View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18113_high_5 (Length: 327)

Name: NF18113_high_5
Description: NF18113
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18113_high_5
NF18113_high_5
[»] chr2 (114 HSPs)
chr2 (1-312)||(19539830-19540139)
chr2 (1-313)||(24376519-24376828)
chr2 (1-313)||(28140979-28141289)
chr2 (1-313)||(25188812-25189121)
chr2 (3-313)||(30557701-30558009)
chr2 (1-313)||(39038019-39038328)
chr2 (1-313)||(18702153-18702463)
chr2 (1-313)||(24778785-24779097)
chr2 (1-313)||(24575448-24575758)
chr2 (1-287)||(22786033-22786320)
chr2 (1-313)||(24851043-24851350)
chr2 (1-313)||(10010128-10010439)
chr2 (1-287)||(22317027-22317313)
chr2 (1-313)||(22188481-22188789)
chr2 (1-313)||(23184680-23184989)
chr2 (1-313)||(23595943-23596252)
chr2 (1-313)||(31801266-31801575)
chr2 (1-313)||(20152379-20152688)
chr2 (3-313)||(22257614-22257922)
chr2 (1-306)||(17963645-17963947)
chr2 (1-287)||(22781993-22782280)
chr2 (1-287)||(38780832-38781118)
chr2 (1-290)||(40781910-40782200)
chr2 (1-313)||(20569127-20569437)
chr2 (1-287)||(44839868-44840155)
chr2 (1-312)||(22271544-22271854)
chr2 (1-287)||(28551297-28551584)
chr2 (1-287)||(33073663-33073948)
chr2 (1-287)||(13964357-13964639)
chr2 (3-287)||(23234444-23234727)
chr2 (1-313)||(24843618-24843927)
chr2 (1-313)||(18431315-18431625)
chr2 (1-313)||(25037639-25037948)
chr2 (1-287)||(34322314-34322597)
chr2 (1-287)||(1587411-1587696)
chr2 (43-313)||(40331523-40331789)
chr2 (55-285)||(45087414-45087645)
chr2 (2-313)||(31328342-31328649)
chr2 (2-313)||(31335063-31335370)
chr2 (1-287)||(14581000-14581280)
chr2 (1-313)||(28712077-28712384)
chr2 (1-212)||(21537629-21537838)
chr2 (1-287)||(28701591-28701877)
chr2 (1-233)||(26619478-26619709)
chr2 (6-218)||(6392139-6392351)
chr2 (1-157)||(22455366-22455521)
chr2 (1-186)||(22776615-22776801)
chr2 (2-287)||(22801906-22802182)
chr2 (1-249)||(10898901-10899140)
chr2 (96-286)||(16494783-16494974)
chr2 (1-157)||(6574506-6574662)
chr2 (1-164)||(44880728-44880890)
chr2 (1-157)||(41122094-41122249)
chr2 (123-313)||(40331201-40331387)
chr2 (1-174)||(19114634-19114806)
chr2 (55-313)||(35744410-35744662)
chr2 (1-157)||(25828697-25828854)
chr2 (178-313)||(41122240-41122373)
chr2 (30-153)||(26366845-26366967)
chr2 (1-249)||(22382956-22383204)
chr2 (178-313)||(26366962-26367095)
chr2 (178-310)||(22455512-22455643)
chr2 (1-174)||(25918265-25918435)
chr2 (98-249)||(20567634-20567783)
chr2 (1-132)||(24441094-24441225)
chr2 (1-107)||(24157432-24157538)
chr2 (208-313)||(27296853-27296957)
chr2 (178-313)||(25828574-25828706)
chr2 (63-174)||(21911303-21911413)
chr2 (30-156)||(23393072-23393198)
chr2 (178-284)||(6574653-6574759)
chr2 (1-174)||(21845708-21845871)
chr2 (30-186)||(19356042-19356194)
chr2 (71-156)||(20647003-20647087)
chr2 (30-245)||(1083495-1083710)
chr2 (71-158)||(19300404-19300490)
chr2 (71-158)||(19498384-19498470)
chr2 (71-158)||(24801994-24802080)
chr2 (71-158)||(24814961-24815047)
chr2 (1-96)||(9015747-9015842)
chr2 (71-158)||(19313411-19313497)
chr2 (238-313)||(6392077-6392150)
chr2 (30-144)||(1088946-1089061)
chr2 (71-158)||(22755039-22755125)
chr2 (5-110)||(14794242-14794346)
chr2 (30-158)||(22763405-22763528)
chr2 (30-158)||(22774109-22774232)
chr2 (78-158)||(38033232-38033311)
chr2 (204-313)||(24838518-24838624)
chr2 (5-174)||(19320785-19320948)
chr2 (30-155)||(967858-967978)
chr2 (30-155)||(24274779-24274899)
chr2 (71-155)||(17970662-17970744)
chr2 (6-110)||(15670998-15671097)
chr2 (71-186)||(7006199-7006312)
chr2 (71-186)||(24328126-24328239)
chr2 (71-186)||(24338796-24338909)
chr2 (230-313)||(26623059-26623141)
chr2 (1-54)||(20567804-20567857)
chr2 (30-174)||(22682946-22683086)
chr2 (145-185)||(26704177-26704217)
chr2 (71-143)||(27978774-27978845)
chr2 (71-143)||(28065303-28065374)
chr2 (71-186)||(1041872-1041985)
chr2 (87-186)||(17857845-17857942)
chr2 (71-186)||(29243945-29244058)
chr2 (71-186)||(29254524-29254637)
chr2 (5-158)||(14866833-14866985)
chr2 (70-112)||(22525274-22525316)
chr2 (70-112)||(40202837-40202879)
chr2 (78-143)||(38586486-38586550)
chr2 (71-119)||(17969602-17969650)
chr2 (5-109)||(27939600-27939702)
chr2 (269-313)||(44880688-44880731)
[»] chr7 (131 HSPs)
chr7 (1-313)||(29935779-29936090)
chr7 (1-313)||(13261048-13261359)
chr7 (1-313)||(13034272-13034581)
chr7 (1-313)||(16316990-16317299)
chr7 (1-313)||(14187102-14187413)
chr7 (1-313)||(16314973-16315283)
chr7 (1-313)||(11792323-11792632)
chr7 (1-287)||(27871153-27871440)
chr7 (1-313)||(2914044-2914354)
chr7 (1-290)||(11318840-11319129)
chr7 (1-313)||(13302274-13302584)
chr7 (1-313)||(15087965-15088272)
chr7 (1-313)||(28622793-28623102)
chr7 (1-310)||(16310340-16310648)
chr7 (1-313)||(16557024-16557331)
chr7 (1-313)||(16608331-16608638)
chr7 (1-313)||(5001258-5001570)
chr7 (1-313)||(4493988-4494300)
chr7 (1-313)||(10883606-10883915)
chr7 (1-313)||(12174774-12175081)
chr7 (1-313)||(41842859-41843168)
chr7 (1-313)||(13731108-13731418)
chr7 (1-313)||(14425961-14426270)
chr7 (1-313)||(13027339-13027642)
chr7 (1-287)||(24795148-24795436)
chr7 (1-313)||(21283808-21284117)
chr7 (1-313)||(15704923-15705229)
chr7 (1-313)||(19328448-19328754)
chr7 (1-313)||(33421166-33421471)
chr7 (1-287)||(13138331-13138618)
chr7 (30-313)||(33692165-33692443)
chr7 (1-287)||(32265154-32265441)
chr7 (1-313)||(13683011-13683320)
chr7 (1-287)||(23280395-23280674)
chr7 (43-313)||(12367213-12367481)
chr7 (1-313)||(331065-331365)
chr7 (1-287)||(15467353-15467639)
chr7 (1-287)||(48063255-48063533)
chr7 (1-313)||(30945793-30946101)
chr7 (3-287)||(9710241-9710525)
chr7 (1-267)||(16112319-16112585)
chr7 (4-313)||(19711450-19711755)
chr7 (1-287)||(48806313-48806601)
chr7 (1-287)||(21381863-21382150)
chr7 (1-231)||(2499531-2499760)
chr7 (1-291)||(13472941-13473221)
chr7 (1-313)||(7488338-7488647)
chr7 (1-287)||(19339683-19339970)
chr7 (1-313)||(9099474-9099780)
chr7 (1-313)||(2265952-2266256)
chr7 (1-313)||(19237470-19237779)
chr7 (1-313)||(9098668-9098974)
chr7 (1-216)||(8182437-8182653)
chr7 (104-287)||(48237378-48237562)
chr7 (1-186)||(13645928-13646114)
chr7 (1-313)||(4820900-4821198)
chr7 (1-173)||(1292580-1292753)
chr7 (86-313)||(33604320-33604544)
chr7 (1-153)||(21691902-21692054)
chr7 (1-249)||(25687275-25687521)
chr7 (1-168)||(39284998-39285164)
chr7 (1-186)||(30025443-30025628)
chr7 (1-174)||(22579652-22579823)
chr7 (1-313)||(16411422-16411717)
chr7 (1-158)||(35953120-35953277)
chr7 (90-290)||(13902136-13902335)
chr7 (1-313)||(13172789-13173092)
chr7 (1-173)||(14425006-14425170)
chr7 (1-249)||(16308148-16308395)
chr7 (78-287)||(13879605-13879817)
chr7 (1-248)||(5034863-5035110)
chr7 (173-312)||(21691775-21691912)
chr7 (178-313)||(44466508-44466640)
chr7 (1-157)||(44466631-44466786)
chr7 (160-313)||(35954500-35954647)
chr7 (32-194)||(602297-602458)
chr7 (218-313)||(13259053-13259146)
chr7 (218-313)||(13266393-13266486)
chr7 (71-278)||(4433040-4433246)
chr7 (30-278)||(4412425-4412673)
chr7 (1-94)||(41842706-41842799)
chr7 (71-158)||(8999393-8999479)
chr7 (6-141)||(18362007-18362140)
chr7 (71-156)||(13175064-13175148)
chr7 (213-290)||(30025369-30025446)
chr7 (30-110)||(16105429-16105509)
chr7 (78-158)||(11087510-11087589)
chr7 (211-287)||(14424952-14425028)
chr7 (71-186)||(24882875-24882988)
chr7 (177-287)||(15574192-15574301)
chr7 (211-313)||(22579829-22579925)
chr7 (211-313)||(1292505-1292602)
chr7 (30-155)||(3476757-3476877)
chr7 (5-186)||(23125486-23125662)
chr7 (30-155)||(29589755-29589876)
chr7 (1-95)||(33605314-33605408)
chr7 (1-61)||(18056684-18056744)
chr7 (178-313)||(9069174-9069303)
chr7 (211-313)||(39285147-39285247)
chr7 (5-174)||(16472243-16472406)
chr7 (188-285)||(16545959-16546055)
chr7 (188-285)||(16619607-16619703)
chr7 (5-110)||(25807007-25807111)
chr7 (71-155)||(8933327-8933409)
chr7 (71-158)||(48381948-48382033)
chr7 (30-155)||(15216080-15216200)
chr7 (34-76)||(48237335-48237377)
chr7 (241-313)||(24787775-24787845)
chr7 (71-144)||(26210003-26210075)
chr7 (71-144)||(12734619-12734691)
chr7 (206-313)||(13645864-13645968)
chr7 (71-155)||(18418878-18418960)
chr7 (71-155)||(18440959-18441041)
chr7 (5-112)||(1878699-1878804)
chr7 (71-186)||(6867679-6867792)
chr7 (71-186)||(6878311-6878424)
chr7 (71-186)||(8617119-8617232)
chr7 (71-186)||(24931057-24931170)
chr7 (71-186)||(37343933-37344046)
chr7 (69-174)||(2501515-2501617)
chr7 (65-186)||(2706060-2706179)
chr7 (5-62)||(11572636-11572693)
chr7 (262-313)||(2499477-2499526)
chr7 (1-57)||(30944760-30944816)
chr7 (78-158)||(40055214-40055292)
chr7 (78-133)||(19416856-19416910)
chr7 (70-112)||(11015573-11015615)
chr7 (65-110)||(2716664-2716709)
chr7 (1-46)||(28408716-28408761)
chr7 (71-124)||(38403665-38403718)
chr7 (71-155)||(13682083-13682165)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (1-313)||(10756841-10757151)
chr1 (1-313)||(12283839-12284151)
chr1 (1-313)||(22153273-22153583)
chr1 (1-313)||(7309235-7309545)
chr1 (1-287)||(35039606-35039892)
chr1 (1-313)||(12624907-12625216)
chr1 (1-313)||(23024211-23024519)
chr1 (1-313)||(32786293-32786600)
chr1 (1-313)||(44824115-44824421)
chr1 (1-287)||(21121418-21121705)
chr1 (1-313)||(22202088-22202397)
chr1 (1-312)||(33256703-33257012)
chr1 (1-312)||(33276875-33277184)
chr1 (1-281)||(2267977-2268256)
chr1 (1-287)||(2834125-2834413)
chr1 (1-287)||(21205226-21205513)
chr1 (1-287)||(21215030-21215317)
chr1 (22-313)||(36133622-36133907)
chr1 (1-287)||(46088428-46088715)
chr1 (1-313)||(23036860-23037167)
chr1 (1-287)||(1577306-1577592)
chr1 (1-313)||(22600545-22600848)
chr1 (3-312)||(16235664-16235967)
chr1 (1-313)||(26702482-26702792)
chr1 (1-313)||(48570584-48570890)
chr1 (2-284)||(29215238-29215520)
chr1 (1-313)||(30892510-30892821)
chr1 (1-313)||(21192218-21192527)
chr1 (1-313)||(21702233-21702540)
chr1 (1-287)||(1899786-1900070)
chr1 (1-287)||(21135514-21135801)
chr1 (1-312)||(19215031-19215339)
chr1 (1-313)||(17025315-17025627)
chr1 (1-313)||(38281984-38282290)
chr1 (1-287)||(21984035-21984321)
chr1 (1-313)||(2327790-2328097)
chr1 (1-313)||(10250407-10250712)
chr1 (1-313)||(14263784-14264091)
chr1 (1-313)||(22465163-22465473)
chr1 (63-313)||(22427753-22428001)
chr1 (1-287)||(30571638-30571923)
chr1 (1-243)||(18896947-18897187)
chr1 (1-287)||(37640448-37640736)
chr1 (3-282)||(18614364-18614641)
chr1 (55-313)||(25448964-25449220)
chr1 (1-287)||(42284080-42284354)
chr1 (1-218)||(19717031-19717249)
chr1 (1-313)||(2266517-2266814)
chr1 (1-186)||(48703744-48703929)
chr1 (1-186)||(21028337-21028521)
chr1 (1-283)||(20908856-20909136)
chr1 (9-171)||(14293045-14293206)
chr1 (1-283)||(17018035-17018307)
chr1 (1-174)||(27858295-27858467)
chr1 (1-174)||(18130364-18130537)
chr1 (1-174)||(23053927-23054096)
chr1 (1-171)||(18517513-18517682)
chr1 (1-249)||(20110301-20110548)
chr1 (1-249)||(26280410-26280651)
chr1 (1-248)||(16233484-16233728)
chr1 (1-174)||(9346328-9346501)
chr1 (8-126)||(28492761-28492879)
chr1 (71-186)||(21543583-21543697)
chr1 (30-185)||(20867232-20867383)
chr1 (78-186)||(23926608-23926715)
chr1 (71-187)||(52351103-52351218)
chr1 (71-158)||(20251348-20251434)
chr1 (71-158)||(22642467-22642553)
chr1 (71-158)||(28473803-28473889)
chr1 (71-186)||(34255939-34256053)
chr1 (5-175)||(2819668-2819834)
chr1 (71-157)||(22655050-22655135)
chr1 (30-158)||(17370614-17370742)
chr1 (78-158)||(22018904-22018983)
chr1 (71-158)||(5929281-5929367)
chr1 (71-158)||(28379567-28379653)
chr1 (71-186)||(46181297-46181410)
chr1 (211-313)||(48703680-48703779)
chr1 (71-157)||(26548679-26548764)
chr1 (71-158)||(19170748-19170834)
chr1 (30-184)||(22610354-22610503)
chr1 (71-158)||(44200589-44200675)
chr1 (71-158)||(45071046-45071132)
chr1 (71-144)||(24029106-24029179)
chr1 (94-158)||(19037579-19037642)
chr1 (71-175)||(20884300-20884402)
chr1 (4-112)||(31358942-31359048)
chr1 (71-142)||(7745504-7745575)
chr1 (215-313)||(14293190-14293286)
chr1 (5-110)||(8698474-8698578)
chr1 (30-174)||(26703132-26703276)
chr1 (234-313)||(38281803-38281877)
chr1 (30-155)||(41132996-41133118)
chr1 (30-155)||(14388506-14388627)
chr1 (71-144)||(18311390-18311462)
chr1 (254-313)||(28492888-28492945)
chr1 (71-155)||(675153-675235)
chr1 (71-186)||(5650684-5650797)
chr1 (71-158)||(12944914-12944999)
chr1 (63-175)||(21684469-21684579)
chr1 (5-97)||(23935442-23935533)
chr1 (71-186)||(19178636-19178749)
chr1 (71-186)||(19187515-19187628)
chr1 (6-61)||(22666009-22666064)
chr1 (12-62)||(23975274-23975324)
chr1 (30-110)||(20798689-20798766)
chr1 (30-110)||(39586721-39586798)
chr1 (30-110)||(47195013-47195090)
chr1 (78-158)||(17956944-17957022)
[»] chr8 (101 HSPs)
chr8 (1-313)||(18321589-18321897)
chr8 (1-313)||(25163481-25163791)
chr8 (1-313)||(9319980-9320289)
chr8 (1-313)||(43639193-43639501)
chr8 (1-313)||(19942646-19942954)
chr8 (1-309)||(18679228-18679534)
chr8 (1-309)||(18718417-18718723)
chr8 (1-313)||(20255941-20256253)
chr8 (1-310)||(43644310-43644616)
chr8 (1-285)||(45538868-45539153)
chr8 (1-287)||(39692968-39693254)
chr8 (3-287)||(21932315-21932599)
chr8 (1-313)||(40845818-40846128)
chr8 (1-313)||(15336519-15336828)
chr8 (1-313)||(15425584-15425893)
chr8 (1-313)||(15516888-15517197)
chr8 (1-313)||(29692723-29693033)
chr8 (1-287)||(23264056-23264342)
chr8 (1-287)||(45292269-45292554)
chr8 (1-313)||(17526163-17526476)
chr8 (1-313)||(19956768-19957078)
chr8 (1-229)||(20382824-20383053)
chr8 (1-313)||(18121539-18121848)
chr8 (1-287)||(17442251-17442536)
chr8 (1-287)||(13431060-13431338)
chr8 (1-314)||(22462068-22462379)
chr8 (1-273)||(24645779-24646051)
chr8 (1-313)||(33560646-33560954)
chr8 (1-287)||(17796854-17797140)
chr8 (3-313)||(19706926-19707226)
chr8 (1-313)||(43773531-43773840)
chr8 (1-313)||(18772102-18772413)
chr8 (1-238)||(1744635-1744872)
chr8 (1-249)||(16206770-16207015)
chr8 (1-216)||(6407230-6407445)
chr8 (3-218)||(30421866-30422081)
chr8 (1-186)||(14989882-14990068)
chr8 (1-186)||(18152078-18152264)
chr8 (54-313)||(26832486-26832742)
chr8 (1-186)||(14990493-14990679)
chr8 (104-306)||(12758270-12758470)
chr8 (1-186)||(22662650-22662836)
chr8 (78-275)||(22707777-22707973)
chr8 (146-313)||(15934236-15934402)
chr8 (121-313)||(16681803-16681993)
chr8 (1-186)||(22673362-22673548)
chr8 (4-141)||(16188563-16188700)
chr8 (1-145)||(36104774-36104916)
chr8 (1-136)||(17701326-17701461)
chr8 (106-313)||(19153443-19153653)
chr8 (145-313)||(14990668-14990830)
chr8 (52-186)||(15934113-15934246)
chr8 (145-313)||(14990057-14990219)
chr8 (145-313)||(18152253-18152415)
chr8 (30-141)||(17928633-17928744)
chr8 (1-119)||(12193515-12193633)
chr8 (1-119)||(12437943-12438061)
chr8 (1-249)||(18557505-18557742)
chr8 (145-313)||(22673211-22673373)
chr8 (1-249)||(25850433-25850671)
chr8 (24-173)||(2810357-2810506)
chr8 (1-158)||(1210173-1210328)
chr8 (1-110)||(19155854-19155963)
chr8 (145-313)||(22662498-22662661)
chr8 (71-278)||(21287849-21288055)
chr8 (71-278)||(45568416-45568622)
chr8 (2-141)||(17917250-17917389)
chr8 (30-245)||(21540432-21540647)
chr8 (71-158)||(21298579-21298665)
chr8 (71-185)||(22211798-22211911)
chr8 (30-175)||(19505897-19506040)
chr8 (71-158)||(8031593-8031679)
chr8 (1-76)||(12758194-12758269)
chr8 (71-158)||(17519558-17519644)
chr8 (71-158)||(19460754-19460840)
chr8 (71-158)||(19558432-19558518)
chr8 (71-158)||(28903033-28903119)
chr8 (71-158)||(29379144-29379230)
chr8 (87-158)||(40002793-40002863)
chr8 (211-308)||(2810285-2810379)
chr8 (71-186)||(22167431-22167544)
chr8 (71-155)||(22136266-22136348)
chr8 (71-158)||(23271616-23271702)
chr8 (2-72)||(16681734-16681804)
chr8 (87-155)||(7018805-7018872)
chr8 (5-110)||(12541254-12541358)
chr8 (5-110)||(33052487-33052591)
chr8 (30-144)||(3843322-3843432)
chr8 (211-313)||(16206681-16206777)
chr8 (30-155)||(20259988-20260108)
chr8 (30-155)||(21046618-21046738)
chr8 (54-158)||(24678881-24678984)
chr8 (238-313)||(6407169-6407239)
chr8 (78-133)||(17879222-17879276)
chr8 (71-186)||(18449130-18449243)
chr8 (1-36)||(18685827-18685862)
chr8 (1-36)||(18731421-18731456)
chr8 (71-186)||(19128508-19128621)
chr8 (71-186)||(19139040-19139153)
chr8 (5-112)||(24634927-24635032)
chr8 (70-111)||(27739492-27739533)
[»] chr3 (174 HSPs)
chr3 (1-313)||(8874551-8874862)
chr3 (1-313)||(17239354-17239664)
chr3 (1-313)||(12963516-12963827)
chr3 (1-290)||(14393435-14393725)
chr3 (3-313)||(16032012-16032320)
chr3 (1-313)||(28581524-28581831)
chr3 (1-313)||(40799316-40799623)
chr3 (1-290)||(22804453-22804744)
chr3 (1-313)||(6090144-6090456)
chr3 (1-290)||(29951869-29952157)
chr3 (1-287)||(11223004-11223290)
chr3 (1-287)||(38178077-38178362)
chr3 (1-309)||(13781017-13781323)
chr3 (1-313)||(20645571-20645881)
chr3 (1-290)||(30001023-30001311)
chr3 (3-313)||(49643195-49643503)
chr3 (1-287)||(47405855-47406142)
chr3 (1-313)||(2560603-2560913)
chr3 (1-313)||(5212998-5213304)
chr3 (1-313)||(33582650-33582957)
chr3 (2-313)||(31302767-31303072)
chr3 (1-313)||(3238109-3238419)
chr3 (1-286)||(20627866-20628151)
chr3 (1-313)||(41494416-41494724)
chr3 (1-312)||(46350278-46350586)
chr3 (1-313)||(47207123-47207430)
chr3 (1-313)||(12726663-12726976)
chr3 (1-287)||(21640306-21640593)
chr3 (4-313)||(30054616-30054920)
chr3 (1-285)||(49553933-49554214)
chr3 (1-313)||(12967725-12968035)
chr3 (1-287)||(40850416-40850703)
chr3 (1-290)||(15902634-15902923)
chr3 (4-287)||(9700472-9700757)
chr3 (1-313)||(26418107-26418418)
chr3 (1-287)||(1728448-1728735)
chr3 (3-313)||(13823485-13823790)
chr3 (1-281)||(12396515-12396794)
chr3 (1-284)||(53057162-53057445)
chr3 (1-287)||(14968803-14969083)
chr3 (1-313)||(2784483-2784792)
chr3 (1-283)||(50299677-50299960)
chr3 (1-313)||(17667824-17668131)
chr3 (1-313)||(20724505-20724815)
chr3 (1-217)||(13947847-13948064)
chr3 (1-286)||(29854846-29855135)
chr3 (55-313)||(2025507-2025760)
chr3 (1-250)||(46796800-46797048)
chr3 (12-219)||(52919944-52920150)
chr3 (1-313)||(14954848-14955155)
chr3 (1-287)||(18122046-18122332)
chr3 (30-313)||(23538624-23538905)
chr3 (1-283)||(6252866-6253147)
chr3 (4-313)||(6174753-6175060)
chr3 (1-231)||(24775965-24776195)
chr3 (1-197)||(22140294-22140490)
chr3 (1-186)||(21606087-21606273)
chr3 (87-313)||(49669008-49669229)
chr3 (1-171)||(19249844-19250013)
chr3 (5-186)||(21638680-21638862)
chr3 (1-186)||(52283272-52283457)
chr3 (1-249)||(8729419-8729666)
chr3 (1-249)||(9081306-9081553)
chr3 (113-287)||(2782918-2783093)
chr3 (3-216)||(12389305-12389518)
chr3 (1-157)||(22128615-22128771)
chr3 (1-126)||(16659050-16659175)
chr3 (1-173)||(22463526-22463698)
chr3 (1-173)||(22464984-22465156)
chr3 (1-244)||(10851295-10851536)
chr3 (34-249)||(14077785-14077998)
chr3 (1-230)||(11867772-11867994)
chr3 (1-157)||(19889374-19889532)
chr3 (1-174)||(13698924-13699095)
chr3 (1-174)||(14007120-14007290)
chr3 (71-313)||(15961132-15961367)
chr3 (1-249)||(16879496-16879744)
chr3 (4-249)||(19198315-19198557)
chr3 (1-124)||(16811704-16811828)
chr3 (1-248)||(4243552-4243798)
chr3 (134-287)||(11222256-11222409)
chr3 (1-126)||(25398689-25398814)
chr3 (1-140)||(18143178-18143316)
chr3 (1-174)||(13410479-13410651)
chr3 (1-174)||(17697172-17697336)
chr3 (151-284)||(1241670-1241803)
chr3 (30-278)||(12753080-12753328)
chr3 (1-174)||(14072253-14072423)
chr3 (71-278)||(13953716-13953922)
chr3 (1-134)||(16881882-16882016)
chr3 (160-313)||(16659183-16659335)
chr3 (202-313)||(14063621-14063731)
chr3 (30-158)||(15832981-15833109)
chr3 (30-158)||(51340584-51340712)
chr3 (3-158)||(7833071-7833215)
chr3 (145-313)||(21638851-21639013)
chr3 (71-158)||(13147838-13147924)
chr3 (71-186)||(17006739-17006853)
chr3 (203-313)||(19249985-19250093)
chr3 (71-158)||(31114363-31114449)
chr3 (215-313)||(52283208-52283303)
chr3 (179-313)||(25398867-25398995)
chr3 (30-158)||(49989834-49989962)
chr3 (78-278)||(11909548-11909747)
chr3 (210-313)||(13939313-13939413)
chr3 (71-186)||(14580888-14581003)
chr3 (30-157)||(15848776-15848903)
chr3 (78-158)||(22150819-22150898)
chr3 (1-81)||(49666838-49666918)
chr3 (71-158)||(10528918-10529004)
chr3 (1-102)||(16811827-16811929)
chr3 (164-290)||(19889509-19889634)
chr3 (1-70)||(16199861-16199930)
chr3 (30-158)||(37412179-37412306)
chr3 (1-248)||(50721589-50721836)
chr3 (1-248)||(50791013-50791260)
chr3 (71-158)||(45862089-45862175)
chr3 (238-313)||(52919882-52919956)
chr3 (30-155)||(2246144-2246265)
chr3 (30-155)||(13199581-13199702)
chr3 (30-155)||(15651407-15651527)
chr3 (30-155)||(15663042-15663162)
chr3 (71-157)||(51989522-51989607)
chr3 (178-287)||(22128516-22128624)
chr3 (1-65)||(31303073-31303137)
chr3 (1-175)||(16305580-16305749)
chr3 (94-158)||(41045316-41045379)
chr3 (211-287)||(46797040-46797115)
chr3 (71-158)||(17017573-17017659)
chr3 (71-158)||(21735885-21735970)
chr3 (87-158)||(27172612-27172681)
chr3 (8-110)||(13931576-13931677)
chr3 (5-82)||(17762524-17762601)
chr3 (5-82)||(19063844-19063921)
chr3 (1-106)||(22766949-22767052)
chr3 (6-106)||(27849808-27849907)
chr3 (7-110)||(15647373-15647475)
chr3 (71-142)||(29906555-29906625)
chr3 (71-142)||(29947720-29947790)
chr3 (71-142)||(29996874-29996944)
chr3 (4-112)||(1463904-1464010)
chr3 (211-287)||(22463676-22463752)
chr3 (211-287)||(22465134-22465210)
chr3 (78-186)||(28168830-28168936)
chr3 (234-285)||(11189454-11189505)
chr3 (71-158)||(16076705-16076790)
chr3 (87-158)||(29933950-29934019)
chr3 (87-158)||(29983104-29983173)
chr3 (5-175)||(12410234-12410399)
chr3 (68-158)||(21317090-21317179)
chr3 (30-158)||(17281770-17281893)
chr3 (71-186)||(6180901-6181014)
chr3 (71-186)||(6221075-6221188)
chr3 (71-144)||(8740499-8740571)
chr3 (101-174)||(22770393-22770464)
chr3 (50-110)||(11078307-11078366)
chr3 (1-73)||(20417889-20417961)
chr3 (71-143)||(27883173-27883244)
chr3 (71-130)||(1053512-1053570)
chr3 (71-186)||(4175130-4175243)
chr3 (87-158)||(8996346-8996415)
chr3 (87-158)||(9006898-9006967)
chr3 (71-186)||(12287352-12287466)
chr3 (71-186)||(12297174-12297288)
chr3 (71-158)||(18006068-18006152)
chr3 (71-186)||(37866194-37866307)
chr3 (71-186)||(37885327-37885440)
chr3 (10-59)||(4768023-4768071)
chr3 (10-63)||(12755896-12755947)
chr3 (78-143)||(14322072-14322136)
chr3 (71-107)||(1794857-1794893)
chr3 (78-158)||(13262053-13262131)
chr3 (71-143)||(16671536-16671606)
chr3 (71-175)||(17961105-17961207)
[»] chr5 (98 HSPs)
chr5 (1-314)||(23413387-23413698)
chr5 (1-313)||(89834-90146)
chr5 (1-313)||(7746107-7746417)
chr5 (1-313)||(21072650-21072959)
chr5 (1-313)||(12353209-12353517)
chr5 (1-313)||(19536710-19537020)
chr5 (1-313)||(25097240-25097549)
chr5 (1-313)||(25155210-25155519)
chr5 (1-313)||(31117293-31117602)
chr5 (1-313)||(643114-643423)
chr5 (1-313)||(10848188-10848496)
chr5 (1-313)||(23880480-23880789)
chr5 (1-290)||(21199414-21199702)
chr5 (1-311)||(17814381-17814689)
chr5 (1-287)||(35932420-35932707)
chr5 (1-310)||(21100116-21100422)
chr5 (1-287)||(30116250-30116536)
chr5 (1-313)||(26783768-26784078)
chr5 (1-313)||(14086953-14087261)
chr5 (1-313)||(15516387-15516693)
chr5 (1-313)||(28464752-28465058)
chr5 (1-313)||(6512843-6513153)
chr5 (16-313)||(9399044-9399339)
chr5 (1-313)||(11993305-11993613)
chr5 (1-313)||(3245855-3246162)
chr5 (1-313)||(9088386-9088692)
chr5 (1-313)||(13545938-13546244)
chr5 (1-287)||(21659648-21659935)
chr5 (1-287)||(23392017-23392305)
chr5 (1-287)||(29138819-29139104)
chr5 (1-287)||(28139041-28139330)
chr5 (1-287)||(33022100-33022389)
chr5 (1-313)||(31487653-31487959)
chr5 (1-313)||(33932684-33932991)
chr5 (1-287)||(35986645-35986933)
chr5 (1-287)||(30742419-30742705)
chr5 (1-313)||(42243098-42243405)
chr5 (1-249)||(2156688-2156934)
chr5 (1-248)||(4886500-4886746)
chr5 (14-313)||(26764920-26765214)
chr5 (1-228)||(20550391-20550617)
chr5 (1-283)||(16606955-16607236)
chr5 (1-176)||(22000469-22000644)
chr5 (1-216)||(31146048-31146264)
chr5 (1-310)||(34637875-34638179)
chr5 (1-173)||(13736548-13736720)
chr5 (1-157)||(6498806-6498961)
chr5 (1-144)||(25930569-25930712)
chr5 (1-174)||(20968764-20968936)
chr5 (3-172)||(23589269-23589436)
chr5 (1-126)||(25740709-25740834)
chr5 (1-249)||(26120239-26120486)
chr5 (147-313)||(4886379-4886540)
chr5 (72-278)||(32160199-32160404)
chr5 (208-313)||(22000647-22000750)
chr5 (30-186)||(24019161-24019315)
chr5 (34-141)||(31589421-31589528)
chr5 (109-290)||(25156554-25156734)
chr5 (4-174)||(34637127-34637292)
chr5 (1-102)||(26758772-26758873)
chr5 (71-158)||(23488091-23488177)
chr5 (71-185)||(13522737-13522850)
chr5 (1-139)||(39799289-39799427)
chr5 (30-158)||(40228229-40228357)
chr5 (71-158)||(1914987-1915073)
chr5 (71-158)||(40033248-40033334)
chr5 (71-185)||(20168559-20168672)
chr5 (1-250)||(20567283-20567537)
chr5 (71-186)||(11208490-11208604)
chr5 (71-158)||(20215597-20215683)
chr5 (87-158)||(23477945-23478015)
chr5 (71-158)||(25112358-25112444)
chr5 (71-158)||(25171449-25171535)
chr5 (71-158)||(36096144-36096230)
chr5 (71-158)||(36097601-36097687)
chr5 (211-313)||(13736698-13736795)
chr5 (71-185)||(35543621-35543733)
chr5 (71-155)||(13533494-13533577)
chr5 (87-158)||(13403802-13403872)
chr5 (63-174)||(22586458-22586567)
chr5 (30-158)||(32753627-32753750)
chr5 (71-155)||(20417397-20417479)
chr5 (178-248)||(6498745-6498815)
chr5 (12-110)||(26055951-26056048)
chr5 (71-144)||(20625259-20625331)
chr5 (202-287)||(26766450-26766534)
chr5 (71-155)||(106613-106695)
chr5 (71-186)||(39352981-39353094)
chr5 (71-186)||(39364974-39365087)
chr5 (71-186)||(40390850-40390963)
chr5 (71-186)||(40401512-40401625)
chr5 (153-231)||(25740633-25740711)
chr5 (5-57)||(30608560-30608612)
chr5 (71-158)||(7031808-7031893)
chr5 (202-249)||(20968719-20968766)
chr5 (71-186)||(22676609-22676723)
chr5 (71-186)||(22686500-22686614)
chr5 (78-158)||(37407148-37407226)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-313)||(14536-14845)
[»] chr6 (117 HSPs)
chr6 (1-313)||(19085576-19085887)
chr6 (1-313)||(7763071-7763381)
chr6 (1-313)||(24116245-24116557)
chr6 (1-290)||(19623418-19623708)
chr6 (1-313)||(12715843-12716153)
chr6 (1-313)||(9717262-9717569)
chr6 (1-313)||(19470085-19470394)
chr6 (1-284)||(20731127-20731410)
chr6 (1-313)||(14100859-14101169)
chr6 (4-287)||(19066443-19066727)
chr6 (3-313)||(18434956-18435265)
chr6 (1-313)||(21624510-21624816)
chr6 (1-287)||(19951994-19952279)
chr6 (3-313)||(13601585-13601893)
chr6 (1-313)||(26941854-26942164)
chr6 (1-249)||(29597554-29597801)
chr6 (1-284)||(32543708-32543991)
chr6 (1-313)||(16876322-16876631)
chr6 (1-287)||(15532048-15532334)
chr6 (1-313)||(19688202-19688506)
chr6 (1-313)||(12422683-12422989)
chr6 (45-313)||(15301633-15301899)
chr6 (1-290)||(16914864-16915153)
chr6 (1-287)||(22801580-22801866)
chr6 (1-313)||(19482171-19482480)
chr6 (30-313)||(33352679-33352957)
chr6 (1-313)||(12347510-12347817)
chr6 (6-313)||(26589017-26589321)
chr6 (1-287)||(21617686-21617971)
chr6 (1-310)||(25593490-25593796)
chr6 (1-313)||(29917445-29917743)
chr6 (1-313)||(17927210-17927518)
chr6 (1-313)||(25929896-25930204)
chr6 (1-313)||(19625228-19625537)
chr6 (6-287)||(17381017-17381298)
chr6 (1-313)||(25592040-25592346)
chr6 (10-284)||(15954141-15954414)
chr6 (101-313)||(15986772-15986980)
chr6 (50-313)||(21234578-21234834)
chr6 (1-249)||(17446076-17446322)
chr6 (1-171)||(20113119-20113288)
chr6 (1-155)||(16265573-16265727)
chr6 (1-186)||(22076828-22077013)
chr6 (1-174)||(7811569-7811740)
chr6 (1-157)||(17316946-17317103)
chr6 (1-171)||(23296283-23296453)
chr6 (1-174)||(21034545-21034716)
chr6 (1-249)||(24719162-24719406)
chr6 (109-283)||(17303803-17303976)
chr6 (1-249)||(24728944-24729191)
chr6 (107-313)||(18377861-18378062)
chr6 (1-134)||(15395108-15395241)
chr6 (3-249)||(16463076-16463322)
chr6 (1-174)||(23230745-23230916)
chr6 (145-313)||(13435303-13435465)
chr6 (14-158)||(18172663-18172806)
chr6 (35-157)||(10631673-10631796)
chr6 (1-156)||(19875408-19875562)
chr6 (1-249)||(32335318-32335564)
chr6 (134-287)||(19833533-19833686)
chr6 (71-245)||(14070562-14070734)
chr6 (48-158)||(18226995-18227104)
chr6 (1-117)||(10704957-10705071)
chr6 (6-186)||(26185263-26185439)
chr6 (71-245)||(14051881-14052053)
chr6 (204-313)||(16528729-16528836)
chr6 (71-158)||(11235223-11235309)
chr6 (211-313)||(20113268-20113368)
chr6 (71-158)||(21127804-21127890)
chr6 (172-290)||(14732709-14732826)
chr6 (5-174)||(25595733-25595899)
chr6 (178-287)||(17317094-17317203)
chr6 (30-158)||(20635295-20635423)
chr6 (178-313)||(10631553-10631682)
chr6 (71-158)||(11205670-11205756)
chr6 (71-158)||(22386378-22386464)
chr6 (71-186)||(31931120-31931233)
chr6 (71-185)||(18554968-18555080)
chr6 (5-110)||(15551607-15551712)
chr6 (71-155)||(25518416-25518499)
chr6 (1-72)||(13144662-13144733)
chr6 (71-158)||(17608796-17608882)
chr6 (6-113)||(31127736-31127842)
chr6 (87-157)||(19453027-19453096)
chr6 (89-186)||(17047256-17047352)
chr6 (71-156)||(19289766-19289850)
chr6 (71-158)||(7586646-7586732)
chr6 (87-186)||(17063897-17063994)
chr6 (30-108)||(24398393-24398471)
chr6 (30-175)||(25735904-25736044)
chr6 (5-174)||(15478209-15478374)
chr6 (30-185)||(12953478-12953628)
chr6 (71-155)||(17742088-17742171)
chr6 (30-186)||(25687096-25687247)
chr6 (71-155)||(9934057-9934139)
chr6 (30-158)||(14923662-14923788)
chr6 (1-61)||(19833453-19833513)
chr6 (211-287)||(22077008-22077083)
chr6 (78-158)||(22308515-22308593)
chr6 (254-313)||(3680531-3680588)
chr6 (1-49)||(17867272-17867320)
chr6 (1-49)||(17877055-17877103)
chr6 (211-283)||(23296231-23296303)
chr6 (87-158)||(16123935-16124005)
chr6 (30-110)||(18926110-18926187)
chr6 (103-142)||(14883505-14883544)
chr6 (202-249)||(23006626-23006673)
chr6 (202-249)||(23781693-23781740)
chr6 (87-157)||(32757126-32757194)
chr6 (71-144)||(17746168-17746240)
chr6 (71-144)||(29765276-29765347)
chr6 (71-144)||(31572155-31572226)
chr6 (71-143)||(5844827-5844898)
chr6 (71-143)||(18826623-18826693)
chr6 (71-143)||(18835018-18835088)
chr6 (71-111)||(31543280-31543320)
chr6 (78-158)||(33199055-33199133)
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (1-313)||(11915113-11915423)
chr4 (1-313)||(15014775-15015085)
chr4 (1-313)||(14605294-14605603)
chr4 (1-313)||(23749936-23750245)
chr4 (1-313)||(17399064-17399372)
chr4 (2-313)||(22675913-22676220)
chr4 (2-306)||(37986001-37986303)
chr4 (1-313)||(45832800-45833106)
chr4 (1-287)||(22190280-22190567)
chr4 (1-313)||(6641096-6641406)
chr4 (1-285)||(29120802-29121086)
chr4 (61-313)||(55379722-55379971)
chr4 (1-287)||(56034007-56034292)
chr4 (1-313)||(16631853-16632163)
chr4 (1-313)||(54679341-54679649)
chr4 (1-313)||(3105809-3106116)
chr4 (1-313)||(11900603-11900912)
chr4 (1-313)||(8685831-8686142)
chr4 (1-287)||(10072368-10072654)
chr4 (1-312)||(12600173-12600480)
chr4 (1-287)||(20976892-20977180)
chr4 (1-284)||(37435936-37436211)
chr4 (1-313)||(16852917-16853225)
chr4 (1-290)||(19912268-19912557)
chr4 (1-313)||(6516901-6517207)
chr4 (3-287)||(13576508-13576792)
chr4 (1-313)||(56533450-56533759)
chr4 (1-286)||(14154383-14154669)
chr4 (1-312)||(3500043-3500348)
chr4 (4-287)||(27189033-27189320)
chr4 (1-287)||(19665801-19666092)
chr4 (1-313)||(15475533-15475841)
chr4 (1-310)||(17788427-17788736)
chr4 (1-283)||(17539840-17540121)
chr4 (1-313)||(55731261-55731567)
chr4 (1-287)||(9751929-9752216)
chr4 (1-287)||(17701154-17701432)
chr4 (1-287)||(25651486-25651770)
chr4 (1-287)||(40860105-40860383)
chr4 (1-274)||(23122969-23123242)
chr4 (1-218)||(29680935-29681153)
chr4 (1-283)||(10661555-10661837)
chr4 (1-283)||(10875700-10875982)
chr4 (1-313)||(16847961-16848269)
chr4 (1-313)||(41115158-41115456)
chr4 (1-197)||(12811565-12811761)
chr4 (1-186)||(14904746-14904931)
chr4 (1-225)||(19621449-19621674)
chr4 (1-196)||(8105164-8105359)
chr4 (1-218)||(39420124-39420343)
chr4 (1-186)||(16939565-16939751)
chr4 (1-186)||(3395126-3395311)
chr4 (1-249)||(17057504-17057749)
chr4 (1-249)||(20571388-20571635)
chr4 (1-157)||(38513442-38513600)
chr4 (78-309)||(15135146-15135374)
chr4 (2-157)||(19884267-19884422)
chr4 (1-158)||(14902836-14902992)
chr4 (3-249)||(13890305-13890551)
chr4 (145-313)||(16939414-16939576)
chr4 (104-313)||(19610827-19611031)
chr4 (1-141)||(2651396-2651534)
chr4 (1-153)||(18773627-18773780)
chr4 (1-110)||(16324904-16325013)
chr4 (55-249)||(19889427-19889620)
chr4 (3-134)||(13027369-13027500)
chr4 (1-248)||(21350589-21350836)
chr4 (1-133)||(36470418-36470541)
chr4 (178-313)||(19884146-19884276)
chr4 (202-313)||(8103698-8103806)
chr4 (71-187)||(17994196-17994311)
chr4 (71-158)||(1671953-1672039)
chr4 (211-313)||(3395062-3395161)
chr4 (146-313)||(16475912-16476077)
chr4 (71-158)||(19241817-19241903)
chr4 (71-185)||(16819754-16819867)
chr4 (71-156)||(18007464-18007548)
chr4 (178-287)||(38513342-38513451)
chr4 (71-158)||(36210514-36210600)
chr4 (71-185)||(23508884-23508996)
chr4 (30-158)||(18775019-18775144)
chr4 (78-158)||(14711189-14711268)
chr4 (78-158)||(14778853-14778932)
chr4 (30-158)||(33377978-33378107)
chr4 (147-276)||(10249380-10249509)
chr4 (30-186)||(55651090-55651241)
chr4 (71-157)||(8997659-8997743)
chr4 (1-110)||(20576902-20577011)
chr4 (1-174)||(13693360-13693520)
chr4 (89-155)||(18775816-18775881)
chr4 (5-110)||(17526777-17526880)
chr4 (5-110)||(18473643-18473748)
chr4 (213-312)||(14904898-14904992)
chr4 (71-155)||(49002360-49002442)
chr4 (1-76)||(10249510-10249584)
chr4 (4-110)||(18394154-18394259)
chr4 (71-186)||(4948105-4948218)
chr4 (11-110)||(7222121-7222219)
chr4 (238-287)||(39420332-39420381)
chr4 (87-158)||(3390250-3390320)
chr4 (71-186)||(24028464-24028577)
chr4 (1-43)||(55379971-55380013)
chr4 (71-144)||(11535653-11535725)
chr4 (71-144)||(31267171-31267243)
chr4 (145-245)||(17538814-17538914)
chr4 (78-186)||(19955348-19955454)
chr4 (238-313)||(29681142-29681215)
chr4 (87-158)||(3370510-3370580)
chr4 (71-158)||(5873166-5873251)
chr4 (202-249)||(16325089-16325136)
chr4 (71-158)||(17917848-17917933)
chr4 (71-186)||(17928468-17928581)
chr4 (87-144)||(10300343-10300399)
chr4 (71-144)||(11514843-11514915)
chr4 (78-143)||(24713240-24713304)
chr4 (269-313)||(36470382-36470424)
chr4 (71-144)||(39532175-39532247)
chr4 (30-62)||(14357508-14357540)
chr4 (78-158)||(19944713-19944791)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-313)||(9376-9684)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-313)||(74001-74310)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (1-313)||(19851-20162)
scaffold0035 (1-282)||(29242-29522)
scaffold0035 (1-186)||(99590-99776)
scaffold0035 (145-287)||(99795-99936)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (1-313)||(37-343)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-246)||(7308-7554)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (1-313)||(219658-219967)
scaffold0004 (1-313)||(210820-211127)
scaffold0004 (1-313)||(244664-244973)
scaffold0004 (59-313)||(377987-378239)
scaffold0004 (1-245)||(87890-88132)
scaffold0004 (1-40)||(377945-377984)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (1-313)||(9324-9635)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (1-287)||(18472-18757)
scaffold0217 (1-287)||(22514-22799)
[»] scaffold0084 (5 HSPs)
scaffold0084 (1-313)||(48751-49061)
scaffold0084 (71-278)||(839-1045)
scaffold0084 (44-186)||(32069-32207)
scaffold0084 (206-313)||(32005-32109)
scaffold0084 (71-140)||(57196-57264)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-313)||(211775-212084)
scaffold0005 (78-158)||(60798-60877)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-313)||(6074-6381)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (1-290)||(1099-1387)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (1-313)||(65789-66096)
scaffold0011 (1-313)||(144834-145141)
scaffold0011 (1-244)||(59046-59287)
scaffold0011 (106-245)||(165118-165256)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (1-313)||(740-1046)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-287)||(87984-88271)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-313)||(7343-7655)
scaffold0026 (1-186)||(59559-59745)
scaffold0026 (211-313)||(59498-59594)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (2-313)||(102989-103298)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (1-313)||(1039-1348)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (1-313)||(7124-7433)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (1-313)||(10491-10800)
scaffold0161 (1-313)||(15155-15464)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-287)||(1204-1491)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-313)||(27814-28119)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-313)||(2650-2953)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-313)||(83812-84120)
scaffold0009 (1-313)||(268201-268509)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-313)||(144324-144635)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-313)||(90440-90747)
scaffold0003 (1-313)||(134-429)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-313)||(9383-9696)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (30-313)||(7243-7521)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (1-313)||(365-671)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (1-287)||(26051-26339)
scaffold0056 (1-173)||(35188-35361)
scaffold0056 (1-95)||(36565-36659)
scaffold0056 (211-287)||(35339-35416)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (1-312)||(80815-81125)
scaffold0028 (1-173)||(5985-6157)
scaffold0028 (167-287)||(24328-24447)
scaffold0028 (147-187)||(24368-24408)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-283)||(8602-8883)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (1-307)||(158535-158838)
scaffold0022 (1-218)||(36910-37128)
scaffold0022 (1-218)||(134970-135188)
scaffold0022 (238-313)||(36848-36921)
scaffold0022 (238-313)||(134908-134981)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (1-285)||(11639-11925)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-313)||(18149-18457)
[»] scaffold0007 (6 HSPs)
scaffold0007 (1-287)||(142537-142823)
scaffold0007 (7-186)||(63912-64091)
scaffold0007 (145-313)||(46084-46249)
scaffold0007 (7-186)||(46238-46417)
scaffold0007 (145-306)||(63765-63923)
scaffold0007 (71-156)||(59705-59788)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-313)||(19006-19314)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-310)||(32169-32475)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (30-312)||(78768-79048)
scaffold0043 (1-72)||(2209-2280)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-287)||(163-451)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (1-275)||(5635-5910)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (1-275)||(5645-5920)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (1-313)||(2401-2709)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (1-313)||(13462-13771)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (38-286)||(360-609)
scaffold0205 (30-141)||(248-359)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (1-217)||(21359-21574)
scaffold0116 (1-313)||(2357-2665)
scaffold0116 (178-307)||(21565-21694)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (35-313)||(16134-16407)
scaffold0247 (35-230)||(25794-25990)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (1-197)||(7-204)
scaffold0771 (30-158)||(5916-6044)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (1-246)||(656-900)
scaffold0498 (54-98)||(913-957)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-275)||(2175-2449)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-313)||(16511-16821)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (1-283)||(2106-2388)
scaffold0622 (6-174)||(3785-3951)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (1-217)||(2374-2586)
scaffold0530 (178-313)||(2577-2709)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (69-291)||(8073-8294)
scaffold0047 (5-52)||(9581-9628)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (1-186)||(13114-13300)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (62-313)||(1260-1507)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (1-206)||(37117-37320)
scaffold0120 (1-206)||(41685-41888)
scaffold0120 (230-311)||(37357-37436)
scaffold0120 (230-311)||(41569-41648)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (1-187)||(3113-3299)
scaffold0280 (211-313)||(3263-3359)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (1-166)||(5708-5874)
scaffold0069 (222-285)||(5874-5937)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (1-158)||(4394-4549)
scaffold0040 (1-170)||(1901-2060)
scaffold0040 (202-314)||(2643-2753)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (1-171)||(5189-5358)
scaffold0273 (34-249)||(22494-22706)
scaffold0273 (211-291)||(5129-5209)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (1-145)||(2890-3033)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-249)||(1261-1507)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (1-249)||(18677-18924)
[»] scaffold0607 (2 HSPs)
scaffold0607 (1-156)||(5579-5734)
scaffold0607 (238-313)||(5518-5588)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (2-126)||(7542-7666)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (178-313)||(44420-44554)
scaffold0064 (71-157)||(44343-44429)
scaffold0064 (1-43)||(44302-44344)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (194-313)||(1960-2077)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-249)||(19554-19801)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (178-313)||(25878-26011)
scaffold0163 (89-155)||(29233-29297)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (1-174)||(3829-4001)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (160-313)||(111193-111343)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (178-313)||(8078-8211)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (30-278)||(4308-4556)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (71-158)||(1454-1540)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (71-158)||(32565-32651)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (71-242)||(38536-38706)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-72)||(26357-26428)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (71-158)||(8068-8154)
scaffold0012 (71-155)||(16365-16448)
scaffold0012 (71-158)||(127404-127489)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (30-158)||(10295-10423)
scaffold0207 (91-158)||(20196-20262)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (71-158)||(4691-4777)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (71-158)||(474-560)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (7-117)||(31349-31460)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (71-158)||(35220-35306)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (71-158)||(61306-61392)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (71-158)||(475703-475789)
scaffold0002 (71-158)||(482223-482309)
scaffold0002 (71-142)||(157078-157149)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (71-185)||(10205-10317)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (5-158)||(7666-7815)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (71-185)||(29212-29324)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (30-158)||(6855-6983)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (78-158)||(2272-2351)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (87-158)||(1596-1666)
[»] scaffold1107 (1 HSPs)
scaffold1107 (5-104)||(2702-2800)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (71-158)||(961-1047)
scaffold0752 (71-158)||(1576-1662)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (71-158)||(2125-2211)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (71-158)||(11334-11420)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (71-158)||(402-488)
scaffold0090 (71-158)||(4782-4868)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (5-104)||(16762-16860)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (87-158)||(6921-6991)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (87-158)||(40779-40849)
scaffold0017 (87-158)||(59325-59395)
scaffold0017 (89-142)||(10113-10166)
[»] scaffold2071 (1 HSPs)
scaffold2071 (87-185)||(901-997)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (87-185)||(58065-58161)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (87-156)||(1403-1471)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (30-158)||(1751-1874)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (87-196)||(76748-76856)
scaffold0037 (202-283)||(76691-76772)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (30-110)||(9-89)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (78-158)||(9544-9623)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (1-81)||(22310-22390)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (91-158)||(936-1002)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (30-158)||(2655-2783)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (30-158)||(20783-20911)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (30-155)||(35298-35418)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (229-313)||(5634-5717)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (71-175)||(38412-38514)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (6-174)||(9417-9577)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (71-144)||(5066-5138)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (78-142)||(15500-15563)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (234-313)||(13801-13878)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (87-186)||(40231-40328)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (71-144)||(10701-10773)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (30-110)||(37109-37186)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (261-309)||(12268-12315)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 114)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19540139 - 19539830
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  19540139 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatc 19540040  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  19540039 aagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 19539940  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19539939 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 19539842  T
Q  301 atccttggaagt 312  Q
     |||||||||||    
T  19539841 ctccttggaagt 19539830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24376828 - 24376519
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  24376828 agttcacttaaaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 24376729  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||    
T  24376728 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tataagtctcttgattgtgttcagga 24376631  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24376630 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagaagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaact 24376532  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||| ||||||    
T  24376531 ctccttagaagtg 24376519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 28140979 - 28141289
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  28140979 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatacattagaaattctagagtattaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 28141078  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28141079 aaatgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattaaaagtctcttggttgtgttcaaga 28141178  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28141179 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagt-atttgaagtctcttgctagttttagcagtgagtagttgtgatcagatattaca-tttttagtgaact 28141276  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  28141277 ctccttggaagtg 28141289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25189121 - 25188812
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  25189121 agttcacttagaatttcttatcaaagtttatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgttttgtgaacaccactgattgtatatc 25189022  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  25189021 tagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttaattgtgttcagga 25188923  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  25188922 gcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgaatagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtaaact 25188825  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  25188824 ctccttggaagtg 25188812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Original strand, 30557701 - 30558009
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  30557701 ttcacttagaatttcttctcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtggacaccactgattgtatatcaa 30557800  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||     
T  30557801 gtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggag 30557899  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  30557900 cataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaactgtaatcagatattac--tttttagtgaactc 30557997  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  30557998 tccttggaagtg 30558009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 39038019 - 39038328
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  39038019 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttatgagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 39038118  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||| ||    
T  39038119 aagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattatgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataacaagtctattgattgtgttcagga 39038217  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39038218 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagtttaagcaatgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 39038315  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  39038316 ctccttggaagtg 39038328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18702463 - 18702153
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18702463 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 18702364  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||   ||||||||| |||  ||||  ||    
T  18702363 aagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttatgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttga 18702265  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18702264 gcacaagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-tttttagtgaact 18702166  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  18702165 ctccttggaagtg 18702153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24779097 - 24778785
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  24779097 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatc 24778998  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||     
T  24778997 atgtgttcaacctcaaacaattttctatgtaattctgtttgaattttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcatgattgtgttcag 24778898  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24778897 gagcataggaaatctattgcagctgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaaatttagcagtgaacagtcgtaatcagatattaca--ttttagtgaa 24778800  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || |||||| |||||    
T  24778799 ctctccttgaaagtg 24778785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24575758 - 24575448
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  24575758 agttcacttaaaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagattcttaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 24575659  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  24575658 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 24575559  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24575558 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 24575462  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  24575461 tctccttggaagtg 24575448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 22786033 - 22786320
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22786033 agttcagttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22786132  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  22786133 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 22786232  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22786233 agcataggaagtctcttacagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 22786320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 24851043 - 24851350
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| | ||||||    
T  24851043 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaag--tctgtatcttatttgtattgtgaacaccattgagtatatatc 24851140  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  24851141 aagtgttcaacctcaaacaattttccttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 24851239  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24851240 gcataggaaatctcttgcagttatgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 24851337  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  24851338 ctccttggaagtg 24851350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 10010128 - 10010439
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10010128 agttcacttagaatttattatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcgtaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 10010227  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  10010228 aagtgttcaacctcaaatatttttctgtgtaattctgtttgaatttagaaatctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 10010327  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10010328 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttga-acatttgaagtctcttgctagttttagcagtgggcagttgtaatcaaatattaca-tttttagtgaac 10010425  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | |||||| |||||    
T  10010426 tctccttgaaagtg 10010439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22317313 - 22317027
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  22317313 agttcacttagaatttcttatcaaagtccatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaaaaccactgattgtatatc 22317214  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  22317213 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 22317115  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22317114 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatctgaagtcacttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagattttacat 22317027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 22188481 - 22188789
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22188481 agttcacttagaatttcttatcaacgttcaaatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22188580  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattag-aagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  22188581 aagtgttcaacctcaaacattttgctttataattatgtttgaatttgtaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagc 22188680  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  22188681 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtttcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 22188775  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  22188776 tctccttggaagtg 22188789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 23184680 - 23184989
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  23184680 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatctaagaaattctagagtcttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatc 23184779  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  23184780 aagtgttcaacctcaaataattttcttttgaattctttttgaa-tagaagtctcttgcagttgtccttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 23184878  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23184879 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagtttgagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 23184976  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  23184977 ctccttgaaagtg 23184989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 23595943 - 23596252
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  23595943 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatctaagaaattctagagtcttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatc 23596042  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  23596043 aagtgttcaacctcaaataattttcttttgaattctttttgaa-tagaagtctcttgcagttgtccttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 23596141  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23596142 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagtttgagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 23596239  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  23596240 ctccttgaaagtg 23596252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 31801266 - 31801575
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  31801266 agttcacttagaatttcttatcaaaactcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 31801365  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    ||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||| |    
T  31801366 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattcataagtctcttcaaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgactgtgttcagg 31801464  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31801465 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac--tttttagtgaac 31801561  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | || |||||||||    
T  31801562 tctctttggaagtg 31801575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 20152379 - 20152688
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  20152379 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 20152478  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20152479 aagtgttcaacatcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttaattgtgttcagg 20152577  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagt--gagcaattgtaatcagatattacattttttagtga 297  Q
    | ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||     ||||||    
T  20152578 agcatagtaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactagttttagcagtgagagtaattgtaatcagatattaca-----tagtga 20152672  T
Q  298 actatccttggaagtg 313  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20152673 actctccttggaagtg 20152688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22257922 - 22257614
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  22257922 ttcacttagaatttcttatcaaagtttatatataagaaattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 22257823  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||     
T  22257822 gtgttcgacctcaaacaattttctttgacattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagatgtctcttgattgtgttcaggag 22257723  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||     
T  22257722 cataggaagtctcttgcagttgggcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattaca--ttttagtgaactc 22257626  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  22257625 tccttggaagtg 22257614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 17963645 - 17963947
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  17963645 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttaaaaattttagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat- 17963743  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  17963744 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattataagtcttttgattgtgttcaag 17963843  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  17963844 agcacaggaaatctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattaca--ttttagtgaac 17963940  T
Q  300 tatcctt 306  Q
    | |||||    
T  17963941 tttcctt 17963947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 22781993 - 22782280
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22781993 agttcacttataatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatc 22782092  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  22782093 atgtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 22782192  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782193 agcataggaagtctgttgcagttatgcttgagcaatttgaagtctcttactaagttttgtagtgagcatttgtaatcagatattacat 22782280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38781118 - 38780832
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  38781118 agttcacttagaatttcttatcaacttttatatattagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 38781019  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  38781018 aagtgttcaacctcaaacctttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 38780919  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38780918 agcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctgttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 38780832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40782200 - 40781910
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  40782200 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagttttaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacactagtgattgtatat 40782101  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  40782100 caagtgttcaacctcaaataattttttgtgtaattctgtttgaattcataagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcag 40782001  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40782000 gagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgag-cattggaagtctcttgctagttttaggagtgagcagttgtaatcagatattacatttt 40781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 20569127 - 20569437
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  20569127 agttcacttagaatttcttaacaactttcagatcttagaaattctagagtcttaaaagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 20569226  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  20569227 aagtgttcagcctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcctgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 20569326  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20569327 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgaccagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 20569423  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  20569424 tctccttggaagtg 20569437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44840155 - 44839868
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  44840155 agttcacttagaatttcttaacaagacttatatcttaggaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 44840056  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  44840055 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtttcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 44839956  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44839955 agcataggaagtctcttgcagttgtacttgaacaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 44839868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22271854 - 22271544
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22271854 agttcacatagaatttcttatcaaagttcatatcttaggaattctagagtgttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22271755  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||| | ||||||||| |||  ||||  ||    
T  22271754 aagtgttcaacctcaaacatatttatatgtaattctgtttgaa-tataagtctcttgcagttatgcttgggcataagaagtctcttgatttagttcttga 22271656  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22271655 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaataagatattacactttttagtgaact 22271556  T
Q  301 atccttggaagt 312  Q
     ||||| |||||    
T  22271555 ctcctttgaagt 22271544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 28551297 - 28551584
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  28551297 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtttgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 28551396  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  28551397 aagtgttcaacttcaaaaaattatctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 28551496  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28551497 agcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgcaatcagatattacat 28551584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33073948 - 33073663
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  33073948 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccattgattgtatatc 33073849  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| || |||||||||| |    
T  33073848 aagtgttaaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgttcagg 33073750  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073749 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgag-catttaaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacat 33073663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 13964357 - 13964639
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  13964357 agttaacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatc 13964456  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  13964457 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttaagca-tagaagtctcttgattgtgttcagg 13964555  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964556 agcataggaagtctcttgcagttgcgcttgag-catttgaagtctctt---agttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 13964639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23234727 - 23234444
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  23234727 ttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagacttaagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccactgattgtatatcaa 23234628  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||     
T  23234627 gtgttcaacctcaaacttttttctttgtaattctgtttgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tagaagtctcttgattgtgttcaggag 23234529  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23234528 cataagaagtctcttgcagttgtgcttaag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaattagatattacat 23234444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24843927 - 24843618
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  24843927 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagactcttaagagtctgtatctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatat 24843828  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||  |    
T  24843827 caagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgccgttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcttg 24843729  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||| |||||     |||||||||||    
T  24843728 agcataagaaatctcttgcagttgtgcttgattagtttgaagtctcttgctattttgagcagtgagcatttgtaatcaaatatt---gattttagtgaac 24843632  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  24843631 tctccttggaagtg 24843618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 18431315 - 18431625
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  18431315 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 18431414  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||       
T  18431415 caagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctgttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttctta 18431513  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18431514 agcatagaaaatctcttgcagttgtacttgagtagtttgaagtctcttgctagttttaacagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 18431611  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | || |||||||||    
T  18431612 tctcattggaagtg 18431625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 25037639 - 25037948
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  25037639 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattataaagtcttaagagtatgtatctgatttgaattgtgaacaccactgattgtatatc 25037738  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  25037739 -agtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgaccattagaagtcacttgattatgttcaag 25037837  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25037838 agcataggaagactcttgcagttgtgcttgag-cacttgaagtctcttgcttgttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 25037934  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  25037935 tctccttggaagtg 25037948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 34322314 - 34322597
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||    
T  34322314 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacagcaccgattgtatatc 34322413  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  | | ||||||| |||||||||| |    
T  34322414 aagtgttcaacctcaaacatttttgt-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagca--ataggtctcttgattgtgttcagg 34322510  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34322511 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttga-acatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacat 34322597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 1587411 - 1587696
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||    
T  1587411 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctttagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacacccttgattgtatatc 1587510  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  1587511 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctatttaaattaagaagtctcttgcagttgtgtttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 1587609  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1587610 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-gatttgaagtctcttactaagtttagtagtgaacaattgtaatcagatattacat 1587696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40331789 - 40331523
Alignment:
Q  43 tctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  40331789 tctagagtctttagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtttga 40331690  T
Q  143 atta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaag 241  Q
    |||| ||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40331689 attaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 40331590  T
Q  242 tctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  40331589 tctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 40331523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 285
Target Start/End: Original strand, 45087414 - 45087645
Alignment:
Q  55 agagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtct 153  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45087414 agagtctatatctgatttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtct 45087513  T
Q  154 cttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaag 253  Q
     ||||  ||||| || |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  45087514 attgcatttgtgcttaagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttgctgttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaag 45087613  T
Q  254 tttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  45087614 tttagtagtgagcatttgtaatcagatattac 45087645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Original strand, 31328342 - 31328649
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  31328342 gttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagactctttagagtctgtatctgaattgtattgtgaacaccactgattgtatatca 31328441  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| | ||    
T  31328442 agtgttcaaactcaaac-ataatctttgtaattctgttttaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttagga 31328540  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  31328541 gcataggaagtctcttgcagttgtgattgag-catttgaagtctcgtactaagtttagtattgaacaattgtaatcagatatta---tttttagtgaact 31328636  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
       ||||||||||    
T  31328637 tctcttggaagtg 31328649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Original strand, 31335063 - 31335370
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  31335063 gttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagactctttagagtctgtatctgaattgtattgtgaacaccactgattgtatatca 31335162  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| | ||    
T  31335163 agtgttcaaactcaaac-ataatctttgtaattctgttttaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttagga 31335261  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  31335262 gcataggaagtctcttgcagttgtgattgag-catttgaagtctcgtactaagtttagtattgaacaattgtaatcagatatta---tttttagtgaact 31335357  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
       ||||||||||    
T  31335358 tctcttggaagtg 31335370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14581280 - 14581000
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14581280 agttcacttagaatttcttaacaaaacttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14581181  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||   |||||| || ||||||||| ||||| |||| |    
T  14581180 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtcttttgcatttgtacatgagcaatagaagtctcttgattgtattcagg 14581081  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||       ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14581080 agcataggaagtatcttgcagttgtggttgaacaatttgaagtct-------agtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 14581000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 28712077 - 28712384
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  28712077 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcgtagaaattctagtgtctttaatgtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactcattgtatatc 28712176  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  28712177 aaatgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaaaaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 28712276  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||    
T  28712277 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttga-acatttgaagtctcgtactaagtttagtagtgagcaattgtaataagatattaca-----tagtgaac 28712370  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  28712371 tctccttggaagtg 28712384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 21537629 - 21537838
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  21537629 agttgacttagaatttcttatcaaagttcatatcttaaaaattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatc 21537728  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  21537729 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagca-taaaagtctcttgattgtgttcagga 21537826  T
Q  201 acataggaaatc 212  Q
      ||||||||||    
T  21537827 gaataggaaatc 21537838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 28701591 - 28701877
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  28701591 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctaaggtctttagagtctgtatctaatttatattgtgaacaccactcattgtatatc 28701690  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  28701691 aagtgttcaaccttaaacatttttctttctaattctgattgaattaagaattctcttgtaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 28701790  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28701791 agcataggaagtctcttgcagttgttcttgag-aatttgaagtttcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacat 28701877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 26619478 - 26619709
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  26619478 agttcacatagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 26619577  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||  ||    
T  26619578 aagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgatttagttcttga 26619676  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagta 233  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26619677 gcataggaaatatcttgcagttgtgcttgagta 26619709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6392351 - 6392139
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  6392351 acttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatttagtg 6392252  T
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacat 204  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||    
T  6392251 ttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcat 6392153  T
Q  205 aggaaatctcttgc 218  Q
    ||||| | ||||||    
T  6392152 aggaagtttcttgc 6392139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22455366 - 22455521
