View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18107_high_15 (Length: 465)

Name: NF18107_high_15
Description: NF18107
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18107_high_15
NF18107_high_15
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (21-454)||(16657309-16657742)
chr2 (39-451)||(16661787-16662199)
chr2 (34-454)||(43625368-43625788)
chr2 (54-454)||(12234665-12235065)
chr2 (54-452)||(7542202-7542600)
chr2 (39-454)||(14703369-14703784)
chr2 (54-352)||(12258475-12258773)
chr2 (54-454)||(12245198-12245598)
chr2 (162-454)||(11999478-11999770)
chr2 (313-454)||(17716485-17716626)
chr2 (54-92)||(11999383-11999421)
chr2 (246-276)||(17704013-17704043)
chr2 (246-283)||(273279-273316)
chr2 (240-276)||(17648005-17648041)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (21-455)||(8659306-8659740)
chr7 (24-454)||(10494166-10494596)
chr7 (21-454)||(13333248-13333681)
chr7 (21-454)||(8667362-8667795)
chr7 (24-451)||(1301406-1301837)
chr7 (21-445)||(8654393-8654817)
chr7 (39-451)||(8585501-8585913)
chr7 (34-454)||(8646833-8647253)
chr7 (157-451)||(8628611-8628905)
chr7 (36-451)||(17260199-17260614)
chr7 (39-452)||(17267900-17268313)
chr7 (38-436)||(27830685-27831083)
chr7 (54-454)||(3147240-3147648)
chr7 (270-454)||(8671422-8671606)
chr7 (135-454)||(8636135-8636454)
chr7 (37-451)||(6789471-6789885)
chr7 (45-286)||(8545600-8545841)
chr7 (45-454)||(29581633-29582042)
chr7 (45-438)||(8576293-8576686)
chr7 (141-454)||(8602037-8602350)
chr7 (45-454)||(8570278-8570687)
chr7 (45-454)||(7877525-7877934)
chr7 (45-436)||(29577479-29577873)
chr7 (45-439)||(8609884-8610278)
chr7 (45-445)||(8382677-8383077)
chr7 (45-454)||(8581667-8582076)
chr7 (45-454)||(8590605-8591014)
chr7 (162-430)||(8538120-8538388)
chr7 (40-454)||(39985608-39986022)
chr7 (368-454)||(8640339-8640425)
chr7 (327-455)||(8017204-8017332)
chr7 (131-453)||(8559386-8559708)
chr7 (312-454)||(8102901-8103043)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (21-455)||(4678349-4678783)
chr1 (43-454)||(34466585-34466996)
chr1 (38-451)||(15594994-15595414)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (21-454)||(9335683-9336116)
chr4 (42-439)||(30775216-30775613)
chr4 (84-454)||(35132454-35132824)
chr4 (310-454)||(23587525-23587669)
chr4 (320-455)||(54396665-54396800)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (71-454)||(12528497-12528880)
chr8 (23-196)||(43744761-43744934)
chr8 (226-454)||(43744997-43745223)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (24-205)||(28219864-28220045)
chr5 (226-454)||(28220099-28220327)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (146-454)||(28910650-28910958)
chr6 (313-395)||(11200123-11200205)
chr6 (321-395)||(11170813-11170887)
chr6 (321-395)||(11209635-11209709)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16657742 - 16657309
Alignment:
Q  21 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16657742 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttgagttcccacttatgtccaccttat 16657643  T
Q  121 tcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657642 tcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaac 16657543  T
Q  221 atcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaata 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16657542 atcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaaga 16657443  T
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657442 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcat 16657343  T
Q  421 tgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657342 tgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 16657309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16662199 - 16661787
Alignment:
Q  39 aaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcct 138  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| || |||||| | | ||| || |    
T  16662199 aaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctt 16662100  T
Q  139 ctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaag 238  Q
      ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  16662099 tcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgag 16662000  T
Q  239 gatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgca 338  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||     
T  16661999 gagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaattacttcttttgtcaaggccatatgcaatagctgct 16661900  T
Q  339 gcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacag 438  Q
    ||||| ||||||||||| || |  |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||    
T  16661899 gcagtgggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcgttaaaataagcaggaacag 16661800  T
Q  439 taacaacagcatt 451  Q
    | ||||| |||||    
T  16661799 tgacaactgcatt 16661787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 454
Target Start/End: Original strand, 43625368 - 43625788
Alignment:
Q  34 aagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaa 133  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||  || ||| | || ||||| || |||||||| | |||    
T  43625368 aagcaaaagacagtgtcctttttcctctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggctcttgagtttccaataatatccacattgttcttcttctcaaa 43625467  T
Q  134 ctcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaatt 233  Q
     || ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    || || |   ||||||||    
T  43625468 ttcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggctttaacacggaagaccttgtccttaatt 43625567  T
Q  234 gtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatag 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |||||| | ||||||||| ||  || ||||| | ||    
T  43625568 gtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaatatttcgttctccaacacaattaattctcttgttaaggccgtatgctagag 43625667  T
Q  334 ctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctgg 433  Q
    | ||||| || ||||||||||| | ||| || |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43625668 cagcagctgttggttcattgattactcgtaaaacattaaggccgacaatgacaccaacatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaagtaagcagg 43625767  T
Q  434 cacagtaacaacagcattctt 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  43625768 cacggtaacaactgcattctt 43625788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 454
Target Start/End: Original strand, 12234665 - 12235065
Alignment:
Q  54 tttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcctctacaaagtagttc 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||| |   ||| ||||||     
T  12234665 tttgccctctcacaagcagttcttaacctcctcaaggcttttggatttccactcatgtccacttttttctttctattgaa-ctcttgagcaaggtagttt 12234763  T
Q  153 accgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaa 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |  || |||| ||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  12234764 accattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagacacatcaa 12234863  T
Q  253 aagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcatt 352  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||  | ||||| ||    
T  12234864 aagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttcgttctccaacacaatcagttctcttgtcaagaccatatgcaacagcggctgccatgggttcgtt 12234963  T
Q  353 gataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattc 452  Q
     || |  |  |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12234964 cattaccctcataacattgaggccagcaatgacaccagcatctatagttgcttttcgttgagaatcattgaaataagcaggcacggtaacaactgcattc 12235063  T
Q  453 tt 454  Q
    ||    
T  12235064 tt 12235065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 452
Target Start/End: Original strand, 7542202 - 7542600
Alignment:
Q  54 tttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattc-ttcttttgaaactcctctacaaagtagttc 152  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  7542202 tttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttctttctcttg-aactcttgtacaaagtagttc 7542300  T
Q  153 accgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaa 252  Q
     || |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |  ||    |  |||||||| || || | |||||||||||    
T  7542301 gccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggccttaacttggaagttgttgcccttaatcgttagtaaagacacatcaa 7542400  T
Q  253 aagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcatt 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7542401 aagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttcgctctccatcataatcagttctcttgtcaaggccatatgcaacagctgcggcagtaggttcatt 7542500  T
