View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18109_low_1 (Length: 603)

Name: NF18109_low_1
Description: NF18109
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18109_low_1
NF18109_low_1
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (12-597)||(9543687-9544272)
chr7 (12-597)||(5389618-5390203)
chr7 (12-597)||(16140631-16141216)
chr7 (12-597)||(26304865-26305450)
chr7 (12-597)||(26361368-26361953)
chr7 (12-597)||(32099689-32100274)
chr7 (12-597)||(46498423-46499008)
chr7 (12-597)||(6535793-6536378)
chr7 (12-597)||(8502358-8502943)
chr7 (12-597)||(44898608-44899193)
chr7 (58-597)||(13283877-13284416)
chr7 (210-582)||(42596865-42597237)
chr7 (14-174)||(42596698-42596858)
chr7 (105-504)||(7582477-7582876)
chr7 (105-459)||(15175386-15175740)
chr7 (104-545)||(14643279-14643720)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (12-597)||(27413457-27414042)
chr5 (12-597)||(18362586-18363171)
chr5 (12-597)||(26200772-26201357)
chr5 (12-597)||(33940629-33941214)
chr5 (14-582)||(20949166-20949734)
chr5 (21-581)||(23375368-23375920)
chr5 (104-453)||(5601579-5601928)
chr5 (105-504)||(30453136-30453535)
chr5 (105-504)||(30458214-30458613)
chr5 (105-504)||(24413672-24414071)
chr5 (104-459)||(24299175-24299530)
chr5 (266-529)||(22456358-22456621)
chr5 (141-545)||(20037121-20037526)
chr5 (104-323)||(21083014-21083233)
chr5 (104-219)||(24289908-24290023)
chr5 (14-87)||(19781874-19781947)
chr5 (185-317)||(15329389-15329521)
chr5 (185-317)||(18709238-18709370)
chr5 (104-176)||(22456711-22456783)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (11-597)||(14892199-14892785)
chr8 (12-597)||(21211417-21212002)
chr8 (85-595)||(22832121-22832631)
chr8 (104-459)||(25035933-25036288)
chr8 (104-459)||(25049970-25050325)
chr8 (104-529)||(33600415-33600840)
chr8 (104-459)||(18233759-18234114)
chr8 (104-459)||(18243210-18243565)
chr8 (104-459)||(12916388-12916743)
chr8 (112-323)||(23749914-23750125)
chr8 (185-317)||(45497837-45497969)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (12-597)||(18161374-18161959)
chr6 (12-597)||(31358870-31359455)
chr6 (12-597)||(16899255-16899840)
chr6 (14-582)||(34766667-34767235)
chr6 (14-597)||(18710425-18711008)
chr6 (14-597)||(18704490-18705073)
chr6 (20-403)||(29541764-29542147)
chr6 (398-597)||(29561121-29561320)
chr6 (372-459)||(25895804-25895891)
chr6 (185-287)||(11375030-11375132)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (13-597)||(16254548-16255127)
chr4 (12-597)||(6693527-6694112)
chr4 (14-597)||(17150684-17151267)
chr4 (14-582)||(520375-520943)
chr4 (14-597)||(7844905-7845488)
chr4 (105-504)||(54698311-54698710)
chr4 (113-459)||(26813342-26813688)
chr4 (185-317)||(14933550-14933682)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (12-597)||(6423616-6424201)
chr3 (12-597)||(8974155-8974740)
chr3 (12-597)||(9538444-9539029)
chr3 (12-518)||(12387297-12387802)
chr3 (104-453)||(48979673-48980022)
chr3 (113-459)||(28366656-28367002)
chr3 (104-411)||(4384222-4384529)
chr3 (113-163)||(28374773-28374823)
chr3 (113-163)||(28382595-28382645)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (12-597)||(16156192-16156777)
chr1 (14-582)||(1987651-1988219)
chr1 (72-567)||(22959697-22960190)
chr1 (104-545)||(14280551-14280992)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (12-597)||(18652527-18653112)
chr2 (20-597)||(45015670-45016247)
chr2 (12-597)||(9512211-9512796)
chr2 (14-582)||(27168448-27169016)
chr2 (58-597)||(22903494-22904033)
chr2 (104-453)||(1791955-1792304)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (12-597)||(52979-53562)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (12-597)||(148017-148602)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (14-582)||(6030-6598)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (14-582)||(7080-7648)
scaffold0313 (14-582)||(10862-11430)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (21-581)||(16545-17097)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (12-434)||(20084-20506)
scaffold0141 (428-597)||(27670-27839)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (179-468)||(1-290)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (72-567)||(189005-189498)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (386-595)||(1-210)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (428-597)||(86973-87142)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (105-504)||(102825-103224)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (104-459)||(257898-258253)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (179-315)||(5060-5196)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 490; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 9544272 - 9543687
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9544272 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9544173  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9544172 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggataccctgaaaata 9544073  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544072 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9543973  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9543972 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactaagatgtcttccaag 9543873  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543872 tatgtggagacctatggtcactgcaatcacccaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatcttattggttcactgagagctcatgaagttgta 9543773  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  9543772 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaagctcatcagctgctgaagatgatgt 9543687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 5390203 - 5389618
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  5390203 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 5390104  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5390103 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 5390004  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5390003 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 5389904  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5389903 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 5389804  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5389803 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 5389704  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  5389703 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 5389618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16141216 - 16140631
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16141216 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16141117  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16141116 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16141017  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141016 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16140917  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16140916 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 16140817  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16140816 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16140717  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16140716 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16140631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 26304865 - 26305450
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26304865 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26304964  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26304965 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26305064  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305065 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26305164  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26305165 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26305264  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26305265 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26305364  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26305365 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26305450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26361953 - 26361368
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26361953 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26361854  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26361853 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26361754  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361753 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26361654  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26361653 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26361554  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26361553 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26361454  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26361453 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26361368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 32099689 - 32100274
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32099689 tcatcacaaatggagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattattaaactc 32099788  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32099789 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 32099888  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099889 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 32099988  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32099989 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 32100088  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32100089 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 32100188  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  32100189 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 32100274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 46498423 - 46499008
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  46498423 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 46498522  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46498523 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 46498622  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498623 catcatgagggtacatttcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 46498722  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46498723 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 46498822  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46498823 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 46498922  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  46498923 ctttaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaactccatcagttgctgatgaagatgt 46499008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 6535793 - 6536378