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  22455366 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaagaccactgattgtatatc 22455465  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22455466 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttg 22455521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22776615 - 22776801
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22776615 agttcacttataatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatc 22776714  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  22776715 atgtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctctt 22776801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22802182 - 22801906
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  22802182 gttcacttagaatttcttttcaaagctcatatcttagaaattctagagtct---------gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatca 22802092  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| | || ||||||||||||| |  ||| ||||||  |||   ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||    
T  22802091 agtgttcaaactcaaaca-tattctttatagttctgtttgaattcattagtatcttgcatttgcacttgaggaataaaagtctcttgattgtgttcagga 22801993  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22801992 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 22801906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 10898901 - 10899140
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgta-tcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  10898901 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttggaaattttagagttttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatat 10898999  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||        ||||||||| ||| |||||  |    
T  10899000 caagtgttcaacctcaaac-attttctttataattttgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttg-------gaagtctcttgattttgttcttg 10899090  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10899091 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 10899140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16494974 - 16494783
Alignment:
Q  96 atatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||    
T  16494974 atatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctgttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 16494875  T
Q  195 tcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca 286  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16494874 tcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtcttttactaagtttagtagtgagcatttgcaatcagatattaca 16494783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 6574506 - 6574662
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  6574506 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttataaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 6574605  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6574606 aagtgttcaacctcaaacacttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttg 6574662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44880890 - 44880728
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  44880890 agttcactttgaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccactgattgcatatc 44880791  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgt 164  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44880790 aagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgt 44880728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 41122094 - 41122249
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  41122094 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattataaagtcttaagagtatgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatc 41122193  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41122194 aagcgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttg 41122249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40331387 - 40331201
Alignment:
Q  123 ttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagt 221  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  40331387 ttctttgtaattatgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcatgagcataggaagtctcttgcagt 40331288  T
Q  222 tgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  40331287 tgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 40331201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19114806 - 19114634
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  19114806 agttcacttataatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatcttatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 19114707  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||| |||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19114706 aagcgttcaacctcaaccatatttctttataattctgtttgaa-tagaagtctctttcagttgtgcttgagcat 19114634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 313
Target Start/End: Original strand, 35744410 - 35744662
Alignment:
Q  55 agagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtct 153  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35744410 agagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttcgacctcaaacatttttct-tgtaattctctttgaattgagaagtct 35744508  T
Q  154 cttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaag 253  Q
    ||| | |||||| || | || || ||||||||| |||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||| | |||    
T  35744509 ctttcagttgtgcttaaacaatagaagtctcttgattgtgtttatgagcatagaaagtctttggcagttgtgtttgag-catttgaagtctcttactaag 35744607  T
Q  254 tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  35744608 tttagtatcgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 35744662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25828854 - 25828697
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |    
T  25828854 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattccatggttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatagc 25828755  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttg 157  Q
    || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25828754 aaatgttcaacctccaacatctttctgtgtaattctgtttgaatttggaagtctcttg 25828697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Original strand, 41122240 - 41122373
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  41122240 aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatatcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttaacagtgagcaattgtaatca 41122339  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  41122340 gatattaca--ttttagtgaactctccttgaaagtg 41122373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Original strand, 26366845 - 26366967
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  26366845 atatcttagaaattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacgccattgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttcttta 26366944  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtct 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  26366945 taattctgtttgaa-tagaagtct 26366967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22383204 - 22382956
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgta-tcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| | |||| ||  |||||| ||||||    
T  22383204 agttcacttagaatttcctaactactttcatatcttagtaattatagagtcttaagagtctat-tttgatttgtatttgtgaacaacactgatagtatat 22383106  T
Q  100 caagtgttcaa-cctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||   |||||||||   | ||| |      
T  22383105 caagtgttcaaccctcaaacaaatttttgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgtgtttgtgctt 22383007  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    || |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22383006 gagcataggaaacgtcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 22382956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Original strand, 26366962 - 26367095
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    |||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||| |    
T  26366962 aagtcttttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgaacagttgtaataa 26367061  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26367062 gatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 26367095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 310
Target Start/End: Original strand, 22455512 - 22455643
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgca-gttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatc 276  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  22455512 aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcaagttgtgcttgggtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatc 22455611  T
Q  277 agatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  22455612 agatattaca--ttttagtgaactctccttggaa 22455643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25918435 - 25918265
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25918435 agttcacttagaatttcttaacaactttcatat-ttagaaattctagagtcttaagagtgtgtatttgatttttattgtgaacaccactgattgtatatc 25918337  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||| | ||||||   |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  25918336 aagtgttcaaac-caaacatccttctatgtaattttgttt-atttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 25918265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20567783 - 20567634
Alignment:
Q  98 atcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||| |     
T  20567783 atcaagtgttcaacctcaaaca-ttttctttgtaattttgtttgaat-agaagtctcttgtagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattttgtcct 20567686  T
Q  198 agaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20567685 tgagcatgggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgatgtctcttgc 20567634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 24441094 - 24441225
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24441094 agttcacttagaatttcttaagaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctacatctgatttgtgttatgaacaccactgattgtatatc 24441193  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaa 132  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  24441194 aagtgttcaatctcaaacatatttatgtgtaa 24441225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24157538 - 24157432
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  24157538 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 24157439  T
Q  101 aagtgtt 107  Q
    || ||||    
T  24157438 aaatgtt 24157432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27296957 - 27296853
Alignment:
Q  208 aaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  27296957 aaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatgagatattgca-tttttagtgaactctccttg 27296859  T
Q  308 gaagtg 313  Q
    ||||||    
T  27296858 gaagtg 27296853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25828706 - 25828574
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  25828706 aagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctcttgtagttgtgcttgagca-tttgaagtctattgctagttttagcagtgagcagttgtaatca 25828608  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  25828607 gatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 25828574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 174
Target Start/End: Original strand, 21911303 - 21911413
Alignment:
Q  63 tatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggtt 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21911303 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgggtatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttg-attagaagtctcttgctttt 21911401  T
Q  163 gtgtttgagcat 174  Q
    ||| ||||||||    
T  21911402 gtgcttgagcat 21911413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Original strand, 23393072 - 23393198
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23393072 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgt 23393171  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23393172 gtaattctgtttgaa-tagaagtctctt 23393198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 284
Target Start/End: Original strand, 6574653 - 6574759
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6574653 aagtctcttgattgtgttcagaagcataggaagtcttttgcagttgtgctttagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatca 6574752  T
Q  278 gatatta 284  Q
    |||||||    
T  6574753 gatatta 6574759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21845871 - 21845708
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21845871 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctaaagtct---------gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21845781  T
Q  101 aagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  21845780 aagtgttcaaacctcaaac-attttttgtgtaattgtgtttg-tttagaagtcttttgcttttgtgcttgagcat 21845708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19356194 - 19356042
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| |  |||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19356194 atatcttagaaattcttaagtct--agagtcttttactgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtg 19356098  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||    
T  19356097 taattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctt 19356042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 20647003 - 20647087
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctctt 156  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20647003 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctctt 20647087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1083710 - 1083495
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1083710 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctctcatttgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaaatgttcaaactcaaacaattttctgt 1083611  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||   |||||||||   || || |  || || ||||| ||||||||   |||||||    
T  1083610 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgctt 1083512  T
Q  229 gagtaatttgaagtctc 245  Q
    ||| |||||||||||||    
T  1083511 gagcaatttgaagtctc 1083495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 19300404 - 19300490
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19300404 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 19300490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 19498384 - 19498470
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19498384 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 19498470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 24801994 - 24802080
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24801994 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 24802080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 24814961 - 24815047
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24814961 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 24815047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 9015747 - 9015842
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgta 96  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  9015747 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagaatcttaagagtctgtatttgatttctattgtgaacaccactgattgta 9015842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 19313411 - 19313497
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19313411 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttg-attagaagtctcttgc 19313497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6392150 - 6392077
Alignment:
Q  238 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6392150 gaagtttcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac--tttttagtgaactctccttggaagtg 6392077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1089061 - 1088946
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1089061 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctctcatttgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgt 1088962  T
Q  129 gtaattctgtttgaat 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  1088961 gtaattctgtttgaat 1088946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22755125 - 22755039
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22755125 ttgtattgtgaacaccgctgattttatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctatttg-attagaagtctcttgc 22755039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Original strand, 14794242 - 14794346
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14794242 cacttagaatttcttaataactttcatatcttagaaactcgagagacttaagagtctg-atttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 14794340  T
Q  105 gttcaa 110  Q
     |||||    
T  14794341 tttcaa 14794346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22763528 - 22763405
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22763528 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtg 22763433  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  22763432 taattttgtttg-attggaagtctcttgc 22763405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22774232 - 22774109
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22774232 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtg 22774137  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  22774136 taattttgttt-aattggaagtctcttgc 22774109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 38033232 - 38033311
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38033232 gtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtttaattctatttg-attagaagtctcttgc 38033311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24838624 - 24838518
Alignment:
Q  204 taggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  || |||||||| |  |||||||||||||||     |||||||||||| ||    
T  24838624 taggaaatctcttgcagttgtgcttgagtattttgaagtctcttcctattttgagcagtgaactgttgtaatcagatatt---gattttagtgaactctc 24838528  T
Q  304 cttggaagtg 313  Q
    ||||||||||    
T  24838527 cttggaagtg 24838518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Original strand, 19320785 - 19320948
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||  | ||||||||||||||||    
T  19320785 cacttagaatttcttaacaactttcatattttagaaattct--agtcttaagagtctg-atttgatttgtattatgaacatcattgattgtatatcaagt 19320881  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||| | ||||||  ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  19320882 gttcaaac-caaacatatttctgtataatt-tatttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 19320948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 967858 - 967978
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  967858 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtg 967953  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  967954 taattttgtttg-attagaagcctct 967978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24274899 - 24274779
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  24274899 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-atattctgtg 24274804  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24274803 taattttgtttgaa-tagaagtctct 24274779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 17970662 - 17970744
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  17970662 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttg-attagaagcctct 17970744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Original strand, 15670998 - 15671097
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||| |   |||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15670998 acttagaatttcttaacaactttcatattttagta---ctagagtcttaagagtctgtttgt--tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtg 15671092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 7006199 - 7006312
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  7006199 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 7006296  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  7006297 gcattagaagtctctt 7006312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 24328126 - 24328239
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  24328126 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 24328223  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  24328224 gcattagaagtctctt 24328239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 24338796 - 24338909
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  24338796 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 24338893  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  24338894 gcattagaagtctctt 24338909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 313
Target Start/End: Original strand, 26623059 - 26623141
Alignment:
Q  230 agtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||| |||| |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  26623059 agtagtttggagtctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattgca-tttttaatgaactctccttggaagtg 26623141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 20567857 - 20567804
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctta 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  20567857 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttaaaaattttagagtctta 20567804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22683086 - 22682946
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || || || |||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||   ||| ||||    
T  22683086 atatcttagaaattctagagtcgtaagagattg-atttgttttgtattctgaacaccacttattgtatatcaagtgtttaaac-caaacttatttatgtg 22682989  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||||| ||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22682988 taatt-tgtttg-tttggaagtctcttgcttttgtgtttgagcat 22682946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26704217 - 26704177
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctct 185  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26704217 tagaagtctctttcggttgtgattgagcattaaaagtctct 26704177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Original strand, 27978774 - 27978845
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  27978774 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 27978845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Original strand, 28065303 - 28065374
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  28065303 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 28065374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1041985 - 1041872
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |  |||||| |||||||| |||| ||   |||| ||||    
T  1041985 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-tttttctgtgtattgttgtttg-attagaagcctctcgcctgtgtgcttga 1041888  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| ||| |||||    
T  1041887 gcattataagactctt 1041872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Original strand, 17857845 - 17857942
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||| |||||||||    
T  17857845 actgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 17857942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29244058 - 29243945
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  29244058 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 29243961  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  29243960 gcattagaagtctctt 29243945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29254637 - 29254524
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  29254637 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 29254540  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  29254539 gcattagaagtctctt 29254524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14866985 - 14866833
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc--gtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||| |||||||| |||  || | |||||||||||||   ||||||||||||||| | |||  ||||||   |||| |||  || ||||||||||||    
T  14866985 cacttaggatttcttatcaattttcacatcttagaaattcataagtcttaagagtctgaa-ctgtgttgtattttgtgaacacctctaattgtatatcaa 14866887  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaat-tctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  14866886 gtgttcaatc-caaacaattttctttgtaatctttgtttg--ttagaagtctcttgc 14866833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Original strand, 22525274 - 22525316
Alignment:
Q  70 tttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacc 112  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525274 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacc 22525316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Original strand, 40202837 - 40202879
Alignment:
Q  70 tttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacc 112  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40202837 tttgtattatgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacc 40202879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Original strand, 38586486 - 38586550
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  38586486 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 38586550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 119
Target Start/End: Original strand, 17969602 - 17969650
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaca 119  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17969602 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaaca 17969650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27939702 - 27939600
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||| |||||||||  ||  || ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||    
T  27939702 cacttataatttcttataaactttcatatcttagaaattcttaagtatta-gagtctgaa-ctgttttgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagt 27939605  T
Q  105 gttca 109  Q
    |||||    
T  27939604 gttca 27939600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44880731 - 44880688
Alignment:
Q  269 ttgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  44880731 ttgtaatcagatattacat-ttttagtgaactctcattggaagtg 44880688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 131)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 29935779 - 29936090
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29935779 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttcgaaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 29935878  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  29935879 aagtgttcaacctcaaacaattttctg-gtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttatgcttgagcattaaaagtctcttgattgtgctcagga 29935977  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29935978 gcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagacttttgctaagtttagcagtgagcaattgtaattagatattacattttttagtgaact 29936077  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  29936078 ctccttggaagtg 29936090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 13261048 - 13261359
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13261048 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtattcgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13261147  T
Q  101 aagtgttcaacct-caaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||| || |    
T  13261148 aagtgttcaacccgcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattaagagtcttttgattctgtccagg 13261247  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13261248 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttaacagtaagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 13261345  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  13261346 tctccttggaagtg 13261359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 13034272 - 13034581
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13034272 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattatggagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13034371  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||| ||    
T  13034372 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataataagtctcttgattctgttcagga 13034470  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13034471 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagaagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 13034568  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  13034569 ctccttggaagtg 13034581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 16316990 - 16317299
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||    
T  16316990 agttcacttagaatttcttatcaaagttcacatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttctattgtaaacaccactgattgtatatc 16317089  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  16317090 aagtgttcaatctcaaacaattttctatgtaattatgttcgaat-agtagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 16317188  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16317189 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaaa--ttttagtgaact 16317286  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  16317287 ctccttggaagtg 16317299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14187413 - 14187102
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14187413 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctatagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14187314  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||| |    
T  14187313 aagtgttcaacctcaaacaattttctatgcaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtatcttgattgtgttcagg 14187214  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14187213 agtataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaac 14187116  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  14187115 tctccttggaagtg 14187102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 16314973 - 16315283
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16314973 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 16315072  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | || |||||||||| |    
T  16315073 aagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtttattgattgtgttcagg 16315172  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||     
T  16315173 agcataggaagtctcttacagttgtacttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaattagatattac--tttttagtgaat 16315269  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  16315270 tctccttggaagtg 16315283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11792632 - 11792323
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |    
T  11792632 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatagcttagaaattctaaagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatacc 11792533  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  11792532 aagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattctatttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 11792434  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11792433 gcataggaagtctcttgcatttgttcttaagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcaatgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 11792336  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  11792335 ctccttggaagtg 11792323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27871440 - 27871153
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  27871440 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 27871341  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  27871340 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 27871241  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27871240 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 27871153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 2914044 - 2914354
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  2914044 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttacgagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 2914143  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||      
T  2914144 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgactgtgttcaga 2914243  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  2914244 agcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttatagtgaac 2914340  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | |||||| |||||    
T  2914341 tctccttgaaagtg 2914354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11319129 - 11318840
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  11319129 agttcacttagaattttttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 11319030  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattag-aagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11319029 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaaatctgtttgaatttgaaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaag 11318930  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11318929 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgttaagtttagcagtgaacatttgtaatcagatattacatttt 11318840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13302584 - 13302274
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13302584 agttcacttataatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13302485  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13302484 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 13302385  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  13302384 agcaaaggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagcctcttgctagttttagcagtcagcagttgtaataagatattaca--ttttagtgaac 13302288  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||||    
T  13302287 tatccttggaagtg 13302274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15088272 - 15087965
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15088272 agttcacttacaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatccgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 15088173  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  15088172 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttagg 15088073  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  15088072 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 15087979  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  15087978 tctccttggaagtg 15087965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 28622793 - 28623102
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  28622793 agttcacttagattttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaaaagtctgtaactgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 28622892  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  28622893 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtgtcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 28622992  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc-aaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||    
T  28622993 aacataggaagtctcttgcaattgtacttgagtaatttgaagtctcttgctagtttttagcagtgagcaattgtaattagatattaca-----tagtgaa 28623087  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  28623088 ctctccttggaagtg 28623102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 16310340 - 16310648
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | |||   ||||||||||||    
T  16310340 agttcacttagaatttcttatcaaagttcacatcttagaaattctagaatcttaagagtctatatctgatttgtattgtaaacacatttgattgtatatc 16310439  T
Q  101 aagtgt--tcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  16310440 aagtgtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtattcag 16310538  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16310539 gagcataagaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaa 16310636  T
Q  299 ctatccttggaa 310  Q
    || ||| |||||    
T  16310637 ctctccatggaa 16310648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 16557024 - 16557331
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16557024 agttcacttagtatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 16557123  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  16557124 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattcgaagtctcttgattgtgttcagg 16557223  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  16557224 agcataggaagtcttttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 16557317  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  16557318 tctccttggaagtg 16557331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16608638 - 16608331
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16608638 agttcacttagtatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 16608539  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  16608538 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattcgaagtctcttgattgtgttcagg 16608439  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  16608438 agcataggaagtcttttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 16608345  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  16608344 tctccttggaagtg 16608331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 5001258 - 5001570
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  || ||  |||||||||    
T  5001258 agttcactttgaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtaaataccacaaattgtatat 5001357  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||     
T  5001358 taactgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagtattagaagtctcttgattgtgttcag 5001457  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5001458 gagtatgggaaatctcttgcagttgtgcttgtgtaatttgaagtctcttgataagtttagcagtgagtagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaa 5001555  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  5001556 ctctccttggaagtg 5001570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4494300 - 4493988
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaa-caaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  4494300 agttcacttagaatttctttttcaaagttcatatcttagaaattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtatat 4494201  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctc-ttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||     
T  4494200 caagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttg-attagaagtctctttgcaattgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgctcag 4494102  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4494101 gagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaa 4494003  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||| ||||||    
T  4494002 ctctcctttgaagtg 4493988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 10883606 - 10883915
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10883606 agttcacttagaatttcttaacaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagt-tttatccgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 10883704  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  10883705 aagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 10883804  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  10883805 agcataggaagtctcttgcagttgttcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattaca--ttttagtgaac 10883901  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  10883902 tctccttggaagtg 10883915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 12174774 - 12175081
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12174774 agttcacttagaatttcttttcaaagttcatatcttagaaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 12174873  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||| ||||| |    
T  12174874 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattatgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgcgttcagg 12174973  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  12174974 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 12175067  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  12175068 tctccttggaagtg 12175081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 41842859 - 41843168
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  41842859 agttcacttagaatttcttatcaaatttcatatcttagaaattcaagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattttgatcaccactgattgtatatc 41842958  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| ||    
T  41842959 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagctgtgcttgaggataagaagtctcttgattgtgttcagga 41843057  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41843058 gcatatgaaatatcttgcagttgtgcttgagtagtttgaaatctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 41843155  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  41843156 ctccttggaagtg 41843168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 13731108 - 13731418
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  13731108 agttctcttagaatttcttaacaactttcttatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 13731207  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| | |    
T  13731208 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgcttgtgtttagg 13731307  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13731308 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcattgaacatttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 13731404  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  13731405 tctccttggaagtg 13731418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14426270 - 14425961
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14426270 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgaatctgacttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14426171  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  14426170 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaattcaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcagg 14426072  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14426071 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-cattttaagtctcgtgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattac--tttttagtgaac 14425975  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | | ||||||||||    
T  14425974 tcttcttggaagtg 14425961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 13027339 - 13027642
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13027339 agttcacttagaatttcttatcaaag---atatcttagaaattctggagtcttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatc 13027435  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  13027436 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaaga 13027534  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||   |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  13027535 gcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagaagtgagca---gtaatcagatattaaa--atttagtgaact 13027629  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  13027630 ctccttgaaagtg 13027642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 24795148 - 24795436
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24795148 agttcacttagaatttcttaacaaagtttacatcttaggaattctagagtctttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 24795247  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||     
T  24795248 caagtgttcaatctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagagaagtctcttgattgtgttcag 24795347  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24795348 gagcataggaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttaatagtgagcatttgtaatcagatattacat 24795436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 21283808 - 21284117
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   || ||| ||| ||||||||||    
T  21283808 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatctatattaggaacaccactaattgtatatc 21283907  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  21283908 aagtgttcaactgcaaacatttttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgctctagcatttgaagtctcttgattgtgttcagga 21284007  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21284008 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgaacagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 21284104  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  21284105 ctccttggaagtg 21284117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 15704923 - 15705229
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15704923 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 15705022  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  15705023 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctatttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 15705121  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||     || |||||    
T  15705122 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttaag-catttgaagtctcttactaaatttagtagagagcaattgtaataagatattaca-----taatgaac 15705215  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||||    
T  15705216 tatccttggaagtg 15705229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 19328448 - 19328754
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  19328448 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatattttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatc 19328547  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  19328548 aagtgttaaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtcacttgcagttgtgcttgagcactagaagtctcttgattgtgttcagg 19328646  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  19328647 agcataggaagtctctagcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgatagttttagcagtgagcaattataatcagatattaca-----tagtgaac 19328740  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  19328741 tctccttggaagtg 19328754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33421471 - 33421166
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  33421471 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagtgtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat- 33421373  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  33421372 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tataattctgtttgaattgagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 33421274  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  33421273 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 33421180  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  33421179 tctccttggaagtg 33421166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 13138331 - 13138618
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13138331 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13138430  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13138431 atgtgttcaacctcaaacatttttcattgtgattttgtttgaatttggaagcctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 13138530  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaag-tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13138531 agcataggaagactcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagttttagcagtgagcaattgtaataagatattacat 13138618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 313
Target Start/End: Original strand, 33692165 - 33692443
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33692165 atatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tg 33692263  T
Q  130 taattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33692264 taattctgtttgaattaagaagtctcttgtagttgtgcttgagcgttagaagtcccttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctt 33692363  T
Q  229 gagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  33692364 gagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgatcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 33692443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 32265154 - 32265441
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  32265154 agttcacttagaatttattaacaaagcttatatcttaggaactctagagtcctttgagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 32265253  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  32265254 aagggttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 32265353  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  32265354 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttttaatcagatattacat 32265441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13683320 - 13683011
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13683320 agttcacttagaatttcttaacaagtttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatc 13683221  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13683220 aagtgtt-aacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagtattagaagtctcttgattgtgttcagg 13683122  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13683121 agcataggaagtctcatgtagttgtgcttgagt-atttgaagtctcttcctagttttagcaatgagcagttgcaatcagatattaca--ttttagtgaac 13683025  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  13683024 tctccttggaagtg 13683011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23280395 - 23280674
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23280395 agttcaattagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 23280494  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||       ||||||| |||| |||| |||| ||| | |    
T  23280495 aagtgttcaacctcaatcatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagtt-------agcattagaagtatcttcattgcgttaagg 23280586  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23280587 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtttcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 23280674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 313
Target Start/End: Original strand, 12367213 - 12367481
Alignment:
Q  43 tctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12367213 tctagagtcctaagagtctgtatgtgatttatgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaat-aattttctgtgtaattctgtttga 12367311  T
Q  143 attagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctta-attgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaag 241  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12367312 attagaagtctcttagagttgtgcttgagcattagaagtctctttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttttgcttgattaatttgaag 12367411  T
Q  242 tctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  12367412 tttcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactttccttggaagtg 12367481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 331365 - 331065
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  331365 agttcacttagaatttcttatcaacgttcatatcctagaaattctagagtct---------gtatctgatttgtattatgaacaccgctgattgtatatc 331275  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  331274 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 331175  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||    
T  331174 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaggtttagcagtgagcatttgtaatcagatattac---ttatagtgaac 331079  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  331078 tctccttggaagtg 331065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15467639 - 15467353
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15467639 agttcaattagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 15467540  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||||| |    
T  15467539 aagtgttcaatctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagtattagatgtctcgtgattgtgttcagg 15467441  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15467440 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagaaatttgaagtctcttgctagttttagaaatgagcaattgtaatcagatattacat 15467353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 48063255 - 48063533
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  48063255 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtct---------gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 48063345  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  48063346 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 48063445  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48063446 agcataggaagtctcttgcagttgtgattgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 48063533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 30945793 - 30946101
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaa-caaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||| || | |||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  30945793 agttcacttagaatttttttatcaactttcatatcttagatattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 30945892  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||     
T  30945893 caagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtgttactgtttgaatcgagaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcag 30945991  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||    
T  30945992 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-----tagtgaa 30946086  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  30946087 ctctccttggaagtg 30946101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 287
Target Start/End: Original strand, 9710241 - 9710525
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||    
T  9710241 ttcacttagaatttcttattaactttcatatcttaaaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgatcgtatctcaa 9710340  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||     
T  9710341 gtgttcaacttcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagaattagaagtctcttgattgtgtttaggag 9710439  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9710440 cgtaggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcaatgagaaattgtaatcagatattacat 9710525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 16112319 - 16112585
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16112319 agttcacttagaatttctcatcaactttcatatcttaaaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacaccactgattgtatatc 16112418  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  16112419 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcagtagaagtctcttgattgtgttcagg 16112518  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagca 267  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16112519 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttga-acatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagca 16112585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 313
Target Start/End: Original strand, 19711450 - 19711755
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  19711450 tcacttagaatttcttaacaaagatcacatcttaggaattctagaatctttagagtcagtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaag 19711549  T
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  | || ||||||||| |  ||||||| ||      
T  19711550 tgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgaataatagaagtctcttgaccgtgttcaggagt 19711649  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactat 302  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |    
T  19711650 ataggaagtctcttggagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactct 19711744  T
Q  303 ccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||    
T  19711745 ccttggaagtg 19711755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 48806313 - 48806601
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  48806313 agttcacttagaatttcttaacaaagctcacatcttaggaattctagagtctttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgcttgtatat 48806412  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  48806413 caagtgttcaacatcaaacatttttcattgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgataatgttcag 48806512  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  48806513 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaacaatttgaagtctcatactaagtttagtattgagcatttgtaatcagatattacat 48806601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 21381863 - 21382150
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21381863 agttcacttagaatttcttaacaaagctcacatcttaggaattctagtgtcattagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21381962  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||| ||  |||||| |    
T  21381963 aagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcagg 21382062  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21382063 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaaatatagaaatgagcaattgtaatcagatattacat 21382150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2499760 - 2499531
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2499760 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 2499661  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | || |||||| |||||| ||| ||    
T  2499660 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttgagcataagaaatctcttgattgtg-tcagga 2499562  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgag 231  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2499561 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag 2499531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 13472941 - 13473221
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  13472941 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagttt---------gtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 13473031  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |    
T  13473032 aagtgttcaggctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataaaatgtctcttgattgtgttcagca 13473130  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttt 291  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13473131 gcatagaaaatctcttgcacttgtgcttgagtagtttgaagtcttttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttt 13473221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 7488338 - 7488647
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  7488338 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttaaaaattctagagtcttaagagtctatagcttatttgtatttgtgaacaccactgattgtatat 7488437  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||  |    
T  7488438 caagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcttg 7488536  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |  || || ||||| || ||||||| |||||||     |||||||||||    
T  7488537 agcataggaaatctcttgaaattgtgcttgagtaatttgaagtcttttgctattttgagtagtgaacatttgtaattagatatt---gattttagtgaac 7488633  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  7488634 tctccttggaagtg 7488647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 19339683 - 19339970
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  19339683 agtttacttataatttcttaaccaagatcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatc 19339782  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  |||| | |    
T  19339783 aagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtctcttgatcttgtttagg 19339882  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19339883 agcataggaagtctcttgcagttgttcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 19339970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 9099474 - 9099780
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  9099474 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctatagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaataccactaattgtatatc 9099573  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |||||||||| |||  ||||  ||    
T  9099574 aagtgttcaacctcaaacatatttatttgcaattctatttgaa-tagaagtctcttgcttttgtgcttgagtatagaaagtctcttgatttagttcttga 9099672  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  9099673 gcataggaaatctcttgcagt----cttgagtagtttgaagtctcttggtagttttagcagtgagcaattgtaatcaaatattaca-tttttagtggact 9099767  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  9099768 ctccttggaagtg 9099780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 2265952 - 2266256
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2265952 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattc--gagtctttagagtctgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 2266049  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    || ||||||| | |||||| || | | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||| |    
T  2266050 aaatgttcaatcacaaacatttattt-tgttattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtttcttgattgtgttcagg 2266148  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||    
T  2266149 aacataggaagtctcttccagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcaaatattaca-----tagtgaac 2266242  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  2266243 tctccttggaagtg 2266256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 19237470 - 19237779
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19237470 agttcacttagaatttcttaacaaaattcatatcttagaaattctagagtattaagaataagtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 19237569  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | |||||  ||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||| | |||  | || | |||||||| ||    
T  19237570 aagtgttcaacctcaaacatatttctttataatttagtttgaa-tagaagtctcttgcttatgtgcttgagcataagaaggttattgaatgtgttcagga 19237668  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| | |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19237669 gcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtagtttgaagttttttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 19237766  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     || |||||||||    
T  19237767 ctcattggaagtg 19237779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 9098668 - 9098974
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  9098668 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctatagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaataccactaattgtatatc 9098767  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |||||||||| |||  ||||  ||    
T  9098768 aagtgttcaacctcaaacatatttatttgcaattctatttgaa-tagaagtctcttgcttttgtgcttgagtatagaaagtctcttgatttagttcttga 9098866  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  9098867 gcataggaaatctctttcagt----cttgagtagtttgaagtctcttggtagttttagcagtgagcaattgtaatcaaatattaca-tttttagtggact 9098961  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  9098962 ctccttggaagtg 9098974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8182653 - 8182437
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  8182653 agttcacttagaatttattatcaaagctcatatcttaggaattctagagcctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 8182554  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  8182553 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcagg 8182454  T
Q  200 aacataggaaatctctt 216  Q
    | |||| ||| ||||||    
T  8182453 agcatatgaagtctctt 8182437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Original strand, 48237378 - 48237562
Alignment:
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  48237378 tgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagc 48237477  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48237478 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaactgtaatcagatattacat 48237562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13646114 - 13645928
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  13646114 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaaaaccacttattgtatatc 13646015  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13646014 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagtattaaaagtctctt 13645928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4821198 - 4820900
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  4821198 agttcacttagaatttcttataaaagctcatatcttagaaattctagagtct---------gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 4821108  T
Q  101 aagtgttcaacct-caaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||| || ||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||     
T  4821107 aagtgttcaaactacaaacatattcct-tgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagatgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcag 4821009  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||    
T  4821008 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtatagtagtgagcaattgtaatcaaatactac-----ttagtgaa 4820915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1292753 - 1292580
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  1292753 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 1292654  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagca 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1292653 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgtttgagca 1292580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33604544 - 33604320
Alignment:
Q  86 tactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  33604544 tactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctc 33604446  T
Q  185 ttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 284  Q
    || |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  33604445 ttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtatcttgctaagtttaacagtgagcagttgtaatcagatatga 33604347  T
Q  285 cattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33604346 c--tttttagcgaactctccttggaagtg 33604320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21692054 - 21691902
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||    
T  21692054 agttcacttagaatttcatatgaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatttc 21691955  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtct 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21691954 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtct 21691902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 25687275 - 25687521
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  25687275 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttaaaaattttagagtcttaagagtttgtatatgatttgtattgggaacaccactgattgtatatc 25687374  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||     ||| |  ||    
T  25687375 aagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattatgtttgaa-taaaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagcctcttgcagttgtgcttga 25687472  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25687473 gcataggaaacctcttgcatttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 25687521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 39284998 - 39285164
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  39284998 agttctcttagaatttcttatcaaagttcatatcttaaaaattctagagtcttaagagtttgtatctaatttgtattgtggacaccactgattgtatatc 39285097  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgttt 168  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39285098 aaatgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgttt 39285164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30025628 - 30025443
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||    
T  30025628 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattctgaacaccactaattgtatatc 30025529  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30025528 aactgttcaacatcaaac-attttctttgtaattttttttgaattaagaagtctcttgcagttgtgtttgagcattagaagtttctt 30025443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 22579652 - 22579823
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22579652 agttcacttagaatttcttaact---ttcatatcttaaaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22579748  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22579749 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattcttcttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 22579823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16411717 - 16411422
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||          ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  16411717 agttcacttagaatttcttaacaaatttcatatcttttaaattctagagtctta----------tctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatat 16411628  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| | |||||||  |    
T  16411627 caagtgttcaacctcaaaca-ttttctttttaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatagtaagtctcttgagtgtgttcttg 16411530  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||  ||  ||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  16411529 agcataagaattctcttgcagttttgcttgagtagtttgaagtctcttgcta--ttgtgc-ttgagcaattgtaatcagatatt---gattttagtgaac 16411436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 35953120 - 35953277
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||    
T  35953120 agttcacttggaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgaatatc 35953219  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35953220 aagtgttcaacctcaaatatttttct-tgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgc 35953277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 290
Target Start/End: Original strand, 13902136 - 13902335
Alignment:
Q  90 gattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaat 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||    
T  13902136 gattgtatatcaagagttcaacctcaaacaattttctttataattatgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgat 13902234  T
Q  190 tgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattt 289  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |  || |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  13902235 tgtgttcaggagcataggaaatcacttacagttgtgcttgagtagtttgaagtcttttgctagcttcagcaatgagcaattgtaattagaaattatattt 13902334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 13172789 - 13173092
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13172789 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtattaagagtc-ctatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatc 13172887  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||   |||||||||     ||| |  ||    
T  13172888 aagtgttcaaccacaaac-attttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcttttgtgcttgagtataggaagtctcttgcagttgtgcttga 13172985  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttag-cagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
     ||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||    |||| |    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  13172986 gcatcggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagttttaagtctcttg----gttttgtgcttgagcaattgtaatcagatatt---gattttagtgaac 13173078  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||||    
T  13173079 tatccttggaagtg 13173092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14425170 - 14425006
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14425170 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtct---------gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14425080  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagca 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14425079 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagca 14425006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16308148 - 16308395
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  16308148 agttcatttagaatttcttaacagctttcatatcttataaattttagagtcttaagagtttgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatata 16308247  T
Q  101 aagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||   ||| ||||||  ||||| |  |    
T  16308248 tagtgttcaaacctcaaac-attttatgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttacttttgtgcttgagcataggaagactcttacgtgtgtgcttg 16308345  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    | ||||| ||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  16308346 agcatagaaaacctcttgcttttgtgcttgactagtttgaagtctcttgc 16308395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13879817 - 13879605
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga-attagaagtctcttgcggttgtgtttgagcatta 176  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13879817 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttataattctgtttgattttagaagtctcttgcagttgtgcttgagaatta 13879718  T
Q  177 aaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagc---aattgta 273  Q
     |||| |||| ||||||||||  | |||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||    
T  13879717 gaagtatcttgattgtgttcagaagcataggaagtctcttgttgttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcattaattgta 13879619  T
Q  274 atcagatattacat 287  Q
    ||||||||||||||    
T  13879618 atcagatattacat 13879605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5035110 - 5034863
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  5035110 agttcacttagaatttcttaacaactttcatacctcagaaattctagagtcgtaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatat 5035011  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||   ||||||| ||||||  ||||| ||||||||   |||||||||   | ||| |  |    
T  5035010 caagtgttcaacctcaaacatttttctgtataattttgtttg-tctagaagtatcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgtgtttgtgcttg 5034912  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  5034911 agcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtatttggaagtctcttg 5034863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21691912 - 21691775
Alignment:
Q  173 attaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgt 272  Q
    |||| |||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21691912 attagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtattttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgt 21691813  T
Q  273 aatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagt 312  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  21691812 aatcagatataaca--ttttagtgaactctccttggaagt 21691775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44466640 - 44466508
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44466640 aagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatca 44466542  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  44466541 gatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 44466508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44466786 - 44466631
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  44466786 agttcacttagaaattcatatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaacagtctctatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatc 44466687  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  44466686 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgttt-tatcagaagtctcttg 44466631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Original strand, 35954500 - 35954647
Alignment:
Q  160 gttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagc 259  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||     
T  35954500 gttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagt 35954598  T
Q  260 agtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  35954599 agtgaggaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 35954647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 602458 - 602297
Alignment:
Q  32 atcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgt 130  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||| || ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  602458 atcttagaaattctaaagtc--aagagtctgttatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaattcaaacaattttctatgt 602361  T
Q  131 aattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||   |||||||||| ||||||    
T  602360 aattctgtttgaattagaagtctcttgctttagtgcttgagcatctgaagtctcttacttgtgt 602297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 313
Target Start/End: Original strand, 13259053 - 13259146
Alignment:
Q  218 cagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  13259053 cagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttaacagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 13259146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 313
Target Start/End: Original strand, 13266393 - 13266486
Alignment:
Q  218 cagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  13266393 cagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttaacagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 13266486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 4433040 - 4433246
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  4433040 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 4433138  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaatt 270  Q