Q  353 gataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattc 452  Q
     ||    |  |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7542501 cattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattaaaataagcaggtacagtaacaactgcattc 7542600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 454
Target Start/End: Original strand, 14703369 - 14703784
Alignment:
Q  39 aaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccac-cttattcttcttttgaaactcc 137  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||  ||  || |||| ||||| |||     
T  14703369 aaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaaggcttttggatttccactaatgtccaatctgttttttctcttgaa-ctct 14703467  T
Q  138 tctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaa 237  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |  |  || ||    ||||||||||| |    
T  14703468 tgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcagtagccttaatttggaagacggtgcccttaattgtta 14703567  T
Q  238 ggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgc 337  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14703568 ggagagacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatattacgttctccaccataatcagttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgc 14703667  T
Q  338 agcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcaca 437  Q
    ||| ||||||||||| || |  |  |  ||||| ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||  || |||||| | || ||||| |||||     
T  14703668 agctgtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacaccagcatccatagtggcttttctttgagaatcactaaaataagcaggcacc 14703767  T
Q  438 gtaacaacagcattctt 454  Q
    |||||||| ||||||||    
T  14703768 gtaacaactgcattctt 14703784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12258773 - 12258475
Alignment:
Q  54 tttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcctctacaaagtagttc 152  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||| |||||||||||  ||    
T  12258773 tttgcactctcacaagctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctcttgaa-ctcttctacaaagtaactc 12258675  T
Q  153 accgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaa 252  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || || | ||| |||| | ||||||| || || | |||||||||||    
T  12258674 accattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaa 12258575  T
Q  253 aagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcatt 352  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||| | |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12258574 aagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatattccgtttttcgacacaattaattcttttgtcaaggccatatgcaaaagctgcagcagtaggttcatt 12258475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12245598 - 12245198
Alignment:
Q  54 tttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcctctacaaagtagttc 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |  |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||     
T  12245598 tttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggcttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctcttgaa-ctcctgtgcaaagtagttt 12245500  T
Q  153 accgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaa 252  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |  || |  | | ||||||| || |||||||| || ||||    
T  12245499 accattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggccttaacttggaagatgttatccttaatagttaggatagaaacgtcaa 12245400  T
Q  253 aagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcatt 352  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||  ||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12245399 aagtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttttcaaggccatatgcaacagctgcagcagtgggttcatt 12245300  T
Q  353 gataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattc 452  Q
     || |  |  |  ||||| || |||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  12245299 cattaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttcgctgagaatcactaaaataagcaggtacagtaacaacagcattc 12245200  T
Q  453 tt 454  Q
    ||    
T  12245199 tt 12245198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 454
Target Start/End: Original strand, 11999478 - 11999770
Alignment:
Q  162 ttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccac 261  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| || || |  || ||||   |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  11999478 ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagctgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgccac 11999577  T
Q  262 cgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcg 361  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | ||  ||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |  |     
T  11999578 cgccaagatcaaagactaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttgtcaaggccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattcattaccct 11999677  T
Q  362 aaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
     |  ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11999678 tataacattgatgccagcaattgcaccggcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagctggtacagtaacaacaacattctt 11999770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17716626 - 17716485
Alignment:
Q  313 tgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctg 412  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||  | || |||||| |||||||| ||||||||||   | || |||| || |||    
T  17716626 tgtcaaaaccataagcaatggctgcagcagtgggctcattaataattctcatgaaattaagaccagcaatagcaccagcatgcttagtagcttgtctctg 17716527  T
Q  413 cgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
     |||  ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17716526 agaaaaattaaagtaagcagggacagtaacaacggcattctt 17716485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 92
Target Start/End: Original strand, 11999383 - 11999421
Alignment:
Q  54 tttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggct 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11999383 tttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggct 11999421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17704043 - 17704013
Alignment:
Q  246 acatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17704043 acatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaaga 17704013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 273316 - 273279
Alignment:
Q  246 acatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaat 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  273316 acatcaaaagtaccacctccaaggtcaaagaccaaaat 273279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17648041 - 17648005
Alignment:
Q  240 atagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaaga 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17648041 atagagacgtcaaaagtaccaccgccaaggtcaaaga 17648005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 455
Target Start/End: Original strand, 8659306 - 8659740
Alignment:
Q  21 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  8659306 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccactaatgtccactttat 8659405  T
Q  121 tcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaac 220  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||    
T  8659406 tcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagaagtggcttttacttcaaagac 8659505  T
Q  221 atcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaata 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  8659506 atcacccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatattttgtttaccatcacagtcacctctcttgtcaaaa 8659605  T
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8659606 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaatggcaccggaatctatggtggcttttcgctgagaatcat 8659705  T
Q  421 tgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttc 455  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  8659706 tgaactatgcaggcactgtaacaacagcattcttc 8659740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10494596 - 10494166
Alignment:
Q  24 gtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattct 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10494596 gtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattct 10494497  T
Q  124 tcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatc 223  Q
    ||||||  |||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  10494496 tctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaagacatc 10494397  T