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6535793 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcagcagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6535892  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6535893 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6535992  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535993 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6536092  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6536093 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 6536192  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6536193 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6536292  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6536293 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 8502358 - 8502943
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  8502358 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8502457  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  8502458 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 8502557  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8502558 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaa 8502657  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8502658 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 8502757  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8502758 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 8502857  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8502858 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 8502943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 44898608 - 44899193
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  44898608 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 44898707  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  44898708 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 44898807  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44898808 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtaaaaatgaaaccattgatgaga 44898907  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44898908 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 44899007  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44899008 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 44899107  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  44899108 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 44899193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 13284416 - 13283877
Alignment:
Q  58 caaagataagagtgcatg-gtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaag 156  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13284416 caaagaaaagagtgcatgtgtcaacagatgaaaaatctcaagtattgttaaattctaaagctagactctttctattatgtgcactaaccatggaagaaag 13284317  T
Q  157 tgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacatt 256  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284316 tgaaagagttgatgaatgcaagaatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacatt 13284217  T
Q  257 ggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttg 356  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13284216 ggagtcaaaaagtttgaa-tctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactgcaatagtaaatgaaatgagatctcttg 13284118  T
Q  357 gaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagattt 456  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13284117 ggaaggcatactccactcatgagagaatcagaaaaatattaagatgccttccaagtatgtggagacctatggtcacttcaatcactcaggccaaagattt 13284018  T
Q  457 aaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttg 556  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13284017 gaaatctatgaacctggaagatctcattggttcacttagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaactagtaaagaaggtaaagtcacttgccttg 13283918  T
Q  557 aaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||    
T  13283917 aaagcctctcagtaaacttcatcagtaactgatgatgatgt 13283877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 210 - 582
Target Start/End: Original strand, 42596865 - 42597237
Alignment:
Q  210 tacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatga 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42596865 tacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactataattgacattagagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgtgaatgaaaccattgatga 42596964  T
Q  310 gatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttcca 409  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  42596965 gatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgccttcca 42597064  T
Q  410 agtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttg 509  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42597065 agtatgtagagacctatggtcactgcaatcactgaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcatttgttcactgagagctcatgaagttg 42597164  T
Q  510 tacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  42597165 tacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcaacaaacctcatcagt 42597237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 42596698 - 42596858
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42596698 atcacagatggagactttgttccaaagaccaaaaaaggaaccatcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaactcta 42596797  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42596798 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagaggtgatgaatg 42596858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 504
Target Start/End: Original strand, 7582477 - 7582876
Alignment:
Q  105 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  7582477 taaattctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtttgggacactct 7582576  T
Q  205 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 304  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  7582577 aaaaattcatcatgaaggaactagccatttaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 7582676  T
Q  305 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 404  Q
    ||||| |||||   ||||| |||  | || || |||||| | ||||| |||| |||  | ||| | ||||||| | | || ||||||||  | |||||||    
T  7582677 gatgaaatgtacttcagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttgtaaaaacttataccactcatgttcggataagaaaaatcttaagatgtc 7582776  T
Q  405 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 504  Q
    || |||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  7582777 tttcaagcacatggatacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattggttcattaaaagctcatga 7582876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 459
Target Start/End: Original strand, 15175386 - 15175740
Alignment:
Q  105 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 204  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |  || ||||| || ||||| ||  |    
T  15175386 taaactctaaagcttgactttttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttacggcaaaagaggtttgggacactct 15175485  T
Q  205 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 304  Q
     ||||| |||||||| |  ||    ||  | |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  15175486 aaaaattcatcatgaagaaactagccacataaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 15175585  T
Q  305 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 404  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  15175586 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 15175685  T
Q  405 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  15175686 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 15175740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 14643720 - 14643279
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  14643720 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaactatggaggaaagtgaaagaatctatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14643621  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| || ||||| || ||    ||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  14643620 taaaaattcaccatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14643521  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  14643520 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcccctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 14643421  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 503  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||  ||| || ||||| |||||  | || ||||||||||    
T  14643420 ctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagatctaaattccttggccctagaggatcttattggaacgcttagagctcatg 14643321  T
Q  504 aagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 545  Q
    || || |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  14643320 aaattctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 14643279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 27413457 - 27414042
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  27413457 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaaggtcaggtattactaaattt 27413556  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27413557 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 27413656  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413657 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 27413756  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413757 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 27413856  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27413857 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 27413956  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  27413957 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 27414042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 18362586 - 18363171
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18362586 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18362685  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18362686 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18362785  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362786 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18362885  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18362886 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18362985  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18362986 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18363085  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18363086 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18363171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26201357 - 26200772
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26201357 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26201258  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26201257 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26201158  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201157 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26201058  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26201057 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26200958  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26200957 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26200858  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26200857 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 33940629 - 33941214
