View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18103_high_5 (Length: 442)

Name: NF18103_high_5
Description: NF18103
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18103_high_5
NF18103_high_5
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (25-434)||(27623520-27623927)
chr6 (24-434)||(8899512-8899918)
chr6 (24-434)||(27355924-27356330)
chr6 (24-434)||(34458321-34458725)
chr6 (24-434)||(33370244-33370650)
chr6 (24-434)||(27284175-27284581)
chr6 (41-434)||(13518007-13518396)
chr6 (40-434)||(27491128-27491518)
chr6 (24-434)||(4539571-4539978)
chr6 (24-434)||(26110224-26110629)
chr6 (24-434)||(26772442-26772847)
chr6 (42-434)||(4763760-4764148)
chr6 (24-434)||(28213433-28213840)
chr6 (42-434)||(16755817-16756206)
chr6 (42-434)||(27063479-27063866)
chr6 (24-434)||(29555537-29555943)
chr6 (24-434)||(22928694-22929102)
chr6 (42-434)||(26791813-26792201)
chr6 (35-434)||(30551813-30552208)
chr6 (42-434)||(28166491-28166880)
chr6 (24-410)||(27200165-27200548)
chr6 (24-410)||(27248685-27249068)
chr6 (48-434)||(29579018-29579399)
chr6 (42-434)||(29507413-29507803)
chr6 (41-434)||(16680135-16680525)
chr6 (24-434)||(4531267-4531673)
chr6 (42-434)||(4778877-4779266)
chr6 (25-434)||(16937838-16938243)
chr6 (48-434)||(13292764-13293140)
chr6 (42-434)||(14139213-14139595)
chr6 (42-434)||(27013730-27014111)
chr6 (42-355)||(26926765-26927073)
chr6 (126-434)||(26666471-26666774)
chr6 (42-434)||(27031020-27031405)
chr6 (42-434)||(27208901-27209285)
chr6 (42-434)||(27239943-27240327)
chr6 (42-434)||(24869707-24870089)
chr6 (42-434)||(27025142-27025526)
chr6 (42-434)||(24299573-24299956)
chr6 (42-434)||(15406346-15406730)
chr6 (42-434)||(15418133-15418517)
chr6 (85-423)||(20174589-20174933)
chr6 (85-423)||(22161058-22161402)
chr6 (24-121)||(23851450-23851547)
chr6 (374-434)||(26927077-26927137)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (24-434)||(39856630-39857034)
chr4 (24-434)||(18794483-18794889)
chr4 (42-434)||(20332288-20332677)
chr4 (42-434)||(40099502-40099891)
chr4 (42-434)||(27157178-27157568)
chr4 (42-434)||(24586227-24586616)
chr4 (41-434)||(14104553-14104941)
chr4 (41-434)||(30759774-30760161)
chr4 (41-434)||(33667669-33668056)
chr4 (42-434)||(54839402-54839789)
chr4 (42-434)||(14753360-14753747)
chr4 (42-434)||(5700551-5700939)
chr4 (35-434)||(21975708-21976103)
chr4 (35-434)||(31120376-31120772)
chr4 (42-434)||(34182830-34183216)
chr4 (24-434)||(5011870-5012277)
chr4 (24-434)||(1906245-1906656)
chr4 (24-434)||(15233809-15234219)
chr4 (42-434)||(24118674-24119061)
chr4 (24-434)||(15276495-15276904)
chr4 (42-434)||(36338392-36338772)
chr4 (48-434)||(6575879-6576253)
chr4 (24-433)||(15380105-15380510)
chr4 (48-434)||(1673877-1674260)
chr4 (42-434)||(17019063-17019447)
chr4 (42-434)||(14671027-14671412)
chr4 (121-434)||(36324183-36324484)
chr4 (35-94)||(18311379-18311439)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (24-434)||(5141086-5141493)
chr7 (30-434)||(26441238-26441639)
chr7 (43-434)||(4138997-4139386)
chr7 (42-434)||(26678856-26679245)
chr7 (24-434)||(11446867-11447273)
chr7 (42-434)||(26663664-26664053)
chr7 (24-434)||(16745272-16745679)
chr7 (24-434)||(26268837-26269247)
chr7 (42-434)||(39206891-39207279)
chr7 (35-434)||(24586287-24586682)
chr7 (24-434)||(3451297-3451704)
chr7 (42-434)||(16443755-16444144)
chr7 (42-434)||(5154081-5154468)
chr7 (48-434)||(5164387-5164769)
chr7 (24-434)||(4205368-4205774)
chr7 (42-434)||(26518790-26519176)
chr7 (42-434)||(31558146-31558534)
chr7 (38-434)||(45393212-45393604)
chr7 (24-434)||(26313601-26314006)
chr7 (42-395)||(26509486-26509837)
chr7 (48-434)||(11418531-11418913)
chr7 (42-434)||(45737298-45737688)
chr7 (24-434)||(16047294-16047697)
chr7 (42-434)||(2160567-2160957)
chr7 (24-434)||(31084374-31084781)
chr7 (127-434)||(26595750-26596055)
chr7 (42-434)||(2779249-2779631)
chr7 (42-434)||(31129902-31130284)
chr7 (24-434)||(10847562-10847970)
chr7 (42-432)||(16512194-16512574)
chr7 (42-434)||(10910678-10911060)
chr7 (42-126)||(26531926-26532010)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (24-434)||(29658877-29659283)
chr3 (24-434)||(32296574-32296981)
chr3 (24-434)||(4629730-4630135)
chr3 (24-434)||(21680646-21681051)
chr3 (42-434)||(5727941-5728330)
chr3 (42-434)||(47029416-47029805)
chr3 (24-434)||(29142663-29143072)
chr3 (42-434)||(5717031-5717420)
chr3 (42-434)||(5764038-5764427)
chr3 (35-434)||(4340585-4340980)
chr3 (24-434)||(18248683-18249089)
chr3 (24-434)||(20570755-20571161)
chr3 (42-434)||(10649034-10649422)
chr3 (24-434)||(28027236-28027640)
chr3 (43-434)||(31958364-31958753)
chr3 (24-434)||(28109860-28110271)
chr3 (43-434)||(5603222-5603611)
chr3 (43-434)||(24334137-24334526)
chr3 (42-434)||(5472951-5473338)
chr3 (42-434)||(8217595-8217985)
chr3 (42-434)||(51787985-51788373)
chr3 (35-434)||(5590270-5590665)
chr3 (42-434)||(4422881-4423269)
chr3 (24-434)||(16422128-16422534)
chr3 (42-434)||(4790542-4790931)
chr3 (24-433)||(16618399-16618808)
chr3 (35-434)||(17978859-17979255)
chr3 (42-434)||(18231156-18231544)
chr3 (42-434)||(22381490-22381877)
chr3 (42-434)||(17970775-17971161)
chr3 (43-434)||(28345135-28345521)
chr3 (42-434)||(10402112-10402499)
chr3 (48-434)||(18286264-18286645)
chr3 (48-434)||(18301565-18301946)
chr3 (42-434)||(20071996-20072386)
chr3 (42-434)||(5019676-5020063)
chr3 (42-434)||(22864757-22865143)
chr3 (42-434)||(22879816-22880202)
chr3 (42-434)||(6536652-6537040)
chr3 (50-434)||(11104270-11104651)
chr3 (42-434)||(7079185-7079578)
chr3 (42-434)||(48471890-48472282)
chr3 (42-434)||(18057223-18057614)
chr3 (42-434)||(31030154-31030535)
chr3 (48-434)||(6207869-6208247)
chr3 (40-434)||(18336589-18336973)
chr3 (47-434)||(19700454-19700849)
chr3 (48-434)||(4727602-4727978)
chr3 (47-434)||(32445122-32445496)
chr3 (42-434)||(15735009-15735392)
chr3 (48-434)||(35886733-35887111)
chr3 (42-434)||(4689614-4689996)
chr3 (42-434)||(8283367-8283766)
chr3 (42-434)||(5658097-5658482)
chr3 (222-434)||(15886650-15886857)
chr3 (42-150)||(15886894-15887004)
chr3 (42-126)||(8002523-8002607)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (24-434)||(40239489-40239894)
chr2 (42-434)||(27809699-27810089)
chr2 (24-434)||(27782212-27782618)
chr2 (24-434)||(12710457-12710863)
chr2 (42-434)||(254508-254896)
chr2 (42-434)||(37945721-37946110)
chr2 (42-434)||(16167476-16167864)
chr2 (42-434)||(12592808-12593200)
chr2 (43-434)||(22921999-22922388)
chr2 (48-434)||(12661543-12661924)
chr2 (42-434)||(13930400-13930790)
chr2 (42-434)||(3788492-3788879)
chr2 (42-434)||(37931370-37931765)
chr2 (43-434)||(19410340-19410729)
chr2 (24-434)||(39896048-39896454)
chr2 (42-434)||(27122523-27122909)
chr2 (41-434)||(34867680-34868068)
chr2 (42-434)||(37383675-37384063)
chr2 (42-434)||(9343843-9344231)
chr2 (35-434)||(16823193-16823588)
chr2 (35-434)||(16897892-16898287)
chr2 (24-434)||(11629041-11629446)
chr2 (42-434)||(39045678-39046066)
chr2 (24-434)||(37679747-37680155)
chr2 (24-434)||(37695012-37695420)
chr2 (35-434)||(21697029-21697427)
chr2 (42-434)||(34160842-34161232)
chr2 (24-434)||(21671026-21671435)
chr2 (42-434)||(31882285-31882672)
chr2 (42-434)||(32055800-32056187)
chr2 (92-434)||(31868642-31868979)
chr2 (24-433)||(27396303-27396718)
chr2 (42-434)||(34297154-34297535)
chr2 (24-434)||(19450274-19450689)
chr2 (42-434)||(28888277-28888660)
chr2 (42-434)||(23122434-23122817)
chr2 (42-434)||(34268782-34269165)
chr2 (42-434)||(27428309-27428690)
chr2 (42-434)||(20843910-20844298)
chr2 (245-434)||(23116993-23117182)
chr2 (42-97)||(31887682-31887737)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (42-434)||(12036-12423)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (35-434)||(28355778-28356176)
chr8 (42-434)||(9360622-9361009)
chr8 (42-434)||(31360528-31360916)
chr8 (24-434)||(12086551-12086958)
chr8 (43-434)||(31483698-31484087)
chr8 (42-434)||(33248366-33248753)
chr8 (24-434)||(19680430-19680835)
chr8 (36-434)||(29835317-29835710)
chr8 (42-434)||(18796706-18797095)
chr8 (42-434)||(15773574-15773962)
chr8 (48-434)||(21341998-21342381)
chr8 (42-434)||(44566980-44567371)
chr8 (48-434)||(19910990-19911374)
chr8 (42-434)||(18715480-18715870)
chr8 (24-434)||(19202203-19202598)
chr8 (42-395)||(33264731-33265079)
chr8 (24-434)||(27602742-27603141)
chr8 (24-433)||(22074758-22075164)
chr8 (24-304)||(16260205-16260480)
chr8 (42-434)||(19655175-19655560)
chr8 (42-434)||(2131096-2131478)
chr8 (42-434)||(19694095-19694479)
chr8 (42-434)||(22138906-22139288)
chr8 (80-434)||(14569194-14569542)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (42-434)||(30174472-30174861)
chr5 (24-434)||(33298522-33298932)
chr5 (36-434)||(3795539-3795934)
chr5 (41-434)||(33881132-33881521)
chr5 (41-434)||(18369298-18369687)
chr5 (24-434)||(28953546-28953952)
chr5 (48-434)||(11555367-11555748)
chr5 (24-434)||(31820176-31820580)
chr5 (24-434)||(32590042-32590447)
chr5 (24-434)||(22894405-22894810)
chr5 (38-434)||(30158037-30158429)
chr5 (24-434)||(37352410-37352816)
chr5 (42-434)||(37760989-37761378)
chr5 (42-434)||(41680711-41681100)
chr5 (47-434)||(43084270-43084653)
chr5 (24-434)||(2517054-2517461)
chr5 (35-434)||(6880303-6880699)
chr5 (24-434)||(9323466-9323871)
chr5 (38-434)||(8659238-8659629)
chr5 (42-434)||(13318594-13318981)
chr5 (24-434)||(12138165-12138570)
chr5 (47-434)||(18494534-18494916)
chr5 (42-434)||(37746088-37746482)
chr5 (41-434)||(24729976-24730365)
chr5 (42-434)||(28655249-28655638)
chr5 (42-434)||(40467319-40467707)
chr5 (42-434)||(9544473-9544862)
chr5 (35-434)||(33522382-33522778)
chr5 (41-434)||(11329643-11330034)
chr5 (42-434)||(15752624-15753006)
chr5 (48-434)||(23631982-23632366)
chr5 (24-434)||(26486385-26486780)
chr5 (42-434)||(13180559-13180943)
chr5 (42-434)||(30035433-30035820)
chr5 (42-434)||(5643807-5644193)
chr5 (42-434)||(13436440-13436834)
chr5 (42-434)||(18122182-18122570)
chr5 (42-434)||(34622525-34622914)
chr5 (42-434)||(37665252-37665640)
chr5 (42-434)||(31437471-31437852)
chr5 (42-434)||(15652526-15652912)
chr5 (47-408)||(25206289-25206653)
chr5 (47-408)||(25270445-25270809)
chr5 (42-434)||(22992890-22993270)
chr5 (47-434)||(23897886-23898263)
chr5 (42-434)||(33783494-33783877)
chr5 (47-434)||(24975861-24976238)
chr5 (42-434)||(24608252-24608636)
chr5 (42-434)||(30940643-30941025)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (42-434)||(3647148-3647536)
chr1 (42-434)||(10968667-10969056)
chr1 (24-434)||(51644204-51644612)
chr1 (49-434)||(10951100-10951482)
chr1 (41-434)||(28591084-28591472)
chr1 (24-434)||(20334281-20334689)
chr1 (42-434)||(28155728-28156118)
chr1 (42-434)||(41787175-41787565)
chr1 (24-434)||(20466761-20467175)
chr1 (24-434)||(16201893-16202307)
chr1 (24-434)||(21891628-21892020)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (24-434)||(3045-3453)
scaffold0159 (218-434)||(17980-18196)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (24-434)||(15551-15964)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (42-434)||(9508-9895)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (24-434)||(13931-14338)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (42-434)||(8795-9182)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (42-434)||(4469-4860)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (42-434)||(9914-10301)
scaffold0143 (42-434)||(33297-33682)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (24-434)||(1639-2045)
scaffold0322 (24-434)||(12028-12445)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (42-434)||(18585-18975)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (24-433)||(25097-25510)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (42-434)||(6066-6451)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (48-434)||(24772-25150)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (24-202)||(359-537)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (260-434)||(1-175)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (24-186)||(26243-26405)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (48-180)||(40759-40898)
scaffold0099 (325-434)||(40495-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623520
Alignment:
Q  25 catcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  125 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctac 27623731  T
Q  225 tttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623730 tttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 27623631  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27623630 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 27623531  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  27623530 tagtctgtggt 27623520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8899918 - 8899512
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899918 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8899819  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  8899818 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 8899724  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899723 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 8899624  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  8899623 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccagg 8899524  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  8899523 atagtctgtggt 8899512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355924
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttcta 27356136  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27356135 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaa 27356036  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |    
T  27356035 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 27355936  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  27355935 atagtctgtggt 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458321
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 34458531  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34458530 ttttctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaa 34458432  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||    
T  34458431 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 34458332  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  34458331 tagtctgtggt 34458321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370244
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 33370456  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33370455 ctttcaaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaa 33370356  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| |    
T  33370355 agcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctctcctccagg 33370256  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  33370255 atagtctgtggt 33370244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27284581 - 27284175
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284581 tcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27284482  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  27284481 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttcta 27284386  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284385 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 27284286  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  27284285 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccagga 27284186  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  27284185 tagtctgtggt 27284175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13518396 - 13518007
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518396 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13518297  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||    
T  13518296 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt----ttccactttcaaagctatatac 13518201  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518200 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 13518101  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  13518100 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 13518007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Original strand, 27491128 - 27491518
Alignment:
Q  40 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491128 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27491227  T
Q  140 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| ||||    
T  27491228 agtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctgtata 27491322  T
Q  240 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491323 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 27491422  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| | ||| |||||||||||||    
T  27491423 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtggt 27491518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539571
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||        | || |    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt---cttttt 4539783  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4539782 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaa 4539683  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||    
T  4539682 agcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 4539583  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||||    
T  4539582 ataatctgtggt 4539571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26110629 - 26110224
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110629 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26110530  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||    
T  26110529 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttcttttta 26110435  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26110434 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaa 26110335  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  26110334 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcaggttctcctccaaga 26110235  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    || ||||||||    
T  26110234 taatctgtggt 26110224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26772847 - 26772442
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772847 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26772748  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||    
T  26772747 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttcta 26772654  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26772653 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaa 26772554  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  26772553 aacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccagg 26772454  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  26772453 atagtctgtggt 26772442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 4763760 - 4764148
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4763760 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4763859  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4763860 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 4763954  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763955 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 4764054  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  4764055 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4764148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28213840
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         |||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 28213627  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28213628 actttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaa 28213727  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||    
T  28213728 aagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 28213827  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||| ||||||||    
T  28213828 gataatctgtggt 28213840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 16755817 - 16756206
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16755916  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  16755917 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 16756011  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat--tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756012 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 16756111  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  16756112 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 27063479 - 27063866
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27063479 cttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27063578  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27063579 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 27063672  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063673 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 27063772  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27063773 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27063866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 29555537 - 29555943
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555537 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29555636  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||    
T  29555637 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttcttttta 29555731  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29555732 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaa 29555831  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  | ||| |    
T  29555832 agcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcccctccagg 29555931  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  29555932 atagtctgtggt 29555943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22929102 - 22928694
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929102 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22929003  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  22929002 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 22928908  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||      
T  22928907 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttg 22928808  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22928807 aaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 22928708  T
Q  421 agatagtctgtggt 434  Q
     |||||||||||||    
T  22928707 ggatagtctgtggt 22928694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 26791813 - 26792201
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26791813 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaa 26791912  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26791913 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 26792007  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792008 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 26792107  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  26792108 ggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 26792201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551813
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 30552014  T
Q  235 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30552013 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 30551914  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  30551913 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 30551814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 28166491 - 28166880
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166491 cttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28166590  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28166591 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 28166685  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166686 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 28166785  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28166786 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28166880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 410
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200548
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||         |||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttct 27200358  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200359 actttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 27200458  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcagg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  27200459 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcagg 27200548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248685
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||         |||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttct 27248875  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248874 actttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 27248775  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcagg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  27248774 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcagg 27248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579399
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttctattttcaaagctatatacaaatcat 29579211  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 346  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579212 tttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 29579311  T
