723
Target Start/End: Original strand, 19007735 - 19007783
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgc 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  19007735 ggcttaattgcactttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgc 19007783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 50615677 - 50615621
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  50615677 tttggcttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 50615621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 50623505 - 50623449
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  50623505 tttggcttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 50623449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 31848246 - 31848191
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31848246 ggcttaattgcacttttctcccctatcttttgttaattgtacgattttgcaccccc 31848191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 41212991 - 41213062
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| || |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41212991 tgatgactcctaattgaagtatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41213062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 32163097 - 32163043
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32163097 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 32163043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 39692054 - 39692000
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  39692054 ggcttaattgcacttttcccccctatattttgtcaattgtgcgattttgcacccc 39692000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 48191409 - 48191355
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  48191409 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaatggtgcgattttgcacccc 48191355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 6002234 - 6002291
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6002234 tttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgtcaattgtgtgattttgcacccc 6002291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 20480168 - 20480221
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  20480168 ggcttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 20480221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 48105173 - 48105116
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48105173 tttggcttaattgcacttttcccccttatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 48105116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 1177069 - 1177017
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1177069 ttaattgcacttttcctccctatctttcgctaattgtgcaattttgcaccccc 1177017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 5769545 - 5769609
Alignment:
Q  144 tcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||| ||||| || |  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5769545 tcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttga 5769609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 508 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 17022052 - 17021925
Alignment:
Q  508 tgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgta 607  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||     ||| |||||| | |||||| ||| |||||||| ||  ||| | ||| |||||||| |||||  |    
T  17022052 tgttgaag-ttgtgatgagattgtgaatgatgtgaattgttgataaatatgcttggtgaatacttgattgtattatcttggaatgttatgtaaatgtaca 17021954  T
Q  608 tattgaattaactatttatgtgaagtact 636  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17021953 tattgaattaactgtttatgttaagtact 17021925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 37235287 - 37235355
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 205  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37235287 tgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37235355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 674 - 772
Target Start/End: Original strand, 41082908 - 41083005
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41082908 tggcttaattgtactttttccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcatcccc-tcttttttttt-agcgattttgcaccccatctttttgccccc 41083005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 50430137 - 50430081
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50430137 ttggtttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 50430081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Original strand, 77184 - 77251
Alignment:
Q  65 tggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  77184 tggagttgttaaactatatgatatagttgatggtgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 77251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 202
Target Start/End: Original strand, 5471711 - 5471774
Alignment:
Q  139 atgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgt 202  Q
    ||||||||||||||| |  |||| || || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5471711 atgactcttaattgatttgtgacttgatagttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgt 5471774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 17607388 - 17607293
Alignment:
Q  541 ttgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtact 636  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || ||| | ||  ||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  17607388 ttgttgatgataagtgtacttggtgaatatttggttgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttatgttaagtact 17607293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21224241 - 21224198
Alignment:
Q  33 tttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttga 76  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21224241 tttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttga 21224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 724
Target Start/End: Original strand, 31847898 - 31847945
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31847898 ttaattgcactttacccccttatcttttgctaattgtgcaattttgca 31847945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 674 - 724
Target Start/End: Original strand, 49317751 - 49317801
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  49317751 tggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgcaattttgca 49317801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 999578 - 999529
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  999578 ggcttaattgcacttttccccctatagattgccaattgtgcgattttgca 999529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 724
Target Start/End: Original strand, 4692022 - 4692071
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  4692022 ggcttaattgcactttctcctctatagtttgctaattgtacgattttgca 4692071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 13918443 - 13918500
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13918443 tttggcttaattgcactttttcctcctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 13918500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 26814691 - 26814748
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  26814691 tttggcttaattgcacttttcctccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 26814748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 6720 - 6068
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |    
T  6720 atatttatcataaggtgttgtattttcctcttttacttgtattatgaaaagttgt----------tgaactatatgatatacttggagtggattaatata 6631  T
Q  109 tacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6630 tacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtatggatgtaaattcttgataatgcaattgttgttga 6531  T
Q  209 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatta 308  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6530 agttgagaaatgtaattggaggtgtacttttacactgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatca 6431  T
Q  309 tcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacat 408  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  6430 tcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcat 6331  T
Q  409 cnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaat 508  Q
    |                   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  6330 c---ttgttgttgttgtttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatatttccatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataatt 6234  T
Q  509 gttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtat 608  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6233 gttgaagattgtgatgagattgtgaatgataattgttgatgataagtgtgctcggtgaatacttgatcgtgatagttgggattgttatgtgaatgtgtat 6134  T
Q  609 attgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||  || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  6133 attgaattaactgtttatgtgaagtacttggaattgacttcaattcatatatgctcaaatctattt 6068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 94)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 24266934 - 24266335
Alignment:
Q  72 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattg 171  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24266934 gttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattg 24266835  T
Q  172 tatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 271  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24266834 tgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatttgtttagtag 24266735  T
Q  272 tttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266734 tttgcattattgagtctttgcttatgtccgtgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaag 24266635  T
Q  372 aggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatat 471  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||                    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24266634 aggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcat---gttcttgttgttgtttggtaccacatgcatgtatgtgttgatattaggcgcatagcatat 24266538  T
Q  472 taacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactact 571  Q
    | ||||| ||||||| | ||||| |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24266537 tgacatgtgtcgtaactattgcatgtgaatgataattgttaaaggttgtggtgagattgtgaatgataattgttgatgataagtgtgcttggtgagtact 24266438  T
Q  572 tgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaattta 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266437 tgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgtgaagtactcggaattgattttaattcatatatgctcaaattta 24266338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 7469241 - 7468854
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatac 111  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7469241 tttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagctgattaatgaatac 7469142  T
Q  112 atgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7469141 atgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgggcgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 7469042  T
Q  212 tgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattat 309  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||    
T  7469041 tgattaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgtttgtatgtccatgcatcat 7468942  T
Q  310 cgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7468941 agtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaacgaggtatacttttacatagttgtttgtaagaggaggtgtactcttacataagatgt 7468854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Original strand, 38636865 - 38637236
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38636865 atatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttatattatgagaagttatatgaagttgttgaactatatgatatagttggagtggattaatgaa 38636964  T
Q  109 tacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38636965 tacatgttgatgaattatgatatgttgatgatgactcttaattgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttga 38637064  T
Q  209 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  38637065 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacat--------tgtatgtttatgttgagtagtttgcattatggagtctttgcttatgtccatgcatca 38637156  T
Q  309 tcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38637157 tcgtcatatc---------gagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgt 38637236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 506
Target Start/End: Original strand, 24553786 - 24554271
Alignment:
Q  20 aaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 119  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||  ||| |||||||    |||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24553786 aaggtgttgtattttcctgctttacttggatggtgataagttgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgat 24553885  T
Q  120 gaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaat 219  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24553886 gaattgtgatattttcgagatgactcttaattgaataatgacatgttgcttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattattgttgaagttgatcaat 24553985  T
Q  220 gtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| || |||||||    
T  24553986 gtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatggtgagtaatttgcattattgagtctttgcttgtatgttcatgcatcatagtcatat 24554085  T
Q  318 caaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnn 417  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||            
T  24554086 cgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgt-tgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttgacatc---ttgtt 24554181  T
Q  418 nnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataa 506  Q
               |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24554182 gttgttgattggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcatatttgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataa 24554271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 89 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 29296810 - 29296506
Alignment:
Q  89 agttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatactt 188  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29296810 agttgaagttgattaatgaatacatgttgatgtactatgatattt-ggtgatgactcttaaataaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatactt 29296712  T
Q  189 gataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtct 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  29296711 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttggtg--tgtatgagttgagtag-ttgcattatttggtct 29296615  T
Q  289 ttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttac 388  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29296614 ttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttac 29296515  T
Q  389 ataagatgt 397  Q
    ||| |||||    
T  29296514 atatgatgt 29296506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15932246 - 15931935
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    |||||| |||| ||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15932246 aactatgtgatgtagatgaagt--attaatgaatgcatattgatgaattgtgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 15932150  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      |||||||||||| |||    
T  15932149 gatgtaaatgcttgataatgcaaatgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgttg------tatgttgagtag-ttg 15932057  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||    
T  15932056 cattatttggtctttgcttatgttcatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatatttttgcttaagtgga 15931957  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||| ||||||| |||||    
T  15931956 ggtgtacttttacatatgatgt 15931935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 26010358 - 26010053
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26010358 aactatgtgatgtagttgaagttaattaatgaatacaagttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 26010260  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    |||||        ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||      ||||||||| |    
T  26010259 gatgt--------gataatgcaattgttgttgaagttaggcaatttaattggaggtgtaattttacattgtattgttgtatgt------tgagtagtt-g 26010175  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26010174 cattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcataagagga 26010075  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  26010074 ggtgtactcttacatatgatgt 26010053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 375
Target Start/End: Original strand, 23227380 - 23227584
Alignment:
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||    
T  23227380 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatttttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtg--tgtatgaattga 23227477  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23227478 gtag-ttgcattattcggtcttttcttatgtccatgcattatcgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgca 23227576  T
Q  368 taagagga 375  Q
    ||||||||    
T  23227577 taagagga 23227584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 398
Target Start/End: Original strand, 19332951 - 19333214
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  19332951 tggtgatgactctttattgaattataacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgatcaatgtaaatggaggtg 19333050  T
Q  233 tacttttacattgt-gttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||     |||| |   |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  19333051 tacttttacattgttgttggtgaatgt-----ttgatt---ttgcattattgagtctttgctcgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatga 19333142  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaa---gaggatgtgtactcttacataagatgta 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19333143 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggaggtgtactcttacatatgatgta 19333214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17265744 - 17265495
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17265744 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 17265645  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  |||| |      ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||          | ||||||||    
T  17265644 tacttttacattgttgttggtgaatg--tatgct------tttgcattattgagtctttgcttgtatgtccatgcatcat----------agtcatatga 17265563  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17265562 gaaatgtaaaaagaggtgtacttttacatagttgttcataagaggaggtgtactcttacatatgatgt 17265495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 17284130 - 17283885
Alignment:
Q  126 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaatt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17284130 tgatattttggtggtgactcttaattgaattatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaatt 17284031  T
Q  226 ggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcat 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||   ||| |||    ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| || |          ||||    
T  17284030 ggaggtgtacttttacattatgttgttgtgagt---tgtggag----ttgcattatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattg----------tcat 17283949  T
Q  326 atgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  17283948 atgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgtgtaagaggaggtgtattcttaca 17283885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 429 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 29296461 - 29296280
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagat 528  Q
    |||||| ||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||  |||||||||| || |||  | || ||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  29296461 gtaccacatgcatgtaggtgtcagatttaggcgcattgcatattggcatgagtcgtgatggttatatgtaaatgataattgttgatgattttgatgagat 29296362  T
Q  529 tgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatat 610  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29296361 tgtaaatgataattgtggatgataagtgtgattggtgaatacttaatcgtgttatttgggattgttacatgaatgtgtatat 29296280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Original strand, 45560326 - 45560411
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttg 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  45560326 ttttctcctttacttggattgtgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttg 45560411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24238389 - 24238291
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  24238389 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatataaatggaggt 24238291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25608891 - 25608794
Alignment:
Q  118 atgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 214  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25608891 atgaatgatgataatgtggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 25608794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 41662459 - 41662360
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41662459 ttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcac-cccctcttttttattgagcgattttgcaccccatctttttgcccc 41662361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25295027 - 25294943
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  25295027 ttttctcctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgtt 25294943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25757047 - 25756963
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  25757047 ttttctcctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgtt 25756963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 3845254 - 3845316
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3845254 ttttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 3845316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 677 - 772
Target Start/End: Original strand, 765736 - 765831
Alignment:
Q  677 cttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  765736 cttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgca-ccccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 765831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 24554264 - 24554405
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | |  |||||| |||    
T  24554264 aatgataattattgatgataagtgtgtttggtgagtacttattcgtgatatttggaattgctatgtgaaggtgtatattgaattgaatgcttatgttaag 24554363  T
Q  633 tactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| | ||     ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24554364 tacttggaacttgatttaattcaaatatgttcaaatttattt 24554405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 772
Target Start/End: Original strand, 43245869 - 43245968
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43245869 ttggcttaattgcactttttccccctatcttttgataattgtgcgattttgca-ccccctcttttttattgagcgattttgcaccccatctttttgcccc 43245967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Original strand, 12281124 - 12281221
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12281124 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgca-cctcctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 12281221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 16928942 - 16928997
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928942 ggcttaattgcactttccccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 16928997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25609104 - 25609017
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 119  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  25609104 ttttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaactatatgatatagttgatgtggattaatacatatatgttgat 25609017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 231
Target Start/End: Original strand, 45560530 - 45560636
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaa 223  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||    
T  45560530 atgatagtctggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataa 45560628  T
Q  224 ttggaggt 231  Q
    ||||||||    
T  45560629 ttggaggt 45560636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 538 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 7468772 - 7468694
Alignment:
Q  538 taattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaatt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7468772 taattgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttattcgtgatatttgaaattgctatgtgaaggtgtatattgaatt 7468694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 37752473 - 37752415
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37752473 tttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 37752415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 15156241 - 15156142
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15156241 ttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgtcaattgtgcgattttgcac-cccctcttttttttttagcgattttgcaccccatctttttgcccc 15156143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 16929298 - 16929241
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16929298 ttggcttaattgcacttttctcccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 16929241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33171102 - 33171010
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggagg 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  33171102 tgatgactcttaattgaattatgacctgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggagg 33171010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7468828 - 7468764
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttg 492  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7468828 gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcatatttgacatgagtcgtaattgttg 7468764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Original strand, 37752082 - 37752138
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37752082 ttggcttaattgcacttttcccccctatgttttgctaattgtgcgattttgcacccc 37752138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 670 - 726
Target Start/End: Original strand, 43162229 - 43162285
Alignment:
Q  670 tatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43162229 tatttggcttaattgcacttttccccctatattttgttaattgtgcgattttgcacc 43162285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 15155883 - 15155938
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15155883 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 15155938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 231
Target Start/End: Original strand, 18042873 - 18042979
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaa 223  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||    
T  18042873 atgataatgtggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataa 18042971  T
Q  224 ttggaggt 231  Q
    ||||||||    
T  18042972 ttggaggt 18042979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43246230 - 43246175
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43246230 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgtgattttgcaccccc 43246175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11543561 - 11543487
Alignment:
Q  43 acttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttg 117  Q
    ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  11543561 acttgaattgtgagaaatagtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttg 11543487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 12281483 - 12281425
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12281483 tttggcttaattgcacttttcccccttatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 12281425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22312716 - 22312642
Alignment:
Q  43 acttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttg 117  Q
    ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  22312716 acttgaattgtgagaaatagtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttg 22312642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 13936723 - 13936776
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13936723 ggcttaattgcacttttccccctatcttttaccaattgtgcgattttgcacccc 13936776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 26009910 - 26009805
Alignment:
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatg 627  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||  ||||| ||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  26009910 ttgtgaatgatgtttgttgatgataagtgtacttggtgaatacttggtcgtattattttggaatgttatgtaaaggtacatattgaattaactatttatg 26009811  T
Q  628 tgaagt 633  Q
    | ||||    
T  26009810 ttaagt 26009805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Original strand, 34313762 - 34313818
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34313762 tttggcttaattgcacttttcccc-tatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 34313818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 39724105 - 39724048
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39724105 tttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 39724048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 673 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 3464001 - 3463903
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||         ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3464001 ttggcttaattgcacttttcccccctatattttgctaattgtgcgatcttgca-ccctctcctttgttttgagcgattttgcaccccatctttttacccc 3463903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22312212 - 22312140
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22312212 gtaccacatgcatatatgtgtcggaattaggcgcatatcatattggcatgagtcttaattgttgcatgtgaat 22312140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 677 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 23123567 - 23123516
Alignment:
Q  677 cttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123567 cttaattgcactttcccct-tatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 23123516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 728
Target Start/End: Original strand, 74688 - 74739
Alignment:
Q  677 cttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74688 cttaattgcacttttccctccatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 74739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 682 - 729
Target Start/End: Original strand, 7127660 - 7127707
Alignment:
Q  682 ttgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7127660 ttgcacttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcatcccc 7127707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11543358 - 11543283
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11543358 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttga 11543283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22312513 - 22312438
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22312513 tggtgatgactcttaatttatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 22312438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9823415 - 9823361
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9823415 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 9823361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Original strand, 22498497 - 22498570
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 106  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  22498497 ttttctcctatacttggaatatgagaagt-gtatggagtggttgaactatattatatagttgatgttgattaatg 22498570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 25609213 - 25609107
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtgga-ttaatgaata 110  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || | |||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  25609213 tttatcataaggcgttgtattttcctcctttacttggatgataataagttgtgcgaagttgttgaaccataggatatagttgaagttgatttaacgaata 25609114  T
Q  111 catgttg 117  Q
    |||||||    
T  25609113 catgttg 25609107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 13027338 - 13027281
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13027338 tttggtttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 13027281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 22851387 - 22851444
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22851387 tttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgtcaattgtgcgattttgcacccc 22851444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5851983 - 5851844
Alignment:
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatg 627  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||||| |||||  |||||| |||| |  ||||||    
T  5851983 ttgtgaatgatgtttgttgatgataagtgtgcttggtgaatacttgaccgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattggattatccgtttatg 5851884  T
Q  628 tgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaat 668  Q
    | |||| || | ||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  5851883 ttaagtgcttgtaattga-tttaactcatatatgctcaaat 5851844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 726
Target Start/End: Original strand, 13026635 - 13026687
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13026635 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacc 13026687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 22498625 - 22498697
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22498625 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacgtgattatgcaattgttgttga 22498697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 682 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 9930885 - 9930842
Alignment:
Q  682 ttgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9930885 ttgcactttcccccttatcttttgttaattgtgcgattttgcac 9930842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 41662107 - 41662162
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcac-tttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41662107 ggcttaattgcacattttccccatatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 41662162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 678 - 727
Target Start/End: Original strand, 15042148 - 15042198
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15042148 ttaattgcactttccccccttatcttttgccaattgtgtgattttgcaccc 15042198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 18020140 - 18020087
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18020140 ggcttaattgcacttttaccc-tatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 18020087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 19332725 - 19332787
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19332725 ttttcttctttacttggattgtgaggaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttga 19332787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 34498609 - 34498555
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34498609 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgcaaattgtgcgattttgcacccc 34498555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43162588 - 43162538
Alignment:
Q  679 taattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  43162588 taattgcacttttccccctatcttttgtcaatcgtgcgattttgcaccccc 43162538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 43598790 - 43598756
Alignment:
Q  693 cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598790 cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 43598756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 696 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 75016 - 74983