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  33940629 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 33940728  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  33940729 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 33940828  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940829 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 33940928  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33940929 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 33941028  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33941029 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 33941128  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  33941129 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 33941214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 582
Target Start/End: Original strand, 20949166 - 20949734
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  20949166 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 20949265  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20949266 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 20949365  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949366 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 20949465  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20949466 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 20949565  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949566 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaggatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 20949665  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20949666 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 20949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 23375920 - 23375368
Alignment:
Q  21 atggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctag 120  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23375920 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 23375821  T
Q  121 actctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgag 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |  || | | |||  |||||     
T  23375820 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 23375721  T
Q  221 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcca 320  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  23375720 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 23375621  T
Q  321 gatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggac 420  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     ||||||||||||     
T  23375620 gatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggag 23375526  T
Q  421 acctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaagga 520  Q
    ||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23375525 acctatgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaa 23375429  T
Q  521 gacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23375428 gacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 23375368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 453
Target Start/End: Original strand, 5601579 - 5601928
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  5601579 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 5601678  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  5601679 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 5601778  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  5601779 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 5601878  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 453  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  5601879 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 5601928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 30453535 - 30453136
Alignment:
Q  105 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 204  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  30453535 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30453436  T
Q  205 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 304  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30453435 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30453336  T
Q  305 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 404  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  30453335 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30453236  T
Q  405 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 504  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  30453235 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 30453136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 30458613 - 30458214
Alignment:
Q  105 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 204  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  30458613 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30458514  T
Q  205 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 304  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30458513 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30458414  T
Q  305 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 404  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  30458413 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30458314  T
Q  405 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 504  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  30458313 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 30458214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 504
Target Start/End: Original strand, 24413672 - 24414071
Alignment:
Q  105 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 204  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  24413672 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 24413771  T
Q  205 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 304  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  24413772 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 24413871  T
Q  305 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 404  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| |||| |||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  24413872 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttgaaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 24413971  T
Q  405 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 504  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  24413972 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 24414071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24299530 - 24299175
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  24299530 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24299431  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  24299430 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 24299331  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24299330 tgatgaaatgtattcatgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 24299231  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24299230 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 24299175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 22456621 - 22456358
Alignment:
Q  266 aaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcat 365  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| | | |||||||||  |||| ||  | |||||   ||    
T  22456621 aaatttgaaatcttcgaaatgaatgaagaggaaaacattgatgaaatgtatttcagatttacttctaaagtaaatgagttgaggtcattgggaaaaatat 22456522  T
Q  366 attctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctat 465  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||  |    
T  22456521 attctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtcttcctaatatatggagacctatggttacagaaatcactcaagccaaagatttaaattcctt 22456422  T
Q  466 gaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaacca 529  Q
    |    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22456421 ggctttagaagatctcattggaacactaagagctcatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 22456358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 545
Target Start/End: Original strand, 20037121 - 20037526
Alignment:
Q  141 taaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaa-tacatcatgagggtacatctcatgtcaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| || |||| | |||||||| || ||    ||||| ||||    
T  20037121 taaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgttaaaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaag 20037220  T
Q  240 aaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaa 339  Q
    |||| || || || |||||  |  ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| ||    
T  20037221 aaacaaggatagatattggcatacgaaaattcgaaatttttgaaatgagtgaagaagaaaacattgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaa 20037320  T
Q  340 tgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatc 439  Q
    |||  | || ||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||  |||||    
T  20037321 tgagttaaggtcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaacacgtggagacctatggttacaacaatc 20037420  T
Q  440 actcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaagg 539  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||  ||    | ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  20037421 actcaagccaacgatctaaattccttggctttagaaaatctcattggaacacttagagctcatgaagttctactccaagaagataaaccggtgaaaaagg 20037520  T
Q  540 taaaaa 545  Q
     |||||    
T  20037521 gaaaaa 20037526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21083233 - 21083014
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||  |||    
T  21083233 ttaaactctaaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagcct 21083134  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||    
T  21083133 taaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccat 21083034  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagat 323  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  21083033 tgatgagatgtttgcaagat 21083014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24290023 - 24289908
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  24290023 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24289924  T
Q  204 tgaaaatacatcatga 219  Q
    | ||||| ||||||||    
T  24289923 taaaaattcatcatga 24289908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 19781874 - 19781947
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatga 87  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || || || ||||||||||| ||||||||    
T  19781874 atcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtaaaggaaaatagtgcatggtccacagatga 19781947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15329521 - 15329389
Alignment:
Q  185 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 284  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  15329521 aaagaaatttgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 15329422  T
Q  285 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 317  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  15329421 tgaaggaaaccgaaaccattgatgaaatgtatg 15329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Original strand, 18709238 - 18709370
Alignment:
Q  185 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 284  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  18709238 aaagaaatttgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 18709337  T