Q  224 acccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatacca 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  10494396 acccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccctcacaatcacttctcttgtcaaggcca 10494297  T
Q  324 tatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattga 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||    
T  10494296 tatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagcaccagcatcaatagtagcctttcgttgagaatcgttga 10494197  T
Q  424 agtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10494196 agtaagccggcacagtaacaacagcattctt 10494166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13333681 - 13333248
Alignment:
Q  21 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat 120  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| || || || ||||    
T  13333681 acagtggtgacaaaagaaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttcccactgatatcgacgttat 13333582  T
Q  121 tcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaac 220  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  13333581 tcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtgagtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagac 13333482  T
Q  221 atcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaata 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||      
T  13333481 atcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcgcttaccatcacaatcacgtctcttgtcaagg 13333382  T
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13333381 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattattcgaatgatattaaggccagcaatagcaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcat 13333282  T
Q  421 tgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13333281 tgaagtaagccggcacagtaacaacggcattctt 13333248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 454
Target Start/End: Original strand, 8667362 - 8667795
Alignment:
Q  21 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||  ||| |||||||| ||||    
T  8667362 acagtggtaacaaaagcaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgactgatgtccactttat 8667461  T
Q  121 tcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaac 220  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  8667462 tcttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagac 8667561  T
Q  221 atcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaata 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||||      
T  8667562 atcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggctaccatcacagtcatttctcttgtcaagg 8667661  T
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcat 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8667662 ccatatgcaatagctgccgcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcat 8667761  T
Q  421 tgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8667762 tgaagtaagctggcacagtaacaacggcattctt 8667795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 24 - 451
Target Start/End: Original strand, 1301406 - 1301837
Alignment:
Q  24 gtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |  | || ||||| |||||||| |||||||    
T  1301406 gtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacacgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattct 1301505  T
Q  124 tcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatc 223  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  1301506 tctttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatc 1301605  T
Q  224 acccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatacca 323  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1301606 gcccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatattccgtttaccatcacagtcacttctcttgtcaaaacca 1301705  T
Q  324 tatgcaatagctgcagcag----taggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatca 419  Q
    || ||||||||||||||||    |||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1301706 tacgcaatagctgcagcagtagctaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatggtggcttttcgctgagaatca 1301805  T
Q  420 ttgaagtaagctggcacagtaacaacagcatt 451  Q
    ||||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  1301806 ttgaaatgtgcaggcacagtaacaacagcatt 1301837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 445
Target Start/End: Original strand, 8654393 - 8654817
Alignment:
Q  21 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| || || || || ||||| ||||    
T  8654393 acagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttat 8654492  T
Q  121 tcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaac 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  8654493 tcttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcaaagac 8654592  T
Q  221 atcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaata 320  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||      
T  8654593 atcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaagg 8654692  T
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcat 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  8654693 ccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcat 8654792  T
Q  421 tgaagtaagctggcacagtaacaac 445  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  8654793 tgaagtatgccggcacagtaacaac 8654817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 8585913 - 8585501
Alignment:
Q  39 aaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcct 138  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||  | | || ||||| || |||||  | | ||| ||||    
T  8585913 aaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcct 8585814  T
Q  139 ctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaag 238  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  8585813 caacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccagcggttgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgag 8585714  T
Q  239 gatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgca 338  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | || | | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  8585713 gagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacagttacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgca 8585614  T
Q  339 gcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacag 438  Q
    ||||| ||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  8585613 gcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacag 8585514  T
Q  439 taacaacagcatt 451  Q
    | ||||| |||||    
T  8585513 tcacaactgcatt 8585501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 454
Target Start/End: Original strand, 8646833 - 8647253
Alignment:
Q  34 aagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaa 133  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||| | ||||||||||| |||||||| | |||    
T  8646833 aagcaaaagatagtgtcctttttgctctctcgcatgccgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaa 8646932  T
Q  134 ctcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaatt 233  Q
     || | | |||||| || |||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || | ||| || | | ||||||||    
T  8646933 ttcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtggctttaacatgaaagaccttatccttaatt 8647032  T
Q  234 gtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatag 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||   || ||||||   ||||||||||||  |||||||| | ||    
T  8647033 gtaaggagagacacatcaaaagttccaccaccaaggtcgaagatgaatatatttcgttcttcagcacaatttgttctcttgtcaaggccatatgcgagag 8647132  T
Q  334 ctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctgg 433  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || | || |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  8647133 cagcagctgttggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccccggcatctatagtggcttttcgctgataatcattgaagtatgcagg 8647232  T
Q  434 cacagtaacaacagcattctt 454  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  8647233 cacagtaacaactgcattctt 8647253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 157 - 451
Target Start/End: Original strand, 8628611 - 8628905
Alignment:
Q  157 ttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagt 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8628611 ttctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagt 8628710  T
Q  257 accaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgata 356  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||   || | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  8628711 cccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattgatt 8628810  T
