View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18104_low_15 (Length: 267)

Name: NF18104_low_15
Description: NF18104
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18104_low_15
NF18104_low_15
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (164-261)||(28372114-28372211)
chr5 (164-260)||(37600041-37600137)
chr5 (164-260)||(38146451-38146547)
chr5 (164-260)||(19510412-19510508)
chr5 (164-260)||(22338962-22339058)
chr5 (164-260)||(33473964-33474060)
chr5 (166-260)||(22335432-22335526)
chr5 (164-260)||(22120624-22120720)
chr5 (164-260)||(23113435-23113531)
chr5 (164-260)||(41878684-41878780)
chr5 (164-260)||(15238150-15238246)
chr5 (167-260)||(24768598-24768691)
chr5 (164-260)||(20294464-20294560)
chr5 (164-247)||(18354760-18354843)
chr5 (164-250)||(19474205-19474291)
chr5 (164-260)||(10751767-10751863)
chr5 (164-260)||(20912285-20912381)
chr5 (186-260)||(22108503-22108577)
chr5 (164-250)||(40727432-40727517)
chr5 (164-260)||(11219505-11219601)
chr5 (164-260)||(11224091-11224187)
chr5 (164-260)||(11227913-11228009)
chr5 (164-260)||(11226107-11226203)
chr5 (164-260)||(11229903-11229999)
chr5 (164-255)||(36459503-36459594)
chr5 (22-66)||(22335692-22335736)
chr5 (22-66)||(22339222-22339266)
chr5 (22-66)||(23113293-23113337)
chr5 (22-66)||(28371906-28371950)
chr5 (164-219)||(22749152-22749207)
chr5 (22-66)||(37599899-37599943)
chr5 (33-66)||(22749305-22749338)
chr5 (22-66)||(41878542-41878586)
chr5 (22-66)||(42959609-42959653)
chr5 (27-66)||(38146314-38146353)
chr5 (33-66)||(19510606-19510639)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (164-260)||(109551-109647)
scaffold0026 (33-66)||(109745-109778)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (164-260)||(224175-224271)
scaffold0012 (30-66)||(224041-224077)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (164-260)||(14420737-14420833)
chr7 (164-260)||(18871247-18871343)
chr7 (167-260)||(15166200-15166293)
chr7 (164-260)||(10897929-10898025)
chr7 (164-260)||(146450-146546)
chr7 (164-260)||(834078-834174)
chr7 (164-260)||(1199258-1199354)
chr7 (164-260)||(16004954-16005050)
chr7 (164-260)||(41283595-41283691)
chr7 (164-260)||(18606285-18606384)
chr7 (164-260)||(838166-838262)
chr7 (164-260)||(1203346-1203442)
chr7 (164-260)||(11660232-11660328)
chr7 (164-260)||(13891580-13891676)
chr7 (164-260)||(16110008-16110104)
chr7 (164-260)||(10607353-10607449)
chr7 (164-260)||(13891963-13892059)
chr7 (164-260)||(16582371-16582467)
chr7 (167-250)||(11302267-11302350)
chr7 (164-260)||(7520248-7520345)
chr7 (164-260)||(39268346-39268442)
chr7 (164-260)||(39721145-39721242)
chr7 (164-260)||(9752540-9752636)
chr7 (164-260)||(15083175-15083272)
chr7 (164-260)||(31675-31771)
chr7 (164-260)||(72404-72500)
chr7 (164-260)||(76513-76609)
chr7 (164-260)||(12706155-12706251)
chr7 (164-260)||(12713490-12713586)
chr7 (164-260)||(12722148-12722244)
chr7 (164-260)||(16908542-16908638)
chr7 (164-260)||(18277944-18278040)
chr7 (164-260)||(18281908-18282004)
chr7 (164-260)||(18424185-18424281)
chr7 (164-260)||(2531365-2531460)
chr7 (164-260)||(2833514-2833610)
chr7 (164-260)||(12717237-12717333)
chr7 (164-250)||(26291116-26291203)
chr7 (164-246)||(45171533-45171615)
chr7 (164-255)||(15213003-15213094)
chr7 (184-260)||(9752644-9752720)
chr7 (164-219)||(20486733-20486788)
chr7 (164-220)||(25928404-25928460)
chr7 (164-229)||(1860054-1860119)
chr7 (164-220)||(13919445-13919501)
chr7 (22-66)||(146644-146688)
chr7 (22-66)||(10897787-10897831)
chr7 (22-66)||(18871441-18871485)
chr7 (33-66)||(16005148-16005181)
chr7 (22-63)||(29795310-29795351)
chr7 (22-63)||(29799129-29799170)
chr7 (30-66)||(11660426-11660462)
chr7 (164-210)||(16185524-16185570)
chr7 (22-66)||(18606481-18606526)
chr7 (184-220)||(9752728-9752764)
chr7 (184-220)||(39268450-39268486)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (164-260)||(15533169-15533265)
chr4 (164-260)||(18211554-18211650)
chr4 (164-260)||(24048417-24048513)
chr4 (164-260)||(36036902-36036998)
chr4 (164-260)||(28384801-28384897)
chr4 (164-260)||(30145733-30145829)
chr4 (164-260)||(49549115-49549212)
chr4 (164-260)||(17052478-17052574)
chr4 (164-260)||(22634959-22635055)
chr4 (164-260)||(20158480-20158576)
chr4 (164-260)||(20163931-20164027)
chr4 (164-260)||(13813865-13813961)
chr4 (164-260)||(13818353-13818449)
chr4 (164-245)||(12422908-12422989)
chr4 (164-260)||(4562806-4562902)
chr4 (164-260)||(5758488-5758584)
chr4 (164-260)||(9555019-9555115)
chr4 (164-260)||(14759024-14759120)
chr4 (164-260)||(14955792-14955888)
chr4 (164-260)||(15223496-15223592)
chr4 (164-260)||(20161156-20161252)
chr4 (184-260)||(24048521-24048597)
chr4 (164-260)||(33740786-33740882)
chr4 (164-260)||(12486221-12486317)
chr4 (164-260)||(23996999-23997094)
chr4 (164-260)||(25688392-25688488)
chr4 (164-247)||(17807017-17807100)
chr4 (166-260)||(38106897-38106990)
chr4 (184-260)||(13818457-13818533)
chr4 (164-220)||(631780-631836)
chr4 (164-210)||(10711825-10711871)
chr4 (164-210)||(10925595-10925641)
chr4 (22-66)||(15533363-15533407)
chr4 (22-66)||(18211769-18211813)
chr4 (22-66)||(36037096-36037140)
chr4 (178-246)||(40906323-40906391)
chr4 (164-210)||(27532752-27532798)
chr4 (167-220)||(14047308-14047361)
chr4 (178-246)||(38106798-38106866)
chr4 (184-220)||(22635063-22635099)
chr4 (30-66)||(24048283-24048319)
chr4 (22-66)||(30145928-30145972)
chr4 (184-229)||(13813969-13814014)
chr4 (184-229)||(13818541-13818586)
chr4 (30-66)||(17142431-17142467)
chr4 (22-66)||(49548973-49549017)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (164-260)||(14764828-14764924)
chr3 (164-260)||(3801920-3802016)
chr3 (164-260)||(23372576-23372672)
chr3 (164-260)||(51299483-51299579)
chr3 (164-260)||(54519547-54519643)
chr3 (164-260)||(41084-41180)
chr3 (164-260)||(9532208-9532304)
chr3 (164-260)||(10834974-10835070)
chr3 (164-260)||(13435768-13435864)
chr3 (164-260)||(18899400-18899499)
chr3 (164-260)||(20249882-20249978)
chr3 (164-260)||(29545971-29546067)
chr3 (164-260)||(12853396-12853492)
chr3 (164-260)||(16795453-16795549)
chr3 (164-260)||(8928900-8928996)
chr3 (164-260)||(11301698-11301794)
chr3 (164-260)||(5219797-5219893)
chr3 (164-260)||(19774148-19774244)
chr3 (164-260)||(38312890-38312985)
chr3 (164-260)||(7108188-7108284)
chr3 (164-260)||(7112123-7112219)
chr3 (164-260)||(11068563-11068659)
chr3 (164-260)||(11167126-11167222)
chr3 (164-247)||(12304136-12304220)
chr3 (164-247)||(16326074-16326158)
chr3 (164-260)||(22320079-22320175)
chr3 (164-260)||(22335134-22335230)
chr3 (164-260)||(28948411-28948507)
chr3 (164-260)||(55021326-55021422)
chr3 (164-250)||(11853666-11853752)
chr3 (164-260)||(30064334-30064431)
chr3 (164-260)||(4108822-4108918)
chr3 (164-260)||(4112671-4112767)
chr3 (164-260)||(14664375-14664471)
chr3 (164-260)||(14667539-14667635)
chr3 (164-260)||(15616127-15616223)
chr3 (164-260)||(12337206-12337302)
chr3 (164-260)||(14497898-14497993)
chr3 (164-260)||(16751934-16752030)
chr3 (164-255)||(11912382-11912473)
chr3 (164-250)||(18933388-18933475)
chr3 (164-246)||(15963461-15963543)
chr3 (164-246)||(15967385-15967467)
chr3 (164-246)||(15971309-15971391)
chr3 (164-219)||(14670017-14670072)
chr3 (164-219)||(14681541-14681596)
chr3 (178-260)||(15564801-15564883)
chr3 (166-255)||(16840238-16840327)
chr3 (164-220)||(15463868-15463924)
chr3 (178-246)||(15555602-15555670)
chr3 (164-210)||(4590193-4590239)
chr3 (164-210)||(8491765-8491811)
chr3 (164-210)||(17318542-17318588)
chr3 (22-66)||(3802114-3802158)
chr3 (22-66)||(9532402-9532446)
chr3 (22-66)||(12304318-12304362)
chr3 (22-66)||(14764686-14764730)
chr3 (164-220)||(23173287-23173343)
chr3 (22-66)||(23372434-23372478)
chr3 (22-66)||(29545808-29545852)
chr3 (22-66)||(51299677-51299721)
chr3 (210-260)||(17348806-17348856)
chr3 (166-210)||(14068097-14068141)
chr3 (33-66)||(20249751-20249784)
chr3 (22-66)||(54519741-54519785)
chr3 (33-66)||(10834877-10834910)
chr3 (30-63)||(18899579-18899612)
chr3 (33-66)||(38312738-38312771)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (164-260)||(10686279-10686375)
chr2 (164-260)||(19663590-19663686)
chr2 (164-260)||(20260207-20260303)
chr2 (164-260)||(9240624-9240720)
chr2 (164-260)||(6481734-6481830)
chr2 (164-260)||(6485201-6485297)
chr2 (164-260)||(37378986-37379082)
chr2 (164-260)||(21074540-21074636)
chr2 (164-260)||(10103329-10103425)
chr2 (164-260)||(12902639-12902735)
chr2 (164-260)||(24630080-24630176)
chr2 (164-260)||(24645101-24645197)
chr2 (164-260)||(24647044-24647140)
chr2 (164-260)||(24647877-24647973)
chr2 (164-260)||(30346690-30346786)
chr2 (164-250)||(27381026-27381112)
chr2 (164-250)||(27384996-27385082)
chr2 (164-260)||(27600321-27600417)
chr2 (164-260)||(31343867-31343963)
chr2 (164-246)||(41532475-41532557)
chr2 (164-220)||(9783984-9784040)
chr2 (22-66)||(6262104-6262148)
chr2 (22-66)||(19663382-19663426)
chr2 (22-66)||(20260401-20260445)
chr2 (22-66)||(10686180-10686224)
chr2 (33-66)||(6481928-6481961)
chr2 (33-66)||(6485395-6485428)
chr2 (29-66)||(21074405-21074442)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (167-260)||(8729645-8729738)
chr8 (164-260)||(11774246-11774342)
chr8 (164-260)||(363218-363314)
chr8 (164-260)||(8415009-8415105)
chr8 (164-260)||(27942718-27942814)
chr8 (164-260)||(23427776-23427872)
chr8 (164-260)||(21409850-21409947)
chr8 (164-260)||(21804342-21804439)
chr8 (164-260)||(14399125-14399221)
chr8 (164-260)||(21829493-21829589)
chr8 (164-260)||(21974216-21974312)
chr8 (164-260)||(43250152-43250248)
chr8 (164-245)||(44385866-44385947)
chr8 (164-260)||(21978326-21978422)
chr8 (164-260)||(22110551-22110647)
chr8 (164-246)||(18864137-18864219)
chr8 (164-246)||(30941597-30941679)
chr8 (164-220)||(23913255-23913311)
chr8 (164-249)||(21328527-21328612)
chr8 (167-255)||(42560917-42561005)
chr8 (164-210)||(21386159-21386205)
chr8 (164-210)||(21968025-21968071)
chr8 (164-210)||(21980865-21980911)
chr8 (164-210)||(21985848-21985894)
chr8 (164-210)||(22000811-22000857)
chr8 (164-210)||(22009229-22009275)
chr8 (33-66)||(44475843-44475876)
chr8 (33-66)||(44479105-44479138)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (164-260)||(150-246)
[»] scaffold0544 (3 HSPs)
scaffold0544 (164-260)||(3549-3645)
scaffold0544 (200-260)||(1-61)
scaffold0544 (29-66)||(3414-3451)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (164-260)||(4475745-4475841)
chr6 (164-260)||(12941171-12941267)
chr6 (164-260)||(23955319-23955415)
chr6 (164-260)||(27222782-27222878)
chr6 (164-260)||(28290927-28291023)
chr6 (164-260)||(22075423-22075519)
chr6 (164-260)||(14470831-14470927)
chr6 (164-260)||(23537931-23538027)
chr6 (164-260)||(27416560-27416656)
chr6 (166-260)||(31479497-31479591)
chr6 (164-260)||(8242362-8242458)
chr6 (164-260)||(11565351-11565447)
chr6 (164-260)||(11716973-11717069)
chr6 (164-260)||(12620366-12620462)
chr6 (164-260)||(23988253-23988349)
chr6 (164-260)||(27555490-27555585)
chr6 (164-260)||(23400627-23400724)
chr6 (164-260)||(16758665-16758761)
chr6 (164-260)||(22947617-22947713)
chr6 (164-260)||(22951573-22951669)
chr6 (164-260)||(23870061-23870157)
chr6 (164-260)||(23874017-23874113)
chr6 (164-246)||(23393605-23393687)
chr6 (164-246)||(23413513-23413595)
chr6 (164-260)||(22861705-22861801)