Q  285 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 317  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  18709338 tgaaggaaaccgaaaccattgatgaaatgtatg 18709370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22456783 - 22456711
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgta 176  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22456783 ttaaattccaaagctcaactctttttacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgta 22456711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 479; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 14892785 - 14892199
Alignment:
Q  11 atcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaatt 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892785 atcatcacatatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaatt 14892686  T
Q  111 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  14892685 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgataaagaggtatgggataccttaaaaat 14892586  T
Q  211 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgag 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14892585 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgag 14892486  T
Q  311 atgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaa 410  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14892485 atgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggtatattctactcatgatagaattagaaaaatattgagatgtcttccaa 14892386  T
Q  411 gtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgt 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892385 gtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggcagaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgt 14892286  T
Q  511 acttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14892285 acttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 14892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 21212002 - 21211417
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  21212002 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 21211903  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  21211902 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 21211803  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211802 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 21211703  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21211702 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 21211603  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21211602 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 21211503  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  21211502 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgatgatgaagatgt 21211417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 595
Target Start/End: Original strand, 22832121 - 22832631
Alignment:
Q  85 tgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgct 184  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  22832121 tgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatgaaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgcc 22832220  T
Q  185 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 284  Q
    ||||| |||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22832221 aaagaggtatgggacactttgagagtacatcatgaaggtacatctcatatcaaagaaactagaattgataatggagtcagaaagtttaaggtctttgaaa 22832320  T
Q  285 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaat 384  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22832321 tgagtgagaatgaaaccatttatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattccactcatgaaagaat 22832420  T
Q  385 tagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcatt 484  Q
      |||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22832421 cggaaagattccgagatgtcttccaattatgtggagacctatcgtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaaccttgaagatctcatt 22832520  T
Q  485 ggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttg 584  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  22832521 ggttcactgagagctcctgaagtagtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagtag 22832620  T
Q  585 ttgatgatgat 595  Q
     ||||||||||    
T  22832621 ctgatgatgat 22832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 25036288 - 25035933
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  25036288 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25036189  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25036188 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25036089  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  25036088 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25035989  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
     | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25035988 ttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25035933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 25050325 - 25049970
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  25050325 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25050226  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25050225 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25050126  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  25050125 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25050026  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
     | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25050025 ttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25049970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 33600840 - 33600415
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| |||||| | ||||| || |    
T  33600840 ttaaattccaaagctcaactctttctacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaaggatttatgaatgtagtactgcaaaagaaatttgggacacat 33600741  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||||||  | || || ||||| ||  ||||||||||| | || ||||||| |||| | |||| |||    
T  33600740 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacacggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgaatgaagaagaaaacat 33600641  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||  | |||||||||||| | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  33600640 tgatgaaatgtattccagatttacctctatagtaaatgaattaaggtcattgggaaaaatatactctcctcatgacagaatcagaaaaatcctcagatgt 33600541  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 503  Q
    ||||| |  || |||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||  ||    | ||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  33600540 cttcctaaaatatggagacctatggttacagcaatcactcaatccaaagacttaaattccttggctttagaagatctcattggaacactaagagcccatg 33600441  T
Q  504 aagttgtacttcaaggagacaaacca 529  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33600440 aagttttgcttcaagaagacaaacca 33600415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 459
Target Start/End: Original strand, 18233759 - 18234114
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  18233759 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18233858  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18233859 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18233958  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18233959 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18234058  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18234059 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18234114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 459
Target Start/End: Original strand, 18243210 - 18243565
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  18243210 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18243309  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18243310 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18243409  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18243410 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18243509  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18243510 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18243565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 459
Target Start/End: Original strand, 12916388 - 12916743
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  12916388 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 12916487  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  12916488 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttagaaatgagtgatgaagaaaacat 12916587  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  12916588 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcctctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 12916687  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  12916688 ctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagacaaagatctaaa 12916743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23750125 - 23749914
Alignment:
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||  |||| |||||     
T  23750125 taaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagccttaaaaatt 23750026  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  23750025 catcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccattgatgaga 23749926  T
Q  312 tgtatgccagat 323  Q
    ||| ||| ||||    
T  23749925 tgtttgcaagat 23749914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45497969 - 45497837
Alignment:
Q  185 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 284  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  45497969 aaagaaatttgggatgctttgaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 45497870  T
Q  285 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 317  Q
    |||  ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  45497869 tgaaggaaaccgaaaccatagatgaaatgtatg 45497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 18161374 - 18161959
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18161374 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18161473  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18161474 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18161573  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161574 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18161673  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18161674 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18161773  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18161774 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18161873  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18161874 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18161959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 31358870 - 31359455