    ||||  ||| ||||||  ||  || |  || || ||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| | | | || ||| | |||||| ||    
T  4433139 gcatagaaattctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcattt 4433238  T
Q  271 gtaatcag 278  Q
    ||||||||    
T  4433239 gtaatcag 4433246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 278
Target Start/End: Original strand, 4412425 - 4412673
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4412425 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgtattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgt 4412524  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||  ||||||||||  ||  || |  || || ||||| ||||||||   |||||||    
T  4412525 ttaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgctt 4412623  T
Q  229 gagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcag 278  Q
    ||| ||||||||||||| | | | || ||| | |||||| ||||||||||    
T  4412624 gagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcag 4412673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 41842706 - 41842799
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattg 94  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  41842706 agttcacttagaatttattatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattttgatcaccactgattg 41842799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 8999393 - 8999479
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8999393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 8999479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 141
Target Start/End: Original strand, 18362007 - 18362140
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    |||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18362007 acttagaatttcttataaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagtgttt-tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtg 18362105  T
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttg 141  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  18362106 ttcaa-atcaaacatctttctgtgtaattttgtttg 18362140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 13175064 - 13175148
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctctt 156  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13175064 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctctt 13175148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30025446 - 30025369
Alignment:
Q  213 tcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30025446 tcttgcagttgtgcatgagcaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttt 30025369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Original strand, 16105429 - 16105509
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16105429 atatcttagaaattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaa 16105509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 11087510 - 11087589
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11087510 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgggtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 11087589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14425028 - 14424952
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14425028 tctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 14424952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 24882875 - 24882988
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  24882875 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 24882972  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||  |||||||||    
T  24882973 gcattggaagtctctt 24882988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 287
Target Start/End: Original strand, 15574192 - 15574301
Alignment:
Q  177 aaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatc 276  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||| || | || ||||| ||||||||||||| |||    
T  15574192 aaagtctcttaattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcatgag-cgtttgaagtctattactaattttagtagtgagcaattgttatc 15574290  T
Q  277 agatattacat 287  Q
    |||||||||||    
T  15574291 agatattacat 15574301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Original strand, 22579829 - 22579925
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||    
T  22579829 tctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactttccttggaa 22579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1292602 - 1292505
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||    
T  1292602 tctcttgcagttgtgtttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagttagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaa 1292508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 3476757 - 3476877
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3476757 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtg 3476852  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  3476853 taattctgtttg-attagaagtctct 3476877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23125662 - 23125486
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| |||  | |||  ||||||||||    
T  23125662 cacttagaatttcttaacaactttcatatcttataaattctagagtcttaagagtctg-atttgttttgtattgtgaacacggccgataatatatcaagt 23125564  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |  ||| | |||||||||| || ||||||    
T  23125563 gttcaac--caaacatatttctttgtaatt-tgtttg-tttagaagtctcttacttttgggcttgagcattagaaatctctt 23125486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29589876 - 29589755
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29589876 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtaatgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtg 29589780  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  29589779 taattctgtttg-attagaagtctct 29589755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33605408 - 33605314
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgt 95  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  33605408 agttcacttaaaatttcttatcaacttccatattttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccactgattgt 33605314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 18056684 - 18056744
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtct 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18056684 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtct 18056744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9069303 - 9069174
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||  |||||  ||||||||    
T  9069303 aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcaaagagcagctgtaatca 9069205  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||| ||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  9069204 gatactaca-----tagtgaactctccttggaagtg 9069174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Original strand, 39285147 - 39285247
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  39285147 tctcttgcagttgtgtttaagtagtttgaagtttcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctctttggaa 39285244  T
Q  311 gtg 313  Q
    |||    
T  39285245 gtg 39285247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16472406 - 16472243
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||  |||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16472406 cactaagaatttcttat-aaacttcatatcttagaaatgatagagttttaagtgtctg-atttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 16472309  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||| | |||||   ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  16472308 gttcaaac-caaacttatttctgtgtaatt-tgtttg--ttataagtctcttgcttttgtggttgagcat 16472243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Original strand, 16545959 - 16546055
Alignment:
Q  188 attgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16545959 attgtattcaggagcataggaagtctcttgcagttgtggttgagta-tttgaagtctcttgctagttttaatagtgagcaattgtaatgagatattac 16546055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16619703 - 16619607
Alignment:
Q  188 attgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16619703 attgtattcaggagcataggaagtctcttgcagttgtggttgagta-tttgaagtctcttgctagttttaatagtgagcaattgtaatgagatattac 16619607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 25807111 - 25807007
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25807111 cacttaaaatttcttaacaactttcatatcttgtaaattctagagtcttaagagtctg-atttgttttgtattatgaacatcactgattgtatatcaagt 25807013  T
Q  105 gttcaa 110  Q
    ||||||    
T  25807012 gttcaa 25807007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8933409 - 8933327
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8933409 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaa-tagaagtctct 8933327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 48382033 - 48381948
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48382033 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattctgtttg-attagaagcctcttgc 48381948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15216200 - 15216080
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||     
T  15216200 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgta 15216105  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15216104 taattttgtttgaa-tagaagtctct 15216080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 48237335 - 48237377
Alignment:
Q  34 cttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtat 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48237335 cttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtat 48237377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24787845 - 24787775
Alignment:
Q  241 gtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  24787845 gtctcttgataagtttagcagtgagtagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 24787775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 26210003 - 26210075
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26210003 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaat 26210075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 12734619 - 12734691
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  12734619 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaactttgtttgaat 12734691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13645968 - 13645864
Alignment:
Q  206 ggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatcct 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |  | ||  |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||    
T  13645968 ggaagtctcttgcagttgtgcttgagt-attaaaagtctcttgctagttatattagtgagtagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctgct 13645872  T
Q  306 tggaagtg 313  Q
    ||||||||    
T  13645871 tggaagtg 13645864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18418960 - 18418878
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  18418960 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-actttctgtgtatttctgtttg-attagaagcctct 18418878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18441041 - 18440959
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  18441041 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-actttctgtgtatttctgtttg-attagaagcctct 18440959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Original strand, 1878699 - 1878804
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||| |||||||| |||  || |||||||| |||||||  ||||||| ||||||| | ||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1878699 cacttagcatttcttatcaactttcatatcttaaaaattcttaagtctta-gagtctgaa-ctgttttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagt 1878796  T
Q  105 gttcaacc 112  Q
    ||||||||    
T  1878797 gttcaacc 1878804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 6867679 - 6867792
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  6867679 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 6867776  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  6867777 gcattagaagtctctt 6867792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 6878311 - 6878424
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  6878311 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 6878408  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  6878409 gcattagaagtctctt 6878424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8617232 - 8617119
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  8617232 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgattga 8617135  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  8617134 gcattagaagtctctt 8617119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 24931057 - 24931170
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  24931057 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 24931154  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  24931155 gcattagaagtctctt 24931170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37344046 - 37343933
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  37344046 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 37343949  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  37343948 gcattagaagtctctt 37343933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 174
Target Start/End: Original strand, 2501515 - 2501617
Alignment:
Q  69 atttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgttt 168  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||||    
T  2501515 atttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaact-tattctttgtaatttcgtttgt-ttagaagtctcttgattttgtgttt 2501611  T
Q  169 gagcat 174  Q
    ||||||    
T  2501612 gagcat 2501617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Original strand, 2706060 - 2706179
Alignment:
Q  65 tctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgt 164  Q
    |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||    
T  2706060 tctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgt 2706157  T
Q  165 gtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  2706158 gcttgagcattagaagtctctt 2706179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 11572636 - 11572693
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctg 62  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11572636 cacttagaatttcttaataactttcacatcatagaaattctagagtcttaagagtctg 11572693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2499526 - 2499477
Alignment:
Q  262 tgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2499526 tgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 2499477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 30944760 - 30944816
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaaga 57  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30944760 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagatattctaaagtcttaaga 30944816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 40055214 - 40055292
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  40055214 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-tttttctgtgtatttttgtttgaa-cagaagtctcttgc 40055292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19416910 - 19416856
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaat 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  19416910 gtgagcacttctgattgtatatcaagtgttcaa-cttacacaattttctttgtaat 19416856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11015615 - 11015573
Alignment:
Q  70 tttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacc 112  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11015615 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacc 11015573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 110
Target Start/End: Original strand, 2716664 - 2716709
Alignment:
Q  65 tctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2716664 tctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2716709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 28408761 - 28408716
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattcta 46  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  28408761 agttcacttataatttcttatcaaagtgcatatcttagaaattcta 28408716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 124
Target Start/End: Original strand, 38403665 - 38403718
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatttt 124  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  38403665 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacattttt 38403718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13682165 - 13682083
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  13682165 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgtttaaagtcaaac-attttcggtgtaattttgtttg-attagaagcctct 13682083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10757151 - 10756841
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10757151 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagttttaagattttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 10757052  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  10757051 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 10756953  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10756952 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacat-ttttagtgaact 10756854  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  10756853 ctccttgaaagtg 10756841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12284151 - 12283839
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  12284151 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagttttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaataccactgattgtatatc 12284052  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattag-aagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  12284051 aagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaaatctgtttgaatttggaagtctcatgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 12283952  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12283951 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgtgtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcaaatattacat-ttttagtgaac 12283853  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  12283852 tctccttggaagtg 12283839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22153583 - 22153273
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  22153583 agttcactcagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaatacaactgattgtatatc 22153484  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  22153483 aagtgttcaacctcaaacatttttcgttgtaattctgtttgaataa-aagtctcttgcagttgtgcttaagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 22153385  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22153384 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-tttctagtgaact 22153286  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  22153285 ctccttggaagtg 22153273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7309545 - 7309235
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  7309545 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtaatgtgaacaccactgattgtatatc 7309446  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||  |    
T  7309445 aagtgttcaacctcagacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcttg 7309346  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7309345 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcatttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 7309249  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||| ||||||    
T  7309248 tctccttagaagtg 7309235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35039892 - 35039606
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  35039892 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 35039793  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  35039792 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgaacattataagtctcttgattgtgttcagg 35039693  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35039692 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-cttttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 35039606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 12624907 - 12625216
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  12624907 agttcacttagaatttcttatgaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatt 12625006  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||  |    
T  12625007 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctacttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcagaa 12625105  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12625106 gcgtaggaaatctcttgcagttatgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 12625203  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  12625204 ctccttggaagtg 12625216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23024519 - 23024211
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23024519 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 23024420  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  23024419 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 23024320  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  23024319 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaattctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 23024225  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  23024224 tctccttggaagtg 23024211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 32786293 - 32786600
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||    
T  32786293 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgcgaacaccattgattgtatatc 32786392  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||| |    
T  32786393 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgttagaattaagaagtctcttgcagttgtgctcgagcattagaagtcttttgattgtgttcagg 32786491  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  32786492 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgatagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 32786586  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  32786587 tctccttggaagtg 32786600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 44824115 - 44824421
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  44824115 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 44824214  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  44824215 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 44824313  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  44824314 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtttcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 44824407  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  44824408 tctccttggaagtg 44824421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 21121418 - 21121705
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21121418 agttcacttagaatttcttaacaaagcttaaatcttaggaattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21121517  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| | |    
T  21121518 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattccgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttagg 21121617  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21121618 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 21121705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 22202088 - 22202397
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22202088 agttcacttagaatttcttatcaaagttcaaatcttagaaattctagtgtct-aagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22202186  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat-tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  22202187 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttaaatatagttgtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 22202286  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  22202287 agcataggaagtctcttgcagttgtgattgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaaa 22202383  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  22202384 tctccttggaagtg 22202397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 33256703 - 33257012
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  33256703 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcataagagcctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 33256802  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  33256803 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagctggacttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaga 33256902  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33256903 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 33256999  T
Q  300 tatccttggaagt 312  Q
    | |||||||||||    
T  33257000 tctccttggaagt 33257012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 33276875 - 33277184
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  33276875 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcataagagcctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 33276974  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  33276975 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagctggacttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaga 33277074  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33277075 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 33277171  T
Q  300 tatccttggaagt 312  Q
    | |||||||||||    
T  33277172 tctccttggaagt 33277184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2268256 - 2267977
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  2268256 agttcgcttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 2268157  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||    
T  2268156 aagtgttcaacctcaaacatttttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgaagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttagga 2268057  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagata 281  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2268056 gcataggaagtctcttgcagttgtgtttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagtagttgtaatcagata 2267977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2834413 - 2834125
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2834413 agttcatttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctaaagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 2834314  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |    
T  2834313 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattgtgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtcttttgattgtgttcagg 2834214  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc-aaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2834213 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagtttttagcagtgagcaattgtaatcaaatattacat 2834125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 21205226 - 21205513
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21205226 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21205325  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||  |    
T  21205326 aagggttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttccgg 21205425  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21205426 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaaggttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 21205513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 21215030 - 21215317
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21215030 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21215129  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||  |    
T  21215130 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtatttttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttccgg 21215229  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21215230 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaaggttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 21215317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36133907 - 36133622
Alignment:
Q  22 caaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaat 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36133907 caaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaacatt 36133808  T
Q  122 tttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagt 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||    
T  36133807 tttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttaggagcatagaaagtctcttgcagt 36133708  T
Q  222 tgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  36133707 tgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 36133622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 46088715 - 46088428
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  46088715 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttaaagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatc 46088616  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  46088615 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 46088516  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  46088515 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaacaatttgaagtctcttactaagtttagaagtgagcatgtgtaatcagatattacat 46088428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 23036860 - 23037167
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23036860 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 23036959  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||| |    
T  23036960 aagtgttcaaccttaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaggtctcttgattgtgttcagg 23037059  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  23037060 agcataggaagtctcttgctgttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagctgtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 23037153  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  23037154 tctccttggaagtg 23037167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1577592 - 1577306
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  1577592 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatc 1577493  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  1577492 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcgtgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 1577393  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1577392 agcataggatgactcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 1577306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 22600545 - 22600848
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | || ||||||||||||||    
T  22600545 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattg---ggaccactgattgtatatc 22600641  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22600642 aagtgttcaacctcaaacatttttct-agtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaag 22600740  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||    
T  22600741 agcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaataagatattaca-----tagtgaac 22600834  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  22600835 tctccttggaagtg 22600848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 312
Target Start/End: Original strand, 16235664 - 16235967
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  16235664 ttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaa 16235763  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  16235764 gtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggag 16235862  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||     
T  16235863 cataggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catgtgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactc 16235956  T
Q  302 tccttggaagt 312  Q
    |||||||||||    
T  16235957 tccttggaagt 16235967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 26702482 - 26702792
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  26702482 agttcactcagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccattgattgtatatc 26702581  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| | | ||    
T  26702582 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgctaagga 26702680  T
Q  201 acataggaaatctcttg-cagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
     ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  26702681 gcatagaaaatctcttgtaagttgtgcttaagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtgatcagatattaca--ttttagtgaac 26702778  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  26702779 tctccttggaagtg 26702792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 48570584 - 48570890
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  48570584 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 48570683  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || ||    
T  48570684 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtggtcgag 48570782  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  48570783 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtatcttactaagtttagtagttagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 48570876  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  48570877 tctccttggaagtg 48570890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29215520 - 29215238
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||||||||||    
T  29215520 gttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatcttatttgtattgtgaatatcactgattgtatatca 29215421  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |    
T  29215420 agtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagaa 29215322  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 284  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29215321 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcatttgtaattagatatta 29215238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30892821 - 30892510
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  30892821 agttcatttagaatttcttattaaagttcataacttagaaattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 30892722  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  30892721 caagtgttcaacctcaaacaatcttctgtgtaattctatttgaatttagaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcag 30892622  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  30892621 gagcataggaagtctcttgcagttgttctttag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattaca--ttttagtgaa 30892525  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  30892524 ctctccttggaagtg 30892510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 21192218 - 21192527
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||    
T  21192218 agttcacttagaatttcttatcaaagttcacatcttagaaattctagagtcttgagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaatgattgtgtatc 21192317  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    | |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||| | ||||||||| || | ||||| ||    
T  21192318 atgtgttcaacctcaaacaatttattttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttatgcttgggcataagaagtctcttgatggagttcagga 21192416  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21192417 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgatgtctcttgctagttttagcagtgagcagttgcaatcagatattaca--ttttagtgaact 21192514  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  21192515 ctccttggaagtg 21192527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21702540 - 21702233
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||    
T  21702540 agttcactcataatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtacatc 21702441  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  21702440 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtttcttgcagttgttcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 21702341  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  21702340 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 21702247  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  21702246 tctccttggaagtg 21702233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1900070 - 1899786
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  1900070 agttcacttagaatttcgtatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgattggtat-gtgaacaccactgattgtatatc 1899972  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    || |||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  1899971 aaatgttcaacctcaaacatttttct-agtagttatgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 1899873  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1899872 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattttaatcagatattacat 1899786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 21135514 - 21135801
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||| |||||||    
T  21135514 agttcacttagaatttcttaacaaagattaaatcttaggatttctaaagtctttagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccattgatcgtatatc 21135613  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  21135614 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcagg 21135713  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21135714 agcataggaagtctcttgaagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagattagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 21135801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19215339 - 19215031
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  19215339 agttcacttagaatttcttaacaaagttcatatcttagaaattctagagtctttagagtatatatctgatctgtattgtgaacatcactgattgtatatc 19215240  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  19215239 aagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 19215141  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  19215140 agcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcattttgaagtctcatactaagtttagtattgagcaattgtaatcagatattac---ttttagtgaac 19215044  T
Q  300 tatccttggaagt 312  Q
    | |||||||||||    
T  19215043 tctccttggaagt 19215031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 17025315 - 17025627
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  17025315 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagattttctaaagtcttaaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatat 17025414  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||  |    
T  17025415 caagtgttcaacctcaaacatttttccttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttg 17025513  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17025514 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctaagtttagaagtgagcagttgtaatcaaatattacattttttagtaaac 17025613  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  17025614 tctccttggaagtg 17025627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38282290 - 38281984
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  38282290 agttcacttagaatttgttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 38282191  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  38282190 aagtgttcaacctcagacatttttct-agtaattctgtttgaattaagaaatctcttacaattgtacttgagcattagaagtctcttgattgcgttcagg 38282092  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  38282091 aacataggaagtctcttacagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 38281998  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  38281997 tctccttggaagtg 38281984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21984321 - 21984035
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  21984321 agttcacttagaattt-ttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctaatttatattgtgaacaccactaattgtatatc 21984223  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  21984222 aagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 21984123  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21984122 agcataggaagtatcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 21984035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 2327790 - 2328097
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2327790 agttcacttagaatttcttataaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctg-atctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 2327888  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa---ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttca 197  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  2327889 aagtgttcaacctcaaac-atattctttgtaattctgtttgaatttttagaagtcttttgcagttgtgcttgagcatcagaagtctcttgattgtgttca 2327987  T
Q  198 agaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtga 297  Q
     || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  2327988 ggagcatatgaagtctcttgcagtcgtgcttgag-catttgaagtctcttgctatgtttggtagtgagcaattgtaatcagatattac-----ttagtga 2328081  T
Q  298 actatccttggaagtg 313  Q
    ||| ||||||||||||    
T  2328082 actctccttggaagtg 2328097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10250712 - 10250407
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10250712 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctaaagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 10250613  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  10250612 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 10250514  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||| |||||||| |     ||||||||    
T  10250513 agcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaa-tttagttgtgagcaattgtaataagatattaga-----tagtgaac 10250421  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  10250420 tctccttggaagtg 10250407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 14263784 - 14264091
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14263784 agttctcttataatttcttttcaaagttcatattttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14263883  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| | |  ||||| |    
T  14263884 aagtgttcagtctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcttttgtgcttgagcaatagaagtctcttgacttagttcagg 14263983  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  14263984 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttaag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattac-----ttagtgaac 14264077  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  14264078 tctccttggaagtg 14264091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 22465163 - 22465473
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  22465163 agttcaattagaatttcttatcaaagctcatatcttaaaagttctattgtcttaagagtctgtatctgatttgtatcatgaacatcactgattgtatatc 22465262  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  22465263 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtgtgaactcagaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 22465361  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22465362 agcataggaagtctctcgcaattatgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcaaatattata-tttttagtgaac 22465459  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  22465460 tctccttggaagtg 22465473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 63 - 313
Target Start/End: Original strand, 22427753 - 22428001
Alignment:
Q  63 tatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggt 161  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22427753 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 22427851  T
Q  162 tgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcag 261  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22427852 tgtgattgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctcacagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagcag 22427950  T
Q  262 tgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22427951 tgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaactctccttggaagtg 22428001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30571923 - 30571638
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  30571923 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctaaagcctttagaatttgtatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatc 30571824  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  30571823 aagtgttcaacttcaaacaatcttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtg-ttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 30571725  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  30571724 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttaag-catttgaagtctcttactaaatttagtagtgaacatttgtaatcagatattacat 30571638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18896947 - 18897187
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18896947 agttcacttagaatttattaacaactttcatattttagaaattctagagtcttaagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 18897046  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  18897047 aagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttg-ttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataaaaagtctcttgattaagttcaaga 18897144  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtc 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18897145 acatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtc 18897187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37640736 - 37640448
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  37640736 agttcacttagaatttcttaacaaagcttacatcttaggaattctagaatctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 37640637  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt--agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  37640636 aagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttaggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcag 37640537  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  37640536 gagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtatagtattgagcagttgtaatcagatattacat 37640448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18614641 - 18614364
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18614641 ttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaggagtctatatctgatttgtattatgaacatcactgattgtatatcaa 18614542  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||| || |    
T  18614541 gtgttcaatttcaaac-attttctttgtaattctgcttgaa-tagaagtctcctgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcatgagc 18614444  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatat 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18614443 ataggaaatctcttgcagttatacttgagtagtttgaagtctcttgctattttgagcagtgagcagttgtaatcagatat 18614364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 313
Target Start/End: Original strand, 25448964 - 25449220
Alignment:
Q  55 agagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtct 153  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  25448964 agagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaaatct 25449063  T
Q  154 cttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaag 253  Q
    |||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  25449064 cttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctattgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaag 25449162  T
Q  254 tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25449163 tttagtagtgagcaattgtaatcagatattac--tttatagtgaacgctccttggaagtg 25449220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42284354 - 42284080
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||              |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  42284354 agttcacttagaatttcataacaaagcttatatcttaggaattctagagtctg-------------tgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 42284268  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  42284267 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 42284168  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42284167 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 42284080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19717249 - 19717031
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  19717249 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagcatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgcatatc 19717150  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  19717149 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttacagttttgtttgagcattagaaatctcttgattgtgttcaag 19717050  T
Q  200 aacataggaaatctcttgc 218  Q
    | |||| ||| ||||||||    
T  19717049 agcatatgaagtctcttgc 19717031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2266814 - 2266517
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||         |||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2266814 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtct---------gtatataatttgtattgtgaacac-actgattgtatatc 2266725  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||| | |    
T  2266724 aagtgttcaagctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgaacatcagaagtctcttgattgtgtttagg 2266626  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  2266625 agcataagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 2266531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 48703929 - 48703744
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  48703929 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtactaagagtctgtatctgatttgtatcgtgaacaccattgattgtatatc 48703830  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  48703829 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctctt 48703744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21028521 - 21028337
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  21028521 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatc 21028422  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  21028421 aagtgttcaacctcaaactatattctttgtaattctgtttgaa-tagaagtatcttgcagttatgcttgagcataaaaagtctctt 21028337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20909136 - 20908856
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||     
T  20909136 agttcacttagaatttattatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacatcattgattgtatata 20909037  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||    ||||||||| ||| | |||   |    
T  20909036 aagtgttcaacctcaaac-gttttctttgtaattctgtttgaa-tataagtctcttgcagttgtgcttgagcagaggaagtctcttgatttttttcttaa 20908939  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  20908938 gcataggaaatctcttgcggttgtgtttgagtagtttcaagtctcgtgctattttgagaagtgagcatttgtaatcagatatt 20908856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 171
Target Start/End: Original strand, 14293045 - 14293206
Alignment:
Q  9 tagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttc 108  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14293045 tagaattttttatcaaagttaatatcttataaattctagaaccttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 14293144  T
Q  109 aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgag 171  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14293145 aacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaa-tagaagtcttttgcagttgtgtttgag 14293206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17018307 - 17018035
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||  || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  17018307 agttcacttagaatttcttttcaactttcatatcttagagattgtagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 17018208  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||        ||| ||||   ||||||||| ||| |||||  ||    
T  17018207 aaatgttcaacatcaaacaattttctttgtaattctatttgaa-tagaagtctcttgc--------ttgtgcataggaagtctcttgatt-tgttcttga 17018118  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |  || |||  |||||||||||||||| |||||    
T  17018117 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagttgtttgaaatctcttgctattttgagcgttgagcaattgtaatcaaatatt 17018035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27858467 - 27858295
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  27858467 agttcacttagaatttcttaacaatttttatattttagaaattctagagtcttaagaatctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 27858368  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  27858367 aagtgttcaacctcaaacatttttttgtgtaattttgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 27858295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 18130364 - 18130537
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  18130364 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtattaagggtttgtatctaatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 18130463  T
Q  101 aagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  18130464 aagtgttcaaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 18130537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23054096 - 23053927
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23054096 agttcacttggaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtc-gtatctgatctgtattgtgaacaccactgattgtatatc 23053998  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  23053997 aagcgttcaacctcaaaca--tttctttttaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcaattgtgcttgagcat 23053927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 18517513 - 18517682
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18517513 agttcacttagaatttcttaacaactttcatattttagaaattttagagtcttaaaagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 18517612  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgag 171  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  18517613 aagtgttcaaccctaaacatttttctatgtaattttgtttg-tctagaagtctcttgcttttgtgcttgag 18517682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20110301 - 20110548
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagtta-atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtata 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||    
T  20110301 agttcacttaggatttcttaacaaactttcatatcttatagattctagagtcttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactaattgtata 20110399  T
Q  99 tcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||||   |||||| ||     ||| |      
T  20110400 tcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagagttgcttgagcataggaagtctattgcagttgtgctt 20110497  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20110498 gagcataggaaacctcttgcagtagtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 20110548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 26280410 - 26280651
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||| |||||||      ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  26280410 agttcacttagaatttcttaacaacttttgtattttagaaattttagagtc------gtctgtatcagatttgtatcgtgaacacctctgattgtatatc 26280503  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||| ||||||||   |||||||||   | ||| |  ||    
T  26280504 aagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttg-tctagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttga 26280602  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     |||| ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26280603 gcataagaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttggaagtctcttgc 26280651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 16233484 - 16233728
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||    
T  16233484 agttcacttagaatttcttaacaaccttcatatcttagaaattctagagtcttaagag--tatatctgatttgtattgtgaacaccactgatagtatgtc 16233581  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||||||   ||| |||||   | ||| |  ||    
T  16233582 aagtgttcaacctcaaacatatttctatgtaattgtgtttg-tttagaagtttcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtttgtgcttga 16233680  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
     ||||||||| |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16233681 gcataggaaacctcttgcttttgtgatttagtagtttgaagtctcttg 16233728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9346501 - 9346328
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgta-tcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||    
T  9346501 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattcttgagtcttaagagtctgtatctgatttgtatttgtgaacaccacttattgtatat 9346402  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||| ||||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  9346401 caagcgttcaacctcaaacatttttttatgtgattgtgtttg-tttagaagtctcttgtttttgtgcttgagcat 9346328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Original strand, 28492761 - 28492879
Alignment:
Q  8 ttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  28492761 ttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgtt 28492860  T
Q  108 caacctcaaacaattttct 126  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  28492861 caacctcaaacatttttct 28492879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21543697 - 21543583
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  21543697 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 21543599  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||  ||||||||||    
T  21543598 gcatagaaagtctctt 21543583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Original strand, 20867232 - 20867383
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| |  |||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20867232 atatcttagaaattcttaagtct--agagtcttttactgcattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtg 20867328  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctct 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||  ||||||||    
T  20867329 taattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 20867383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23926715 - 23926608
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaa 177  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||      
T  23926715 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattgg 23926617  T
Q  178 aagtctctt 186  Q
    |||||||||    
T  23926616 aagtctctt 23926608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 187
Target Start/End: Original strand, 52351103 - 52351218
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  52351103 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 52351201  T
Q  171 gcattaaaagtctctta 187  Q
    ||||   ||||||||||    
T  52351202 gcataggaagtctctta 52351218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20251434 - 20251348
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20251434 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 20251348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22642553 - 22642467
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22642553 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 22642467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28473889 - 28473803
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28473889 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 28473803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 34255939 - 34256053
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | ||| ||||    
T  34255939 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-ataagaagtctcttgctttagtgcttga 34256037  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||| | |||||||||    
T  34256038 gcataagaagtctctt 34256053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Original strand, 2819668 - 2819834
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2819668 cacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctaaagtcttaagagtatg-atttgttttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagt 2819766  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcatt 175  Q
    |||||| | ||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2819767 gttcaaac-caaacatatttctttgtaatt-tgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatt 2819834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22655135 - 22655050
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22655135 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttg 22655050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17370742 - 17370614
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17370742 atatcttagaaattcttaagtctatagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgt 17370643  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17370642 gtaattctatttgaa-tagaagtctcttgc 17370614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22018983 - 22018904
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22018983 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 22018904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5929367 - 5929281
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5929367 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 5929281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28379653 - 28379567
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28379653 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 28379567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 46181297 - 46181410
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  46181297 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 46181394  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||  |||||||||    
T  46181395 gcattggaagtctctt 46181410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48703779 - 48703680
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  48703779 tctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaa 48703683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Original strand, 26548679 - 26548764
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26548679 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttg 26548764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 19170748 - 19170834
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19170748 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 19170834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Original strand, 22610354 - 22610503
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22610354 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtg 22610449  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctc 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||    ||| |||||||||| |||||||    
T  22610450 taattctgtttg-attagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctc 22610503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44200675 - 44200589
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44200675 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttg-attagaaatctcttgc 44200589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 45071046 - 45071132
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45071046 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 45071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 24029106 - 24029179
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24029106 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaccattttctgtgtaattctgtttgaat 24029179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19037642 - 19037579
Alignment:
Q  94 gtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19037642 gtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 19037579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 175
Target Start/End: Original strand, 20884300 - 20884402
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  20884300 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 20884397  T
Q  171 gcatt 175  Q
    |||||    
T  20884398 gcatt 20884402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31359048 - 31358942
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||  || || ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  31359048 tcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattttagagtctt-agagtctcaat-tgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaag 31358951  T
Q  104 tgttcaacc 112  Q
    |||||||||    
T  31358950 tgttcaacc 31358942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 142
Target Start/End: Original strand, 7745504 - 7745575
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7745504 ttgtattgtgaacacccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttga 7745575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 313
Target Start/End: Original strand, 14293190 - 14293286
Alignment:
Q  215 ttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  14293190 ttgcagttgtgtttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaaccggatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 14293286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 8698578 - 8698474
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8698578 cacttagaatttcttaacaactttcgtatcttagaaattctagagttttaagagtc-ggatgtgttttttattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 8698480  T
Q  105 gttcaa 110  Q
    ||||||    
T  8698479 gttcaa 8698474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26703276 - 26703132
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaa---gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttct 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |    
T  26703276 atatcttataaattctagagtcttaataagagtct-tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaac-caaacatctttat 26703179  T
Q  127 gtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
     ||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  26703178 atgtaattttgtttg-tttataagtctcttgcttttgtgcttgagcat 26703132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38281877 - 38281803
Alignment:
Q  234 atttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  38281877 atttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 38281803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 41132996 - 41133118
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  41132996 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagagttcaaagtcaaacaattttctgtg 41133092  T
Q  130 taa-ttctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||    
T  41133093 taatttatgtttg-attagaagtctct 41133118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 14388506 - 14388627
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  14388506 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttttgtg 14388601  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  14388602 taattctgtttgattaagaagcctct 14388627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 18311390 - 18311462
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18311390 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattatgtttgaat 18311462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 313
Target Start/End: Original strand, 28492888 - 28492945
Alignment:
Q  254 tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  28492888 tttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 28492945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 675235 - 675153
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  675235 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttatgtgtaattttgtttg-attagaagcctct 675153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 5650684 - 5650797
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  5650684 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 5650781  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  5650782 gcattagaagtctctt 5650797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12944999 - 12944914
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  12944999 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaa-tagaagcctcttgc 12944914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 175
Target Start/End: Original strand, 21684469 - 21684579
Alignment:
Q  63 tatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggtt 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| |  ||    
T  21684469 tatctgatttgtattgtgaacatcagtgattgtatatcaagtgttcaa-agcaaacatctttctgtgtaattttgttt-atttagaaatctctttctttt 21684566  T
Q  163 gtgtttgagcatt 175  Q
    ||| |||||||||    
T  21684567 gtgcttgagcatt 21684579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 23935442 - 23935533
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtat 97  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23935442 cacttagaatttcttaacaactttcatatgttaaaacttctagagtattaagagtctg-acttgttttgtattgtgatcaccactgattgtat 23935533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19178749 - 19178636
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  19178749 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 19178652  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  19178651 gcattagaagtctctt 19178636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19187628 - 19187515
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  19187628 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 19187531  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  19187530 gcattagaagtctctt 19187515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22666064 - 22666009
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtct 61  Q
    |||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22666064 actttgaatatcttatcaaagtttgtatcttagaaattctaaagtcttaagagtct 22666009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 23975274 - 23975324
Alignment:
Q  12 aatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctg 62  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23975274 aatttcttaacaactttcatatcttagaaatattagagtcttaagagtctg 23975324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20798766 - 20798689
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20798766 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20798689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39586798 - 39586721
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  ||| |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39586798 atatcttagaaattcaaaagtct--agagtctgtatcgtatt-gtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaa 39586721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 47195090 - 47195013
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||  ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47195090 atatcttagaaattcaaaagtct--agagtctttatcgtatt-gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 47195013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17957022 - 17956944
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  17957022 gtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaagatcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-cagaagtctcttgc 17956944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 101)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 18321589 - 18321897
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18321589 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 18321688  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18321689 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttaattgtgttcagga 18321787  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||    
T  18321788 gcataggaaatctcttgcag-tgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtattcagatattac--tttttagtaaact 18321884  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  18321885 ttccttggaagtg 18321897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25163791 - 25163481
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25163791 agttcacttagaatttcttatcaaagtttatatcttagaaattctagagttttaagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 25163692  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| ||    
T  25163691 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaaatctcttgattgtgttcagga 25163592  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25163591 gtataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 25163494  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  25163493 ctccttggaagtg 25163481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9320289 - 9319980
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  9320289 agttcacttagaatttctcatcaaagctcatatctttgaaattctagagtcttaagaatctgtatttgatttgtattgtgagcatcactgattgtatatc 9320190  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  9320189 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 9320091  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9320090 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac--tttttagtgaac 9319994  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  9319993 tctccttggaagtg 9319980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43639501 - 43639193
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  43639501 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 43639402  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  43639401 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcagg 43639302  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  43639301 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 43639207  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  43639206 tctccttggaagtg 43639193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19942954 - 19942646
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19942954 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaatagtccgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 19942855  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19942854 aagtgttca-cctcaaacatttttctttgtaattctgtttga-ttataagtctcttgcagttgtgcttgaccattagaagtctcttgattgtattcaaga 19942757  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19942756 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctttctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 19942659  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  19942658 ctccttggaagtg 19942646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18679534 - 18679228
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  18679534 agttcacttagaatttcttatcaaggttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgaattgtattgtgaacaccactcattgtatatc 18679435  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||    
T  18679434 aagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttacagttgtgcttgagcattagaagtctcttgactgtgttcagga 18679335  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18679334 gcataggaagtctcttgaagttgtgtttgag-aatttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcatttgtaatcagatattaca-tttttagtgaact 18679237  T
Q  301 atccttgga 309  Q
     ||||||||    
T  18679236 gtccttgga 18679228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18718723 - 18718417
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  18718723 agttcacttagaatttcttatcaaggttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgaattgtattgtgaacaccactcattgtatatc 18718624  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||    
T  18718623 aagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttacagttgtgcttgagcattagaagtctcttgactgtgttcagga 18718524  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18718523 gcataggaagtctcttgaagttgtgtttgag-aatttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcatttgtaatcagatattaca-tttttagtgaact 18718426  T
Q  301 atccttgga 309  Q
     ||||||||    
T  18718425 gtccttgga 18718417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 20255941 - 20256253
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  20255941 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttcaaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcgctgattgtatatc 20256040  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  20256041 aagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 20256140  T
Q  200 aacataggaaatctcttgc-agttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20256141 agcataggaaatctcttgcaagttgtgcttgggtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaa 20256238  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  20256239 ctctccttggaagtg 20256253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43644616 - 43644310