chr6 (164-237)||(19869160-19869233)
chr6 (164-255)||(1254114-1254205)
chr6 (164-255)||(34297805-34297896)
chr6 (164-250)||(16622797-16622881)
chr6 (164-260)||(25737842-25737938)
chr6 (166-220)||(2076276-2076330)
chr6 (164-210)||(18918613-18918659)
chr6 (22-66)||(12941365-12941409)
chr6 (22-62)||(4475944-4475984)
chr6 (164-210)||(18953516-18953562)
chr6 (33-66)||(27222976-27223009)
chr6 (184-220)||(23537887-23537923)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (164-260)||(32649017-32649113)
chr1 (164-260)||(16370875-16370971)
chr1 (166-260)||(29533837-29533931)
chr1 (167-260)||(20439188-20439281)
chr1 (164-260)||(22132131-22132227)
chr1 (164-260)||(33795983-33796079)
chr1 (164-260)||(1009212-1009308)
chr1 (164-260)||(1926828-1926924)
chr1 (164-260)||(16376848-16376944)
chr1 (164-260)||(20925842-20925938)
chr1 (164-250)||(20230171-20230258)
chr1 (164-260)||(41389697-41389793)
chr1 (164-260)||(39245203-39245297)
chr1 (164-260)||(39248758-39248852)
chr1 (164-260)||(52634218-52634314)
chr1 (164-220)||(41801311-41801367)
chr1 (164-210)||(21406253-21406299)
chr1 (33-66)||(16371069-16371102)
chr1 (30-66)||(28311709-28311745)
chr1 (30-66)||(29533997-29534033)
chr1 (30-66)||(32649229-32649265)
[»] scaffold0337 (2 HSPs)
scaffold0337 (164-255)||(10854-10945)
scaffold0337 (22-66)||(10712-10756)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (167-260)||(37568-37661)
scaffold0124 (164-260)||(25600-25696)
scaffold0124 (33-66)||(37478-37511)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (164-260)||(5192-5288)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (164-260)||(33887-33983)
scaffold0080 (164-214)||(28468-28518)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (167-260)||(8775-8868)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (164-260)||(853-949)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (164-250)||(14804-14890)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (164-260)||(5563-5659)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (164-260)||(18773-18869)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (164-260)||(70705-70801)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (167-260)||(11095-11188)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (164-260)||(11001-11097)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (164-260)||(60358-60454)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (164-260)||(11727-11823)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (164-260)||(34160-34256)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (164-260)||(68588-68684)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (164-246)||(15607-15689)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (164-260)||(5775-5871)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (164-255)||(4076-4167)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (164-247)||(8540-8623)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (164-220)||(6993-7049)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (164-260)||(6353-6448)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (164-220)||(74364-74420)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (176-260)||(115390-115473)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (164-211)||(37235-37282)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (164-212)||(10765-10813)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (164-210)||(3974-4020)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (164-210)||(23970-24016)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (164-210)||(62872-62918)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (201-260)||(641-700)
scaffold1873 (184-212)||(605-633)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (164-210)||(37230-37276)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (164-255)||(163600-163691)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (190-220)||(21390-21420)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 261
Target Start/End: Original strand, 28372114 - 28372211
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28372114 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtc 28372211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 37600041 - 37600137
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37600041 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 37600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 38146451 - 38146547
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38146451 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 38146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19510508 - 19510412
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19510508 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 19510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22339058 - 22338962
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22339058 acttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaataatgatgt 22338962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 33473964 - 33474060
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473964 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 33474060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22335526 - 22335432
Alignment:
Q  166 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22335526 ttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaataatgatgt 22335432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 22120624 - 22120720
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120624 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 22120720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 23113435 - 23113531
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23113435 acttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 23113531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 41878684 - 41878780
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41878684 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 41878780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 15238150 - 15238246
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15238150 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 24768598 - 24768691
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  24768598 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaattaatgatgt 24768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20294560 - 20294464
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20294560 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 20294464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18354843 - 18354760
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattat 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18354843 acttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattat 18354760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 19474205 - 19474291
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19474205 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 19474291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10751863 - 10751767
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10751863 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 10751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 20912285 - 20912381
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  20912285 acttgatgatgtgtatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaattaatgatgt 20912381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 260
Target Start/End: Original strand, 22108503 - 22108577
Alignment:
Q  186 ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22108503 ttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 40727432 - 40727517
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40727432 acttgatgatg-ttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaa 40727517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11219601 - 11219505
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11219601 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11219505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11224187 - 11224091
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11224187 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11224091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11228009 - 11227913
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11228009 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11227913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11226203 - 11226107
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11226203 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11226107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11229999 - 11229903
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11229999 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11229903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36459594 - 36459503
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36459594 acttaatgatgattatgttaagttgataagttgttccttattcatgttttgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 36459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22335736 - 22335692
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22335736 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 22335692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22339266 - 22339222
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339266 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 22339222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 23113293 - 23113337
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113293 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 23113337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 28371906 - 28371950
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28371906 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 28371950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22749207 - 22749152
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  22749207 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatgagttgttaat 22749152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 37599899 - 37599943
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37599899 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgaagactgtt 37599943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22749338 - 22749305
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22749338 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 22749305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 41878542 - 41878586
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41878542 tgagaagatgtttatgataatgattacgaagttatgatgactgtt 41878586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 42959653 - 42959609
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42959653 tgagaagatgtttatgatatttattatgatgttatgatgactgtt 42959609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 66
Target Start/End: Original strand, 38146314 - 38146353
Alignment:
Q  27 agatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38146314 agatttttatgatattgattacgatgtcatgatgactgtt 38146353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19510639 - 19510606