Q  347 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  29579312 atcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 29579399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 29507413 - 29507803
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29507413 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 29507512  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||           || ||||||||||||||||||||    
T  29507513 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttcttt--ttttactttcaaagctatataca 29507609  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507610 aaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 29507709  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  29507710 ggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29507803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 16680135 - 16680525
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16680135 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtgga 16680234  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| |||||||    
T  16680235 gtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttcaaagttatatac 16680330  T
Q  241 aaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680331 aaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgaca 16680430  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  16680431 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 16680525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 4531267 - 4531673
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531267 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4531366  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  4531367 ctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttcta 4531461  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531462 ctttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 4531561  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctat-ttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||| || |||||||||| ||| | ||||    
T  4531562 agcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 4531660  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||| ||||||||    
T  4531661 gataatctgtggt 4531673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 4778877 - 4779266
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778877 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 4778976  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaa-gctatata 239  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||| ||| ||||    
T  4778977 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaaagctgtata 4779071  T
Q  240 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779072 cgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 4779171  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  4779172 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4779266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16938243 - 16937838
Alignment:
Q  25 catcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938243 catctgaagcttttgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16938144  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||    
T  16938143 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttcta 16938050  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16938049 ttttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaa 16937950  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||| | |||||    
T  16937949 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaag 16937850  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||||    
T  16937849 ataatctgtggt 16937838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13293140 - 13292764
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13293140 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 13293041  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293040 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 13292946  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292945 tttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 13292851  T
Q  348 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  13292850 tcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13292764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14139595 - 14139213
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14139595 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14139496  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  14139495 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 14139401  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14139400 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatg 14139306  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  14139305 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 14139213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 27013730 - 27014111
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27013730 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27013829  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  27013830 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 27013924  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  27013925 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27014018  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  27014019 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 27014111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 42 - 355
Target Start/End: Original strand, 26926765 - 26927073
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26926765 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 26926864  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26926865 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 26926958  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926959 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 26927058  T
Q  341 ggtacattcaaatga 355  Q
    |||||||||||||||    
T  26927059 ggtacattcaaatga 26927073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 126 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666471
Alignment:
Q  126 ttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctact 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctact 26666681  T
Q  226 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26666680 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaa 26666581  T
Q  325 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagat 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  26666580 caaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggat 26666481  T
Q  425 agtctgtggt 434  Q
    ||||||||||    
T  26666480 agtctgtggt 26666471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 27031020 - 27031405
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27031020 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27031119  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  27031120 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtaca 27031214  T
Q  241 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    | ||||||||||||||||||||||||    
T  27031215 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaac 27031310  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27031311 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27031405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 27208901 - 27209285
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27208901 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27209000  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  27209001 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 27209095  T
Q  241 aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||    
T  27209096 aaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagca 27209188  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27209189 acagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27209285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27240327 - 27239943
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27240327 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27240228  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  27240227 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 27240133  T
Q  241 aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||    
T  27240132 aaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagca 27240040  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27240039 acagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27239943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 24869707 - 24870089
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24869707 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24869806  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  24869807 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgtaca 24869901  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  24869902 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 24869994  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||| | ||| |||||||||||||    
T  24869995 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 24870089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 27025142 - 27025526
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27025142 cttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27025241  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  27025242 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 27025336  T
Q  241 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  27025337 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 27025429  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27025430 cagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27025526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24299956 - 24299573
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24299956 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24299857  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || |||| |||||| ||| |||     
T  24299856 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactctcaaagttatgtaca 24299762  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||    
T  24299761 aaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaaca 24299667  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24299666 gggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24299573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15406730 - 15406346
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15406730 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15406631  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  15406630 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagatatgtac 15406536  T
Q  241 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||    
T  15406535 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 15406442  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15406441 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15406346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15418517 - 15418133
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15418517 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15418418  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  15418417 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagatatgtac 15418323  T
Q  241 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||    
T  15418322 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 15418229  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15418228 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15418133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 423
Target Start/End: Original strand, 20174589 - 20174933
Alignment:
Q  85 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174589 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 20174688  T
Q  185 ctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaac 282  Q
    || |||||||||||| ||||||||        |  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctc--tttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaac 20174785  T
Q  283 aaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtata 375  Q
    ||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||       
T  20174786 aaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcg 20174885  T
Q  376 tgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
      |  |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  20174886 catcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaaga 20174933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22161402 - 22161058
Alignment:
Q  85 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161402 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 22161303  T
Q  185 ctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaac 282  Q
    || |||||||||||| ||||||||        |  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctc--tttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaac 22161206  T
Q  283 aaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtata 375  Q
    ||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||       
T  22161205 aaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcg 22161106  T
Q  376 tgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
      |  |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22161105 catcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaaga 22161058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23851547 - 23851450
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 121  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851547 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 434
Target Start/End: Original strand, 26927077 - 26927137
Alignment:
Q  374 tatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | | | |||||||||||||    
T  26927077 tatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggt 26927137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39857034
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctttttt-----cttcta 39856823  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856824 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 39856923  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||    
T  39856924 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 39857023  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  39857024 tagtctgtggt 39857034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794483
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 18794695  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18794694 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaa 18794595  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |    
T  18794594 agcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 18794495  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  18794494 atagtctgtggt 18794483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20332677 - 20332288
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332677 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 20332578  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  20332577 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 20332481  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332480 aaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 20332381  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  20332380 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20332288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40099891 - 40099502
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099891 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 40099792  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  40099791 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 40099695  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099694 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 40099595  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  40099594 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40099502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27157568 - 27157178
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157568 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27157469  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27157468 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 27157372  T
Q  242 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157371 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 27157272  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27157271 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27157178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24586616 - 24586227
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586616 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24586517  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  24586516 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 24586421  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586420 aaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatag 24586321  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24586320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24586227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 14104553 - 14104941
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104553 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 14104652  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  14104653 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactct----gttttctttctactttcaaagctatatac 14104747  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104748 aaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 14104847  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  14104848 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14104941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 30759774 - 30760161
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759774 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30759873  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  30759874 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 30759967  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759968 aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 30760067  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  30760068 ggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33668056 - 33667669
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668056 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33667957  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  33667956 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 33667863  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667862 aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33667763  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  33667762 ggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33667669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 54839402 - 54839789
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54839402 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 54839501  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  54839502 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 54839595  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54839596 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacag 54839695  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  54839696 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 54839789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14753747 - 14753360
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14753747 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14753648  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  14753647 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 14753554  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14753553 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaaca 14753454  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  14753453 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14753360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 5700551 - 5700939
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700551 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5700650  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  5700651 gtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 5700744  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5700745 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaaca 5700844  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5700845 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5700939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976103
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 21975902  T
Q  235 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21975903 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 21976002  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||    
T  21976003 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctatgg 21976102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31120772 - 31120376
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31120772 ttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatc 31120673  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  31120672 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 31120578  T
Q  235 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt-gaaaagcaaacctg 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  31120577 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccg 31120478  T
Q  333 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31120477 agcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31120378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34183216 - 34182830
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34183216 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34183117  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  34183116 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 34183022  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183021 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 34182923  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  34182922 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 34182830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012277
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctactttt----cttct 5012064  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5012065 actttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaa 5012164  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||     
T  5012165 aagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 5012264  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||    
T  5012265 gatagtctgtggt 5012277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 1906245 - 1906656
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906245 tcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 1906344  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  1906345 ctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttcta 1906439  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 316  Q
    |||||||||| || |||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  1906440 ctttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctatt 1906539  T
Q  317 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttc 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1906540 ttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttc 1906638  T
Q  417 cccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||| |||||||||||||    
T  1906639 cccaggatagtctgtggt 1906656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 15233809 - 15234219
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233809 tcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15233908  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  15233909 ctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 15234003  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattt 317  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       |||||||||||||    
T  15234004 ctttcaaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattt 15234103  T
Q  318 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcc 417  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15234104 tg-aaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcc 15234202  T
Q  418 ccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| |||||||||||||    
T  15234203 ccaggatagtctgtggt 15234219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 24118674 - 24119061
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24118674 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24118773  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  24118774 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagctatataca 24118868  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24118869 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacag 24118968  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||    
T  24118969 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtccgtggt 24119061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15276904 - 15276495