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  31358870 tcatcacaaatgaagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 31358969  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31358970 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 31359069  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359070 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 31359169  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31359170 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 31359269  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31359270 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 31359369  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  31359370 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 31359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 16899255 - 16899840
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16899255 tcatcacagatggagactatgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16899354  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  16899355 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgagatactctgaaaata 16899454  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899455 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16899554  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16899555 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattcaactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 16899654  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16899655 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16899754  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16899755 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 582
Target Start/End: Original strand, 34766667 - 34767235
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  34766667 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 34766766  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34766767 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 34766866  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766867 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 34766966  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34766967 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 34767066  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34767067 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 34767166  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34767167 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 34767235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18711008 - 18710425
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||    
T  18711008 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18710909  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||| | ||||    
T  18710908 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18710809  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710808 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 18710709  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18710708 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagta 18710609  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18710608 tgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtact 18710509  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18710508 tcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18710425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18705073 - 18704490
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||    
T  18705073 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18704974  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||| | ||||    
T  18704973 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18704874  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18704873 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaattttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatt 18704774  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18704773 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagta 18704674  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18704673 tgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtact 18704574  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18704573 tcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18704490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 403
Target Start/End: Original strand, 29541764 - 29542147
Alignment:
Q  20 gatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagcta 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29541764 gatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagcta 29541863  T
Q  120 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541864 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 29541963  T
Q  220 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcc 319  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29541964 gggtcaatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttaaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgct 29542063  T
Q  320 agatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  29542064 agatttactacaatagtaaatgaaatgaaatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 29542147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 398 - 597
Target Start/End: Original strand, 29561121 - 29561320
Alignment:
Q  398 agatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagag 497  Q
    ||||||||| ||||| ||||   || |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29561121 agatgtctttcaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 29561220  T
Q  498 ctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  29561221 ctcatgaagtcgtacttcaaggagataaaccagtgaagaatgtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 29561320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 459
Target Start/End: Original strand, 25895804 - 25895891
Alignment:
Q  372 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25895804 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 25895891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Original strand, 11375030 - 11375132
Alignment:
Q  185 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 284  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||    
T  11375030 aaagaaatttgggatacattaaaaatacatcatgaaggaactagtcatgtgaaagaaacaagaattgacataggtgtacgaaaatttgaattattcgaaa 11375129  T
Q  285 tga 287  Q
    |||    
T  11375130 tga 11375132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 477; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 597
Target Start/End: Original strand, 16254548 - 16255127
Alignment:
Q  13 catcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattct 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16254548 catcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtcacagaaaagagtacatggtcaacagatgaaaaagctcaagtattgttaaactct 16254647  T
Q  113 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  16254648 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaaga-----gggataccttgaaaatac 16254742  T
Q  213 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254743 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 16254842  T
Q  313 gtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagt 412  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16254843 gtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagt 16254942  T
Q  413 atgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtac 512  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254943 atgtggagacctatggtcactgtaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtac 16255042  T
Q  513 ttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255043 ttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgctgatgatgatgt 16255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 6693527 - 6694112
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6693527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6693626  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6693627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6693726  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6693826  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6693827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 6693926  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6693927 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6694026  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6694027 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6694112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 597
Target Start/End: Original strand, 17150684 - 17151267
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  17150684 atcacagatggagactttgttccaacaaccaacgaaggaactgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaatgctcaggtattgttaaacttta 17150783  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17150784 aagctagactctttctatcatttgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 17150883  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150884 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 17150983  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  17150984 tatgctagatttactacaatagtaaattaaatgagatatcttgaaaaggcatattctactcatgtttgaattagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 17151083  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17151084 tttggagacctatggtcaatgcaattactcaggccaaagatttataatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 17151183  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  17151184 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 17151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 520943 - 520375
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  520943 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 520844  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  520843 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 520744  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520743 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 520644  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  520643 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaaacatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 520544  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520543 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 520444  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  520443 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 7845488 - 7844905
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||   || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||    
T  7845488 atcacagatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctataaaggaaaagaaggcatggtcaacagatgaaaaggctcatgtattactaaactcta 7845389  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |    
T  7845388 aagctagactttttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgggacactctgaaaatata 7845289  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845288 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgatattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7845189  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||     
T  7845188 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcttattctacttatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 7845089  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7845088 tatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaatctagaagatctcattggctcattgagagctcatgaagttgtact 7844989  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  7844988 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgcattgaaagcatctcaacaaagctcattagtagctgatgatgatgt 7844905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 54698710 - 54698311