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19510639 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 19510606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 109647 - 109551
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109647 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 109551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 109778 - 109745
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  109778 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 109745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 224175 - 224271
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224175 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 224271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 224041 - 224077
Alignment:
Q  30 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224041 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 224077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14420833 - 14420737
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14420833 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 14420737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18871343 - 18871247
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871343 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18871247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15166293 - 15166200
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15166293 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15166200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 10897929 - 10898025
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897929 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10898025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 146546 - 146450
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146546 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 834078 - 834174
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  834078 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 1199258 - 1199354
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1199258 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 1199354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16005050 - 16004954
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16005050 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 16004954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41283691 - 41283595
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41283691 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 41283595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18606384 - 18606285
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattatta---ttatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18606384 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattattatgaaatgatgatgt 18606285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 838166 - 838262
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  838166 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 838262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 1203346 - 1203442
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1203346 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 1203442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11660328 - 11660232
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11660328 acttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaattatgatgt 11660232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13891676 - 13891580
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13891676 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 16110008 - 16110104
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16110008 acttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 16110104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 10607353 - 10607449
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10607353 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10607449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13892059 - 13891963
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13892059 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13891963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16582467 - 16582371
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16582467 acttgatgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 16582371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11302350 - 11302267
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11302350 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 11302267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 7520248 - 7520345
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7520248 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 7520345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 39268346 - 39268442
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39268346 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 39268442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39721242 - 39721145
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39721242 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39721145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 9752540 - 9752636
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9752540 acttggtgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15083272 - 15083175
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaag-ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15083272 acttgatgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15083175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31771 - 31675
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31771 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 72404 - 72500
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  72404 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 72500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 76513 - 76609
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  76513 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 76609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 12706155 - 12706251
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12706155 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12706251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12713586 - 12713490
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12713586 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12713490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12722244 - 12722148
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12722244 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12722148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 16908542 - 16908638
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16908542 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16908638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18278040 - 18277944
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18278040 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18277944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18282004 - 18281908
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18282004 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18281908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18424281 - 18424185
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18424281 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18424185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 2531365 - 2531460
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2531365 acttgatgatg-ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataaagagatgttttatgaataattattattatgaattaatgatgt 2531460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 2833514 - 2833610
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2833514 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgttcaatgaataattattattatgaattaatgatgt 2833610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12717333 - 12717237
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12717333 acttgctgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12717237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26291203 - 26291116
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26291203 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaa 26291116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 45171533 - 45171615
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  45171533 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 45171615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15213094 - 15213003
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15213094 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 15213003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Original strand, 9752644 - 9752720
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9752644 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20486788 - 20486733
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20486788 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 20486733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 25928404 - 25928460
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25928404 actttatgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgctaatg 25928460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 229
Target Start/End: Original strand, 1860054 - 1860119
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 229  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  1860054 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttg 1860119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 13919445 - 13919501
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919445 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 13919501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 146688 - 146644
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146688 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 146644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 10897787 - 10897831
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897787 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 10897831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18871485 - 18871441
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871485 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 18871441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16005181 - 16005148
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16005181 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 16005148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 29795351 - 29795310
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgact 63  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29795351 tgagaagatgtttataatattgattacgatgttatgatgact 29795310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 29799170 - 29799129
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgact 63  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29799170 tgagaagatgtttataatattgattacgatgttatgatgact 29799129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11660462 - 11660426
Alignment:
Q  30 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11660462 tgtttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 11660426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16185570 - 16185524
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16185570 acttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattcatga 16185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18606526 - 18606481
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgata-ttgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18606526 tgagaagatgtttatgataattgattatgatgttatgatgactgtt 18606481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Original strand, 9752728 - 9752764
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9752728 agttgataagttatcttttattcatgaattgataatg 9752764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Original strand, 39268450 - 39268486
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39268450 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatg 39268486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15533265 - 15533169
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533265 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15533169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18211650 - 18211554
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211650 acttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18211554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 24048417 - 24048513
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048417 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36036998 - 36036902
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36036998 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttcatgaataattattattatgaaatgatgatgt 36036902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28384897 - 28384801
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384897 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 28384801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30145829 - 30145733
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30145829 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 30145733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 49549115 - 49549212
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataa-gttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49549115 acttgatgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 49549212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 17052478 - 17052574
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17052478 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 17052574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 22634959 - 22635055
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22634959 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 20158480 - 20158576
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20158480 acttgatgatgcttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 20163931 - 20164027
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20163931 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20164027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 13813865 - 13813961
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13813865 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13813961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 13818353 - 13818449
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13818353 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12422989 - 12422908
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12422989 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 12422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 4562806 - 4562902
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4562806 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4562902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 5758488 - 5758584
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5758488 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 5758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9555115 - 9555019
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9555115 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 9555019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 14759024 - 14759120
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14759024 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14759120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 14955792 - 14955888
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14955792 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14955888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15223592 - 15223496
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15223592 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15223496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 20161156 - 20161252
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20161156 acttgataatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Original strand, 24048521 - 24048597
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048521 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgttaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33740882 - 33740786
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33740882 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 33740786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12486317 - 12486221
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12486317 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12486221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 23996999 - 23997094
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23996999 acttgatgatggttatgt-aagttgataagttctcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataatcattattatgaattaatgatgt 23997094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25688488 - 25688392
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25688488 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 25688392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17807100 - 17807017
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattat 247  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17807100 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattat 17807017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38106990 - 38106897
Alignment:
Q  166 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  38106990 ttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtctttcattcatgagttgctaat-gaatgtttgatgaagaattattattatgaattaatgatgt 38106897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Original strand, 13818457 - 13818533
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13818457 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 631780 - 631836
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  631780 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatgagttgctaatg 631836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10711871 - 10711825
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10711871 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10711825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10925641 - 10925595
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10925641 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10925595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15533407 - 15533363
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533407 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 15533363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18211813 - 18211769
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211813 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 18211769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 36037140 - 36037096
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36037140 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 36037096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40906391 - 40906323
Alignment:
Q  178 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  40906391 atgttaagttgttaagttgtcttctattcataagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattatta 40906323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27532798 - 27532752
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27532798 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttctattcatga 27532752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14047361 - 14047308
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  14047361 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtattttattcatgagttgttaatg 14047308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38106866 - 38106798
Alignment:
Q  178 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  38106866 atgttaagttgttaagttgtcttctatttatgagttgctaatgagatgttttatgaagaattattatta 38106798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Original strand, 22635063 - 22635099
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22635063 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 22635099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 24048283 - 24048319
Alignment:
Q  30 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24048283 tgtttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 24048319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 30145972 - 30145928
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30145972 tgagaagatgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 30145928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 13813969 - 13814014
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  13813969 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttg 13814014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 13818541 - 13818586
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  13818541 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttg 13818586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17142467 - 17142431
Alignment:
Q  30 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17142467 tgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 17142431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 49548973 - 49549017
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  49548973 tgagaagatgtttatgataatgattacgaagttatgatgattgtt 49549017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 14764828 - 14764924
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764828 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 14764924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3802016 - 3801920
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3802016 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 3801920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 23372576 - 23372672
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23372576 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23372672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51299579 - 51299483
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51299579 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 51299483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 54519643 - 54519547