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276904 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15276805  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||        |  ||||    
T  15276804 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctctcta 15276710  T
Q  224 ctttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctatttt 318  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  15276709 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgtttt 15276610  T
Q  319 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccc 418  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15276609 g-aaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccc 15276511  T
Q  419 caagatagtctgtggt 434  Q
    || |||||||||||||    
T  15276510 caggatagtctgtggt 15276495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36338772 - 36338392
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338772 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 36338673  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  36338672 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 36338578  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  36338577 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 36338484  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  36338483 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 36338392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 6575879 - 6576253
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6575879 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 6575978  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6575979 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaacat 6576073  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576074 tttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 6576167  T
Q  348 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  6576168 tcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6576253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15380510 - 15380105
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15380510 tcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15380411  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  15380410 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 15380316  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| |||||||    
T  15380315 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttgaa 15380216  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15380215 a-gcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccag 15380117  T
Q  422 gatagtctgtgg 433  Q
    ||||||||||||    
T  15380116 gatagtctgtgg 15380105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674260
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | ||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttctactttcaaagccatgtacaaaaaat 1674071  T
Q  248 --tttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1674072 attttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacttgagcaacaggg 1674170  T
Q  343 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  1674171 tacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtggt 1674260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 17019063 - 17019447
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17019063 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 17019162  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc-aaagctatata 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||| |||||||| ||    
T  17019163 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaaagctatgta 17019257  T
Q  240 c-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  17019258 caaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 17019351  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  17019352 cagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17019447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 14671027 - 14671412
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14671027 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 14671126  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  14671127 gttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 14671221  T
Q  241 aa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    || ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  14671222 aagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 14671315  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | | | |||||||||||||    
T  14671316 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggt 14671412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 121 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324183
Alignment:
Q  121 aagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnncctt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----ctt 36324390  T
Q  221 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||    
T  36324389 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttga 36324296  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||| | |||    
T  36324295 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctcca 36324197  T
Q  421 agatagtctgtggt 434  Q
     |||||||||||||    
T  36324196 ggatagtctgtggt 36324183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18311439 - 18311379
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtg-gttactg-tgttcaatgtacc 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18311439 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaa-tgtagtgtattactgttgttcaatgtacc 18311379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5141493 - 5141086
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141493 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5141394  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  5141393 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 5141299  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aa 321  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5141298 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 5141199  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||     
T  5141198 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 5141099  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||    
T  5141098 gatagtctgtggt 5141086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 434
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441639
Alignment:
Q  30 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  130 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |         ||| ||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccatttttt---cttttactttca 26441434  T
Q  230 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441435 aagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 26441534  T
Q  330 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtct 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  26441535 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 26441634  T
Q  430 gtggt 434  Q
    |||||    
T  26441635 gtggt 26441639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4139386 - 4138997
Alignment:
Q  43 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 142  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139386 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 4139287  T
Q  143 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  4139286 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 4139189  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139188 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4139089  T
Q  343 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  4139088 tacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4138997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26679245 - 26678856
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679245 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26679146  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26679145 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 26679049  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26679048 aaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggg 26678949  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  26678948 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26678856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447273
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttcta 11447060  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg--aaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447061 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 11447160  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||     
T  11447161 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 11447260  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||    
T  11447261 gatagtctgtggt 11447273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26664053 - 26663664
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664053 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26663954  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26663953 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 26663857  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26663856 aaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggg 26663757  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  26663756 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 26663664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16745679 - 16745272
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745679 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16745580  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  16745579 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 16745485  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745484 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 16745385  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |  ||     
T  16745384 aagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaagttctccttcag 16745285  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||    
T  16745284 gatagtctgtggt 16745272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26269247 - 26268837
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269247 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26269148  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         | || ||    
T  26269147 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttcttttta 26269053  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctatttt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26269052 ctttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 26268953  T
Q  319 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |    
T  26268952 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 26268853  T
Q  419 caagatagtctgtggt 434  Q
    || |||||||||||||    
T  26268852 caggatagtctgtggt 26268837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39207279 - 39206891
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207279 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 39207180  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  39207179 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 39207085  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207084 aaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 39206985  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  39206984 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39206891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24586682 - 24586287
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586682 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 24586583  T
Q  134 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||         ||||||||||||||||    
T  24586582 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgttt-aagactctattttt----cttctactttcaaagc 24586488  T
Q  234 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586487 tatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 24586388  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  24586387 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 24586288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451704
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||         ||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttcta 3451490  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451491 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 3451590  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| || |||||||||| ||| | |||    
T  3451591 aaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcaggttctcctcca 3451690  T
Q  421 agatagtctgtggt 434  Q
     |||||| ||||||    
T  3451691 ggatagtatgtggt 3451704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16444144 - 16443755
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16444144 cttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 16444045  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||| ||||    
T  16444044 tcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctacttt----ctttctactttcaaagctatgtaca 16443950  T
Q  242 aaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16443949 aaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaac 16443851  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16443850 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 16443755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 5154081 - 5154468
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5154081 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5154180  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  5154181 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 5154275  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154276 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5154375  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5154376 gtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5154468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 5164387 - 5164769
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5164387 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 5164486  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc-tatatacaaaaca 246  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5164487 tttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagcctatatacaaaaca 5164581  T
Q  247 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164582 ttttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 5164681  T
Q  347 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5164682 tccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5164769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 4205368 - 4205774
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205368 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 4205467  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  4205468 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 4205561  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4205562 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 4205661  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||    
T  4205662 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaa 4205761  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||| ||||||||    
T  4205762 gataatctgtggt 4205774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 26518790 - 26519176
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26518889  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  26518890 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 26518983  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518984 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26519083  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  26519084 gtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26519176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31558534 - 31558146
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31558534 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31558435  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31558434 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 31558340  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558339 aatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 31558240  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  31558239 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 31558146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 38 - 434
Target Start/End: Original strand, 45393212 - 45393604
Alignment:
Q  38 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393212 tgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 45393311  T
Q  138 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  45393312 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctactttt----cttctactttcaaagctata 45393406  T
Q  238 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393407 cacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 45393506  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  45393507 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 45393604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26314006 - 26313601
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314006 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26313907  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  26313906 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 26313813  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26313812 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 26313713  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||    
T  26313712 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 26313613  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||||    
T  26313612 ataatctgtggt 26313601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26509837 - 26509486
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26509837 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 26509738  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  26509737 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 26509642  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509641 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 26509542  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaata 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26509541 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaata 26509486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11418913 - 11418531
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11418913 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 11418814  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11418813 cttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttttactttcaaagctatatacaaaacat 11418719  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418718 tttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 11418619  T
Q  347 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||| |||||||||||||    
T  11418618 ttcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccaggatagtctgtggt 11418531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 45737298 - 45737688
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45737298 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 45737397  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  45737398 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 45737491  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737492 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 45737591  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  45737592 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 45737688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 16047294 - 16047697
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047294 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16047393  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  16047394 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 16047488  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16047489 ctgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttgaaa- 16047586  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  16047587 gcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccggga 16047686  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  16047687 tagtctgtggt 16047697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 2160567 - 2160957
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2160567 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2160666  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| ||||    
T  2160667 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttc----ctttttactttcaaagctatgtaca 2160761  T
Q  242 aaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  2160762 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaac 2160861  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2160862 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 2160957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31084781 - 31084374
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084781 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 31084682  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||    
T  31084681 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctattttt----cttct 31084587  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31084586 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaa 31084487  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||    
T  31084486 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 31084387  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||| ||||||||    
T  31084386 gataatctgtggt 31084374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 127 - 434
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596055
Alignment:
Q  127 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactt 26595846  T
Q  227 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595847 tcaaagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 26595946  T
Q  326 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagata 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||    
T  26595947 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggata 26596046  T
Q  426 gtctgtggt 434  Q
    |||||||||    
T  26596047 gtctgtggt 26596055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 2779249 - 2779631
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2779249 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2779348  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  2779349 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 2779443  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  2779444 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 2779538  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  2779539 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 2779631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 31129902 - 31130284
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31129902 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31130001  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  31130002 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 31130096  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31130097 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31130191  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  31130192 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 31130284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 10847562 - 10847970
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10847562 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 10847661  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||        |  ||||    
T  10847662 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctg-aaactcta----ttttctctcta 10847756  T
Q  224 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattt 317  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||    
T  10847757 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttt 10847856  T
Q  318 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcc 417  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  10847857 tg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggctcttcc 10847953  T
Q  418 ccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| |||||||||||||    
T  10847954 ccaggatagtctgtggt 10847970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16512574 - 16512194
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512574 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 16512475  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  16512474 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 16512380  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||    
T  16512379 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 16512288  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  16512287 agggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10911060 - 10910678