Q  357 attcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcatt 451  Q
    || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  8628811 atcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatt 8628905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 451
Target Start/End: Original strand, 17260199 - 17260614
Alignment:
Q  36 gcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattc-ttcttttgaaac 134  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||  || ||| |||||||||  |    
T  17260199 gcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttgggttcccaataatgtccaattttttcgttcttttgat-c 17260297  T
Q  135 tcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattg 234  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  | ||||| || || || || || | | |||||||||    
T  17260298 tcctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattg 17260397  T
Q  235 taaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagc 334  Q
    ||| || ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     | |||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  17260398 taacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgtacttaaacacaattagttctcttgacaaggccatatgcaatagc 17260497  T
Q  335 tgcagcagtaggttcattga-taattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctgg 433  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |  ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  17260498 tgcagcaataggttcattaattaacttcaaa-acataaaggccagcaataacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcagg 17260596  T
Q  434 cacagtaacaacagcatt 451  Q
     ||||||| |||| ||||    
T  17260597 aacagtaataacaacatt 17260614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 17267900 - 17268313
Alignment:
Q  39 aaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcct 138  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||   || | ||  || || ||| |||  |  ||||    
T  17267900 aaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggcttttgggttcccaacaattttcaatttttttttccttttgatttcct 17267999  T
Q  139 ctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaag 238  Q
    | ||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  | ||||| || || || || || | | ||||||||||||     
T  17268000 caacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaac 17268099  T
Q  239 gatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgca 338  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||| | | |||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17268100 gagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgttcttcaacacagttagttctcttgccaaggccatatgcaatagctgca 17268199  T
Q  339 gcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacag 438  Q
    ||||| ||||||||||| |     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  17268200 gcagttggttcattgattaccttcaatacattaaggccagcaatgacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcgttgaagtaagccgggacag 17268299  T
Q  439 taacaacagcattc 452  Q
    |||  |||||||||    
T  17268300 taatgacagcattc 17268313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27831083 - 27830685
Alignment:
Q  38 aaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcc 137  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |  ||| ||    
T  27831083 aaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggttcccactaatgtccactcttttcttcttcttgaacacc 27830984  T
Q  138 tctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaa 237  Q
    || ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |  || || | | ||||||||||||    
T  27830983 tccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcagttgccttaacttggaagaccttatccttaattgtaa 27830884  T
Q  238 ggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgc 337  Q
      | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||  | | |   ||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  27830883 caagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatattccgttctccagtatattttgttcccgtgtcaaggccatatgcaatagctgc 27830784  T
Q  338 agcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcac 436  Q
    ||||||||| ||  | || || || |  ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  27830783 agcagtaggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtggcttttcgttgagagtcattgaaataagctggcac 27830685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 454
Target Start/End: Original strand, 3147240 - 3147648
Alignment:
Q  54 tttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttca 153  Q
    ||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||    
T  3147240 tttgctctttcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttgagttctcactaatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttca 3147339  T
Q  154 ccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaa 253  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || | ||| || | | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3147340 ccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcctgcgatggccttaacttgaaagaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaa 3147439  T
Q  254 agtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccg------tttaccat--cacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtag 345  Q
    ||| ||||| || | |||||||| ||||||||| ||      |  || ||  |||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3147440 agtcccaccacccaagtcaaagataaaaatattacgctcctctacacaattacacaattagttctcttgtccagtccatacgcaatagctgcagcagtag 3147539  T
Q  346 gttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaac 445  Q
    |||||||||| || || |  | |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  3147540 gttcattgattatccgcataatattaaggccagcaataacaccagcatctattgtcgctttccgctgagcatcattgaaataagcaggtacggtaacaac 3147639  T
Q  446 agcattctt 454  Q
     ||||||||    
T  3147640 tgcattctt 3147648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 270 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8671606 - 8671422
Alignment:
Q  270 tcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacat 369  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  8671606 tcaaagacaaaaatatttcggttaccttcacggtcatttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacat 8671507  T
Q  370 taaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8671506 taagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcattctt 8671422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8636454 - 8636135
Alignment:
Q  135 tcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattg 234  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||     
T  8636454 tcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtggctttaacttcaaagacttcacctttaattt 8636355  T
Q  235 taaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagc 334  Q
    | || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  |    | |||| | || |||||| | ||  ||||| |||| |||    
T  8636354 tgagtatagacacgtcgaatgtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttctctctttaacacagttacctctcttttgaagtccatacgcaaaagc 8636255  T
Q  335 tgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggc 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8636254 tgcagcagttggttcattgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtggatttacgctgagaatcattgaaataagcgggc 8636155  T
Q  435 acagtaacaacagcattctt 454  Q
    |||||||  || ||||||||    
T  8636154 acagtaatgactgcattctt 8636135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 451
Target Start/End: Original strand, 6789471 - 6789885
Alignment:
Q  37 caaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactc 136  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  || ||| | || ||||| || |||||| | | ||||||    
T  6789471 caaaagagagtacccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttccagtaatatccactttgttcttcctcttaaactc 6789570  T
Q  137 ctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgta 236  Q
    |||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| || || |  || || | | | || |||||     
T  6789571 ctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggtggccttaacttggaagaccttatctttgattgtt 6789670  T
Q  237 aggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctg 336  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||  ||| |  ||| | ||||||| ||||  |||||||||| ||| |    
T  6789671 aagatagacacatcgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttttttctccaccgtaattagttctcttatcaaggccatatgcaagagcag 6789770  T