Alignment:
Q  696 ctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75016 ctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 74983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 9822745 - 9822802
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  9822745 tttggcttaattgcacttttcacccctatcttttatcaattgtgcgattttgcacccc 9822802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 23123335 - 23123392
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  23123335 tttggcttaattgcacttttccctcctatcttttgtcaattgtgcgattttacacccc 23123392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24270997 - 24270964
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270997 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgt 24270964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 25438789 - 25438846
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25438789 tttgacttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 25438846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 37397202 - 37397145
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37397202 tttggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcccccc 37397145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 725
Target Start/End: Original strand, 11007561 - 11007613
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    ||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007561 ttggcttaattacatttttcctgctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 11007613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18179135 - 18179083
Alignment:
Q  157 atgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaa 209  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  18179135 atgacttgttgattgtatggatgtaagtatttgataatgcaattgttggtgaa 18179083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 33170807 - 33170719
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagat 517  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| ||  ||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  33170807 gtaccacatgcatatatgtgtcgggattaggcgcatatcatattggcatgagtcttatgtgttgcatgtgaatgatgactgttgaagat 33170719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 37654972 - 37655040
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 205  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37654972 tgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37655040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 767759 - 767720
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtg 714  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  767759 ggcttaattgcacttttccccctatcttttgttaattgtg 767720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 694 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 9465908 - 9465873
Alignment:
Q  694 ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9465908 ccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 9465873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18033012 - 18032943
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggatgtgtactcttac 388  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||   | |||||||||| ||||||||||||    
T  18033012 tcatatgaaaaatgtaaaatgaagtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggaggtgtactcttac 18032943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 23116143 - 23116214
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||| || |  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116143 tgatgattctcaattgaattatgacttgattgttgtgtgtacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 23116214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 678 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 7127973 - 7127923
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaa-ttgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7127973 ttaattgcacttttttccctatcttttgctaatttgtgcgattttgcaccc 7127923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 13937443 - 13937389
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  13937443 ggcttaattgcacttttcccccctattttttgtcaattgtgcgaatttgcacccc 13937389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18033201 - 18033091
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaac-aatgtaattggaggtgtac 235  Q
    |||||||||||  ||||||  | || |||| ||||| |||||   ||||||||||||||||  || ||||||  | |||  |||||||||||||||||||    
T  18033201 tgatgactcttgtttgaattgtaacttgttgattgtgtggattgtaatacttgataatgcatatggtgttgatttagaaagaatgtaattggaggtgtac 18033102  T
Q  236 ttttacattgt 246  Q
    |||||||||||    
T  18033101 ttttacattgt 18033091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 37396708 - 37396762
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37396708 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccgattgtgcgattttgcacccc 37396762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 742 - 772
Target Start/End: Original strand, 37752181 - 37752211
Alignment:
Q  742 gagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37752181 gagcgattttgcaccccatctttttgccccc 37752211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 743 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 74971 - 74942
Alignment:
Q  743 agcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74971 agcgattttgcaccccatctttttgccccc 74942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 724
Target Start/End: Original strand, 3307335 - 3307388
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3307335 tttggcttaattgcatttttcacccctatcttttgtcaattgtgcgattttgca 3307388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 3463642 - 3463694
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3463642 ggcttaattacattttcccc-ctatcttttgttaattgtgcaattttgcacccc 3463694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 724
Target Start/End: Original strand, 6092777 - 6092825
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6092777 ggcttaattgcattttcccc-ctatcttttgtcaattgtgcgattttgca 6092825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 728
Target Start/End: Original strand, 9623495 - 9623556
Alignment:
Q  668 tttatttggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9623495 tttatttggcttaattgcactttttctcactatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 9623556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 678 - 726
Target Start/End: Original strand, 22786843 - 22786892
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22786843 ttaattgcactttttccccctatcttttactaattgtgtgattttgcacc 22786892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 24473340 - 24473397
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24473340 tttggcttaattgcactttttccccctatagtttgccaattgtgtgattttgcacccc 24473397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 724
Target Start/End: Original strand, 33747984 - 33748033
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33747984 ggcttaattgcacttttttccatatcttttgctaattgtgtgattttgca 33748033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 29912984 - 29912388
Alignment:
Q  74 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgta 173  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| |||||     
T  29912984 tgaactataaaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttggggacgactcttaatggaatgatgacatgttgattgtg 29912885  T
Q  174 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29912884 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgtaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 29912785  T
Q  274 tgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagag 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29912784 tgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagag 29912685  T
Q  374 gatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatatta 473  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||                   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29912684 gaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc---ttgttgttgttgtttggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcatattg 29912588  T
Q  474 acatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  29912587 acatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtgatgaga-tgtgaatgataattgttgattataagtatgcttggtgaatacttg 29912489  T
Q  574 atcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttatt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29912488 atcgtgatatttgggattgttatatgaatgtgcatattgaattaaatgtttatgtgaagtactcggaatcgactttaattcatatatgctcaaatttatt 29912389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 24083047 - 24082455
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24083047 agttgatgaactatagaatatagttgaagttaattaatgattatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttg 24082948  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24082947 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgatgcatgtatatgttga 24082848  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24082847 gtagtttgcattattgggtctttacttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcgtatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 24082748  T
Q  368 taagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagc 467  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24082747 taagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttgccatc---ttgttgttgttgtttggtaccaaatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagc 24082651  T
Q  468 atattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgac 567  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24082650 atattgacatgagtcgtgattgttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtg-----------aatgataattgttgatgataagtgtgcttgttgag 24082562  T
Q  568 tacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaa 667  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24082561 tatttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactctctatgtgaagtactcgaaatggactttaattcatatatgctcaaa 24082462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 68 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6455611 - 6455283
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6455611 agttgatgaactataaaatataattgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttg 6455512  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6455511 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggatgtgtactcttacattgcgttggtgtatgtatatgttga 6455412  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6455411 gtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatagtcataacgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgt-tg 6455313  T
Q  368 taagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6455312 taagaggaggtgtactcttacctaagatgt 6455283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 72 - 513
Target Start/End: Original strand, 26561057 - 26561491
Alignment:
Q  72 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattg 171  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26561057 gttgaactataa-atatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatatgttggtgatgactcttaattgaataacgacatgttgattg 26561155  T
Q  172 tatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 271  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  26561156 tgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtg------tatgttgagtag 26561249  T
Q  272 tttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  26561250 tttgcattattgagtttttgcttgtatgtccatgcatcataatcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtttgta 26561349  T
Q  370 agaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||                   |||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26561350 agaggatgtgtacttttacataagatgtgcggttggcatc---ttgttgttgttggttggtaccgcatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcgtagcat 26561446  T
Q  470 a-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttga 513  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  26561447 atttgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattgttga 26561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 73 - 402
Target Start/End: Original strand, 5622699 - 5623024
Alignment:
Q  73 ttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgt 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5622699 ttgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgt 5622798  T
Q  173 atggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagt 272  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  5622799 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtacttttacattgtgttggtg------tatgttgagtagt 5622892  T
Q  273 ttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaa 370  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  5622893 ttgcattattgagtctttgctcgaatgtccatgcatcataatcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtatttttacataattgtttgtaa 5622992  T
Q  371 gaggatgtgtactcttacataagatgtatggt 402  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5622993 gaggaggtgtactcttgcataagatgtttggt 5623024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 242
Target Start/End: Original strand, 33627613 - 33627823
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33627613 ttttctcctttacttgtattatgaaaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagttgattaataaatacatgttgatgaattgtgatat 33627712  T
Q  132 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33627713 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgactgtgtggacgtaaatactggataatgcaattgtggttgaagttgatcaatgtaaatggaggt 33627812  T
Q  232 gtacttttaca 242  Q
    |||||||||||    
T  33627813 gtacttttaca 33627823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 397
Target Start/End: Original strand, 21224000 - 21224277
Alignment:
Q  99 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21224000 gattaatgaatgagtgttgatgaattgtgatattttggtg--gactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 21224097  T
Q  199 ttgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatat 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||    |||| |||||  || ||||| ||| |    
T  21224098 ttgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagt-tatg--gag----ttgcgttatttggtttttgc-tatgt 21224189  T
Q  299 ccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||| ||           ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  21224190 ccatgcatcat----------tatcatatga-aaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttttgcgtaataggaggtgtactcttacatatgatgt 21224277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21108394 - 21108173
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtac 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21108394 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac 21108295  T
Q  236 ttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaa 332  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||         | ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| || |||||||  | |||||||||||    
T  21108294 -tttacattgttgttggtgaatgtat--------gattttgcattattgagtctttgcttgtgtgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaa 21108204  T
Q  333 atgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21108203 atgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg 21108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 246
Target Start/End: Original strand, 14343079 - 14343199
Alignment:
Q  126 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaatt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  14343079 tgatattttggtgataactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaa 14343178  T
Q  226 ggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  14343179 ggagatgtacttttacattgt 14343199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 540 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 6455179 - 6455045
Alignment:
Q  540 attgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcga 639  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||      
T  6455179 attgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttgatcgtgatatttggaatggttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagtattcat 6455080  T
Q  640 aaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    ||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6455079 aatttgatttaattcatatatgctcaaatttattt 6455045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 5623119 - 5623260
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5623119 aatgatgattgttgatgataagtgcatttgatgagtacttaatcgtgataattggaattgttaggtgaatgtgtatattgaattaactatttatgttaag 5623218  T
Q  633 tactc-gaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
     |||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5623219 cactcagaacttga-tttaattcatatatgctcaaatttattt 5623260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 18532161 - 18532295
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgag 268  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  18532161 ttgtgtggacgtaattacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatg--taagttgag 18532258  T
Q  269 tagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatt 307  Q
    ||  ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  18532259 ta-attgcattgttgggtctttgc-tatgtccatgcatt 18532295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 22055125 - 22055259
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgag 268  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||    
T  22055125 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggatgtgtacttttacattgtgttgatgtatg--taagttgag 22055222  T
Q  269 tagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatt 307  Q
    ||  ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22055223 ta-attgcattgttgggtctttgc-tatgtccatgcatt 22055259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 772
Target Start/End: Original strand, 18433013 - 18433112
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18433013 ttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca-ccccatctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgcccc 18433111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 22428934 - 22428987
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22428934 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 22428987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 20455205 - 20455305
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  20455205 ttttctcctttacttgaattgtgagaaactgaatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 20455304  T
Q  132 t 132  Q
    |    
T  20455305 t 20455305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21108586 - 21108505
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21108586 tttaccataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttga 21108505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Original strand, 24226695 - 24226861
Alignment:
Q  33 tttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatga--attatgata 130  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||       |||||  || |||||||  || ||||||    
T  24226695 tttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatgtagttgatgt-------tgaat-gatattgatgattatgatgata 24226786  T
Q  131 ttttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 205  Q
     | || |||||||||||| |||||| ||||| ||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24226787 atgtgatgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 24226861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 26561477 - 26561618
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| || || | |||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| |||    
T  26561477 aatgataattgttgatgataaatgtgcttggtgagtacttattcgtgatgttaggaactgttatgtgaagatgtatattgaattgaatgcttatgttaag 26561576  T
Q  633 tactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| | ||   | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26561577 tacttggaacttaatttaattcatatatgttcaaatttattt 26561618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 332 - 409
Target Start/End: Original strand, 33627798 - 33627875
Alignment:
Q  332 aatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatc 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33627798 aatgtaaatggaggtgtacttttacaaagttgattgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtgtggttggcatc 33627875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11965008 - 11964921
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 119  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  11965008 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactaaataatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgat 11964921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 772
Target Start/End: Original strand, 34576865 - 34576962
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34576865 ttggtttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttacacccca-tctttttttt-gagcgattttgcaccccatctttttgccccc 34576962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 22429249 - 22429196
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22429249 ggcttaattgcatttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 22429196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 675 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 25116115 - 25116058
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccct 731  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25116115 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcacccccct 25116058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11964795 - 11964720
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11964795 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 11964720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 18433370 - 18433315
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18433370 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 18433315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 727
Target Start/End: Original strand, 23011076 - 23011131
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23011076 tttggcttaattgcatttttccccttatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 23011131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Original strand, 25115757 - 25115854
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115757 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgtgattttgca-ccccctttttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 25115854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Original strand, 25174849 - 25174946
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174849 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgtgattttgca-ccccctttttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 25174946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 25175205 - 25175150
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25175205 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 25175150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Original strand, 26020450 - 26020547
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||         ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26020450 ggcttaattgcacttttcctccctatcttttgctaattgtgcgattttgca-ccccatctttttttttgagcgattttgcaccgcatctttttgccccc 26020547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 34577218 - 34577164
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34577218 tggcttaattgcactttttcccctatcttttgctaattgtgtgattttgcacccc 34577164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 37610674 - 37610620
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37610674 tttggcttaattgtactttcccccctatagtttgctaattgtgcgattttgcacc 37610620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Original strand, 20833224 - 20833301
Alignment:
Q  39 ctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||    
T  20833224 ctttacttgtattgtgagaaataatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgtt 20833301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 727
Target Start/End: Original strand, 41382896 - 41382945
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41382896 ttaattgcattttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccc 41382945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 41383220 - 41383167
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41383220 ggcttaattgaacttttccccctattttttgctaattgtgcgattttgcacccc 41383167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 18817667 - 18817611
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18817667 ttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 18817611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23414204 - 23414117
Alignment:
Q  18 ataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 106  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  23414204 ataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatg 23414117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 9665882 - 9665828
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9665882 tttggcttaattccacttttccccctatcttttgctaattgtgc-attttgcaccc 9665828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 229
Target Start/End: Original strand, 20455419 - 20455513
Alignment:
Q  135 ggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggag 229  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  20455419 ggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgccattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 20455513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 16466796 - 16466746
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16466796 ggcttaattgcacttttcccccctatattttgctaattgtgcgattttgca 16466746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 501
Target Start/End: Original strand, 5623049 - 5623121
Alignment:
Q  430 taccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5623049 taccacatgcatgtatgtgtcggaattaagcgcataacatatttggcatgagtcgtaattgttgcatgtgaat 5623121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 12441367 - 12441320
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattt 720  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12441367 tttggcttaattgcacttttcccc-tatcttttgctaattgtgcgattt 12441320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 14342875 - 14342959
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    |||||||| ||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||    
T  14342875 ttttctccattaattgaattgtgagaaatggtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgtt 14342959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 22729492 - 22729440
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22729492 gcttaattgcacttttccccctataatttgccaattgtgcgattttgcacccc 22729440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 726
Target Start/End: Original strand, 31569910 - 31569958
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31569910 ttaattgcacttttccccctatcttttgtcaattgtgcgattttgcacc 31569958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 672 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 37780799 - 37780744
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37780799 tttggcttaattgtacttttcccccctatagtttgctaattgtgcgattttgcacc 37780744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Original strand, 9665560 - 9665609
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9665560 ttaattgcacttttcccc-tatcttttgctaattgtgcaattttgcacccc 9665609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 12498567 - 12498621
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12498567 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 12498621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 12498982 - 12498928
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12498982 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 12498928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 18816952 - 18817006
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18816952 ggcttaattgcatttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 18817006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26571218 - 26571164
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26571218 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 26571164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 678 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 41383100 - 41383048
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatctttt---gctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  41383100 ttaattgcactttcccccctattttttttggctaattgtgcgattttgcaccc 41383048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 6455257 - 6455184
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  6455257 gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcacattgcatagttgacatgagttgtaattattgcatgtgaat 6455184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Original strand, 19514524 - 19514580
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccc--tatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19514524 tggcttaattgcactttcccccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 19514580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 23011432 - 23011383
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23011432 ttaattgcactttttcccttatcttttgttaattgtgcgattttgcaccc 23011383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 37610202 - 37610255
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37610202 ggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgtgattttgcacccc 37610255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 37780320 - 37780373
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37780320 ggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgtgattttgcacccc 37780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Original strand, 3888237 - 3888293
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcac-tttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3888237 ttggcttaattgcacatttcccccctatagtttgccaattgtacgattttgcacccc 3888293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 11964494 - 11964434
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattg 489  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  11964494 gtaccacatgcatgtatgtgtcgggattaggcgcatataatattgacatgagtcttaattg 11964434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 17301584 - 17301620
Alignment:
Q  163 tgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaat 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17301584 tgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaat 17301620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 725
Target Start/End: Original strand, 22729006 - 22729058
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  22729006 ttggcttaattgcacttttccccctatagtttgtaaattgtgcgattttgcac 22729058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 5187884 - 5187829
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5187884 ggcttaattgcacttttgccccttatcttttgttaattgtgcaattttgcaccccc 5187829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 11351478 - 11351427
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11351478 ttaattgcacttttcactcctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 11351427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Original strand, 21207229 - 21207280
Alignment:
Q  678 ttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21207229 ttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 21207280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Original strand, 24851786 - 24851853
Alignment:
Q  131 ttttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||||||||||||||   |  || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24851786 ttttggtgatgactcttttgttgattatgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 24851853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 43464245 - 43464194
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  43464245 ggcttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacc 43464194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 692 - 726
Target Start/End: Original strand, 16726096 - 16726130
Alignment:
Q  692 ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16726096 ccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacc 16726130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 19515017 - 19514963
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  19515017 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 19514963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Original strand, 43463759 - 43463809
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43463759 ttaattgcacttttccccttatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 43463809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 2817631 - 2817582
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgatttt 721  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2817631 tttgacttaattgcacttttccccctatagtttgcgaattgtgcgatttt 2817582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 673 - 726
Target Start/End: Original strand, 12441040 - 12441093
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  12441040 ttggcttaattgcacttttttccctatcttttattaattgtgcaattttgcacc 12441093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 38763772 - 38763115
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 108  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38763772 atatttatcattaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 38763673  T
Q  109 tacatgttgatgaatta-tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 207  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38763672 tacatgttgatgaatttgtgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatggcatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttg 38763574  T
Q  208 aagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatt 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  38763573 aagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccatgcatc 38763480  T
Q  308 atcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgaca 407  Q
    || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  38763479 attgtcatatcatgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagatgaggtgtactcttacataagatgtgcggttggca 38763380  T
Q  408 tcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcat-attaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataa 506  Q
    ||                   |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  38763379 tc---ttgttgttgttatttggtaccacatgcatatatgtgtcggaattaggcgcattgcataattaacatgagttgtaattgttgcatgtgaatgataa 38763283  T
Q  507 atgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgt 606  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38763282 ttgttgaagattgtgatgagattgtgaatgataattgttgatgataagtgtgcttggtgaatacttgatcatgatatttgaaattgttatgtgaatgtgt 38763183  T