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10911060 cttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10910961  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  10910960 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 10910866  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  10910865 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 10910773  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  10910772 atggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10910678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26532010 - 26531926
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 126  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532010 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658877
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttcta 29659089  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29659088 ctttcaaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaa 29658989  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |    
T  29658988 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 29658889  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  29658888 atagtctgtggt 29658877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296981
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttt---cttcta 32296770  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296771 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 32296870  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||    
T  32296871 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 32296970  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  32296971 tagtctgtggt 32296981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 4629730 - 4630135
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629730 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4629829  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  4629830 ctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 4629924  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629925 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 4630024  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| |    
T  4630025 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 4630123  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  4630124 atagtctgtggt 4630135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21681051
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 21680840  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680841 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 21680940  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| |    
T  21680941 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 21681039  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  21681040 atagtctgtggt 21681051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 5727941 - 5728330
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727941 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5728040  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5728041 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5728137  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728138 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5728237  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5728238 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5728330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 47029416 - 47029805
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029416 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 47029515  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  47029516 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 47029612  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029613 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 47029712  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  47029713 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 47029805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29143072 - 29142663
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143072 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29142973  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||    
T  29142972 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttt----ttcta 29142877  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--ga 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  29142876 ctttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaa 29142777  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||    
T  29142776 aaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 29142677  T
Q  421 agatagtctgtggt 434  Q
     |||||||||||||    
T  29142676 ggatagtctgtggt 29142663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 5717031 - 5717420
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717031 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5717130  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5717131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5717227  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717228 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5717327  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5717328 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5717420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5764427 - 5764038
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764427 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5764328  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5764327 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5764231  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764230 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5764131  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5764130 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5764038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340585
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 4340786  T
Q  235 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340785 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 4340686  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  4340685 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 4340586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249089
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||         ||||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaa-ctctattttt----cttcta 18248877  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18248878 ctttcaaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaa 18248977  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |    
T  18248978 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 18249077  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  18249078 atagtctgtggt 18249089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570755
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 20570967  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20570966 ttttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaa 20570867  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  20570866 agcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccagg 20570767  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  20570766 atagtctgtggt 20570755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 10649034 - 10649422
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649034 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10649133  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  10649134 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 10649228  T
Q  242 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649229 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10649328  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  10649329 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10649422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027640
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||         ||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttcta 28027429  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027430 ctttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 28027529  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||| ||    
T  28027530 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagga 28027629  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  28027630 tagtctgtggt 28027640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31958753 - 31958364
Alignment:
Q  43 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 142  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958753 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 31958654  T
Q  143 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  31958653 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 31958556  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958555 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 31958456  T
Q  343 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31958455 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31958364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28110271 - 28109860
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110271 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 28110172  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||    
T  28110171 gctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttct 28110076  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110075 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 28109976  T
Q  319 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  28109975 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctc 28109876  T
Q  419 caagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||| ||||||||    
T  28109875 caagataatctgtggt 28109860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5603611 - 5603222
Alignment:
Q  43 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 142  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603611 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 5603512  T
Q  143 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  5603511 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 5603414  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603413 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 5603314  T
Q  343 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5603313 taccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Original strand, 24334137 - 24334526
Alignment:
Q  43 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 142  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334137 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 24334236  T
Q  143 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||| ||||    
T  24334237 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatacacaa 24334334  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334335 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 24334434  T
Q  343 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24334435 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24334526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 5472951 - 5473338
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472951 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5473050  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5473051 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 5473145  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473146 aaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5473244  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5473245 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5473338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 8217595 - 8217985
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8217595 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggag 8217694  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  8217695 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 8217789  T
Q  242 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217790 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 8217889  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  8217890 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8217985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 51787985 - 51788373
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787985 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 51788084  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  51788085 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 51788179  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788180 aaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 51788279  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  51788280 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 51788373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5590665 - 5590270
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5590665 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 5590566  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  5590565 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 5590471  T
Q  235 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590470 atgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 5590371  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| |||    
T  5590370 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctatgg 5590271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 4422881 - 4423269
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4422881 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4422980  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4422981 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 4423075  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423076 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 4423175  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  4423176 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4423269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 16422128 - 16422534
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422128 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccg-gaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16422226  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  16422227 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 16422321  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16422322 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttga 16422421  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16422422 aa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 16422520  T
Q  421 agatagtctgtggt 434  Q
     |||||||||||||    
T  16422521 ggatagtctgtggt 16422534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4790931 - 4790542
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4790931 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4790832  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  4790831 ttcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 4790737  T
Q  241 aaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790736 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 4790637  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  4790636 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4790542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16618808 - 16618399
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618808 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16618709  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  16618708 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 16618614  T
Q  224 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattt 317  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| ||||    
T  16618613 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattt 16618514  T
Q  318 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcc 417  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16618513 tg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttcc 16618415  T
Q  418 ccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16618414 ccaggatagtctgtgg 16618399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978859
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 17979061  T
Q  235 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17979060 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctg 17978961  T
Q  333 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 432  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  17978960 agcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 17978861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 18231156 - 18231544
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18231156 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggag 18231255  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         | |||||||||||||||||||||||    
T  18231256 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactct----gttttctttctactttcaaagctatataca 18231350  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18231351 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacag 18231450  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18231451 ggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18231544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22381877 - 22381490
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381877 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 22381778  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  22381777 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 22381683  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22381682 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacag 22381583  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  22381582 tgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22381490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17971161 - 17970775
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971161 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 17971062  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  17971061 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 17970968  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970967 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 17970868  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  17970867 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17970775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Original strand, 28345135 - 28345521
Alignment:
Q  43 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 142  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345135 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 28345234  T
Q  143 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||||    
T  28345235 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatacaa 28345328  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345329 atcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28345428  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  28345429 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 28345521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 10402112 - 10402499
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10402112 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10402211  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||          |||||||||||||||||||||||    
T  10402212 tcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaattctattttt-----ttctactttcaaagctatataca 10402305  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402306 aaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10402405  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  10402406 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10402499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286264
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 18286452  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18286451 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtac 18286352  T
Q  346 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18286351 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18286264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301565
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 18301753  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18301752 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtac 18301653  T
Q  346 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18301652 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18301565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 20071996 - 20072386
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20071996 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 20072095  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  20072096 tcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 20072189  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072190 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 20072289  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  20072290 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20072386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 5019676 - 5020063
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5019676 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5019775  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5019776 tcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctacttt-----cttctactttcaaagctatataca 5019869  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019870 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5019969  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  5019970 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 5020063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22865143 - 22864757
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22865143 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22865044  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  22865043 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgcttt---cttctactttcaaagctgtataca 22864950  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22864949 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22864850  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||| || ||| | ||| | |||||||||||    
T  22864849 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22864757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22880202 - 22879816
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22880202 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22880103  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  22880102 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgcttt---cttctactttcaaagctgtataca 22880009  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22880008 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22879909  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||| || ||| | ||| | |||||||||||    
T  22879908 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22879816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6537040 - 6536652
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6537040 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 6536941  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  6536940 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 6536846  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6536845 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacag 6536746  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  6536745 ggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 6536652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 50 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11104651 - 11104270
Alignment:
Q  50 ttcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcct 149  Q
    ||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11104651 ttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgcct 11104552  T
Q  150 ttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta--tatacaaaacat 247  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||  |||||||   ||    
T  11104551 tcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt----ctttttactttcaaagctaaatatacaatttat 11104457  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 347  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104456 tttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 11104357  T
Q  348 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  11104356 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11104270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 7079185 - 7079578
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7079185 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 7079284  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata-- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||||||||||||      
T  7079285 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagctatatata 7079379  T
Q  240 --caaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 335  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079380 tacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 7079479  T