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54519643 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 54519547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41180 - 41084
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 41084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9532304 - 9532208
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9532304 acttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 9532208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 10834974 - 10835070
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834974 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10835070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13435864 - 13435768
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13435864 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18899499 - 18899400
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgc---taatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899499 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18899400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 20249882 - 20249978
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20249882 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatattcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 20249978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 29545971 - 29546067
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545971 acttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatggaaggtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 29546067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 12853396 - 12853492
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12853396 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 12853492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16795549 - 16795453
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16795549 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 16795453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 8928900 - 8928996
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8928900 acttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 8928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 11301698 - 11301794
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11301698 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 11301794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5219893 - 5219797
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5219893 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 5219797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19774244 - 19774148
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19774244 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 19774148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 38312890 - 38312985
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat-ggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38312890 acttgatgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatgaa-tgctaatgggaatgttcgatgaat-attattattatgaaatgatgatgt 38312985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7108284 - 7108188
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7108284 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 7108188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7112219 - 7112123
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7112219 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 7112123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11068659 - 11068563
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11068659 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11068563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 11167126 - 11167222
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11167126 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12304220 - 12304136
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataat-tattattat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12304220 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaattatatattattat 12304136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Original strand, 16326074 - 16326158
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataat-tattattat 247  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16326074 acttgatgagggttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaattatatattattat 16326158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22320175 - 22320079
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22320175 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22320079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22335230 - 22335134
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22335230 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22335134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28948507 - 28948411
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28948507 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 28948411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 55021422 - 55021326
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  55021422 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 55021326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11853752 - 11853666
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11853752 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaa 11853666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30064431 - 30064334
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30064431 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaattaatgatgt 30064334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 4108822 - 4108918
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4108822 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4108918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 4112671 - 4112767
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4112671 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14664471 - 14664375
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  14664471 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaattaatgatgt 14664375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14667635 - 14667539
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  14667635 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaattaatgatgt 14667539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15616223 - 15616127
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15616223 acttgaagatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15616127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12337302 - 12337206
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgga-atgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12337302 acttgatgatgtttatgttaaattgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 12337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14497993 - 14497898
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14497993 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 16751934 - 16752030
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16751934 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttatcttttattcatcaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16752030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11912473 - 11912382
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11912473 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 11912382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 18933388 - 18933475
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18933388 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaa 18933475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15963543 - 15963461
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15963543 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 15963461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15967467 - 15967385
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15967467 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 15967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15971391 - 15971309
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15971391 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 15971309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14670072 - 14670017
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14670072 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14670017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14681596 - 14681541
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14681596 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15564883 - 15564801
Alignment:
Q  178 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15564883 atgttaagttgatgtgttgtcttctgttcatgagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattattatgaattgatgatgt 15564801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 255
Target Start/End: Original strand, 16840238 - 16840327
Alignment:
Q  166 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16840238 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagattcttgctgaataattattgttatgaattgat 16840327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15463924 - 15463868
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15463924 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 15463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15555670 - 15555602
Alignment:
Q  178 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15555670 atgttaagttgttaagttgtcttatattcatgagttgctaatgagatgtttgatgaagaattattatta 15555602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 4590193 - 4590239
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4590193 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 4590239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 8491765 - 8491811
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8491765 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 8491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 17318542 - 17318588
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17318542 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 17318588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 3802158 - 3802114
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802158 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 3802114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9532446 - 9532402
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9532446 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 9532402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12304362 - 12304318
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304362 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 12304318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 14764686 - 14764730
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764686 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 14764730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23173343 - 23173287
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23173343 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatg 23173287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 23372434 - 23372478