Q  607 atattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38763182 atattgaattaactgtttatgtgaaatactcggaattgactttaattcatatatgctcaaatctattt 38763115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 12733139 - 12732754
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatac 111  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12733139 tttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttgtattgtgagaaatggtgcgaagttgttgaactataggatatagttgaagttgattgatgaatac 12733041  T
Q  112 atgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12733040 atgttgattaattgtgacattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgacgattgtgtggacgcaaatacttaataatgcaattgttgttgaagt 12732941  T
Q  212 tgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctt-tgcttatatccatgcattatc 310  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||| ||     
T  12732940 tgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtattcgttgagtagtttgcattattgagtcttgtttgtatgtccatgcatcata 12732841  T
Q  311 gtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12732840 gtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaagaaggtgtacttttacatagttgatcgtaagaggaggtgtactcttatataagatgt 12732754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18275739 - 18275414
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18275739 aactatgtgatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 18275641  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |      ||||||||||||  |     
T  18275640 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgtcg------tatgttgagtag-gta 18275548  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18275547 cattatttggtcttttcttatgtccatacattattgtcatatcgagtcatatgataaatggaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 18275448  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgtatggttgacatc 409  Q
     ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  18275447 ggtgtactcttacatatgatgtgcggttgacatc 18275414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42707684 - 42707399
Alignment:
Q  69 gttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaa 168  Q
    |||| |||||||| | |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  42707684 gttgatgaactatgtaatatagttaaagttgattattggatatatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgactcttgattgaataatgacatgctga 42707586  T
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgag 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  42707585 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaattgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgta--tataagttgag 42707488  T
Q  269 tagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacat 358  Q
    ||| ||||||||||  || ||||||||| || ||| || || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42707487 tag-ttgcattattcggtatttgcttatgtctatggatcatagtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacat 42707399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 409
Target Start/End: Original strand, 7187277 - 7187509
Alignment:
Q  174 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||    
T  7187277 tggatgtaaatacttgatagtgcaattgttggtggagttgagcaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgt--gtatgaattgagtagtt 7187374  T
Q  274 tgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagag 373  Q
     ||||||||   ||||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7187375 -gcattattcgttctttgcttatgtccatgcatattcgtcatatcgagtcatatgtgaaatggaaaaggagatgtacttttacatagttgcgcgtaagag 7187473  T
Q  374 gatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatc 409  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7187474 gaggtgtactcttacatatgatgtgtggttgacatc 7187509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 18240949 - 18241084
Alignment:
Q  20 aaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 119  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| ||  ||| ||||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18240949 aaggtgttgtattttcctcttttacttggatggtgataagttgtgtaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgat 18241048  T
Q  120 gaattatgatattttggtgatgactcttaattgaat 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18241049 gaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaat 18241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 389
Target Start/End: Original strand, 19823806 - 19824003
Alignment:
Q  174 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 273  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||    |    
T  19823806 tggatgtaaatgcttaataatgcaattgtggttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagt---tgtagag----t 19823898  T
Q  274 tgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagag 373  Q
    |||||||||  |||||||| ||| |||||| || || |          |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19823899 tgcattatttggtctttgc-tatgtccatgtatcattg----------tcatttgtgaaatataaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagag 19823987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 547 - 674
Target Start/End: Original strand, 7187637 - 7187763
Alignment:
Q  547 atgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagat 646  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||  ||     
T  7187637 atgataagtgtgattggtgaatacttgatcgtgctatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaattgtctatgtgaagtacctgaaattga- 7187735  T
Q  647 tttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7187736 tttaattcctatatgctcaaatctattt 7187763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 15676248 - 15676382
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgag 268  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||    
T  15676248 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttaaattgtgttggtgtatg--taagttgag 15676345  T
Q  269 tagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatt 307  Q
    || |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15676346 ta-tttgcattgttgggtctttgc-tatgtccatgcatt 15676382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 259
Target Start/End: Original strand, 10105523 - 10105613
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 259  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10105523 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 10105613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31114607 - 31114517
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 259  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31114607 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 31114517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 3930533 - 3930437
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3930533 ggcttaattgcacttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac-cccctcttttttttttagcgattttgcaccccatctttttgccccc 3930437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 16555873 - 16555774
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555873 ttggcttaattgcacttttcccccttatcttttgctaattgtgcgattttgca-ccccatctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgcccc 16555775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 667 - 729
Target Start/End: Original strand, 22681567 - 22681629
Alignment:
Q  667 atttatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22681567 atttaattagcttaattgcactttcccccctatcttttgtcaattgtgcgattttgcaccccc 22681629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24237733 - 24237655
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24237733 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgagtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 24237655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 54364894 - 54364992
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  54364894 tggtaatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggatgtaaacacttgataattcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggaggt 54364992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19558390 - 19558317
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaat 105  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  19558390 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatcgagttgttgaaccatatgatatagttgatgttgattaat 19558317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 238
Target Start/End: Original strand, 10115705 - 10115795
Alignment:
Q  150 ttgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt--tgaacaatgtaattggaggtgtacttt 238  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10115705 ttgaattatgacttgttgattgtgtggatgtaaaaacttgataatgcaaatgatgttgaatttatgaagaatgtaattggaggtgtacttt 10115795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 533 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 12732654 - 12732552
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||||| |  |||||| |||    
T  12732654 aatgatgattattgatgataagtgtgcttgatgagtacttattcgtgatatttgaaattgttatgtgaaact-tatattgaattaaatgcttatgttaag 12732556  T
Q  633 tact 636  Q
    ||||    
T  12732555 tact 12732552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13198960 - 13198905
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13198960 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 13198905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 213
Target Start/End: Original strand, 17213168 - 17213247
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttg 213  Q
    |||||||||||  | |||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17213168 tggtgatgacttcttattgaattgtgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcacttgttgttgaagttg 17213247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 35393829 - 35393775
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35393829 ggcttaattgcacttttcaccctatcttttgctaattgtgcgaatttgcaccccc 35393775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 56505693 - 56505747
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56505693 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 56505747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 26207361 - 26207414
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26207361 ggcttaattgcactttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 26207414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 5371807 - 5371906
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    ||||||||||| | || ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  5371807 ttttctcctttgcctgaattgtgagaaactgtatggagttgttga-ctatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 5371905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 16555515 - 16555570
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16555515 ggcttaattgcacttttcccccttatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 16555570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 18077256 - 18077201
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077256 ggcttaattgcacttttcacccctattttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 18077201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19558177 - 19558102
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19558177 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 19558102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 41257679 - 41257750
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41257679 tgatgactcttatttgaattatgacttgattgttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtggttga 41257750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 666 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 11241723 - 11241661
Alignment:
Q  666 aatttatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11241723 aattaattaggcttaattgtacttttccccctatcttttgccaattgtgggattttgcacccc 11241661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 12134860 - 12134922
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12134860 ttttctcttttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttga 12134922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 12732718 - 12732652
Alignment:
Q  436 atgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12732718 atgcatatatgtgtcggaattaggcgcataacatatttgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaat 12732652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Original strand, 18420208 - 18420320
Alignment:
Q  132 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt-tgaacaatgtaattggagg 230  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||   | ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  18420208 tttgatgatgactcttg-ttgaattaagacttgttgattgtgtggatgtaaa-acttgataatgcataaggtgttgaattatgaagaatgtaattggagg 18420305  T
Q  231 tgtacttttacattg 245  Q
    |||||||||||||||    
T  18420306 tgtacttttacattg 18420320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 42707324 - 42707202
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagat 528  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | |  ||| || |||| |||||||  || ||| |  ||    
T  42707324 gtaccacatgcatgtaggtgtcgtatttaggcgcattgcatattgacatgattcgtaattgctacttgtgtatgataattgttgaaacttatgaagcaat 42707225  T
Q  529 tgttaatgataattgttgatgat 551  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  42707224 tgtaaatgataattgttgatgat 42707202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 50678779 - 50678833
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50678779 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 50678833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Original strand, 3930176 - 3930233
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  3930176 tttggcttaattgcactttttcccctatcttttattaattatgcgattttgcaccccc 3930233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 8488534 - 8488481
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8488534 gcttaattgcacttttcgccttatctttttctaattgtgcgattttgcaccccc 8488481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24237879 - 24237783
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 106  Q
    ||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||  |||||||||| || ||||||||    
T  24237879 atatttatcataaggttttgtatttt-ctcctttacttggattataagaacgtgtatggagttgttgagatataatatatagttgatgttgattaatg 24237783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 32703707 - 32703650
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32703707 tttggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 32703650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 36096532 - 36096475
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36096532 tttggtttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 36096475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 49070817 - 49070721
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 106  Q
    |||||||  |||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  49070817 atatttatgataaggtgttgtattct-ctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatg 49070721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 17376668 - 17376768
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| || |||||||| ||||||| || | |||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  17376668 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggggttgttaaattatatgatttagttgatgttggttaatgcatatatgttgattgattgtgatat 17376767  T
Q  132 t 132  Q
    |    
T  17376768 t 17376768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 729
Target Start/End: Original strand, 27304716 - 27304771
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27304716 ttggcttaattgcccttttcccc-tatcttctgctaattgtgcgattttgcaccccc 27304771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 50679480 - 50679424
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50679480 ttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtacgattttgcacccc 50679424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Original strand, 5372022 - 5372116
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  5372022 tgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtcattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 5372116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8182227 - 8182168
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatctttt-gctaattgtgcgattttgcacccccctc 732  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8182227 ggcttaattgcacttttcacccctatttttttgctaattgtgcgattttgcacccccctc 8182168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18275280 - 18275154
Alignment:
Q  541 ttgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaa 640  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||||| |||| || | |    
T  18275280 ttgttgatgataagtgtgcttggtgaatagttgatcgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattcgattaaccgtttatgttaagtgcttgga 18275181  T
Q  641 aaagattttaattcatatatgctcaaat 668  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||    
T  18275180 attga-tttaactcatatatgctcaaat 18275154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 679 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 49178866 - 49178815
Alignment:
Q  679 taattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49178866 taattgcacttttctcccctatcttttgccaattgtgcgattttgcaccccc 49178815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 24775837 - 24775783
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24775837 ggcttaattgcacttttccctcctatcttttgtcaattgtgcgattttgcacccc 24775783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 28196346 - 28196400
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28196346 ggcttaattgcacttttcccccctataatttgccaattgtgcgattttgcacccc 28196400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 28196827 - 28196773
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28196827 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 28196773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 36095817 - 36095871
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36095817 ggcttaattgcatttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 36095871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 673 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 48406440 - 48406386
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48406440 ttggtttaattgtactttcccccctataatttgccaattgtgcgattttgcaccc 48406386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 54364658 - 54364735
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgata 87  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||    
T  54364658 atatttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaattatatgata 54364735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 729
Target Start/End: Original strand, 11241387 - 11241444
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11241387 ttggcttaattgcacttttcctccttatcttttgttaattgtgcgattttgcatcccc 11241444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 23539841 - 23539893
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23539841 ggcttaattgcactttccccc-tatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 23539893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 728
Target Start/End: Original strand, 25161879 - 25161932
Alignment:
Q  676 gcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25161879 gcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 25161932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 727
Target Start/End: Original strand, 39415244 - 39415277
Alignment:
Q  694 ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39415244 ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 39415277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 533 - 610
Target Start/End: Original strand, 50223854 - 50223931
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatat 610  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  | ||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  50223854 aatgatgattgttgatgataagtgtgtttgatgaatacatacttgtgatatttggaattgttgcatgaatgtgtatat 50223931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 4239422 - 4239366
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4239422 ttggcttaattgcactttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 4239366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 697 - 772
Target Start/End: Original strand, 13198626 - 13198701
Alignment:
Q  697 tatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13198626 tatcttttgccaattgtgcgattttgcaccccctcttttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 13198701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 675 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 22681933 - 22681881
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22681933 ggcttaattgcacttttccctcctatcttttgttaattgtgcaattttgcacc 22681881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 668 - 715
Target Start/End: Original strand, 49178526 - 49178574
Alignment:
Q  668 tttatttggcttaattgcac-tttcccccctatcttttgctaattgtgc 715  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49178526 tttatttggcttaattgcacttttctcccatatcttttgctaattgtgc 49178574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 50223487 - 50223555
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 205  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50223487 tgatgactctttattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttaataatgcaattgttgt 50223555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 7603473 - 7603422
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  7603473 tggcttaattgcactttttcccctatctttttacaattgtgcgattttgcac 7603422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 729
Target Start/End: Original strand, 8181992 - 8182047
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttc-ccccctatc-ttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8181992 gcttaattgcacttttgccccctatcgttttgccaattgtgcgattttgcaccccc 8182047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 9380795 - 9380744
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  9380795 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcac 9380744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 10238780 - 10238851
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |  |  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10238780 tgatgactcttaattggattatgactttattgttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttga 10238851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 27304943 - 27304892
Alignment:
Q  680 aattgcactttc-ccccctatctttt-gctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27304943 aattgcactttttccccctatctttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 27304892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 54509151 - 54509116
Alignment:
Q  692 ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54509151 ccccctattttttgctaattgtgcgattttgcaccc 54509116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 5205988 - 5206042
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  5205988 ggcttaattgcacttttcctccctatcttttgttaatttggcgattttgcacccc 5206042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 674 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 5206284 - 5206231
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5206284 tggcttaattgcacttttcccccttatcttttt-taattgtgcgattttgcaccc 5206231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 9023244 - 9023298
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9023244 ggcttaattgcacttttctcccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 9023298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9023734 - 9023680
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  9023734 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 9023680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 9380307 - 9380361
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9380307 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcccccc 9380361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Original strand, 13908430 - 13908472
Alignment:
Q  157 atgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13908430 atgacttgttaattgtatggatgtaaatgcttgatactgcaat 13908472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14617823 - 14617785
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14617823 tcatatgagaaatgtaaaatgaggtgtacctttacatag 14617785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26207800 - 26207746
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26207800 ggcttaattgcatttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 26207746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 32703225 - 32703279
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32703225 ggcttaattgcacttttcccccctataatttgccaattgtgcgattatgcacccc 32703279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 39744519 - 39744465
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  39744519 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 39744465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 43051306 - 43051252
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43051306 ggcttaattgcatttttcacccctatcttttgccaattgtgtgattttgcacccc 43051252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 696 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 47219233 - 47219203
Alignment:
Q  696 ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219233 ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 47219203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49070672 - 49070594
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||| || || ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49070672 tggttatgactcttaattgatctatgacttgattgattatgtggacgttaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 49070594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 169496 - 169439
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  169496 tttggcttaattgcatttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 169439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 729
Target Start/End: Original strand, 7603146 - 7603198
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  7603146 gcttaattgcacttttcccc-tatctttttttaattgtgcaattttgcaccccc 7603198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 728
Target Start/End: Original strand, 11529169 - 11529222
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11529169 gcttaattgcacttttcctccctaacttttgccaattgtgtgattttgcacccc 11529222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14617925 - 14617896
Alignment:
Q  217 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14617925 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 14617896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 25225452 - 25225399
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactt-tcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25225452 ggcttaattgcacttctgtctcctatcttttgccaattgtgcgattttgcaccc 25225399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 517 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 42707201 - 42707152
Alignment:
Q  517 ttgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatga 566  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42707201 ttgtgacgagattgtgaatgatgattattgatgataagtgtgtttgatga 42707152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Original strand, 47469662 - 47469754
Alignment:
Q  138 gatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||| |||||||| || || || |  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||| |||||||||||    
T  47469662 gatgactctgaattgaattataacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgtcg-aggtgatcaatataattggaggt 47469754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 48405962 - 48406015
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  48405962 ggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattatgcaattttgcacccc 48406015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 501
Target Start/End: Original strand, 50223791 - 50223856
Alignment:
Q  436 atgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| || |||||||| ||||||    
T  50223791 atgcatatatgtgtcgggattaggcgcatatcatattggcatgagtcttatttgttgcatgtgaat 50223856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 918
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  1518 agttgatgaactatagaatatagttgaagttgactaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacttcttg 1419  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1418 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttgcattgtgttggtgtatgtatatgttga 1319  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1318 gtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatctagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtttacttttacatagttgtgcg 1219  T
Q  368 taagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagc 467  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||                   ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1218 ttagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc---ttgttgttgttgtttggtaccatattcatgtatgtgttggaattaggcgcatagc 1122  T
Q  468 atattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgac 567  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  1121 atattgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattg-tgaagattgtcaagagattgtgaatgataattgttgatgataagtgtggttggtgag 1023  T
Q  568 tacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaa 667  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| | | ||     |||||||||||||||||||||    
T  1022 tggttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaattgtttatgttgagtagttggaatttgatttaattcatatatgctcaaa 923  T
Q  668 tttat 672  Q
    |||||    
T  922 tttat 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Original strand, 21405 - 21672
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgt 233  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  |||  | || ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| |  | |||||||| ||||| |||    
T  21405 tggtgatgattcttatttgaattgtgatttattgattgtgtggacgtaaatacttgataataaaattgttggtgaacta-atcaatgtaaatggagatgt 21503  T
Q  234 acttttacattgt-gttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctttgcttatat--ccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  21504 aattttacattgttgttggtgaatgtatatgtgaggtgattttgcattattgagtctttgcttgtatgtccatgcattatagtcatattgagtcatatga 21603  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtg-cgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21604 gaaatctaaaaggaggtgtaattttacataggtgagatgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 21672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 68 - 674
Target Start/End: Original strand, 4146937 - 4147525
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4146937 agttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttg 4147036  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  4147037 attgtgtggatgtaaatgttttataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgttcttttacattgtgttggcatatgtatatgtcga 4147136  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4147137 gtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatttaaaaggaggtgtacttttacatagttgcgcg 4147236  T
Q  368 taagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagc 467  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||                   |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4147237 taagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttggcatc-------ttgttgttgctggtaccacatgcatgtatgtgttggaattaggcgcatagc 4147329  T
Q  468 atattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgac 567  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4147330 atattgtcatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtg-----------aatgataattgttgatgataagtgtgcttggtgag 4147418  T
Q  568 tacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaa 667  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||    
T  4147419 tacttaatcgtgatatttgggactgttatatgaatttgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcggaatttgacttaattcatatatgctcaaa 4147518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 68 - 674
Target Start/End: Original strand, 6229894 - 6230491
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6229894 agttgatgaattatagaatatagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttg 6229992  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |    
T  6229993 attgtgtggatgtaaatgttttataatgcaattgttgttgaagttgaacgatgtaattggaggtgtacttttatattgtgttggcatatgtatatgttta 6230092  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggagg---tgtacttttacatagttgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6230093 gtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtcatgtacttttacatagttgt 6230192  T
Q  365 gcgtaagagga---tgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcg 461  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6230193 gcgtaagaggaggccgtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc---ttgttgttgttgtttggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcg 6230289  T
Q  462 catagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgctt 561  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6230290 catagcatattgacatgagtcgtaatttttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtg-----------aatgataattgttgatgataagtgtgctt 6230378  T
Q  562 gatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatg 661  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  6230379 ggtgagtacttgatcgtgatatttgggattgttttgtgaatgtgtatattgaattagctgtttatatgaagtactcgaaatttgatttaattcatatatg 6230478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18969086 - 18968687
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969086 atatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgaatggagctgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 18968987  T
Q  109 tacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18968986 tacatgttgatgaattatgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtcgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 18968887  T
Q  209 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatta 308  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  18968886 agttgaacaatgtaattgaatgtgtacttttacattgtgttggtatatgtatatgttgagtag-ttgcattattgggtctttgcttatgtccatgcatca 18968788  T
Q  309 tcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacat 408  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18968787 ttgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgtataagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttggcat 18968688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Original strand, 43428739 - 43429138
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatac 111  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43428739 tttatcataaggtattgtattttcctctattacttgtattatgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtggaagttgattaatgaatac 43428838  T
Q  112 atgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43428839 atgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatggaattgttgttgaagt 43428938  T