Q  336 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  7079480 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 7079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 48471890 - 48472282
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48471890 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggag 48471989  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  48471990 tcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 48472084  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472085 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagca 48472184  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  48472185 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 48472282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 18057223 - 18057614
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18057223 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18057322  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  18057323 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 18057417  T
Q  241 aaaa-cattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18057418 aaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaa 18057517  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18057518 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 18057614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31030535 - 31030154
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31030535 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31030436  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31030435 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 31030341  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31030340 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31030246  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31030245 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaagatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31030154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 6207869 - 6208247
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6207869 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 6207968  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207969 ccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaaca 6208064  T
Q  247 ttttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 344  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208065 ttttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 6208158  T
Q  345 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6208159 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtggt 6208247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Original strand, 18336589 - 18336973
Alignment:
Q  40 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 138  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18336589 tacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 18336688  T
Q  139 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatat 238  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  18336689 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatat 18336783  T
Q  239 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  18336784 acaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaac 18336878  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  18336879 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctatggt 18336973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 434
Target Start/End: Original strand, 19700454 - 19700849
Alignment:
Q  47 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19700454 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 19700553  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa-- 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||| |||||||      
T  19700554 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt----ctttttactttcaaagctatgtacaaaaaa 19700648  T
Q  245 ---------cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctg 332  Q
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19700649 aaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctg 19700747  T
Q  333 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19700748 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattcttccccaggatagtctgtg 19700847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 4727602 - 4727978
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4727602 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 4727701  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4727702 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaacat 4727796  T
Q  248 tttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 345  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727797 tttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 4727890  T
Q  346 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4727891 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtggt 4727978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 47 - 434
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445496
Alignment:
Q  47 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatatacaaaaca 32445316  T
Q  247 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445317 ttttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 32445409  T
Q  347 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  32445410 ttcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32445496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15735392 - 15735009
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735392 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15735293  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          ||| ||||||||||| ||| |||     
T  15735292 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-----gctttcttttactttcaaagttatgtaca 15735199  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  15735198 aaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaac 15735104  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15735103 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15735009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 35886733 - 35887111
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  35886733 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 35886832  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  35886833 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaac 35886927  T
Q  246 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 343  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35886928 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggt 35887021  T
Q  344 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  35887022 acattcaaacg-aacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 35887111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 4689614 - 4689996
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4689614 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 4689713  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          ||| ||||||| ||| ||| |||    
T  4689714 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-----gctttcttttactttctaagttatgtac 4689807  T
Q  241 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  4689808 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 4689900  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||  ||| | ||| |||||||||||||    
T  4689901 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcagattctcctccaggatagtctgtggt 4689996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8283766 - 8283367
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283766 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 8283667  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||          | || ||||||||||| ||| |||     
T  8283666 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttg-aaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtaca 8283572  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaac 329  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||          ||||| | | ||||| |||||||||    
T  8283571 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaac 8283472  T
Q  330 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  8283471 ctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 8283372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 5658097 - 5658482
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658097 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5658196  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 239  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||        |||| ||||||||| | ||| ||    
T  5658197 tcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttccttttactttcaacgttatgta 5658291  T
Q  240 c-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| ||||    
T  5658292 caaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagca 5658385  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    || |||||||||| ||| | | | |||||||||||||    
T  5658386 acagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgttacaagcaggttctcctcaaggatagtctgtggt 5658482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15886857 - 15886650
Alignment:
Q  222 tactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 318  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||       ||    
T  15886857 tactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaagcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tt 15886765  T
Q  319 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |    
T  15886764 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 15886666  T
Q  419 caagatagtctgtggt 434  Q
    |  |||||||||||||    
T  15886665 ccggatagtctgtggt 15886650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15887004 - 15886894
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccgtgg 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15887004 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtgg 15886905  T
Q  140 agtcatgcctt 150  Q
    ||||| |||||    
T  15886904 agtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 126
Target Start/End: Original strand, 8002523 - 8002607
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 126  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002523 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239894
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 40239683  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239684 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 40239783  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| |    
T  40239784 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 40239882  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  40239883 atagtctgtggt 40239894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 27809699 - 27810089
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809699 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27809798  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27809799 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttt--cttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27810089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782618
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 27782406  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27782407 ttttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaa 27782506  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  27782507 agcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccagg 27782606  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  27782607 atagtctgtggt 27782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710457
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttcta 12710670  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710669 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 12710570  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||     
T  12710569 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 12710470  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||    
T  12710469 gatagtctgtggt 12710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 254896 - 254508
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254896 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 254797  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  254796 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 254700  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254699 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 254601  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  254600 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 254508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37946110 - 37945721
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946110 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37946011  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  37946010 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 37945914  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945913 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37945814  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  37945813 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37945721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 16167476 - 16167864
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167476 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16167575  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  16167576 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 16167670  T
Q  242 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167671 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 16167770  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  16167771 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16167864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 12592808 - 12593200
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592808 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12592907  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  12592908 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 12593003  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12593004 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaa 12593103  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  12593104 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12593200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22922388 - 22921999
Alignment:
Q  43 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 142  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922388 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 22922289  T
Q  143 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  22922288 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 22922191  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922190 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 22922091  T
Q  343 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  22922090 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22921999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 12661543 - 12661924
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12661543 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 12661642  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661643 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 12661737  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661738 tttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 12661837  T
Q  348 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  12661838 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12661924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13930790 - 13930400
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13930691  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  13930690 tcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 13930595  T
Q  242 aaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930594 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 13930495  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13930494 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 13930400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 3788492 - 3788879
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  3788492 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggag 3788591  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  3788592 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 3788686  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788687 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 3788786  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  3788787 gtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3788879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 37931370 - 37931765
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931370 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37931469  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnc--cttctactttcaaagctatata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||    
T  37931470 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatata 37931569  T
Q  240 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931570 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 37931669  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  37931670 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 37931765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19410729 - 19410340
Alignment:
Q  43 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 142  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410729 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 19410630  T
Q  143 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||| ||||    
T  19410629 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatacacaa 19410532  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19410531 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagga 19410432  T
Q  343 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  19410431 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 19410340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 39896048 - 39896454
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39896048 tcatctgaagcttctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccga 39896147  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||    
T  39896148 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 39896242  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39896243 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 39896342  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |    
T  39896343 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 39896442  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  39896443 atagtctgtggt 39896454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 27122523 - 27122909
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27122523 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27122622  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27122623 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 27122716  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27122717 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagg 27122816  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27122817 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27122909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 34867680 - 34868068
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34867680 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtaga 34867779  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  34867780 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 34867873  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867874 aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 34867973  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  34867974 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34868068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 37383675 - 37384063
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383675 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37383774  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  37383775 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 37383869  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383870 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 37383969  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  37383970 ggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37384063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9344231 - 9343843
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9344231 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9344132  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  9344131 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 9344037  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344036 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacag 9343937  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  9343936 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9343843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823193
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 16823394  T
Q  235 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16823393 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16823294  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  16823293 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 16823194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898287
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 16898086  T
Q  235 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16898087 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16898186  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  16898187 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 16898286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11629446 - 11629041
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629446 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11629347  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||| ||    
T  11629346 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----ctttta 11629253  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11629252 ttttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaa 11629153  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||     
T  11629152 aaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 11629054  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||    
T  11629053 gatagtctgtggt 11629041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39046066 - 39045678
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| |  || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39046066 cttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 39045967  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  39045966 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 39045872  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045871 aaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 39045772  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  39045771 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39045678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37680155 - 37679747
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37680155 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37680056  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  37680055 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 37679962  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttg 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  37679961 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttg 37679862  T
Q  320 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||    
T  37679861 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctcc 37679762  T
Q  420 aagatagtctgtggt 434  Q
    | |||||||||||||    
T  37679761 aggatagtctgtggt 37679747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37695420 - 37695012
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37695420 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37695321  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  37695320 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 37695227  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttg 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  37695226 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttg 37695127  T
Q  320 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||    
T  37695126 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctcc 37695027  T
Q  420 aagatagtctgtggt 434  Q
    | |||||||||||||    
T  37695026 aggatagtctgtggt 37695012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21697427 - 21697029
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697427 ttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21697328  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | | ||||||||||||||    
T  21697327 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----cttcctactttcaaagct 21697233  T