Alignment:
Q  105 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 204  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  54698710 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 54698611  T
Q  205 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 304  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  54698610 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 54698511  T
Q  305 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 404  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  54698510 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 54698411  T
Q  405 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 504  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  54698410 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 54698311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 459
Target Start/End: Original strand, 26813342 - 26813688
Alignment:
Q  113 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 212  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  26813342 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttactgcaaaagaagtttgggacactctaaaaattc 26813441  T
Q  213 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 312  Q
    |||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| ||    
T  26813442 atcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaat 26813541  T
Q  313 gtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagt 412  Q
    |||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||| | ||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||     
T  26813542 gtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcgaataagaaaaattttaagatgtcttccaagc 26813641  T
Q  413 atgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  26813642 acatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 26813688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Original strand, 14933550 - 14933682
Alignment:
Q  185 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 284  Q
    |||||| | |||||| | || |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  14933550 aaagaaatttgggatgctttcaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 14933649  T
Q  285 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 317  Q
    |||  ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  14933650 tgaaggaaaccgaaaccatagatgaaatgtatg 14933682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 6423616 - 6424201
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6423616 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaaatgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6423715  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6423716 taaagctagactctttctatcgtgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 6423815  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423816 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6423915  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6423916 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgaggtgtcttccaag 6424015  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6424016 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctataaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6424115  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  6424116 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 6424201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 8974155 - 8974740
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  8974155 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8974254  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8974255 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 8974354  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974355 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 8974454  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8974455 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 8974554  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8974555 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 8974654  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  8974655 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 8974740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 9538444 - 9539029
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9538444 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9538543  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  9538544 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaacaagtatgggatactctgaaaata 9538643  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538644 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9538743  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9538744 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 9538843  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9538844 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 9538943  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  9538944 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 9539029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 12387297 - 12387802
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||    
T  12387297 tcatcacagatggagactttgttccaaaaaccaaagaaggaactgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaagtattaataaactc 12387396  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||    
T  12387397 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaactgaaagagtttatgaatttaagaatgc-aaagaggtatgggataccttgatagta 12387495  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12387496 catcatgaagttacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattgaagtcataaagttggaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 12387595  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12387596 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaataagatcttttggaaaggcatattccacttatgagagagtcagaaaaatattgagatgccttccaag 12387695  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||| | | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12387696 tatgcgaagacctatggtcactgcaattactcaggctaaatatttacaatatatgaacttggaagatctcattgattcactgatagctcatgaagttgta 12387795  T
Q  512 cttcaag 518  Q
    |||||||    
T  12387796 cttcaag 12387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 453
Target Start/End: Original strand, 48979673 - 48980022
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  48979673 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 48979772  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  48979773 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 48979872  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  48979873 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 48979972  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 453  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  48979973 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 48980022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28367002 - 28366656
Alignment:
Q  113 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 212  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  28367002 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtcactgcaaaagaagtttgggacactctaaaaattc 28366903  T
Q  213 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 312  Q
    |||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| ||    
T  28366902 atcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaat 28366803  T
Q  313 gtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagt 412  Q
    |||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||     
T  28366802 gtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaattttaagatgtcttccaagc 28366703  T
Q  413 atgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  28366702 acatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 28366656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4384529 - 4384222
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || || ||||| |    
T  4384529 ttaaattctaaagctcgagtctatctatcatgcagattaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtttgagatactt 4384430  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | |||||  ||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||| |||| ||||||| |||| |  | | |||    
T  4384429 taaaaatcaatcatgaaggaacaaggcacgtaaaagaaacaagaatagatatcggtgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaatgaataaaataacat 4384330  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||| ||  | |||||| |  |||| | ||||| ||||||| | | ||||    
T  4384329 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaattaagatcacttgggaaaacttattctgccgatgacataattaaaaaaatattaaaatgt 4384230  T
Q  404 cttccaag 411  Q
    ||||||||    
T  4384229 cttccaag 4384222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28374823 - 28374773
Alignment:
Q  113 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 163  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28374823 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28374773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28382645 - 28382595
Alignment:
Q  113 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 163  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28382645 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28382595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 16156192 - 16156777
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16156192 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16156291  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16156292 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16156391  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156392 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16156491  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156492 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgataaaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 16156591  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16156592 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggcaaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16156691  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16156692 cttcaacgagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacctgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16156777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 1988219 - 1987651