Q  212 tgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgctt--atatccatgcattat 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  43428939 tgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatgcgttgagtagtttgtattattgagtctttgcttgcatgtccatgcatcat 43429038  T
Q  310 cgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatc 409  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  43429039 agtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaagtgtacttttacatagttgatcgtaagaggaggtgtactcttacgtaagatgtgtggttggcatc 43429138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 32 - 397
Target Start/End: Original strand, 25105183 - 25105554
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25105183 ttttctcctttacttgaattgtgggaaattgtatggagttgttgaactaaatgatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatat 25105282  T
Q  132 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  25105283 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagatgatcagtgtaaatggaggt 25105382  T
Q  232 gtacttttacattgtgttgg----tgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcat 325  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  | || |||||||| | ||||    
T  25105383 gtacttttacattgtgttggtgtatgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttgtatgtccatgtttcatagtcatatcgagtcat 25105482  T
Q  326 atgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25105483 atgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgattgtaagaggacgtgtactcttacataagatgt 25105554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 68 - 397
Target Start/End: Original strand, 14816956 - 14817285
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14816956 agttgatgaactatagaacatagttgaagttgatttatgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaaatgaataatgacatgttg 14817055  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14817056 atcgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgccgttgaagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 14817155  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  14817156 gtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggagatatatttttacatagttgtgcg 14817255  T
Q  368 taagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14817256 taagaggaggtgtactcttacataagatgt 14817285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 68 - 397
Target Start/End: Original strand, 17319836 - 17320166
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggatt-aatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtt 166  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17319836 agtttttgaactataggatatagttgaagttgatttaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatttt 17319935  T
Q  167 aattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttg 266  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319936 gattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac--ttacattgtgttggtgtatgtatatgttg 17320033  T
Q  267 agtagtttgcattattgagtctttgcttatat--ccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgt 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17320034 agtagtttgcattattgagtctttgcttgtatgcccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttga 17320133  T
Q  365 gcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
      |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17320134 ttgtaagaagaggtgtactcttacataagatgt 17320166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 74 - 391
Target Start/End: Original strand, 4163450 - 4163767
Alignment:
Q  74 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgta 173  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  4163450 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattggg 4163549  T
Q  174 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 273  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||    
T  4163550 tggatgtaaatgctttataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggcatgtgtatatgtcgagtactt 4163649  T
Q  274 tgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagag 373  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4163650 tgcattattgggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaaaag 4163749  T
Q  374 gatgtgtactcttacata 391  Q
    || ||||||| |||||||    
T  4163750 gaggtgtactgttacata 4163767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 73 - 402
Target Start/End: Original strand, 21167986 - 21168311
Alignment:
Q  73 ttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgt 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21167986 ttgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgt 21168085  T
Q  173 atggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagt 272  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  21168086 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtacttttacattgtgttggtg------tatgttgagtagt 21168179  T
Q  273 ttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaa 370  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  21168180 ttgcattattgagtctttgctcgaatgtccatgcatcataatcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtatttttacataattgtttgtaa 21168279  T
Q  371 gaggatgtgtactcttacataagatgtatggt 402  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  21168280 gaggaggtgtactcttgcataagatgtttggt 21168311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34558790 - 34558477
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  34558790 aactatatgatgcagttgaagttgtctaatgaatacatgttaatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgagtgtgtg 34558692  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||    
T  34558691 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtag-ttg 34558599  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||  ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34558598 cattatttggtctttgcttatgtccactcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacataattatgcgtaagagga 34558499  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  34558498 ggtgtactcttacatatgatgt 34558477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 335 - 674
Target Start/End: Original strand, 4163743 - 4164078
Alignment:
Q  335 gtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacca 434  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||                   ||||||    
T  4163743 gtaaaaggaggtgtactgttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttgtcatcttgttgttgttggta----gtacca 4163838  T
Q  435 tatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaa 534  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  4163839 catgcatgtatgtgtcagaattaggcgcataacatattcacatgactcgtaattgttgcatgtgaatgataattattgaagattgtgatgagattgtgaa 4163938  T
Q  535 tgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagta 634  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4163939 tgataattgttgatgataagcgtgcttggtgagtacttaattgtgatatttgggattgttatgtgaatttttatattgaattaactgtttatgtgaagta 4164038  T
Q  635 ctcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4164039 ctcggaattttatttaattcatatatgctcaaatttattt 4164078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17203563 - 17203283
Alignment:
Q  99 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17203563 gattaatgaatgtgtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 17203464  T
Q  199 ttgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatat 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      || |||||| || ||||||||||  |||||||| ||| |    
T  17203463 ttgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------taagttgaggag-ttgcattatttggtctttgc-tatgt 17203372  T
Q  299 ccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||| || |          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  17203371 ccatgcatcattg----------tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtagtcatacatatgatgt 17203283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 483 - 674
Target Start/End: Original strand, 14819487 - 14819678
Alignment:
Q  483 gtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgata 582  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14819487 gtaattgttgcatgtgaatgataagtgttgaagattgtgatgagattgtgaatgataattttttatgataagtgtgcttggtgaatacttgatcgtgata 14819586  T
Q  583 tttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14819587 tttgagattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatttgaagtactcgaaattgattttaattcatatatgctcaaatttattt 14819678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 113 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12020834 - 12020574
Alignment:
Q  113 tgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12020834 tgttgatgaattgtgatattttggcggtgtctcttaaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgctcgataatgcaattgttgttgaagtt 12020735  T
Q  213 gaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgt 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||    ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| || |     
T  12020734 gtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagt---tgtggag----ttgcattatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattg- 12020644  T
Q  313 catatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacata 391  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12020643 ---------tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaagaggtgtactcttacata 12020574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 496 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 18968594 - 18968417
Alignment:
Q  496 gtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgtta 595  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  18968594 gtgaatgataattgttgaagattgtgatgagattgtgaatgataattgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttgatcgtgatatttgggattattt 18968495  T
Q  596 tgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttatt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18968494 tgtgaatgtgtatattgaattaattgtttatgtgaagtactcagacttgattttaattcatatatgctcaagtttatt 18968417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15549411 - 15549143
Alignment:
Q  103 aatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgt 202  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15549411 aatgaatgtatgttgatgaattgtgatattttggtggtgatacttaattgaataatgacatgttggttgtgttgatgtaaatgcttaataatgcaattgt 15549312  T
Q  203 tgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccat 302  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || ||| |||    ||||||||||   ||||||| ||| |||||    
T  15549311 tgttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta---atttgtagag----ttgcattatttgctctttgc-tatgtccat 15549220  T
Q  303 gcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    |||| ||          | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15549219 gcatcat----------agtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtatttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtacttttaca 15549143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Original strand, 17759761 - 17760020
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17759761 tggtgatgactcttaattgaattttgacttgattgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 17759859  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||         | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  17759860 tacttttacattgttgttggtgaatgtat--------gattttgcattattgagtctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatga 17759951  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  17759952 gaaatgtaaaaggagatgtacttttacatagttgaattgtaaaaggaggtgtactcttacatatgatgt 17760020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Original strand, 19061081 - 19061340
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19061081 tggtgatgactcttaattgaattttgacttgattgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 19061179  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||        | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  19061180 tacttttacattgttgttggtgaatgtata--------attttgcattattgaatctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatga 19061271  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  19061272 gaaatgtaaaaggagatgtacttttacatagttgaattgtaaaaggaggtgtactcttacatatgatgt 19061340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8603548 - 8603428
Alignment:
Q  126 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  8603548 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgtcatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgttgaagttgatcaatgtaaaa 8603449  T
Q  226 ggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8603448 ggaggtgtacttttacattgt 8603428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27050593 - 27050327
Alignment:
Q  126 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaatt 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||   |||||||| |    
T  27050593 tgataatttggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattggtggtgaa-ttactcaatgtaaat 27050495  T
Q  226 ggaggtgtacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtt-tgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaa 321  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| |  ||||  ||  || ||| |  ||| | |||||||| ||  ||| ||||||||| || ||||||| ||     
T  27050494 ggaggggtacttttacattgcttttggtgaa--tataaattaggtggttgtatattgtcgagtctttacttgtatgtccatgcatcatagtcatattaag 27050397  T
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggatgtgtactcttac 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||    
T  27050396 tcatatgagaaatgtaaaaagaggtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggatgtgtactcttac 27050327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 21168406 - 21168547
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21168406 aatgatgattgttgatgataagtgcatttgatgagtacttaatcgtgataattggaattgttaggtgaatgtgtatattgaattaactatttatgttaag 21168505  T
Q  633 tactc-gaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
     |||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21168506 cactcagaacttga-tttaattcatatatgctcaaatttattt 21168547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 43429226 - 43429367
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||  |||    
T  43429226 aatgatgaatgttgatgataagtgtgcttgatgagtacttaatcgtgatgtttggaattgttatgtgaaggtgtatattgaattaaatgcttatgctaag 43429325  T
Q  633 tactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| ||||     || |||||||||||| ||||||||||||    
T  43429326 tacttgaaacttgattcaattcatatatgttcaaatttattt 43429367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17392195 - 17391997
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaata--cttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| | || ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17392195 tggtgatgactcttatttgaattgtgactttttgattgtgtggacgtaaatatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaaatggaagt 17392096  T
Q  232 gtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatat 327  Q
    |  || ||||||||||||| || || ||||| |   || | |||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  17392095 gatctcttacattgtgttgttgaatatatatatgaggtgattttgcattgtcgagtctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatatcaagtcatat 17391997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 5229222 - 5229322
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  5229222 ttttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgtcgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 5229321  T
Q  132 t 132  Q
    |    
T  5229322 t 5229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 47871175 - 47871121
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47871175 ggcttaattgcacttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 47871121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 17320266 - 17320407
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  17320266 aatgatgattattgatgataagtgtgcttgatgagtaattattcctgatatttggaatttttatgtgaaggtgtatattgaattaaatgcttatgttaag 17320365  T
Q  633 tactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| | ||     |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17320366 tacttgtaacttgatttaattcatttatgttcaaatttattt 17320407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11401633 - 11401549
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||    
T  11401633 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatgataaagttgatgttgattaatgcatatatgtt 11401549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 672 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 20969076 - 20968977
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccc 770  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20969076 tttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgca--cccctttttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccc 20968979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 5229398 - 5229495
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  5229398 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 5229495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 10293966 - 10293908
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10293966 tttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 10293908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 490
Target Start/End: Original strand, 14817314 - 14817375
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgt 490  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14817314 gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcataacatattgacatgagtcgtaattgt 14817375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17385704 - 17385633
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaa 209  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17385704 tgatgactctta-ttgaattatgacttgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaaatgttggtgaa 17385633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 18968655 - 18968577
Alignment:
Q  468 atattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttga 547  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18968655 atattgacgtgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataatt-ttgaagattgtgatgagaatgtgaatgataattgttga 18968577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 20968718 - 20968773
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcac-tttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20968718 ggcttaattgcacctttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 20968773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 666 - 727
Target Start/End: Original strand, 1927763 - 1927825
Alignment:
Q  666 aatttatttggcttaattgcac-tttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1927763 aatttttttggcttaattgcacctttcccccctatcttttgccaattatgcgattttgcaccc 1927825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8603698 - 8603617
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8603698 tttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaactatatgatatagttga 8603617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 728
Target Start/End: Original strand, 3353120 - 3353181
Alignment:
Q  667 atttatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  3353120 atttatttggcttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 3353181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Original strand, 17320195 - 17320268
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17320195 gtaccacatgcatatatgtggcggaattaggcgcatagcatatttgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaat 17320268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 675 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 8315135 - 8315083
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  8315135 ggcttaattgcactttcccccctatattttgtcaattgtgcgattttgcaccc 8315083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 674 - 729
Target Start/End: Original strand, 17372297 - 17372353
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcac-tttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17372297 tggcttaattgcaccttttccccctattttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 17372353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 675 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 18875245 - 18875155
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttt 765  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  18875245 ggcttaattgcacttttgccccctatcttttgctaattgtacgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttt 18875155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41660453 - 41660382
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41660453 tgatgactcttaatagaattatgacctgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41660382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 1928484 - 1928434
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1928484 ttaattgcattttcctccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 1928434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9027087 - 9027033
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9027087 tggcttaatttcacttttccccctatcttttgctaattgtgcaattttacacccc 9027033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 14016014 - 14015964
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14016014 ttaattgcacttttcatcctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 14015964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 42627600 - 42627550
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42627600 tggcttaattgcacttttccctctatcttttgctaattgtgtgattttgca 42627550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Original strand, 42672977 - 42673031
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42672977 tggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 42673031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 667 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 48160395 - 48160333
Alignment:
Q  667 atttatttggcttaattgcactttcccccc-tatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48160395 atttttttggcttaattgcactttccccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 48160333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 765
Target Start/End: Original strand, 13657444 - 13657536
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatctttt-gctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttt 765  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  13657444 tggcttaattacacttttctccctatttttttgccaattgtgcgattttgcacccccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttt 13657536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 727
Target Start/End: Original strand, 18874882 - 18874935
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18874882 ggctcaattgcactttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 18874935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 513
Target Start/End: Original strand, 43429155 - 43429240
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttga 513  Q
    |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  43429155 gtaccacatgcatatatgtgttggaattaggcgcataacatatttgacatgagtcataattgttgcatgtgaatgatgaatgttga 43429240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 45060925 - 45060872
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45060925 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgctaattgtgcgattttacaccc 45060872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 53688359 - 53688306
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  53688359 tttggcttaattgcactttctcccctatagtttgccaattgtgcgattttgcac 53688306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 772
Target Start/End: Original strand, 10293627 - 10293705
Alignment:
Q  693 cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10293627 cccctatcttttgtcaattgtgcgattttgcaccccc-tctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 10293705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 501
Target Start/End: Original strand, 21168336 - 21168408
Alignment:
Q  430 taccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21168336 taccacatgcatgtatgtgtcggaattaagcgcataacatatttggcatgagtcgtaattgttgcatgtgaat 21168408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 24485516 - 24485460
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24485516 tttggcttaattgcacttttctccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 24485460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 42673352 - 42673296
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  42673352 tttggcttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 42673296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 34558432 - 34558237
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgaga 527  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||         
T  34558432 gtaccacatgcatgtaggtgtcggagttaggcgcattgcataattaacatgagttg--attgtggcatgtgaatgataattgttgaagtttgtga----- 34558340  T
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatg 627  Q
          |||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||  ||||| | | |||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  34558339 ------atgatgtttgttgatgataagtgtacttggtgaatacttggttgtattattttgaaatgttatgtaaatatacatattgaattaactgtttatg 34558246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 211
Target Start/End: Original strand, 38377137 - 38377212
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  38377137 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattattgtcgaagt 38377212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 47870823 - 47870877
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcg-attttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47870823 ggcttaattgcactttttcccctatcttttgctaattatgcgaattttgcacccc 47870877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 48159897 - 48159951
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48159897 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 48159951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 3644840 - 3644783
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3644840 tttggcttaattgcatttttcccccttattttttgttaattgtgcgattttgcacccc 3644783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 26007182 - 26007235
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  26007182 ggcttaattgcattttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 26007235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 40848521 - 40848574
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40848521 ggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttacacccc 40848574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 722
Target Start/End: Original strand, 45060595 - 45060644
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttg 722  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45060595 tggcttaattgcacttttccccactatcttttgctaattatgcgattttg 45060644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 668 - 727
Target Start/End: Original strand, 1100908 - 1100968
Alignment:
Q  668 tttatttggcttaattgcactt-tcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1100908 tttattagacttaattgcacttatccaccctatcttttgcaaattgtgcgatttttcaccc 1100968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8023066 - 8023014
Alignment:
Q  157 atgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaa 209  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  8023066 atgacttgttgattgtatggatgtaagtatttgataatgcaattgttggtgaa 8023014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 15548968 - 15548876
Alignment:
Q  544 ttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtact 636  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||  ||| | ||| |||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15548968 ttgatgataaatgtgcttggtgaatacttgattgtattatcttggaatgttatgtaaatgcacatattgaattaactgtttatgttaagtact 15548876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 676 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 17372645 - 17372594
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17372645 gcttaattgcacttttcccc-tatattttactaattgtgcgattttgcacccc 17372594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 727
Target Start/End: Original strand, 8314011 - 8314066
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  8314011 ttggcttaattgcacttttctcccctatattttgtcaattgtgcgattttgcaccc 8314066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 665 - 727
Target Start/End: Original strand, 22429148 - 22429211
Alignment:
Q  665 aaatttatttggcttaattgcac-tttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  22429148 aaatttaatttgcttaattgcacttttctcccctatattttgccaattgtgcgactttgcaccc 22429211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 22429647 - 22429596
Alignment:
Q  677 cttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22429647 cttaattgcactttccctcctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 22429596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 682 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 26540915 - 26540876
Alignment:
Q  682 ttgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgatttt 721  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26540915 ttgcacctttccccctatcttttgctaattgtgcgatttt 26540876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 47666390 - 47666335
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47666390 tggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcaattttgcacccc 47666335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Original strand, 9026739 - 9026789
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9026739 ttaattgcatttttcctcctatcttttgttaattgtgcaattttgcacccc 9026789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 680 - 732
Target Start/End: Original strand, 18875017 - 18875071
Alignment:
Q  680 aattgcactttc-ccccctatctttt-gctaattgtgcgattttgcacccccctc 732  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18875017 aattgcacttttgccccctatctttttgctaattgtgcgattttgcacctccctc 18875071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 21896565 - 21896511
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  21896565 tggcttaattgcattttttcccctatattttgtcaattgtgcgattttgcacccc 21896511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 40849015 - 40848961
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40849015 ggcttaattgcacttttcccctctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 40848961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 53687888 - 53687942
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  53687888 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 53687942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 1101235 - 1101182
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  1101235 ggcttaattgcacttttcccccttatcttttgctttttgtgcgatttttcaccc 1101182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 727
Target Start/End: Original strand, 4947263 - 4947312
Alignment:
Q  679 taattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4947263 taattgcacttttcacccctattttttgttaattgtgcgattttgcaccc 4947312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 743 - 772
Target Start/End: Original strand, 18874957 - 18874986
Alignment:
Q  743 agcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18874957 agcgattttgcaccccatctttttgccccc 18874986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 27238957 - 27238900
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27238957 tttggtttaattgcacttttcccctctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 27238900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 53766633 - 53766580
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  53766633 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgcaaattgtgcaattttgcaccc 53766580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 106)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 14939769 - 14939242
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  14939769 atatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttatatgaagttgttgaactaaatgatatagttgaagtgtatcaatgaa 14939670  T
Q  109 tacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14939669 tacgtgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 14939570  T
Q  209 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatta 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  14939569 agttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacat--------tgtatgtttatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgcccatgcatca 14939478  T
Q  309 tcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacat 408  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  14939477 tcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcat 14939378  T
Q  409 cnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaat 508  Q
    |                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |    
T  14939377 c---ttgttgttgttgtttggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcatattgacatgagtcgtaattgttgcatgtgattgataatt 14939281  T
Q  509 gttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttga 547  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14939280 gttgaagattgtgatgagattgtgaatgataattgttga 14939242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15367362 - 15366835
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  15367362 atatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttatatgaagttgttgaactaaatgatatagttgaagtgtatcaatgaa 15367263  T
Q  109 tacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15367262 tacgtgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 15367163  T
Q  209 agttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcatta 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  15367162 agttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacat--------tgtatgtttatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgaccatgcatca 15367071  T
Q  309 tcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacat 408  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  15367070 tcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcat 15366971  T
Q  409 cnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaat 508  Q
    |                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |    
T  15366970 c---ttgttgttgttatttggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcatattgacatgagtcgtaattgttgcatgtgattgataatt 15366874  T
Q  509 gttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttga 547  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15366873 gttgaagattgtgatgagattgtgaatgataattgttga 15366835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 68 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 31500145 - 31499816
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  31500145 agttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgctgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaatattgacatgttg 31500046  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgta-tgtatatgttg 266  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31500045 attgtgtggaggtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtattgtatatgttg 31499946  T