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  43644616 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 43644517  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||  | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  43644516 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgctcgaa-tagaagtctcttgcagttacgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 43644418  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  43644417 tcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgttggttttagcagtgagcagttgtaatcagatatt--atattttagtgaact 43644320  T
Q  301 atccttggaa 310  Q
     |||||||||    
T  43644319 ctccttggaa 43644310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 45538868 - 45539153
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  45538868 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagcctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 45538967  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  45538968 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 45539067  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcag-ttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    | |||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45539068 agcatatgaagtctcttgcagtttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaataagatattac 45539153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39693254 - 39692968
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  39693254 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaatgattgtatatc 39693155  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  39693154 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttacagttgcgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 39693055  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39693054 agcataggaagactcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttaggagtgagcagttgtaatcagatattacat 39692968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21932599 - 21932315
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21932599 ttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttataaatcctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 21932500  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  21932499 gtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttcaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggag 21932401  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932400 cataggaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtatgttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 21932315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 40845818 - 40846128
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  40845818 agttcacttagaatttcttataaaaactcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 40845917  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  40845918 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 40846017  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattg---taatcagatattacattttttagtg 296  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||     |||||    
T  40846018 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaataatcagatattaca-----tagtg 40846111  T
Q  297 aactatccttggaagtg 313  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40846112 aactctccttggaagtg 40846128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 15336519 - 15336828
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  15336519 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctatagtctttagagtcagtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatc 15336618  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||| |||||| |    
T  15336619 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatagaagtctcttgattatgttcagg 15336717  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  15336718 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagaaattgcaatcagatattac--tttttagtgaac 15336814  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  15336815 tctccttggaagtg 15336828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 15425584 - 15425893
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  15425584 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctatagtctttagagtcagtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatc 15425683  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||| |||||| |    
T  15425684 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatagaagtctcttgattatgttcagg 15425782  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  15425783 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagaaattgcaatcagatattac--tttttagtgaac 15425879  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  15425880 tctccttggaagtg 15425893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 15516888 - 15517197
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  15516888 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctatagtctttagagtcagtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatc 15516987  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||| |||||| |    
T  15516988 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatagaagtctcttgattatgttcagg 15517086  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  15517087 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagaaattgcaatcagatattac--tttttagtgaac 15517183  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  15517184 tctccttggaagtg 15517197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29693033 - 29692723
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29693033 agttcacctataatttcttatcaaagttcatatcttagaagttctatagttttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 29692934  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  29692933 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttaagg 29692834  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29692833 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagtagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 29692737  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  29692736 tctccttggaagtg 29692723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23264056 - 23264342
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23264056 agttcacttataatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 23264155  T
Q  101 aagtgttcaa-cctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23264156 aagtgctcaacccacaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctattgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttcattgtgttcaa 23264255  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23264256 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca--ttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 23264342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45292554 - 45292269
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  45292554 agttcacttagaatttcttaacaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 45292455  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  45292454 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaggtctattgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 45292355  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45292354 agcataggaagtctcttgcagttgt--ctgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 45292269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 17526163 - 17526476
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  17526163 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 17526262  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgt---gtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttc 196  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |   |||||| |||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17526263 aagtgttcaacctcaaacgttttttttttttgtaattttgtttgaatttaaaagtctcttgcagctgtgcttgagcattataagtctcttgattgtgttc 17526362  T
Q  197 aagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtg 296  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17526363 aggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttcag-catttgaactctcttgctatgtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtg 17526459  T
Q  297 aactatccttggaagtg 313  Q
    |||| ||||||||||||    
T  17526460 aactctccttggaagtg 17526476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 19956768 - 19957078
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19956768 agtttacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 19956867  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    ||| ||||||||   |||||| || ||| |||||  ||    
T  19956868 aagtgttcaacttcaaacaaatttctttgtaattatgtttgaa-tagaagtctcttgcttgcgtgcttgagcataggaagtctattgattttgttcttga 19956966  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaa-tttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19956967 gcataggaaatctcttgcagttgtgattgagtaagttttaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 19957064  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  19957065 tctccttggaagtg 19957078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 20382824 - 20383053
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  20382824 agttcacttagaatttcttaacaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 20382923  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |    
T  20382924 aagtgttcaacctcaaacatttttcgttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaaatctcttgattgtgttcagg 20383023  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttg 229  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20383024 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttg 20383053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 18121539 - 18121848
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  18121539 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctaatttctattatgaacaccactgattgtatatc 18121638  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  18121639 aagtgttcaacctcaaacatttttct-agtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 18121737  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  18121738 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttga-acatttgaagtctcttgatggttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--tagtagtgaac 18121834  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  18121835 tctccttggaagtg 18121848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 17442251 - 17442536
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  17442251 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagaggttgtatctga-ttgtattgtgaacaccactgattgtgtatc 17442349  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  17442350 aagtgttcaacatcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtttcttgcagttgtgctggagcataagaagtctcttgattgtgttcagg 17442449  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17442450 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctctttctatttttagtagtgagcaattgtaatcagatattacat 17442536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 13431060 - 13431338
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||         ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13431060 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtct---------gtatcagatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13431150  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  13431151 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctattgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 13431250  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13431251 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtcttttactaagtttagtagtgagcatttgcaatcagatattacat 13431338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 22462068 - 22462379
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22462068 agttcaattagaatttcttaacaactttcatatcttacaaattctagagtcttaaaagtctgtatctgatttgtatggtgaacaccactgattgtatatc 22462167  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||  ||    
T  22462168 aagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgttt-aaatagaagtctcttgtaggtgtgcttgagcatatgaagtctcttgatttagttcttga 22462266  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22462267 gcataggaaatctgttgcacttgtatttgagtagtttaaagtctcttgcaagttttagcagtgagtagttttaatcagatattaca-tttttagtgaact 22462365  T
Q  301 atccttggaagtga 314  Q
     |||||||||||||    
T  22462366 ctccttggaagtga 22462379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24646051 - 24645779
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  24646051 agttcacttagaatttcttattaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatc 24645952  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttc-tgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  24645951 aagtgttcaacctcaaacatttttcttttctaattctgttagaattataagtctcttgcagttgttcttgagcattagaagtctcttgattgtgttgagg 24645852  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgta 273  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  24645851 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgta 24645779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 33560646 - 33560954
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  33560646 agttcacttagaatttcttaacaaagcttacatcttaggaaatctagaatctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 33560745  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| ||  |||||| |    
T  33560746 aagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcagg 33560845  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  33560846 agcataggaagtatcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 33560940  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  33560941 tctccttggaagtg 33560954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17797140 - 17796854
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  17797140 agttcacttagaatttcttatcaactttcatattttagaaattatagagtcttaagagactgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatc 17797041  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  17797040 aagtgttcaacctcaaatatttttct-tgtaattttgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 17796942  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc-aaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17796941 agcataagaagtctcttgcagttgtgcttga-ccatttgaagtctcttgctagtttttagtagtgagcaattgtaatcagatattacat 17796854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19707226 - 19706926
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  19707226 ttcacttagaatttcttatgaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 19707127  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| | | || ||||||||   |||||| || |||||||||| || |    
T  19707126 gtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-taaaagtctcctgcagctatgcttgagcataggaagtctattgattgtgttcaggagc 19707028  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactat 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||       || |||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  19707027 ataggaaatctcttgcagtt-tg-------aaattgaagtctcttgctagttttaggagtgagaagttgtaattagatattaca-tttttagtgaactct 19706937  T
Q  303 ccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||    
T  19706936 ccttggaagtg 19706926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43773840 - 43773531
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  43773840 agttcacttagaatttcttaacaaagtttacatcttaggaattttagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 43773741  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  43773740 caagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgtttgaattgagaagtctattgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcag 43773641  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||     |||||||    
T  43773640 gagcataggaagtatcttgcagttgtgcttaagcaagttgaaatctcttgctagttttagcagagagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaa 43773546  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  43773545 ctctccttggaagtg 43773531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18772413 - 18772102
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  18772413 agttcacttaaaatttcttatcaactttcgtatcttagaaaatctagagtctcaaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccgctgattgtatat 18772314  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||   ||||||||| |||  ||||  |    
T  18772313 caagtgttcaacctgaaacaaatttctttgtaattctgtttgaataa-aagtctcttgcagttatgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttg 18772215  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18772214 agcataggaaatctcttgcagttgtacttgagtagtttgaagtctcttgctagtgttagcagtgagcagttgtaatcagatattac-ttttttagtgaac 18772116  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  18772115 tctccttggaagtg 18772102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1744872 - 1744635
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  1744872 agttcacttagaatttattaacaaagtttacatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 1744773  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||| ||| |||||| |    
T  1744772 aagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattttgtttgaattgagaagtctcttgcagttttgattgagcaatagaagtctcttgattatgttcatg 1744674  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 238  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1744673 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 1744635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16207015 - 16206770
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  16207015 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattatag--tcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaaaaccactgattgtatatc 16206918  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  16206917 aagtgttcaacctcaaacatttttct-agtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcatttttgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 16206819  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    | |||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16206818 agcatatgaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgc 16206770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6407445 - 6407230
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  6407445 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccattgattgtatatc 6407346  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat-tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  6407345 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatcaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 6407247  T
Q  200 aacataggaaatctctt 216  Q
    | |||||||| ||||||    
T  6407246 agcataggaagtctctt 6407230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 30421866 - 30422081
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  30421866 ttcacttagaatttcttatcaactttcacatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 30421965  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||     
T  30421966 gtgttcgacctcaaac-attttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattctgttcaggag 30422064  T
Q  202 cataggaaatctcttgc 218  Q
    |||||||| ||||||||    
T  30422065 cataggaagtctcttgc 30422081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 14989882 - 14990068
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14989882 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14989981  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| || || |||||||||    
T  14989982 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgatcaatagaagtctctt 14990068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18152078 - 18152264
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18152078 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 18152177  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  18152178 aagtgttcaacttcaaaccattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctctt 18152264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26832742 - 26832486
Alignment:
Q  54 aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtct 153  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26832742 aagagtccgtatatgatttatattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaat-agaagtct 26832644  T
Q  154 cttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaag 253  Q
    ||||| ||| || ||||||||   ||||||||| | |  ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |      
T  26832643 cttgcagttttgcttgagcataggaagtctcttgacttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagt 26832544  T
Q  254 tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||||| || |||||||||    
T  26832543 tttagcagtgagcagttgtaatcagatatt--ttcttttagtgaactctctttggaagtg 26832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 14990493 - 14990679
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14990493 agttcacttaaaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14990592  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  14990593 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaattcataagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctctt 14990679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Original strand, 12758270 - 12758470
Alignment:
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||| | || |    
T  12758270 tgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtcttttgcagttgtgcttgagcattagaagtcttttgattgtgtttaggagc 12758369  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactat 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  12758370 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttaaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactct 12758466  T
Q  303 cctt 306  Q
    ||||    
T  12758467 cctt 12758470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22662836 - 22662650
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  22662836 agttctcttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 22662737  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| | || |||||||||    
T  22662736 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttgagtaatagaagtctctt 22662650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22707973 - 22707777
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaa 177  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||       
T  22707973 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttataattatgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatg 22707875  T
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaat 275  Q
    ||||||||| ||| |||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||    
T  22707874 aagtctcttgattttgttcttgagcatagggaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagtttgagcagtgagcatttgtaat 22707777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 313
Target Start/End: Original strand, 15934236 - 15934402
Alignment:
Q  146 agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctc 245  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15934236 agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatatcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctc 15934335  T
Q  246 ttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15934336 ttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaactctccttggaagtg 15934402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 313
Target Start/End: Original strand, 16681803 - 16681993
Alignment:
Q  121 ttttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgca 219  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16681803 ttttctttgtgattctgtttgaatttagaagtctcttggagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgca 16681902  T
Q  220 gttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    | |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  16681903 gctgtgtttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttagaagtg 16681993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22673548 - 22673362
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||    
T  22673548 agttctcttagaatttcttatcaaagctcatgtcttagaaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtatagtgaacaccggtgattgtatatc 22673449  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||| || | |||||||    
T  22673448 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagacgtctctt 22673362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16188700 - 16188563
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  16188700 tcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattccagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacactagtgattgtatatcaag 16188601  T
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16188600 tgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtttg 16188563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36104916 - 36104774
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  36104916 agttcacttagaatttcgtatcaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 36104817  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt 145  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36104816 aagtg-tcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatt 36104774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17701461 - 17701326
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  17701461 agttcacttataatttcttatcaaagttaatatcttagaaattatagagtcgtaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 17701362  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  17701361 aagtgttcaacctcaaataatattctttgtaattct 17701326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19153653 - 19153443
Alignment:
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacat 204  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||    
T  19153653 ttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtttcctgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagtagcat 19153554  T
Q  205 aggaaa-----tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    |||||      ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19153553 aggaagggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaggtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 19153457  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  19153456 tctccttggaagtg 19153443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 14990668 - 14990830
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14990668 tagaagtctcttgcagttgtgtttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtct 14990766  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  14990767 cttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 14990830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 186
Target Start/End: Original strand, 15934113 - 15934246
Alignment:
Q  52 ttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15934113 ttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattttgtttgaa-tagaagt 15934211  T
Q  152 ctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||    
T  15934212 ctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctctt 15934246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 14990057 - 14990219
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14990057 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtct 14990155  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||     | ||||||||| ||||||||||||    
T  14990156 cttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatatta-----tatagtgaactctccttggaagtg 14990219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 18152253 - 18152415
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18152253 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagcaacataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtct 18152351  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  18152352 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 18152415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17928744 - 17928633
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||    
T  17928744 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcagacatttttttttg 17928645  T
Q  130 taattctgtttg 141  Q
    ||||| ||||||    
T  17928644 taattgtgtttg 17928633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12193633 - 12193515
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12193633 agttcacttagaatttcttagcatctttcatattttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 12193534  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaaca 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12193533 aagtgttcaacctcaaaca 12193515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12438061 - 12437943
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12438061 agttcacttagaatttcttagcatctttcatattttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 12437962  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaaca 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12437961 aagtgttcaacctcaaaca 12437943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18557742 - 18557505
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||    
T  18557742 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtctta----------tctgatttgtatttgtgaacaccacttattgtatat 18557653  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||   |||||||||   | ||| |  |    
T  18557652 caactgttaaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttg 18557555  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18557554 aacataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtgtcttgc 18557505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22673373 - 22673211
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22673373 tagacgtctcttgtagttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtct 22673275  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  22673274 cttaataagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 22673211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 25850433 - 25850671
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  25850433 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagag---------tctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatc 25850523  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||| ||   ||| |||||   | | | |  ||    
T  25850524 aagtgttcaacctcaaacatatttttgtgtaattgtgtttg-tttagaagactcttgcttttgtgcttgagtataggaagactcttgtgtttatgcttga 25850622  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25850623 gcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 25850671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2810506 - 2810357
Alignment:
Q  24 aagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2810506 aagttcatatcttagaaattcctaagtcttaaagagtctgtatcggatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatat 2810407  T
Q  123 ttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagca 173  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  2810406 ttctttgtaattctgtttg-attataactctcttgcagttgtgcttgagca 2810357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 1210173 - 1210328
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  1210173 agttcacttagaatttcttataaactttcatatattagaaattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 1210272  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  1210273 aagtgtccaaac-caaacatctttctgtgtaattttgtttg-tttagaagtcttttgc 1210328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 19155963 - 19155854
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19155963 agttcacttagaatttcttaacagctttcatatcgtagaaattctagaatcttaaaagtttgtatctgatttgtattgtgagcaccactgattgtatatc 19155864  T
Q  101 aagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||    
T  19155863 aagtgttcaa 19155854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22662661 - 22662498
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgc-ttgagtaatttgaagtc 243  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||   || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  22662661 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttttggagcataggaagtctcttgcagttgtgctttgag-catttgaagtc 22662563  T
Q  244 tcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  22662562 tcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 22662498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21288055 - 21287849
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  21288055 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 21287957  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaatt 270  Q
    ||||   |||||||||  |||||| |  || || ||||| ||||||||   ||| |||||| ||||||||||||| | | | || ||| | |||||| ||    
T  21287956 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtacttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagtt 21287857  T
Q  271 gtaatcag 278  Q
    ||||||||    
T  21287856 gtaatcag 21287849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 45568416 - 45568622
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  45568416 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 45568514  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaatt 270  Q
    ||||   |||||||||  |||||| |  || || ||||| ||| ||||   |||||||||| ||||||||||||| | | | || ||| | |||||| ||    
T  45568515 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtcttttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagtt 45568614  T
Q  271 gtaatcag 278  Q
    ||||||||    
T  45568615 gtaatcag 45568622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 17917250 - 17917389
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||  |  ||| |||||||||||    
T  17917250 gttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagttttaagagtttgtatctaatttttattgtgaatatcactaattgtatatca 17917349  T
Q  102 agtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttg 141  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  17917350 agtgttcaaacctcaaac-attttctgtataattatgtttg 17917389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21540647 - 21540432
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21540647 atatcttagaaattcttaagtctaaagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaaactcaaacaattttctgt 21540548  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||| ||||||||   |||||||||   ||||| |  || || ||||| ||||||||    ||||||    
T  21540547 gtaattctgtttgaa-tagaagtctctttctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcatgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgctt 21540449  T
Q  229 gagtaatttgaagtctc 245  Q
    ||| |||||||||||||    
T  21540448 gagcaatttgaagtctc 21540432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21298665 - 21298579
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21298665 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 21298579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 22211798 - 22211911
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  22211798 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 22211896  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    |||||  ||||||||    
T  22211897 gcattggaagtctct 22211911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Original strand, 19505897 - 19506040
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| || | ||||||  ||||| ||    
T  19505897 atatcttaaaaattctagagtcttaagaatctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgtttaaac-caaacatctttctatg 19505995  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcatt 175  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  19505996 taattttgtttg-tttagaagtctcttacttgtgtgtttgagcatt 19506040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8031679 - 8031593
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8031679 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 8031593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 12758194 - 12758269
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtat 76  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12758194 agtttacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtat 12758269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 17519558 - 17519644
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17519558 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 17519644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19460840 - 19460754
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19460840 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 19460754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19558518 - 19558432
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19558518 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 19558432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28903119 - 28903033
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28903119 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 28903033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29379230 - 29379144
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29379230 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 29379144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40002863 - 40002793
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40002863 actgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 40002793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2810379 - 2810285
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttgg 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||    
T  2810379 tctcttgcagttgtgcttgagcagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcaaatattac---ttttagtgaactctccttgg 2810285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 22167431 - 22167544
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    ||| ||||    
T  22167431 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctctcgcctgcgtgcttga 22167528  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  22167529 gcattagaagtctctt 22167544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 22136266 - 22136348
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22136266 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctct 22136348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 23271616 - 23271702
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23271616 ttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaatcctgtttgaa-tagaagtctcttgc 23271702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Original strand, 16681734 - 16681804
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgattt 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16681734 gttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaatgtctaaagtcttaagagtctgtatctgattt 16681804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Original strand, 7018805 - 7018872
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7018805 actgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttg-attagaagtctct 7018872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 12541358 - 12541254
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12541358 cactcagaatttcttaacaactttcttatcttaaaaattctagaaacttaagagtctg-atttgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 12541260  T
Q  105 gttcaa 110  Q
    ||||||    
T  12541259 gttcaa 12541254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 33052591 - 33052487
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||| | |||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |    
T  33052591 cacttaaattttcttaataactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctg-atttgttttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaaat 33052493  T
Q  105 gttcaa 110  Q
    ||||||    
T  33052492 gttcaa 33052487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3843432 - 3843322
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  3843432 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtg 3843337  T
Q  130 taattctgtttgaat 144  Q
    ||||| |||||||||    
T  3843336 taattttgtttgaat 3843322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16206777 - 16206681
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||    
T  16206777 tctcttgctgttgtgcttgagca-tttgaagtctattgctagttttagcattgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaa 16206684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 20259988 - 20260108
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  20259988 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtg 20260083  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  20260084 taattttgtttg-attagaagcctct 20260108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 21046618 - 21046738
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21046618 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtg 21046713  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  21046714 taattttgtttg-attagaagcctct 21046738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Original strand, 24678881 - 24678984
Alignment:
Q  54 aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtct 153  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||| |||||   ||||||||||    
T  24678881 aagagtatgtatgtgatttgtattgtgatcaccattgattgtatatcaagtgttcaaccttaaacatatttatgggtaattgtgttt-ttttagaagtct 24678979  T
Q  154 cttgc 158  Q
    |||||    
T  24678980 cttgc 24678984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6407239 - 6407169
Alignment:
Q  238 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  6407239 gaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 6407169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17879276 - 17879222
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaat 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17879276 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaacaattttctttgtaat 17879222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18449243 - 18449130
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  18449243 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 18449146  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  18449145 gcattagaagtctctt 18449130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 18685827 - 18685862
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatctt 36  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18685827 agttcacttaaaatttcttaacaaagttaatatctt 18685862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 18731421 - 18731456
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatctt 36  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18731421 agttcacttaaaatttcttaacaaagttaatatctt 18731456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19128621 - 19128508
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  19128621 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 19128524  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  19128523 gcattagaagtctctt 19128508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19139153 - 19139040
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  19139153 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 19139056  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  19139055 gcattagaagtctctt 19139040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24635032 - 24634927
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||| |||||||||  ||  || ||||||||||||||||  ||||||| |||| || || || ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  24635032 cacttataatttcttataaactttcatatcttagaaattcttaagtctta-gagtatgaat-tgttttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagt 24634935  T
Q  105 gttcaacc 112  Q
    ||||||||    
T  24634934 gttcaacc 24634927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27739533 - 27739492
Alignment:
Q  70 tttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaac 111  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27739533 tttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaac 27739492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 174)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 8874551 - 8874862
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  8874551 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatc 8874650  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  8874651 aagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttaagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 8874750  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8874751 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttggcagtgagcagttgtaatcaaatattaca-tttttagtaaact 8874849  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  8874850 ctccttggaagtg 8874862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 17239354 - 17239664
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  17239354 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacgccactgattgtatatc 17239453  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  17239454 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 17239553  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17239554 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagat-ttaca--ttttagtgaac 17239650  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  17239651 tttccttggaagtg 17239664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 12963516 - 12963827
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12963516 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 12963615  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  12963616 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 12963715  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12963716 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttcaaagctcttgctaagtttatcattgagcagttgtaatcagatattac--tttttagtgaac 12963813  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  12963814 tctccttggaagtg 12963827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 14393435 - 14393725
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14393435 agttcacttagaatttcttaccaaagttcatatcttagaaattataaagtcttaagagtttgtatctgatttgtattatgaacaccactaattgtatatc 14393534  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  14393535 aagtgttcaacctcaaacgattttatgtgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 14393634  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14393635 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttt 14393725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16032320 - 16032012
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  16032320 ttcacttagaatttcttaacaaagttcatatcttagaaattttagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 16032221  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| || |    
T  16032220 gtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggagc 16032122  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactat 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  16032121 ataggaaatctcttgcacttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattaca-tttttagtgaactct 16032023  T
Q  303 ccttggaagtg 313  Q
     ||| ||||||    
T  16032022 tcttagaagtg 16032012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28581831 - 28581524
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  28581831 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 28581732  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  28581731 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagc 28581633  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  28581632 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtttcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 28581538  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  28581537 tctccttggaagtg 28581524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40799623 - 40799316
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  40799623 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtttctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 40799524  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  40799523 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 40799425  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  40799424 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagaagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 40799330  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||||    
T  40799329 tatccttggaagtg 40799316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 22804453 - 22804744
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22804453 agttcacttagaatttcttatcaaaattcatatcttagaaattctagagtcttaaaagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22804552  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  22804553 aaatgttcaacctcaaacaaatttcttagtaattctgtttgaattttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcag 22804652  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22804653 gagcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtttcttgttaaatttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttt 22804744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6090456 - 6090144
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||     
T  6090456 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagttttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatg 6090357  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  6090356 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 6090257  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  6090256 agcgtaggaagtctcttgcagttgtacttgagcaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagaagttgtaatcagatactaca-tttttagtgagc 6090158  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  6090157 tctccttggaagtg 6090144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 29951869 - 29952157
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29951869 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 29951968  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  29951969 aagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtttgaa-tagaagtcttttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 29952067  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29952068 gcacaagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttt 29952157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11223290 - 11223004
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  11223290 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatc 11223191  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  11223190 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgaccattagaagtctcttgattgtgttcagg 11223091  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11223090 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcggtgagcaattgtaatcagatattacat 11223004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 38178077 - 38178362
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  38178077 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 38178176  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  38178177 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaagtaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 38178275  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38178276 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 38178362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 13781017 - 13781323
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  13781017 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattcgagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 13781116  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13781117 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgtagttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcagg 13781216  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  13781217 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatatttca--ttttagtgaac 13781313  T
Q  300 tatccttgga 309  Q
    | ||||||||    
T  13781314 tctccttgga 13781323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20645881 - 20645571
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||    
T  20645881 agttcacttagaatttcttattaaagttcatatcttagaaattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactaattgtatatc 20645782  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  20645781 aagtgttcaacctcaaataattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 20645682  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||    
T  20645681 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaaa--ttttggtgaac 20645585  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  20645584 tctccttggaagtg 20645571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 30001023 - 30001311
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  30001023 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgagttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 30001122  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  30001123 aagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtttgaa-tagaagtcttttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 30001221  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30001222 gcacaagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttt 30001311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Original strand, 49643195 - 49643503
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  49643195 ttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaa 49643294  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  49643295 gtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggag 49643394  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  49643395 cataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgaccagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactc 49643491  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    |||||| |||||    
T  49643492 tccttgaaagtg 49643503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 47405855 - 47406142
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  47405855 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 47405954  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |    
T  47405955 aagtgttcaatctcaaatatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtattcagg 47406054  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47406055 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 47406142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2560913 - 2560603
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  2560913 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatc 2560814  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  2560813 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 2560715  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2560714 agcataggaagtctattacagttgtgtttgag-catttgaagtctgttgataagtttagcagtaagcaattgtaatcagatattaca-tttttagtgaac 2560617  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  2560616 tctccttggaagtg 2560603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5213304 - 5212998
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5213304 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagattctgtatctgatttgtattgtgaacactactgattgtatatc 5213205  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||      
T  5213204 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaga 5213106  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||    
T  5213105 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaataagatattaca-----tagtgaac 5213012  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  5213011 tctccttggaagtg 5212998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33582957 - 33582650
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  33582957 agttcacttagaacttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacaccacttattgtatatc 33582858  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| || |||||||||| |    
T  33582857 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgttcagg 33582759  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  33582758 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactatgtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 33582664  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  33582663 tctccttggaagtg 33582650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31303072 - 31302767
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||    
T  31303072 gttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccattgattgtatatca 31302973  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||    
T  31302972 agtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tagaagtctcttgattgtgttcagga 31302874  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||    
T  31302873 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcaggtattaca-----tagtgaact 31302780  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  31302779 ctccttggaagtg 31302767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3238419 - 3238109
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  3238419 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaagttctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgtttgtatat 3238320  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||| ||||||||||     
T  3238319 caagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcag 3238221  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3238220 gagcataggaagtcgcttgcagttgcgcttgag-aatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaa 3238124  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  3238123 ctctccttggaagtg 3238109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 20627866 - 20628151
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  20627866 agttcacttagaatttcttatcaactttcacatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 20627965  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||| |    
T  20627966 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaattctcttgattgtattcagg 20628064  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca 286  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20628065 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattaca 20628151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41494724 - 41494416
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  41494724 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 41494625  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| || |||||||||| ||    
T  41494624 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgttt-aaatagaagtctcttgcatttgtgcttgagcataagaagtctattgattgtgttcagga 41494526  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  41494525 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgttaagtttagcaatgagcagttgtaatcagatattaca--ttatagtgaact 41494429  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  41494428 ctccttgaaagtg 41494416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 46350278 - 46350586
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  46350278 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 46350377  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  46350378 aagtattcaacatcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcctgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 46350477  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc-aaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  46350478 agcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagtttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaa 46350572  T
Q  299 ctatccttggaagt 312  Q
    || |||||||||||    
T  46350573 ctctccttggaagt 46350586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47207430 - 47207123
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  47207430 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 47207331  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||      
T  47207330 aagtgttcaacctcaaatatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtcttttgattgtgttcaga 47207232  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  47207231 agcatatgaagtatcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 47207137  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  47207136 tctccttggaagtg 47207123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 12726663 - 12726976
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagc----actactgattgta 96  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||      || |||| |||||    
T  12726663 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaattaaaaccactggttgta 12726762  T
Q  97 tatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttc 196  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  12726763 tatcaaatgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttc 12726862  T
Q  197 aagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtg 296  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12726863 aggagcataggaagtctcttgcagttgtgctttag-catttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtg 12726959  T
Q  297 aactatccttggaagtg 313  Q
    |||| |||||| |||||    
T  12726960 aactctccttgaaagtg 12726976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21640593 - 21640306
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21640593 agttcacttagaatttcttatcaaagcgtatatcctaggaattctagagtctatagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21640494  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  21640493 aagtgttcaacttcaaacaatattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcagg 21640394  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21640393 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 21640306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 313
Target Start/End: Original strand, 30054616 - 30054920
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  30054616 tcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtttctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaag 30054715  T
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  30054716 tgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttaattgtgttcaggagc 30054815  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactat 302  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| |    
T  30054816 atagaaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttag-tgtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactct 30054909  T
Q  303 ccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||    
T  30054910 ccttggaagtg 30054920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 49553933 - 49554214
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||    
T  49553933 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttaggaattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtaaatc 49554032  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49554033 aagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaaga 49554132  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  49554133 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtcttttgctagttttagcagtgaacaattg--atcagatattac 49554214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12968035 - 12967725
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  12968035 agttcacttagaatttcttaacaaatttcatatcttagaaattctagagtctcaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatg 12967936  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||| || |||  |||   ||    
T  12967935 aagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagaattggaagtcttttgatttagttattga 12967837  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12967836 gcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgactagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaact 12967738  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  12967737 ctccttgaaagtg 12967725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40850703 - 40850416
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  40850703 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctaaagtctttagagtttttatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 40850604  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  40850603 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtacttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 40850504  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40850503 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaactctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 40850416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15902923 - 15902634
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15902923 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 15902824  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  15902823 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaga 15902724  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    | |||| ||| ||||||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  15902723 agcatacgaagtctcttgtaattgtgcttgag-catttgaagcctcttgcaaagtttagcagtgagtagttgtaatcagaaattacatttt 15902634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 9700472 - 9700757
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||    
T  9700472 tcacttagaatttcttaacaaagcttgcatcttaggaattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaa 9700571  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||     
T  9700572 gtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggag 9700671  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9700672 cataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 9700757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 26418107 - 26418418
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  26418107 agttcacatagaatttcttaacaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 26418206  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
     | |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||   |||  |    
T  26418207 taggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttatttcttg 26418305  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26418306 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagattgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaac 26418404  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | | ||||||||||    
T  26418405 tctacttggaagtg 26418418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 1728448 - 1728735
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  1728448 agttcacttagaatttcttaacaaagctcacatcttaggaattctatagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 1728547  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||| ||  |||||| |    
T  1728548 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcagg 1728647  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1728648 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgaacaattgtaatcagatattacat 1728735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13823790 - 13823485
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||    
T  13823790 ttcacttagaacttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacatattgtatatcaa 13823691  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  13823690 gtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggag 13823591  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||     
T  13823590 cataggaagtctcttgtagttgtgcttga-acatttgaagtctcttgatggttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactc 13823497  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  13823496 tccttggaagtg 13823485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12396794 - 12396515
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||    
T  12396794 agttcacttataatttcttatcaaatttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatttc 12396695  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||  ||    
T  12396694 aagtgctcaacctcaaataattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgattttgttcttga 12396596  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagata 281  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396595 gcatagaaaatctcttgtagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctatttttagcagtgagcaattgtaatcagata 12396515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 53057162 - 53057445
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  53057162 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatc 53057261  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  53057262 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcctgagcattagaagtctcttgattgtgttcaga 53057361  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 284  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53057362 agtatatgaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 53057445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14969083 - 14968803
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||      |||    
T  14969083 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgaa-----atc 14968989  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  14968988 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttagg 14968890  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14968889 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 14968803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2784792 - 2784483
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  2784792 agttcacttataatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagtgtctttagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatc 2784693  T
Q  101 aagtgttcaacct-caaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||     
T  2784692 aagtgttcaaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcag 2784593  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||| ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||     |||||||    
T  2784592 gagcatatgaagtctcttgctgttgtgtttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaattagatattaca-----tagtgaa 2784498  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  2784497 ctctccttggaagtg 2784483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50299960 - 50299677
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  50299960 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatattagaaattctaaagtctttagagtctatatttgatttatattgtgaacaccactgattgtatatc 50299861  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  50299860 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcagg 50299761  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
    | | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50299760 agcctaggaagtctctcgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatatt 50299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17668131 - 17667824
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||  |||||||||    
T  17668131 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattcttgagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactttttgtatatc 17668032  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |    
T  17668031 aagtgttcaacctcaaacatttttccttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgatagtgttcagg 17667932  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||     ||||||||    
T  17667931 agcatagaaagactcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatatttca-----tagtgaac 17667838  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  17667837 tctccttggaagtg 17667824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20724815 - 20724505
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||    
T  20724815 agttcacttagaatttcttatcaaagtttatatcttagaaattctagagtattaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattatatatc 20724716  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    | | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||||   ||||||||| |||  |||    |    
T  20724715 aggcgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtatcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttattta 20724617  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20724616 gcataggaaatctcttgcaattgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctaattttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtaaact 20724518  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  20724517 ctccttggaagtg 20724505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13948064 - 13947847
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  13948064 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatc 13947965  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13947964 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttataagtctcttgcagttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcagg 13947865  T
Q  200 aacataggaaatctcttg 217  Q
    | |||||||| |||||||    
T  13947864 agcataggaagtctcttg 13947847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29855135 - 29854846
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29855135 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 29855036  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||| |    
T  29855035 aagtgttcaacctgaaacgtttttctttgtaattctgttttaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaataggagtctcttgattgtgttcagg 29854936  T
Q  200 a----acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca 286  Q
    |    | ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29854935 agcatatataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagttagcaattgtaatcagatattaca 29854846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2025760 - 2025507
Alignment:
Q  55 agagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2025760 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtct 2025661  T
Q  154 cttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaag 253  Q
    ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  2025660 cttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgag-catttgaagtctcttactaag 2025562  T
Q  254 tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  2025561 tttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 2025507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 46796800 - 46797048
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  46796800 agttcacttaaaatttcttatcaaagctcatatcttaagaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 46796899  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  46796900 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 46796998  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgca 250  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46796999 agcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgca 46797048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52920150 - 52919944
Alignment:
Q  12 aatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaac 111  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52920150 aatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 52920051  T
Q  112 ctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaat 211  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  52920050 ctcaaacatttttctttgtaattctgtttg-attagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagt 52919952  T
Q  212 ctcttgca 219  Q
    ||||||||    
T  52919951 ctcttgca 52919944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14955155 - 14954848
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14955155 agttctcttagaatttcttatcaaagctcagatcttagaaattctagagtctttagagtatgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14955056  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || | ||||||| |||||||||| |    
T  14955055 aagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaggtctcttgattgtgttcagg 14954957  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  14954956 agcatagaaagtctcttgcaattgtgtttgatcaatttgaagtctcttactaagtttggtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 14954862  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  14954861 tctccttggaagtg 14954848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 18122046 - 18122332