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1988219 atcacagatggagactttgttccattaaccaaagaaggaatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 1988120  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1988119 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 1988020  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988019 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 1987920  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1987919 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgacttccaagta 1987820  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1987819 tgtggagacctatggtcactgaaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaatctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 1987720  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1987719 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaatctcatcagt 1987651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 72 - 567
Target Start/End: Original strand, 22959697 - 22960190
Alignment:
Q  72 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 171  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22959697 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcattaaccttggaagaaagtgaaagggttgatga 22959796  T
Q  172 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 271  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22959797 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaaccactcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 22959895  T
Q  272 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattcta 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | |||| | |    
T  22959896 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaatgtatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatacca 22959995  T
Q  372 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 471  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   |    
T  22959996 ctcatgatagaatcaggaagatactaagatgtcttccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 22960095  T
Q  472 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 567  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  22960096 ggaagaactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccagtgaggaaggtaaaatcacttaccttaaaagcttctca 22960190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 14280992 - 14280551
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| ||||||||   ||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  14280992 ttaaactctaaagcccaactctttttacaatgttcaataaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14280893  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  14280892 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14280793  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| ||||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  14280792 tgatgatatgtattcacgattcacttcaatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcccctcatgacagaattagaaaaattttaagatgt 14280693  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 503  Q
    || ||||  |  |||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||    | || |||||||||||  | || ||||||||||    
T  14280692 ctcccaaacacatggagacccatggttacagcaatcactcaagccaaagatctaaattccttggctttagaggatctcattggaacgcttagagctcatg 14280593  T
Q  504 aagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 545  Q
    || || |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  14280592 aaattctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 14280551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 18652527 - 18653112
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18652527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18652626  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  18652627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 18652726  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18652826  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18652827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18652926  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18652927 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18653026  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  18653027 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 18653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 597
Target Start/End: Original strand, 45015670 - 45016247
Alignment:
Q  20 gatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagcta 119  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  45015670 gatgaagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactatactctaaagcta 45015769  T
Q  120 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatga 219  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015770 gagtctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 45015869  T
Q  220 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45015870 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgct 45015969  T
Q  320 agatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtgga 419  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015970 agatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtgga 45016069  T
Q  420 cacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaagg 519  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45016070 gacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaagg 45016169  T
Q  520 agacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45016170 agacaaaccagtaaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagtcaagctcatcagttgctgatgatgatgt 45016247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 9512796 - 9512211
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9512796 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9512697  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  9512696 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 9512597  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512596 catcatgagggtacatctcatgtcagagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9512497  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9512496 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 9512397  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9512396 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 9512297  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  9512296 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 9512211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 27169016 - 27168448
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  27169016 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 27168917  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27168916 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 27168817  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168816 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagagaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 27168717  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27168716 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 27168617  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168616 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 27168517  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27168516 tcaaggagacaaaccagtaaagaaagtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 27168448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 597
Target Start/End: Original strand, 22903494 - 22904033
Alignment:
Q  58 caaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagt 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903494 caaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaaactcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagt 22903593  T
Q  158 gaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattg 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903594 gaaagagttgatgaatgtattaatgctaaagatgtatgggatattttgatattacatcatgatggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattg 22903693  T
Q  258 gagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttgg 357  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22903694 gagttagaaagtttcaagtctttgaaatgagtgagaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttattacaatagtaaatgaaatgagatctcttgg 22903793  T
Q  358 aaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagattta 457  Q
    |||| ||||||  |||||||| | ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  22903794 aaagacatatttcactcatgagataatcagaaaaatattgagttgccttccaagtatgtggagacctatggtaactgcaattactcaggccaaagatttg 22903893  T
Q  458 aaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttga 557  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |    
T  22903894 aaatctatgaacttggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccaatgaagaaggtaaagtcacttgccttaa 22903993  T
Q  558 aagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||    
T  22903994 aagcctctcagcaaacctcatcagtagctgaagatgatgt 22904033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 453
Target Start/End: Original strand, 1791955 - 1792304
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  1791955 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 1792054  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  1792055 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 1792154  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  1792155 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 1792254  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 453  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  1792255 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 1792304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 467; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 53562 - 52979
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53562 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaatagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 53463  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53462 taaagctagactctttctatcatgtgcattaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttaaaaata 53363  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53362 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 53263  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  53262 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaata--gagatgtcttccaag 53165  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53164 tatatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctcgaagatctcattggatcactgagagctcatgaagttata 53065  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  53064 cttcaaggagacaaactagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcatcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 52979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Original strand, 148017 - 148602
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  148017 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaggtattactaaactc 148116  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  148117 ttaagctagactctttctatcatgtgcacttaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgtgataccttaaaaata 148216  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  148217 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgaga 148316  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  148317 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattatactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 148416  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgta 511  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  148417 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctagaggatctcattggttcactgagagctcatgacgttgta 148516  T