Q  267 agtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  31499945 agtagtttgcattatttagtctttgcttatgtccattcatcatagtcatatcgagttatatgagtaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgt-t 31499847  T
Q  367 gtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31499846 gtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 31499816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 85 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 4437771 - 4437357
Alignment:
Q  85 atatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaat 184  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  4437771 atatagttgaagttgattactgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaat 4437672  T
Q  185 acttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4437671 acttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgatgt-tgtatatgttgagttgtttgcattattga 4437573  T
Q  285 gtctttgcttata--tccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtac 382  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  4437572 gtctgtgcttatatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggagatgtacttttacatagttgt-tgtaagaggaggtgtac 4437474  T
Q  383 tcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcat-attaacatgagt 481  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4437473 tcttacctaagatgtgtggttggcatc---ttgttgttgttaattggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcattgcataattaacatgagt 4437377  T
Q  482 cgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  4437376 tgtaattgttgcatgtgaat 4437357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 88 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 4445169 - 4444758
Alignment:
Q  88 tagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  4445169 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcataattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatact 4445070  T
Q  188 tgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4445069 tgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgatgt-tgtatatgttgagttgtttgcattattgagtc 4444971  T
Q  288 tttgcttata--tccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactct 385  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4444970 tgtgcttatatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggagatgtacttttacatagttgt-tgtaagaggaggtgtactct 4444872  T
Q  386 tacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcat-attaacatgagtcgt 484  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  4444871 tacctaagatgtgtggttggcatc---ttgttgttgttaattggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcattgcataattaacatgagttgt 4444775  T
Q  485 aattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||||||| ||||||    
T  4444774 aattgttgcatgtgaat 4444758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 72 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33558624 - 33558291
Alignment:
Q  72 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattg 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  33558624 gttgaactatataatatagttgaagttgattaatgaatacttgttgttgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataacgacatattgattg 33558525  T
Q  172 tatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 271  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||    
T  33558524 tgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttcgtg------tatgttgagtag 33558431  T
Q  272 tttgcattattgagtctttgcttata--tccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  33558430 tttgcattattgagtctttgcttatacgtccatgcatcgtggtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacacagttgtttgta 33558331  T
Q  370 agaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatc 409  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  33558330 agagaaggtgtactcttacatgagatgtgcggttgacatc 33558291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 76 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 48354264 - 48353956
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48354264 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 48354166  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||    
T  48354165 gatgtaaatgcttgataatgcagttgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttg 48354072  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  48354071 cattattgggtctttgcttatgtccatgtatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggatatgcacttttacatagttgtgcgtaagagga 48353972  T
Q  376 tgtgtactcttacata 391  Q
     |||||||||||||||    
T  48353971 ggtgtactcttacata 48353956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Original strand, 16921193 - 16921518
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  16921193 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatagtgtg 16921291  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||  |||    
T  16921292 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagta-attg 16921384  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16921385 cattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcataagagaaatgtaaaaggatgtgttcttttacatagttgtgcgtaagagga 16921484  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgtatggttgacatc 409  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16921485 ggtgtactcttacatacgatgtgtggttggcatc 16921518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 74 - 397
Target Start/End: Original strand, 34242379 - 34242695
Alignment:
Q  74 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgta 173  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  34242379 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttatttgaataatgacatgttaattgtg 34242477  T
Q  174 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      ||||||||||||||    
T  34242478 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacatttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtt 34242571  T
Q  274 tgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagag 373  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34242572 tgcattattgggtctttgtttatgtccatgcatctgtgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatatttatgcgtaagag 34242671  T
Q  374 gatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    || ||||||||||||||| |||||    
T  34242672 gaggtgtactcttacatatgatgt 34242695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 76 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9610165 - 9609852
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9610165 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtg 9610067  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||    
T  9610066 gatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtag-ttg 9609974  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9609973 cattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatagttgtgtgtaagagga 9609874  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgt 397  Q
      |||||||||||||| |||||    
T  9609873 gatgtactcttacatatgatgt 9609852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9837737 - 9837424
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9837737 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtg 9837639  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||    
T  9837638 gatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgtatgtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtag-ttg 9837546  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9837545 cattatttggtctttgcttatgtccattcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatagttgtgtgtaagagga 9837446  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgt 397  Q
      |||||||||||||| |||||    
T  9837445 gatgtactcttacatatgatgt 9837424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 389
Target Start/End: Original strand, 17225206 - 17225478
Alignment:
Q  99 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17225206 gattaatgaatgtgtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 17225305  T
Q  199 ttgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatat 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||    ||||||||||  |||||||||| | |    
T  17225306 ttgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagt---tgtagag----ttgcattatttggtctttgctt-tgt 17225397  T
Q  299 ccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    |||||||| || |          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17225398 ccatgcatcattg----------tcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttaca 17225478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 429 - 674
Target Start/End: Original strand, 20587232 - 20587475
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagat 528  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  20587232 gtaccacatgcatatatgtgtcggaattaggcgcatagcatattagcatgagtcgtaattgttggatgtgaatgataattgttgaaggttgtgatgagat 20587331  T
Q  529 tgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgt 628  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |    
T  20587332 tgtgaatgataattgttgatgataagtgtgcttggttagtacttgatcgtgata-ttgggatggttatgtgaatgtgtacattgaattaact-gttatat 20587429  T
Q  629 gaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20587430 gaagtactcagaattgattttaattcatatatgcttaaatttattt 20587475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16918474 - 16918182
Alignment:
Q  99 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16918474 gattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacattttgtttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 16918375  T
Q  199 ttgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatat 298  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||| |||    ||||||||||  || ||||| ||  |    
T  16918374 ttgttgttgaagttgtaaaatgtaattggaggtgtaattttacattgtgttgttgtaagt---tgtggag----ttgcattatttggtgtttgc-tacgt 16918283  T
Q  299 ccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgta 398  Q
    |||||||| || |          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||     
T  16918282 ccatgcatcattg----------tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacacagttgtgcataagagaagatgtactcttacatatgatgtg 16918193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 429 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 16382143 - 16381985
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagat 528  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  16382143 gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcatattggcatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattattgaagattgtgatgagat 16382044  T
Q  529 tgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgg 587  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16382043 tgtgaatgataattgttgatgataagtgtgtttggtgagtacttgatcgtgatatttgg 16381985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 45148431 - 45148171
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  45148431 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttggtcgatgtaaatggaggtg 45148332  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||         | |||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  45148331 tacttttacattgttgttggtgaatgtat--------gattttgcactattgagtctttgtttgtatgtccatgcatcatagtcatattaagtcatatga 45148240  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45148239 gaaatgtaaaaggaggtgtatttttacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacataagatgt 45148171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16382399 - 16382178
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16382399 tggtgatgactcttaattgaattatgacttaattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 16382300  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||        | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  16382299 tacttttacattgttgttggtgaatgtata--------attttgcattattgagtctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatga 16382208  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacata 359  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16382207 gaaatgtaaaaggaggtgtactcttacata 16382178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 496 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 14939225 - 14939048
Alignment:
Q  496 gtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgtta 595  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14939225 gtgaatgataattgttgaagattgtggtgagattatgaatgatatttgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttggtcgtgatatttgggattgtta 14939126  T
Q  596 tgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||| | | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14939125 tgtaaatgtacatattgaattaact-gttatgtgaagtaattggaattgattttaatacatatatgctcaaatttattt 14939048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 496 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 15366818 - 15366641
Alignment:
Q  496 gtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgtta 595  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15366818 gtgaatgataattgttgaagattgtggtgagattatgaatgatatttgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttggtcgtgatatttgggattgtta 15366719  T
Q  596 tgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||| | | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15366718 tgtaaatgtacatattgaattaact-gttatgtgaagtaattggaattgattttaatacatatatgctcaaatttattt 15366641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 4437355 - 4437214
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  4437355 aatgatgattgttgatgataagtgtgtttgatgaatacttaattgtgatggttggaattgttatgtgaatgtgtatattaaattaactgtttatgttaag 4437256  T
Q  633 tactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4437255 tactcggaacttgttttaattcatatatgctcagattcattt 4437214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 4444756 - 4444615
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  4444756 aatgatgattgttgatgataagtgtgtttgatgaatacttaattgtgatggttggaattgttatgtgaatgtgtatattaaattaactgtttatgttaag 4444657  T
Q  633 tactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4444656 tactcggaacttgttttaattcatatatgctcagattcattt 4444615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 33558203 - 33558062
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  33558203 aatgatgattgttgatgataagtgtgcttgatgagtacttaatcgtgataattgggactatgatatgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaag 33558104  T
Q  633 tac-tcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    ||| | |||   || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33558103 tacttagaacttga-tttaattcatatatgttcaaatttattt 33558062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 542 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 31499711 - 31499579
Alignment:
Q  542 tgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtac-tcgaa 640  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||    
T  31499711 tgttgatgataagtatgcttggtgagtacttgatcgtgatatttgaaatggttatgtgaatgtttatattgaattaactgtttatgttaagtacttagaa 31499612  T
Q  641 aaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31499611 tttga-tttaattcatatatgctcaaatttattt 31499579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 429 - 674
Target Start/End: Original strand, 34242740 - 34242976
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgaga 527  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34242740 gtaccacatgcatgtatgtgtcggagttaggtgcattgcataattaacatgagttg-aattgttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtgatgaga 34242838  T
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatg 627  Q
    |||| ||||||     ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||          ||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  34242839 ttgtgaatgatgtgaattgatgaaaagtgtgtttggtgaatacttgatcgtaatattt----------tgtaaatgtacatattgaatcaactatttatg 34242928  T
Q  628 tgaagtactcgaaaaaga-ttttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    | |||| || | ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34242929 ttaagtgcttggaattgatttttaattcatatatgctcaaatctattt 34242976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 541 - 674
Target Start/End: Original strand, 16921650 - 16921783
Alignment:
Q  541 ttgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaa 640  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||| |||| || | |    
T  16921650 ttgttgatgataagtgtgcttggtgaatgcttgatcgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttatgttaagtgcttgga 16921749  T
Q  641 aaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16921750 attgattttaattcatataagctcaaatctattt 16921783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4483786 - 4483686
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    ||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  4483786 ttttcccctttatttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 4483687  T
Q  132 t 132  Q
    |    
T  4483686 t 4483686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 21539488 - 21539592
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaat 224  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||  |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  21539488 atgataatgtggtgatgactcttatttaaattgtgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgatcaatgtaaa 21539587  T
Q  225 tggag 229  Q
    |||||    
T  21539588 tggag 21539592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 21676066 - 21676150
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||    
T  21676066 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgtt 21676150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28719513 - 28719413
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  28719513 ttttctcttttacttgaattttgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatagagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 28719414  T
Q  132 t 132  Q
    |    
T  28719413 t 28719413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 9412379 - 9412282
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9412379 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 9412282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 116
Target Start/End: Original strand, 8564736 - 8564818
Alignment:
Q  34 ttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  8564736 ttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgtt 8564818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Original strand, 15979389 - 15979510
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaat 224  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||  |||| |||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15979389 atgataatgtggtgatgactcttacttaaatcgtgacttgttgattgtggggacgtaaatagttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaa 15979488  T
Q  225 tggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    ||||||||  || |||||||||    
T  15979489 tggaggtgatctcttacattgt 15979510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 3687712 - 3687614
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687712 ttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcac-cccctc-ttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgcccc 3687615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16382619 - 16382544
Alignment:
Q  18 ataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382619 ataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattatgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttga 16382544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 9322388 - 9322459
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9322388 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtatggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 9322459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 116
Target Start/End: Original strand, 21539368 - 21539431
Alignment:
Q  53 tgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  21539368 tgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatacatgtt 21539431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Original strand, 8564899 - 8564977
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8564899 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtttggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 8564977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13772958 - 13772900
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13772958 tttggcttaattgcacttttcccccctatcatttgctaattgtgcgattttgcaccccc 13772900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 722
Target Start/End: Original strand, 27096044 - 27096094
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttg 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27096044 tttggcttaattgcactttcccccctatattttgctaattgtgcgattttg 27096094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 27182259 - 27182209
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttg 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27182259 tttggcttaattgcactttcccccctatattttgctaattgtgcgattttg 27182209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 678 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 6908534 - 6908485
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6908534 ttaattgcactttcccccctattttttgctaattgtgcgattttgcaccc 6908485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Original strand, 3687350 - 3687409
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt--cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3687350 tttggcttaattgcacttttccccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 3687409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19066425 - 19066362
Alignment:
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  19066425 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgttcaatataaatggaggt 19066362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 727
Target Start/End: Original strand, 23686418 - 23686473
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23686418 tttggcttaattgcacttttccccctatcttttgctaattgtacaattttgcaccc 23686473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 727
Target Start/End: Original strand, 35079957 - 35080012
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35079957 tttggcttaattgcacttttccccctatcttttgctaattgtggggttttgcaccc 35080012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 360
Target Start/End: Original strand, 8325309 - 8325371
Alignment:
Q  298 tccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 360  Q
    ||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8325309 tccatgcatcatagtcatattaagtcatatgagaaatgtaaaaggagatgtacttttacatag 8325371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16207097 - 16207027
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacata 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  16207097 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtaattttacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacata 16207027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 8953941 - 8953888
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8953941 gcttaattgcacttttccccctatcttttgttaattgtgcaattttgcaccccc 8953888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 33558274 - 33558201
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcat-attaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  33558274 gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcattgcataattaatatgagttgtaattgttgcatgtgaat 33558201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 44599486 - 44599543
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44599486 tttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 44599543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 675 - 727
Target Start/End: Original strand, 6908213 - 6908265
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6908213 ggcttaattgcacttttccccctatctattgttaattgtgcgattttgcaccc 6908265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13617804 - 13617717
Alignment:
Q  18 ataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 106  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  13617804 ataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatg 13617717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 15979213 - 15979273
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagtt 92  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15979213 ttttctactttacttggattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatgatatagtt 15979273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4483573 - 4483498
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483573 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 4483498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 5349785 - 5349733
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5349785 tggcttaattgcactttcccc--tatcttttgttaattgtgcgattttgcacccc 5349733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 9412023 - 9412078
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9412023 ggcttaattgcacttttcccccttatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 9412078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Original strand, 21676354 - 21676429
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676354 tggtgatgactctaaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 21676429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28719299 - 28719224
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28719299 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttga 28719224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 13772641 - 13772695
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13772641 ggcttaattgcacttttcctccctatcttttgctaattgtgtgattttgcacccc 13772695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 44600189 - 44600135
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44600189 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 44600135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46472998 - 46472948
Alignment:
Q  56 gaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  46472998 gaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatg 46472948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 665 - 725
Target Start/End: Original strand, 5735242 - 5735303
Alignment:
Q  665 aaatttatttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5735242 aaatttaattagcttaattgcacttttctcccctatctttggctaattgtgcgattttgcac 5735303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 37888830 - 37888887
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37888830 tttggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 37888887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 92
Target Start/End: Original strand, 39292895 - 39292952
Alignment:
Q  35 tctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagtt 92  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39292895 tctcctttacgtgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaaccatatgatctagtt 39292952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 726
Target Start/End: Original strand, 18925054 - 18925114
Alignment:
Q  667 atttatttggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18925054 atttttttggcttaattgcacttttcttccctatcttttgctaattgtgcaattttgcacc 18925114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 23686771 - 23686723
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttg 722  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23686771 ggcttaattgcactttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttg 23686723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 34236010 - 34235974
Alignment:
Q  696 ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctc 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34236010 ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctc 34235974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Original strand, 3193396 - 3193475
Alignment:
Q  167 aattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||  || |||||||||    
T  3193396 aattgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgttcaatatagttggaggtgatctcttacattgt 3193475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Original strand, 3204667 - 3204721
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3204667 ttggcttaattgcactttccccc-tatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 3204721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9035348 - 9035293
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9035348 tggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 9035293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 496 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 14939259 - 14939208
Alignment:
Q  496 gtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttga 547  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14939259 gtgaatgataattgttgaagattatgatgagattgtgaatgataattgttga 14939208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 496 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15366852 - 15366801
Alignment:
Q  496 gtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttga 547  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15366852 gtgaatgataattgttgaagattatgatgagattgtgaatgataattgttga 15366801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 20584208 - 20584279
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| || |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584208 tgatgactcttaatgaaatcatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 20584279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 10533034 - 10533088
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10533034 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 10533088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 13863313 - 13863367
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13863313 ggcttaattgcatttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 13863367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 37889313 - 37889259
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37889313 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 37889259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 37972450 - 37972396
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37972450 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 37972396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Original strand, 48359319 - 48359373
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  48359319 tggcttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 48359373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 13744286 - 13744233
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  13744286 ggcttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 13744233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Original strand, 17150771 - 17150815
Alignment:
Q  157 atgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattg 201  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17150771 atgacttgttgattgtatggatgtaaatagttgataatgcaattg 17150815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 676 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 18925373 - 18925322
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18925373 gcttaattgcacttttcctc-tatattttgctaattgtgcgattttgcacccc 18925322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 677 - 729
Target Start/End: Original strand, 33628397 - 33628449
Alignment:
Q  677 cttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33628397 cttaattgcacttttctccttatcttttgctaattgtgcaattttgcatcccc 33628449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 9034867 - 9034922
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9034867 ggcttaattgcacttttcccccctataatttgccaattgtgcgattctgcaccccc 9034922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 18864455 - 18864404
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18864455 ggcttaattgtacttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacc 18864404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Original strand, 20418891 - 20418942
Alignment:
Q  678 ttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20418891 ttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 20418942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 27096392 - 27096341
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  27096392 ttaattgcacttttccccctatcttttgtcaattgtgtgattttgcatcccc 27096341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Original strand, 27181911 - 27181962
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  27181911 ttaattgcacttttccccctatcttttgtcaattgtgtgattttgcatcccc 27181962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 42419079 - 42419028
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42419079 ttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgcgtttttgcaccccc 42419028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 3205147 - 3205093
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  3205147 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 3205093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 8643820 - 8643766
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8643820 ggcttaattgcacttttcatccctatcttttaccaattgtgcgattttgcacccc 8643766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Original strand, 9128652 - 9128702
Alignment:
Q  154 ataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 204  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9128652 ataatgacttgtcgattgtatggatgtaagtatttgataatgcaattgttg 9128702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 13864010 - 13863964
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattt 720  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13864010 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattt 13863964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 17156967 - 17157021
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  17156967 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 17157021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 20419378 - 20419324
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  20419378 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 20419324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 22740156 - 22740210
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22740156 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 22740210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 22740641 - 22740591
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22740641 ttaattgcacttttccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 22740591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Original strand, 29291803 - 29291861
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29291803 tttgacttaattgcactttttctccctatcttttgataattatgcgattttgcaccccc 29291861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 29292098 - 29292040