Q  235 atatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaac 329  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  21697232 atgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaac 21697134  T
Q  330 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtct 429  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21697133 ctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtct 21697034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 34160842 - 34161232
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34160842 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34160941  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  34160942 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 34161036  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161037 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 34161136  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  34161137 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34161232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21671435 - 21671026
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21671435 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21671336  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  21671335 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 21671242  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctatttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  21671241 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctatttt 21671142  T
Q  319 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | |    
T  21671141 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctc 21671042  T
Q  419 caagatagtctgtggt 434  Q
    || |||||||||||||    
T  21671041 caggatagtctgtggt 21671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 31882285 - 31882672
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31882285 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31882384  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31882385 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 31882478  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31882479 aaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacgg 31882578  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31882579 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31882672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 32055800 - 32056187
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32055800 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 32055899  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  32055900 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 32055993  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055994 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 32056093  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  32056094 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 32056187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 92 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868642
Alignment:
Q  92 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  192 tttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 291  Q
    ||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868879 tttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 31868786  T
Q  292 -gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctattt 390  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  31868785 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctattt 31868686  T
Q  391 caatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31868685 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31868642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 24 - 433
Target Start/End: Original strand, 27396303 - 27396718
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27396303 tcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 27396402  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  27396403 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 27396497  T
Q  224 ctttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttgt 311  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||    
T  27396498 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgt 27396597  T
Q  312 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggc 411  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27396598 cctttttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 27396696  T
Q  412 tcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  27396697 tcttccccaggatagtctgtgg 27396718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 34297154 - 34297535
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34297154 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 34297253  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  34297254 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 34297348  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  34297349 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34297442  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  34297443 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 34297535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19450689 - 19450274
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19450689 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 19450590  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||        |  ||||    
T  19450589 ctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctctcta 19450495  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg------aaaactttttgtc 312  Q
    ||||||||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||||    
T  19450494 ctttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtc 19450395  T
Q  313 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggct 412  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19450394 tgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggct 19450296  T
Q  413 cttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  19450295 cttccccaggatagtctgtggt 19450274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 28888277 - 28888660
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888277 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28888376  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  28888377 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 28888471  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  28888472 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 28888565  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28888566 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28888660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23122817 - 23122434
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23122817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgga 23122718  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  23122717 gtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtac 23122623  T
Q  241 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  23122622 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 23122529  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  23122528 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23122434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34269165 - 34268782
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34269165 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggag 34269066  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  34269065 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 34268971  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  34268970 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 34268878  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  34268877 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagattcttctctaggatagtctgtggt 34268782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27428690 - 27428309
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27428690 cttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27428591  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||| ||| | |     
T  27428590 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtgca 27428496  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||    
T  27428495 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 27428404  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  27428403 agggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtccgtggt 27428309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 20843910 - 20844298
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20843910 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 20844009  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc-aaagctatat- 238  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||| ||| |||| ||| |     
T  20844010 gtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttaccttcaaaagttatgtt 20844104  T
Q  239 -acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 335  Q
     | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||    
T  20844105 caaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagc 20844199  T
Q  336 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  20844200 aacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20844298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 434
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117182
Alignment:
Q  245 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 344  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  345 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23117182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31887737 - 31887682
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccacc 97  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31887737 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12423
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12036 cttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12135  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |    
T  12136 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatata 12230  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 12330  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  12331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28356176 - 28355778
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356176 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 28356077  T
Q  134 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||    
T  28356076 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttt--cttctactttcaaagc 28355979  T
Q  234 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355978 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 28355879  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  28355878 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 28355779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 9360622 - 9361009
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360622 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9360721  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9360722 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 9360816  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360817 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 9360916  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  9360917 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9361009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 31360528 - 31360916
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360528 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 31360627  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  31360628 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 31360722  T
Q  242 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360723 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 31360822  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31360823 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31360916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086551
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         |||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 12086764  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12086763 actttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaa 12086664  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||    
T  12086663 aagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 12086564  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||| ||||||||    
T  12086563 gataatctgtggt 12086551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31484087 - 31483698
Alignment:
Q  43 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 142  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484087 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 31483988  T
Q  143 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  31483987 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 31483890  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31483889 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaagg 31483790  T
Q  343 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31483789 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31483698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 33248366 - 33248753
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248366 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33248465  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  33248466 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 33248560  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248561 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 33248660  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  33248661 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33248753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 19680430 - 19680835
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680430 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19680529  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  19680530 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 19680623  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19680624 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 19680723  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |    
T  19680724 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 19680823  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  19680824 atagtctgtggt 19680835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 36 - 434
Target Start/End: Original strand, 29835317 - 29835710
Alignment:
Q  36 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  136 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta 235  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttt-----cttctactttcaaagcta 29835511  T
Q  236 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 335  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835512 tatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 29835611  T
Q  336 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  29835612 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagataatctgtggt 29835710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 18796706 - 18797095
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18796706 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 18796805  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18796806 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 18796900  T
Q  241 aaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796901 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 18797000  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18797001 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18797095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 15773574 - 15773962
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15773574 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15773673  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||| |||||||||||    
T  15773674 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcagagctatataca 15773768  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773769 aaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 15773868  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15773869 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15773962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21342381 - 21341998
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21342381 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21342282  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21342281 ccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 21342187  T
Q  247 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342186 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 21342087  T
Q  346 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||  ||||||||||||    
T  21342086 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagaatagtctgtggt 21341998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 44566980 - 44567371
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| ||||||||||||||  || || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44566980 cttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 44567079  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  44567080 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 44567173  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567174 aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 44567273  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  44567274 acagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 44567371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19911374 - 19910990
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19911374 aattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 19911275  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa--c 245  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| |||||||  |    
T  19911274 cttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttc----ctttttactttcaaagctatgtacaaaaaac 19911180  T
Q  246 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19911179 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggta 19911080  T
Q  345 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19911079 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 19910990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 18715480 - 18715870
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18715480 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18715579  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  18715580 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 18715673  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715674 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 18715773  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  18715774 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18715870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19202598 - 19202203
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagt-ttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202598 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19202499  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||                  
T  19202498 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat------------- 19202413  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19202412 --tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 19202315  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| | |||||    
T  19202314 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 19202215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 395
Target Start/End: Original strand, 33264731 - 33265079
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33264731 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33264830  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||     
T  33264831 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatacg 33264924  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264925 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33265024  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaata 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  33265025 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27603141 - 27602742
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603141 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27603042  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||    
T  27603041 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttcttttta 27602947  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 320  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||        ||||||    
T  27602946 ctttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttga 27602855  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||    
T  27602854 aaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 27602756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074758
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||        | |||||    
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 22074970  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  22074969 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttga 22074870  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    || |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22074869 aa-gcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccta 22074771  T
Q  421 agatagtctgtgg 433  Q
     ||||||||||||    
T  22074770 ggatagtctgtgg 22074758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 304
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260480
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 16260399  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260400 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19655560 - 19655175
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19655560 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19655461  T
Q  140 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 239  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| ||    
T  19655460 agtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgta 19655366  T
Q  240 c-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||    
T  19655365 caaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagca 19655273  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19655272 acagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagactcttccccaggatagtctttggt 19655175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2131478 - 2131096
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2131478 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2131379  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  2131378 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgtaca 2131284  T
Q  241 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||    
T  2131283 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaac 2131191  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  2131190 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 2131096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 19694095 - 19694479
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19694095 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 19694194  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||          | || ||||||||||| ||| |||    
T  19694195 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtac 19694289  T
Q  241 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  19694290 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 19694383  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||| | ||| |||||||||||||    
T  19694384 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtggt 19694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 22138906 - 22139288
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22138906 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 22139005  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||    
T  22139006 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtac 22139100  T
Q  241 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| |||||||    
T  22139101 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaa 22139191  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  22139192 cagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22139288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 434
Target Start/End: Original strand, 14569194 - 14569542
Alignment:
Q  80 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569194 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 14569293  T
Q  180 tgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aa 272  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  14569294 tgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaa 14569388  T
Q  273 tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 372  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14569389 tgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 14569480  T
Q  373 atatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