Q  512 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  148517 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaagtaaaaacacttaccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 148602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 6598 - 6030
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  6598 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 6499  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6498 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 6399  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6398 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 6299  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6298 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 6199  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6198 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 6099  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6098 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 582
Target Start/End: Original strand, 7080 - 7648
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  7080 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 7179  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7180 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 7279  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7280 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7379  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7380 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 7479  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 7579  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7580 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 7648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 582
Target Start/End: Original strand, 10862 - 11430
Alignment:
Q  14 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  10862 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 10961  T
Q  114 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10962 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 11061  T
Q  214 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 11161  T
Q  314 tatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagta 413  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11162 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 11261  T
Q  414 tgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11262 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 11361  T
Q  514 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 582  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11362 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 11430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 581
Target Start/End: Original strand, 16545 - 17097
Alignment:
Q  21 atggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctag 120  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16545 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 16644  T
Q  121 actctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgag 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |  || | | |||  |||||     
T  16645 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 16744  T
Q  221 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcca 320  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  16745 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 16844  T
Q  321 gatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggac 420  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     ||||||||||||     
T  16845 gatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggag 16939  T
Q  421 acctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaagga 520  Q
    ||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16940 acctatgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaa 17036  T
Q  521 gacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17037 gacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 434
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20506
Alignment:
Q  12 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||    
T  20084 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaatctcaggtattactaaactc 20183  T
Q  112 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||||||| ||  ||| | ||    
T  20184 caaagctagactctttctatcatgtgcactgactagggaagaaagtgaaagagttgatgtgtgtaaaaatgccaaagatgtatgggacactctgagagta 20283  T
Q  212 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 311  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284 catcataaaggtacatctcatgtcaaaggaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaactctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 20383  T
Q  312 tgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  20384 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaag 20483  T
Q  412 tatgtggacacctatggtcactg 434  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  20484 aatgtggagacctatggtcactg 20506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 428 - 597
Target Start/End: Original strand, 27670 - 27839
Alignment:
Q  428 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 527  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27670 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 27769  T
Q  528 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  27770 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 27839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 179 - 468
Target Start/End: Original strand, 1 - 290
Alignment:
Q  179 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtct 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1 aatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaagtttgaagtct 100  T
Q  279 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  101 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgaaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttagaaaagcatattccactcatga 200  T
Q  379 tagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaa 468  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  201 aagaataagaaaaataatgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 72 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 189498 - 189005
Alignment:
Q  72 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 171  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  189498 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcactaaccttggaagaaattgaaagggttgatga 189399  T
Q  172 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 271  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  189398 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaacctctcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 189300  T
Q  272 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattcta 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | ||||   |    
T  189299 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgataaaatatatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatagca 189200  T
Q  372 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 471  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   |    
T  189199 ctcatgatagaattaggaagatactaagatgtcttccaagtacatggaggcctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 189100  T
Q  472 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 567  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  189099 ggaagtactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccaatgagaaaggtaaaatcacttgccttaaaagcttctca 189005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 386 - 595
Target Start/End: Original strand, 1 - 210
Alignment:
Q  386 agaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agaaaaatattgagatgtcttccaagtatttggagacctatggtcactgcaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 100  T
Q  486 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacactttccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgc 200  T
Q  586 tgatgatgat 595  Q
    ||||||||||    
T  201 tgatgatgat 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 428 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 87142 - 86973
Alignment:
Q  428 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 527  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  87142 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 87043  T
Q  528 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 597  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  87042 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 86973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 103224 - 102825
Alignment:
Q  105 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 204  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  103224 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 103125  T
Q  205 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 304  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  103124 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 103025  T
Q  305 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 404  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  103024 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 102925  T
Q  405 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 504  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  102924 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 102825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 459
Target Start/End: Original strand, 257898 - 258253
Alignment:
Q  104 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| |||||||||| |    
T  257898 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatatgggatacgt 257997  T
Q  204 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 303  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  257998 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 258097  T
Q  304 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 403  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  258098 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 258197  T
Q  404 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 459  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  258198 ctcccaaaaacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 258253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 315
Target Start/End: Original strand, 5060 - 5196
Alignment:
Q  179 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtct 278  Q
    ||||| |||||| | |||||||| || ||  |||||||||| || ||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| | |    
T  5060 aatgccaaagaaatttgggatacattaaaggtacatcatgaaggcaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaaatttgaactat 5159  T
Q  279 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgta 315  Q
    |||||||||  ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  5160 ttgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatgaaatgta 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University