Q  337 cagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcac 436  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  6789771 cagctgttggttcattgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtggctttccgttgagaatcattgaaataagcaggcac 6789870  T
Q  437 agtaacaacagcatt 451  Q
    ||||| ||| |||||    
T  6789871 agtaataactgcatt 6789885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 286
Target Start/End: Original strand, 8545600 - 8545841
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || ||| | || |||||| | |  |||||||  ||||    
T  8545600 agtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaaggcttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaa 8545699  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| || || || |||| ||||| ||| |||||||| || || ||||| || | |   ||||||||||| |||||    
T  8545700 agtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagtggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 8545799  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatatt 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8545800 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatt 8545841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 29582042 - 29581633
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| || ||| |||| |||||||| |||||||  || |||||| | |  ||||| |   |||    
T  29582042 agtgtcctctttgccctctcacaagctgttctcagcttccttaaagcttttgggttcccactaatgtccaaattgttcttcctcttcaactcattcgcaa 29581943  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||| || || |||||   |||| |||| | ||| || | |||    
T  29581942 agtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtggccttcacttcaaacttatcatccttgagtgtgagaagaga 29581843  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagta 344  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  || ||||| ||||| ||| || ||| || || ||| | ||||||||||||||  || ||||||||     
T  29581842 cacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaatatatttcgttttccaacaaaattacctcccttttgaataccatatgcaagtgcagcagcagtt 29581743  T
Q  345 ggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaa 444  Q
    ||||| ||||| || |  |  ||||| |||||||| ||    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |    
T  29581742 ggttcgttgattatcctcattacattgaggccagctataatgccagcatctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtaatca 29581643  T
Q  445 cagcattctt 454  Q
    | ||||||||    
T  29581642 ctgcattctt 29581633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 438
Target Start/End: Original strand, 8576293 - 8576686
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| || ||| | || | ||| ||    |||||||  ||||    
T  8576293 agtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaaggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaacaa 8576392  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    |||  | |||| || ||||||||||||| |  || || |||||||||| |||||||||||| || || || || ||||    ||||| ||| || |||||    
T  8576393 agtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattgttcttaactgtgagaataga 8576492  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagta 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || |||||| |  |||||| | ||  ||||| |||| |||||| |||||     
T  8576493 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttcttttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatacgcaagagctgccgcagtc 8576592  T
Q  345 ggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacag 438  Q
    ||||||||||| ||  | | |||||| || |||||||| ||||| |||||| | |||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  8576593 ggttcattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacctgcatctttagtggctcttcgttgggaatcattaaaataagcaggcacag 8576686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 454
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602350
Alignment:
Q  141 acaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaagga 240  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| || || ||||| | || |  ||||||||| || |    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaa 8602136  T
Q  241 tagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagc 340  Q
     ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||| |  |   || |||||| |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || ||    
T  8602137 gagaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagcagctgc 8602236  T
Q  341 agtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagta 440  Q
    ||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||    
T  8602237 agttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcattaaaataagccggcacagta 8602336  T
Q  441 acaacagcattctt 454  Q
    ||||| ||||||||    
T  8602337 acaactgcattctt 8602350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 454
Target Start/End: Original strand, 8570278 - 8570687
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||| | || |||||||| |  |||| ||  ||||    
T  8570278 agtgtcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaaggcttttgggttcctactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttcacaa 8570377  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    |||   ||| | ||||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||||| || || ||| |    | | |||||| ||| || |||||    
T  8570378 agtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagttgttatccttaactgtgagaataga 8570477  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagta 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| || || ||| |  |||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||     
T  8570478 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacaaaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagtc 8570577  T
Q  345 ggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaa 444  Q
    ||||||||||| || || |  ||||| || ||||||||  |||| |||||| | |||||| |||| || |||||||| || ||||| || |||||||  |    
T  8570578 ggttcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 8570677  T
Q  445 cagcattctt 454  Q
    | ||||||||    
T  8570678 ctgcattctt 8570687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7877934 - 7877525
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || ||||  |||||||| ||||||||| | | |||||||   || |    
T  7877934 agtgtccttttagccctctcacatgcagttctcaacctcctaagggccctcgggtttccaccaatgtccactttattcttcctcttaaactccatcacta 7877835  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    | | ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||   |||| | || | ||| || | |||    
T  7877834 aatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagctattacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagaga 7877735  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttacc-atcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagt 343  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||  || | ||| ||||| || ||   | | | ||||||| | ||  ||||||||||  || ||||||||    
T  7877734 cacatcgaaagtgccaccaccaagatcaatgatgaacacatttcgttttccgatgttattta-ttctcttttgaaggccatatgcaagggcagcagcagt 7877636  T
Q  344 aggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaaca 443  Q
     |||||||| || || || |  ||||| ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7877635 tggttcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggcttttcgttgagaatcattgaaataagccggcacagtaaca 7877536  T
Q  444 acagcattctt 454  Q
    || ||||||||    
T  7877535 actgcattctt 7877525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 29577873 - 29577479
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||| |||| |||  ||| |||||||| || |||||| | |  ||||| |  ||||    
T  29577873 agtgccctctttgccctctcacaagcagttctcagcttccttaaagcttttgggttcaaactaatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaa 29577774  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    ||| | ||||| || | ||||| ||||||||||| || |||||||| |  || |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||| || | |||    
T  29577773 agtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggcctttacttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagaga 29577674  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgttt---accatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagca 341  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||  || | ||| || ||   | || || ||| || |||||| | ||| ||||||||||  || ||||||    
T  29577673 cacatcaaaggtgccaccaccaagatcaaagatgaatacatttcgctttccaacaacaaaattacctctcttttgaattccatatgcaagtgcagcagca 29577574  T
Q  342 gtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcac 436  Q