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||    
T  18122046 agttcacctagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctaaagtcttaatagtctgcatctgatttttattgcgaacaccactgattgtatatc 18122145  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||||| | || ||||||||| |||| ||||| |    
T  18122146 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtttcttgcagttatgcttgaggaatagaagtctcttgattgagttcagg 18122244  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18122245 agcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatttgaggtctcttgatagttttagcagtgagcaattgtaatcagatatcacat 18122332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 313
Target Start/End: Original strand, 23538624 - 23538905
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  23538624 atatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatatgtattgtgaacaccgcttattgtatatcaggtgttcaacctcaaacatatttctttg 23538723  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttg 229  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23538724 taattctatttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttgagcataagaaatctcttgcagttgtgcttg 23538822  T
Q  230 agtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||| |||||||| |||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23538823 agtagtttgaagtttcttgctagttttagcattgagcagttgtaatcagatattata-tttttagtgaactctccttggaagtg 23538905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6253147 - 6252866
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||    
T  6253147 agttcacttagaatttcttatcaacttttatatcttagaaattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattatatatc 6253048  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||  ||    
T  6253047 aagtgttcaacctcaaacatctttctttgtaattctatttgaa-tataagtctcttgtagttgtgcttgagcatacgaagtctcttgattttgttcttga 6252949  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  6252948 gcataggaaatctcttgcagttgtgattgagtagtttcaagtctcttgctagttttagcagtgagctgttgtaatcaaatatt 6252866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6175060 - 6174753
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  6175060 tcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaag 6174961  T
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaaca 203  Q
    | |||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||| |||| ||| |||||  || ||    
T  6174960 tcttcaaccttaaacatctttctttgtaattctatttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtgtcttgattttgttcttgagca 6174862  T
Q  204 taggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatt--ttttagtgaacta 301  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||| ||||   |||  ||||||||||||     
T  6174861 taggaaacatcttgtagttgtgattgagtagtttcaagtctcttgctagttttagcagtgagctgttgtaatcaaatat---attgattttagtgaactc 6174765  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  6174764 tccttggaagtg 6174753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24775965 - 24776195
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  24775965 agttcacttagaatttcttatcaaaacttatatcttagaaattctagagtccttagagtcagtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 24776064  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| | |    
T  24776065 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtcttttgcagttatgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttagg 24776163  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgag 231  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24776164 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag 24776195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22140490 - 22140294
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22140490 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattcttgagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22140391  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttca 197  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22140390 aagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttca 22140294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21606087 - 21606273
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21606087 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21606186  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  21606187 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctctt 21606273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 313
Target Start/End: Original strand, 49669008 - 49669229
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctct 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  49669008 actgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctct 49669107  T
Q  186 taattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    | |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  49669108 tgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttta-acatttgaagtctcttactaagtttagtagttagcatttgtaatgagatattac 49669206  T
Q  286 attttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |     ||||||||| ||||||||||||    
T  49669207 a-----tagtgaactctccttggaagtg 49669229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 19249844 - 19250013
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19249844 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 19249943  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgag 171  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||| |||||    
T  19249944 aagtgttcaaccttaaacaa-tttctttgtaattctgtttgaataggaaatctcttgttgttgtgcttgag 19250013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 21638680 - 21638862
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21638680 cacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaactctagagtctgtagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 21638779  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||    
T  21638780 gttcaacctcaaacatttttctttgcaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgtttgagcaatagaaggctctt 21638862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 52283457 - 52283272
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  52283457 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttaaaaattctagaatcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacac-actgattgtatatc 52283359  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  52283358 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtcttttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctctt 52283272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8729419 - 8729666
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  8729419 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtgtgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatc 8729518  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |  ||||| |||| ||| | |||||||||   |  || |  ||    
T  8729519 aagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttacttttgtgcttgaacataagaagtctcttgcgtcagtgcttga 8729617  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     ||||||||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8729618 gcataggaaacctcttgcttttgtgtttgagtagcttgaagtctcttgc 8729666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9081306 - 9081553
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  9081306 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtgtgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatc 9081405  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |  ||||| |||| ||| | |||||||||   |  || |  ||    
T  9081406 aagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttacttttgtgcttgaacataagaagtctcttgcgtcagtgcttga 9081504  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     ||||||||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  9081505 gcataggaaacctcttgcttttgtgtttgagtagcttgaagtctcttgc 9081553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2783093 - 2782918
Alignment:
Q  113 tcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaat 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||| ||| |    
T  2783093 tcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagt 2782994  T
Q  212 ctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2782993 ctcttgctgttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 2782918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 12389305 - 12389518
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  12389305 ttcacttagaatttctattcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgttttgtgaacaccacttattgtatatcaa 12389404  T
Q  103 gtgttcaacctc-aaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||| || ||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||     
T  12389405 gtgttcaacatcaaaaaaaaattctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgtagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggag 12389503  T
Q  202 cataggaaatctctt 216  Q
    ||||| |||||||||    
T  12389504 catagaaaatctctt 12389518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22128771 - 22128615
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22128771 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22128672  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  22128671 aagtgttcaacttcaaacatttttct-tgtaattatgtttgaatttagaagtcccttg 22128615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 16659050 - 16659175
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  16659050 agttcacttaaaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatc 16659149  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttct 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16659150 aagtgttcaacctcaaacaattttct 16659175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 22463526 - 22463698
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22463526 agttcgcttagaatttcttaacaaagcttatatcttagga-ttctagagtctttatagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22463624  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagca 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22463625 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagca 22463698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 22464984 - 22465156
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22464984 agttcgcttagaatttcttaacaaagcttatatcttagga-ttctagagtctttatagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22465082  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagca 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22465083 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagca 22465156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10851536 - 10851295
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgta-tcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||  ||||||||||||    
T  10851536 agttcacttataatttcttaaaaactttcatatcttagaaattctagagtcttaaaagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccgctgattgtatat 10851438  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||   |||||||||     ||| |  |    
T  10851437 caagtgttcaacctgaaac-attttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgaggataggaagtctcttgcagttgtgcttg 10851340  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10851339 agcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtattttgaagtct 10851295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 14077785 - 14077998
Alignment:
Q  34 cttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaat 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14077785 cttagaaattctagagtcataagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaat 14077883  T
Q  134 tctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagta 233  Q
    | |||||| | ||||||||| |||| ||| || ||||||||   |||||||||     ||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14077884 tttgtttg-agtagaagtcttttgcagttatgcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagta 14077982  T
Q  234 atttgaagtctcttgc 249  Q
     |||||||| ||||||    
T  14077983 gtttgaagtgtcttgc 14077998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11867994 - 11867772
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| ||||||    
T  11867994 agttcacttagaatttcttatcaacttccatattttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattctgaacaccactaattatatatc 11867895  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||      ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | | ||    
T  11867894 aactgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgttt------gaagtattttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgctaagga 11867802  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttga 230  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11867801 ggataggaagtctcttgcagttgtgcttga 11867772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 19889374 - 19889532
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||||||||||    
T  19889374 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagttttaagagtctgtatctgatttttattgtgaaaatcactaattgtatatc 19889473  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--attagaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  19889474 aagtgttcaacctcaaacaattttcagtataattctgtttgagcattagaggtctcttg 19889532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13699095 - 13698924
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13699095 agttcacttggaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtctgaagagtct-tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13698997  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  13698996 aagtgttcaaccccaatcatttttctgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgtttttgtgcttgagcat 13698924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14007290 - 14007120
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  14007290 agttcacttagaatttcttaacaattttcatatcttggaaattctagagtcttaagagtc-acatctaatttgtattgtgaacagccctgattgtatatc 14007192  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14007191 aagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 14007120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 313
Target Start/End: Original strand, 15961132 - 15961367
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| ||| || ||||    
T  15961132 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctccaacatttttctttgtaattctgtttgaa-taaaagtttcttgcagttttgcttga 15961230  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaatt 270  Q
    ||||   ||||||||| ||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||  ||| |||||    
T  15961231 gcataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgcta--ttgagc-ttgaacaatt 15961327  T
Q  271 gtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||     |||||||||||| ||||||||||||    
T  15961328 gtaatcagatatt---gattttagtgaactctccttggaagtg 15961367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16879744 - 16879496
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  16879744 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagaggcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattttatat 16879645  T
Q  100 caagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| || |||||   || ||||||   | ||| |      
T  16879644 caagtgttcaaacctcaaac-attttttgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcttaagcataggaactctcttgtgtttgtgctt 16879547  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16879546 gagtataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtatcttgc 16879496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 19198315 - 19198557
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||     
T  19198315 tcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagaatc-ctatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaaa 19198413  T
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaaca 203  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||   || ||||||     ||| |  || ||    
T  19198414 tgttcaacctcatac-attttctttgtaattctgtttgaa-tataagtctattgcttttgtgcttgagcataggaattctcttgcagttgtgcttgagca 19198511  T
Q  204 taggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19198512 taggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 19198557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 16811704 - 16811828
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  16811704 agttcacttagaatttcttaacaactttcaaatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatctgtgaacaccactaattgtatat 16811803  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaatttt 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  16811804 caagtgttcaacctcaaacactttt 16811828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 4243552 - 4243798
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||    || |||||||||    
T  4243552 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttttattgtaaacatcgttgtttgtatatc 4243651  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| |||| |||   ||| |||||   ||||| |   |    
T  4243652 aagtgttcaacctcaaagatatttctgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtggttgaacataggaagactcttgcgtgtgtgcttaa 4243750  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
     ||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4243751 gcataggaaacctcttgattttgtgcttgagtagtttgaagtctcttg 4243798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11222409 - 11222256
Alignment:
Q  134 tctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagt 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||     
T  11222409 tctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgaccattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgag- 11222311  T
Q  233 aatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
     |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11222310 catttgaagtctcttgctagttttagcggtgagcaattgtaatcagatattacat 11222256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 25398689 - 25398814
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||| | |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25398689 agttcatttagaatttcttatctactttcatatcttagaaattctatagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 25398788  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttct 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25398789 aagtgttcaacctcaaacatttttct 25398814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 18143178 - 18143316
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  18143178 agttcacttataatttcttatcaactttcatgtcttagaaattctaaagacttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 18143277  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgttt 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18143278 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgttt 18143316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 13410479 - 13410651
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13410479 agttcacttataatttcttaacaactttcatatcttagaaactatagagtcttaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13410578  T
Q  101 aagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  | |||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  13410579 aagtgttcaaacctcaaac-attttttgtgtaattgtgtttg-ttcagaagtttcttgctcttgtgcttgagcat 13410651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17697336 - 17697172
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||        ||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  17697336 agttcacttataatttcttatcaactttcatatcttagaaattcta--------agagtttgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatt 17697245  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17697244 aagtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 17697172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 284
Target Start/End: Original strand, 1241670 - 1241803
Alignment:
Q  151 tctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgca 250  Q
    ||||||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  1241670 tctcttgcatttgtgtttgagtaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagtaatttgaagtctcttact 1241769  T
Q  251 aagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 284  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1241770 aagtttagtcgtgagcatttgtaatcagatatta 1241803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 278
Target Start/End: Original strand, 12753080 - 12753328
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| | || ||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12753080 atatcttagaaattcttaagtctaaagagtctatcatttgcattgtattgtgaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgt 12753179  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||   |||||||||   ||||| |  || || ||||| ||||||||   |||||||    
T  12753180 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgctt 12753278  T
Q  229 gagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcag 278  Q
    ||| ||||||||||||| | | | || ||| | |||||| ||||||||||    
T  12753279 gagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcag 12753328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14072423 - 14072253
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14072423 agttcacttagaatttattaacacctttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtcac-atctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14072325  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  14072324 aagttttcaacctcaaac-attttttatgtatttttgtttgaa-tataagtctcttgcttttgtgcttgagcat 14072253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13953922 - 13953716
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  13953922 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 13953824  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaatt 270  Q
    ||||   |||||||||  |||||| |  || || ||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| | | | || ||| | |||||| ||    
T  13953823 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagtt 13953724  T
Q  271 gtaatcag 278  Q
    ||||||||    
T  13953723 gtaatcag 13953716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16882016 - 16881882
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  16882016 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtattaaagagtttgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 16881917  T
Q  100 caagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaatt 134  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  16881916 caagtgttcaaatctcaaac-attttctgtgtaatt 16881882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Original strand, 16659183 - 16659335
Alignment:
Q  160 gttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagc 259  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||    
T  16659183 gttgtgcttgagcattagaagtctcttaactgttttcaggagcatagaaagtctcttgaaattgtgcttgagca-tttgaagtctcttgttagttttagc 16659281  T
Q  260 agtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  16659282 agtgagcagttgtaatcagatattacattttttagagaagtctccttggaagtg 16659335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 14063621 - 14063731
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14063621 catatgaaatctcttgcacttgtgcttgagtagtttgaagtctctttctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaactc 14063719  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  14063720 tccttggaagtg 14063731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15833109 - 15832981
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15833109 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgt 15833010  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15833009 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 15832981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 51340712 - 51340584
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  51340712 atatcttagaaattctaaagtctagagagtctctcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgt 51340613  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51340612 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 51340584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 7833071 - 7833215
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||    
T  7833071 ttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaatttctagagtctta----------tctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaa 7833160  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  7833161 gtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttg-tttagaagtatcttgc 7833215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 21638851 - 21639013
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  21638851 tagaaggctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtct 21638949  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||| | |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  21638950 cttactaagtttagtagcaaacaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 21639013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13147924 - 13147838
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13147924 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 13147838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17006853 - 17006739
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||| ||||    
T  17006853 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tataagtctcttgctttagtgcttga 17006755  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||| | |||||||||    
T  17006754 gcataagaagtctctt 17006739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Original strand, 19249985 - 19250093
Alignment:
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactat 302  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
T  19249985 ataggaaatctcttgttgttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatatt--atattttagtgaacttt 19250082  T
Q  303 ccttggaagtg 313  Q
    | |||||||||    
T  19250083 cattggaagtg 19250093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 31114363 - 31114449
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31114363 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 31114449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 52283303 - 52283208
Alignment:
Q  215 ttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  52283303 ttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagaaattgtaatcagatattac--tttttagtgaactctccttggaagtg 52283208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 313
Target Start/End: Original strand, 25398867 - 25398995
Alignment:
Q  179 agtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcag 278  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  25398867 agtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaaca-tttgaagtctcttgctagttttagcagcgagcaattgtaatcag 25398965  T
Q  279 atattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  25398966 atattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 25398995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 49989962 - 49989834
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  49989962 atatcttagaaattcttaagtctagagagtcttttatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgt 49989863  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49989862 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 49989834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 278
Target Start/End: Original strand, 11909548 - 11909747
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaa 177  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||       
T  11909548 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagg 11909646  T
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    |||||||||  |||||  |  || || ||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||||| | | | || ||| | |||||| |||||||||    
T  11909647 aagtctcttgcttgtgggcttgagcaaaggaagtttcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatca 11909746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13939413 - 13939313
Alignment:
Q  210 atctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttgga 309  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  13939413 atctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcactgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttgga 13939317  T
Q  310 agtg 313  Q
    ||||    
T  13939316 agtg 13939313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14581003 - 14580888
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaca-attttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttg 169  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||    
T  14581003 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttg 14580905  T
Q  170 agcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||  |||||||||    
T  14580904 agcattggaagtctctt 14580888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15848903 - 15848776
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15848903 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctat 15848804  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15848803 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttg 15848776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22150898 - 22150819
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22150898 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 22150819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 49666838 - 49666918
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtga 81  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  49666838 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtga 49666918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10529004 - 10528918
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10529004 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 10528918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16811929 - 16811827
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttct-taacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||    
T  16811929 agttcacttagaatttctgtttcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtattatgaacaccactgactgtatat 16811830  T
Q  100 caa 102  Q
    |||    
T  16811829 caa 16811827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 290
Target Start/End: Original strand, 19889509 - 19889634
Alignment:
Q  164 tgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtg 263  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |  |||||||||     
T  19889509 tgtttgagcattagaggtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgctttag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtt 19889607  T
Q  264 agcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    |||| || |||||||||||||||||||    
T  19889608 agcagttttaatcagatattacatttt 19889634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 16199861 - 16199930
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgat 70  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16199861 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagattcttaagagtctgtatctgat 16199930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 37412306 - 37412179
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||  |  |||  |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37412306 atatcttagaaattcttaagtctagagagtccttcactgcattgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtg 37412207  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37412206 taattctgtttg-tttagaagtctcttgc 37412179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50721836 - 50721589
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| | |||  |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||    
T  50721836 agttcacttagaattttttaacaactgttatatcttagaaaatttagtatcttaaaaatctgtatctgatttgaattgtgaacaccactgattatatatc 50721737  T
Q  101 aagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    || ||||| |||||||||||  ||| |||| |||| ||||||| | | |||| | ||||  ||||| |||||||| | |||||||||   ||||| |       
T  50721736 aaatgttcaaacctcaaacatctttttgtgaaattttgtttgattaaaaagt-tattgcttttgtgattgagcataagaagtctcttgcgtgtgtgcttt 50721638  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  50721637 aacataagaaatctcttgcttttgtgcttgagtatattgaaatctcttg 50721589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 50791013 - 50791260
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| | |||  |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||    
T  50791013 agttcacttagaattttttaacaactgttatatcttagaaaatttagtatcttaaaaatctgtatctgatttgaattgtgaacaccactgattatatatc 50791112  T
Q  101 aagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    || ||||| |||||||||||  ||| |||| |||| ||||||| | | |||| | ||||  ||||| |||||||| | |||||||||   ||||| |       
T  50791113 aaatgttcaaacctcaaacatctttttgtgaaattttgtttgattaaaaagt-tattgcttttgtgattgagcataagaagtctcttgcgtgtgtgcttt 50791211  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  50791212 aacataagaaatctcttgcttttgtgcttgagtatattgaaatctcttg 50791260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 45862089 - 45862175
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45862089 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaacaattttctgtataattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 45862175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 52919956 - 52919882
Alignment:
Q  238 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  52919956 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacat-ttttagcgaactctccttggaagtg 52919882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2246265 - 2246144
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2246265 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtg 2246169  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  2246168 taattctgtttg-attagaagtctct 2246144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 13199581 - 13199702
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13199581 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtg 13199677  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  13199678 taattttgtttg-attagaagtctct 13199702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 15651407 - 15651527
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  15651407 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctgtat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctgtg 15651502  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  15651503 taattctgtttg-attagaagtctct 15651527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 15663042 - 15663162
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  15663042 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctgtat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctgtg 15663137  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  15663138 taattctgtttg-attagaagtctct 15663162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Original strand, 51989522 - 51989607
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51989522 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaatttactgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttg 51989607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22128624 - 22128516
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  22128624 aagtcccttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttaacagtgagcaattgtaatca 22128526  T
Q  278 gatattacat 287  Q
    ||| ||||||    
T  22128525 gatgttacat 22128516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 31303137 - 31303073
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtat 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31303137 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtat 31303073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 16305580 - 16305749
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || |||| ||| | |||||||||||     
T  16305580 agttcacttagaatttcttataaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatc---tttaaattgtgaacaccattgattgtatatt 16305676  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcatt 175  Q
    || ||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  16305677 aattgttcaaac-caaacatctttctctgtagttttgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcttcagcatt 16305749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41045379 - 41045316
Alignment:
Q  94 gtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41045379 gtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 41045316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 287
Target Start/End: Original strand, 46797040 - 46797115
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46797040 tctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttactaagtttagtagtgatcaattgtaatcagatattacat 46797115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17017659 - 17017573
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17017659 ttgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaaacttaaataattttctgtgtatttctgtttgaa-tagaagtctcttgc 17017573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21735970 - 21735885
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21735970 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttttgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 21735885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27172681 - 27172612
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27172681 actgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacaattttct-tgtaattctgtttgaa-tataagtctcttgc 27172612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 13931677 - 13931576
Alignment:
Q  8 ttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgtt 107  Q
    ||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  13931677 ttagaattttttaataactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtct-aatttgttttgtattgtgaacaacactgattgtatatcaagtgtt 13931579  T
Q  108 caa 110  Q
    |||    
T  13931578 caa 13931576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 17762524 - 17762601
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgag 82  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  17762524 cacttagaatttcttaataaatttcatctcttaggaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttttattgtgag 17762601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 19063844 - 19063921
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgag 82  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  19063844 cacttagaatttcttaataaatttcatctcttaggaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttttattgtgag 19063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 22766949 - 22767052
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||    
T  22766949 agttcacttagaatttcttattaactttcatatcttagaaattttagagtcttaagagtct-ta-ctgatttgtattgtgaacaccactcattttatatc 22767046  T
Q  101 aagtgt 106  Q
    ||||||    
T  22767047 aagtgt 22767052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27849907 - 27849808
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  27849907 acttataatttcttaacaactttcatattttagaaattctagagtcttaagagtctg-atttattttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtg 27849809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15647475 - 15647373
Alignment:
Q  7 cttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgt 106  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| ||||  || |||  || ||||||||||||    
T  15647475 cttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctaaagtcttaagagtctg-atttgttttgtattgtgaataccactagttctatatcaagtgt 15647377  T
Q  107 tcaa 110  Q
    ||||    
T  15647376 tcaa 15647373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 142
Target Start/End: Original strand, 29906555 - 29906625
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29906555 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttga 29906625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 142
Target Start/End: Original strand, 29947720 - 29947790
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29947720 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttga 29947790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 142
Target Start/End: Original strand, 29996874 - 29996944
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29996874 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttga 29996944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1464010 - 1463904
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    ||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||  ||||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  1464010 tcacttagaatttcttatcaactttcatatcttacaaattcttaagtctta-gagtctgaa-ctgttttatattgtgaacaccactgattgtatatcaag 1463913  T
Q  104 tgttcaacc 112  Q
    |||||||||    
T  1463912 tgttcaacc 1463904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 287
Target Start/End: Original strand, 22463676 - 22463752
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | | |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22463676 tctcttgcagttgtgcttgagcaattcggagtctcatactaagtttaatagtgagcatttgtaatcagatattacat 22463752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 287
Target Start/End: Original strand, 22465134 - 22465210
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | | |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22465134 tctcttgcagttgtgcttgagcaattcggagtctcatactaagtttaatagtgagcatttgtaatcagatattacat 22465210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28168936 - 28168830
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaa 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||   |||| ||||||||||     
T  28168936 gtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-cagaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattag 28168839  T
Q  178 aagtctctt 186  Q
    ||| |||||    
T  28168838 aagactctt 28168830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11189505 - 11189454
Alignment:
Q  234 atttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11189505 atttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 11189454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16076790 - 16076705
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  16076790 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-tagaagcctcttgc 16076705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 29933950 - 29934019
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  29933950 actgattgtatatcaagtgttcaatcccaaac-attttctgtgtaattttgtttg-attggaagtctcttgc 29934019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 29983104 - 29983173
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  29983104 actgattgtatatcaagtgttcaatcccaaac-attttctgtgtaattttgtttg-attggaagtctcttgc 29983173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Original strand, 12410234 - 12410399
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |    
T  12410234 cacttagaatttcttaacaattttcagaacttagaaactctagagtcttaa-agtctgaat-tgttttgtattgtgaacaccactgattgtatataaatt 12410331  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcatt 175  Q
    |||||| | |||||   ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  12410332 gttcaaac-caaacttatttctttgtaatt-tgtttg-tttagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatt 12410399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21317179 - 21317090
Alignment:
Q  68 gatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  21317179 gatttgtattgtgaacaccactgattatatatcatatgttgaacctcaaacatttttctatgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgc 21317090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 17281770 - 17281893
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  17281770 atatcttagaaattctcaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtg 17281865  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    || || |||||||| |||||| |||||||    
T  17281866 tatttttgtttgaa-tagaagcctcttgc 17281893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 6180901 - 6181014
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  6180901 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 6180998  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  6180999 gcattagaagtctctt 6181014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 6221075 - 6221188
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  6221075 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 6221172  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  6221173 gcattagaagtctctt 6221188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 8740499 - 8740571
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  8740499 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaat 8740571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 22770393 - 22770464
Alignment:
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22770393 aagtgttcaatctcaaaca-ttttctttgtaattctgttcga-ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 22770464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11078366 - 11078307
Alignment:
Q  50 tcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11078366 tcttaagagtctg-atttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaa 11078307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20417961 - 20417889
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttg 73  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20417961 agttcacttaaagtttcataataactttcatatattagaaattctagaatcttaagagtctgaatctgatttg 20417889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27883244 - 27883173
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  27883244 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 27883173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1053570 - 1053512
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgt 130  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  1053570 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgt 1053512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 4175130 - 4175243
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  4175130 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 4175227  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  4175228 gcattagaagtctctt 4175243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 8996346 - 8996415
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  8996346 actgattgtatatcaagtgttcatcatcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-tagaagcctcttgc 8996415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 9006898 - 9006967
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  9006898 actgattgtatatcaagtgttcatcatcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-tagaagcctcttgc 9006967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 12287352 - 12287466
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||    ||| ||||    
T  12287352 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctctcgcctgcgtgcttga 12287450  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  12287451 gcattagaagtctctt 12287466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 12297174 - 12297288
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||    ||| ||||    
T  12297174 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctctcgcctgcgtgcttga 12297272  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  12297273 gcattagaagtctctt 12297288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18006152 - 18006068
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  18006152 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaaccaatttct-tgtatttgtgtttgaa-tagaagtctcttgc 18006068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37866307 - 37866194
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  37866307 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 37866210  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  37866209 gcattagaagtctctt 37866194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37885440 - 37885327
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| || |||||||||||||    ||| ||||    
T  37885440 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atcagaagtctcttgcctgcgtgcttga 37885343  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  37885342 gcattagaagtctctt 37885327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 59
Target Start/End: Original strand, 4768023 - 4768071
Alignment:
Q  10 agaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagt 59  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4768023 agaatttcttatcaaagttagtatcttagaaattcta-agtctttagagt 4768071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 12755896 - 12755947
Alignment:
Q  10 agaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt 63  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12755896 agaatttcttatcaaagtttatatcttagaaattcta-agtctt-agagtctgt 12755947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Original strand, 14322072 - 14322136
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  14322072 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 14322136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 107
Target Start/End: Original strand, 1794857 - 1794893
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgtt 107  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1794857 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgtt 1794893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 13262053 - 13262131
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  13262053 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-cagaagtctcttgc 13262131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Original strand, 16671536 - 16671606
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  16671536 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-atcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 16671606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17961207 - 17961105
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||||| | || || |||||||| ||||||||||||||   |||| ||||    
T  17961207 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtccaaccaatttctttatatttttgtttgaa-tagaagtctcttgcctgtgtgcttga 17961110  T
Q  171 gcatt 175  Q
    |||||    
T  17961109 gcatt 17961105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 98)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 23413387 - 23413698
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  23413387 agttcacttagaatttcttatcacagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccagtgattgtatatc 23413486  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23413487 aagtgttcatcctcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaaga 23413586  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23413587 gcataggaaatctcttgcagttgtgctcgagtaatttgaagtttcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttaatgaact 23413684  T
Q  301 atccttggaagtga 314  Q
     |||||||||||||    
T  23413685 ctccttggaagtga 23413698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 89834 - 90146
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  89834 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacaccactaattgtatatc 89933  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  89934 aagtgttcaaccttaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgcttgtgttcagg 90033  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  90034 agcataggaaatctcttgcagttgtgctttagtaatttgaagtctctagctaagtttagcagtgaacagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaac 90132  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | | ||||||||||    
T  90133 tcttcttggaagtg 90146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 7746107 - 7746417
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  7746107 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtccatatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 7746206  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  7746207 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattataagtctcttgcagttgtgcttgagcattataagtctcttgattgtgttcagga 7746306  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  7746307 gcataggaagactcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttctagtgaact 7746404  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  7746405 ctccttggaagtg 7746417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 21072650 - 21072959
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  21072650 agttcacttaaaatttcttatcaaaattcatatcttagaaattctagactcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatc 21072749  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  21072750 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaa-tataagtctcttgcagttgtgcttgagcattaaaagtctcttgattgtgttctgta 21072848  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21072849 gcataggaaatatcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 21072946  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     || |||||||||    
T  21072947 ctcattggaagtg 21072959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 12353209 - 12353517
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  12353209 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 12353308  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  12353309 aagtgttcaatctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 12353406  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12353407 gcataggaaatctcttgcaattatgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcatttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 12353504  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  12353505 ctccttggaagtg 12353517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 19536710 - 19537020
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  19536710 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 19536809  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  19536810 aaa-tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcag 19536908  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19536909 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaa 19537005  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  19537006 ctctccttggaagtg 19537020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 25097240 - 25097549
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  25097240 agttcacttagaatttcttatcaaagtggatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtactctgaacaccactgattgtatatc 25097339  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   | || |||| |||||||||||||    
T  25097340 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgttcgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggacgtgtcttgattgtgttcaaga 25097438  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25097439 gcataggaaatctcttgcaattgtgcttaagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 25097536  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  25097537 ctccttggaagtg 25097549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 25155210 - 25155519
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  25155210 agttcacttagaatttcttatcaaagtggatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtactctgaacaccactgattgtatatc 25155309  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   | || |||| |||||||||||||    
T  25155310 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgttcgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggacgtgtcttgattgtgttcaaga 25155408  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25155409 gcataggaaatctcttgcaattgtgcttaagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 25155506  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  25155507 ctccttggaagtg 25155519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31117602 - 31117293
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  31117602 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 31117503  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  31117502 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgttcttcagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 31117404  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  31117403 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagt-atttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagtagttgtaatcagatattaca--ttttagtaaac 31117307  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  31117306 tctccttggaagtg 31117293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 643114 - 643423
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  643114 agttcacttagaattttttatcaaagttcatatcttagaaattctatagtcataagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 643213  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  643214 aaatgttcaagctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatgagaagtctcttgattgtgttcagga 643312  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  643313 gcataagaaatctcttgcagttatgcttgagtaatttgaagcctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 643410  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  643411 ctccttggaagtg 643423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10848496 - 10848188
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10848496 agttctcttaggatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 10848397  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  10848396 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcagg 10848297  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  10848296 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 10848202  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  10848201 tctccttggaagtg 10848188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23880789 - 23880480
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23880789 agttcacttagaatttcttatcaaagttcacatcttagaaattttaaagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 23880690  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| ||    
T  23880689 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgttcgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagtatcagaagtctcttgattgtgttcagga 23880591  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23880590 gcataggaaatctcttgcagttgggcttgagtaatttgaagtctcttgctagttgtagcagtgagtagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 23880493  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  23880492 ctccttggaagtg 23880480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 21199414 - 21199702
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  21199414 agttcacttagaatttctaatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatc 21199513  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  21199514 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcaattgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 21199612  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  21199613 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagtagttataatcagatattaaatttt 21199702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17814689 - 17814381
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  17814689 agttcacttagaatttattatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatc 17814590  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| | | |||||| |    
T  17814589 aagtgttcaaccttaaacatttttctttgtaattctggttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtttcttgactatgttcagg 17814490  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17814489 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgatcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 17814393  T
Q  300 tatccttggaag 311  Q
    | ||||||||||    
T  17814392 tctccttggaag 17814381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 35932420 - 35932707
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  35932420 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 35932519  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  35932520 aagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 35932619  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35932620 agcataggaagtctcctgcagttgtgcttgagcaattttaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 35932707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 21100116 - 21100422
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21100116 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaatcctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21100215  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| | |||| | || ||| |||||| ||    
T  21100216 aagtgttcaatcttaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tataagtctcttgtagttgtgtttgagcataagaagtttattgattatgttcagga 21100314  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21100315 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagccgttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 21100412  T
Q  301 atccttggaa 310  Q
     || ||||||    
T  21100413 ctcattggaa 21100422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 30116250 - 30116536
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  30116250 agttcacttagaatttctcatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaataccactgattgtatatc 30116349  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  30116350 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 30116449  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30116450 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 30116536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26784078 - 26783768
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  26784078 agttcacttagaatttcttatcaaagtccatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 26783979  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  26783978 aagtgttcaacctcaaactattttctttgtaattctgtttcaattcagaagtctcttgcagttgtacttaagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 26783879  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  26783878 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctctttctagttttagcagtgagcagttgtaaacagatgttaca--ttttagtgaac 26783782  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | || |||||||||    
T  26783781 tctctttggaagtg 26783768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 14086953 - 14087261
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  14086953 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtgtatc 14087052  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  14087053 aagtattcaacctcaaataattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtgtcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 14087152  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  14087153 agcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 14087247  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  14087248 tctccttggaagtg 14087261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15516693 - 15516387
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15516693 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagagcctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 15516594  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |    
T  15516593 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgtttgaccaatataagtctcttcattgtgttcagg 15516495  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||    
T  15516494 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaattagatattaca-----tagtgaac 15516401  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  15516400 tctccttggaagtg 15516387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 28464752 - 28465058
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  28464752 agttcacttagaatt-cttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 28464850  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  28464851 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 28464950  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  28464951 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttga-acatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 28465044  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  28465045 tctccttggaagtg 28465058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 6512843 - 6513153
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  6512843 agttcacttagaaattcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagttttaagagtctgcatcttatttttattgtgaacaccactgattgtatatc 6512942  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  6512943 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattttgttcaag 6513042  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  6513043 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttaaagtctcttgctatgtttagcagtgagcagttgtaatcagatactaca--ttatagtgaac 6513139  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  6513140 tctccttggaagtg 6513153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 9399044 - 9399339
Alignment:
Q  16 tcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctca 115  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9399044 tcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaacctca 9399143  T
Q  116 aacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctct 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  9399144 aacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtcttttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcc 9399242  T
Q  216 tgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9399243 tgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttgtagctctgagtagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaactctccttggaagtg 9399339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11993613 - 11993305
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||     
T  11993613 agttcacttaaaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatata 11993514  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  11993513 aagtgttcaacctcaaacatttttat-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcagg 11993415  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||    
T  11993414 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaattctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaattagataatac---ttttagtgaac 11993319  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  11993318 tctccttggaagtg 11993305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 3245855 - 3246162
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  3245855 agttcacttataatttcttatcaaatcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 3245954  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  3245955 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaaatctcttgattgtgttcagg 3246054  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  3246055 agcatatgaagtctcttgcagttgtgctt-aaacatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 3246148  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  3246149 tctccttggaagtg 3246162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9088692 - 9088386
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  9088692 agttcacttagagtttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtttgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 9088593  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  9088592 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagatgtgtttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 9088494  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  9088493 agcataagaagtctcttgcagttgcacttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 9088400  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  9088399 tttccttggaagtg 9088386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 13545938 - 13546244
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13545938 agttcacttaaaatttcttatcaaccttcatatcttagaaattcttgagtcttaaaagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13546037  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13546038 aagtgttcaacctctaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaag 13546136  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||     |||||||||    
T  13546137 tgcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcattgagctattgtaatcagatattac-----ttagtgaac 13546230  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  13546231 tctccttggaagtg 13546244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21659935 - 21659648
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21659935 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21659836  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgttt-gaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||| || ||||||| |    
T  21659835 aagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttggatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatggaagtctcttgatcgtgttcagg 21659736  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21659735 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagtcttagcaatgagcaattgtaatcagatattacat 21659648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23392017 - 23392305
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  23392017 agttcacttagaatttcttaacaaagcttacatcttaggaattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatat 23392116  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  23392117 caagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcag 23392216  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23392217 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaggaagttgaagtctcctgctagttttagccgtgagcaattgtaatcagatattacat 23392305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 29138819 - 29139104
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29138819 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 29138918  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  29138919 aagtgttcaacctcaaatatttttct-tgtaattctatttgaatttataagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcagg 29139017  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  29139018 agcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagggagcaattgtaataagatattacat 29139104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28139330 - 28139041
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  28139330 agttcacttagaatttcttatcaaaactcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgcatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 28139231  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||| |||||| |    
T  28139230 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagtaatagaagtctcttgattatgttcagg 28139132  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagc----agtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28139131 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagcacgtagtgagcaattgtaatcagatattacat 28139041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33022389 - 33022100
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||||||    
T  33022389 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaataccaccaattgtatatc 33022290  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  33022289 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaaaaagtctctcgcggttgtgcttgatcattagaagtctcttgattgtgttcagg 33022190  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtga--gcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  33022189 agcataggaagtctcttgcagatgtgcttgagaaacttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcgcaattgtaattagatattacat 33022100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31487959 - 31487653
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  31487959 agttcacatacaatttcttattaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttctattgtgaacaccactgattttatatc 31487860  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  31487859 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctatttgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgagaattagaagtctcttgattgtgttcagg 31487761  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  31487760 agcataggaagtctcttgcagctgtgcttgag-catttgaagtctctttgtagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 31487667  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  31487666 tctccttggaagtg 31487653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33932991 - 33932684
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  33932991 agttctcttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttggagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 33932892  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| | |    
T  33932891 aagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttagg 33932793  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||     ||||||||    
T  33932792 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttagtaaatttagtagtgagcatttgtaatcagatattgca-----tagtgaac 33932698  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  33932697 tctccttggaagtg 33932684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 35986645 - 35986933
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  35986645 agttcacttagaatttcttaacaaagcttacatcttaggaattctagagtctttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 35986744  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  35986745 caagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttatgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcag 35986844  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  35986845 gagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgaacatttgtaatcagatattacat 35986933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30742705 - 30742419
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  30742705 agttctcttagaatttcttatcaaagctcatatcttataaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 30742606  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaa-gtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  30742605 aagtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattctgtttgaattcaaatgtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 30742507  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30742506 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgaacaatttgaagtctcttactaagtttaatagtgagcatttgtaatcagatattacat 30742419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42243405 - 42243098
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  42243405 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagtgtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatc 42243306  T
Q  101 a-agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |  |||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  42243305 agtgtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaa 42243207  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||     | |||||||    
T  42243206 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgaacatttgtaatcagatatta-----tatagtgaa 42243113  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  42243112 ctctccttggaagtg 42243098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 2156688 - 2156934
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2156688 agttcatttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtct-tatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 2156786  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||| ||    
T  2156787 aagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgattttgttcatga 2156885  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2156886 gcatatgaaacctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 2156934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4886746 - 4886500