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23372434 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 23372478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 29545808 - 29545852
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545808 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 29545852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 51299721 - 51299677
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51299721 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 51299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 260
Target Start/End: Original strand, 17348806 - 17348856
Alignment:
Q  210 aattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17348806 aattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 17348856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 210
Target Start/End: Original strand, 14068097 - 14068141
Alignment:
Q  166 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14068097 ttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 14068141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Original strand, 20249751 - 20249784
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249751 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 20249784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 54519785 - 54519741
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  54519785 tgagaagatgtttatgataatgattacgaagttatgatgactgtt 54519741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Original strand, 10834877 - 10834910
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10834877 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 10834910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18899612 - 18899579
Alignment:
Q  30 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgact 63  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899612 tgtttgtgatattgattacgatgttatgatgact 18899579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Original strand, 38312738 - 38312771
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38312738 ttatgatatggattacgatgttatgatgactgtt 38312771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 10686279 - 10686375
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686279 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10686375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 19663590 - 19663686
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663590 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 19663686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20260303 - 20260207
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260303 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 20260207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9240720 - 9240624
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240720 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 9240624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6481830 - 6481734
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6481830 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 6481734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6485297 - 6485201
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6485297 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 6485201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37379082 - 37378986
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37379082 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 37378986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 21074540 - 21074636
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21074540 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaaaaaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 21074636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 10103329 - 10103425
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10103329 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 10103425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 12902639 - 12902735
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12902639 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12902735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 24630080 - 24630176
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24630080 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24645197 - 24645101
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24645197 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24645101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24647140 - 24647044
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24647140 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24647044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24647973 - 24647877
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24647973 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24647877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 30346690 - 30346786
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30346690 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 30346786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 27381026 - 27381112
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381026 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 27381112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 27384996 - 27385082
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27384996 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 27385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27600417 - 27600321
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27600417 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaattaatgatgt 27600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31343963 - 31343867
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31343963 acttgatgatgtatatgttaagttgataagctgtcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 41532475 - 41532557
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  41532475 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 41532557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9784040 - 9783984
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9784040 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 9783984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 6262104 - 6262148
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6262104 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 6262148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 19663382 - 19663426
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663382 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 19663426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20260445 - 20260401
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260445 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 20260401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 10686180 - 10686224
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686180 tgagaagatatttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 10686224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 6481961 - 6481928
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6481961 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 6481928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 6485428 - 6485395
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6485428 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 6485395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 66
Target Start/End: Original strand, 21074405 - 21074442
Alignment:
Q  29 atgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21074405 atgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 21074442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 8729645 - 8729738
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8729645 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8729738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11774342 - 11774246
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11774342 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 11774246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 363314 - 363218
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  363314 acttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 363218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 8415009 - 8415105
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8415009 acttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8415105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 27942718 - 27942814
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27942718 acttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 27942814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23427872 - 23427776
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23427872 acttaatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattataaattgatgatgt 23427776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21409947 - 21409850
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21409947 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21409850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21804439 - 21804342
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21804439 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21804342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 14399125 - 14399221
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  14399125 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaattaatgatgt 14399221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 21829493 - 21829589
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21829493 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 21974216 - 21974312
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21974216 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21974312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43250248 - 43250152
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43250248 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 43250152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 245
Target Start/End: Original strand, 44385866 - 44385947
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44385866 acttgatgatgattatgttaacttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 44385947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 21978326 - 21978422
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21978326 acttgatgatgtttatgttatattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21978422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22110647 - 22110551
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22110647 acttgatgatttttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 18864137 - 18864219
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18864137 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 18864219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 30941597 - 30941679
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  30941597 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 30941679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23913311 - 23913255