    || ||||||||||| || || |  ||||| |||||||||||    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29577573 gttggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaataatgccggcatctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagctggcac 29577479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 439
Target Start/End: Original strand, 8609884 - 8610278
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || || |  |||||||| || ||      || |||| |||  |||||||  ||||    
T  8609884 agtgtcctctttgccctctcacaagcagtcctcaacctcctaagagccctcgagttcccactgatatcttttgaatgcttccttttgaactccttcacaa 8609983  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    |||  || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| || || || || ||| |||     |||||||| || | |||    
T  8609984 agtgattaaccattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccagcagtagccttgacatcgaaagcattgtttttaattgtgagaacaga 8610083  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccg-tttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagt 343  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||| ||| |||||| |  |||||| | || ||||||||||| ||| ||||| ||    
T  8610084 cacatcgaaagtcccaccaccaagatcaaagataaaaatatttctattttcca-cacaattagctctcttctgaagaccatatgcaagagccgcagccgt 8610182  T
Q  344 aggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagt 439  Q
     |||||||||||||| || |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  8610183 tggttcattgataatccggattacattaaggccagaaatgacaccagcatcttttgtggctttccgctgagaatcattaaaataagcaggcacagt 8610278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 8383077 - 8382677
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || |  ||  |||| |||||||| ||||||   |||| |||| | |  ||||| || ||||    
T  8383077 agtgtcctttttgccctctcgcaagccgttcttaaccttctaagagcctttgggttcccactaatgtccttattatgcttcctcttgaactcgtcaacaa 8382978  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||| || || || || ||||||| |||||||||||| || ||  |||| |||| |  ||||||||| |||| |||    
T  8382977 agtacttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagtgtctccggcagtggccttcacaacaaagacattattcttaattgtgaggagaga 8382878  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagta 344  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| |  |   ||  ||||| |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || |||||     
T  8382877 cacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttctctcttcaagacaattagctctcttctgaaggccatatgcaagagcagcggcagtt 8382778  T
Q  345 ggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaa 444  Q
    || |||||||| || || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  8382777 ggctcattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccagcatcttttgtggctttccgttgagaatcattgaaatatgcaggcacggtaacaa 8382678  T
Q  445 c 445  Q
    |    
T  8382677 c 8382677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 454
Target Start/End: Original strand, 8581667 - 8582076
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat-tcttcttttgaaactcctctaca 143  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || | |||| ||||||| ||| | || ||| | |||| | |||| ||||| ||||   |||    
T  8581667 agtgtccttttcgctctctcacaagcagtcctcaaccttctaatggcttttggatttccaataatctcctctttatgttttctcttgaa-ctccgacaca 8581765  T
Q  144 aagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatag 243  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||||| || || ||| |  | | |  ||||| ||| || ||||    
T  8581766 aagtgattcaccattctgttatcaaaatcttcccctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagtcgttattcttaactgtgagaatag 8581865  T
Q  244 acacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagt 343  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||| || |||||| |  |||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8581866 acacatcaaaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagt 8581965  T
Q  344 aggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaaca 443  Q
     ||||||||||| || || |  ||||| || || |||||  |||| |||||| | |||||| |||| || |||||||| || ||||| || |||||||      
T  8581966 cggttcattgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatc 8582065  T
Q  444 acagcattctt 454  Q
    || ||||||||    
T  8582066 actgcattctt 8582076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 454
Target Start/End: Original strand, 8590605 - 8591014
Alignment:
Q  45 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 144  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  || ||||  ||||||||||  ||||| ||||||||| |   ||||||||  || |    
T  8590605 agtgtccttttagccctctcacaagctgttttcaacctcctaagagcccttgcgttcccacttaaatccactttattcttcctcctaaactccttcacca 8590704  T
Q  145 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 244  Q
    | | ||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||| |||||||||||| |||||   |||||| || | ||| || | |||    
T  8590705 aatggtgaaccattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagaga 8590804  T
Q  245 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttacc-atcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagt 343  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  || | ||| ||||| || ||   | |  || ||||| | ||  ||||||||||   | || |||||    
T  8590805 cacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaacacatttcgttttccgatgttactttct-ctcttttgaaggccatatgcaaggccagcggcagt 8590903  T
Q  344 aggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaaca 443  Q
     |||||||| || || || |  ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8590904 tggttcattaattatccgcattacattcaagccagcaatgacaccagcatctttggtagctttcctctgagaatcattaaaataagctggcacagtaaca 8591003  T
Q  444 acagcattctt 454  Q
    || ||||||||    
T  8591004 actgcattctt 8591014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 430
Target Start/End: Original strand, 8538120 - 8538388
Alignment:
Q  162 ttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccac 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||   |||  ||| |  ||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8538120 ttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccggcagtggccttgactgtaaaggcattattcttcaatgtaaggagagatacatcaaaagttccac 8538219  T
Q  262 cgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcg 361  Q
    | ||||| |||||||  ||||  || |  |   || |||||| |  |||||| | ||  || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  8538220 caccaagatcaaagatgaaaacttttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccgtatgcaagagcagcagctgtaggttcattgattatccg 8538319  T
Q  362 aaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagc 430  Q
     |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  8538320 cattacattgaggccagcaatgacaccagcatctttggtggctcttcgctgtgaatcattgaaataagc 8538388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 454
Target Start/End: Original strand, 39985608 - 39986022
Alignment:
Q  40 aagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcct 138  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || || ||||| ||||||  ||| ||||| || ||||| ||| |    
T  39985608 aagagagagttctcttcgctctttcacaagcagtcctcaacctcctaagagctctggggttgccactgatgtccttcttgttctttctcttgaa-ctctt 39985706  T
Q  139 ctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaag 238  Q
      ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||| | | |  | | ||| || ||    
T  39985707 gaacaaagtggttcaccattctgttgtcaaaatcctcacctccaagatgggtgtctccggctgtggctttcacctcaaagataccctcttcaatagttag 39985806  T
Q  239 gatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaa-tcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgc 337  Q
     | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||   |  ||| |||   |  ||| ||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  39985807 caaagagacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatcaagacattcttctctccaacactggttgctt-tcttgtcaagaccataagcaatggcagc 39985905  T
Q  338 agcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcaca 437  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || |||||  | ||||||||  |||| ||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||    
T  39985906 agcagtgggctcattgataattcgcatgacattaagaccggcaataactccagcatccttggtagcttgacgctgggagtcattaaagtaagcagggaca 39986005  T
Q  438 gtaacaacagcattctt 454  Q
    |||||||||||||||||    
T  39986006 gtaacaacagcattctt 39986022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8640425 - 8640339
Alignment:
Q  368 attaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  8640425 attaaggccagcaatggccccggcatctatggtggctttttgctgataatcattgaagtaagcaggcatagtaacaactgcattctt 8640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8017332 - 8017204
Alignment:
Q  327 gcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagt 426  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||  || ||||| || || |||||| |||| |||||  | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  8017332 gcaatagctgcagctgttggctcgttgataattctcaaaacattgagtcctgcaatgacaccggcatcctttgtggcttgacgctgcgaatcattgaagt 8017233  T
Q  427 aagctggcacagtaacaacagcattcttc 455  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8017232 aagctggaactgtaacaacggcattcttc 8017204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 8559386 - 8559708
Alignment:
Q  131 aaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcaccctta 230  Q
    |||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||| || || ||||| | || |  ||||    
T  8559386 aaactcttttacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattctta 8559485  T
Q  231 attgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaa 330  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||  |||||||| |  |    | |||||| |  |||||| | ||  ||||||||||    
T  8559486 attgtgagaagagaaacatcaaaagttccaccaccgagatcaaagatgaaaatatttctctctttaacacaattagatctcttttgaagtccatatgcaa 8559585  T
Q  331 tagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagc 430  Q
     ||| || ||||| ||||||||||| ||  | |  |||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||| |||  || |||||||| || |||||    
T  8559586 gagcagctgcagttggttcattgattatctgcattacattaagaccagcaatttcacctgcatctttggtggctcttctttgagaatcattaaaataagc 8559685  T
Q  431 tggcacagtaacaacagcattct 453  Q
     || || ||||  ||||||||||    
T  8559686 aggtacggtaatcacagcattct 8559708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 454
Target Start/End: Original strand, 8102901 - 8103043
Alignment:
Q  312 ttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgct 411  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||  || ||||| |  ||||| ||  ||||||||||| | || ||||  ||||    
T  8102901 ttgtcaagaccgtaggcaatagcagcagcagttggctcattaataattctcaaaacatttaaaccagcgataacaccagcatctttagttgcttgacgct 8103000  T
Q  412 gcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  8103001 gagaatcattgaagtaagcagggacagtgacgacggcattctt 8103043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 21 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4678783 - 4678349
Alignment:
Q  21 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat 120  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||  |||  ||| |||||||| ||||    
T  4678783 acagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccttaagggttttgcgttcttactaatgtccacattat 4678684  T
Q  121 tcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaac 220  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  4678683 tcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccagcagtggcttttacttcaaagac 4678584  T
Q  221 atcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaata 320  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |    
T  4678583 accacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacaatcactttcacttctcttgtcaaaa 4678484  T
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcat 420  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4678483 ccatatgcaatagctgcaacagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgttgagaatcat 4678384  T
Q  421 tgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttc 455  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  4678383 tgaagtatgcaggcacagtaacaacgacattcttc 4678349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 34466996 - 34466585
Alignment:
Q  43 agagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctac 142  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||   |||| |||| | |  ||||||| | |    
T  34466996 agagtgtcctctttgcattctcgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctttgc 34466897  T
Q  143 aaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggata 242  Q
    ||||| |||| || |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  34466896 aaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggaga 34466797  T
Q  243 gacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaata-ttccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagca 341  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | | ||| || | |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34466796 gacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttccttcttcca-caaagtcagctctcttgtcaagtccatatgcaatagctgcagca 34466698  T
Q  342 gtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaa 441  Q
    || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||| |  || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |    
T  34466697 gtgggttcattgattatttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgagaatcattaaaataagcaggcacggtga 34466598  T
Q  442 caacagcattctt 454  Q
     ||| ||||||||    
T  34466597 taactgcattctt 34466585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 451
Target Start/End: Original strand, 15594994 - 15595414
Alignment:
Q  38 aaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcc 137  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| || |||||| | |  || |||    
T  15594994 aaaagagagtaccctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttcccagtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcc 15595093  T
Q  138 tctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaa 237  Q
    |   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || |  || || |   |||||||||| |    
T  15595094 tgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgtggccttaacttggaagaccttgtccttaattgtta 15595193  T
Q  238 ggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctg- 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||     
T  15595194 ggatagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttctccaacacagttaatcctcttgtcaaggccatatgcaatagctgc 15595293  T
Q  337 ------cagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagc 430  Q
          |||| || ||||||||||| |  || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  15595294 agctgtcagctgtcggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattgagataagc 15595393  T
Q  431 tggcacagtaacaacagcatt 451  Q
     ||||| |||||||| |||||    
T  15595394 aggcacggtaacaactgcatt 15595414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9336116 - 9335683
Alignment:
Q  21 acagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||    | |||||||| ||||    
T  9336116 acagtggtaacaaaagcaaaagacagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgcttgatgtccactttat 9336017  T
Q  121 tcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaac 220  Q
    |||||||||  ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |     
T  9336016 tcttcttttttaactcttccacaaaatagttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatag 9335917  T
Q  221 atcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaata 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||      
T  9335916 atcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccatcacagtcatttctcttatcaagg 9335817  T
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9335816 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcat 9335717  T
Q  421 tgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9335716 tgaagtaagctggcacggtaacaacggcattctt 9335683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 439
Target Start/End: Original strand, 30775216 - 30775613
Alignment:
Q  42 gagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctcta 141  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || |||||| | | ||| |||||||    
T  30775216 gagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctcta 30775315  T
Q  142 caaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggat 241  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |  |||| || || |     
T  30775316 caaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagcagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaag 30775415  T
Q  242 agacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagca 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||   || |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||    
T  30775416 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgca 30775515  T
Q  342 gtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagt 439  Q
    || || ||||| || ||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  30775516 gtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacagt 30775613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 454
Target Start/End: Original strand, 35132454 - 35132824
Alignment:
Q  84 ctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctccccca 182  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  35132454 ctcaaggcttttgaattcccactaatgtctactttgttctttctcttgaa-ctcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccg 35132552  T
Q  183 aggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaa 282  Q
    || |||||||||||||||||||| || || |  || |||| | ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  35132553 agatgagtgtttccggcagtggccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaa 35132652  T
Q  283 tattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaat 382  Q
    ||||  |||  ||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || | ||  |  |||||  | ||||||||    
T  35132653 tattttgttctccagcacaatcagatctcttgtcaaggccatatgcaaccgctgcggcagtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaat 35132752  T
Q  383 ggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35132753 agcaccagcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagcaggcacagtaacaactgcattctt 35132824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23587669 - 23587525
Alignment:
Q  310 tcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcg 409  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || ||||| || |||| |||| |||| |||||| | || ||||  ||    
T  23587669 tcttatcaagaccataagcaatagcagcagcggtaggttcattaataattctcaacacattgagtccagaaatgacaccggcatcttttgtagcttgacg 23587570  T
Q  410 ctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  23587569 ttgtgaatcgttgaagtaagcaggcacagttacaacggcattctt 23587525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 455
Target Start/End: Original strand, 54396665 - 54396800
Alignment:
Q  320 accatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatca 419  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |  || | ||| |||||||||||| | || ||||  || || ||||||    
T  54396665 accataagcaattgcagcagcagtaggctcattaataatcctcaacacattcaaacccgaaatagcaccagcatctttcgtagcttgacgttgagaatca 54396764  T
Q  420 ttgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttc 455  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  54396765 ttgaaataagcaggaacagtaacaacagcattcttc 54396800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 454
Target Start/End: Original strand, 12528497 - 12528880
Alignment:
Q  71 agttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaag 170  Q
    ||||||||| ||||| | |||| |||  |||||| | ||||| || || |||||| | | |||||| |  |||||||  |||||| |||  |||||||||    
T  12528497 agttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaactttgttcttcctcttaaactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaag 12528596  T
Q  171 tcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggt 270  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || || || |||| |  ||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12528597 tcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattattctttactgtaagaagagacacatcaaaagttccaccgccaaggt 12528696  T
Q  271 caaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacatt 370  Q
    |||| | ||||||  | |  |   ||  ||||| |  |||||| | ||| |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||    
T  12528697 caaaaataaaaatccttctctcttcaagacaattagctctcttttgaatgccatatgcaagagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacatt 12528796  T
Q  371 aaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
     |||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||    
T  12528797 gaggccagcaatgacaccagcatccttggtggctcgtcgctgcgaatcattgaaatacgctggcaccgtaatcactgcattctt 12528880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 43744761 - 43744934
Alignment:
Q  23 agtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  43744761 agtggtgacaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttc 43744860  T
Q  123 ttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttcc 196  Q
    ||||| | |||||||||| | |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  43744861 ttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttcc 43744934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 454
Target Start/End: Original strand, 43744997 - 43745223
Alignment:
Q  226 ccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccata 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| | |   |   || | | | ||||||| || | ||||||    
T  43744997 ccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcttcctcgcacagagttagttctcttttccagaccata 43745096  T
Q  326 tgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaag 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||     
T  43745097 tgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatcta--gtggctttccgctgataatcattgaaa 43745194  T
Q  426 taagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43745195 taagccggcacagtaacaactgcattctt 43745223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Original strand, 28219864 - 28220045
Alignment:
Q  24 gtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattct 123  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||  || ||| | ||||||||||| ||||    
T  28219864 gtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttct 28219963  T
Q  124 tcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggc 205  Q
    |||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  28219964 tcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcggtggc 28220045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 454
Target Start/End: Original strand, 28220099 - 28220327
Alignment:
Q  226 ccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtt-taccatcacaatcacttctcttgtcaataccat 324  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||| | ||||  || | | |||| ||||| |  ||||    
T  28220099 cctttattctaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcgttctcccatg-cagttagttcttttgtccaatccat 28220197  T
Q  325 atgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaa 424  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  || |  |  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  28220198 atgcaatagcagcagcagtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatcattgaa 28220297  T
Q  425 gtaagctggcacagtaacaacagcattctt 454  Q
     ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  28220298 ataagcaggcacagtaataactgcattctt 28220327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 454
Target Start/End: Original strand, 28910650 - 28910958
Alignment:
Q  146 gtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagac 245  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| || ||||| || || |  || || | | ||| ||||||||||| |||     
T  28910650 gtagttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaa 28910749  T
Q  246 acatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtag 345  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||| ||||  ||| |||| ||||  ||| |||| |||  ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||      
T  28910750 acatcaaaagtcccactacccaggtcgaagatgaaagtatttcgttctccagcacactcagctctcttgtcgaggccatatgaaatagctacagcagtga 28910849  T
Q  346 gttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaac 445  Q
    | |||||||| || || |  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||| | | || ||||||||     
T  28910850 gctcattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcattgaaataaccagtcaaagtaacaat 28910949  T
Q  446 agcattctt 454  Q
     ||||||||    
T  28910950 tgcattctt 28910958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 395
Target Start/End: Original strand, 11200123 - 11200205
Alignment:
Q  313 tgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatct 395  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||| ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11200123 tgtcaagaccatatgcaattgcagctgcagaaggctcattgattattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatct 11200205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 395
Target Start/End: Original strand, 11170813 - 11170887
Alignment:
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatct 395  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11170813 ccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatct 11170887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 395
Target Start/End: Original strand, 11209635 - 11209709
Alignment:
Q  321 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatct 395  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11209635 ccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatct 11209709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University