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  4886746 agttctcttagaatttcttatcaacgctcatatcttagaaattctagagtctttagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 4886647  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  4886646 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 4886548  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  4886547 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa-tagaagtctcttg 4886500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26765214 - 26764920
Alignment:
Q  14 tttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacct 113  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  26765214 tttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagagtttttagagtcagtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaatct 26765115  T
Q  114 caaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatc 212  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||    
T  26765114 caaacatttttct-tgtaattctgtttgatttgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtc 26765016  T
Q  213 tcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaa-ttgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaag 311  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     | ||||||||| ||||||||||    
T  26765015 tcttgcaattgtgcttgag-catttgaagtctcttactaactttagtagtgagcaatttgtaatcagatatta-----tatagtgaactctccttggaag 26764922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20550617 - 20550391
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||    
T  20550617 agttcacttagaatttcttatcaactttcgtatcttagaaattctagagtcttaaaagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgcttgtatatc 20550518  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  20550517 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttg-attagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 20550419  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
     |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  20550418 gcatatgaagtctcttacagttgtgctt 20550391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16607236 - 16606955
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  16607236 agttcacttagaatatcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctcatttgtattgtgaacacccctgattgtatatc 16607137  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||  ||    
T  16607136 aagtgttcaacctcaaacatatttctttgtagttctgtttgaa-tagaagtatcttgcaattgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttga 16607038  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
     |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16607037 gcataggaaatctcttgcatttatgcttcagtagtttgaagtctcttgctagtttgagcagtgagtaattctaatcagatatt 16606955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 22000469 - 22000644
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||    
T  22000469 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactcattgtaaatc 22000568  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22000569 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtttaattctgtttaaatttgaagtctctggcagttgtgcttgagcatta 22000644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 31146048 - 31146264
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  31146048 agttcacttagaattttttaacaaagcttatatctcaggaattttagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 31146147  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||| |    
T  31146148 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaattaagaaatctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtatcttgattgtgttcagg 31146247  T
Q  200 aacataggaaatctctt 216  Q
    | |||||||| ||||||    
T  31146248 agcataggaagtctctt 31146264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34638179 - 34637875
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  34638179 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattgtagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 34638080  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt--aattgtgttcaa 198  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||||   |||||||||  | ||||| |  |    
T  34638079 aagtgttcaacctcaaaaaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcatttgtggttaagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttga 34637981  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgag-taatttgaagtctcttgcaaagtttag-cagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtg 296  Q
    | |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    | |||||    |||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  34637980 gca-ttaggaaacctcttgcagttgtgcttgagttagtttgaagtctctt----actttagtgtttgagcaattgtaatcagatatta---attttagtg 34637889  T
Q  297 aactatccttggaa 310  Q
    |||| |||||||||    
T  34637888 aactctccttggaa 34637875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 13736548 - 13736720
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13736548 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattttagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13736647  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagca 173  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13736648 aagtgttcagcctcaaacatttttct-tgtaattctatttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagca 13736720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6498961 - 6498806
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  6498961 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaaaagtttgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 6498862  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6498861 aagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaa-tggaagtctcttg 6498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 25930569 - 25930712
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  25930569 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 25930668  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25930669 aactgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 25930712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20968936 - 20968764
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||    
T  20968936 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtgttgtgaacaccattgattgtatatc 20968837  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||   ||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  20968836 aagtgttcaatctcaaacatttttatgtgtaattttttttg-tctagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 20968764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23589436 - 23589269
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  23589436 ttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttaaaaattttagagtcttaagagtctgtatctgatttgttttatgaacaccacttattgtatatcaa 23589337  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagc 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23589336 gtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttg-attagaagtctcttgcttttgtgcttgagc 23589269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25740834 - 25740709
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25740834 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattccagagtcttaggagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 25740735  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttct 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25740734 aagtgttcaacctcaaacagttttct 25740709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 26120239 - 26120486
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| ||||    
T  26120239 agttcacttagaatttcttaataactttcatatcttagaaattctagagccttaaagagtctgtatctgacttgtattgtgaacaccaatgattgaatat 26120338  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||   || || || |||||   |||||||||  |||||| |  |    
T  26120339 caattgttcaacctcaaac-attttctttgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgattttatgcttaagcataggaagtctcttgtttgtgtgcttg 26120436  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    | ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26120437 agcataggaaacctcttacttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 26120486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4886540 - 4886379
Alignment:
Q  147 gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctct 246  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4886540 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggaccataggaagtctcttgcaattgtgtttgagcaatttgaagtctct 4886441  T
Q  247 tgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  4886440 tactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactttccttggaagtg 4886379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32160404 - 32160199
Alignment:
Q  72 tgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgag 171  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||    
T  32160404 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttgag 32160306  T
Q  172 cattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattg 271  Q
    |||   |||||||||  |||||| |  || || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | | | || ||| | |||||| |||    
T  32160305 cataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaaatctcttgcctgtgtgcttgagtaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 32160206  T
Q  272 taatcag 278  Q
    |||||||    
T  32160205 taatcag 32160199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 208 - 313
Target Start/End: Original strand, 22000647 - 22000750
Alignment:
Q  208 aaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttg 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  22000647 aaatctcttgcaattgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttg 22000744  T
Q  308 gaagtg 313  Q
    ||||||    
T  22000745 gaagtg 22000750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24019315 - 24019161
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24019315 atatcatagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaaatgttcaacc-caaacatttttttgtg 24019217  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24019216 taattgtgtttg-tttagaaatctcttgcttttgtgcttgagcataaaaaatctctt 24019161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 31589421 - 31589528
Alignment:
Q  34 cttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaat 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31589421 cttagaatttctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagttttcaacctcaaacatttttctgtgtaat 31589520  T
Q  134 tctgtttg 141  Q
    | ||||||    
T  31589521 tgtgtttg 31589528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 25156554 - 25156734
Alignment:
Q  109 aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacatagga 208  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||  || || || | ||||||||||||| |||||||    
T  25156554 aacctcaaacaatattctttgaaaatctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgaacatagaacgtgtcatgattgtgttcaagagcatagga 25156652  T
Q  209 aatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    |||||||  || |||||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25156653 aatctctcacaattgtgcttaagttgtttgaagtctcttgcgagttttagcagtgagcaatggtaatcagatataacatttt 25156734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34637292 - 34637127
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    |||||||||||||||||  ||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  34637292 tcacttagaatttcttataaactttcatgtcttagaaattctagagtcttaagagtctg-atttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaag 34637194  T
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34637193 tgttcaac--caaacatatttctttgtaatt-tgtttg-ttcagaagtctcttgcttttgtgtttgagcat 34637127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 26758873 - 26758772
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  26758873 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtttttagagtcagtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 26758774  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  26758773 aa 26758772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23488177 - 23488091
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23488177 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 23488091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13522850 - 13522737
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  13522850 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 13522752  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    |||||  ||||||||    
T  13522751 gcattggaagtctct 13522737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 39799289 - 39799427
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  39799289 agtttacttaaatttttttaacaactttcatattttagaaattatagagtcttaagagtttgtatttgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 39799388  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 139  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  39799389 aagtgttcaacctcaaatatttttttgtgtaattttgtt 39799427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40228357 - 40228229
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40228357 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgt 40228258  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40228257 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 40228229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1915073 - 1914987
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1915073 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaa-tagaagtctcttgc 1914987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 40033248 - 40033334
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40033248 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 40033334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 20168559 - 20168672
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  20168559 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 20168657  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    ||||  |||||||||    
T  20168658 gcatagaaagtctct 20168672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20567537 - 20567283
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagt-----ctgtatctgat--ttgtatcgtgagcactactgatt 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||  ||     ||  | | |||  |||||| |||| ||| ||||| |    
T  20567537 agttcacttagaatttcttaacaacttccatatcttagaaattcgagagtcttaattgttcaacctcaaacagatcattgtattgtgaacaccactgaat 20567438  T
Q  94 gtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||   |||||||||   | ||    
T  20567437 gtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttattattctgtttg-attagaagtctcttggttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttg 20567340  T
Q  194 ttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgca 250  Q
    | |  || || |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20567339 tgcttgagcaaaggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgca 20567283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 11208490 - 11208604
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  11208490 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtacaattctatttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 11208588  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||| | |||||||||    
T  11208589 gcataagaagtctctt 11208604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 20215597 - 20215683
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  20215597 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtataattctgtttgaa-taaaagtctcttgc 20215683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23478015 - 23477945
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23478015 actgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttcagtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 23477945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 25112358 - 25112444
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25112358 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 25112444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 25171449 - 25171535
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25171449 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 25171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 36096144 - 36096230
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36096144 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttg-attagaagtctcttgc 36096230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 36097601 - 36097687
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36097601 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttg-attagaagtctcttgc 36097687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Original strand, 13736698 - 13736795
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||| |||||||||    
T  13736698 tctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagtagtgagcaattgtaatcaaatattaca-----tagtgaactctccttggaa 13736792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 35543621 - 35543733
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | ||| ||||    
T  35543621 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-atcagaagtctcttgctttagtgcttga 35543718  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    |||||  ||||||||    
T  35543719 gcattggaagtctct 35543733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13533577 - 13533494
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13533577 ttgtattgtgaacactattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgttattctgtttg-attagaagtctct 13533494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13403872 - 13403802
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13403872 actgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 13403802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 174
Target Start/End: Original strand, 22586458 - 22586567
Alignment:
Q  63 tatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggtt 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||   ||    
T  22586458 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacc-caaacatttttatgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttggtttt 22586555  T
Q  163 gtgtttgagcat 174  Q
    ||| ||||||||    
T  22586556 gtgcttgagcat 22586567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32753750 - 32753627
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  32753750 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaac-attttctgtg 32753655  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32753654 taattttgtttgaa-tagaagtctcttgc 32753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 20417397 - 20417479
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20417397 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaa-tagaagtctct 20417479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6498815 - 6498745
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6498815 aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgttgttgtgcttgagtagtttggagtctcttg 6498745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Original strand, 26055951 - 26056048
Alignment:
Q  12 aatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |  ||||||| |||||  || || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26055951 aatttcttaacaactttcatatcttagaaattcgattgtcttaacagtcta-atttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 26056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 20625259 - 20625331
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  20625259 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaat 20625331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 287
Target Start/End: Original strand, 26766450 - 26766534
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26766450 cataggaagtctcttgcatttgtacttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgattagttgtaatcagatattacat 26766534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 106613 - 106695
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  106613 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-actttctgtgtatttctgtttg-attagaagcctct 106695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 39352981 - 39353094
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  39352981 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 39353078  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  39353079 gcattagaagtctctt 39353094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 39364974 - 39365087
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  39364974 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 39365071  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  39365072 gcattagaagtctctt 39365087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 40390850 - 40390963
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  40390850 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 40390947  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  40390948 gcattagaagtctctt 40390963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 40401512 - 40401625
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  40401512 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 40401609  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  40401610 gcattagaagtctctt 40401625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25740711 - 25740633
Alignment:
Q  153 tcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgag 231  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||| || |||||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25740711 tcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgctgttgtgcttgag 25740633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 30608560 - 30608612
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaaga 57  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30608560 cacttagaatttcttatataagtttatatcttagaaattctaaagtcttaaga 30608612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7031893 - 7031808
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  7031893 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgc 7031808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20968766 - 20968719
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20968766 cataggaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttggaagtctcttgc 20968719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 22676609 - 22676723
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||    ||| ||||    
T  22676609 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctctcgcctgcgtgcttga 22676707  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  22676708 gcattagaagtctctt 22676723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 22686500 - 22686614
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||    ||| ||||    
T  22686500 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctctcgcctgcgtgcttga 22686598  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  22686599 gcattagaagtctctt 22686614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 37407148 - 37407226
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  37407148 gtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-tagaagcctcttgc 37407226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14845 - 14536
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  14845 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacgccactgattgtatatc 14746  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  14745 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttgaagtttcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 14646  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  14645 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagat-ttaca--ttttagtgaact 14549  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  14548 ttccttggaagtg 14536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 117)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19085887 - 19085576
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19085887 agttcatttagaattttttatcaaagcgcatatcttagaaactctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 19085788  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  19085787 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 19085688  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  19085687 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttggtgaac 19085590  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  19085589 tctccttggaagtg 19085576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7763381 - 7763071
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  7763381 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 7763282  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| | ||    
T  7763281 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgtttagga 7763183  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7763182 gcatatgaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctaagtttagcactcaacaattgtaatcagatattaca-tttttagtgaact 7763084  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     | |||| |||||    
T  7763083 cttcttgaaagtg 7763071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24116557 - 24116245
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  24116557 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatat 24116458  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  24116457 caagtgttcaacctcaaataattttttgtgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagctgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcag 24116358  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24116357 gagcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttaaagtctctcgctaagtttagaagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaa 24116260  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  24116259 ctctccttggaagtg 24116245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19623708 - 19623418
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  19623708 agttcacttagaatttcttatcaaagtta-tatcttagaaattatagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatat 19623610  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||     
T  19623609 caagtgtttaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagactcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctctagattgtgttcag 19623510  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19623509 gagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgaataatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttt 19623418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 12715843 - 12716153
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12715843 agttcacttcgaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 12715942  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  12715943 aagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcaggtgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 12716042  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12716043 agcataggaattctcttgcagttgtgcttgag-catttatagtctcttgctaagtttagcaatgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 12716139  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  12716140 tctccttggaagtg 12716153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9717569 - 9717262
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  9717569 agttcactcagaatttcttatcaattttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 9717470  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  9717469 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 9717371  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  9717370 agcataagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattac-----ttagtgaac 9717276  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  9717275 tctccttggaagtg 9717262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19470394 - 19470085
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  19470394 agtttacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 19470295  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||    
T  19470294 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttttgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcagga 19470196  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  19470195 gcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatatcaca--ttatagtgaact 19470098  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||| ||||||    
T  19470097 ctccttagaagtg 19470085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 20731127 - 20731410
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  20731127 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 20731226  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  20731227 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 20731325  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 284  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20731326 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 20731410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 14100859 - 14101169
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaa-caaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||| |    
T  14100859 agttcacttagaatttcttcttcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaataccactgattgtattt 14100958  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  14100959 caagtgtccaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 14101057  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14101058 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagagagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 14101155  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  14101156 tctccttggaagtg 14101169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 19066443 - 19066727
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  19066443 tcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaag 19066542  T
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |    
T  19066543 tgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaggtctattgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagc 19066642  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19066643 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 19066727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18435265 - 18434956
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||| |||| ||||||| |||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18435265 ttcacatagagtttcttatcaactttcatatcgtagaaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 18435166  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  18435165 gtgttcaaccttaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtctcttacagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggag 18435067  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  18435066 cataggaagtctcttgcagttgtgcttga-tcatttgaagtctcttgctaaatttagcagtgagcagttgtaattacatattacattttttagtgaactc 18434968  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  18434967 tccttggaagtg 18434956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21624816 - 21624510
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  21624816 agttcacttaaaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgagcaccactaattgtatatc 21624717  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  21624716 aagtgttcgacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgattgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 21624618  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||    
T  21624617 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtatcttgctagttttagcagtgagcaattgtaattagatattac-----ttagtgaac 21624524  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  21624523 tctccttggaagtg 21624510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 19951994 - 19952279
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  19951994 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcataagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattttatatc 19952093  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  19952094 aagtgttcaacctcaaacatttttct-agtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaggtctcttgattgtgttcaag 19952192  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | ||||| || | ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19952193 agcatagaaagtttcttgcagttgtgtttgag-catttgaagtcttttgctaattttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 19952279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13601893 - 13601585
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13601893 ttcatttagaatttcttaacagctttcatatcttagaaattttagagtcttaagagtcggtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 13601794  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  13601793 gtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaatttagaagtctcttggagttgtacttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggag 13601694  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  13601693 cataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcgtgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactc 13601597  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  13601596 tccttggaagtg 13601585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26942164 - 26941854
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  26942164 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttaggaattatagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 26942065  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||  |||  ||||  ||    
T  26942064 aagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctctcgatttagttcttga 26941966  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26941965 gcataggtaatctcttgcagttgtgattgagtagtttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtaaact 26941867  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  26941866 ctccttggaagtg 26941854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29597801 - 29597554
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29597801 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctaaagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 29597702  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29597701 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgaacattaaaagtctcttgatcgtgttcaaga 29597602  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29597601 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttcag-catttgaagtctcttgc 29597554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32543991 - 32543708
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  32543991 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttataaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 32543892  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |    
T  32543891 aagtgttcaacctcaaaaaaatttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattataagtcttttgattgtgttcagg 32543793  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 284  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32543792 agcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcaactgtaatcagatatta 32543708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16876631 - 16876322
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16876631 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatatgtattgtgaacaccactgattgtatatc 16876532  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||| || || |||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  16876531 aagtgtttaaactaaaac-atattttttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgaagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaag 16876433  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16876432 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattac--tttttagtgaac 16876336  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||| ||||||    
T  16876335 tctccttcgaagtg 16876322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 15532048 - 15532334
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  15532048 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatattttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtaatgtgaacaccactgattgtatatc 15532147  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt--agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  15532148 aagtgttcaacctcaaacatctttct-tgtagttctgtttgaattaaagaagtctattgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcag 15532246  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532247 gagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 15532334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19688506 - 19688202
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  19688506 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttataaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 19688407  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  19688406 aagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttaagca-taaaagtctcttgattgtgttcagga 19688308  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||     |||||||||    
T  19688307 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaaatcttttgc-tagtttagcattgagcgattgcaatcagatattaca-----tagtgaact 19688215  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  19688214 ctccttggaagtg 19688202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12422989 - 12422683
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12422989 agttcactcagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 12422890  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||| |    
T  12422889 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcctgcagttgtgcttgagcaatagaagactcttgattgtgttcagg 12422791  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  12422790 agcatgggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 12422697  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  12422696 tctccttggaagtg 12422683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15301899 - 15301633
Alignment:
Q  45 tagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa- 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15301899 tagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 15301800  T
Q  144 ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtc 243  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  15301799 ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaattctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-cttttgaaatc 15301701  T
Q  244 tcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  15301700 tcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 15301633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16915153 - 16914864
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagtta-atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  16915153 agttcacttagaatttcttatcaaactttcatatcttagaaattctatagtcttaagagactgtatgtgatttatattgtgaacacgactaattgtatat 16915054  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  16915053 caagtgttcaacctcaaacatttttctttgaaattatgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagg 16914955  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  16914954 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagtagtcgtaatcagatattacatttt 16914864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22801866 - 22801580
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22801866 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaatagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22801767  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||  |||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  22801766 aatggttcaactgcaaacattttgct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 22801668  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801667 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatttgaagtctcttactagtcttagaagtgagcaattgtaatcagatattacat 22801580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19482480 - 19482171
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  19482480 agttcacttagaatttcttaacaaaggttacatcttaggaattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 19482381  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||| | ||  |||||||    
T  19482380 caagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgttcttgagcaatagaagtctccttatcttgttcaa 19482281  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||| | | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||     |||||||    
T  19482280 gagcataggaagtctcttacagttgcgcttcagcaatttgaagtctcatactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaa 19482186  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  19482185 ctctccttggaagtg 19482171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 313
Target Start/End: Original strand, 33352679 - 33352957
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  33352679 atatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttcaacttcaaacaattttctttg 33352778  T
Q  130 taattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33352779 taattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctt 33352878  T
Q  229 gagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  33352879 gag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagattttaca-----tagtgaactctccttggaagtg 33352957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12347817 - 12347510
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||    
T  12347817 agttcacttaaaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacacg-ctgattgtatat 12347720  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||  |    
T  12347719 caagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgtagttgtgattgagcataggaagtctcttgattttgttcttg 12347621  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  12347620 agcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctattttgagcagtgaacaattgtaatcagatatt---gattttagtgaac 12347524  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  12347523 tttccttggaagtg 12347510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26589321 - 26589017
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26589321 acttagaatttcttaacaaagcttacatcttaggaattctagagtctttagagtctgtaaatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtg 26589222  T
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacat 204  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||    
T  26589221 ttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaattctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattttgttcaggagcat 26589122  T
Q  205 aggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaa-ttgtaatcagatattacattttttagtgaactatc 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||| ||    
T  26589121 aggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaatttgtaattagatattaca-----tagtgaactctc 26589027  T
Q  304 cttggaagtg 313  Q
    ||||||||||    
T  26589026 cttggaagtg 26589017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21617971 - 21617686
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21617971 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21617872  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  || |||| || |||||| || |||||||||| |    
T  21617871 aagtgttcaacctcaaac-attttttttgtttttctgtttgaattgagaagtcttttgcagttgttctttagcaatagaagtcttttgattgtgttcagg 21617773  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21617772 agcataggaagtctcttgcaattgttcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacat 21617686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25593796 - 25593490
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |  ||||||||||||||    
T  25593796 agttcacttagaatttcttaacaat-ttcatatcttataaattctagagtcttaagagtttgtatttgatttgtattgtgaatatcactgattgtatatc 25593698  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  25593697 aagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctatttaaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 25593598  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||||    
T  25593597 agcataggaagtctcttgcagttgtgtttgag-catttgaagtcttttgctaagtttagcagtgagcatttgtaatcaaatatt--atattttggtgaac 25593501  T
Q  300 tatccttggaa 310  Q
    | |||||||||    
T  25593500 tctccttggaa 25593490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29917743 - 29917445
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |      | ||||||||||||||    
T  29917743 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttataaattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattg------ccactgattgtatatc 29917650  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  29917649 aagtgttcaacctcaaacattttttt-tgtaattctgtttgaattaagaagtcttttgcagttttgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 29917551  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |   ||||||||||||| ||||||||||     ||||||||    
T  29917550 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttcaagtctcttgctaattttaac---gagcaattgtaataagatattaca-----tagtgaac 29917459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17927518 - 17927210
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  17927518 agttcgcttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagttttaagattctgtatctgatttttattgtgaacaccactgattgtttatc 17927419  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| || ||  ||    
T  17927418 aagtattcaacctcaaacatatttctttgtaattctgttt-aaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatgggaagtctcttgattttgctcttga 17927320  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||     ||||||||||||    
T  17927319 gcataggaaatctcttgcaattgtgtttgagtagtttgaagtctcttgctaattttagcattgagcagttgtaatcagatatt---gattttagtgaact 17927223  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  17927222 ctccttggaagtg 17927210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25930204 - 25929896
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| | | | ||||||||||||    
T  25930204 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattttagagccttaaaagtctgtatctgatttttattgtgaactccattgattgtatatc 25930105  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||| ||  |||||  ||    
T  25930104 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgatattgttcttga 25930006  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||| ||||||||||     ||||||||||||    
T  25930005 gcataggaaatctcttgcagttgtacttgcgtagtttgaagtctcttgctattttgagcagtgagcatttgtgatcagatatt---gattttagtgaact 25929909  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  25929908 ctccttggaagtg 25929896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19625537 - 19625228
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19625537 agttgacttagaatttcttaacaac-ttcattgcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatcttatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 19625439  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||  || |   |    
T  19625438 aagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatagaaagtatcttgttttagtacttta 19625340  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19625339 gcataggaaatctcttgcagttgtgttcgagtagtttgatgtctcttgctagttttagtagtaagcagttgtaatcagatataaca-tttttagtgaact 19625241  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  19625240 ctccttggaagtg 19625228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17381298 - 17381017
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||   |||    
T  17381298 acttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctggagtctttatagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatagtgtg 17381199  T
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacat 204  Q
    |||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || | || |||    
T  17381198 ttcaaccttaaatatttttatttgtaattctgtttggattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcatgattgtttttatgagcat 17381099  T
Q  205 aggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17381098 aggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaattagatattacat 17381017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25592346 - 25592040
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||    
T  25592346 agttcacttagaatttcttaccaactttcgtatcttagaaattatagagccttaagagtct-tatctgatttgtatagtgaacatcactgattgcatatc 25592248  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| | | |||||  ||    
T  25592247 aagtgttcaaccttaaaca-ttttctttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgaatttgttcttga 25592150  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||  |||   | ||||||||||||    
T  25592149 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagtgatt---tattttagtgaact 25592053  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  25592052 ctccttggaagtg 25592040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15954414 - 15954141
Alignment:
Q  10 agaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttca 109  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  15954414 agaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaaatgttca 15954315  T
Q  110 acctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacatagga 208  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||| ||    
T  15954314 acctcaaacatttttct-tataattatgtttgaattcagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttgaggagcatatga 15954216  T
Q  209 aatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 284  Q
    | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15954215 agtctcttgcaattgtgcttgag-catttgaattctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatatta 15954141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 101 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15986980 - 15986772
Alignment:
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||| | ||    
T  15986980 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgagt-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcat-agaagtctattgattgtgtttagga 15986883  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15986882 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 15986785  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||| ||||||    
T  15986784 ctcctttgaagtg 15986772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21234834 - 21234578
Alignment:
Q  50 tcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-ga 148  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  21234834 tcttaagagtct--atctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctatttgaattaaga 21234738  T
Q  149 agtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  21234737 agtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtttcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgccgttgtgcttgagcattttgaaatctcttg 21234638  T
Q  249 caaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  21234637 ctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 21234578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17446076 - 17446322
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgta-tcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  17446076 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacactactgattgtatat 17446174  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||   |||||||||   | ||| |  |    
T  17446175 caagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaa-tataagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcatttgtgcttg 17446272  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17446273 agcataggaaacctcttgctgttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 17446322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 20113119 - 20113288
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  20113119 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacaccactaattgtatatc 20113218  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgag 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  20113219 aagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgag 20113288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 16265573 - 16265727
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16265573 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 16265672  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctct 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16265673 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctct 16265727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22076828 - 22077013
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22076828 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatctttggtattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22076927  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  22076928 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctctt 22077013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7811740 - 7811569
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  7811740 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattttagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgttaacaccactgattgtatatc 7811641  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  7811640 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaa-tctgtttgaa-tagaattttcttgcagttgtgcttgagcat 7811569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 17316946 - 17317103
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  17316946 agttcacttagaatttcttaacaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 17317045  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttg 157  Q
    |||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17317046 aagtgttcaacctcaaccatttttcattgtaattatgtttgaatttagaagtctcttg 17317103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23296453 - 23296283
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  23296453 agttcacttataatttcttatcaaccttcatatcttagaaattcgagagtcttaagagtctgtatttgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatat 23296354  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgag 171  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  23296353 caactgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgag 23296283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21034716 - 21034545
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  21034716 agttcacttagaatttcttagcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtcac-atctaatttgtattgcgaacaccactgattgtatatc 21034618  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21034617 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 21034545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 24719162 - 24719406
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||    
T  24719162 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaactctaaagtcttaagagtatgtatatgatttgtattatgaacaccactgattgtacatc 24719261  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    |||||||||||||||  ||||| ||||||||   ||| |||||   ||||  |  ||    
T  24719262 aagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtt----ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgtgtgtgggcttga 24719357  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24719358 gcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 24719406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 283
Target Start/End: Original strand, 17303803 - 17303976
Alignment:
Q  109 aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacatagga 208  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||  || |||| ||    
T  17303803 aacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcttgagcatatga 17303901  T
Q  209 aatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17303902 aatctcttgcagttgtgctttagtagtttgaagtctcttgctattttgagcagtgagcaattgtaatcagatatt 17303976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 24728944 - 24729191
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||| |||    
T  24728944 agttcacttaaaatttcttaacaacttttatatcttagaaactctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacatcattgattgtacatc 24729043  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||   ||| |||||   ||||  |  ||    
T  24729044 aagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatacgaagactcttgcgtgtgggcttga 24729142  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24729143 gcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtcttttgc 24729191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18378062 - 18377861
Alignment:
Q  107 tcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattag-aagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacata 205  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||      
T  18378062 tcaacctcaaacatttttctttgtaattcggtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcagg 18377963  T
Q  206 ggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatcct 305  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||| ||||    
T  18377962 ggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcatttgtaattagatattaca-----tagtgaactctcct 18377869  T
Q  306 tggaagtg 313  Q
    ||||||||    
T  18377868 tggaagtg 18377861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 15395108 - 15395241
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15395108 agttcacttataatttcttaacaactttcataacttagaaactttagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 15395207  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaatt 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15395208 aagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaatt 15395241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 16463076 - 16463322
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagca-ctactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||| |||||||    
T  16463076 ttcacttagaatttcttaacaaccttcatatcatagaaattctagagtcttaagagtc-gcatctgatttgtattgtgaacaccaactgattttatatca 16463174  T
Q  102 agtgttcaacctcaaaca-attttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgt-gttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||   |||||||||  | || || |  |    
T  16463175 agtgttcaacctcaaacattttttttttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcaattgtgcttgagtataggaagtctctt-gtagtagtgcttg 16463272  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16463273 agcataggaaacctcttgcgtttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 16463322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23230916 - 23230745
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||    
T  23230916 agttcacttaaaatttcttaacaaattttatatcttataaattatagagtcttaagaatctgtatctgatttgttttgtgaacaccattgattgtatatc 23230817  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  23230816 aagtgttcaacctcaaac-attttttgtctaattctgttcg-tttataagtctcttgcttttgtgtttgagcat 23230745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13435465 - 13435303
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  13435465 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtct 13435367  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  13435366 cttgctagttttagcagtgaacaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 13435303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 18172663 - 18172806
Alignment:
Q  14 tttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacct 113  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18172663 tttcttaacaaatttcatatcttagaaactctcgcgtcttaagagtttgtatctgatttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacct 18172762  T
Q  114 caaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18172763 caaacatatttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 18172806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10631796 - 10631673
Alignment:
Q  35 ttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaatt 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10631796 ttagaaattctagagtctcaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaatt 10631697  T
Q  135 ctgtttgaatt-agaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  10631696 ctgtttgaattaagaagtctcttg 10631673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19875562 - 19875408
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgta-tcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||    
T  19875562 agttcacttagaatttctcaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactaattgtatat 19875464  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctctt 156  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19875463 caattgtttaacctcaaac-attttctttgtaattctttttgaattaaaagtctctt 19875408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32335564 - 32335318
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatctta-gaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  32335564 agttcacttagaacttcttaacaactttcatattttttgaaattctaaagtcttaagagttt-tatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatat 32335466  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||   |||||| ||   | ||| |  |    
T  32335465 caagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttg-attataagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctattgcgtttgtgcttg 32335368  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    | |||| || | |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32335367 agcatatgagacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 32335318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 287
Target Start/End: Original strand, 19833533 - 19833686
Alignment:
Q  134 tctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagt 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  19833533 tctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcagtagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtacttgag- 19833631  T
Q  233 aatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
     ||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19833632 catttgaaatctgttactaagtttagtagtgagcaattgtaataagatattacat 19833686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 245
Target Start/End: Original strand, 14070562 - 14070734
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  14070562 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 14070660  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctc 245  Q
    |||| | |||||||||  |||||| |  || |||||||| |||||||  | |||||||||| | |||||||||||    
T  14070661 gcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgttg-tgtgcttgagcattttgaagtctc 14070734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18227104 - 18226995
Alignment:
Q  48 agtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattag 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  18227104 agtcttaagagtttgtatctgatttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttg-attag 18227006  T
Q  148 aagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||    
T  18227005 aagtctcttgc 18226995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 10704957 - 10705071
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10704957 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattatagagtc--aagagtttgtatcttatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 10705054  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaa 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  10705055 aagtgttcaacctcaaa 10705071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26185439 - 26185263
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    |||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||    
T  26185439 acttagaatttcttataaaatt--atatcttagaaattctagtgtcttaagagtct-tatgtgatttgtattgtgaaaaccattgattgtatatcaagtg 26185343  T
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||  |||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  26185342 ttcaacgccaaatatttttatgtgtaattatgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgtttgagcataaaaaatctctt 26185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 245
Target Start/End: Original strand, 14051881 - 14052053
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  14051881 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 14051979  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctc 245  Q
    |||| | |||||||||  |||||| |  || |||||||  |||||||  | |||||||||| | |||||||||||    
T  14051980 gcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggatgtctcttgttg-tgtgcttgagaattttgaagtctc 14052053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16528836 - 16528729
Alignment:
Q  204 taggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatc 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  16528836 taggaaatctcttgcagtcgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctc 16528739  T
Q  304 cttggaagtg 313  Q
    ||||||||||    
T  16528738 cttggaagtg 16528729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11235309 - 11235223
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11235309 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 11235223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Original strand, 20113268 - 20113368
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20113268 tctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattaca--ttttagtgaactctccttggaa 20113365  T
Q  311 gtg 313  Q
    |||    
T  20113366 gtg 20113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21127890 - 21127804
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21127890 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 21127804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Original strand, 14732709 - 14732826
Alignment:
Q  172 cattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattg 271  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||    
T  14732709 cattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgtg-catttgaagtctcgtgctagttttagcagtgagcagttg 14732807  T
Q  272 taatcagatattacatttt 290  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14732808 taatcagatattacatttt 14732826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25595899 - 25595733
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||  ||  || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||    
T  25595899 cacttagaatttcttataaactttcatttcttagaaattctagagttttaagagtttgtatctaatttgtattgtgaacatcactgcttgtatatcaagt 25595800  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  25595799 gttcaa-atcaaacatttttctgtgtaattttgtt--gtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 25595733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 287
Target Start/End: Original strand, 17317094 - 17317203
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| ||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  17317094 aagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgagtaattgtaatca 17317193  T
Q  278 gatattacat 287  Q
    ||||||||||    
T  17317194 gatattacat 17317203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20635423 - 20635295
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20635423 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaattttctgt 20635324  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20635323 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 20635295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10631682 - 10631553
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10631682 aagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatca 10631584  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
     | ||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  10631583 aacattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 10631553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11205756 - 11205670
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11205756 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 11205670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22386464 - 22386378
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22386464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 22386378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31931233 - 31931120
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  31931233 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 31931136  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||  |||||||||    
T  31931135 gcattggaagtctctt 31931120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18555080 - 18554968
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  18555080 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 18554983  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    |||||  ||||||||    
T  18554982 gcattggaagtctct 18554968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15551712 - 15551607
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |    
T  15551712 cacttataatttcttaacaattgtcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctttatttgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaatt 15551613  T
Q  105 gttcaa 110  Q
    ||||||    
T  15551612 gttcaa 15551607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25518499 - 25518416
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25518499 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctct 25518416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13144733 - 13144662
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgattt 72  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13144733 agttcactttgaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgattt 13144662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 17608796 - 17608882
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17608796 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 17608882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 31127736 - 31127842
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    |||||||||||||||  ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||||||||    
T  31127736 acttagaatttcttataaactttcatatcttagatattctagagtcttaagagtct-tatctgatctgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtg 31127834  T
Q  106 ttcaacct 113  Q
    ||||||||    
T  31127835 ttcaacct 31127842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 157
Target Start/End: Original strand, 19453027 - 19453096
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19453027 actgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttg 19453096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17047352 - 17047256
Alignment:
Q  89 tgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||    
T  17047352 tgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaataattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctt 17047256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 19289766 - 19289850
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctctt 156  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19289766 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctctt 19289850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 7586646 - 7586732
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7586646 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagcgttcaaactcaaacaattttctgtgtaaatctgtttg-attagaagtctcttgc 7586732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17063994 - 17063897
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||    
T  17063994 actgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacaattttct-tgtaattctgtttgaa-tataagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctt 17063897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24398471 - 24398393
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttc 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  24398471 atatcatagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacatcattgattgtatatcaagtgttc 24398393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Original strand, 25735904 - 25736044
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25735904 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtg 25735999  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcatt 175  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||  | ||| |||||||||    
T  25736000 taattttgtttg-attagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 25736044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Original strand, 15478209 - 15478374
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||    
T  15478209 cacttaaaatttcttaacaactttcatatcttaaaagttctagagtcttaagagtctgaat-tgttttgtattgtgaacaccattgattgtatagcaagt 15478307  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||| | |||||   ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  15478308 gttcaaac-caaacttatttctttgtaatt-tgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 15478374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Original strand, 12953478 - 12953628
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  12953478 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaacaaatttttgtg 12953573  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctct 185  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  | ||| |||||||||  ||||||||    
T  12953574 taattctgtttg-attagaagcctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 12953628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 17742088 - 17742171
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17742088 ttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctatgtaattctgtttgattaagaagtctct 17742171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 25687096 - 25687247
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  25687096 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttatgtg 25687191  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||  | ||| |||||||||| ||| |||||    
T  25687192 taattttgtttg-attagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactctt 25687247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 9934057 - 9934139
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9934057 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattctgtttg-attagaagactct 9934139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 14923662 - 14923788
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||  ||| ||||    
T  14923662 atatcctagaaattctaaattcttaagagtctgattttgatttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcgaac-caaacatctttatgtg 14923760  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  14923761 taattttgtttg-tttagaagtctcttgc 14923788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 19833453 - 19833513
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtct 61  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19833453 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtct 19833513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 287
Target Start/End: Original strand, 22077008 - 22077083
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  22077008 tctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttactaagtttaatagagagcaattgtaatcagatattacat 22077083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22308593 - 22308515
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  22308593 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttctgtttg-attagaagcctcttgc 22308515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3680588 - 3680531
Alignment:
Q  254 tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3680588 tttagcagtgatcaattgtaataagatattac--tttttagtgaactctccttggaagtg 3680531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 17867320 - 17867272
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagag 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17867320 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagag 17867272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 17877103 - 17877055
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagag 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17877103 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagag 17877055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23296303 - 23296231