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29292098 tttggcttaattgcacttttttcctctaacttttgctaattgtgcgattttccaccccc 29292040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 724
Target Start/End: Original strand, 29292922 - 29292972
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  29292922 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgca 29292972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 672 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 29293403 - 29293349
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  29293403 tttggcttaattgcatttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcac 29293349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 33628714 - 33628660
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33628714 ggctaaattgcactttttccctctatcttttactaattgtgcgattttgcacccc 33628660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 533 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 4483218 - 4483185
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatga 566  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483218 aatgatgattgttgatgataagtgtgcttgatga 4483185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 246
Target Start/End: Original strand, 8325230 - 8325259
Alignment:
Q  217 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8325230 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 8325259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 528 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 9609720 - 9609613
Alignment:
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatt-tgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttat 626  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| | |||||    
T  9609720 ttgtgaatgatgtttgttgatga-aagtgtgctaggtgaatacttgatcgtattattatgggat-gttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttat 9609623  T
Q  627 gtgaagtact 636  Q
    || |||||||    
T  9609622 gttaagtact 9609613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 528 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 9837292 - 9837185
Alignment:
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatt-tgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttat 626  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| | |||||    
T  9837292 ttgtgaatgatgtttgttgatga-aagtgtgctaggtgaatacttgatcgtattattatgggat-gttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttat 9837195  T
Q  627 gtgaagtact 636  Q
    || |||||||    
T  9837194 gttaagtact 9837185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 732
Target Start/End: Original strand, 39983700 - 39983757
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctc 732  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  39983700 gcttaattgcacttttcccccttatcttttattaattatgcgatttcgcacccccctc 39983757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 99 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 29604462 - 29603899
Alignment:
Q  99 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  29604462 gattaatgaatatatgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattaaataatgacatgttgattgtgtggatgcaaatatttgataatgcaa 29604363  T
Q  199 ttgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatat 298  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  29604362 ttgttgttgaagttgtacactgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggt------atatgttgagtagttttcattgttgaatctttgcttatgt 29604269  T
Q  299 ccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgta 398  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  29604268 ccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgcg 29604169  T
Q  399 tggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtg 498  Q
    |||||||||||                   |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||    
T  29604168 tggttgacatcttgttgttgttgttg----gtaccacatgcatgcatgtgtcggaattaggcgcataacatattgacatgagttgtaattgt-gcatgtg 29604074  T
Q  499 aataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgt 598  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29604073 aatgataattgtggaagattgtgatgaaattgtgaatgataattgttgatgataagtgtgcttggtgaatacttgattgtgatatttgagattgttatgt 29603974  T
Q  599 gaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttatt 673  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  29603973 gaatgagtatattgaattaactgtttatgtgaagtacttgaaattgtttttaattcatgaatgctcaaatttatt 29603899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 32351010 - 32350683
Alignment:
Q  72 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattg 171  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32351010 gttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggagatgactcttaattgaataatgacatgttgattg 32350911  T
Q  172 tatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 271  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32350910 tgtggacgtaaatacttggtaatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgcacgtatatgttgagtag 32350811  T
Q  272 tttgcattattgagtctttgcttata--tccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgta 369  Q
    || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  32350810 ttggcattatcgagtctttgcttatatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggagatgcacttttacatagttgtttgta 32350711  T
Q  370 agaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32350710 agaggaggtgtactcttacataagatgt 32350683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 68 - 381
Target Start/End: Original strand, 18630875 - 18631184
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| ||||||||   |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  18630875 agttgatgaactatggaatatagctaaagttgattaatgaatatatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaattgaataatgacatattg 18630973  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  18630974 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttggtg--tgtatgagttga 18631071  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18631072 gtag-ttgcattattcggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgttcttttacatagttgtgcg 18631170  T
Q  368 taagaggatgtgta 381  Q
    |||||||| |||||    
T  18631171 taagaggaggtgta 18631184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 174 - 501
Target Start/End: Original strand, 15006014 - 15006342
Alignment:
Q  174 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag-t 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15006014 tggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattggtgtatgtatatgttgagtagtt 15006113  T
Q  273 ttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaa 370  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  15006114 ttgcattattgggtctttacttgtatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgattataa 15006213  T
Q  371 gaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata 470  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||                   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15006214 gaggaggtgtactcttagataagatgtgtgattgacatc---ttgttgttgttgattggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcata 15006310  T
Q  471 t-taacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    | | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15006311 tctgacatgagttgtaattgttgcatgtgaat 15006342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 22463314 - 22463514
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatac 111  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||  | || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22463314 tttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttggattgtgagaaattgtgcgaaggttttgaactataggatatagttgaagttgattaatgaatac 22463413  T
Q  112 atgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22463414 atgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttatttgaataacaacatgttgattgtgtggacgtagatacttgataatgcaattgttgttgaagt 22463513  T
Q  212 t 212  Q
    |    
T  22463514 t 22463514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25650024 - 25649839
Alignment:
Q  127 gatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  25650024 gatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattc 25649925  T
Q  227 gaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatc 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  25649924 gaggtgtaattttacattgtgttcttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtcgttgcttatgtccatgcatcattgtcatatc 25649839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 397
Target Start/End: Original strand, 11374178 - 11374437
Alignment:
Q  135 ggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11374178 ggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggatataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgt 11374277  T
Q  234 acttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgag 330  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||         | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||| || |||||||  | |||||||||    
T  11374278 acttttacattgttgttggtgaatgtat--------gattttgcattattgaatctttgcttgtatgtccatacatcatagtcatattgagtcatatgag 11374369  T
Q  331 aaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11374370 aaatgtaaaaggaggtgtccttttacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacataagatgt 11374437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 397
Target Start/End: Original strand, 22363497 - 22363763
Alignment:
Q  113 tgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22363497 tgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataattcaattttggttgaagtt 22363596  T
Q  213 gaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgt 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   ||| |||    ||||||||||   |||||| |||| ||||||||| || |     
T  22363597 gtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgttgtaagt---tgtggag----ttgcattatttgatctttg-ttatgtccatgcatcattg- 22363687  T
Q  313 catatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
             |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  22363688 ---------tcatatgaaaaatgtaaaaggagatgttcttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttatatatgatgt 22363763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 429 - 674
Target Start/End: Original strand, 33539821 - 33540066
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgaga 527  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33539821 gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcattgcataattaacatgagttg-aattgttgcatgcgaatgataattgttgaagattgtgatgaga 33539919  T
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatg 627  Q
    |||| ||||||     ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  33539920 ttgtgaatgatgtgaattgatgataagtgtgcttggttaatacttgatcgtaatattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtttatg 33540019  T
Q  628 tgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    | |||| || | ||  |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33540020 ttaagtgcttggaattgattttaattcatatatgctcagatctattt 33540066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21622023 - 21621752
Alignment:
Q  100 attaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaat 199  Q
    ||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| || |||| ||||||    
T  21622023 attaatgaatgtgtgttgatgaactgtgatagtttggtgatgactattaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgctcgatagtgcaat 21621924  T
Q  200 tgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatc 299  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |  ||| |||    ||||||||||  |||||||| ||| ||    
T  21621923 tgttgttgaagttgtgaaatgtaattggaggtttacttttacattgtgttgttgta---aattgtagag----ttgcattatttggtctttgc-tatgtc 21621832  T
Q  300 catgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    ||||||| || |          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21621831 catgcatcattg----------tcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttaca 21621752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Original strand, 29161836 - 29162096
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |  || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29161836 tggtgatgactcttaatttaattatgactttattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcattgtaaatggaggtg 29161935  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||         | ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  29161936 tacttttacattgttgttggtgaatgtat--------gattttgcattattaagtctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatga 29162027  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29162028 gaaatgtaaaagaagatgtacttttacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacataagatgt 29162096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 438 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25649829 - 25649599
Alignment:
Q  438 gcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatg 536  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25649829 gcatgtatgtatcggagttagccgcattgcataattaacatgagttg-aattgttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtgatcagattgtgaatg 25649731  T
Q  537 ataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtact 636  Q
    ||     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  25649730 atctgaattgatgataagtgtgcttggtgaatacttgatcgtaatattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtttatgtaaagtgct 25649631  T
Q  637 cgaaaaagattttaattcatatatgctcaaat 668  Q
     | ||  ||||  ||||| |||||||||||||    
T  25649630 tggaattgattccaattcctatatgctcaaat 25649599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 360
Target Start/End: Original strand, 5485657 - 5485886
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgt 233  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  | | |||||||| |||| ||||    
T  5485657 tggtgatgtctcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaatggatgtgt 5485755  T
Q  234 acttttacattg-tgttggtgtatgtatatgtt-gagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||  | ||| || ||| |||| ||||||  ||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  5485756 acttttacattgttgttggtgaatacatatgttagatgattttacaatatcgagtttttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatga 5485855  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5485856 gaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatag 5485886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25918539 - 25918421
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtact 236  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  25918539 tgataactcttaattgtataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtctact 25918440  T
Q  237 tttacattgtgttggtgta 255  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  25918439 tttacattgtgttgttgta 25918421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Original strand, 31162201 - 31162322
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaat 224  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31162201 atgataatgtggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtggaagtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaa 31162300  T
Q  225 tggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    ||||||||  || |||||||||    
T  31162301 tggaggtgatctcttacattgt 31162322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 397
Target Start/End: Original strand, 4228611 - 4228872
Alignment:
Q  135 ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgta 234  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||   || |||||    
T  4228611 ggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgtacgtaaatagttgataatgcaattgttggtgaacta-atcaatgtaaaatgatgtgta 4228709  T
Q  235 cttttacattgt-gttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaa 332  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||   || | |||||||| ||||  |||    ||| ||||||||| || |||||||  | |||||||||||    
T  4228710 cttttacattgttgttggtgaatgtatatgtgaggtgattttgcattgttgatacttg---tatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaa 4228806  T
Q  333 atgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4228807 gtgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgaattgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgt 4228872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 397
Target Start/End: Original strand, 4173002 - 4173263
Alignment:
Q  135 ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgta 234  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||   || |||||    
T  4173002 ggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgtatgtaaatagttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaaatgatgtgta 4173100  T
Q  235 cttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaa 332  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||   || | |||||||| ||||  |||    ||| ||||||||| || |||||||  | |||||||||||    
T  4173101 cttttacattgttgttggtgaatgtatatgtgaggtgattttgcattgttgatactt---gtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaa 4173197  T
Q  333 atgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||    ||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  4173198 gtgtaaaaggagatgtacttttacataggtgaattgtaagaggaggtgtactcttgcatatgatgt 4173263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16375241 - 16375068
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaat 224  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  16375241 atgataatatggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattatgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgctcaatgtaaa 16375142  T
Q  225 tggaggtgtacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatat 298  Q
    || |||||  || |||||||| ||||| || || ||||||  | | | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  16375141 tgaaggtgatctcttacattgttgttgttgaatatatatgaggtg-attttgcattgtcgagtctttgcttatat 16375068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 3404043 - 3403946
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404043 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 3403946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Original strand, 17084466 - 17084553
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 119  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||    
T  17084466 ttttctcatttacttgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatgcatatatgttgat 17084553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 533 - 636
Target Start/End: Original strand, 22467796 - 22467899
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  22467796 aatgatgattattgatgataagtgtgcttgatgagtacttattcgtgatatttggaattgttatgtgaagttgtatattgaattaaatgattatgttaag 22467895  T
Q  633 tact 636  Q
    ||||    
T  22467896 tact 22467899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Original strand, 21031979 - 21032075
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21031979 ggcttaattgcacttttccccctaacttttgctaattgtgcgattttgca-ccccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 21032075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 670 - 724
Target Start/End: Original strand, 30388057 - 30388111
Alignment:
Q  670 tatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30388057 tatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 30388111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 545 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 32350581 - 32350492
Alignment:
Q  545 tgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagta 634  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32350581 tgatgataagtgtgcttggtgagtacttaatcgtgataattggaatacttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagta 32350492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Original strand, 33539664 - 33539750
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaat--gaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattg 152  Q
    ||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33539664 agttgatgaactatagaatatagatgaagttgattaatatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattg 33539750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 667 - 728
Target Start/End: Original strand, 3403709 - 3403771
Alignment:
Q  667 atttatttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3403709 atttctttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 3403771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 10039676 - 10039729
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039676 ggcttaattgcacttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 10039729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 15006340 - 15006482
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||| |||    
T  15006340 aatgatgattgttgatgataaatgtgcttcatgagtacttattcatgatatttggaattgttatgtgaaggtgtatattgaatcaaatgattatgttaag 15006439  T
Q  633 tactcgaaaa--agattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| | |||   || ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15006440 tacttggaaacttga-tttaattcatatatgttcatatttattt 15006482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23220758 - 23220659
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  23220758 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattatatg-agttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 23220660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16135333 - 16135254
Alignment:
Q  40 tttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 119  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  16135333 tttacttggattgtgagaaattgtatggagttattgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgat 16135254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 246
Target Start/End: Original strand, 17857743 - 17857821
Alignment:
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  17857743 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgttcaatgtagttggaggtgatctcttacattgt 17857821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 397
Target Start/End: Original strand, 17375262 - 17375338
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17375262 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtctacttttacatagttgaattgtaagaggagttgtactcttacataagatgt 17375338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Original strand, 3825530 - 3825581
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3825530 ttaattgcacttttccccctatattttgctaattgtgcgattttgcaccccc 3825581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 18241854 - 18241909
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18241854 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 18241909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25918364 - 25918305
Alignment:
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  25918364 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgtgtgtaagaagaggtgtactcttaca 25918305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 673 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 11656838 - 11656746
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttt 765  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  11656838 ttggcttaattgcacttttctctcctatcttttgctaattgtgcgattttgcac-cccctctttatttttgagcgattttgcaccccatctttt 11656746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13579704 - 13579650
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13579704 ggcttaattgcacttttctccctatcgtttgctaattgtgcgattttgcaccccc 13579650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 32350654 - 32350588
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcat-attaacatgagtcgtaattgttgca 494  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  32350654 gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcattgcataattaacatgagttgtaattgttgca 32350588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34965751 - 34965658
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  34965751 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtgaacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 34965658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Original strand, 22467725 - 22467798
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22467725 gtaccacatgcatgtatgtttcgaaattaggcgcataacatatttgacatgagttgtaattgttgcatgtgaat 22467798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 33655168 - 33655111
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctc 732  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33655168 ggcttaattgcacttgtccccttatcttttgctaattgtgcaattttgcacccccctc 33655111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 33828987 - 33829044
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33828987 tttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 33829044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16135128 - 16135053
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16135128 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttga 16135053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 18242190 - 18242113
Alignment:
Q  694 ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242190 ccctatcttttgccaattgtgcgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 18242113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19853040 - 19852973
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19853040 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 19852973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 31598778 - 31598732
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31598778 ttaattgcacttttccccctatcttttgttaattgtgcgattttgca 31598732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 33829690 - 33829636
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33829690 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 33829636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21032334 - 21032285
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgc 723  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21032334 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgttaattgtgcgattttgc 21032285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 29074425 - 29074372
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29074425 ggcttaattgctctttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 29074372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 29079189 - 29079136
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29079189 ggcttaattgctctttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 29079136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 29106998 - 29106945
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29106998 ggcttaattgctctttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 29106945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 692 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 30388398 - 30388361
Alignment:
Q  692 ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30388398 ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 30388361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 31598326 - 31598274
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31598326 ggcttaattgtatttttccctctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 31598274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 729
Target Start/End: Original strand, 33971992 - 33972048
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33971992 ttggcttaattgcagtttttcccctatcttttgttaattgtacgattttgcaccccc 33972048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21930741 - 21930666
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21930741 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgtaattgttgttga 21930666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 11373970 - 11374032
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11373970 ttttctcctttacttggattgtgagatagtatatagagttgttgaactatatgatatagttga 11374032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 22684414 - 22684358
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22684414 tttggcttaattgcacttttccccttatagtttgccaattgtgtgattttgcacccc 22684358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 22754654 - 22754710
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22754654 tttggcttaattgcacttttccccttatagtttgccaattgtgtgattttgcacccc 22754710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 729
Target Start/End: Original strand, 2762611 - 2762662
Alignment:
Q  680 aattgcactttc-ccccctatctttt-gctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2762611 aattgcacttttgccccctatctttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 2762662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 10039893 - 10039842
Alignment:
Q  680 aattgcactttc-ccccctatctttt-gctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10039893 aattgcacttttgccccctatctttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 10039842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 10087913 - 10087858
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10087913 tggcttaattgcacttttcccccctttagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 10087858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 231
Target Start/End: Original strand, 18104830 - 18104892
Alignment:
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||    
T  18104830 attgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttg-aggtgatcaatataattggaggt 18104892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23220244 - 23220173
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaa 500  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  23220244 gtaccacatgcatatatgtgtcgggattaggcgcatatcatattggcatgggtcttaattgttgcatgtgaa 23220173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 33974354 - 33974299
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33974354 tggcttaattgcatttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 33974299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 691 - 729
Target Start/End: Original strand, 2762500 - 2762538
Alignment:
Q  691 cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762500 ccccccaattttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 2762538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7654602 - 7654548
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  7654602 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 7654548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 680 - 729
Target Start/End: Original strand, 12714436 - 12714486
Alignment:
Q  680 aattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12714436 aattgcacttttgccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcagcccc 12714486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 23250592 - 23250646
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  23250592 ggcttaattgcactttttcccctatcttttgtcaattgtgagatcttgcaccccc 23250646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 23250945 - 23250891
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23250945 ggcttgattgcactttttgccctatcttttgctaattgtgcgaatttgtaccccc 23250891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19852817 - 19852752
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgca 494  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||    
T  19852817 gtaccacatgcatatatgtgtcgggattaggcgcatatcatattggcatgagtcttatttgttgca 19852752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 223 - 666
Target Start/End: Original strand, 25354 - 25795
Alignment:
Q  223 attggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||| | |    
T  25354 attggaggtgtacttttacattgtgttggagtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtcgatgcatcattgtcatatcgagt 25453  T
Q  323 catatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnn 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||                 
T  25454 catatgagaaatgtaaaaggaggtgtaattttacatagttgtgcataagaggatgtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc------ttgttgt 25547  T
Q  423 nnnnnngtaccatatg----catgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagatt 518  Q
          |||||| |||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  25548 tgtttggtaccacatgcatgcatgtatgtgtcagaattaggcgcatagcatattgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattgttgaagatt 25647  T
Q  519 gtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaa 618  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25648 gtgatgaaattgtgaatgataattgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttgatcgtgctatttgagattgttatgtgaatgtgtatattgaattaa 25747  T
Q  619 ctatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaa 666  Q
    || ||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||    
T  25748 ctgtttatgtgaagtattcaaaatttattttaattcatatatgctcaa 25795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25133162 - 25132688
Alignment:
Q  20 aaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||| ||||| |    ||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  25133162 aaggtgttgtattttcctcctttacttggatggtgataagttatgaaaagtggttgaacaatagaatatagttgaagttgattaatgaatacctgatgat 25133063  T
Q  120 gaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaat 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25133062 gaattgtgatattttggtgatgactct-----gaataatgacatgttggttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaat 25132968  T
Q  220 gtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||     
T  25132967 gtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtcttcgcttatgtccatgcatcatagtcatatcg 25132868  T
Q  320 aatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnn 419  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||              
T  25132867 agtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtttgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttggtatc---ttgttgt 25132771  T
Q  420 nnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25132770 tgttgattggtaccacatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatatttgacatcagtcgtaattgttgcatgtgaat 25132688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 69 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24881538 - 24881224
Alignment:
Q  69 gttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaa 168  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  24881538 gttgatgaactatagaacatagttgaagttgattaatgattatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttgaatgaataatgacatgttga 24881439  T
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgag 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24881438 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgcatgtgtatgttgag 24881339  T
Q  269 tagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgt 368  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24881338 tagttggcattattgggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgggtcatttgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgt 24881239  T