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23913311 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 23913255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21328612 - 21328527
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  21328612 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatgcttgttgaataattattgttatga 21328527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Original strand, 42560917 - 42561005
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42560917 tgatggtggttatgttaagttgacaagttgttccttattcatgcattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 42561005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21386205 - 21386159
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21386205 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 21968025 - 21968071
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21968025 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21968071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 21980865 - 21980911
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21980865 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21980911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 21985848 - 21985894
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21985848 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21985894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 22000811 - 22000857
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22000811 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 22000857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 22009229 - 22009275
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22009229 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 22009275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 44475876 - 44475843
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44475876 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 44475843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 44479138 - 44479105
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44479138 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 44479105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 246 - 150
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  246 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgtaatgatgatgt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 3549 - 3645
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3549 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 260
Target Start/End: Original strand, 1 - 61
Alignment:
Q  200 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 66
Target Start/End: Original strand, 3414 - 3451
Alignment:
Q  29 atgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3414 atgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 3451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4475841 - 4475745
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4475841 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 4475745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12941267 - 12941171
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941267 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 12941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23955415 - 23955319
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955415 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23955319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27222878 - 27222782
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27222878 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 27222782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 28290927 - 28291023
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28290927 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcataaattgctaattgaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 28291023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 22075423 - 22075519
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22075423 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 22075519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14470927 - 14470831
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14470927 acttgatgatgtttatgttaggttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14470831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23538027 - 23537931
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23538027 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 23537931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 27416560 - 27416656
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27416560 acttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 27416656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 260
Target Start/End: Original strand, 31479497 - 31479591
Alignment:
Q  166 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31479497 ttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31479591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8242458 - 8242362
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8242458 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 8242362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11565447 - 11565351
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11565447 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11565351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 11716973 - 11717069
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11716973 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11717069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 12620366 - 12620462
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12620366 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12620462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23988349 - 23988253
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23988349 acttgatgatgtttatattaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23988253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27555585 - 27555490
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27555585 acttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 27555490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23400724 - 23400627
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  23400724 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaagtaatgatgt 23400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16758761 - 16758665
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16758761 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatagtgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22947713 - 22947617
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22947713 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22947617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22951669 - 22951573
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22951669 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22951573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23870157 - 23870061
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23870157 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23870061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23874113 - 23874017
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23874113 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23874017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23393687 - 23393605
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23393687 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 23393605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23413595 - 23413513
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23413595 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 23413513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22861801 - 22861705
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22861801 acttggtgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatgattatgaattaatgatgt 22861705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19869233 - 19869160
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataa 237  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19869233 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 19869160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1254205 - 1254114
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1254205 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 1254114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Original strand, 34297805 - 34297896
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34297805 acttgctgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 34297896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16622881 - 16622797
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16622881 acttgatgatgtttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattatcattatgaa 16622797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25737938 - 25737842
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  25737938 acttgatgatgattatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgagatgcttgctgaataattactgttatgaattgataatgt 25737842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2076330 - 2076276
Alignment:
Q  166 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2076330 ttgatgatgattatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgataatg 2076276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 18918613 - 18918659
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18918613 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 18918659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12941409 - 12941365
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941409 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 12941365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4475984 - 4475944
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgac 62  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4475984 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgac 4475944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 18953516 - 18953562
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18953516 acttgatgatgattatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 18953562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 27223009 - 27222976
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27223009 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 27222976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23537923 - 23537887
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23537923 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgctaatg 23537887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32649113 - 32649017
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32649113 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 32649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16370971 - 16370875
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16370971 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 16370875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29533931 - 29533837
Alignment:
Q  166 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29533931 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 29533837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 20439188 - 20439281
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20439188 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 20439281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 22132131 - 22132227
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22132131 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22132227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33796079 - 33795983
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33796079 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 33795983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1009308 - 1009212
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1009308 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 1009212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 1926828 - 1926924
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1926828 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 1926924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 16376848 - 16376944
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16376848 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16376944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 20925842 - 20925938
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20925842 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 20925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 20230171 - 20230258
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20230171 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 20230258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 41389697 - 41389793
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41389697 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 41389793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 39245203 - 39245297
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39245203 acttgatgatgtttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39245297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 39248758 - 39248852
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39248758 acttgatgatgtttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39248852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52634314 - 52634218
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  52634314 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttattttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 52634218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 41801311 - 41801367
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41801311 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 41801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21406299 - 21406253
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21406299 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21406253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16371102 - 16371069
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371102 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 16371069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 28311745 - 28311709
Alignment:
Q  30 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28311745 tgtttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 28311709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 29534033 - 29533997
Alignment:
Q  30 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29534033 tgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 29533997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 32649265 - 32649229
Alignment:
Q  30 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32649265 tgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 32649229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Original strand, 10854 - 10945
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10854 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 10712 - 10756
Alignment:
Q  22 tgaggagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712 tgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37661
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37568 tgatgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 37661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 25600 - 25696
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgtgatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 25696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Original strand, 37478 - 37511
Alignment:
Q  33 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37478 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 37511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5288 - 5192
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5288 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatggaatgtttgatgaataattattatgatgaattgatgatgt 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33983 - 33887
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33983 acttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 33887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28518 - 28468
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28518 acttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 28468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 8775 - 8868
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8775 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaaatgatgatgt 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 853 - 949
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  853 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14890 - 14804
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 5563 - 5659
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5563 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattatgaattaatgatgt 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18869 - 18773
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  18869 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattataaattgatgatgt 18773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 70801 - 70705
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  70801 acttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 70705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 11095 - 11188
Alignment:
Q  167 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11095 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaattaatgatgt 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11097 - 11001
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11097 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 60358 - 60454
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  60358 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 60454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11727
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11823 acttgatgatgcttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 11727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 34160 - 34256
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34160 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 34256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 68588 - 68684
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  68588 acttgatggtgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 68684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 15607 - 15689
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15607 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 15689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5871 - 5775
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgga-atgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5871 acttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagacgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4167 - 4076
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4167 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 4076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8540
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattat 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  8623 acttgatgatgtttatgttaagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattattattat 8540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 6993 - 7049
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6993 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 6353 - 6448
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6353 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataactattattatgaattaatgatgt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 74364 - 74420
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  74364 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatg 74420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 260
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115473
Alignment:
Q  176 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  115390 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtatttttatgaattgatgatgt 115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 211
Target Start/End: Original strand, 37235 - 37282
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37235 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 37282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10813 - 10765
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10813 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaat 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4020 - 3974
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4020 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 23970 - 24016
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23970 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 24016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 62872 - 62918
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  62872 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 62918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 641
Alignment:
Q  201 ttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 260  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  700 ttatccatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 605
Alignment:
Q  184 agttgataagttgtcttttattcatgaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  633 agttgataagttgtcttttattcatgaat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 37230 - 37276
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37230 acttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 37276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Original strand, 163600 - 163691
Alignment:
Q  164 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  163600 acttgatgagggttatgttaagttgataacttgttccttattcatgttttggtaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgat 163691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 220
Target Start/End: Original strand, 21390 - 21420
Alignment:
Q  190 taagttgtcttttattcatgaattgctaatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21390 taagttgtcttttattcatgaattgctaatg 21420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University