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  || |||||||| || || ||||||||||||    
T  23296303 tctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttggtattttgagcagtgaacatttataatcagatatt 23296231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 16123935 - 16124005
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  16123935 actgattgtacatcaagtgttcaaggtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaa-tagaagtctcttgc 16124005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Original strand, 18926110 - 18926187
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18926110 atatcttagaaattcaaaagtct--agagtctgtatcgtatt-gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18926187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 142
Target Start/End: Original strand, 14883505 - 14883544
Alignment:
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14883505 gtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattgtgtttga 14883544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 23006626 - 23006673
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23006626 cataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 23006673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23781740 - 23781693
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23781740 cataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 23781693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32757194 - 32757126
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  32757194 actgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-cagaagtctcttg 32757126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 17746168 - 17746240
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  17746168 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 17746240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29765347 - 29765276
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  29765347 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaac-attttctttgtatttttgtttgaat 29765276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31572226 - 31572155
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  31572226 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 31572155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5844898 - 5844827
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  5844898 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 5844827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Original strand, 18826623 - 18826693
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  18826623 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-atcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 18826693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Original strand, 18835018 - 18835088
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  18835018 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-atcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 18835088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 111
Target Start/End: Original strand, 31543280 - 31543320
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaac 111  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31543280 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 31543320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33199133 - 33199055
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  33199133 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgc 33199055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11915423 - 11915113
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||    
T  11915423 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagcctgtatctgatttgtattgtgaccaccactggttgtatatc 11915324  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||| ||    
T  11915323 aagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataacaagtctattgattgtgttcagga 11915225  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11915224 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaataagatattaca-tttttagtgaact 11915126  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||    
T  11915125 atccttggaagtg 11915113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 15014775 - 15015085
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15014775 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 15014874  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  15014875 aagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttcaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 15014973  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15014974 gcataggaaatctcttgcaattgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattaca-tttttagtgaact 15015072  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  15015073 ctccttggaagtg 15015085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 14605294 - 14605603
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14605294 agttcacttaaaatttcttaccaagtttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14605393  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  14605394 aagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtcattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttcagga 14605493  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||| ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14605494 gcatatgaagtctcttgcagttgcgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 14605590  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  14605591 ctccttggaagtg 14605603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23750245 - 23749936
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23750245 agttcacttaaaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgatcaccactgattgtatatc 23750146  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  23750145 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagtcgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 23750047  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23750046 gcataggaaatatcctgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttaacagtgaacagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 23749949  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  23749948 ctccttggaagtg 23749936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 17399064 - 17399372
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  17399064 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 17399163  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  17399164 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 17399263  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  17399264 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagactcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 17399358  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  17399359 tctccttggaagtg 17399372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Original strand, 22675913 - 22676220
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  22675913 gttcacttagaatttcttatcaaatttaataccttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatca 22676012  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    | |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  22676013 aatgttcaacctcaaacattttttcttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgattgagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 22676112  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  22676113 acataggaagtctcttacagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgaacaattgtaatcagatattaca-----tagtgaact 22676207  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  22676208 ctccttggaagtg 22676220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 306
Target Start/End: Original strand, 37986001 - 37986303
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  37986001 gttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatca 37986100  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  37986101 agtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtacttgagcattagaagtctctttattgtgttcagga 37986200  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  37986201 gcatacgaaatctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgatcaattgtaatcggatattaca--ttttagtgaact 37986297  T
Q  301 atcctt 306  Q
     |||||    
T  37986298 ctcctt 37986303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45833106 - 45832800
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  45833106 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 45833007  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  45833006 aagtgttcagcctcaaacatttttct-agtaattctgtttgaattaagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 45832908  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  45832907 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaggtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 45832814  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  45832813 tctccttggaagtg 45832800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22190567 - 22190280
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  22190567 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgttttgtgaacaccactgattgtatatc 22190468  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| | |    
T  22190467 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttagg 22190368  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22190367 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 22190280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6641406 - 6641096
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  6641406 agttcacttaaaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattttagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgagaacaccactgattgtatatc 6641307  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| |    
T  6641306 aagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcaattgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcagg 6641207  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6641206 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 6641110  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  6641109 tctccttggaagtg 6641096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29121086 - 29120802
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  29121086 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatc 29120987  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  29120986 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagtcgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 29120888  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29120887 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtcttttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 29120802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 61 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 55379971 - 55379722
Alignment:
Q  61 tgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcgg 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  55379971 tgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttccgtgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcag 55379873  T
Q  161 ttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagca 260  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55379872 ttgtgcttgagcat-agaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagca 55379774  T
Q  261 gtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  55379773 gtgagcagttgtaatcagatattacat-ttttagtgaactctccttggaagtg 55379722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 56034292 - 56034007
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  56034292 agttcatttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagt-tgtatctgatttgtattgtgaataccactgattgtatatc 56034194  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||| ||    
T  56034193 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcaattgtgcttgagcatttgaagtctcttgatcgtgttcagga 56034094  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56034093 gcataggaagtctcttgcagttgtacttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattttaatcagatattacat 56034007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16632163 - 16631853
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16632163 agttcacttagaatttcgtaacaactttcatatctaagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgaacaccacttattgtatatc 16632064  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  16632063 aagtgttcaacgtcaaacatttttcgttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgaagttgtgcttgggcattagaagtctcttgattgtgtttagg 16631964  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  16631963 agcataggaagtttcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcatttgtaataagatattaca--ttttagtgaac 16631867  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  16631866 tctccttggaagtg 16631853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54679649 - 54679341
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  54679649 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattccagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 54679550  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| |    
T  54679549 aagtgttcaacctcaaccatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtttcttgattgtgttcagg 54679450  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc-aaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||    
T  54679449 agtataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagtttttagcagtgagcaattctaatcagatattaca-----tagtgaa 54679356  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  54679355 ctctccttggaagtg 54679341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 3105809 - 3106116
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  3105809 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattatagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 3105908  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  3105909 aagtgttcatt-tcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 3106007  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  3106008 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgaacatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 3106102  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  3106103 tctccttggaagtg 3106116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11900912 - 11900603
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  11900912 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtctaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 11900813  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| || |||||||||||| | |||||| |||||||    ||||||||| ||| |||||  ||    
T  11900812 aagtgttcaacctcaaaaaaatttctttgcaattctattt-aaatagaagtctcttacagttgtgcttgagcaaaggaagtctcttgattatgttcttga 11900714  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  11900713 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagtaattgtaattagatattaca--ttttagtgaact 11900616  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  11900615 ctccttggaagtg 11900603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 8685831 - 8686142
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  8685831 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagactcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatata 8685930  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
     ||||||||||||||||||   || | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||||  ||    
T  8685931 cagtgttcaacctcaaacatagttatttgtcattctgtttgaat-agaagtcacttgcagttgtgcttgagtataggaagtctcttgattgtgttcttga 8686029  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8686030 gcatgggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagttttaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 8686129  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  8686130 ctccttgaaagtg 8686142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10072654 - 10072368
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  10072654 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttatatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatc 10072555  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  10072554 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaga 10072456  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10072455 agcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtcttttgatagttttagcaatgagcaattgtaatcatatattacat 10072368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12600480 - 12600173
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||     
T  12600480 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagacttaggagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactaattgtatata 12600381  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  12600380 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcagg 12600281  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12600280 agcataggaaatctcttgcagttgtggttgag-catttgaagtctctt--ctagtgtagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 12600186  T
Q  300 tatccttggaagt 312  Q
    | |||||||||||    
T  12600185 tctccttggaagt 12600173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20977180 - 20976892
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  20977180 agttcacttagaatttcttaacaaagcttacatcttaggaattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatat 20977081  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  20977080 caagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaattaagaattctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcag 20976981  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20976980 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 20976892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 37435936 - 37436211
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37435936 agttcacttagaatttcttaacaactttcat------gaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatc 37436029  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||    
T  37436030 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgagttagaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tagaagtctcttgattgtgttcagga 37436128  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatta 284  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37436129 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtaagcaattgtaatcagatatta 37436211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16853225 - 16852917
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  16853225 agttcacttggaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 16853126  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  16853125 aagtgttcaacctcaaac-atattctttgtacttctgtttgaagtgagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 16853027  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16853026 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttaag-catttgaagtctcttactaaatttagtagtgagcaattgtaatcagatattac---ttttagtgaac 16852931  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  16852930 tctccttggaagtg 16852917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 19912268 - 19912557
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||    
T  19912268 agttcacttagaattccttatcaaaattcatttcttagaaattctagagtcttaagagtctgtttctgatttgtattgtgaacaccattgattgcatatc 19912367  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  19912368 aagtgttcaacctcaaacaattttcgttgtagttctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttgagg 19912467  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19912468 agcataggaagtctcttgcagtagtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattacatttt 19912557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6517207 - 6516901
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  6517207 agttcacttagaatttattatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 6517108  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| | |    
T  6517107 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtcttttgcagttatgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttagg 6517009  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  6517008 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattttaatcagatattaca-----tagtgaac 6516915  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  6516914 tctccttggaagtg 6516901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 287
Target Start/End: Original strand, 13576508 - 13576792
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||    
T  13576508 ttcacttagaatttcttattaactttcatatcttaaaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgatcgtatctcaa 13576607  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||     
T  13576608 gtgttcaacttcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagaattagaagtctcttgattgtgttaaggag 13576706  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13576707 cataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcaatgagaaattgtaatcagatattacat 13576792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 56533450 - 56533759
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  56533450 agttcacttaaaatttcgtatcaaagttcatatctttgaaattctaaagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 56533549  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt---agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttca 197  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  56533550 aagtgttcaacctcaaaca-tattctttgtaattctgtttgaatttttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatcagaagtttcttgattgtgttca 56533648  T
Q  198 agaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtga 297  Q
     || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  56533649 ggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtga 56533743  T
Q  298 actatccttggaagtg 313  Q
    ||| ||||||||||||    
T  56533744 actctccttggaagtg 56533759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 14154383 - 14154669
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagtta-atatcttagaaattctagagtctta-agagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  14154383 agttcacttagaatttcttaacaaactttcatatcttagaaattctagagtctgatagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtata 14154482  T
Q  99 tcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttca 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  14154483 tcaagtgttcaacctcaaac-attttccttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttct 14154581  T
Q  198 agaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca 286  Q
     || |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  14154582 tgagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgaacatttgtaatcagttattaca 14154669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 3500043 - 3500348
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  3500043 agttcacttaaaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctga-ttgtattgtaaacaccactgattgtatatc 3500141  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  |||||| |    
T  3500142 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcagg 3500241  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  3500242 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaaatttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 3500335  T
Q  300 tatccttggaagt 312  Q
    | |||||||||||    
T  3500336 tctccttggaagt 3500348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 27189033 - 27189320
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||    
T  27189033 tcacttagaatttcttaacaaagcttgcatcttaggaattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaa 27189132  T
Q  103 gtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaa--ttctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |  || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  27189133 gtgttcaacttcaaacaattttctttgttaatttttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 27189232  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27189233 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 27189320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19666092 - 19665801
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatat----cttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgta 96  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||||    
T  19666092 agttcacttataatttcttatcaaagttcatatatatcttagaaattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtaaataccactgattgta 19665993  T
Q  97 tatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgtt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19665992 tatcaaatgttcaacctcaaacatttttctttgtaaatttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtt 19665893  T
Q  196 caagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaag-tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19665892 caagagcataggaagactcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacat 19665801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 15475533 - 15475841
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  15475533 agttcacttataatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagttagtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatc 15475632  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||| |    
T  15475633 aagtgtttaatctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcgtgttcagg 15475732  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||     ||||||||    
T  15475733 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcattgagcaattgtaatcaaatattaca-----tagtgaac 15475827  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  15475828 tctccttggaagtg 15475841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 17788427 - 17788736
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  17788427 agttcacttagaatttcttaaccactttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 17788526  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||| |||   |||  |    
T  17788527 caagtgttcaatctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaattctcttgatttatttcttg 17788625  T
Q  200 aaca-taggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    | ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17788626 agcacggggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattaca-tttttagtgaa 17788724  T
Q  299 ctatccttggaa 310  Q
    || |||||||||    
T  17788725 ctctccttggaa 17788736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17540121 - 17539840
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||    
T  17540121 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattatatatc 17540022  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||| |||| |||  ||||  ||    
T  17540021 aagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgatgatagaaagtttcttgatttagttcttga 17539923  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17539922 gcataggaaatctcttgtagttgcgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatatt 17539840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 55731567 - 55731261
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  55731567 agttctcttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 55731468  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  55731467 aagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattatgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 55731369  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  55731368 agcataggaagtctcttgcatttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgaacatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 55731275  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  55731274 tctccttggaagtg 55731261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 9751929 - 9752216
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  9751929 agttcacttagaatttctttacaaagcttacatcttaggaattctagaatctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 9752028  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  |||||  |    
T  9752029 aagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcttg 9752128  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  9752129 agcataggatgtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtattgagcatttgtaatcagatattacat 9752216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 17701154 - 17701432
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  17701154 agttcacttagaatttcttaacaaagcttacatcttaggaattctagagtct---------gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 17701244  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  |||||| |    
T  17701245 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatattgttcagg 17701344  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17701345 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagtagtgagcaattgtaattagatattacat 17701432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 25651486 - 25651770
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| | |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  25651486 agttcacttataatttct-atcaaagctcatatattagatattctagtgtctttagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatc 25651584  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| | |    
T  25651585 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tggaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttagg 25651683  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25651684 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaaatttagtagtgagcaattgtaataagatattacat 25651770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40860383 - 40860105
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  40860383 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtat---------gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 40860293  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |      
T  40860292 aagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgattgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttagt 40860193  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  40860192 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttttaatcagatattacat 40860105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23123242 - 23122969
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||    
T  23123242 agttcacttagaatttcttatcatatctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcactgtgaacaccactgattgtatatc 23123143  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  23123142 aagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgccattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 23123043  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaa 274  Q
    | |||| ||| ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  23123042 agcatatgaagtctcttgcaattgtacttgag-catttgaagtctcttggtagttttagcagtgagcaattgtaa 23122969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 29680935 - 29681153
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29680935 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 29681034  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  29681035 aagtgttcaaccttaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttacagatgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 29681134  T
Q  200 aacataggaaatctcttgc 218  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  29681135 agcataggaagtctcttgc 29681153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 10661555 - 10661837
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||    
T  10661555 agttcacttataatttcttaacaactttcatatattagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactggttgtatctc 10661654  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || |||||   ||||||||| |||  ||||  ||    
T  10661655 aagtgttcaacatcaaacaattttctttgtaattctgttt-aagtagaagtcacttgcagttgtgcttaagcatatgaagtctcttgatttggttcttga 10661753  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagttt-agcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10661754 gtataagaaatctcttgcacttgtggttgagtagcttgaagtctcttgctagttttgagcagtgagcaattgtaatcagatatt 10661837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 10875700 - 10875982
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||    
T  10875700 agttcacttataatttcttaacaactttcatatattagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactggttgtatctc 10875799  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || |||||   ||||||||| |||  ||||  ||    
T  10875800 aagtgttcaacatcaaacaattttctttgtaattctgttt-aagtagaagtcacttgcagttgtgcttaagcatatgaagtctcttgatttggttcttga 10875898  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagttt-agcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10875899 gtataagaaatctcttgcacttgtggttgagtagcttgaagtctcttgctagttttgagcagtgagcaattgtaatcagatatt 10875982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16848269 - 16847961
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||  | ||||||||||||    
T  16848269 agttcacttggaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtttttagagtctgtatctgatttgttttgtgaacatcattgattgtatatc 16848170  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||| |||| ||||| |    
T  16848169 aagtgctcaaccttaaac-atattctttgtaatcttgtttgaattgagaagtcttttgccgttgtgcttgaacaatagaagtctcttgattgagttcatg 16848071  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16848070 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgtg-catttgaagtctcttactaaatatagtagtgagcaattgtaatcagatattac---ttttagtgaac 16847975  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  16847974 tctccttggaagtg 16847961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 41115158 - 41115456
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||             ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||    
T  41115158 agttcacttataatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtctc------------ctgatttgtattgtgaacaccactgattgtacatc 41115245  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||  ||||   |    
T  41115246 aagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgatttagttcttaa 41115344  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41115345 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttaaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattaca-ttttcagtgaact 41115443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 12811565 - 12811761
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12811565 agttcacgtagaatttcttatcaaagtttatatcttagaaattttagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 12811664  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttca 197  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12811665 aagtgttcaatctcaaacatttttcgttgtaattctatttgaattagaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttca 12811761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 14904746 - 14904931
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  14904746 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtaaacaccactgattgtatatc 14904845  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  14904846 aaatgttcaacctcaaacatttttttgtgtaattctgtttgaattagaagtatcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctctt 14904931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19621449 - 19621674
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||| ||||||||||    
T  19621449 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtaaacaccacttattgtatatc 19621548  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||      
T  19621549 aagtgttcaacctcaaataattttatgtgtaattatatttgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttgagtattagaagtctcttgattgtgttcagt 19621648  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtg 225  Q
    | ||||| |||||| ||| |||||||    
T  19621649 agcatagtaaatcttttgaagttgtg 19621674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8105359 - 8105164
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  8105359 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtgtgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 8105260  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttc 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| || ||| |||||    
T  8105259 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctattgattttgttc 8105164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 39420124 - 39420343
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  39420124 agttcacttagaatttcttaacaaagctcacatcttaggaattctagagtctttaagagtctatatctgatttgtattgttaacaccactgattgtatat 39420223  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  39420224 caagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttacagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcag 39420323  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgc 218  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  39420324 gagcataggaagtctcttgc 39420343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16939751 - 16939565
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16939751 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttacgaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 16939652  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  16939651 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctctt 16939565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3395311 - 3395126
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  3395311 agttcacttagaatttcttaacaactttcttatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 3395212  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||    
T  3395211 aagtgttcaacctcaaac-attttctttttaattctatttgaatttagaagtctcttgcagttatgcttgagcatttgaagtctctt 3395126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17057504 - 17057749
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  17057504 agttcacatagaatttcttaaaaactttcctatcttagaaattctaaagtcttaagagtct-tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 17057602  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||   |||||| ||   | ||| |  ||    
T  17057603 aagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaa-taaaagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtcttttgtgtttgtgcttga 17057700  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17057701 gcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 17057749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20571388 - 20571635
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||    
T  20571388 agttcacttagaattttttaacaactttcatatctttgaaattatagagtcttaagagtttgtatctgatttgtactgtgaacaccactggttgtatatc 20571487  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||   | ||| |  ||    
T  20571488 aagtgttcaacctctaacatttttctgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgtttgaacataggaagtctcttgtgtatgtgcttga 20571586  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     |||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20571587 gcatatgaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 20571635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38513600 - 38513442
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  38513600 agttcacttagaatttcttatcaaagtttacatcttagaaattctaaagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 38513501  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttg 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38513500 caagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgtttgaatttagaagtctcttg 38513442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15135374 - 15135146
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaa 177  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |     
T  15135374 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttataattctgtttgaa-tagaagtctcttgtagttgtgcttatgcataag 15135276  T
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||  || ||||||  |||||| |    
T  15135275 aagtctcttgattgtgttctggagcataggaaatctcttgttgttgtgcttgagttgtttgaagtctcttgctagttttcacaatgagcagctgtaatta 15135176  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttgga 309  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15135175 gatattaca--ttttagtgaactctccttgga 15135146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19884422 - 19884267
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  19884422 gttcacttagaatttcttatcaaatttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatca 19884323  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttg 157  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  19884322 agtgttcaaccgcaaacatttttct-tgtaattttgtttgacttaagaagtctcttg 19884267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 14902836 - 14902992
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||    
T  14902836 agttcacttagaatttcttaaaaaattttatatcttagaaattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaccgaatgtatatc 14902935  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  14902936 aagtgttcaacctcaaacatttttctgtataattgtgtttg-tctagaagtctcttgc 14902992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13890551 - 13890305
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    |||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  13890551 ttcacttagaatttccaaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatca 13890452  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||   ||| || ||   | ||| |  ||     
T  13890451 agtgttccacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttg-tttagaagactcttgcttttgtgcttgagcataggaagactattgtgtttgtgcttgag 13890353  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13890352 cataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 13890305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16939576 - 16939414
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16939576 tagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtct 16939478  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  16939477 cttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 16939414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 313
Target Start/End: Original strand, 19610827 - 19611031
Alignment:
Q  104 tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaac 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| || |    
T  19610827 tgtttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttcgaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaaatctcttgattgtgttcaggagc 19610926  T
Q  203 ataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactat 302  Q
    |||  ||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||     ||||||||| |    
T  19610927 ataaaaagacttttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattaca-----tagtgaactct 19611020  T
Q  303 ccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||    
T  19611021 ccttggaagtg 19611031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2651534 - 2651396
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| | |||| |||||||    
T  2651534 agttcacttagaatttcttat-aaatttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtct-tatcttatttgtattgtgaacaccaatgatagtatatc 2651437  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttg 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2651436 aagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttg 2651396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18773780 - 18773627
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgta-tcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||| |    
T  18773780 agttcacttagaatttcttaagaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattcgtgaacaccactaattgtattt 18773681  T
Q  100 caag-tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtct 153  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18773680 caagtttttaaacctcaaacaattttctatgtaattatgttt-aattagaagtct 18773627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 16324904 - 16325013
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  16324904 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 16325003  T
Q  101 aagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||    
T  16325004 aagtgttcaa 16325013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Original strand, 19889427 - 19889620
Alignment:
Q  55 agagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19889427 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaacctcaaac-attttctgtgtaattctgtttg-attagaagtct 19889524  T
Q  154 cttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    |||||  ||||| ||||||||   ||| |||||   | ||| |  || ||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19889525 cttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgtctttgtgcttgagcataggaaacctcttgattttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 19889620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13027500 - 13027369
Alignment:
Q  3 ttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  13027500 ttcacttagaatttcttaacaactttcataacttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtgtatcaa 13027401  T
Q  103 gtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaatt 134  Q
    |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13027400 gtgttcaaacctaaaac-attttcagtgtaatt 13027369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 21350589 - 21350836
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||   | |||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21350589 agttcacttagaattttctaacaactgttatatcttagaagatctagtatcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21350688  T
Q  101 aagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||  || |||   ||||| |||||||| | |||||||||   ||||| |  |    
T  21350689 aagtgttcaaacctcaaacatctttttgtgtaattttgtttg-attaaaaacctattgtttttgtgcttgagcataagaagtctcttgtgtgtgtgcttg 21350787  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttg 248  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  21350788 aacataagaaatctcttgcttttgtgcttgagtatattgaaatctcttg 21350836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36470541 - 36470418
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  36470541 agttcacttagaatttcttaacaattttcatatcttagaaattctagagtct---------gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 36470451  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaat 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36470450 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaat 36470418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19884276 - 19884146
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| |||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  19884276 aagtctcttgattgtgttcaggagcagatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtttcttgctaattttagtagtgagcaattgtaatca 19884177  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  19884176 gatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 19884146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8103806 - 8103698
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  8103806 cataggaagtctcttgcagttgtccttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttaacagtgagcaattgtaatcaaatattac--tttttagtgaactc 8103710  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  8103709 tccttggaagtg 8103698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 187
Target Start/End: Original strand, 17994196 - 17994311
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  17994196 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 17994294  T
Q  171 gcattaaaagtctctta 187  Q
    ||||   ||||||||||    
T  17994295 gcataggaagtctctta 17994311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1672039 - 1671953
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1672039 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 1671953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3395161 - 3395062
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  3395161 tctcttgcagttatgcttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtaaactctccttggaa 3395065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 313
Target Start/End: Original strand, 16475912 - 16476077
Alignment:
Q  146 agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctc 245  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  16475912 agaagtctcttgcagttgcgcatgagcataagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaaatctcttgttg-tgtgcttgagtagtttgaagtctc 16476010  T
Q  246 ttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||| |  ||||| ||| | || || ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  16476011 ttgctagttttagtagtaaacagttataatccgatattaca-tttttagtgaactctcattggaagtg 16476077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19241903 - 19241817
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19241903 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 19241817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 16819754 - 16819867
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  16819754 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 16819852  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    |||||  ||||||||    
T  16819853 gcattggaagtctct 16819867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 18007464 - 18007548
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctctt 156  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18007464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctctt 18007548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38513451 - 38513342
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| ||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  38513451 aagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgagtaattgtaatca 38513352  T
Q  278 gatattacat 287  Q
    ||||||||||    
T  38513351 gatattacat 38513342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 36210514 - 36210600
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36210514 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 36210600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23508996 - 23508884
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  23508996 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 23508899  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    |||||  ||||||||    
T  23508898 gcattggaagtctct 23508884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 18775019 - 18775144
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||  ||  |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18775019 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttaattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtg 18775116  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18775117 taattctgtttg-attagaagtctcttgc 18775144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 14711189 - 14711268
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14711189 gtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 14711268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 14778853 - 14778932
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14778853 gtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 14778932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33378107 - 33377978
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctg-atttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctg 127  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || || ||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33378107 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattggtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctg 33378008  T
Q  128 tgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33378007 cgtaattctatttgaa-tagaagtctcttgc 33377978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10249509 - 10249380
Alignment:
Q  147 gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctct 246  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10249509 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaatctcttgtagttgttcttgagtagtttgaagtctct 10249410  T
Q  247 tgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatc 276  Q
    ||| |  || |||  |||||||||||||||    
T  10249409 tgctattttgagccctgagcaattgtaatc 10249380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55651241 - 55651090
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  55651241 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaac-attttctgtg 55651146  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||| |||||    
T  55651145 taattttgtttgaa-tagaagtctcttgccttcgtgcttgagcattagaagactctt 55651090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Original strand, 8997659 - 8997743
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8997659 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaga-caaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttg 8997743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20577011 - 20576902
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| |||||||||  ||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  || ||||||||||||||    
T  20577011 agttcacttataatttcttataaactgtcatatcttagaaattttagagtcttaagagtctgtatttgatttgtatttggaaaaccactgattgtatatc 20576912  T
Q  101 aagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||    
T  20576911 aagtgttcaa 20576902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13693520 - 13693360
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  13693520 agttcacttagaatttcttataaactttcatatcttagaaattctagagtct---------gtatctgatttgtattgcgaacaccactgattgtatatc 13693430  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  13693429 aagtgttcaaac-caaacatctttctgtgtaat--tgtttg-tttagaagtctctagcttttgtgcttgagcat 13693360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Original strand, 18775816 - 18775881
Alignment:
Q  89 tgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18775816 tgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaatcttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctct 18775881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Original strand, 17526777 - 17526880
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17526777 cacttagaattttttgacaactttgatatcttagaaattctagagtctt-agagtctgaat-tgttttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagt 17526874  T
Q  105 gttcaa 110  Q
    ||||||    
T  17526875 gttcaa 17526880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18473748 - 18473643
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||| |||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18473748 cacttataatttcttataaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctcattattatttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagt 18473649  T
Q  105 gttcaa 110  Q
    ||||||    
T  18473648 gttcaa 18473643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 312
Target Start/End: Original strand, 14904898 - 14904992
Alignment:
Q  213 tcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagttt-agcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||    
T  14904898 tcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgataggttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaag 14904991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 49002360 - 49002442
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49002360 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaa-tagaagtctct 49002442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10249584 - 10249510
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtat 76  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10249584 agttcacttagaatttcttatcaactttcatattttagaaattctagaatcttaagagtct-tatctgatttgtat 10249510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18394259 - 18394154
Alignment:
Q  4 tcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaag 103  Q
    |||||||||||||||||| ||  |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||   || || ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18394259 tcacttagaatttcttaataacttccatattttagaaattttagagtcttaagagtcaa-atttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaag 18394161  T
Q  104 tgttcaa 110  Q
    |||||||    
T  18394160 tgttcaa 18394154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4948218 - 4948105
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||   |||| ||||    
T  4948218 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgtgtgcttga 4948121  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  4948120 gcattagaagtctctt 4948105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 7222219 - 7222121
Alignment:
Q  11 gaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||  ||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  7222219 gaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtc-caatttgttttgtattatgaacaccagtgattgcatatcaagtgttcaa 7222121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Original strand, 39420332 - 39420381
Alignment:
Q  238 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39420332 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 39420381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3390320 - 3390250
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  3390320 actgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaa-cagaagtctcttgc 3390250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 24028464 - 24028577
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||    
T  24028464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 24028561  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  24028562 gcattagaagtctctt 24028577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 55380013 - 55379971
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaatt 43  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  55380013 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaatt 55379971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11535725 - 11535653
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  11535725 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 11535653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 31267171 - 31267243
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  31267171 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 31267243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17538914 - 17538814
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||| |||  ||||  || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||    
T  17538914 tagaagtctcttgcagttgtgcttgaggatagaaagtttcttgatttagttcttgagcatagaaaatctcttgtagttgcgcttgagtagtttgaaatct 17538815  T
Q  245 c 245  Q
    |    
T  17538814 c 17538814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Original strand, 19955348 - 19955454
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaa 177  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||| ||||||||||     
T  19955348 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattag 19955445  T
Q  178 aagtctctt 186  Q
    |||||||||    
T  19955446 aagtctctt 19955454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Original strand, 29681142 - 29681215
Alignment:
Q  238 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  29681142 gaagtctcttgctagtgttagcagtgagaagttgtaatcatatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 29681215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3370580 - 3370510
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  3370580 actgattgtatatcaagtgttcataatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaa-cagaagtctcttgc 3370510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5873251 - 5873166
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  5873251 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatatttctttgtatttttgtttgaa-tagaagcctcttgc 5873166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 16325089 - 16325136
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16325089 cataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 16325136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17917933 - 17917848
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  17917933 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgc 17917848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17928581 - 17928468
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||    ||| ||||    
T  17928581 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attggaagtctcttgcctgcgtgcttga 17928484  T
Q  171 gcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||| |||||||||    
T  17928483 gcattagaagtctctt 17928468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10300399 - 10300343
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  10300399 actgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaat 10300343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11514915 - 11514843
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  11514915 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctatgtatttttgtttgaat 11514843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24713304 - 24713240
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  24713304 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 24713240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36470424 - 36470382
Alignment:
Q  269 ttgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  36470424 ttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 36470382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 39532175 - 39532247
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||  | |||||||||    
T  39532175 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatctttgtttgaat 39532247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 62
Target Start/End: Original strand, 14357508 - 14357540
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctg 62  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14357508 atatcttagaatttctagagtcttaagagtctg 14357540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 19944713 - 19944791
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  19944713 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ctcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgc 19944791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9684 - 9376
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  9684 agttcacttagaatttcttatcaaa-ttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatc 9586  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  9585 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttaattgtgttcagga 9487  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9486 gcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgaatagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 9389  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  9388 ctccttggaagtg 9376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 74310 - 74001
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  74310 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctacagtcttaagagtctatatctgatttgtattgtgatcaccactgattgtatatc 74211  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||    
T  74210 aagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttaattgtgttcagga 74112  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  74111 gcataagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctaagtttaacagtgagcaattgtaatcaaatattaaa--ttttagtgaact 74014  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  74013 ctccttggaagtg 74001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 19851 - 20162
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19851 agttcaattagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 19950  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  19951 aagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaattagaagtcatttgcagttgtgcttgagcattagaaatctcttgattgtgttcaaaa 20050  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20051 gcgtaggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctatgtttagcgttgagcagttgtaataagatattaca-tttttagtgaact 20149  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     || |||||||||    
T  20150 ctctttggaagtg 20162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29522 - 29242
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29522 agtttacttagaatttctttacaactttcatatcttagaaattctaaagtcttaatagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 29423  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| | |||  ||    
T  29422 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tataagcctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttttttcttga 29324  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatat 282  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  29323 gcataggaaacctcttgcaattgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctattttgagcagtgagcaactataatcagatat 29242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 99590 - 99776
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  99590 agttctcttagaatgtcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatc 99689  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  99690 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctattgcatttgtgcttgagcaatagaagtctctt 99776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 287
Target Start/End: Original strand, 99795 - 99936
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  99795 tagaagtctcttgccgttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgag-catttaaagtct 99893  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||| | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  99894 cttaccaagtttagtagtcagcaattataataagatattacat 99936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 37 - 343
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  37 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 136  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  137 aattgttcaacttcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagga 236  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  237 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtttcatgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaact 330  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||    
T  331 atccttggaagtg 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7554 - 7308
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  7554 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtactgtgaacactactgattgtatatc 7455  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7454 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaag 7355  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctct 246  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7354 agcataggaaaactcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctct 7308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 219967 - 219658
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  219967 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatc 219868  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  219867 aagtgttcaacctcacacaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgaacataagaagtctcttgattgtgttcagga 219769  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  219768 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttatcagtgagcttttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 219671  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  219670 ctccttgaaagtg 219658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 211127 - 210820
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  211127 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 211028  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  211027 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 210928  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  210927 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 210834  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  210833 tctccttggaagtg 210820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 244664 - 244973
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  244664 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 244763  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||  ||    
T  244764 aagt-ttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaa-tagaactctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttga 244861  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  244862 gcataggaaatttcttgcagctgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-tttttagtgaacc 244960  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  244961 ctccttgaaagtg 244973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 313
Target Start/End: Original strand, 377987 - 378239
Alignment:
Q  59 tctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttg 157  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  377987 tctgtatgtgatttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttg 378086  T
Q  158 cggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagttta 257  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||    
T  378087 cagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagactcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagtttta 378185  T
Q  258 gcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  378186 gcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 378239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 88132 - 87890
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  88132 agttcatttagaattccttaacaactttcatatcttataaattctagagtcttaagagtct-tatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 88034  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||| ||||||||||| | || | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||   ||||||||| ||| |||||  ||    
T  88033 aagtgtttaacctcaaacattgttatctgtaattctatttgaat-agaagtctcttgcagttgcgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcttga 87935  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctc 245  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  87934 gcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctc 87890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 377945 - 377984
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaa 40  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  377945 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaa 377984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9635 - 9324
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  9635 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacactagtgattgtatatc 9536  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt--agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  9535 aagtgttcaacctaaaacaattttctttgtaattatgtttgaatttaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcag 9436  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9435 gagcataggaagtctcttgcatttgtgcttgag-cgtttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagaagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaa 9339  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  9338 ctctccttggaagtg 9324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18757 - 18472
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18757 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 18658  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  18657 aagtgttcaacctcaaa-aaatttct-tataattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttctgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 18560  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18559 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 18472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 22514 - 22799
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22514 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 22613  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  22614 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaactaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 22712  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22713 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacat 22799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49061 - 48751
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  49061 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatc 48962  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  48961 aagtgtttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 48862  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  48861 agcataggaagtctcttgcatttgtggttgag-catttgaagtctcttgttaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaac 48765  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  48764 tctccttggaagtg 48751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 839 - 1045
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    | ||| ||||    
T  839 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttaatttagtgcttga 937  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaatt 270  Q
    ||||   |||||||||  |||||| |  || || ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| | | | || ||| | |||||| ||    
T  938 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgtgtgcttgagtaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagtt 1037  T
Q  271 gtaatcag 278  Q
    ||||||||    
T  1038 gtaatcag 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32207 - 32069
Alignment:
Q  44 ctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa 143  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||     ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  32207 ctagattcttcatagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtata-----tgttcaacctcaagcatttttctttgtaattctgtttgaa 32113  T
Q  144 -ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
     || |||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||    
T  32112 tttggaagtctcttgcagttgttcttgagcatttgaagtctctt 32069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32109 - 32005
Alignment:
Q  206 ggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatcct 305  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |  ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  32109 ggaagtctcttgcagttgttcttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagtatcgagtagtcttaatcagatattacatttt--agtgaactctcct 32013  T
Q  306 tggaagtg 313  Q
    ||||||||    
T  32012 tggaagtg 32005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 140
Target Start/End: Original strand, 57196 - 57264
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgttt 140  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||    
T  57196 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgttt 57264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 212084 - 211775
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||    
T  212084 agttcacttaaaatttcttaccaagtttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacaaattgtatatc 211985  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  211984 aagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtcattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttcagga 211885  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||| ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  211884 gcatatgaagtctcttgcagttgagcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 211788  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  211787 ctccttggaagtg 211775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 60877 - 60798
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60877 gtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 60798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 6074 - 6381