     | ||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  14569481 gtgtgttggtgtctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctccaggatattctgtggt 14569542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 30174472 - 30174861
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174472 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30174571  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  30174572 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 30174668  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174669 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30174768  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  30174769 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30174861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 33298522 - 33298932
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298522 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33298621  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||    
T  33298622 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttt---ttcta 33298718  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--ga 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  33298719 ctttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaa 33298818  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||    
T  33298819 aaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 33298918  T
Q  421 agatagtctgtggt 434  Q
     |||||||||||||    
T  33298919 ggatagtctgtggt 33298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 36 - 434
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795934
Alignment:
Q  36 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 135  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  136 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttt---cttctactttcaaagcta 3795735  T
Q  236 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795736 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 3795835  T
Q  336 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  3795836 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3795934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 33881132 - 33881521
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881132 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33881231  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||    
T  33881232 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt----ttccactttcaaagctatatac 33881327  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881328 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33881427  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  33881428 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 33881521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18369687 - 18369298
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369687 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 18369588  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18369587 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctattttt----cttctactttcaaagctatatac 18369492  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369491 aaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18369392  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18369391 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18369298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953546
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 28953758  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28953757 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaa 28953658  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||| | |||     
T  28953657 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccag 28953559  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||    
T  28953558 gatagtctgtggt 28953546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 11555367 - 11555748
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11555367 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 11555466  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555467 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 11555561  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555562 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 11555661  T
Q  348 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||    
T  11555662 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtcggtggt 11555748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820176
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttcta 31820387  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31820386 ttttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 31820287  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || ||    
T  31820286 gcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcagga 31820187  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  31820186 tagtctgtggt 31820176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32590042
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctacttt-----cttcta 32590254  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590253 ctttcaaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 32590154  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |    
T  32590153 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 32590054  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  32590053 atagtctgtggt 32590042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 22894405 - 22894810
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894405 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22894504  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  22894505 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 22894599  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22894600 ctttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttgaaa 22894699  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  22894700 -gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaagcagactcttccccagg 22894798  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||    
T  22894799 atagtctgtggt 22894810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 38 - 434
Target Start/End: Original strand, 30158037 - 30158429
Alignment:
Q  38 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 137  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158037 tgtactcgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 30158136  T
Q  138 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  30158137 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctaccttt----cttctactttcaaagctata 30158231  T
Q  238 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158232 tacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 30158331  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  30158332 acggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30158429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352410
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 37352622  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37352621 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaa 37352522  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |    
T  37352521 agcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 37352422  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||||    
T  37352421 ataatctgtggt 37352410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 37760989 - 37761378
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37760989 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggag 37761088  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  37761089 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 37761183  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37761184 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaaca 37761283  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||    
T  37761284 gggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagactgtggt 37761378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 41680711 - 41681100
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680711 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 41680810  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  41680811 tcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 41680906  T
Q  242 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41680907 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaaca 41681006  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  41681007 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41681100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 47 - 434
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084653
Alignment:
Q  47 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    |||||||||||||    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaac- 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||||||| |||||||||||      
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttcaaagttatatacaaaaat 43084464  T
Q  246 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084465 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 43084564  T
Q  346 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  43084565 attcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 43084653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 2517054 - 2517461
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517054 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 2517153  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||         ||||||    
T  2517154 ctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagat-tctatttt-----cttcta 2517247  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517248 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 2517347  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| | |||    
T  2517348 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctcca 2517447  T
Q  421 agatagtctgtggt 434  Q
     |||||||||||||    
T  2517448 ggatagtctgtggt 2517461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Original strand, 6880303 - 6880699
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880303 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 6880402  T
Q  134 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||         ||||||||||||||||    
T  6880403 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aagactctattttt----cttctactttcaaagc 6880497  T
Q  234 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880498 tatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 6880597  T
Q  333 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  6880598 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 6880697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 9323466 - 9323871
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323466 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 9323565  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  9323566 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 9323659  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9323660 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 9323759  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||    
T  9323760 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 9323859  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||||    
T  9323860 ataatctgtggt 9323871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 38 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8659629 - 8659238
Alignment:
Q  38 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8659629 tgtacttgtgaattcaaagtttcgg-gaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgt 8659531  T
Q  138 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  8659530 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctata 8659436  T
Q  238 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8659435 tacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagca 8659336  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  8659335 acagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13318981 - 13318594
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13318981 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 13318882  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  13318881 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 13318787  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13318786 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 13318687  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  13318686 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 13318594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 12138165 - 12138570
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138165 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 12138264  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  12138265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 12138358  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12138359 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 12138458  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||    
T  12138459 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 12138558  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||||    
T  12138559 ataatctgtggt 12138570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 47 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18494916 - 18494534
Alignment:
Q  47 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18494916 gaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 18494817  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 246  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||   |    
T  18494816 ccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-----cttctactttcaaagctatatacaattta 18494722  T
Q  247 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 346  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494721 ctttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 18494622  T
Q  347 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  18494621 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18494534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37746482 - 37746088
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37746482 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37746383  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || ||||||||||||||||||||    
T  37746382 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt----ctttttactttcaaagctatataca 37746287  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37746286 aaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37746187  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagc--gagtat----atgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  37746186 gtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37746088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 24729976 - 24730365
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729976 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24730075  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  24730076 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 24730169  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730170 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 24730269  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  24730270 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 24730365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 28655249 - 28655638
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655249 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28655348  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28655349 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 28655442  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655443 aaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 28655542  T
Q  339 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28655543 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28655638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40467707 - 40467319
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40467707 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggag 40467608  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  40467607 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 40467513  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467512 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 40467413  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  40467412 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40467319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9544862 - 9544473
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9544862 cttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9544764  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9544763 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 9544670  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9544669 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaa 9544570  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  9544569 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 9544473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522778
Alignment:
Q  35 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  135 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||           || |||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctt---ttttactttcaaagct 33522577  T
Q  235 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33522578 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 33522677  T
Q  334 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  33522678 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 33522777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 11329643 - 11330034
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329643 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11329742  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta--tat 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||  |||    
T  11329743 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctaaatat 11329837  T
Q  239 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329838 acaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 11329937  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  11329938 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11330034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15753006 - 15752624
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753006 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15752907  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  15752906 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 15752813  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752812 aaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15752717  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  15752716 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 15752624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Original strand, 23631982 - 23632366
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23631982 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgc 23632081  T
Q  148 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632082 cttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 23632176  T
Q  248 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23632177 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggta 23632276  T
Q  345 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  23632277 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttataagccggttctcctccaggatagtctgtggt 23632366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 26486385 - 26486780
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486385 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26486484  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||                  
T  26486485 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat------------- 26486570  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 322  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26486571 --tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 26486668  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||    
T  26486669 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 26486768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13180943 - 13180559
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13180943 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13180844  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  13180843 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 13180748  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  13180747 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 13180653  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  13180652 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 13180559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 30035433 - 30035820
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30035433 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 30035532  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  30035533 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 30035626  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035627 aaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 30035726  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||  ||| | |||||||| ||||||||    
T  30035727 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcagattctcctccaagataatctgtggt 30035820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 5643807 - 5644193
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5643807 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggag 5643906  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||    
T  5643907 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttttactttcaaagctatataca 5644000  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644001 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5644100  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  5644101 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 5644193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13436834 - 13436440
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436834 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13436735  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  13436734 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttcaaagctatatac 13436639  T
Q  241 aaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436638 aaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 13436539  T
Q  336 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  13436538 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatattacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13436440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18122570 - 18122182
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18122570 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18122471  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  18122470 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttttt---ttctactttcaaagctatataca 18122375  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122374 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18122275  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||| | ||| |||||||||||||    
T  18122274 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 18122182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 34622525 - 34622914
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34622525 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgga 34622624  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||    
T  34622625 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatac 34622719  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34622720 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 34622819  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  34622820 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 34622914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37665640 - 37665252
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37665640 cttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37665541  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  37665540 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctgtataca 37665446  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37665445 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaaca 37665346  T
Q  340 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  37665345 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 37665252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 31437471 - 31437852
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31437471 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31437570  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  31437571 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 31437665  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  31437666 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31437759  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  31437760 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 31437852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15652912 - 15652526