Q  369 aagaggatgtgtact 383  Q
    ||||||| |||||||    
T  24881238 aagaggaggtgtact 24881224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20272243 - 20271974
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||||  ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20272243 tggtgatgactcttatttgaattatgacttgattgattgagtggacataaatatttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatgaaggtg 20272144  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatg 328  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  || | |  ||||||||||||||||| |  ||| | || |||| |  |||||||  | |||||||    
T  20272143 tacttttacattgttgttggtgaatgtatatgttaggtgattaggcattattgagtctttggttgtatgttcaagcatcacagtcatattgagtcatatg 20272044  T
Q  329 agaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20272043 agaaatgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgatttgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 20271974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 466 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 24869088 - 24868880
Alignment:
Q  466 gcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatg 565  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24869088 gcatattgacatgagttgtatttgttgcatgtgaatggtaattgttggagcttgtgatgagattgtgaatgatagttgttgatgataagtgtgcttggtg 24868989  T
Q  566 actacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctca 665  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||  ||  || | || |||||||||||| |    
T  24868988 agtacttgttcgtgatatttgagattgttatgtgaatgcgtatattaaattaattgtctatgtgaagtactctgaattgactatatttcatatatgctaa 24868889  T
Q  666 aatttattt 674  Q
    ||| |||||    
T  24868888 aatctattt 24868880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6093692 - 6093433
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6093692 tggtgatg-ctcttaattgaattatgacttgattgattgtgtgggtgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 6093594  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || ||         | ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  6093593 tacttttacattgttgttggtgagtgcat--------gattttgcattattgagtctgtgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatga 6093502  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6093501 gaaatgtaaaagggtttgtacttttacacagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacataagatgt 6093433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 148 - 389
Target Start/End: Original strand, 40641631 - 40641854
Alignment:
Q  148 aattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  40641631 aattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactttg 40641730  T
Q  248 ttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtg 347  Q
    ||| |||| ||   ||| |||    |||||| |||  |||||||| ||| ||||||||| || |          ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40641731 ttgttgtaagt---tgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattg----------tcatatgtgaaatgtaaaaggaggtg 40641812  T
Q  348 tacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40641813 tacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttaca 40641854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 264 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19661073 - 19660948
Alignment:
Q  264 ttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg 363  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19661073 ttgagtagtt-gcattattcggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagtgg 19660975  T
Q  364 tgcgtaagaggatgtgtactcttacat 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19660974 tgcgtaagaggaggtgtactcttacat 19660948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 259
Target Start/End: Original strand, 24342740 - 24342830
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 259  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24342740 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 24342830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19665472 - 19665386
Alignment:
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19665472 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttagagttgagcaatgtaactagaggtgtacttttacattgtgttggtgt 19665386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18534885 - 18534785
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  18534885 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 18534786  T
Q  132 t 132  Q
    |    
T  18534785 t 18534785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Original strand, 9782201 - 9782314
Alignment:
Q  99 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9782201 gattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgataatt-ggtggtgactcttcaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgcttgataatgcaa 9782299  T
Q  199 ttgttgttgaagttg 213  Q
    |||||||||||||||    
T  9782300 ttgttgttgaagttg 9782314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22331774 - 22331702
Alignment:
Q  34 ttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  22331774 ttctcctttacttgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatg 22331702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Original strand, 24832331 - 24832428
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24832331 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca-ccccatctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 24832428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Original strand, 30190923 - 30191020
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30190923 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgca-ccccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 30191020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 11883983 - 11883925
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11883983 tttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 11883925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 25132690 - 25132549
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  25132690 aatgatgagtgttggtgataagtgtgcttggtgagtacttattcgtgatatttggaattgtcatgtgaaggtgtatattgaattaaatgcttatgttaag 25132591  T
Q  633 tactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| | ||     ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25132590 tacttggaacttgatttaattcatatatgttcaaatctattt 25132549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 382
Target Start/End: Original strand, 9782417 - 9782477
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtac 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9782417 tcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttttgcgtaagaggaggtgtac 9782477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 678 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 40469780 - 40469686
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469780 ttaattgcactttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 40469686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43641774 - 43641597
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatg----ttgatga--atta 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || | ||  ||  |||    |||||||  || |    
T  43641774 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatgtagttgatgttgaatgat--attgatgatcattgatgatcatga 43641677  T
Q  126 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 205  Q
    ||||| | || |||||||||||| |||||| ||||| ||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43641676 tgataatgtgatgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 43641597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 11883623 - 11883678
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11883623 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 11883678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 726
Target Start/End: Original strand, 6171154 - 6171207
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6171154 ttggcttaattgcacttttccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcacc 6171207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43495661 - 43495604
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43495661 tttggcttaattgcactttcccacctatattttgctaattgtgcgattttgcatcccc 43495604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 230
Target Start/End: Original strand, 45619350 - 45619455
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaat 224  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||  |||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||     
T  45619350 atgataatgtggtgatgactcatatttgaattgtgacttgttgattgtgtagacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttaatcaatgtaaa 45619449  T
Q  225 tggagg 230  Q
    ||||||    
T  45619450 tggagg 45619455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 20347518 - 20347463
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20347518 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcaccccc 20347463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 667 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 30191287 - 30191224
Alignment:
Q  667 atttatttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30191287 atttttttggcttaattgcacttttcccccctatcttttattaattgtgcgattttgcaccccc 30191224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 24562193 - 24562291
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  24562193 tggtgatgacttttgattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggaggt 24562291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26737838 - 26737781
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26737838 tttggcttaattgcacttttcacccctatcttttgctaactgtgcgattttgcacccc 26737781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 726
Target Start/End: Original strand, 40221311 - 40221364
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40221311 ttggcttaattgcacctttccccctatcttttgctaattgttcgattttgcacc 40221364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6093891 - 6093831
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagtt 92  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093891 ttttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagtt 6093831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 675 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 6171510 - 6171414
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6171510 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgccaattgtgggattttgca--cccctctttttttttgagcaattttgcaccccatctttttgccccc 6171414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 677 - 729
Target Start/End: Original strand, 18055050 - 18055101
Alignment:
Q  677 cttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055050 cttaattgcacttttcccccta-cttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 18055101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 24561960 - 24562079
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatac 111  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||  ||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||| |||     
T  24561960 tttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttgattaatgcatat 24562058  T
Q  112 atgttgatgaattatgatatt 132  Q
    ||||||||  ||| |||||||    
T  24562059 atgttgattgattgtgatatt 24562079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 636
Target Start/End: Original strand, 30994734 - 30994786
Alignment:
Q  584 ttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtact 636  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30994734 ttggaattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagtact 30994786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 32673193 - 32673142
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32673193 ttaattgcactttttcccctatcttttgccaattgtgcgattttgcaccccc 32673142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 388
Target Start/End: Original strand, 34135780 - 34135849
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggatgtgtactcttac 388  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||| ||||||||||||    
T  34135780 tcatatgaggaatgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggaggtgtactcttac 34135849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 2639536 - 2639482
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2639536 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 2639482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 18296747 - 18296693
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18296747 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 18296693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 19434686 - 19434748
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19434686 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtaaggagtttttgaactatatgatgtagttga 19434748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24276725 - 24276632
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  24276725 tgatgactcttaattgaattatgacttaattgttgtctggtcgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 24276632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 26737482 - 26737535
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26737482 ggcttaattgcacttttctcc-tatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 26737535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 26841587 - 26841641
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26841587 ggcttaattgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 26841641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Original strand, 40469424 - 40469482
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469424 tttggcttaattgtatttttccctcctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 40469482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 17850975 - 17851032
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17850975 tttggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 17851032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26842295 - 26842238
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26842295 tttggcttaagtgcacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 26842238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 16911321 - 16911269
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16911321 gcttaattgcactttcgcccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 16911269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 17346088 - 17346037
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17346088 ggcttaattgcactttttcctttatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 17346037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18534672 - 18534598
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18534672 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaa-tacttgataatgcaattgttgttga 18534598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 2638820 - 2638874
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2638820 ggcttaattgcatttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 2638874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 5378661 - 5378715
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5378661 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 5378715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 20347163 - 20347217
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20347163 ggcttaattacacttttcccctctatcttttgttaattgtgcgattttgcacccc 20347217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 37720204 - 37720258
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37720204 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 37720258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 41790966 - 41790912
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41790966 ggcttaattgcacttttcccccctatattttgccaattgtgcgattttgcccccc 41790912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7591907 - 7591850
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgca-ctttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7591907 tttggcttaattgcatctttcactcctatcttttgtcaattgtgcgattttgcacccc 7591850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7980056 - 7980003
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7980056 ggcttaattgcactttttcctctatagtttgctaattgtgcgattttgcacccc 7980003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 688 - 729
Target Start/End: Original strand, 15920792 - 15920833
Alignment:
Q  688 tttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15920792 tttccctcctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 15920833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 728
Target Start/End: Original strand, 18296077 - 18296130
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18296077 gcttaattgtacttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 18296130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45618458 - 45618405
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatga 85  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45618458 ttttctcttttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatga 45618405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 675 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 6495775 - 6495723
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6495775 ggcttaattgcacttttcctccctatcttttgtgaattgtgcgattttgcacc 6495723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 688 - 728
Target Start/End: Original strand, 7591215 - 7591255
Alignment:
Q  688 tttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7591215 tttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 7591255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 23154174 - 23154222
Alignment:
Q  150 ttgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23154174 ttgaattatgacttgttgattttatggatgtaaatacttgataatgcaa 23154222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 23565431 - 23565479
Alignment:
Q  150 ttgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23565431 ttgaattatgacttgttgattttatggatgtaaatacttgataatgcaa 23565479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Original strand, 39668570 - 39668633
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39668570 tggtgatgactctttgtt-aattatgacctgttgattgtatggatgtaaatgcttgataatgcaa 39668633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43495535 - 43495483
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatc-ttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43495535 ttaattgcacttttccccctatctttttgtcaattgtgcgattttgcaccccc 43495483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Original strand, 8851151 - 8851202
Alignment:
Q  678 ttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8851151 ttaattgcacttttcccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 8851202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 771
Target Start/End: Original strand, 15321394 - 15321486
Alignment:
Q  677 cttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15321394 cttaattgcacttttcccc-tatcttttgttaattgtgcaattttgcatcccc-tattttattttgagcgattttgcaccccatctttttgcccc 15321486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 729
Target Start/End: Original strand, 17345736 - 17345786
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17345736 ttaattgcacttttcccc-tatcttttgctaattatgcaattttgcaccccc 17345786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 721
Target Start/End: Original strand, 43495309 - 43495356
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccc-cctatcttttgctaattgtgcgatttt 721  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43495309 ggcttaattgcacttttcccacctatattttgctaattgtgcgatttt 43495356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 5380013 - 5379959
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  5380013 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttaccaattgtgcgattttgcacccc 5379959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 667 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7664735 - 7664673
Alignment:
Q  667 atttatttggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  7664735 atttttttggcttaattgcacttttcctccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 7664673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 8851636 - 8851582
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  8851636 ggcttaattgcacttttcccccctatagtttgtcaattgtgcgattttgcacccc 8851582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 671 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26692878 - 26692820
Alignment:
Q  671 atttggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26692878 atttggtttaattgcacttttcccctctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 26692820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 674 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 38490895 - 38490845
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38490895 tggcttaattgcactttcctccctatagtttaccaattgtgcgattttgca 38490845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 671 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 19141905 - 19141853
Alignment:
Q  671 atttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  19141905 atttggtttaattgcactttccccc-tatagtttgccaattgtgcgattttgca 19141853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 22137152 - 22137221
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 206  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22137152 tgatgactcttatatgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaaatgttgtt 22137221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 26737706 - 26737657
Alignment:
Q  680 aattgcactttc-ccccctatctttt-gctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26737706 aattgcacttttgccccctatctttttgctaattgtgcgattttgcaccc 26737657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 692 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 40221525 - 40221488
Alignment:
Q  692 ccccctatctttt-gctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40221525 ccccctatctttttgctaattgtgcgattttgcacccc 40221488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 68 - 547
Target Start/End: Original strand, 2219 - 2674
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2219 agttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgataattttgtgatgactcttaattgaataatgacatgttg 2318  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||                     |||||||||||||||    
T  2319 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaactggaggt---------------------gtatgtatatgttga 2397  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2398 gtagtttgcattattgggtttttgcttatgtccatgcatcaccgtcatatcgagtcatatgagaaatttaaaaggagatgtacttttacatagttgtgag 2497  T
Q  368 taagaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagc 467  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||                   |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2498 taagaggaggtgtactgttacataagatgtgtggttggcatc---ttgttgttgttgtttggtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggtgcatagc 2594  T
Q  468 atattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttga 547  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2595 ttattaacatcagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtgatgagattgtgaatgataattgttga 2674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 496 - 668
Target Start/End: Original strand, 2691 - 2863
Alignment:
Q  496 gtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgtta 595  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| || ||||    
T  2691 gtgaatgataatggttgaagattgtgatgagattgtgaatgataaatgttgatgataagtgtgcttggtgagtacatgatcgtgataattggaatggtta 2790  T
Q  596 tgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaat 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||   | |||||||||||| |||||||||    
T  2791 tgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagtactcagaatctaatttaattcatatttgctcaaat 2863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 496 - 547
Target Start/End: Original strand, 2657 - 2708
Alignment:
Q  496 gtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttga 547  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2657 gtgaatgataattgttgaagattgtgatgagattgtgaatgataatggttga 2708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 270 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10086 - 9723
Alignment:
Q  270 agtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10086 agtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgggta 9987  T
Q  370 agaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcat 469  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9986 agaggaggtgtactcttacataatatgtgcggttggcatcttcttgttgttgtttg---gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcat 9890  T
Q  470 attaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgacta 569  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  9889 attgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtgatgagattgtgaatcataattgttgatgataagtgtgcttggtgagtg 9790  T
Q  570 cttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtact 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9789 cttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagtact 9723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 270 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 19511 - 19148
Alignment:
Q  270 agtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19511 agtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgggta 19412  T
Q  370 agaggatgtgtactcttacataagatgtatggttgacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcat 469  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19411 agaggaggtgtactcttacataatatgtgcggttggcatcttcttgttgttgtttg---gtaccacatgcatgtatgtgtcggaattaggcgcatagcat 19315  T
Q  470 attaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgagattgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgacta 569  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  19314 attgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaatgataattgttgaagattgtgatgagattgtgaatcataattgttgatgataagtgtgcttggtgagtg 19215  T
Q  570 cttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtact 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19214 cttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagtact 19148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 76 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12360 - 12040
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12360 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttag-tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 12262  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||| |||    
T  12261 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttatagttgagcaatgcaattggaggtgtactttgacattgtgttg------ttatatgttgagtag-ttg 12169  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12168 tattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 12069  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgtatggttg 404  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12068 ggtgtactcttacatatgatgtgtggttg 12040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 528 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 11914 - 11806
Alignment:
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatg 627  Q
    |||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||  |||||  || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  11914 ttgtgaatgatgtttggtgatgataagtgtacttggtgaatacttggtcgtattattttagaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactatttatg 11815  T
Q  628 tgaagtact 636  Q
    | |||||||    
T  11814 ttaagtact 11806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 68 - 397
Target Start/End: Original strand, 23300 - 23623
Alignment:
Q  68 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta 167  Q
    ||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23300 agttgatgaactatggaatatagttaaagttgattaatgaatatatgttgatgaagtatgatattt--gtgatgactcttaattgaataatgacatgttg 23397  T
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||    
T  23398 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttagattgtgttgctg--tgtataagttga 23495  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 367  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23496 gtag-ttgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtaattttacat-gttgtgcg 23593  T
Q  368 taagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23594 aaagaggaggtgtactcttacatatgatgt 23623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 107 - 397
Target Start/End: Original strand, 19073 - 19358
Alignment:
Q  107 aatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 206  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19073 aatatatgttgatgaagtatgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 19171  T
Q  207 gaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcat 306  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  19172 ggagttgaacaatgtaactggatgtgtacttttacattgtgttggtg--tgtataagttgagtag-ttgcattattcggtcttttcttatgtccatgcat 19268  T
Q  307 tatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  19269 catcgtcacatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacat-gttgtgcgtaagaggaggtgtacttttacatacgatgt 19358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 107 - 397
Target Start/End: Original strand, 28649 - 28934
Alignment:
Q  107 aatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 206  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649 aatatatgttgatgaagtatgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 28747  T
Q  207 gaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcat 306  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  28748 ggagttgaacaatgtaactggatgtgtacttttacattgtgttggtg--tgtataagttgagtag-ttgcattattcggtcttttcttatgtccatgcat 28844  T
Q  307 tatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  28845 catcgtcacatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacat-gttgtgcgtaagaggaggtgtacttttacatacgatgt 28934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 429 - 566
Target Start/End: Original strand, 23667 - 23804
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagatt-gtgatgaga 527  Q
    |||||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||| | | ||||||| |  | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  23667 gtaccacatgcatgtaggtg-cggatttaggcgcatagcatattgacattatttgtaattgctatatgtgaatgataattgttgaagatttgtgatgaga 23765  T
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatga 566  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23766 ttgtgaatgatgattgttgatgatacgtgtgtttgatga 23804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 455 - 566
Target Start/End: Original strand, 19428 - 19540
Alignment:
Q  455 ttaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagatt-gtgatgagattgttaatgataattgttgatgataa 553  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |  | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  19428 ttaggctcataacatattgacatgagtcgtaattgctatatgtgaatgataattgttgaagatttgtgatgagattgtgaatgatgattgttgatgatag 19527  T
Q  554 gtgtgcttgatga 566  Q
    || || |||||||    
T  19528 gtttgtttgatga 19540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 455 - 566
Target Start/End: Original strand, 29004 - 29116
Alignment:
Q  455 ttaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagatt-gtgatgagattgttaatgataattgttgatgataa 553  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |  | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  29004 ttaggctcataacatattgacatgagtcgtaattgctatatgtgaatgataattgttgaagatttgtgatgagattgtgaatgatgattgttgatgatag 29103  T
Q  554 gtgtgcttgatga 566  Q
    || || |||||||    
T  29104 gtttgtttgatga 29116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 76 - 397
Target Start/End: Original strand, 1344 - 1658
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  1344 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtg 1443  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||| ||||| |||    
T  1444 gatgtaaatgcatgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatttaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttaagtag-ttg 1536  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||| | ||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1537 cattatttggtctatacttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaagcaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 1636  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  1637 ggtgtactcttacatatgatgt 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 541 - 641
Target Start/End: Original strand, 1827 - 1927
Alignment:
Q  541 ttgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaa 640  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  1827 ttgttgatgataagtgtgcttggtggatacttgatcgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttgaa 1926  T
Q  641 a 641  Q
    |    
T  1927 a 1927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 76 - 397
Target Start/End: Original strand, 98430 - 98743
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  98430 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacgtgttgatgaattatgatcttt-ggtgacgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 98528  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||    
T  98529 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtag-ttg 98621  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |  |    
T  98622 cattatttggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacataattatgcataaaaaaa 98721  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  98722 ggtgtactcttacatatgatgt 98743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 429 - 636
Target Start/End: Original strand, 98788 - 98995
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcata-ttaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgtgatgaga 527  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||||||   ||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  98788 gtaccacatgcatgtatgtgtcggagttaggcacattgcataattagcatgagttaaaat-gttgtatgtgaatgataattgttgaagattgtgatgaga 98886  T
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatg 627  Q
    |||| ||||||  |  |||||||||||||| ||||  || |||||  ||||  ||||| | | |||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||    
T  98887 ttgtgaatgatgttaattgatgataagtgtacttggcgaatacttagtcgtattattttgaaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtgtatg 98986  T
Q  628 tgaagtact 636  Q
    | |||||||    
T  98987 ttaagtact 98995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 88 - 397
Target Start/End: Original strand, 198640 - 198941
Alignment:
Q  88 tagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatact 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |    
T  198640 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgtt 198738  T
Q  188 tgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||       ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  198739 tgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgttg------aatgttgagtag-ttgcattatttggta 198831  T