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  6074 agttcacttagaatttcatatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctggatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 6173  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6174 aagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattaaaagtctcttgattgtgttcagg 6273  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  6274 agcataagaagtcttttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 6367  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  6368 tctccttggaagtg 6381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1387 - 1099
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  1387 agttcacttagaatttcttatcaactttcctatcttagaaattctagaatcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 1288  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  1287 aagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagtcgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttcagga 1188  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttt 290  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1187 gcataggaagtctcttgcagttgtccttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttt 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 65789 - 66096
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  65789 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcctagaaattctagagtccttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 65888  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  65889 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 65988  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  65989 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 66082  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  66083 tctccttggaagtg 66096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 144834 - 145141
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  144834 agttcacttagaatttcttatcaaagcttatatcctagaagttctagagtccttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 144933  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  144934 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 145033  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | | |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  145034 agcgtaggaagtctcttgcaattgtgcttgag-catttgaagtctcttagtaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 145127  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    ||| ||||||||||    
T  145128 tatacttggaagtg 145141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 59287 - 59046
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgta-tcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |    
T  59287 agttcacttagaatatcttaacaattttcatatcttagaaattctagagtcttaggagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatgt 59189  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||   |||| ||||   | ||| |  |    
T  59188 caaatgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttg-attagaagtctcttgcttttgtggttgagcataggaagtatcttgcatttgtgcttg 59091  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    | ||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  59090 agcataggaaacctcttgcttttgtgcttgactagtttgaagtct 59046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 245
Target Start/End: Original strand, 165118 - 165256
Alignment:
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacata 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||   |||||||||   ||||| |  || || |    
T  165118 ttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaa 165216  T
Q  206 ggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctc 245  Q
    |||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  165217 ggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctc 165256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1046 - 740
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1046 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgagcactactgattgtatatc 947  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||   |||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||    
T  946 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgttt--aatagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatatgaagtctcttgattgtgttcagga 849  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||| || |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  848 gcatagggaaactcttgcttgtgtgcttgagtagtttgaagtctcttgttagttttagcagtgagcaatt----acagatattacattttttagtgaact 753  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  752 ctccttggaagtg 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 87984 - 88271
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  87984 agttcacttagaatttcttaacaaggcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatc 88083  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  88084 aagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaag 88183  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  88184 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactacgtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 88271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7655 - 7343
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaat---atcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtat 97  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  7655 agttcacttagaatt-cttatcaaagttcatcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtat 7557  T
Q  98 atcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||| || |||||| |||||||||    
T  7556 atcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttcagcattagaactctcttgattgtgttc 7457  T
Q  197 aagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtg 296  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7456 aggaacataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtg 7360  T
Q  297 aactatccttggaagtg 313  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7359 aactctccttggaagtg 7343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 59745 - 59559
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  59745 agttcacttagaatttcttatcaaagatcatatcttagaaattataaagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 59646  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  59645 aattgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagaattagaagtctctt 59559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 59594 - 59498
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  59594 tctcttgcagttgtgcttgag-aattagaagtctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaa---gatattacatttt--agtgaactctccttggaa 59501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 103298 - 102989
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| | |||||||||||||    
T  103298 gttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtatacaccattgattgtatatca 103199  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||     
T  103198 agtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatcataagtctcttgattgtgttcaggag 103099  T
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    ||||| || |||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  103098 catagcaagtctcctgtagttgtgcttgag-catttgaagtcttttgcttggtttggcagtgaacagttgtaatcagatattac-ttttttagtgaacta 103001  T
Q  302 tccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||    
T  103000 tccttggaagtg 102989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 1039 - 1348
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  1039 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgaatctgacttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 1138  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  1139 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattatgtttgaattcaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcagg 1237  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1238 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-cattttaagtctcgtgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattac--tttttagtgaac 1334  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | | ||||||||||    
T  1335 tctacttggaagtg 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 7124 - 7433
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  7124 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaaaactgattgtatatc 7223  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  7224 aagtgttcaaccttaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattgagaagtatcttgccgttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 7322  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7323 agcatgggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaaatctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattac--tttttagtgaac 7419  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  7420 tctccttggaagtg 7433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 10491 - 10800
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||||    
T  10491 agttcacttaaaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaatggttgtatatc 10590  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  10591 aagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattatctttga-ttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatcagaagtctcttgattgtgttcagga 10689  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  10690 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtagtcagatattac--tttttagtgaact 10787  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     | ||||||||||    
T  10788 tttcttggaagtg 10800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 15155 - 15464
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||||    
T  15155 agttcacttaaaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaatggttgtatatc 15254  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  15255 aagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattatctttga-ttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatcagaagtctcttgattgtgttcagga 15353  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  15354 gcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtagtcagatattac--tttttagtgaact 15451  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     | ||||||||||    
T  15452 tttcttggaagtg 15464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1491
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  1204 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccactgattgtatatc 1303  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  1304 aagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgtttgaattaaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcagg 1403  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1404 agcataggaagtctcttgaagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 27814 - 28119
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||||||||||||||    
T  27814 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttatattgtgaaaatcactgattgtatatc 27913  T
Q  101 aagtgttcaa-cctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  27914 aagtgttcaaccctcaaacatttttctgtgtaattctgt-----ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 28008  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  28009 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttga-acatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaattagatattaca--ttttagtgaac 28105  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  28106 tctccttggaagtg 28119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2650
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      | || ||| || |||||||||||    
T  2953 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatt------gcgaacaccaccgattgtatatc 2860  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  2859 aagtgttcaacctcaaacaatttcctttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 2761  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2760 gcataggaaatctcttgcagttgtgtttgagtagtttgaagtctcttgccagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 2663  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     |||||| |||||    
T  2662 ctccttgtaagtg 2650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 84120 - 83812
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  84120 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatataagatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 84021  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  84020 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tttagttctgttcgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttagg 83922  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagttt-agcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  83921 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatttgaagtctcttgctagttttaagcagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaa 83827  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  83826 ctctccttggaagtg 83812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 268509 - 268201
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  268509 agttcacttagaatttcttttcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 268410  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||  ||    
T  268409 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgtttaagcatagaaagtctcttgattttgttcttga 268311  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |  || ||||||||| | ||||||||| |||||     ||||||||||||    
T  268310 gcataggaaatatcttacaattgtgcttgagtagtttgaagtgtcttgctattttgagcagtgagaagttgtaatcaaatatt---gattttagtgaact 268214  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  268213 ctccttggaagtg 268201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 144635 - 144324
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||    
T  144635 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtggacaccaatgattgtatat 144536  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||  ||||       
T  144535 caagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgatttagttcttc 144437  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  144436 agcataggaaatctcttgcatttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaaacagatatttga-tttttagtgaac 144338  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||| ||||||    
T  144337 tctccttagaagtg 144324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 90440 - 90747
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  90440 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcataagagtctgtatatgatttctattgtgaacactactgattgtatatc 90539  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| || || ||||||||| |||||||||| |    
T  90540 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgaccaatagaagtctcttgattgtgttcagg 90638  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  90639 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagttagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaac 90733  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  90734 tctccttggaagtg 90747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 134
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||          ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  429 agttcacttagaatttcttaacaaatttcatatcttttaaattctagagtctta----------tctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatat 340  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| | |||||||  |    
T  339 caagtgttcaacctcaaaca-ttttctttttaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatagtaagtctcttgagtgtgttcttg 242  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||  ||  ||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  241 agcataagaattctcttgcagttttgcttgagtagtttgaagtctcttgcta--ttgtgc-ttgagcaattgtaatcagatatt---gattttagtgaac 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9696 - 9383
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagc----actactgattgta 96  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||      || |||| |||||    
T  9696 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaattaaaaccactggttgta 9597  T
Q  97 tatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttc 196  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9596 tatcaaatgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttc 9497  T
Q  197 aagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtg 296  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9496 aggagcatagtaagtctcttgcagttgtgctttag-catttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtg 9400  T
Q  297 aactatccttggaagtg 313  Q
    |||| |||||| |||||    
T  9399 aactctccttgtaagtg 9383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7521 - 7243
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  7521 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgacctcaaacatttttct-tg 7423  T
Q  130 taattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7422 taattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctt 7323  T
Q  229 gagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  7322 gagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgattaattgtaatcaaatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 7243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 365 - 671
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||    
T  365 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacacaacaaattgtatatc 464  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||   |||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||    
T  465 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgttt--aatagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatatgaagtctcttgattgtgttcagga 562  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     |||||| || |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  563 gcatagggaaactcttgcttgtgtgcttgagtagtttgaagtctcttgttagttttagcagtgagcaatt----acagatattacattttttagtgaact 658  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||||||||    
T  659 ctccttggaagtg 671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 26051 - 26339
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||| ||||    
T  26051 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctaatttgtactgtgaacaccactgattgtctatc 26150  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  26151 aagtgttcaacctcaaacatttgtctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgattgagcaatataagtctcttgattgtgttcagg 26250  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagttt-agcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26251 agcataggaagtctcttgcagttgtacttgagcaatttgaagtctcttactaagtttaagtagtgagcatttgtaatcagatattacat 26339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 35188 - 35361
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  35188 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatc 35287  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagca 173  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  35288 aagtgttcaacctcaaaaaaaattctttgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagca 35361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 36565 - 36659
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgt 95  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  36565 agttcactttgaatttcatatcaaagttcatatcttataaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactggttgt 36659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 287
Target Start/End: Original strand, 35339 - 35416
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagttt-agcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35339 tctcttgcaattgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttaagttgtgagcatttgtaatcagatattacat 35416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 81125 - 80815
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  81125 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat 81026  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||| |||| ||| |||||  |    
T  81025 caagtgttcaacctcaaataattttctttgtgattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatcaagtatcttgattttgttcttg 80927  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  80926 agcataggaaatgtcttgtagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgccagttttaggagtgagcagttgtaagtagatattaca-tttttagtgaac 80828  T
Q  300 tatccttggaagt 312  Q
    | |||||||||||    
T  80827 tctccttggaagt 80815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 5985 - 6157
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5985 agttctcttataatttcttatcaaagcttataacttagaaattctagagtctttagagttagcatctgatgtgtattgtgaacaccactgattgtatatc 6084  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagca 173  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||    
T  6085 aagtattcaacctcaaccatttttct-tgtaattttgtttgaattcagaagtctcttgtagttgtgcttgagca 6157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 287
Target Start/End: Original strand, 24328 - 24447
Alignment:
Q  167 ttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagc 266  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  24328 ttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagca-tttgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 24426  T
Q  267 aattgtaatcagatattacat 287  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  24427 aattgtaataagatattacat 24447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 24368 - 24408
Alignment:
Q  147 gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctta 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24368 gaagtctcttgcagttgtgtttgagcatttgaagtctctta 24408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8883 - 8602
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  8883 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatc 8784  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  8783 aagtgttcaagctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 8685  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8684 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgag-catttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatatt 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 158838 - 158535
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||    
T  158838 agttcacatataatttcttatcaaagttcatattttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttacattgtgaacaccactgattgtatatc 158739  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||    
T  158738 aagttttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctctttcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcagga 158640  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  158639 gcataggaaatctcttgcagttgtgcatgagcagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 158542  T
Q  301 atccttg 307  Q
     ||||||    
T  158541 ctccttg 158535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37128 - 36910
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||    
T  37128 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattttgaacaccactgattttatatc 37029  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaaca-attttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  37028 aagtgttcaacctcaaacattttttttttgtaattctgtttgaattagaagtcccttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 36929  T
Q  200 aacataggaaatctcttgc 218  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  36928 agcataggaagtctcttgc 36910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 135188 - 134970
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||    
T  135188 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattttgaacaccactgattttatatc 135089  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaaca-attttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  135088 aagtgttcaacctcaaacattttttttttgtaattctgtttgaattagaagtcccttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 134989  T
Q  200 aacataggaaatctcttgc 218  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  134988 agcataggaagtctcttgc 134970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36921 - 36848
Alignment:
Q  238 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  36921 gaagtctcttgctagttctagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttgtaagtg 36848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 134981 - 134908
Alignment:
Q  238 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  134981 gaagtctcttgctagttctagcagtgagcaattgtaatcagatattaca--ttttagtgaactctccttgtaagtg 134908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11925 - 11639
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  11925 agttcccttagaatttcttaacaaaacttatatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtttatc 11826  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  11825 aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 11726  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc-aaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11725 agcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaatttttagtagtgagcatttgtaatcagatattac 11639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 18149 - 18457
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  18149 agttcacttagaatttcttaacaaagcttaaaccttaggaattctaaagtctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatc 18248  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  18249 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctgttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 18348  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  18349 agcataggaagtctcttgcagctgtgcttgagcaacttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 18443  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  18444 tctccttggaagtg 18457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 6)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 142823 - 142537
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||    
T  142823 agttcacttagaatttcttatcaaaattcatatcttagaaattctagagtcttaagagtccgtacctgatttgtattgtgaactccactgattatatatc 142724  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatta-gaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  142723 aagtattcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaattctcttgtagttatgtttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 142625  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  142624 agcataggaagtctcttgcagttgcgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagtagtgagcaattgtaattagatattacat 142537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 64091 - 63912
Alignment:
Q  7 cttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  64091 cttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgt 63992  T
Q  107 tcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    |||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  63991 tcaaactcaaac-ataatctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctctt 63912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46249 - 46084
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46249 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtct 46151  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  46150 cttactaagtttagtagtgagcaattgtaaccagatattac--tttttagtgaactctccttggaagtg 46084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 46417 - 46238
Alignment:
Q  7 cttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgt 106  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46417 cttagagtttcttatcaaagttcatatcttagaaattttagagtctttagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgt 46318  T
Q  107 tcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    |||| ||||||  ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  46317 tcaaactcaaa-gataatctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctctt 46238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 63923 - 63765
Alignment:
Q  145 tagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtct 244  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  63923 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtct 63825  T
Q  245 cttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatcctt 306  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  63824 cttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatatt--attttttagtgaactctcctt 63765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 59705 - 59788
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctctt 156  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  59705 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttttgtgtcattctgtttg-attagaagtctctt 59788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 19006 - 19314
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  19006 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctgattggtattgtgaacaccactgactgtatatc 19105  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  19106 aagtgttcaacctcaaacattttgcattgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagg 19205  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaag-tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||     |||||||    
T  19206 agcataggaacactcttgcagttgtgcttgag-catttgaagtctcttgctaagttttagcactaagcaattctaatcagatattaca-----tagtgaa 19299  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  19300 ctctccttggaagtg 19314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 32169 - 32475
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||  || ||||||||||||||    
T  32169 agttcacttagaatttattaacaactttcatatcttagaaattctagagtattaagagtctgtatcagatttgtattatgaaaaccactgattgtatatc 32268  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||  ||    
T  32269 aagtgttcaacctcaaacaaatttcattgtaattctgtttg-attagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgatttagttcttga 32367  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32368 gtataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctctttctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca--ttttagtgaact 32465  T
Q  301 atccttggaa 310  Q
     |||||||||    
T  32466 ctccttggaa 32475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 312
Target Start/End: Original strand, 78768 - 79048
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  78768 atatcttagaaattctagggtctttagagtatgtatctcatttgtattgtaaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttct-tg 78866  T
Q  130 taattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  78867 taattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagtaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctt 78966  T
Q  229 gagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagt 312  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  78967 gagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattac--tttttagtgaactctccttggaagt 79048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 2209 - 2280
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgattt 72  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2209 agttcacttagaatttcttataaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctatatctaattt 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 451 - 163
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtctt-aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  451 agttcacttagaatttcttaacaaagcttacatcttaggaattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatat 352  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  351 caagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcag 252  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 287  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  251 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaggaagttgaagtctcctgctagttttagccgtgagcaattgtaatcagatattacat 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5910 - 5635
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5910 agttcacttataatttcttttcaaagttcatatcttagaaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 5811  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| || |||||||||| |    
T  5810 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgttcagg 5711  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaat 275  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  5710 agcataggaagtcgcttgcagttgtgcttgatcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaat 5635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5920 - 5645
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5920 agttcacttataatttcttttcaaagttcatatcttagaaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 5821  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| || |||||||||| |    
T  5820 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgttcagg 5721  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaat 275  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  5720 agcataggaagtcgcttgcagttgtgcttgatcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaat 5645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2709 - 2401
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgattt-gtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  2709 agtttacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattctaaagtcttaagagtatgtatctgattttgtattgtgaacaccactgattgtatat 2610  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  2609 caagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtttttctgtttgaatttagaagtcttttgcagttgtgcttgagcattataagtctctttattgtgttcag 2511  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaa 298  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||     |||||||    
T  2510 gagcataggaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctttctatttttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaa 2416  T
Q  299 ctatccttggaagtg 313  Q
    || ||||||||||||    
T  2415 ctctccttggaagtg 2401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13771 - 13462
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13771 agttcacttagaatttcttaccaaaattcatatcttagaaattctagactcttaagagtctgcatctgatttgtattgtgagcaccactgattgtatatc 13672  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | || || ||||| || ||||||||||||||   |||  |||||||| | ||||||||| |||  ||||  ||    
T  13671 aagtgttcaacctcaaacatatttctttatatttttgttttaa-tagaagtctcttgcttgtgtacttgagcataagaagtctcttgatttagttcttga 13573  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaact 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13572 gcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgtagtctcttgctagttttagcagtgagcagtcgcaatcagatattaca--ttttagtgaact 13475  T
Q  301 atccttggaagtg 313  Q
     ||||||| ||||    
T  13474 ctccttggtagtg 13462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 286
Target Start/End: Original strand, 360 - 609
Alignment:
Q  38 gaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  360 gaaattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttg 459  T
Q  138 tttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatt 236  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| ||| ||| |||| |||||||  ||||    
T  460 tttgaatttagaattctcttgcagttgtgcttgagcattacaagtctcttgagtgtgttcaggagcataggaagtctattgtagttatgcttgaacaatt 559  T
Q  237 tgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca 286  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  560 tgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaca 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 248
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  359 atatcttggaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttg 260  T
Q  130 taattctgtttg 141  Q
    ||||||||||||    
T  259 taattctgtttg 248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 21359 - 21574
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21359 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21458  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21459 aagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgggcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaaga 21557  T
Q  201 acataggaaatctcttg 217  Q
     |||||||| |||||||    
T  21558 gcataggaagtctcttg 21574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 2357 - 2665
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2357 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaagaattctagagtctttaaagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 2456  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||| |   | | |  |    
T  2457 aagtgtttcacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgaaattctccttg 2556  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | ||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  2557 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtgtcttaataagtttcgtagtgggcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaac 2651  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  2652 tctccttggaagtg 2665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 307
Target Start/End: Original strand, 21565 - 21694
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21565 aagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtggttgagcagtttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatca 21664  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21665 gatattacattttttagtgaactctccttg 21694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 313
Target Start/End: Original strand, 16134 - 16407
Alignment:
Q  35 ttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaatt 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  16134 ttagaaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacttcaaacaattttctttgtaatt 16233  T
Q  135 ctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagta 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||      
T  16234 ctgtttgaattaagaagtctcttgccgttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-c 16332  T
Q  234 atttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  16333 atttgaaatctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 16407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 230
Target Start/End: Original strand, 25794 - 25990
Alignment:
Q  35 ttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaatt 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  25794 ttagaaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacttcaaacaattttctttgtaatt 25893  T
Q  135 ctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttga 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25894 ctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttga 25990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 204 - 7
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  204 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatc 105  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  104 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttataagtctcttgcagttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttca 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6044 - 5916
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6044 atatcttagaaattcttaagtctatagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctat 5945  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5944 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 5916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 656 - 900
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  656 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaactctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacactactgattgtatatc 755  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||  ||||   |    
T  756 aagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctatttgaa-tagaagtatcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttaa 854  T
Q  201 acataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctct 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  855 gcataggaaatctcttgcagttgtgctttagtagtttgaagtctct 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Original strand, 913 - 957
Alignment:
Q  54 aagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  913 aagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtata 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 2175 - 2449
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  2175 agttcactttgaatttcttaacaactttcatatcttagaaattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatat 2274  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||   ||||||||| |||  ||||  |    
T  2275 caagtgttcaaccttaaaaaaatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctattgcagttgtacttgagcataggaagtctcttgatttagttctcg 2373  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaat 275  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  2374 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttaagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaat 2449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 16511 - 16821
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  16511 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttggaaattctggagtcttaaagagtctgtatctgatttgtcttgtgaacaccactgattgtatat 16610  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
     ||||||||||||||||| ||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||   ||| ||||| |||  ||||  |    
T  16611 aaagtgttcaacctcaaaaaaaaatatttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgagcttgagcataggaagcctcttgatttagttcttg 16709  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaac 299  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  16710 agcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagaagtgagcagttataatcagatattaca--ttttagtgaac 16807  T
Q  300 tatccttggaagtg 313  Q
    | ||||||||||||    
T  16808 tctccttggaagtg 16821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2388 - 2106
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtatat 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    || |||||||||    
T  2388 agttcacttagaatttcatatcaactttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatttgtgaacgtcgctaattgtatat 2289  T
Q  100 caagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaag 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||| | |||  |    
T  2288 caaatgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttttttcttg 2190  T
Q  200 aacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2189 agcataggaaatctcttgcagtttttcttgagttgtttgaagtctcttgctattttgagcagtgagcatttgtaatcagatatt 2106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 3785 - 3951
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    |||||||||||||||  ||  || |||||||  |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||    
T  3785 acttagaatttcttataaactttcatatcttcaaaattctagagtcttaagagtcta-atttgttttgtattgtgaacaccgctgattgtatattaagtg 3883  T
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  3884 ttcaatctcaaacattattctgtgtaattgtgtttg-tttataagtctcttgcttttgtgcttgagcat 3951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 2374 - 2586
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2374 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatctaagaaattctagagtcttaag----tgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 2469  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  2470 aagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctctttcagttgtacttgaacattagaagtctcttgattgtgttcagga 2569  T
Q  201 acataggaaatctcttg 217  Q
    ||||||||| |||||||    
T  2570 acataggaagtctcttg 2586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Original strand, 2577 - 2709
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||    
T  2577 aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttaacagtgagcagttgtaatca 2675  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2676 gatattaca--ttttagtgaactctccttggaagtg 2709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8294 - 8073
Alignment:
Q  69 atttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgttt 168  Q
    |||||||| | || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||    
T  8294 atttgtattgggaacaccactgattgtatattaagtgttcaacctcatacaattttttttgtaattctgtttgaat-agaagtatcttgcagttgtgctt 8196  T
Q  169 gagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaa 268  Q
    |||||| | ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  8195 gagcataagaagtctcttgattgcgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcaatgagcaa 8096  T
Q  269 ttgtaatcagatattacattttt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8095 ttgtaatcagatattacattttt 8073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 9628 - 9581
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtct 52  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9628 cacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtct 9581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13300 - 13114
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13300 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagttttaagaattcgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 13201  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||    
T  13200 aagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgaacattagaagtctctt 13114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1507 - 1260
Alignment:
Q  62 gtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggt 161  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||||||       
T  1507 gtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtagatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttga-ttagaattttcttgctta 1409  T
Q  162 tgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcag 261  Q
    |||| |||||||| | | ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||| ||    
T  1408 tgtggttgagcat-agaggtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttatgcttgagtattttaaagtctcttgctagttttagtag 1310  T
Q  262 tgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1309 tgagcaattgtaatcagatattac--tttttagtgaactctccttggaagtg 1260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 37117 - 37320
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||     
T  37117 agttcacttagaatttcttatcaaacttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtcattatctgatttgtattgtgaacacctctgattgtatat- 37215  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  37216 aagtgttcaaccttaaacgattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 37314  T
Q  201 acatag 206  Q
     |||||    
T  37315 gcatag 37320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41888 - 41685
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||     
T  41888 agttcacttagaatttcttatcaaacttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtcattatctgatttgtattgtgaacacctctgattgtatat- 41790  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaaga 200  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  41789 aagtgttcaaccttaaacgattttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcagga 41691  T
Q  201 acatag 206  Q
     |||||    
T  41690 gcatag 41685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 311
Target Start/End: Original strand, 37357 - 37436
Alignment:
Q  230 agtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaag 311  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||    
T  37357 agtaatttcaagtctcttgctaagtttagcagtcagcaattgtaatcagatattaga--ttttagtaaactctccttggaag 37436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41648 - 41569
Alignment:
Q  230 agtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaag 311  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||    
T  41648 agtaatttcaagtctcttgctaagtttagcagtcagcaattgtaatcagatattaga--ttttagtaaactctccttggaag 41569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 3113 - 3299
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  3113 agttcacttagaatttcttatcaaagctcatatcttaggaattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 3212  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctta 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  3213 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctctta 3299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Original strand, 3263 - 3359
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||    
T  3263 tctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaa 3356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 5708 - 5874
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5708 agttcacttagaatttcttaacaaagcttatatcttgggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 5807  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgcggttgtgt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5808 aagtgttcaacctcaaacaattttcattataattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgt 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 285
Target Start/End: Original strand, 5874 - 5937
Alignment:
Q  222 tgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattac 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  5874 tgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgagcgtttgtaatcagatattac 5937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 4394 - 4549
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  4394 agttcacttagaatttcttaacaactttcatattttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 4493  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  4494 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgc 4549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1901 - 2060
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |    
T  1901 agttcacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattatagag---------tctgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatacc 1991  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  1992 aagtgttcaacctcaaacaaaattttttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttga 2060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 314
Target Start/End: Original strand, 2643 - 2753
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaacta 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  2643 catatgaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt-aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaataagatattaca-tttttagtgaactc 2740  T
Q  302 tccttggaagtga 314  Q
    |||||||||||||    
T  2741 tccttggaagtga 2753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5358 - 5189
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  5358 agttcacttagaatttcttatcaacttccatatcttagaaattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgcacaccactgattgtatatc 5259  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgag 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  5258 aagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgag 5189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22706 - 22494
Alignment:
Q  34 cttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaat 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| || |  || |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  22706 cttataaattctagagtcttaagagtttcaa-ctgatttgtattgtaaataccactgatggtatatcaagtgttcaaccttaaac-attttctttgtaat 22609  T
Q  134 tctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagta 233  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||   |||||||||   | ||| | | | ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  22608 tctttttgaa-tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcgtttgtgctaaagcataggaaacctcttgctattgtgcttgagta 22510  T
Q  234 atttgaagtctcttgc 249  Q
     |||||||||||||||    
T  22509 gtttgaagtctcttgc 22494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5209 - 5129
Alignment:
Q  211 tctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5209 tctcttgcagttgtgcttgagtagttttaagtctcttgctagttttcgcagtaagcagttgtaatcagatattacattttt 5129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3033 - 2890
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  3033 agttcacttagaatttcgtatcaaagcttatatcttagaaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 2934  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt 145  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2933 aagtg-tcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatt 2890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1261 - 1507
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  1261 agttcacttagaatttcttaccaactttcatgtcttagaaattcttgagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 1360  T
Q  101 aagtgttc-aacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat--taaaagtctcttaattgtgttca 197  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||  | |||||   || |||||  |  |||| ||      
T  1361 aagtgttcaaacctcaagc-attttctgtgtaattttgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcataagcataggaagagtcttgtgtttgtctt-- 1456  T
Q  198 agaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
     || ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457 -gagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18924 - 18677
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaa-caaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatc-gtgagcactactgattgtata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || | ||| ||||||| ||||    
T  18924 agttcacttagaatttcttaaacaactttcatatcttagaaattctagagttttaagagtc-gtatctgatttgtatttgtaaacaccactgattttata 18826  T
Q  99 tcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||     | | |      
T  18825 tcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctatttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgcagttctgctt 18728  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  18727 gagcataggaaatctcttgtagttgtgcttgcatagtttgaagtctcttgc 18677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5734 - 5579
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5734 agttcacttagaatttcttatcaaaactcatatcttaggaattctagagtctttaaagtttgcatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatc 5635  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatt-agaagtctctt 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5634 aagtgttcaacctcaaacatttttct-tataattctgtttgaattaagaagtctctt 5579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5588 - 5518
Alignment:
Q  238 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  5588 gaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattaca-----tagtgaactctccttggaagtg 5518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 7542 - 7666
Alignment:
Q  2 gttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatca 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  7542 gttcacttagaatttcttatcaaagctcgtatcttaggaattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatca 7641  T
Q  102 agtgttcaacctcaaacaattttct 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  7642 agtgttcaacctcaaacatttttct 7666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Original strand, 44420 - 44554
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  44420 aagtttcttgattgtgttcaagagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttcctagttttagcagtgaccaattgtaatca 44519  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  44520 aatattacatttttt-gtgaactctccttgaaagtg 44554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Original strand, 44343 - 44429
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttg 157  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  44343 ttgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaacctcaaataaatttctttgtaattctgtttgaatcagaagtttcttg 44429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 44302 - 44344
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaatt 43  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44302 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaatt 44344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 1960 - 2077
Alignment:
Q  194 ttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttttta 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  1960 ttcaagagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgcgcagttgtaatcagatattaca--tttta 2057  T
Q  294 gtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  2058 gtgaactctccttggaagtg 2077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19801 - 19554
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||    
T  19801 agttcacttagaatttcttatcaactttcatatcttagaaattcaag--tcttaagagtttgtatctgatttgtattatgaacatcactgattgtatatc 19704  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt--aattgtgttcaa 198  Q
    || ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||| ||||||||   ||||||| |     ||||| |      
T  19703 aaatgttcaatctcaaatatttttctgtgtaattgtgttt-ctttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcatgcgtgtgtgtgctt 19605  T
Q  199 gaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgc 249  Q
    || ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19604 gagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc 19554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26011 - 25878
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  26011 aagtctcgtgattgtgttcatgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaaca-tttgaagtctcttgctaagtttagcaatgagcagttgtaatca 25913  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25912 gatattacat-ttttagtgaactctccttggaagtg 25878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29297 - 29233
Alignment:
Q  89 tgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29297 tgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctct 29233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4001 - 3829
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  4001 agtttacttagaatttcttaacaactttcatatctcagaaattctagagtcttaagagtctgattatgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatc 3902  T
Q  101 aagtgttcaacctcaaacaatttt-ctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    |||||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  3901 aagtgttcaatc-caaatatttttcctgtgtaattgtgtttg-tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 3829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Original strand, 111193 - 111343
Alignment:
Q  160 gttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagc 259  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  111193 gttgtgcttgagcattagaagtctcttgattttgttcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagca-tttgaagtctcttgttaagtttagc 111291  T
Q  260 agtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||    
T  111292 agtgaggaattgtaatcagatattac--cttttagtgaaatctccttggaagtg 111343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8211 - 8078
Alignment:
Q  178 aagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatca 277  Q
    ||||||||| ||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  8211 aagtctcttgattgtattcaggggcgtaggaaatctcttgcagttgtgcttgaatagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatca 8112  T
Q  278 gatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8111 gatattaca--ttttactgaactctccttggaagtg 8078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 278
Target Start/End: Original strand, 4308 - 4556
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  4308 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaactcaaacaattttctat 4407  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgctt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||   || ||||||  |||||| |  || || ||||| ||||||||   |||||||    
T  4408 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgctt 4506  T
Q  229 gagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcag 278  Q
    ||| ||||||||||||| | | | || ||| | |||||| ||||||||||    
T  4507 gagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcag 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 1454 - 1540
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1454 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 1540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32651 - 32565
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32651 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 32565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 242
Target Start/End: Original strand, 38536 - 38706
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  38536 ttgtatagtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgctttagtgcttga 38634  T
Q  171 gcattaaaagtctcttaattgtgttcaagaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagt 242  Q
    ||||  ||||||||||  |||||| |  || || ||||| ||||||||   ||||| |||| ||||||||||    
T  38635 gcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcctgagaaatttgaagt 38706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 26357 - 26428
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgattt 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357 agttcacttagaatttcttatcaaagttcatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgattt 26428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 8068 - 8154
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8068 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 8154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16448 - 16365
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16448 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattctgtttgattaagaagtctct 16365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 127489 - 127404
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  127489 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-attttatgtgtaattttgtttg-attggaagtctcttgc 127404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10423 - 10295
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||   ||||||| | || ||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10423 atatcttagaaattcttaagtcaagagagtctttcatttgaattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgt 10324  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10323 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 10295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20262 - 20196
Alignment:
Q  91 attgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20262 attgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattcagtttgaa-tagaagtctcttgc 20196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4777 - 4691
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4777 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 4691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 560 - 474
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  560 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 31460 - 31349
Alignment:
Q  7 cttagaatttcttaa-caaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31460 cttagaatttcttaaacaactttcatatcatggaaattctagagtcttacgagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtg 31361  T
Q  106 ttcaacctcaaa 117  Q
    ||||||||||||    
T  31360 ttcaacctcaaa 31349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 35306 - 35220
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35306 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 35220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 61392 - 61306
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  61392 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 61306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 475703 - 475789
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  475703 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctttttgaa-tagaagtctcttgc 475789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 482223 - 482309
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  482223 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctttttgaa-tagaagtctcttgc 482309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 142
Target Start/End: Original strand, 157078 - 157149
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  157078 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 157149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 10205 - 10317
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  10205 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 10302  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    |||||  ||||||||    
T  10303 gcattggaagtctct 10317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7815 - 7666
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    |||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7815 cacttataatttattaataactttcatatcttagaaattttagagtcttaggagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 7716  T
Q  105 gttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||  ||||||   ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  7715 gttcaa--tcaaacttatttctgtgtgatt-tgtttg-tttagaagtctcttgc 7666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 29212 - 29324
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  29212 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttga 29309  T
Q  171 gcattaaaagtctct 185  Q
    |||||  ||||||||    
T  29310 gcattggaagtctct 29324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6983 - 6855
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  6983 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattatgtgttcaaactcaaacaattttctgt 6884  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6883 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 6855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 2272 - 2351
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2272 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 2351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 1596 - 1666
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1596 actgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1107 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1107
Description:

Target: scaffold1107; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 2702 - 2800
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2702 cacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattatagagtcttaagagtttggat-tgttttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagt 2800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1047 - 961
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1047 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttg-attagaagtctcttgc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1662 - 1576
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1662 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttg-attagaagtctcttgc 1576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 2125 - 2211
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2125 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctatttgaa-tagaagtctcttgc 2211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11420 - 11334
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11420 ttgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctattgc 11334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 402
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  488 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaa-tagaagtctcttgc 402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4868 - 4782
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4868 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaa-tagaagtctcttgc 4782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 16762 - 16860
Alignment:
Q  5 cacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16762 cacttagaatttcttaacaactttcatatcttagaaattatagagtcttaagagtttggat-tgttttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 6921 - 6991
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6921 actgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 6991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 40779 - 40849
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40779 actgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgc 40849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 59325 - 59395
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  59325 actgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 59395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10166 - 10113
Alignment:
Q  89 tgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10166 tgattgtatatcaagtattcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttga 10113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 185
Target Start/End: Original strand, 901 - 997
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctct 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||  ||||||||    
T  901 actgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 58161 - 58065
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctct 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||  ||||||||    
T  58161 actgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtgtaattctgtttg-attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 58065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 156
Target Start/End: Original strand, 1403 - 1471
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctctt 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1403 actgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctctt 1471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1874 - 1751
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1874 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaacaattttctgtg 1779  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1778 taattctgtttg-attagaagtctcttgc 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 76856 - 76748
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||    
T  76856 actgattgtatatcaagtgttcaacccgaaacatatttctttgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctctt 76758  T
Q  187 aattgtgttc 196  Q
     ||| |||||    
T  76757 gattttgttc 76748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 76772 - 76691
Alignment:
Q  202 cataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatatt 283  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  76772 cataggaagtctcttgattttgttcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatatt 76691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 89 - 9
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  89 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtattttattcgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaa 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9623 - 9544
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9623 gtgaacaccactgatggtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaatactgtttgaa-tagaagtctcttgc 9544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22390 - 22310
Alignment:
Q  1 agttcacttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtga 81  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22390 agttcacttagaattttttaccaactttcatatcttagaaattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtga 22310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1002 - 936
Alignment:
Q  91 attgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1002 attgtatatcaagttttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2655
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaa-gagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttc-aacctcaaacaattttctg 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |     
T  2783 atatcttagatattctagagtcttaaagagtctgtatctaattggtattgtgaacagcactgattgtatatcaagtgttcaaacctcaaac-atttgatt 2685  T
Q  128 tgtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  2684 tgtaattctatttg-agtagaagtctcttgc 2655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 20783 - 20911
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgt-atctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgt 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| | || ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||    
T  20783 atatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattatttgttcaaactcaaacaattttttgt 20882  T
Q  129 gtaattctgtttgaattagaagtctcttgc 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20883 gtaattctgtttgaa-tagaagtctcttgc 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35418 - 35298
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  35418 atatcttagaaattcttaagtct--agagtctttat-tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtctaactattttctgtg 35323  T
Q  130 taattctgtttgaattagaagtctct 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  35322 taattctgtttg-attagaagtctct 35298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5717 - 5634
Alignment:
Q  229 gagtaatttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  5717 gagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaca-gttttagtgaactctcgttggaagtg 5634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 175
Target Start/End: Original strand, 38412 - 38514
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttga 170  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||    
T  38412 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctatgcaattctgtttgattta-aagtctcttgctttagtgcttga 38509  T
Q  171 gcatt 175  Q
    |||||    
T  38510 gcatt 38514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 9417 - 9577
Alignment:
Q  6 acttagaatttcttaacaaagttaatatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtg 105  Q
    |||||||||||||||  ||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||| |      || |||||| ||||||||||||    
T  9417 acttagaatttcttataaactttcatatcttacaaattctacagtcttaagagtctgattttgaattgtaac------acaactgatagtatatcaagtg 9510  T
Q  106 ttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcat 174  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  9511 ttcaaac-caaacatttttctgtgtaattttgtttg-tttagaagtcttttgcttttgtgattgagcat 9577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5138 - 5066
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  5138 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaat 5066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15563 - 15500
Alignment:
Q  78 gtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15563 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttga 15500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 313
Target Start/End: Original strand, 13801 - 13878
Alignment:
Q  234 atttgaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttggaagtg 313  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||    
T  13801 atttgaagtctcttgctagttttagcagtgggcagttgtaatcagatattaca--ttgtagtgtactctccttggaagtg 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40328 - 40231
Alignment:
Q  87 actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcggttgtgtttgagcattaaaagtctctt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| |||||    
T  40328 actgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa-tagaagcctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactctt 40231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 10701 - 10773
Alignment:
Q  71 ttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaat 144  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || | |||||||    
T  10701 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaac-attttctgtgtatttttatttgaat 10773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Original strand, 37109 - 37186
Alignment:
Q  30 atatcttagaaattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||| ||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37109 atatcttagaaattcaaaagtct--agagtctttat-tgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 37186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12315 - 12268
Alignment:
Q  261 gtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactatccttgga 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  12315 gtgagcatttgtaatcagatattaca-tatttagtgaactgtccttgga 12268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University