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15652912 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15652813  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  15652812 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 15652718  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||    
T  15652717 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagg 15652618  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15652617 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15652526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 47 - 408
Target Start/End: Original strand, 25206289 - 25206653
Alignment:
Q  47 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcat 145  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25206289 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25206388  T
Q  146 gcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaa 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||  |||    
T  25206389 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 25206483  T
Q  244 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25206484 acattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaa 25206582  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagca 408  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25206583 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25206653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 47 - 408
Target Start/End: Original strand, 25270445 - 25270809
Alignment:
Q  47 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcat 145  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25270445 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25270544  T
Q  146 gcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaa 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||  |||    
T  25270545 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 25270639  T
Q  244 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25270640 acattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaa 25270738  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagca 408  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25270739 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25270809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22993270 - 22992890
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22993270 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22993171  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  22993170 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 22993076  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  22993075 aaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22992982  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  22992981 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22992890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 434
Target Start/End: Original strand, 23897886 - 23898263
Alignment:
Q  47 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  23897886 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacg 23897985  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac----aa 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| |||    ||    
T  23897986 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaa 23898080  T
Q  243 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||    
T  23898081 aacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagg 23898170  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  23898171 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttgcaagcagattcttctccaggatagtctgtggt 23898263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 33783494 - 33783877
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33783494 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33783593  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  33783594 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 33783688  T
Q  241 aaaacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| ||||||    
T  33783689 aaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaa 33783781  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  33783782 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33783877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 434
Target Start/End: Original strand, 24975861 - 24976238
Alignment:
Q  47 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24975861 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 24975960  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24975961 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaac 24976055  T
Q  246 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 343  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976056 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 24976147  T
Q  344 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||    
T  24976148 acattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtggt 24976238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 24608252 - 24608636
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24608252 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24608351  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||          | || ||||||||||| ||| |||    
T  24608352 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttg-aaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtac 24608446  T
Q  241 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  24608447 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 24608539  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24608540 cagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24608636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 30940643 - 30941025
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30940643 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 30940742  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  30940743 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttg-aaattct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 30940837  T
Q  241 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||    
T  30940838 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 30940929  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  30940930 cagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30941025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 3647148 - 3647536
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3647148 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 3647247  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  3647248 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 3647343  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647344 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 3647443  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  3647444 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3647536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 10968667 - 10969056
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968667 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10968766  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  10968767 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 10968863  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968864 aaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 10968963  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | ||| ||| |||||||||    
T  10968964 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatggtctgtggt 10969056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 51644204 - 51644612
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644204 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 51644303  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  51644304 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttcta 51644400  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51644401 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaa 51644500  T
Q  323 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||  | |||||    
T  51644501 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcacctccaag 51644600  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||| ||||||||    
T  51644601 ataatctgtggt 51644612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 49 - 434
Target Start/End: Original strand, 10951100 - 10951482
Alignment:
Q  49 attcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcc 148  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10951100 attcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcc 10951199  T
Q  149 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951200 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatatacaaaacatt 10951296  T
Q  249 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 348  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10951297 ttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacatt 10951396  T
Q  349 caaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  10951397 caaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 10951482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 28591084 - 28591472
Alignment:
Q  41 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591084 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 28591183  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||    
T  28591184 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatac 28591278  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591279 aaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28591378  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28591379 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28591472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20334689 - 20334281
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334689 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20334590  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  20334589 ccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 20334495  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttg 319  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20334494 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg 20334395  T
Q  320 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccc 419  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20334394 aaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 20334296  T
Q  420 aagatagtctgtggt 434  Q
    | |||||||||||||    
T  20334295 aggatagtctgtggt 20334281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 28155728 - 28156118
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155728 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28155827  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28155828 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 28155921  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155922 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 28156021  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28156022 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28156118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41787565 - 41787175
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41787565 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 41787466  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  41787465 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 41787372  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787371 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 41787272  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  41787271 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41787175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 20466761 - 20467175
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466761 tcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20466860  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||| |    
T  20466861 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcca 20466955  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt--------gaaaactttttgtct 313  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         |||| ||  |||||    
T  20466956 ctttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtct 20467055  T
Q  314 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20467056 attttg-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 20467154  T
Q  414 ttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  20467155 ttccccatgatagtctgtggt 20467175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16202307 - 16201893
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202307 tcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16202208  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||    
T  16202207 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttcttttta 16202113  T
Q  224 ctttcaaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtct 313  Q
    |||||||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||    
T  16202112 ctttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtct 16202013  T
Q  314 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  16202012 attttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttc 16201914  T
Q  414 ttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  16201913 ttctccaggatagtctgtggt 16201893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21892020 - 21891628
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892020 tcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21891921  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||||     
T  21891920 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta--------ctttctt 21891830  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 320  Q
     ||       ||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      || | ||||||    
T  21891829 ttt-------tatgttcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttga 21891741  T
Q  321 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcccca 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||    
T  21891740 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 21891642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3045
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3354  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  3353 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 3256  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3255 ctttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 3156  T
Q  324 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaaga 423  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||    
T  3155 gcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 3056  T
Q  424 tagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||    
T  3055 tagtctgtggt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 218 - 434
Target Start/End: Original strand, 17980 - 18196
Alignment:
Q  218 cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17980 cttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattt 18079  T
Q  318 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttcc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |     
T  18080 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 18179  T
Q  418 ccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||| |||||||||||||    
T  18180 ccaggatagtctgtggt 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 15551 - 15964
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 15745  T
Q  224 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15746 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 15845  T
Q  317 ttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctctt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||     
T  15846 ttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 15945  T
Q  416 ccccaagatagtctgtggt 434  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  15946 ctccaggatagtctgtggt 15964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9895 - 9508
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9895 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9796  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9795 tcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 9701  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9700 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 9601  T
Q  342 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  9600 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14338
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         |||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 14125  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14126 actttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaa 14225  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||    
T  14226 aagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 14325  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||| ||||||||    
T  14326 gataatctgtggt 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9182 - 8795
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9182 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9083  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9082 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 8989  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8988 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacag 8889  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  8888 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4860 - 4469
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 139  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4860 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4761  T
Q  140 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4760 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatata 4666  T
Q  240 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4665 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaa 4566  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4565 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10301
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9914 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaag 10013  T
Q  142 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 241  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  10014 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 10107  T
Q  242 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10108 aaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10207  T
Q  341 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  10208 ggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 33297 - 33682
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33297 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 33396  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  33397 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtac 33491  T
Q  241 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaa 337  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||    
T  33492 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaa 33586  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  33587 cagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 1639 - 2045
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1639 tcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 1738  T
Q  123 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||    
T  1739 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttct 1832  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1833 actttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaa 1932  T
Q  322 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||      
T  1933 aagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgg 2032  T
Q  422 gatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||    
T  2033 gatagtctgtggt 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12445
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028 tcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12127  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaattt-gagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||        | ||||    
T  12128 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttct 12222  T
Q  223 actttcaaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttg 310  Q
    |||||||||||||| || ||||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  12223 actttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttg 12322  T
Q  311 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcagg 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12323 tctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 12421  T
Q  411 ctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  12422 ctcttctccaggatagtctgtggt 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 18585 - 18975
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18585 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 18684  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 240  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18685 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 18778  T
Q  241 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18779 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 18878  T
Q  338 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18879 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 433
Target Start/End: Original strand, 25097 - 25510
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25097 tcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 25196  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 223  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  25197 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 25291  T
Q  224 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------ctttttgtct 313  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||    
T  25292 ctttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtct 25391  T
Q  314 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctc 413  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25392 gttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 25490  T
Q  414 ttccccaagatagtctgtgg 433  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  25491 ttccccaggatagtctgtgg 25510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 434
Target Start/End: Original strand, 6066 - 6451
Alignment:
Q  42 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6066 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 6165  T
Q  141 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatat-- 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |      
T  6166 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgttc 6260  T
Q  239 acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 336  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||    
T  6261 aaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagca 6353  T
Q  337 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  6354 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25150 - 24772
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25150 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 25051  T
Q  147 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  25050 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaac 24956  T
Q  246 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 343  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24955 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggt 24862  T
Q  344 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24861 acattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 359 - 537
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 260 - 434
Target Start/End: Original strand, 1 - 175
Alignment:
Q  260 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  359 atgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 434  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtggt 175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26405 - 26243
Alignment:
Q  24 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 123  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26405 tcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaag 26306  T
Q  124 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 186  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26305 ctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40759
Alignment:
Q  48 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgtt-caat-gtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggag 141  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  142 tcatgcctttggct-gaccaccactcttatacatcaattt 180  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40495
Alignment:
Q  325 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatat-gtgctacaagcaggctcttccccaag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||  || |||||||||| ||| | ||| |    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  423 atagtctgtggt 434  Q
    ||||| ||||||    
T  40506 atagtatgtggt 40495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University