Q  288 tttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactctta 387  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  198832 tttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatataaaaggagatgtacttttacatagttttgcgtaagaggaggtgtactctta 198931  T
Q  388 cataagatgt 397  Q
    |||| |||||    
T  198932 catatgatgt 198941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 668
Target Start/End: Original strand, 199074 - 199199
Alignment:
Q  541 ttgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcgaa 640  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||  |||||| ||||||  ||||||| |||| || | |    
T  199074 ttgttaatgataagtgtacttggtgactacttgatcgtattattt-ggaatgttatgtaaatgtacatattggattaaccgtttatgttaagtgcttgga 199172  T
Q  641 aaagattttaattcatatatgctcaaat 668  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||    
T  199173 attga-tttaactcatatatgctcaaat 199199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30018 - 29703
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30018 aactatatgatgtagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgaccttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 29920  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||    
T  29919 gatgtaaatgcttggtaatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagta-tttg 29827  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29826 cattatttggtctttgcttatgtccatgcatcat----------tatcatatgagaaatgtaaaatgaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 29737  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgtatggttgacatc 409  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  29736 ggtgtactcttacatatgatgtgtggttggcatc 29703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 29582 - 29474
Alignment:
Q  528 ttgttaatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatg 627  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||   ||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  29582 ttgtgaatgatgtttgttgatgataagtgtacttggtgaatacttgttcgcattattttggaacgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtttatg 29483  T
Q  628 tgaagtact 636  Q
      |||||||    
T  29482 ctaagtact 29474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 76 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 68414 - 68111
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  68414 aactacatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgattaatgacatgttgattgtgtg 68316  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 275  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||    
T  68315 gacgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtag-ttg 68223  T
Q  276 cattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 375  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||||| || |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68222 cattatttggtctttgcttatgtctatgcatcattg----------tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagagga 68133  T
Q  376 tgtgtactcttacataagatgt 397  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  68132 ggtgtactcttacatatgatgt 68111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Original strand, 255736 - 255857
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaat 224  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||| ||||||  |||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  255736 atgataatgtggtgttgactattatttgaattgtgacttgatgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttcttcaatgtagt 255835  T
Q  225 tggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    ||||||||  || |||||||||    
T  255836 tggaggtgatctcttacattgt 255857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 205687 - 205741
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  205687 ggcttaattgcatttttctccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 205741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 270
Target Start/End: Original strand, 3231 - 3425
Alignment:
Q  76 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatg 175  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  3231 aactatagaatatagttgaagttgattaatcaatacgtgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgatgattgtgtg 3330  T
Q  176 gatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 270  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3331 gacgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 3425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 6581 - 6722
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6581 aatgttaattgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttgatcgtgatatttggaattgtttggtgaatgagtatattgaattaactttttatgttaag 6680  T
Q  633 tactc-gaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    | ||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6681 tgctcagaatttga-tttaattcatatatgctcaaatttattt 6722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 168 - 397
Target Start/End: Original strand, 105967 - 106195
Alignment:
Q  168 attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttga 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||   ||||    
T  105967 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttggagttgaataatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttgatgt--gtatgaattga 106064  T
Q  268 gtagtttgcattattgagtctttgcttatat--ccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtg 365  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106065 gtagtt-gcattattcggtctttgcttttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttaacatagttgtg 106163  T
Q  366 cgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  106164 cgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgt 106195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 118 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11478 - 11193
Alignment:
Q  118 atgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaac 216  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11478 atgaatgatgataatgtggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatc 11379  T
Q  217 aatgtaattggaggtgtacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgt 312  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    || | || |||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||    
T  11378 aatgtaaaaggaggtgtacttttacattgttgttggtgaatgtatatgcgaggtgatttcgcattattgagtctttgcttgtatatccaagcatcatagt 11279  T
Q  313 catatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  11278 catatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatagttgaattgtaagaagaggtgtactcttacatatgatgt 11193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11659 - 11553
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaa-gtggattaatgaata 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  11659 tttatcataaggtgttttatttt-ctcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaagttgttgagttatattatatagttgaatgttgattaatgcata 11561  T
Q  111 catgttga 118  Q
     |||||||    
T  11560 tatgttga 11553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 185330 - 185274
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttccc-ccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  185330 ttggcttaattgcacttttcctccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 185274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 409
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6755
Alignment:
Q  193 atgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgc 292  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  6543 atgcaattgttgtgga-gttgtacaatgtaactggaagtgtacttttacattgtgttggtgt--gtatgaattgagtagtt-gcattattcggtctttgc 6638  T
Q  293 ttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataa 392  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6639 ttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtatttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatat 6738  T
Q  393 gatgtatggttgacatc 409  Q
    |||||  ||||||||||    
T  6739 gatgtgcggttgacatc 6755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 547 - 639
Target Start/End: Original strand, 6897 - 6989
Alignment:
Q  547 atgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaagtactcga 639  Q
    ||||||| |||| ||| ||| || ||||| ||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6897 atgataaatgtgattggtgaataattgattgtgttaattgggattattatgtgtaagtgtatattgaattaactgtctatgtgaagtactcga 6989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 491
Target Start/End: Original strand, 6787 - 6850
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagca-tattaacatgagtcgtaattgtt 491  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  6787 gtaccacatgcatgtaggtgtcggaattaggcgcattgcattatttgcatgagtcgtaattgtt 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 397
Target Start/End: Original strand, 10662 - 10946
Alignment:
Q  118 atgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaac 216  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10662 atgaatgatgataatgtggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgatgatgcaattgttgttgaagttgatc 10761  T
Q  217 aatgtaattggaggtgtacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgt 312  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    || | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || ||    
T  10762 aatgtaaaaggagatgtacttttacattgttgttggtgaatgtatatgcgaggtgattttgcattattgattctttgcttgtatgtccatgcatcatagt 10861  T
Q  313 catatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10862 catattgagtcatatgag-aatgtaaaaggaggtgtactttaacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgt 10946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Original strand, 8316 - 8400
Alignment:
Q  9 atatttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaa 95  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  8316 atatttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaagttgtt-agctatattatatagttgaa 8400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34310 - 34243
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 204  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34310 tgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 34243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 103; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 397
Target Start/End: Original strand, 63867 - 64049
Alignment:
Q  212 tgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcg 311  Q
    |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  63867 tgaaaaatgtaactggatgagtacttttacattgtgttggtgtatatgaat--tgagtagtt-gcattattctgtctttgcttatgtccatgcatcatcg 63963  T
Q  312 tcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  63964 tcatatcaagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgaactcttacatatgatgt 64049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Original strand, 1061 - 1210
Alignment:
Q  72 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattg 171  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  1061 gttgaactatagagtatagttgaagttgattaatgaatacatgatgatgaattgtgatattttgatgatgact--taattgaataatgacatgttgattg 1158  T
Q  172 tatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaa 223  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1159 tgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 356
Alignment:
Q  99 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtga-tgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgca 197  Q
    |||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  628 gattaatgaatgtgtgttgatgaatggtgatattt-ggtgaatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtatggatgtaaatgtttaataatgca 530  T
Q  198 attgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttata 297  Q
    |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||    ||||||||||  |||||||| |||     
T  529 attgttgttggagttttacaaagtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagt---tgtagag----ttgcattatttggtctttgc-tatg 438  T
Q  298 tccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    ||||||||| || |          ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  437 tccatgcatcattg----------tcatatgcgaaatgtaaacggaggtgtacttttacatagttttgcgtaagaggaggtatactcttaca 356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52188 - 52047
Alignment:
Q  105 tgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||  || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52188 tgaatacatgttgatgaattataatcctt--gtcatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttg 52091  T
Q  205 ttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52090 ttgaagttgagcaatgtaattggaggtttacttttacattgtgt 52047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 52005 - 51954
Alignment:
Q  338 aaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  52005 aaaggaggtgtacttttacatagttgtccataagaggaggtgtactcttaca 51954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5620 - 5464
Alignment:
Q  99 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaa 198  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  5620 gattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacacgatggttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaa 5521  T
Q  199 ttgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgta 255  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  5520 ttgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgttgttgta 5464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5404 - 5348
Alignment:
Q  333 atgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  5404 atgtaaaaagaggtgtacttttacatagttgtgcgtaacaggaggtctactcttaca 5348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Original strand, 15213 - 15481
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgtta-attgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |  | |||||||| ||||||||    
T  15213 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgatggattgtgtggaagtaaatactttataattcaattgttggtgaacta-atcaatgtaaatggaggtg 15311  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatg 328  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  || |||||||  |  ||||||    
T  15312 tacttttacattgtttttggtgaatgtatatgtgaggtgattttgcattattgagtctttgcttgtatgtccatgcaacatagtcatattgagccatatg 15411  T
Q  329 agaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgt 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15412 agaaatgtaaaagggggtgtacttttacataggtgaattgtaagaggaggtgtactcttacttaagatgt 15481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 14959 - 15043
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  14959 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgtcgattaatgcatatatgtt 15043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 398
Target Start/End: Original strand, 1538 - 1800
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||| || || ||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  1538 tggtgatgactcctagttgaattttgacttgattgattatgtggacgtaattacttgatattgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggatgtg 1637  T
Q  233 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct--tatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatga 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||         | |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  1638 tacttttacattgttgttggtgaatgtat--------gattttgtattattgagtctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatga 1729  T
Q  330 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacata-gttg-tgcgtaagaggatgtgtactcttacataagatgta 398  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1730 gaaatgtaaaaggaggtgtactcttacatatgatgaattgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgta 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 1331 - 1393
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1331 ttttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttga 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 21699 - 21558
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||    
T  21699 aatgttaattgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttgatcgtgatatttggaattgtttggtgaatgagtatattgaaataactggttatgttaag 21600  T
Q  633 tactc-gaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    ||||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21599 tactcagaatttga-tttaattcatatatgctcaaatttattt 21558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1472
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  1372 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgacgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 1471  T
Q  132 t 132  Q
    |    
T  1472 t 1472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 5752 - 5852
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  5752 ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgacgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatat 5851  T
Q  132 t 132  Q
    |    
T  5852 t 5852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 674 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 6751 - 6654
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgccccc 772  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6751 tggcttaattgcacttttccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgccccc 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 6394 - 6449
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6394 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 669 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 45866 - 45764
Alignment:
Q  669 ttatttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgc 768  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  45866 ttattaggcttaattgcacttttccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgc 45768  T
Q  769 cccc 772  Q
    ||||    
T  45767 cccc 45764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 725
Target Start/End: Original strand, 45537 - 45587
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac 725  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45537 ggcttaattgcacttttccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcac 45587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 675 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 25423 - 25327
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423 ggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgcccc 25327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50390 - 50304
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgta 255  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  50390 ttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgttgttgta 50304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 50244 - 50188
Alignment:
Q  333 atgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggatgtgtactcttaca 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  50244 atgtaaaaagaggtgtacttttacatagttgtgcgtaacaggaggtctactcttaca 50188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 533 - 674
Target Start/End: Original strand, 1669 - 1810
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactatttatgtgaag 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  1669 aatgatgattgttgatgataagtgtgcttggtgagtacttattcgtgatatctggaattattatgtgaaggtgtatattgaattaaattcttatgttaag 1768  T
Q  633 tactcgaaaaagattttaattcatatatgctcaaatttattt 674  Q
    |||| | ||     ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1769 tacttggaacttgatttaattcacatatgttcaaatttattt 1810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 501
Target Start/End: Original strand, 1622 - 1671
Alignment:
Q  453 aattaggcgcatagcatatta-acatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1622 aattaggcgcatagcatatttgacatgagtcgtaattgttgcatgtgaat 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9628 - 9532
Alignment:
Q  136 gtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  9628 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtcgatcaatataaatggaggt 9532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9870 - 9795
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaag-ttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 106  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9870 ttttctcttttacttgaattgtgagaaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatg 9795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 429 - 520
Target Start/End: Original strand, 14234 - 14325
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaataataaatgttgaagattgt 520  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||    
T  14234 gtaccacatgcatgtatctgtcggaattaggcgcatggcatattgacatgagtcgtaattgattcatgtgaatgataattgttgaagattgt 14325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Original strand, 438927 - 438985
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  438927 tttggcttaattgcacttttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 438985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 183716 - 183662
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcacttt-cccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  183716 ggcttaattgcacttttcccccctatattttgctaattgtgcga-tttgcaccccc 183662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 439253 - 439198
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccct-atcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  439253 ggcttaattgcactttttccccttatcttttgctaattgtgcgattttgcatcccc 439198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 727
Target Start/End: Original strand, 183367 - 183416
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  183367 ttaattgcacttttccccctatcttttgtcaattgtacgattttgcaccc 183416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 1476 - 1377
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccccctcnnnnnnnnngagcgattttgcaccccatctttttgcccc 771  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1476 ttggcttaattgcactttttccccctatcttttgccaattgtgcgattttgcac-cccctctttttttttgagcgattttgcaccccatctttttgcccc 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 729
Target Start/End: Original strand, 1116 - 1173
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1116 ttggcttaattgcactttttccccctatcttttgttaattgtgcgattttgcaccccc 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Original strand, 2299 - 2376
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2299 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattaattgtgtggac-taaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 2376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12562 - 12464
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  12562 tggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgcacgtaaatacttgataatgcaattgattttgaagatgatcaatgtaaatggaggtg 12464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Original strand, 3979 - 4062
Alignment:
Q  311 gtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggatgtgtactcttacata 391  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   | |||||||||| |||||||||||||||    
T  3979 gtcatattaagtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggaggtgtactcttacata 4062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 17211 - 17158
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17211 ttggcttaattgcacttttccccctatcttttgctaattgtgcaattttgcacc 17158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 729
Target Start/End: Original strand, 16851 - 16906
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16851 ttggcttaattgc-ctttttcccctatcttttgctaattgtgcgattatgcaccccc 16906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 115
Target Start/End: Original strand, 12202 - 12284
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgt 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  12202 ttttctcctt-acttgaattgtgagaaattgtatggaattgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 12284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12434
Alignment:
Q  169 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  12358 ttgtgtggatgtgaatacttgataatgcaattgttgaggaa-ttgttcaatgtagttggaggtgatctcttacattgt 12434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 7654 - 7599
Alignment:
Q  674 tggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7654 tggcttaattgcactttttcccctatcttttgctaattgtgcgattttgtaccccc 7599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 7455 - 7508
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7455 ggcttaattgcactttttcccctatcttttgctaattatgcgattttgcacccc 7508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 360
Target Start/End: Original strand, 20289 - 20518
Alignment:
Q  130 attttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt-tgaacaatgtaattgga 228  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||   || |||||||||||||  || ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  20289 attttgatgatgactcttatttgaattatgacttgttgattgtgtagattggaa-acttgataatgcatatggtgttgatttatgaagaatgtaattgga 20387  T
Q  229 ggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatatccatgcattatcgtcatatcaaatcatatg 328  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||  | ||||  ||| ||    |||||| | |||||||   | |  ||||||||| || |||||||  | |||||||    
T  20388 ggtgtacttttatattgc-ttggtgattatatagattgtgttaggtgcattgtcgagtcttacttgaagtccatgcatcatagtcatattgagtcatatg 20486  T
Q  329 agaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20487 agaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 20518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 420 - 326
Alignment:
Q  138 gatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtg 232  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || | ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  420 gatgactcttatttgaattgtgacttgatgattatgtggacgtaaatactttataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaaatggaggtg 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 130727 - 130634
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||    
T  130727 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttg-aggtgatcaatataattggaggt 130634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 729
Target Start/End: Original strand, 411923 - 411977
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  411923 ggcttaattgcactttaccccctatcttttgtcaattgtgcgattttgcaccccc 411977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 50563 - 50506
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccccc 729  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50563 tttggcttaattgcacttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcaccccc 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 44935 - 45007
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44935 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttga 45007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 533 - 610
Target Start/End: Original strand, 45294 - 45371
Alignment:
Q  533 aatgataattgttgatgataagtgtgcttgatgactacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatat 610  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |  || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  45294 aatgatgattgttgatgataagtgtgtctgatgaatacatagtcatgatatttggaattgttgtgtggatgtgtatat 45371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6877
Alignment:
Q  676 gcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcaccc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6927 gcttaattgcactttcccccctatcttttgccaattgtgc-attttgcaccc 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 726
Target Start/End: Original strand, 6609 - 6659
Alignment:
Q  677 cttaattgcact-ttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6609 cttaattgcactgttcccccctatcttttgttaattgtgtgattttgcacc 6659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 34787 - 34858
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34787 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttga 34858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 85260 - 85189
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||||||||| || || || |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85260 tgatgactcttaattgaattataacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 85189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26398 - 26305
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 231  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  26398 tgatgacttttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 26305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 4932 - 4851
Alignment:
Q  12 tttaccataaggtgttctatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4932 tttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaagttgttgagctatattatatagttga 4851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4789 - 4711
Alignment:
Q  134 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 211  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4789 tggttatgactcttaattgatctatgacttgattgattgtgtggacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 4711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1221 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1221
Description:

Target: scaffold1221; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 1508 - 1564
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1508 tttggcttaattgcactttttcctctatcttttgccaattgtgtgattttgcacccc 1564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1221; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 1834 - 1786
Alignment:
Q  678 ttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacc 726  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1834 ttaattgcacttttccccctatcttttgtttattgtgcgattttgcacc 1786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 819 - 763
Alignment:
Q  672 tttggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  819 tttggcttaattgcactttttcccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 728
Target Start/End: Original strand, 6150 - 6206
Alignment:
Q  673 ttggcttaattgcactttccccc-ctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6150 ttggcttaattgcacttttcacctctatcttttgctaattgtgcgattttacacccc 6206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 6849 - 6795
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcc-cccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6849 ggcttaattgcatttttcacccctatcttttgccaattgtgcgattttgcacccc 6795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5316
Alignment:
Q  32 ttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 116  Q
    |||||||| ||| ||| ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||    
T  5232 ttttctccattaattgaattgtgagaaatggtatgaagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgtatatatgtt 5316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 5511 - 5580
Alignment:
Q  125 atgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttaattgtatggatgtaaatacttgataa 193  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  5511 atgataatgtggtgaagactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataa 5580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 388
Target Start/End: Original strand, 1500 - 1569
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggatgtgtactcttac 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | | |||||||| ||||||||||||    
T  1500 tcatatgagaaatgtaaaaggagatgtacttttacataggtgaaatacttaagaggaggtgtactcttac 1569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1427
Alignment:
Q  132 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggat-gtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt-tgaacaatgtaattggag 229  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||| || || ||||| |||||||||||||  || ||||||  | |||| ||||||||| |||    
T  1314 tttggtgacgactcttg-ttgaattatgacttgttaattgtgtgaattgtaaa-acttgataatgcatatggtgttgatttatgaagaatgtaattagag 1411  T
Q  230 gtgtacttttacattg 245  Q
    ||||||||||||||||    
T  1412 gtgtacttttacattg 1427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 99673 - 99601
Alignment:
Q  429 gtaccatatgcatgtatgtgtcgaaattaggcgcatagcatattaacatgagtcgtaattgttgcaggtgaat 501  Q
    |||||| || ||| |||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  99673 gtaccacatacatatatgtgtcgggaataggcgcatatcatattgacatgagtcttatttgttgcaggtgaat 99601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 457
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  528 tgatgactcttaaatgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttcataatgcaaatgttgttga 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5583 - 5512
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5583 tgatgactcttaaatgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttcataatgcaaatgttgttga 5512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4116 - 4045
Alignment:
Q  137 tgatgactcttaattgaataatgacatgttaattgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 208  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4116 tgatgactcttaaatgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttcataatgcaaatgttgttga 4045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 724
Target Start/End: Original strand, 10012 - 10062
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgca 724  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10012 ggcttaattgcacttttgccccctatcttttgccaattgtacgattttgca 10062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 79482 - 79444
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  79482 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactatcacatag 79444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 38749 - 38695
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttc-ccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38749 ggcttaattgcactttttccccctatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 38695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 360
Target Start/End: Original strand, 199554 - 199592
Alignment:
Q  322 tcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  199554 tcatatgagaaatgtaaaatgaggtgtacctttacatag 199592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 246
Target Start/End: Original strand, 199452 - 199481
Alignment:
Q  217 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  199452 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 199481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 94
Target Start/End: Original strand, 14072 - 14137
Alignment:
Q  29 tatttttctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 94  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| | || ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14072 tatttttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgatgttgttgaattatatgatatagttga 14137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 728
Target Start/End: Original strand, 19621 - 19674
Alignment:
Q  675 ggcttaattgcactttcccccctatcttttgctaattgtgcgattttgcacccc 728  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19621 ggcttaattgcaattttccccatatagtttgccaattgtgcgattttgcacccc 19674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University